logo

Genes within 1Mb (chr6:137258205:A:G):

View on , UCSC , GTEx , gnomAD

Immune cell-type specific single cell cis-eQTLs in OASIS
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000027697 IFNGR1 38756 sc-eQTL 1.06e-02 0.222 0.0863 0.207 B L1
ENSG00000029363 BCLAF1 968354 sc-eQTL 4.31e-01 -0.0307 0.039 0.207 B L1
ENSG00000112357 PEX7 435641 sc-eQTL 8.01e-02 -0.181 0.103 0.207 B L1
ENSG00000112378 PERP -849214 sc-eQTL 4.29e-01 -0.0544 0.0685 0.207 B L1
ENSG00000118503 TNFAIP3 -609009 sc-eQTL 1.44e-01 0.0806 0.055 0.207 B L1
ENSG00000197442 MAP3K5 465728 sc-eQTL 5.84e-01 -0.0422 0.077 0.207 B L1
ENSG00000237499 WAKMAR2 -610028 sc-eQTL 6.03e-01 -0.0453 0.0869 0.207 B L1
ENSG00000027697 IFNGR1 38756 sc-eQTL 1.22e-01 0.0876 0.0565 0.207 CD4T L1
ENSG00000029363 BCLAF1 968354 sc-eQTL 4.22e-01 -0.0345 0.0429 0.207 CD4T L1
ENSG00000112357 PEX7 435641 sc-eQTL 7.67e-03 0.242 0.0899 0.207 CD4T L1
ENSG00000112378 PERP -849214 sc-eQTL 2.49e-02 0.137 0.0607 0.207 CD4T L1
ENSG00000118503 TNFAIP3 -609009 sc-eQTL 9.42e-01 -0.00418 0.0575 0.207 CD4T L1
ENSG00000197442 MAP3K5 465728 sc-eQTL 4.92e-01 -0.0301 0.0438 0.207 CD4T L1
ENSG00000237499 WAKMAR2 -610028 sc-eQTL 6.86e-01 -0.0293 0.0724 0.207 CD4T L1
ENSG00000027697 IFNGR1 38756 sc-eQTL 1.78e-02 0.155 0.0651 0.207 CD8T L1
ENSG00000029363 BCLAF1 968354 sc-eQTL 9.66e-01 -0.00189 0.0446 0.207 CD8T L1
ENSG00000112357 PEX7 435641 sc-eQTL 7.52e-01 0.0348 0.11 0.207 CD8T L1
ENSG00000112378 PERP -849214 sc-eQTL 4.41e-01 0.0554 0.0718 0.207 CD8T L1
ENSG00000118503 TNFAIP3 -609009 sc-eQTL 8.47e-01 -0.0107 0.0555 0.207 CD8T L1
ENSG00000197442 MAP3K5 465728 sc-eQTL 1.68e-01 -0.0808 0.0584 0.207 CD8T L1
ENSG00000237499 WAKMAR2 -610028 sc-eQTL 9.74e-01 0.00263 0.0815 0.207 CD8T L1
ENSG00000027697 IFNGR1 38756 sc-eQTL 3.01e-01 0.0824 0.0795 0.209 DC L1
ENSG00000029363 BCLAF1 968354 sc-eQTL 1.20e-01 -0.111 0.0713 0.209 DC L1
ENSG00000112357 PEX7 435641 sc-eQTL 6.43e-01 0.0521 0.112 0.209 DC L1
ENSG00000118503 TNFAIP3 -609009 sc-eQTL 9.81e-01 -0.00201 0.0852 0.209 DC L1
ENSG00000135525 MAP7 707386 sc-eQTL 4.01e-01 -0.0775 0.0921 0.209 DC L1
ENSG00000197442 MAP3K5 465728 sc-eQTL 7.84e-02 -0.155 0.0877 0.209 DC L1
ENSG00000237499 WAKMAR2 -610028 sc-eQTL 5.56e-02 -0.166 0.086 0.209 DC L1
ENSG00000286646 AL121933.2 474160 sc-eQTL 5.37e-01 0.0714 0.115 0.209 DC L1
ENSG00000027697 IFNGR1 38756 sc-eQTL 2.40e-01 0.0774 0.0657 0.207 Mono L1
ENSG00000029363 BCLAF1 968354 sc-eQTL 5.73e-03 -0.155 0.0554 0.207 Mono L1
ENSG00000112357 PEX7 435641 sc-eQTL 1.26e-01 0.169 0.11 0.207 Mono L1
ENSG00000118503 TNFAIP3 -609009 sc-eQTL 6.47e-01 0.0257 0.0559 0.207 Mono L1
ENSG00000135525 MAP7 707386 sc-eQTL 1.03e-01 -0.159 0.0973 0.207 Mono L1
ENSG00000197442 MAP3K5 465728 sc-eQTL 2.77e-02 -0.143 0.0645 0.207 Mono L1
ENSG00000237499 WAKMAR2 -610028 sc-eQTL 5.02e-01 -0.0466 0.0692 0.207 Mono L1
ENSG00000286646 AL121933.2 474160 sc-eQTL 2.61e-01 0.0889 0.0788 0.207 Mono L1
ENSG00000027697 IFNGR1 38756 sc-eQTL 5.73e-03 0.201 0.072 0.208 NK L1
ENSG00000029363 BCLAF1 968354 sc-eQTL 6.41e-01 0.0182 0.0389 0.208 NK L1
ENSG00000112357 PEX7 435641 sc-eQTL 7.89e-01 0.0303 0.113 0.208 NK L1
ENSG00000112378 PERP -849214 sc-eQTL 4.10e-02 0.145 0.0706 0.208 NK L1
ENSG00000118503 TNFAIP3 -609009 sc-eQTL 4.45e-01 0.0466 0.0609 0.208 NK L1
ENSG00000197442 MAP3K5 465728 sc-eQTL 8.78e-01 -0.0134 0.0874 0.208 NK L1
ENSG00000237499 WAKMAR2 -610028 sc-eQTL 5.97e-01 -0.0458 0.0864 0.208 NK L1
ENSG00000027697 IFNGR1 38756 sc-eQTL 2.59e-07 0.34 0.0638 0.207 Other_T L1
ENSG00000029363 BCLAF1 968354 sc-eQTL 7.89e-02 -0.0999 0.0566 0.207 Other_T L1
ENSG00000112357 PEX7 435641 sc-eQTL 4.23e-01 -0.0888 0.111 0.207 Other_T L1
ENSG00000112378 PERP -849214 sc-eQTL 9.27e-01 0.0081 0.0889 0.207 Other_T L1
ENSG00000118503 TNFAIP3 -609009 sc-eQTL 3.97e-01 0.0359 0.0422 0.207 Other_T L1
ENSG00000197442 MAP3K5 465728 sc-eQTL 5.18e-02 -0.158 0.0809 0.207 Other_T L1
ENSG00000237499 WAKMAR2 -610028 sc-eQTL 3.81e-01 0.0735 0.0838 0.207 Other_T L1
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000027697 IFNGR1 38756 sc-eQTL 2.04e-02 0.268 0.114 0.212 B_Activated L2
ENSG00000029363 BCLAF1 968354 sc-eQTL 6.64e-01 0.0411 0.0943 0.212 B_Activated L2
ENSG00000112357 PEX7 435641 sc-eQTL 3.88e-02 0.235 0.113 0.212 B_Activated L2
ENSG00000112378 PERP -849214 sc-eQTL 6.08e-01 0.0303 0.0591 0.212 B_Activated L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 -609009 sc-eQTL 3.00e-01 0.119 0.114 0.212 B_Activated L2
ENSG00000197442 MAP3K5 465728 sc-eQTL 5.14e-01 0.0839 0.128 0.212 B_Activated L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 -610028 sc-eQTL 5.51e-01 0.0598 0.1 0.212 B_Activated L2
ENSG00000027697 IFNGR1 38756 sc-eQTL 5.62e-02 0.193 0.101 0.208 B_Intermediate L2
ENSG00000029363 BCLAF1 968354 sc-eQTL 5.59e-01 0.0338 0.0578 0.208 B_Intermediate L2
ENSG00000112357 PEX7 435641 sc-eQTL 7.07e-01 0.04 0.106 0.208 B_Intermediate L2
ENSG00000112378 PERP -849214 sc-eQTL 4.72e-01 -0.0697 0.0968 0.208 B_Intermediate L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 -609009 sc-eQTL 2.92e-01 0.0802 0.0758 0.208 B_Intermediate L2
ENSG00000197442 MAP3K5 465728 sc-eQTL 4.29e-01 0.0727 0.0918 0.208 B_Intermediate L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 -610028 sc-eQTL 4.70e-01 -0.078 0.108 0.208 B_Intermediate L2
ENSG00000027697 IFNGR1 38756 sc-eQTL 4.96e-02 0.213 0.108 0.205 B_Memory L2
ENSG00000029363 BCLAF1 968354 sc-eQTL 1.13e-01 0.102 0.0643 0.205 B_Memory L2
ENSG00000112357 PEX7 435641 sc-eQTL 1.42e-01 -0.161 0.109 0.205 B_Memory L2
ENSG00000112378 PERP -849214 sc-eQTL 7.60e-01 -0.0317 0.104 0.205 B_Memory L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 -609009 sc-eQTL 4.12e-01 0.0585 0.0711 0.205 B_Memory L2
ENSG00000197442 MAP3K5 465728 sc-eQTL 6.24e-01 0.0478 0.0973 0.205 B_Memory L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 -610028 sc-eQTL 5.28e-01 0.067 0.106 0.205 B_Memory L2
ENSG00000027697 IFNGR1 38756 sc-eQTL 2.65e-01 0.0987 0.0884 0.207 B_Naive1 L2
ENSG00000029363 BCLAF1 968354 sc-eQTL 7.32e-01 -0.0173 0.0507 0.207 B_Naive1 L2
ENSG00000112357 PEX7 435641 sc-eQTL 7.27e-04 -0.391 0.114 0.207 B_Naive1 L2
ENSG00000112378 PERP -849214 sc-eQTL 4.68e-01 0.0743 0.102 0.207 B_Naive1 L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 -609009 sc-eQTL 9.93e-01 -0.000521 0.0593 0.207 B_Naive1 L2
ENSG00000197442 MAP3K5 465728 sc-eQTL 8.37e-01 -0.0171 0.0834 0.207 B_Naive1 L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 -610028 sc-eQTL 2.00e-01 -0.119 0.0926 0.207 B_Naive1 L2
ENSG00000027697 IFNGR1 38756 sc-eQTL 2.45e-02 0.242 0.107 0.206 B_Naive2 L2
ENSG00000029363 BCLAF1 968354 sc-eQTL 2.16e-01 -0.0775 0.0624 0.206 B_Naive2 L2
ENSG00000112357 PEX7 435641 sc-eQTL 7.95e-01 0.0307 0.118 0.206 B_Naive2 L2
ENSG00000112378 PERP -849214 sc-eQTL 3.35e-01 0.0831 0.0859 0.206 B_Naive2 L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 -609009 sc-eQTL 8.06e-01 0.0211 0.086 0.206 B_Naive2 L2
ENSG00000197442 MAP3K5 465728 sc-eQTL 9.38e-01 0.00712 0.0916 0.206 B_Naive2 L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 -610028 sc-eQTL 5.88e-01 -0.0603 0.111 0.206 B_Naive2 L2
ENSG00000027697 IFNGR1 38756 sc-eQTL 1.56e-01 0.149 0.104 0.205 CD4_CTL L2
ENSG00000029363 BCLAF1 968354 sc-eQTL 1.21e-01 -0.144 0.0924 0.205 CD4_CTL L2
ENSG00000112357 PEX7 435641 sc-eQTL 2.39e-01 0.137 0.116 0.205 CD4_CTL L2
ENSG00000112378 PERP -849214 sc-eQTL 7.88e-01 0.0317 0.118 0.205 CD4_CTL L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 -609009 sc-eQTL 4.32e-01 0.054 0.0686 0.205 CD4_CTL L2
ENSG00000197442 MAP3K5 465728 sc-eQTL 7.32e-01 0.0376 0.11 0.205 CD4_CTL L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 -610028 sc-eQTL 5.79e-01 -0.0594 0.107 0.205 CD4_CTL L2
ENSG00000027697 IFNGR1 38756 sc-eQTL 7.16e-01 0.0196 0.0537 0.207 CD4_Naive L2
ENSG00000029363 BCLAF1 968354 sc-eQTL 1.61e-01 -0.0605 0.0429 0.207 CD4_Naive L2
ENSG00000112357 PEX7 435641 sc-eQTL 5.77e-02 0.192 0.101 0.207 CD4_Naive L2
ENSG00000112378 PERP -849214 sc-eQTL 9.97e-01 0.000356 0.0837 0.207 CD4_Naive L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 -609009 sc-eQTL 8.29e-01 -0.0127 0.0587 0.207 CD4_Naive L2
ENSG00000197442 MAP3K5 465728 sc-eQTL 7.20e-01 0.0155 0.0431 0.207 CD4_Naive L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 -610028 sc-eQTL 4.99e-01 -0.0515 0.076 0.207 CD4_Naive L2
ENSG00000027697 IFNGR1 38756 sc-eQTL 1.22e-01 0.116 0.0746 0.207 CD4_TCM L2
ENSG00000029363 BCLAF1 968354 sc-eQTL 3.63e-01 0.0431 0.0472 0.207 CD4_TCM L2
ENSG00000112357 PEX7 435641 sc-eQTL 2.34e-01 0.131 0.11 0.207 CD4_TCM L2
ENSG00000112378 PERP -849214 sc-eQTL 8.69e-02 0.159 0.0924 0.207 CD4_TCM L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 -609009 sc-eQTL 7.11e-01 -0.0201 0.054 0.207 CD4_TCM L2
ENSG00000197442 MAP3K5 465728 sc-eQTL 7.15e-01 0.0225 0.0615 0.207 CD4_TCM L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 -610028 sc-eQTL 9.55e-01 0.00426 0.0757 0.207 CD4_TCM L2
ENSG00000027697 IFNGR1 38756 sc-eQTL 6.16e-03 0.233 0.0842 0.207 CD4_TEM L2
ENSG00000029363 BCLAF1 968354 sc-eQTL 8.96e-01 -0.00792 0.0608 0.207 CD4_TEM L2
ENSG00000112357 PEX7 435641 sc-eQTL 7.06e-01 -0.0418 0.111 0.207 CD4_TEM L2
ENSG00000112378 PERP -849214 sc-eQTL 1.86e-01 0.118 0.0893 0.207 CD4_TEM L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 -609009 sc-eQTL 7.54e-01 -0.0178 0.0569 0.207 CD4_TEM L2
ENSG00000197442 MAP3K5 465728 sc-eQTL 3.07e-01 -0.0898 0.0877 0.207 CD4_TEM L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 -610028 sc-eQTL 3.48e-01 -0.0856 0.0911 0.207 CD4_TEM L2
ENSG00000027697 IFNGR1 38756 sc-eQTL 3.33e-03 0.229 0.0771 0.207 CD8_CTL L2
ENSG00000029363 BCLAF1 968354 sc-eQTL 3.62e-01 -0.0478 0.0523 0.207 CD8_CTL L2
ENSG00000112357 PEX7 435641 sc-eQTL 7.85e-01 0.0296 0.108 0.207 CD8_CTL L2
ENSG00000112378 PERP -849214 sc-eQTL 9.63e-02 0.173 0.103 0.207 CD8_CTL L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 -609009 sc-eQTL 2.92e-01 0.0697 0.066 0.207 CD8_CTL L2
ENSG00000197442 MAP3K5 465728 sc-eQTL 4.96e-01 -0.0637 0.0933 0.207 CD8_CTL L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 -610028 sc-eQTL 9.21e-01 0.00926 0.0931 0.207 CD8_CTL L2
ENSG00000027697 IFNGR1 38756 sc-eQTL 3.93e-01 0.0669 0.0781 0.207 CD8_Naive L2
ENSG00000029363 BCLAF1 968354 sc-eQTL 9.46e-01 -0.00371 0.0546 0.207 CD8_Naive L2
ENSG00000112357 PEX7 435641 sc-eQTL 1.65e-01 0.157 0.113 0.207 CD8_Naive L2
ENSG00000112378 PERP -849214 sc-eQTL 1.28e-01 0.131 0.0858 0.207 CD8_Naive L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 -609009 sc-eQTL 9.22e-01 0.00603 0.0612 0.207 CD8_Naive L2
ENSG00000197442 MAP3K5 465728 sc-eQTL 1.72e-01 -0.099 0.0722 0.207 CD8_Naive L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 -610028 sc-eQTL 1.70e-01 -0.124 0.0901 0.207 CD8_Naive L2
ENSG00000027697 IFNGR1 38756 sc-eQTL 5.48e-01 -0.063 0.105 0.204 CD8_TCM L2
ENSG00000029363 BCLAF1 968354 sc-eQTL 7.93e-01 0.0206 0.0786 0.204 CD8_TCM L2
ENSG00000112357 PEX7 435641 sc-eQTL 3.10e-01 0.122 0.12 0.204 CD8_TCM L2
ENSG00000112378 PERP -849214 sc-eQTL 5.52e-01 -0.0701 0.118 0.204 CD8_TCM L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 -609009 sc-eQTL 1.79e-01 -0.0762 0.0565 0.204 CD8_TCM L2
ENSG00000197442 MAP3K5 465728 sc-eQTL 5.61e-01 -0.0589 0.101 0.204 CD8_TCM L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 -610028 sc-eQTL 4.31e-01 -0.0819 0.104 0.204 CD8_TCM L2
ENSG00000027697 IFNGR1 38756 sc-eQTL 5.84e-03 0.279 0.1 0.215 CD8_TEM L2
ENSG00000029363 BCLAF1 968354 sc-eQTL 5.87e-01 -0.0524 0.0963 0.215 CD8_TEM L2
ENSG00000112357 PEX7 435641 sc-eQTL 4.50e-01 0.0888 0.117 0.215 CD8_TEM L2
ENSG00000112378 PERP -849214 sc-eQTL 3.15e-01 0.123 0.122 0.215 CD8_TEM L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 -609009 sc-eQTL 3.31e-01 0.0732 0.0751 0.215 CD8_TEM L2
ENSG00000197442 MAP3K5 465728 sc-eQTL 4.94e-01 -0.0797 0.116 0.215 CD8_TEM L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 -610028 sc-eQTL 3.95e-01 0.0951 0.112 0.215 CD8_TEM L2
ENSG00000027697 IFNGR1 38756 sc-eQTL 5.96e-08 0.409 0.0727 0.21 MAIT L2
ENSG00000029363 BCLAF1 968354 sc-eQTL 2.91e-01 0.0685 0.0647 0.21 MAIT L2
ENSG00000112357 PEX7 435641 sc-eQTL 2.90e-02 -0.23 0.105 0.21 MAIT L2
ENSG00000112378 PERP -849214 sc-eQTL 8.08e-01 0.0268 0.11 0.21 MAIT L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 -609009 sc-eQTL 2.14e-01 0.0652 0.0523 0.21 MAIT L2
ENSG00000197442 MAP3K5 465728 sc-eQTL 2.15e-01 -0.113 0.0911 0.21 MAIT L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 -610028 sc-eQTL 7.32e-01 0.0333 0.0971 0.21 MAIT L2
ENSG00000027697 IFNGR1 38756 sc-eQTL 2.86e-02 0.193 0.0877 0.207 NK_CD56bright L2
ENSG00000029363 BCLAF1 968354 sc-eQTL 4.21e-01 0.0527 0.0653 0.207 NK_CD56bright L2
ENSG00000112357 PEX7 435641 sc-eQTL 2.28e-01 0.139 0.115 0.207 NK_CD56bright L2
ENSG00000112378 PERP -849214 sc-eQTL 6.86e-01 0.0419 0.104 0.207 NK_CD56bright L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 -609009 sc-eQTL 8.34e-02 0.114 0.0656 0.207 NK_CD56bright L2
ENSG00000197442 MAP3K5 465728 sc-eQTL 3.07e-01 -0.103 0.1 0.207 NK_CD56bright L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 -610028 sc-eQTL 9.47e-02 0.176 0.105 0.207 NK_CD56bright L2
ENSG00000027697 IFNGR1 38756 sc-eQTL 1.96e-03 0.208 0.0662 0.205 NK_CD56dim L2
ENSG00000029363 BCLAF1 968354 sc-eQTL 1.72e-01 0.0604 0.044 0.205 NK_CD56dim L2
ENSG00000112357 PEX7 435641 sc-eQTL 9.35e-01 -0.00946 0.117 0.205 NK_CD56dim L2
ENSG00000112378 PERP -849214 sc-eQTL 2.35e-02 0.185 0.081 0.205 NK_CD56dim L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 -609009 sc-eQTL 4.70e-01 0.0461 0.0637 0.205 NK_CD56dim L2
ENSG00000197442 MAP3K5 465728 sc-eQTL 6.35e-01 0.0437 0.0918 0.205 NK_CD56dim L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 -610028 sc-eQTL 8.50e-01 -0.0181 0.0955 0.205 NK_CD56dim L2
ENSG00000027697 IFNGR1 38756 sc-eQTL 2.70e-02 0.203 0.091 0.194 NK_HLA L2
ENSG00000029363 BCLAF1 968354 sc-eQTL 3.59e-01 -0.0717 0.0779 0.194 NK_HLA L2
ENSG00000112357 PEX7 435641 sc-eQTL 6.59e-01 0.0518 0.117 0.194 NK_HLA L2
ENSG00000112378 PERP -849214 sc-eQTL 5.26e-01 0.0603 0.0949 0.194 NK_HLA L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 -609009 sc-eQTL 3.47e-01 0.0687 0.0729 0.194 NK_HLA L2
ENSG00000197442 MAP3K5 465728 sc-eQTL 9.72e-01 -0.00414 0.116 0.194 NK_HLA L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 -610028 sc-eQTL 2.46e-01 -0.136 0.117 0.194 NK_HLA L2
ENSG00000027697 IFNGR1 38756 sc-eQTL 3.22e-02 0.155 0.0718 0.205 NK_cytokine L2
ENSG00000029363 BCLAF1 968354 sc-eQTL 2.88e-01 0.0575 0.054 0.205 NK_cytokine L2
ENSG00000112357 PEX7 435641 sc-eQTL 2.25e-01 -0.138 0.114 0.205 NK_cytokine L2
ENSG00000112378 PERP -849214 sc-eQTL 7.43e-01 0.0284 0.0864 0.205 NK_cytokine L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 -609009 sc-eQTL 7.39e-01 0.0216 0.0648 0.205 NK_cytokine L2
ENSG00000197442 MAP3K5 465728 sc-eQTL 7.10e-01 0.0331 0.089 0.205 NK_cytokine L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 -610028 sc-eQTL 3.64e-01 -0.0886 0.0975 0.205 NK_cytokine L2
ENSG00000027697 IFNGR1 38756 sc-eQTL 8.09e-01 -0.0319 0.132 0.211 PB L2
ENSG00000029363 BCLAF1 968354 sc-eQTL 6.44e-02 -0.209 0.112 0.211 PB L2
ENSG00000112357 PEX7 435641 sc-eQTL 5.31e-01 0.085 0.135 0.211 PB L2
ENSG00000112378 PERP -849214 sc-eQTL 2.47e-01 0.0977 0.084 0.211 PB L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 -609009 sc-eQTL 6.74e-02 0.186 0.101 0.211 PB L2
ENSG00000197442 MAP3K5 465728 sc-eQTL 1.42e-01 -0.171 0.115 0.211 PB L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 -610028 sc-eQTL 1.07e-01 0.197 0.122 0.211 PB L2
ENSG00000027697 IFNGR1 38756 sc-eQTL 3.44e-03 0.267 0.0901 0.204 Pro_T L2
ENSG00000029363 BCLAF1 968354 sc-eQTL 3.12e-02 -0.205 0.0943 0.204 Pro_T L2
ENSG00000112357 PEX7 435641 sc-eQTL 4.67e-01 0.0812 0.112 0.204 Pro_T L2
ENSG00000112378 PERP -849214 sc-eQTL 4.97e-01 0.0604 0.0888 0.204 Pro_T L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 -609009 sc-eQTL 6.36e-01 -0.0265 0.056 0.204 Pro_T L2
ENSG00000197442 MAP3K5 465728 sc-eQTL 4.94e-01 -0.0742 0.108 0.204 Pro_T L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 -610028 sc-eQTL 6.99e-01 0.0421 0.109 0.204 Pro_T L2
ENSG00000027697 IFNGR1 38756 sc-eQTL 2.72e-01 0.113 0.102 0.207 Treg L2
ENSG00000029363 BCLAF1 968354 sc-eQTL 7.37e-01 0.0223 0.0664 0.207 Treg L2
ENSG00000112357 PEX7 435641 sc-eQTL 4.09e-01 0.0897 0.108 0.207 Treg L2
ENSG00000112378 PERP -849214 sc-eQTL 4.95e-03 0.327 0.115 0.207 Treg L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 -609009 sc-eQTL 1.93e-01 -0.085 0.0651 0.207 Treg L2
ENSG00000197442 MAP3K5 465728 sc-eQTL 1.28e-01 -0.108 0.0704 0.207 Treg L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 -610028 sc-eQTL 9.24e-01 -0.00946 0.0997 0.207 Treg L2
ENSG00000027697 IFNGR1 38756 sc-eQTL 4.59e-01 0.0652 0.0879 0.21 cDC L2
ENSG00000029363 BCLAF1 968354 sc-eQTL 1.30e-01 -0.134 0.0881 0.21 cDC L2
ENSG00000112357 PEX7 435641 sc-eQTL 4.41e-01 0.0879 0.114 0.21 cDC L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 -609009 sc-eQTL 9.08e-01 0.01 0.0868 0.21 cDC L2
ENSG00000135525 MAP7 707386 sc-eQTL 6.64e-01 -0.0441 0.101 0.21 cDC L2
ENSG00000197442 MAP3K5 465728 sc-eQTL 4.72e-01 -0.0642 0.0892 0.21 cDC L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 -610028 sc-eQTL 9.32e-03 -0.292 0.111 0.21 cDC L2
ENSG00000286646 AL121933.2 474160 sc-eQTL 9.92e-01 0.00113 0.116 0.21 cDC L2
ENSG00000027697 IFNGR1 38756 sc-eQTL 7.88e-01 0.0166 0.0618 0.207 cMono_IL1B L2
ENSG00000029363 BCLAF1 968354 sc-eQTL 2.34e-02 -0.15 0.0655 0.207 cMono_IL1B L2
ENSG00000112357 PEX7 435641 sc-eQTL 2.87e-01 0.118 0.111 0.207 cMono_IL1B L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 -609009 sc-eQTL 3.62e-01 -0.0606 0.0664 0.207 cMono_IL1B L2
ENSG00000135525 MAP7 707386 sc-eQTL 5.89e-01 -0.0518 0.0957 0.207 cMono_IL1B L2
ENSG00000197442 MAP3K5 465728 sc-eQTL 1.07e-01 -0.111 0.0688 0.207 cMono_IL1B L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 -610028 sc-eQTL 7.90e-01 -0.0189 0.0711 0.207 cMono_IL1B L2
ENSG00000286646 AL121933.2 474160 sc-eQTL 4.85e-01 0.0622 0.0889 0.207 cMono_IL1B L2
ENSG00000027697 IFNGR1 38756 sc-eQTL 2.00e-01 0.0917 0.0714 0.207 cMono_S100A L2
ENSG00000029363 BCLAF1 968354 sc-eQTL 5.83e-02 -0.139 0.073 0.207 cMono_S100A L2
ENSG00000112357 PEX7 435641 sc-eQTL 2.66e-01 0.128 0.115 0.207 cMono_S100A L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 -609009 sc-eQTL 4.53e-01 -0.0478 0.0636 0.207 cMono_S100A L2
ENSG00000135525 MAP7 707386 sc-eQTL 5.37e-01 -0.0663 0.107 0.207 cMono_S100A L2
ENSG00000197442 MAP3K5 465728 sc-eQTL 1.10e-01 -0.138 0.086 0.207 cMono_S100A L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 -610028 sc-eQTL 9.47e-02 -0.152 0.0908 0.207 cMono_S100A L2
ENSG00000286646 AL121933.2 474160 sc-eQTL 1.64e-01 0.124 0.0888 0.207 cMono_S100A L2
ENSG00000027697 IFNGR1 38756 sc-eQTL 1.51e-01 0.163 0.113 0.197 gdT L2
ENSG00000029363 BCLAF1 968354 sc-eQTL 1.21e-01 -0.155 0.0995 0.197 gdT L2
ENSG00000112357 PEX7 435641 sc-eQTL 9.61e-01 0.00712 0.144 0.197 gdT L2
ENSG00000112378 PERP -849214 sc-eQTL 9.31e-01 -0.0109 0.126 0.197 gdT L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 -609009 sc-eQTL 2.18e-01 0.0864 0.0697 0.197 gdT L2
ENSG00000197442 MAP3K5 465728 sc-eQTL 4.24e-02 -0.299 0.146 0.197 gdT L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 -610028 sc-eQTL 2.34e-01 0.151 0.126 0.197 gdT L2
ENSG00000027697 IFNGR1 38756 sc-eQTL 4.91e-01 -0.0518 0.0752 0.211 intMono L2
ENSG00000029363 BCLAF1 968354 sc-eQTL 6.89e-01 -0.0398 0.0993 0.211 intMono L2
ENSG00000112357 PEX7 435641 sc-eQTL 3.44e-01 0.0959 0.101 0.211 intMono L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 -609009 sc-eQTL 8.75e-01 -0.0102 0.065 0.211 intMono L2
ENSG00000135525 MAP7 707386 sc-eQTL 8.89e-01 -0.014 0.0998 0.211 intMono L2
ENSG00000197442 MAP3K5 465728 sc-eQTL 8.19e-01 -0.0242 0.106 0.211 intMono L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 -610028 sc-eQTL 5.74e-01 -0.0544 0.0968 0.211 intMono L2
ENSG00000286646 AL121933.2 474160 sc-eQTL 3.22e-01 0.111 0.111 0.211 intMono L2
ENSG00000027697 IFNGR1 38756 sc-eQTL 2.27e-01 0.109 0.0897 0.213 ncMono L2
ENSG00000029363 BCLAF1 968354 sc-eQTL 5.20e-01 0.045 0.0699 0.213 ncMono L2
ENSG00000112357 PEX7 435641 sc-eQTL 4.48e-01 0.0846 0.111 0.213 ncMono L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 -609009 sc-eQTL 9.11e-01 -0.00893 0.0797 0.213 ncMono L2
ENSG00000135525 MAP7 707386 sc-eQTL 1.79e-01 -0.132 0.098 0.213 ncMono L2
ENSG00000197442 MAP3K5 465728 sc-eQTL 1.56e-01 -0.147 0.103 0.213 ncMono L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 -610028 sc-eQTL 6.11e-01 0.0507 0.0996 0.213 ncMono L2
ENSG00000286646 AL121933.2 474160 sc-eQTL 7.73e-01 -0.0303 0.105 0.213 ncMono L2
ENSG00000027697 IFNGR1 38756 sc-eQTL 7.61e-01 -0.0327 0.107 0.206 pDC L2
ENSG00000029363 BCLAF1 968354 sc-eQTL 1.53e-01 -0.115 0.08 0.206 pDC L2
ENSG00000112357 PEX7 435641 sc-eQTL 8.41e-01 -0.0238 0.118 0.206 pDC L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 -609009 sc-eQTL 7.61e-01 0.0303 0.0994 0.206 pDC L2
ENSG00000135525 MAP7 707386 sc-eQTL 5.22e-01 0.0528 0.0824 0.206 pDC L2
ENSG00000197442 MAP3K5 465728 sc-eQTL 9.32e-01 -0.0113 0.132 0.206 pDC L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 -610028 sc-eQTL 9.34e-01 -0.00834 0.101 0.206 pDC L2
ENSG00000286646 AL121933.2 474160 sc-eQTL 5.96e-01 0.0645 0.122 0.206 pDC L2
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000027697 IFNGR1 38756 sc-eQTL 3.68e-03 0.259 0.0882 0.207 B_Memory LOneK1K
ENSG00000029363 BCLAF1 968354 sc-eQTL 2.31e-01 0.0604 0.0503 0.207 B_Memory LOneK1K
ENSG00000112357 PEX7 435641 sc-eQTL 8.08e-01 -0.0252 0.103 0.207 B_Memory LOneK1K
ENSG00000112378 PERP -849214 sc-eQTL 4.52e-01 -0.0723 0.096 0.207 B_Memory LOneK1K
ENSG00000118503 TNFAIP3 -609009 sc-eQTL 7.80e-03 0.168 0.0624 0.207 B_Memory LOneK1K
ENSG00000197442 MAP3K5 465728 sc-eQTL 6.24e-01 0.0413 0.084 0.207 B_Memory LOneK1K
ENSG00000237499 WAKMAR2 -610028 sc-eQTL 6.56e-01 0.0479 0.107 0.207 B_Memory LOneK1K
ENSG00000027697 IFNGR1 38756 sc-eQTL 4.77e-02 0.186 0.0932 0.207 B_Naive LOneK1K
ENSG00000029363 BCLAF1 968354 sc-eQTL 1.67e-01 -0.0596 0.043 0.207 B_Naive LOneK1K
ENSG00000112357 PEX7 435641 sc-eQTL 2.33e-02 -0.259 0.113 0.207 B_Naive LOneK1K
ENSG00000112378 PERP -849214 sc-eQTL 4.48e-01 0.0779 0.102 0.207 B_Naive LOneK1K
ENSG00000118503 TNFAIP3 -609009 sc-eQTL 5.68e-01 0.0308 0.0538 0.207 B_Naive LOneK1K
ENSG00000197442 MAP3K5 465728 sc-eQTL 6.31e-01 0.038 0.0789 0.207 B_Naive LOneK1K
ENSG00000237499 WAKMAR2 -610028 sc-eQTL 2.52e-01 -0.11 0.0956 0.207 B_Naive LOneK1K
ENSG00000027697 IFNGR1 38756 sc-eQTL 5.99e-01 0.0328 0.0622 0.207 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000029363 BCLAF1 968354 sc-eQTL 1.24e-02 -0.144 0.0571 0.207 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000112357 PEX7 435641 sc-eQTL 3.39e-01 0.107 0.112 0.207 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000118503 TNFAIP3 -609009 sc-eQTL 7.48e-01 -0.0185 0.0576 0.207 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000135525 MAP7 707386 sc-eQTL 2.69e-01 -0.11 0.0997 0.207 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000197442 MAP3K5 465728 sc-eQTL 3.32e-02 -0.143 0.0668 0.207 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000237499 WAKMAR2 -610028 sc-eQTL 2.56e-01 -0.0784 0.0688 0.207 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000286646 AL121933.2 474160 sc-eQTL 1.85e-01 0.106 0.08 0.207 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000027697 IFNGR1 38756 sc-eQTL 3.74e-01 0.0653 0.0733 0.209 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000029363 BCLAF1 968354 sc-eQTL 6.10e-01 0.0339 0.0663 0.209 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000112357 PEX7 435641 sc-eQTL 3.46e-01 0.104 0.111 0.209 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000118503 TNFAIP3 -609009 sc-eQTL 9.67e-01 0.00287 0.0686 0.209 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000135525 MAP7 707386 sc-eQTL 1.24e-01 -0.165 0.107 0.209 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000197442 MAP3K5 465728 sc-eQTL 1.41e-01 -0.129 0.0875 0.209 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000237499 WAKMAR2 -610028 sc-eQTL 9.98e-01 -0.000281 0.0919 0.209 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000286646 AL121933.2 474160 sc-eQTL 1.52e-01 0.149 0.104 0.209 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000027697 IFNGR1 38756 sc-eQTL 9.24e-04 0.227 0.0676 0.205 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000029363 BCLAF1 968354 sc-eQTL 5.49e-01 0.0242 0.0402 0.205 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000112357 PEX7 435641 sc-eQTL 8.02e-01 -0.0294 0.117 0.205 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000112378 PERP -849214 sc-eQTL 5.78e-02 0.137 0.072 0.205 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000118503 TNFAIP3 -609009 sc-eQTL 5.57e-01 0.0372 0.0632 0.205 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000197442 MAP3K5 465728 sc-eQTL 8.23e-01 0.0192 0.0854 0.205 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000237499 WAKMAR2 -610028 sc-eQTL 4.08e-01 -0.0733 0.0883 0.205 NK_CD56dim LOneK1K

Statistical fine-mapping results from Japan COVID-19 Task Force
(Shown only for PIP>0.001)
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
PIP (SuSiE)
PIP (FINEMAP)
MAF
ENSG00000027697 IFNGR1 38756 pQTL 0.0084 0.0529 0.02 0.0 0.0 0.19
ENSG00000027697 IFNGR1 38756 eQTL 4.36e-05 0.0701 0.0171 0.0 0.0 0.192
ENSG00000118503 TNFAIP3 -609009 eQTL 0.0104 -0.0424 0.0165 0.00134 0.0 0.192
ENSG00000182747 SLC35D3 335904 eQTL 0.000926 -0.131 0.0394 0.0 0.0 0.192

Expression Modifier Score(EMS) for GTEx 49tissues
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Whole Blood
Muscle Skeletal
Liver
Brain Cerebellum
Prostate
Spleen
Skin Sun Exposed Lower leg
Artery Coronary
Esophagus Muscularis
Esophagus Gastroesophageal Junction
Artery Tibial
Heart Atrial Appendage
Nerve Tibial
Heart Left Ventricle
Adrenal Gland
Adipose Visceral Omentum
Pancreas
Lung
Pituitary
Brain Nucleus accumbens basal ganglia
Colon Transverse
Adipose Subcutaneous
Esophagus Mucosa
Brain Cortex
Thyroid
Stomach
Breast Mammary Tissue
Colon Sigmoid
Skin Not Sun Exposed Suprapubic
Testis
Artery Aorta
Brain Amygdala
Brain Anterior cingulate cortex BA24
Brain Caudate basal ganglia
Brain Cerebellar Hemisphere
Brain Frontal Cortex BA9
Brain Hippocampus
Brain Hypothalamus
Brain Putamen basal ganglia
Brain Spinal cord cervical c-1
Brain Substantia nigra
Cells Cultured fibroblasts
Cells EBV-transformed lymphocytes
Kidney Cortex
Minor Salivary Gland
Ovary
Small Intestine Terminal Ileum
Uterus
Vagina
ENSG00000027697 IFNGR1 38756 2.99e-05 9.6e-06 1.32e-06 5.17e-06 2.1e-06 6.03e-06 1.01e-05 1.52e-06 6.28e-06 4.81e-06 9.08e-06 4.41e-06 1.15e-05 3.85e-06 2.44e-06 6.49e-06 4.55e-06 9.51e-06 2.57e-06 2.65e-06 4.99e-06 8.33e-06 6.93e-06 2.82e-06 1.29e-05 2.92e-06 4.68e-06 3.89e-06 7.5e-06 8.58e-06 4.17e-06 5.91e-07 1.26e-06 3.01e-06 3.56e-06 1.32e-06 1.03e-06 5.24e-07 1.37e-06 1.04e-06 7.14e-07 1.24e-05 2.27e-06 1.85e-07 6.87e-07 1.01e-06 1.02e-06 6.6e-07 5.85e-07
ENSG00000182747 SLC35D3 335904 1.07e-06 1.5e-07 5.82e-08 2.22e-07 9.21e-08 1.25e-07 2.1e-07 5.4e-08 1.45e-07 5.42e-08 1.55e-07 1.01e-07 1.79e-07 7.64e-08 5.36e-08 7.74e-08 4.17e-08 1.64e-07 7.12e-08 6.02e-08 1.21e-07 1.26e-07 1.58e-07 2.87e-08 1.85e-07 1.21e-07 1.2e-07 1.06e-07 1.24e-07 1.05e-07 1.06e-07 2.9e-08 4.74e-08 8.56e-08 2.97e-08 3.93e-08 5.31e-08 9.26e-08 6.58e-08 3.67e-08 6.21e-08 1.55e-07 2.62e-08 1.61e-08 3.84e-08 1.19e-08 1.15e-07 3.8e-09 4.9e-08