logo

Genes within 1Mb (chr6:137273053:A:T):

View on , UCSC , GTEx , gnomAD

Immune cell-type specific single cell cis-eQTLs in OASIS
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000027697 IFNGR1 53604 sc-eQTL 4.98e-02 -0.165 0.0838 0.199 B L1
ENSG00000029363 BCLAF1 983202 sc-eQTL 7.60e-01 0.0115 0.0376 0.199 B L1
ENSG00000112357 PEX7 450489 sc-eQTL 2.56e-01 0.114 0.0997 0.199 B L1
ENSG00000112378 PERP -834366 sc-eQTL 8.09e-01 -0.016 0.0662 0.199 B L1
ENSG00000118503 TNFAIP3 -594161 sc-eQTL 9.64e-01 -0.00244 0.0533 0.199 B L1
ENSG00000197442 MAP3K5 480576 sc-eQTL 2.94e-01 -0.078 0.0741 0.199 B L1
ENSG00000237499 WAKMAR2 -595180 sc-eQTL 7.88e-01 -0.0226 0.0839 0.199 B L1
ENSG00000027697 IFNGR1 53604 sc-eQTL 6.74e-01 -0.024 0.057 0.199 CD4T L1
ENSG00000029363 BCLAF1 983202 sc-eQTL 3.88e-01 -0.0372 0.0431 0.199 CD4T L1
ENSG00000112357 PEX7 450489 sc-eQTL 1.40e-01 -0.135 0.0913 0.199 CD4T L1
ENSG00000112378 PERP -834366 sc-eQTL 3.37e-01 -0.0591 0.0615 0.199 CD4T L1
ENSG00000118503 TNFAIP3 -594161 sc-eQTL 4.02e-01 -0.0484 0.0576 0.199 CD4T L1
ENSG00000197442 MAP3K5 480576 sc-eQTL 5.01e-01 -0.0296 0.0439 0.199 CD4T L1
ENSG00000237499 WAKMAR2 -595180 sc-eQTL 1.05e-01 -0.118 0.0722 0.199 CD4T L1
ENSG00000027697 IFNGR1 53604 sc-eQTL 3.00e-01 -0.0665 0.064 0.199 CD8T L1
ENSG00000029363 BCLAF1 983202 sc-eQTL 5.63e-01 0.0251 0.0434 0.199 CD8T L1
ENSG00000112357 PEX7 450489 sc-eQTL 6.39e-01 -0.0502 0.107 0.199 CD8T L1
ENSG00000112378 PERP -834366 sc-eQTL 8.10e-01 -0.0168 0.0699 0.199 CD8T L1
ENSG00000118503 TNFAIP3 -594161 sc-eQTL 7.41e-01 0.0178 0.054 0.199 CD8T L1
ENSG00000197442 MAP3K5 480576 sc-eQTL 9.17e-01 -0.00595 0.057 0.199 CD8T L1
ENSG00000237499 WAKMAR2 -595180 sc-eQTL 1.26e-01 -0.121 0.0788 0.199 CD8T L1
ENSG00000027697 IFNGR1 53604 sc-eQTL 1.22e-01 -0.117 0.0751 0.203 DC L1
ENSG00000029363 BCLAF1 983202 sc-eQTL 5.50e-01 -0.0406 0.0679 0.203 DC L1
ENSG00000112357 PEX7 450489 sc-eQTL 4.83e-01 0.0746 0.106 0.203 DC L1
ENSG00000118503 TNFAIP3 -594161 sc-eQTL 4.14e-01 0.066 0.0806 0.203 DC L1
ENSG00000135525 MAP7 722234 sc-eQTL 2.85e-01 -0.0935 0.0872 0.203 DC L1
ENSG00000197442 MAP3K5 480576 sc-eQTL 4.11e-01 -0.0688 0.0836 0.203 DC L1
ENSG00000237499 WAKMAR2 -595180 sc-eQTL 5.83e-01 0.0452 0.0822 0.203 DC L1
ENSG00000286646 AL121933.2 489008 sc-eQTL 8.13e-01 0.0259 0.109 0.203 DC L1
ENSG00000027697 IFNGR1 53604 sc-eQTL 8.31e-01 -0.014 0.0657 0.199 Mono L1
ENSG00000029363 BCLAF1 983202 sc-eQTL 8.42e-01 0.0112 0.0562 0.199 Mono L1
ENSG00000112357 PEX7 450489 sc-eQTL 2.83e-02 -0.242 0.109 0.199 Mono L1
ENSG00000118503 TNFAIP3 -594161 sc-eQTL 2.58e-01 0.0631 0.0556 0.199 Mono L1
ENSG00000135525 MAP7 722234 sc-eQTL 5.29e-01 -0.0615 0.0975 0.199 Mono L1
ENSG00000197442 MAP3K5 480576 sc-eQTL 5.04e-01 0.0435 0.065 0.199 Mono L1
ENSG00000237499 WAKMAR2 -595180 sc-eQTL 3.30e-01 0.0674 0.0689 0.199 Mono L1
ENSG00000286646 AL121933.2 489008 sc-eQTL 8.32e-01 0.0167 0.0788 0.199 Mono L1
ENSG00000027697 IFNGR1 53604 sc-eQTL 4.87e-02 -0.141 0.0713 0.2 NK L1
ENSG00000029363 BCLAF1 983202 sc-eQTL 9.41e-01 0.00285 0.0382 0.2 NK L1
ENSG00000112357 PEX7 450489 sc-eQTL 7.82e-01 -0.0307 0.111 0.2 NK L1
ENSG00000112378 PERP -834366 sc-eQTL 8.43e-02 -0.12 0.0695 0.2 NK L1
ENSG00000118503 TNFAIP3 -594161 sc-eQTL 5.64e-01 -0.0346 0.0598 0.2 NK L1
ENSG00000197442 MAP3K5 480576 sc-eQTL 7.27e-01 -0.03 0.0858 0.2 NK L1
ENSG00000237499 WAKMAR2 -595180 sc-eQTL 6.53e-01 -0.0382 0.0848 0.2 NK L1
ENSG00000027697 IFNGR1 53604 sc-eQTL 4.56e-04 -0.231 0.065 0.199 Other_T L1
ENSG00000029363 BCLAF1 983202 sc-eQTL 9.78e-02 -0.0927 0.0557 0.199 Other_T L1
ENSG00000112357 PEX7 450489 sc-eQTL 7.20e-01 -0.0392 0.109 0.199 Other_T L1
ENSG00000112378 PERP -834366 sc-eQTL 8.76e-01 0.0136 0.0875 0.199 Other_T L1
ENSG00000118503 TNFAIP3 -594161 sc-eQTL 4.94e-01 0.0285 0.0416 0.199 Other_T L1
ENSG00000197442 MAP3K5 480576 sc-eQTL 9.96e-01 -0.00043 0.0804 0.199 Other_T L1
ENSG00000237499 WAKMAR2 -595180 sc-eQTL 1.61e-01 -0.116 0.0822 0.199 Other_T L1
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000027697 IFNGR1 53604 sc-eQTL 3.02e-01 -0.115 0.111 0.189 B_Activated L2
ENSG00000029363 BCLAF1 983202 sc-eQTL 5.16e-01 0.0589 0.0905 0.189 B_Activated L2
ENSG00000112357 PEX7 450489 sc-eQTL 4.98e-01 -0.0744 0.11 0.189 B_Activated L2
ENSG00000112378 PERP -834366 sc-eQTL 6.89e-01 0.0228 0.0568 0.189 B_Activated L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 -594161 sc-eQTL 5.14e-01 0.0719 0.11 0.189 B_Activated L2
ENSG00000197442 MAP3K5 480576 sc-eQTL 9.03e-01 0.0151 0.123 0.189 B_Activated L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 -595180 sc-eQTL 6.96e-01 -0.0376 0.0962 0.189 B_Activated L2
ENSG00000027697 IFNGR1 53604 sc-eQTL 6.64e-02 -0.181 0.0979 0.2 B_Intermediate L2
ENSG00000029363 BCLAF1 983202 sc-eQTL 2.54e-01 -0.064 0.056 0.2 B_Intermediate L2
ENSG00000112357 PEX7 450489 sc-eQTL 2.12e-01 0.129 0.103 0.2 B_Intermediate L2
ENSG00000112378 PERP -834366 sc-eQTL 5.66e-01 -0.054 0.0941 0.2 B_Intermediate L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 -594161 sc-eQTL 9.28e-01 -0.00665 0.0739 0.2 B_Intermediate L2
ENSG00000197442 MAP3K5 480576 sc-eQTL 7.62e-01 0.0271 0.0893 0.2 B_Intermediate L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 -595180 sc-eQTL 5.73e-01 -0.0591 0.105 0.2 B_Intermediate L2
ENSG00000027697 IFNGR1 53604 sc-eQTL 1.39e-01 -0.158 0.107 0.198 B_Memory L2
ENSG00000029363 BCLAF1 983202 sc-eQTL 6.27e-01 -0.031 0.0636 0.198 B_Memory L2
ENSG00000112357 PEX7 450489 sc-eQTL 7.34e-01 -0.0368 0.108 0.198 B_Memory L2
ENSG00000112378 PERP -834366 sc-eQTL 1.87e-01 0.134 0.101 0.198 B_Memory L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 -594161 sc-eQTL 5.61e-01 0.0408 0.0701 0.198 B_Memory L2
ENSG00000197442 MAP3K5 480576 sc-eQTL 3.23e-01 -0.0947 0.0955 0.198 B_Memory L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 -595180 sc-eQTL 6.44e-01 0.0483 0.104 0.198 B_Memory L2
ENSG00000027697 IFNGR1 53604 sc-eQTL 5.26e-01 -0.0533 0.0839 0.199 B_Naive1 L2
ENSG00000029363 BCLAF1 983202 sc-eQTL 7.42e-01 0.0158 0.048 0.199 B_Naive1 L2
ENSG00000112357 PEX7 450489 sc-eQTL 6.69e-01 -0.0474 0.111 0.199 B_Naive1 L2
ENSG00000112378 PERP -834366 sc-eQTL 1.68e-01 -0.133 0.0965 0.199 B_Naive1 L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 -594161 sc-eQTL 8.94e-01 0.00752 0.0562 0.199 B_Naive1 L2
ENSG00000197442 MAP3K5 480576 sc-eQTL 9.17e-01 0.00823 0.079 0.199 B_Naive1 L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 -595180 sc-eQTL 7.71e-01 0.0257 0.088 0.199 B_Naive1 L2
ENSG00000027697 IFNGR1 53604 sc-eQTL 4.14e-01 -0.084 0.103 0.2 B_Naive2 L2
ENSG00000029363 BCLAF1 983202 sc-eQTL 3.52e-02 0.125 0.059 0.2 B_Naive2 L2
ENSG00000112357 PEX7 450489 sc-eQTL 3.87e-02 0.232 0.111 0.2 B_Naive2 L2
ENSG00000112378 PERP -834366 sc-eQTL 4.17e-01 -0.0664 0.0818 0.2 B_Naive2 L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 -594161 sc-eQTL 4.24e-01 -0.0654 0.0817 0.2 B_Naive2 L2
ENSG00000197442 MAP3K5 480576 sc-eQTL 3.66e-01 -0.0788 0.0869 0.2 B_Naive2 L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 -595180 sc-eQTL 3.61e-01 -0.0967 0.106 0.2 B_Naive2 L2
ENSG00000027697 IFNGR1 53604 sc-eQTL 1.40e-01 -0.142 0.0961 0.2 CD4_CTL L2
ENSG00000029363 BCLAF1 983202 sc-eQTL 4.81e-01 -0.0605 0.0856 0.2 CD4_CTL L2
ENSG00000112357 PEX7 450489 sc-eQTL 5.97e-01 -0.0567 0.107 0.2 CD4_CTL L2
ENSG00000112378 PERP -834366 sc-eQTL 8.22e-01 -0.0244 0.109 0.2 CD4_CTL L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 -594161 sc-eQTL 6.73e-01 -0.0267 0.0633 0.2 CD4_CTL L2
ENSG00000197442 MAP3K5 480576 sc-eQTL 8.59e-01 -0.0179 0.101 0.2 CD4_CTL L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 -595180 sc-eQTL 8.54e-02 -0.169 0.0978 0.2 CD4_CTL L2
ENSG00000027697 IFNGR1 53604 sc-eQTL 4.28e-01 0.0426 0.0536 0.199 CD4_Naive L2
ENSG00000029363 BCLAF1 983202 sc-eQTL 4.62e-01 -0.0317 0.0431 0.199 CD4_Naive L2
ENSG00000112357 PEX7 450489 sc-eQTL 6.49e-01 -0.0462 0.101 0.199 CD4_Naive L2
ENSG00000112378 PERP -834366 sc-eQTL 3.56e-01 -0.0773 0.0835 0.199 CD4_Naive L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 -594161 sc-eQTL 5.33e-01 -0.0366 0.0587 0.199 CD4_Naive L2
ENSG00000197442 MAP3K5 480576 sc-eQTL 5.18e-01 -0.0279 0.0431 0.199 CD4_Naive L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 -595180 sc-eQTL 8.75e-02 -0.13 0.0755 0.199 CD4_Naive L2
ENSG00000027697 IFNGR1 53604 sc-eQTL 8.39e-01 -0.015 0.0735 0.199 CD4_TCM L2
ENSG00000029363 BCLAF1 983202 sc-eQTL 4.92e-02 -0.0909 0.0459 0.199 CD4_TCM L2
ENSG00000112357 PEX7 450489 sc-eQTL 1.18e-01 -0.169 0.107 0.199 CD4_TCM L2
ENSG00000112378 PERP -834366 sc-eQTL 6.55e-01 -0.0408 0.0911 0.199 CD4_TCM L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 -594161 sc-eQTL 3.67e-01 -0.0478 0.0528 0.199 CD4_TCM L2
ENSG00000197442 MAP3K5 480576 sc-eQTL 9.34e-01 -0.00503 0.0603 0.199 CD4_TCM L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 -595180 sc-eQTL 1.98e-01 -0.0954 0.0739 0.199 CD4_TCM L2
ENSG00000027697 IFNGR1 53604 sc-eQTL 7.73e-01 -0.0245 0.0847 0.199 CD4_TEM L2
ENSG00000029363 BCLAF1 983202 sc-eQTL 7.67e-01 -0.0178 0.0601 0.199 CD4_TEM L2
ENSG00000112357 PEX7 450489 sc-eQTL 1.13e-01 0.173 0.109 0.199 CD4_TEM L2
ENSG00000112378 PERP -834366 sc-eQTL 9.80e-01 -0.00219 0.0887 0.199 CD4_TEM L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 -594161 sc-eQTL 7.72e-01 -0.0164 0.0563 0.199 CD4_TEM L2
ENSG00000197442 MAP3K5 480576 sc-eQTL 1.93e-01 -0.113 0.0866 0.199 CD4_TEM L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 -595180 sc-eQTL 6.56e-01 -0.0402 0.0902 0.199 CD4_TEM L2
ENSG00000027697 IFNGR1 53604 sc-eQTL 7.05e-01 0.0292 0.0771 0.199 CD8_CTL L2
ENSG00000029363 BCLAF1 983202 sc-eQTL 9.01e-01 -0.00637 0.0514 0.199 CD8_CTL L2
ENSG00000112357 PEX7 450489 sc-eQTL 9.33e-01 0.00893 0.106 0.199 CD8_CTL L2
ENSG00000112378 PERP -834366 sc-eQTL 9.70e-01 -0.00383 0.102 0.199 CD8_CTL L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 -594161 sc-eQTL 8.14e-01 0.0152 0.0649 0.199 CD8_CTL L2
ENSG00000197442 MAP3K5 480576 sc-eQTL 7.82e-01 -0.0254 0.0915 0.199 CD8_CTL L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 -595180 sc-eQTL 7.56e-01 0.0284 0.0912 0.199 CD8_CTL L2
ENSG00000027697 IFNGR1 53604 sc-eQTL 6.30e-01 -0.0364 0.0754 0.199 CD8_Naive L2
ENSG00000029363 BCLAF1 983202 sc-eQTL 5.96e-01 0.0279 0.0526 0.199 CD8_Naive L2
ENSG00000112357 PEX7 450489 sc-eQTL 6.94e-01 -0.043 0.109 0.199 CD8_Naive L2
ENSG00000112378 PERP -834366 sc-eQTL 3.05e-01 -0.0853 0.0829 0.199 CD8_Naive L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 -594161 sc-eQTL 5.64e-01 -0.0341 0.059 0.199 CD8_Naive L2
ENSG00000197442 MAP3K5 480576 sc-eQTL 6.92e-01 -0.0277 0.0699 0.199 CD8_Naive L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 -595180 sc-eQTL 1.69e-01 -0.12 0.0869 0.199 CD8_Naive L2
ENSG00000027697 IFNGR1 53604 sc-eQTL 5.17e-01 -0.0669 0.103 0.197 CD8_TCM L2
ENSG00000029363 BCLAF1 983202 sc-eQTL 9.21e-01 0.00765 0.0775 0.197 CD8_TCM L2
ENSG00000112357 PEX7 450489 sc-eQTL 8.84e-01 -0.0174 0.118 0.197 CD8_TCM L2
ENSG00000112378 PERP -834366 sc-eQTL 8.52e-01 -0.0217 0.116 0.197 CD8_TCM L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 -594161 sc-eQTL 3.89e-01 0.0482 0.0558 0.197 CD8_TCM L2
ENSG00000197442 MAP3K5 480576 sc-eQTL 7.46e-01 0.0324 0.0998 0.197 CD8_TCM L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 -595180 sc-eQTL 3.71e-01 -0.0917 0.102 0.197 CD8_TCM L2
ENSG00000027697 IFNGR1 53604 sc-eQTL 4.53e-02 -0.196 0.0973 0.194 CD8_TEM L2
ENSG00000029363 BCLAF1 983202 sc-eQTL 7.31e-01 -0.032 0.0928 0.194 CD8_TEM L2
ENSG00000112357 PEX7 450489 sc-eQTL 8.88e-01 -0.016 0.113 0.194 CD8_TEM L2
ENSG00000112378 PERP -834366 sc-eQTL 1.08e-01 -0.189 0.117 0.194 CD8_TEM L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 -594161 sc-eQTL 1.52e-01 0.104 0.0721 0.194 CD8_TEM L2
ENSG00000197442 MAP3K5 480576 sc-eQTL 6.44e-01 -0.0519 0.112 0.194 CD8_TEM L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 -595180 sc-eQTL 4.14e-01 0.0879 0.107 0.194 CD8_TEM L2
ENSG00000027697 IFNGR1 53604 sc-eQTL 2.89e-06 -0.358 0.0745 0.199 MAIT L2
ENSG00000029363 BCLAF1 983202 sc-eQTL 2.34e-01 -0.0776 0.065 0.199 MAIT L2
ENSG00000112357 PEX7 450489 sc-eQTL 5.09e-01 0.0704 0.106 0.199 MAIT L2
ENSG00000112378 PERP -834366 sc-eQTL 9.48e-01 -0.00721 0.111 0.199 MAIT L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 -594161 sc-eQTL 6.50e-01 0.024 0.0528 0.199 MAIT L2
ENSG00000197442 MAP3K5 480576 sc-eQTL 9.54e-01 0.00528 0.092 0.199 MAIT L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 -595180 sc-eQTL 2.49e-01 -0.113 0.0974 0.199 MAIT L2
ENSG00000027697 IFNGR1 53604 sc-eQTL 4.53e-02 -0.171 0.0849 0.196 NK_CD56bright L2
ENSG00000029363 BCLAF1 983202 sc-eQTL 8.77e-01 0.00984 0.0633 0.196 NK_CD56bright L2
ENSG00000112357 PEX7 450489 sc-eQTL 3.19e-01 -0.111 0.112 0.196 NK_CD56bright L2
ENSG00000112378 PERP -834366 sc-eQTL 2.01e-01 -0.128 0.0998 0.196 NK_CD56bright L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 -594161 sc-eQTL 8.43e-01 0.0126 0.0639 0.196 NK_CD56bright L2
ENSG00000197442 MAP3K5 480576 sc-eQTL 2.36e-01 -0.115 0.0968 0.196 NK_CD56bright L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 -595180 sc-eQTL 8.66e-02 -0.174 0.101 0.196 NK_CD56bright L2
ENSG00000027697 IFNGR1 53604 sc-eQTL 2.08e-01 -0.0844 0.0668 0.2 NK_CD56dim L2
ENSG00000029363 BCLAF1 983202 sc-eQTL 4.10e-01 0.0362 0.0438 0.2 NK_CD56dim L2
ENSG00000112357 PEX7 450489 sc-eQTL 2.96e-01 -0.121 0.115 0.2 NK_CD56dim L2
ENSG00000112378 PERP -834366 sc-eQTL 4.72e-01 -0.0584 0.0811 0.2 NK_CD56dim L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 -594161 sc-eQTL 6.22e-01 -0.0311 0.0631 0.2 NK_CD56dim L2
ENSG00000197442 MAP3K5 480576 sc-eQTL 8.45e-01 0.0178 0.0909 0.2 NK_CD56dim L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 -595180 sc-eQTL 4.31e-01 -0.0746 0.0945 0.2 NK_CD56dim L2
ENSG00000027697 IFNGR1 53604 sc-eQTL 1.45e-01 -0.123 0.0839 0.208 NK_HLA L2
ENSG00000029363 BCLAF1 983202 sc-eQTL 5.45e-01 -0.0433 0.0714 0.208 NK_HLA L2
ENSG00000112357 PEX7 450489 sc-eQTL 1.90e-01 0.14 0.107 0.208 NK_HLA L2
ENSG00000112378 PERP -834366 sc-eQTL 8.18e-01 -0.0201 0.0869 0.208 NK_HLA L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 -594161 sc-eQTL 3.00e-01 -0.0693 0.0667 0.208 NK_HLA L2
ENSG00000197442 MAP3K5 480576 sc-eQTL 9.00e-01 -0.0134 0.106 0.208 NK_HLA L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 -595180 sc-eQTL 4.95e-01 0.0736 0.108 0.208 NK_HLA L2
ENSG00000027697 IFNGR1 53604 sc-eQTL 1.50e-01 -0.101 0.0701 0.2 NK_cytokine L2
ENSG00000029363 BCLAF1 983202 sc-eQTL 1.05e-01 -0.0851 0.0523 0.2 NK_cytokine L2
ENSG00000112357 PEX7 450489 sc-eQTL 1.69e-01 0.152 0.11 0.2 NK_cytokine L2
ENSG00000112378 PERP -834366 sc-eQTL 7.73e-01 0.0243 0.0839 0.2 NK_cytokine L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 -594161 sc-eQTL 7.82e-01 -0.0175 0.0629 0.2 NK_cytokine L2
ENSG00000197442 MAP3K5 480576 sc-eQTL 5.60e-01 -0.0505 0.0864 0.2 NK_cytokine L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 -595180 sc-eQTL 9.65e-01 -0.00414 0.0948 0.2 NK_cytokine L2
ENSG00000027697 IFNGR1 53604 sc-eQTL 3.34e-01 0.13 0.134 0.167 PB L2
ENSG00000029363 BCLAF1 983202 sc-eQTL 9.06e-01 -0.0138 0.116 0.167 PB L2
ENSG00000112357 PEX7 450489 sc-eQTL 7.79e-01 0.0389 0.138 0.167 PB L2
ENSG00000112378 PERP -834366 sc-eQTL 1.76e-01 -0.117 0.0856 0.167 PB L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 -594161 sc-eQTL 8.81e-01 -0.0157 0.105 0.167 PB L2
ENSG00000197442 MAP3K5 480576 sc-eQTL 1.26e-01 -0.182 0.118 0.167 PB L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 -595180 sc-eQTL 5.36e-01 -0.0779 0.125 0.167 PB L2
ENSG00000027697 IFNGR1 53604 sc-eQTL 8.07e-01 -0.0211 0.0861 0.198 Pro_T L2
ENSG00000029363 BCLAF1 983202 sc-eQTL 6.20e-01 -0.0443 0.0892 0.198 Pro_T L2
ENSG00000112357 PEX7 450489 sc-eQTL 5.47e-01 -0.063 0.104 0.198 Pro_T L2
ENSG00000112378 PERP -834366 sc-eQTL 3.47e-01 -0.0782 0.083 0.198 Pro_T L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 -594161 sc-eQTL 3.57e-01 0.0483 0.0523 0.198 Pro_T L2
ENSG00000197442 MAP3K5 480576 sc-eQTL 1.67e-01 0.14 0.101 0.198 Pro_T L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 -595180 sc-eQTL 2.35e-01 -0.121 0.101 0.198 Pro_T L2
ENSG00000027697 IFNGR1 53604 sc-eQTL 8.54e-01 -0.0184 0.0997 0.199 Treg L2
ENSG00000029363 BCLAF1 983202 sc-eQTL 4.19e-01 -0.0521 0.0643 0.199 Treg L2
ENSG00000112357 PEX7 450489 sc-eQTL 2.30e-01 -0.126 0.105 0.199 Treg L2
ENSG00000112378 PERP -834366 sc-eQTL 8.25e-01 -0.0252 0.114 0.199 Treg L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 -594161 sc-eQTL 2.97e-01 0.066 0.0632 0.199 Treg L2
ENSG00000197442 MAP3K5 480576 sc-eQTL 8.30e-01 0.0148 0.0686 0.199 Treg L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 -595180 sc-eQTL 1.40e-01 0.143 0.0961 0.199 Treg L2
ENSG00000027697 IFNGR1 53604 sc-eQTL 5.25e-01 -0.0532 0.0834 0.205 cDC L2
ENSG00000029363 BCLAF1 983202 sc-eQTL 1.62e-01 -0.117 0.0837 0.205 cDC L2
ENSG00000112357 PEX7 450489 sc-eQTL 3.89e-01 0.0931 0.108 0.205 cDC L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 -594161 sc-eQTL 7.75e-01 -0.0235 0.0823 0.205 cDC L2
ENSG00000135525 MAP7 722234 sc-eQTL 2.96e-01 -0.101 0.096 0.205 cDC L2
ENSG00000197442 MAP3K5 480576 sc-eQTL 4.48e-01 -0.0643 0.0846 0.205 cDC L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 -595180 sc-eQTL 8.19e-01 -0.0246 0.107 0.205 cDC L2
ENSG00000286646 AL121933.2 489008 sc-eQTL 4.15e-01 0.0901 0.11 0.205 cDC L2
ENSG00000027697 IFNGR1 53604 sc-eQTL 6.48e-01 0.0278 0.0607 0.199 cMono_IL1B L2
ENSG00000029363 BCLAF1 983202 sc-eQTL 4.07e-01 0.054 0.065 0.199 cMono_IL1B L2
ENSG00000112357 PEX7 450489 sc-eQTL 5.91e-02 -0.206 0.108 0.199 cMono_IL1B L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 -594161 sc-eQTL 4.84e-02 0.129 0.0648 0.199 cMono_IL1B L2
ENSG00000135525 MAP7 722234 sc-eQTL 4.41e-01 -0.0726 0.094 0.199 cMono_IL1B L2
ENSG00000197442 MAP3K5 480576 sc-eQTL 6.12e-01 -0.0346 0.0679 0.199 cMono_IL1B L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 -595180 sc-eQTL 2.32e-01 0.0834 0.0696 0.199 cMono_IL1B L2
ENSG00000286646 AL121933.2 489008 sc-eQTL 8.47e-01 -0.0169 0.0874 0.199 cMono_IL1B L2
ENSG00000027697 IFNGR1 53604 sc-eQTL 4.59e-01 -0.0524 0.0707 0.199 cMono_S100A L2
ENSG00000029363 BCLAF1 983202 sc-eQTL 8.21e-01 -0.0165 0.0727 0.199 cMono_S100A L2
ENSG00000112357 PEX7 450489 sc-eQTL 1.75e-01 -0.154 0.113 0.199 cMono_S100A L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 -594161 sc-eQTL 2.61e-01 0.0707 0.0627 0.199 cMono_S100A L2
ENSG00000135525 MAP7 722234 sc-eQTL 2.73e-02 -0.233 0.105 0.199 cMono_S100A L2
ENSG00000197442 MAP3K5 480576 sc-eQTL 9.15e-02 0.144 0.0849 0.199 cMono_S100A L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 -595180 sc-eQTL 7.25e-01 -0.0318 0.0903 0.199 cMono_S100A L2
ENSG00000286646 AL121933.2 489008 sc-eQTL 6.33e-01 0.0422 0.0881 0.199 cMono_S100A L2
ENSG00000027697 IFNGR1 53604 sc-eQTL 3.84e-01 -0.0895 0.103 0.215 gdT L2
ENSG00000029363 BCLAF1 983202 sc-eQTL 1.60e-01 -0.127 0.0899 0.215 gdT L2
ENSG00000112357 PEX7 450489 sc-eQTL 6.87e-01 -0.0526 0.13 0.215 gdT L2
ENSG00000112378 PERP -834366 sc-eQTL 1.08e-01 0.182 0.113 0.215 gdT L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 -594161 sc-eQTL 2.69e-01 0.0699 0.0629 0.215 gdT L2
ENSG00000197442 MAP3K5 480576 sc-eQTL 4.94e-02 0.261 0.132 0.215 gdT L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 -595180 sc-eQTL 3.45e-01 -0.108 0.114 0.215 gdT L2
ENSG00000027697 IFNGR1 53604 sc-eQTL 6.25e-01 0.0369 0.0753 0.198 intMono L2
ENSG00000029363 BCLAF1 983202 sc-eQTL 2.23e-01 -0.121 0.0992 0.198 intMono L2
ENSG00000112357 PEX7 450489 sc-eQTL 7.84e-02 -0.178 0.101 0.198 intMono L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 -594161 sc-eQTL 2.49e-01 0.075 0.0649 0.198 intMono L2
ENSG00000135525 MAP7 722234 sc-eQTL 8.82e-01 0.0148 0.1 0.198 intMono L2
ENSG00000197442 MAP3K5 480576 sc-eQTL 2.24e-01 -0.129 0.106 0.198 intMono L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 -595180 sc-eQTL 6.28e-01 -0.047 0.097 0.198 intMono L2
ENSG00000286646 AL121933.2 489008 sc-eQTL 3.10e-01 -0.114 0.112 0.198 intMono L2
ENSG00000027697 IFNGR1 53604 sc-eQTL 4.86e-01 -0.061 0.0874 0.195 ncMono L2
ENSG00000029363 BCLAF1 983202 sc-eQTL 5.70e-01 -0.0387 0.0679 0.195 ncMono L2
ENSG00000112357 PEX7 450489 sc-eQTL 4.11e-01 -0.0892 0.108 0.195 ncMono L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 -594161 sc-eQTL 9.64e-02 0.128 0.0769 0.195 ncMono L2
ENSG00000135525 MAP7 722234 sc-eQTL 6.06e-01 0.0494 0.0957 0.195 ncMono L2
ENSG00000197442 MAP3K5 480576 sc-eQTL 1.07e-01 0.162 0.1 0.195 ncMono L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 -595180 sc-eQTL 6.17e-01 0.0485 0.0968 0.195 ncMono L2
ENSG00000286646 AL121933.2 489008 sc-eQTL 5.25e-01 -0.0649 0.102 0.195 ncMono L2
ENSG00000027697 IFNGR1 53604 sc-eQTL 3.11e-01 -0.0958 0.0943 0.218 pDC L2
ENSG00000029363 BCLAF1 983202 sc-eQTL 5.16e-01 0.0461 0.0709 0.218 pDC L2
ENSG00000112357 PEX7 450489 sc-eQTL 9.44e-01 -0.00736 0.104 0.218 pDC L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 -594161 sc-eQTL 7.07e-02 0.158 0.0868 0.218 pDC L2
ENSG00000135525 MAP7 722234 sc-eQTL 9.93e-01 -0.000627 0.0727 0.218 pDC L2
ENSG00000197442 MAP3K5 480576 sc-eQTL 8.68e-01 0.0194 0.116 0.218 pDC L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 -595180 sc-eQTL 5.91e-01 -0.0479 0.0889 0.218 pDC L2
ENSG00000286646 AL121933.2 489008 sc-eQTL 6.67e-01 0.0463 0.107 0.218 pDC L2
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000027697 IFNGR1 53604 sc-eQTL 6.42e-03 -0.237 0.086 0.199 B_Memory LOneK1K
ENSG00000029363 BCLAF1 983202 sc-eQTL 2.76e-01 -0.0536 0.049 0.199 B_Memory LOneK1K
ENSG00000112357 PEX7 450489 sc-eQTL 8.88e-01 0.0142 0.101 0.199 B_Memory LOneK1K
ENSG00000112378 PERP -834366 sc-eQTL 3.08e-01 0.0953 0.0933 0.199 B_Memory LOneK1K
ENSG00000118503 TNFAIP3 -594161 sc-eQTL 7.60e-01 -0.0189 0.0617 0.199 B_Memory LOneK1K
ENSG00000197442 MAP3K5 480576 sc-eQTL 9.69e-01 0.00318 0.0818 0.199 B_Memory LOneK1K
ENSG00000237499 WAKMAR2 -595180 sc-eQTL 8.66e-01 -0.0177 0.104 0.199 B_Memory LOneK1K
ENSG00000027697 IFNGR1 53604 sc-eQTL 2.37e-01 -0.105 0.0884 0.199 B_Naive LOneK1K
ENSG00000029363 BCLAF1 983202 sc-eQTL 2.23e-01 0.0496 0.0406 0.199 B_Naive LOneK1K
ENSG00000112357 PEX7 450489 sc-eQTL 3.32e-01 0.105 0.108 0.199 B_Naive LOneK1K
ENSG00000112378 PERP -834366 sc-eQTL 1.31e-01 -0.146 0.0961 0.199 B_Naive LOneK1K
ENSG00000118503 TNFAIP3 -594161 sc-eQTL 8.40e-01 -0.0103 0.0508 0.199 B_Naive LOneK1K
ENSG00000197442 MAP3K5 480576 sc-eQTL 2.39e-01 -0.0876 0.0742 0.199 B_Naive LOneK1K
ENSG00000237499 WAKMAR2 -595180 sc-eQTL 7.53e-01 -0.0285 0.0904 0.199 B_Naive LOneK1K
ENSG00000027697 IFNGR1 53604 sc-eQTL 8.79e-01 -0.00948 0.0622 0.199 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000029363 BCLAF1 983202 sc-eQTL 4.77e-01 0.0412 0.0578 0.199 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000112357 PEX7 450489 sc-eQTL 5.71e-02 -0.212 0.111 0.199 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000118503 TNFAIP3 -594161 sc-eQTL 1.52e-01 0.0823 0.0572 0.199 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000135525 MAP7 722234 sc-eQTL 1.23e-01 -0.154 0.0993 0.199 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000197442 MAP3K5 480576 sc-eQTL 6.01e-01 0.0352 0.0674 0.199 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000237499 WAKMAR2 -595180 sc-eQTL 3.39e-01 0.066 0.0688 0.199 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000286646 AL121933.2 489008 sc-eQTL 9.24e-01 -0.00769 0.0802 0.199 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000027697 IFNGR1 53604 sc-eQTL 5.42e-01 -0.044 0.0721 0.2 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000029363 BCLAF1 983202 sc-eQTL 3.84e-01 -0.0567 0.065 0.2 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000112357 PEX7 450489 sc-eQTL 2.08e-01 -0.137 0.108 0.2 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000118503 TNFAIP3 -594161 sc-eQTL 2.15e-02 0.154 0.0665 0.2 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000135525 MAP7 722234 sc-eQTL 7.14e-01 0.0386 0.105 0.2 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000197442 MAP3K5 480576 sc-eQTL 5.25e-01 0.055 0.0863 0.2 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000237499 WAKMAR2 -595180 sc-eQTL 8.07e-01 -0.0221 0.0903 0.2 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000286646 AL121933.2 489008 sc-eQTL 1.65e-01 -0.142 0.102 0.2 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000027697 IFNGR1 53604 sc-eQTL 8.14e-02 -0.118 0.0674 0.2 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000029363 BCLAF1 983202 sc-eQTL 9.89e-01 -0.00053 0.0394 0.2 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000112357 PEX7 450489 sc-eQTL 7.47e-01 0.037 0.114 0.2 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000112378 PERP -834366 sc-eQTL 2.67e-01 -0.0789 0.0708 0.2 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000118503 TNFAIP3 -594161 sc-eQTL 4.51e-01 -0.0466 0.0618 0.2 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000197442 MAP3K5 480576 sc-eQTL 7.11e-01 -0.031 0.0835 0.2 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000237499 WAKMAR2 -595180 sc-eQTL 7.68e-01 -0.0256 0.0865 0.2 NK_CD56dim LOneK1K

Statistical fine-mapping results from Japan COVID-19 Task Force
(Shown only for PIP>0.001)
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
PIP (SuSiE)
PIP (FINEMAP)
MAF
ENSG00000027697 IFNGR1 53604 pQTL 0.00549 -0.0565 0.0203 0.0 0.0 0.201
ENSG00000027697 IFNGR1 53604 eQTL 3.18e-06 -0.0819 0.0175 0.0 0.0 0.194

Expression Modifier Score(EMS) for GTEx 49tissues
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Whole Blood
Muscle Skeletal
Liver
Brain Cerebellum
Prostate
Spleen
Skin Sun Exposed Lower leg
Artery Coronary
Esophagus Muscularis
Esophagus Gastroesophageal Junction
Artery Tibial
Heart Atrial Appendage
Nerve Tibial
Heart Left Ventricle
Adrenal Gland
Adipose Visceral Omentum
Pancreas
Lung
Pituitary
Brain Nucleus accumbens basal ganglia
Colon Transverse
Adipose Subcutaneous
Esophagus Mucosa
Brain Cortex
Thyroid
Stomach
Breast Mammary Tissue
Colon Sigmoid
Skin Not Sun Exposed Suprapubic
Testis
Artery Aorta
Brain Amygdala
Brain Anterior cingulate cortex BA24
Brain Caudate basal ganglia
Brain Cerebellar Hemisphere
Brain Frontal Cortex BA9
Brain Hippocampus
Brain Hypothalamus
Brain Putamen basal ganglia
Brain Spinal cord cervical c-1
Brain Substantia nigra
Cells Cultured fibroblasts
Cells EBV-transformed lymphocytes
Kidney Cortex
Minor Salivary Gland
Ovary
Small Intestine Terminal Ileum
Uterus
Vagina
ENSG00000027697 IFNGR1 53604 4.04e-05 9.88e-06 8.81e-07 5.17e-06 1.82e-06 6.19e-06 9.78e-06 1.29e-06 7.29e-06 3.57e-06 1.05e-05 4.92e-06 1.35e-05 3.61e-06 1.46e-06 5.68e-06 3.96e-06 8.1e-06 1.58e-06 2.13e-06 2.93e-06 8.14e-06 6.89e-06 1.93e-06 1.27e-05 2.85e-06 4.15e-06 1.78e-06 7.52e-06 7.71e-06 4.4e-06 3.85e-07 5.37e-07 2.2e-06 3.7e-06 1.17e-06 1.07e-06 4.51e-07 9.19e-07 7.19e-07 4.36e-07 1.29e-05 1.49e-06 2.06e-07 5.96e-07 1.34e-06 1.03e-06 2.54e-07 1.58e-07
ENSG00000237499 \N -595180 8.21e-07 1.53e-07 5.49e-08 2.26e-07 1.01e-07 8.85e-08 1.99e-07 5.53e-08 1.45e-07 6.4e-08 1.67e-07 1.19e-07 1.95e-07 7.95e-08 5.72e-08 8.08e-08 4.01e-08 2.15e-07 6.75e-08 5.2e-08 1.22e-07 1.39e-07 1.64e-07 3.22e-08 1.85e-07 1.22e-07 1.19e-07 1.01e-07 1.24e-07 1.06e-07 1.07e-07 3.68e-08 3.21e-08 9.76e-08 3.12e-08 2.68e-08 5.3e-08 8.93e-08 6.76e-08 5.35e-08 5.59e-08 1.55e-07 2.94e-08 2.33e-08 3.07e-08 6.98e-09 1e-07 1.89e-09 4.79e-08