logo

Genes within 1Mb (chr1:54964961:G:A):

View on , UCSC , GTEx , gnomAD

Immune cell-type specific single cell cis-eQTLs in OASIS
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000006555 TTC22 163638 sc-eQTL 8.16e-01 0.0277 0.119 0.126 B L1
ENSG00000116133 DHCR24 77766 sc-eQTL 2.26e-01 0.136 0.112 0.126 B L1
ENSG00000116205 TCEANC2 911377 sc-eQTL 7.57e-01 -0.0301 0.0972 0.126 B L1
ENSG00000116209 TMEM59 911457 sc-eQTL 5.98e-01 0.0313 0.0592 0.126 B L1
ENSG00000116221 MRPL37 780920 sc-eQTL 4.42e-02 -0.155 0.0768 0.126 B L1
ENSG00000157216 SSBP3 551482 sc-eQTL 1.56e-01 -0.115 0.0808 0.126 B L1
ENSG00000162402 USP24 -250403 sc-eQTL 2.20e-01 -0.0843 0.0685 0.126 B L1
ENSG00000215883 CYB5RL 764925 sc-eQTL 1.85e-01 -0.175 0.132 0.126 B L1
ENSG00000243725 TTC4 249100 sc-eQTL 4.09e-01 -0.0952 0.115 0.126 B L1
ENSG00000006555 TTC22 163638 sc-eQTL 4.15e-01 -0.0766 0.0938 0.126 CD4T L1
ENSG00000116205 TCEANC2 911377 sc-eQTL 4.09e-01 -0.0635 0.0767 0.126 CD4T L1
ENSG00000116209 TMEM59 911457 sc-eQTL 1.54e-02 0.172 0.0706 0.126 CD4T L1
ENSG00000116221 MRPL37 780920 sc-eQTL 2.79e-03 -0.293 0.0969 0.126 CD4T L1
ENSG00000157216 SSBP3 551482 sc-eQTL 9.93e-02 0.135 0.0816 0.126 CD4T L1
ENSG00000162402 USP24 -250403 sc-eQTL 5.71e-01 -0.038 0.0669 0.126 CD4T L1
ENSG00000243725 TTC4 249100 sc-eQTL 3.83e-01 0.0879 0.101 0.126 CD4T L1
ENSG00000006555 TTC22 163638 sc-eQTL 8.66e-01 -0.0137 0.0812 0.126 CD8T L1
ENSG00000116205 TCEANC2 911377 sc-eQTL 9.46e-01 -0.00686 0.101 0.126 CD8T L1
ENSG00000116209 TMEM59 911457 sc-eQTL 1.03e-01 0.114 0.0698 0.126 CD8T L1
ENSG00000116221 MRPL37 780920 sc-eQTL 9.27e-02 -0.162 0.096 0.126 CD8T L1
ENSG00000157216 SSBP3 551482 sc-eQTL 6.61e-01 -0.0305 0.0694 0.126 CD8T L1
ENSG00000162402 USP24 -250403 sc-eQTL 7.25e-01 0.0237 0.0671 0.126 CD8T L1
ENSG00000243725 TTC4 249100 sc-eQTL 2.00e-01 0.149 0.116 0.126 CD8T L1
ENSG00000116133 DHCR24 77766 sc-eQTL 9.45e-01 -0.00774 0.113 0.119 DC L1
ENSG00000116205 TCEANC2 911377 sc-eQTL 3.96e-01 0.107 0.126 0.119 DC L1
ENSG00000116209 TMEM59 911457 sc-eQTL 3.23e-01 -0.0981 0.0989 0.119 DC L1
ENSG00000116221 MRPL37 780920 sc-eQTL 9.51e-01 -0.0082 0.133 0.119 DC L1
ENSG00000157216 SSBP3 551482 sc-eQTL 5.95e-01 0.0632 0.119 0.119 DC L1
ENSG00000162390 ACOT11 422704 sc-eQTL 7.03e-01 -0.0435 0.114 0.119 DC L1
ENSG00000162402 USP24 -250403 sc-eQTL 1.59e-01 0.0969 0.0686 0.119 DC L1
ENSG00000215883 CYB5RL 764925 sc-eQTL 8.53e-02 -0.214 0.124 0.119 DC L1
ENSG00000243725 TTC4 249100 sc-eQTL 7.87e-01 0.0362 0.134 0.119 DC L1
ENSG00000116133 DHCR24 77766 sc-eQTL 2.49e-01 0.0915 0.0791 0.126 Mono L1
ENSG00000116205 TCEANC2 911377 sc-eQTL 1.81e-01 -0.115 0.0853 0.126 Mono L1
ENSG00000116209 TMEM59 911457 sc-eQTL 4.72e-01 -0.0458 0.0635 0.126 Mono L1
ENSG00000116221 MRPL37 780920 sc-eQTL 6.93e-01 -0.042 0.106 0.126 Mono L1
ENSG00000157216 SSBP3 551482 sc-eQTL 4.99e-01 -0.0826 0.122 0.126 Mono L1
ENSG00000162402 USP24 -250403 sc-eQTL 3.37e-01 -0.0697 0.0725 0.126 Mono L1
ENSG00000243725 TTC4 249100 sc-eQTL 7.49e-01 -0.0409 0.128 0.126 Mono L1
ENSG00000006555 TTC22 163638 sc-eQTL 9.45e-01 -0.00742 0.107 0.127 NK L1
ENSG00000116133 DHCR24 77766 sc-eQTL 8.09e-01 -0.0262 0.108 0.127 NK L1
ENSG00000116205 TCEANC2 911377 sc-eQTL 1.83e-01 0.142 0.107 0.127 NK L1
ENSG00000116209 TMEM59 911457 sc-eQTL 6.47e-02 0.154 0.0831 0.127 NK L1
ENSG00000116221 MRPL37 780920 sc-eQTL 8.38e-01 -0.0213 0.104 0.127 NK L1
ENSG00000157216 SSBP3 551482 sc-eQTL 1.19e-01 -0.141 0.0898 0.127 NK L1
ENSG00000162398 LEXM 158898 sc-eQTL 1.82e-01 -0.135 0.101 0.127 NK L1
ENSG00000162402 USP24 -250403 sc-eQTL 9.66e-01 -0.00264 0.0615 0.127 NK L1
ENSG00000243725 TTC4 249100 sc-eQTL 8.33e-01 0.0246 0.116 0.127 NK L1
ENSG00000006555 TTC22 163638 sc-eQTL 8.82e-01 0.0143 0.096 0.126 Other_T L1
ENSG00000116133 DHCR24 77766 sc-eQTL 5.31e-03 -0.206 0.0732 0.126 Other_T L1
ENSG00000116205 TCEANC2 911377 sc-eQTL 6.65e-01 0.0484 0.111 0.126 Other_T L1
ENSG00000116209 TMEM59 911457 sc-eQTL 3.89e-01 0.0659 0.0764 0.126 Other_T L1
ENSG00000116221 MRPL37 780920 sc-eQTL 8.96e-01 -0.00936 0.0717 0.126 Other_T L1
ENSG00000157216 SSBP3 551482 sc-eQTL 3.31e-01 -0.0806 0.0827 0.126 Other_T L1
ENSG00000162402 USP24 -250403 sc-eQTL 5.16e-01 -0.0573 0.0882 0.126 Other_T L1
ENSG00000215883 CYB5RL 764925 sc-eQTL 6.03e-01 -0.0628 0.121 0.126 Other_T L1
ENSG00000243725 TTC4 249100 sc-eQTL 6.30e-01 0.0579 0.12 0.126 Other_T L1
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000006555 TTC22 163638 sc-eQTL 5.26e-01 -0.0646 0.102 0.133 B_Activated L2
ENSG00000116133 DHCR24 77766 sc-eQTL 8.05e-01 0.0296 0.12 0.133 B_Activated L2
ENSG00000116205 TCEANC2 911377 sc-eQTL 4.03e-01 0.107 0.128 0.133 B_Activated L2
ENSG00000116209 TMEM59 911457 sc-eQTL 7.90e-01 0.0365 0.136 0.133 B_Activated L2
ENSG00000116221 MRPL37 780920 sc-eQTL 2.03e-01 0.188 0.147 0.133 B_Activated L2
ENSG00000157216 SSBP3 551482 sc-eQTL 3.04e-01 -0.137 0.133 0.133 B_Activated L2
ENSG00000162402 USP24 -250403 sc-eQTL 5.74e-01 -0.0733 0.13 0.133 B_Activated L2
ENSG00000215883 CYB5RL 764925 sc-eQTL 5.35e-01 0.0713 0.115 0.133 B_Activated L2
ENSG00000243725 TTC4 249100 sc-eQTL 7.06e-01 0.0472 0.125 0.133 B_Activated L2
ENSG00000006555 TTC22 163638 sc-eQTL 4.27e-01 0.102 0.128 0.127 B_Intermediate L2
ENSG00000116133 DHCR24 77766 sc-eQTL 3.51e-01 0.111 0.119 0.127 B_Intermediate L2
ENSG00000116205 TCEANC2 911377 sc-eQTL 1.71e-01 0.163 0.118 0.127 B_Intermediate L2
ENSG00000116209 TMEM59 911457 sc-eQTL 3.23e-02 -0.217 0.101 0.127 B_Intermediate L2
ENSG00000116221 MRPL37 780920 sc-eQTL 1.14e-01 -0.189 0.119 0.127 B_Intermediate L2
ENSG00000157216 SSBP3 551482 sc-eQTL 2.11e-01 -0.14 0.111 0.127 B_Intermediate L2
ENSG00000162402 USP24 -250403 sc-eQTL 1.38e-01 -0.139 0.0937 0.127 B_Intermediate L2
ENSG00000215883 CYB5RL 764925 sc-eQTL 3.12e-01 -0.135 0.133 0.127 B_Intermediate L2
ENSG00000243725 TTC4 249100 sc-eQTL 9.22e-01 0.0118 0.121 0.127 B_Intermediate L2
ENSG00000006555 TTC22 163638 sc-eQTL 5.64e-01 0.0713 0.123 0.127 B_Memory L2
ENSG00000116133 DHCR24 77766 sc-eQTL 1.53e-01 -0.175 0.122 0.127 B_Memory L2
ENSG00000116205 TCEANC2 911377 sc-eQTL 7.52e-01 -0.0414 0.131 0.127 B_Memory L2
ENSG00000116209 TMEM59 911457 sc-eQTL 8.59e-01 0.0194 0.109 0.127 B_Memory L2
ENSG00000116221 MRPL37 780920 sc-eQTL 2.10e-01 -0.139 0.11 0.127 B_Memory L2
ENSG00000157216 SSBP3 551482 sc-eQTL 6.32e-01 -0.0496 0.103 0.127 B_Memory L2
ENSG00000162402 USP24 -250403 sc-eQTL 2.23e-01 0.123 0.101 0.127 B_Memory L2
ENSG00000215883 CYB5RL 764925 sc-eQTL 7.40e-01 -0.0416 0.125 0.127 B_Memory L2
ENSG00000243725 TTC4 249100 sc-eQTL 8.87e-03 -0.337 0.127 0.127 B_Memory L2
ENSG00000006555 TTC22 163638 sc-eQTL 9.74e-01 0.0041 0.127 0.126 B_Naive1 L2
ENSG00000116133 DHCR24 77766 sc-eQTL 8.32e-01 0.0253 0.119 0.126 B_Naive1 L2
ENSG00000116205 TCEANC2 911377 sc-eQTL 3.86e-01 -0.0923 0.106 0.126 B_Naive1 L2
ENSG00000116209 TMEM59 911457 sc-eQTL 8.49e-01 -0.0148 0.0773 0.126 B_Naive1 L2
ENSG00000116221 MRPL37 780920 sc-eQTL 4.55e-01 -0.0852 0.114 0.126 B_Naive1 L2
ENSG00000157216 SSBP3 551482 sc-eQTL 4.75e-01 0.0776 0.108 0.126 B_Naive1 L2
ENSG00000162402 USP24 -250403 sc-eQTL 5.44e-01 -0.0519 0.0854 0.126 B_Naive1 L2
ENSG00000215883 CYB5RL 764925 sc-eQTL 4.13e-01 -0.106 0.129 0.126 B_Naive1 L2
ENSG00000243725 TTC4 249100 sc-eQTL 6.18e-01 -0.0581 0.116 0.126 B_Naive1 L2
ENSG00000006555 TTC22 163638 sc-eQTL 6.22e-01 0.0628 0.127 0.127 B_Naive2 L2
ENSG00000116133 DHCR24 77766 sc-eQTL 8.44e-01 0.0218 0.111 0.127 B_Naive2 L2
ENSG00000116205 TCEANC2 911377 sc-eQTL 8.38e-01 -0.0251 0.123 0.127 B_Naive2 L2
ENSG00000116209 TMEM59 911457 sc-eQTL 3.40e-01 0.0968 0.101 0.127 B_Naive2 L2
ENSG00000116221 MRPL37 780920 sc-eQTL 9.07e-01 -0.0139 0.119 0.127 B_Naive2 L2
ENSG00000157216 SSBP3 551482 sc-eQTL 7.84e-01 -0.0322 0.117 0.127 B_Naive2 L2
ENSG00000162402 USP24 -250403 sc-eQTL 5.35e-01 0.0578 0.0931 0.127 B_Naive2 L2
ENSG00000215883 CYB5RL 764925 sc-eQTL 7.26e-01 -0.046 0.131 0.127 B_Naive2 L2
ENSG00000243725 TTC4 249100 sc-eQTL 3.35e-01 -0.132 0.136 0.127 B_Naive2 L2
ENSG00000006555 TTC22 163638 sc-eQTL 8.13e-01 -0.0287 0.121 0.125 CD4_CTL L2
ENSG00000116205 TCEANC2 911377 sc-eQTL 6.81e-01 0.0515 0.125 0.125 CD4_CTL L2
ENSG00000116209 TMEM59 911457 sc-eQTL 8.69e-01 -0.0188 0.114 0.125 CD4_CTL L2
ENSG00000116221 MRPL37 780920 sc-eQTL 2.62e-01 -0.157 0.139 0.125 CD4_CTL L2
ENSG00000157216 SSBP3 551482 sc-eQTL 5.33e-01 -0.0536 0.0858 0.125 CD4_CTL L2
ENSG00000162402 USP24 -250403 sc-eQTL 7.25e-02 -0.211 0.117 0.125 CD4_CTL L2
ENSG00000243725 TTC4 249100 sc-eQTL 6.15e-01 -0.0665 0.132 0.125 CD4_CTL L2
ENSG00000006555 TTC22 163638 sc-eQTL 1.11e-01 -0.179 0.112 0.126 CD4_Naive L2
ENSG00000116205 TCEANC2 911377 sc-eQTL 4.67e-01 -0.0623 0.0854 0.126 CD4_Naive L2
ENSG00000116209 TMEM59 911457 sc-eQTL 6.91e-02 0.151 0.0825 0.126 CD4_Naive L2
ENSG00000116221 MRPL37 780920 sc-eQTL 7.08e-03 -0.287 0.105 0.126 CD4_Naive L2
ENSG00000157216 SSBP3 551482 sc-eQTL 2.79e-01 0.0925 0.0853 0.126 CD4_Naive L2
ENSG00000162402 USP24 -250403 sc-eQTL 6.16e-01 -0.0371 0.0738 0.126 CD4_Naive L2
ENSG00000243725 TTC4 249100 sc-eQTL 2.54e-01 0.128 0.112 0.126 CD4_Naive L2
ENSG00000006555 TTC22 163638 sc-eQTL 5.01e-01 0.0795 0.118 0.126 CD4_TCM L2
ENSG00000116205 TCEANC2 911377 sc-eQTL 7.55e-01 0.0359 0.115 0.126 CD4_TCM L2
ENSG00000116209 TMEM59 911457 sc-eQTL 1.10e-01 0.138 0.086 0.126 CD4_TCM L2
ENSG00000116221 MRPL37 780920 sc-eQTL 2.28e-01 -0.131 0.109 0.126 CD4_TCM L2
ENSG00000157216 SSBP3 551482 sc-eQTL 3.89e-01 0.0919 0.107 0.126 CD4_TCM L2
ENSG00000162402 USP24 -250403 sc-eQTL 5.79e-01 0.0491 0.0884 0.126 CD4_TCM L2
ENSG00000243725 TTC4 249100 sc-eQTL 4.94e-01 -0.0872 0.127 0.126 CD4_TCM L2
ENSG00000006555 TTC22 163638 sc-eQTL 1.20e-01 -0.207 0.133 0.126 CD4_TEM L2
ENSG00000116205 TCEANC2 911377 sc-eQTL 7.98e-02 -0.221 0.126 0.126 CD4_TEM L2
ENSG00000116209 TMEM59 911457 sc-eQTL 3.40e-01 0.0936 0.0979 0.126 CD4_TEM L2
ENSG00000116221 MRPL37 780920 sc-eQTL 1.93e-01 -0.164 0.126 0.126 CD4_TEM L2
ENSG00000157216 SSBP3 551482 sc-eQTL 8.24e-01 0.024 0.108 0.126 CD4_TEM L2
ENSG00000162402 USP24 -250403 sc-eQTL 8.34e-02 -0.17 0.0978 0.126 CD4_TEM L2
ENSG00000243725 TTC4 249100 sc-eQTL 1.77e-01 0.175 0.13 0.126 CD4_TEM L2
ENSG00000006555 TTC22 163638 sc-eQTL 2.37e-01 0.126 0.106 0.126 CD8_CTL L2
ENSG00000116205 TCEANC2 911377 sc-eQTL 2.34e-01 -0.14 0.117 0.126 CD8_CTL L2
ENSG00000116209 TMEM59 911457 sc-eQTL 9.59e-02 0.17 0.102 0.126 CD8_CTL L2
ENSG00000116221 MRPL37 780920 sc-eQTL 8.04e-01 0.0302 0.121 0.126 CD8_CTL L2
ENSG00000157216 SSBP3 551482 sc-eQTL 9.01e-01 -0.0104 0.0829 0.126 CD8_CTL L2
ENSG00000162402 USP24 -250403 sc-eQTL 4.53e-01 -0.0618 0.0823 0.126 CD8_CTL L2
ENSG00000243725 TTC4 249100 sc-eQTL 1.33e-02 0.304 0.122 0.126 CD8_CTL L2
ENSG00000006555 TTC22 163638 sc-eQTL 1.96e-01 -0.156 0.12 0.126 CD8_Naive L2
ENSG00000116205 TCEANC2 911377 sc-eQTL 8.43e-01 0.0216 0.109 0.126 CD8_Naive L2
ENSG00000116209 TMEM59 911457 sc-eQTL 2.26e-01 0.129 0.106 0.126 CD8_Naive L2
ENSG00000116221 MRPL37 780920 sc-eQTL 5.49e-03 -0.353 0.126 0.126 CD8_Naive L2
ENSG00000157216 SSBP3 551482 sc-eQTL 6.32e-01 0.0464 0.0968 0.126 CD8_Naive L2
ENSG00000162402 USP24 -250403 sc-eQTL 9.90e-02 0.145 0.0875 0.126 CD8_Naive L2
ENSG00000243725 TTC4 249100 sc-eQTL 1.95e-01 -0.167 0.128 0.126 CD8_Naive L2
ENSG00000006555 TTC22 163638 sc-eQTL 6.17e-01 -0.0673 0.134 0.125 CD8_TCM L2
ENSG00000116205 TCEANC2 911377 sc-eQTL 8.56e-01 0.0245 0.135 0.125 CD8_TCM L2
ENSG00000116209 TMEM59 911457 sc-eQTL 3.73e-01 0.106 0.119 0.125 CD8_TCM L2
ENSG00000116221 MRPL37 780920 sc-eQTL 4.51e-01 -0.102 0.135 0.125 CD8_TCM L2
ENSG00000157216 SSBP3 551482 sc-eQTL 3.52e-01 0.109 0.117 0.125 CD8_TCM L2
ENSG00000162402 USP24 -250403 sc-eQTL 1.03e-01 -0.185 0.113 0.125 CD8_TCM L2
ENSG00000243725 TTC4 249100 sc-eQTL 7.36e-01 -0.0466 0.138 0.125 CD8_TCM L2
ENSG00000006555 TTC22 163638 sc-eQTL 4.86e-01 0.0876 0.126 0.126 CD8_TEM L2
ENSG00000116205 TCEANC2 911377 sc-eQTL 5.70e-01 -0.0747 0.131 0.126 CD8_TEM L2
ENSG00000116209 TMEM59 911457 sc-eQTL 8.90e-01 -0.0176 0.127 0.126 CD8_TEM L2
ENSG00000116221 MRPL37 780920 sc-eQTL 5.36e-01 -0.0796 0.128 0.126 CD8_TEM L2
ENSG00000157216 SSBP3 551482 sc-eQTL 9.80e-01 -0.00312 0.122 0.126 CD8_TEM L2
ENSG00000162402 USP24 -250403 sc-eQTL 6.53e-01 0.0578 0.128 0.126 CD8_TEM L2
ENSG00000243725 TTC4 249100 sc-eQTL 4.57e-01 0.0969 0.13 0.126 CD8_TEM L2
ENSG00000006555 TTC22 163638 sc-eQTL 8.73e-01 -0.0184 0.115 0.123 MAIT L2
ENSG00000116133 DHCR24 77766 sc-eQTL 1.30e-01 -0.128 0.0844 0.123 MAIT L2
ENSG00000116205 TCEANC2 911377 sc-eQTL 7.55e-01 -0.0374 0.119 0.123 MAIT L2
ENSG00000116209 TMEM59 911457 sc-eQTL 1.31e-01 0.163 0.107 0.123 MAIT L2
ENSG00000116221 MRPL37 780920 sc-eQTL 5.99e-01 0.0691 0.131 0.123 MAIT L2
ENSG00000157216 SSBP3 551482 sc-eQTL 7.84e-01 -0.0319 0.116 0.123 MAIT L2
ENSG00000162402 USP24 -250403 sc-eQTL 1.40e-01 -0.152 0.103 0.123 MAIT L2
ENSG00000215883 CYB5RL 764925 sc-eQTL 6.99e-01 0.0465 0.12 0.123 MAIT L2
ENSG00000243725 TTC4 249100 sc-eQTL 4.24e-01 -0.0954 0.119 0.123 MAIT L2
ENSG00000006555 TTC22 163638 sc-eQTL 9.31e-02 -0.221 0.131 0.129 NK_CD56bright L2
ENSG00000116133 DHCR24 77766 sc-eQTL 2.84e-01 -0.125 0.116 0.129 NK_CD56bright L2
ENSG00000116205 TCEANC2 911377 sc-eQTL 2.13e-01 -0.153 0.123 0.129 NK_CD56bright L2
ENSG00000116209 TMEM59 911457 sc-eQTL 9.18e-01 -0.0124 0.12 0.129 NK_CD56bright L2
ENSG00000116221 MRPL37 780920 sc-eQTL 7.74e-01 -0.0387 0.134 0.129 NK_CD56bright L2
ENSG00000157216 SSBP3 551482 sc-eQTL 6.91e-01 0.0404 0.101 0.129 NK_CD56bright L2
ENSG00000162398 LEXM 158898 sc-eQTL 5.05e-01 -0.0798 0.119 0.129 NK_CD56bright L2
ENSG00000162402 USP24 -250403 sc-eQTL 5.07e-01 -0.0683 0.103 0.129 NK_CD56bright L2
ENSG00000243725 TTC4 249100 sc-eQTL 8.35e-01 -0.0271 0.13 0.129 NK_CD56bright L2
ENSG00000006555 TTC22 163638 sc-eQTL 5.00e-02 0.212 0.107 0.127 NK_CD56dim L2
ENSG00000116133 DHCR24 77766 sc-eQTL 9.43e-01 -0.00806 0.113 0.127 NK_CD56dim L2
ENSG00000116205 TCEANC2 911377 sc-eQTL 2.12e-01 0.153 0.122 0.127 NK_CD56dim L2
ENSG00000116209 TMEM59 911457 sc-eQTL 1.34e-01 0.136 0.0903 0.127 NK_CD56dim L2
ENSG00000116221 MRPL37 780920 sc-eQTL 5.31e-01 -0.074 0.118 0.127 NK_CD56dim L2
ENSG00000157216 SSBP3 551482 sc-eQTL 1.61e-01 -0.135 0.0962 0.127 NK_CD56dim L2
ENSG00000162398 LEXM 158898 sc-eQTL 5.26e-01 -0.0706 0.111 0.127 NK_CD56dim L2
ENSG00000162402 USP24 -250403 sc-eQTL 6.85e-01 0.0287 0.0706 0.127 NK_CD56dim L2
ENSG00000243725 TTC4 249100 sc-eQTL 2.64e-01 -0.135 0.121 0.127 NK_CD56dim L2
ENSG00000006555 TTC22 163638 sc-eQTL 5.11e-03 -0.361 0.128 0.128 NK_HLA L2
ENSG00000116133 DHCR24 77766 sc-eQTL 5.42e-01 -0.0774 0.127 0.128 NK_HLA L2
ENSG00000116205 TCEANC2 911377 sc-eQTL 3.49e-01 0.115 0.122 0.128 NK_HLA L2
ENSG00000116209 TMEM59 911457 sc-eQTL 4.75e-01 0.087 0.121 0.128 NK_HLA L2
ENSG00000116221 MRPL37 780920 sc-eQTL 6.25e-01 -0.0656 0.134 0.128 NK_HLA L2
ENSG00000157216 SSBP3 551482 sc-eQTL 1.98e-01 -0.141 0.109 0.128 NK_HLA L2
ENSG00000162398 LEXM 158898 sc-eQTL 2.04e-01 -0.157 0.123 0.128 NK_HLA L2
ENSG00000162402 USP24 -250403 sc-eQTL 9.34e-02 0.152 0.0899 0.128 NK_HLA L2
ENSG00000243725 TTC4 249100 sc-eQTL 2.96e-01 0.141 0.135 0.128 NK_HLA L2
ENSG00000006555 TTC22 163638 sc-eQTL 7.11e-01 0.0429 0.116 0.127 NK_cytokine L2
ENSG00000116133 DHCR24 77766 sc-eQTL 6.06e-01 -0.0604 0.117 0.127 NK_cytokine L2
ENSG00000116205 TCEANC2 911377 sc-eQTL 1.15e-01 0.183 0.115 0.127 NK_cytokine L2
ENSG00000116209 TMEM59 911457 sc-eQTL 2.00e-01 0.121 0.0941 0.127 NK_cytokine L2
ENSG00000116221 MRPL37 780920 sc-eQTL 9.27e-01 -0.0107 0.116 0.127 NK_cytokine L2
ENSG00000157216 SSBP3 551482 sc-eQTL 7.62e-02 -0.173 0.0969 0.127 NK_cytokine L2
ENSG00000162398 LEXM 158898 sc-eQTL 8.24e-01 -0.0272 0.122 0.127 NK_cytokine L2
ENSG00000162402 USP24 -250403 sc-eQTL 6.09e-01 -0.0426 0.0831 0.127 NK_cytokine L2
ENSG00000243725 TTC4 249100 sc-eQTL 6.37e-02 0.228 0.122 0.127 NK_cytokine L2
ENSG00000006555 TTC22 163638 sc-eQTL 6.18e-01 0.0671 0.134 0.152 PB L2
ENSG00000116133 DHCR24 77766 sc-eQTL 5.43e-01 0.0725 0.119 0.152 PB L2
ENSG00000116205 TCEANC2 911377 sc-eQTL 8.62e-01 0.0252 0.145 0.152 PB L2
ENSG00000116209 TMEM59 911457 sc-eQTL 3.51e-02 0.127 0.0593 0.152 PB L2
ENSG00000116221 MRPL37 780920 sc-eQTL 1.80e-02 -0.257 0.107 0.152 PB L2
ENSG00000157216 SSBP3 551482 sc-eQTL 1.27e-01 -0.193 0.126 0.152 PB L2
ENSG00000162402 USP24 -250403 sc-eQTL 7.28e-01 -0.0502 0.144 0.152 PB L2
ENSG00000215883 CYB5RL 764925 sc-eQTL 5.12e-01 0.0982 0.149 0.152 PB L2
ENSG00000243725 TTC4 249100 sc-eQTL 5.78e-01 -0.0778 0.139 0.152 PB L2
ENSG00000006555 TTC22 163638 sc-eQTL 8.49e-01 -0.0224 0.118 0.128 Pro_T L2
ENSG00000116133 DHCR24 77766 sc-eQTL 3.75e-02 -0.207 0.0989 0.128 Pro_T L2
ENSG00000116205 TCEANC2 911377 sc-eQTL 1.92e-01 0.159 0.121 0.128 Pro_T L2
ENSG00000116209 TMEM59 911457 sc-eQTL 7.48e-01 0.0272 0.0846 0.128 Pro_T L2
ENSG00000116221 MRPL37 780920 sc-eQTL 5.12e-01 -0.0544 0.0828 0.128 Pro_T L2
ENSG00000157216 SSBP3 551482 sc-eQTL 7.89e-01 -0.0249 0.0929 0.128 Pro_T L2
ENSG00000162402 USP24 -250403 sc-eQTL 2.11e-01 0.142 0.113 0.128 Pro_T L2
ENSG00000215883 CYB5RL 764925 sc-eQTL 4.33e-01 -0.0877 0.112 0.128 Pro_T L2
ENSG00000243725 TTC4 249100 sc-eQTL 9.92e-01 0.0013 0.124 0.128 Pro_T L2
ENSG00000006555 TTC22 163638 sc-eQTL 9.73e-02 -0.193 0.116 0.126 Treg L2
ENSG00000116205 TCEANC2 911377 sc-eQTL 8.86e-01 -0.0179 0.125 0.126 Treg L2
ENSG00000116209 TMEM59 911457 sc-eQTL 7.55e-01 0.0309 0.0988 0.126 Treg L2
ENSG00000116221 MRPL37 780920 sc-eQTL 3.04e-01 -0.126 0.122 0.126 Treg L2
ENSG00000157216 SSBP3 551482 sc-eQTL 6.24e-01 -0.0536 0.109 0.126 Treg L2
ENSG00000162402 USP24 -250403 sc-eQTL 7.03e-01 0.0397 0.104 0.126 Treg L2
ENSG00000243725 TTC4 249100 sc-eQTL 8.77e-01 -0.0203 0.131 0.126 Treg L2
ENSG00000116133 DHCR24 77766 sc-eQTL 5.73e-01 -0.0623 0.11 0.122 cDC L2
ENSG00000116205 TCEANC2 911377 sc-eQTL 7.99e-01 0.0333 0.13 0.122 cDC L2
ENSG00000116209 TMEM59 911457 sc-eQTL 2.16e-01 -0.137 0.11 0.122 cDC L2
ENSG00000116221 MRPL37 780920 sc-eQTL 3.40e-01 0.135 0.141 0.122 cDC L2
ENSG00000157216 SSBP3 551482 sc-eQTL 5.11e-01 0.086 0.13 0.122 cDC L2
ENSG00000162390 ACOT11 422704 sc-eQTL 5.01e-01 -0.0818 0.121 0.122 cDC L2
ENSG00000162402 USP24 -250403 sc-eQTL 2.59e-01 0.154 0.136 0.122 cDC L2
ENSG00000215883 CYB5RL 764925 sc-eQTL 3.60e-02 -0.244 0.116 0.122 cDC L2
ENSG00000243725 TTC4 249100 sc-eQTL 9.27e-02 0.234 0.139 0.122 cDC L2
ENSG00000116133 DHCR24 77766 sc-eQTL 3.67e-01 0.0697 0.077 0.126 cMono_IL1B L2
ENSG00000116205 TCEANC2 911377 sc-eQTL 4.36e-01 -0.0836 0.107 0.126 cMono_IL1B L2
ENSG00000116209 TMEM59 911457 sc-eQTL 7.67e-01 -0.0193 0.065 0.126 cMono_IL1B L2
ENSG00000116221 MRPL37 780920 sc-eQTL 3.75e-01 -0.103 0.116 0.126 cMono_IL1B L2
ENSG00000157216 SSBP3 551482 sc-eQTL 5.88e-01 0.0641 0.118 0.126 cMono_IL1B L2
ENSG00000162402 USP24 -250403 sc-eQTL 8.33e-01 -0.0185 0.0873 0.126 cMono_IL1B L2
ENSG00000243725 TTC4 249100 sc-eQTL 5.19e-01 -0.0862 0.133 0.126 cMono_IL1B L2
ENSG00000116133 DHCR24 77766 sc-eQTL 3.32e-01 0.07 0.072 0.126 cMono_S100A L2
ENSG00000116205 TCEANC2 911377 sc-eQTL 3.06e-01 -0.113 0.11 0.126 cMono_S100A L2
ENSG00000116209 TMEM59 911457 sc-eQTL 5.34e-01 -0.0549 0.0881 0.126 cMono_S100A L2
ENSG00000116221 MRPL37 780920 sc-eQTL 7.99e-01 0.0325 0.127 0.126 cMono_S100A L2
ENSG00000157216 SSBP3 551482 sc-eQTL 2.02e-01 -0.169 0.132 0.126 cMono_S100A L2
ENSG00000162402 USP24 -250403 sc-eQTL 3.49e-02 -0.225 0.106 0.126 cMono_S100A L2
ENSG00000243725 TTC4 249100 sc-eQTL 7.52e-01 0.0424 0.134 0.126 cMono_S100A L2
ENSG00000006555 TTC22 163638 sc-eQTL 8.88e-01 0.0172 0.122 0.124 gdT L2
ENSG00000116133 DHCR24 77766 sc-eQTL 2.56e-01 -0.154 0.135 0.124 gdT L2
ENSG00000116205 TCEANC2 911377 sc-eQTL 1.41e-01 0.201 0.136 0.124 gdT L2
ENSG00000116209 TMEM59 911457 sc-eQTL 7.27e-01 -0.0485 0.139 0.124 gdT L2
ENSG00000116221 MRPL37 780920 sc-eQTL 7.22e-01 -0.0566 0.159 0.124 gdT L2
ENSG00000157216 SSBP3 551482 sc-eQTL 2.23e-01 -0.118 0.0968 0.124 gdT L2
ENSG00000162402 USP24 -250403 sc-eQTL 7.82e-01 -0.0363 0.131 0.124 gdT L2
ENSG00000215883 CYB5RL 764925 sc-eQTL 8.30e-01 -0.0292 0.136 0.124 gdT L2
ENSG00000243725 TTC4 249100 sc-eQTL 1.10e-01 -0.244 0.152 0.124 gdT L2
ENSG00000116133 DHCR24 77766 sc-eQTL 1.84e-02 -0.229 0.0962 0.131 intMono L2
ENSG00000116205 TCEANC2 911377 sc-eQTL 2.17e-01 0.15 0.121 0.131 intMono L2
ENSG00000116209 TMEM59 911457 sc-eQTL 9.65e-01 0.00391 0.0892 0.131 intMono L2
ENSG00000116221 MRPL37 780920 sc-eQTL 6.62e-01 -0.0597 0.136 0.131 intMono L2
ENSG00000157216 SSBP3 551482 sc-eQTL 6.48e-01 -0.0637 0.139 0.131 intMono L2
ENSG00000162402 USP24 -250403 sc-eQTL 4.02e-01 0.104 0.124 0.131 intMono L2
ENSG00000243725 TTC4 249100 sc-eQTL 2.47e-01 0.153 0.132 0.131 intMono L2
ENSG00000116133 DHCR24 77766 sc-eQTL 1.97e-02 -0.23 0.0978 0.122 ncMono L2
ENSG00000116205 TCEANC2 911377 sc-eQTL 2.39e-01 -0.146 0.124 0.122 ncMono L2
ENSG00000116209 TMEM59 911457 sc-eQTL 6.28e-01 -0.0481 0.0992 0.122 ncMono L2
ENSG00000116221 MRPL37 780920 sc-eQTL 2.47e-02 0.286 0.126 0.122 ncMono L2
ENSG00000157216 SSBP3 551482 sc-eQTL 6.31e-01 -0.0673 0.14 0.122 ncMono L2
ENSG00000162402 USP24 -250403 sc-eQTL 5.33e-01 0.0697 0.112 0.122 ncMono L2
ENSG00000243725 TTC4 249100 sc-eQTL 6.09e-01 0.0678 0.132 0.122 ncMono L2
ENSG00000116133 DHCR24 77766 sc-eQTL 4.79e-01 0.0855 0.121 0.119 pDC L2
ENSG00000116205 TCEANC2 911377 sc-eQTL 6.32e-01 0.0696 0.145 0.119 pDC L2
ENSG00000116209 TMEM59 911457 sc-eQTL 4.03e-01 -0.0968 0.115 0.119 pDC L2
ENSG00000116221 MRPL37 780920 sc-eQTL 7.72e-01 -0.0445 0.154 0.119 pDC L2
ENSG00000157216 SSBP3 551482 sc-eQTL 5.08e-01 0.0904 0.136 0.119 pDC L2
ENSG00000162390 ACOT11 422704 sc-eQTL 7.90e-01 -0.0153 0.0574 0.119 pDC L2
ENSG00000162402 USP24 -250403 sc-eQTL 4.73e-01 0.0697 0.0968 0.119 pDC L2
ENSG00000215883 CYB5RL 764925 sc-eQTL 5.32e-01 -0.0829 0.132 0.119 pDC L2
ENSG00000243725 TTC4 249100 sc-eQTL 2.61e-01 -0.172 0.152 0.119 pDC L2
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000006555 TTC22 163638 sc-eQTL 9.79e-01 -0.00325 0.123 0.126 B_Memory LOneK1K
ENSG00000116133 DHCR24 77766 sc-eQTL 9.96e-01 0.00056 0.123 0.126 B_Memory LOneK1K
ENSG00000116205 TCEANC2 911377 sc-eQTL 6.39e-01 0.0559 0.119 0.126 B_Memory LOneK1K
ENSG00000116209 TMEM59 911457 sc-eQTL 3.57e-01 -0.0855 0.0925 0.126 B_Memory LOneK1K
ENSG00000116221 MRPL37 780920 sc-eQTL 5.76e-02 -0.21 0.11 0.126 B_Memory LOneK1K
ENSG00000157216 SSBP3 551482 sc-eQTL 1.69e-01 -0.133 0.0961 0.126 B_Memory LOneK1K
ENSG00000162402 USP24 -250403 sc-eQTL 4.04e-01 -0.0734 0.0879 0.126 B_Memory LOneK1K
ENSG00000215883 CYB5RL 764925 sc-eQTL 3.23e-01 -0.134 0.135 0.126 B_Memory LOneK1K
ENSG00000243725 TTC4 249100 sc-eQTL 4.40e-01 -0.0938 0.121 0.126 B_Memory LOneK1K
ENSG00000006555 TTC22 163638 sc-eQTL 6.53e-01 0.0576 0.128 0.126 B_Naive LOneK1K
ENSG00000116133 DHCR24 77766 sc-eQTL 5.75e-01 0.0648 0.115 0.126 B_Naive LOneK1K
ENSG00000116205 TCEANC2 911377 sc-eQTL 5.51e-01 -0.0621 0.104 0.126 B_Naive LOneK1K
ENSG00000116209 TMEM59 911457 sc-eQTL 5.26e-01 0.047 0.074 0.126 B_Naive LOneK1K
ENSG00000116221 MRPL37 780920 sc-eQTL 2.60e-01 -0.12 0.106 0.126 B_Naive LOneK1K
ENSG00000157216 SSBP3 551482 sc-eQTL 4.75e-01 0.0681 0.0952 0.126 B_Naive LOneK1K
ENSG00000162402 USP24 -250403 sc-eQTL 7.44e-01 -0.0267 0.0817 0.126 B_Naive LOneK1K
ENSG00000215883 CYB5RL 764925 sc-eQTL 4.86e-01 -0.0902 0.129 0.126 B_Naive LOneK1K
ENSG00000243725 TTC4 249100 sc-eQTL 5.67e-01 -0.0697 0.122 0.126 B_Naive LOneK1K
ENSG00000116133 DHCR24 77766 sc-eQTL 1.38e-01 0.111 0.0742 0.126 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000116205 TCEANC2 911377 sc-eQTL 3.73e-01 -0.0832 0.0932 0.126 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000116209 TMEM59 911457 sc-eQTL 5.12e-01 -0.0422 0.0643 0.126 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000116221 MRPL37 780920 sc-eQTL 4.64e-01 -0.0835 0.114 0.126 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000157216 SSBP3 551482 sc-eQTL 8.09e-01 -0.0289 0.119 0.126 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000162402 USP24 -250403 sc-eQTL 3.41e-01 -0.0776 0.0814 0.126 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000243725 TTC4 249100 sc-eQTL 5.42e-01 -0.0826 0.135 0.126 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000116133 DHCR24 77766 sc-eQTL 4.41e-02 -0.188 0.0926 0.127 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000116205 TCEANC2 911377 sc-eQTL 9.68e-01 0.00499 0.123 0.127 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000116209 TMEM59 911457 sc-eQTL 4.18e-01 -0.074 0.0913 0.127 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000116221 MRPL37 780920 sc-eQTL 1.72e-01 0.171 0.125 0.127 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000157216 SSBP3 551482 sc-eQTL 5.29e-01 -0.0841 0.133 0.127 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000162402 USP24 -250403 sc-eQTL 3.78e-01 0.0928 0.105 0.127 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000243725 TTC4 249100 sc-eQTL 2.44e-01 0.154 0.132 0.127 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000006555 TTC22 163638 sc-eQTL 7.82e-01 0.0291 0.105 0.127 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000116133 DHCR24 77766 sc-eQTL 9.47e-01 0.00737 0.11 0.127 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000116205 TCEANC2 911377 sc-eQTL 1.00e-01 0.177 0.107 0.127 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000116209 TMEM59 911457 sc-eQTL 3.40e-02 0.176 0.0826 0.127 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000116221 MRPL37 780920 sc-eQTL 8.59e-01 -0.0198 0.112 0.127 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000157216 SSBP3 551482 sc-eQTL 6.84e-02 -0.167 0.091 0.127 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000162398 LEXM 158898 sc-eQTL 3.04e-01 -0.106 0.103 0.127 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000162402 USP24 -250403 sc-eQTL 8.46e-01 0.0128 0.0656 0.127 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000243725 TTC4 249100 sc-eQTL 9.58e-01 0.00615 0.117 0.127 NK_CD56dim LOneK1K

Statistical fine-mapping results from Japan COVID-19 Task Force
(Shown only for PIP>0.001)
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
PIP (SuSiE)
PIP (FINEMAP)
MAF
ENSG00000006555 TTC22 163638 eQTL 0.000806 -0.074 0.022 0.0 0.0 0.128

Expression Modifier Score(EMS) for GTEx 49tissues
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Whole Blood
Muscle Skeletal
Liver
Brain Cerebellum
Prostate
Spleen
Skin Sun Exposed Lower leg
Artery Coronary
Esophagus Muscularis
Esophagus Gastroesophageal Junction
Artery Tibial
Heart Atrial Appendage
Nerve Tibial
Heart Left Ventricle
Adrenal Gland
Adipose Visceral Omentum
Pancreas
Lung
Pituitary
Brain Nucleus accumbens basal ganglia
Colon Transverse
Adipose Subcutaneous
Esophagus Mucosa
Brain Cortex
Thyroid
Stomach
Breast Mammary Tissue
Colon Sigmoid
Skin Not Sun Exposed Suprapubic
Testis
Artery Aorta
Brain Amygdala
Brain Anterior cingulate cortex BA24
Brain Caudate basal ganglia
Brain Cerebellar Hemisphere
Brain Frontal Cortex BA9
Brain Hippocampus
Brain Hypothalamus
Brain Putamen basal ganglia
Brain Spinal cord cervical c-1
Brain Substantia nigra
Cells Cultured fibroblasts
Cells EBV-transformed lymphocytes
Kidney Cortex
Minor Salivary Gland
Ovary
Small Intestine Terminal Ileum
Uterus
Vagina
ENSG00000162402 \N -250403 1.32e-06 9.83e-07 3.35e-07 7e-07 2.95e-07 4.76e-07 1.28e-06 3.46e-07 1.2e-06 3.95e-07 1.41e-06 6.08e-07 2e-06 2.76e-07 4.31e-07 7.3e-07 8.06e-07 5.36e-07 6.91e-07 6.79e-07 4.86e-07 1.24e-06 9.22e-07 6.21e-07 1.96e-06 3.79e-07 7.27e-07 7.25e-07 1.23e-06 1.25e-06 5.45e-07 1.55e-07 1.97e-07 5.6e-07 5.36e-07 4.81e-07 4.79e-07 1.67e-07 2.78e-07 2.29e-07 2.8e-07 1.53e-06 5.94e-08 4.13e-08 1.67e-07 1.24e-07 2.38e-07 5.28e-08 1.04e-07