logo

Genes within 1Mb (chr6:137269707:C:T):

View on , UCSC , GTEx , gnomAD

Immune cell-type specific single cell cis-eQTLs in OASIS
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000027697 IFNGR1 50258 sc-eQTL 4.25e-02 0.265 0.13 0.075 B L1
ENSG00000029363 BCLAF1 979856 sc-eQTL 2.02e-01 0.0745 0.0582 0.075 B L1
ENSG00000112357 PEX7 447143 sc-eQTL 2.41e-01 -0.182 0.155 0.075 B L1
ENSG00000112378 PERP -837712 sc-eQTL 7.12e-01 0.038 0.103 0.075 B L1
ENSG00000118503 TNFAIP3 -597507 sc-eQTL 5.76e-01 0.0463 0.0828 0.075 B L1
ENSG00000197442 MAP3K5 477230 sc-eQTL 4.05e-01 0.0962 0.115 0.075 B L1
ENSG00000237499 WAKMAR2 -598526 sc-eQTL 2.31e-01 0.156 0.13 0.075 B L1
ENSG00000027697 IFNGR1 50258 sc-eQTL 9.99e-01 -9.97e-05 0.0875 0.075 CD4T L1
ENSG00000029363 BCLAF1 979856 sc-eQTL 5.11e-01 0.0435 0.0661 0.075 CD4T L1
ENSG00000112357 PEX7 447143 sc-eQTL 2.51e-02 0.314 0.139 0.075 CD4T L1
ENSG00000112378 PERP -837712 sc-eQTL 4.98e-01 0.0641 0.0945 0.075 CD4T L1
ENSG00000118503 TNFAIP3 -597507 sc-eQTL 6.24e-01 -0.0435 0.0886 0.075 CD4T L1
ENSG00000197442 MAP3K5 477230 sc-eQTL 6.19e-01 -0.0336 0.0675 0.075 CD4T L1
ENSG00000237499 WAKMAR2 -598526 sc-eQTL 6.24e-01 -0.0548 0.111 0.075 CD4T L1
ENSG00000027697 IFNGR1 50258 sc-eQTL 4.90e-01 0.0695 0.101 0.075 CD8T L1
ENSG00000029363 BCLAF1 979856 sc-eQTL 2.43e-01 0.0796 0.0679 0.075 CD8T L1
ENSG00000112357 PEX7 447143 sc-eQTL 5.53e-01 -0.0996 0.168 0.075 CD8T L1
ENSG00000112378 PERP -837712 sc-eQTL 5.21e-01 0.0705 0.11 0.075 CD8T L1
ENSG00000118503 TNFAIP3 -597507 sc-eQTL 8.12e-01 -0.0202 0.0847 0.075 CD8T L1
ENSG00000197442 MAP3K5 477230 sc-eQTL 8.22e-01 -0.0201 0.0895 0.075 CD8T L1
ENSG00000237499 WAKMAR2 -598526 sc-eQTL 2.80e-01 -0.134 0.124 0.075 CD8T L1
ENSG00000027697 IFNGR1 50258 sc-eQTL 6.27e-01 0.0616 0.127 0.072 DC L1
ENSG00000029363 BCLAF1 979856 sc-eQTL 9.14e-01 0.0123 0.114 0.072 DC L1
ENSG00000112357 PEX7 447143 sc-eQTL 9.22e-01 0.0174 0.179 0.072 DC L1
ENSG00000118503 TNFAIP3 -597507 sc-eQTL 6.40e-01 -0.0635 0.136 0.072 DC L1
ENSG00000135525 MAP7 718888 sc-eQTL 8.48e-01 0.0282 0.147 0.072 DC L1
ENSG00000197442 MAP3K5 477230 sc-eQTL 2.42e-01 -0.165 0.14 0.072 DC L1
ENSG00000237499 WAKMAR2 -598526 sc-eQTL 1.94e-01 -0.179 0.138 0.072 DC L1
ENSG00000286646 AL121933.2 485662 sc-eQTL 8.36e-01 0.0381 0.184 0.072 DC L1
ENSG00000027697 IFNGR1 50258 sc-eQTL 1.92e-01 0.132 0.101 0.075 Mono L1
ENSG00000029363 BCLAF1 979856 sc-eQTL 5.73e-02 -0.164 0.0857 0.075 Mono L1
ENSG00000112357 PEX7 447143 sc-eQTL 9.45e-02 0.284 0.169 0.075 Mono L1
ENSG00000118503 TNFAIP3 -597507 sc-eQTL 9.28e-01 0.00775 0.0858 0.075 Mono L1
ENSG00000135525 MAP7 718888 sc-eQTL 3.32e-01 -0.146 0.15 0.075 Mono L1
ENSG00000197442 MAP3K5 477230 sc-eQTL 8.08e-01 0.0244 0.1 0.075 Mono L1
ENSG00000237499 WAKMAR2 -598526 sc-eQTL 5.09e-01 -0.0703 0.106 0.075 Mono L1
ENSG00000286646 AL121933.2 485662 sc-eQTL 7.87e-01 0.0328 0.121 0.075 Mono L1
ENSG00000027697 IFNGR1 50258 sc-eQTL 2.58e-01 0.126 0.111 0.075 NK L1
ENSG00000029363 BCLAF1 979856 sc-eQTL 8.70e-01 0.00969 0.0592 0.075 NK L1
ENSG00000112357 PEX7 447143 sc-eQTL 1.72e-01 -0.235 0.171 0.075 NK L1
ENSG00000112378 PERP -837712 sc-eQTL 2.81e-02 0.237 0.107 0.075 NK L1
ENSG00000118503 TNFAIP3 -597507 sc-eQTL 6.81e-01 -0.0382 0.0928 0.075 NK L1
ENSG00000197442 MAP3K5 477230 sc-eQTL 5.96e-01 0.0707 0.133 0.075 NK L1
ENSG00000237499 WAKMAR2 -598526 sc-eQTL 2.47e-01 -0.152 0.131 0.075 NK L1
ENSG00000027697 IFNGR1 50258 sc-eQTL 1.27e-01 0.16 0.105 0.075 Other_T L1
ENSG00000029363 BCLAF1 979856 sc-eQTL 7.32e-01 -0.0303 0.0883 0.075 Other_T L1
ENSG00000112357 PEX7 447143 sc-eQTL 9.75e-01 0.00549 0.172 0.075 Other_T L1
ENSG00000112378 PERP -837712 sc-eQTL 2.07e-02 0.317 0.136 0.075 Other_T L1
ENSG00000118503 TNFAIP3 -597507 sc-eQTL 6.40e-01 0.0307 0.0655 0.075 Other_T L1
ENSG00000197442 MAP3K5 477230 sc-eQTL 3.86e-01 0.11 0.126 0.075 Other_T L1
ENSG00000237499 WAKMAR2 -598526 sc-eQTL 8.54e-01 0.024 0.13 0.075 Other_T L1
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000027697 IFNGR1 50258 sc-eQTL 5.91e-01 0.0943 0.175 0.074 B_Activated L2
ENSG00000029363 BCLAF1 979856 sc-eQTL 9.87e-01 0.00227 0.142 0.074 B_Activated L2
ENSG00000112357 PEX7 447143 sc-eQTL 8.89e-01 0.024 0.172 0.074 B_Activated L2
ENSG00000112378 PERP -837712 sc-eQTL 7.25e-01 0.0314 0.0891 0.074 B_Activated L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 -597507 sc-eQTL 6.49e-01 -0.0788 0.173 0.074 B_Activated L2
ENSG00000197442 MAP3K5 477230 sc-eQTL 1.70e-01 0.265 0.193 0.074 B_Activated L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 -598526 sc-eQTL 2.59e-01 -0.17 0.151 0.074 B_Activated L2
ENSG00000027697 IFNGR1 50258 sc-eQTL 2.55e-01 0.178 0.156 0.075 B_Intermediate L2
ENSG00000029363 BCLAF1 979856 sc-eQTL 3.81e-01 0.0779 0.0888 0.075 B_Intermediate L2
ENSG00000112357 PEX7 447143 sc-eQTL 5.92e-01 -0.0878 0.164 0.075 B_Intermediate L2
ENSG00000112378 PERP -837712 sc-eQTL 1.88e-01 0.196 0.149 0.075 B_Intermediate L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 -597507 sc-eQTL 5.57e-01 0.0689 0.117 0.075 B_Intermediate L2
ENSG00000197442 MAP3K5 477230 sc-eQTL 5.37e-01 0.0874 0.141 0.075 B_Intermediate L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 -598526 sc-eQTL 6.11e-01 -0.0846 0.166 0.075 B_Intermediate L2
ENSG00000027697 IFNGR1 50258 sc-eQTL 1.23e-01 0.26 0.168 0.075 B_Memory L2
ENSG00000029363 BCLAF1 979856 sc-eQTL 3.95e-01 0.0853 0.1 0.075 B_Memory L2
ENSG00000112357 PEX7 447143 sc-eQTL 5.22e-01 0.109 0.17 0.075 B_Memory L2
ENSG00000112378 PERP -837712 sc-eQTL 9.00e-02 0.271 0.159 0.075 B_Memory L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 -597507 sc-eQTL 6.28e-01 0.0535 0.11 0.075 B_Memory L2
ENSG00000197442 MAP3K5 477230 sc-eQTL 5.79e-01 0.0837 0.151 0.075 B_Memory L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 -598526 sc-eQTL 2.91e-01 0.173 0.164 0.075 B_Memory L2
ENSG00000027697 IFNGR1 50258 sc-eQTL 3.98e-01 0.112 0.133 0.075 B_Naive1 L2
ENSG00000029363 BCLAF1 979856 sc-eQTL 2.20e-01 0.0931 0.0756 0.075 B_Naive1 L2
ENSG00000112357 PEX7 447143 sc-eQTL 5.43e-03 -0.484 0.172 0.075 B_Naive1 L2
ENSG00000112378 PERP -837712 sc-eQTL 8.76e-01 -0.0239 0.153 0.075 B_Naive1 L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 -597507 sc-eQTL 8.23e-01 -0.0199 0.0889 0.075 B_Naive1 L2
ENSG00000197442 MAP3K5 477230 sc-eQTL 8.08e-01 0.0304 0.125 0.075 B_Naive1 L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 -598526 sc-eQTL 5.81e-01 0.077 0.139 0.075 B_Naive1 L2
ENSG00000027697 IFNGR1 50258 sc-eQTL 2.02e-01 0.208 0.163 0.075 B_Naive2 L2
ENSG00000029363 BCLAF1 979856 sc-eQTL 7.91e-01 0.0252 0.0948 0.075 B_Naive2 L2
ENSG00000112357 PEX7 447143 sc-eQTL 4.92e-01 0.123 0.179 0.075 B_Naive2 L2
ENSG00000112378 PERP -837712 sc-eQTL 6.15e-01 -0.0656 0.13 0.075 B_Naive2 L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 -597507 sc-eQTL 9.57e-01 0.00706 0.13 0.075 B_Naive2 L2
ENSG00000197442 MAP3K5 477230 sc-eQTL 8.95e-01 -0.0183 0.139 0.075 B_Naive2 L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 -598526 sc-eQTL 2.18e-01 0.207 0.168 0.075 B_Naive2 L2
ENSG00000027697 IFNGR1 50258 sc-eQTL 5.52e-01 0.0939 0.158 0.073 CD4_CTL L2
ENSG00000029363 BCLAF1 979856 sc-eQTL 2.90e-01 -0.148 0.14 0.073 CD4_CTL L2
ENSG00000112357 PEX7 447143 sc-eQTL 3.69e-01 0.157 0.175 0.073 CD4_CTL L2
ENSG00000112378 PERP -837712 sc-eQTL 6.12e-01 -0.0901 0.177 0.073 CD4_CTL L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 -597507 sc-eQTL 1.18e-01 -0.161 0.103 0.073 CD4_CTL L2
ENSG00000197442 MAP3K5 477230 sc-eQTL 6.08e-01 0.0847 0.165 0.073 CD4_CTL L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 -598526 sc-eQTL 7.94e-01 -0.0421 0.161 0.073 CD4_CTL L2
ENSG00000027697 IFNGR1 50258 sc-eQTL 2.68e-01 -0.0923 0.0831 0.075 CD4_Naive L2
ENSG00000029363 BCLAF1 979856 sc-eQTL 4.91e-01 0.0461 0.0668 0.075 CD4_Naive L2
ENSG00000112357 PEX7 447143 sc-eQTL 2.20e-02 0.359 0.155 0.075 CD4_Naive L2
ENSG00000112378 PERP -837712 sc-eQTL 6.50e-01 -0.059 0.13 0.075 CD4_Naive L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 -597507 sc-eQTL 7.65e-01 -0.0273 0.0911 0.075 CD4_Naive L2
ENSG00000197442 MAP3K5 477230 sc-eQTL 4.42e-01 -0.0515 0.0668 0.075 CD4_Naive L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 -598526 sc-eQTL 9.95e-01 -0.000747 0.118 0.075 CD4_Naive L2
ENSG00000027697 IFNGR1 50258 sc-eQTL 5.76e-01 0.0647 0.116 0.075 CD4_TCM L2
ENSG00000029363 BCLAF1 979856 sc-eQTL 2.76e-01 0.0795 0.0728 0.075 CD4_TCM L2
ENSG00000112357 PEX7 447143 sc-eQTL 7.69e-01 0.05 0.17 0.075 CD4_TCM L2
ENSG00000112378 PERP -837712 sc-eQTL 9.49e-02 0.239 0.143 0.075 CD4_TCM L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 -597507 sc-eQTL 5.15e-01 -0.0543 0.0833 0.075 CD4_TCM L2
ENSG00000197442 MAP3K5 477230 sc-eQTL 7.75e-01 0.0272 0.0949 0.075 CD4_TCM L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 -598526 sc-eQTL 8.26e-01 -0.0257 0.117 0.075 CD4_TCM L2
ENSG00000027697 IFNGR1 50258 sc-eQTL 3.64e-01 0.119 0.131 0.075 CD4_TEM L2
ENSG00000029363 BCLAF1 979856 sc-eQTL 8.47e-01 0.018 0.0932 0.075 CD4_TEM L2
ENSG00000112357 PEX7 447143 sc-eQTL 6.14e-01 -0.0857 0.17 0.075 CD4_TEM L2
ENSG00000112378 PERP -837712 sc-eQTL 6.57e-02 0.252 0.136 0.075 CD4_TEM L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 -597507 sc-eQTL 7.09e-01 -0.0327 0.0873 0.075 CD4_TEM L2
ENSG00000197442 MAP3K5 477230 sc-eQTL 3.67e-01 -0.122 0.135 0.075 CD4_TEM L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 -598526 sc-eQTL 9.40e-01 -0.0105 0.14 0.075 CD4_TEM L2
ENSG00000027697 IFNGR1 50258 sc-eQTL 4.20e-01 0.0971 0.12 0.075 CD8_CTL L2
ENSG00000029363 BCLAF1 979856 sc-eQTL 3.23e-01 -0.0793 0.0801 0.075 CD8_CTL L2
ENSG00000112357 PEX7 447143 sc-eQTL 8.47e-01 -0.032 0.166 0.075 CD8_CTL L2
ENSG00000112378 PERP -837712 sc-eQTL 3.61e-01 0.145 0.159 0.075 CD8_CTL L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 -597507 sc-eQTL 9.57e-01 0.00546 0.101 0.075 CD8_CTL L2
ENSG00000197442 MAP3K5 477230 sc-eQTL 6.97e-01 0.0556 0.143 0.075 CD8_CTL L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 -598526 sc-eQTL 6.65e-01 -0.0617 0.142 0.075 CD8_CTL L2
ENSG00000027697 IFNGR1 50258 sc-eQTL 2.52e-01 0.138 0.12 0.075 CD8_Naive L2
ENSG00000029363 BCLAF1 979856 sc-eQTL 1.41e-02 0.205 0.083 0.075 CD8_Naive L2
ENSG00000112357 PEX7 447143 sc-eQTL 8.27e-01 -0.0383 0.175 0.075 CD8_Naive L2
ENSG00000112378 PERP -837712 sc-eQTL 7.47e-01 0.043 0.133 0.075 CD8_Naive L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 -597507 sc-eQTL 9.63e-01 0.00436 0.0943 0.075 CD8_Naive L2
ENSG00000197442 MAP3K5 477230 sc-eQTL 3.82e-01 -0.0977 0.112 0.075 CD8_Naive L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 -598526 sc-eQTL 6.13e-01 -0.0705 0.139 0.075 CD8_Naive L2
ENSG00000027697 IFNGR1 50258 sc-eQTL 8.00e-01 -0.0409 0.162 0.074 CD8_TCM L2
ENSG00000029363 BCLAF1 979856 sc-eQTL 5.54e-01 0.0718 0.121 0.074 CD8_TCM L2
ENSG00000112357 PEX7 447143 sc-eQTL 6.52e-01 0.0838 0.185 0.074 CD8_TCM L2
ENSG00000112378 PERP -837712 sc-eQTL 3.57e-01 0.168 0.181 0.074 CD8_TCM L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 -597507 sc-eQTL 1.39e-01 -0.129 0.0871 0.074 CD8_TCM L2
ENSG00000197442 MAP3K5 477230 sc-eQTL 9.59e-01 0.00811 0.156 0.074 CD8_TCM L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 -598526 sc-eQTL 6.63e-01 -0.0699 0.16 0.074 CD8_TCM L2
ENSG00000027697 IFNGR1 50258 sc-eQTL 4.96e-01 0.101 0.148 0.078 CD8_TEM L2
ENSG00000029363 BCLAF1 979856 sc-eQTL 9.01e-01 0.0175 0.14 0.078 CD8_TEM L2
ENSG00000112357 PEX7 447143 sc-eQTL 5.82e-01 0.094 0.171 0.078 CD8_TEM L2
ENSG00000112378 PERP -837712 sc-eQTL 4.46e-01 0.136 0.177 0.078 CD8_TEM L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 -597507 sc-eQTL 4.67e-01 0.0797 0.109 0.078 CD8_TEM L2
ENSG00000197442 MAP3K5 477230 sc-eQTL 3.76e-01 -0.15 0.169 0.078 CD8_TEM L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 -598526 sc-eQTL 2.06e-01 -0.205 0.162 0.078 CD8_TEM L2
ENSG00000027697 IFNGR1 50258 sc-eQTL 1.47e-01 0.173 0.119 0.076 MAIT L2
ENSG00000029363 BCLAF1 979856 sc-eQTL 1.09e-01 0.158 0.0985 0.076 MAIT L2
ENSG00000112357 PEX7 447143 sc-eQTL 1.13e-01 -0.256 0.161 0.076 MAIT L2
ENSG00000112378 PERP -837712 sc-eQTL 6.17e-02 0.314 0.167 0.076 MAIT L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 -597507 sc-eQTL 5.95e-01 -0.0427 0.0802 0.076 MAIT L2
ENSG00000197442 MAP3K5 477230 sc-eQTL 8.06e-01 0.0344 0.14 0.076 MAIT L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 -598526 sc-eQTL 5.18e-01 0.0961 0.148 0.076 MAIT L2
ENSG00000027697 IFNGR1 50258 sc-eQTL 6.86e-01 0.0543 0.134 0.073 NK_CD56bright L2
ENSG00000029363 BCLAF1 979856 sc-eQTL 4.87e-01 -0.0687 0.0987 0.073 NK_CD56bright L2
ENSG00000112357 PEX7 447143 sc-eQTL 6.95e-01 -0.0684 0.174 0.073 NK_CD56bright L2
ENSG00000112378 PERP -837712 sc-eQTL 6.90e-01 0.0624 0.156 0.073 NK_CD56bright L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 -597507 sc-eQTL 5.46e-01 0.0603 0.0996 0.073 NK_CD56bright L2
ENSG00000197442 MAP3K5 477230 sc-eQTL 7.03e-01 -0.0578 0.152 0.073 NK_CD56bright L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 -598526 sc-eQTL 8.23e-01 -0.0357 0.159 0.073 NK_CD56bright L2
ENSG00000027697 IFNGR1 50258 sc-eQTL 1.13e-01 0.164 0.103 0.073 NK_CD56dim L2
ENSG00000029363 BCLAF1 979856 sc-eQTL 2.02e-01 0.0864 0.0674 0.073 NK_CD56dim L2
ENSG00000112357 PEX7 447143 sc-eQTL 5.71e-01 -0.101 0.178 0.073 NK_CD56dim L2
ENSG00000112378 PERP -837712 sc-eQTL 5.42e-03 0.346 0.123 0.073 NK_CD56dim L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 -597507 sc-eQTL 7.31e-01 -0.0335 0.0976 0.073 NK_CD56dim L2
ENSG00000197442 MAP3K5 477230 sc-eQTL 2.37e-01 0.166 0.14 0.073 NK_CD56dim L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 -598526 sc-eQTL 2.98e-01 -0.152 0.146 0.073 NK_CD56dim L2
ENSG00000027697 IFNGR1 50258 sc-eQTL 5.86e-01 0.0741 0.136 0.071 NK_HLA L2
ENSG00000029363 BCLAF1 979856 sc-eQTL 7.29e-02 -0.206 0.114 0.071 NK_HLA L2
ENSG00000112357 PEX7 447143 sc-eQTL 9.74e-01 0.00559 0.173 0.071 NK_HLA L2
ENSG00000112378 PERP -837712 sc-eQTL 7.09e-01 -0.0523 0.14 0.071 NK_HLA L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 -597507 sc-eQTL 7.05e-01 -0.0408 0.108 0.071 NK_HLA L2
ENSG00000197442 MAP3K5 477230 sc-eQTL 7.46e-01 0.0556 0.171 0.071 NK_HLA L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 -598526 sc-eQTL 1.54e-01 -0.247 0.173 0.071 NK_HLA L2
ENSG00000027697 IFNGR1 50258 sc-eQTL 1.45e-01 0.159 0.109 0.073 NK_cytokine L2
ENSG00000029363 BCLAF1 979856 sc-eQTL 5.73e-01 0.0459 0.0815 0.073 NK_cytokine L2
ENSG00000112357 PEX7 447143 sc-eQTL 1.55e-02 -0.413 0.169 0.073 NK_cytokine L2
ENSG00000112378 PERP -837712 sc-eQTL 8.67e-01 0.0218 0.13 0.073 NK_cytokine L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 -597507 sc-eQTL 6.89e-01 -0.0391 0.0975 0.073 NK_cytokine L2
ENSG00000197442 MAP3K5 477230 sc-eQTL 4.28e-01 0.106 0.134 0.073 NK_cytokine L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 -598526 sc-eQTL 7.88e-01 -0.0397 0.147 0.073 NK_cytokine L2
ENSG00000027697 IFNGR1 50258 sc-eQTL 9.48e-01 -0.0153 0.233 0.063 PB L2
ENSG00000029363 BCLAF1 979856 sc-eQTL 8.53e-01 -0.0374 0.201 0.063 PB L2
ENSG00000112357 PEX7 447143 sc-eQTL 4.02e-01 -0.201 0.238 0.063 PB L2
ENSG00000112378 PERP -837712 sc-eQTL 5.53e-02 0.284 0.147 0.063 PB L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 -597507 sc-eQTL 1.87e-01 0.238 0.18 0.063 PB L2
ENSG00000197442 MAP3K5 477230 sc-eQTL 9.94e-01 -0.00145 0.206 0.063 PB L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 -598526 sc-eQTL 2.78e-01 0.236 0.216 0.063 PB L2
ENSG00000027697 IFNGR1 50258 sc-eQTL 2.65e-01 0.151 0.135 0.074 Pro_T L2
ENSG00000029363 BCLAF1 979856 sc-eQTL 1.68e-01 -0.194 0.14 0.074 Pro_T L2
ENSG00000112357 PEX7 447143 sc-eQTL 1.20e-01 0.256 0.164 0.074 Pro_T L2
ENSG00000112378 PERP -837712 sc-eQTL 1.88e-01 0.172 0.13 0.074 Pro_T L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 -597507 sc-eQTL 5.38e-01 -0.051 0.0826 0.074 Pro_T L2
ENSG00000197442 MAP3K5 477230 sc-eQTL 5.70e-01 0.091 0.16 0.074 Pro_T L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 -598526 sc-eQTL 8.92e-01 -0.0218 0.16 0.074 Pro_T L2
ENSG00000027697 IFNGR1 50258 sc-eQTL 5.42e-01 0.0986 0.161 0.075 Treg L2
ENSG00000029363 BCLAF1 979856 sc-eQTL 2.95e-01 0.109 0.104 0.075 Treg L2
ENSG00000112357 PEX7 447143 sc-eQTL 3.43e-01 -0.162 0.17 0.075 Treg L2
ENSG00000112378 PERP -837712 sc-eQTL 4.11e-02 0.376 0.183 0.075 Treg L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 -597507 sc-eQTL 1.73e-01 -0.14 0.102 0.075 Treg L2
ENSG00000197442 MAP3K5 477230 sc-eQTL 6.32e-02 -0.206 0.11 0.075 Treg L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 -598526 sc-eQTL 2.05e-01 -0.198 0.156 0.075 Treg L2
ENSG00000027697 IFNGR1 50258 sc-eQTL 2.75e-01 0.152 0.139 0.071 cDC L2
ENSG00000029363 BCLAF1 979856 sc-eQTL 7.88e-01 0.0377 0.14 0.071 cDC L2
ENSG00000112357 PEX7 447143 sc-eQTL 4.86e-01 -0.125 0.18 0.071 cDC L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 -597507 sc-eQTL 3.80e-01 -0.12 0.137 0.071 cDC L2
ENSG00000135525 MAP7 718888 sc-eQTL 7.98e-01 -0.0411 0.16 0.071 cDC L2
ENSG00000197442 MAP3K5 477230 sc-eQTL 8.07e-01 0.0344 0.141 0.071 cDC L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 -598526 sc-eQTL 5.58e-01 -0.105 0.178 0.071 cDC L2
ENSG00000286646 AL121933.2 485662 sc-eQTL 5.88e-01 0.0996 0.183 0.071 cDC L2
ENSG00000027697 IFNGR1 50258 sc-eQTL 2.08e-01 0.118 0.0937 0.075 cMono_IL1B L2
ENSG00000029363 BCLAF1 979856 sc-eQTL 2.03e-01 -0.128 0.101 0.075 cMono_IL1B L2
ENSG00000112357 PEX7 447143 sc-eQTL 5.98e-01 0.0893 0.169 0.075 cMono_IL1B L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 -597507 sc-eQTL 9.67e-01 -0.00416 0.101 0.075 cMono_IL1B L2
ENSG00000135525 MAP7 718888 sc-eQTL 8.74e-01 0.0232 0.146 0.075 cMono_IL1B L2
ENSG00000197442 MAP3K5 477230 sc-eQTL 7.86e-01 0.0286 0.105 0.075 cMono_IL1B L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 -598526 sc-eQTL 7.72e-01 -0.0313 0.108 0.075 cMono_IL1B L2
ENSG00000286646 AL121933.2 485662 sc-eQTL 6.69e-01 0.0579 0.135 0.075 cMono_IL1B L2
ENSG00000027697 IFNGR1 50258 sc-eQTL 7.06e-01 0.0411 0.109 0.075 cMono_S100A L2
ENSG00000029363 BCLAF1 979856 sc-eQTL 8.80e-01 -0.0169 0.112 0.075 cMono_S100A L2
ENSG00000112357 PEX7 447143 sc-eQTL 6.51e-02 0.321 0.173 0.075 cMono_S100A L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 -597507 sc-eQTL 8.11e-01 -0.0232 0.0967 0.075 cMono_S100A L2
ENSG00000135525 MAP7 718888 sc-eQTL 5.29e-01 -0.102 0.163 0.075 cMono_S100A L2
ENSG00000197442 MAP3K5 477230 sc-eQTL 7.21e-01 0.047 0.131 0.075 cMono_S100A L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 -598526 sc-eQTL 2.22e-01 -0.17 0.138 0.075 cMono_S100A L2
ENSG00000286646 AL121933.2 485662 sc-eQTL 8.09e-01 0.0327 0.136 0.075 cMono_S100A L2
ENSG00000027697 IFNGR1 50258 sc-eQTL 9.51e-01 0.01 0.164 0.064 gdT L2
ENSG00000029363 BCLAF1 979856 sc-eQTL 5.18e-01 -0.0936 0.144 0.064 gdT L2
ENSG00000112357 PEX7 447143 sc-eQTL 4.16e-01 -0.169 0.208 0.064 gdT L2
ENSG00000112378 PERP -837712 sc-eQTL 8.97e-02 0.308 0.18 0.064 gdT L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 -597507 sc-eQTL 4.33e-01 0.0793 0.101 0.064 gdT L2
ENSG00000197442 MAP3K5 477230 sc-eQTL 2.73e-02 -0.469 0.21 0.064 gdT L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 -598526 sc-eQTL 8.99e-01 0.0233 0.183 0.064 gdT L2
ENSG00000027697 IFNGR1 50258 sc-eQTL 6.59e-01 0.0515 0.117 0.073 intMono L2
ENSG00000029363 BCLAF1 979856 sc-eQTL 8.53e-02 -0.265 0.153 0.073 intMono L2
ENSG00000112357 PEX7 447143 sc-eQTL 7.87e-01 0.0426 0.157 0.073 intMono L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 -597507 sc-eQTL 9.72e-01 0.00358 0.101 0.073 intMono L2
ENSG00000135525 MAP7 718888 sc-eQTL 9.37e-01 0.0123 0.155 0.073 intMono L2
ENSG00000197442 MAP3K5 477230 sc-eQTL 9.95e-01 0.00106 0.164 0.073 intMono L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 -598526 sc-eQTL 9.54e-01 0.00877 0.15 0.073 intMono L2
ENSG00000286646 AL121933.2 485662 sc-eQTL 6.65e-01 -0.075 0.173 0.073 intMono L2
ENSG00000027697 IFNGR1 50258 sc-eQTL 9.02e-01 -0.0166 0.134 0.079 ncMono L2
ENSG00000029363 BCLAF1 979856 sc-eQTL 6.70e-01 0.0445 0.104 0.079 ncMono L2
ENSG00000112357 PEX7 447143 sc-eQTL 4.30e-02 0.335 0.164 0.079 ncMono L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 -597507 sc-eQTL 3.10e-01 -0.12 0.118 0.079 ncMono L2
ENSG00000135525 MAP7 718888 sc-eQTL 7.17e-01 0.0532 0.147 0.079 ncMono L2
ENSG00000197442 MAP3K5 477230 sc-eQTL 8.69e-01 0.0254 0.154 0.079 ncMono L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 -598526 sc-eQTL 5.77e-01 0.0828 0.148 0.079 ncMono L2
ENSG00000286646 AL121933.2 485662 sc-eQTL 6.69e-01 0.067 0.156 0.079 ncMono L2
ENSG00000027697 IFNGR1 50258 sc-eQTL 6.42e-01 -0.076 0.163 0.071 pDC L2
ENSG00000029363 BCLAF1 979856 sc-eQTL 3.54e-01 -0.113 0.122 0.071 pDC L2
ENSG00000112357 PEX7 447143 sc-eQTL 3.28e-01 0.175 0.179 0.071 pDC L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 -597507 sc-eQTL 2.89e-01 0.16 0.151 0.071 pDC L2
ENSG00000135525 MAP7 718888 sc-eQTL 8.02e-01 0.0315 0.125 0.071 pDC L2
ENSG00000197442 MAP3K5 477230 sc-eQTL 6.51e-01 0.0907 0.2 0.071 pDC L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 -598526 sc-eQTL 2.36e-01 -0.182 0.153 0.071 pDC L2
ENSG00000286646 AL121933.2 485662 sc-eQTL 5.46e-01 -0.112 0.185 0.071 pDC L2
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000027697 IFNGR1 50258 sc-eQTL 3.74e-02 0.287 0.137 0.075 B_Memory LOneK1K
ENSG00000029363 BCLAF1 979856 sc-eQTL 7.59e-02 0.138 0.0771 0.075 B_Memory LOneK1K
ENSG00000112357 PEX7 447143 sc-eQTL 5.52e-01 -0.0948 0.159 0.075 B_Memory LOneK1K
ENSG00000112378 PERP -837712 sc-eQTL 5.54e-02 0.282 0.147 0.075 B_Memory LOneK1K
ENSG00000118503 TNFAIP3 -597507 sc-eQTL 1.09e-01 0.156 0.097 0.075 B_Memory LOneK1K
ENSG00000197442 MAP3K5 477230 sc-eQTL 3.01e-01 0.134 0.129 0.075 B_Memory LOneK1K
ENSG00000237499 WAKMAR2 -598526 sc-eQTL 8.93e-01 0.0222 0.165 0.075 B_Memory LOneK1K
ENSG00000027697 IFNGR1 50258 sc-eQTL 2.23e-01 0.171 0.14 0.075 B_Naive LOneK1K
ENSG00000029363 BCLAF1 979856 sc-eQTL 5.02e-01 0.0433 0.0643 0.075 B_Naive LOneK1K
ENSG00000112357 PEX7 447143 sc-eQTL 1.05e-01 -0.276 0.17 0.075 B_Naive LOneK1K
ENSG00000112378 PERP -837712 sc-eQTL 8.37e-01 -0.0314 0.153 0.075 B_Naive LOneK1K
ENSG00000118503 TNFAIP3 -597507 sc-eQTL 9.02e-01 0.00987 0.0803 0.075 B_Naive LOneK1K
ENSG00000197442 MAP3K5 477230 sc-eQTL 6.84e-01 0.048 0.118 0.075 B_Naive LOneK1K
ENSG00000237499 WAKMAR2 -598526 sc-eQTL 4.19e-01 0.116 0.143 0.075 B_Naive LOneK1K
ENSG00000027697 IFNGR1 50258 sc-eQTL 4.41e-01 0.0727 0.0943 0.075 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000029363 BCLAF1 979856 sc-eQTL 2.92e-01 -0.0925 0.0877 0.075 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000112357 PEX7 447143 sc-eQTL 2.98e-01 0.176 0.169 0.075 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000118503 TNFAIP3 -597507 sc-eQTL 9.94e-01 0.000624 0.0873 0.075 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000135525 MAP7 718888 sc-eQTL 7.03e-01 -0.0578 0.152 0.075 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000197442 MAP3K5 477230 sc-eQTL 7.13e-01 0.0376 0.102 0.075 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000237499 WAKMAR2 -598526 sc-eQTL 3.74e-01 -0.0931 0.104 0.075 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000286646 AL121933.2 485662 sc-eQTL 6.99e-01 0.0472 0.122 0.075 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000027697 IFNGR1 50258 sc-eQTL 6.77e-01 0.0466 0.112 0.075 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000029363 BCLAF1 979856 sc-eQTL 4.53e-01 -0.076 0.101 0.075 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000112357 PEX7 447143 sc-eQTL 2.64e-01 0.188 0.168 0.075 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000118503 TNFAIP3 -597507 sc-eQTL 7.33e-01 -0.0357 0.105 0.075 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000135525 MAP7 718888 sc-eQTL 8.21e-01 -0.0369 0.163 0.075 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000197442 MAP3K5 477230 sc-eQTL 3.99e-01 -0.113 0.134 0.075 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000237499 WAKMAR2 -598526 sc-eQTL 6.36e-01 0.0665 0.14 0.075 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000286646 AL121933.2 485662 sc-eQTL 6.29e-01 0.0769 0.159 0.075 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000027697 IFNGR1 50258 sc-eQTL 1.37e-01 0.158 0.106 0.073 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000029363 BCLAF1 979856 sc-eQTL 7.75e-01 0.0176 0.0616 0.073 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000112357 PEX7 447143 sc-eQTL 1.74e-01 -0.243 0.178 0.073 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000112378 PERP -837712 sc-eQTL 4.17e-02 0.225 0.11 0.073 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000118503 TNFAIP3 -597507 sc-eQTL 5.20e-01 -0.0623 0.0966 0.073 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000197442 MAP3K5 477230 sc-eQTL 2.47e-01 0.151 0.13 0.073 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000237499 WAKMAR2 -598526 sc-eQTL 1.83e-01 -0.18 0.135 0.073 NK_CD56dim LOneK1K

Statistical fine-mapping results from Japan COVID-19 Task Force
(Shown only for PIP>0.001)
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
PIP (SuSiE)
PIP (FINEMAP)
MAF
ENSG00000027697 IFNGR1 50258 eQTL 0.000168 0.104 0.0275 0.0 0.0 0.0672
ENSG00000118503 TNFAIP3 -597507 eQTL 0.0196 -0.0623 0.0266 0.001 0.0 0.0672
ENSG00000182747 SLC35D3 347406 eQTL 0.012 -0.16 0.0637 0.0 0.0 0.0672

Expression Modifier Score(EMS) for GTEx 49tissues
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Whole Blood
Muscle Skeletal
Liver
Brain Cerebellum
Prostate
Spleen
Skin Sun Exposed Lower leg
Artery Coronary
Esophagus Muscularis
Esophagus Gastroesophageal Junction
Artery Tibial
Heart Atrial Appendage
Nerve Tibial
Heart Left Ventricle
Adrenal Gland
Adipose Visceral Omentum
Pancreas
Lung
Pituitary
Brain Nucleus accumbens basal ganglia
Colon Transverse
Adipose Subcutaneous
Esophagus Mucosa
Brain Cortex
Thyroid
Stomach
Breast Mammary Tissue
Colon Sigmoid
Skin Not Sun Exposed Suprapubic
Testis
Artery Aorta
Brain Amygdala
Brain Anterior cingulate cortex BA24
Brain Caudate basal ganglia
Brain Cerebellar Hemisphere
Brain Frontal Cortex BA9
Brain Hippocampus
Brain Hypothalamus
Brain Putamen basal ganglia
Brain Spinal cord cervical c-1
Brain Substantia nigra
Cells Cultured fibroblasts
Cells EBV-transformed lymphocytes
Kidney Cortex
Minor Salivary Gland
Ovary
Small Intestine Terminal Ileum
Uterus
Vagina
ENSG00000027697 IFNGR1 50258 1.77e-05 1.54e-05 1.29e-06 7.15e-06 2.35e-06 6.12e-06 1.68e-05 1.93e-06 1.06e-05 5.36e-06 1.41e-05 5.86e-06 2.01e-05 4.2e-06 3.67e-06 6.6e-06 5.67e-06 9.66e-06 2.97e-06 2.79e-06 5.16e-06 1.09e-05 1.11e-05 3.25e-06 1.83e-05 3.52e-06 5.98e-06 4.09e-06 1.38e-05 1.08e-05 7.59e-06 9.52e-07 1.27e-06 2.99e-06 4.54e-06 2.11e-06 1.33e-06 1.74e-06 1.6e-06 1.01e-06 7.35e-07 1.67e-05 1.42e-06 1.68e-07 7.98e-07 1.64e-06 1.29e-06 6.92e-07 5.78e-07
ENSG00000182747 SLC35D3 347406 1.32e-06 9.01e-07 1.02e-07 3.16e-07 1.05e-07 4.35e-07 8.96e-07 1.4e-07 6.71e-07 2.72e-07 1.1e-06 5.08e-07 1.07e-06 2.54e-07 4.36e-07 2.89e-07 5.63e-07 5.02e-07 3.26e-07 2.25e-07 1.92e-07 5.18e-07 4.59e-07 2.17e-07 1.47e-06 2.49e-07 4.83e-07 2.68e-07 5.56e-07 8.59e-07 4.08e-07 5.82e-08 4.28e-08 1.75e-07 3.52e-07 7.92e-08 1.07e-07 6.78e-08 6.81e-08 2.24e-08 3.2e-08 7.54e-07 5.78e-08 1.43e-08 1.6e-07 1.95e-08 9.98e-08 3.04e-09 4.54e-08