Genes within 1Mb (chr6:137271924:T:C):

View on , UCSC , GTEx , gnomAD


Immune cell-type specific single cell cis-eQTLs in OASIS
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000027697 IFNGR1 52475 sc-eQTL 4.06e-01 -0.0629 0.0755 0.286 B L1
ENSG00000029363 BCLAF1 982073 sc-eQTL 7.43e-02 0.0599 0.0334 0.286 B L1
ENSG00000112357 PEX7 449360 sc-eQTL 5.35e-01 0.0555 0.0894 0.286 B L1
ENSG00000112378 PERP -835495 sc-eQTL 3.35e-01 -0.0571 0.0591 0.286 B L1
ENSG00000118503 TNFAIP3 -595290 sc-eQTL 1.86e-01 -0.063 0.0475 0.286 B L1
ENSG00000197442 MAP3K5 479447 sc-eQTL 8.09e-01 -0.0161 0.0665 0.286 B L1
ENSG00000237499 WAKMAR2 -596309 sc-eQTL 6.18e-01 -0.0375 0.075 0.286 B L1
ENSG00000027697 IFNGR1 52475 sc-eQTL 7.90e-03 -0.134 0.05 0.286 CD4T L1
ENSG00000029363 BCLAF1 982073 sc-eQTL 9.07e-02 0.0649 0.0382 0.286 CD4T L1
ENSG00000112357 PEX7 449360 sc-eQTL 4.05e-02 -0.167 0.081 0.286 CD4T L1
ENSG00000112378 PERP -835495 sc-eQTL 9.73e-01 0.00187 0.0549 0.286 CD4T L1
ENSG00000118503 TNFAIP3 -595290 sc-eQTL 1.80e-01 0.0689 0.0513 0.286 CD4T L1
ENSG00000197442 MAP3K5 479447 sc-eQTL 5.76e-01 0.0219 0.0392 0.286 CD4T L1
ENSG00000237499 WAKMAR2 -596309 sc-eQTL 4.10e-02 0.132 0.0642 0.286 CD4T L1
ENSG00000027697 IFNGR1 52475 sc-eQTL 3.15e-04 -0.205 0.0559 0.286 CD8T L1
ENSG00000029363 BCLAF1 982073 sc-eQTL 7.41e-01 0.0129 0.039 0.286 CD8T L1
ENSG00000112357 PEX7 449360 sc-eQTL 9.91e-01 0.00111 0.0962 0.286 CD8T L1
ENSG00000112378 PERP -835495 sc-eQTL 8.22e-01 -0.0142 0.0629 0.286 CD8T L1
ENSG00000118503 TNFAIP3 -595290 sc-eQTL 7.82e-01 -0.0134 0.0485 0.286 CD8T L1
ENSG00000197442 MAP3K5 479447 sc-eQTL 4.13e-01 -0.042 0.0512 0.286 CD8T L1
ENSG00000237499 WAKMAR2 -596309 sc-eQTL 1.30e-01 -0.108 0.0709 0.286 CD8T L1
ENSG00000027697 IFNGR1 52475 sc-eQTL 6.58e-01 -0.0311 0.0702 0.286 DC L1
ENSG00000029363 BCLAF1 982073 sc-eQTL 4.19e-02 0.128 0.0626 0.286 DC L1
ENSG00000112357 PEX7 449360 sc-eQTL 3.49e-01 -0.0927 0.0987 0.286 DC L1
ENSG00000118503 TNFAIP3 -595290 sc-eQTL 4.11e-01 -0.0618 0.0749 0.286 DC L1
ENSG00000135525 MAP7 721105 sc-eQTL 7.52e-01 -0.0257 0.0813 0.286 DC L1
ENSG00000197442 MAP3K5 479447 sc-eQTL 8.42e-01 0.0156 0.0779 0.286 DC L1
ENSG00000237499 WAKMAR2 -596309 sc-eQTL 3.79e-01 0.0673 0.0764 0.286 DC L1
ENSG00000286646 AL121933.2 487879 sc-eQTL 5.54e-01 0.0602 0.102 0.286 DC L1
ENSG00000027697 IFNGR1 52475 sc-eQTL 1.32e-01 -0.0866 0.0573 0.286 Mono L1
ENSG00000029363 BCLAF1 982073 sc-eQTL 1.44e-01 0.0718 0.049 0.286 Mono L1
ENSG00000112357 PEX7 449360 sc-eQTL 4.31e-01 0.0763 0.0967 0.286 Mono L1
ENSG00000118503 TNFAIP3 -595290 sc-eQTL 5.76e-01 -0.0273 0.0488 0.286 Mono L1
ENSG00000135525 MAP7 721105 sc-eQTL 3.95e-01 0.0727 0.0853 0.286 Mono L1
ENSG00000197442 MAP3K5 479447 sc-eQTL 8.30e-01 -0.0122 0.057 0.286 Mono L1
ENSG00000237499 WAKMAR2 -596309 sc-eQTL 3.65e-01 -0.0548 0.0604 0.286 Mono L1
ENSG00000286646 AL121933.2 487879 sc-eQTL 6.83e-01 0.0282 0.069 0.286 Mono L1
ENSG00000027697 IFNGR1 52475 sc-eQTL 4.87e-02 -0.128 0.0647 0.288 NK L1
ENSG00000029363 BCLAF1 982073 sc-eQTL 7.80e-01 0.00971 0.0347 0.288 NK L1
ENSG00000112357 PEX7 449360 sc-eQTL 3.96e-01 0.0856 0.101 0.288 NK L1
ENSG00000112378 PERP -835495 sc-eQTL 6.10e-01 0.0325 0.0635 0.288 NK L1
ENSG00000118503 TNFAIP3 -595290 sc-eQTL 8.04e-01 0.0135 0.0544 0.288 NK L1
ENSG00000197442 MAP3K5 479447 sc-eQTL 5.72e-01 0.0441 0.0778 0.288 NK L1
ENSG00000237499 WAKMAR2 -596309 sc-eQTL 3.71e-01 -0.0689 0.0769 0.288 NK L1
ENSG00000027697 IFNGR1 52475 sc-eQTL 3.75e-03 -0.17 0.0581 0.286 Other_T L1
ENSG00000029363 BCLAF1 982073 sc-eQTL 1.48e-01 0.0717 0.0494 0.286 Other_T L1
ENSG00000112357 PEX7 449360 sc-eQTL 6.43e-01 0.0447 0.0965 0.286 Other_T L1
ENSG00000112378 PERP -835495 sc-eQTL 5.85e-01 -0.0423 0.0775 0.286 Other_T L1
ENSG00000118503 TNFAIP3 -595290 sc-eQTL 5.16e-01 -0.024 0.0368 0.286 Other_T L1
ENSG00000197442 MAP3K5 479447 sc-eQTL 5.05e-01 -0.0475 0.0711 0.286 Other_T L1
ENSG00000237499 WAKMAR2 -596309 sc-eQTL 7.14e-02 -0.132 0.0726 0.286 Other_T L1
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000027697 IFNGR1 52475 sc-eQTL 8.26e-01 0.0221 0.1 0.276 B_Activated L2
ENSG00000029363 BCLAF1 982073 sc-eQTL 6.52e-01 -0.0368 0.0815 0.276 B_Activated L2
ENSG00000112357 PEX7 449360 sc-eQTL 5.67e-01 -0.0566 0.0987 0.276 B_Activated L2
ENSG00000112378 PERP -835495 sc-eQTL 8.54e-01 0.00941 0.0511 0.276 B_Activated L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 -595290 sc-eQTL 4.93e-01 -0.0681 0.099 0.276 B_Activated L2
ENSG00000197442 MAP3K5 479447 sc-eQTL 7.03e-01 0.0424 0.111 0.276 B_Activated L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 -596309 sc-eQTL 8.54e-01 -0.0159 0.0866 0.276 B_Activated L2
ENSG00000027697 IFNGR1 52475 sc-eQTL 3.35e-01 -0.0871 0.0901 0.283 B_Intermediate L2
ENSG00000029363 BCLAF1 982073 sc-eQTL 6.78e-02 0.0936 0.051 0.283 B_Intermediate L2
ENSG00000112357 PEX7 449360 sc-eQTL 3.09e-01 -0.0962 0.0943 0.283 B_Intermediate L2
ENSG00000112378 PERP -835495 sc-eQTL 6.74e-01 0.0363 0.0861 0.283 B_Intermediate L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 -595290 sc-eQTL 3.88e-01 -0.0583 0.0675 0.283 B_Intermediate L2
ENSG00000197442 MAP3K5 479447 sc-eQTL 2.05e-01 -0.104 0.0814 0.283 B_Intermediate L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 -596309 sc-eQTL 4.99e-01 0.0649 0.0958 0.283 B_Intermediate L2
ENSG00000027697 IFNGR1 52475 sc-eQTL 4.84e-01 -0.0688 0.0982 0.287 B_Memory L2
ENSG00000029363 BCLAF1 982073 sc-eQTL 2.98e-01 0.0608 0.0583 0.287 B_Memory L2
ENSG00000112357 PEX7 449360 sc-eQTL 7.06e-01 -0.0376 0.0993 0.287 B_Memory L2
ENSG00000112378 PERP -835495 sc-eQTL 5.80e-02 -0.177 0.0927 0.287 B_Memory L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 -595290 sc-eQTL 4.24e-01 -0.0514 0.0642 0.287 B_Memory L2
ENSG00000197442 MAP3K5 479447 sc-eQTL 5.02e-01 0.059 0.0877 0.287 B_Memory L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 -596309 sc-eQTL 7.20e-01 -0.0344 0.0957 0.287 B_Memory L2
ENSG00000027697 IFNGR1 52475 sc-eQTL 4.23e-01 -0.0608 0.0757 0.286 B_Naive1 L2
ENSG00000029363 BCLAF1 982073 sc-eQTL 5.77e-01 0.0242 0.0433 0.286 B_Naive1 L2
ENSG00000112357 PEX7 449360 sc-eQTL 9.18e-02 0.168 0.0993 0.286 B_Naive1 L2
ENSG00000112378 PERP -835495 sc-eQTL 5.96e-01 -0.0464 0.0874 0.286 B_Naive1 L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 -595290 sc-eQTL 9.07e-01 0.00593 0.0507 0.286 B_Naive1 L2
ENSG00000197442 MAP3K5 479447 sc-eQTL 6.24e-01 -0.035 0.0713 0.286 B_Naive1 L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 -596309 sc-eQTL 3.63e-01 0.0723 0.0793 0.286 B_Naive1 L2
ENSG00000027697 IFNGR1 52475 sc-eQTL 5.21e-01 -0.0606 0.0943 0.285 B_Naive2 L2
ENSG00000029363 BCLAF1 982073 sc-eQTL 5.60e-01 0.0319 0.0547 0.285 B_Naive2 L2
ENSG00000112357 PEX7 449360 sc-eQTL 9.27e-01 -0.00942 0.103 0.285 B_Naive2 L2
ENSG00000112378 PERP -835495 sc-eQTL 8.05e-02 0.131 0.0747 0.285 B_Naive2 L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 -595290 sc-eQTL 4.14e-01 -0.0615 0.0751 0.285 B_Naive2 L2
ENSG00000197442 MAP3K5 479447 sc-eQTL 8.20e-01 0.0182 0.08 0.285 B_Naive2 L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 -596309 sc-eQTL 8.36e-01 -0.0202 0.0972 0.285 B_Naive2 L2
ENSG00000027697 IFNGR1 52475 sc-eQTL 9.17e-01 -0.00906 0.0872 0.293 CD4_CTL L2
ENSG00000029363 BCLAF1 982073 sc-eQTL 1.77e-01 0.104 0.077 0.293 CD4_CTL L2
ENSG00000112357 PEX7 449360 sc-eQTL 4.35e-01 -0.0755 0.0966 0.293 CD4_CTL L2
ENSG00000112378 PERP -835495 sc-eQTL 4.21e-01 -0.0789 0.0979 0.293 CD4_CTL L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 -595290 sc-eQTL 4.13e-01 0.0469 0.0571 0.293 CD4_CTL L2
ENSG00000197442 MAP3K5 479447 sc-eQTL 5.88e-01 0.0496 0.0912 0.293 CD4_CTL L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 -596309 sc-eQTL 5.54e-01 -0.0527 0.0889 0.293 CD4_CTL L2
ENSG00000027697 IFNGR1 52475 sc-eQTL 4.35e-02 -0.0972 0.0479 0.286 CD4_Naive L2
ENSG00000029363 BCLAF1 982073 sc-eQTL 8.66e-02 0.0663 0.0385 0.286 CD4_Naive L2
ENSG00000112357 PEX7 449360 sc-eQTL 1.08e-02 -0.231 0.0898 0.286 CD4_Naive L2
ENSG00000112378 PERP -835495 sc-eQTL 1.71e-01 0.103 0.075 0.286 CD4_Naive L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 -595290 sc-eQTL 2.67e-01 0.0587 0.0527 0.286 CD4_Naive L2
ENSG00000197442 MAP3K5 479447 sc-eQTL 9.75e-01 -0.00122 0.0388 0.286 CD4_Naive L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 -596309 sc-eQTL 1.87e-02 0.16 0.0675 0.286 CD4_Naive L2
ENSG00000027697 IFNGR1 52475 sc-eQTL 6.22e-02 -0.123 0.0656 0.286 CD4_TCM L2
ENSG00000029363 BCLAF1 982073 sc-eQTL 6.70e-01 0.0178 0.0417 0.286 CD4_TCM L2
ENSG00000112357 PEX7 449360 sc-eQTL 7.99e-01 -0.0247 0.0971 0.286 CD4_TCM L2
ENSG00000112378 PERP -835495 sc-eQTL 6.65e-01 -0.0356 0.0821 0.286 CD4_TCM L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 -595290 sc-eQTL 4.90e-01 0.033 0.0476 0.286 CD4_TCM L2
ENSG00000197442 MAP3K5 479447 sc-eQTL 9.62e-01 -0.00258 0.0543 0.286 CD4_TCM L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 -596309 sc-eQTL 2.80e-02 0.146 0.066 0.286 CD4_TCM L2
ENSG00000027697 IFNGR1 52475 sc-eQTL 8.12e-01 -0.0177 0.0745 0.286 CD4_TEM L2
ENSG00000029363 BCLAF1 982073 sc-eQTL 7.76e-01 0.015 0.0528 0.286 CD4_TEM L2
ENSG00000112357 PEX7 449360 sc-eQTL 8.70e-02 -0.164 0.0955 0.286 CD4_TEM L2
ENSG00000112378 PERP -835495 sc-eQTL 6.78e-01 -0.0325 0.0779 0.286 CD4_TEM L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 -595290 sc-eQTL 3.14e-01 0.0499 0.0494 0.286 CD4_TEM L2
ENSG00000197442 MAP3K5 479447 sc-eQTL 1.03e-01 0.124 0.076 0.286 CD4_TEM L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 -596309 sc-eQTL 1.08e-01 0.127 0.0789 0.286 CD4_TEM L2
ENSG00000027697 IFNGR1 52475 sc-eQTL 4.39e-03 -0.193 0.0672 0.286 CD8_CTL L2
ENSG00000029363 BCLAF1 982073 sc-eQTL 3.75e-01 0.0406 0.0456 0.286 CD8_CTL L2
ENSG00000112357 PEX7 449360 sc-eQTL 9.60e-01 0.0047 0.0942 0.286 CD8_CTL L2
ENSG00000112378 PERP -835495 sc-eQTL 1.19e-01 -0.141 0.0901 0.286 CD8_CTL L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 -595290 sc-eQTL 3.52e-01 -0.0536 0.0575 0.286 CD8_CTL L2
ENSG00000197442 MAP3K5 479447 sc-eQTL 6.30e-01 -0.0392 0.0813 0.286 CD8_CTL L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 -596309 sc-eQTL 3.60e-03 -0.234 0.0794 0.286 CD8_CTL L2
ENSG00000027697 IFNGR1 52475 sc-eQTL 2.50e-01 -0.0769 0.0668 0.286 CD8_Naive L2
ENSG00000029363 BCLAF1 982073 sc-eQTL 7.70e-01 0.0137 0.0467 0.286 CD8_Naive L2
ENSG00000112357 PEX7 449360 sc-eQTL 4.65e-01 -0.0709 0.0969 0.286 CD8_Naive L2
ENSG00000112378 PERP -835495 sc-eQTL 1.30e-01 0.112 0.0734 0.286 CD8_Naive L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 -595290 sc-eQTL 2.62e-01 0.0588 0.0522 0.286 CD8_Naive L2
ENSG00000197442 MAP3K5 479447 sc-eQTL 4.58e-01 0.0461 0.062 0.286 CD8_Naive L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 -596309 sc-eQTL 1.17e-01 0.121 0.077 0.286 CD8_Naive L2
ENSG00000027697 IFNGR1 52475 sc-eQTL 3.50e-02 -0.188 0.0885 0.294 CD8_TCM L2
ENSG00000029363 BCLAF1 982073 sc-eQTL 4.62e-01 0.0495 0.0671 0.294 CD8_TCM L2
ENSG00000112357 PEX7 449360 sc-eQTL 1.51e-01 -0.147 0.102 0.294 CD8_TCM L2
ENSG00000112378 PERP -835495 sc-eQTL 6.79e-01 0.0417 0.101 0.294 CD8_TCM L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 -595290 sc-eQTL 7.46e-01 0.0157 0.0485 0.294 CD8_TCM L2
ENSG00000197442 MAP3K5 479447 sc-eQTL 5.59e-01 0.0507 0.0865 0.294 CD8_TCM L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 -596309 sc-eQTL 1.65e-01 0.123 0.0883 0.294 CD8_TCM L2
ENSG00000027697 IFNGR1 52475 sc-eQTL 3.57e-03 -0.246 0.0833 0.283 CD8_TEM L2
ENSG00000029363 BCLAF1 982073 sc-eQTL 5.65e-01 0.0463 0.0803 0.283 CD8_TEM L2
ENSG00000112357 PEX7 449360 sc-eQTL 5.34e-01 -0.061 0.0979 0.283 CD8_TEM L2
ENSG00000112378 PERP -835495 sc-eQTL 7.95e-01 0.0265 0.102 0.283 CD8_TEM L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 -595290 sc-eQTL 2.24e-01 -0.0764 0.0626 0.283 CD8_TEM L2
ENSG00000197442 MAP3K5 479447 sc-eQTL 8.52e-01 -0.0182 0.0971 0.283 CD8_TEM L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 -596309 sc-eQTL 9.83e-02 -0.154 0.0925 0.283 CD8_TEM L2
ENSG00000027697 IFNGR1 52475 sc-eQTL 1.56e-01 -0.0988 0.0694 0.288 MAIT L2
ENSG00000029363 BCLAF1 982073 sc-eQTL 1.52e-01 0.083 0.0577 0.288 MAIT L2
ENSG00000112357 PEX7 449360 sc-eQTL 7.58e-01 0.0291 0.0946 0.288 MAIT L2
ENSG00000112378 PERP -835495 sc-eQTL 6.27e-01 0.048 0.0986 0.288 MAIT L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 -595290 sc-eQTL 5.75e-01 -0.0263 0.0469 0.288 MAIT L2
ENSG00000197442 MAP3K5 479447 sc-eQTL 9.30e-01 0.0072 0.0818 0.288 MAIT L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 -596309 sc-eQTL 3.43e-01 -0.0823 0.0866 0.288 MAIT L2
ENSG00000027697 IFNGR1 52475 sc-eQTL 6.05e-03 -0.205 0.0738 0.291 NK_CD56bright L2
ENSG00000029363 BCLAF1 982073 sc-eQTL 7.22e-01 0.0198 0.0555 0.291 NK_CD56bright L2
ENSG00000112357 PEX7 449360 sc-eQTL 9.14e-01 0.0106 0.0981 0.291 NK_CD56bright L2
ENSG00000112378 PERP -835495 sc-eQTL 4.68e-01 0.0638 0.0877 0.291 NK_CD56bright L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 -595290 sc-eQTL 9.47e-01 0.00369 0.056 0.291 NK_CD56bright L2
ENSG00000197442 MAP3K5 479447 sc-eQTL 2.55e-01 0.097 0.0849 0.291 NK_CD56bright L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 -596309 sc-eQTL 4.04e-01 -0.0746 0.0892 0.291 NK_CD56bright L2
ENSG00000027697 IFNGR1 52475 sc-eQTL 3.70e-03 -0.175 0.0595 0.289 NK_CD56dim L2
ENSG00000029363 BCLAF1 982073 sc-eQTL 6.42e-01 -0.0185 0.0396 0.289 NK_CD56dim L2
ENSG00000112357 PEX7 449360 sc-eQTL 2.17e-01 0.129 0.104 0.289 NK_CD56dim L2
ENSG00000112378 PERP -835495 sc-eQTL 9.53e-01 0.00438 0.0735 0.289 NK_CD56dim L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 -595290 sc-eQTL 9.25e-01 -0.0054 0.0572 0.289 NK_CD56dim L2
ENSG00000197442 MAP3K5 479447 sc-eQTL 9.13e-01 0.00895 0.0823 0.289 NK_CD56dim L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 -596309 sc-eQTL 2.26e-01 -0.104 0.0853 0.289 NK_CD56dim L2
ENSG00000027697 IFNGR1 52475 sc-eQTL 2.59e-01 -0.0868 0.0767 0.295 NK_HLA L2
ENSG00000029363 BCLAF1 982073 sc-eQTL 8.76e-01 0.0102 0.0652 0.295 NK_HLA L2
ENSG00000112357 PEX7 449360 sc-eQTL 5.37e-01 -0.0604 0.0976 0.295 NK_HLA L2
ENSG00000112378 PERP -835495 sc-eQTL 3.98e-01 -0.067 0.0791 0.295 NK_HLA L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 -595290 sc-eQTL 1.46e-01 0.0886 0.0607 0.295 NK_HLA L2
ENSG00000197442 MAP3K5 479447 sc-eQTL 5.55e-01 -0.0572 0.0968 0.295 NK_HLA L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 -596309 sc-eQTL 5.69e-01 0.056 0.0982 0.295 NK_HLA L2
ENSG00000027697 IFNGR1 52475 sc-eQTL 4.46e-02 -0.129 0.0636 0.289 NK_cytokine L2
ENSG00000029363 BCLAF1 982073 sc-eQTL 5.04e-01 0.0321 0.0479 0.289 NK_cytokine L2
ENSG00000112357 PEX7 449360 sc-eQTL 9.06e-01 0.012 0.101 0.289 NK_cytokine L2
ENSG00000112378 PERP -835495 sc-eQTL 1.03e-01 0.125 0.076 0.289 NK_cytokine L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 -595290 sc-eQTL 5.71e-01 0.0326 0.0573 0.289 NK_cytokine L2
ENSG00000197442 MAP3K5 479447 sc-eQTL 7.41e-01 0.0261 0.0788 0.289 NK_cytokine L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 -596309 sc-eQTL 2.50e-01 0.0995 0.0862 0.289 NK_cytokine L2
ENSG00000027697 IFNGR1 52475 sc-eQTL 9.44e-01 -0.00788 0.113 0.3 PB L2
ENSG00000029363 BCLAF1 982073 sc-eQTL 7.26e-02 0.173 0.0957 0.3 PB L2
ENSG00000112357 PEX7 449360 sc-eQTL 4.94e-01 -0.0791 0.115 0.3 PB L2
ENSG00000112378 PERP -835495 sc-eQTL 4.41e-01 -0.0557 0.0719 0.3 PB L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 -595290 sc-eQTL 9.95e-01 0.000512 0.0875 0.3 PB L2
ENSG00000197442 MAP3K5 479447 sc-eQTL 1.97e-02 0.23 0.0972 0.3 PB L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 -596309 sc-eQTL 2.52e-02 -0.233 0.103 0.3 PB L2
ENSG00000027697 IFNGR1 52475 sc-eQTL 8.91e-02 -0.131 0.0768 0.287 Pro_T L2
ENSG00000029363 BCLAF1 982073 sc-eQTL 9.24e-01 0.00764 0.0802 0.287 Pro_T L2
ENSG00000112357 PEX7 449360 sc-eQTL 7.78e-01 -0.0265 0.0939 0.287 Pro_T L2
ENSG00000112378 PERP -835495 sc-eQTL 5.16e-01 0.0486 0.0746 0.287 Pro_T L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 -595290 sc-eQTL 8.58e-01 -0.00845 0.0471 0.287 Pro_T L2
ENSG00000197442 MAP3K5 479447 sc-eQTL 4.19e-01 -0.0738 0.0911 0.287 Pro_T L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 -596309 sc-eQTL 5.40e-01 -0.0561 0.0914 0.287 Pro_T L2
ENSG00000027697 IFNGR1 52475 sc-eQTL 4.73e-01 -0.0636 0.0885 0.286 Treg L2
ENSG00000029363 BCLAF1 982073 sc-eQTL 1.86e-01 0.0756 0.057 0.286 Treg L2
ENSG00000112357 PEX7 449360 sc-eQTL 5.24e-01 0.0596 0.0935 0.286 Treg L2
ENSG00000112378 PERP -835495 sc-eQTL 2.14e-01 -0.126 0.101 0.286 Treg L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 -595290 sc-eQTL 2.94e-01 0.0591 0.0561 0.286 Treg L2
ENSG00000197442 MAP3K5 479447 sc-eQTL 8.83e-01 -0.00895 0.061 0.286 Treg L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 -596309 sc-eQTL 4.93e-01 0.0589 0.0858 0.286 Treg L2
ENSG00000027697 IFNGR1 52475 sc-eQTL 3.10e-01 -0.079 0.0776 0.288 cDC L2
ENSG00000029363 BCLAF1 982073 sc-eQTL 8.51e-02 0.135 0.0777 0.288 cDC L2
ENSG00000112357 PEX7 449360 sc-eQTL 1.72e-01 -0.137 0.1 0.288 cDC L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 -595290 sc-eQTL 9.82e-01 -0.00169 0.0767 0.288 cDC L2
ENSG00000135525 MAP7 721105 sc-eQTL 3.77e-01 -0.0793 0.0894 0.288 cDC L2
ENSG00000197442 MAP3K5 479447 sc-eQTL 9.67e-01 0.00331 0.0789 0.288 cDC L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 -596309 sc-eQTL 1.59e-01 0.14 0.0993 0.288 cDC L2
ENSG00000286646 AL121933.2 487879 sc-eQTL 5.05e-01 0.0686 0.103 0.288 cDC L2
ENSG00000027697 IFNGR1 52475 sc-eQTL 2.99e-01 -0.0569 0.0547 0.286 cMono_IL1B L2
ENSG00000029363 BCLAF1 982073 sc-eQTL 4.99e-01 0.0397 0.0587 0.286 cMono_IL1B L2
ENSG00000112357 PEX7 449360 sc-eQTL 3.89e-02 0.203 0.0976 0.286 cMono_IL1B L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 -595290 sc-eQTL 9.16e-01 -0.00621 0.059 0.286 cMono_IL1B L2
ENSG00000135525 MAP7 721105 sc-eQTL 4.03e-01 0.0711 0.0848 0.286 cMono_IL1B L2
ENSG00000197442 MAP3K5 479447 sc-eQTL 5.20e-01 0.0395 0.0613 0.286 cMono_IL1B L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 -596309 sc-eQTL 3.74e-01 -0.056 0.0629 0.286 cMono_IL1B L2
ENSG00000286646 AL121933.2 487879 sc-eQTL 8.84e-01 0.0115 0.0789 0.286 cMono_IL1B L2
ENSG00000027697 IFNGR1 52475 sc-eQTL 4.24e-01 -0.0499 0.0623 0.286 cMono_S100A L2
ENSG00000029363 BCLAF1 982073 sc-eQTL 5.55e-03 0.176 0.063 0.286 cMono_S100A L2
ENSG00000112357 PEX7 449360 sc-eQTL 3.13e-01 -0.101 0.0999 0.286 cMono_S100A L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 -595290 sc-eQTL 4.27e-01 0.044 0.0554 0.286 cMono_S100A L2
ENSG00000135525 MAP7 721105 sc-eQTL 2.04e-01 0.119 0.093 0.286 cMono_S100A L2
ENSG00000197442 MAP3K5 479447 sc-eQTL 3.11e-01 -0.0764 0.0752 0.286 cMono_S100A L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 -596309 sc-eQTL 9.31e-01 0.00691 0.0796 0.286 cMono_S100A L2
ENSG00000286646 AL121933.2 487879 sc-eQTL 2.58e-01 0.0878 0.0775 0.286 cMono_S100A L2
ENSG00000027697 IFNGR1 52475 sc-eQTL 2.42e-03 -0.291 0.0943 0.282 gdT L2
ENSG00000029363 BCLAF1 982073 sc-eQTL 1.97e-02 0.198 0.0841 0.282 gdT L2
ENSG00000112357 PEX7 449360 sc-eQTL 9.21e-01 -0.0122 0.123 0.282 gdT L2
ENSG00000112378 PERP -835495 sc-eQTL 8.45e-02 -0.185 0.107 0.282 gdT L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 -595290 sc-eQTL 2.67e-01 -0.0664 0.0596 0.282 gdT L2
ENSG00000197442 MAP3K5 479447 sc-eQTL 1.12e-01 -0.201 0.126 0.282 gdT L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 -596309 sc-eQTL 6.99e-01 -0.0421 0.108 0.282 gdT L2
ENSG00000027697 IFNGR1 52475 sc-eQTL 3.72e-01 -0.0601 0.0672 0.287 intMono L2
ENSG00000029363 BCLAF1 982073 sc-eQTL 5.45e-01 0.0539 0.0888 0.287 intMono L2
ENSG00000112357 PEX7 449360 sc-eQTL 8.16e-01 -0.0211 0.0908 0.287 intMono L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 -595290 sc-eQTL 2.59e-01 -0.0656 0.058 0.287 intMono L2
ENSG00000135525 MAP7 721105 sc-eQTL 3.88e-01 -0.0772 0.0892 0.287 intMono L2
ENSG00000197442 MAP3K5 479447 sc-eQTL 5.25e-01 0.0602 0.0945 0.287 intMono L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 -596309 sc-eQTL 6.65e-01 -0.0375 0.0866 0.287 intMono L2
ENSG00000286646 AL121933.2 487879 sc-eQTL 7.76e-01 -0.0284 0.0999 0.287 intMono L2
ENSG00000027697 IFNGR1 52475 sc-eQTL 3.19e-01 -0.079 0.0791 0.285 ncMono L2
ENSG00000029363 BCLAF1 982073 sc-eQTL 2.59e-01 -0.0695 0.0614 0.285 ncMono L2
ENSG00000112357 PEX7 449360 sc-eQTL 4.63e-01 0.0722 0.0981 0.285 ncMono L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 -595290 sc-eQTL 8.69e-01 -0.0116 0.0702 0.285 ncMono L2
ENSG00000135525 MAP7 721105 sc-eQTL 1.97e-01 0.112 0.0864 0.285 ncMono L2
ENSG00000197442 MAP3K5 479447 sc-eQTL 3.92e-01 -0.078 0.091 0.285 ncMono L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 -596309 sc-eQTL 6.20e-01 0.0435 0.0877 0.285 ncMono L2
ENSG00000286646 AL121933.2 487879 sc-eQTL 5.73e-01 -0.0521 0.0924 0.285 ncMono L2
ENSG00000027697 IFNGR1 52475 sc-eQTL 7.51e-01 0.0295 0.0926 0.291 pDC L2
ENSG00000029363 BCLAF1 982073 sc-eQTL 3.18e-01 0.0694 0.0692 0.291 pDC L2
ENSG00000112357 PEX7 449360 sc-eQTL 7.58e-01 0.0315 0.102 0.291 pDC L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 -595290 sc-eQTL 1.03e-01 -0.14 0.0851 0.291 pDC L2
ENSG00000135525 MAP7 721105 sc-eQTL 6.52e-01 -0.0321 0.0712 0.291 pDC L2
ENSG00000197442 MAP3K5 479447 sc-eQTL 4.81e-01 -0.0804 0.114 0.291 pDC L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 -596309 sc-eQTL 4.28e-01 0.0691 0.087 0.291 pDC L2
ENSG00000286646 AL121933.2 487879 sc-eQTL 2.11e-01 -0.131 0.105 0.291 pDC L2
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000027697 IFNGR1 52475 sc-eQTL 4.71e-01 -0.0578 0.08 0.286 B_Memory LOneK1K
ENSG00000029363 BCLAF1 982073 sc-eQTL 8.03e-02 0.0785 0.0446 0.286 B_Memory LOneK1K
ENSG00000112357 PEX7 449360 sc-eQTL 5.07e-01 -0.0611 0.092 0.286 B_Memory LOneK1K
ENSG00000112378 PERP -835495 sc-eQTL 1.18e-01 -0.133 0.0851 0.286 B_Memory LOneK1K
ENSG00000118503 TNFAIP3 -595290 sc-eQTL 5.40e-02 -0.109 0.056 0.286 B_Memory LOneK1K
ENSG00000197442 MAP3K5 479447 sc-eQTL 1.49e-01 -0.108 0.0744 0.286 B_Memory LOneK1K
ENSG00000237499 WAKMAR2 -596309 sc-eQTL 6.38e-01 -0.045 0.0955 0.286 B_Memory LOneK1K
ENSG00000027697 IFNGR1 52475 sc-eQTL 4.72e-01 -0.0583 0.081 0.286 B_Naive LOneK1K
ENSG00000029363 BCLAF1 982073 sc-eQTL 6.27e-01 0.0181 0.0372 0.286 B_Naive LOneK1K
ENSG00000112357 PEX7 449360 sc-eQTL 1.60e-01 0.138 0.0982 0.286 B_Naive LOneK1K
ENSG00000112378 PERP -835495 sc-eQTL 8.06e-01 -0.0217 0.0883 0.286 B_Naive LOneK1K
ENSG00000118503 TNFAIP3 -595290 sc-eQTL 6.44e-01 -0.0215 0.0464 0.286 B_Naive LOneK1K
ENSG00000197442 MAP3K5 479447 sc-eQTL 6.23e-01 -0.0335 0.068 0.286 B_Naive LOneK1K
ENSG00000237499 WAKMAR2 -596309 sc-eQTL 7.63e-01 0.025 0.0826 0.286 B_Naive LOneK1K
ENSG00000027697 IFNGR1 52475 sc-eQTL 4.68e-01 -0.0393 0.0541 0.286 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000029363 BCLAF1 982073 sc-eQTL 2.45e-01 0.0586 0.0502 0.286 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000112357 PEX7 449360 sc-eQTL 2.32e-01 0.116 0.0968 0.286 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000118503 TNFAIP3 -595290 sc-eQTL 7.64e-01 -0.015 0.0501 0.286 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000135525 MAP7 721105 sc-eQTL 2.57e-01 0.0985 0.0866 0.286 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000197442 MAP3K5 479447 sc-eQTL 9.55e-01 -0.00331 0.0587 0.286 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000237499 WAKMAR2 -596309 sc-eQTL 5.29e-01 -0.0378 0.0599 0.286 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000286646 AL121933.2 487879 sc-eQTL 1.80e-01 0.0936 0.0695 0.286 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000027697 IFNGR1 52475 sc-eQTL 1.27e-01 -0.0983 0.0641 0.287 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000029363 BCLAF1 982073 sc-eQTL 7.29e-01 -0.0202 0.0583 0.287 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000112357 PEX7 449360 sc-eQTL 9.03e-01 0.0118 0.0974 0.287 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000118503 TNFAIP3 -595290 sc-eQTL 2.20e-01 -0.0738 0.0601 0.287 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000135525 MAP7 721105 sc-eQTL 7.35e-01 0.0319 0.0941 0.287 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000197442 MAP3K5 479447 sc-eQTL 7.87e-01 -0.0209 0.0773 0.287 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000237499 WAKMAR2 -596309 sc-eQTL 9.47e-01 -0.00542 0.0808 0.287 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000286646 AL121933.2 487879 sc-eQTL 1.63e-01 -0.128 0.0913 0.287 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000027697 IFNGR1 52475 sc-eQTL 3.63e-02 -0.129 0.0612 0.289 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000029363 BCLAF1 982073 sc-eQTL 8.87e-01 0.0051 0.0359 0.289 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000112357 PEX7 449360 sc-eQTL 4.13e-01 0.0855 0.104 0.289 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000112378 PERP -835495 sc-eQTL 5.32e-01 0.0405 0.0647 0.289 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000118503 TNFAIP3 -595290 sc-eQTL 6.37e-01 0.0266 0.0564 0.289 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000197442 MAP3K5 479447 sc-eQTL 7.98e-01 0.0195 0.0762 0.289 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000237499 WAKMAR2 -596309 sc-eQTL 6.23e-01 -0.0389 0.0789 0.289 NK_CD56dim LOneK1K


Statistical fine-mapping results from Japan COVID-19 Task Force
(Shown only for PIP>0.001)
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
PIP (SuSiE)
PIP (FINEMAP)
MAF
ENSG00000118503 TNFAIP3 -595290 eQTL 0.00556 0.0413 0.0149 0.00207 0.0 0.303
ENSG00000135525 MAP7 721105 eQTL 0.0195 0.0633 0.027 0.00119 0.0 0.303


Expression Modifier Score(EMS) for GTEx 49tissues
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Whole Blood
Muscle Skeletal
Liver
Brain Cerebellum
Prostate
Spleen
Skin Sun Exposed Lower leg
Artery Coronary
Esophagus Muscularis
Esophagus Gastroesophageal Junction
Artery Tibial
Heart Atrial Appendage
Nerve Tibial
Heart Left Ventricle
Adrenal Gland
Adipose Visceral Omentum
Pancreas
Lung
Pituitary
Brain Nucleus accumbens basal ganglia
Colon Transverse
Adipose Subcutaneous
Esophagus Mucosa
Brain Cortex
Thyroid
Stomach
Breast Mammary Tissue
Colon Sigmoid
Skin Not Sun Exposed Suprapubic
Testis
Artery Aorta
Brain Amygdala
Brain Anterior cingulate cortex BA24
Brain Caudate basal ganglia
Brain Cerebellar Hemisphere
Brain Frontal Cortex BA9
Brain Hippocampus
Brain Hypothalamus
Brain Putamen basal ganglia
Brain Spinal cord cervical c-1
Brain Substantia nigra
Cells Cultured fibroblasts
Cells EBV-transformed lymphocytes
Kidney Cortex
Minor Salivary Gland
Ovary
Small Intestine Terminal Ileum
Uterus
Vagina