Genes within 1Mb (chr1:54962631:C:A):

View on , UCSC , GTEx , gnomAD


Immune cell-type specific single cell cis-eQTLs in OASIS
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000006555 TTC22 161308 sc-eQTL 8.16e-01 0.0277 0.119 0.126 B L1
ENSG00000116133 DHCR24 75436 sc-eQTL 2.26e-01 0.136 0.112 0.126 B L1
ENSG00000116205 TCEANC2 909047 sc-eQTL 7.57e-01 -0.0301 0.0972 0.126 B L1
ENSG00000116209 TMEM59 909127 sc-eQTL 5.98e-01 0.0313 0.0592 0.126 B L1
ENSG00000116221 MRPL37 778590 sc-eQTL 4.42e-02 -0.155 0.0768 0.126 B L1
ENSG00000157216 SSBP3 549152 sc-eQTL 1.56e-01 -0.115 0.0808 0.126 B L1
ENSG00000162402 USP24 -252733 sc-eQTL 2.20e-01 -0.0843 0.0685 0.126 B L1
ENSG00000215883 CYB5RL 762595 sc-eQTL 1.85e-01 -0.175 0.132 0.126 B L1
ENSG00000243725 TTC4 246770 sc-eQTL 4.09e-01 -0.0952 0.115 0.126 B L1
ENSG00000006555 TTC22 161308 sc-eQTL 4.15e-01 -0.0766 0.0938 0.126 CD4T L1
ENSG00000116205 TCEANC2 909047 sc-eQTL 4.09e-01 -0.0635 0.0767 0.126 CD4T L1
ENSG00000116209 TMEM59 909127 sc-eQTL 1.54e-02 0.172 0.0706 0.126 CD4T L1
ENSG00000116221 MRPL37 778590 sc-eQTL 2.79e-03 -0.293 0.0969 0.126 CD4T L1
ENSG00000157216 SSBP3 549152 sc-eQTL 9.93e-02 0.135 0.0816 0.126 CD4T L1
ENSG00000162402 USP24 -252733 sc-eQTL 5.71e-01 -0.038 0.0669 0.126 CD4T L1
ENSG00000243725 TTC4 246770 sc-eQTL 3.83e-01 0.0879 0.101 0.126 CD4T L1
ENSG00000006555 TTC22 161308 sc-eQTL 8.66e-01 -0.0137 0.0812 0.126 CD8T L1
ENSG00000116205 TCEANC2 909047 sc-eQTL 9.46e-01 -0.00686 0.101 0.126 CD8T L1
ENSG00000116209 TMEM59 909127 sc-eQTL 1.03e-01 0.114 0.0698 0.126 CD8T L1
ENSG00000116221 MRPL37 778590 sc-eQTL 9.27e-02 -0.162 0.096 0.126 CD8T L1
ENSG00000157216 SSBP3 549152 sc-eQTL 6.61e-01 -0.0305 0.0694 0.126 CD8T L1
ENSG00000162402 USP24 -252733 sc-eQTL 7.25e-01 0.0237 0.0671 0.126 CD8T L1
ENSG00000243725 TTC4 246770 sc-eQTL 2.00e-01 0.149 0.116 0.126 CD8T L1
ENSG00000116133 DHCR24 75436 sc-eQTL 9.45e-01 -0.00774 0.113 0.119 DC L1
ENSG00000116205 TCEANC2 909047 sc-eQTL 3.96e-01 0.107 0.126 0.119 DC L1
ENSG00000116209 TMEM59 909127 sc-eQTL 3.23e-01 -0.0981 0.0989 0.119 DC L1
ENSG00000116221 MRPL37 778590 sc-eQTL 9.51e-01 -0.0082 0.133 0.119 DC L1
ENSG00000157216 SSBP3 549152 sc-eQTL 5.95e-01 0.0632 0.119 0.119 DC L1
ENSG00000162390 ACOT11 420374 sc-eQTL 7.03e-01 -0.0435 0.114 0.119 DC L1
ENSG00000162402 USP24 -252733 sc-eQTL 1.59e-01 0.0969 0.0686 0.119 DC L1
ENSG00000215883 CYB5RL 762595 sc-eQTL 8.53e-02 -0.214 0.124 0.119 DC L1
ENSG00000243725 TTC4 246770 sc-eQTL 7.87e-01 0.0362 0.134 0.119 DC L1
ENSG00000116133 DHCR24 75436 sc-eQTL 2.49e-01 0.0915 0.0791 0.126 Mono L1
ENSG00000116205 TCEANC2 909047 sc-eQTL 1.81e-01 -0.115 0.0853 0.126 Mono L1
ENSG00000116209 TMEM59 909127 sc-eQTL 4.72e-01 -0.0458 0.0635 0.126 Mono L1
ENSG00000116221 MRPL37 778590 sc-eQTL 6.93e-01 -0.042 0.106 0.126 Mono L1
ENSG00000157216 SSBP3 549152 sc-eQTL 4.99e-01 -0.0826 0.122 0.126 Mono L1
ENSG00000162402 USP24 -252733 sc-eQTL 3.37e-01 -0.0697 0.0725 0.126 Mono L1
ENSG00000243725 TTC4 246770 sc-eQTL 7.49e-01 -0.0409 0.128 0.126 Mono L1
ENSG00000006555 TTC22 161308 sc-eQTL 9.45e-01 -0.00742 0.107 0.127 NK L1
ENSG00000116133 DHCR24 75436 sc-eQTL 8.09e-01 -0.0262 0.108 0.127 NK L1
ENSG00000116205 TCEANC2 909047 sc-eQTL 1.83e-01 0.142 0.107 0.127 NK L1
ENSG00000116209 TMEM59 909127 sc-eQTL 6.47e-02 0.154 0.0831 0.127 NK L1
ENSG00000116221 MRPL37 778590 sc-eQTL 8.38e-01 -0.0213 0.104 0.127 NK L1
ENSG00000157216 SSBP3 549152 sc-eQTL 1.19e-01 -0.141 0.0898 0.127 NK L1
ENSG00000162398 LEXM 156568 sc-eQTL 1.82e-01 -0.135 0.101 0.127 NK L1
ENSG00000162402 USP24 -252733 sc-eQTL 9.66e-01 -0.00264 0.0615 0.127 NK L1
ENSG00000243725 TTC4 246770 sc-eQTL 8.33e-01 0.0246 0.116 0.127 NK L1
ENSG00000006555 TTC22 161308 sc-eQTL 8.82e-01 0.0143 0.096 0.126 Other_T L1
ENSG00000116133 DHCR24 75436 sc-eQTL 5.31e-03 -0.206 0.0732 0.126 Other_T L1
ENSG00000116205 TCEANC2 909047 sc-eQTL 6.65e-01 0.0484 0.111 0.126 Other_T L1
ENSG00000116209 TMEM59 909127 sc-eQTL 3.89e-01 0.0659 0.0764 0.126 Other_T L1
ENSG00000116221 MRPL37 778590 sc-eQTL 8.96e-01 -0.00936 0.0717 0.126 Other_T L1
ENSG00000157216 SSBP3 549152 sc-eQTL 3.31e-01 -0.0806 0.0827 0.126 Other_T L1
ENSG00000162402 USP24 -252733 sc-eQTL 5.16e-01 -0.0573 0.0882 0.126 Other_T L1
ENSG00000215883 CYB5RL 762595 sc-eQTL 6.03e-01 -0.0628 0.121 0.126 Other_T L1
ENSG00000243725 TTC4 246770 sc-eQTL 6.30e-01 0.0579 0.12 0.126 Other_T L1
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000006555 TTC22 161308 sc-eQTL 5.26e-01 -0.0646 0.102 0.133 B_Activated L2
ENSG00000116133 DHCR24 75436 sc-eQTL 8.05e-01 0.0296 0.12 0.133 B_Activated L2
ENSG00000116205 TCEANC2 909047 sc-eQTL 4.03e-01 0.107 0.128 0.133 B_Activated L2
ENSG00000116209 TMEM59 909127 sc-eQTL 7.90e-01 0.0365 0.136 0.133 B_Activated L2
ENSG00000116221 MRPL37 778590 sc-eQTL 2.03e-01 0.188 0.147 0.133 B_Activated L2
ENSG00000157216 SSBP3 549152 sc-eQTL 3.04e-01 -0.137 0.133 0.133 B_Activated L2
ENSG00000162402 USP24 -252733 sc-eQTL 5.74e-01 -0.0733 0.13 0.133 B_Activated L2
ENSG00000215883 CYB5RL 762595 sc-eQTL 5.35e-01 0.0713 0.115 0.133 B_Activated L2
ENSG00000243725 TTC4 246770 sc-eQTL 7.06e-01 0.0472 0.125 0.133 B_Activated L2
ENSG00000006555 TTC22 161308 sc-eQTL 4.27e-01 0.102 0.128 0.127 B_Intermediate L2
ENSG00000116133 DHCR24 75436 sc-eQTL 3.51e-01 0.111 0.119 0.127 B_Intermediate L2
ENSG00000116205 TCEANC2 909047 sc-eQTL 1.71e-01 0.163 0.118 0.127 B_Intermediate L2
ENSG00000116209 TMEM59 909127 sc-eQTL 3.23e-02 -0.217 0.101 0.127 B_Intermediate L2
ENSG00000116221 MRPL37 778590 sc-eQTL 1.14e-01 -0.189 0.119 0.127 B_Intermediate L2
ENSG00000157216 SSBP3 549152 sc-eQTL 2.11e-01 -0.14 0.111 0.127 B_Intermediate L2
ENSG00000162402 USP24 -252733 sc-eQTL 1.38e-01 -0.139 0.0937 0.127 B_Intermediate L2
ENSG00000215883 CYB5RL 762595 sc-eQTL 3.12e-01 -0.135 0.133 0.127 B_Intermediate L2
ENSG00000243725 TTC4 246770 sc-eQTL 9.22e-01 0.0118 0.121 0.127 B_Intermediate L2
ENSG00000006555 TTC22 161308 sc-eQTL 5.64e-01 0.0713 0.123 0.127 B_Memory L2
ENSG00000116133 DHCR24 75436 sc-eQTL 1.53e-01 -0.175 0.122 0.127 B_Memory L2
ENSG00000116205 TCEANC2 909047 sc-eQTL 7.52e-01 -0.0414 0.131 0.127 B_Memory L2
ENSG00000116209 TMEM59 909127 sc-eQTL 8.59e-01 0.0194 0.109 0.127 B_Memory L2
ENSG00000116221 MRPL37 778590 sc-eQTL 2.10e-01 -0.139 0.11 0.127 B_Memory L2
ENSG00000157216 SSBP3 549152 sc-eQTL 6.32e-01 -0.0496 0.103 0.127 B_Memory L2
ENSG00000162402 USP24 -252733 sc-eQTL 2.23e-01 0.123 0.101 0.127 B_Memory L2
ENSG00000215883 CYB5RL 762595 sc-eQTL 7.40e-01 -0.0416 0.125 0.127 B_Memory L2
ENSG00000243725 TTC4 246770 sc-eQTL 8.87e-03 -0.337 0.127 0.127 B_Memory L2
ENSG00000006555 TTC22 161308 sc-eQTL 9.74e-01 0.0041 0.127 0.126 B_Naive1 L2
ENSG00000116133 DHCR24 75436 sc-eQTL 8.32e-01 0.0253 0.119 0.126 B_Naive1 L2
ENSG00000116205 TCEANC2 909047 sc-eQTL 3.86e-01 -0.0923 0.106 0.126 B_Naive1 L2
ENSG00000116209 TMEM59 909127 sc-eQTL 8.49e-01 -0.0148 0.0773 0.126 B_Naive1 L2
ENSG00000116221 MRPL37 778590 sc-eQTL 4.55e-01 -0.0852 0.114 0.126 B_Naive1 L2
ENSG00000157216 SSBP3 549152 sc-eQTL 4.75e-01 0.0776 0.108 0.126 B_Naive1 L2
ENSG00000162402 USP24 -252733 sc-eQTL 5.44e-01 -0.0519 0.0854 0.126 B_Naive1 L2
ENSG00000215883 CYB5RL 762595 sc-eQTL 4.13e-01 -0.106 0.129 0.126 B_Naive1 L2
ENSG00000243725 TTC4 246770 sc-eQTL 6.18e-01 -0.0581 0.116 0.126 B_Naive1 L2
ENSG00000006555 TTC22 161308 sc-eQTL 6.22e-01 0.0628 0.127 0.127 B_Naive2 L2
ENSG00000116133 DHCR24 75436 sc-eQTL 8.44e-01 0.0218 0.111 0.127 B_Naive2 L2
ENSG00000116205 TCEANC2 909047 sc-eQTL 8.38e-01 -0.0251 0.123 0.127 B_Naive2 L2
ENSG00000116209 TMEM59 909127 sc-eQTL 3.40e-01 0.0968 0.101 0.127 B_Naive2 L2
ENSG00000116221 MRPL37 778590 sc-eQTL 9.07e-01 -0.0139 0.119 0.127 B_Naive2 L2
ENSG00000157216 SSBP3 549152 sc-eQTL 7.84e-01 -0.0322 0.117 0.127 B_Naive2 L2
ENSG00000162402 USP24 -252733 sc-eQTL 5.35e-01 0.0578 0.0931 0.127 B_Naive2 L2
ENSG00000215883 CYB5RL 762595 sc-eQTL 7.26e-01 -0.046 0.131 0.127 B_Naive2 L2
ENSG00000243725 TTC4 246770 sc-eQTL 3.35e-01 -0.132 0.136 0.127 B_Naive2 L2
ENSG00000006555 TTC22 161308 sc-eQTL 8.13e-01 -0.0287 0.121 0.125 CD4_CTL L2
ENSG00000116205 TCEANC2 909047 sc-eQTL 6.81e-01 0.0515 0.125 0.125 CD4_CTL L2
ENSG00000116209 TMEM59 909127 sc-eQTL 8.69e-01 -0.0188 0.114 0.125 CD4_CTL L2
ENSG00000116221 MRPL37 778590 sc-eQTL 2.62e-01 -0.157 0.139 0.125 CD4_CTL L2
ENSG00000157216 SSBP3 549152 sc-eQTL 5.33e-01 -0.0536 0.0858 0.125 CD4_CTL L2
ENSG00000162402 USP24 -252733 sc-eQTL 7.25e-02 -0.211 0.117 0.125 CD4_CTL L2
ENSG00000243725 TTC4 246770 sc-eQTL 6.15e-01 -0.0665 0.132 0.125 CD4_CTL L2
ENSG00000006555 TTC22 161308 sc-eQTL 1.11e-01 -0.179 0.112 0.126 CD4_Naive L2
ENSG00000116205 TCEANC2 909047 sc-eQTL 4.67e-01 -0.0623 0.0854 0.126 CD4_Naive L2
ENSG00000116209 TMEM59 909127 sc-eQTL 6.91e-02 0.151 0.0825 0.126 CD4_Naive L2
ENSG00000116221 MRPL37 778590 sc-eQTL 7.08e-03 -0.287 0.105 0.126 CD4_Naive L2
ENSG00000157216 SSBP3 549152 sc-eQTL 2.79e-01 0.0925 0.0853 0.126 CD4_Naive L2
ENSG00000162402 USP24 -252733 sc-eQTL 6.16e-01 -0.0371 0.0738 0.126 CD4_Naive L2
ENSG00000243725 TTC4 246770 sc-eQTL 2.54e-01 0.128 0.112 0.126 CD4_Naive L2
ENSG00000006555 TTC22 161308 sc-eQTL 5.01e-01 0.0795 0.118 0.126 CD4_TCM L2
ENSG00000116205 TCEANC2 909047 sc-eQTL 7.55e-01 0.0359 0.115 0.126 CD4_TCM L2
ENSG00000116209 TMEM59 909127 sc-eQTL 1.10e-01 0.138 0.086 0.126 CD4_TCM L2
ENSG00000116221 MRPL37 778590 sc-eQTL 2.28e-01 -0.131 0.109 0.126 CD4_TCM L2
ENSG00000157216 SSBP3 549152 sc-eQTL 3.89e-01 0.0919 0.107 0.126 CD4_TCM L2
ENSG00000162402 USP24 -252733 sc-eQTL 5.79e-01 0.0491 0.0884 0.126 CD4_TCM L2
ENSG00000243725 TTC4 246770 sc-eQTL 4.94e-01 -0.0872 0.127 0.126 CD4_TCM L2
ENSG00000006555 TTC22 161308 sc-eQTL 1.20e-01 -0.207 0.133 0.126 CD4_TEM L2
ENSG00000116205 TCEANC2 909047 sc-eQTL 7.98e-02 -0.221 0.126 0.126 CD4_TEM L2
ENSG00000116209 TMEM59 909127 sc-eQTL 3.40e-01 0.0936 0.0979 0.126 CD4_TEM L2
ENSG00000116221 MRPL37 778590 sc-eQTL 1.93e-01 -0.164 0.126 0.126 CD4_TEM L2
ENSG00000157216 SSBP3 549152 sc-eQTL 8.24e-01 0.024 0.108 0.126 CD4_TEM L2
ENSG00000162402 USP24 -252733 sc-eQTL 8.34e-02 -0.17 0.0978 0.126 CD4_TEM L2
ENSG00000243725 TTC4 246770 sc-eQTL 1.77e-01 0.175 0.13 0.126 CD4_TEM L2
ENSG00000006555 TTC22 161308 sc-eQTL 2.37e-01 0.126 0.106 0.126 CD8_CTL L2
ENSG00000116205 TCEANC2 909047 sc-eQTL 2.34e-01 -0.14 0.117 0.126 CD8_CTL L2
ENSG00000116209 TMEM59 909127 sc-eQTL 9.59e-02 0.17 0.102 0.126 CD8_CTL L2
ENSG00000116221 MRPL37 778590 sc-eQTL 8.04e-01 0.0302 0.121 0.126 CD8_CTL L2
ENSG00000157216 SSBP3 549152 sc-eQTL 9.01e-01 -0.0104 0.0829 0.126 CD8_CTL L2
ENSG00000162402 USP24 -252733 sc-eQTL 4.53e-01 -0.0618 0.0823 0.126 CD8_CTL L2
ENSG00000243725 TTC4 246770 sc-eQTL 1.33e-02 0.304 0.122 0.126 CD8_CTL L2
ENSG00000006555 TTC22 161308 sc-eQTL 1.96e-01 -0.156 0.12 0.126 CD8_Naive L2
ENSG00000116205 TCEANC2 909047 sc-eQTL 8.43e-01 0.0216 0.109 0.126 CD8_Naive L2
ENSG00000116209 TMEM59 909127 sc-eQTL 2.26e-01 0.129 0.106 0.126 CD8_Naive L2
ENSG00000116221 MRPL37 778590 sc-eQTL 5.49e-03 -0.353 0.126 0.126 CD8_Naive L2
ENSG00000157216 SSBP3 549152 sc-eQTL 6.32e-01 0.0464 0.0968 0.126 CD8_Naive L2
ENSG00000162402 USP24 -252733 sc-eQTL 9.90e-02 0.145 0.0875 0.126 CD8_Naive L2
ENSG00000243725 TTC4 246770 sc-eQTL 1.95e-01 -0.167 0.128 0.126 CD8_Naive L2
ENSG00000006555 TTC22 161308 sc-eQTL 6.17e-01 -0.0673 0.134 0.125 CD8_TCM L2
ENSG00000116205 TCEANC2 909047 sc-eQTL 8.56e-01 0.0245 0.135 0.125 CD8_TCM L2
ENSG00000116209 TMEM59 909127 sc-eQTL 3.73e-01 0.106 0.119 0.125 CD8_TCM L2
ENSG00000116221 MRPL37 778590 sc-eQTL 4.51e-01 -0.102 0.135 0.125 CD8_TCM L2
ENSG00000157216 SSBP3 549152 sc-eQTL 3.52e-01 0.109 0.117 0.125 CD8_TCM L2
ENSG00000162402 USP24 -252733 sc-eQTL 1.03e-01 -0.185 0.113 0.125 CD8_TCM L2
ENSG00000243725 TTC4 246770 sc-eQTL 7.36e-01 -0.0466 0.138 0.125 CD8_TCM L2
ENSG00000006555 TTC22 161308 sc-eQTL 4.86e-01 0.0876 0.126 0.126 CD8_TEM L2
ENSG00000116205 TCEANC2 909047 sc-eQTL 5.70e-01 -0.0747 0.131 0.126 CD8_TEM L2
ENSG00000116209 TMEM59 909127 sc-eQTL 8.90e-01 -0.0176 0.127 0.126 CD8_TEM L2
ENSG00000116221 MRPL37 778590 sc-eQTL 5.36e-01 -0.0796 0.128 0.126 CD8_TEM L2
ENSG00000157216 SSBP3 549152 sc-eQTL 9.80e-01 -0.00312 0.122 0.126 CD8_TEM L2
ENSG00000162402 USP24 -252733 sc-eQTL 6.53e-01 0.0578 0.128 0.126 CD8_TEM L2
ENSG00000243725 TTC4 246770 sc-eQTL 4.57e-01 0.0969 0.13 0.126 CD8_TEM L2
ENSG00000006555 TTC22 161308 sc-eQTL 8.73e-01 -0.0184 0.115 0.123 MAIT L2
ENSG00000116133 DHCR24 75436 sc-eQTL 1.30e-01 -0.128 0.0844 0.123 MAIT L2
ENSG00000116205 TCEANC2 909047 sc-eQTL 7.55e-01 -0.0374 0.119 0.123 MAIT L2
ENSG00000116209 TMEM59 909127 sc-eQTL 1.31e-01 0.163 0.107 0.123 MAIT L2
ENSG00000116221 MRPL37 778590 sc-eQTL 5.99e-01 0.0691 0.131 0.123 MAIT L2
ENSG00000157216 SSBP3 549152 sc-eQTL 7.84e-01 -0.0319 0.116 0.123 MAIT L2
ENSG00000162402 USP24 -252733 sc-eQTL 1.40e-01 -0.152 0.103 0.123 MAIT L2
ENSG00000215883 CYB5RL 762595 sc-eQTL 6.99e-01 0.0465 0.12 0.123 MAIT L2
ENSG00000243725 TTC4 246770 sc-eQTL 4.24e-01 -0.0954 0.119 0.123 MAIT L2
ENSG00000006555 TTC22 161308 sc-eQTL 9.31e-02 -0.221 0.131 0.129 NK_CD56bright L2
ENSG00000116133 DHCR24 75436 sc-eQTL 2.84e-01 -0.125 0.116 0.129 NK_CD56bright L2
ENSG00000116205 TCEANC2 909047 sc-eQTL 2.13e-01 -0.153 0.123 0.129 NK_CD56bright L2
ENSG00000116209 TMEM59 909127 sc-eQTL 9.18e-01 -0.0124 0.12 0.129 NK_CD56bright L2
ENSG00000116221 MRPL37 778590 sc-eQTL 7.74e-01 -0.0387 0.134 0.129 NK_CD56bright L2
ENSG00000157216 SSBP3 549152 sc-eQTL 6.91e-01 0.0404 0.101 0.129 NK_CD56bright L2
ENSG00000162398 LEXM 156568 sc-eQTL 5.05e-01 -0.0798 0.119 0.129 NK_CD56bright L2
ENSG00000162402 USP24 -252733 sc-eQTL 5.07e-01 -0.0683 0.103 0.129 NK_CD56bright L2
ENSG00000243725 TTC4 246770 sc-eQTL 8.35e-01 -0.0271 0.13 0.129 NK_CD56bright L2
ENSG00000006555 TTC22 161308 sc-eQTL 5.00e-02 0.212 0.107 0.127 NK_CD56dim L2
ENSG00000116133 DHCR24 75436 sc-eQTL 9.43e-01 -0.00806 0.113 0.127 NK_CD56dim L2
ENSG00000116205 TCEANC2 909047 sc-eQTL 2.12e-01 0.153 0.122 0.127 NK_CD56dim L2
ENSG00000116209 TMEM59 909127 sc-eQTL 1.34e-01 0.136 0.0903 0.127 NK_CD56dim L2
ENSG00000116221 MRPL37 778590 sc-eQTL 5.31e-01 -0.074 0.118 0.127 NK_CD56dim L2
ENSG00000157216 SSBP3 549152 sc-eQTL 1.61e-01 -0.135 0.0962 0.127 NK_CD56dim L2
ENSG00000162398 LEXM 156568 sc-eQTL 5.26e-01 -0.0706 0.111 0.127 NK_CD56dim L2
ENSG00000162402 USP24 -252733 sc-eQTL 6.85e-01 0.0287 0.0706 0.127 NK_CD56dim L2
ENSG00000243725 TTC4 246770 sc-eQTL 2.64e-01 -0.135 0.121 0.127 NK_CD56dim L2
ENSG00000006555 TTC22 161308 sc-eQTL 5.11e-03 -0.361 0.128 0.128 NK_HLA L2
ENSG00000116133 DHCR24 75436 sc-eQTL 5.42e-01 -0.0774 0.127 0.128 NK_HLA L2
ENSG00000116205 TCEANC2 909047 sc-eQTL 3.49e-01 0.115 0.122 0.128 NK_HLA L2
ENSG00000116209 TMEM59 909127 sc-eQTL 4.75e-01 0.087 0.121 0.128 NK_HLA L2
ENSG00000116221 MRPL37 778590 sc-eQTL 6.25e-01 -0.0656 0.134 0.128 NK_HLA L2
ENSG00000157216 SSBP3 549152 sc-eQTL 1.98e-01 -0.141 0.109 0.128 NK_HLA L2
ENSG00000162398 LEXM 156568 sc-eQTL 2.04e-01 -0.157 0.123 0.128 NK_HLA L2
ENSG00000162402 USP24 -252733 sc-eQTL 9.34e-02 0.152 0.0899 0.128 NK_HLA L2
ENSG00000243725 TTC4 246770 sc-eQTL 2.96e-01 0.141 0.135 0.128 NK_HLA L2
ENSG00000006555 TTC22 161308 sc-eQTL 7.11e-01 0.0429 0.116 0.127 NK_cytokine L2
ENSG00000116133 DHCR24 75436 sc-eQTL 6.06e-01 -0.0604 0.117 0.127 NK_cytokine L2
ENSG00000116205 TCEANC2 909047 sc-eQTL 1.15e-01 0.183 0.115 0.127 NK_cytokine L2
ENSG00000116209 TMEM59 909127 sc-eQTL 2.00e-01 0.121 0.0941 0.127 NK_cytokine L2
ENSG00000116221 MRPL37 778590 sc-eQTL 9.27e-01 -0.0107 0.116 0.127 NK_cytokine L2
ENSG00000157216 SSBP3 549152 sc-eQTL 7.62e-02 -0.173 0.0969 0.127 NK_cytokine L2
ENSG00000162398 LEXM 156568 sc-eQTL 8.24e-01 -0.0272 0.122 0.127 NK_cytokine L2
ENSG00000162402 USP24 -252733 sc-eQTL 6.09e-01 -0.0426 0.0831 0.127 NK_cytokine L2
ENSG00000243725 TTC4 246770 sc-eQTL 6.37e-02 0.228 0.122 0.127 NK_cytokine L2
ENSG00000006555 TTC22 161308 sc-eQTL 6.18e-01 0.0671 0.134 0.152 PB L2
ENSG00000116133 DHCR24 75436 sc-eQTL 5.43e-01 0.0725 0.119 0.152 PB L2
ENSG00000116205 TCEANC2 909047 sc-eQTL 8.62e-01 0.0252 0.145 0.152 PB L2
ENSG00000116209 TMEM59 909127 sc-eQTL 3.51e-02 0.127 0.0593 0.152 PB L2
ENSG00000116221 MRPL37 778590 sc-eQTL 1.80e-02 -0.257 0.107 0.152 PB L2
ENSG00000157216 SSBP3 549152 sc-eQTL 1.27e-01 -0.193 0.126 0.152 PB L2
ENSG00000162402 USP24 -252733 sc-eQTL 7.28e-01 -0.0502 0.144 0.152 PB L2
ENSG00000215883 CYB5RL 762595 sc-eQTL 5.12e-01 0.0982 0.149 0.152 PB L2
ENSG00000243725 TTC4 246770 sc-eQTL 5.78e-01 -0.0778 0.139 0.152 PB L2
ENSG00000006555 TTC22 161308 sc-eQTL 8.49e-01 -0.0224 0.118 0.128 Pro_T L2
ENSG00000116133 DHCR24 75436 sc-eQTL 3.75e-02 -0.207 0.0989 0.128 Pro_T L2
ENSG00000116205 TCEANC2 909047 sc-eQTL 1.92e-01 0.159 0.121 0.128 Pro_T L2
ENSG00000116209 TMEM59 909127 sc-eQTL 7.48e-01 0.0272 0.0846 0.128 Pro_T L2
ENSG00000116221 MRPL37 778590 sc-eQTL 5.12e-01 -0.0544 0.0828 0.128 Pro_T L2
ENSG00000157216 SSBP3 549152 sc-eQTL 7.89e-01 -0.0249 0.0929 0.128 Pro_T L2
ENSG00000162402 USP24 -252733 sc-eQTL 2.11e-01 0.142 0.113 0.128 Pro_T L2
ENSG00000215883 CYB5RL 762595 sc-eQTL 4.33e-01 -0.0877 0.112 0.128 Pro_T L2
ENSG00000243725 TTC4 246770 sc-eQTL 9.92e-01 0.0013 0.124 0.128 Pro_T L2
ENSG00000006555 TTC22 161308 sc-eQTL 9.73e-02 -0.193 0.116 0.126 Treg L2
ENSG00000116205 TCEANC2 909047 sc-eQTL 8.86e-01 -0.0179 0.125 0.126 Treg L2
ENSG00000116209 TMEM59 909127 sc-eQTL 7.55e-01 0.0309 0.0988 0.126 Treg L2
ENSG00000116221 MRPL37 778590 sc-eQTL 3.04e-01 -0.126 0.122 0.126 Treg L2
ENSG00000157216 SSBP3 549152 sc-eQTL 6.24e-01 -0.0536 0.109 0.126 Treg L2
ENSG00000162402 USP24 -252733 sc-eQTL 7.03e-01 0.0397 0.104 0.126 Treg L2
ENSG00000243725 TTC4 246770 sc-eQTL 8.77e-01 -0.0203 0.131 0.126 Treg L2
ENSG00000116133 DHCR24 75436 sc-eQTL 5.73e-01 -0.0623 0.11 0.122 cDC L2
ENSG00000116205 TCEANC2 909047 sc-eQTL 7.99e-01 0.0333 0.13 0.122 cDC L2
ENSG00000116209 TMEM59 909127 sc-eQTL 2.16e-01 -0.137 0.11 0.122 cDC L2
ENSG00000116221 MRPL37 778590 sc-eQTL 3.40e-01 0.135 0.141 0.122 cDC L2
ENSG00000157216 SSBP3 549152 sc-eQTL 5.11e-01 0.086 0.13 0.122 cDC L2
ENSG00000162390 ACOT11 420374 sc-eQTL 5.01e-01 -0.0818 0.121 0.122 cDC L2
ENSG00000162402 USP24 -252733 sc-eQTL 2.59e-01 0.154 0.136 0.122 cDC L2
ENSG00000215883 CYB5RL 762595 sc-eQTL 3.60e-02 -0.244 0.116 0.122 cDC L2
ENSG00000243725 TTC4 246770 sc-eQTL 9.27e-02 0.234 0.139 0.122 cDC L2
ENSG00000116133 DHCR24 75436 sc-eQTL 3.67e-01 0.0697 0.077 0.126 cMono_IL1B L2
ENSG00000116205 TCEANC2 909047 sc-eQTL 4.36e-01 -0.0836 0.107 0.126 cMono_IL1B L2
ENSG00000116209 TMEM59 909127 sc-eQTL 7.67e-01 -0.0193 0.065 0.126 cMono_IL1B L2
ENSG00000116221 MRPL37 778590 sc-eQTL 3.75e-01 -0.103 0.116 0.126 cMono_IL1B L2
ENSG00000157216 SSBP3 549152 sc-eQTL 5.88e-01 0.0641 0.118 0.126 cMono_IL1B L2
ENSG00000162402 USP24 -252733 sc-eQTL 8.33e-01 -0.0185 0.0873 0.126 cMono_IL1B L2
ENSG00000243725 TTC4 246770 sc-eQTL 5.19e-01 -0.0862 0.133 0.126 cMono_IL1B L2
ENSG00000116133 DHCR24 75436 sc-eQTL 3.32e-01 0.07 0.072 0.126 cMono_S100A L2
ENSG00000116205 TCEANC2 909047 sc-eQTL 3.06e-01 -0.113 0.11 0.126 cMono_S100A L2
ENSG00000116209 TMEM59 909127 sc-eQTL 5.34e-01 -0.0549 0.0881 0.126 cMono_S100A L2
ENSG00000116221 MRPL37 778590 sc-eQTL 7.99e-01 0.0325 0.127 0.126 cMono_S100A L2
ENSG00000157216 SSBP3 549152 sc-eQTL 2.02e-01 -0.169 0.132 0.126 cMono_S100A L2
ENSG00000162402 USP24 -252733 sc-eQTL 3.49e-02 -0.225 0.106 0.126 cMono_S100A L2
ENSG00000243725 TTC4 246770 sc-eQTL 7.52e-01 0.0424 0.134 0.126 cMono_S100A L2
ENSG00000006555 TTC22 161308 sc-eQTL 8.88e-01 0.0172 0.122 0.124 gdT L2
ENSG00000116133 DHCR24 75436 sc-eQTL 2.56e-01 -0.154 0.135 0.124 gdT L2
ENSG00000116205 TCEANC2 909047 sc-eQTL 1.41e-01 0.201 0.136 0.124 gdT L2
ENSG00000116209 TMEM59 909127 sc-eQTL 7.27e-01 -0.0485 0.139 0.124 gdT L2
ENSG00000116221 MRPL37 778590 sc-eQTL 7.22e-01 -0.0566 0.159 0.124 gdT L2
ENSG00000157216 SSBP3 549152 sc-eQTL 2.23e-01 -0.118 0.0968 0.124 gdT L2
ENSG00000162402 USP24 -252733 sc-eQTL 7.82e-01 -0.0363 0.131 0.124 gdT L2
ENSG00000215883 CYB5RL 762595 sc-eQTL 8.30e-01 -0.0292 0.136 0.124 gdT L2
ENSG00000243725 TTC4 246770 sc-eQTL 1.10e-01 -0.244 0.152 0.124 gdT L2
ENSG00000116133 DHCR24 75436 sc-eQTL 1.84e-02 -0.229 0.0962 0.131 intMono L2
ENSG00000116205 TCEANC2 909047 sc-eQTL 2.17e-01 0.15 0.121 0.131 intMono L2
ENSG00000116209 TMEM59 909127 sc-eQTL 9.65e-01 0.00391 0.0892 0.131 intMono L2
ENSG00000116221 MRPL37 778590 sc-eQTL 6.62e-01 -0.0597 0.136 0.131 intMono L2
ENSG00000157216 SSBP3 549152 sc-eQTL 6.48e-01 -0.0637 0.139 0.131 intMono L2
ENSG00000162402 USP24 -252733 sc-eQTL 4.02e-01 0.104 0.124 0.131 intMono L2
ENSG00000243725 TTC4 246770 sc-eQTL 2.47e-01 0.153 0.132 0.131 intMono L2
ENSG00000116133 DHCR24 75436 sc-eQTL 1.97e-02 -0.23 0.0978 0.122 ncMono L2
ENSG00000116205 TCEANC2 909047 sc-eQTL 2.39e-01 -0.146 0.124 0.122 ncMono L2
ENSG00000116209 TMEM59 909127 sc-eQTL 6.28e-01 -0.0481 0.0992 0.122 ncMono L2
ENSG00000116221 MRPL37 778590 sc-eQTL 2.47e-02 0.286 0.126 0.122 ncMono L2
ENSG00000157216 SSBP3 549152 sc-eQTL 6.31e-01 -0.0673 0.14 0.122 ncMono L2
ENSG00000162402 USP24 -252733 sc-eQTL 5.33e-01 0.0697 0.112 0.122 ncMono L2
ENSG00000243725 TTC4 246770 sc-eQTL 6.09e-01 0.0678 0.132 0.122 ncMono L2
ENSG00000116133 DHCR24 75436 sc-eQTL 4.79e-01 0.0855 0.121 0.119 pDC L2
ENSG00000116205 TCEANC2 909047 sc-eQTL 6.32e-01 0.0696 0.145 0.119 pDC L2
ENSG00000116209 TMEM59 909127 sc-eQTL 4.03e-01 -0.0968 0.115 0.119 pDC L2
ENSG00000116221 MRPL37 778590 sc-eQTL 7.72e-01 -0.0445 0.154 0.119 pDC L2
ENSG00000157216 SSBP3 549152 sc-eQTL 5.08e-01 0.0904 0.136 0.119 pDC L2
ENSG00000162390 ACOT11 420374 sc-eQTL 7.90e-01 -0.0153 0.0574 0.119 pDC L2
ENSG00000162402 USP24 -252733 sc-eQTL 4.73e-01 0.0697 0.0968 0.119 pDC L2
ENSG00000215883 CYB5RL 762595 sc-eQTL 5.32e-01 -0.0829 0.132 0.119 pDC L2
ENSG00000243725 TTC4 246770 sc-eQTL 2.61e-01 -0.172 0.152 0.119 pDC L2
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000006555 TTC22 161308 sc-eQTL 9.79e-01 -0.00325 0.123 0.126 B_Memory LOneK1K
ENSG00000116133 DHCR24 75436 sc-eQTL 9.96e-01 0.00056 0.123 0.126 B_Memory LOneK1K
ENSG00000116205 TCEANC2 909047 sc-eQTL 6.39e-01 0.0559 0.119 0.126 B_Memory LOneK1K
ENSG00000116209 TMEM59 909127 sc-eQTL 3.57e-01 -0.0855 0.0925 0.126 B_Memory LOneK1K
ENSG00000116221 MRPL37 778590 sc-eQTL 5.76e-02 -0.21 0.11 0.126 B_Memory LOneK1K
ENSG00000157216 SSBP3 549152 sc-eQTL 1.69e-01 -0.133 0.0961 0.126 B_Memory LOneK1K
ENSG00000162402 USP24 -252733 sc-eQTL 4.04e-01 -0.0734 0.0879 0.126 B_Memory LOneK1K
ENSG00000215883 CYB5RL 762595 sc-eQTL 3.23e-01 -0.134 0.135 0.126 B_Memory LOneK1K
ENSG00000243725 TTC4 246770 sc-eQTL 4.40e-01 -0.0938 0.121 0.126 B_Memory LOneK1K
ENSG00000006555 TTC22 161308 sc-eQTL 6.53e-01 0.0576 0.128 0.126 B_Naive LOneK1K
ENSG00000116133 DHCR24 75436 sc-eQTL 5.75e-01 0.0648 0.115 0.126 B_Naive LOneK1K
ENSG00000116205 TCEANC2 909047 sc-eQTL 5.51e-01 -0.0621 0.104 0.126 B_Naive LOneK1K
ENSG00000116209 TMEM59 909127 sc-eQTL 5.26e-01 0.047 0.074 0.126 B_Naive LOneK1K
ENSG00000116221 MRPL37 778590 sc-eQTL 2.60e-01 -0.12 0.106 0.126 B_Naive LOneK1K
ENSG00000157216 SSBP3 549152 sc-eQTL 4.75e-01 0.0681 0.0952 0.126 B_Naive LOneK1K
ENSG00000162402 USP24 -252733 sc-eQTL 7.44e-01 -0.0267 0.0817 0.126 B_Naive LOneK1K
ENSG00000215883 CYB5RL 762595 sc-eQTL 4.86e-01 -0.0902 0.129 0.126 B_Naive LOneK1K
ENSG00000243725 TTC4 246770 sc-eQTL 5.67e-01 -0.0697 0.122 0.126 B_Naive LOneK1K
ENSG00000116133 DHCR24 75436 sc-eQTL 1.38e-01 0.111 0.0742 0.126 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000116205 TCEANC2 909047 sc-eQTL 3.73e-01 -0.0832 0.0932 0.126 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000116209 TMEM59 909127 sc-eQTL 5.12e-01 -0.0422 0.0643 0.126 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000116221 MRPL37 778590 sc-eQTL 4.64e-01 -0.0835 0.114 0.126 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000157216 SSBP3 549152 sc-eQTL 8.09e-01 -0.0289 0.119 0.126 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000162402 USP24 -252733 sc-eQTL 3.41e-01 -0.0776 0.0814 0.126 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000243725 TTC4 246770 sc-eQTL 5.42e-01 -0.0826 0.135 0.126 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000116133 DHCR24 75436 sc-eQTL 4.41e-02 -0.188 0.0926 0.127 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000116205 TCEANC2 909047 sc-eQTL 9.68e-01 0.00499 0.123 0.127 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000116209 TMEM59 909127 sc-eQTL 4.18e-01 -0.074 0.0913 0.127 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000116221 MRPL37 778590 sc-eQTL 1.72e-01 0.171 0.125 0.127 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000157216 SSBP3 549152 sc-eQTL 5.29e-01 -0.0841 0.133 0.127 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000162402 USP24 -252733 sc-eQTL 3.78e-01 0.0928 0.105 0.127 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000243725 TTC4 246770 sc-eQTL 2.44e-01 0.154 0.132 0.127 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000006555 TTC22 161308 sc-eQTL 7.82e-01 0.0291 0.105 0.127 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000116133 DHCR24 75436 sc-eQTL 9.47e-01 0.00737 0.11 0.127 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000116205 TCEANC2 909047 sc-eQTL 1.00e-01 0.177 0.107 0.127 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000116209 TMEM59 909127 sc-eQTL 3.40e-02 0.176 0.0826 0.127 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000116221 MRPL37 778590 sc-eQTL 8.59e-01 -0.0198 0.112 0.127 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000157216 SSBP3 549152 sc-eQTL 6.84e-02 -0.167 0.091 0.127 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000162398 LEXM 156568 sc-eQTL 3.04e-01 -0.106 0.103 0.127 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000162402 USP24 -252733 sc-eQTL 8.46e-01 0.0128 0.0656 0.127 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000243725 TTC4 246770 sc-eQTL 9.58e-01 0.00615 0.117 0.127 NK_CD56dim LOneK1K


Statistical fine-mapping results from Japan COVID-19 Task Force
(Shown only for PIP>0.001)
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
PIP (SuSiE)
PIP (FINEMAP)
MAF
ENSG00000006555 TTC22 161308 eQTL 0.00085 -0.0738 0.022 0.0 0.0 0.128


Expression Modifier Score(EMS) for GTEx 49tissues
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Whole Blood
Muscle Skeletal
Liver
Brain Cerebellum
Prostate
Spleen
Skin Sun Exposed Lower leg
Artery Coronary
Esophagus Muscularis
Esophagus Gastroesophageal Junction
Artery Tibial
Heart Atrial Appendage
Nerve Tibial
Heart Left Ventricle
Adrenal Gland
Adipose Visceral Omentum
Pancreas
Lung
Pituitary
Brain Nucleus accumbens basal ganglia
Colon Transverse
Adipose Subcutaneous
Esophagus Mucosa
Brain Cortex
Thyroid
Stomach
Breast Mammary Tissue
Colon Sigmoid
Skin Not Sun Exposed Suprapubic
Testis
Artery Aorta
Brain Amygdala
Brain Anterior cingulate cortex BA24
Brain Caudate basal ganglia
Brain Cerebellar Hemisphere
Brain Frontal Cortex BA9
Brain Hippocampus
Brain Hypothalamus
Brain Putamen basal ganglia
Brain Spinal cord cervical c-1
Brain Substantia nigra
Cells Cultured fibroblasts
Cells EBV-transformed lymphocytes
Kidney Cortex
Minor Salivary Gland
Ovary
Small Intestine Terminal Ileum
Uterus
Vagina
ENSG00000162402 \N -252733 1.29e-06 1.18e-06 2.1e-07 1.33e-06 1.77e-07 6.06e-07 1.64e-06 3.28e-07 1.29e-06 4.03e-07 1.65e-06 5.98e-07 2.15e-06 2.95e-07 4.26e-07 8.27e-07 8.06e-07 5.55e-07 5.88e-07 6.76e-07 4.57e-07 1.27e-06 8.89e-07 5.84e-07 2.25e-06 3.66e-07 7.55e-07 7.27e-07 1.28e-06 1.22e-06 6.18e-07 3.9e-08 1.32e-07 6.8e-07 5.25e-07 2.94e-07 4.75e-07 1.56e-07 2.92e-07 2.48e-07 2.98e-07 1.63e-06 9.55e-08 5.71e-08 1.84e-07 1.22e-07 2.09e-07 8.66e-08 5.4e-08