logo

Genes within 1Mb (chr6:137283976:C:T):

View on , UCSC , GTEx , gnomAD

Immune cell-type specific single cell cis-eQTLs in OASIS
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000027697 IFNGR1 64527 sc-eQTL 9.12e-01 -0.00833 0.0756 0.278 B L1
ENSG00000029363 BCLAF1 994125 sc-eQTL 2.44e-02 0.0754 0.0333 0.278 B L1
ENSG00000112357 PEX7 461412 sc-eQTL 2.56e-01 0.102 0.0892 0.278 B L1
ENSG00000112378 PERP -823443 sc-eQTL 5.01e-01 -0.0399 0.0592 0.278 B L1
ENSG00000118503 TNFAIP3 -583238 sc-eQTL 1.92e-01 -0.0622 0.0475 0.278 B L1
ENSG00000197442 MAP3K5 491499 sc-eQTL 9.13e-01 0.00726 0.0665 0.278 B L1
ENSG00000237499 WAKMAR2 -584257 sc-eQTL 4.03e-01 -0.0628 0.0749 0.278 B L1
ENSG00000027697 IFNGR1 64527 sc-eQTL 1.91e-02 -0.12 0.0508 0.278 CD4T L1
ENSG00000029363 BCLAF1 994125 sc-eQTL 2.35e-01 0.0463 0.0388 0.278 CD4T L1
ENSG00000112357 PEX7 461412 sc-eQTL 4.61e-01 -0.0611 0.0828 0.278 CD4T L1
ENSG00000112378 PERP -823443 sc-eQTL 2.10e-01 0.0697 0.0555 0.278 CD4T L1
ENSG00000118503 TNFAIP3 -583238 sc-eQTL 1.86e-01 0.0689 0.0519 0.278 CD4T L1
ENSG00000197442 MAP3K5 491499 sc-eQTL 6.10e-01 0.0203 0.0397 0.278 CD4T L1
ENSG00000237499 WAKMAR2 -584257 sc-eQTL 3.44e-01 0.0622 0.0655 0.278 CD4T L1
ENSG00000027697 IFNGR1 64527 sc-eQTL 2.47e-02 -0.13 0.0573 0.278 CD8T L1
ENSG00000029363 BCLAF1 994125 sc-eQTL 9.47e-01 0.00261 0.0393 0.278 CD8T L1
ENSG00000112357 PEX7 461412 sc-eQTL 3.50e-01 0.0904 0.0965 0.278 CD8T L1
ENSG00000112378 PERP -823443 sc-eQTL 5.29e-01 -0.0398 0.0632 0.278 CD8T L1
ENSG00000118503 TNFAIP3 -583238 sc-eQTL 4.10e-01 0.0403 0.0488 0.278 CD8T L1
ENSG00000197442 MAP3K5 491499 sc-eQTL 8.36e-01 0.0107 0.0516 0.278 CD8T L1
ENSG00000237499 WAKMAR2 -584257 sc-eQTL 1.32e-01 -0.108 0.0713 0.278 CD8T L1
ENSG00000027697 IFNGR1 64527 sc-eQTL 7.41e-01 0.0234 0.0708 0.27 DC L1
ENSG00000029363 BCLAF1 994125 sc-eQTL 3.80e-02 0.132 0.063 0.27 DC L1
ENSG00000112357 PEX7 461412 sc-eQTL 6.87e-01 -0.0402 0.0996 0.27 DC L1
ENSG00000118503 TNFAIP3 -583238 sc-eQTL 7.21e-02 -0.136 0.075 0.27 DC L1
ENSG00000135525 MAP7 733157 sc-eQTL 9.61e-01 0.00405 0.0819 0.27 DC L1
ENSG00000197442 MAP3K5 491499 sc-eQTL 7.80e-01 -0.0219 0.0785 0.27 DC L1
ENSG00000237499 WAKMAR2 -584257 sc-eQTL 8.08e-01 0.0187 0.0771 0.27 DC L1
ENSG00000286646 AL121933.2 499931 sc-eQTL 6.29e-01 0.0496 0.102 0.27 DC L1
ENSG00000027697 IFNGR1 64527 sc-eQTL 7.38e-01 -0.0192 0.0574 0.278 Mono L1
ENSG00000029363 BCLAF1 994125 sc-eQTL 1.81e-01 0.0656 0.0489 0.278 Mono L1
ENSG00000112357 PEX7 461412 sc-eQTL 2.79e-01 0.105 0.0964 0.278 Mono L1
ENSG00000118503 TNFAIP3 -583238 sc-eQTL 8.99e-01 -0.00618 0.0487 0.278 Mono L1
ENSG00000135525 MAP7 733157 sc-eQTL 6.12e-01 0.0433 0.0852 0.278 Mono L1
ENSG00000197442 MAP3K5 491499 sc-eQTL 3.08e-01 0.0579 0.0567 0.278 Mono L1
ENSG00000237499 WAKMAR2 -584257 sc-eQTL 5.65e-01 -0.0348 0.0603 0.278 Mono L1
ENSG00000286646 AL121933.2 499931 sc-eQTL 7.89e-01 0.0184 0.0689 0.278 Mono L1
ENSG00000027697 IFNGR1 64527 sc-eQTL 6.55e-02 -0.121 0.0652 0.279 NK L1
ENSG00000029363 BCLAF1 994125 sc-eQTL 8.62e-01 -0.00606 0.0349 0.279 NK L1
ENSG00000112357 PEX7 461412 sc-eQTL 1.65e-01 0.141 0.101 0.279 NK L1
ENSG00000112378 PERP -823443 sc-eQTL 3.23e-01 0.0632 0.0637 0.279 NK L1
ENSG00000118503 TNFAIP3 -583238 sc-eQTL 5.25e-01 0.0348 0.0546 0.279 NK L1
ENSG00000197442 MAP3K5 491499 sc-eQTL 5.72e-01 -0.0444 0.0783 0.279 NK L1
ENSG00000237499 WAKMAR2 -584257 sc-eQTL 5.67e-01 -0.0445 0.0774 0.279 NK L1
ENSG00000027697 IFNGR1 64527 sc-eQTL 6.06e-03 -0.163 0.0588 0.278 Other_T L1
ENSG00000029363 BCLAF1 994125 sc-eQTL 4.12e-01 0.0412 0.0501 0.278 Other_T L1
ENSG00000112357 PEX7 461412 sc-eQTL 3.01e-01 -0.101 0.0974 0.278 Other_T L1
ENSG00000112378 PERP -823443 sc-eQTL 5.05e-01 -0.0522 0.0783 0.278 Other_T L1
ENSG00000118503 TNFAIP3 -583238 sc-eQTL 8.70e-01 0.00611 0.0373 0.278 Other_T L1
ENSG00000197442 MAP3K5 491499 sc-eQTL 7.47e-01 0.0233 0.0719 0.278 Other_T L1
ENSG00000237499 WAKMAR2 -584257 sc-eQTL 6.22e-02 -0.138 0.0734 0.278 Other_T L1
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000027697 IFNGR1 64527 sc-eQTL 1.20e-01 0.163 0.104 0.265 B_Activated L2
ENSG00000029363 BCLAF1 994125 sc-eQTL 5.30e-01 0.0537 0.0852 0.265 B_Activated L2
ENSG00000112357 PEX7 461412 sc-eQTL 5.45e-01 -0.0626 0.103 0.265 B_Activated L2
ENSG00000112378 PERP -823443 sc-eQTL 7.87e-01 0.0145 0.0535 0.265 B_Activated L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 -583238 sc-eQTL 5.93e-02 -0.195 0.103 0.265 B_Activated L2
ENSG00000197442 MAP3K5 491499 sc-eQTL 3.63e-01 0.106 0.116 0.265 B_Activated L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 -584257 sc-eQTL 7.91e-01 -0.024 0.0906 0.265 B_Activated L2
ENSG00000027697 IFNGR1 64527 sc-eQTL 6.77e-01 -0.0372 0.0893 0.277 B_Intermediate L2
ENSG00000029363 BCLAF1 994125 sc-eQTL 6.25e-03 0.138 0.0499 0.277 B_Intermediate L2
ENSG00000112357 PEX7 461412 sc-eQTL 4.38e-01 -0.0725 0.0933 0.277 B_Intermediate L2
ENSG00000112378 PERP -823443 sc-eQTL 8.91e-01 0.0117 0.0852 0.277 B_Intermediate L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 -583238 sc-eQTL 4.59e-01 -0.0495 0.0668 0.277 B_Intermediate L2
ENSG00000197442 MAP3K5 491499 sc-eQTL 3.16e-01 -0.0811 0.0806 0.277 B_Intermediate L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 -584257 sc-eQTL 9.76e-01 -0.0028 0.0948 0.277 B_Intermediate L2
ENSG00000027697 IFNGR1 64527 sc-eQTL 9.06e-01 0.0115 0.0972 0.276 B_Memory L2
ENSG00000029363 BCLAF1 994125 sc-eQTL 7.43e-02 0.103 0.0573 0.276 B_Memory L2
ENSG00000112357 PEX7 461412 sc-eQTL 3.79e-01 -0.0864 0.098 0.276 B_Memory L2
ENSG00000112378 PERP -823443 sc-eQTL 1.90e-01 -0.121 0.092 0.276 B_Memory L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 -583238 sc-eQTL 4.00e-01 -0.0536 0.0635 0.276 B_Memory L2
ENSG00000197442 MAP3K5 491499 sc-eQTL 4.62e-01 0.0639 0.0867 0.276 B_Memory L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 -584257 sc-eQTL 3.50e-01 0.0885 0.0944 0.276 B_Memory L2
ENSG00000027697 IFNGR1 64527 sc-eQTL 6.61e-01 -0.0333 0.0759 0.278 B_Naive1 L2
ENSG00000029363 BCLAF1 994125 sc-eQTL 1.25e-01 0.0665 0.0431 0.278 B_Naive1 L2
ENSG00000112357 PEX7 461412 sc-eQTL 2.14e-02 0.229 0.0989 0.278 B_Naive1 L2
ENSG00000112378 PERP -823443 sc-eQTL 3.49e-01 -0.0821 0.0874 0.278 B_Naive1 L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 -583238 sc-eQTL 4.93e-01 -0.0349 0.0508 0.278 B_Naive1 L2
ENSG00000197442 MAP3K5 491499 sc-eQTL 5.73e-01 -0.0403 0.0714 0.278 B_Naive1 L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 -584257 sc-eQTL 6.70e-01 -0.0339 0.0796 0.278 B_Naive1 L2
ENSG00000027697 IFNGR1 64527 sc-eQTL 4.98e-01 -0.0646 0.0951 0.277 B_Naive2 L2
ENSG00000029363 BCLAF1 994125 sc-eQTL 7.33e-01 0.0188 0.0552 0.277 B_Naive2 L2
ENSG00000112357 PEX7 461412 sc-eQTL 7.29e-01 0.0361 0.104 0.277 B_Naive2 L2
ENSG00000112378 PERP -823443 sc-eQTL 1.63e-01 0.106 0.0755 0.277 B_Naive2 L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 -583238 sc-eQTL 3.92e-02 -0.156 0.075 0.277 B_Naive2 L2
ENSG00000197442 MAP3K5 491499 sc-eQTL 1.66e-01 0.112 0.0803 0.277 B_Naive2 L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 -584257 sc-eQTL 5.68e-01 0.056 0.0979 0.277 B_Naive2 L2
ENSG00000027697 IFNGR1 64527 sc-eQTL 7.49e-01 0.0282 0.0877 0.284 CD4_CTL L2
ENSG00000029363 BCLAF1 994125 sc-eQTL 1.20e-01 0.121 0.0774 0.284 CD4_CTL L2
ENSG00000112357 PEX7 461412 sc-eQTL 9.98e-01 0.000252 0.0973 0.284 CD4_CTL L2
ENSG00000112378 PERP -823443 sc-eQTL 7.09e-01 -0.0368 0.0986 0.284 CD4_CTL L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 -583238 sc-eQTL 3.20e-01 0.0572 0.0574 0.284 CD4_CTL L2
ENSG00000197442 MAP3K5 491499 sc-eQTL 5.56e-01 0.0542 0.0917 0.284 CD4_CTL L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 -584257 sc-eQTL 6.97e-01 -0.0349 0.0895 0.284 CD4_CTL L2
ENSG00000027697 IFNGR1 64527 sc-eQTL 1.67e-01 -0.0679 0.049 0.278 CD4_Naive L2
ENSG00000029363 BCLAF1 994125 sc-eQTL 1.72e-01 0.0539 0.0393 0.278 CD4_Naive L2
ENSG00000112357 PEX7 461412 sc-eQTL 2.87e-01 -0.099 0.0927 0.278 CD4_Naive L2
ENSG00000112378 PERP -823443 sc-eQTL 1.59e-02 0.184 0.0756 0.278 CD4_Naive L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 -583238 sc-eQTL 3.24e-01 0.053 0.0537 0.278 CD4_Naive L2
ENSG00000197442 MAP3K5 491499 sc-eQTL 8.89e-01 0.00552 0.0395 0.278 CD4_Naive L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 -584257 sc-eQTL 2.24e-01 0.0847 0.0695 0.278 CD4_Naive L2
ENSG00000027697 IFNGR1 64527 sc-eQTL 2.50e-02 -0.15 0.0665 0.278 CD4_TCM L2
ENSG00000029363 BCLAF1 994125 sc-eQTL 5.41e-01 0.0259 0.0424 0.278 CD4_TCM L2
ENSG00000112357 PEX7 461412 sc-eQTL 6.83e-01 0.0404 0.0987 0.278 CD4_TCM L2
ENSG00000112378 PERP -823443 sc-eQTL 9.05e-01 -0.01 0.0835 0.278 CD4_TCM L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 -583238 sc-eQTL 5.07e-01 0.0322 0.0484 0.278 CD4_TCM L2
ENSG00000197442 MAP3K5 491499 sc-eQTL 8.66e-01 0.0093 0.0552 0.278 CD4_TCM L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 -584257 sc-eQTL 8.12e-02 0.118 0.0674 0.278 CD4_TCM L2
ENSG00000027697 IFNGR1 64527 sc-eQTL 8.14e-01 0.0178 0.0758 0.278 CD4_TEM L2
ENSG00000029363 BCLAF1 994125 sc-eQTL 4.77e-01 0.0382 0.0537 0.278 CD4_TEM L2
ENSG00000112357 PEX7 461412 sc-eQTL 1.28e-01 -0.148 0.0973 0.278 CD4_TEM L2
ENSG00000112378 PERP -823443 sc-eQTL 9.19e-01 -0.00812 0.0793 0.278 CD4_TEM L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 -583238 sc-eQTL 2.48e-01 0.0581 0.0502 0.278 CD4_TEM L2
ENSG00000197442 MAP3K5 491499 sc-eQTL 2.13e-01 0.0968 0.0774 0.278 CD4_TEM L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 -584257 sc-eQTL 2.82e-01 0.0867 0.0805 0.278 CD4_TEM L2
ENSG00000027697 IFNGR1 64527 sc-eQTL 1.56e-02 -0.168 0.069 0.278 CD8_CTL L2
ENSG00000029363 BCLAF1 994125 sc-eQTL 4.88e-01 0.0324 0.0466 0.278 CD8_CTL L2
ENSG00000112357 PEX7 461412 sc-eQTL 6.03e-01 0.0501 0.0962 0.278 CD8_CTL L2
ENSG00000112378 PERP -823443 sc-eQTL 3.05e-02 -0.199 0.0916 0.278 CD8_CTL L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 -583238 sc-eQTL 8.84e-01 -0.00859 0.0589 0.278 CD8_CTL L2
ENSG00000197442 MAP3K5 491499 sc-eQTL 6.57e-01 -0.0369 0.0831 0.278 CD8_CTL L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 -584257 sc-eQTL 7.94e-02 -0.145 0.0822 0.278 CD8_CTL L2
ENSG00000027697 IFNGR1 64527 sc-eQTL 9.14e-01 0.00741 0.0684 0.278 CD8_Naive L2
ENSG00000029363 BCLAF1 994125 sc-eQTL 7.70e-01 -0.014 0.0477 0.278 CD8_Naive L2
ENSG00000112357 PEX7 461412 sc-eQTL 6.41e-01 0.0463 0.0991 0.278 CD8_Naive L2
ENSG00000112378 PERP -823443 sc-eQTL 3.73e-01 0.0672 0.0752 0.278 CD8_Naive L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 -583238 sc-eQTL 1.72e-01 0.073 0.0533 0.278 CD8_Naive L2
ENSG00000197442 MAP3K5 491499 sc-eQTL 1.27e-01 0.0966 0.0631 0.278 CD8_Naive L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 -584257 sc-eQTL 9.33e-01 0.0067 0.0791 0.278 CD8_Naive L2
ENSG00000027697 IFNGR1 64527 sc-eQTL 1.20e-01 -0.139 0.0891 0.282 CD8_TCM L2
ENSG00000029363 BCLAF1 994125 sc-eQTL 1.34e-01 0.101 0.0669 0.282 CD8_TCM L2
ENSG00000112357 PEX7 461412 sc-eQTL 2.38e-01 -0.121 0.103 0.282 CD8_TCM L2
ENSG00000112378 PERP -823443 sc-eQTL 8.45e-01 -0.0197 0.101 0.282 CD8_TCM L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 -583238 sc-eQTL 6.82e-01 0.0199 0.0486 0.282 CD8_TCM L2
ENSG00000197442 MAP3K5 491499 sc-eQTL 2.83e-01 0.0931 0.0865 0.282 CD8_TCM L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 -584257 sc-eQTL 1.80e-01 0.119 0.0885 0.282 CD8_TCM L2
ENSG00000027697 IFNGR1 64527 sc-eQTL 1.14e-01 -0.135 0.0853 0.274 CD8_TEM L2
ENSG00000029363 BCLAF1 994125 sc-eQTL 8.25e-01 0.0179 0.081 0.274 CD8_TEM L2
ENSG00000112357 PEX7 461412 sc-eQTL 4.70e-01 -0.0714 0.0987 0.274 CD8_TEM L2
ENSG00000112378 PERP -823443 sc-eQTL 3.39e-01 -0.0983 0.103 0.274 CD8_TEM L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 -583238 sc-eQTL 8.56e-01 0.0115 0.0633 0.274 CD8_TEM L2
ENSG00000197442 MAP3K5 491499 sc-eQTL 7.18e-01 0.0355 0.0979 0.274 CD8_TEM L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 -584257 sc-eQTL 1.90e-01 -0.123 0.0935 0.274 CD8_TEM L2
ENSG00000027697 IFNGR1 64527 sc-eQTL 2.84e-01 -0.0742 0.0691 0.279 MAIT L2
ENSG00000029363 BCLAF1 994125 sc-eQTL 3.02e-01 0.0593 0.0574 0.279 MAIT L2
ENSG00000112357 PEX7 461412 sc-eQTL 9.96e-01 0.000489 0.0939 0.279 MAIT L2
ENSG00000112378 PERP -823443 sc-eQTL 9.78e-01 0.00264 0.0979 0.279 MAIT L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 -583238 sc-eQTL 9.10e-01 -0.0053 0.0466 0.279 MAIT L2
ENSG00000197442 MAP3K5 491499 sc-eQTL 4.78e-01 0.0576 0.0811 0.279 MAIT L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 -584257 sc-eQTL 4.04e-01 -0.0719 0.086 0.279 MAIT L2
ENSG00000027697 IFNGR1 64527 sc-eQTL 3.00e-02 -0.165 0.0754 0.28 NK_CD56bright L2
ENSG00000029363 BCLAF1 994125 sc-eQTL 7.90e-01 0.015 0.0563 0.28 NK_CD56bright L2
ENSG00000112357 PEX7 461412 sc-eQTL 3.73e-01 0.0885 0.0992 0.28 NK_CD56bright L2
ENSG00000112378 PERP -823443 sc-eQTL 8.42e-01 0.0178 0.0891 0.28 NK_CD56bright L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 -583238 sc-eQTL 5.86e-01 0.031 0.0568 0.28 NK_CD56bright L2
ENSG00000197442 MAP3K5 491499 sc-eQTL 4.51e-01 -0.0651 0.0863 0.28 NK_CD56bright L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 -584257 sc-eQTL 2.06e-01 -0.114 0.0902 0.28 NK_CD56bright L2
ENSG00000027697 IFNGR1 64527 sc-eQTL 3.01e-02 -0.131 0.0601 0.28 NK_CD56dim L2
ENSG00000029363 BCLAF1 994125 sc-eQTL 8.89e-01 -0.00557 0.0397 0.28 NK_CD56dim L2
ENSG00000112357 PEX7 461412 sc-eQTL 1.04e-01 0.17 0.104 0.28 NK_CD56dim L2
ENSG00000112378 PERP -823443 sc-eQTL 2.39e-01 0.0867 0.0734 0.28 NK_CD56dim L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 -583238 sc-eQTL 7.01e-01 0.022 0.0572 0.28 NK_CD56dim L2
ENSG00000197442 MAP3K5 491499 sc-eQTL 5.64e-01 -0.0475 0.0823 0.28 NK_CD56dim L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 -584257 sc-eQTL 4.30e-01 -0.0677 0.0856 0.28 NK_CD56dim L2
ENSG00000027697 IFNGR1 64527 sc-eQTL 6.78e-02 -0.14 0.0762 0.281 NK_HLA L2
ENSG00000029363 BCLAF1 994125 sc-eQTL 7.08e-01 0.0244 0.065 0.281 NK_HLA L2
ENSG00000112357 PEX7 461412 sc-eQTL 9.47e-01 0.00652 0.0976 0.281 NK_HLA L2
ENSG00000112378 PERP -823443 sc-eQTL 4.81e-01 -0.0558 0.0791 0.281 NK_HLA L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 -583238 sc-eQTL 1.19e-01 0.0946 0.0605 0.281 NK_HLA L2
ENSG00000197442 MAP3K5 491499 sc-eQTL 2.21e-01 -0.118 0.0964 0.281 NK_HLA L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 -584257 sc-eQTL 5.45e-01 0.0594 0.098 0.281 NK_HLA L2
ENSG00000027697 IFNGR1 64527 sc-eQTL 6.90e-02 -0.115 0.0627 0.28 NK_cytokine L2
ENSG00000029363 BCLAF1 994125 sc-eQTL 8.98e-01 0.00609 0.0472 0.28 NK_cytokine L2
ENSG00000112357 PEX7 461412 sc-eQTL 8.74e-01 0.0158 0.0993 0.28 NK_cytokine L2
ENSG00000112378 PERP -823443 sc-eQTL 7.99e-02 0.132 0.0748 0.28 NK_cytokine L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 -583238 sc-eQTL 2.98e-01 0.0587 0.0563 0.28 NK_cytokine L2
ENSG00000197442 MAP3K5 491499 sc-eQTL 9.67e-01 0.00322 0.0776 0.28 NK_cytokine L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 -584257 sc-eQTL 2.61e-01 0.0956 0.0849 0.28 NK_cytokine L2
ENSG00000027697 IFNGR1 64527 sc-eQTL 5.28e-01 -0.0724 0.114 0.293 PB L2
ENSG00000029363 BCLAF1 994125 sc-eQTL 2.79e-01 0.107 0.0983 0.293 PB L2
ENSG00000112357 PEX7 461412 sc-eQTL 9.96e-01 0.000564 0.118 0.293 PB L2
ENSG00000112378 PERP -823443 sc-eQTL 7.19e-01 -0.0264 0.0734 0.293 PB L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 -583238 sc-eQTL 3.14e-01 0.0897 0.0886 0.293 PB L2
ENSG00000197442 MAP3K5 491499 sc-eQTL 1.14e-01 0.16 0.1 0.293 PB L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 -584257 sc-eQTL 1.03e-01 -0.174 0.106 0.293 PB L2
ENSG00000027697 IFNGR1 64527 sc-eQTL 6.50e-02 -0.144 0.0775 0.28 Pro_T L2
ENSG00000029363 BCLAF1 994125 sc-eQTL 6.10e-01 0.0413 0.0809 0.28 Pro_T L2
ENSG00000112357 PEX7 461412 sc-eQTL 4.70e-01 -0.0685 0.0947 0.28 Pro_T L2
ENSG00000112378 PERP -823443 sc-eQTL 8.95e-01 -0.01 0.0755 0.28 Pro_T L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 -583238 sc-eQTL 8.74e-01 0.00754 0.0476 0.28 Pro_T L2
ENSG00000197442 MAP3K5 491499 sc-eQTL 2.42e-01 -0.108 0.0918 0.28 Pro_T L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 -584257 sc-eQTL 3.83e-01 -0.0806 0.0922 0.28 Pro_T L2
ENSG00000027697 IFNGR1 64527 sc-eQTL 2.60e-01 -0.103 0.0908 0.278 Treg L2
ENSG00000029363 BCLAF1 994125 sc-eQTL 2.35e-01 0.0699 0.0586 0.278 Treg L2
ENSG00000112357 PEX7 461412 sc-eQTL 7.59e-01 0.0296 0.0962 0.278 Treg L2
ENSG00000112378 PERP -823443 sc-eQTL 9.83e-01 0.00225 0.104 0.278 Treg L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 -583238 sc-eQTL 1.38e-01 0.0858 0.0576 0.278 Treg L2
ENSG00000197442 MAP3K5 491499 sc-eQTL 3.71e-01 0.0561 0.0626 0.278 Treg L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 -584257 sc-eQTL 2.76e-01 0.0963 0.0881 0.278 Treg L2
ENSG00000027697 IFNGR1 64527 sc-eQTL 8.75e-01 -0.0121 0.0771 0.276 cDC L2
ENSG00000029363 BCLAF1 994125 sc-eQTL 8.90e-02 0.132 0.0771 0.276 cDC L2
ENSG00000112357 PEX7 461412 sc-eQTL 4.64e-01 -0.073 0.0996 0.276 cDC L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 -583238 sc-eQTL 3.84e-01 -0.0661 0.0758 0.276 cDC L2
ENSG00000135525 MAP7 733157 sc-eQTL 8.91e-01 0.0122 0.0888 0.276 cDC L2
ENSG00000197442 MAP3K5 491499 sc-eQTL 7.68e-01 0.0231 0.0782 0.276 cDC L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 -584257 sc-eQTL 4.46e-01 0.0755 0.0988 0.276 cDC L2
ENSG00000286646 AL121933.2 499931 sc-eQTL 2.65e-01 0.113 0.101 0.276 cDC L2
ENSG00000027697 IFNGR1 64527 sc-eQTL 9.46e-01 -0.00369 0.0547 0.278 cMono_IL1B L2
ENSG00000029363 BCLAF1 994125 sc-eQTL 4.08e-01 0.0486 0.0586 0.278 cMono_IL1B L2
ENSG00000112357 PEX7 461412 sc-eQTL 5.98e-02 0.185 0.0976 0.278 cMono_IL1B L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 -583238 sc-eQTL 8.48e-01 -0.0113 0.0589 0.278 cMono_IL1B L2
ENSG00000135525 MAP7 733157 sc-eQTL 3.80e-01 0.0744 0.0846 0.278 cMono_IL1B L2
ENSG00000197442 MAP3K5 491499 sc-eQTL 1.33e-01 0.0918 0.0609 0.278 cMono_IL1B L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 -584257 sc-eQTL 2.59e-01 -0.0709 0.0627 0.278 cMono_IL1B L2
ENSG00000286646 AL121933.2 499931 sc-eQTL 9.31e-01 -0.00684 0.0787 0.278 cMono_IL1B L2
ENSG00000027697 IFNGR1 64527 sc-eQTL 9.52e-01 -0.00375 0.0626 0.278 cMono_S100A L2
ENSG00000029363 BCLAF1 994125 sc-eQTL 1.31e-03 0.204 0.0627 0.278 cMono_S100A L2
ENSG00000112357 PEX7 461412 sc-eQTL 9.95e-01 -0.000691 0.1 0.278 cMono_S100A L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 -583238 sc-eQTL 6.13e-01 0.0282 0.0556 0.278 cMono_S100A L2
ENSG00000135525 MAP7 733157 sc-eQTL 3.76e-01 0.0829 0.0934 0.278 cMono_S100A L2
ENSG00000197442 MAP3K5 491499 sc-eQTL 8.98e-01 -0.00966 0.0756 0.278 cMono_S100A L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 -584257 sc-eQTL 9.02e-01 0.00983 0.0798 0.278 cMono_S100A L2
ENSG00000286646 AL121933.2 499931 sc-eQTL 7.42e-01 0.0257 0.0779 0.278 cMono_S100A L2
ENSG00000027697 IFNGR1 64527 sc-eQTL 4.11e-02 -0.191 0.0925 0.273 gdT L2
ENSG00000029363 BCLAF1 994125 sc-eQTL 2.66e-01 0.0919 0.0823 0.273 gdT L2
ENSG00000112357 PEX7 461412 sc-eQTL 4.49e-01 -0.0901 0.119 0.273 gdT L2
ENSG00000112378 PERP -823443 sc-eQTL 7.07e-01 -0.0391 0.104 0.273 gdT L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 -583238 sc-eQTL 3.02e-01 -0.0596 0.0576 0.273 gdT L2
ENSG00000197442 MAP3K5 491499 sc-eQTL 4.08e-01 -0.101 0.122 0.273 gdT L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 -584257 sc-eQTL 7.60e-01 -0.032 0.105 0.273 gdT L2
ENSG00000027697 IFNGR1 64527 sc-eQTL 8.97e-01 -0.0088 0.0677 0.28 intMono L2
ENSG00000029363 BCLAF1 994125 sc-eQTL 5.37e-01 0.0552 0.0894 0.28 intMono L2
ENSG00000112357 PEX7 461412 sc-eQTL 2.88e-01 -0.0969 0.091 0.28 intMono L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 -583238 sc-eQTL 3.05e-01 -0.06 0.0583 0.28 intMono L2
ENSG00000135525 MAP7 733157 sc-eQTL 2.25e-01 -0.109 0.0895 0.28 intMono L2
ENSG00000197442 MAP3K5 491499 sc-eQTL 7.34e-01 0.0324 0.0951 0.28 intMono L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 -584257 sc-eQTL 8.60e-01 -0.0154 0.0872 0.28 intMono L2
ENSG00000286646 AL121933.2 499931 sc-eQTL 9.79e-01 -0.00266 0.101 0.28 intMono L2
ENSG00000027697 IFNGR1 64527 sc-eQTL 6.06e-01 -0.0415 0.0802 0.274 ncMono L2
ENSG00000029363 BCLAF1 994125 sc-eQTL 2.98e-01 -0.0649 0.0622 0.274 ncMono L2
ENSG00000112357 PEX7 461412 sc-eQTL 8.84e-01 0.0145 0.0994 0.274 ncMono L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 -583238 sc-eQTL 4.66e-01 0.0518 0.0709 0.274 ncMono L2
ENSG00000135525 MAP7 733157 sc-eQTL 7.28e-01 0.0305 0.0878 0.274 ncMono L2
ENSG00000197442 MAP3K5 491499 sc-eQTL 9.55e-01 0.00522 0.0923 0.274 ncMono L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 -584257 sc-eQTL 8.32e-01 0.0189 0.0888 0.274 ncMono L2
ENSG00000286646 AL121933.2 499931 sc-eQTL 3.41e-01 -0.0893 0.0934 0.274 ncMono L2
ENSG00000027697 IFNGR1 64527 sc-eQTL 5.19e-01 0.0578 0.0893 0.277 pDC L2
ENSG00000029363 BCLAF1 994125 sc-eQTL 4.09e-01 0.0554 0.067 0.277 pDC L2
ENSG00000112357 PEX7 461412 sc-eQTL 5.82e-01 0.0542 0.0984 0.277 pDC L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 -583238 sc-eQTL 1.17e-01 -0.13 0.0823 0.277 pDC L2
ENSG00000135525 MAP7 733157 sc-eQTL 4.04e-01 -0.0574 0.0686 0.277 pDC L2
ENSG00000197442 MAP3K5 491499 sc-eQTL 3.53e-01 -0.102 0.11 0.277 pDC L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 -584257 sc-eQTL 7.33e-01 -0.0287 0.0841 0.277 pDC L2
ENSG00000286646 AL121933.2 499931 sc-eQTL 7.44e-02 -0.18 0.1 0.277 pDC L2
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000027697 IFNGR1 64527 sc-eQTL 7.99e-01 0.0202 0.0794 0.278 B_Memory LOneK1K
ENSG00000029363 BCLAF1 994125 sc-eQTL 4.96e-03 0.124 0.0438 0.278 B_Memory LOneK1K
ENSG00000112357 PEX7 461412 sc-eQTL 4.25e-01 -0.073 0.0912 0.278 B_Memory LOneK1K
ENSG00000112378 PERP -823443 sc-eQTL 1.63e-01 -0.118 0.0845 0.278 B_Memory LOneK1K
ENSG00000118503 TNFAIP3 -583238 sc-eQTL 1.31e-01 -0.0846 0.0558 0.278 B_Memory LOneK1K
ENSG00000197442 MAP3K5 491499 sc-eQTL 3.08e-01 -0.0756 0.074 0.278 B_Memory LOneK1K
ENSG00000237499 WAKMAR2 -584257 sc-eQTL 9.92e-01 -0.000995 0.0948 0.278 B_Memory LOneK1K
ENSG00000027697 IFNGR1 64527 sc-eQTL 5.21e-01 -0.0518 0.0806 0.278 B_Naive LOneK1K
ENSG00000029363 BCLAF1 994125 sc-eQTL 1.82e-01 0.0494 0.0369 0.278 B_Naive LOneK1K
ENSG00000112357 PEX7 461412 sc-eQTL 3.76e-02 0.203 0.0972 0.278 B_Naive LOneK1K
ENSG00000112378 PERP -823443 sc-eQTL 4.46e-01 -0.067 0.0878 0.278 B_Naive LOneK1K
ENSG00000118503 TNFAIP3 -583238 sc-eQTL 2.20e-01 -0.0566 0.046 0.278 B_Naive LOneK1K
ENSG00000197442 MAP3K5 491499 sc-eQTL 8.78e-01 0.0104 0.0677 0.278 B_Naive LOneK1K
ENSG00000237499 WAKMAR2 -584257 sc-eQTL 6.25e-01 -0.0403 0.0822 0.278 B_Naive LOneK1K
ENSG00000027697 IFNGR1 64527 sc-eQTL 8.32e-01 0.0115 0.0541 0.278 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000029363 BCLAF1 994125 sc-eQTL 1.33e-01 0.0755 0.0501 0.278 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000112357 PEX7 461412 sc-eQTL 7.36e-02 0.173 0.0964 0.278 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000118503 TNFAIP3 -583238 sc-eQTL 7.40e-01 -0.0166 0.05 0.278 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000135525 MAP7 733157 sc-eQTL 2.43e-01 0.101 0.0866 0.278 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000197442 MAP3K5 491499 sc-eQTL 3.76e-01 0.0519 0.0585 0.278 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000237499 WAKMAR2 -584257 sc-eQTL 4.82e-01 -0.0421 0.0599 0.278 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000286646 AL121933.2 499931 sc-eQTL 5.39e-01 0.0429 0.0697 0.278 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000027697 IFNGR1 64527 sc-eQTL 4.50e-01 -0.0491 0.0649 0.278 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000029363 BCLAF1 994125 sc-eQTL 5.16e-01 -0.0382 0.0586 0.278 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000112357 PEX7 461412 sc-eQTL 5.08e-01 -0.0649 0.098 0.278 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000118503 TNFAIP3 -583238 sc-eQTL 8.17e-01 -0.0141 0.0607 0.278 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000135525 MAP7 733157 sc-eQTL 5.08e-01 -0.0628 0.0947 0.278 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000197442 MAP3K5 491499 sc-eQTL 5.58e-01 0.0456 0.0778 0.278 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000237499 WAKMAR2 -584257 sc-eQTL 7.66e-01 0.0243 0.0814 0.278 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000286646 AL121933.2 499931 sc-eQTL 4.08e-01 -0.0764 0.0922 0.278 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000027697 IFNGR1 64527 sc-eQTL 7.88e-02 -0.108 0.0614 0.28 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000029363 BCLAF1 994125 sc-eQTL 7.60e-01 -0.011 0.0359 0.28 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000112357 PEX7 461412 sc-eQTL 2.88e-01 0.111 0.104 0.28 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000112378 PERP -823443 sc-eQTL 2.05e-01 0.082 0.0645 0.28 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000118503 TNFAIP3 -583238 sc-eQTL 4.79e-01 0.0399 0.0563 0.28 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000197442 MAP3K5 491499 sc-eQTL 6.73e-01 -0.0322 0.0761 0.28 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000237499 WAKMAR2 -584257 sc-eQTL 8.41e-01 -0.0158 0.0789 0.28 NK_CD56dim LOneK1K

Statistical fine-mapping results from Japan COVID-19 Task Force
(Shown only for PIP>0.001)
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
PIP (SuSiE)
PIP (FINEMAP)
MAF
ENSG00000118503 TNFAIP3 -583238 eQTL 0.0496 0.0309 0.0157 0.0 0.0 0.291
ENSG00000135525 MAP7 733157 eQTL 0.00169 0.0897 0.0285 0.00777 0.00121 0.291
ENSG00000226004 AL591468.1 -661826 eQTL 0.0434 -0.055 0.0272 0.0 0.0 0.291

Expression Modifier Score(EMS) for GTEx 49tissues
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Whole Blood
Muscle Skeletal
Liver
Brain Cerebellum
Prostate
Spleen
Skin Sun Exposed Lower leg
Artery Coronary
Esophagus Muscularis
Esophagus Gastroesophageal Junction
Artery Tibial
Heart Atrial Appendage
Nerve Tibial
Heart Left Ventricle
Adrenal Gland
Adipose Visceral Omentum
Pancreas
Lung
Pituitary
Brain Nucleus accumbens basal ganglia
Colon Transverse
Adipose Subcutaneous
Esophagus Mucosa
Brain Cortex
Thyroid
Stomach
Breast Mammary Tissue
Colon Sigmoid
Skin Not Sun Exposed Suprapubic
Testis
Artery Aorta
Brain Amygdala
Brain Anterior cingulate cortex BA24
Brain Caudate basal ganglia
Brain Cerebellar Hemisphere
Brain Frontal Cortex BA9
Brain Hippocampus
Brain Hypothalamus
Brain Putamen basal ganglia
Brain Spinal cord cervical c-1
Brain Substantia nigra
Cells Cultured fibroblasts
Cells EBV-transformed lymphocytes
Kidney Cortex
Minor Salivary Gland
Ovary
Small Intestine Terminal Ileum
Uterus
Vagina