Genes within 1Mb (chr1:54957825:CT:C):

View on , UCSC , GTEx , gnomAD


Immune cell-type specific single cell cis-eQTLs in OASIS
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000006555 TTC22 156502 sc-eQTL 6.98e-01 0.0471 0.121 0.115 B L1
ENSG00000116133 DHCR24 70630 sc-eQTL 1.83e-01 0.153 0.114 0.115 B L1
ENSG00000116205 TCEANC2 904241 sc-eQTL 9.71e-01 0.00358 0.0991 0.115 B L1
ENSG00000116209 TMEM59 904321 sc-eQTL 7.80e-01 0.0169 0.0603 0.115 B L1
ENSG00000116221 MRPL37 773784 sc-eQTL 1.61e-01 -0.111 0.0786 0.115 B L1
ENSG00000157216 SSBP3 544346 sc-eQTL 5.55e-01 -0.0488 0.0826 0.115 B L1
ENSG00000162402 USP24 -257539 sc-eQTL 3.03e-01 -0.0721 0.0699 0.115 B L1
ENSG00000215883 CYB5RL 757789 sc-eQTL 3.42e-01 -0.128 0.135 0.115 B L1
ENSG00000243725 TTC4 241964 sc-eQTL 6.97e-01 -0.0458 0.117 0.115 B L1
ENSG00000006555 TTC22 156502 sc-eQTL 4.49e-01 -0.0725 0.0956 0.115 CD4T L1
ENSG00000116205 TCEANC2 904241 sc-eQTL 1.83e-01 -0.104 0.0779 0.115 CD4T L1
ENSG00000116209 TMEM59 904321 sc-eQTL 8.12e-02 0.127 0.0724 0.115 CD4T L1
ENSG00000116221 MRPL37 773784 sc-eQTL 6.52e-03 -0.272 0.099 0.115 CD4T L1
ENSG00000157216 SSBP3 544346 sc-eQTL 2.00e-01 0.107 0.0833 0.115 CD4T L1
ENSG00000162402 USP24 -257539 sc-eQTL 4.21e-01 -0.0549 0.0681 0.115 CD4T L1
ENSG00000243725 TTC4 241964 sc-eQTL 4.16e-01 0.0834 0.102 0.115 CD4T L1
ENSG00000006555 TTC22 156502 sc-eQTL 9.51e-01 -0.00514 0.0829 0.115 CD8T L1
ENSG00000116205 TCEANC2 904241 sc-eQTL 7.53e-01 -0.0325 0.103 0.115 CD8T L1
ENSG00000116209 TMEM59 904321 sc-eQTL 1.57e-01 0.101 0.0714 0.115 CD8T L1
ENSG00000116221 MRPL37 773784 sc-eQTL 9.62e-02 -0.164 0.0981 0.115 CD8T L1
ENSG00000157216 SSBP3 544346 sc-eQTL 4.08e-01 -0.0587 0.0708 0.115 CD8T L1
ENSG00000162402 USP24 -257539 sc-eQTL 6.55e-01 0.0307 0.0686 0.115 CD8T L1
ENSG00000243725 TTC4 241964 sc-eQTL 2.09e-01 0.149 0.119 0.115 CD8T L1
ENSG00000116133 DHCR24 70630 sc-eQTL 8.09e-01 0.028 0.116 0.11 DC L1
ENSG00000116205 TCEANC2 904241 sc-eQTL 4.40e-01 0.1 0.13 0.11 DC L1
ENSG00000116209 TMEM59 904321 sc-eQTL 4.53e-01 -0.0768 0.102 0.11 DC L1
ENSG00000116221 MRPL37 773784 sc-eQTL 9.53e-01 -0.00815 0.137 0.11 DC L1
ENSG00000157216 SSBP3 544346 sc-eQTL 8.38e-01 0.0251 0.122 0.11 DC L1
ENSG00000162390 ACOT11 415568 sc-eQTL 9.77e-01 -0.00344 0.118 0.11 DC L1
ENSG00000162402 USP24 -257539 sc-eQTL 5.87e-02 0.134 0.0704 0.11 DC L1
ENSG00000215883 CYB5RL 757789 sc-eQTL 4.84e-01 -0.09 0.128 0.11 DC L1
ENSG00000243725 TTC4 241964 sc-eQTL 9.95e-01 -0.00079 0.138 0.11 DC L1
ENSG00000116133 DHCR24 70630 sc-eQTL 4.56e-01 0.061 0.0817 0.115 Mono L1
ENSG00000116205 TCEANC2 904241 sc-eQTL 8.66e-02 -0.151 0.0877 0.115 Mono L1
ENSG00000116209 TMEM59 904321 sc-eQTL 5.43e-01 -0.0399 0.0655 0.115 Mono L1
ENSG00000116221 MRPL37 773784 sc-eQTL 4.92e-01 -0.0754 0.11 0.115 Mono L1
ENSG00000157216 SSBP3 544346 sc-eQTL 4.25e-01 -0.1 0.125 0.115 Mono L1
ENSG00000162402 USP24 -257539 sc-eQTL 4.57e-01 -0.0557 0.0748 0.115 Mono L1
ENSG00000243725 TTC4 241964 sc-eQTL 5.93e-01 -0.0705 0.132 0.115 Mono L1
ENSG00000006555 TTC22 156502 sc-eQTL 9.77e-01 -0.00315 0.11 0.116 NK L1
ENSG00000116133 DHCR24 70630 sc-eQTL 7.49e-01 -0.0355 0.111 0.116 NK L1
ENSG00000116205 TCEANC2 904241 sc-eQTL 5.02e-01 0.0734 0.109 0.116 NK L1
ENSG00000116209 TMEM59 904321 sc-eQTL 1.08e-01 0.137 0.0851 0.116 NK L1
ENSG00000116221 MRPL37 773784 sc-eQTL 9.10e-01 0.012 0.106 0.116 NK L1
ENSG00000157216 SSBP3 544346 sc-eQTL 6.67e-02 -0.169 0.0915 0.116 NK L1
ENSG00000162398 LEXM 151762 sc-eQTL 2.46e-01 -0.12 0.103 0.116 NK L1
ENSG00000162402 USP24 -257539 sc-eQTL 9.44e-01 -0.0044 0.0628 0.116 NK L1
ENSG00000243725 TTC4 241964 sc-eQTL 7.81e-01 0.0331 0.119 0.116 NK L1
ENSG00000006555 TTC22 156502 sc-eQTL 8.05e-01 0.0245 0.0989 0.115 Other_T L1
ENSG00000116133 DHCR24 70630 sc-eQTL 2.45e-03 -0.23 0.0751 0.115 Other_T L1
ENSG00000116205 TCEANC2 904241 sc-eQTL 5.09e-01 0.0759 0.115 0.115 Other_T L1
ENSG00000116209 TMEM59 904321 sc-eQTL 3.00e-01 0.0817 0.0786 0.115 Other_T L1
ENSG00000116221 MRPL37 773784 sc-eQTL 9.82e-01 0.00168 0.0738 0.115 Other_T L1
ENSG00000157216 SSBP3 544346 sc-eQTL 1.81e-01 -0.114 0.085 0.115 Other_T L1
ENSG00000162402 USP24 -257539 sc-eQTL 3.64e-01 -0.0826 0.0907 0.115 Other_T L1
ENSG00000215883 CYB5RL 757789 sc-eQTL 4.01e-01 -0.105 0.124 0.115 Other_T L1
ENSG00000243725 TTC4 241964 sc-eQTL 3.46e-01 0.117 0.124 0.115 Other_T L1
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000006555 TTC22 156502 sc-eQTL 6.81e-01 -0.0423 0.103 0.128 B_Activated L2
ENSG00000116133 DHCR24 70630 sc-eQTL 1.72e-01 0.165 0.12 0.128 B_Activated L2
ENSG00000116205 TCEANC2 904241 sc-eQTL 5.70e-01 0.0737 0.129 0.128 B_Activated L2
ENSG00000116209 TMEM59 904321 sc-eQTL 8.02e-01 0.0346 0.138 0.128 B_Activated L2
ENSG00000116221 MRPL37 773784 sc-eQTL 2.58e-01 0.168 0.148 0.128 B_Activated L2
ENSG00000157216 SSBP3 544346 sc-eQTL 4.23e-01 -0.108 0.134 0.128 B_Activated L2
ENSG00000162402 USP24 -257539 sc-eQTL 4.59e-01 -0.0973 0.131 0.128 B_Activated L2
ENSG00000215883 CYB5RL 757789 sc-eQTL 3.75e-01 0.103 0.116 0.128 B_Activated L2
ENSG00000243725 TTC4 241964 sc-eQTL 6.93e-01 0.0497 0.126 0.128 B_Activated L2
ENSG00000006555 TTC22 156502 sc-eQTL 1.43e-01 0.191 0.13 0.116 B_Intermediate L2
ENSG00000116133 DHCR24 70630 sc-eQTL 5.13e-01 0.0793 0.121 0.116 B_Intermediate L2
ENSG00000116205 TCEANC2 904241 sc-eQTL 3.44e-02 0.254 0.119 0.116 B_Intermediate L2
ENSG00000116209 TMEM59 904321 sc-eQTL 1.78e-02 -0.244 0.102 0.116 B_Intermediate L2
ENSG00000116221 MRPL37 773784 sc-eQTL 1.49e-01 -0.175 0.121 0.116 B_Intermediate L2
ENSG00000157216 SSBP3 544346 sc-eQTL 4.68e-01 -0.0824 0.113 0.116 B_Intermediate L2
ENSG00000162402 USP24 -257539 sc-eQTL 1.31e-01 -0.144 0.0951 0.116 B_Intermediate L2
ENSG00000215883 CYB5RL 757789 sc-eQTL 4.59e-01 -0.1 0.135 0.116 B_Intermediate L2
ENSG00000243725 TTC4 241964 sc-eQTL 7.07e-01 0.0463 0.123 0.116 B_Intermediate L2
ENSG00000006555 TTC22 156502 sc-eQTL 8.81e-01 -0.0188 0.126 0.116 B_Memory L2
ENSG00000116133 DHCR24 70630 sc-eQTL 5.22e-02 -0.242 0.124 0.116 B_Memory L2
ENSG00000116205 TCEANC2 904241 sc-eQTL 8.87e-01 0.0191 0.134 0.116 B_Memory L2
ENSG00000116209 TMEM59 904321 sc-eQTL 9.81e-01 -0.0027 0.111 0.116 B_Memory L2
ENSG00000116221 MRPL37 773784 sc-eQTL 2.53e-01 -0.129 0.113 0.116 B_Memory L2
ENSG00000157216 SSBP3 544346 sc-eQTL 9.34e-01 -0.00869 0.105 0.116 B_Memory L2
ENSG00000162402 USP24 -257539 sc-eQTL 1.11e-01 0.164 0.102 0.116 B_Memory L2
ENSG00000215883 CYB5RL 757789 sc-eQTL 8.39e-01 -0.0259 0.127 0.116 B_Memory L2
ENSG00000243725 TTC4 241964 sc-eQTL 1.48e-02 -0.32 0.13 0.116 B_Memory L2
ENSG00000006555 TTC22 156502 sc-eQTL 7.03e-01 0.0495 0.129 0.115 B_Naive1 L2
ENSG00000116133 DHCR24 70630 sc-eQTL 4.67e-01 0.0884 0.121 0.115 B_Naive1 L2
ENSG00000116205 TCEANC2 904241 sc-eQTL 3.44e-01 -0.102 0.108 0.115 B_Naive1 L2
ENSG00000116209 TMEM59 904321 sc-eQTL 9.03e-01 -0.00964 0.0787 0.115 B_Naive1 L2
ENSG00000116221 MRPL37 773784 sc-eQTL 8.54e-01 -0.0214 0.116 0.115 B_Naive1 L2
ENSG00000157216 SSBP3 544346 sc-eQTL 2.65e-01 0.123 0.11 0.115 B_Naive1 L2
ENSG00000162402 USP24 -257539 sc-eQTL 3.89e-01 -0.0751 0.0869 0.115 B_Naive1 L2
ENSG00000215883 CYB5RL 757789 sc-eQTL 3.26e-01 -0.129 0.131 0.115 B_Naive1 L2
ENSG00000243725 TTC4 241964 sc-eQTL 9.30e-01 -0.0104 0.119 0.115 B_Naive1 L2
ENSG00000006555 TTC22 156502 sc-eQTL 7.74e-01 0.0376 0.131 0.116 B_Naive2 L2
ENSG00000116133 DHCR24 70630 sc-eQTL 9.41e-01 0.00837 0.114 0.116 B_Naive2 L2
ENSG00000116205 TCEANC2 904241 sc-eQTL 7.35e-01 0.0427 0.126 0.116 B_Naive2 L2
ENSG00000116209 TMEM59 904321 sc-eQTL 2.29e-01 0.125 0.104 0.116 B_Naive2 L2
ENSG00000116221 MRPL37 773784 sc-eQTL 9.91e-01 -0.00145 0.122 0.116 B_Naive2 L2
ENSG00000157216 SSBP3 544346 sc-eQTL 6.48e-01 0.0551 0.12 0.116 B_Naive2 L2
ENSG00000162402 USP24 -257539 sc-eQTL 3.49e-01 0.0894 0.0953 0.116 B_Naive2 L2
ENSG00000215883 CYB5RL 757789 sc-eQTL 7.38e-01 -0.0449 0.134 0.116 B_Naive2 L2
ENSG00000243725 TTC4 241964 sc-eQTL 3.00e-01 -0.145 0.139 0.116 B_Naive2 L2
ENSG00000006555 TTC22 156502 sc-eQTL 6.01e-01 -0.0649 0.124 0.114 CD4_CTL L2
ENSG00000116205 TCEANC2 904241 sc-eQTL 3.02e-01 0.132 0.127 0.114 CD4_CTL L2
ENSG00000116209 TMEM59 904321 sc-eQTL 9.96e-01 -0.000645 0.116 0.114 CD4_CTL L2
ENSG00000116221 MRPL37 773784 sc-eQTL 5.84e-01 -0.0782 0.142 0.114 CD4_CTL L2
ENSG00000157216 SSBP3 544346 sc-eQTL 2.97e-01 -0.0914 0.0875 0.114 CD4_CTL L2
ENSG00000162402 USP24 -257539 sc-eQTL 4.12e-02 -0.245 0.119 0.114 CD4_CTL L2
ENSG00000243725 TTC4 241964 sc-eQTL 5.14e-01 -0.0881 0.135 0.114 CD4_CTL L2
ENSG00000006555 TTC22 156502 sc-eQTL 1.13e-01 -0.181 0.114 0.115 CD4_Naive L2
ENSG00000116205 TCEANC2 904241 sc-eQTL 2.23e-01 -0.106 0.0867 0.115 CD4_Naive L2
ENSG00000116209 TMEM59 904321 sc-eQTL 3.06e-01 0.0866 0.0844 0.115 CD4_Naive L2
ENSG00000116221 MRPL37 773784 sc-eQTL 1.58e-02 -0.262 0.108 0.115 CD4_Naive L2
ENSG00000157216 SSBP3 544346 sc-eQTL 2.35e-01 0.103 0.0868 0.115 CD4_Naive L2
ENSG00000162402 USP24 -257539 sc-eQTL 6.68e-01 -0.0322 0.0751 0.115 CD4_Naive L2
ENSG00000243725 TTC4 241964 sc-eQTL 3.11e-01 0.116 0.114 0.115 CD4_Naive L2
ENSG00000006555 TTC22 156502 sc-eQTL 5.45e-01 0.0725 0.12 0.115 CD4_TCM L2
ENSG00000116205 TCEANC2 904241 sc-eQTL 7.85e-01 0.0318 0.117 0.115 CD4_TCM L2
ENSG00000116209 TMEM59 904321 sc-eQTL 1.70e-01 0.121 0.0875 0.115 CD4_TCM L2
ENSG00000116221 MRPL37 773784 sc-eQTL 1.41e-01 -0.162 0.11 0.115 CD4_TCM L2
ENSG00000157216 SSBP3 544346 sc-eQTL 4.07e-01 0.09 0.108 0.115 CD4_TCM L2
ENSG00000162402 USP24 -257539 sc-eQTL 9.95e-01 -0.000595 0.0899 0.115 CD4_TCM L2
ENSG00000243725 TTC4 241964 sc-eQTL 5.55e-01 -0.0764 0.129 0.115 CD4_TCM L2
ENSG00000006555 TTC22 156502 sc-eQTL 2.16e-01 -0.169 0.136 0.115 CD4_TEM L2
ENSG00000116205 TCEANC2 904241 sc-eQTL 6.55e-02 -0.238 0.129 0.115 CD4_TEM L2
ENSG00000116209 TMEM59 904321 sc-eQTL 1.86e-01 0.133 0.1 0.115 CD4_TEM L2
ENSG00000116221 MRPL37 773784 sc-eQTL 3.61e-01 -0.118 0.129 0.115 CD4_TEM L2
ENSG00000157216 SSBP3 544346 sc-eQTL 7.67e-01 0.033 0.111 0.115 CD4_TEM L2
ENSG00000162402 USP24 -257539 sc-eQTL 2.23e-01 -0.123 0.101 0.115 CD4_TEM L2
ENSG00000243725 TTC4 241964 sc-eQTL 2.16e-01 0.165 0.133 0.115 CD4_TEM L2
ENSG00000006555 TTC22 156502 sc-eQTL 3.01e-01 0.112 0.108 0.115 CD8_CTL L2
ENSG00000116205 TCEANC2 904241 sc-eQTL 9.46e-02 -0.2 0.119 0.115 CD8_CTL L2
ENSG00000116209 TMEM59 904321 sc-eQTL 1.08e-01 0.167 0.104 0.115 CD8_CTL L2
ENSG00000116221 MRPL37 773784 sc-eQTL 8.62e-01 -0.0216 0.124 0.115 CD8_CTL L2
ENSG00000157216 SSBP3 544346 sc-eQTL 4.38e-01 -0.0656 0.0845 0.115 CD8_CTL L2
ENSG00000162402 USP24 -257539 sc-eQTL 5.38e-01 -0.0519 0.0841 0.115 CD8_CTL L2
ENSG00000243725 TTC4 241964 sc-eQTL 1.22e-02 0.314 0.124 0.115 CD8_CTL L2
ENSG00000006555 TTC22 156502 sc-eQTL 1.45e-01 -0.18 0.123 0.115 CD8_Naive L2
ENSG00000116205 TCEANC2 904241 sc-eQTL 8.97e-01 0.0145 0.112 0.115 CD8_Naive L2
ENSG00000116209 TMEM59 904321 sc-eQTL 4.63e-01 0.0801 0.109 0.115 CD8_Naive L2
ENSG00000116221 MRPL37 773784 sc-eQTL 7.95e-03 -0.345 0.129 0.115 CD8_Naive L2
ENSG00000157216 SSBP3 544346 sc-eQTL 7.27e-01 0.0346 0.0991 0.115 CD8_Naive L2
ENSG00000162402 USP24 -257539 sc-eQTL 4.65e-02 0.179 0.0893 0.115 CD8_Naive L2
ENSG00000243725 TTC4 241964 sc-eQTL 7.27e-02 -0.236 0.131 0.115 CD8_Naive L2
ENSG00000006555 TTC22 156502 sc-eQTL 9.97e-01 0.000566 0.137 0.113 CD8_TCM L2
ENSG00000116205 TCEANC2 904241 sc-eQTL 5.10e-01 0.0905 0.137 0.113 CD8_TCM L2
ENSG00000116209 TMEM59 904321 sc-eQTL 3.51e-01 0.113 0.121 0.113 CD8_TCM L2
ENSG00000116221 MRPL37 773784 sc-eQTL 6.53e-01 -0.0618 0.137 0.113 CD8_TCM L2
ENSG00000157216 SSBP3 544346 sc-eQTL 2.55e-01 0.135 0.119 0.113 CD8_TCM L2
ENSG00000162402 USP24 -257539 sc-eQTL 1.36e-01 -0.172 0.115 0.113 CD8_TCM L2
ENSG00000243725 TTC4 241964 sc-eQTL 6.85e-01 -0.0569 0.14 0.113 CD8_TCM L2
ENSG00000006555 TTC22 156502 sc-eQTL 2.46e-01 0.149 0.128 0.114 CD8_TEM L2
ENSG00000116205 TCEANC2 904241 sc-eQTL 2.19e-01 -0.165 0.134 0.114 CD8_TEM L2
ENSG00000116209 TMEM59 904321 sc-eQTL 9.82e-01 0.00285 0.13 0.114 CD8_TEM L2
ENSG00000116221 MRPL37 773784 sc-eQTL 5.86e-01 -0.0717 0.132 0.114 CD8_TEM L2
ENSG00000157216 SSBP3 544346 sc-eQTL 9.04e-01 -0.015 0.124 0.114 CD8_TEM L2
ENSG00000162402 USP24 -257539 sc-eQTL 9.09e-01 0.015 0.131 0.114 CD8_TEM L2
ENSG00000243725 TTC4 241964 sc-eQTL 2.17e-01 0.164 0.133 0.114 CD8_TEM L2
ENSG00000006555 TTC22 156502 sc-eQTL 8.35e-01 -0.0245 0.118 0.113 MAIT L2
ENSG00000116133 DHCR24 70630 sc-eQTL 7.50e-02 -0.155 0.0864 0.113 MAIT L2
ENSG00000116205 TCEANC2 904241 sc-eQTL 8.60e-01 0.0216 0.123 0.113 MAIT L2
ENSG00000116209 TMEM59 904321 sc-eQTL 3.13e-01 0.112 0.11 0.113 MAIT L2
ENSG00000116221 MRPL37 773784 sc-eQTL 9.98e-01 -0.000374 0.135 0.113 MAIT L2
ENSG00000157216 SSBP3 544346 sc-eQTL 4.70e-01 -0.0862 0.119 0.113 MAIT L2
ENSG00000162402 USP24 -257539 sc-eQTL 2.39e-01 -0.125 0.106 0.113 MAIT L2
ENSG00000215883 CYB5RL 757789 sc-eQTL 8.96e-01 0.0161 0.123 0.113 MAIT L2
ENSG00000243725 TTC4 241964 sc-eQTL 9.37e-01 -0.00965 0.122 0.113 MAIT L2
ENSG00000006555 TTC22 156502 sc-eQTL 1.49e-01 -0.192 0.133 0.118 NK_CD56bright L2
ENSG00000116133 DHCR24 70630 sc-eQTL 2.94e-01 -0.124 0.118 0.118 NK_CD56bright L2
ENSG00000116205 TCEANC2 904241 sc-eQTL 1.55e-01 -0.177 0.124 0.118 NK_CD56bright L2
ENSG00000116209 TMEM59 904321 sc-eQTL 4.65e-01 -0.0889 0.121 0.118 NK_CD56bright L2
ENSG00000116221 MRPL37 773784 sc-eQTL 7.14e-01 -0.0499 0.136 0.118 NK_CD56bright L2
ENSG00000157216 SSBP3 544346 sc-eQTL 6.05e-01 0.053 0.102 0.118 NK_CD56bright L2
ENSG00000162398 LEXM 151762 sc-eQTL 7.09e-01 -0.0451 0.121 0.118 NK_CD56bright L2
ENSG00000162402 USP24 -257539 sc-eQTL 8.25e-01 -0.0231 0.104 0.118 NK_CD56bright L2
ENSG00000243725 TTC4 241964 sc-eQTL 9.36e-01 -0.0105 0.131 0.118 NK_CD56bright L2
ENSG00000006555 TTC22 156502 sc-eQTL 4.63e-02 0.22 0.11 0.116 NK_CD56dim L2
ENSG00000116133 DHCR24 70630 sc-eQTL 9.49e-01 0.00733 0.115 0.116 NK_CD56dim L2
ENSG00000116205 TCEANC2 904241 sc-eQTL 4.62e-01 0.092 0.125 0.116 NK_CD56dim L2
ENSG00000116209 TMEM59 904321 sc-eQTL 2.23e-01 0.113 0.0923 0.116 NK_CD56dim L2
ENSG00000116221 MRPL37 773784 sc-eQTL 8.03e-01 0.03 0.12 0.116 NK_CD56dim L2
ENSG00000157216 SSBP3 544346 sc-eQTL 7.76e-02 -0.174 0.0979 0.116 NK_CD56dim L2
ENSG00000162398 LEXM 151762 sc-eQTL 5.25e-01 -0.0721 0.113 0.116 NK_CD56dim L2
ENSG00000162402 USP24 -257539 sc-eQTL 7.95e-01 0.0188 0.072 0.116 NK_CD56dim L2
ENSG00000243725 TTC4 241964 sc-eQTL 2.25e-01 -0.15 0.123 0.116 NK_CD56dim L2
ENSG00000006555 TTC22 156502 sc-eQTL 2.56e-03 -0.393 0.129 0.119 NK_HLA L2
ENSG00000116133 DHCR24 70630 sc-eQTL 4.81e-01 -0.0906 0.128 0.119 NK_HLA L2
ENSG00000116205 TCEANC2 904241 sc-eQTL 5.80e-01 0.0687 0.124 0.119 NK_HLA L2
ENSG00000116209 TMEM59 904321 sc-eQTL 7.51e-01 0.0391 0.123 0.119 NK_HLA L2
ENSG00000116221 MRPL37 773784 sc-eQTL 8.98e-01 0.0175 0.136 0.119 NK_HLA L2
ENSG00000157216 SSBP3 544346 sc-eQTL 3.53e-01 -0.103 0.11 0.119 NK_HLA L2
ENSG00000162398 LEXM 151762 sc-eQTL 3.19e-01 -0.124 0.125 0.119 NK_HLA L2
ENSG00000162402 USP24 -257539 sc-eQTL 3.78e-02 0.19 0.0906 0.119 NK_HLA L2
ENSG00000243725 TTC4 241964 sc-eQTL 7.50e-02 0.243 0.136 0.119 NK_HLA L2
ENSG00000006555 TTC22 156502 sc-eQTL 8.42e-01 0.0235 0.118 0.116 NK_cytokine L2
ENSG00000116133 DHCR24 70630 sc-eQTL 5.70e-01 -0.0679 0.119 0.116 NK_cytokine L2
ENSG00000116205 TCEANC2 904241 sc-eQTL 1.57e-01 0.167 0.118 0.116 NK_cytokine L2
ENSG00000116209 TMEM59 904321 sc-eQTL 9.97e-02 0.158 0.0957 0.116 NK_cytokine L2
ENSG00000116221 MRPL37 773784 sc-eQTL 6.73e-01 -0.05 0.119 0.116 NK_cytokine L2
ENSG00000157216 SSBP3 544346 sc-eQTL 5.38e-02 -0.191 0.0987 0.116 NK_cytokine L2
ENSG00000162398 LEXM 151762 sc-eQTL 7.05e-01 -0.0472 0.124 0.116 NK_cytokine L2
ENSG00000162402 USP24 -257539 sc-eQTL 4.83e-01 -0.0595 0.0847 0.116 NK_cytokine L2
ENSG00000243725 TTC4 241964 sc-eQTL 3.66e-02 0.262 0.124 0.116 NK_cytokine L2
ENSG00000006555 TTC22 156502 sc-eQTL 6.86e-01 0.0556 0.137 0.144 PB L2
ENSG00000116133 DHCR24 70630 sc-eQTL 9.15e-02 0.204 0.12 0.144 PB L2
ENSG00000116205 TCEANC2 904241 sc-eQTL 9.57e-01 0.00791 0.148 0.144 PB L2
ENSG00000116209 TMEM59 904321 sc-eQTL 3.26e-02 0.131 0.0606 0.144 PB L2
ENSG00000116221 MRPL37 773784 sc-eQTL 1.41e-02 -0.273 0.109 0.144 PB L2
ENSG00000157216 SSBP3 544346 sc-eQTL 8.88e-02 -0.22 0.128 0.144 PB L2
ENSG00000162402 USP24 -257539 sc-eQTL 7.80e-01 -0.0412 0.147 0.144 PB L2
ENSG00000215883 CYB5RL 757789 sc-eQTL 1.27e-01 0.233 0.151 0.144 PB L2
ENSG00000243725 TTC4 241964 sc-eQTL 6.87e-01 -0.0576 0.143 0.144 PB L2
ENSG00000006555 TTC22 156502 sc-eQTL 4.65e-01 -0.0885 0.121 0.117 Pro_T L2
ENSG00000116133 DHCR24 70630 sc-eQTL 3.50e-02 -0.216 0.102 0.117 Pro_T L2
ENSG00000116205 TCEANC2 904241 sc-eQTL 1.27e-01 0.191 0.125 0.117 Pro_T L2
ENSG00000116209 TMEM59 904321 sc-eQTL 5.58e-01 0.0511 0.087 0.117 Pro_T L2
ENSG00000116221 MRPL37 773784 sc-eQTL 3.28e-01 -0.0834 0.0851 0.117 Pro_T L2
ENSG00000157216 SSBP3 544346 sc-eQTL 6.38e-01 -0.045 0.0956 0.117 Pro_T L2
ENSG00000162402 USP24 -257539 sc-eQTL 2.35e-01 0.138 0.116 0.117 Pro_T L2
ENSG00000215883 CYB5RL 757789 sc-eQTL 4.08e-01 -0.0953 0.115 0.117 Pro_T L2
ENSG00000243725 TTC4 241964 sc-eQTL 9.03e-01 0.0156 0.128 0.117 Pro_T L2
ENSG00000006555 TTC22 156502 sc-eQTL 1.24e-01 -0.183 0.118 0.115 Treg L2
ENSG00000116205 TCEANC2 904241 sc-eQTL 7.20e-01 -0.0457 0.127 0.115 Treg L2
ENSG00000116209 TMEM59 904321 sc-eQTL 8.30e-01 0.0217 0.101 0.115 Treg L2
ENSG00000116221 MRPL37 773784 sc-eQTL 2.59e-01 -0.141 0.124 0.115 Treg L2
ENSG00000157216 SSBP3 544346 sc-eQTL 7.71e-01 -0.0325 0.111 0.115 Treg L2
ENSG00000162402 USP24 -257539 sc-eQTL 9.98e-01 -0.000222 0.106 0.115 Treg L2
ENSG00000243725 TTC4 241964 sc-eQTL 4.62e-01 -0.0982 0.133 0.115 Treg L2
ENSG00000116133 DHCR24 70630 sc-eQTL 8.15e-01 -0.0268 0.114 0.112 cDC L2
ENSG00000116205 TCEANC2 904241 sc-eQTL 9.76e-01 -0.00405 0.135 0.112 cDC L2
ENSG00000116209 TMEM59 904321 sc-eQTL 2.17e-01 -0.141 0.114 0.112 cDC L2
ENSG00000116221 MRPL37 773784 sc-eQTL 3.79e-01 0.129 0.146 0.112 cDC L2
ENSG00000157216 SSBP3 544346 sc-eQTL 7.52e-01 0.0428 0.135 0.112 cDC L2
ENSG00000162390 ACOT11 415568 sc-eQTL 7.86e-01 -0.0341 0.126 0.112 cDC L2
ENSG00000162402 USP24 -257539 sc-eQTL 1.71e-01 0.193 0.14 0.112 cDC L2
ENSG00000215883 CYB5RL 757789 sc-eQTL 6.77e-02 -0.22 0.12 0.112 cDC L2
ENSG00000243725 TTC4 241964 sc-eQTL 4.51e-02 0.288 0.143 0.112 cDC L2
ENSG00000116133 DHCR24 70630 sc-eQTL 4.54e-01 0.0594 0.0793 0.115 cMono_IL1B L2
ENSG00000116205 TCEANC2 904241 sc-eQTL 2.09e-01 -0.138 0.11 0.115 cMono_IL1B L2
ENSG00000116209 TMEM59 904321 sc-eQTL 8.39e-01 -0.0136 0.0669 0.115 cMono_IL1B L2
ENSG00000116221 MRPL37 773784 sc-eQTL 3.27e-01 -0.117 0.119 0.115 cMono_IL1B L2
ENSG00000157216 SSBP3 544346 sc-eQTL 8.22e-01 0.0274 0.122 0.115 cMono_IL1B L2
ENSG00000162402 USP24 -257539 sc-eQTL 9.56e-01 -0.00501 0.0899 0.115 cMono_IL1B L2
ENSG00000243725 TTC4 241964 sc-eQTL 2.58e-01 -0.155 0.137 0.115 cMono_IL1B L2
ENSG00000116133 DHCR24 70630 sc-eQTL 4.95e-01 0.0508 0.0743 0.115 cMono_S100A L2
ENSG00000116205 TCEANC2 904241 sc-eQTL 1.45e-01 -0.165 0.113 0.115 cMono_S100A L2
ENSG00000116209 TMEM59 904321 sc-eQTL 6.94e-01 -0.0357 0.0908 0.115 cMono_S100A L2
ENSG00000116221 MRPL37 773784 sc-eQTL 7.07e-01 -0.0494 0.131 0.115 cMono_S100A L2
ENSG00000157216 SSBP3 544346 sc-eQTL 2.30e-01 -0.163 0.136 0.115 cMono_S100A L2
ENSG00000162402 USP24 -257539 sc-eQTL 7.19e-02 -0.198 0.109 0.115 cMono_S100A L2
ENSG00000243725 TTC4 241964 sc-eQTL 9.40e-01 -0.0104 0.138 0.115 cMono_S100A L2
ENSG00000006555 TTC22 156502 sc-eQTL 2.70e-01 0.14 0.126 0.112 gdT L2
ENSG00000116133 DHCR24 70630 sc-eQTL 3.48e-01 -0.133 0.141 0.112 gdT L2
ENSG00000116205 TCEANC2 904241 sc-eQTL 7.01e-02 0.256 0.14 0.112 gdT L2
ENSG00000116209 TMEM59 904321 sc-eQTL 9.56e-01 0.00791 0.144 0.112 gdT L2
ENSG00000116221 MRPL37 773784 sc-eQTL 9.50e-01 0.0103 0.165 0.112 gdT L2
ENSG00000157216 SSBP3 544346 sc-eQTL 4.65e-01 -0.0738 0.101 0.112 gdT L2
ENSG00000162402 USP24 -257539 sc-eQTL 5.57e-01 -0.0798 0.136 0.112 gdT L2
ENSG00000215883 CYB5RL 757789 sc-eQTL 5.38e-01 -0.087 0.141 0.112 gdT L2
ENSG00000243725 TTC4 241964 sc-eQTL 2.40e-01 -0.186 0.158 0.112 gdT L2
ENSG00000116133 DHCR24 70630 sc-eQTL 1.08e-02 -0.254 0.0986 0.12 intMono L2
ENSG00000116205 TCEANC2 904241 sc-eQTL 2.64e-01 0.14 0.124 0.12 intMono L2
ENSG00000116209 TMEM59 904321 sc-eQTL 7.75e-01 0.0262 0.0917 0.12 intMono L2
ENSG00000116221 MRPL37 773784 sc-eQTL 5.52e-01 -0.0834 0.14 0.12 intMono L2
ENSG00000157216 SSBP3 544346 sc-eQTL 3.44e-01 -0.136 0.143 0.12 intMono L2
ENSG00000162402 USP24 -257539 sc-eQTL 3.62e-01 0.117 0.127 0.12 intMono L2
ENSG00000243725 TTC4 241964 sc-eQTL 4.68e-01 0.0988 0.136 0.12 intMono L2
ENSG00000116133 DHCR24 70630 sc-eQTL 7.32e-02 -0.183 0.102 0.113 ncMono L2
ENSG00000116205 TCEANC2 904241 sc-eQTL 6.13e-01 -0.0651 0.128 0.113 ncMono L2
ENSG00000116209 TMEM59 904321 sc-eQTL 9.24e-01 -0.0098 0.103 0.113 ncMono L2
ENSG00000116221 MRPL37 773784 sc-eQTL 1.17e-02 0.332 0.13 0.113 ncMono L2
ENSG00000157216 SSBP3 544346 sc-eQTL 4.60e-01 -0.107 0.145 0.113 ncMono L2
ENSG00000162402 USP24 -257539 sc-eQTL 6.28e-01 0.0561 0.116 0.113 ncMono L2
ENSG00000243725 TTC4 241964 sc-eQTL 3.45e-01 0.129 0.137 0.113 ncMono L2
ENSG00000116133 DHCR24 70630 sc-eQTL 4.08e-01 0.105 0.126 0.105 pDC L2
ENSG00000116205 TCEANC2 904241 sc-eQTL 6.53e-01 0.0684 0.152 0.105 pDC L2
ENSG00000116209 TMEM59 904321 sc-eQTL 4.11e-01 -0.0997 0.121 0.105 pDC L2
ENSG00000116221 MRPL37 773784 sc-eQTL 6.87e-01 -0.0651 0.161 0.105 pDC L2
ENSG00000157216 SSBP3 544346 sc-eQTL 6.39e-01 0.0673 0.143 0.105 pDC L2
ENSG00000162390 ACOT11 415568 sc-eQTL 4.32e-01 0.0473 0.06 0.105 pDC L2
ENSG00000162402 USP24 -257539 sc-eQTL 3.96e-01 0.0863 0.101 0.105 pDC L2
ENSG00000215883 CYB5RL 757789 sc-eQTL 6.63e-01 0.0606 0.139 0.105 pDC L2
ENSG00000243725 TTC4 241964 sc-eQTL 8.99e-02 -0.271 0.159 0.105 pDC L2
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000006555 TTC22 156502 sc-eQTL 8.23e-01 0.0279 0.125 0.115 B_Memory LOneK1K
ENSG00000116133 DHCR24 70630 sc-eQTL 8.78e-01 -0.0193 0.125 0.115 B_Memory LOneK1K
ENSG00000116205 TCEANC2 904241 sc-eQTL 1.94e-01 0.157 0.12 0.115 B_Memory LOneK1K
ENSG00000116209 TMEM59 904321 sc-eQTL 2.01e-01 -0.12 0.0937 0.115 B_Memory LOneK1K
ENSG00000116221 MRPL37 773784 sc-eQTL 5.48e-02 -0.216 0.112 0.115 B_Memory LOneK1K
ENSG00000157216 SSBP3 544346 sc-eQTL 3.52e-01 -0.0912 0.0978 0.115 B_Memory LOneK1K
ENSG00000162402 USP24 -257539 sc-eQTL 4.24e-01 -0.0716 0.0892 0.115 B_Memory LOneK1K
ENSG00000215883 CYB5RL 757789 sc-eQTL 4.68e-01 -0.0997 0.137 0.115 B_Memory LOneK1K
ENSG00000243725 TTC4 241964 sc-eQTL 6.90e-01 -0.0492 0.123 0.115 B_Memory LOneK1K
ENSG00000006555 TTC22 156502 sc-eQTL 6.53e-01 0.0587 0.13 0.115 B_Naive LOneK1K
ENSG00000116133 DHCR24 70630 sc-eQTL 4.79e-01 0.0831 0.117 0.115 B_Naive LOneK1K
ENSG00000116205 TCEANC2 904241 sc-eQTL 6.74e-01 -0.0447 0.106 0.115 B_Naive LOneK1K
ENSG00000116209 TMEM59 904321 sc-eQTL 3.73e-01 0.0671 0.0752 0.115 B_Naive LOneK1K
ENSG00000116221 MRPL37 773784 sc-eQTL 5.90e-01 -0.0584 0.108 0.115 B_Naive LOneK1K
ENSG00000157216 SSBP3 544346 sc-eQTL 1.25e-01 0.148 0.0964 0.115 B_Naive LOneK1K
ENSG00000162402 USP24 -257539 sc-eQTL 7.96e-01 -0.0215 0.0831 0.115 B_Naive LOneK1K
ENSG00000215883 CYB5RL 757789 sc-eQTL 5.50e-01 -0.0787 0.131 0.115 B_Naive LOneK1K
ENSG00000243725 TTC4 241964 sc-eQTL 7.52e-01 -0.0392 0.124 0.115 B_Naive LOneK1K
ENSG00000116133 DHCR24 70630 sc-eQTL 3.20e-01 0.0766 0.0768 0.115 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000116205 TCEANC2 904241 sc-eQTL 1.28e-01 -0.146 0.0958 0.115 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000116209 TMEM59 904321 sc-eQTL 5.51e-01 -0.0396 0.0664 0.115 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000116221 MRPL37 773784 sc-eQTL 3.04e-01 -0.121 0.117 0.115 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000157216 SSBP3 544346 sc-eQTL 7.41e-01 -0.0407 0.123 0.115 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000162402 USP24 -257539 sc-eQTL 4.72e-01 -0.0605 0.084 0.115 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000243725 TTC4 241964 sc-eQTL 2.80e-01 -0.151 0.139 0.115 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000116133 DHCR24 70630 sc-eQTL 6.23e-02 -0.181 0.0964 0.116 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000116205 TCEANC2 904241 sc-eQTL 7.14e-01 0.0469 0.128 0.116 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000116209 TMEM59 904321 sc-eQTL 5.98e-01 -0.0501 0.0949 0.116 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000116221 MRPL37 773784 sc-eQTL 1.61e-01 0.182 0.13 0.116 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000157216 SSBP3 544346 sc-eQTL 3.22e-01 -0.138 0.139 0.116 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000162402 USP24 -257539 sc-eQTL 3.74e-01 0.0972 0.109 0.116 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000243725 TTC4 241964 sc-eQTL 1.98e-01 0.176 0.137 0.116 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000006555 TTC22 156502 sc-eQTL 8.02e-01 0.027 0.108 0.116 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000116133 DHCR24 70630 sc-eQTL 9.34e-01 -0.00934 0.112 0.116 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000116205 TCEANC2 904241 sc-eQTL 2.62e-01 0.124 0.11 0.116 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000116209 TMEM59 904321 sc-eQTL 3.73e-02 0.177 0.0844 0.116 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000116221 MRPL37 773784 sc-eQTL 9.53e-01 0.00669 0.114 0.116 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000157216 SSBP3 544346 sc-eQTL 3.47e-02 -0.197 0.0927 0.116 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000162398 LEXM 151762 sc-eQTL 3.61e-01 -0.0966 0.105 0.116 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000162402 USP24 -257539 sc-eQTL 8.89e-01 0.00933 0.067 0.116 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000243725 TTC4 241964 sc-eQTL 9.58e-01 0.00628 0.119 0.116 NK_CD56dim LOneK1K


Statistical fine-mapping results from Japan COVID-19 Task Force
(Shown only for PIP>0.001)
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
PIP (SuSiE)
PIP (FINEMAP)
MAF
ENSG00000006555 TTC22 156502 eQTL 0.00195 -0.0731 0.0235 0.0 0.0 0.106
ENSG00000243725 TTC4 241964 eQTL 0.0415 0.0559 0.0274 0.0 0.0 0.106


Expression Modifier Score(EMS) for GTEx 49tissues
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Whole Blood
Muscle Skeletal
Liver
Brain Cerebellum
Prostate
Spleen
Skin Sun Exposed Lower leg
Artery Coronary
Esophagus Muscularis
Esophagus Gastroesophageal Junction
Artery Tibial
Heart Atrial Appendage
Nerve Tibial
Heart Left Ventricle
Adrenal Gland
Adipose Visceral Omentum
Pancreas
Lung
Pituitary
Brain Nucleus accumbens basal ganglia
Colon Transverse
Adipose Subcutaneous
Esophagus Mucosa
Brain Cortex
Thyroid
Stomach
Breast Mammary Tissue
Colon Sigmoid
Skin Not Sun Exposed Suprapubic
Testis
Artery Aorta
Brain Amygdala
Brain Anterior cingulate cortex BA24
Brain Caudate basal ganglia
Brain Cerebellar Hemisphere
Brain Frontal Cortex BA9
Brain Hippocampus
Brain Hypothalamus
Brain Putamen basal ganglia
Brain Spinal cord cervical c-1
Brain Substantia nigra
Cells Cultured fibroblasts
Cells EBV-transformed lymphocytes
Kidney Cortex
Minor Salivary Gland
Ovary
Small Intestine Terminal Ileum
Uterus
Vagina