logo

Genes within 1Mb (chr6:137256548:TG:T):

View on , UCSC , GTEx , gnomAD

Immune cell-type specific single cell cis-eQTLs in OASIS
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000027697 IFNGR1 37099 sc-eQTL 2.80e-02 -0.188 0.0848 0.197 B L1
ENSG00000029363 BCLAF1 966697 sc-eQTL 7.58e-01 0.0118 0.0382 0.197 B L1
ENSG00000112357 PEX7 433984 sc-eQTL 3.21e-01 0.101 0.101 0.197 B L1
ENSG00000112378 PERP -850871 sc-eQTL 9.48e-01 -0.00439 0.0672 0.197 B L1
ENSG00000118503 TNFAIP3 -610666 sc-eQTL 8.41e-01 -0.0109 0.0541 0.197 B L1
ENSG00000197442 MAP3K5 464071 sc-eQTL 3.23e-01 -0.0746 0.0753 0.197 B L1
ENSG00000237499 WAKMAR2 -611685 sc-eQTL 9.30e-01 -0.00749 0.0852 0.197 B L1
ENSG00000027697 IFNGR1 37099 sc-eQTL 6.01e-01 -0.0303 0.0579 0.197 CD4T L1
ENSG00000029363 BCLAF1 966697 sc-eQTL 3.57e-01 -0.0404 0.0438 0.197 CD4T L1
ENSG00000112357 PEX7 433984 sc-eQTL 1.59e-01 -0.131 0.0929 0.197 CD4T L1
ENSG00000112378 PERP -850871 sc-eQTL 3.32e-01 -0.0609 0.0625 0.197 CD4T L1
ENSG00000118503 TNFAIP3 -610666 sc-eQTL 3.86e-01 -0.0509 0.0586 0.197 CD4T L1
ENSG00000197442 MAP3K5 464071 sc-eQTL 5.19e-01 -0.0289 0.0447 0.197 CD4T L1
ENSG00000237499 WAKMAR2 -611685 sc-eQTL 1.25e-01 -0.113 0.0735 0.197 CD4T L1
ENSG00000027697 IFNGR1 37099 sc-eQTL 2.94e-01 -0.0683 0.0649 0.197 CD8T L1
ENSG00000029363 BCLAF1 966697 sc-eQTL 5.51e-01 0.0263 0.044 0.197 CD8T L1
ENSG00000112357 PEX7 433984 sc-eQTL 5.62e-01 -0.063 0.109 0.197 CD8T L1
ENSG00000112378 PERP -850871 sc-eQTL 8.79e-01 -0.0108 0.071 0.197 CD8T L1
ENSG00000118503 TNFAIP3 -610666 sc-eQTL 6.64e-01 0.0238 0.0548 0.197 CD8T L1
ENSG00000197442 MAP3K5 464071 sc-eQTL 7.94e-01 -0.0152 0.0579 0.197 CD8T L1
ENSG00000237499 WAKMAR2 -611685 sc-eQTL 1.75e-01 -0.109 0.0801 0.197 CD8T L1
ENSG00000027697 IFNGR1 37099 sc-eQTL 1.57e-01 -0.108 0.0763 0.2 DC L1
ENSG00000029363 BCLAF1 966697 sc-eQTL 5.62e-01 -0.0401 0.0689 0.2 DC L1
ENSG00000112357 PEX7 433984 sc-eQTL 4.70e-01 0.078 0.108 0.2 DC L1
ENSG00000118503 TNFAIP3 -610666 sc-eQTL 4.33e-01 0.0643 0.0818 0.2 DC L1
ENSG00000135525 MAP7 705729 sc-eQTL 3.93e-01 -0.0759 0.0886 0.2 DC L1
ENSG00000197442 MAP3K5 464071 sc-eQTL 4.70e-01 -0.0615 0.0849 0.2 DC L1
ENSG00000237499 WAKMAR2 -611685 sc-eQTL 6.12e-01 0.0425 0.0835 0.2 DC L1
ENSG00000286646 AL121933.2 472503 sc-eQTL 8.82e-01 0.0165 0.111 0.2 DC L1
ENSG00000027697 IFNGR1 37099 sc-eQTL 9.39e-01 -0.00508 0.0666 0.197 Mono L1
ENSG00000029363 BCLAF1 966697 sc-eQTL 8.04e-01 0.0142 0.057 0.197 Mono L1
ENSG00000112357 PEX7 433984 sc-eQTL 3.95e-02 -0.23 0.111 0.197 Mono L1
ENSG00000118503 TNFAIP3 -610666 sc-eQTL 2.42e-01 0.0661 0.0563 0.197 Mono L1
ENSG00000135525 MAP7 705729 sc-eQTL 5.25e-01 -0.0629 0.0988 0.197 Mono L1
ENSG00000197442 MAP3K5 464071 sc-eQTL 4.19e-01 0.0534 0.0659 0.197 Mono L1
ENSG00000237499 WAKMAR2 -611685 sc-eQTL 3.17e-01 0.0701 0.0699 0.197 Mono L1
ENSG00000286646 AL121933.2 472503 sc-eQTL 8.79e-01 0.0121 0.0799 0.197 Mono L1
ENSG00000027697 IFNGR1 37099 sc-eQTL 7.16e-02 -0.131 0.0724 0.197 NK L1
ENSG00000029363 BCLAF1 966697 sc-eQTL 9.50e-01 0.00242 0.0388 0.197 NK L1
ENSG00000112357 PEX7 433984 sc-eQTL 6.92e-01 -0.0447 0.113 0.197 NK L1
ENSG00000112378 PERP -850871 sc-eQTL 8.97e-02 -0.12 0.0705 0.197 NK L1
ENSG00000118503 TNFAIP3 -610666 sc-eQTL 5.43e-01 -0.037 0.0607 0.197 NK L1
ENSG00000197442 MAP3K5 464071 sc-eQTL 7.19e-01 -0.0313 0.087 0.197 NK L1
ENSG00000237499 WAKMAR2 -611685 sc-eQTL 6.77e-01 -0.0359 0.0861 0.197 NK L1
ENSG00000027697 IFNGR1 37099 sc-eQTL 5.78e-04 -0.23 0.0659 0.197 Other_T L1
ENSG00000029363 BCLAF1 966697 sc-eQTL 1.00e-01 -0.0933 0.0565 0.197 Other_T L1
ENSG00000112357 PEX7 433984 sc-eQTL 7.14e-01 -0.0406 0.111 0.197 Other_T L1
ENSG00000112378 PERP -850871 sc-eQTL 8.16e-01 0.0206 0.0887 0.197 Other_T L1
ENSG00000118503 TNFAIP3 -610666 sc-eQTL 4.04e-01 0.0352 0.0421 0.197 Other_T L1
ENSG00000197442 MAP3K5 464071 sc-eQTL 9.28e-01 -0.00734 0.0815 0.197 Other_T L1
ENSG00000237499 WAKMAR2 -611685 sc-eQTL 1.98e-01 -0.108 0.0834 0.197 Other_T L1
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000027697 IFNGR1 37099 sc-eQTL 2.27e-01 -0.136 0.112 0.186 B_Activated L2
ENSG00000029363 BCLAF1 966697 sc-eQTL 5.44e-01 0.0554 0.0913 0.186 B_Activated L2
ENSG00000112357 PEX7 433984 sc-eQTL 4.67e-01 -0.0807 0.111 0.186 B_Activated L2
ENSG00000112378 PERP -850871 sc-eQTL 6.79e-01 0.0237 0.0573 0.186 B_Activated L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 -610666 sc-eQTL 6.79e-01 0.046 0.111 0.186 B_Activated L2
ENSG00000197442 MAP3K5 464071 sc-eQTL 9.57e-01 -0.00664 0.124 0.186 B_Activated L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 -611685 sc-eQTL 7.16e-01 -0.0353 0.097 0.186 B_Activated L2
ENSG00000027697 IFNGR1 37099 sc-eQTL 8.66e-02 -0.171 0.0994 0.197 B_Intermediate L2
ENSG00000029363 BCLAF1 966697 sc-eQTL 2.71e-01 -0.0627 0.0568 0.197 B_Intermediate L2
ENSG00000112357 PEX7 433984 sc-eQTL 2.37e-01 0.124 0.104 0.197 B_Intermediate L2
ENSG00000112378 PERP -850871 sc-eQTL 6.05e-01 -0.0494 0.0954 0.197 B_Intermediate L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 -610666 sc-eQTL 8.60e-01 -0.0132 0.0749 0.197 B_Intermediate L2
ENSG00000197442 MAP3K5 464071 sc-eQTL 7.17e-01 0.0329 0.0905 0.197 B_Intermediate L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 -611685 sc-eQTL 5.37e-01 -0.0656 0.106 0.197 B_Intermediate L2
ENSG00000027697 IFNGR1 37099 sc-eQTL 1.12e-01 -0.173 0.108 0.196 B_Memory L2
ENSG00000029363 BCLAF1 966697 sc-eQTL 6.39e-01 -0.0303 0.0646 0.196 B_Memory L2
ENSG00000112357 PEX7 433984 sc-eQTL 8.40e-01 -0.0222 0.11 0.196 B_Memory L2
ENSG00000112378 PERP -850871 sc-eQTL 1.45e-01 0.151 0.103 0.196 B_Memory L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 -610666 sc-eQTL 5.67e-01 0.0408 0.0711 0.196 B_Memory L2
ENSG00000197442 MAP3K5 464071 sc-eQTL 3.18e-01 -0.097 0.0969 0.196 B_Memory L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 -611685 sc-eQTL 6.07e-01 0.0545 0.106 0.196 B_Memory L2
ENSG00000027697 IFNGR1 37099 sc-eQTL 3.40e-01 -0.0813 0.085 0.197 B_Naive1 L2
ENSG00000029363 BCLAF1 966697 sc-eQTL 7.65e-01 0.0146 0.0486 0.197 B_Naive1 L2
ENSG00000112357 PEX7 433984 sc-eQTL 6.42e-01 -0.0523 0.112 0.197 B_Naive1 L2
ENSG00000112378 PERP -850871 sc-eQTL 1.83e-01 -0.131 0.0978 0.197 B_Naive1 L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 -610666 sc-eQTL 9.95e-01 0.000369 0.057 0.197 B_Naive1 L2
ENSG00000197442 MAP3K5 464071 sc-eQTL 8.78e-01 0.0123 0.0801 0.197 B_Naive1 L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 -611685 sc-eQTL 6.26e-01 0.0436 0.0892 0.197 B_Naive1 L2
ENSG00000027697 IFNGR1 37099 sc-eQTL 3.31e-01 -0.101 0.104 0.197 B_Naive2 L2
ENSG00000029363 BCLAF1 966697 sc-eQTL 2.85e-02 0.131 0.0596 0.197 B_Naive2 L2
ENSG00000112357 PEX7 433984 sc-eQTL 5.64e-02 0.216 0.113 0.197 B_Naive2 L2
ENSG00000112378 PERP -850871 sc-eQTL 4.36e-01 -0.0646 0.0828 0.197 B_Naive2 L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 -610666 sc-eQTL 4.15e-01 -0.0675 0.0827 0.197 B_Naive2 L2
ENSG00000197442 MAP3K5 464071 sc-eQTL 3.41e-01 -0.084 0.088 0.197 B_Naive2 L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 -611685 sc-eQTL 4.68e-01 -0.0778 0.107 0.197 B_Naive2 L2
ENSG00000027697 IFNGR1 37099 sc-eQTL 1.52e-01 -0.14 0.0976 0.198 CD4_CTL L2
ENSG00000029363 BCLAF1 966697 sc-eQTL 4.29e-01 -0.0689 0.0869 0.198 CD4_CTL L2
ENSG00000112357 PEX7 433984 sc-eQTL 5.67e-01 -0.0623 0.109 0.198 CD4_CTL L2
ENSG00000112378 PERP -850871 sc-eQTL 7.80e-01 -0.0309 0.11 0.198 CD4_CTL L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 -610666 sc-eQTL 7.36e-01 -0.0217 0.0643 0.198 CD4_CTL L2
ENSG00000197442 MAP3K5 464071 sc-eQTL 8.38e-01 -0.021 0.103 0.198 CD4_CTL L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 -611685 sc-eQTL 1.12e-01 -0.159 0.0995 0.198 CD4_CTL L2
ENSG00000027697 IFNGR1 37099 sc-eQTL 6.06e-01 0.0282 0.0546 0.197 CD4_Naive L2
ENSG00000029363 BCLAF1 966697 sc-eQTL 4.43e-01 -0.0337 0.0438 0.197 CD4_Naive L2
ENSG00000112357 PEX7 433984 sc-eQTL 6.08e-01 -0.0529 0.103 0.197 CD4_Naive L2
ENSG00000112378 PERP -850871 sc-eQTL 3.14e-01 -0.0857 0.0849 0.197 CD4_Naive L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 -610666 sc-eQTL 5.06e-01 -0.0397 0.0597 0.197 CD4_Naive L2
ENSG00000197442 MAP3K5 464071 sc-eQTL 5.45e-01 -0.0266 0.0438 0.197 CD4_Naive L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 -611685 sc-eQTL 8.62e-02 -0.132 0.0768 0.197 CD4_Naive L2
ENSG00000027697 IFNGR1 37099 sc-eQTL 7.28e-01 -0.0259 0.0746 0.197 CD4_TCM L2
ENSG00000029363 BCLAF1 966697 sc-eQTL 4.18e-02 -0.0954 0.0466 0.197 CD4_TCM L2
ENSG00000112357 PEX7 433984 sc-eQTL 1.25e-01 -0.168 0.109 0.197 CD4_TCM L2
ENSG00000112378 PERP -850871 sc-eQTL 5.89e-01 -0.0501 0.0925 0.197 CD4_TCM L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 -610666 sc-eQTL 3.73e-01 -0.0478 0.0536 0.197 CD4_TCM L2
ENSG00000197442 MAP3K5 464071 sc-eQTL 9.27e-01 -0.00559 0.0612 0.197 CD4_TCM L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 -611685 sc-eQTL 2.23e-01 -0.0918 0.075 0.197 CD4_TCM L2
ENSG00000027697 IFNGR1 37099 sc-eQTL 8.30e-01 -0.0184 0.086 0.197 CD4_TEM L2
ENSG00000029363 BCLAF1 966697 sc-eQTL 7.78e-01 -0.0172 0.061 0.197 CD4_TEM L2
ENSG00000112357 PEX7 433984 sc-eQTL 7.15e-02 0.199 0.11 0.197 CD4_TEM L2
ENSG00000112378 PERP -850871 sc-eQTL 8.95e-01 0.0118 0.09 0.197 CD4_TEM L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 -610666 sc-eQTL 8.02e-01 -0.0144 0.0571 0.197 CD4_TEM L2
ENSG00000197442 MAP3K5 464071 sc-eQTL 1.86e-01 -0.117 0.0878 0.197 CD4_TEM L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 -611685 sc-eQTL 6.41e-01 -0.0427 0.0915 0.197 CD4_TEM L2
ENSG00000027697 IFNGR1 37099 sc-eQTL 6.38e-01 0.0369 0.0783 0.197 CD8_CTL L2
ENSG00000029363 BCLAF1 966697 sc-eQTL 9.81e-01 -0.00124 0.0522 0.197 CD8_CTL L2
ENSG00000112357 PEX7 433984 sc-eQTL 9.60e-01 0.00538 0.108 0.197 CD8_CTL L2
ENSG00000112378 PERP -850871 sc-eQTL 9.44e-01 0.00724 0.104 0.197 CD8_CTL L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 -610666 sc-eQTL 7.38e-01 0.022 0.0659 0.197 CD8_CTL L2
ENSG00000197442 MAP3K5 464071 sc-eQTL 7.70e-01 -0.0272 0.093 0.197 CD8_CTL L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 -611685 sc-eQTL 6.63e-01 0.0405 0.0926 0.197 CD8_CTL L2
ENSG00000027697 IFNGR1 37099 sc-eQTL 6.13e-01 -0.0387 0.0765 0.197 CD8_Naive L2
ENSG00000029363 BCLAF1 966697 sc-eQTL 6.01e-01 0.028 0.0534 0.197 CD8_Naive L2
ENSG00000112357 PEX7 433984 sc-eQTL 5.68e-01 -0.0633 0.111 0.197 CD8_Naive L2
ENSG00000112378 PERP -850871 sc-eQTL 3.15e-01 -0.0847 0.0841 0.197 CD8_Naive L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 -610666 sc-eQTL 5.25e-01 -0.0381 0.0598 0.197 CD8_Naive L2
ENSG00000197442 MAP3K5 464071 sc-eQTL 6.10e-01 -0.0362 0.0709 0.197 CD8_Naive L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 -611685 sc-eQTL 1.84e-01 -0.118 0.0881 0.197 CD8_Naive L2
ENSG00000027697 IFNGR1 37099 sc-eQTL 5.09e-01 -0.0693 0.105 0.194 CD8_TCM L2
ENSG00000029363 BCLAF1 966697 sc-eQTL 9.28e-01 0.00713 0.0787 0.194 CD8_TCM L2
ENSG00000112357 PEX7 433984 sc-eQTL 8.83e-01 -0.0178 0.12 0.194 CD8_TCM L2
ENSG00000112378 PERP -850871 sc-eQTL 9.24e-01 -0.0113 0.118 0.194 CD8_TCM L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 -610666 sc-eQTL 3.36e-01 0.0546 0.0567 0.194 CD8_TCM L2
ENSG00000197442 MAP3K5 464071 sc-eQTL 8.74e-01 0.0161 0.101 0.194 CD8_TCM L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 -611685 sc-eQTL 4.04e-01 -0.0869 0.104 0.194 CD8_TCM L2
ENSG00000027697 IFNGR1 37099 sc-eQTL 4.53e-02 -0.196 0.0973 0.194 CD8_TEM L2
ENSG00000029363 BCLAF1 966697 sc-eQTL 7.31e-01 -0.032 0.0928 0.194 CD8_TEM L2
ENSG00000112357 PEX7 433984 sc-eQTL 8.88e-01 -0.016 0.113 0.194 CD8_TEM L2
ENSG00000112378 PERP -850871 sc-eQTL 1.08e-01 -0.189 0.117 0.194 CD8_TEM L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 -610666 sc-eQTL 1.52e-01 0.104 0.0721 0.194 CD8_TEM L2
ENSG00000197442 MAP3K5 464071 sc-eQTL 6.44e-01 -0.0519 0.112 0.194 CD8_TEM L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 -611685 sc-eQTL 4.14e-01 0.0879 0.107 0.194 CD8_TEM L2
ENSG00000027697 IFNGR1 37099 sc-eQTL 2.94e-06 -0.363 0.0755 0.197 MAIT L2
ENSG00000029363 BCLAF1 966697 sc-eQTL 2.18e-01 -0.0815 0.0659 0.197 MAIT L2
ENSG00000112357 PEX7 433984 sc-eQTL 4.57e-01 0.0803 0.108 0.197 MAIT L2
ENSG00000112378 PERP -850871 sc-eQTL 9.88e-01 -0.00174 0.113 0.197 MAIT L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 -610666 sc-eQTL 5.79e-01 0.0297 0.0535 0.197 MAIT L2
ENSG00000197442 MAP3K5 464071 sc-eQTL 9.88e-01 0.00144 0.0933 0.197 MAIT L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 -611685 sc-eQTL 2.56e-01 -0.112 0.0987 0.197 MAIT L2
ENSG00000027697 IFNGR1 37099 sc-eQTL 6.19e-02 -0.162 0.0864 0.193 NK_CD56bright L2
ENSG00000029363 BCLAF1 966697 sc-eQTL 8.23e-01 0.0144 0.0643 0.193 NK_CD56bright L2
ENSG00000112357 PEX7 433984 sc-eQTL 1.99e-01 -0.146 0.113 0.193 NK_CD56bright L2
ENSG00000112378 PERP -850871 sc-eQTL 2.16e-01 -0.126 0.101 0.193 NK_CD56bright L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 -610666 sc-eQTL 7.67e-01 0.0193 0.0649 0.193 NK_CD56bright L2
ENSG00000197442 MAP3K5 464071 sc-eQTL 2.46e-01 -0.114 0.0984 0.193 NK_CD56bright L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 -611685 sc-eQTL 1.09e-01 -0.165 0.103 0.193 NK_CD56bright L2
ENSG00000027697 IFNGR1 37099 sc-eQTL 3.07e-01 -0.0696 0.0679 0.198 NK_CD56dim L2
ENSG00000029363 BCLAF1 966697 sc-eQTL 4.06e-01 0.0369 0.0444 0.198 NK_CD56dim L2
ENSG00000112357 PEX7 433984 sc-eQTL 2.91e-01 -0.124 0.117 0.198 NK_CD56dim L2
ENSG00000112378 PERP -850871 sc-eQTL 4.54e-01 -0.0618 0.0823 0.198 NK_CD56dim L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 -610666 sc-eQTL 6.09e-01 -0.0328 0.0641 0.198 NK_CD56dim L2
ENSG00000197442 MAP3K5 464071 sc-eQTL 8.36e-01 0.0191 0.0923 0.198 NK_CD56dim L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 -611685 sc-eQTL 4.07e-01 -0.0796 0.0959 0.198 NK_CD56dim L2
ENSG00000027697 IFNGR1 37099 sc-eQTL 1.67e-01 -0.118 0.0853 0.205 NK_HLA L2
ENSG00000029363 BCLAF1 966697 sc-eQTL 5.78e-01 -0.0404 0.0725 0.205 NK_HLA L2
ENSG00000112357 PEX7 433984 sc-eQTL 1.58e-01 0.153 0.108 0.205 NK_HLA L2
ENSG00000112378 PERP -850871 sc-eQTL 8.18e-01 -0.0203 0.0883 0.205 NK_HLA L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 -610666 sc-eQTL 2.85e-01 -0.0726 0.0677 0.205 NK_HLA L2
ENSG00000197442 MAP3K5 464071 sc-eQTL 7.97e-01 -0.0278 0.108 0.205 NK_HLA L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 -611685 sc-eQTL 5.44e-01 0.0664 0.109 0.205 NK_HLA L2
ENSG00000027697 IFNGR1 37099 sc-eQTL 1.92e-01 -0.0931 0.0712 0.198 NK_cytokine L2
ENSG00000029363 BCLAF1 966697 sc-eQTL 1.02e-01 -0.0872 0.053 0.198 NK_cytokine L2
ENSG00000112357 PEX7 433984 sc-eQTL 2.00e-01 0.144 0.112 0.198 NK_cytokine L2
ENSG00000112378 PERP -850871 sc-eQTL 8.67e-01 0.0143 0.0851 0.198 NK_cytokine L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 -610666 sc-eQTL 7.72e-01 -0.0185 0.0638 0.198 NK_cytokine L2
ENSG00000197442 MAP3K5 464071 sc-eQTL 5.04e-01 -0.0586 0.0876 0.198 NK_cytokine L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 -611685 sc-eQTL 9.89e-01 0.00127 0.0962 0.198 NK_cytokine L2
ENSG00000027697 IFNGR1 37099 sc-eQTL 3.34e-01 0.13 0.134 0.167 PB L2
ENSG00000029363 BCLAF1 966697 sc-eQTL 9.06e-01 -0.0138 0.116 0.167 PB L2
ENSG00000112357 PEX7 433984 sc-eQTL 7.79e-01 0.0389 0.138 0.167 PB L2
ENSG00000112378 PERP -850871 sc-eQTL 1.76e-01 -0.117 0.0856 0.167 PB L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 -610666 sc-eQTL 8.81e-01 -0.0157 0.105 0.167 PB L2
ENSG00000197442 MAP3K5 464071 sc-eQTL 1.26e-01 -0.182 0.118 0.167 PB L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 -611685 sc-eQTL 5.36e-01 -0.0779 0.125 0.167 PB L2
ENSG00000027697 IFNGR1 37099 sc-eQTL 6.90e-01 -0.035 0.0875 0.196 Pro_T L2
ENSG00000029363 BCLAF1 966697 sc-eQTL 5.97e-01 -0.048 0.0907 0.196 Pro_T L2
ENSG00000112357 PEX7 433984 sc-eQTL 5.93e-01 -0.0569 0.106 0.196 Pro_T L2
ENSG00000112378 PERP -850871 sc-eQTL 3.28e-01 -0.0827 0.0844 0.196 Pro_T L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 -610666 sc-eQTL 5.09e-01 0.0352 0.0533 0.196 Pro_T L2
ENSG00000197442 MAP3K5 464071 sc-eQTL 2.55e-01 0.118 0.103 0.196 Pro_T L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 -611685 sc-eQTL 2.56e-01 -0.118 0.103 0.196 Pro_T L2
ENSG00000027697 IFNGR1 37099 sc-eQTL 8.67e-01 -0.0169 0.101 0.197 Treg L2
ENSG00000029363 BCLAF1 966697 sc-eQTL 4.75e-01 -0.0467 0.0653 0.197 Treg L2
ENSG00000112357 PEX7 433984 sc-eQTL 2.93e-01 -0.112 0.107 0.197 Treg L2
ENSG00000112378 PERP -850871 sc-eQTL 8.24e-01 -0.0257 0.116 0.197 Treg L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 -610666 sc-eQTL 2.74e-01 0.0704 0.0641 0.197 Treg L2
ENSG00000197442 MAP3K5 464071 sc-eQTL 8.88e-01 0.00985 0.0697 0.197 Treg L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 -611685 sc-eQTL 1.09e-01 0.157 0.0975 0.197 Treg L2
ENSG00000027697 IFNGR1 37099 sc-eQTL 5.92e-01 -0.0455 0.0849 0.202 cDC L2
ENSG00000029363 BCLAF1 966697 sc-eQTL 1.91e-01 -0.112 0.0852 0.202 cDC L2
ENSG00000112357 PEX7 433984 sc-eQTL 3.53e-01 0.102 0.11 0.202 cDC L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 -610666 sc-eQTL 7.52e-01 -0.0265 0.0837 0.202 cDC L2
ENSG00000135525 MAP7 705729 sc-eQTL 4.10e-01 -0.0807 0.0977 0.202 cDC L2
ENSG00000197442 MAP3K5 464071 sc-eQTL 5.37e-01 -0.0532 0.0861 0.202 cDC L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 -611685 sc-eQTL 8.23e-01 -0.0244 0.109 0.202 cDC L2
ENSG00000286646 AL121933.2 472503 sc-eQTL 4.60e-01 0.083 0.112 0.202 cDC L2
ENSG00000027697 IFNGR1 37099 sc-eQTL 5.32e-01 0.0385 0.0614 0.197 cMono_IL1B L2
ENSG00000029363 BCLAF1 966697 sc-eQTL 3.61e-01 0.0602 0.0657 0.197 cMono_IL1B L2
ENSG00000112357 PEX7 433984 sc-eQTL 6.34e-02 -0.205 0.11 0.197 cMono_IL1B L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 -610666 sc-eQTL 3.69e-02 0.137 0.0655 0.197 cMono_IL1B L2
ENSG00000135525 MAP7 705729 sc-eQTL 3.62e-01 -0.0868 0.095 0.197 cMono_IL1B L2
ENSG00000197442 MAP3K5 464071 sc-eQTL 6.49e-01 -0.0313 0.0687 0.197 cMono_IL1B L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 -611685 sc-eQTL 1.90e-01 0.0924 0.0703 0.197 cMono_IL1B L2
ENSG00000286646 AL121933.2 472503 sc-eQTL 7.67e-01 -0.0262 0.0884 0.197 cMono_IL1B L2
ENSG00000027697 IFNGR1 37099 sc-eQTL 5.81e-01 -0.0396 0.0717 0.197 cMono_S100A L2
ENSG00000029363 BCLAF1 966697 sc-eQTL 8.33e-01 -0.0156 0.0737 0.197 cMono_S100A L2
ENSG00000112357 PEX7 433984 sc-eQTL 1.81e-01 -0.154 0.115 0.197 cMono_S100A L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 -610666 sc-eQTL 2.18e-01 0.0784 0.0635 0.197 cMono_S100A L2
ENSG00000135525 MAP7 705729 sc-eQTL 2.71e-02 -0.236 0.106 0.197 cMono_S100A L2
ENSG00000197442 MAP3K5 464071 sc-eQTL 7.28e-02 0.155 0.086 0.197 cMono_S100A L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 -611685 sc-eQTL 6.76e-01 -0.0384 0.0915 0.197 cMono_S100A L2
ENSG00000286646 AL121933.2 472503 sc-eQTL 6.71e-01 0.038 0.0893 0.197 cMono_S100A L2
ENSG00000027697 IFNGR1 37099 sc-eQTL 4.62e-01 -0.0771 0.104 0.212 gdT L2
ENSG00000029363 BCLAF1 966697 sc-eQTL 1.73e-01 -0.125 0.0916 0.212 gdT L2
ENSG00000112357 PEX7 433984 sc-eQTL 6.16e-01 -0.0665 0.133 0.212 gdT L2
ENSG00000112378 PERP -850871 sc-eQTL 9.58e-02 0.192 0.115 0.212 gdT L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 -610666 sc-eQTL 1.92e-01 0.0839 0.064 0.212 gdT L2
ENSG00000197442 MAP3K5 464071 sc-eQTL 6.61e-02 0.249 0.135 0.212 gdT L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 -611685 sc-eQTL 4.27e-01 -0.0928 0.116 0.212 gdT L2
ENSG00000027697 IFNGR1 37099 sc-eQTL 6.22e-01 0.0378 0.0765 0.196 intMono L2
ENSG00000029363 BCLAF1 966697 sc-eQTL 1.92e-01 -0.132 0.101 0.196 intMono L2
ENSG00000112357 PEX7 433984 sc-eQTL 1.05e-01 -0.167 0.102 0.196 intMono L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 -610666 sc-eQTL 2.21e-01 0.0809 0.0658 0.196 intMono L2
ENSG00000135525 MAP7 705729 sc-eQTL 7.11e-01 0.0376 0.101 0.196 intMono L2
ENSG00000197442 MAP3K5 464071 sc-eQTL 2.48e-01 -0.124 0.107 0.196 intMono L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 -611685 sc-eQTL 7.04e-01 -0.0375 0.0984 0.196 intMono L2
ENSG00000286646 AL121933.2 472503 sc-eQTL 3.06e-01 -0.116 0.113 0.196 intMono L2
ENSG00000027697 IFNGR1 37099 sc-eQTL 5.88e-01 -0.0481 0.0887 0.192 ncMono L2
ENSG00000029363 BCLAF1 966697 sc-eQTL 6.57e-01 -0.0307 0.0689 0.192 ncMono L2
ENSG00000112357 PEX7 433984 sc-eQTL 4.83e-01 -0.0772 0.11 0.192 ncMono L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 -610666 sc-eQTL 1.01e-01 0.129 0.078 0.192 ncMono L2
ENSG00000135525 MAP7 705729 sc-eQTL 6.38e-01 0.0458 0.0971 0.192 ncMono L2
ENSG00000197442 MAP3K5 464071 sc-eQTL 9.99e-02 0.168 0.101 0.192 ncMono L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 -611685 sc-eQTL 5.82e-01 0.0541 0.0982 0.192 ncMono L2
ENSG00000286646 AL121933.2 472503 sc-eQTL 5.93e-01 -0.0555 0.104 0.192 ncMono L2
ENSG00000027697 IFNGR1 37099 sc-eQTL 4.23e-01 -0.0772 0.0961 0.215 pDC L2
ENSG00000029363 BCLAF1 966697 sc-eQTL 6.66e-01 0.0312 0.0722 0.215 pDC L2
ENSG00000112357 PEX7 433984 sc-eQTL 8.77e-01 -0.0164 0.106 0.215 pDC L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 -610666 sc-eQTL 7.74e-02 0.157 0.0883 0.215 pDC L2
ENSG00000135525 MAP7 705729 sc-eQTL 9.91e-01 0.000855 0.074 0.215 pDC L2
ENSG00000197442 MAP3K5 464071 sc-eQTL 8.98e-01 0.0152 0.118 0.215 pDC L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 -611685 sc-eQTL 4.85e-01 -0.0634 0.0904 0.215 pDC L2
ENSG00000286646 AL121933.2 472503 sc-eQTL 6.47e-01 0.0501 0.109 0.215 pDC L2
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000027697 IFNGR1 37099 sc-eQTL 6.38e-03 -0.241 0.0873 0.197 B_Memory LOneK1K
ENSG00000029363 BCLAF1 966697 sc-eQTL 2.67e-01 -0.0554 0.0498 0.197 B_Memory LOneK1K
ENSG00000112357 PEX7 433984 sc-eQTL 8.95e-01 0.0135 0.102 0.197 B_Memory LOneK1K
ENSG00000112378 PERP -850871 sc-eQTL 2.33e-01 0.113 0.0947 0.197 B_Memory LOneK1K
ENSG00000118503 TNFAIP3 -610666 sc-eQTL 6.88e-01 -0.0252 0.0627 0.197 B_Memory LOneK1K
ENSG00000197442 MAP3K5 464071 sc-eQTL 9.33e-01 0.007 0.083 0.197 B_Memory LOneK1K
ENSG00000237499 WAKMAR2 -611685 sc-eQTL 8.74e-01 -0.0169 0.106 0.197 B_Memory LOneK1K
ENSG00000027697 IFNGR1 37099 sc-eQTL 1.46e-01 -0.13 0.0894 0.197 B_Naive LOneK1K
ENSG00000029363 BCLAF1 966697 sc-eQTL 2.27e-01 0.0499 0.0411 0.197 B_Naive LOneK1K
ENSG00000112357 PEX7 433984 sc-eQTL 4.01e-01 0.0918 0.109 0.197 B_Naive LOneK1K
ENSG00000112378 PERP -850871 sc-eQTL 1.47e-01 -0.142 0.0974 0.197 B_Naive LOneK1K
ENSG00000118503 TNFAIP3 -610666 sc-eQTL 7.32e-01 -0.0176 0.0514 0.197 B_Naive LOneK1K
ENSG00000197442 MAP3K5 464071 sc-eQTL 2.59e-01 -0.0851 0.0752 0.197 B_Naive LOneK1K
ENSG00000237499 WAKMAR2 -611685 sc-eQTL 9.38e-01 -0.00719 0.0916 0.197 B_Naive LOneK1K
ENSG00000027697 IFNGR1 37099 sc-eQTL 9.96e-01 0.000307 0.063 0.197 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000029363 BCLAF1 966697 sc-eQTL 4.30e-01 0.0463 0.0586 0.197 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000112357 PEX7 433984 sc-eQTL 6.53e-02 -0.208 0.112 0.197 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000118503 TNFAIP3 -610666 sc-eQTL 1.37e-01 0.0865 0.058 0.197 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000135525 MAP7 705729 sc-eQTL 1.07e-01 -0.163 0.101 0.197 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000197442 MAP3K5 464071 sc-eQTL 5.23e-01 0.0436 0.0683 0.197 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000237499 WAKMAR2 -611685 sc-eQTL 3.35e-01 0.0673 0.0697 0.197 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000286646 AL121933.2 472503 sc-eQTL 8.34e-01 -0.017 0.0813 0.197 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000027697 IFNGR1 37099 sc-eQTL 6.26e-01 -0.0356 0.0731 0.198 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000029363 BCLAF1 966697 sc-eQTL 4.14e-01 -0.054 0.066 0.198 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000112357 PEX7 433984 sc-eQTL 2.77e-01 -0.12 0.11 0.198 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000118503 TNFAIP3 -610666 sc-eQTL 1.97e-02 0.158 0.0674 0.198 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000135525 MAP7 705729 sc-eQTL 6.56e-01 0.0476 0.107 0.198 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000197442 MAP3K5 464071 sc-eQTL 5.04e-01 0.0586 0.0875 0.198 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000237499 WAKMAR2 -611685 sc-eQTL 8.81e-01 -0.0138 0.0916 0.198 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000286646 AL121933.2 472503 sc-eQTL 1.91e-01 -0.136 0.104 0.198 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000027697 IFNGR1 37099 sc-eQTL 1.19e-01 -0.107 0.0685 0.198 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000029363 BCLAF1 966697 sc-eQTL 9.72e-01 -0.0014 0.04 0.198 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000112357 PEX7 433984 sc-eQTL 7.76e-01 0.0331 0.116 0.198 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000112378 PERP -850871 sc-eQTL 2.62e-01 -0.0809 0.0718 0.198 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000118503 TNFAIP3 -610666 sc-eQTL 4.31e-01 -0.0494 0.0626 0.198 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000197442 MAP3K5 464071 sc-eQTL 6.99e-01 -0.0328 0.0847 0.198 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000237499 WAKMAR2 -611685 sc-eQTL 7.84e-01 -0.024 0.0878 0.198 NK_CD56dim LOneK1K

Statistical fine-mapping results from Japan COVID-19 Task Force
(Shown only for PIP>0.001)
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
PIP (SuSiE)
PIP (FINEMAP)
MAF
ENSG00000027697 IFNGR1 37099 pQTL 0.00464 -0.0537 0.0189 0.0 0.0 0.21
ENSG00000027697 IFNGR1 37099 eQTL 2.29e-06 -0.077 0.0162 0.0 0.0 0.204

Expression Modifier Score(EMS) for GTEx 49tissues
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Whole Blood
Muscle Skeletal
Liver
Brain Cerebellum
Prostate
Spleen
Skin Sun Exposed Lower leg
Artery Coronary
Esophagus Muscularis
Esophagus Gastroesophageal Junction
Artery Tibial
Heart Atrial Appendage
Nerve Tibial
Heart Left Ventricle
Adrenal Gland
Adipose Visceral Omentum
Pancreas
Lung
Pituitary
Brain Nucleus accumbens basal ganglia
Colon Transverse
Adipose Subcutaneous
Esophagus Mucosa
Brain Cortex
Thyroid
Stomach
Breast Mammary Tissue
Colon Sigmoid
Skin Not Sun Exposed Suprapubic
Testis
Artery Aorta
Brain Amygdala
Brain Anterior cingulate cortex BA24
Brain Caudate basal ganglia
Brain Cerebellar Hemisphere
Brain Frontal Cortex BA9
Brain Hippocampus
Brain Hypothalamus
Brain Putamen basal ganglia
Brain Spinal cord cervical c-1
Brain Substantia nigra
Cells Cultured fibroblasts
Cells EBV-transformed lymphocytes
Kidney Cortex
Minor Salivary Gland
Ovary
Small Intestine Terminal Ileum
Uterus
Vagina
ENSG00000027697 IFNGR1 37099 9.4e-05 2.74e-05 4.66e-06 1.2e-05 2.7e-06 1.51e-05 3.29e-05 2.12e-06 1.67e-05 7.23e-06 2.09e-05 8.32e-06 3.56e-05 7.61e-06 5.68e-06 1.26e-05 1.53e-05 2.41e-05 4.51e-06 3.14e-06 9.54e-06 2.06e-05 2.82e-05 5.48e-06 3e-05 5.97e-06 7.82e-06 6.24e-06 2.28e-05 2.02e-05 1.05e-05 9.85e-07 1.44e-06 3.68e-06 6.94e-06 2.85e-06 1.78e-06 1.95e-06 2.03e-06 1.74e-06 9.83e-07 4.48e-05 5.69e-06 1.65e-07 1.84e-06 2.28e-06 2.84e-06 7.13e-07 5.61e-07
ENSG00000237499 \N -611685 5.86e-06 3.03e-06 6.41e-07 1.83e-06 2.71e-07 7.6e-07 1.8e-06 3.45e-07 1.51e-06 3.87e-07 1.88e-06 1.28e-06 2.66e-06 1.1e-06 3.44e-07 1.22e-06 1.1e-06 2.23e-06 5.93e-07 6.44e-07 6.44e-07 2.77e-06 2.12e-06 6.39e-07 2.67e-06 1.07e-06 9.37e-07 7.22e-07 1.72e-06 1.5e-06 6.68e-07 4.43e-08 2.17e-07 5.71e-07 6.88e-07 4.49e-07 7.36e-07 1.1e-07 1.14e-07 9.44e-09 8.09e-08 4.1e-06 1.32e-06 1.61e-07 1.89e-07 2.94e-07 1.97e-07 2.89e-09 4.61e-08