logo

Genes within 1Mb (chr6:137270272:A:G):

View on , UCSC , GTEx , gnomAD

Immune cell-type specific single cell cis-eQTLs in OASIS
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000027697 IFNGR1 50823 sc-eQTL 5.35e-01 -0.0932 0.15 0.06 B L1
ENSG00000029363 BCLAF1 980421 sc-eQTL 7.38e-01 -0.0224 0.0669 0.06 B L1
ENSG00000112357 PEX7 447708 sc-eQTL 2.69e-01 0.197 0.177 0.06 B L1
ENSG00000112378 PERP -837147 sc-eQTL 2.59e-01 -0.133 0.117 0.06 B L1
ENSG00000118503 TNFAIP3 -596942 sc-eQTL 4.64e-01 0.0696 0.0948 0.06 B L1
ENSG00000197442 MAP3K5 477795 sc-eQTL 9.55e-02 0.22 0.131 0.06 B L1
ENSG00000237499 WAKMAR2 -597961 sc-eQTL 6.06e-01 -0.0771 0.149 0.06 B L1
ENSG00000027697 IFNGR1 50823 sc-eQTL 9.21e-01 -0.00996 0.101 0.06 CD4T L1
ENSG00000029363 BCLAF1 980421 sc-eQTL 2.12e-01 -0.0949 0.0758 0.06 CD4T L1
ENSG00000112357 PEX7 447708 sc-eQTL 9.03e-01 -0.0198 0.162 0.06 CD4T L1
ENSG00000112378 PERP -837147 sc-eQTL 5.28e-01 -0.0686 0.109 0.06 CD4T L1
ENSG00000118503 TNFAIP3 -596942 sc-eQTL 3.91e-01 -0.0875 0.102 0.06 CD4T L1
ENSG00000197442 MAP3K5 477795 sc-eQTL 5.35e-01 -0.0482 0.0775 0.06 CD4T L1
ENSG00000237499 WAKMAR2 -597961 sc-eQTL 2.70e-02 -0.282 0.127 0.06 CD4T L1
ENSG00000027697 IFNGR1 50823 sc-eQTL 4.15e-01 -0.0941 0.115 0.06 CD8T L1
ENSG00000029363 BCLAF1 980421 sc-eQTL 9.62e-01 0.00368 0.0781 0.06 CD8T L1
ENSG00000112357 PEX7 447708 sc-eQTL 2.69e-01 0.213 0.192 0.06 CD8T L1
ENSG00000112378 PERP -837147 sc-eQTL 2.91e-01 0.133 0.125 0.06 CD8T L1
ENSG00000118503 TNFAIP3 -596942 sc-eQTL 4.19e-01 0.0785 0.0969 0.06 CD8T L1
ENSG00000197442 MAP3K5 477795 sc-eQTL 9.79e-01 -0.00276 0.103 0.06 CD8T L1
ENSG00000237499 WAKMAR2 -597961 sc-eQTL 1.69e-01 -0.196 0.142 0.06 CD8T L1
ENSG00000027697 IFNGR1 50823 sc-eQTL 5.74e-01 -0.0774 0.137 0.061 DC L1
ENSG00000029363 BCLAF1 980421 sc-eQTL 2.17e-01 0.153 0.123 0.061 DC L1
ENSG00000112357 PEX7 447708 sc-eQTL 7.21e-01 -0.0693 0.193 0.061 DC L1
ENSG00000118503 TNFAIP3 -596942 sc-eQTL 1.90e-01 -0.192 0.146 0.061 DC L1
ENSG00000135525 MAP7 719453 sc-eQTL 7.37e-01 0.0536 0.159 0.061 DC L1
ENSG00000197442 MAP3K5 477795 sc-eQTL 6.21e-01 -0.0754 0.152 0.061 DC L1
ENSG00000237499 WAKMAR2 -597961 sc-eQTL 8.10e-01 -0.0361 0.15 0.061 DC L1
ENSG00000286646 AL121933.2 486227 sc-eQTL 7.35e-01 0.0675 0.199 0.061 DC L1
ENSG00000027697 IFNGR1 50823 sc-eQTL 6.26e-01 -0.0563 0.115 0.06 Mono L1
ENSG00000029363 BCLAF1 980421 sc-eQTL 6.55e-01 -0.0442 0.0987 0.06 Mono L1
ENSG00000112357 PEX7 447708 sc-eQTL 5.31e-03 -0.538 0.191 0.06 Mono L1
ENSG00000118503 TNFAIP3 -596942 sc-eQTL 3.86e-01 0.0849 0.0978 0.06 Mono L1
ENSG00000135525 MAP7 719453 sc-eQTL 7.05e-01 -0.0649 0.171 0.06 Mono L1
ENSG00000197442 MAP3K5 477795 sc-eQTL 2.63e-01 0.128 0.114 0.06 Mono L1
ENSG00000237499 WAKMAR2 -597961 sc-eQTL 3.47e-01 0.114 0.121 0.06 Mono L1
ENSG00000286646 AL121933.2 486227 sc-eQTL 4.64e-01 -0.102 0.138 0.06 Mono L1
ENSG00000027697 IFNGR1 50823 sc-eQTL 1.36e-01 -0.189 0.126 0.06 NK L1
ENSG00000029363 BCLAF1 980421 sc-eQTL 6.70e-01 -0.0288 0.0675 0.06 NK L1
ENSG00000112357 PEX7 447708 sc-eQTL 3.86e-01 0.17 0.196 0.06 NK L1
ENSG00000112378 PERP -837147 sc-eQTL 2.98e-01 -0.129 0.123 0.06 NK L1
ENSG00000118503 TNFAIP3 -596942 sc-eQTL 4.87e-01 -0.0736 0.106 0.06 NK L1
ENSG00000197442 MAP3K5 477795 sc-eQTL 7.33e-01 -0.0518 0.152 0.06 NK L1
ENSG00000237499 WAKMAR2 -597961 sc-eQTL 1.12e-01 -0.238 0.149 0.06 NK L1
ENSG00000027697 IFNGR1 50823 sc-eQTL 5.73e-01 -0.0673 0.119 0.06 Other_T L1
ENSG00000029363 BCLAF1 980421 sc-eQTL 2.62e-01 -0.112 0.0997 0.06 Other_T L1
ENSG00000112357 PEX7 447708 sc-eQTL 8.68e-01 -0.0324 0.194 0.06 Other_T L1
ENSG00000112378 PERP -837147 sc-eQTL 5.32e-01 -0.0975 0.156 0.06 Other_T L1
ENSG00000118503 TNFAIP3 -596942 sc-eQTL 2.21e-01 0.0908 0.0739 0.06 Other_T L1
ENSG00000197442 MAP3K5 477795 sc-eQTL 6.51e-01 0.0649 0.143 0.06 Other_T L1
ENSG00000237499 WAKMAR2 -597961 sc-eQTL 5.49e-01 0.0882 0.147 0.06 Other_T L1
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000027697 IFNGR1 50823 sc-eQTL 6.24e-01 -0.0994 0.203 0.061 B_Activated L2
ENSG00000029363 BCLAF1 980421 sc-eQTL 6.72e-01 0.0697 0.165 0.061 B_Activated L2
ENSG00000112357 PEX7 447708 sc-eQTL 5.87e-01 -0.109 0.199 0.061 B_Activated L2
ENSG00000112378 PERP -837147 sc-eQTL 7.67e-01 -0.0306 0.103 0.061 B_Activated L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 -596942 sc-eQTL 6.60e-02 0.367 0.198 0.061 B_Activated L2
ENSG00000197442 MAP3K5 477795 sc-eQTL 2.11e-01 0.28 0.223 0.061 B_Activated L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 -597961 sc-eQTL 5.33e-01 0.109 0.175 0.061 B_Activated L2
ENSG00000027697 IFNGR1 50823 sc-eQTL 6.93e-01 0.0692 0.175 0.06 B_Intermediate L2
ENSG00000029363 BCLAF1 980421 sc-eQTL 7.80e-01 -0.0279 0.0998 0.06 B_Intermediate L2
ENSG00000112357 PEX7 447708 sc-eQTL 5.95e-01 0.0977 0.183 0.06 B_Intermediate L2
ENSG00000112378 PERP -837147 sc-eQTL 7.61e-01 0.0509 0.167 0.06 B_Intermediate L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 -596942 sc-eQTL 3.07e-01 0.134 0.131 0.06 B_Intermediate L2
ENSG00000197442 MAP3K5 477795 sc-eQTL 1.26e-02 0.393 0.156 0.06 B_Intermediate L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 -597961 sc-eQTL 1.68e-02 -0.443 0.184 0.06 B_Intermediate L2
ENSG00000027697 IFNGR1 50823 sc-eQTL 6.73e-01 -0.0806 0.191 0.06 B_Memory L2
ENSG00000029363 BCLAF1 980421 sc-eQTL 3.95e-01 -0.0965 0.113 0.06 B_Memory L2
ENSG00000112357 PEX7 447708 sc-eQTL 9.69e-02 0.32 0.192 0.06 B_Memory L2
ENSG00000112378 PERP -837147 sc-eQTL 8.32e-01 0.0385 0.181 0.06 B_Memory L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 -596942 sc-eQTL 2.91e-01 0.132 0.125 0.06 B_Memory L2
ENSG00000197442 MAP3K5 477795 sc-eQTL 2.68e-01 0.189 0.17 0.06 B_Memory L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 -597961 sc-eQTL 7.27e-01 -0.0649 0.186 0.06 B_Memory L2
ENSG00000027697 IFNGR1 50823 sc-eQTL 5.36e-01 -0.0929 0.15 0.06 B_Naive1 L2
ENSG00000029363 BCLAF1 980421 sc-eQTL 8.85e-01 0.0124 0.0857 0.06 B_Naive1 L2
ENSG00000112357 PEX7 447708 sc-eQTL 8.22e-01 0.0446 0.198 0.06 B_Naive1 L2
ENSG00000112378 PERP -837147 sc-eQTL 2.23e-02 -0.394 0.171 0.06 B_Naive1 L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 -596942 sc-eQTL 2.02e-01 0.128 0.1 0.06 B_Naive1 L2
ENSG00000197442 MAP3K5 477795 sc-eQTL 2.12e-01 0.176 0.141 0.06 B_Naive1 L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 -597961 sc-eQTL 4.83e-01 0.11 0.157 0.06 B_Naive1 L2
ENSG00000027697 IFNGR1 50823 sc-eQTL 6.51e-01 -0.083 0.183 0.06 B_Naive2 L2
ENSG00000029363 BCLAF1 980421 sc-eQTL 2.89e-01 0.113 0.106 0.06 B_Naive2 L2
ENSG00000112357 PEX7 447708 sc-eQTL 7.57e-01 0.0622 0.201 0.06 B_Naive2 L2
ENSG00000112378 PERP -837147 sc-eQTL 7.26e-01 -0.0512 0.146 0.06 B_Naive2 L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 -596942 sc-eQTL 8.72e-01 0.0236 0.146 0.06 B_Naive2 L2
ENSG00000197442 MAP3K5 477795 sc-eQTL 5.24e-01 -0.099 0.155 0.06 B_Naive2 L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 -597961 sc-eQTL 8.78e-02 0.322 0.187 0.06 B_Naive2 L2
ENSG00000027697 IFNGR1 50823 sc-eQTL 6.81e-01 0.0717 0.174 0.059 CD4_CTL L2
ENSG00000029363 BCLAF1 980421 sc-eQTL 7.38e-01 0.0517 0.155 0.059 CD4_CTL L2
ENSG00000112357 PEX7 447708 sc-eQTL 2.70e-01 -0.213 0.193 0.059 CD4_CTL L2
ENSG00000112378 PERP -837147 sc-eQTL 9.58e-01 0.0102 0.196 0.059 CD4_CTL L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 -596942 sc-eQTL 9.53e-01 -0.00668 0.114 0.059 CD4_CTL L2
ENSG00000197442 MAP3K5 477795 sc-eQTL 6.35e-01 0.0866 0.182 0.059 CD4_CTL L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 -597961 sc-eQTL 8.18e-01 -0.0409 0.178 0.059 CD4_CTL L2
ENSG00000027697 IFNGR1 50823 sc-eQTL 7.71e-01 0.0277 0.0952 0.06 CD4_Naive L2
ENSG00000029363 BCLAF1 980421 sc-eQTL 1.04e-01 -0.124 0.076 0.06 CD4_Naive L2
ENSG00000112357 PEX7 447708 sc-eQTL 3.29e-01 0.175 0.179 0.06 CD4_Naive L2
ENSG00000112378 PERP -837147 sc-eQTL 5.26e-01 0.0942 0.148 0.06 CD4_Naive L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 -596942 sc-eQTL 2.50e-01 -0.12 0.104 0.06 CD4_Naive L2
ENSG00000197442 MAP3K5 477795 sc-eQTL 3.38e-01 -0.0732 0.0763 0.06 CD4_Naive L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 -597961 sc-eQTL 5.35e-02 -0.26 0.134 0.06 CD4_Naive L2
ENSG00000027697 IFNGR1 50823 sc-eQTL 8.50e-01 -0.0254 0.135 0.06 CD4_TCM L2
ENSG00000029363 BCLAF1 980421 sc-eQTL 3.53e-01 -0.0789 0.0848 0.06 CD4_TCM L2
ENSG00000112357 PEX7 447708 sc-eQTL 8.23e-01 -0.0442 0.198 0.06 CD4_TCM L2
ENSG00000112378 PERP -837147 sc-eQTL 1.39e-01 -0.247 0.166 0.06 CD4_TCM L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 -596942 sc-eQTL 4.04e-01 -0.081 0.0969 0.06 CD4_TCM L2
ENSG00000197442 MAP3K5 477795 sc-eQTL 3.87e-01 0.0956 0.11 0.06 CD4_TCM L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 -597961 sc-eQTL 5.06e-02 -0.265 0.135 0.06 CD4_TCM L2
ENSG00000027697 IFNGR1 50823 sc-eQTL 2.56e-01 -0.172 0.151 0.06 CD4_TEM L2
ENSG00000029363 BCLAF1 980421 sc-eQTL 4.19e-01 -0.087 0.107 0.06 CD4_TEM L2
ENSG00000112357 PEX7 447708 sc-eQTL 6.98e-01 0.0761 0.196 0.06 CD4_TEM L2
ENSG00000112378 PERP -837147 sc-eQTL 5.04e-01 -0.106 0.158 0.06 CD4_TEM L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 -596942 sc-eQTL 8.40e-01 0.0204 0.101 0.06 CD4_TEM L2
ENSG00000197442 MAP3K5 477795 sc-eQTL 6.99e-01 -0.0602 0.155 0.06 CD4_TEM L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 -597961 sc-eQTL 1.33e-01 -0.242 0.161 0.06 CD4_TEM L2
ENSG00000027697 IFNGR1 50823 sc-eQTL 7.62e-01 -0.042 0.138 0.06 CD8_CTL L2
ENSG00000029363 BCLAF1 980421 sc-eQTL 8.45e-01 -0.018 0.0922 0.06 CD8_CTL L2
ENSG00000112357 PEX7 447708 sc-eQTL 3.23e-01 0.188 0.19 0.06 CD8_CTL L2
ENSG00000112378 PERP -837147 sc-eQTL 5.04e-01 0.122 0.183 0.06 CD8_CTL L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 -596942 sc-eQTL 6.55e-01 0.052 0.116 0.06 CD8_CTL L2
ENSG00000197442 MAP3K5 477795 sc-eQTL 4.37e-01 -0.128 0.164 0.06 CD8_CTL L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 -597961 sc-eQTL 2.88e-01 0.174 0.163 0.06 CD8_CTL L2
ENSG00000027697 IFNGR1 50823 sc-eQTL 3.95e-02 -0.277 0.134 0.06 CD8_Naive L2
ENSG00000029363 BCLAF1 980421 sc-eQTL 5.28e-01 -0.0596 0.0943 0.06 CD8_Naive L2
ENSG00000112357 PEX7 447708 sc-eQTL 9.86e-01 0.00345 0.196 0.06 CD8_Naive L2
ENSG00000112378 PERP -837147 sc-eQTL 6.51e-02 -0.274 0.148 0.06 CD8_Naive L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 -596942 sc-eQTL 5.79e-01 -0.0587 0.106 0.06 CD8_Naive L2
ENSG00000197442 MAP3K5 477795 sc-eQTL 9.55e-01 -0.0071 0.125 0.06 CD8_Naive L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 -597961 sc-eQTL 4.55e-02 -0.312 0.155 0.06 CD8_Naive L2
ENSG00000027697 IFNGR1 50823 sc-eQTL 4.61e-01 -0.133 0.18 0.058 CD8_TCM L2
ENSG00000029363 BCLAF1 980421 sc-eQTL 1.86e-01 -0.179 0.135 0.058 CD8_TCM L2
ENSG00000112357 PEX7 447708 sc-eQTL 1.90e-01 0.271 0.206 0.058 CD8_TCM L2
ENSG00000112378 PERP -837147 sc-eQTL 5.77e-02 0.383 0.201 0.058 CD8_TCM L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 -596942 sc-eQTL 9.80e-02 0.161 0.0971 0.058 CD8_TCM L2
ENSG00000197442 MAP3K5 477795 sc-eQTL 8.93e-01 -0.0234 0.174 0.058 CD8_TCM L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 -597961 sc-eQTL 1.93e-01 -0.233 0.178 0.058 CD8_TCM L2
ENSG00000027697 IFNGR1 50823 sc-eQTL 4.44e-01 -0.132 0.171 0.062 CD8_TEM L2
ENSG00000029363 BCLAF1 980421 sc-eQTL 9.89e-01 0.00221 0.162 0.062 CD8_TEM L2
ENSG00000112357 PEX7 447708 sc-eQTL 3.65e-01 0.179 0.197 0.062 CD8_TEM L2
ENSG00000112378 PERP -837147 sc-eQTL 2.39e-01 -0.242 0.205 0.062 CD8_TEM L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 -596942 sc-eQTL 1.64e-01 0.176 0.126 0.062 CD8_TEM L2
ENSG00000197442 MAP3K5 477795 sc-eQTL 6.34e-02 0.362 0.194 0.062 CD8_TEM L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 -597961 sc-eQTL 1.54e-01 -0.268 0.187 0.062 CD8_TEM L2
ENSG00000027697 IFNGR1 50823 sc-eQTL 1.49e-01 -0.2 0.138 0.058 MAIT L2
ENSG00000029363 BCLAF1 980421 sc-eQTL 8.18e-01 0.0267 0.115 0.058 MAIT L2
ENSG00000112357 PEX7 447708 sc-eQTL 9.57e-01 0.0101 0.188 0.058 MAIT L2
ENSG00000112378 PERP -837147 sc-eQTL 7.06e-01 -0.0742 0.196 0.058 MAIT L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 -596942 sc-eQTL 6.27e-01 0.0455 0.0934 0.058 MAIT L2
ENSG00000197442 MAP3K5 477795 sc-eQTL 4.57e-01 0.121 0.163 0.058 MAIT L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 -597961 sc-eQTL 8.90e-01 0.024 0.173 0.058 MAIT L2
ENSG00000027697 IFNGR1 50823 sc-eQTL 2.20e-02 -0.342 0.148 0.062 NK_CD56bright L2
ENSG00000029363 BCLAF1 980421 sc-eQTL 4.51e-01 -0.0835 0.111 0.062 NK_CD56bright L2
ENSG00000112357 PEX7 447708 sc-eQTL 6.95e-01 -0.0767 0.195 0.062 NK_CD56bright L2
ENSG00000112378 PERP -837147 sc-eQTL 6.93e-01 0.0691 0.175 0.062 NK_CD56bright L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 -596942 sc-eQTL 9.67e-01 -0.00469 0.112 0.062 NK_CD56bright L2
ENSG00000197442 MAP3K5 477795 sc-eQTL 5.52e-01 0.101 0.17 0.062 NK_CD56bright L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 -597961 sc-eQTL 4.60e-01 -0.132 0.178 0.062 NK_CD56bright L2
ENSG00000027697 IFNGR1 50823 sc-eQTL 7.23e-01 -0.0418 0.118 0.06 NK_CD56dim L2
ENSG00000029363 BCLAF1 980421 sc-eQTL 9.01e-01 0.0096 0.0769 0.06 NK_CD56dim L2
ENSG00000112357 PEX7 447708 sc-eQTL 5.98e-01 0.107 0.203 0.06 NK_CD56dim L2
ENSG00000112378 PERP -837147 sc-eQTL 8.41e-01 -0.0285 0.143 0.06 NK_CD56dim L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 -596942 sc-eQTL 3.95e-01 -0.0942 0.111 0.06 NK_CD56dim L2
ENSG00000197442 MAP3K5 477795 sc-eQTL 4.17e-01 -0.13 0.159 0.06 NK_CD56dim L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 -597961 sc-eQTL 1.42e-02 -0.405 0.164 0.06 NK_CD56dim L2
ENSG00000027697 IFNGR1 50823 sc-eQTL 6.32e-01 -0.0706 0.147 0.064 NK_HLA L2
ENSG00000029363 BCLAF1 980421 sc-eQTL 8.27e-01 -0.0273 0.125 0.064 NK_HLA L2
ENSG00000112357 PEX7 447708 sc-eQTL 8.01e-01 -0.0473 0.187 0.064 NK_HLA L2
ENSG00000112378 PERP -837147 sc-eQTL 6.89e-02 -0.275 0.15 0.064 NK_HLA L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 -596942 sc-eQTL 8.51e-01 0.0219 0.117 0.064 NK_HLA L2
ENSG00000197442 MAP3K5 477795 sc-eQTL 6.76e-01 0.0777 0.185 0.064 NK_HLA L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 -597961 sc-eQTL 9.50e-01 0.0117 0.188 0.064 NK_HLA L2
ENSG00000027697 IFNGR1 50823 sc-eQTL 2.57e-01 -0.14 0.123 0.06 NK_cytokine L2
ENSG00000029363 BCLAF1 980421 sc-eQTL 4.34e-01 -0.0723 0.0922 0.06 NK_cytokine L2
ENSG00000112357 PEX7 447708 sc-eQTL 8.33e-01 -0.041 0.194 0.06 NK_cytokine L2
ENSG00000112378 PERP -837147 sc-eQTL 9.70e-01 0.00553 0.147 0.06 NK_cytokine L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 -596942 sc-eQTL 3.14e-01 -0.111 0.11 0.06 NK_cytokine L2
ENSG00000197442 MAP3K5 477795 sc-eQTL 5.44e-01 -0.0923 0.152 0.06 NK_cytokine L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 -597961 sc-eQTL 9.92e-01 0.00171 0.167 0.06 NK_cytokine L2
ENSG00000027697 IFNGR1 50823 sc-eQTL 8.98e-01 -0.0337 0.261 0.056 PB L2
ENSG00000029363 BCLAF1 980421 sc-eQTL 8.31e-01 0.0483 0.225 0.056 PB L2
ENSG00000112357 PEX7 447708 sc-eQTL 8.40e-01 -0.0542 0.268 0.056 PB L2
ENSG00000112378 PERP -837147 sc-eQTL 3.16e-01 -0.168 0.167 0.056 PB L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 -596942 sc-eQTL 6.54e-01 0.0912 0.203 0.056 PB L2
ENSG00000197442 MAP3K5 477795 sc-eQTL 8.79e-02 -0.392 0.228 0.056 PB L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 -597961 sc-eQTL 7.23e-01 -0.0864 0.244 0.056 PB L2
ENSG00000027697 IFNGR1 50823 sc-eQTL 6.69e-01 -0.0663 0.155 0.061 Pro_T L2
ENSG00000029363 BCLAF1 980421 sc-eQTL 8.80e-01 0.0242 0.161 0.061 Pro_T L2
ENSG00000112357 PEX7 447708 sc-eQTL 8.63e-01 0.0326 0.188 0.061 Pro_T L2
ENSG00000112378 PERP -837147 sc-eQTL 3.68e-01 -0.135 0.149 0.061 Pro_T L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 -596942 sc-eQTL 7.41e-01 0.0313 0.0944 0.061 Pro_T L2
ENSG00000197442 MAP3K5 477795 sc-eQTL 6.60e-01 0.0806 0.183 0.061 Pro_T L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 -597961 sc-eQTL 5.25e-01 -0.117 0.183 0.061 Pro_T L2
ENSG00000027697 IFNGR1 50823 sc-eQTL 3.11e-01 -0.182 0.179 0.06 Treg L2
ENSG00000029363 BCLAF1 980421 sc-eQTL 5.85e-01 -0.0633 0.116 0.06 Treg L2
ENSG00000112357 PEX7 447708 sc-eQTL 1.24e-02 -0.47 0.186 0.06 Treg L2
ENSG00000112378 PERP -837147 sc-eQTL 9.80e-01 -0.00525 0.205 0.06 Treg L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 -596942 sc-eQTL 3.26e-01 0.112 0.114 0.06 Treg L2
ENSG00000197442 MAP3K5 477795 sc-eQTL 3.05e-01 0.126 0.123 0.06 Treg L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 -597961 sc-eQTL 4.78e-01 0.123 0.173 0.06 Treg L2
ENSG00000027697 IFNGR1 50823 sc-eQTL 3.38e-01 -0.151 0.157 0.059 cDC L2
ENSG00000029363 BCLAF1 980421 sc-eQTL 2.93e-01 -0.167 0.158 0.059 cDC L2
ENSG00000112357 PEX7 447708 sc-eQTL 6.86e-01 -0.0825 0.204 0.059 cDC L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 -596942 sc-eQTL 2.96e-01 -0.162 0.155 0.059 cDC L2
ENSG00000135525 MAP7 719453 sc-eQTL 9.36e-01 0.0147 0.182 0.059 cDC L2
ENSG00000197442 MAP3K5 477795 sc-eQTL 9.03e-01 -0.0195 0.16 0.059 cDC L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 -597961 sc-eQTL 6.54e-01 -0.0907 0.202 0.059 cDC L2
ENSG00000286646 AL121933.2 486227 sc-eQTL 1.54e-01 0.296 0.207 0.059 cDC L2
ENSG00000027697 IFNGR1 50823 sc-eQTL 7.75e-01 0.0306 0.107 0.06 cMono_IL1B L2
ENSG00000029363 BCLAF1 980421 sc-eQTL 6.68e-01 -0.0491 0.115 0.06 cMono_IL1B L2
ENSG00000112357 PEX7 447708 sc-eQTL 1.70e-03 -0.597 0.188 0.06 cMono_IL1B L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 -596942 sc-eQTL 1.51e-01 0.165 0.114 0.06 cMono_IL1B L2
ENSG00000135525 MAP7 719453 sc-eQTL 3.92e-01 -0.142 0.165 0.06 cMono_IL1B L2
ENSG00000197442 MAP3K5 477795 sc-eQTL 3.17e-01 -0.12 0.119 0.06 cMono_IL1B L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 -597961 sc-eQTL 2.66e-01 0.137 0.122 0.06 cMono_IL1B L2
ENSG00000286646 AL121933.2 486227 sc-eQTL 8.19e-01 -0.0353 0.154 0.06 cMono_IL1B L2
ENSG00000027697 IFNGR1 50823 sc-eQTL 2.29e-01 -0.153 0.127 0.06 cMono_S100A L2
ENSG00000029363 BCLAF1 980421 sc-eQTL 8.78e-01 0.0202 0.131 0.06 cMono_S100A L2
ENSG00000112357 PEX7 447708 sc-eQTL 9.22e-01 0.0201 0.204 0.06 cMono_S100A L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 -596942 sc-eQTL 8.15e-01 -0.0265 0.113 0.06 cMono_S100A L2
ENSG00000135525 MAP7 719453 sc-eQTL 6.30e-01 -0.0918 0.19 0.06 cMono_S100A L2
ENSG00000197442 MAP3K5 477795 sc-eQTL 6.30e-02 0.285 0.153 0.06 cMono_S100A L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 -597961 sc-eQTL 4.94e-01 0.111 0.162 0.06 cMono_S100A L2
ENSG00000286646 AL121933.2 486227 sc-eQTL 4.84e-01 -0.111 0.158 0.06 cMono_S100A L2
ENSG00000027697 IFNGR1 50823 sc-eQTL 8.49e-01 0.0316 0.166 0.076 gdT L2
ENSG00000029363 BCLAF1 980421 sc-eQTL 2.01e-01 -0.186 0.145 0.076 gdT L2
ENSG00000112357 PEX7 447708 sc-eQTL 3.63e-01 -0.191 0.209 0.076 gdT L2
ENSG00000112378 PERP -837147 sc-eQTL 4.63e-01 -0.135 0.183 0.076 gdT L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 -596942 sc-eQTL 4.17e-02 0.206 0.1 0.076 gdT L2
ENSG00000197442 MAP3K5 477795 sc-eQTL 2.94e-01 0.226 0.215 0.076 gdT L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 -597961 sc-eQTL 9.62e-01 0.00878 0.185 0.076 gdT L2
ENSG00000027697 IFNGR1 50823 sc-eQTL 2.67e-01 0.148 0.133 0.06 intMono L2
ENSG00000029363 BCLAF1 980421 sc-eQTL 7.77e-01 -0.0498 0.176 0.06 intMono L2
ENSG00000112357 PEX7 447708 sc-eQTL 2.03e-02 -0.414 0.177 0.06 intMono L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 -596942 sc-eQTL 7.52e-01 0.0363 0.115 0.06 intMono L2
ENSG00000135525 MAP7 719453 sc-eQTL 6.56e-01 0.0785 0.176 0.06 intMono L2
ENSG00000197442 MAP3K5 477795 sc-eQTL 8.95e-01 0.0248 0.187 0.06 intMono L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 -597961 sc-eQTL 9.22e-01 -0.0169 0.171 0.06 intMono L2
ENSG00000286646 AL121933.2 486227 sc-eQTL 3.43e-02 -0.416 0.195 0.06 intMono L2
ENSG00000027697 IFNGR1 50823 sc-eQTL 2.01e-01 -0.197 0.154 0.061 ncMono L2
ENSG00000029363 BCLAF1 980421 sc-eQTL 6.25e-01 -0.0587 0.12 0.061 ncMono L2
ENSG00000112357 PEX7 447708 sc-eQTL 1.80e-01 -0.256 0.191 0.061 ncMono L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 -596942 sc-eQTL 8.36e-01 -0.0283 0.137 0.061 ncMono L2
ENSG00000135525 MAP7 719453 sc-eQTL 4.17e-01 -0.137 0.169 0.061 ncMono L2
ENSG00000197442 MAP3K5 477795 sc-eQTL 3.16e-02 0.38 0.176 0.061 ncMono L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 -597961 sc-eQTL 1.26e-01 -0.261 0.17 0.061 ncMono L2
ENSG00000286646 AL121933.2 486227 sc-eQTL 7.05e-01 0.0683 0.18 0.061 ncMono L2
ENSG00000027697 IFNGR1 50823 sc-eQTL 6.40e-01 -0.0824 0.176 0.062 pDC L2
ENSG00000029363 BCLAF1 980421 sc-eQTL 8.11e-02 0.229 0.131 0.062 pDC L2
ENSG00000112357 PEX7 447708 sc-eQTL 6.67e-01 -0.0834 0.193 0.062 pDC L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 -596942 sc-eQTL 8.63e-01 -0.0283 0.163 0.062 pDC L2
ENSG00000135525 MAP7 719453 sc-eQTL 2.31e-01 0.162 0.135 0.062 pDC L2
ENSG00000197442 MAP3K5 477795 sc-eQTL 8.98e-01 0.0279 0.216 0.062 pDC L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 -597961 sc-eQTL 8.82e-01 0.0245 0.165 0.062 pDC L2
ENSG00000286646 AL121933.2 486227 sc-eQTL 6.71e-01 0.0848 0.199 0.062 pDC L2
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000027697 IFNGR1 50823 sc-eQTL 7.16e-01 0.0569 0.156 0.06 B_Memory LOneK1K
ENSG00000029363 BCLAF1 980421 sc-eQTL 3.49e-01 -0.0824 0.0877 0.06 B_Memory LOneK1K
ENSG00000112357 PEX7 447708 sc-eQTL 3.25e-01 0.177 0.18 0.06 B_Memory LOneK1K
ENSG00000112378 PERP -837147 sc-eQTL 6.98e-01 0.065 0.167 0.06 B_Memory LOneK1K
ENSG00000118503 TNFAIP3 -596942 sc-eQTL 4.33e-01 0.0866 0.11 0.06 B_Memory LOneK1K
ENSG00000197442 MAP3K5 477795 sc-eQTL 4.12e-03 0.416 0.143 0.06 B_Memory LOneK1K
ENSG00000237499 WAKMAR2 -597961 sc-eQTL 4.69e-02 -0.37 0.185 0.06 B_Memory LOneK1K
ENSG00000027697 IFNGR1 50823 sc-eQTL 3.10e-01 -0.161 0.158 0.06 B_Naive LOneK1K
ENSG00000029363 BCLAF1 980421 sc-eQTL 9.81e-01 0.00171 0.073 0.06 B_Naive LOneK1K
ENSG00000112357 PEX7 447708 sc-eQTL 5.86e-01 0.105 0.193 0.06 B_Naive LOneK1K
ENSG00000112378 PERP -837147 sc-eQTL 3.04e-02 -0.373 0.171 0.06 B_Naive LOneK1K
ENSG00000118503 TNFAIP3 -596942 sc-eQTL 5.94e-01 0.0486 0.0909 0.06 B_Naive LOneK1K
ENSG00000197442 MAP3K5 477795 sc-eQTL 5.74e-01 0.075 0.133 0.06 B_Naive LOneK1K
ENSG00000237499 WAKMAR2 -597961 sc-eQTL 2.86e-01 0.173 0.162 0.06 B_Naive LOneK1K
ENSG00000027697 IFNGR1 50823 sc-eQTL 7.13e-01 -0.0402 0.109 0.06 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000029363 BCLAF1 980421 sc-eQTL 7.21e-01 -0.0364 0.102 0.06 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000112357 PEX7 447708 sc-eQTL 6.43e-02 -0.362 0.194 0.06 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000118503 TNFAIP3 -596942 sc-eQTL 4.05e-01 0.0841 0.101 0.06 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000135525 MAP7 719453 sc-eQTL 4.77e-01 -0.125 0.175 0.06 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000197442 MAP3K5 477795 sc-eQTL 7.03e-01 0.0452 0.118 0.06 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000237499 WAKMAR2 -597961 sc-eQTL 2.27e-01 0.146 0.121 0.06 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000286646 AL121933.2 486227 sc-eQTL 4.34e-01 -0.11 0.141 0.06 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000027697 IFNGR1 50823 sc-eQTL 6.25e-01 -0.0632 0.129 0.06 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000029363 BCLAF1 980421 sc-eQTL 4.82e-01 -0.0823 0.117 0.06 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000112357 PEX7 447708 sc-eQTL 2.19e-02 -0.445 0.193 0.06 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000118503 TNFAIP3 -596942 sc-eQTL 9.33e-01 0.0102 0.121 0.06 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000135525 MAP7 719453 sc-eQTL 9.16e-01 -0.0199 0.189 0.06 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000197442 MAP3K5 477795 sc-eQTL 5.32e-02 0.299 0.154 0.06 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000237499 WAKMAR2 -597961 sc-eQTL 3.14e-01 -0.163 0.162 0.06 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000286646 AL121933.2 486227 sc-eQTL 2.62e-01 -0.206 0.183 0.06 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000027697 IFNGR1 50823 sc-eQTL 2.58e-01 -0.136 0.12 0.06 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000029363 BCLAF1 980421 sc-eQTL 7.78e-01 -0.0196 0.0697 0.06 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000112357 PEX7 447708 sc-eQTL 4.77e-01 0.144 0.202 0.06 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000112378 PERP -837147 sc-eQTL 3.97e-01 -0.106 0.125 0.06 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000118503 TNFAIP3 -596942 sc-eQTL 4.76e-01 -0.0781 0.109 0.06 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000197442 MAP3K5 477795 sc-eQTL 5.75e-01 -0.083 0.148 0.06 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000237499 WAKMAR2 -597961 sc-eQTL 1.99e-01 -0.197 0.152 0.06 NK_CD56dim LOneK1K

Statistical fine-mapping results from Japan COVID-19 Task Force
(Shown only for PIP>0.001)
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
PIP (SuSiE)
PIP (FINEMAP)
MAF
ENSG00000027697 IFNGR1 50823 eQTL 3.91e-08 -0.149 0.0268 0.0 0.0 0.0667
ENSG00000118503 TNFAIP3 -596942 eQTL 0.0456 0.0524 0.0262 0.0 0.0 0.0667

Expression Modifier Score(EMS) for GTEx 49tissues
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Whole Blood
Muscle Skeletal
Liver
Brain Cerebellum
Prostate
Spleen
Skin Sun Exposed Lower leg
Artery Coronary
Esophagus Muscularis
Esophagus Gastroesophageal Junction
Artery Tibial
Heart Atrial Appendage
Nerve Tibial
Heart Left Ventricle
Adrenal Gland
Adipose Visceral Omentum
Pancreas
Lung
Pituitary
Brain Nucleus accumbens basal ganglia
Colon Transverse
Adipose Subcutaneous
Esophagus Mucosa
Brain Cortex
Thyroid
Stomach
Breast Mammary Tissue
Colon Sigmoid
Skin Not Sun Exposed Suprapubic
Testis
Artery Aorta
Brain Amygdala
Brain Anterior cingulate cortex BA24
Brain Caudate basal ganglia
Brain Cerebellar Hemisphere
Brain Frontal Cortex BA9
Brain Hippocampus
Brain Hypothalamus
Brain Putamen basal ganglia
Brain Spinal cord cervical c-1
Brain Substantia nigra
Cells Cultured fibroblasts
Cells EBV-transformed lymphocytes
Kidney Cortex
Minor Salivary Gland
Ovary
Small Intestine Terminal Ileum
Uterus
Vagina
ENSG00000027697 IFNGR1 50823 8.12e-06 9.38e-06 1.36e-06 5.03e-06 2.14e-06 4.1e-06 1.01e-05 1.69e-06 8.41e-06 4.7e-06 1.05e-05 5.03e-06 1.36e-05 3.85e-06 2.21e-06 6.45e-06 3.75e-06 6.08e-06 2.48e-06 2.65e-06 4.66e-06 8.97e-06 6.98e-06 2.82e-06 1.29e-05 3.28e-06 4.69e-06 3.68e-06 8.37e-06 7.98e-06 5.06e-06 9.88e-07 1.1e-06 2.96e-06 3.88e-06 2.21e-06 1.74e-06 1.9e-06 1.99e-06 1.04e-06 1.02e-06 1.24e-05 1.39e-06 1.61e-07 6.99e-07 1.31e-06 9.55e-07 7.14e-07 4.36e-07
ENSG00000118503 TNFAIP3 -596942 3.14e-07 1.53e-07 5.72e-08 2.26e-07 1.03e-07 8.37e-08 2.1e-07 5.62e-08 1.54e-07 7.6e-08 1.63e-07 1.2e-07 2.29e-07 8e-08 5.94e-08 7.89e-08 4.31e-08 1.64e-07 7.09e-08 5.35e-08 1.22e-07 1.42e-07 1.62e-07 3.58e-08 2.02e-07 1.23e-07 1.17e-07 1.1e-07 1.34e-07 1.05e-07 1.14e-07 4.4e-08 3.56e-08 9.58e-08 3.51e-08 2.79e-08 4.62e-08 8.57e-08 6.49e-08 5.56e-08 4.92e-08 1.59e-07 3.4e-08 1.08e-08 3.3e-08 1.55e-08 8.81e-08 1.95e-09 4.94e-08
ENSG00000237499 \N -597961 3.14e-07 1.53e-07 5.72e-08 2.26e-07 1.03e-07 8.37e-08 2.1e-07 5.62e-08 1.44e-07 7.6e-08 1.63e-07 1.2e-07 2.29e-07 8e-08 5.94e-08 7.89e-08 4.31e-08 1.64e-07 7.09e-08 5.35e-08 1.22e-07 1.42e-07 1.62e-07 3.58e-08 2.02e-07 1.22e-07 1.17e-07 1.1e-07 1.34e-07 1.05e-07 1.14e-07 4.4e-08 3.56e-08 9.58e-08 3.51e-08 2.79e-08 4.62e-08 8.57e-08 6.49e-08 5.56e-08 4.92e-08 1.59e-07 3.4e-08 1.08e-08 3.3e-08 1.55e-08 8.81e-08 1.95e-09 4.94e-08