logo

Genes within 1Mb (chr6:137267806:C:T):

View on , UCSC , GTEx , gnomAD

Immune cell-type specific single cell cis-eQTLs in OASIS
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000027697 IFNGR1 48357 sc-eQTL 4.29e-01 -0.0607 0.0765 0.278 B L1
ENSG00000029363 BCLAF1 977955 sc-eQTL 9.23e-02 0.0573 0.0339 0.278 B L1
ENSG00000112357 PEX7 445242 sc-eQTL 5.61e-01 0.0528 0.0906 0.278 B L1
ENSG00000112378 PERP -839613 sc-eQTL 2.44e-01 -0.0699 0.0598 0.278 B L1
ENSG00000118503 TNFAIP3 -599408 sc-eQTL 2.35e-01 -0.0574 0.0482 0.278 B L1
ENSG00000197442 MAP3K5 475329 sc-eQTL 9.10e-01 0.00766 0.0674 0.278 B L1
ENSG00000237499 WAKMAR2 -600427 sc-eQTL 5.64e-01 -0.0439 0.076 0.278 B L1
ENSG00000027697 IFNGR1 48357 sc-eQTL 5.29e-03 -0.142 0.0504 0.278 CD4T L1
ENSG00000029363 BCLAF1 977955 sc-eQTL 1.71e-01 0.0532 0.0387 0.278 CD4T L1
ENSG00000112357 PEX7 445242 sc-eQTL 4.30e-02 -0.167 0.0818 0.278 CD4T L1
ENSG00000112378 PERP -839613 sc-eQTL 9.90e-01 0.00071 0.0555 0.278 CD4T L1
ENSG00000118503 TNFAIP3 -599408 sc-eQTL 1.96e-01 0.0672 0.0518 0.278 CD4T L1
ENSG00000197442 MAP3K5 475329 sc-eQTL 4.04e-01 0.033 0.0395 0.278 CD4T L1
ENSG00000237499 WAKMAR2 -600427 sc-eQTL 5.67e-02 0.124 0.0649 0.278 CD4T L1
ENSG00000027697 IFNGR1 48357 sc-eQTL 3.02e-04 -0.208 0.0566 0.278 CD8T L1
ENSG00000029363 BCLAF1 977955 sc-eQTL 8.39e-01 0.00803 0.0395 0.278 CD8T L1
ENSG00000112357 PEX7 445242 sc-eQTL 8.85e-01 0.0142 0.0974 0.278 CD8T L1
ENSG00000112378 PERP -839613 sc-eQTL 9.01e-01 -0.00797 0.0637 0.278 CD8T L1
ENSG00000118503 TNFAIP3 -599408 sc-eQTL 7.40e-01 -0.0164 0.0491 0.278 CD8T L1
ENSG00000197442 MAP3K5 475329 sc-eQTL 7.89e-01 -0.0139 0.0519 0.278 CD8T L1
ENSG00000237499 WAKMAR2 -600427 sc-eQTL 9.16e-02 -0.122 0.0717 0.278 CD8T L1
ENSG00000027697 IFNGR1 48357 sc-eQTL 5.99e-01 -0.0374 0.0711 0.277 DC L1
ENSG00000029363 BCLAF1 977955 sc-eQTL 2.53e-02 0.142 0.0632 0.277 DC L1
ENSG00000112357 PEX7 445242 sc-eQTL 4.12e-01 -0.0823 0.1 0.277 DC L1
ENSG00000118503 TNFAIP3 -599408 sc-eQTL 3.95e-01 -0.0647 0.0759 0.277 DC L1
ENSG00000135525 MAP7 716987 sc-eQTL 6.30e-01 -0.0397 0.0823 0.277 DC L1
ENSG00000197442 MAP3K5 475329 sc-eQTL 9.07e-01 0.00923 0.0789 0.277 DC L1
ENSG00000237499 WAKMAR2 -600427 sc-eQTL 4.95e-01 0.0529 0.0774 0.277 DC L1
ENSG00000286646 AL121933.2 483761 sc-eQTL 6.63e-01 0.0449 0.103 0.277 DC L1
ENSG00000027697 IFNGR1 48357 sc-eQTL 1.05e-01 -0.0942 0.0578 0.278 Mono L1
ENSG00000029363 BCLAF1 977955 sc-eQTL 1.17e-01 0.0777 0.0494 0.278 Mono L1
ENSG00000112357 PEX7 445242 sc-eQTL 6.05e-01 0.0507 0.0978 0.278 Mono L1
ENSG00000118503 TNFAIP3 -599408 sc-eQTL 5.47e-01 -0.0297 0.0493 0.278 Mono L1
ENSG00000135525 MAP7 716987 sc-eQTL 3.66e-01 0.078 0.0861 0.278 Mono L1
ENSG00000197442 MAP3K5 475329 sc-eQTL 9.99e-01 8.42e-05 0.0576 0.278 Mono L1
ENSG00000237499 WAKMAR2 -600427 sc-eQTL 4.66e-01 -0.0446 0.061 0.278 Mono L1
ENSG00000286646 AL121933.2 483761 sc-eQTL 8.65e-01 0.0119 0.0697 0.278 Mono L1
ENSG00000027697 IFNGR1 48357 sc-eQTL 7.46e-02 -0.117 0.0655 0.279 NK L1
ENSG00000029363 BCLAF1 977955 sc-eQTL 8.96e-01 0.0046 0.035 0.279 NK L1
ENSG00000112357 PEX7 445242 sc-eQTL 3.75e-01 0.0904 0.102 0.279 NK L1
ENSG00000112378 PERP -839613 sc-eQTL 5.46e-01 0.0387 0.0641 0.279 NK L1
ENSG00000118503 TNFAIP3 -599408 sc-eQTL 6.94e-01 0.0216 0.0549 0.279 NK L1
ENSG00000197442 MAP3K5 475329 sc-eQTL 5.57e-01 0.0462 0.0786 0.279 NK L1
ENSG00000237499 WAKMAR2 -600427 sc-eQTL 4.10e-01 -0.0642 0.0777 0.279 NK L1
ENSG00000027697 IFNGR1 48357 sc-eQTL 8.95e-03 -0.155 0.0589 0.278 Other_T L1
ENSG00000029363 BCLAF1 977955 sc-eQTL 1.84e-01 0.0666 0.05 0.278 Other_T L1
ENSG00000112357 PEX7 445242 sc-eQTL 9.54e-01 0.00564 0.0977 0.278 Other_T L1
ENSG00000112378 PERP -839613 sc-eQTL 4.85e-01 -0.0548 0.0783 0.278 Other_T L1
ENSG00000118503 TNFAIP3 -599408 sc-eQTL 4.97e-01 -0.0253 0.0372 0.278 Other_T L1
ENSG00000197442 MAP3K5 475329 sc-eQTL 5.97e-01 -0.0381 0.0719 0.278 Other_T L1
ENSG00000237499 WAKMAR2 -600427 sc-eQTL 9.07e-02 -0.125 0.0735 0.278 Other_T L1
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000027697 IFNGR1 48357 sc-eQTL 8.77e-01 0.0159 0.102 0.265 B_Activated L2
ENSG00000029363 BCLAF1 977955 sc-eQTL 8.49e-01 -0.0158 0.083 0.265 B_Activated L2
ENSG00000112357 PEX7 445242 sc-eQTL 5.77e-01 -0.0562 0.1 0.265 B_Activated L2
ENSG00000112378 PERP -839613 sc-eQTL 7.97e-01 0.0134 0.052 0.265 B_Activated L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 -599408 sc-eQTL 5.14e-01 -0.066 0.101 0.265 B_Activated L2
ENSG00000197442 MAP3K5 475329 sc-eQTL 6.55e-01 0.0506 0.113 0.265 B_Activated L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 -600427 sc-eQTL 8.87e-01 -0.0126 0.0882 0.265 B_Activated L2
ENSG00000027697 IFNGR1 48357 sc-eQTL 3.86e-01 -0.0792 0.0911 0.275 B_Intermediate L2
ENSG00000029363 BCLAF1 977955 sc-eQTL 3.76e-02 0.108 0.0514 0.275 B_Intermediate L2
ENSG00000112357 PEX7 445242 sc-eQTL 2.79e-01 -0.103 0.0952 0.275 B_Intermediate L2
ENSG00000112378 PERP -839613 sc-eQTL 9.07e-01 0.0101 0.0871 0.275 B_Intermediate L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 -599408 sc-eQTL 4.29e-01 -0.054 0.0682 0.275 B_Intermediate L2
ENSG00000197442 MAP3K5 475329 sc-eQTL 2.33e-01 -0.0984 0.0823 0.275 B_Intermediate L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 -600427 sc-eQTL 5.35e-01 0.0601 0.0968 0.275 B_Intermediate L2
ENSG00000027697 IFNGR1 48357 sc-eQTL 5.12e-01 -0.0652 0.0992 0.278 B_Memory L2
ENSG00000029363 BCLAF1 977955 sc-eQTL 2.74e-01 0.0646 0.0588 0.278 B_Memory L2
ENSG00000112357 PEX7 445242 sc-eQTL 6.26e-01 -0.049 0.1 0.278 B_Memory L2
ENSG00000112378 PERP -839613 sc-eQTL 1.07e-01 -0.152 0.0938 0.278 B_Memory L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 -599408 sc-eQTL 5.21e-01 -0.0417 0.0649 0.278 B_Memory L2
ENSG00000197442 MAP3K5 475329 sc-eQTL 5.62e-01 0.0515 0.0886 0.278 B_Memory L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 -600427 sc-eQTL 7.17e-01 -0.0351 0.0966 0.278 B_Memory L2
ENSG00000027697 IFNGR1 48357 sc-eQTL 3.27e-01 -0.0752 0.0766 0.278 B_Naive1 L2
ENSG00000029363 BCLAF1 977955 sc-eQTL 6.82e-01 0.018 0.0438 0.278 B_Naive1 L2
ENSG00000112357 PEX7 445242 sc-eQTL 1.10e-01 0.162 0.101 0.278 B_Naive1 L2
ENSG00000112378 PERP -839613 sc-eQTL 7.27e-01 -0.0309 0.0885 0.278 B_Naive1 L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 -599408 sc-eQTL 7.88e-01 0.0138 0.0514 0.278 B_Naive1 L2
ENSG00000197442 MAP3K5 475329 sc-eQTL 6.76e-01 -0.0301 0.0721 0.278 B_Naive1 L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 -600427 sc-eQTL 5.72e-01 0.0455 0.0804 0.278 B_Naive1 L2
ENSG00000027697 IFNGR1 48357 sc-eQTL 5.62e-01 -0.0556 0.0957 0.277 B_Naive2 L2
ENSG00000029363 BCLAF1 977955 sc-eQTL 7.43e-01 0.0182 0.0555 0.277 B_Naive2 L2
ENSG00000112357 PEX7 445242 sc-eQTL 9.61e-01 0.00516 0.105 0.277 B_Naive2 L2
ENSG00000112378 PERP -839613 sc-eQTL 1.62e-01 0.107 0.076 0.277 B_Naive2 L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 -599408 sc-eQTL 4.40e-01 -0.059 0.0762 0.277 B_Naive2 L2
ENSG00000197442 MAP3K5 475329 sc-eQTL 6.36e-01 0.0385 0.0812 0.277 B_Naive2 L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 -600427 sc-eQTL 9.35e-01 0.00802 0.0987 0.277 B_Naive2 L2
ENSG00000027697 IFNGR1 48357 sc-eQTL 6.55e-01 -0.0396 0.0883 0.284 CD4_CTL L2
ENSG00000029363 BCLAF1 977955 sc-eQTL 1.97e-01 0.101 0.0781 0.284 CD4_CTL L2
ENSG00000112357 PEX7 445242 sc-eQTL 5.07e-01 -0.0651 0.0979 0.284 CD4_CTL L2
ENSG00000112378 PERP -839613 sc-eQTL 4.60e-01 -0.0734 0.0992 0.284 CD4_CTL L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 -599408 sc-eQTL 4.09e-01 0.0479 0.0579 0.284 CD4_CTL L2
ENSG00000197442 MAP3K5 475329 sc-eQTL 4.15e-01 0.0754 0.0923 0.284 CD4_CTL L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 -600427 sc-eQTL 8.91e-01 -0.0124 0.0902 0.284 CD4_CTL L2
ENSG00000027697 IFNGR1 48357 sc-eQTL 3.32e-02 -0.104 0.0484 0.278 CD4_Naive L2
ENSG00000029363 BCLAF1 977955 sc-eQTL 1.34e-01 0.0587 0.039 0.278 CD4_Naive L2
ENSG00000112357 PEX7 445242 sc-eQTL 2.05e-02 -0.213 0.0911 0.278 CD4_Naive L2
ENSG00000112378 PERP -839613 sc-eQTL 1.65e-01 0.106 0.0758 0.278 CD4_Naive L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 -599408 sc-eQTL 2.48e-01 0.0617 0.0533 0.278 CD4_Naive L2
ENSG00000197442 MAP3K5 475329 sc-eQTL 7.82e-01 0.0109 0.0392 0.278 CD4_Naive L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 -600427 sc-eQTL 2.44e-02 0.155 0.0684 0.278 CD4_Naive L2
ENSG00000027697 IFNGR1 48357 sc-eQTL 5.42e-02 -0.128 0.0662 0.278 CD4_TCM L2
ENSG00000029363 BCLAF1 977955 sc-eQTL 8.46e-01 0.00821 0.0422 0.278 CD4_TCM L2
ENSG00000112357 PEX7 445242 sc-eQTL 7.06e-01 -0.037 0.0981 0.278 CD4_TCM L2
ENSG00000112378 PERP -839613 sc-eQTL 5.83e-01 -0.0456 0.0829 0.278 CD4_TCM L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 -599408 sc-eQTL 4.48e-01 0.0366 0.0481 0.278 CD4_TCM L2
ENSG00000197442 MAP3K5 475329 sc-eQTL 9.77e-01 -0.00157 0.0548 0.278 CD4_TCM L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 -600427 sc-eQTL 2.74e-02 0.148 0.0667 0.278 CD4_TCM L2
ENSG00000027697 IFNGR1 48357 sc-eQTL 8.60e-01 -0.0133 0.0753 0.278 CD4_TEM L2
ENSG00000029363 BCLAF1 977955 sc-eQTL 9.13e-01 0.00581 0.0534 0.278 CD4_TEM L2
ENSG00000112357 PEX7 445242 sc-eQTL 8.61e-02 -0.166 0.0965 0.278 CD4_TEM L2
ENSG00000112378 PERP -839613 sc-eQTL 6.05e-01 -0.0408 0.0787 0.278 CD4_TEM L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 -599408 sc-eQTL 4.42e-01 0.0385 0.05 0.278 CD4_TEM L2
ENSG00000197442 MAP3K5 475329 sc-eQTL 1.15e-01 0.122 0.0768 0.278 CD4_TEM L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 -600427 sc-eQTL 1.26e-01 0.122 0.0798 0.278 CD4_TEM L2
ENSG00000027697 IFNGR1 48357 sc-eQTL 4.06e-03 -0.197 0.0679 0.278 CD8_CTL L2
ENSG00000029363 BCLAF1 977955 sc-eQTL 3.47e-01 0.0434 0.0461 0.278 CD8_CTL L2
ENSG00000112357 PEX7 445242 sc-eQTL 9.08e-01 -0.011 0.0953 0.278 CD8_CTL L2
ENSG00000112378 PERP -839613 sc-eQTL 1.62e-01 -0.128 0.0912 0.278 CD8_CTL L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 -599408 sc-eQTL 4.35e-01 -0.0456 0.0582 0.278 CD8_CTL L2
ENSG00000197442 MAP3K5 475329 sc-eQTL 9.08e-01 -0.00955 0.0823 0.278 CD8_CTL L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 -600427 sc-eQTL 9.68e-03 -0.211 0.0807 0.278 CD8_CTL L2
ENSG00000027697 IFNGR1 48357 sc-eQTL 2.78e-01 -0.0735 0.0675 0.278 CD8_Naive L2
ENSG00000029363 BCLAF1 977955 sc-eQTL 9.77e-01 0.00134 0.0473 0.278 CD8_Naive L2
ENSG00000112357 PEX7 445242 sc-eQTL 6.54e-01 -0.0441 0.0981 0.278 CD8_Naive L2
ENSG00000112378 PERP -839613 sc-eQTL 9.32e-02 0.125 0.0741 0.278 CD8_Naive L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 -599408 sc-eQTL 3.68e-01 0.0477 0.0529 0.278 CD8_Naive L2
ENSG00000197442 MAP3K5 475329 sc-eQTL 3.16e-01 0.063 0.0626 0.278 CD8_Naive L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 -600427 sc-eQTL 1.86e-01 0.104 0.078 0.278 CD8_Naive L2
ENSG00000027697 IFNGR1 48357 sc-eQTL 2.81e-02 -0.197 0.0892 0.285 CD8_TCM L2
ENSG00000029363 BCLAF1 977955 sc-eQTL 6.07e-01 0.0349 0.0677 0.285 CD8_TCM L2
ENSG00000112357 PEX7 445242 sc-eQTL 1.60e-01 -0.145 0.103 0.285 CD8_TCM L2
ENSG00000112378 PERP -839613 sc-eQTL 7.02e-01 0.0389 0.102 0.285 CD8_TCM L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 -599408 sc-eQTL 7.95e-01 0.0127 0.0489 0.285 CD8_TCM L2
ENSG00000197442 MAP3K5 475329 sc-eQTL 4.21e-01 0.0704 0.0872 0.285 CD8_TCM L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 -600427 sc-eQTL 1.57e-01 0.127 0.0891 0.285 CD8_TCM L2
ENSG00000027697 IFNGR1 48357 sc-eQTL 4.75e-03 -0.241 0.0844 0.274 CD8_TEM L2
ENSG00000029363 BCLAF1 977955 sc-eQTL 5.60e-01 0.0474 0.0812 0.274 CD8_TEM L2
ENSG00000112357 PEX7 445242 sc-eQTL 4.84e-01 -0.0695 0.099 0.274 CD8_TEM L2
ENSG00000112378 PERP -839613 sc-eQTL 8.47e-01 0.0199 0.103 0.274 CD8_TEM L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 -599408 sc-eQTL 3.57e-01 -0.0586 0.0634 0.274 CD8_TEM L2
ENSG00000197442 MAP3K5 475329 sc-eQTL 9.58e-01 0.00514 0.0982 0.274 CD8_TEM L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 -600427 sc-eQTL 1.18e-01 -0.147 0.0936 0.274 CD8_TEM L2
ENSG00000027697 IFNGR1 48357 sc-eQTL 2.63e-01 -0.079 0.0703 0.279 MAIT L2
ENSG00000029363 BCLAF1 977955 sc-eQTL 1.67e-01 0.0809 0.0583 0.279 MAIT L2
ENSG00000112357 PEX7 445242 sc-eQTL 9.32e-01 -0.00822 0.0956 0.279 MAIT L2
ENSG00000112378 PERP -839613 sc-eQTL 7.51e-01 0.0316 0.0997 0.279 MAIT L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 -599408 sc-eQTL 4.51e-01 -0.0358 0.0474 0.279 MAIT L2
ENSG00000197442 MAP3K5 475329 sc-eQTL 7.55e-01 0.0258 0.0826 0.279 MAIT L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 -600427 sc-eQTL 3.38e-01 -0.0842 0.0876 0.279 MAIT L2
ENSG00000027697 IFNGR1 48357 sc-eQTL 1.41e-02 -0.185 0.0748 0.282 NK_CD56bright L2
ENSG00000029363 BCLAF1 977955 sc-eQTL 7.10e-01 0.0209 0.056 0.282 NK_CD56bright L2
ENSG00000112357 PEX7 445242 sc-eQTL 9.93e-01 0.000899 0.099 0.282 NK_CD56bright L2
ENSG00000112378 PERP -839613 sc-eQTL 4.41e-01 0.0684 0.0886 0.282 NK_CD56bright L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 -599408 sc-eQTL 7.91e-01 0.015 0.0565 0.282 NK_CD56bright L2
ENSG00000197442 MAP3K5 475329 sc-eQTL 2.49e-01 0.0991 0.0857 0.282 NK_CD56bright L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 -600427 sc-eQTL 3.97e-01 -0.0765 0.09 0.282 NK_CD56bright L2
ENSG00000027697 IFNGR1 48357 sc-eQTL 5.86e-03 -0.167 0.0601 0.28 NK_CD56dim L2
ENSG00000029363 BCLAF1 977955 sc-eQTL 6.06e-01 -0.0207 0.04 0.28 NK_CD56dim L2
ENSG00000112357 PEX7 445242 sc-eQTL 2.34e-01 0.125 0.105 0.28 NK_CD56dim L2
ENSG00000112378 PERP -839613 sc-eQTL 9.16e-01 0.00784 0.0742 0.28 NK_CD56dim L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 -599408 sc-eQTL 9.61e-01 0.00285 0.0577 0.28 NK_CD56dim L2
ENSG00000197442 MAP3K5 475329 sc-eQTL 9.46e-01 0.0056 0.083 0.28 NK_CD56dim L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 -600427 sc-eQTL 3.01e-01 -0.0893 0.0862 0.28 NK_CD56dim L2
ENSG00000027697 IFNGR1 48357 sc-eQTL 2.75e-01 -0.0847 0.0774 0.285 NK_HLA L2
ENSG00000029363 BCLAF1 977955 sc-eQTL 9.60e-01 0.00332 0.0657 0.285 NK_HLA L2
ENSG00000112357 PEX7 445242 sc-eQTL 7.43e-01 -0.0323 0.0985 0.285 NK_HLA L2
ENSG00000112378 PERP -839613 sc-eQTL 3.36e-01 -0.0769 0.0798 0.285 NK_HLA L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 -599408 sc-eQTL 9.51e-02 0.102 0.0611 0.285 NK_HLA L2
ENSG00000197442 MAP3K5 475329 sc-eQTL 5.11e-01 -0.0643 0.0976 0.285 NK_HLA L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 -600427 sc-eQTL 4.64e-01 0.0727 0.099 0.285 NK_HLA L2
ENSG00000027697 IFNGR1 48357 sc-eQTL 9.18e-02 -0.109 0.0645 0.28 NK_cytokine L2
ENSG00000029363 BCLAF1 977955 sc-eQTL 6.05e-01 0.0251 0.0484 0.28 NK_cytokine L2
ENSG00000112357 PEX7 445242 sc-eQTL 9.80e-01 0.0026 0.102 0.28 NK_cytokine L2
ENSG00000112378 PERP -839613 sc-eQTL 7.95e-02 0.135 0.0767 0.28 NK_cytokine L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 -599408 sc-eQTL 5.59e-01 0.0338 0.0579 0.28 NK_cytokine L2
ENSG00000197442 MAP3K5 475329 sc-eQTL 6.21e-01 0.0394 0.0796 0.28 NK_cytokine L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 -600427 sc-eQTL 2.54e-01 0.0996 0.0871 0.28 NK_cytokine L2
ENSG00000027697 IFNGR1 48357 sc-eQTL 9.83e-01 0.00232 0.112 0.296 PB L2
ENSG00000029363 BCLAF1 977955 sc-eQTL 9.53e-02 0.16 0.0952 0.296 PB L2
ENSG00000112357 PEX7 445242 sc-eQTL 5.73e-01 -0.0647 0.115 0.296 PB L2
ENSG00000112378 PERP -839613 sc-eQTL 5.05e-01 -0.0478 0.0715 0.296 PB L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 -599408 sc-eQTL 9.08e-01 0.01 0.0868 0.296 PB L2
ENSG00000197442 MAP3K5 475329 sc-eQTL 1.95e-02 0.229 0.0965 0.296 PB L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 -600427 sc-eQTL 2.81e-02 -0.227 0.102 0.296 PB L2
ENSG00000027697 IFNGR1 48357 sc-eQTL 1.09e-01 -0.125 0.0778 0.28 Pro_T L2
ENSG00000029363 BCLAF1 977955 sc-eQTL 8.84e-01 0.0119 0.0812 0.28 Pro_T L2
ENSG00000112357 PEX7 445242 sc-eQTL 8.16e-01 -0.0221 0.0951 0.28 Pro_T L2
ENSG00000112378 PERP -839613 sc-eQTL 6.08e-01 0.0388 0.0756 0.28 Pro_T L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 -599408 sc-eQTL 9.85e-01 0.000914 0.0477 0.28 Pro_T L2
ENSG00000197442 MAP3K5 475329 sc-eQTL 2.84e-01 -0.099 0.0921 0.28 Pro_T L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 -600427 sc-eQTL 5.94e-01 -0.0494 0.0925 0.28 Pro_T L2
ENSG00000027697 IFNGR1 48357 sc-eQTL 4.55e-01 -0.0668 0.0893 0.278 Treg L2
ENSG00000029363 BCLAF1 977955 sc-eQTL 2.70e-01 0.0637 0.0576 0.278 Treg L2
ENSG00000112357 PEX7 445242 sc-eQTL 7.34e-01 0.0321 0.0944 0.278 Treg L2
ENSG00000112378 PERP -839613 sc-eQTL 2.80e-01 -0.11 0.102 0.278 Treg L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 -599408 sc-eQTL 2.83e-01 0.061 0.0567 0.278 Treg L2
ENSG00000197442 MAP3K5 475329 sc-eQTL 9.65e-01 -0.0027 0.0616 0.278 Treg L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 -600427 sc-eQTL 7.27e-01 0.0303 0.0866 0.278 Treg L2
ENSG00000027697 IFNGR1 48357 sc-eQTL 3.03e-01 -0.0811 0.0785 0.278 cDC L2
ENSG00000029363 BCLAF1 977955 sc-eQTL 4.15e-02 0.161 0.0784 0.278 cDC L2
ENSG00000112357 PEX7 445242 sc-eQTL 1.53e-01 -0.145 0.101 0.278 cDC L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 -599408 sc-eQTL 9.54e-01 0.00445 0.0776 0.278 cDC L2
ENSG00000135525 MAP7 716987 sc-eQTL 2.57e-01 -0.103 0.0904 0.278 cDC L2
ENSG00000197442 MAP3K5 475329 sc-eQTL 8.51e-01 0.015 0.0798 0.278 cDC L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 -600427 sc-eQTL 1.90e-01 0.132 0.101 0.278 cDC L2
ENSG00000286646 AL121933.2 483761 sc-eQTL 6.50e-01 0.0473 0.104 0.278 cDC L2
ENSG00000027697 IFNGR1 48357 sc-eQTL 2.09e-01 -0.0694 0.0551 0.278 cMono_IL1B L2
ENSG00000029363 BCLAF1 977955 sc-eQTL 4.20e-01 0.0478 0.0592 0.278 cMono_IL1B L2
ENSG00000112357 PEX7 445242 sc-eQTL 5.46e-02 0.191 0.0986 0.278 cMono_IL1B L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 -599408 sc-eQTL 9.26e-01 -0.00555 0.0595 0.278 cMono_IL1B L2
ENSG00000135525 MAP7 716987 sc-eQTL 4.05e-01 0.0714 0.0855 0.278 cMono_IL1B L2
ENSG00000197442 MAP3K5 475329 sc-eQTL 4.11e-01 0.0509 0.0618 0.278 cMono_IL1B L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 -600427 sc-eQTL 4.36e-01 -0.0495 0.0635 0.278 cMono_IL1B L2
ENSG00000286646 AL121933.2 483761 sc-eQTL 9.99e-01 0.000123 0.0796 0.278 cMono_IL1B L2
ENSG00000027697 IFNGR1 48357 sc-eQTL 3.77e-01 -0.0556 0.0628 0.278 cMono_S100A L2
ENSG00000029363 BCLAF1 977955 sc-eQTL 6.99e-03 0.173 0.0635 0.278 cMono_S100A L2
ENSG00000112357 PEX7 445242 sc-eQTL 2.70e-01 -0.111 0.101 0.278 cMono_S100A L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 -599408 sc-eQTL 5.15e-01 0.0364 0.0559 0.278 cMono_S100A L2
ENSG00000135525 MAP7 716987 sc-eQTL 1.91e-01 0.123 0.0938 0.278 cMono_S100A L2
ENSG00000197442 MAP3K5 475329 sc-eQTL 4.42e-01 -0.0584 0.0759 0.278 cMono_S100A L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 -600427 sc-eQTL 7.97e-01 0.0207 0.0803 0.278 cMono_S100A L2
ENSG00000286646 AL121933.2 483761 sc-eQTL 4.79e-01 0.0556 0.0783 0.278 cMono_S100A L2
ENSG00000027697 IFNGR1 48357 sc-eQTL 8.84e-03 -0.256 0.0965 0.27 gdT L2
ENSG00000029363 BCLAF1 977955 sc-eQTL 2.42e-02 0.195 0.0855 0.27 gdT L2
ENSG00000112357 PEX7 445242 sc-eQTL 9.73e-01 -0.0042 0.125 0.27 gdT L2
ENSG00000112378 PERP -839613 sc-eQTL 5.25e-02 -0.211 0.108 0.27 gdT L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 -599408 sc-eQTL 3.74e-01 -0.0541 0.0607 0.27 gdT L2
ENSG00000197442 MAP3K5 475329 sc-eQTL 2.30e-01 -0.154 0.128 0.27 gdT L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 -600427 sc-eQTL 6.26e-01 -0.0538 0.11 0.27 gdT L2
ENSG00000027697 IFNGR1 48357 sc-eQTL 3.44e-01 -0.0644 0.0678 0.278 intMono L2
ENSG00000029363 BCLAF1 977955 sc-eQTL 4.60e-01 0.0664 0.0896 0.278 intMono L2
ENSG00000112357 PEX7 445242 sc-eQTL 6.45e-01 -0.0422 0.0916 0.278 intMono L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 -599408 sc-eQTL 4.22e-01 -0.0471 0.0586 0.278 intMono L2
ENSG00000135525 MAP7 716987 sc-eQTL 4.30e-01 -0.0713 0.09 0.278 intMono L2
ENSG00000197442 MAP3K5 475329 sc-eQTL 5.07e-01 0.0633 0.0954 0.278 intMono L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 -600427 sc-eQTL 7.31e-01 -0.0301 0.0875 0.278 intMono L2
ENSG00000286646 AL121933.2 483761 sc-eQTL 7.00e-01 -0.039 0.101 0.278 intMono L2
ENSG00000027697 IFNGR1 48357 sc-eQTL 3.88e-01 -0.0693 0.08 0.276 ncMono L2
ENSG00000029363 BCLAF1 977955 sc-eQTL 2.70e-01 -0.0686 0.0621 0.276 ncMono L2
ENSG00000112357 PEX7 445242 sc-eQTL 5.95e-01 0.0528 0.0992 0.276 ncMono L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 -599408 sc-eQTL 8.45e-01 -0.0139 0.0709 0.276 ncMono L2
ENSG00000135525 MAP7 716987 sc-eQTL 1.45e-01 0.128 0.0872 0.276 ncMono L2
ENSG00000197442 MAP3K5 475329 sc-eQTL 3.95e-01 -0.0784 0.092 0.276 ncMono L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 -600427 sc-eQTL 7.01e-01 0.0341 0.0887 0.276 ncMono L2
ENSG00000286646 AL121933.2 483761 sc-eQTL 5.74e-01 -0.0526 0.0935 0.276 ncMono L2
ENSG00000027697 IFNGR1 48357 sc-eQTL 9.29e-01 0.00829 0.0924 0.282 pDC L2
ENSG00000029363 BCLAF1 977955 sc-eQTL 3.09e-01 0.0704 0.0691 0.282 pDC L2
ENSG00000112357 PEX7 445242 sc-eQTL 5.97e-01 0.0538 0.102 0.282 pDC L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 -599408 sc-eQTL 1.24e-01 -0.131 0.085 0.282 pDC L2
ENSG00000135525 MAP7 716987 sc-eQTL 5.35e-01 -0.0441 0.0709 0.282 pDC L2
ENSG00000197442 MAP3K5 475329 sc-eQTL 4.40e-01 -0.0879 0.113 0.282 pDC L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 -600427 sc-eQTL 7.44e-01 0.0284 0.0869 0.282 pDC L2
ENSG00000286646 AL121933.2 483761 sc-eQTL 2.81e-01 -0.113 0.104 0.282 pDC L2
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000027697 IFNGR1 48357 sc-eQTL 5.64e-01 -0.0467 0.0808 0.278 B_Memory LOneK1K
ENSG00000029363 BCLAF1 977955 sc-eQTL 4.46e-02 0.0909 0.045 0.278 B_Memory LOneK1K
ENSG00000112357 PEX7 445242 sc-eQTL 4.52e-01 -0.07 0.0929 0.278 B_Memory LOneK1K
ENSG00000112378 PERP -839613 sc-eQTL 1.55e-01 -0.123 0.0861 0.278 B_Memory LOneK1K
ENSG00000118503 TNFAIP3 -599408 sc-eQTL 7.95e-02 -0.0998 0.0567 0.278 B_Memory LOneK1K
ENSG00000197442 MAP3K5 475329 sc-eQTL 1.75e-01 -0.102 0.0752 0.278 B_Memory LOneK1K
ENSG00000237499 WAKMAR2 -600427 sc-eQTL 6.59e-01 -0.0426 0.0965 0.278 B_Memory LOneK1K
ENSG00000027697 IFNGR1 48357 sc-eQTL 4.23e-01 -0.0659 0.0821 0.278 B_Naive LOneK1K
ENSG00000029363 BCLAF1 977955 sc-eQTL 8.12e-01 0.00901 0.0378 0.278 B_Naive LOneK1K
ENSG00000112357 PEX7 445242 sc-eQTL 1.59e-01 0.141 0.0996 0.278 B_Naive LOneK1K
ENSG00000112378 PERP -839613 sc-eQTL 8.24e-01 -0.02 0.0895 0.278 B_Naive LOneK1K
ENSG00000118503 TNFAIP3 -599408 sc-eQTL 7.08e-01 -0.0177 0.047 0.278 B_Naive LOneK1K
ENSG00000197442 MAP3K5 475329 sc-eQTL 8.09e-01 -0.0167 0.069 0.278 B_Naive LOneK1K
ENSG00000237499 WAKMAR2 -600427 sc-eQTL 8.74e-01 0.0133 0.0838 0.278 B_Naive LOneK1K
ENSG00000027697 IFNGR1 48357 sc-eQTL 3.79e-01 -0.048 0.0545 0.278 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000029363 BCLAF1 977955 sc-eQTL 2.05e-01 0.0644 0.0506 0.278 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000112357 PEX7 445242 sc-eQTL 3.08e-01 0.0999 0.0978 0.278 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000118503 TNFAIP3 -599408 sc-eQTL 7.18e-01 -0.0182 0.0505 0.278 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000135525 MAP7 716987 sc-eQTL 2.51e-01 0.101 0.0873 0.278 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000197442 MAP3K5 475329 sc-eQTL 8.83e-01 0.00874 0.0592 0.278 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000237499 WAKMAR2 -600427 sc-eQTL 6.47e-01 -0.0277 0.0605 0.278 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000286646 AL121933.2 483761 sc-eQTL 2.79e-01 0.0762 0.0702 0.278 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000027697 IFNGR1 48357 sc-eQTL 1.46e-01 -0.0948 0.0649 0.278 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000029363 BCLAF1 977955 sc-eQTL 7.94e-01 -0.0154 0.0589 0.278 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000112357 PEX7 445242 sc-eQTL 9.06e-01 -0.0117 0.0984 0.278 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000118503 TNFAIP3 -599408 sc-eQTL 3.01e-01 -0.063 0.0608 0.278 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000135525 MAP7 716987 sc-eQTL 6.19e-01 0.0473 0.0951 0.278 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000197442 MAP3K5 475329 sc-eQTL 8.21e-01 -0.0177 0.0781 0.278 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000237499 WAKMAR2 -600427 sc-eQTL 9.27e-01 -0.00752 0.0817 0.278 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000286646 AL121933.2 483761 sc-eQTL 1.52e-01 -0.133 0.0923 0.278 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000027697 IFNGR1 48357 sc-eQTL 5.63e-02 -0.119 0.0619 0.28 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000029363 BCLAF1 977955 sc-eQTL 9.93e-01 0.000297 0.0363 0.28 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000112357 PEX7 445242 sc-eQTL 4.02e-01 0.0884 0.105 0.28 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000112378 PERP -839613 sc-eQTL 4.90e-01 0.0451 0.0653 0.28 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000118503 TNFAIP3 -599408 sc-eQTL 5.48e-01 0.0342 0.0569 0.28 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000197442 MAP3K5 475329 sc-eQTL 7.50e-01 0.0245 0.0769 0.28 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000237499 WAKMAR2 -600427 sc-eQTL 6.83e-01 -0.0325 0.0796 0.28 NK_CD56dim LOneK1K

Statistical fine-mapping results from Japan COVID-19 Task Force
(Shown only for PIP>0.001)
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
PIP (SuSiE)
PIP (FINEMAP)
MAF
ENSG00000118503 TNFAIP3 -599408 eQTL 0.00496 0.0434 0.0154 0.00215 0.0 0.272
ENSG00000135525 MAP7 716987 eQTL 0.00638 0.0766 0.028 0.00271 0.0 0.272

Expression Modifier Score(EMS) for GTEx 49tissues
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Whole Blood
Muscle Skeletal
Liver
Brain Cerebellum
Prostate
Spleen
Skin Sun Exposed Lower leg
Artery Coronary
Esophagus Muscularis
Esophagus Gastroesophageal Junction
Artery Tibial
Heart Atrial Appendage
Nerve Tibial
Heart Left Ventricle
Adrenal Gland
Adipose Visceral Omentum
Pancreas
Lung
Pituitary
Brain Nucleus accumbens basal ganglia
Colon Transverse
Adipose Subcutaneous
Esophagus Mucosa
Brain Cortex
Thyroid
Stomach
Breast Mammary Tissue
Colon Sigmoid
Skin Not Sun Exposed Suprapubic
Testis
Artery Aorta
Brain Amygdala
Brain Anterior cingulate cortex BA24
Brain Caudate basal ganglia
Brain Cerebellar Hemisphere
Brain Frontal Cortex BA9
Brain Hippocampus
Brain Hypothalamus
Brain Putamen basal ganglia
Brain Spinal cord cervical c-1
Brain Substantia nigra
Cells Cultured fibroblasts
Cells EBV-transformed lymphocytes
Kidney Cortex
Minor Salivary Gland
Ovary
Small Intestine Terminal Ileum
Uterus
Vagina