logo

Genes within 1Mb (chr1:54958117:A:G):

View on , UCSC , GTEx , gnomAD

Immune cell-type specific single cell cis-eQTLs in OASIS
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000006555 TTC22 156794 sc-eQTL 7.56e-01 0.0297 0.0955 0.263 B L1
ENSG00000116133 DHCR24 70922 sc-eQTL 5.31e-01 -0.0566 0.0902 0.263 B L1
ENSG00000116205 TCEANC2 904533 sc-eQTL 8.67e-02 -0.133 0.0774 0.263 B L1
ENSG00000116209 TMEM59 904613 sc-eQTL 3.89e-01 0.0409 0.0474 0.263 B L1
ENSG00000116221 MRPL37 774076 sc-eQTL 7.83e-01 0.0171 0.0621 0.263 B L1
ENSG00000157216 SSBP3 544638 sc-eQTL 6.74e-01 -0.0274 0.065 0.263 B L1
ENSG00000162402 USP24 -257247 sc-eQTL 2.29e-01 -0.0663 0.0549 0.263 B L1
ENSG00000215883 CYB5RL 758081 sc-eQTL 9.07e-02 0.179 0.105 0.263 B L1
ENSG00000243725 TTC4 242256 sc-eQTL 8.92e-01 -0.0125 0.0923 0.263 B L1
ENSG00000006555 TTC22 156794 sc-eQTL 2.74e-02 -0.163 0.0733 0.263 CD4T L1
ENSG00000116205 TCEANC2 904533 sc-eQTL 2.25e-01 0.0735 0.0604 0.263 CD4T L1
ENSG00000116209 TMEM59 904613 sc-eQTL 3.06e-01 -0.0578 0.0563 0.263 CD4T L1
ENSG00000116221 MRPL37 774076 sc-eQTL 4.49e-01 0.0592 0.0779 0.263 CD4T L1
ENSG00000157216 SSBP3 544638 sc-eQTL 9.92e-02 -0.107 0.0644 0.263 CD4T L1
ENSG00000162402 USP24 -257247 sc-eQTL 2.26e-01 -0.0638 0.0526 0.263 CD4T L1
ENSG00000243725 TTC4 242256 sc-eQTL 2.46e-02 -0.178 0.0785 0.263 CD4T L1
ENSG00000006555 TTC22 156794 sc-eQTL 3.07e-01 -0.0663 0.0648 0.263 CD8T L1
ENSG00000116205 TCEANC2 904533 sc-eQTL 8.33e-01 0.0171 0.0809 0.263 CD8T L1
ENSG00000116209 TMEM59 904613 sc-eQTL 6.36e-01 -0.0266 0.0562 0.263 CD8T L1
ENSG00000116221 MRPL37 774076 sc-eQTL 4.76e-01 -0.0551 0.0772 0.263 CD8T L1
ENSG00000157216 SSBP3 544638 sc-eQTL 8.00e-01 -0.0141 0.0556 0.263 CD8T L1
ENSG00000162402 USP24 -257247 sc-eQTL 9.50e-01 -0.00338 0.0537 0.263 CD8T L1
ENSG00000243725 TTC4 242256 sc-eQTL 5.57e-01 -0.0548 0.0931 0.263 CD8T L1
ENSG00000116133 DHCR24 70922 sc-eQTL 1.42e-01 -0.126 0.0857 0.259 DC L1
ENSG00000116205 TCEANC2 904533 sc-eQTL 7.65e-01 0.0289 0.0966 0.259 DC L1
ENSG00000116209 TMEM59 904613 sc-eQTL 7.36e-01 0.0257 0.0759 0.259 DC L1
ENSG00000116221 MRPL37 774076 sc-eQTL 5.87e-01 0.0555 0.102 0.259 DC L1
ENSG00000157216 SSBP3 544638 sc-eQTL 2.96e-01 -0.095 0.0907 0.259 DC L1
ENSG00000162390 ACOT11 415860 sc-eQTL 6.41e-01 0.0408 0.0874 0.259 DC L1
ENSG00000162402 USP24 -257247 sc-eQTL 4.90e-01 -0.0364 0.0527 0.259 DC L1
ENSG00000215883 CYB5RL 758081 sc-eQTL 9.61e-02 0.158 0.0947 0.259 DC L1
ENSG00000243725 TTC4 242256 sc-eQTL 2.85e-01 -0.11 0.102 0.259 DC L1
ENSG00000116133 DHCR24 70922 sc-eQTL 6.57e-01 -0.0278 0.0625 0.263 Mono L1
ENSG00000116205 TCEANC2 904533 sc-eQTL 5.92e-01 -0.0362 0.0674 0.263 Mono L1
ENSG00000116209 TMEM59 904613 sc-eQTL 5.86e-01 0.0273 0.0501 0.263 Mono L1
ENSG00000116221 MRPL37 774076 sc-eQTL 1.06e-01 -0.135 0.0833 0.263 Mono L1
ENSG00000157216 SSBP3 544638 sc-eQTL 1.77e-03 0.297 0.0938 0.263 Mono L1
ENSG00000162402 USP24 -257247 sc-eQTL 9.41e-01 0.00421 0.0572 0.263 Mono L1
ENSG00000243725 TTC4 242256 sc-eQTL 3.10e-01 -0.102 0.101 0.263 Mono L1
ENSG00000006555 TTC22 156794 sc-eQTL 8.14e-01 -0.0201 0.0854 0.264 NK L1
ENSG00000116133 DHCR24 70922 sc-eQTL 1.04e-02 -0.219 0.0848 0.264 NK L1
ENSG00000116205 TCEANC2 904533 sc-eQTL 4.47e-01 -0.0647 0.0849 0.264 NK L1
ENSG00000116209 TMEM59 904613 sc-eQTL 2.85e-01 -0.0712 0.0664 0.264 NK L1
ENSG00000116221 MRPL37 774076 sc-eQTL 3.87e-01 -0.0717 0.0826 0.264 NK L1
ENSG00000157216 SSBP3 544638 sc-eQTL 3.70e-02 0.149 0.0711 0.264 NK L1
ENSG00000162398 LEXM 152054 sc-eQTL 9.77e-01 0.00234 0.0806 0.264 NK L1
ENSG00000162402 USP24 -257247 sc-eQTL 5.07e-01 -0.0324 0.0488 0.264 NK L1
ENSG00000243725 TTC4 242256 sc-eQTL 6.95e-01 -0.0362 0.0924 0.264 NK L1
ENSG00000006555 TTC22 156794 sc-eQTL 4.78e-01 -0.0536 0.0753 0.263 Other_T L1
ENSG00000116133 DHCR24 70922 sc-eQTL 6.74e-01 0.0246 0.0584 0.263 Other_T L1
ENSG00000116205 TCEANC2 904533 sc-eQTL 7.88e-01 -0.0235 0.0875 0.263 Other_T L1
ENSG00000116209 TMEM59 904613 sc-eQTL 9.11e-01 0.00671 0.06 0.263 Other_T L1
ENSG00000116221 MRPL37 774076 sc-eQTL 2.44e-01 0.0654 0.0561 0.263 Other_T L1
ENSG00000157216 SSBP3 544638 sc-eQTL 8.53e-01 0.012 0.0651 0.263 Other_T L1
ENSG00000162402 USP24 -257247 sc-eQTL 4.81e-01 0.0489 0.0692 0.263 Other_T L1
ENSG00000215883 CYB5RL 758081 sc-eQTL 3.38e-01 -0.0907 0.0945 0.263 Other_T L1
ENSG00000243725 TTC4 242256 sc-eQTL 6.97e-01 -0.0367 0.0943 0.263 Other_T L1
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000006555 TTC22 156794 sc-eQTL 5.70e-01 0.0459 0.0806 0.273 B_Activated L2
ENSG00000116133 DHCR24 70922 sc-eQTL 3.58e-01 -0.0871 0.0946 0.273 B_Activated L2
ENSG00000116205 TCEANC2 904533 sc-eQTL 5.92e-01 0.0546 0.102 0.273 B_Activated L2
ENSG00000116209 TMEM59 904613 sc-eQTL 7.47e-01 0.035 0.108 0.273 B_Activated L2
ENSG00000116221 MRPL37 774076 sc-eQTL 3.53e-01 0.108 0.117 0.273 B_Activated L2
ENSG00000157216 SSBP3 544638 sc-eQTL 4.98e-01 0.0717 0.106 0.273 B_Activated L2
ENSG00000162402 USP24 -257247 sc-eQTL 4.44e-02 -0.207 0.102 0.273 B_Activated L2
ENSG00000215883 CYB5RL 758081 sc-eQTL 5.06e-01 0.0606 0.091 0.273 B_Activated L2
ENSG00000243725 TTC4 242256 sc-eQTL 3.93e-01 0.0844 0.0986 0.273 B_Activated L2
ENSG00000006555 TTC22 156794 sc-eQTL 3.13e-01 0.102 0.101 0.264 B_Intermediate L2
ENSG00000116133 DHCR24 70922 sc-eQTL 4.53e-01 -0.0705 0.0937 0.264 B_Intermediate L2
ENSG00000116205 TCEANC2 904533 sc-eQTL 6.79e-01 0.0387 0.0935 0.264 B_Intermediate L2
ENSG00000116209 TMEM59 904613 sc-eQTL 2.96e-01 0.0836 0.0798 0.264 B_Intermediate L2
ENSG00000116221 MRPL37 774076 sc-eQTL 1.35e-01 0.14 0.0936 0.264 B_Intermediate L2
ENSG00000157216 SSBP3 544638 sc-eQTL 1.91e-01 -0.115 0.0876 0.264 B_Intermediate L2
ENSG00000162402 USP24 -257247 sc-eQTL 5.27e-01 -0.0469 0.074 0.264 B_Intermediate L2
ENSG00000215883 CYB5RL 758081 sc-eQTL 5.20e-01 -0.0675 0.105 0.264 B_Intermediate L2
ENSG00000243725 TTC4 242256 sc-eQTL 9.52e-01 0.00571 0.0953 0.264 B_Intermediate L2
ENSG00000006555 TTC22 156794 sc-eQTL 8.06e-01 0.0239 0.0974 0.263 B_Memory L2
ENSG00000116133 DHCR24 70922 sc-eQTL 9.02e-01 0.0119 0.0967 0.263 B_Memory L2
ENSG00000116205 TCEANC2 904533 sc-eQTL 3.28e-02 -0.22 0.102 0.263 B_Memory L2
ENSG00000116209 TMEM59 904613 sc-eQTL 1.96e-01 0.111 0.0859 0.263 B_Memory L2
ENSG00000116221 MRPL37 774076 sc-eQTL 4.11e-01 0.0718 0.0872 0.263 B_Memory L2
ENSG00000157216 SSBP3 544638 sc-eQTL 7.45e-01 0.0266 0.0815 0.263 B_Memory L2
ENSG00000162402 USP24 -257247 sc-eQTL 6.35e-01 -0.0379 0.0797 0.263 B_Memory L2
ENSG00000215883 CYB5RL 758081 sc-eQTL 9.05e-01 -0.0118 0.0986 0.263 B_Memory L2
ENSG00000243725 TTC4 242256 sc-eQTL 5.28e-01 0.0645 0.102 0.263 B_Memory L2
ENSG00000006555 TTC22 156794 sc-eQTL 4.60e-01 0.0759 0.103 0.263 B_Naive1 L2
ENSG00000116133 DHCR24 70922 sc-eQTL 3.41e-01 -0.0918 0.0962 0.263 B_Naive1 L2
ENSG00000116205 TCEANC2 904533 sc-eQTL 2.58e-01 -0.0972 0.0857 0.263 B_Naive1 L2
ENSG00000116209 TMEM59 904613 sc-eQTL 6.12e-01 -0.0317 0.0624 0.263 B_Naive1 L2
ENSG00000116221 MRPL37 774076 sc-eQTL 1.71e-01 -0.126 0.0917 0.263 B_Naive1 L2
ENSG00000157216 SSBP3 544638 sc-eQTL 9.19e-01 0.00891 0.0878 0.263 B_Naive1 L2
ENSG00000162402 USP24 -257247 sc-eQTL 7.71e-01 -0.0201 0.0691 0.263 B_Naive1 L2
ENSG00000215883 CYB5RL 758081 sc-eQTL 7.68e-02 0.184 0.104 0.263 B_Naive1 L2
ENSG00000243725 TTC4 242256 sc-eQTL 6.30e-01 -0.0454 0.0941 0.263 B_Naive1 L2
ENSG00000006555 TTC22 156794 sc-eQTL 1.74e-01 -0.138 0.101 0.262 B_Naive2 L2
ENSG00000116133 DHCR24 70922 sc-eQTL 3.91e-01 -0.0759 0.0882 0.262 B_Naive2 L2
ENSG00000116205 TCEANC2 904533 sc-eQTL 8.49e-01 0.0187 0.0981 0.262 B_Naive2 L2
ENSG00000116209 TMEM59 904613 sc-eQTL 8.44e-01 0.016 0.0807 0.262 B_Naive2 L2
ENSG00000116221 MRPL37 774076 sc-eQTL 3.55e-01 -0.088 0.0949 0.262 B_Naive2 L2
ENSG00000157216 SSBP3 544638 sc-eQTL 1.64e-01 0.13 0.0932 0.262 B_Naive2 L2
ENSG00000162402 USP24 -257247 sc-eQTL 9.74e-01 -0.00241 0.0742 0.262 B_Naive2 L2
ENSG00000215883 CYB5RL 758081 sc-eQTL 6.22e-02 0.194 0.104 0.262 B_Naive2 L2
ENSG00000243725 TTC4 242256 sc-eQTL 8.79e-01 -0.0166 0.109 0.262 B_Naive2 L2
ENSG00000006555 TTC22 156794 sc-eQTL 9.04e-01 -0.0114 0.0948 0.261 CD4_CTL L2
ENSG00000116205 TCEANC2 904533 sc-eQTL 2.23e-01 -0.119 0.0972 0.261 CD4_CTL L2
ENSG00000116209 TMEM59 904613 sc-eQTL 3.45e-01 0.0838 0.0885 0.261 CD4_CTL L2
ENSG00000116221 MRPL37 774076 sc-eQTL 3.67e-01 0.0984 0.109 0.261 CD4_CTL L2
ENSG00000157216 SSBP3 544638 sc-eQTL 7.63e-01 0.0203 0.0671 0.261 CD4_CTL L2
ENSG00000162402 USP24 -257247 sc-eQTL 9.82e-01 0.00206 0.0922 0.261 CD4_CTL L2
ENSG00000243725 TTC4 242256 sc-eQTL 7.39e-01 -0.0344 0.103 0.261 CD4_CTL L2
ENSG00000006555 TTC22 156794 sc-eQTL 1.42e-01 -0.128 0.0866 0.263 CD4_Naive L2
ENSG00000116205 TCEANC2 904533 sc-eQTL 5.48e-01 0.0398 0.0662 0.263 CD4_Naive L2
ENSG00000116209 TMEM59 904613 sc-eQTL 1.80e-01 -0.0862 0.0641 0.263 CD4_Naive L2
ENSG00000116221 MRPL37 774076 sc-eQTL 6.84e-01 0.0338 0.083 0.263 CD4_Naive L2
ENSG00000157216 SSBP3 544638 sc-eQTL 5.12e-01 -0.0435 0.0662 0.263 CD4_Naive L2
ENSG00000162402 USP24 -257247 sc-eQTL 8.86e-01 -0.00821 0.0572 0.263 CD4_Naive L2
ENSG00000243725 TTC4 242256 sc-eQTL 2.27e-01 -0.105 0.0868 0.263 CD4_Naive L2
ENSG00000006555 TTC22 156794 sc-eQTL 2.74e-02 -0.202 0.0908 0.263 CD4_TCM L2
ENSG00000116205 TCEANC2 904533 sc-eQTL 1.16e-01 0.14 0.0889 0.263 CD4_TCM L2
ENSG00000116209 TMEM59 904613 sc-eQTL 3.38e-01 -0.0646 0.0673 0.263 CD4_TCM L2
ENSG00000116221 MRPL37 774076 sc-eQTL 6.01e-01 0.0444 0.0848 0.263 CD4_TCM L2
ENSG00000157216 SSBP3 544638 sc-eQTL 2.52e-02 -0.185 0.0821 0.263 CD4_TCM L2
ENSG00000162402 USP24 -257247 sc-eQTL 4.53e-01 -0.0517 0.0688 0.263 CD4_TCM L2
ENSG00000243725 TTC4 242256 sc-eQTL 4.06e-02 -0.202 0.0983 0.263 CD4_TCM L2
ENSG00000006555 TTC22 156794 sc-eQTL 1.82e-01 0.14 0.105 0.263 CD4_TEM L2
ENSG00000116205 TCEANC2 904533 sc-eQTL 4.55e-01 0.0745 0.0995 0.263 CD4_TEM L2
ENSG00000116209 TMEM59 904613 sc-eQTL 9.03e-01 0.00944 0.0772 0.263 CD4_TEM L2
ENSG00000116221 MRPL37 774076 sc-eQTL 7.19e-01 -0.0358 0.0993 0.263 CD4_TEM L2
ENSG00000157216 SSBP3 544638 sc-eQTL 2.33e-02 -0.192 0.0842 0.263 CD4_TEM L2
ENSG00000162402 USP24 -257247 sc-eQTL 7.45e-01 -0.0252 0.0775 0.263 CD4_TEM L2
ENSG00000243725 TTC4 242256 sc-eQTL 1.92e-02 -0.239 0.101 0.263 CD4_TEM L2
ENSG00000006555 TTC22 156794 sc-eQTL 7.53e-01 -0.0264 0.0836 0.263 CD8_CTL L2
ENSG00000116205 TCEANC2 904533 sc-eQTL 3.09e-01 -0.0943 0.0924 0.263 CD8_CTL L2
ENSG00000116209 TMEM59 904613 sc-eQTL 6.70e-01 0.0344 0.0805 0.263 CD8_CTL L2
ENSG00000116221 MRPL37 774076 sc-eQTL 7.12e-01 0.0352 0.0954 0.263 CD8_CTL L2
ENSG00000157216 SSBP3 544638 sc-eQTL 3.02e-01 0.0673 0.0651 0.263 CD8_CTL L2
ENSG00000162402 USP24 -257247 sc-eQTL 4.96e-01 -0.0442 0.0648 0.263 CD8_CTL L2
ENSG00000243725 TTC4 242256 sc-eQTL 2.96e-02 0.21 0.096 0.263 CD8_CTL L2
ENSG00000006555 TTC22 156794 sc-eQTL 7.75e-01 0.0272 0.0947 0.263 CD8_Naive L2
ENSG00000116205 TCEANC2 904533 sc-eQTL 1.16e-01 0.135 0.0852 0.263 CD8_Naive L2
ENSG00000116209 TMEM59 904613 sc-eQTL 9.27e-01 -0.00772 0.0839 0.263 CD8_Naive L2
ENSG00000116221 MRPL37 774076 sc-eQTL 3.90e-02 -0.207 0.0996 0.263 CD8_Naive L2
ENSG00000157216 SSBP3 544638 sc-eQTL 6.69e-01 -0.0326 0.0761 0.263 CD8_Naive L2
ENSG00000162402 USP24 -257247 sc-eQTL 5.94e-01 -0.037 0.0692 0.263 CD8_Naive L2
ENSG00000243725 TTC4 242256 sc-eQTL 2.97e-01 -0.106 0.101 0.263 CD8_Naive L2
ENSG00000006555 TTC22 156794 sc-eQTL 3.52e-01 -0.095 0.102 0.252 CD8_TCM L2
ENSG00000116205 TCEANC2 904533 sc-eQTL 4.09e-01 -0.0847 0.102 0.252 CD8_TCM L2
ENSG00000116209 TMEM59 904613 sc-eQTL 7.22e-01 0.0322 0.0904 0.252 CD8_TCM L2
ENSG00000116221 MRPL37 774076 sc-eQTL 1.55e-01 0.145 0.102 0.252 CD8_TCM L2
ENSG00000157216 SSBP3 544638 sc-eQTL 7.94e-01 -0.0233 0.0889 0.252 CD8_TCM L2
ENSG00000162402 USP24 -257247 sc-eQTL 4.54e-01 0.0646 0.0861 0.252 CD8_TCM L2
ENSG00000243725 TTC4 242256 sc-eQTL 1.18e-02 -0.262 0.103 0.252 CD8_TCM L2
ENSG00000006555 TTC22 156794 sc-eQTL 6.78e-01 -0.0407 0.0978 0.272 CD8_TEM L2
ENSG00000116205 TCEANC2 904533 sc-eQTL 1.57e-01 0.144 0.102 0.272 CD8_TEM L2
ENSG00000116209 TMEM59 904613 sc-eQTL 6.98e-01 0.0383 0.0987 0.272 CD8_TEM L2
ENSG00000116221 MRPL37 774076 sc-eQTL 9.20e-01 -0.01 0.1 0.272 CD8_TEM L2
ENSG00000157216 SSBP3 544638 sc-eQTL 3.85e-01 -0.0822 0.0945 0.272 CD8_TEM L2
ENSG00000162402 USP24 -257247 sc-eQTL 3.45e-01 0.0942 0.0995 0.272 CD8_TEM L2
ENSG00000243725 TTC4 242256 sc-eQTL 1.30e-01 -0.153 0.101 0.272 CD8_TEM L2
ENSG00000006555 TTC22 156794 sc-eQTL 5.85e-02 -0.175 0.0922 0.262 MAIT L2
ENSG00000116133 DHCR24 70922 sc-eQTL 3.44e-01 0.0652 0.0687 0.262 MAIT L2
ENSG00000116205 TCEANC2 904533 sc-eQTL 8.04e-01 -0.024 0.0969 0.262 MAIT L2
ENSG00000116209 TMEM59 904613 sc-eQTL 3.70e-01 0.0785 0.0874 0.262 MAIT L2
ENSG00000116221 MRPL37 774076 sc-eQTL 5.86e-01 0.058 0.106 0.262 MAIT L2
ENSG00000157216 SSBP3 544638 sc-eQTL 5.91e-01 0.0506 0.0942 0.262 MAIT L2
ENSG00000162402 USP24 -257247 sc-eQTL 3.13e-01 0.0845 0.0835 0.262 MAIT L2
ENSG00000215883 CYB5RL 758081 sc-eQTL 3.73e-01 -0.0867 0.0971 0.262 MAIT L2
ENSG00000243725 TTC4 242256 sc-eQTL 1.11e-01 0.154 0.0961 0.262 MAIT L2
ENSG00000006555 TTC22 156794 sc-eQTL 2.04e-01 0.132 0.103 0.262 NK_CD56bright L2
ENSG00000116133 DHCR24 70922 sc-eQTL 4.68e-01 -0.0665 0.0914 0.262 NK_CD56bright L2
ENSG00000116205 TCEANC2 904533 sc-eQTL 6.48e-01 -0.0442 0.0967 0.262 NK_CD56bright L2
ENSG00000116209 TMEM59 904613 sc-eQTL 4.58e-01 -0.07 0.0942 0.262 NK_CD56bright L2
ENSG00000116221 MRPL37 774076 sc-eQTL 6.18e-01 0.0526 0.105 0.262 NK_CD56bright L2
ENSG00000157216 SSBP3 544638 sc-eQTL 3.39e-02 0.168 0.0785 0.262 NK_CD56bright L2
ENSG00000162398 LEXM 152054 sc-eQTL 9.70e-01 -0.00351 0.0938 0.262 NK_CD56bright L2
ENSG00000162402 USP24 -257247 sc-eQTL 6.89e-01 0.0324 0.0807 0.262 NK_CD56bright L2
ENSG00000243725 TTC4 242256 sc-eQTL 5.71e-01 0.0577 0.102 0.262 NK_CD56bright L2
ENSG00000006555 TTC22 156794 sc-eQTL 5.22e-01 -0.0557 0.0867 0.265 NK_CD56dim L2
ENSG00000116133 DHCR24 70922 sc-eQTL 1.29e-03 -0.288 0.0883 0.265 NK_CD56dim L2
ENSG00000116205 TCEANC2 904533 sc-eQTL 3.15e-01 -0.0984 0.0978 0.265 NK_CD56dim L2
ENSG00000116209 TMEM59 904613 sc-eQTL 1.06e-01 -0.117 0.0723 0.265 NK_CD56dim L2
ENSG00000116221 MRPL37 774076 sc-eQTL 6.86e-01 -0.0383 0.0945 0.265 NK_CD56dim L2
ENSG00000157216 SSBP3 544638 sc-eQTL 2.13e-02 0.177 0.0764 0.265 NK_CD56dim L2
ENSG00000162398 LEXM 152054 sc-eQTL 5.28e-01 0.0562 0.0889 0.265 NK_CD56dim L2
ENSG00000162402 USP24 -257247 sc-eQTL 3.92e-01 0.0484 0.0565 0.265 NK_CD56dim L2
ENSG00000243725 TTC4 242256 sc-eQTL 7.79e-01 -0.0273 0.0968 0.265 NK_CD56dim L2
ENSG00000006555 TTC22 156794 sc-eQTL 9.13e-01 -0.0114 0.104 0.267 NK_HLA L2
ENSG00000116133 DHCR24 70922 sc-eQTL 9.34e-01 -0.00839 0.101 0.267 NK_HLA L2
ENSG00000116205 TCEANC2 904533 sc-eQTL 9.11e-01 0.0109 0.0978 0.267 NK_HLA L2
ENSG00000116209 TMEM59 904613 sc-eQTL 4.40e-01 -0.0751 0.097 0.267 NK_HLA L2
ENSG00000116221 MRPL37 774076 sc-eQTL 2.11e-01 -0.134 0.107 0.267 NK_HLA L2
ENSG00000157216 SSBP3 544638 sc-eQTL 6.76e-01 0.0366 0.0874 0.267 NK_HLA L2
ENSG00000162398 LEXM 152054 sc-eQTL 1.18e-01 -0.154 0.098 0.267 NK_HLA L2
ENSG00000162402 USP24 -257247 sc-eQTL 5.06e-01 -0.0482 0.0723 0.267 NK_HLA L2
ENSG00000243725 TTC4 242256 sc-eQTL 2.82e-01 0.116 0.108 0.267 NK_HLA L2
ENSG00000006555 TTC22 156794 sc-eQTL 7.66e-01 -0.0272 0.0913 0.265 NK_cytokine L2
ENSG00000116133 DHCR24 70922 sc-eQTL 3.10e-01 -0.0937 0.0921 0.265 NK_cytokine L2
ENSG00000116205 TCEANC2 904533 sc-eQTL 9.17e-01 0.00962 0.0917 0.265 NK_cytokine L2
ENSG00000116209 TMEM59 904613 sc-eQTL 9.20e-01 -0.00745 0.0745 0.265 NK_cytokine L2
ENSG00000116221 MRPL37 774076 sc-eQTL 4.46e-01 -0.07 0.0917 0.265 NK_cytokine L2
ENSG00000157216 SSBP3 544638 sc-eQTL 1.83e-01 0.103 0.0767 0.265 NK_cytokine L2
ENSG00000162398 LEXM 152054 sc-eQTL 1.27e-01 -0.147 0.0957 0.265 NK_cytokine L2
ENSG00000162402 USP24 -257247 sc-eQTL 6.40e-02 -0.121 0.0651 0.265 NK_cytokine L2
ENSG00000243725 TTC4 242256 sc-eQTL 2.78e-01 -0.106 0.097 0.265 NK_cytokine L2
ENSG00000006555 TTC22 156794 sc-eQTL 8.01e-01 -0.029 0.115 0.267 PB L2
ENSG00000116133 DHCR24 70922 sc-eQTL 1.54e-01 0.144 0.101 0.267 PB L2
ENSG00000116205 TCEANC2 904533 sc-eQTL 7.38e-01 0.0414 0.124 0.267 PB L2
ENSG00000116209 TMEM59 904613 sc-eQTL 8.93e-01 0.007 0.0517 0.267 PB L2
ENSG00000116221 MRPL37 774076 sc-eQTL 8.78e-01 0.0144 0.094 0.267 PB L2
ENSG00000157216 SSBP3 544638 sc-eQTL 7.67e-01 0.0322 0.109 0.267 PB L2
ENSG00000162402 USP24 -257247 sc-eQTL 4.47e-01 0.0938 0.123 0.267 PB L2
ENSG00000215883 CYB5RL 758081 sc-eQTL 1.13e-01 0.202 0.126 0.267 PB L2
ENSG00000243725 TTC4 242256 sc-eQTL 4.85e-01 0.0834 0.119 0.267 PB L2
ENSG00000006555 TTC22 156794 sc-eQTL 7.14e-02 0.167 0.0921 0.261 Pro_T L2
ENSG00000116133 DHCR24 70922 sc-eQTL 5.49e-01 0.0472 0.0788 0.261 Pro_T L2
ENSG00000116205 TCEANC2 904533 sc-eQTL 3.47e-01 0.0905 0.0961 0.261 Pro_T L2
ENSG00000116209 TMEM59 904613 sc-eQTL 3.88e-01 -0.0577 0.0667 0.261 Pro_T L2
ENSG00000116221 MRPL37 774076 sc-eQTL 2.54e-02 0.146 0.0646 0.261 Pro_T L2
ENSG00000157216 SSBP3 544638 sc-eQTL 2.88e-01 0.0779 0.0732 0.261 Pro_T L2
ENSG00000162402 USP24 -257247 sc-eQTL 4.43e-01 -0.0687 0.0894 0.261 Pro_T L2
ENSG00000215883 CYB5RL 758081 sc-eQTL 9.51e-01 -0.00548 0.0883 0.261 Pro_T L2
ENSG00000243725 TTC4 242256 sc-eQTL 4.01e-03 -0.28 0.0963 0.261 Pro_T L2
ENSG00000006555 TTC22 156794 sc-eQTL 7.71e-01 -0.0268 0.0922 0.263 Treg L2
ENSG00000116205 TCEANC2 904533 sc-eQTL 9.84e-01 -0.00194 0.0988 0.263 Treg L2
ENSG00000116209 TMEM59 904613 sc-eQTL 7.79e-01 0.0219 0.0781 0.263 Treg L2
ENSG00000116221 MRPL37 774076 sc-eQTL 7.40e-01 0.0321 0.0966 0.263 Treg L2
ENSG00000157216 SSBP3 544638 sc-eQTL 3.25e-01 0.0849 0.086 0.263 Treg L2
ENSG00000162402 USP24 -257247 sc-eQTL 7.03e-02 -0.148 0.0815 0.263 Treg L2
ENSG00000243725 TTC4 242256 sc-eQTL 6.53e-01 -0.0466 0.103 0.263 Treg L2
ENSG00000116133 DHCR24 70922 sc-eQTL 4.18e-02 -0.172 0.0837 0.266 cDC L2
ENSG00000116205 TCEANC2 904533 sc-eQTL 8.50e-01 -0.0189 0.0999 0.266 cDC L2
ENSG00000116209 TMEM59 904613 sc-eQTL 1.31e-01 0.128 0.0843 0.266 cDC L2
ENSG00000116221 MRPL37 774076 sc-eQTL 7.63e-01 0.0328 0.109 0.266 cDC L2
ENSG00000157216 SSBP3 544638 sc-eQTL 9.49e-01 -0.0064 0.1 0.266 cDC L2
ENSG00000162390 ACOT11 415860 sc-eQTL 3.26e-01 0.0914 0.0928 0.266 cDC L2
ENSG00000162402 USP24 -257247 sc-eQTL 8.62e-01 -0.0182 0.104 0.266 cDC L2
ENSG00000215883 CYB5RL 758081 sc-eQTL 9.60e-02 0.149 0.089 0.266 cDC L2
ENSG00000243725 TTC4 242256 sc-eQTL 1.54e-01 -0.152 0.106 0.266 cDC L2
ENSG00000116133 DHCR24 70922 sc-eQTL 5.89e-01 -0.0326 0.0602 0.263 cMono_IL1B L2
ENSG00000116205 TCEANC2 904533 sc-eQTL 7.55e-02 -0.148 0.083 0.263 cMono_IL1B L2
ENSG00000116209 TMEM59 904613 sc-eQTL 4.68e-01 -0.0368 0.0507 0.263 cMono_IL1B L2
ENSG00000116221 MRPL37 774076 sc-eQTL 9.25e-01 -0.00854 0.0904 0.263 cMono_IL1B L2
ENSG00000157216 SSBP3 544638 sc-eQTL 3.98e-02 0.189 0.0913 0.263 cMono_IL1B L2
ENSG00000162402 USP24 -257247 sc-eQTL 4.78e-01 0.0484 0.0681 0.263 cMono_IL1B L2
ENSG00000243725 TTC4 242256 sc-eQTL 6.01e-01 -0.0545 0.104 0.263 cMono_IL1B L2
ENSG00000116133 DHCR24 70922 sc-eQTL 8.93e-01 -0.00761 0.0565 0.263 cMono_S100A L2
ENSG00000116205 TCEANC2 904533 sc-eQTL 8.59e-01 0.0153 0.0862 0.263 cMono_S100A L2
ENSG00000116209 TMEM59 904613 sc-eQTL 2.58e-01 0.078 0.0688 0.263 cMono_S100A L2
ENSG00000116221 MRPL37 774076 sc-eQTL 2.23e-02 -0.227 0.0984 0.263 cMono_S100A L2
ENSG00000157216 SSBP3 544638 sc-eQTL 1.40e-01 0.153 0.103 0.263 cMono_S100A L2
ENSG00000162402 USP24 -257247 sc-eQTL 8.25e-02 -0.145 0.0831 0.263 cMono_S100A L2
ENSG00000243725 TTC4 242256 sc-eQTL 9.32e-01 0.00892 0.105 0.263 cMono_S100A L2
ENSG00000006555 TTC22 156794 sc-eQTL 6.69e-01 0.0406 0.0949 0.27 gdT L2
ENSG00000116133 DHCR24 70922 sc-eQTL 8.30e-01 0.0228 0.106 0.27 gdT L2
ENSG00000116205 TCEANC2 904533 sc-eQTL 4.18e-01 -0.0861 0.106 0.27 gdT L2
ENSG00000116209 TMEM59 904613 sc-eQTL 4.22e-01 -0.0867 0.108 0.27 gdT L2
ENSG00000116221 MRPL37 774076 sc-eQTL 2.15e-01 -0.153 0.123 0.27 gdT L2
ENSG00000157216 SSBP3 544638 sc-eQTL 4.65e-01 0.0554 0.0756 0.27 gdT L2
ENSG00000162402 USP24 -257247 sc-eQTL 4.65e-01 0.0744 0.102 0.27 gdT L2
ENSG00000215883 CYB5RL 758081 sc-eQTL 2.90e-02 0.229 0.104 0.27 gdT L2
ENSG00000243725 TTC4 242256 sc-eQTL 2.36e-01 0.141 0.119 0.27 gdT L2
ENSG00000116133 DHCR24 70922 sc-eQTL 7.02e-01 -0.0292 0.0762 0.262 intMono L2
ENSG00000116205 TCEANC2 904533 sc-eQTL 1.69e-01 -0.13 0.0945 0.262 intMono L2
ENSG00000116209 TMEM59 904613 sc-eQTL 9.33e-01 -0.00583 0.0698 0.262 intMono L2
ENSG00000116221 MRPL37 774076 sc-eQTL 7.66e-01 -0.0318 0.107 0.262 intMono L2
ENSG00000157216 SSBP3 544638 sc-eQTL 5.28e-03 0.301 0.107 0.262 intMono L2
ENSG00000162402 USP24 -257247 sc-eQTL 8.07e-01 -0.0237 0.0972 0.262 intMono L2
ENSG00000243725 TTC4 242256 sc-eQTL 4.41e-01 -0.0797 0.103 0.262 intMono L2
ENSG00000116133 DHCR24 70922 sc-eQTL 9.74e-01 -0.0025 0.0752 0.269 ncMono L2
ENSG00000116205 TCEANC2 904533 sc-eQTL 1.27e-01 0.143 0.0935 0.269 ncMono L2
ENSG00000116209 TMEM59 904613 sc-eQTL 5.34e-01 0.0469 0.0752 0.269 ncMono L2
ENSG00000116221 MRPL37 774076 sc-eQTL 4.02e-02 -0.198 0.096 0.269 ncMono L2
ENSG00000157216 SSBP3 544638 sc-eQTL 1.06e-01 0.171 0.105 0.269 ncMono L2
ENSG00000162402 USP24 -257247 sc-eQTL 7.93e-01 0.0223 0.0848 0.269 ncMono L2
ENSG00000243725 TTC4 242256 sc-eQTL 1.61e-01 -0.141 0.0999 0.269 ncMono L2
ENSG00000116133 DHCR24 70922 sc-eQTL 8.52e-01 0.0168 0.0901 0.257 pDC L2
ENSG00000116205 TCEANC2 904533 sc-eQTL 5.02e-01 0.0727 0.108 0.257 pDC L2
ENSG00000116209 TMEM59 904613 sc-eQTL 3.90e-01 -0.0742 0.0861 0.257 pDC L2
ENSG00000116221 MRPL37 774076 sc-eQTL 7.20e-01 0.0412 0.115 0.257 pDC L2
ENSG00000157216 SSBP3 544638 sc-eQTL 1.79e-01 -0.137 0.101 0.257 pDC L2
ENSG00000162390 ACOT11 415860 sc-eQTL 8.10e-01 0.0103 0.0428 0.257 pDC L2
ENSG00000162402 USP24 -257247 sc-eQTL 4.74e-01 -0.0519 0.0722 0.257 pDC L2
ENSG00000215883 CYB5RL 758081 sc-eQTL 5.18e-01 -0.064 0.0987 0.257 pDC L2
ENSG00000243725 TTC4 242256 sc-eQTL 6.81e-01 0.0469 0.114 0.257 pDC L2
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000006555 TTC22 156794 sc-eQTL 1.48e-01 0.139 0.0959 0.263 B_Memory LOneK1K
ENSG00000116133 DHCR24 70922 sc-eQTL 3.20e-01 -0.0962 0.0965 0.263 B_Memory LOneK1K
ENSG00000116205 TCEANC2 904533 sc-eQTL 5.45e-01 -0.0566 0.0934 0.263 B_Memory LOneK1K
ENSG00000116209 TMEM59 904613 sc-eQTL 2.11e-01 0.0909 0.0724 0.263 B_Memory LOneK1K
ENSG00000116221 MRPL37 774076 sc-eQTL 3.14e-02 0.187 0.0861 0.263 B_Memory LOneK1K
ENSG00000157216 SSBP3 544638 sc-eQTL 5.47e-01 -0.0457 0.0757 0.263 B_Memory LOneK1K
ENSG00000162402 USP24 -257247 sc-eQTL 1.35e-01 -0.103 0.0687 0.263 B_Memory LOneK1K
ENSG00000215883 CYB5RL 758081 sc-eQTL 9.88e-01 -0.00164 0.106 0.263 B_Memory LOneK1K
ENSG00000243725 TTC4 242256 sc-eQTL 2.00e-01 0.122 0.0949 0.263 B_Memory LOneK1K
ENSG00000006555 TTC22 156794 sc-eQTL 6.45e-01 -0.0476 0.103 0.263 B_Naive LOneK1K
ENSG00000116133 DHCR24 70922 sc-eQTL 1.03e-01 -0.152 0.0924 0.263 B_Naive LOneK1K
ENSG00000116205 TCEANC2 904533 sc-eQTL 2.41e-01 -0.0985 0.0838 0.263 B_Naive LOneK1K
ENSG00000116209 TMEM59 904613 sc-eQTL 6.92e-01 -0.0237 0.0597 0.263 B_Naive LOneK1K
ENSG00000116221 MRPL37 774076 sc-eQTL 3.61e-01 -0.0785 0.0857 0.263 B_Naive LOneK1K
ENSG00000157216 SSBP3 544638 sc-eQTL 1.72e-01 0.105 0.0765 0.263 B_Naive LOneK1K
ENSG00000162402 USP24 -257247 sc-eQTL 8.15e-01 0.0154 0.0659 0.263 B_Naive LOneK1K
ENSG00000215883 CYB5RL 758081 sc-eQTL 5.04e-04 0.358 0.101 0.263 B_Naive LOneK1K
ENSG00000243725 TTC4 242256 sc-eQTL 7.36e-01 -0.0332 0.0981 0.263 B_Naive LOneK1K
ENSG00000116133 DHCR24 70922 sc-eQTL 8.10e-01 -0.0142 0.059 0.263 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000116205 TCEANC2 904533 sc-eQTL 3.40e-01 -0.0705 0.0737 0.263 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000116209 TMEM59 904613 sc-eQTL 7.41e-01 0.0168 0.0509 0.263 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000116221 MRPL37 774076 sc-eQTL 1.87e-01 -0.119 0.0898 0.263 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000157216 SSBP3 544638 sc-eQTL 8.83e-03 0.245 0.0929 0.263 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000162402 USP24 -257247 sc-eQTL 9.07e-01 -0.00756 0.0645 0.263 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000243725 TTC4 242256 sc-eQTL 7.13e-01 -0.0393 0.107 0.263 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000116133 DHCR24 70922 sc-eQTL 9.04e-01 0.00859 0.0712 0.265 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000116205 TCEANC2 904533 sc-eQTL 6.91e-01 0.0372 0.0935 0.265 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000116209 TMEM59 904613 sc-eQTL 5.88e-01 0.0377 0.0695 0.265 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000116221 MRPL37 774076 sc-eQTL 7.52e-02 -0.169 0.0946 0.265 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000157216 SSBP3 544638 sc-eQTL 6.20e-03 0.276 0.0999 0.265 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000162402 USP24 -257247 sc-eQTL 9.73e-01 -0.00275 0.0801 0.265 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000243725 TTC4 242256 sc-eQTL 1.50e-01 -0.144 0.1 0.265 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000006555 TTC22 156794 sc-eQTL 7.54e-01 -0.0265 0.0845 0.265 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000116133 DHCR24 70922 sc-eQTL 6.46e-03 -0.238 0.0867 0.265 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000116205 TCEANC2 904533 sc-eQTL 6.08e-01 -0.0444 0.0865 0.265 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000116209 TMEM59 904613 sc-eQTL 2.02e-01 -0.0854 0.0667 0.265 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000116221 MRPL37 774076 sc-eQTL 1.70e-01 -0.123 0.0893 0.265 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000157216 SSBP3 544638 sc-eQTL 2.42e-02 0.165 0.0727 0.265 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000162398 LEXM 152054 sc-eQTL 7.28e-01 -0.0289 0.0829 0.265 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000162402 USP24 -257247 sc-eQTL 4.34e-01 -0.0412 0.0525 0.265 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000243725 TTC4 242256 sc-eQTL 6.00e-01 -0.0492 0.0936 0.265 NK_CD56dim LOneK1K

Statistical fine-mapping results from Japan COVID-19 Task Force
(Shown only for PIP>0.001)
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
PIP (SuSiE)
PIP (FINEMAP)
MAF

Expression Modifier Score(EMS) for GTEx 49tissues
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Whole Blood
Muscle Skeletal
Liver
Brain Cerebellum
Prostate
Spleen
Skin Sun Exposed Lower leg
Artery Coronary
Esophagus Muscularis
Esophagus Gastroesophageal Junction
Artery Tibial
Heart Atrial Appendage
Nerve Tibial
Heart Left Ventricle
Adrenal Gland
Adipose Visceral Omentum
Pancreas
Lung
Pituitary
Brain Nucleus accumbens basal ganglia
Colon Transverse
Adipose Subcutaneous
Esophagus Mucosa
Brain Cortex
Thyroid
Stomach
Breast Mammary Tissue
Colon Sigmoid
Skin Not Sun Exposed Suprapubic
Testis
Artery Aorta
Brain Amygdala
Brain Anterior cingulate cortex BA24
Brain Caudate basal ganglia
Brain Cerebellar Hemisphere
Brain Frontal Cortex BA9
Brain Hippocampus
Brain Hypothalamus
Brain Putamen basal ganglia
Brain Spinal cord cervical c-1
Brain Substantia nigra
Cells Cultured fibroblasts
Cells EBV-transformed lymphocytes
Kidney Cortex
Minor Salivary Gland
Ovary
Small Intestine Terminal Ileum
Uterus
Vagina
ENSG00000234810 \N -371171 1.25e-06 8.36e-07 9.16e-08 4.37e-07 1.05e-07 2.54e-07 6.02e-07 1.38e-07 4.26e-07 2.28e-07 9.47e-07 3.73e-07 9.79e-07 1.6e-07 2.35e-07 2e-07 2.53e-07 3.82e-07 1.89e-07 1.24e-07 1.68e-07 3.8e-07 4.2e-07 1.25e-07 1.13e-06 2.46e-07 2.71e-07 2.24e-07 4.22e-07 6.35e-07 3.56e-07 4.78e-08 5.17e-08 1.39e-07 3.48e-07 8.75e-08 9.77e-08 6.11e-08 5.77e-08 5.8e-08 4.51e-08 9.49e-07 2.71e-08 1.13e-08 8.43e-08 1.32e-08 9.84e-08 0.0 5.16e-08