logo

Genes within 1Mb (chr1:54963689:T:C):

View on , UCSC , GTEx , gnomAD

Immune cell-type specific single cell cis-eQTLs in OASIS
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000006555 TTC22 162366 sc-eQTL 7.56e-01 0.0297 0.0955 0.263 B L1
ENSG00000116133 DHCR24 76494 sc-eQTL 5.31e-01 -0.0566 0.0902 0.263 B L1
ENSG00000116205 TCEANC2 910105 sc-eQTL 8.67e-02 -0.133 0.0774 0.263 B L1
ENSG00000116209 TMEM59 910185 sc-eQTL 3.89e-01 0.0409 0.0474 0.263 B L1
ENSG00000116221 MRPL37 779648 sc-eQTL 7.83e-01 0.0171 0.0621 0.263 B L1
ENSG00000157216 SSBP3 550210 sc-eQTL 6.74e-01 -0.0274 0.065 0.263 B L1
ENSG00000162402 USP24 -251675 sc-eQTL 2.29e-01 -0.0663 0.0549 0.263 B L1
ENSG00000215883 CYB5RL 763653 sc-eQTL 9.07e-02 0.179 0.105 0.263 B L1
ENSG00000243725 TTC4 247828 sc-eQTL 8.92e-01 -0.0125 0.0923 0.263 B L1
ENSG00000006555 TTC22 162366 sc-eQTL 2.74e-02 -0.163 0.0733 0.263 CD4T L1
ENSG00000116205 TCEANC2 910105 sc-eQTL 2.25e-01 0.0735 0.0604 0.263 CD4T L1
ENSG00000116209 TMEM59 910185 sc-eQTL 3.06e-01 -0.0578 0.0563 0.263 CD4T L1
ENSG00000116221 MRPL37 779648 sc-eQTL 4.49e-01 0.0592 0.0779 0.263 CD4T L1
ENSG00000157216 SSBP3 550210 sc-eQTL 9.92e-02 -0.107 0.0644 0.263 CD4T L1
ENSG00000162402 USP24 -251675 sc-eQTL 2.26e-01 -0.0638 0.0526 0.263 CD4T L1
ENSG00000243725 TTC4 247828 sc-eQTL 2.46e-02 -0.178 0.0785 0.263 CD4T L1
ENSG00000006555 TTC22 162366 sc-eQTL 3.07e-01 -0.0663 0.0648 0.263 CD8T L1
ENSG00000116205 TCEANC2 910105 sc-eQTL 8.33e-01 0.0171 0.0809 0.263 CD8T L1
ENSG00000116209 TMEM59 910185 sc-eQTL 6.36e-01 -0.0266 0.0562 0.263 CD8T L1
ENSG00000116221 MRPL37 779648 sc-eQTL 4.76e-01 -0.0551 0.0772 0.263 CD8T L1
ENSG00000157216 SSBP3 550210 sc-eQTL 8.00e-01 -0.0141 0.0556 0.263 CD8T L1
ENSG00000162402 USP24 -251675 sc-eQTL 9.50e-01 -0.00338 0.0537 0.263 CD8T L1
ENSG00000243725 TTC4 247828 sc-eQTL 5.57e-01 -0.0548 0.0931 0.263 CD8T L1
ENSG00000116133 DHCR24 76494 sc-eQTL 1.42e-01 -0.126 0.0857 0.259 DC L1
ENSG00000116205 TCEANC2 910105 sc-eQTL 7.65e-01 0.0289 0.0966 0.259 DC L1
ENSG00000116209 TMEM59 910185 sc-eQTL 7.36e-01 0.0257 0.0759 0.259 DC L1
ENSG00000116221 MRPL37 779648 sc-eQTL 5.87e-01 0.0555 0.102 0.259 DC L1
ENSG00000157216 SSBP3 550210 sc-eQTL 2.96e-01 -0.095 0.0907 0.259 DC L1
ENSG00000162390 ACOT11 421432 sc-eQTL 6.41e-01 0.0408 0.0874 0.259 DC L1
ENSG00000162402 USP24 -251675 sc-eQTL 4.90e-01 -0.0364 0.0527 0.259 DC L1
ENSG00000215883 CYB5RL 763653 sc-eQTL 9.61e-02 0.158 0.0947 0.259 DC L1
ENSG00000243725 TTC4 247828 sc-eQTL 2.85e-01 -0.11 0.102 0.259 DC L1
ENSG00000116133 DHCR24 76494 sc-eQTL 6.57e-01 -0.0278 0.0625 0.263 Mono L1
ENSG00000116205 TCEANC2 910105 sc-eQTL 5.92e-01 -0.0362 0.0674 0.263 Mono L1
ENSG00000116209 TMEM59 910185 sc-eQTL 5.86e-01 0.0273 0.0501 0.263 Mono L1
ENSG00000116221 MRPL37 779648 sc-eQTL 1.06e-01 -0.135 0.0833 0.263 Mono L1
ENSG00000157216 SSBP3 550210 sc-eQTL 1.77e-03 0.297 0.0938 0.263 Mono L1
ENSG00000162402 USP24 -251675 sc-eQTL 9.41e-01 0.00421 0.0572 0.263 Mono L1
ENSG00000243725 TTC4 247828 sc-eQTL 3.10e-01 -0.102 0.101 0.263 Mono L1
ENSG00000006555 TTC22 162366 sc-eQTL 8.14e-01 -0.0201 0.0854 0.264 NK L1
ENSG00000116133 DHCR24 76494 sc-eQTL 1.04e-02 -0.219 0.0848 0.264 NK L1
ENSG00000116205 TCEANC2 910105 sc-eQTL 4.47e-01 -0.0647 0.0849 0.264 NK L1
ENSG00000116209 TMEM59 910185 sc-eQTL 2.85e-01 -0.0712 0.0664 0.264 NK L1
ENSG00000116221 MRPL37 779648 sc-eQTL 3.87e-01 -0.0717 0.0826 0.264 NK L1
ENSG00000157216 SSBP3 550210 sc-eQTL 3.70e-02 0.149 0.0711 0.264 NK L1
ENSG00000162398 LEXM 157626 sc-eQTL 9.77e-01 0.00234 0.0806 0.264 NK L1
ENSG00000162402 USP24 -251675 sc-eQTL 5.07e-01 -0.0324 0.0488 0.264 NK L1
ENSG00000243725 TTC4 247828 sc-eQTL 6.95e-01 -0.0362 0.0924 0.264 NK L1
ENSG00000006555 TTC22 162366 sc-eQTL 4.78e-01 -0.0536 0.0753 0.263 Other_T L1
ENSG00000116133 DHCR24 76494 sc-eQTL 6.74e-01 0.0246 0.0584 0.263 Other_T L1
ENSG00000116205 TCEANC2 910105 sc-eQTL 7.88e-01 -0.0235 0.0875 0.263 Other_T L1
ENSG00000116209 TMEM59 910185 sc-eQTL 9.11e-01 0.00671 0.06 0.263 Other_T L1
ENSG00000116221 MRPL37 779648 sc-eQTL 2.44e-01 0.0654 0.0561 0.263 Other_T L1
ENSG00000157216 SSBP3 550210 sc-eQTL 8.53e-01 0.012 0.0651 0.263 Other_T L1
ENSG00000162402 USP24 -251675 sc-eQTL 4.81e-01 0.0489 0.0692 0.263 Other_T L1
ENSG00000215883 CYB5RL 763653 sc-eQTL 3.38e-01 -0.0907 0.0945 0.263 Other_T L1
ENSG00000243725 TTC4 247828 sc-eQTL 6.97e-01 -0.0367 0.0943 0.263 Other_T L1
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000006555 TTC22 162366 sc-eQTL 5.70e-01 0.0459 0.0806 0.273 B_Activated L2
ENSG00000116133 DHCR24 76494 sc-eQTL 3.58e-01 -0.0871 0.0946 0.273 B_Activated L2
ENSG00000116205 TCEANC2 910105 sc-eQTL 5.92e-01 0.0546 0.102 0.273 B_Activated L2
ENSG00000116209 TMEM59 910185 sc-eQTL 7.47e-01 0.035 0.108 0.273 B_Activated L2
ENSG00000116221 MRPL37 779648 sc-eQTL 3.53e-01 0.108 0.117 0.273 B_Activated L2
ENSG00000157216 SSBP3 550210 sc-eQTL 4.98e-01 0.0717 0.106 0.273 B_Activated L2
ENSG00000162402 USP24 -251675 sc-eQTL 4.44e-02 -0.207 0.102 0.273 B_Activated L2
ENSG00000215883 CYB5RL 763653 sc-eQTL 5.06e-01 0.0606 0.091 0.273 B_Activated L2
ENSG00000243725 TTC4 247828 sc-eQTL 3.93e-01 0.0844 0.0986 0.273 B_Activated L2
ENSG00000006555 TTC22 162366 sc-eQTL 3.13e-01 0.102 0.101 0.264 B_Intermediate L2
ENSG00000116133 DHCR24 76494 sc-eQTL 4.53e-01 -0.0705 0.0937 0.264 B_Intermediate L2
ENSG00000116205 TCEANC2 910105 sc-eQTL 6.79e-01 0.0387 0.0935 0.264 B_Intermediate L2
ENSG00000116209 TMEM59 910185 sc-eQTL 2.96e-01 0.0836 0.0798 0.264 B_Intermediate L2
ENSG00000116221 MRPL37 779648 sc-eQTL 1.35e-01 0.14 0.0936 0.264 B_Intermediate L2
ENSG00000157216 SSBP3 550210 sc-eQTL 1.91e-01 -0.115 0.0876 0.264 B_Intermediate L2
ENSG00000162402 USP24 -251675 sc-eQTL 5.27e-01 -0.0469 0.074 0.264 B_Intermediate L2
ENSG00000215883 CYB5RL 763653 sc-eQTL 5.20e-01 -0.0675 0.105 0.264 B_Intermediate L2
ENSG00000243725 TTC4 247828 sc-eQTL 9.52e-01 0.00571 0.0953 0.264 B_Intermediate L2
ENSG00000006555 TTC22 162366 sc-eQTL 8.06e-01 0.0239 0.0974 0.263 B_Memory L2
ENSG00000116133 DHCR24 76494 sc-eQTL 9.02e-01 0.0119 0.0967 0.263 B_Memory L2
ENSG00000116205 TCEANC2 910105 sc-eQTL 3.28e-02 -0.22 0.102 0.263 B_Memory L2
ENSG00000116209 TMEM59 910185 sc-eQTL 1.96e-01 0.111 0.0859 0.263 B_Memory L2
ENSG00000116221 MRPL37 779648 sc-eQTL 4.11e-01 0.0718 0.0872 0.263 B_Memory L2
ENSG00000157216 SSBP3 550210 sc-eQTL 7.45e-01 0.0266 0.0815 0.263 B_Memory L2
ENSG00000162402 USP24 -251675 sc-eQTL 6.35e-01 -0.0379 0.0797 0.263 B_Memory L2
ENSG00000215883 CYB5RL 763653 sc-eQTL 9.05e-01 -0.0118 0.0986 0.263 B_Memory L2
ENSG00000243725 TTC4 247828 sc-eQTL 5.28e-01 0.0645 0.102 0.263 B_Memory L2
ENSG00000006555 TTC22 162366 sc-eQTL 4.60e-01 0.0759 0.103 0.263 B_Naive1 L2
ENSG00000116133 DHCR24 76494 sc-eQTL 3.41e-01 -0.0918 0.0962 0.263 B_Naive1 L2
ENSG00000116205 TCEANC2 910105 sc-eQTL 2.58e-01 -0.0972 0.0857 0.263 B_Naive1 L2
ENSG00000116209 TMEM59 910185 sc-eQTL 6.12e-01 -0.0317 0.0624 0.263 B_Naive1 L2
ENSG00000116221 MRPL37 779648 sc-eQTL 1.71e-01 -0.126 0.0917 0.263 B_Naive1 L2
ENSG00000157216 SSBP3 550210 sc-eQTL 9.19e-01 0.00891 0.0878 0.263 B_Naive1 L2
ENSG00000162402 USP24 -251675 sc-eQTL 7.71e-01 -0.0201 0.0691 0.263 B_Naive1 L2
ENSG00000215883 CYB5RL 763653 sc-eQTL 7.68e-02 0.184 0.104 0.263 B_Naive1 L2
ENSG00000243725 TTC4 247828 sc-eQTL 6.30e-01 -0.0454 0.0941 0.263 B_Naive1 L2
ENSG00000006555 TTC22 162366 sc-eQTL 1.74e-01 -0.138 0.101 0.262 B_Naive2 L2
ENSG00000116133 DHCR24 76494 sc-eQTL 3.91e-01 -0.0759 0.0882 0.262 B_Naive2 L2
ENSG00000116205 TCEANC2 910105 sc-eQTL 8.49e-01 0.0187 0.0981 0.262 B_Naive2 L2
ENSG00000116209 TMEM59 910185 sc-eQTL 8.44e-01 0.016 0.0807 0.262 B_Naive2 L2
ENSG00000116221 MRPL37 779648 sc-eQTL 3.55e-01 -0.088 0.0949 0.262 B_Naive2 L2
ENSG00000157216 SSBP3 550210 sc-eQTL 1.64e-01 0.13 0.0932 0.262 B_Naive2 L2
ENSG00000162402 USP24 -251675 sc-eQTL 9.74e-01 -0.00241 0.0742 0.262 B_Naive2 L2
ENSG00000215883 CYB5RL 763653 sc-eQTL 6.22e-02 0.194 0.104 0.262 B_Naive2 L2
ENSG00000243725 TTC4 247828 sc-eQTL 8.79e-01 -0.0166 0.109 0.262 B_Naive2 L2
ENSG00000006555 TTC22 162366 sc-eQTL 9.04e-01 -0.0114 0.0948 0.261 CD4_CTL L2
ENSG00000116205 TCEANC2 910105 sc-eQTL 2.23e-01 -0.119 0.0972 0.261 CD4_CTL L2
ENSG00000116209 TMEM59 910185 sc-eQTL 3.45e-01 0.0838 0.0885 0.261 CD4_CTL L2
ENSG00000116221 MRPL37 779648 sc-eQTL 3.67e-01 0.0984 0.109 0.261 CD4_CTL L2
ENSG00000157216 SSBP3 550210 sc-eQTL 7.63e-01 0.0203 0.0671 0.261 CD4_CTL L2
ENSG00000162402 USP24 -251675 sc-eQTL 9.82e-01 0.00206 0.0922 0.261 CD4_CTL L2
ENSG00000243725 TTC4 247828 sc-eQTL 7.39e-01 -0.0344 0.103 0.261 CD4_CTL L2
ENSG00000006555 TTC22 162366 sc-eQTL 1.42e-01 -0.128 0.0866 0.263 CD4_Naive L2
ENSG00000116205 TCEANC2 910105 sc-eQTL 5.48e-01 0.0398 0.0662 0.263 CD4_Naive L2
ENSG00000116209 TMEM59 910185 sc-eQTL 1.80e-01 -0.0862 0.0641 0.263 CD4_Naive L2
ENSG00000116221 MRPL37 779648 sc-eQTL 6.84e-01 0.0338 0.083 0.263 CD4_Naive L2
ENSG00000157216 SSBP3 550210 sc-eQTL 5.12e-01 -0.0435 0.0662 0.263 CD4_Naive L2
ENSG00000162402 USP24 -251675 sc-eQTL 8.86e-01 -0.00821 0.0572 0.263 CD4_Naive L2
ENSG00000243725 TTC4 247828 sc-eQTL 2.27e-01 -0.105 0.0868 0.263 CD4_Naive L2
ENSG00000006555 TTC22 162366 sc-eQTL 2.74e-02 -0.202 0.0908 0.263 CD4_TCM L2
ENSG00000116205 TCEANC2 910105 sc-eQTL 1.16e-01 0.14 0.0889 0.263 CD4_TCM L2
ENSG00000116209 TMEM59 910185 sc-eQTL 3.38e-01 -0.0646 0.0673 0.263 CD4_TCM L2
ENSG00000116221 MRPL37 779648 sc-eQTL 6.01e-01 0.0444 0.0848 0.263 CD4_TCM L2
ENSG00000157216 SSBP3 550210 sc-eQTL 2.52e-02 -0.185 0.0821 0.263 CD4_TCM L2
ENSG00000162402 USP24 -251675 sc-eQTL 4.53e-01 -0.0517 0.0688 0.263 CD4_TCM L2
ENSG00000243725 TTC4 247828 sc-eQTL 4.06e-02 -0.202 0.0983 0.263 CD4_TCM L2
ENSG00000006555 TTC22 162366 sc-eQTL 1.82e-01 0.14 0.105 0.263 CD4_TEM L2
ENSG00000116205 TCEANC2 910105 sc-eQTL 4.55e-01 0.0745 0.0995 0.263 CD4_TEM L2
ENSG00000116209 TMEM59 910185 sc-eQTL 9.03e-01 0.00944 0.0772 0.263 CD4_TEM L2
ENSG00000116221 MRPL37 779648 sc-eQTL 7.19e-01 -0.0358 0.0993 0.263 CD4_TEM L2
ENSG00000157216 SSBP3 550210 sc-eQTL 2.33e-02 -0.192 0.0842 0.263 CD4_TEM L2
ENSG00000162402 USP24 -251675 sc-eQTL 7.45e-01 -0.0252 0.0775 0.263 CD4_TEM L2
ENSG00000243725 TTC4 247828 sc-eQTL 1.92e-02 -0.239 0.101 0.263 CD4_TEM L2
ENSG00000006555 TTC22 162366 sc-eQTL 7.53e-01 -0.0264 0.0836 0.263 CD8_CTL L2
ENSG00000116205 TCEANC2 910105 sc-eQTL 3.09e-01 -0.0943 0.0924 0.263 CD8_CTL L2
ENSG00000116209 TMEM59 910185 sc-eQTL 6.70e-01 0.0344 0.0805 0.263 CD8_CTL L2
ENSG00000116221 MRPL37 779648 sc-eQTL 7.12e-01 0.0352 0.0954 0.263 CD8_CTL L2
ENSG00000157216 SSBP3 550210 sc-eQTL 3.02e-01 0.0673 0.0651 0.263 CD8_CTL L2
ENSG00000162402 USP24 -251675 sc-eQTL 4.96e-01 -0.0442 0.0648 0.263 CD8_CTL L2
ENSG00000243725 TTC4 247828 sc-eQTL 2.96e-02 0.21 0.096 0.263 CD8_CTL L2
ENSG00000006555 TTC22 162366 sc-eQTL 7.75e-01 0.0272 0.0947 0.263 CD8_Naive L2
ENSG00000116205 TCEANC2 910105 sc-eQTL 1.16e-01 0.135 0.0852 0.263 CD8_Naive L2
ENSG00000116209 TMEM59 910185 sc-eQTL 9.27e-01 -0.00772 0.0839 0.263 CD8_Naive L2
ENSG00000116221 MRPL37 779648 sc-eQTL 3.90e-02 -0.207 0.0996 0.263 CD8_Naive L2
ENSG00000157216 SSBP3 550210 sc-eQTL 6.69e-01 -0.0326 0.0761 0.263 CD8_Naive L2
ENSG00000162402 USP24 -251675 sc-eQTL 5.94e-01 -0.037 0.0692 0.263 CD8_Naive L2
ENSG00000243725 TTC4 247828 sc-eQTL 2.97e-01 -0.106 0.101 0.263 CD8_Naive L2
ENSG00000006555 TTC22 162366 sc-eQTL 3.52e-01 -0.095 0.102 0.252 CD8_TCM L2
ENSG00000116205 TCEANC2 910105 sc-eQTL 4.09e-01 -0.0847 0.102 0.252 CD8_TCM L2
ENSG00000116209 TMEM59 910185 sc-eQTL 7.22e-01 0.0322 0.0904 0.252 CD8_TCM L2
ENSG00000116221 MRPL37 779648 sc-eQTL 1.55e-01 0.145 0.102 0.252 CD8_TCM L2
ENSG00000157216 SSBP3 550210 sc-eQTL 7.94e-01 -0.0233 0.0889 0.252 CD8_TCM L2
ENSG00000162402 USP24 -251675 sc-eQTL 4.54e-01 0.0646 0.0861 0.252 CD8_TCM L2
ENSG00000243725 TTC4 247828 sc-eQTL 1.18e-02 -0.262 0.103 0.252 CD8_TCM L2
ENSG00000006555 TTC22 162366 sc-eQTL 6.78e-01 -0.0407 0.0978 0.272 CD8_TEM L2
ENSG00000116205 TCEANC2 910105 sc-eQTL 1.57e-01 0.144 0.102 0.272 CD8_TEM L2
ENSG00000116209 TMEM59 910185 sc-eQTL 6.98e-01 0.0383 0.0987 0.272 CD8_TEM L2
ENSG00000116221 MRPL37 779648 sc-eQTL 9.20e-01 -0.01 0.1 0.272 CD8_TEM L2
ENSG00000157216 SSBP3 550210 sc-eQTL 3.85e-01 -0.0822 0.0945 0.272 CD8_TEM L2
ENSG00000162402 USP24 -251675 sc-eQTL 3.45e-01 0.0942 0.0995 0.272 CD8_TEM L2
ENSG00000243725 TTC4 247828 sc-eQTL 1.30e-01 -0.153 0.101 0.272 CD8_TEM L2
ENSG00000006555 TTC22 162366 sc-eQTL 5.85e-02 -0.175 0.0922 0.262 MAIT L2
ENSG00000116133 DHCR24 76494 sc-eQTL 3.44e-01 0.0652 0.0687 0.262 MAIT L2
ENSG00000116205 TCEANC2 910105 sc-eQTL 8.04e-01 -0.024 0.0969 0.262 MAIT L2
ENSG00000116209 TMEM59 910185 sc-eQTL 3.70e-01 0.0785 0.0874 0.262 MAIT L2
ENSG00000116221 MRPL37 779648 sc-eQTL 5.86e-01 0.058 0.106 0.262 MAIT L2
ENSG00000157216 SSBP3 550210 sc-eQTL 5.91e-01 0.0506 0.0942 0.262 MAIT L2
ENSG00000162402 USP24 -251675 sc-eQTL 3.13e-01 0.0845 0.0835 0.262 MAIT L2
ENSG00000215883 CYB5RL 763653 sc-eQTL 3.73e-01 -0.0867 0.0971 0.262 MAIT L2
ENSG00000243725 TTC4 247828 sc-eQTL 1.11e-01 0.154 0.0961 0.262 MAIT L2
ENSG00000006555 TTC22 162366 sc-eQTL 2.04e-01 0.132 0.103 0.262 NK_CD56bright L2
ENSG00000116133 DHCR24 76494 sc-eQTL 4.68e-01 -0.0665 0.0914 0.262 NK_CD56bright L2
ENSG00000116205 TCEANC2 910105 sc-eQTL 6.48e-01 -0.0442 0.0967 0.262 NK_CD56bright L2
ENSG00000116209 TMEM59 910185 sc-eQTL 4.58e-01 -0.07 0.0942 0.262 NK_CD56bright L2
ENSG00000116221 MRPL37 779648 sc-eQTL 6.18e-01 0.0526 0.105 0.262 NK_CD56bright L2
ENSG00000157216 SSBP3 550210 sc-eQTL 3.39e-02 0.168 0.0785 0.262 NK_CD56bright L2
ENSG00000162398 LEXM 157626 sc-eQTL 9.70e-01 -0.00351 0.0938 0.262 NK_CD56bright L2
ENSG00000162402 USP24 -251675 sc-eQTL 6.89e-01 0.0324 0.0807 0.262 NK_CD56bright L2
ENSG00000243725 TTC4 247828 sc-eQTL 5.71e-01 0.0577 0.102 0.262 NK_CD56bright L2
ENSG00000006555 TTC22 162366 sc-eQTL 5.22e-01 -0.0557 0.0867 0.265 NK_CD56dim L2
ENSG00000116133 DHCR24 76494 sc-eQTL 1.29e-03 -0.288 0.0883 0.265 NK_CD56dim L2
ENSG00000116205 TCEANC2 910105 sc-eQTL 3.15e-01 -0.0984 0.0978 0.265 NK_CD56dim L2
ENSG00000116209 TMEM59 910185 sc-eQTL 1.06e-01 -0.117 0.0723 0.265 NK_CD56dim L2
ENSG00000116221 MRPL37 779648 sc-eQTL 6.86e-01 -0.0383 0.0945 0.265 NK_CD56dim L2
ENSG00000157216 SSBP3 550210 sc-eQTL 2.13e-02 0.177 0.0764 0.265 NK_CD56dim L2
ENSG00000162398 LEXM 157626 sc-eQTL 5.28e-01 0.0562 0.0889 0.265 NK_CD56dim L2
ENSG00000162402 USP24 -251675 sc-eQTL 3.92e-01 0.0484 0.0565 0.265 NK_CD56dim L2
ENSG00000243725 TTC4 247828 sc-eQTL 7.79e-01 -0.0273 0.0968 0.265 NK_CD56dim L2
ENSG00000006555 TTC22 162366 sc-eQTL 9.13e-01 -0.0114 0.104 0.267 NK_HLA L2
ENSG00000116133 DHCR24 76494 sc-eQTL 9.34e-01 -0.00839 0.101 0.267 NK_HLA L2
ENSG00000116205 TCEANC2 910105 sc-eQTL 9.11e-01 0.0109 0.0978 0.267 NK_HLA L2
ENSG00000116209 TMEM59 910185 sc-eQTL 4.40e-01 -0.0751 0.097 0.267 NK_HLA L2
ENSG00000116221 MRPL37 779648 sc-eQTL 2.11e-01 -0.134 0.107 0.267 NK_HLA L2
ENSG00000157216 SSBP3 550210 sc-eQTL 6.76e-01 0.0366 0.0874 0.267 NK_HLA L2
ENSG00000162398 LEXM 157626 sc-eQTL 1.18e-01 -0.154 0.098 0.267 NK_HLA L2
ENSG00000162402 USP24 -251675 sc-eQTL 5.06e-01 -0.0482 0.0723 0.267 NK_HLA L2
ENSG00000243725 TTC4 247828 sc-eQTL 2.82e-01 0.116 0.108 0.267 NK_HLA L2
ENSG00000006555 TTC22 162366 sc-eQTL 7.66e-01 -0.0272 0.0913 0.265 NK_cytokine L2
ENSG00000116133 DHCR24 76494 sc-eQTL 3.10e-01 -0.0937 0.0921 0.265 NK_cytokine L2
ENSG00000116205 TCEANC2 910105 sc-eQTL 9.17e-01 0.00962 0.0917 0.265 NK_cytokine L2
ENSG00000116209 TMEM59 910185 sc-eQTL 9.20e-01 -0.00745 0.0745 0.265 NK_cytokine L2
ENSG00000116221 MRPL37 779648 sc-eQTL 4.46e-01 -0.07 0.0917 0.265 NK_cytokine L2
ENSG00000157216 SSBP3 550210 sc-eQTL 1.83e-01 0.103 0.0767 0.265 NK_cytokine L2
ENSG00000162398 LEXM 157626 sc-eQTL 1.27e-01 -0.147 0.0957 0.265 NK_cytokine L2
ENSG00000162402 USP24 -251675 sc-eQTL 6.40e-02 -0.121 0.0651 0.265 NK_cytokine L2
ENSG00000243725 TTC4 247828 sc-eQTL 2.78e-01 -0.106 0.097 0.265 NK_cytokine L2
ENSG00000006555 TTC22 162366 sc-eQTL 8.01e-01 -0.029 0.115 0.267 PB L2
ENSG00000116133 DHCR24 76494 sc-eQTL 1.54e-01 0.144 0.101 0.267 PB L2
ENSG00000116205 TCEANC2 910105 sc-eQTL 7.38e-01 0.0414 0.124 0.267 PB L2
ENSG00000116209 TMEM59 910185 sc-eQTL 8.93e-01 0.007 0.0517 0.267 PB L2
ENSG00000116221 MRPL37 779648 sc-eQTL 8.78e-01 0.0144 0.094 0.267 PB L2
ENSG00000157216 SSBP3 550210 sc-eQTL 7.67e-01 0.0322 0.109 0.267 PB L2
ENSG00000162402 USP24 -251675 sc-eQTL 4.47e-01 0.0938 0.123 0.267 PB L2
ENSG00000215883 CYB5RL 763653 sc-eQTL 1.13e-01 0.202 0.126 0.267 PB L2
ENSG00000243725 TTC4 247828 sc-eQTL 4.85e-01 0.0834 0.119 0.267 PB L2
ENSG00000006555 TTC22 162366 sc-eQTL 7.14e-02 0.167 0.0921 0.261 Pro_T L2
ENSG00000116133 DHCR24 76494 sc-eQTL 5.49e-01 0.0472 0.0788 0.261 Pro_T L2
ENSG00000116205 TCEANC2 910105 sc-eQTL 3.47e-01 0.0905 0.0961 0.261 Pro_T L2
ENSG00000116209 TMEM59 910185 sc-eQTL 3.88e-01 -0.0577 0.0667 0.261 Pro_T L2
ENSG00000116221 MRPL37 779648 sc-eQTL 2.54e-02 0.146 0.0646 0.261 Pro_T L2
ENSG00000157216 SSBP3 550210 sc-eQTL 2.88e-01 0.0779 0.0732 0.261 Pro_T L2
ENSG00000162402 USP24 -251675 sc-eQTL 4.43e-01 -0.0687 0.0894 0.261 Pro_T L2
ENSG00000215883 CYB5RL 763653 sc-eQTL 9.51e-01 -0.00548 0.0883 0.261 Pro_T L2
ENSG00000243725 TTC4 247828 sc-eQTL 4.01e-03 -0.28 0.0963 0.261 Pro_T L2
ENSG00000006555 TTC22 162366 sc-eQTL 7.71e-01 -0.0268 0.0922 0.263 Treg L2
ENSG00000116205 TCEANC2 910105 sc-eQTL 9.84e-01 -0.00194 0.0988 0.263 Treg L2
ENSG00000116209 TMEM59 910185 sc-eQTL 7.79e-01 0.0219 0.0781 0.263 Treg L2
ENSG00000116221 MRPL37 779648 sc-eQTL 7.40e-01 0.0321 0.0966 0.263 Treg L2
ENSG00000157216 SSBP3 550210 sc-eQTL 3.25e-01 0.0849 0.086 0.263 Treg L2
ENSG00000162402 USP24 -251675 sc-eQTL 7.03e-02 -0.148 0.0815 0.263 Treg L2
ENSG00000243725 TTC4 247828 sc-eQTL 6.53e-01 -0.0466 0.103 0.263 Treg L2
ENSG00000116133 DHCR24 76494 sc-eQTL 4.18e-02 -0.172 0.0837 0.266 cDC L2
ENSG00000116205 TCEANC2 910105 sc-eQTL 8.50e-01 -0.0189 0.0999 0.266 cDC L2
ENSG00000116209 TMEM59 910185 sc-eQTL 1.31e-01 0.128 0.0843 0.266 cDC L2
ENSG00000116221 MRPL37 779648 sc-eQTL 7.63e-01 0.0328 0.109 0.266 cDC L2
ENSG00000157216 SSBP3 550210 sc-eQTL 9.49e-01 -0.0064 0.1 0.266 cDC L2
ENSG00000162390 ACOT11 421432 sc-eQTL 3.26e-01 0.0914 0.0928 0.266 cDC L2
ENSG00000162402 USP24 -251675 sc-eQTL 8.62e-01 -0.0182 0.104 0.266 cDC L2
ENSG00000215883 CYB5RL 763653 sc-eQTL 9.60e-02 0.149 0.089 0.266 cDC L2
ENSG00000243725 TTC4 247828 sc-eQTL 1.54e-01 -0.152 0.106 0.266 cDC L2
ENSG00000116133 DHCR24 76494 sc-eQTL 5.89e-01 -0.0326 0.0602 0.263 cMono_IL1B L2
ENSG00000116205 TCEANC2 910105 sc-eQTL 7.55e-02 -0.148 0.083 0.263 cMono_IL1B L2
ENSG00000116209 TMEM59 910185 sc-eQTL 4.68e-01 -0.0368 0.0507 0.263 cMono_IL1B L2
ENSG00000116221 MRPL37 779648 sc-eQTL 9.25e-01 -0.00854 0.0904 0.263 cMono_IL1B L2
ENSG00000157216 SSBP3 550210 sc-eQTL 3.98e-02 0.189 0.0913 0.263 cMono_IL1B L2
ENSG00000162402 USP24 -251675 sc-eQTL 4.78e-01 0.0484 0.0681 0.263 cMono_IL1B L2
ENSG00000243725 TTC4 247828 sc-eQTL 6.01e-01 -0.0545 0.104 0.263 cMono_IL1B L2
ENSG00000116133 DHCR24 76494 sc-eQTL 8.93e-01 -0.00761 0.0565 0.263 cMono_S100A L2
ENSG00000116205 TCEANC2 910105 sc-eQTL 8.59e-01 0.0153 0.0862 0.263 cMono_S100A L2
ENSG00000116209 TMEM59 910185 sc-eQTL 2.58e-01 0.078 0.0688 0.263 cMono_S100A L2
ENSG00000116221 MRPL37 779648 sc-eQTL 2.23e-02 -0.227 0.0984 0.263 cMono_S100A L2
ENSG00000157216 SSBP3 550210 sc-eQTL 1.40e-01 0.153 0.103 0.263 cMono_S100A L2
ENSG00000162402 USP24 -251675 sc-eQTL 8.25e-02 -0.145 0.0831 0.263 cMono_S100A L2
ENSG00000243725 TTC4 247828 sc-eQTL 9.32e-01 0.00892 0.105 0.263 cMono_S100A L2
ENSG00000006555 TTC22 162366 sc-eQTL 6.69e-01 0.0406 0.0949 0.27 gdT L2
ENSG00000116133 DHCR24 76494 sc-eQTL 8.30e-01 0.0228 0.106 0.27 gdT L2
ENSG00000116205 TCEANC2 910105 sc-eQTL 4.18e-01 -0.0861 0.106 0.27 gdT L2
ENSG00000116209 TMEM59 910185 sc-eQTL 4.22e-01 -0.0867 0.108 0.27 gdT L2
ENSG00000116221 MRPL37 779648 sc-eQTL 2.15e-01 -0.153 0.123 0.27 gdT L2
ENSG00000157216 SSBP3 550210 sc-eQTL 4.65e-01 0.0554 0.0756 0.27 gdT L2
ENSG00000162402 USP24 -251675 sc-eQTL 4.65e-01 0.0744 0.102 0.27 gdT L2
ENSG00000215883 CYB5RL 763653 sc-eQTL 2.90e-02 0.229 0.104 0.27 gdT L2
ENSG00000243725 TTC4 247828 sc-eQTL 2.36e-01 0.141 0.119 0.27 gdT L2
ENSG00000116133 DHCR24 76494 sc-eQTL 7.02e-01 -0.0292 0.0762 0.262 intMono L2
ENSG00000116205 TCEANC2 910105 sc-eQTL 1.69e-01 -0.13 0.0945 0.262 intMono L2
ENSG00000116209 TMEM59 910185 sc-eQTL 9.33e-01 -0.00583 0.0698 0.262 intMono L2
ENSG00000116221 MRPL37 779648 sc-eQTL 7.66e-01 -0.0318 0.107 0.262 intMono L2
ENSG00000157216 SSBP3 550210 sc-eQTL 5.28e-03 0.301 0.107 0.262 intMono L2
ENSG00000162402 USP24 -251675 sc-eQTL 8.07e-01 -0.0237 0.0972 0.262 intMono L2
ENSG00000243725 TTC4 247828 sc-eQTL 4.41e-01 -0.0797 0.103 0.262 intMono L2
ENSG00000116133 DHCR24 76494 sc-eQTL 9.74e-01 -0.0025 0.0752 0.269 ncMono L2
ENSG00000116205 TCEANC2 910105 sc-eQTL 1.27e-01 0.143 0.0935 0.269 ncMono L2
ENSG00000116209 TMEM59 910185 sc-eQTL 5.34e-01 0.0469 0.0752 0.269 ncMono L2
ENSG00000116221 MRPL37 779648 sc-eQTL 4.02e-02 -0.198 0.096 0.269 ncMono L2
ENSG00000157216 SSBP3 550210 sc-eQTL 1.06e-01 0.171 0.105 0.269 ncMono L2
ENSG00000162402 USP24 -251675 sc-eQTL 7.93e-01 0.0223 0.0848 0.269 ncMono L2
ENSG00000243725 TTC4 247828 sc-eQTL 1.61e-01 -0.141 0.0999 0.269 ncMono L2
ENSG00000116133 DHCR24 76494 sc-eQTL 8.52e-01 0.0168 0.0901 0.257 pDC L2
ENSG00000116205 TCEANC2 910105 sc-eQTL 5.02e-01 0.0727 0.108 0.257 pDC L2
ENSG00000116209 TMEM59 910185 sc-eQTL 3.90e-01 -0.0742 0.0861 0.257 pDC L2
ENSG00000116221 MRPL37 779648 sc-eQTL 7.20e-01 0.0412 0.115 0.257 pDC L2
ENSG00000157216 SSBP3 550210 sc-eQTL 1.79e-01 -0.137 0.101 0.257 pDC L2
ENSG00000162390 ACOT11 421432 sc-eQTL 8.10e-01 0.0103 0.0428 0.257 pDC L2
ENSG00000162402 USP24 -251675 sc-eQTL 4.74e-01 -0.0519 0.0722 0.257 pDC L2
ENSG00000215883 CYB5RL 763653 sc-eQTL 5.18e-01 -0.064 0.0987 0.257 pDC L2
ENSG00000243725 TTC4 247828 sc-eQTL 6.81e-01 0.0469 0.114 0.257 pDC L2
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000006555 TTC22 162366 sc-eQTL 1.48e-01 0.139 0.0959 0.263 B_Memory LOneK1K
ENSG00000116133 DHCR24 76494 sc-eQTL 3.20e-01 -0.0962 0.0965 0.263 B_Memory LOneK1K
ENSG00000116205 TCEANC2 910105 sc-eQTL 5.45e-01 -0.0566 0.0934 0.263 B_Memory LOneK1K
ENSG00000116209 TMEM59 910185 sc-eQTL 2.11e-01 0.0909 0.0724 0.263 B_Memory LOneK1K
ENSG00000116221 MRPL37 779648 sc-eQTL 3.14e-02 0.187 0.0861 0.263 B_Memory LOneK1K
ENSG00000157216 SSBP3 550210 sc-eQTL 5.47e-01 -0.0457 0.0757 0.263 B_Memory LOneK1K
ENSG00000162402 USP24 -251675 sc-eQTL 1.35e-01 -0.103 0.0687 0.263 B_Memory LOneK1K
ENSG00000215883 CYB5RL 763653 sc-eQTL 9.88e-01 -0.00164 0.106 0.263 B_Memory LOneK1K
ENSG00000243725 TTC4 247828 sc-eQTL 2.00e-01 0.122 0.0949 0.263 B_Memory LOneK1K
ENSG00000006555 TTC22 162366 sc-eQTL 6.45e-01 -0.0476 0.103 0.263 B_Naive LOneK1K
ENSG00000116133 DHCR24 76494 sc-eQTL 1.03e-01 -0.152 0.0924 0.263 B_Naive LOneK1K
ENSG00000116205 TCEANC2 910105 sc-eQTL 2.41e-01 -0.0985 0.0838 0.263 B_Naive LOneK1K
ENSG00000116209 TMEM59 910185 sc-eQTL 6.92e-01 -0.0237 0.0597 0.263 B_Naive LOneK1K
ENSG00000116221 MRPL37 779648 sc-eQTL 3.61e-01 -0.0785 0.0857 0.263 B_Naive LOneK1K
ENSG00000157216 SSBP3 550210 sc-eQTL 1.72e-01 0.105 0.0765 0.263 B_Naive LOneK1K
ENSG00000162402 USP24 -251675 sc-eQTL 8.15e-01 0.0154 0.0659 0.263 B_Naive LOneK1K
ENSG00000215883 CYB5RL 763653 sc-eQTL 5.04e-04 0.358 0.101 0.263 B_Naive LOneK1K
ENSG00000243725 TTC4 247828 sc-eQTL 7.36e-01 -0.0332 0.0981 0.263 B_Naive LOneK1K
ENSG00000116133 DHCR24 76494 sc-eQTL 8.10e-01 -0.0142 0.059 0.263 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000116205 TCEANC2 910105 sc-eQTL 3.40e-01 -0.0705 0.0737 0.263 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000116209 TMEM59 910185 sc-eQTL 7.41e-01 0.0168 0.0509 0.263 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000116221 MRPL37 779648 sc-eQTL 1.87e-01 -0.119 0.0898 0.263 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000157216 SSBP3 550210 sc-eQTL 8.83e-03 0.245 0.0929 0.263 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000162402 USP24 -251675 sc-eQTL 9.07e-01 -0.00756 0.0645 0.263 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000243725 TTC4 247828 sc-eQTL 7.13e-01 -0.0393 0.107 0.263 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000116133 DHCR24 76494 sc-eQTL 9.04e-01 0.00859 0.0712 0.265 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000116205 TCEANC2 910105 sc-eQTL 6.91e-01 0.0372 0.0935 0.265 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000116209 TMEM59 910185 sc-eQTL 5.88e-01 0.0377 0.0695 0.265 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000116221 MRPL37 779648 sc-eQTL 7.52e-02 -0.169 0.0946 0.265 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000157216 SSBP3 550210 sc-eQTL 6.20e-03 0.276 0.0999 0.265 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000162402 USP24 -251675 sc-eQTL 9.73e-01 -0.00275 0.0801 0.265 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000243725 TTC4 247828 sc-eQTL 1.50e-01 -0.144 0.1 0.265 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000006555 TTC22 162366 sc-eQTL 7.54e-01 -0.0265 0.0845 0.265 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000116133 DHCR24 76494 sc-eQTL 6.46e-03 -0.238 0.0867 0.265 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000116205 TCEANC2 910105 sc-eQTL 6.08e-01 -0.0444 0.0865 0.265 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000116209 TMEM59 910185 sc-eQTL 2.02e-01 -0.0854 0.0667 0.265 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000116221 MRPL37 779648 sc-eQTL 1.70e-01 -0.123 0.0893 0.265 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000157216 SSBP3 550210 sc-eQTL 2.42e-02 0.165 0.0727 0.265 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000162398 LEXM 157626 sc-eQTL 7.28e-01 -0.0289 0.0829 0.265 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000162402 USP24 -251675 sc-eQTL 4.34e-01 -0.0412 0.0525 0.265 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000243725 TTC4 247828 sc-eQTL 6.00e-01 -0.0492 0.0936 0.265 NK_CD56dim LOneK1K

Statistical fine-mapping results from Japan COVID-19 Task Force
(Shown only for PIP>0.001)
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
PIP (SuSiE)
PIP (FINEMAP)
MAF

Expression Modifier Score(EMS) for GTEx 49tissues
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Whole Blood
Muscle Skeletal
Liver
Brain Cerebellum
Prostate
Spleen
Skin Sun Exposed Lower leg
Artery Coronary
Esophagus Muscularis
Esophagus Gastroesophageal Junction
Artery Tibial
Heart Atrial Appendage
Nerve Tibial
Heart Left Ventricle
Adrenal Gland
Adipose Visceral Omentum
Pancreas
Lung
Pituitary
Brain Nucleus accumbens basal ganglia
Colon Transverse
Adipose Subcutaneous
Esophagus Mucosa
Brain Cortex
Thyroid
Stomach
Breast Mammary Tissue
Colon Sigmoid
Skin Not Sun Exposed Suprapubic
Testis
Artery Aorta
Brain Amygdala
Brain Anterior cingulate cortex BA24
Brain Caudate basal ganglia
Brain Cerebellar Hemisphere
Brain Frontal Cortex BA9
Brain Hippocampus
Brain Hypothalamus
Brain Putamen basal ganglia
Brain Spinal cord cervical c-1
Brain Substantia nigra
Cells Cultured fibroblasts
Cells EBV-transformed lymphocytes
Kidney Cortex
Minor Salivary Gland
Ovary
Small Intestine Terminal Ileum
Uterus
Vagina
ENSG00000234810 \N -365599 1.27e-06 9.15e-07 1.58e-07 3.6e-07 1.07e-07 3.2e-07 8.73e-07 2.62e-07 8.7e-07 2.72e-07 1.25e-06 5.55e-07 1.43e-06 2.05e-07 4.17e-07 4.19e-07 7.39e-07 5.26e-07 3.26e-07 1.91e-07 2.42e-07 6.27e-07 5.87e-07 2.7e-07 1.74e-06 2.44e-07 5.49e-07 3.78e-07 6.84e-07 8.5e-07 4.9e-07 5.71e-08 5.31e-08 1.79e-07 3.22e-07 1.44e-07 1.31e-07 7.64e-08 7.42e-08 1.61e-08 4.78e-08 1.43e-06 7.37e-08 5.93e-09 1.25e-07 2.07e-08 1.21e-07 1.24e-08 5.96e-08