logo

Genes within 1Mb (chr1:54951697:T:C):

View on , UCSC , GTEx , gnomAD

Immune cell-type specific single cell cis-eQTLs in OASIS
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000006555 TTC22 150374 sc-eQTL 9.30e-01 0.00835 0.0947 0.286 B L1
ENSG00000116133 DHCR24 64502 sc-eQTL 3.67e-01 -0.0808 0.0894 0.286 B L1
ENSG00000116205 TCEANC2 898113 sc-eQTL 1.27e-01 -0.118 0.0768 0.286 B L1
ENSG00000116209 TMEM59 898193 sc-eQTL 9.48e-01 0.00305 0.0471 0.286 B L1
ENSG00000116221 MRPL37 767656 sc-eQTL 8.72e-01 0.00991 0.0616 0.286 B L1
ENSG00000157216 SSBP3 538218 sc-eQTL 4.40e-01 -0.0498 0.0644 0.286 B L1
ENSG00000162402 USP24 -263667 sc-eQTL 6.45e-02 -0.101 0.0542 0.286 B L1
ENSG00000215883 CYB5RL 751661 sc-eQTL 1.32e-01 0.158 0.105 0.286 B L1
ENSG00000243725 TTC4 235836 sc-eQTL 8.22e-01 -0.0206 0.0915 0.286 B L1
ENSG00000006555 TTC22 150374 sc-eQTL 1.37e-02 -0.18 0.0726 0.286 CD4T L1
ENSG00000116205 TCEANC2 898113 sc-eQTL 2.64e-01 0.0673 0.0601 0.286 CD4T L1
ENSG00000116209 TMEM59 898193 sc-eQTL 4.38e-02 -0.113 0.0556 0.286 CD4T L1
ENSG00000116221 MRPL37 767656 sc-eQTL 1.40e-01 0.114 0.0772 0.286 CD4T L1
ENSG00000157216 SSBP3 538218 sc-eQTL 5.48e-02 -0.123 0.0638 0.286 CD4T L1
ENSG00000162402 USP24 -263667 sc-eQTL 1.98e-01 -0.0675 0.0523 0.286 CD4T L1
ENSG00000243725 TTC4 235836 sc-eQTL 4.30e-02 -0.159 0.0782 0.286 CD4T L1
ENSG00000006555 TTC22 150374 sc-eQTL 1.21e-01 -0.0998 0.0641 0.286 CD8T L1
ENSG00000116205 TCEANC2 898113 sc-eQTL 8.22e-01 -0.0181 0.0804 0.286 CD8T L1
ENSG00000116209 TMEM59 898193 sc-eQTL 4.61e-01 -0.0411 0.0557 0.286 CD8T L1
ENSG00000116221 MRPL37 767656 sc-eQTL 2.69e-01 -0.0849 0.0766 0.286 CD8T L1
ENSG00000157216 SSBP3 538218 sc-eQTL 7.56e-01 -0.0171 0.0552 0.286 CD8T L1
ENSG00000162402 USP24 -263667 sc-eQTL 3.98e-01 -0.0451 0.0533 0.286 CD8T L1
ENSG00000243725 TTC4 235836 sc-eQTL 5.52e-01 -0.0551 0.0925 0.286 CD8T L1
ENSG00000116133 DHCR24 64502 sc-eQTL 1.47e-01 -0.124 0.0851 0.284 DC L1
ENSG00000116205 TCEANC2 898113 sc-eQTL 5.88e-01 -0.0519 0.0958 0.284 DC L1
ENSG00000116209 TMEM59 898193 sc-eQTL 9.77e-01 0.00219 0.0754 0.284 DC L1
ENSG00000116221 MRPL37 767656 sc-eQTL 9.70e-01 0.00385 0.101 0.284 DC L1
ENSG00000157216 SSBP3 538218 sc-eQTL 3.33e-01 -0.0874 0.0901 0.284 DC L1
ENSG00000162390 ACOT11 409440 sc-eQTL 8.80e-01 -0.0131 0.0868 0.284 DC L1
ENSG00000162402 USP24 -263667 sc-eQTL 4.36e-01 -0.0409 0.0523 0.284 DC L1
ENSG00000215883 CYB5RL 751661 sc-eQTL 2.82e-01 0.102 0.0944 0.284 DC L1
ENSG00000243725 TTC4 235836 sc-eQTL 3.82e-01 -0.0891 0.102 0.284 DC L1
ENSG00000116133 DHCR24 64502 sc-eQTL 4.23e-01 -0.0494 0.0615 0.286 Mono L1
ENSG00000116205 TCEANC2 898113 sc-eQTL 7.14e-01 -0.0244 0.0664 0.286 Mono L1
ENSG00000116209 TMEM59 898193 sc-eQTL 9.17e-01 -0.00517 0.0493 0.286 Mono L1
ENSG00000116221 MRPL37 767656 sc-eQTL 1.54e-01 -0.118 0.0822 0.286 Mono L1
ENSG00000157216 SSBP3 538218 sc-eQTL 3.00e-03 0.278 0.0926 0.286 Mono L1
ENSG00000162402 USP24 -263667 sc-eQTL 7.65e-01 0.0169 0.0564 0.286 Mono L1
ENSG00000243725 TTC4 235836 sc-eQTL 3.01e-01 -0.103 0.099 0.286 Mono L1
ENSG00000006555 TTC22 150374 sc-eQTL 6.14e-01 -0.0429 0.0851 0.288 NK L1
ENSG00000116133 DHCR24 64502 sc-eQTL 9.08e-03 -0.223 0.0846 0.288 NK L1
ENSG00000116205 TCEANC2 898113 sc-eQTL 5.11e-01 -0.0558 0.0847 0.288 NK L1
ENSG00000116209 TMEM59 898193 sc-eQTL 6.65e-02 -0.122 0.0659 0.288 NK L1
ENSG00000116221 MRPL37 767656 sc-eQTL 4.78e-01 -0.0587 0.0825 0.288 NK L1
ENSG00000157216 SSBP3 538218 sc-eQTL 2.75e-02 0.157 0.0708 0.288 NK L1
ENSG00000162398 LEXM 145634 sc-eQTL 7.67e-01 0.0238 0.0803 0.288 NK L1
ENSG00000162402 USP24 -263667 sc-eQTL 4.27e-01 -0.0388 0.0486 0.288 NK L1
ENSG00000243725 TTC4 235836 sc-eQTL 4.07e-01 -0.0765 0.092 0.288 NK L1
ENSG00000006555 TTC22 150374 sc-eQTL 3.14e-01 -0.0755 0.0748 0.286 Other_T L1
ENSG00000116133 DHCR24 64502 sc-eQTL 7.84e-01 0.016 0.0582 0.286 Other_T L1
ENSG00000116205 TCEANC2 898113 sc-eQTL 6.21e-01 -0.0431 0.087 0.286 Other_T L1
ENSG00000116209 TMEM59 898193 sc-eQTL 2.77e-01 -0.065 0.0596 0.286 Other_T L1
ENSG00000116221 MRPL37 767656 sc-eQTL 5.85e-02 0.106 0.0555 0.286 Other_T L1
ENSG00000157216 SSBP3 538218 sc-eQTL 5.66e-01 0.0372 0.0647 0.286 Other_T L1
ENSG00000162402 USP24 -263667 sc-eQTL 6.07e-01 0.0355 0.0689 0.286 Other_T L1
ENSG00000215883 CYB5RL 751661 sc-eQTL 2.66e-01 -0.105 0.094 0.286 Other_T L1
ENSG00000243725 TTC4 235836 sc-eQTL 6.29e-01 -0.0454 0.0938 0.286 Other_T L1
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000006555 TTC22 150374 sc-eQTL 2.49e-01 0.0932 0.0806 0.293 B_Activated L2
ENSG00000116133 DHCR24 64502 sc-eQTL 2.47e-01 -0.11 0.0947 0.293 B_Activated L2
ENSG00000116205 TCEANC2 898113 sc-eQTL 7.36e-01 0.0345 0.102 0.293 B_Activated L2
ENSG00000116209 TMEM59 898193 sc-eQTL 5.11e-01 0.0713 0.108 0.293 B_Activated L2
ENSG00000116221 MRPL37 767656 sc-eQTL 4.38e-01 0.091 0.117 0.293 B_Activated L2
ENSG00000157216 SSBP3 538218 sc-eQTL 3.84e-01 0.0923 0.106 0.293 B_Activated L2
ENSG00000162402 USP24 -263667 sc-eQTL 1.65e-02 -0.246 0.102 0.293 B_Activated L2
ENSG00000215883 CYB5RL 751661 sc-eQTL 4.93e-01 0.0627 0.0912 0.293 B_Activated L2
ENSG00000243725 TTC4 235836 sc-eQTL 5.50e-01 0.0593 0.099 0.293 B_Activated L2
ENSG00000006555 TTC22 150374 sc-eQTL 4.51e-01 0.0757 0.1 0.285 B_Intermediate L2
ENSG00000116133 DHCR24 64502 sc-eQTL 5.06e-01 -0.062 0.093 0.285 B_Intermediate L2
ENSG00000116205 TCEANC2 898113 sc-eQTL 6.94e-01 0.0365 0.0927 0.285 B_Intermediate L2
ENSG00000116209 TMEM59 898193 sc-eQTL 7.08e-01 0.0298 0.0794 0.285 B_Intermediate L2
ENSG00000116221 MRPL37 767656 sc-eQTL 1.82e-01 0.125 0.093 0.285 B_Intermediate L2
ENSG00000157216 SSBP3 538218 sc-eQTL 1.97e-01 -0.113 0.0869 0.285 B_Intermediate L2
ENSG00000162402 USP24 -263667 sc-eQTL 1.95e-01 -0.0951 0.0732 0.285 B_Intermediate L2
ENSG00000215883 CYB5RL 751661 sc-eQTL 3.87e-01 -0.0901 0.104 0.285 B_Intermediate L2
ENSG00000243725 TTC4 235836 sc-eQTL 8.01e-01 -0.0239 0.0946 0.285 B_Intermediate L2
ENSG00000006555 TTC22 150374 sc-eQTL 9.36e-01 0.00779 0.0963 0.287 B_Memory L2
ENSG00000116133 DHCR24 64502 sc-eQTL 6.14e-01 0.0482 0.0955 0.287 B_Memory L2
ENSG00000116205 TCEANC2 898113 sc-eQTL 8.00e-02 -0.178 0.101 0.287 B_Memory L2
ENSG00000116209 TMEM59 898193 sc-eQTL 3.26e-01 0.0837 0.085 0.287 B_Memory L2
ENSG00000116221 MRPL37 767656 sc-eQTL 2.26e-01 0.104 0.086 0.287 B_Memory L2
ENSG00000157216 SSBP3 538218 sc-eQTL 7.59e-01 -0.0247 0.0805 0.287 B_Memory L2
ENSG00000162402 USP24 -263667 sc-eQTL 3.94e-01 -0.0672 0.0786 0.287 B_Memory L2
ENSG00000215883 CYB5RL 751661 sc-eQTL 6.63e-01 -0.0425 0.0974 0.287 B_Memory L2
ENSG00000243725 TTC4 235836 sc-eQTL 6.02e-01 0.0528 0.101 0.287 B_Memory L2
ENSG00000006555 TTC22 150374 sc-eQTL 9.70e-01 0.00383 0.102 0.286 B_Naive1 L2
ENSG00000116133 DHCR24 64502 sc-eQTL 3.97e-01 -0.0809 0.0954 0.286 B_Naive1 L2
ENSG00000116205 TCEANC2 898113 sc-eQTL 5.66e-01 -0.0489 0.0852 0.286 B_Naive1 L2
ENSG00000116209 TMEM59 898193 sc-eQTL 6.52e-01 -0.028 0.0619 0.286 B_Naive1 L2
ENSG00000116221 MRPL37 767656 sc-eQTL 1.20e-01 -0.142 0.0908 0.286 B_Naive1 L2
ENSG00000157216 SSBP3 538218 sc-eQTL 8.91e-01 0.0119 0.087 0.286 B_Naive1 L2
ENSG00000162402 USP24 -263667 sc-eQTL 8.07e-01 -0.0167 0.0685 0.286 B_Naive1 L2
ENSG00000215883 CYB5RL 751661 sc-eQTL 8.68e-02 0.177 0.103 0.286 B_Naive1 L2
ENSG00000243725 TTC4 235836 sc-eQTL 3.02e-01 -0.0963 0.093 0.286 B_Naive1 L2
ENSG00000006555 TTC22 150374 sc-eQTL 3.11e-01 -0.102 0.1 0.285 B_Naive2 L2
ENSG00000116133 DHCR24 64502 sc-eQTL 3.87e-01 -0.0756 0.0872 0.285 B_Naive2 L2
ENSG00000116205 TCEANC2 898113 sc-eQTL 6.45e-01 -0.0446 0.0969 0.285 B_Naive2 L2
ENSG00000116209 TMEM59 898193 sc-eQTL 3.98e-01 -0.0674 0.0797 0.285 B_Naive2 L2
ENSG00000116221 MRPL37 767656 sc-eQTL 5.19e-01 -0.0606 0.0939 0.285 B_Naive2 L2
ENSG00000157216 SSBP3 538218 sc-eQTL 1.72e-01 0.126 0.0921 0.285 B_Naive2 L2
ENSG00000162402 USP24 -263667 sc-eQTL 5.40e-01 -0.045 0.0733 0.285 B_Naive2 L2
ENSG00000215883 CYB5RL 751661 sc-eQTL 1.34e-01 0.155 0.103 0.285 B_Naive2 L2
ENSG00000243725 TTC4 235836 sc-eQTL 8.41e-01 0.0215 0.107 0.285 B_Naive2 L2
ENSG00000006555 TTC22 150374 sc-eQTL 9.85e-01 0.00175 0.0954 0.284 CD4_CTL L2
ENSG00000116205 TCEANC2 898113 sc-eQTL 1.28e-01 -0.149 0.0976 0.284 CD4_CTL L2
ENSG00000116209 TMEM59 898193 sc-eQTL 3.92e-01 0.0764 0.0891 0.284 CD4_CTL L2
ENSG00000116221 MRPL37 767656 sc-eQTL 2.16e-01 0.136 0.109 0.284 CD4_CTL L2
ENSG00000157216 SSBP3 538218 sc-eQTL 6.90e-01 0.0269 0.0675 0.284 CD4_CTL L2
ENSG00000162402 USP24 -263667 sc-eQTL 9.75e-01 -0.00295 0.0927 0.284 CD4_CTL L2
ENSG00000243725 TTC4 235836 sc-eQTL 6.90e-01 0.0414 0.104 0.284 CD4_CTL L2
ENSG00000006555 TTC22 150374 sc-eQTL 1.01e-01 -0.141 0.0859 0.286 CD4_Naive L2
ENSG00000116205 TCEANC2 898113 sc-eQTL 4.58e-01 0.0488 0.0656 0.286 CD4_Naive L2
ENSG00000116209 TMEM59 898193 sc-eQTL 8.70e-02 -0.109 0.0635 0.286 CD4_Naive L2
ENSG00000116221 MRPL37 767656 sc-eQTL 3.95e-01 0.0701 0.0823 0.286 CD4_Naive L2
ENSG00000157216 SSBP3 538218 sc-eQTL 4.76e-01 -0.0469 0.0657 0.286 CD4_Naive L2
ENSG00000162402 USP24 -263667 sc-eQTL 9.26e-01 -0.00527 0.0568 0.286 CD4_Naive L2
ENSG00000243725 TTC4 235836 sc-eQTL 2.84e-01 -0.0927 0.0863 0.286 CD4_Naive L2
ENSG00000006555 TTC22 150374 sc-eQTL 1.92e-02 -0.213 0.0903 0.286 CD4_TCM L2
ENSG00000116205 TCEANC2 898113 sc-eQTL 2.70e-01 0.0982 0.0887 0.286 CD4_TCM L2
ENSG00000116209 TMEM59 898193 sc-eQTL 7.35e-02 -0.12 0.0666 0.286 CD4_TCM L2
ENSG00000116221 MRPL37 767656 sc-eQTL 5.09e-01 0.0558 0.0843 0.286 CD4_TCM L2
ENSG00000157216 SSBP3 538218 sc-eQTL 4.88e-02 -0.162 0.082 0.286 CD4_TCM L2
ENSG00000162402 USP24 -263667 sc-eQTL 5.01e-01 -0.0462 0.0685 0.286 CD4_TCM L2
ENSG00000243725 TTC4 235836 sc-eQTL 3.27e-02 -0.21 0.0977 0.286 CD4_TCM L2
ENSG00000006555 TTC22 150374 sc-eQTL 5.28e-01 0.0666 0.105 0.286 CD4_TEM L2
ENSG00000116205 TCEANC2 898113 sc-eQTL 5.55e-01 0.059 0.0999 0.286 CD4_TEM L2
ENSG00000116209 TMEM59 898193 sc-eQTL 4.17e-01 -0.0629 0.0773 0.286 CD4_TEM L2
ENSG00000116221 MRPL37 767656 sc-eQTL 7.72e-01 0.0289 0.0997 0.286 CD4_TEM L2
ENSG00000157216 SSBP3 538218 sc-eQTL 1.20e-02 -0.213 0.0842 0.286 CD4_TEM L2
ENSG00000162402 USP24 -263667 sc-eQTL 4.18e-01 -0.063 0.0776 0.286 CD4_TEM L2
ENSG00000243725 TTC4 235836 sc-eQTL 1.73e-02 -0.243 0.101 0.286 CD4_TEM L2
ENSG00000006555 TTC22 150374 sc-eQTL 9.74e-01 -0.00276 0.0832 0.286 CD8_CTL L2
ENSG00000116205 TCEANC2 898113 sc-eQTL 5.91e-02 -0.173 0.0914 0.286 CD8_CTL L2
ENSG00000116209 TMEM59 898193 sc-eQTL 9.28e-01 0.00725 0.0801 0.286 CD8_CTL L2
ENSG00000116221 MRPL37 767656 sc-eQTL 5.90e-01 -0.0513 0.0949 0.286 CD8_CTL L2
ENSG00000157216 SSBP3 538218 sc-eQTL 2.50e-01 0.0746 0.0647 0.286 CD8_CTL L2
ENSG00000162402 USP24 -263667 sc-eQTL 5.17e-01 -0.0419 0.0645 0.286 CD8_CTL L2
ENSG00000243725 TTC4 235836 sc-eQTL 1.83e-02 0.227 0.0953 0.286 CD8_CTL L2
ENSG00000006555 TTC22 150374 sc-eQTL 6.80e-01 -0.039 0.0943 0.286 CD8_Naive L2
ENSG00000116205 TCEANC2 898113 sc-eQTL 1.52e-01 0.122 0.085 0.286 CD8_Naive L2
ENSG00000116209 TMEM59 898193 sc-eQTL 8.62e-01 0.0146 0.0835 0.286 CD8_Naive L2
ENSG00000116221 MRPL37 767656 sc-eQTL 3.09e-02 -0.215 0.0991 0.286 CD8_Naive L2
ENSG00000157216 SSBP3 538218 sc-eQTL 6.81e-01 -0.0312 0.0758 0.286 CD8_Naive L2
ENSG00000162402 USP24 -263667 sc-eQTL 1.31e-01 -0.104 0.0686 0.286 CD8_Naive L2
ENSG00000243725 TTC4 235836 sc-eQTL 2.84e-01 -0.108 0.101 0.286 CD8_Naive L2
ENSG00000006555 TTC22 150374 sc-eQTL 4.56e-01 -0.077 0.103 0.273 CD8_TCM L2
ENSG00000116205 TCEANC2 898113 sc-eQTL 1.93e-01 -0.135 0.103 0.273 CD8_TCM L2
ENSG00000116209 TMEM59 898193 sc-eQTL 6.16e-01 0.046 0.0915 0.273 CD8_TCM L2
ENSG00000116221 MRPL37 767656 sc-eQTL 1.69e-01 0.143 0.103 0.273 CD8_TCM L2
ENSG00000157216 SSBP3 538218 sc-eQTL 8.64e-01 -0.0155 0.09 0.273 CD8_TCM L2
ENSG00000162402 USP24 -263667 sc-eQTL 4.04e-01 0.0728 0.0871 0.273 CD8_TCM L2
ENSG00000243725 TTC4 235836 sc-eQTL 7.94e-03 -0.28 0.104 0.273 CD8_TCM L2
ENSG00000006555 TTC22 150374 sc-eQTL 8.52e-01 -0.0182 0.0971 0.292 CD8_TEM L2
ENSG00000116205 TCEANC2 898113 sc-eQTL 4.05e-02 0.207 0.1 0.292 CD8_TEM L2
ENSG00000116209 TMEM59 898193 sc-eQTL 8.37e-01 -0.0201 0.098 0.292 CD8_TEM L2
ENSG00000116221 MRPL37 767656 sc-eQTL 5.96e-01 -0.0526 0.0992 0.292 CD8_TEM L2
ENSG00000157216 SSBP3 538218 sc-eQTL 2.64e-01 -0.105 0.0936 0.292 CD8_TEM L2
ENSG00000162402 USP24 -263667 sc-eQTL 6.31e-01 0.0477 0.0989 0.292 CD8_TEM L2
ENSG00000243725 TTC4 235836 sc-eQTL 1.43e-01 -0.147 0.1 0.292 CD8_TEM L2
ENSG00000006555 TTC22 150374 sc-eQTL 3.28e-02 -0.198 0.0919 0.286 MAIT L2
ENSG00000116133 DHCR24 64502 sc-eQTL 5.30e-01 0.0432 0.0687 0.286 MAIT L2
ENSG00000116205 TCEANC2 898113 sc-eQTL 6.10e-01 -0.0495 0.0968 0.286 MAIT L2
ENSG00000116209 TMEM59 898193 sc-eQTL 6.43e-01 0.0406 0.0875 0.286 MAIT L2
ENSG00000116221 MRPL37 767656 sc-eQTL 4.08e-01 0.0881 0.106 0.286 MAIT L2
ENSG00000157216 SSBP3 538218 sc-eQTL 6.57e-01 0.0419 0.0942 0.286 MAIT L2
ENSG00000162402 USP24 -263667 sc-eQTL 3.18e-01 0.0835 0.0835 0.286 MAIT L2
ENSG00000215883 CYB5RL 751661 sc-eQTL 4.71e-01 -0.0702 0.0972 0.286 MAIT L2
ENSG00000243725 TTC4 235836 sc-eQTL 8.70e-02 0.165 0.096 0.286 MAIT L2
ENSG00000006555 TTC22 150374 sc-eQTL 1.81e-01 0.137 0.102 0.287 NK_CD56bright L2
ENSG00000116133 DHCR24 64502 sc-eQTL 8.78e-01 -0.014 0.0905 0.287 NK_CD56bright L2
ENSG00000116205 TCEANC2 898113 sc-eQTL 4.39e-01 -0.0741 0.0955 0.287 NK_CD56bright L2
ENSG00000116209 TMEM59 898193 sc-eQTL 3.97e-01 -0.079 0.0931 0.287 NK_CD56bright L2
ENSG00000116221 MRPL37 767656 sc-eQTL 9.96e-01 0.000546 0.104 0.287 NK_CD56bright L2
ENSG00000157216 SSBP3 538218 sc-eQTL 7.30e-03 0.209 0.0771 0.287 NK_CD56bright L2
ENSG00000162398 LEXM 145634 sc-eQTL 8.10e-01 -0.0224 0.0927 0.287 NK_CD56bright L2
ENSG00000162402 USP24 -263667 sc-eQTL 9.00e-01 0.01 0.0798 0.287 NK_CD56bright L2
ENSG00000243725 TTC4 235836 sc-eQTL 8.80e-01 0.0152 0.101 0.287 NK_CD56bright L2
ENSG00000006555 TTC22 150374 sc-eQTL 3.23e-01 -0.0851 0.086 0.289 NK_CD56dim L2
ENSG00000116133 DHCR24 64502 sc-eQTL 2.51e-03 -0.269 0.0879 0.289 NK_CD56dim L2
ENSG00000116205 TCEANC2 898113 sc-eQTL 3.98e-01 -0.0824 0.0972 0.289 NK_CD56dim L2
ENSG00000116209 TMEM59 898193 sc-eQTL 2.21e-02 -0.164 0.0713 0.289 NK_CD56dim L2
ENSG00000116221 MRPL37 767656 sc-eQTL 8.26e-01 -0.0207 0.0939 0.289 NK_CD56dim L2
ENSG00000157216 SSBP3 538218 sc-eQTL 1.17e-02 0.192 0.0757 0.289 NK_CD56dim L2
ENSG00000162398 LEXM 145634 sc-eQTL 3.44e-01 0.0837 0.0882 0.289 NK_CD56dim L2
ENSG00000162402 USP24 -263667 sc-eQTL 5.64e-01 0.0324 0.0561 0.289 NK_CD56dim L2
ENSG00000243725 TTC4 235836 sc-eQTL 7.17e-01 -0.035 0.0961 0.289 NK_CD56dim L2
ENSG00000006555 TTC22 150374 sc-eQTL 9.45e-01 -0.00705 0.103 0.29 NK_HLA L2
ENSG00000116133 DHCR24 64502 sc-eQTL 7.72e-01 -0.029 0.1 0.29 NK_HLA L2
ENSG00000116205 TCEANC2 898113 sc-eQTL 9.11e-01 0.0108 0.0965 0.29 NK_HLA L2
ENSG00000116209 TMEM59 898193 sc-eQTL 1.29e-01 -0.145 0.0953 0.29 NK_HLA L2
ENSG00000116221 MRPL37 767656 sc-eQTL 1.61e-01 -0.148 0.105 0.29 NK_HLA L2
ENSG00000157216 SSBP3 538218 sc-eQTL 6.34e-01 0.0411 0.0861 0.29 NK_HLA L2
ENSG00000162398 LEXM 145634 sc-eQTL 1.27e-01 -0.148 0.0966 0.29 NK_HLA L2
ENSG00000162402 USP24 -263667 sc-eQTL 5.89e-01 -0.0386 0.0713 0.29 NK_HLA L2
ENSG00000243725 TTC4 235836 sc-eQTL 5.48e-01 0.0641 0.106 0.29 NK_HLA L2
ENSG00000006555 TTC22 150374 sc-eQTL 7.69e-01 -0.0266 0.0906 0.289 NK_cytokine L2
ENSG00000116133 DHCR24 64502 sc-eQTL 1.40e-01 -0.135 0.0912 0.289 NK_cytokine L2
ENSG00000116205 TCEANC2 898113 sc-eQTL 8.94e-01 -0.0121 0.091 0.289 NK_cytokine L2
ENSG00000116209 TMEM59 898193 sc-eQTL 4.78e-01 -0.0526 0.0739 0.289 NK_cytokine L2
ENSG00000116221 MRPL37 767656 sc-eQTL 4.59e-01 -0.0675 0.091 0.289 NK_cytokine L2
ENSG00000157216 SSBP3 538218 sc-eQTL 1.55e-01 0.109 0.0761 0.289 NK_cytokine L2
ENSG00000162398 LEXM 145634 sc-eQTL 1.62e-01 -0.133 0.0951 0.289 NK_cytokine L2
ENSG00000162402 USP24 -263667 sc-eQTL 1.12e-01 -0.103 0.0647 0.289 NK_cytokine L2
ENSG00000243725 TTC4 235836 sc-eQTL 1.61e-01 -0.135 0.0961 0.289 NK_cytokine L2
ENSG00000006555 TTC22 150374 sc-eQTL 9.43e-01 0.00788 0.111 0.3 PB L2
ENSG00000116133 DHCR24 64502 sc-eQTL 1.26e-01 0.149 0.0971 0.3 PB L2
ENSG00000116205 TCEANC2 898113 sc-eQTL 8.63e-01 -0.0206 0.119 0.3 PB L2
ENSG00000116209 TMEM59 898193 sc-eQTL 8.92e-01 -0.00678 0.0499 0.3 PB L2
ENSG00000116221 MRPL37 767656 sc-eQTL 5.96e-01 0.0481 0.0906 0.3 PB L2
ENSG00000157216 SSBP3 538218 sc-eQTL 9.53e-01 -0.00612 0.105 0.3 PB L2
ENSG00000162402 USP24 -263667 sc-eQTL 3.31e-01 0.116 0.118 0.3 PB L2
ENSG00000215883 CYB5RL 751661 sc-eQTL 5.38e-02 0.236 0.121 0.3 PB L2
ENSG00000243725 TTC4 235836 sc-eQTL 9.61e-02 0.191 0.114 0.3 PB L2
ENSG00000006555 TTC22 150374 sc-eQTL 9.71e-02 0.153 0.0916 0.283 Pro_T L2
ENSG00000116133 DHCR24 64502 sc-eQTL 4.54e-01 0.0587 0.0783 0.283 Pro_T L2
ENSG00000116205 TCEANC2 898113 sc-eQTL 1.96e-01 0.124 0.0953 0.283 Pro_T L2
ENSG00000116209 TMEM59 898193 sc-eQTL 1.38e-01 -0.0983 0.066 0.283 Pro_T L2
ENSG00000116221 MRPL37 767656 sc-eQTL 3.34e-02 0.138 0.0643 0.283 Pro_T L2
ENSG00000157216 SSBP3 538218 sc-eQTL 2.67e-01 0.0809 0.0727 0.283 Pro_T L2
ENSG00000162402 USP24 -263667 sc-eQTL 2.83e-01 -0.0955 0.0887 0.283 Pro_T L2
ENSG00000215883 CYB5RL 751661 sc-eQTL 8.98e-01 -0.0113 0.0877 0.283 Pro_T L2
ENSG00000243725 TTC4 235836 sc-eQTL 6.77e-03 -0.262 0.0959 0.283 Pro_T L2
ENSG00000006555 TTC22 150374 sc-eQTL 4.66e-01 -0.0666 0.0911 0.286 Treg L2
ENSG00000116205 TCEANC2 898113 sc-eQTL 6.74e-01 -0.0411 0.0976 0.286 Treg L2
ENSG00000116209 TMEM59 898193 sc-eQTL 7.75e-01 -0.0221 0.0772 0.286 Treg L2
ENSG00000116221 MRPL37 767656 sc-eQTL 2.11e-01 0.119 0.0952 0.286 Treg L2
ENSG00000157216 SSBP3 538218 sc-eQTL 3.80e-01 0.0749 0.0851 0.286 Treg L2
ENSG00000162402 USP24 -263667 sc-eQTL 7.52e-02 -0.144 0.0806 0.286 Treg L2
ENSG00000243725 TTC4 235836 sc-eQTL 8.72e-01 -0.0165 0.102 0.286 Treg L2
ENSG00000116133 DHCR24 64502 sc-eQTL 3.13e-02 -0.181 0.0832 0.288 cDC L2
ENSG00000116205 TCEANC2 898113 sc-eQTL 9.63e-01 -0.00463 0.0993 0.288 cDC L2
ENSG00000116209 TMEM59 898193 sc-eQTL 1.79e-01 0.113 0.084 0.288 cDC L2
ENSG00000116221 MRPL37 767656 sc-eQTL 8.23e-01 0.0242 0.108 0.288 cDC L2
ENSG00000157216 SSBP3 538218 sc-eQTL 8.00e-01 -0.0253 0.0995 0.288 cDC L2
ENSG00000162390 ACOT11 409440 sc-eQTL 6.87e-01 0.0373 0.0925 0.288 cDC L2
ENSG00000162402 USP24 -263667 sc-eQTL 7.52e-01 -0.0328 0.104 0.288 cDC L2
ENSG00000215883 CYB5RL 751661 sc-eQTL 1.61e-01 0.125 0.0887 0.288 cDC L2
ENSG00000243725 TTC4 235836 sc-eQTL 2.09e-01 -0.134 0.106 0.288 cDC L2
ENSG00000116133 DHCR24 64502 sc-eQTL 8.31e-01 -0.0127 0.0594 0.286 cMono_IL1B L2
ENSG00000116205 TCEANC2 898113 sc-eQTL 1.05e-01 -0.134 0.082 0.286 cMono_IL1B L2
ENSG00000116209 TMEM59 898193 sc-eQTL 3.85e-01 -0.0435 0.05 0.286 cMono_IL1B L2
ENSG00000116221 MRPL37 767656 sc-eQTL 8.63e-01 0.0154 0.0892 0.286 cMono_IL1B L2
ENSG00000157216 SSBP3 538218 sc-eQTL 6.65e-02 0.167 0.0903 0.286 cMono_IL1B L2
ENSG00000162402 USP24 -263667 sc-eQTL 3.23e-01 0.0665 0.0671 0.286 cMono_IL1B L2
ENSG00000243725 TTC4 235836 sc-eQTL 4.58e-01 -0.0764 0.103 0.286 cMono_IL1B L2
ENSG00000116133 DHCR24 64502 sc-eQTL 2.73e-01 -0.061 0.0555 0.286 cMono_S100A L2
ENSG00000116205 TCEANC2 898113 sc-eQTL 7.87e-01 0.023 0.0849 0.286 cMono_S100A L2
ENSG00000116209 TMEM59 898193 sc-eQTL 5.41e-01 0.0416 0.0679 0.286 cMono_S100A L2
ENSG00000116221 MRPL37 767656 sc-eQTL 2.18e-02 -0.224 0.097 0.286 cMono_S100A L2
ENSG00000157216 SSBP3 538218 sc-eQTL 1.19e-01 0.159 0.101 0.286 cMono_S100A L2
ENSG00000162402 USP24 -263667 sc-eQTL 1.17e-01 -0.129 0.0821 0.286 cMono_S100A L2
ENSG00000243725 TTC4 235836 sc-eQTL 9.69e-01 -0.00408 0.103 0.286 cMono_S100A L2
ENSG00000006555 TTC22 150374 sc-eQTL 9.10e-01 -0.0108 0.0953 0.297 gdT L2
ENSG00000116133 DHCR24 64502 sc-eQTL 8.41e-01 -0.0214 0.106 0.297 gdT L2
ENSG00000116205 TCEANC2 898113 sc-eQTL 6.54e-01 -0.048 0.107 0.297 gdT L2
ENSG00000116209 TMEM59 898193 sc-eQTL 1.23e-01 -0.167 0.107 0.297 gdT L2
ENSG00000116221 MRPL37 767656 sc-eQTL 9.97e-01 -0.000493 0.124 0.297 gdT L2
ENSG00000157216 SSBP3 538218 sc-eQTL 2.70e-01 0.0837 0.0757 0.297 gdT L2
ENSG00000162402 USP24 -263667 sc-eQTL 8.51e-01 0.0192 0.102 0.297 gdT L2
ENSG00000215883 CYB5RL 751661 sc-eQTL 6.49e-02 0.195 0.105 0.297 gdT L2
ENSG00000243725 TTC4 235836 sc-eQTL 2.26e-01 0.145 0.119 0.297 gdT L2
ENSG00000116133 DHCR24 64502 sc-eQTL 3.64e-01 -0.0686 0.0754 0.287 intMono L2
ENSG00000116205 TCEANC2 898113 sc-eQTL 2.45e-01 -0.109 0.0938 0.287 intMono L2
ENSG00000116209 TMEM59 898193 sc-eQTL 6.98e-01 -0.0269 0.0691 0.287 intMono L2
ENSG00000116221 MRPL37 767656 sc-eQTL 7.72e-01 -0.0306 0.106 0.287 intMono L2
ENSG00000157216 SSBP3 538218 sc-eQTL 7.74e-03 0.285 0.106 0.287 intMono L2
ENSG00000162402 USP24 -263667 sc-eQTL 9.29e-01 0.00853 0.0963 0.287 intMono L2
ENSG00000243725 TTC4 235836 sc-eQTL 4.44e-01 -0.0785 0.102 0.287 intMono L2
ENSG00000116133 DHCR24 64502 sc-eQTL 4.66e-01 -0.0542 0.0741 0.292 ncMono L2
ENSG00000116205 TCEANC2 898113 sc-eQTL 8.26e-02 0.161 0.0921 0.292 ncMono L2
ENSG00000116209 TMEM59 898193 sc-eQTL 8.31e-01 0.0159 0.0743 0.292 ncMono L2
ENSG00000116221 MRPL37 767656 sc-eQTL 5.60e-02 -0.183 0.095 0.292 ncMono L2
ENSG00000157216 SSBP3 538218 sc-eQTL 1.43e-01 0.153 0.104 0.292 ncMono L2
ENSG00000162402 USP24 -263667 sc-eQTL 9.22e-01 0.00823 0.0837 0.292 ncMono L2
ENSG00000243725 TTC4 235836 sc-eQTL 2.35e-01 -0.118 0.0988 0.292 ncMono L2
ENSG00000116133 DHCR24 64502 sc-eQTL 9.53e-01 0.00534 0.0902 0.277 pDC L2
ENSG00000116205 TCEANC2 898113 sc-eQTL 9.50e-01 -0.00682 0.108 0.277 pDC L2
ENSG00000116209 TMEM59 898193 sc-eQTL 1.99e-01 -0.111 0.086 0.277 pDC L2
ENSG00000116221 MRPL37 767656 sc-eQTL 8.72e-01 0.0186 0.115 0.277 pDC L2
ENSG00000157216 SSBP3 538218 sc-eQTL 1.35e-01 -0.152 0.101 0.277 pDC L2
ENSG00000162390 ACOT11 409440 sc-eQTL 9.32e-01 0.00368 0.0429 0.277 pDC L2
ENSG00000162402 USP24 -263667 sc-eQTL 7.47e-01 -0.0234 0.0724 0.277 pDC L2
ENSG00000215883 CYB5RL 751661 sc-eQTL 3.23e-01 -0.0979 0.0987 0.277 pDC L2
ENSG00000243725 TTC4 235836 sc-eQTL 6.60e-01 0.0503 0.114 0.277 pDC L2
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000006555 TTC22 150374 sc-eQTL 1.69e-01 0.132 0.0954 0.286 B_Memory LOneK1K
ENSG00000116133 DHCR24 64502 sc-eQTL 4.22e-01 -0.0772 0.096 0.286 B_Memory LOneK1K
ENSG00000116205 TCEANC2 898113 sc-eQTL 6.10e-01 -0.0475 0.0929 0.286 B_Memory LOneK1K
ENSG00000116209 TMEM59 898193 sc-eQTL 4.69e-01 0.0524 0.0722 0.286 B_Memory LOneK1K
ENSG00000116221 MRPL37 767656 sc-eQTL 2.10e-02 0.199 0.0855 0.286 B_Memory LOneK1K
ENSG00000157216 SSBP3 538218 sc-eQTL 3.40e-01 -0.0718 0.0751 0.286 B_Memory LOneK1K
ENSG00000162402 USP24 -263667 sc-eQTL 2.61e-02 -0.152 0.0679 0.286 B_Memory LOneK1K
ENSG00000215883 CYB5RL 751661 sc-eQTL 6.47e-01 -0.0484 0.105 0.286 B_Memory LOneK1K
ENSG00000243725 TTC4 235836 sc-eQTL 3.18e-01 0.0945 0.0945 0.286 B_Memory LOneK1K
ENSG00000006555 TTC22 150374 sc-eQTL 4.44e-01 -0.0781 0.102 0.286 B_Naive LOneK1K
ENSG00000116133 DHCR24 64502 sc-eQTL 1.63e-01 -0.128 0.0913 0.286 B_Naive LOneK1K
ENSG00000116205 TCEANC2 898113 sc-eQTL 2.10e-01 -0.104 0.0826 0.286 B_Naive LOneK1K
ENSG00000116209 TMEM59 898193 sc-eQTL 3.03e-01 -0.0607 0.0588 0.286 B_Naive LOneK1K
ENSG00000116221 MRPL37 767656 sc-eQTL 3.45e-01 -0.0799 0.0845 0.286 B_Naive LOneK1K
ENSG00000157216 SSBP3 538218 sc-eQTL 2.10e-01 0.095 0.0755 0.286 B_Naive LOneK1K
ENSG00000162402 USP24 -263667 sc-eQTL 9.36e-01 -0.00523 0.065 0.286 B_Naive LOneK1K
ENSG00000215883 CYB5RL 751661 sc-eQTL 1.46e-03 0.324 0.1 0.286 B_Naive LOneK1K
ENSG00000243725 TTC4 235836 sc-eQTL 6.24e-01 -0.0475 0.0967 0.286 B_Naive LOneK1K
ENSG00000116133 DHCR24 64502 sc-eQTL 6.90e-01 -0.0232 0.058 0.286 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000116205 TCEANC2 898113 sc-eQTL 4.86e-01 -0.0506 0.0726 0.286 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000116209 TMEM59 898193 sc-eQTL 9.92e-01 0.000496 0.0501 0.286 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000116221 MRPL37 767656 sc-eQTL 2.58e-01 -0.1 0.0885 0.286 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000157216 SSBP3 538218 sc-eQTL 1.30e-02 0.229 0.0915 0.286 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000162402 USP24 -263667 sc-eQTL 9.55e-01 0.00357 0.0635 0.286 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000243725 TTC4 235836 sc-eQTL 6.21e-01 -0.0521 0.105 0.286 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000116133 DHCR24 64502 sc-eQTL 6.28e-01 -0.0343 0.0707 0.289 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000116205 TCEANC2 898113 sc-eQTL 6.21e-01 0.0459 0.0929 0.289 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000116209 TMEM59 898193 sc-eQTL 9.47e-01 -0.00463 0.0691 0.289 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000116221 MRPL37 767656 sc-eQTL 7.32e-02 -0.169 0.0939 0.289 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000157216 SSBP3 538218 sc-eQTL 8.94e-03 0.262 0.0993 0.289 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000162402 USP24 -263667 sc-eQTL 9.78e-01 0.00221 0.0796 0.289 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000243725 TTC4 235836 sc-eQTL 2.00e-01 -0.128 0.0994 0.289 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000006555 TTC22 150374 sc-eQTL 4.98e-01 -0.0569 0.0837 0.289 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000116133 DHCR24 64502 sc-eQTL 5.77e-03 -0.24 0.086 0.289 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000116205 TCEANC2 898113 sc-eQTL 6.72e-01 -0.0364 0.0858 0.289 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000116209 TMEM59 898193 sc-eQTL 3.27e-02 -0.141 0.0657 0.289 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000116221 MRPL37 767656 sc-eQTL 2.66e-01 -0.099 0.0887 0.289 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000157216 SSBP3 538218 sc-eQTL 1.91e-02 0.17 0.072 0.289 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000162398 LEXM 145634 sc-eQTL 9.93e-01 -0.000719 0.0823 0.289 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000162402 USP24 -263667 sc-eQTL 3.86e-01 -0.0452 0.0521 0.289 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000243725 TTC4 235836 sc-eQTL 3.81e-01 -0.0814 0.0927 0.289 NK_CD56dim LOneK1K

Statistical fine-mapping results from Japan COVID-19 Task Force
(Shown only for PIP>0.001)
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
PIP (SuSiE)
PIP (FINEMAP)
MAF
ENSG00000157216 SSBP3 538218 eQTL 0.0208 0.0341 0.0147 0.0 0.0 0.296

Expression Modifier Score(EMS) for GTEx 49tissues
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Whole Blood
Muscle Skeletal
Liver
Brain Cerebellum
Prostate
Spleen
Skin Sun Exposed Lower leg
Artery Coronary
Esophagus Muscularis
Esophagus Gastroesophageal Junction
Artery Tibial
Heart Atrial Appendage
Nerve Tibial
Heart Left Ventricle
Adrenal Gland
Adipose Visceral Omentum
Pancreas
Lung
Pituitary
Brain Nucleus accumbens basal ganglia
Colon Transverse
Adipose Subcutaneous
Esophagus Mucosa
Brain Cortex
Thyroid
Stomach
Breast Mammary Tissue
Colon Sigmoid
Skin Not Sun Exposed Suprapubic
Testis
Artery Aorta
Brain Amygdala
Brain Anterior cingulate cortex BA24
Brain Caudate basal ganglia
Brain Cerebellar Hemisphere
Brain Frontal Cortex BA9
Brain Hippocampus
Brain Hypothalamus
Brain Putamen basal ganglia
Brain Spinal cord cervical c-1
Brain Substantia nigra
Cells Cultured fibroblasts
Cells EBV-transformed lymphocytes
Kidney Cortex
Minor Salivary Gland
Ovary
Small Intestine Terminal Ileum
Uterus
Vagina
ENSG00000116133 \N 64502 6.57e-06 7.85e-06 9.81e-07 3.83e-06 1.87e-06 2.56e-06 9.53e-06 1.3e-06 5.24e-06 3.5e-06 8.91e-06 3.67e-06 1.13e-05 3.13e-06 1.4e-06 4.64e-06 3.7e-06 3.95e-06 2.18e-06 2.41e-06 3.51e-06 7.45e-06 6.05e-06 2.64e-06 9.99e-06 2.46e-06 3.47e-06 2.35e-06 7.04e-06 7.86e-06 4.02e-06 5.84e-07 9.96e-07 2.76e-06 2.4e-06 2.09e-06 1.47e-06 1.3e-06 1.56e-06 8.53e-07 9.12e-07 8.47e-06 8.49e-07 1.75e-07 7.72e-07 9.44e-07 9.29e-07 6.58e-07 5.6e-07
ENSG00000234810 \N -377591 1.24e-06 9.07e-07 1.58e-07 3.19e-07 1.16e-07 3.41e-07 7.99e-07 2.64e-07 8.61e-07 2.98e-07 1.15e-06 5.69e-07 1.49e-06 2.1e-07 4.12e-07 4.79e-07 6.37e-07 5.26e-07 3.36e-07 3.06e-07 2.29e-07 6.2e-07 5.82e-07 3.56e-07 1.59e-06 2.4e-07 4.97e-07 4.77e-07 7.61e-07 8.63e-07 4.53e-07 5.45e-08 1.05e-07 2.72e-07 3.16e-07 3e-07 1.83e-07 1.13e-07 8.45e-08 1.84e-08 1.97e-07 1.15e-06 5.03e-08 1.1e-08 1.82e-07 4.18e-08 1.54e-07 3.21e-08 6.03e-08