logo

Genes within 1Mb (chr1:54968291:A:G):

View on , UCSC , GTEx , gnomAD

Immune cell-type specific single cell cis-eQTLs in OASIS
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000006555 TTC22 166968 sc-eQTL 8.09e-01 0.023 0.0951 0.222 B L1
ENSG00000116133 DHCR24 81096 sc-eQTL 9.96e-01 0.000485 0.09 0.222 B L1
ENSG00000116205 TCEANC2 914707 sc-eQTL 9.49e-01 -0.00501 0.0776 0.222 B L1
ENSG00000116209 TMEM59 914787 sc-eQTL 9.42e-02 0.079 0.047 0.222 B L1
ENSG00000116221 MRPL37 784250 sc-eQTL 1.17e-01 -0.0969 0.0615 0.222 B L1
ENSG00000157216 SSBP3 554812 sc-eQTL 1.94e-01 -0.0841 0.0645 0.222 B L1
ENSG00000162402 USP24 -247073 sc-eQTL 2.45e-01 -0.0638 0.0547 0.222 B L1
ENSG00000215883 CYB5RL 768255 sc-eQTL 3.13e-01 -0.107 0.105 0.222 B L1
ENSG00000243725 TTC4 252430 sc-eQTL 6.76e-01 -0.0385 0.0919 0.222 B L1
ENSG00000006555 TTC22 166968 sc-eQTL 5.64e-01 -0.0433 0.0749 0.222 CD4T L1
ENSG00000116205 TCEANC2 914707 sc-eQTL 6.89e-01 0.0246 0.0613 0.222 CD4T L1
ENSG00000116209 TMEM59 914787 sc-eQTL 1.83e-01 0.0759 0.0569 0.222 CD4T L1
ENSG00000116221 MRPL37 784250 sc-eQTL 4.47e-02 -0.158 0.0782 0.222 CD4T L1
ENSG00000157216 SSBP3 554812 sc-eQTL 9.60e-01 0.0033 0.0655 0.222 CD4T L1
ENSG00000162402 USP24 -247073 sc-eQTL 2.30e-01 -0.0641 0.0532 0.222 CD4T L1
ENSG00000243725 TTC4 252430 sc-eQTL 5.61e-01 -0.0467 0.0803 0.222 CD4T L1
ENSG00000006555 TTC22 166968 sc-eQTL 9.09e-01 0.00756 0.066 0.222 CD8T L1
ENSG00000116205 TCEANC2 914707 sc-eQTL 5.62e-01 -0.0478 0.0822 0.222 CD8T L1
ENSG00000116209 TMEM59 914787 sc-eQTL 4.18e-01 0.0463 0.057 0.222 CD8T L1
ENSG00000116221 MRPL37 784250 sc-eQTL 2.16e-01 -0.0971 0.0783 0.222 CD8T L1
ENSG00000157216 SSBP3 554812 sc-eQTL 5.71e-01 -0.032 0.0564 0.222 CD8T L1
ENSG00000162402 USP24 -247073 sc-eQTL 5.15e-01 0.0356 0.0546 0.222 CD8T L1
ENSG00000243725 TTC4 252430 sc-eQTL 7.10e-01 0.0352 0.0947 0.222 CD8T L1
ENSG00000116133 DHCR24 81096 sc-eQTL 7.98e-01 0.0229 0.0895 0.212 DC L1
ENSG00000116205 TCEANC2 914707 sc-eQTL 3.26e-01 0.0985 0.1 0.212 DC L1
ENSG00000116209 TMEM59 914787 sc-eQTL 7.24e-01 -0.0279 0.0788 0.212 DC L1
ENSG00000116221 MRPL37 784250 sc-eQTL 5.01e-01 0.0713 0.106 0.212 DC L1
ENSG00000157216 SSBP3 554812 sc-eQTL 6.17e-01 0.0473 0.0943 0.212 DC L1
ENSG00000162390 ACOT11 426034 sc-eQTL 9.76e-01 0.00277 0.0908 0.212 DC L1
ENSG00000162402 USP24 -247073 sc-eQTL 4.00e-01 0.0461 0.0547 0.212 DC L1
ENSG00000215883 CYB5RL 768255 sc-eQTL 7.58e-01 -0.0305 0.099 0.212 DC L1
ENSG00000243725 TTC4 252430 sc-eQTL 6.42e-01 -0.0496 0.106 0.212 DC L1
ENSG00000116133 DHCR24 81096 sc-eQTL 4.61e-01 0.0464 0.0629 0.222 Mono L1
ENSG00000116205 TCEANC2 914707 sc-eQTL 4.05e-02 -0.139 0.0673 0.222 Mono L1
ENSG00000116209 TMEM59 914787 sc-eQTL 4.91e-01 -0.0348 0.0504 0.222 Mono L1
ENSG00000116221 MRPL37 784250 sc-eQTL 6.36e-01 -0.04 0.0844 0.222 Mono L1
ENSG00000157216 SSBP3 554812 sc-eQTL 8.81e-01 0.0146 0.0967 0.222 Mono L1
ENSG00000162402 USP24 -247073 sc-eQTL 6.36e-02 -0.107 0.0572 0.222 Mono L1
ENSG00000243725 TTC4 252430 sc-eQTL 8.08e-01 -0.0247 0.101 0.222 Mono L1
ENSG00000006555 TTC22 166968 sc-eQTL 9.94e-01 0.000699 0.087 0.223 NK L1
ENSG00000116133 DHCR24 81096 sc-eQTL 3.02e-01 -0.0907 0.0876 0.223 NK L1
ENSG00000116205 TCEANC2 914707 sc-eQTL 4.28e-01 0.0687 0.0865 0.223 NK L1
ENSG00000116209 TMEM59 914787 sc-eQTL 1.26e-01 0.104 0.0675 0.223 NK L1
ENSG00000116221 MRPL37 784250 sc-eQTL 3.64e-01 -0.0767 0.0842 0.223 NK L1
ENSG00000157216 SSBP3 554812 sc-eQTL 1.22e-01 -0.113 0.0728 0.223 NK L1
ENSG00000162398 LEXM 162228 sc-eQTL 6.30e-01 -0.0396 0.0821 0.223 NK L1
ENSG00000162402 USP24 -247073 sc-eQTL 2.54e-01 -0.0568 0.0497 0.223 NK L1
ENSG00000243725 TTC4 252430 sc-eQTL 6.31e-01 0.0453 0.0941 0.223 NK L1
ENSG00000006555 TTC22 166968 sc-eQTL 6.90e-01 0.031 0.0776 0.222 Other_T L1
ENSG00000116133 DHCR24 81096 sc-eQTL 4.51e-02 -0.12 0.0597 0.222 Other_T L1
ENSG00000116205 TCEANC2 914707 sc-eQTL 5.28e-01 -0.057 0.09 0.222 Other_T L1
ENSG00000116209 TMEM59 914787 sc-eQTL 3.42e-01 0.0587 0.0617 0.222 Other_T L1
ENSG00000116221 MRPL37 784250 sc-eQTL 6.53e-01 -0.0261 0.0579 0.222 Other_T L1
ENSG00000157216 SSBP3 554812 sc-eQTL 3.65e-01 -0.0607 0.0669 0.222 Other_T L1
ENSG00000162402 USP24 -247073 sc-eQTL 6.87e-01 -0.0288 0.0713 0.222 Other_T L1
ENSG00000215883 CYB5RL 768255 sc-eQTL 7.15e-01 -0.0356 0.0975 0.222 Other_T L1
ENSG00000243725 TTC4 252430 sc-eQTL 8.12e-01 0.0232 0.0971 0.222 Other_T L1
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000006555 TTC22 166968 sc-eQTL 5.44e-01 -0.0489 0.0804 0.23 B_Activated L2
ENSG00000116133 DHCR24 81096 sc-eQTL 7.96e-01 -0.0245 0.0945 0.23 B_Activated L2
ENSG00000116205 TCEANC2 914707 sc-eQTL 7.27e-01 0.0355 0.101 0.23 B_Activated L2
ENSG00000116209 TMEM59 914787 sc-eQTL 7.28e-01 0.0375 0.108 0.23 B_Activated L2
ENSG00000116221 MRPL37 784250 sc-eQTL 8.06e-02 0.203 0.115 0.23 B_Activated L2
ENSG00000157216 SSBP3 554812 sc-eQTL 4.64e-01 -0.0772 0.105 0.23 B_Activated L2
ENSG00000162402 USP24 -247073 sc-eQTL 5.48e-01 -0.0619 0.103 0.23 B_Activated L2
ENSG00000215883 CYB5RL 768255 sc-eQTL 2.79e-01 0.0984 0.0905 0.23 B_Activated L2
ENSG00000243725 TTC4 252430 sc-eQTL 2.01e-01 0.126 0.0981 0.23 B_Activated L2
ENSG00000006555 TTC22 166968 sc-eQTL 2.66e-02 0.227 0.102 0.223 B_Intermediate L2
ENSG00000116133 DHCR24 81096 sc-eQTL 8.72e-01 -0.0154 0.0956 0.223 B_Intermediate L2
ENSG00000116205 TCEANC2 914707 sc-eQTL 5.81e-02 0.18 0.0944 0.223 B_Intermediate L2
ENSG00000116209 TMEM59 914787 sc-eQTL 2.38e-01 -0.0963 0.0813 0.223 B_Intermediate L2
ENSG00000116221 MRPL37 784250 sc-eQTL 4.96e-01 -0.0653 0.0958 0.223 B_Intermediate L2
ENSG00000157216 SSBP3 554812 sc-eQTL 5.42e-02 -0.172 0.0888 0.223 B_Intermediate L2
ENSG00000162402 USP24 -247073 sc-eQTL 2.72e-01 -0.0828 0.0752 0.223 B_Intermediate L2
ENSG00000215883 CYB5RL 768255 sc-eQTL 2.36e-01 -0.127 0.106 0.223 B_Intermediate L2
ENSG00000243725 TTC4 252430 sc-eQTL 7.93e-01 0.0255 0.0971 0.223 B_Intermediate L2
ENSG00000006555 TTC22 166968 sc-eQTL 5.42e-01 0.0605 0.0989 0.222 B_Memory L2
ENSG00000116133 DHCR24 81096 sc-eQTL 5.20e-02 -0.19 0.0974 0.222 B_Memory L2
ENSG00000116205 TCEANC2 914707 sc-eQTL 7.99e-01 -0.0267 0.105 0.222 B_Memory L2
ENSG00000116209 TMEM59 914787 sc-eQTL 1.34e-01 0.131 0.0872 0.222 B_Memory L2
ENSG00000116221 MRPL37 784250 sc-eQTL 6.08e-01 -0.0456 0.0887 0.222 B_Memory L2
ENSG00000157216 SSBP3 554812 sc-eQTL 4.10e-01 -0.0682 0.0827 0.222 B_Memory L2
ENSG00000162402 USP24 -247073 sc-eQTL 9.87e-01 0.0013 0.081 0.222 B_Memory L2
ENSG00000215883 CYB5RL 768255 sc-eQTL 9.81e-01 -0.00236 0.1 0.222 B_Memory L2
ENSG00000243725 TTC4 252430 sc-eQTL 3.44e-02 -0.219 0.103 0.222 B_Memory L2
ENSG00000006555 TTC22 166968 sc-eQTL 5.84e-01 -0.0562 0.102 0.222 B_Naive1 L2
ENSG00000116133 DHCR24 81096 sc-eQTL 8.15e-01 -0.0225 0.096 0.222 B_Naive1 L2
ENSG00000116205 TCEANC2 914707 sc-eQTL 2.61e-01 -0.0963 0.0854 0.222 B_Naive1 L2
ENSG00000116209 TMEM59 914787 sc-eQTL 6.48e-01 0.0284 0.0622 0.222 B_Naive1 L2
ENSG00000116221 MRPL37 784250 sc-eQTL 9.76e-02 -0.152 0.0911 0.222 B_Naive1 L2
ENSG00000157216 SSBP3 554812 sc-eQTL 2.92e-02 0.19 0.0864 0.222 B_Naive1 L2
ENSG00000162402 USP24 -247073 sc-eQTL 5.31e-01 -0.0432 0.0688 0.222 B_Naive1 L2
ENSG00000215883 CYB5RL 768255 sc-eQTL 5.53e-01 -0.0617 0.104 0.222 B_Naive1 L2
ENSG00000243725 TTC4 252430 sc-eQTL 7.78e-01 -0.0264 0.0937 0.222 B_Naive1 L2
ENSG00000006555 TTC22 166968 sc-eQTL 9.72e-01 0.00368 0.104 0.221 B_Naive2 L2
ENSG00000116133 DHCR24 81096 sc-eQTL 9.87e-01 0.00146 0.0903 0.221 B_Naive2 L2
ENSG00000116205 TCEANC2 914707 sc-eQTL 9.31e-01 -0.00868 0.1 0.221 B_Naive2 L2
ENSG00000116209 TMEM59 914787 sc-eQTL 3.41e-01 0.0786 0.0824 0.221 B_Naive2 L2
ENSG00000116221 MRPL37 784250 sc-eQTL 4.63e-01 -0.0714 0.097 0.221 B_Naive2 L2
ENSG00000157216 SSBP3 554812 sc-eQTL 8.53e-01 0.0178 0.0957 0.221 B_Naive2 L2
ENSG00000162402 USP24 -247073 sc-eQTL 3.19e-01 0.0756 0.0757 0.221 B_Naive2 L2
ENSG00000215883 CYB5RL 768255 sc-eQTL 9.50e-01 0.00676 0.107 0.221 B_Naive2 L2
ENSG00000243725 TTC4 252430 sc-eQTL 9.97e-01 -0.000377 0.111 0.221 B_Naive2 L2
ENSG00000006555 TTC22 166968 sc-eQTL 8.26e-01 -0.0216 0.0982 0.218 CD4_CTL L2
ENSG00000116205 TCEANC2 914707 sc-eQTL 8.97e-01 -0.0131 0.101 0.218 CD4_CTL L2
ENSG00000116209 TMEM59 914787 sc-eQTL 7.94e-01 0.024 0.0919 0.218 CD4_CTL L2
ENSG00000116221 MRPL37 784250 sc-eQTL 6.27e-01 -0.055 0.113 0.218 CD4_CTL L2
ENSG00000157216 SSBP3 554812 sc-eQTL 6.68e-01 -0.0298 0.0695 0.218 CD4_CTL L2
ENSG00000162402 USP24 -247073 sc-eQTL 6.33e-02 -0.177 0.0947 0.218 CD4_CTL L2
ENSG00000243725 TTC4 252430 sc-eQTL 2.85e-01 -0.114 0.107 0.218 CD4_CTL L2
ENSG00000006555 TTC22 166968 sc-eQTL 2.75e-01 -0.0977 0.0893 0.222 CD4_Naive L2
ENSG00000116205 TCEANC2 914707 sc-eQTL 9.41e-01 0.00503 0.0682 0.222 CD4_Naive L2
ENSG00000116209 TMEM59 914787 sc-eQTL 6.40e-01 0.031 0.0663 0.222 CD4_Naive L2
ENSG00000116221 MRPL37 784250 sc-eQTL 2.17e-01 -0.105 0.0851 0.222 CD4_Naive L2
ENSG00000157216 SSBP3 554812 sc-eQTL 3.20e-01 0.0678 0.068 0.222 CD4_Naive L2
ENSG00000162402 USP24 -247073 sc-eQTL 6.24e-01 -0.0289 0.0588 0.222 CD4_Naive L2
ENSG00000243725 TTC4 252430 sc-eQTL 9.60e-01 -0.00452 0.0897 0.222 CD4_Naive L2
ENSG00000006555 TTC22 166968 sc-eQTL 9.30e-01 -0.0083 0.094 0.222 CD4_TCM L2
ENSG00000116205 TCEANC2 914707 sc-eQTL 3.26e-01 0.0898 0.0912 0.222 CD4_TCM L2
ENSG00000116209 TMEM59 914787 sc-eQTL 3.05e-01 0.0708 0.0688 0.222 CD4_TCM L2
ENSG00000116221 MRPL37 784250 sc-eQTL 2.32e-01 -0.104 0.0864 0.222 CD4_TCM L2
ENSG00000157216 SSBP3 554812 sc-eQTL 2.23e-01 -0.103 0.0847 0.222 CD4_TCM L2
ENSG00000162402 USP24 -247073 sc-eQTL 9.08e-01 0.00814 0.0705 0.222 CD4_TCM L2
ENSG00000243725 TTC4 252430 sc-eQTL 5.34e-02 -0.195 0.101 0.222 CD4_TCM L2
ENSG00000006555 TTC22 166968 sc-eQTL 9.79e-01 0.00282 0.106 0.222 CD4_TEM L2
ENSG00000116205 TCEANC2 914707 sc-eQTL 1.55e-01 -0.143 0.1 0.222 CD4_TEM L2
ENSG00000116209 TMEM59 914787 sc-eQTL 1.10e-01 0.124 0.0774 0.222 CD4_TEM L2
ENSG00000116221 MRPL37 784250 sc-eQTL 6.54e-02 -0.184 0.0994 0.222 CD4_TEM L2
ENSG00000157216 SSBP3 554812 sc-eQTL 6.31e-01 -0.0413 0.0858 0.222 CD4_TEM L2
ENSG00000162402 USP24 -247073 sc-eQTL 1.08e-01 -0.126 0.0777 0.222 CD4_TEM L2
ENSG00000243725 TTC4 252430 sc-eQTL 5.35e-01 0.0642 0.103 0.222 CD4_TEM L2
ENSG00000006555 TTC22 166968 sc-eQTL 3.59e-01 0.0781 0.085 0.222 CD8_CTL L2
ENSG00000116205 TCEANC2 914707 sc-eQTL 8.78e-02 -0.161 0.0937 0.222 CD8_CTL L2
ENSG00000116209 TMEM59 914787 sc-eQTL 2.96e-01 0.0858 0.0819 0.222 CD8_CTL L2
ENSG00000116221 MRPL37 784250 sc-eQTL 6.33e-01 0.0465 0.0972 0.222 CD8_CTL L2
ENSG00000157216 SSBP3 554812 sc-eQTL 8.97e-01 -0.00861 0.0665 0.222 CD8_CTL L2
ENSG00000162402 USP24 -247073 sc-eQTL 9.88e-01 -0.00102 0.0661 0.222 CD8_CTL L2
ENSG00000243725 TTC4 252430 sc-eQTL 5.58e-03 0.272 0.0971 0.222 CD8_CTL L2
ENSG00000006555 TTC22 166968 sc-eQTL 5.48e-01 -0.0575 0.0956 0.222 CD8_Naive L2
ENSG00000116205 TCEANC2 914707 sc-eQTL 6.28e-01 0.042 0.0865 0.222 CD8_Naive L2
ENSG00000116209 TMEM59 914787 sc-eQTL 1.42e-01 0.124 0.0842 0.222 CD8_Naive L2
ENSG00000116221 MRPL37 784250 sc-eQTL 3.85e-04 -0.356 0.0986 0.222 CD8_Naive L2
ENSG00000157216 SSBP3 554812 sc-eQTL 5.89e-01 0.0416 0.0768 0.222 CD8_Naive L2
ENSG00000162402 USP24 -247073 sc-eQTL 1.06e-01 0.113 0.0695 0.222 CD8_Naive L2
ENSG00000243725 TTC4 252430 sc-eQTL 9.02e-03 -0.265 0.101 0.222 CD8_Naive L2
ENSG00000006555 TTC22 166968 sc-eQTL 9.85e-01 0.00195 0.105 0.215 CD8_TCM L2
ENSG00000116205 TCEANC2 914707 sc-eQTL 6.84e-01 -0.0431 0.106 0.215 CD8_TCM L2
ENSG00000116209 TMEM59 914787 sc-eQTL 1.97e-01 0.12 0.0927 0.215 CD8_TCM L2
ENSG00000116221 MRPL37 784250 sc-eQTL 3.32e-01 0.102 0.105 0.215 CD8_TCM L2
ENSG00000157216 SSBP3 554812 sc-eQTL 4.98e-01 0.0621 0.0915 0.215 CD8_TCM L2
ENSG00000162402 USP24 -247073 sc-eQTL 6.33e-02 -0.164 0.088 0.215 CD8_TCM L2
ENSG00000243725 TTC4 252430 sc-eQTL 1.09e-01 -0.172 0.107 0.215 CD8_TCM L2
ENSG00000006555 TTC22 166968 sc-eQTL 7.09e-01 0.0374 0.0999 0.226 CD8_TEM L2
ENSG00000116205 TCEANC2 914707 sc-eQTL 9.20e-01 -0.0105 0.104 0.226 CD8_TEM L2
ENSG00000116209 TMEM59 914787 sc-eQTL 9.25e-01 0.00946 0.101 0.226 CD8_TEM L2
ENSG00000116221 MRPL37 784250 sc-eQTL 8.11e-01 -0.0245 0.102 0.226 CD8_TEM L2
ENSG00000157216 SSBP3 554812 sc-eQTL 6.91e-01 -0.0385 0.0966 0.226 CD8_TEM L2
ENSG00000162402 USP24 -247073 sc-eQTL 1.34e-01 0.152 0.101 0.226 CD8_TEM L2
ENSG00000243725 TTC4 252430 sc-eQTL 7.38e-01 0.0347 0.103 0.226 CD8_TEM L2
ENSG00000006555 TTC22 166968 sc-eQTL 9.61e-01 0.00453 0.0933 0.221 MAIT L2
ENSG00000116133 DHCR24 81096 sc-eQTL 2.45e-01 -0.0802 0.0689 0.221 MAIT L2
ENSG00000116205 TCEANC2 914707 sc-eQTL 3.66e-01 -0.088 0.097 0.221 MAIT L2
ENSG00000116209 TMEM59 914787 sc-eQTL 8.37e-02 0.152 0.0872 0.221 MAIT L2
ENSG00000116221 MRPL37 784250 sc-eQTL 8.21e-01 0.0242 0.107 0.221 MAIT L2
ENSG00000157216 SSBP3 554812 sc-eQTL 9.05e-01 -0.0113 0.0946 0.221 MAIT L2
ENSG00000162402 USP24 -247073 sc-eQTL 3.96e-01 -0.0714 0.0839 0.221 MAIT L2
ENSG00000215883 CYB5RL 768255 sc-eQTL 6.28e-01 0.0473 0.0976 0.221 MAIT L2
ENSG00000243725 TTC4 252430 sc-eQTL 8.73e-01 0.0155 0.0971 0.221 MAIT L2
ENSG00000006555 TTC22 166968 sc-eQTL 7.38e-01 -0.0349 0.104 0.22 NK_CD56bright L2
ENSG00000116133 DHCR24 81096 sc-eQTL 2.75e-01 -0.101 0.0918 0.22 NK_CD56bright L2
ENSG00000116205 TCEANC2 914707 sc-eQTL 1.97e-01 -0.125 0.0969 0.22 NK_CD56bright L2
ENSG00000116209 TMEM59 914787 sc-eQTL 9.59e-01 0.00488 0.0949 0.22 NK_CD56bright L2
ENSG00000116221 MRPL37 784250 sc-eQTL 8.30e-01 -0.0228 0.106 0.22 NK_CD56bright L2
ENSG00000157216 SSBP3 554812 sc-eQTL 3.34e-01 0.0771 0.0797 0.22 NK_CD56bright L2
ENSG00000162398 LEXM 162228 sc-eQTL 8.22e-01 -0.0212 0.0943 0.22 NK_CD56bright L2
ENSG00000162402 USP24 -247073 sc-eQTL 5.39e-01 -0.0499 0.0811 0.22 NK_CD56bright L2
ENSG00000243725 TTC4 252430 sc-eQTL 9.33e-01 -0.00863 0.102 0.22 NK_CD56bright L2
ENSG00000006555 TTC22 166968 sc-eQTL 1.62e-01 0.124 0.0881 0.224 NK_CD56dim L2
ENSG00000116133 DHCR24 81096 sc-eQTL 4.87e-01 -0.0642 0.0922 0.224 NK_CD56dim L2
ENSG00000116205 TCEANC2 914707 sc-eQTL 9.40e-01 0.00759 0.1 0.224 NK_CD56dim L2
ENSG00000116209 TMEM59 914787 sc-eQTL 3.33e-01 0.0719 0.074 0.224 NK_CD56dim L2
ENSG00000116221 MRPL37 784250 sc-eQTL 3.44e-01 -0.0913 0.0962 0.224 NK_CD56dim L2
ENSG00000157216 SSBP3 554812 sc-eQTL 5.23e-01 -0.0504 0.0789 0.224 NK_CD56dim L2
ENSG00000162398 LEXM 162228 sc-eQTL 7.34e-01 0.0309 0.0908 0.224 NK_CD56dim L2
ENSG00000162402 USP24 -247073 sc-eQTL 8.26e-01 0.0127 0.0577 0.224 NK_CD56dim L2
ENSG00000243725 TTC4 252430 sc-eQTL 3.98e-01 -0.0836 0.0986 0.224 NK_CD56dim L2
ENSG00000006555 TTC22 166968 sc-eQTL 3.66e-02 -0.215 0.102 0.226 NK_HLA L2
ENSG00000116133 DHCR24 81096 sc-eQTL 7.80e-01 -0.0281 0.101 0.226 NK_HLA L2
ENSG00000116205 TCEANC2 914707 sc-eQTL 1.93e-01 0.126 0.0968 0.226 NK_HLA L2
ENSG00000116209 TMEM59 914787 sc-eQTL 8.17e-01 0.0223 0.0965 0.226 NK_HLA L2
ENSG00000116221 MRPL37 784250 sc-eQTL 2.68e-02 -0.234 0.105 0.226 NK_HLA L2
ENSG00000157216 SSBP3 554812 sc-eQTL 3.46e-01 -0.0818 0.0866 0.226 NK_HLA L2
ENSG00000162398 LEXM 162228 sc-eQTL 5.55e-02 -0.187 0.097 0.226 NK_HLA L2
ENSG00000162402 USP24 -247073 sc-eQTL 4.87e-01 0.05 0.0718 0.226 NK_HLA L2
ENSG00000243725 TTC4 252430 sc-eQTL 5.74e-02 0.203 0.106 0.226 NK_HLA L2
ENSG00000006555 TTC22 166968 sc-eQTL 2.74e-01 0.102 0.0931 0.224 NK_cytokine L2
ENSG00000116133 DHCR24 81096 sc-eQTL 2.99e-01 -0.098 0.0942 0.224 NK_cytokine L2
ENSG00000116205 TCEANC2 914707 sc-eQTL 2.54e-02 0.209 0.0927 0.224 NK_cytokine L2
ENSG00000116209 TMEM59 914787 sc-eQTL 8.89e-02 0.129 0.0757 0.224 NK_cytokine L2
ENSG00000116221 MRPL37 784250 sc-eQTL 7.42e-01 -0.0309 0.0939 0.224 NK_cytokine L2
ENSG00000157216 SSBP3 554812 sc-eQTL 3.17e-02 -0.169 0.078 0.224 NK_cytokine L2
ENSG00000162398 LEXM 162228 sc-eQTL 9.91e-01 -0.00107 0.0985 0.224 NK_cytokine L2
ENSG00000162402 USP24 -247073 sc-eQTL 6.59e-02 -0.123 0.0666 0.224 NK_cytokine L2
ENSG00000243725 TTC4 252430 sc-eQTL 4.36e-01 0.0776 0.0994 0.224 NK_cytokine L2
ENSG00000006555 TTC22 166968 sc-eQTL 5.72e-01 -0.0641 0.113 0.256 PB L2
ENSG00000116133 DHCR24 81096 sc-eQTL 6.96e-02 0.181 0.099 0.256 PB L2
ENSG00000116205 TCEANC2 914707 sc-eQTL 3.32e-01 -0.119 0.122 0.256 PB L2
ENSG00000116209 TMEM59 914787 sc-eQTL 6.06e-02 0.0953 0.0503 0.256 PB L2
ENSG00000116221 MRPL37 784250 sc-eQTL 1.38e-01 -0.137 0.092 0.256 PB L2
ENSG00000157216 SSBP3 554812 sc-eQTL 1.42e-01 -0.157 0.106 0.256 PB L2
ENSG00000162402 USP24 -247073 sc-eQTL 6.28e-01 0.059 0.122 0.256 PB L2
ENSG00000215883 CYB5RL 768255 sc-eQTL 2.06e-01 0.159 0.125 0.256 PB L2
ENSG00000243725 TTC4 252430 sc-eQTL 8.40e-01 -0.0238 0.118 0.256 PB L2
ENSG00000006555 TTC22 166968 sc-eQTL 5.66e-01 0.0543 0.0944 0.222 Pro_T L2
ENSG00000116133 DHCR24 81096 sc-eQTL 1.21e-01 -0.124 0.0799 0.222 Pro_T L2
ENSG00000116205 TCEANC2 914707 sc-eQTL 2.14e-01 0.122 0.0977 0.222 Pro_T L2
ENSG00000116209 TMEM59 914787 sc-eQTL 5.21e-01 0.0437 0.068 0.222 Pro_T L2
ENSG00000116221 MRPL37 784250 sc-eQTL 3.34e-01 -0.0643 0.0665 0.222 Pro_T L2
ENSG00000157216 SSBP3 554812 sc-eQTL 4.79e-01 0.053 0.0746 0.222 Pro_T L2
ENSG00000162402 USP24 -247073 sc-eQTL 1.62e-01 0.127 0.0907 0.222 Pro_T L2
ENSG00000215883 CYB5RL 768255 sc-eQTL 5.01e-01 -0.0605 0.0899 0.222 Pro_T L2
ENSG00000243725 TTC4 252430 sc-eQTL 3.42e-01 -0.0952 0.0999 0.222 Pro_T L2
ENSG00000006555 TTC22 166968 sc-eQTL 4.46e-01 -0.0711 0.0932 0.222 Treg L2
ENSG00000116205 TCEANC2 914707 sc-eQTL 8.49e-01 0.0191 0.1 0.222 Treg L2
ENSG00000116209 TMEM59 914787 sc-eQTL 8.18e-01 -0.0182 0.0791 0.222 Treg L2
ENSG00000116221 MRPL37 784250 sc-eQTL 8.25e-02 -0.169 0.0971 0.222 Treg L2
ENSG00000157216 SSBP3 554812 sc-eQTL 3.95e-01 0.0743 0.0871 0.222 Treg L2
ENSG00000162402 USP24 -247073 sc-eQTL 2.73e-01 -0.0911 0.0829 0.222 Treg L2
ENSG00000243725 TTC4 252430 sc-eQTL 3.55e-01 -0.097 0.105 0.222 Treg L2
ENSG00000116133 DHCR24 81096 sc-eQTL 7.64e-01 -0.0263 0.0875 0.22 cDC L2
ENSG00000116205 TCEANC2 914707 sc-eQTL 7.64e-01 0.0311 0.103 0.22 cDC L2
ENSG00000116209 TMEM59 914787 sc-eQTL 8.02e-01 0.0221 0.0877 0.22 cDC L2
ENSG00000116221 MRPL37 784250 sc-eQTL 9.74e-02 0.186 0.111 0.22 cDC L2
ENSG00000157216 SSBP3 554812 sc-eQTL 1.41e-01 0.152 0.103 0.22 cDC L2
ENSG00000162390 ACOT11 426034 sc-eQTL 8.94e-01 -0.0128 0.0962 0.22 cDC L2
ENSG00000162402 USP24 -247073 sc-eQTL 4.40e-01 0.0834 0.108 0.22 cDC L2
ENSG00000215883 CYB5RL 768255 sc-eQTL 2.39e-01 -0.109 0.0923 0.22 cDC L2
ENSG00000243725 TTC4 252430 sc-eQTL 5.74e-01 0.0623 0.111 0.22 cDC L2
ENSG00000116133 DHCR24 81096 sc-eQTL 6.87e-01 0.0247 0.0612 0.222 cMono_IL1B L2
ENSG00000116205 TCEANC2 914707 sc-eQTL 3.73e-01 -0.0758 0.0849 0.222 cMono_IL1B L2
ENSG00000116209 TMEM59 914787 sc-eQTL 1.93e-01 -0.0671 0.0514 0.222 cMono_IL1B L2
ENSG00000116221 MRPL37 784250 sc-eQTL 6.11e-01 -0.0468 0.0918 0.222 cMono_IL1B L2
ENSG00000157216 SSBP3 554812 sc-eQTL 1.33e-01 0.141 0.0933 0.222 cMono_IL1B L2
ENSG00000162402 USP24 -247073 sc-eQTL 7.53e-01 -0.0219 0.0693 0.222 cMono_IL1B L2
ENSG00000243725 TTC4 252430 sc-eQTL 8.67e-01 0.0177 0.106 0.222 cMono_IL1B L2
ENSG00000116133 DHCR24 81096 sc-eQTL 8.17e-01 0.0134 0.0576 0.222 cMono_S100A L2
ENSG00000116205 TCEANC2 914707 sc-eQTL 1.03e-01 -0.143 0.0873 0.222 cMono_S100A L2
ENSG00000116209 TMEM59 914787 sc-eQTL 3.31e-01 -0.0684 0.0701 0.222 cMono_S100A L2
ENSG00000116221 MRPL37 784250 sc-eQTL 9.58e-01 -0.00536 0.102 0.222 cMono_S100A L2
ENSG00000157216 SSBP3 554812 sc-eQTL 3.55e-01 -0.0976 0.105 0.222 cMono_S100A L2
ENSG00000162402 USP24 -247073 sc-eQTL 6.53e-03 -0.23 0.0839 0.222 cMono_S100A L2
ENSG00000243725 TTC4 252430 sc-eQTL 6.69e-01 -0.0457 0.107 0.222 cMono_S100A L2
ENSG00000006555 TTC22 166968 sc-eQTL 4.63e-01 0.0711 0.0966 0.212 gdT L2
ENSG00000116133 DHCR24 81096 sc-eQTL 3.12e-01 -0.109 0.107 0.212 gdT L2
ENSG00000116205 TCEANC2 914707 sc-eQTL 5.38e-01 0.0668 0.108 0.212 gdT L2
ENSG00000116209 TMEM59 914787 sc-eQTL 6.86e-01 -0.0445 0.11 0.212 gdT L2
ENSG00000116221 MRPL37 784250 sc-eQTL 9.46e-01 -0.0085 0.126 0.212 gdT L2
ENSG00000157216 SSBP3 554812 sc-eQTL 2.47e-01 -0.0893 0.0768 0.212 gdT L2
ENSG00000162402 USP24 -247073 sc-eQTL 7.84e-01 -0.0285 0.104 0.212 gdT L2
ENSG00000215883 CYB5RL 768255 sc-eQTL 8.01e-02 0.188 0.107 0.212 gdT L2
ENSG00000243725 TTC4 252430 sc-eQTL 4.90e-02 -0.238 0.12 0.212 gdT L2
ENSG00000116133 DHCR24 81096 sc-eQTL 3.47e-02 -0.163 0.0765 0.231 intMono L2
ENSG00000116205 TCEANC2 914707 sc-eQTL 3.29e-01 -0.0941 0.0961 0.231 intMono L2
ENSG00000116209 TMEM59 914787 sc-eQTL 4.15e-01 0.0577 0.0707 0.231 intMono L2
ENSG00000116221 MRPL37 784250 sc-eQTL 4.10e-01 -0.0892 0.108 0.231 intMono L2
ENSG00000157216 SSBP3 554812 sc-eQTL 9.50e-01 -0.00687 0.111 0.231 intMono L2
ENSG00000162402 USP24 -247073 sc-eQTL 4.99e-01 -0.0667 0.0985 0.231 intMono L2
ENSG00000243725 TTC4 252430 sc-eQTL 3.27e-01 0.103 0.105 0.231 intMono L2
ENSG00000116133 DHCR24 81096 sc-eQTL 1.75e-01 -0.106 0.0776 0.219 ncMono L2
ENSG00000116205 TCEANC2 914707 sc-eQTL 6.82e-01 -0.04 0.0974 0.219 ncMono L2
ENSG00000116209 TMEM59 914787 sc-eQTL 8.21e-01 0.0176 0.078 0.219 ncMono L2
ENSG00000116221 MRPL37 784250 sc-eQTL 8.60e-01 0.0178 0.101 0.219 ncMono L2
ENSG00000157216 SSBP3 554812 sc-eQTL 6.71e-01 -0.0468 0.11 0.219 ncMono L2
ENSG00000162402 USP24 -247073 sc-eQTL 4.18e-01 0.0712 0.0878 0.219 ncMono L2
ENSG00000243725 TTC4 252430 sc-eQTL 5.00e-01 -0.0703 0.104 0.219 ncMono L2
ENSG00000116133 DHCR24 81096 sc-eQTL 7.26e-01 0.0328 0.0934 0.218 pDC L2
ENSG00000116205 TCEANC2 914707 sc-eQTL 3.76e-01 0.0992 0.112 0.218 pDC L2
ENSG00000116209 TMEM59 914787 sc-eQTL 4.66e-01 -0.0654 0.0894 0.218 pDC L2
ENSG00000116221 MRPL37 784250 sc-eQTL 9.12e-01 -0.0132 0.119 0.218 pDC L2
ENSG00000157216 SSBP3 554812 sc-eQTL 6.01e-01 0.0553 0.106 0.218 pDC L2
ENSG00000162390 ACOT11 426034 sc-eQTL 3.56e-01 0.041 0.0443 0.218 pDC L2
ENSG00000162402 USP24 -247073 sc-eQTL 8.86e-01 -0.0108 0.075 0.218 pDC L2
ENSG00000215883 CYB5RL 768255 sc-eQTL 8.99e-01 0.013 0.103 0.218 pDC L2
ENSG00000243725 TTC4 252430 sc-eQTL 3.43e-01 -0.112 0.118 0.218 pDC L2
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000006555 TTC22 166968 sc-eQTL 2.68e-01 0.108 0.0972 0.222 B_Memory LOneK1K
ENSG00000116133 DHCR24 81096 sc-eQTL 1.06e-01 -0.158 0.0973 0.222 B_Memory LOneK1K
ENSG00000116205 TCEANC2 914707 sc-eQTL 1.10e-01 0.151 0.094 0.222 B_Memory LOneK1K
ENSG00000116209 TMEM59 914787 sc-eQTL 7.01e-01 0.0283 0.0736 0.222 B_Memory LOneK1K
ENSG00000116221 MRPL37 784250 sc-eQTL 3.88e-01 -0.0761 0.088 0.222 B_Memory LOneK1K
ENSG00000157216 SSBP3 554812 sc-eQTL 1.41e-01 -0.113 0.0762 0.222 B_Memory LOneK1K
ENSG00000162402 USP24 -247073 sc-eQTL 9.26e-02 -0.117 0.0694 0.222 B_Memory LOneK1K
ENSG00000215883 CYB5RL 768255 sc-eQTL 4.65e-01 -0.0785 0.107 0.222 B_Memory LOneK1K
ENSG00000243725 TTC4 252430 sc-eQTL 8.46e-01 -0.0187 0.0964 0.222 B_Memory LOneK1K
ENSG00000006555 TTC22 166968 sc-eQTL 8.57e-01 -0.0185 0.103 0.222 B_Naive LOneK1K
ENSG00000116133 DHCR24 81096 sc-eQTL 9.86e-01 0.00159 0.0926 0.222 B_Naive LOneK1K
ENSG00000116205 TCEANC2 914707 sc-eQTL 4.78e-01 -0.0594 0.0835 0.222 B_Naive LOneK1K
ENSG00000116209 TMEM59 914787 sc-eQTL 2.23e-01 0.0723 0.0592 0.222 B_Naive LOneK1K
ENSG00000116221 MRPL37 784250 sc-eQTL 7.60e-02 -0.151 0.0848 0.222 B_Naive LOneK1K
ENSG00000157216 SSBP3 554812 sc-eQTL 2.32e-02 0.173 0.0755 0.222 B_Naive LOneK1K
ENSG00000162402 USP24 -247073 sc-eQTL 9.76e-01 -0.00195 0.0655 0.222 B_Naive LOneK1K
ENSG00000215883 CYB5RL 768255 sc-eQTL 8.42e-01 -0.0206 0.104 0.222 B_Naive LOneK1K
ENSG00000243725 TTC4 252430 sc-eQTL 8.83e-01 -0.0144 0.0976 0.222 B_Naive LOneK1K
ENSG00000116133 DHCR24 81096 sc-eQTL 2.94e-01 0.0624 0.0592 0.222 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000116205 TCEANC2 914707 sc-eQTL 1.21e-01 -0.115 0.0739 0.222 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000116209 TMEM59 914787 sc-eQTL 1.50e-01 -0.0736 0.051 0.222 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000116221 MRPL37 784250 sc-eQTL 6.27e-01 -0.0441 0.0907 0.222 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000157216 SSBP3 554812 sc-eQTL 5.82e-01 0.0523 0.0949 0.222 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000162402 USP24 -247073 sc-eQTL 1.47e-01 -0.0939 0.0646 0.222 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000243725 TTC4 252430 sc-eQTL 8.56e-01 -0.0195 0.108 0.222 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000116133 DHCR24 81096 sc-eQTL 7.42e-02 -0.132 0.0736 0.224 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000116205 TCEANC2 914707 sc-eQTL 2.88e-01 -0.103 0.0972 0.224 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000116209 TMEM59 914787 sc-eQTL 9.74e-01 0.00235 0.0725 0.224 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000116221 MRPL37 784250 sc-eQTL 9.87e-01 -0.00167 0.0993 0.224 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000157216 SSBP3 554812 sc-eQTL 7.26e-01 -0.0371 0.106 0.224 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000162402 USP24 -247073 sc-eQTL 9.18e-01 0.00859 0.0835 0.224 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000243725 TTC4 252430 sc-eQTL 8.33e-01 -0.0222 0.105 0.224 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000006555 TTC22 166968 sc-eQTL 5.32e-01 0.0538 0.0858 0.224 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000116133 DHCR24 81096 sc-eQTL 3.89e-01 -0.0773 0.0896 0.224 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000116205 TCEANC2 914707 sc-eQTL 2.16e-01 0.109 0.0877 0.224 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000116209 TMEM59 914787 sc-eQTL 8.52e-02 0.117 0.0676 0.224 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000116221 MRPL37 784250 sc-eQTL 2.89e-01 -0.0966 0.0909 0.224 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000157216 SSBP3 554812 sc-eQTL 1.24e-01 -0.115 0.0744 0.224 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000162398 LEXM 162228 sc-eQTL 7.53e-01 -0.0265 0.0843 0.224 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000162402 USP24 -247073 sc-eQTL 2.89e-01 -0.0567 0.0533 0.224 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000243725 TTC4 252430 sc-eQTL 9.02e-01 -0.0117 0.0952 0.224 NK_CD56dim LOneK1K

Statistical fine-mapping results from Japan COVID-19 Task Force
(Shown only for PIP>0.001)
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
PIP (SuSiE)
PIP (FINEMAP)
MAF
ENSG00000006555 TTC22 166968 eQTL 0.00326 -0.0521 0.0177 0.0 0.0 0.218

Expression Modifier Score(EMS) for GTEx 49tissues
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Whole Blood
Muscle Skeletal
Liver
Brain Cerebellum
Prostate
Spleen
Skin Sun Exposed Lower leg
Artery Coronary
Esophagus Muscularis
Esophagus Gastroesophageal Junction
Artery Tibial
Heart Atrial Appendage
Nerve Tibial
Heart Left Ventricle
Adrenal Gland
Adipose Visceral Omentum
Pancreas
Lung
Pituitary
Brain Nucleus accumbens basal ganglia
Colon Transverse
Adipose Subcutaneous
Esophagus Mucosa
Brain Cortex
Thyroid
Stomach
Breast Mammary Tissue
Colon Sigmoid
Skin Not Sun Exposed Suprapubic
Testis
Artery Aorta
Brain Amygdala
Brain Anterior cingulate cortex BA24
Brain Caudate basal ganglia
Brain Cerebellar Hemisphere
Brain Frontal Cortex BA9
Brain Hippocampus
Brain Hypothalamus
Brain Putamen basal ganglia
Brain Spinal cord cervical c-1
Brain Substantia nigra
Cells Cultured fibroblasts
Cells EBV-transformed lymphocytes
Kidney Cortex
Minor Salivary Gland
Ovary
Small Intestine Terminal Ileum
Uterus
Vagina