logo

Genes within 1Mb (chr1:54960470:AAAAGCCACT:A):

View on , UCSC , GTEx , gnomAD

Immune cell-type specific single cell cis-eQTLs in OASIS
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000006555 TTC22 159147 sc-eQTL 2.47e-01 0.174 0.15 0.075 B L1
ENSG00000116133 DHCR24 73275 sc-eQTL 3.55e-01 0.131 0.142 0.075 B L1
ENSG00000116205 TCEANC2 906886 sc-eQTL 6.40e-01 0.0574 0.122 0.075 B L1
ENSG00000116209 TMEM59 906966 sc-eQTL 5.49e-01 0.0448 0.0745 0.075 B L1
ENSG00000116221 MRPL37 776429 sc-eQTL 2.91e-01 0.103 0.0974 0.075 B L1
ENSG00000157216 SSBP3 546991 sc-eQTL 9.20e-02 0.172 0.102 0.075 B L1
ENSG00000162402 USP24 -254894 sc-eQTL 5.98e-01 0.0457 0.0865 0.075 B L1
ENSG00000215883 CYB5RL 760434 sc-eQTL 7.27e-01 0.0583 0.167 0.075 B L1
ENSG00000243725 TTC4 244609 sc-eQTL 5.81e-01 -0.0802 0.145 0.075 B L1
ENSG00000006555 TTC22 159147 sc-eQTL 1.78e-01 -0.158 0.117 0.075 CD4T L1
ENSG00000116205 TCEANC2 906886 sc-eQTL 6.71e-01 -0.0407 0.0959 0.075 CD4T L1
ENSG00000116209 TMEM59 906966 sc-eQTL 2.92e-01 0.0942 0.0891 0.075 CD4T L1
ENSG00000116221 MRPL37 776429 sc-eQTL 8.81e-01 -0.0184 0.123 0.075 CD4T L1
ENSG00000157216 SSBP3 546991 sc-eQTL 7.69e-01 0.0301 0.103 0.075 CD4T L1
ENSG00000162402 USP24 -254894 sc-eQTL 1.99e-01 0.107 0.0832 0.075 CD4T L1
ENSG00000243725 TTC4 244609 sc-eQTL 2.03e-01 0.16 0.125 0.075 CD4T L1
ENSG00000006555 TTC22 159147 sc-eQTL 1.38e-01 -0.153 0.103 0.075 CD8T L1
ENSG00000116205 TCEANC2 906886 sc-eQTL 6.62e-01 -0.0563 0.129 0.075 CD8T L1
ENSG00000116209 TMEM59 906966 sc-eQTL 6.87e-01 0.0361 0.0893 0.075 CD8T L1
ENSG00000116221 MRPL37 776429 sc-eQTL 8.80e-01 -0.0186 0.123 0.075 CD8T L1
ENSG00000157216 SSBP3 546991 sc-eQTL 6.37e-01 -0.0417 0.0883 0.075 CD8T L1
ENSG00000162402 USP24 -254894 sc-eQTL 8.13e-01 0.0203 0.0854 0.075 CD8T L1
ENSG00000243725 TTC4 244609 sc-eQTL 2.50e-01 0.171 0.148 0.075 CD8T L1
ENSG00000116133 DHCR24 73275 sc-eQTL 3.02e-01 0.14 0.135 0.077 DC L1
ENSG00000116205 TCEANC2 906886 sc-eQTL 2.50e-01 -0.175 0.151 0.077 DC L1
ENSG00000116209 TMEM59 906966 sc-eQTL 9.19e-01 0.0122 0.119 0.077 DC L1
ENSG00000116221 MRPL37 776429 sc-eQTL 8.34e-01 0.0337 0.16 0.077 DC L1
ENSG00000157216 SSBP3 546991 sc-eQTL 9.90e-01 0.00173 0.143 0.077 DC L1
ENSG00000162390 ACOT11 418213 sc-eQTL 1.31e-01 0.208 0.137 0.077 DC L1
ENSG00000162402 USP24 -254894 sc-eQTL 2.04e-01 -0.105 0.0827 0.077 DC L1
ENSG00000215883 CYB5RL 760434 sc-eQTL 6.46e-01 -0.069 0.15 0.077 DC L1
ENSG00000243725 TTC4 244609 sc-eQTL 1.03e-01 0.263 0.16 0.077 DC L1
ENSG00000116133 DHCR24 73275 sc-eQTL 8.33e-01 0.0207 0.0983 0.075 Mono L1
ENSG00000116205 TCEANC2 906886 sc-eQTL 8.93e-01 0.0143 0.106 0.075 Mono L1
ENSG00000116209 TMEM59 906966 sc-eQTL 1.56e-01 0.112 0.0784 0.075 Mono L1
ENSG00000116221 MRPL37 776429 sc-eQTL 9.11e-01 -0.0147 0.132 0.075 Mono L1
ENSG00000157216 SSBP3 546991 sc-eQTL 8.07e-02 0.263 0.15 0.075 Mono L1
ENSG00000162402 USP24 -254894 sc-eQTL 7.43e-01 0.0296 0.0899 0.075 Mono L1
ENSG00000243725 TTC4 244609 sc-eQTL 2.84e-01 0.169 0.158 0.075 Mono L1
ENSG00000006555 TTC22 159147 sc-eQTL 9.19e-01 -0.0139 0.137 0.075 NK L1
ENSG00000116133 DHCR24 73275 sc-eQTL 4.72e-01 0.0994 0.138 0.075 NK L1
ENSG00000116205 TCEANC2 906886 sc-eQTL 8.33e-01 0.0288 0.136 0.075 NK L1
ENSG00000116209 TMEM59 906966 sc-eQTL 1.20e-01 0.166 0.106 0.075 NK L1
ENSG00000116221 MRPL37 776429 sc-eQTL 5.93e-01 0.0709 0.133 0.075 NK L1
ENSG00000157216 SSBP3 546991 sc-eQTL 6.67e-01 0.0495 0.115 0.075 NK L1
ENSG00000162398 LEXM 154407 sc-eQTL 4.44e-03 -0.364 0.127 0.075 NK L1
ENSG00000162402 USP24 -254894 sc-eQTL 5.66e-01 0.0449 0.0782 0.075 NK L1
ENSG00000243725 TTC4 244609 sc-eQTL 2.38e-01 -0.175 0.148 0.075 NK L1
ENSG00000006555 TTC22 159147 sc-eQTL 6.01e-01 -0.0631 0.12 0.075 Other_T L1
ENSG00000116133 DHCR24 73275 sc-eQTL 6.11e-01 0.0476 0.0935 0.075 Other_T L1
ENSG00000116205 TCEANC2 906886 sc-eQTL 9.43e-01 0.01 0.14 0.075 Other_T L1
ENSG00000116209 TMEM59 906966 sc-eQTL 1.95e-01 0.124 0.0957 0.075 Other_T L1
ENSG00000116221 MRPL37 776429 sc-eQTL 6.83e-01 0.0367 0.0899 0.075 Other_T L1
ENSG00000157216 SSBP3 546991 sc-eQTL 4.96e-01 0.0708 0.104 0.075 Other_T L1
ENSG00000162402 USP24 -254894 sc-eQTL 1.77e-04 0.409 0.107 0.075 Other_T L1
ENSG00000215883 CYB5RL 760434 sc-eQTL 6.63e-02 0.277 0.15 0.075 Other_T L1
ENSG00000243725 TTC4 244609 sc-eQTL 8.26e-01 0.0331 0.151 0.075 Other_T L1
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000006555 TTC22 159147 sc-eQTL 3.31e-01 -0.121 0.124 0.077 B_Activated L2
ENSG00000116133 DHCR24 73275 sc-eQTL 8.77e-01 -0.0227 0.146 0.077 B_Activated L2
ENSG00000116205 TCEANC2 906886 sc-eQTL 8.98e-02 0.266 0.156 0.077 B_Activated L2
ENSG00000116209 TMEM59 906966 sc-eQTL 9.99e-01 -0.000134 0.167 0.077 B_Activated L2
ENSG00000116221 MRPL37 776429 sc-eQTL 2.20e-01 0.221 0.18 0.077 B_Activated L2
ENSG00000157216 SSBP3 546991 sc-eQTL 1.29e-01 0.247 0.162 0.077 B_Activated L2
ENSG00000162402 USP24 -254894 sc-eQTL 6.56e-01 -0.0711 0.159 0.077 B_Activated L2
ENSG00000215883 CYB5RL 760434 sc-eQTL 6.53e-01 -0.0632 0.141 0.077 B_Activated L2
ENSG00000243725 TTC4 244609 sc-eQTL 2.68e-01 -0.169 0.152 0.077 B_Activated L2
ENSG00000006555 TTC22 159147 sc-eQTL 6.61e-01 -0.0709 0.162 0.075 B_Intermediate L2
ENSG00000116133 DHCR24 73275 sc-eQTL 8.88e-01 -0.0212 0.15 0.075 B_Intermediate L2
ENSG00000116205 TCEANC2 906886 sc-eQTL 7.85e-01 -0.0408 0.149 0.075 B_Intermediate L2
ENSG00000116209 TMEM59 906966 sc-eQTL 6.19e-01 0.0637 0.128 0.075 B_Intermediate L2
ENSG00000116221 MRPL37 776429 sc-eQTL 7.31e-01 0.0517 0.151 0.075 B_Intermediate L2
ENSG00000157216 SSBP3 546991 sc-eQTL 5.78e-01 0.0782 0.141 0.075 B_Intermediate L2
ENSG00000162402 USP24 -254894 sc-eQTL 5.18e-02 0.23 0.117 0.075 B_Intermediate L2
ENSG00000215883 CYB5RL 760434 sc-eQTL 2.23e-01 0.204 0.167 0.075 B_Intermediate L2
ENSG00000243725 TTC4 244609 sc-eQTL 2.36e-01 0.18 0.152 0.075 B_Intermediate L2
ENSG00000006555 TTC22 159147 sc-eQTL 1.38e-01 0.231 0.155 0.075 B_Memory L2
ENSG00000116133 DHCR24 73275 sc-eQTL 8.26e-01 0.0341 0.155 0.075 B_Memory L2
ENSG00000116205 TCEANC2 906886 sc-eQTL 5.85e-01 0.0904 0.165 0.075 B_Memory L2
ENSG00000116209 TMEM59 906966 sc-eQTL 2.19e-01 0.169 0.138 0.075 B_Memory L2
ENSG00000116221 MRPL37 776429 sc-eQTL 5.93e-01 -0.0748 0.14 0.075 B_Memory L2
ENSG00000157216 SSBP3 546991 sc-eQTL 3.48e-01 -0.123 0.13 0.075 B_Memory L2
ENSG00000162402 USP24 -254894 sc-eQTL 9.33e-01 0.0108 0.128 0.075 B_Memory L2
ENSG00000215883 CYB5RL 760434 sc-eQTL 2.97e-01 0.165 0.157 0.075 B_Memory L2
ENSG00000243725 TTC4 244609 sc-eQTL 9.32e-01 0.0139 0.164 0.075 B_Memory L2
ENSG00000006555 TTC22 159147 sc-eQTL 5.37e-01 -0.0994 0.161 0.075 B_Naive1 L2
ENSG00000116133 DHCR24 73275 sc-eQTL 2.15e-01 0.187 0.15 0.075 B_Naive1 L2
ENSG00000116205 TCEANC2 906886 sc-eQTL 3.92e-02 -0.277 0.133 0.075 B_Naive1 L2
ENSG00000116209 TMEM59 906966 sc-eQTL 4.57e-01 0.0729 0.0977 0.075 B_Naive1 L2
ENSG00000116221 MRPL37 776429 sc-eQTL 2.25e-01 0.175 0.144 0.075 B_Naive1 L2
ENSG00000157216 SSBP3 546991 sc-eQTL 2.66e-03 0.409 0.134 0.075 B_Naive1 L2
ENSG00000162402 USP24 -254894 sc-eQTL 9.17e-01 -0.0113 0.108 0.075 B_Naive1 L2
ENSG00000215883 CYB5RL 760434 sc-eQTL 5.55e-01 -0.0964 0.163 0.075 B_Naive1 L2
ENSG00000243725 TTC4 244609 sc-eQTL 8.38e-01 -0.0301 0.147 0.075 B_Naive1 L2
ENSG00000006555 TTC22 159147 sc-eQTL 2.76e-01 0.177 0.162 0.075 B_Naive2 L2
ENSG00000116133 DHCR24 73275 sc-eQTL 6.44e-01 0.0655 0.141 0.075 B_Naive2 L2
ENSG00000116205 TCEANC2 906886 sc-eQTL 5.82e-02 0.297 0.156 0.075 B_Naive2 L2
ENSG00000116209 TMEM59 906966 sc-eQTL 6.26e-01 -0.0631 0.129 0.075 B_Naive2 L2
ENSG00000116221 MRPL37 776429 sc-eQTL 8.91e-01 0.0209 0.152 0.075 B_Naive2 L2
ENSG00000157216 SSBP3 546991 sc-eQTL 7.80e-01 -0.0419 0.15 0.075 B_Naive2 L2
ENSG00000162402 USP24 -254894 sc-eQTL 1.66e-01 0.164 0.118 0.075 B_Naive2 L2
ENSG00000215883 CYB5RL 760434 sc-eQTL 3.02e-01 -0.173 0.167 0.075 B_Naive2 L2
ENSG00000243725 TTC4 244609 sc-eQTL 6.36e-01 -0.0825 0.174 0.075 B_Naive2 L2
ENSG00000006555 TTC22 159147 sc-eQTL 7.24e-01 0.0546 0.154 0.073 CD4_CTL L2
ENSG00000116205 TCEANC2 906886 sc-eQTL 9.94e-01 -0.00118 0.159 0.073 CD4_CTL L2
ENSG00000116209 TMEM59 906966 sc-eQTL 7.79e-02 -0.254 0.143 0.073 CD4_CTL L2
ENSG00000116221 MRPL37 776429 sc-eQTL 2.17e-01 -0.219 0.177 0.073 CD4_CTL L2
ENSG00000157216 SSBP3 546991 sc-eQTL 2.87e-01 0.116 0.109 0.073 CD4_CTL L2
ENSG00000162402 USP24 -254894 sc-eQTL 8.71e-01 0.0243 0.15 0.073 CD4_CTL L2
ENSG00000243725 TTC4 244609 sc-eQTL 3.98e-01 0.142 0.168 0.073 CD4_CTL L2
ENSG00000006555 TTC22 159147 sc-eQTL 2.05e-01 -0.175 0.138 0.075 CD4_Naive L2
ENSG00000116205 TCEANC2 906886 sc-eQTL 4.64e-01 -0.0772 0.105 0.075 CD4_Naive L2
ENSG00000116209 TMEM59 906966 sc-eQTL 3.08e-01 0.105 0.102 0.075 CD4_Naive L2
ENSG00000116221 MRPL37 776429 sc-eQTL 9.80e-01 0.0034 0.132 0.075 CD4_Naive L2
ENSG00000157216 SSBP3 546991 sc-eQTL 3.81e-01 -0.0924 0.105 0.075 CD4_Naive L2
ENSG00000162402 USP24 -254894 sc-eQTL 2.97e-01 0.095 0.0908 0.075 CD4_Naive L2
ENSG00000243725 TTC4 244609 sc-eQTL 2.35e-01 0.165 0.138 0.075 CD4_Naive L2
ENSG00000006555 TTC22 159147 sc-eQTL 5.00e-02 -0.285 0.145 0.075 CD4_TCM L2
ENSG00000116205 TCEANC2 906886 sc-eQTL 6.64e-01 0.0618 0.142 0.075 CD4_TCM L2
ENSG00000116209 TMEM59 906966 sc-eQTL 3.47e-01 0.101 0.107 0.075 CD4_TCM L2
ENSG00000116221 MRPL37 776429 sc-eQTL 6.81e-01 -0.0554 0.135 0.075 CD4_TCM L2
ENSG00000157216 SSBP3 546991 sc-eQTL 4.57e-01 0.0984 0.132 0.075 CD4_TCM L2
ENSG00000162402 USP24 -254894 sc-eQTL 7.50e-02 0.194 0.109 0.075 CD4_TCM L2
ENSG00000243725 TTC4 244609 sc-eQTL 2.38e-01 0.186 0.157 0.075 CD4_TCM L2
ENSG00000006555 TTC22 159147 sc-eQTL 8.88e-01 0.0237 0.168 0.075 CD4_TEM L2
ENSG00000116205 TCEANC2 906886 sc-eQTL 9.82e-01 -0.00369 0.159 0.075 CD4_TEM L2
ENSG00000116209 TMEM59 906966 sc-eQTL 6.80e-01 0.0509 0.123 0.075 CD4_TEM L2
ENSG00000116221 MRPL37 776429 sc-eQTL 6.13e-01 0.0802 0.158 0.075 CD4_TEM L2
ENSG00000157216 SSBP3 546991 sc-eQTL 1.42e-01 0.199 0.135 0.075 CD4_TEM L2
ENSG00000162402 USP24 -254894 sc-eQTL 1.97e-01 0.159 0.123 0.075 CD4_TEM L2
ENSG00000243725 TTC4 244609 sc-eQTL 8.20e-01 0.0372 0.163 0.075 CD4_TEM L2
ENSG00000006555 TTC22 159147 sc-eQTL 2.66e-01 -0.148 0.133 0.075 CD8_CTL L2
ENSG00000116205 TCEANC2 906886 sc-eQTL 8.56e-01 0.0268 0.148 0.075 CD8_CTL L2
ENSG00000116209 TMEM59 906966 sc-eQTL 9.65e-01 -0.00558 0.129 0.075 CD8_CTL L2
ENSG00000116221 MRPL37 776429 sc-eQTL 3.62e-01 0.139 0.152 0.075 CD8_CTL L2
ENSG00000157216 SSBP3 546991 sc-eQTL 9.04e-01 0.0125 0.104 0.075 CD8_CTL L2
ENSG00000162402 USP24 -254894 sc-eQTL 7.28e-01 0.0361 0.104 0.075 CD8_CTL L2
ENSG00000243725 TTC4 244609 sc-eQTL 8.73e-01 -0.0248 0.155 0.075 CD8_CTL L2
ENSG00000006555 TTC22 159147 sc-eQTL 8.15e-01 0.0353 0.151 0.075 CD8_Naive L2
ENSG00000116205 TCEANC2 906886 sc-eQTL 5.86e-01 -0.0743 0.136 0.075 CD8_Naive L2
ENSG00000116209 TMEM59 906966 sc-eQTL 6.68e-01 0.0573 0.133 0.075 CD8_Naive L2
ENSG00000116221 MRPL37 776429 sc-eQTL 5.76e-01 -0.0896 0.16 0.075 CD8_Naive L2
ENSG00000157216 SSBP3 546991 sc-eQTL 2.54e-01 0.138 0.121 0.075 CD8_Naive L2
ENSG00000162402 USP24 -254894 sc-eQTL 5.71e-01 -0.0624 0.11 0.075 CD8_Naive L2
ENSG00000243725 TTC4 244609 sc-eQTL 1.23e-02 0.401 0.159 0.075 CD8_Naive L2
ENSG00000006555 TTC22 159147 sc-eQTL 3.65e-01 -0.146 0.161 0.079 CD8_TCM L2
ENSG00000116205 TCEANC2 906886 sc-eQTL 2.89e-01 0.172 0.162 0.079 CD8_TCM L2
ENSG00000116209 TMEM59 906966 sc-eQTL 7.11e-02 -0.257 0.142 0.079 CD8_TCM L2
ENSG00000116221 MRPL37 776429 sc-eQTL 5.50e-01 0.0969 0.162 0.079 CD8_TCM L2
ENSG00000157216 SSBP3 546991 sc-eQTL 8.09e-01 0.034 0.141 0.079 CD8_TCM L2
ENSG00000162402 USP24 -254894 sc-eQTL 9.40e-01 0.0103 0.136 0.079 CD8_TCM L2
ENSG00000243725 TTC4 244609 sc-eQTL 4.29e-01 0.131 0.165 0.079 CD8_TCM L2
ENSG00000006555 TTC22 159147 sc-eQTL 4.43e-01 -0.124 0.161 0.071 CD8_TEM L2
ENSG00000116205 TCEANC2 906886 sc-eQTL 7.82e-01 0.0466 0.168 0.071 CD8_TEM L2
ENSG00000116209 TMEM59 906966 sc-eQTL 2.84e-01 0.174 0.162 0.071 CD8_TEM L2
ENSG00000116221 MRPL37 776429 sc-eQTL 8.36e-01 -0.0342 0.165 0.071 CD8_TEM L2
ENSG00000157216 SSBP3 546991 sc-eQTL 4.69e-01 0.113 0.156 0.071 CD8_TEM L2
ENSG00000162402 USP24 -254894 sc-eQTL 4.01e-01 0.138 0.164 0.071 CD8_TEM L2
ENSG00000243725 TTC4 244609 sc-eQTL 7.98e-01 0.0426 0.167 0.071 CD8_TEM L2
ENSG00000006555 TTC22 159147 sc-eQTL 4.63e-01 -0.107 0.145 0.074 MAIT L2
ENSG00000116133 DHCR24 73275 sc-eQTL 1.57e-02 0.258 0.106 0.074 MAIT L2
ENSG00000116205 TCEANC2 906886 sc-eQTL 9.66e-01 0.00652 0.151 0.074 MAIT L2
ENSG00000116209 TMEM59 906966 sc-eQTL 6.30e-01 0.066 0.137 0.074 MAIT L2
ENSG00000116221 MRPL37 776429 sc-eQTL 7.75e-01 -0.0475 0.166 0.074 MAIT L2
ENSG00000157216 SSBP3 546991 sc-eQTL 5.68e-01 0.084 0.147 0.074 MAIT L2
ENSG00000162402 USP24 -254894 sc-eQTL 1.25e-01 0.2 0.13 0.074 MAIT L2
ENSG00000215883 CYB5RL 760434 sc-eQTL 1.39e-01 0.224 0.151 0.074 MAIT L2
ENSG00000243725 TTC4 244609 sc-eQTL 7.04e-01 0.0575 0.151 0.074 MAIT L2
ENSG00000006555 TTC22 159147 sc-eQTL 3.33e-01 0.161 0.166 0.076 NK_CD56bright L2
ENSG00000116133 DHCR24 73275 sc-eQTL 5.25e-01 -0.0936 0.147 0.076 NK_CD56bright L2
ENSG00000116205 TCEANC2 906886 sc-eQTL 7.11e-01 -0.0575 0.155 0.076 NK_CD56bright L2
ENSG00000116209 TMEM59 906966 sc-eQTL 6.36e-01 0.0718 0.151 0.076 NK_CD56bright L2
ENSG00000116221 MRPL37 776429 sc-eQTL 1.68e-01 0.233 0.169 0.076 NK_CD56bright L2
ENSG00000157216 SSBP3 546991 sc-eQTL 7.58e-01 0.0393 0.128 0.076 NK_CD56bright L2
ENSG00000162398 LEXM 154407 sc-eQTL 5.78e-01 -0.0839 0.151 0.076 NK_CD56bright L2
ENSG00000162402 USP24 -254894 sc-eQTL 3.68e-01 -0.117 0.129 0.076 NK_CD56bright L2
ENSG00000243725 TTC4 244609 sc-eQTL 8.70e-01 -0.0268 0.164 0.076 NK_CD56bright L2
ENSG00000006555 TTC22 159147 sc-eQTL 9.18e-01 -0.0142 0.138 0.075 NK_CD56dim L2
ENSG00000116133 DHCR24 73275 sc-eQTL 2.39e-01 0.169 0.143 0.075 NK_CD56dim L2
ENSG00000116205 TCEANC2 906886 sc-eQTL 6.65e-01 0.0673 0.155 0.075 NK_CD56dim L2
ENSG00000116209 TMEM59 906966 sc-eQTL 4.69e-02 0.228 0.114 0.075 NK_CD56dim L2
ENSG00000116221 MRPL37 776429 sc-eQTL 2.78e-01 -0.163 0.149 0.075 NK_CD56dim L2
ENSG00000157216 SSBP3 546991 sc-eQTL 8.73e-01 0.0196 0.123 0.075 NK_CD56dim L2
ENSG00000162398 LEXM 154407 sc-eQTL 1.92e-04 -0.518 0.136 0.075 NK_CD56dim L2
ENSG00000162402 USP24 -254894 sc-eQTL 2.70e-01 0.0989 0.0894 0.075 NK_CD56dim L2
ENSG00000243725 TTC4 244609 sc-eQTL 8.43e-01 -0.0304 0.153 0.075 NK_CD56dim L2
ENSG00000006555 TTC22 159147 sc-eQTL 3.77e-01 0.146 0.165 0.071 NK_HLA L2
ENSG00000116133 DHCR24 73275 sc-eQTL 6.31e-01 -0.0777 0.161 0.071 NK_HLA L2
ENSG00000116205 TCEANC2 906886 sc-eQTL 5.18e-01 -0.101 0.155 0.071 NK_HLA L2
ENSG00000116209 TMEM59 906966 sc-eQTL 3.52e-01 -0.144 0.154 0.071 NK_HLA L2
ENSG00000116221 MRPL37 776429 sc-eQTL 9.71e-02 0.282 0.169 0.071 NK_HLA L2
ENSG00000157216 SSBP3 546991 sc-eQTL 3.50e-01 0.13 0.139 0.071 NK_HLA L2
ENSG00000162398 LEXM 154407 sc-eQTL 9.62e-01 -0.00745 0.157 0.071 NK_HLA L2
ENSG00000162402 USP24 -254894 sc-eQTL 7.97e-01 0.0296 0.115 0.071 NK_HLA L2
ENSG00000243725 TTC4 244609 sc-eQTL 9.40e-01 0.013 0.172 0.071 NK_HLA L2
ENSG00000006555 TTC22 159147 sc-eQTL 3.58e-01 -0.135 0.147 0.075 NK_cytokine L2
ENSG00000116133 DHCR24 73275 sc-eQTL 6.05e-01 0.077 0.148 0.075 NK_cytokine L2
ENSG00000116205 TCEANC2 906886 sc-eQTL 5.80e-01 0.0817 0.147 0.075 NK_cytokine L2
ENSG00000116209 TMEM59 906966 sc-eQTL 1.36e-01 0.178 0.119 0.075 NK_cytokine L2
ENSG00000116221 MRPL37 776429 sc-eQTL 2.60e-01 0.166 0.147 0.075 NK_cytokine L2
ENSG00000157216 SSBP3 546991 sc-eQTL 9.31e-01 0.0108 0.124 0.075 NK_cytokine L2
ENSG00000162398 LEXM 154407 sc-eQTL 5.95e-02 -0.291 0.154 0.075 NK_cytokine L2
ENSG00000162402 USP24 -254894 sc-eQTL 1.66e-01 0.146 0.105 0.075 NK_cytokine L2
ENSG00000243725 TTC4 244609 sc-eQTL 6.70e-03 -0.421 0.154 0.075 NK_cytokine L2
ENSG00000006555 TTC22 159147 sc-eQTL 7.93e-02 0.312 0.176 0.078 PB L2
ENSG00000116133 DHCR24 73275 sc-eQTL 2.22e-01 -0.193 0.157 0.078 PB L2
ENSG00000116205 TCEANC2 906886 sc-eQTL 3.62e-01 -0.176 0.192 0.078 PB L2
ENSG00000116209 TMEM59 906966 sc-eQTL 8.66e-01 0.0136 0.0806 0.078 PB L2
ENSG00000116221 MRPL37 776429 sc-eQTL 8.62e-01 -0.0255 0.146 0.078 PB L2
ENSG00000157216 SSBP3 546991 sc-eQTL 1.65e-01 -0.234 0.168 0.078 PB L2
ENSG00000162402 USP24 -254894 sc-eQTL 6.41e-01 0.0899 0.192 0.078 PB L2
ENSG00000215883 CYB5RL 760434 sc-eQTL 1.16e-01 -0.312 0.197 0.078 PB L2
ENSG00000243725 TTC4 244609 sc-eQTL 6.80e-01 -0.0769 0.186 0.078 PB L2
ENSG00000006555 TTC22 159147 sc-eQTL 3.09e-02 -0.321 0.148 0.076 Pro_T L2
ENSG00000116133 DHCR24 73275 sc-eQTL 6.84e-01 -0.0518 0.127 0.076 Pro_T L2
ENSG00000116205 TCEANC2 906886 sc-eQTL 8.29e-01 0.0336 0.155 0.076 Pro_T L2
ENSG00000116209 TMEM59 906966 sc-eQTL 7.02e-01 0.0412 0.107 0.076 Pro_T L2
ENSG00000116221 MRPL37 776429 sc-eQTL 5.50e-01 0.0631 0.105 0.076 Pro_T L2
ENSG00000157216 SSBP3 546991 sc-eQTL 8.77e-01 -0.0183 0.118 0.076 Pro_T L2
ENSG00000162402 USP24 -254894 sc-eQTL 3.72e-01 0.129 0.144 0.076 Pro_T L2
ENSG00000215883 CYB5RL 760434 sc-eQTL 4.14e-02 0.289 0.141 0.076 Pro_T L2
ENSG00000243725 TTC4 244609 sc-eQTL 8.00e-01 0.0402 0.158 0.076 Pro_T L2
ENSG00000006555 TTC22 159147 sc-eQTL 1.33e-01 0.221 0.146 0.075 Treg L2
ENSG00000116205 TCEANC2 906886 sc-eQTL 5.72e-01 -0.089 0.157 0.075 Treg L2
ENSG00000116209 TMEM59 906966 sc-eQTL 6.77e-01 -0.0519 0.124 0.075 Treg L2
ENSG00000116221 MRPL37 776429 sc-eQTL 5.54e-01 0.0912 0.154 0.075 Treg L2
ENSG00000157216 SSBP3 546991 sc-eQTL 7.21e-02 0.247 0.136 0.075 Treg L2
ENSG00000162402 USP24 -254894 sc-eQTL 7.61e-01 -0.0398 0.131 0.075 Treg L2
ENSG00000243725 TTC4 244609 sc-eQTL 9.78e-01 -0.00457 0.165 0.075 Treg L2
ENSG00000116133 DHCR24 73275 sc-eQTL 8.92e-01 0.0185 0.136 0.076 cDC L2
ENSG00000116205 TCEANC2 906886 sc-eQTL 3.89e-01 -0.138 0.161 0.076 cDC L2
ENSG00000116209 TMEM59 906966 sc-eQTL 2.42e-01 0.16 0.136 0.076 cDC L2
ENSG00000116221 MRPL37 776429 sc-eQTL 9.64e-01 -0.00796 0.175 0.076 cDC L2
ENSG00000157216 SSBP3 546991 sc-eQTL 6.83e-01 -0.0659 0.161 0.076 cDC L2
ENSG00000162390 ACOT11 418213 sc-eQTL 4.70e-01 0.108 0.15 0.076 cDC L2
ENSG00000162402 USP24 -254894 sc-eQTL 5.14e-01 -0.11 0.168 0.076 cDC L2
ENSG00000215883 CYB5RL 760434 sc-eQTL 3.39e-01 -0.138 0.144 0.076 cDC L2
ENSG00000243725 TTC4 244609 sc-eQTL 7.09e-02 0.31 0.171 0.076 cDC L2
ENSG00000116133 DHCR24 73275 sc-eQTL 5.50e-01 0.0581 0.0971 0.075 cMono_IL1B L2
ENSG00000116205 TCEANC2 906886 sc-eQTL 8.44e-01 0.0266 0.135 0.075 cMono_IL1B L2
ENSG00000116209 TMEM59 906966 sc-eQTL 1.65e-01 0.114 0.0815 0.075 cMono_IL1B L2
ENSG00000116221 MRPL37 776429 sc-eQTL 1.13e-01 -0.231 0.145 0.075 cMono_IL1B L2
ENSG00000157216 SSBP3 546991 sc-eQTL 7.35e-02 0.266 0.148 0.075 cMono_IL1B L2
ENSG00000162402 USP24 -254894 sc-eQTL 3.16e-01 -0.11 0.11 0.075 cMono_IL1B L2
ENSG00000243725 TTC4 244609 sc-eQTL 6.99e-01 0.065 0.168 0.075 cMono_IL1B L2
ENSG00000116133 DHCR24 73275 sc-eQTL 4.55e-01 -0.068 0.0909 0.075 cMono_S100A L2
ENSG00000116205 TCEANC2 906886 sc-eQTL 9.90e-01 0.00166 0.139 0.075 cMono_S100A L2
ENSG00000116209 TMEM59 906966 sc-eQTL 9.93e-01 0.00097 0.111 0.075 cMono_S100A L2
ENSG00000116221 MRPL37 776429 sc-eQTL 3.15e-01 0.161 0.16 0.075 cMono_S100A L2
ENSG00000157216 SSBP3 546991 sc-eQTL 8.37e-01 -0.0344 0.167 0.075 cMono_S100A L2
ENSG00000162402 USP24 -254894 sc-eQTL 2.76e-01 0.147 0.135 0.075 cMono_S100A L2
ENSG00000243725 TTC4 244609 sc-eQTL 8.38e-01 0.0346 0.169 0.075 cMono_S100A L2
ENSG00000006555 TTC22 159147 sc-eQTL 4.65e-01 -0.115 0.156 0.067 gdT L2
ENSG00000116133 DHCR24 73275 sc-eQTL 4.48e-01 0.133 0.174 0.067 gdT L2
ENSG00000116205 TCEANC2 906886 sc-eQTL 9.13e-01 -0.0193 0.175 0.067 gdT L2
ENSG00000116209 TMEM59 906966 sc-eQTL 1.16e-01 0.279 0.176 0.067 gdT L2
ENSG00000116221 MRPL37 776429 sc-eQTL 5.15e-01 -0.133 0.204 0.067 gdT L2
ENSG00000157216 SSBP3 546991 sc-eQTL 3.99e-01 -0.105 0.125 0.067 gdT L2
ENSG00000162402 USP24 -254894 sc-eQTL 4.70e-04 0.575 0.161 0.067 gdT L2
ENSG00000215883 CYB5RL 760434 sc-eQTL 2.01e-01 -0.223 0.173 0.067 gdT L2
ENSG00000243725 TTC4 244609 sc-eQTL 9.62e-01 0.00933 0.197 0.067 gdT L2
ENSG00000116133 DHCR24 73275 sc-eQTL 8.28e-01 0.0264 0.122 0.073 intMono L2
ENSG00000116205 TCEANC2 906886 sc-eQTL 5.89e-01 0.0819 0.151 0.073 intMono L2
ENSG00000116209 TMEM59 906966 sc-eQTL 8.18e-02 0.193 0.11 0.073 intMono L2
ENSG00000116221 MRPL37 776429 sc-eQTL 4.17e-01 0.138 0.17 0.073 intMono L2
ENSG00000157216 SSBP3 546991 sc-eQTL 9.19e-01 0.0177 0.174 0.073 intMono L2
ENSG00000162402 USP24 -254894 sc-eQTL 2.77e-01 0.168 0.154 0.073 intMono L2
ENSG00000243725 TTC4 244609 sc-eQTL 3.89e-02 0.339 0.163 0.073 intMono L2
ENSG00000116133 DHCR24 73275 sc-eQTL 8.54e-02 0.2 0.116 0.077 ncMono L2
ENSG00000116205 TCEANC2 906886 sc-eQTL 3.30e-01 -0.142 0.146 0.077 ncMono L2
ENSG00000116209 TMEM59 906966 sc-eQTL 1.89e-02 0.273 0.115 0.077 ncMono L2
ENSG00000116221 MRPL37 776429 sc-eQTL 9.43e-01 -0.0108 0.151 0.077 ncMono L2
ENSG00000157216 SSBP3 546991 sc-eQTL 3.65e-02 0.343 0.163 0.077 ncMono L2
ENSG00000162402 USP24 -254894 sc-eQTL 9.26e-01 0.0122 0.132 0.077 ncMono L2
ENSG00000243725 TTC4 244609 sc-eQTL 9.80e-01 0.004 0.156 0.077 ncMono L2
ENSG00000116133 DHCR24 73275 sc-eQTL 3.53e-01 0.131 0.14 0.082 pDC L2
ENSG00000116205 TCEANC2 906886 sc-eQTL 8.05e-01 -0.0417 0.169 0.082 pDC L2
ENSG00000116209 TMEM59 906966 sc-eQTL 8.58e-01 0.0242 0.135 0.082 pDC L2
ENSG00000116221 MRPL37 776429 sc-eQTL 7.36e-01 -0.0605 0.179 0.082 pDC L2
ENSG00000157216 SSBP3 546991 sc-eQTL 4.75e-01 0.114 0.159 0.082 pDC L2
ENSG00000162390 ACOT11 418213 sc-eQTL 1.02e-02 0.17 0.0654 0.082 pDC L2
ENSG00000162402 USP24 -254894 sc-eQTL 7.43e-01 -0.0371 0.113 0.082 pDC L2
ENSG00000215883 CYB5RL 760434 sc-eQTL 4.00e-01 0.13 0.154 0.082 pDC L2
ENSG00000243725 TTC4 244609 sc-eQTL 8.59e-01 0.0316 0.178 0.082 pDC L2
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000006555 TTC22 159147 sc-eQTL 5.56e-01 0.0912 0.155 0.075 B_Memory LOneK1K
ENSG00000116133 DHCR24 73275 sc-eQTL 8.71e-01 -0.0252 0.155 0.075 B_Memory LOneK1K
ENSG00000116205 TCEANC2 906886 sc-eQTL 4.82e-01 0.105 0.15 0.075 B_Memory LOneK1K
ENSG00000116209 TMEM59 906966 sc-eQTL 4.68e-01 0.0848 0.117 0.075 B_Memory LOneK1K
ENSG00000116221 MRPL37 776429 sc-eQTL 4.53e-01 0.105 0.14 0.075 B_Memory LOneK1K
ENSG00000157216 SSBP3 546991 sc-eQTL 9.16e-01 0.0129 0.122 0.075 B_Memory LOneK1K
ENSG00000162402 USP24 -254894 sc-eQTL 8.25e-01 0.0246 0.111 0.075 B_Memory LOneK1K
ENSG00000215883 CYB5RL 760434 sc-eQTL 1.66e-01 0.236 0.17 0.075 B_Memory LOneK1K
ENSG00000243725 TTC4 244609 sc-eQTL 5.87e-01 0.0832 0.153 0.075 B_Memory LOneK1K
ENSG00000006555 TTC22 159147 sc-eQTL 3.93e-01 0.139 0.162 0.075 B_Naive LOneK1K
ENSG00000116133 DHCR24 73275 sc-eQTL 1.34e-01 0.219 0.146 0.075 B_Naive LOneK1K
ENSG00000116205 TCEANC2 906886 sc-eQTL 7.36e-01 -0.0447 0.132 0.075 B_Naive LOneK1K
ENSG00000116209 TMEM59 906966 sc-eQTL 8.36e-01 0.0195 0.094 0.075 B_Naive LOneK1K
ENSG00000116221 MRPL37 776429 sc-eQTL 3.04e-01 0.139 0.135 0.075 B_Naive LOneK1K
ENSG00000157216 SSBP3 546991 sc-eQTL 1.02e-02 0.309 0.119 0.075 B_Naive LOneK1K
ENSG00000162402 USP24 -254894 sc-eQTL 3.98e-01 0.0877 0.104 0.075 B_Naive LOneK1K
ENSG00000215883 CYB5RL 760434 sc-eQTL 3.19e-01 -0.164 0.164 0.075 B_Naive LOneK1K
ENSG00000243725 TTC4 244609 sc-eQTL 6.38e-01 -0.0728 0.154 0.075 B_Naive LOneK1K
ENSG00000116133 DHCR24 73275 sc-eQTL 7.20e-01 0.0336 0.0938 0.075 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000116205 TCEANC2 906886 sc-eQTL 7.95e-01 0.0305 0.117 0.075 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000116209 TMEM59 906966 sc-eQTL 3.07e-01 0.0827 0.0808 0.075 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000116221 MRPL37 776429 sc-eQTL 6.66e-01 -0.062 0.143 0.075 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000157216 SSBP3 546991 sc-eQTL 1.45e-01 0.218 0.149 0.075 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000162402 USP24 -254894 sc-eQTL 6.97e-01 -0.04 0.103 0.075 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000243725 TTC4 244609 sc-eQTL 4.95e-01 0.116 0.17 0.075 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000116133 DHCR24 73275 sc-eQTL 5.78e-01 0.063 0.113 0.075 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000116205 TCEANC2 906886 sc-eQTL 6.97e-01 -0.058 0.149 0.075 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000116209 TMEM59 906966 sc-eQTL 1.77e-02 0.261 0.109 0.075 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000116221 MRPL37 776429 sc-eQTL 7.11e-01 0.0562 0.151 0.075 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000157216 SSBP3 546991 sc-eQTL 1.31e-01 0.244 0.161 0.075 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000162402 USP24 -254894 sc-eQTL 3.50e-01 0.119 0.127 0.075 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000243725 TTC4 244609 sc-eQTL 2.03e-01 0.203 0.159 0.075 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000006555 TTC22 159147 sc-eQTL 7.18e-01 -0.0482 0.133 0.075 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000116133 DHCR24 73275 sc-eQTL 3.40e-01 0.133 0.139 0.075 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000116205 TCEANC2 906886 sc-eQTL 4.64e-01 0.1 0.136 0.075 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000116209 TMEM59 906966 sc-eQTL 1.17e-01 0.165 0.105 0.075 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000116221 MRPL37 776429 sc-eQTL 9.91e-01 -0.00156 0.142 0.075 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000157216 SSBP3 546991 sc-eQTL 6.39e-01 0.0545 0.116 0.075 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000162398 LEXM 154407 sc-eQTL 1.28e-03 -0.417 0.128 0.075 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000162402 USP24 -254894 sc-eQTL 3.37e-01 0.0798 0.0828 0.075 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000243725 TTC4 244609 sc-eQTL 1.11e-01 -0.235 0.147 0.075 NK_CD56dim LOneK1K

Statistical fine-mapping results from Japan COVID-19 Task Force
(Shown only for PIP>0.001)
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
PIP (SuSiE)
PIP (FINEMAP)
MAF
ENSG00000157216 SSBP3 546991 eQTL 0.0209 -0.0601 0.026 0.00112 0.0 0.0707
ENSG00000162390 ACOT11 418213 eQTL 0.00807 0.115 0.0434 0.00104 0.0 0.0707
ENSG00000162399 BSND -37723 pQTL 0.022 0.14 0.0609 0.00143 0.0 0.0694
ENSG00000169174 PCSK9 -79078 eQTL 0.0386 -0.0661 0.0319 0.0 0.0 0.0707

Expression Modifier Score(EMS) for GTEx 49tissues
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Whole Blood
Muscle Skeletal
Liver
Brain Cerebellum
Prostate
Spleen
Skin Sun Exposed Lower leg
Artery Coronary
Esophagus Muscularis
Esophagus Gastroesophageal Junction
Artery Tibial
Heart Atrial Appendage
Nerve Tibial
Heart Left Ventricle
Adrenal Gland
Adipose Visceral Omentum
Pancreas
Lung
Pituitary
Brain Nucleus accumbens basal ganglia
Colon Transverse
Adipose Subcutaneous
Esophagus Mucosa
Brain Cortex
Thyroid
Stomach
Breast Mammary Tissue
Colon Sigmoid
Skin Not Sun Exposed Suprapubic
Testis
Artery Aorta
Brain Amygdala
Brain Anterior cingulate cortex BA24
Brain Caudate basal ganglia
Brain Cerebellar Hemisphere
Brain Frontal Cortex BA9
Brain Hippocampus
Brain Hypothalamus
Brain Putamen basal ganglia
Brain Spinal cord cervical c-1
Brain Substantia nigra
Cells Cultured fibroblasts
Cells EBV-transformed lymphocytes
Kidney Cortex
Minor Salivary Gland
Ovary
Small Intestine Terminal Ileum
Uterus
Vagina