logo

Genes within 1Mb (chr1:54963552:T:C):

View on , UCSC , GTEx , gnomAD

Immune cell-type specific single cell cis-eQTLs in OASIS
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000006555 TTC22 162229 sc-eQTL 8.16e-01 0.0277 0.119 0.126 B L1
ENSG00000116133 DHCR24 76357 sc-eQTL 2.26e-01 0.136 0.112 0.126 B L1
ENSG00000116205 TCEANC2 909968 sc-eQTL 7.57e-01 -0.0301 0.0972 0.126 B L1
ENSG00000116209 TMEM59 910048 sc-eQTL 5.98e-01 0.0313 0.0592 0.126 B L1
ENSG00000116221 MRPL37 779511 sc-eQTL 4.42e-02 -0.155 0.0768 0.126 B L1
ENSG00000157216 SSBP3 550073 sc-eQTL 1.56e-01 -0.115 0.0808 0.126 B L1
ENSG00000162402 USP24 -251812 sc-eQTL 2.20e-01 -0.0843 0.0685 0.126 B L1
ENSG00000215883 CYB5RL 763516 sc-eQTL 1.85e-01 -0.175 0.132 0.126 B L1
ENSG00000243725 TTC4 247691 sc-eQTL 4.09e-01 -0.0952 0.115 0.126 B L1
ENSG00000006555 TTC22 162229 sc-eQTL 4.15e-01 -0.0766 0.0938 0.126 CD4T L1
ENSG00000116205 TCEANC2 909968 sc-eQTL 4.09e-01 -0.0635 0.0767 0.126 CD4T L1
ENSG00000116209 TMEM59 910048 sc-eQTL 1.54e-02 0.172 0.0706 0.126 CD4T L1
ENSG00000116221 MRPL37 779511 sc-eQTL 2.79e-03 -0.293 0.0969 0.126 CD4T L1
ENSG00000157216 SSBP3 550073 sc-eQTL 9.93e-02 0.135 0.0816 0.126 CD4T L1
ENSG00000162402 USP24 -251812 sc-eQTL 5.71e-01 -0.038 0.0669 0.126 CD4T L1
ENSG00000243725 TTC4 247691 sc-eQTL 3.83e-01 0.0879 0.101 0.126 CD4T L1
ENSG00000006555 TTC22 162229 sc-eQTL 8.66e-01 -0.0137 0.0812 0.126 CD8T L1
ENSG00000116205 TCEANC2 909968 sc-eQTL 9.46e-01 -0.00686 0.101 0.126 CD8T L1
ENSG00000116209 TMEM59 910048 sc-eQTL 1.03e-01 0.114 0.0698 0.126 CD8T L1
ENSG00000116221 MRPL37 779511 sc-eQTL 9.27e-02 -0.162 0.096 0.126 CD8T L1
ENSG00000157216 SSBP3 550073 sc-eQTL 6.61e-01 -0.0305 0.0694 0.126 CD8T L1
ENSG00000162402 USP24 -251812 sc-eQTL 7.25e-01 0.0237 0.0671 0.126 CD8T L1
ENSG00000243725 TTC4 247691 sc-eQTL 2.00e-01 0.149 0.116 0.126 CD8T L1
ENSG00000116133 DHCR24 76357 sc-eQTL 9.45e-01 -0.00774 0.113 0.119 DC L1
ENSG00000116205 TCEANC2 909968 sc-eQTL 3.96e-01 0.107 0.126 0.119 DC L1
ENSG00000116209 TMEM59 910048 sc-eQTL 3.23e-01 -0.0981 0.0989 0.119 DC L1
ENSG00000116221 MRPL37 779511 sc-eQTL 9.51e-01 -0.0082 0.133 0.119 DC L1
ENSG00000157216 SSBP3 550073 sc-eQTL 5.95e-01 0.0632 0.119 0.119 DC L1
ENSG00000162390 ACOT11 421295 sc-eQTL 7.03e-01 -0.0435 0.114 0.119 DC L1
ENSG00000162402 USP24 -251812 sc-eQTL 1.59e-01 0.0969 0.0686 0.119 DC L1
ENSG00000215883 CYB5RL 763516 sc-eQTL 8.53e-02 -0.214 0.124 0.119 DC L1
ENSG00000243725 TTC4 247691 sc-eQTL 7.87e-01 0.0362 0.134 0.119 DC L1
ENSG00000116133 DHCR24 76357 sc-eQTL 2.49e-01 0.0915 0.0791 0.126 Mono L1
ENSG00000116205 TCEANC2 909968 sc-eQTL 1.81e-01 -0.115 0.0853 0.126 Mono L1
ENSG00000116209 TMEM59 910048 sc-eQTL 4.72e-01 -0.0458 0.0635 0.126 Mono L1
ENSG00000116221 MRPL37 779511 sc-eQTL 6.93e-01 -0.042 0.106 0.126 Mono L1
ENSG00000157216 SSBP3 550073 sc-eQTL 4.99e-01 -0.0826 0.122 0.126 Mono L1
ENSG00000162402 USP24 -251812 sc-eQTL 3.37e-01 -0.0697 0.0725 0.126 Mono L1
ENSG00000243725 TTC4 247691 sc-eQTL 7.49e-01 -0.0409 0.128 0.126 Mono L1
ENSG00000006555 TTC22 162229 sc-eQTL 9.45e-01 -0.00742 0.107 0.127 NK L1
ENSG00000116133 DHCR24 76357 sc-eQTL 8.09e-01 -0.0262 0.108 0.127 NK L1
ENSG00000116205 TCEANC2 909968 sc-eQTL 1.83e-01 0.142 0.107 0.127 NK L1
ENSG00000116209 TMEM59 910048 sc-eQTL 6.47e-02 0.154 0.0831 0.127 NK L1
ENSG00000116221 MRPL37 779511 sc-eQTL 8.38e-01 -0.0213 0.104 0.127 NK L1
ENSG00000157216 SSBP3 550073 sc-eQTL 1.19e-01 -0.141 0.0898 0.127 NK L1
ENSG00000162398 LEXM 157489 sc-eQTL 1.82e-01 -0.135 0.101 0.127 NK L1
ENSG00000162402 USP24 -251812 sc-eQTL 9.66e-01 -0.00264 0.0615 0.127 NK L1
ENSG00000243725 TTC4 247691 sc-eQTL 8.33e-01 0.0246 0.116 0.127 NK L1
ENSG00000006555 TTC22 162229 sc-eQTL 8.82e-01 0.0143 0.096 0.126 Other_T L1
ENSG00000116133 DHCR24 76357 sc-eQTL 5.31e-03 -0.206 0.0732 0.126 Other_T L1
ENSG00000116205 TCEANC2 909968 sc-eQTL 6.65e-01 0.0484 0.111 0.126 Other_T L1
ENSG00000116209 TMEM59 910048 sc-eQTL 3.89e-01 0.0659 0.0764 0.126 Other_T L1
ENSG00000116221 MRPL37 779511 sc-eQTL 8.96e-01 -0.00936 0.0717 0.126 Other_T L1
ENSG00000157216 SSBP3 550073 sc-eQTL 3.31e-01 -0.0806 0.0827 0.126 Other_T L1
ENSG00000162402 USP24 -251812 sc-eQTL 5.16e-01 -0.0573 0.0882 0.126 Other_T L1
ENSG00000215883 CYB5RL 763516 sc-eQTL 6.03e-01 -0.0628 0.121 0.126 Other_T L1
ENSG00000243725 TTC4 247691 sc-eQTL 6.30e-01 0.0579 0.12 0.126 Other_T L1
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000006555 TTC22 162229 sc-eQTL 5.26e-01 -0.0646 0.102 0.133 B_Activated L2
ENSG00000116133 DHCR24 76357 sc-eQTL 8.05e-01 0.0296 0.12 0.133 B_Activated L2
ENSG00000116205 TCEANC2 909968 sc-eQTL 4.03e-01 0.107 0.128 0.133 B_Activated L2
ENSG00000116209 TMEM59 910048 sc-eQTL 7.90e-01 0.0365 0.136 0.133 B_Activated L2
ENSG00000116221 MRPL37 779511 sc-eQTL 2.03e-01 0.188 0.147 0.133 B_Activated L2
ENSG00000157216 SSBP3 550073 sc-eQTL 3.04e-01 -0.137 0.133 0.133 B_Activated L2
ENSG00000162402 USP24 -251812 sc-eQTL 5.74e-01 -0.0733 0.13 0.133 B_Activated L2
ENSG00000215883 CYB5RL 763516 sc-eQTL 5.35e-01 0.0713 0.115 0.133 B_Activated L2
ENSG00000243725 TTC4 247691 sc-eQTL 7.06e-01 0.0472 0.125 0.133 B_Activated L2
ENSG00000006555 TTC22 162229 sc-eQTL 4.27e-01 0.102 0.128 0.127 B_Intermediate L2
ENSG00000116133 DHCR24 76357 sc-eQTL 3.51e-01 0.111 0.119 0.127 B_Intermediate L2
ENSG00000116205 TCEANC2 909968 sc-eQTL 1.71e-01 0.163 0.118 0.127 B_Intermediate L2
ENSG00000116209 TMEM59 910048 sc-eQTL 3.23e-02 -0.217 0.101 0.127 B_Intermediate L2
ENSG00000116221 MRPL37 779511 sc-eQTL 1.14e-01 -0.189 0.119 0.127 B_Intermediate L2
ENSG00000157216 SSBP3 550073 sc-eQTL 2.11e-01 -0.14 0.111 0.127 B_Intermediate L2
ENSG00000162402 USP24 -251812 sc-eQTL 1.38e-01 -0.139 0.0937 0.127 B_Intermediate L2
ENSG00000215883 CYB5RL 763516 sc-eQTL 3.12e-01 -0.135 0.133 0.127 B_Intermediate L2
ENSG00000243725 TTC4 247691 sc-eQTL 9.22e-01 0.0118 0.121 0.127 B_Intermediate L2
ENSG00000006555 TTC22 162229 sc-eQTL 5.64e-01 0.0713 0.123 0.127 B_Memory L2
ENSG00000116133 DHCR24 76357 sc-eQTL 1.53e-01 -0.175 0.122 0.127 B_Memory L2
ENSG00000116205 TCEANC2 909968 sc-eQTL 7.52e-01 -0.0414 0.131 0.127 B_Memory L2
ENSG00000116209 TMEM59 910048 sc-eQTL 8.59e-01 0.0194 0.109 0.127 B_Memory L2
ENSG00000116221 MRPL37 779511 sc-eQTL 2.10e-01 -0.139 0.11 0.127 B_Memory L2
ENSG00000157216 SSBP3 550073 sc-eQTL 6.32e-01 -0.0496 0.103 0.127 B_Memory L2
ENSG00000162402 USP24 -251812 sc-eQTL 2.23e-01 0.123 0.101 0.127 B_Memory L2
ENSG00000215883 CYB5RL 763516 sc-eQTL 7.40e-01 -0.0416 0.125 0.127 B_Memory L2
ENSG00000243725 TTC4 247691 sc-eQTL 8.87e-03 -0.337 0.127 0.127 B_Memory L2
ENSG00000006555 TTC22 162229 sc-eQTL 9.74e-01 0.0041 0.127 0.126 B_Naive1 L2
ENSG00000116133 DHCR24 76357 sc-eQTL 8.32e-01 0.0253 0.119 0.126 B_Naive1 L2
ENSG00000116205 TCEANC2 909968 sc-eQTL 3.86e-01 -0.0923 0.106 0.126 B_Naive1 L2
ENSG00000116209 TMEM59 910048 sc-eQTL 8.49e-01 -0.0148 0.0773 0.126 B_Naive1 L2
ENSG00000116221 MRPL37 779511 sc-eQTL 4.55e-01 -0.0852 0.114 0.126 B_Naive1 L2
ENSG00000157216 SSBP3 550073 sc-eQTL 4.75e-01 0.0776 0.108 0.126 B_Naive1 L2
ENSG00000162402 USP24 -251812 sc-eQTL 5.44e-01 -0.0519 0.0854 0.126 B_Naive1 L2
ENSG00000215883 CYB5RL 763516 sc-eQTL 4.13e-01 -0.106 0.129 0.126 B_Naive1 L2
ENSG00000243725 TTC4 247691 sc-eQTL 6.18e-01 -0.0581 0.116 0.126 B_Naive1 L2
ENSG00000006555 TTC22 162229 sc-eQTL 6.22e-01 0.0628 0.127 0.127 B_Naive2 L2
ENSG00000116133 DHCR24 76357 sc-eQTL 8.44e-01 0.0218 0.111 0.127 B_Naive2 L2
ENSG00000116205 TCEANC2 909968 sc-eQTL 8.38e-01 -0.0251 0.123 0.127 B_Naive2 L2
ENSG00000116209 TMEM59 910048 sc-eQTL 3.40e-01 0.0968 0.101 0.127 B_Naive2 L2
ENSG00000116221 MRPL37 779511 sc-eQTL 9.07e-01 -0.0139 0.119 0.127 B_Naive2 L2
ENSG00000157216 SSBP3 550073 sc-eQTL 7.84e-01 -0.0322 0.117 0.127 B_Naive2 L2
ENSG00000162402 USP24 -251812 sc-eQTL 5.35e-01 0.0578 0.0931 0.127 B_Naive2 L2
ENSG00000215883 CYB5RL 763516 sc-eQTL 7.26e-01 -0.046 0.131 0.127 B_Naive2 L2
ENSG00000243725 TTC4 247691 sc-eQTL 3.35e-01 -0.132 0.136 0.127 B_Naive2 L2
ENSG00000006555 TTC22 162229 sc-eQTL 8.13e-01 -0.0287 0.121 0.125 CD4_CTL L2
ENSG00000116205 TCEANC2 909968 sc-eQTL 6.81e-01 0.0515 0.125 0.125 CD4_CTL L2
ENSG00000116209 TMEM59 910048 sc-eQTL 8.69e-01 -0.0188 0.114 0.125 CD4_CTL L2
ENSG00000116221 MRPL37 779511 sc-eQTL 2.62e-01 -0.157 0.139 0.125 CD4_CTL L2
ENSG00000157216 SSBP3 550073 sc-eQTL 5.33e-01 -0.0536 0.0858 0.125 CD4_CTL L2
ENSG00000162402 USP24 -251812 sc-eQTL 7.25e-02 -0.211 0.117 0.125 CD4_CTL L2
ENSG00000243725 TTC4 247691 sc-eQTL 6.15e-01 -0.0665 0.132 0.125 CD4_CTL L2
ENSG00000006555 TTC22 162229 sc-eQTL 1.11e-01 -0.179 0.112 0.126 CD4_Naive L2
ENSG00000116205 TCEANC2 909968 sc-eQTL 4.67e-01 -0.0623 0.0854 0.126 CD4_Naive L2
ENSG00000116209 TMEM59 910048 sc-eQTL 6.91e-02 0.151 0.0825 0.126 CD4_Naive L2
ENSG00000116221 MRPL37 779511 sc-eQTL 7.08e-03 -0.287 0.105 0.126 CD4_Naive L2
ENSG00000157216 SSBP3 550073 sc-eQTL 2.79e-01 0.0925 0.0853 0.126 CD4_Naive L2
ENSG00000162402 USP24 -251812 sc-eQTL 6.16e-01 -0.0371 0.0738 0.126 CD4_Naive L2
ENSG00000243725 TTC4 247691 sc-eQTL 2.54e-01 0.128 0.112 0.126 CD4_Naive L2
ENSG00000006555 TTC22 162229 sc-eQTL 5.01e-01 0.0795 0.118 0.126 CD4_TCM L2
ENSG00000116205 TCEANC2 909968 sc-eQTL 7.55e-01 0.0359 0.115 0.126 CD4_TCM L2
ENSG00000116209 TMEM59 910048 sc-eQTL 1.10e-01 0.138 0.086 0.126 CD4_TCM L2
ENSG00000116221 MRPL37 779511 sc-eQTL 2.28e-01 -0.131 0.109 0.126 CD4_TCM L2
ENSG00000157216 SSBP3 550073 sc-eQTL 3.89e-01 0.0919 0.107 0.126 CD4_TCM L2
ENSG00000162402 USP24 -251812 sc-eQTL 5.79e-01 0.0491 0.0884 0.126 CD4_TCM L2
ENSG00000243725 TTC4 247691 sc-eQTL 4.94e-01 -0.0872 0.127 0.126 CD4_TCM L2
ENSG00000006555 TTC22 162229 sc-eQTL 1.20e-01 -0.207 0.133 0.126 CD4_TEM L2
ENSG00000116205 TCEANC2 909968 sc-eQTL 7.98e-02 -0.221 0.126 0.126 CD4_TEM L2
ENSG00000116209 TMEM59 910048 sc-eQTL 3.40e-01 0.0936 0.0979 0.126 CD4_TEM L2
ENSG00000116221 MRPL37 779511 sc-eQTL 1.93e-01 -0.164 0.126 0.126 CD4_TEM L2
ENSG00000157216 SSBP3 550073 sc-eQTL 8.24e-01 0.024 0.108 0.126 CD4_TEM L2
ENSG00000162402 USP24 -251812 sc-eQTL 8.34e-02 -0.17 0.0978 0.126 CD4_TEM L2
ENSG00000243725 TTC4 247691 sc-eQTL 1.77e-01 0.175 0.13 0.126 CD4_TEM L2
ENSG00000006555 TTC22 162229 sc-eQTL 2.37e-01 0.126 0.106 0.126 CD8_CTL L2
ENSG00000116205 TCEANC2 909968 sc-eQTL 2.34e-01 -0.14 0.117 0.126 CD8_CTL L2
ENSG00000116209 TMEM59 910048 sc-eQTL 9.59e-02 0.17 0.102 0.126 CD8_CTL L2
ENSG00000116221 MRPL37 779511 sc-eQTL 8.04e-01 0.0302 0.121 0.126 CD8_CTL L2
ENSG00000157216 SSBP3 550073 sc-eQTL 9.01e-01 -0.0104 0.0829 0.126 CD8_CTL L2
ENSG00000162402 USP24 -251812 sc-eQTL 4.53e-01 -0.0618 0.0823 0.126 CD8_CTL L2
ENSG00000243725 TTC4 247691 sc-eQTL 1.33e-02 0.304 0.122 0.126 CD8_CTL L2
ENSG00000006555 TTC22 162229 sc-eQTL 1.96e-01 -0.156 0.12 0.126 CD8_Naive L2
ENSG00000116205 TCEANC2 909968 sc-eQTL 8.43e-01 0.0216 0.109 0.126 CD8_Naive L2
ENSG00000116209 TMEM59 910048 sc-eQTL 2.26e-01 0.129 0.106 0.126 CD8_Naive L2
ENSG00000116221 MRPL37 779511 sc-eQTL 5.49e-03 -0.353 0.126 0.126 CD8_Naive L2
ENSG00000157216 SSBP3 550073 sc-eQTL 6.32e-01 0.0464 0.0968 0.126 CD8_Naive L2
ENSG00000162402 USP24 -251812 sc-eQTL 9.90e-02 0.145 0.0875 0.126 CD8_Naive L2
ENSG00000243725 TTC4 247691 sc-eQTL 1.95e-01 -0.167 0.128 0.126 CD8_Naive L2
ENSG00000006555 TTC22 162229 sc-eQTL 6.17e-01 -0.0673 0.134 0.125 CD8_TCM L2
ENSG00000116205 TCEANC2 909968 sc-eQTL 8.56e-01 0.0245 0.135 0.125 CD8_TCM L2
ENSG00000116209 TMEM59 910048 sc-eQTL 3.73e-01 0.106 0.119 0.125 CD8_TCM L2
ENSG00000116221 MRPL37 779511 sc-eQTL 4.51e-01 -0.102 0.135 0.125 CD8_TCM L2
ENSG00000157216 SSBP3 550073 sc-eQTL 3.52e-01 0.109 0.117 0.125 CD8_TCM L2
ENSG00000162402 USP24 -251812 sc-eQTL 1.03e-01 -0.185 0.113 0.125 CD8_TCM L2
ENSG00000243725 TTC4 247691 sc-eQTL 7.36e-01 -0.0466 0.138 0.125 CD8_TCM L2
ENSG00000006555 TTC22 162229 sc-eQTL 4.86e-01 0.0876 0.126 0.126 CD8_TEM L2
ENSG00000116205 TCEANC2 909968 sc-eQTL 5.70e-01 -0.0747 0.131 0.126 CD8_TEM L2
ENSG00000116209 TMEM59 910048 sc-eQTL 8.90e-01 -0.0176 0.127 0.126 CD8_TEM L2
ENSG00000116221 MRPL37 779511 sc-eQTL 5.36e-01 -0.0796 0.128 0.126 CD8_TEM L2
ENSG00000157216 SSBP3 550073 sc-eQTL 9.80e-01 -0.00312 0.122 0.126 CD8_TEM L2
ENSG00000162402 USP24 -251812 sc-eQTL 6.53e-01 0.0578 0.128 0.126 CD8_TEM L2
ENSG00000243725 TTC4 247691 sc-eQTL 4.57e-01 0.0969 0.13 0.126 CD8_TEM L2
ENSG00000006555 TTC22 162229 sc-eQTL 8.73e-01 -0.0184 0.115 0.123 MAIT L2
ENSG00000116133 DHCR24 76357 sc-eQTL 1.30e-01 -0.128 0.0844 0.123 MAIT L2
ENSG00000116205 TCEANC2 909968 sc-eQTL 7.55e-01 -0.0374 0.119 0.123 MAIT L2
ENSG00000116209 TMEM59 910048 sc-eQTL 1.31e-01 0.163 0.107 0.123 MAIT L2
ENSG00000116221 MRPL37 779511 sc-eQTL 5.99e-01 0.0691 0.131 0.123 MAIT L2
ENSG00000157216 SSBP3 550073 sc-eQTL 7.84e-01 -0.0319 0.116 0.123 MAIT L2
ENSG00000162402 USP24 -251812 sc-eQTL 1.40e-01 -0.152 0.103 0.123 MAIT L2
ENSG00000215883 CYB5RL 763516 sc-eQTL 6.99e-01 0.0465 0.12 0.123 MAIT L2
ENSG00000243725 TTC4 247691 sc-eQTL 4.24e-01 -0.0954 0.119 0.123 MAIT L2
ENSG00000006555 TTC22 162229 sc-eQTL 9.31e-02 -0.221 0.131 0.129 NK_CD56bright L2
ENSG00000116133 DHCR24 76357 sc-eQTL 2.84e-01 -0.125 0.116 0.129 NK_CD56bright L2
ENSG00000116205 TCEANC2 909968 sc-eQTL 2.13e-01 -0.153 0.123 0.129 NK_CD56bright L2
ENSG00000116209 TMEM59 910048 sc-eQTL 9.18e-01 -0.0124 0.12 0.129 NK_CD56bright L2
ENSG00000116221 MRPL37 779511 sc-eQTL 7.74e-01 -0.0387 0.134 0.129 NK_CD56bright L2
ENSG00000157216 SSBP3 550073 sc-eQTL 6.91e-01 0.0404 0.101 0.129 NK_CD56bright L2
ENSG00000162398 LEXM 157489 sc-eQTL 5.05e-01 -0.0798 0.119 0.129 NK_CD56bright L2
ENSG00000162402 USP24 -251812 sc-eQTL 5.07e-01 -0.0683 0.103 0.129 NK_CD56bright L2
ENSG00000243725 TTC4 247691 sc-eQTL 8.35e-01 -0.0271 0.13 0.129 NK_CD56bright L2
ENSG00000006555 TTC22 162229 sc-eQTL 5.00e-02 0.212 0.107 0.127 NK_CD56dim L2
ENSG00000116133 DHCR24 76357 sc-eQTL 9.43e-01 -0.00806 0.113 0.127 NK_CD56dim L2
ENSG00000116205 TCEANC2 909968 sc-eQTL 2.12e-01 0.153 0.122 0.127 NK_CD56dim L2
ENSG00000116209 TMEM59 910048 sc-eQTL 1.34e-01 0.136 0.0903 0.127 NK_CD56dim L2
ENSG00000116221 MRPL37 779511 sc-eQTL 5.31e-01 -0.074 0.118 0.127 NK_CD56dim L2
ENSG00000157216 SSBP3 550073 sc-eQTL 1.61e-01 -0.135 0.0962 0.127 NK_CD56dim L2
ENSG00000162398 LEXM 157489 sc-eQTL 5.26e-01 -0.0706 0.111 0.127 NK_CD56dim L2
ENSG00000162402 USP24 -251812 sc-eQTL 6.85e-01 0.0287 0.0706 0.127 NK_CD56dim L2
ENSG00000243725 TTC4 247691 sc-eQTL 2.64e-01 -0.135 0.121 0.127 NK_CD56dim L2
ENSG00000006555 TTC22 162229 sc-eQTL 5.11e-03 -0.361 0.128 0.128 NK_HLA L2
ENSG00000116133 DHCR24 76357 sc-eQTL 5.42e-01 -0.0774 0.127 0.128 NK_HLA L2
ENSG00000116205 TCEANC2 909968 sc-eQTL 3.49e-01 0.115 0.122 0.128 NK_HLA L2
ENSG00000116209 TMEM59 910048 sc-eQTL 4.75e-01 0.087 0.121 0.128 NK_HLA L2
ENSG00000116221 MRPL37 779511 sc-eQTL 6.25e-01 -0.0656 0.134 0.128 NK_HLA L2
ENSG00000157216 SSBP3 550073 sc-eQTL 1.98e-01 -0.141 0.109 0.128 NK_HLA L2
ENSG00000162398 LEXM 157489 sc-eQTL 2.04e-01 -0.157 0.123 0.128 NK_HLA L2
ENSG00000162402 USP24 -251812 sc-eQTL 9.34e-02 0.152 0.0899 0.128 NK_HLA L2
ENSG00000243725 TTC4 247691 sc-eQTL 2.96e-01 0.141 0.135 0.128 NK_HLA L2
ENSG00000006555 TTC22 162229 sc-eQTL 7.11e-01 0.0429 0.116 0.127 NK_cytokine L2
ENSG00000116133 DHCR24 76357 sc-eQTL 6.06e-01 -0.0604 0.117 0.127 NK_cytokine L2
ENSG00000116205 TCEANC2 909968 sc-eQTL 1.15e-01 0.183 0.115 0.127 NK_cytokine L2
ENSG00000116209 TMEM59 910048 sc-eQTL 2.00e-01 0.121 0.0941 0.127 NK_cytokine L2
ENSG00000116221 MRPL37 779511 sc-eQTL 9.27e-01 -0.0107 0.116 0.127 NK_cytokine L2
ENSG00000157216 SSBP3 550073 sc-eQTL 7.62e-02 -0.173 0.0969 0.127 NK_cytokine L2
ENSG00000162398 LEXM 157489 sc-eQTL 8.24e-01 -0.0272 0.122 0.127 NK_cytokine L2
ENSG00000162402 USP24 -251812 sc-eQTL 6.09e-01 -0.0426 0.0831 0.127 NK_cytokine L2
ENSG00000243725 TTC4 247691 sc-eQTL 6.37e-02 0.228 0.122 0.127 NK_cytokine L2
ENSG00000006555 TTC22 162229 sc-eQTL 6.18e-01 0.0671 0.134 0.152 PB L2
ENSG00000116133 DHCR24 76357 sc-eQTL 5.43e-01 0.0725 0.119 0.152 PB L2
ENSG00000116205 TCEANC2 909968 sc-eQTL 8.62e-01 0.0252 0.145 0.152 PB L2
ENSG00000116209 TMEM59 910048 sc-eQTL 3.51e-02 0.127 0.0593 0.152 PB L2
ENSG00000116221 MRPL37 779511 sc-eQTL 1.80e-02 -0.257 0.107 0.152 PB L2
ENSG00000157216 SSBP3 550073 sc-eQTL 1.27e-01 -0.193 0.126 0.152 PB L2
ENSG00000162402 USP24 -251812 sc-eQTL 7.28e-01 -0.0502 0.144 0.152 PB L2
ENSG00000215883 CYB5RL 763516 sc-eQTL 5.12e-01 0.0982 0.149 0.152 PB L2
ENSG00000243725 TTC4 247691 sc-eQTL 5.78e-01 -0.0778 0.139 0.152 PB L2
ENSG00000006555 TTC22 162229 sc-eQTL 8.49e-01 -0.0224 0.118 0.128 Pro_T L2
ENSG00000116133 DHCR24 76357 sc-eQTL 3.75e-02 -0.207 0.0989 0.128 Pro_T L2
ENSG00000116205 TCEANC2 909968 sc-eQTL 1.92e-01 0.159 0.121 0.128 Pro_T L2
ENSG00000116209 TMEM59 910048 sc-eQTL 7.48e-01 0.0272 0.0846 0.128 Pro_T L2
ENSG00000116221 MRPL37 779511 sc-eQTL 5.12e-01 -0.0544 0.0828 0.128 Pro_T L2
ENSG00000157216 SSBP3 550073 sc-eQTL 7.89e-01 -0.0249 0.0929 0.128 Pro_T L2
ENSG00000162402 USP24 -251812 sc-eQTL 2.11e-01 0.142 0.113 0.128 Pro_T L2
ENSG00000215883 CYB5RL 763516 sc-eQTL 4.33e-01 -0.0877 0.112 0.128 Pro_T L2
ENSG00000243725 TTC4 247691 sc-eQTL 9.92e-01 0.0013 0.124 0.128 Pro_T L2
ENSG00000006555 TTC22 162229 sc-eQTL 9.73e-02 -0.193 0.116 0.126 Treg L2
ENSG00000116205 TCEANC2 909968 sc-eQTL 8.86e-01 -0.0179 0.125 0.126 Treg L2
ENSG00000116209 TMEM59 910048 sc-eQTL 7.55e-01 0.0309 0.0988 0.126 Treg L2
ENSG00000116221 MRPL37 779511 sc-eQTL 3.04e-01 -0.126 0.122 0.126 Treg L2
ENSG00000157216 SSBP3 550073 sc-eQTL 6.24e-01 -0.0536 0.109 0.126 Treg L2
ENSG00000162402 USP24 -251812 sc-eQTL 7.03e-01 0.0397 0.104 0.126 Treg L2
ENSG00000243725 TTC4 247691 sc-eQTL 8.77e-01 -0.0203 0.131 0.126 Treg L2
ENSG00000116133 DHCR24 76357 sc-eQTL 5.73e-01 -0.0623 0.11 0.122 cDC L2
ENSG00000116205 TCEANC2 909968 sc-eQTL 7.99e-01 0.0333 0.13 0.122 cDC L2
ENSG00000116209 TMEM59 910048 sc-eQTL 2.16e-01 -0.137 0.11 0.122 cDC L2
ENSG00000116221 MRPL37 779511 sc-eQTL 3.40e-01 0.135 0.141 0.122 cDC L2
ENSG00000157216 SSBP3 550073 sc-eQTL 5.11e-01 0.086 0.13 0.122 cDC L2
ENSG00000162390 ACOT11 421295 sc-eQTL 5.01e-01 -0.0818 0.121 0.122 cDC L2
ENSG00000162402 USP24 -251812 sc-eQTL 2.59e-01 0.154 0.136 0.122 cDC L2
ENSG00000215883 CYB5RL 763516 sc-eQTL 3.60e-02 -0.244 0.116 0.122 cDC L2
ENSG00000243725 TTC4 247691 sc-eQTL 9.27e-02 0.234 0.139 0.122 cDC L2
ENSG00000116133 DHCR24 76357 sc-eQTL 3.67e-01 0.0697 0.077 0.126 cMono_IL1B L2
ENSG00000116205 TCEANC2 909968 sc-eQTL 4.36e-01 -0.0836 0.107 0.126 cMono_IL1B L2
ENSG00000116209 TMEM59 910048 sc-eQTL 7.67e-01 -0.0193 0.065 0.126 cMono_IL1B L2
ENSG00000116221 MRPL37 779511 sc-eQTL 3.75e-01 -0.103 0.116 0.126 cMono_IL1B L2
ENSG00000157216 SSBP3 550073 sc-eQTL 5.88e-01 0.0641 0.118 0.126 cMono_IL1B L2
ENSG00000162402 USP24 -251812 sc-eQTL 8.33e-01 -0.0185 0.0873 0.126 cMono_IL1B L2
ENSG00000243725 TTC4 247691 sc-eQTL 5.19e-01 -0.0862 0.133 0.126 cMono_IL1B L2
ENSG00000116133 DHCR24 76357 sc-eQTL 3.32e-01 0.07 0.072 0.126 cMono_S100A L2
ENSG00000116205 TCEANC2 909968 sc-eQTL 3.06e-01 -0.113 0.11 0.126 cMono_S100A L2
ENSG00000116209 TMEM59 910048 sc-eQTL 5.34e-01 -0.0549 0.0881 0.126 cMono_S100A L2
ENSG00000116221 MRPL37 779511 sc-eQTL 7.99e-01 0.0325 0.127 0.126 cMono_S100A L2
ENSG00000157216 SSBP3 550073 sc-eQTL 2.02e-01 -0.169 0.132 0.126 cMono_S100A L2
ENSG00000162402 USP24 -251812 sc-eQTL 3.49e-02 -0.225 0.106 0.126 cMono_S100A L2
ENSG00000243725 TTC4 247691 sc-eQTL 7.52e-01 0.0424 0.134 0.126 cMono_S100A L2
ENSG00000006555 TTC22 162229 sc-eQTL 8.88e-01 0.0172 0.122 0.124 gdT L2
ENSG00000116133 DHCR24 76357 sc-eQTL 2.56e-01 -0.154 0.135 0.124 gdT L2
ENSG00000116205 TCEANC2 909968 sc-eQTL 1.41e-01 0.201 0.136 0.124 gdT L2
ENSG00000116209 TMEM59 910048 sc-eQTL 7.27e-01 -0.0485 0.139 0.124 gdT L2
ENSG00000116221 MRPL37 779511 sc-eQTL 7.22e-01 -0.0566 0.159 0.124 gdT L2
ENSG00000157216 SSBP3 550073 sc-eQTL 2.23e-01 -0.118 0.0968 0.124 gdT L2
ENSG00000162402 USP24 -251812 sc-eQTL 7.82e-01 -0.0363 0.131 0.124 gdT L2
ENSG00000215883 CYB5RL 763516 sc-eQTL 8.30e-01 -0.0292 0.136 0.124 gdT L2
ENSG00000243725 TTC4 247691 sc-eQTL 1.10e-01 -0.244 0.152 0.124 gdT L2
ENSG00000116133 DHCR24 76357 sc-eQTL 1.84e-02 -0.229 0.0962 0.131 intMono L2
ENSG00000116205 TCEANC2 909968 sc-eQTL 2.17e-01 0.15 0.121 0.131 intMono L2
ENSG00000116209 TMEM59 910048 sc-eQTL 9.65e-01 0.00391 0.0892 0.131 intMono L2
ENSG00000116221 MRPL37 779511 sc-eQTL 6.62e-01 -0.0597 0.136 0.131 intMono L2
ENSG00000157216 SSBP3 550073 sc-eQTL 6.48e-01 -0.0637 0.139 0.131 intMono L2
ENSG00000162402 USP24 -251812 sc-eQTL 4.02e-01 0.104 0.124 0.131 intMono L2
ENSG00000243725 TTC4 247691 sc-eQTL 2.47e-01 0.153 0.132 0.131 intMono L2
ENSG00000116133 DHCR24 76357 sc-eQTL 1.97e-02 -0.23 0.0978 0.122 ncMono L2
ENSG00000116205 TCEANC2 909968 sc-eQTL 2.39e-01 -0.146 0.124 0.122 ncMono L2
ENSG00000116209 TMEM59 910048 sc-eQTL 6.28e-01 -0.0481 0.0992 0.122 ncMono L2
ENSG00000116221 MRPL37 779511 sc-eQTL 2.47e-02 0.286 0.126 0.122 ncMono L2
ENSG00000157216 SSBP3 550073 sc-eQTL 6.31e-01 -0.0673 0.14 0.122 ncMono L2
ENSG00000162402 USP24 -251812 sc-eQTL 5.33e-01 0.0697 0.112 0.122 ncMono L2
ENSG00000243725 TTC4 247691 sc-eQTL 6.09e-01 0.0678 0.132 0.122 ncMono L2
ENSG00000116133 DHCR24 76357 sc-eQTL 4.79e-01 0.0855 0.121 0.119 pDC L2
ENSG00000116205 TCEANC2 909968 sc-eQTL 6.32e-01 0.0696 0.145 0.119 pDC L2
ENSG00000116209 TMEM59 910048 sc-eQTL 4.03e-01 -0.0968 0.115 0.119 pDC L2
ENSG00000116221 MRPL37 779511 sc-eQTL 7.72e-01 -0.0445 0.154 0.119 pDC L2
ENSG00000157216 SSBP3 550073 sc-eQTL 5.08e-01 0.0904 0.136 0.119 pDC L2
ENSG00000162390 ACOT11 421295 sc-eQTL 7.90e-01 -0.0153 0.0574 0.119 pDC L2
ENSG00000162402 USP24 -251812 sc-eQTL 4.73e-01 0.0697 0.0968 0.119 pDC L2
ENSG00000215883 CYB5RL 763516 sc-eQTL 5.32e-01 -0.0829 0.132 0.119 pDC L2
ENSG00000243725 TTC4 247691 sc-eQTL 2.61e-01 -0.172 0.152 0.119 pDC L2
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000006555 TTC22 162229 sc-eQTL 9.79e-01 -0.00325 0.123 0.126 B_Memory LOneK1K
ENSG00000116133 DHCR24 76357 sc-eQTL 9.96e-01 0.00056 0.123 0.126 B_Memory LOneK1K
ENSG00000116205 TCEANC2 909968 sc-eQTL 6.39e-01 0.0559 0.119 0.126 B_Memory LOneK1K
ENSG00000116209 TMEM59 910048 sc-eQTL 3.57e-01 -0.0855 0.0925 0.126 B_Memory LOneK1K
ENSG00000116221 MRPL37 779511 sc-eQTL 5.76e-02 -0.21 0.11 0.126 B_Memory LOneK1K
ENSG00000157216 SSBP3 550073 sc-eQTL 1.69e-01 -0.133 0.0961 0.126 B_Memory LOneK1K
ENSG00000162402 USP24 -251812 sc-eQTL 4.04e-01 -0.0734 0.0879 0.126 B_Memory LOneK1K
ENSG00000215883 CYB5RL 763516 sc-eQTL 3.23e-01 -0.134 0.135 0.126 B_Memory LOneK1K
ENSG00000243725 TTC4 247691 sc-eQTL 4.40e-01 -0.0938 0.121 0.126 B_Memory LOneK1K
ENSG00000006555 TTC22 162229 sc-eQTL 6.53e-01 0.0576 0.128 0.126 B_Naive LOneK1K
ENSG00000116133 DHCR24 76357 sc-eQTL 5.75e-01 0.0648 0.115 0.126 B_Naive LOneK1K
ENSG00000116205 TCEANC2 909968 sc-eQTL 5.51e-01 -0.0621 0.104 0.126 B_Naive LOneK1K
ENSG00000116209 TMEM59 910048 sc-eQTL 5.26e-01 0.047 0.074 0.126 B_Naive LOneK1K
ENSG00000116221 MRPL37 779511 sc-eQTL 2.60e-01 -0.12 0.106 0.126 B_Naive LOneK1K
ENSG00000157216 SSBP3 550073 sc-eQTL 4.75e-01 0.0681 0.0952 0.126 B_Naive LOneK1K
ENSG00000162402 USP24 -251812 sc-eQTL 7.44e-01 -0.0267 0.0817 0.126 B_Naive LOneK1K
ENSG00000215883 CYB5RL 763516 sc-eQTL 4.86e-01 -0.0902 0.129 0.126 B_Naive LOneK1K
ENSG00000243725 TTC4 247691 sc-eQTL 5.67e-01 -0.0697 0.122 0.126 B_Naive LOneK1K
ENSG00000116133 DHCR24 76357 sc-eQTL 1.38e-01 0.111 0.0742 0.126 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000116205 TCEANC2 909968 sc-eQTL 3.73e-01 -0.0832 0.0932 0.126 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000116209 TMEM59 910048 sc-eQTL 5.12e-01 -0.0422 0.0643 0.126 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000116221 MRPL37 779511 sc-eQTL 4.64e-01 -0.0835 0.114 0.126 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000157216 SSBP3 550073 sc-eQTL 8.09e-01 -0.0289 0.119 0.126 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000162402 USP24 -251812 sc-eQTL 3.41e-01 -0.0776 0.0814 0.126 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000243725 TTC4 247691 sc-eQTL 5.42e-01 -0.0826 0.135 0.126 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000116133 DHCR24 76357 sc-eQTL 4.41e-02 -0.188 0.0926 0.127 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000116205 TCEANC2 909968 sc-eQTL 9.68e-01 0.00499 0.123 0.127 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000116209 TMEM59 910048 sc-eQTL 4.18e-01 -0.074 0.0913 0.127 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000116221 MRPL37 779511 sc-eQTL 1.72e-01 0.171 0.125 0.127 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000157216 SSBP3 550073 sc-eQTL 5.29e-01 -0.0841 0.133 0.127 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000162402 USP24 -251812 sc-eQTL 3.78e-01 0.0928 0.105 0.127 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000243725 TTC4 247691 sc-eQTL 2.44e-01 0.154 0.132 0.127 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000006555 TTC22 162229 sc-eQTL 7.82e-01 0.0291 0.105 0.127 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000116133 DHCR24 76357 sc-eQTL 9.47e-01 0.00737 0.11 0.127 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000116205 TCEANC2 909968 sc-eQTL 1.00e-01 0.177 0.107 0.127 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000116209 TMEM59 910048 sc-eQTL 3.40e-02 0.176 0.0826 0.127 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000116221 MRPL37 779511 sc-eQTL 8.59e-01 -0.0198 0.112 0.127 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000157216 SSBP3 550073 sc-eQTL 6.84e-02 -0.167 0.091 0.127 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000162398 LEXM 157489 sc-eQTL 3.04e-01 -0.106 0.103 0.127 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000162402 USP24 -251812 sc-eQTL 8.46e-01 0.0128 0.0656 0.127 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000243725 TTC4 247691 sc-eQTL 9.58e-01 0.00615 0.117 0.127 NK_CD56dim LOneK1K

Statistical fine-mapping results from Japan COVID-19 Task Force
(Shown only for PIP>0.001)
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
PIP (SuSiE)
PIP (FINEMAP)
MAF
ENSG00000006555 TTC22 162229 eQTL 0.000806 -0.074 0.022 0.0 0.0 0.128

Expression Modifier Score(EMS) for GTEx 49tissues
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Whole Blood
Muscle Skeletal
Liver
Brain Cerebellum
Prostate
Spleen
Skin Sun Exposed Lower leg
Artery Coronary
Esophagus Muscularis
Esophagus Gastroesophageal Junction
Artery Tibial
Heart Atrial Appendage
Nerve Tibial
Heart Left Ventricle
Adrenal Gland
Adipose Visceral Omentum
Pancreas
Lung
Pituitary
Brain Nucleus accumbens basal ganglia
Colon Transverse
Adipose Subcutaneous
Esophagus Mucosa
Brain Cortex
Thyroid
Stomach
Breast Mammary Tissue
Colon Sigmoid
Skin Not Sun Exposed Suprapubic
Testis
Artery Aorta
Brain Amygdala
Brain Anterior cingulate cortex BA24
Brain Caudate basal ganglia
Brain Cerebellar Hemisphere
Brain Frontal Cortex BA9
Brain Hippocampus
Brain Hypothalamus
Brain Putamen basal ganglia
Brain Spinal cord cervical c-1
Brain Substantia nigra
Cells Cultured fibroblasts
Cells EBV-transformed lymphocytes
Kidney Cortex
Minor Salivary Gland
Ovary
Small Intestine Terminal Ileum
Uterus
Vagina
ENSG00000162402 \N -251812 3.31e-06 4.67e-06 8.15e-07 2.42e-06 7.76e-07 8.44e-07 2.43e-06 9.96e-07 3.4e-06 2.35e-06 3.49e-06 3.04e-06 4.18e-06 1.54e-06 1.26e-06 3.71e-06 2e-06 2.46e-06 1.41e-06 8.79e-07 1.9e-06 3.9e-06 3.35e-06 1.62e-06 4.68e-06 1.25e-06 2.57e-06 1.78e-06 3.55e-06 3.11e-06 1.97e-06 4.16e-07 5.66e-07 1.73e-06 1.92e-06 8.95e-07 9.08e-07 4.91e-07 1.26e-06 4.56e-07 2.54e-07 4.04e-06 4.81e-07 1.68e-07 3.63e-07 1.1e-06 8.86e-07 5.83e-07 2.56e-07