logo

Genes within 1Mb (chr6:137251220:C:A):

View on , UCSC , GTEx , gnomAD

Immune cell-type specific single cell cis-eQTLs in OASIS
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000027697 IFNGR1 31771 sc-eQTL 1.07e-01 0.234 0.144 0.06 B L1
ENSG00000029363 BCLAF1 961369 sc-eQTL 2.80e-01 0.0699 0.0645 0.06 B L1
ENSG00000112357 PEX7 428656 sc-eQTL 6.67e-01 -0.074 0.172 0.06 B L1
ENSG00000112378 PERP -856199 sc-eQTL 6.27e-01 0.0553 0.114 0.06 B L1
ENSG00000118503 TNFAIP3 -615994 sc-eQTL 6.56e-01 0.0409 0.0916 0.06 B L1
ENSG00000197442 MAP3K5 458743 sc-eQTL 2.20e-01 0.156 0.127 0.06 B L1
ENSG00000237499 WAKMAR2 -617013 sc-eQTL 2.79e-01 0.156 0.144 0.06 B L1
ENSG00000027697 IFNGR1 31771 sc-eQTL 7.01e-01 0.037 0.0962 0.06 CD4T L1
ENSG00000029363 BCLAF1 961369 sc-eQTL 5.45e-01 0.0442 0.0728 0.06 CD4T L1
ENSG00000112357 PEX7 428656 sc-eQTL 5.23e-02 0.3 0.154 0.06 CD4T L1
ENSG00000112378 PERP -856199 sc-eQTL 4.41e-01 0.0802 0.104 0.06 CD4T L1
ENSG00000118503 TNFAIP3 -615994 sc-eQTL 3.21e-01 -0.0967 0.0973 0.06 CD4T L1
ENSG00000197442 MAP3K5 458743 sc-eQTL 9.97e-01 -0.000278 0.0743 0.06 CD4T L1
ENSG00000237499 WAKMAR2 -617013 sc-eQTL 1.39e-01 -0.181 0.122 0.06 CD4T L1
ENSG00000027697 IFNGR1 31771 sc-eQTL 7.96e-01 0.0286 0.111 0.06 CD8T L1
ENSG00000029363 BCLAF1 961369 sc-eQTL 6.56e-01 0.0334 0.0748 0.06 CD8T L1
ENSG00000112357 PEX7 428656 sc-eQTL 4.78e-01 -0.131 0.184 0.06 CD8T L1
ENSG00000112378 PERP -856199 sc-eQTL 7.65e-01 0.0361 0.121 0.06 CD8T L1
ENSG00000118503 TNFAIP3 -615994 sc-eQTL 6.73e-01 -0.0393 0.0931 0.06 CD8T L1
ENSG00000197442 MAP3K5 458743 sc-eQTL 5.51e-01 0.0587 0.0983 0.06 CD8T L1
ENSG00000237499 WAKMAR2 -617013 sc-eQTL 6.53e-02 -0.251 0.136 0.06 CD8T L1
ENSG00000027697 IFNGR1 31771 sc-eQTL 7.70e-01 0.0406 0.138 0.059 DC L1
ENSG00000029363 BCLAF1 961369 sc-eQTL 6.77e-01 -0.052 0.124 0.059 DC L1
ENSG00000112357 PEX7 428656 sc-eQTL 9.04e-01 -0.0235 0.195 0.059 DC L1
ENSG00000118503 TNFAIP3 -615994 sc-eQTL 4.90e-01 -0.102 0.148 0.059 DC L1
ENSG00000135525 MAP7 700401 sc-eQTL 8.05e-01 -0.0396 0.16 0.059 DC L1
ENSG00000197442 MAP3K5 458743 sc-eQTL 4.27e-01 -0.122 0.153 0.059 DC L1
ENSG00000237499 WAKMAR2 -617013 sc-eQTL 2.09e-01 -0.189 0.15 0.059 DC L1
ENSG00000286646 AL121933.2 467175 sc-eQTL 6.02e-01 0.105 0.2 0.059 DC L1
ENSG00000027697 IFNGR1 31771 sc-eQTL 1.54e-01 0.157 0.11 0.06 Mono L1
ENSG00000029363 BCLAF1 961369 sc-eQTL 7.50e-02 -0.167 0.0934 0.06 Mono L1
ENSG00000112357 PEX7 428656 sc-eQTL 4.23e-02 0.375 0.183 0.06 Mono L1
ENSG00000118503 TNFAIP3 -615994 sc-eQTL 3.93e-01 0.0798 0.0932 0.06 Mono L1
ENSG00000135525 MAP7 700401 sc-eQTL 4.87e-01 -0.114 0.163 0.06 Mono L1
ENSG00000197442 MAP3K5 458743 sc-eQTL 5.60e-01 0.0635 0.109 0.06 Mono L1
ENSG00000237499 WAKMAR2 -617013 sc-eQTL 5.27e-01 -0.0732 0.116 0.06 Mono L1
ENSG00000286646 AL121933.2 467175 sc-eQTL 3.15e-01 0.133 0.132 0.06 Mono L1
ENSG00000027697 IFNGR1 31771 sc-eQTL 2.68e-01 0.136 0.123 0.06 NK L1
ENSG00000029363 BCLAF1 961369 sc-eQTL 8.25e-01 -0.0145 0.0653 0.06 NK L1
ENSG00000112357 PEX7 428656 sc-eQTL 3.18e-01 -0.189 0.189 0.06 NK L1
ENSG00000112378 PERP -856199 sc-eQTL 1.67e-02 0.284 0.118 0.06 NK L1
ENSG00000118503 TNFAIP3 -615994 sc-eQTL 7.37e-01 -0.0345 0.102 0.06 NK L1
ENSG00000197442 MAP3K5 458743 sc-eQTL 9.80e-01 0.00367 0.147 0.06 NK L1
ENSG00000237499 WAKMAR2 -617013 sc-eQTL 1.75e-01 -0.197 0.144 0.06 NK L1
ENSG00000027697 IFNGR1 31771 sc-eQTL 3.07e-01 0.119 0.117 0.06 Other_T L1
ENSG00000029363 BCLAF1 961369 sc-eQTL 9.03e-01 0.0119 0.098 0.06 Other_T L1
ENSG00000112357 PEX7 428656 sc-eQTL 9.82e-01 -0.0043 0.191 0.06 Other_T L1
ENSG00000112378 PERP -856199 sc-eQTL 3.15e-02 0.327 0.151 0.06 Other_T L1
ENSG00000118503 TNFAIP3 -615994 sc-eQTL 9.28e-01 0.00657 0.0727 0.06 Other_T L1
ENSG00000197442 MAP3K5 458743 sc-eQTL 2.69e-01 0.155 0.14 0.06 Other_T L1
ENSG00000237499 WAKMAR2 -617013 sc-eQTL 9.26e-01 -0.0134 0.144 0.06 Other_T L1
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000027697 IFNGR1 31771 sc-eQTL 6.96e-01 0.0754 0.192 0.061 B_Activated L2
ENSG00000029363 BCLAF1 961369 sc-eQTL 5.78e-01 0.0871 0.156 0.061 B_Activated L2
ENSG00000112357 PEX7 428656 sc-eQTL 8.95e-01 0.0251 0.189 0.061 B_Activated L2
ENSG00000112378 PERP -856199 sc-eQTL 9.04e-01 -0.0118 0.098 0.061 B_Activated L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 -615994 sc-eQTL 2.57e-01 -0.215 0.189 0.061 B_Activated L2
ENSG00000197442 MAP3K5 458743 sc-eQTL 2.55e-01 0.242 0.212 0.061 B_Activated L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 -617013 sc-eQTL 2.08e-01 -0.209 0.165 0.061 B_Activated L2
ENSG00000027697 IFNGR1 31771 sc-eQTL 1.07e-01 0.279 0.172 0.06 B_Intermediate L2
ENSG00000029363 BCLAF1 961369 sc-eQTL 5.28e-01 0.0623 0.0984 0.06 B_Intermediate L2
ENSG00000112357 PEX7 428656 sc-eQTL 9.37e-01 0.0142 0.181 0.06 B_Intermediate L2
ENSG00000112378 PERP -856199 sc-eQTL 1.11e-01 0.263 0.164 0.06 B_Intermediate L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 -615994 sc-eQTL 9.70e-01 0.00485 0.13 0.06 B_Intermediate L2
ENSG00000197442 MAP3K5 458743 sc-eQTL 1.41e-01 0.23 0.156 0.06 B_Intermediate L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 -617013 sc-eQTL 4.09e-01 -0.152 0.184 0.06 B_Intermediate L2
ENSG00000027697 IFNGR1 31771 sc-eQTL 4.72e-02 0.365 0.183 0.06 B_Memory L2
ENSG00000029363 BCLAF1 961369 sc-eQTL 8.13e-01 0.026 0.109 0.06 B_Memory L2
ENSG00000112357 PEX7 428656 sc-eQTL 1.65e-01 0.258 0.185 0.06 B_Memory L2
ENSG00000112378 PERP -856199 sc-eQTL 1.83e-01 0.233 0.174 0.06 B_Memory L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 -615994 sc-eQTL 7.54e-01 0.0378 0.121 0.06 B_Memory L2
ENSG00000197442 MAP3K5 458743 sc-eQTL 2.93e-01 0.173 0.164 0.06 B_Memory L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 -617013 sc-eQTL 4.99e-01 0.121 0.179 0.06 B_Memory L2
ENSG00000027697 IFNGR1 31771 sc-eQTL 9.69e-01 0.00577 0.147 0.06 B_Naive1 L2
ENSG00000029363 BCLAF1 961369 sc-eQTL 1.33e-01 0.126 0.0837 0.06 B_Naive1 L2
ENSG00000112357 PEX7 428656 sc-eQTL 1.57e-02 -0.467 0.192 0.06 B_Naive1 L2
ENSG00000112378 PERP -856199 sc-eQTL 9.58e-01 -0.00894 0.17 0.06 B_Naive1 L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 -615994 sc-eQTL 8.83e-01 -0.0145 0.0985 0.06 B_Naive1 L2
ENSG00000197442 MAP3K5 458743 sc-eQTL 7.21e-01 0.0495 0.138 0.06 B_Naive1 L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 -617013 sc-eQTL 3.58e-01 0.142 0.154 0.06 B_Naive1 L2
ENSG00000027697 IFNGR1 31771 sc-eQTL 3.52e-01 0.168 0.18 0.06 B_Naive2 L2
ENSG00000029363 BCLAF1 961369 sc-eQTL 8.90e-01 0.0145 0.105 0.06 B_Naive2 L2
ENSG00000112357 PEX7 428656 sc-eQTL 6.56e-01 0.0879 0.197 0.06 B_Naive2 L2
ENSG00000112378 PERP -856199 sc-eQTL 6.23e-01 -0.0708 0.144 0.06 B_Naive2 L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 -615994 sc-eQTL 6.88e-01 -0.0577 0.144 0.06 B_Naive2 L2
ENSG00000197442 MAP3K5 458743 sc-eQTL 8.03e-01 0.0382 0.153 0.06 B_Naive2 L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 -617013 sc-eQTL 2.22e-01 0.227 0.185 0.06 B_Naive2 L2
ENSG00000027697 IFNGR1 31771 sc-eQTL 5.75e-01 0.0983 0.175 0.057 CD4_CTL L2
ENSG00000029363 BCLAF1 961369 sc-eQTL 3.59e-01 -0.143 0.155 0.057 CD4_CTL L2
ENSG00000112357 PEX7 428656 sc-eQTL 1.48e-01 0.281 0.193 0.057 CD4_CTL L2
ENSG00000112378 PERP -856199 sc-eQTL 1.00e+00 -5.27e-05 0.197 0.057 CD4_CTL L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 -615994 sc-eQTL 5.25e-02 -0.222 0.114 0.057 CD4_CTL L2
ENSG00000197442 MAP3K5 458743 sc-eQTL 7.06e-01 0.0692 0.183 0.057 CD4_CTL L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 -617013 sc-eQTL 5.54e-01 -0.106 0.179 0.057 CD4_CTL L2
ENSG00000027697 IFNGR1 31771 sc-eQTL 2.96e-01 -0.0962 0.0918 0.06 CD4_Naive L2
ENSG00000029363 BCLAF1 961369 sc-eQTL 4.20e-01 0.0597 0.0738 0.06 CD4_Naive L2
ENSG00000112357 PEX7 428656 sc-eQTL 5.34e-02 0.335 0.172 0.06 CD4_Naive L2
ENSG00000112378 PERP -856199 sc-eQTL 4.76e-01 -0.102 0.143 0.06 CD4_Naive L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 -615994 sc-eQTL 3.01e-01 -0.104 0.1 0.06 CD4_Naive L2
ENSG00000197442 MAP3K5 458743 sc-eQTL 8.03e-01 -0.0185 0.0739 0.06 CD4_Naive L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 -617013 sc-eQTL 2.73e-01 -0.143 0.13 0.06 CD4_Naive L2
ENSG00000027697 IFNGR1 31771 sc-eQTL 5.99e-01 0.0669 0.127 0.06 CD4_TCM L2
ENSG00000029363 BCLAF1 961369 sc-eQTL 3.91e-01 0.0688 0.0801 0.06 CD4_TCM L2
ENSG00000112357 PEX7 428656 sc-eQTL 7.24e-01 0.0661 0.187 0.06 CD4_TCM L2
ENSG00000112378 PERP -856199 sc-eQTL 1.42e-01 0.231 0.157 0.06 CD4_TCM L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 -615994 sc-eQTL 3.96e-01 -0.0778 0.0914 0.06 CD4_TCM L2
ENSG00000197442 MAP3K5 458743 sc-eQTL 6.86e-01 0.0423 0.104 0.06 CD4_TCM L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 -617013 sc-eQTL 5.28e-01 -0.081 0.128 0.06 CD4_TCM L2
ENSG00000027697 IFNGR1 31771 sc-eQTL 2.16e-01 0.178 0.143 0.06 CD4_TEM L2
ENSG00000029363 BCLAF1 961369 sc-eQTL 3.55e-01 0.0942 0.102 0.06 CD4_TEM L2
ENSG00000112357 PEX7 428656 sc-eQTL 5.06e-01 -0.123 0.185 0.06 CD4_TEM L2
ENSG00000112378 PERP -856199 sc-eQTL 1.31e-01 0.226 0.149 0.06 CD4_TEM L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 -615994 sc-eQTL 5.23e-01 -0.061 0.0953 0.06 CD4_TEM L2
ENSG00000197442 MAP3K5 458743 sc-eQTL 7.09e-01 -0.0551 0.147 0.06 CD4_TEM L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 -617013 sc-eQTL 9.10e-01 0.0174 0.153 0.06 CD4_TEM L2
ENSG00000027697 IFNGR1 31771 sc-eQTL 6.57e-01 0.0592 0.133 0.06 CD8_CTL L2
ENSG00000029363 BCLAF1 961369 sc-eQTL 1.36e-01 -0.132 0.0884 0.06 CD8_CTL L2
ENSG00000112357 PEX7 428656 sc-eQTL 9.13e-01 -0.02 0.183 0.06 CD8_CTL L2
ENSG00000112378 PERP -856199 sc-eQTL 6.51e-01 0.0798 0.176 0.06 CD8_CTL L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 -615994 sc-eQTL 7.59e-01 0.0345 0.112 0.06 CD8_CTL L2
ENSG00000197442 MAP3K5 458743 sc-eQTL 3.35e-01 0.153 0.158 0.06 CD8_CTL L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 -617013 sc-eQTL 5.19e-01 -0.102 0.158 0.06 CD8_CTL L2
ENSG00000027697 IFNGR1 31771 sc-eQTL 5.17e-01 0.0861 0.133 0.06 CD8_Naive L2
ENSG00000029363 BCLAF1 961369 sc-eQTL 1.98e-02 0.215 0.0914 0.06 CD8_Naive L2
ENSG00000112357 PEX7 428656 sc-eQTL 7.12e-01 -0.071 0.192 0.06 CD8_Naive L2
ENSG00000112378 PERP -856199 sc-eQTL 9.33e-01 -0.0123 0.146 0.06 CD8_Naive L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 -615994 sc-eQTL 6.16e-01 -0.052 0.104 0.06 CD8_Naive L2
ENSG00000197442 MAP3K5 458743 sc-eQTL 8.08e-01 0.03 0.123 0.06 CD8_Naive L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 -617013 sc-eQTL 2.18e-01 -0.189 0.153 0.06 CD8_Naive L2
ENSG00000027697 IFNGR1 31771 sc-eQTL 7.40e-01 0.0602 0.181 0.058 CD8_TCM L2
ENSG00000029363 BCLAF1 961369 sc-eQTL 2.76e-01 0.148 0.136 0.058 CD8_TCM L2
ENSG00000112357 PEX7 428656 sc-eQTL 2.14e-01 0.259 0.207 0.058 CD8_TCM L2
ENSG00000112378 PERP -856199 sc-eQTL 5.11e-01 0.134 0.204 0.058 CD8_TCM L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 -615994 sc-eQTL 8.39e-02 -0.169 0.0975 0.058 CD8_TCM L2
ENSG00000197442 MAP3K5 458743 sc-eQTL 8.93e-01 0.0237 0.175 0.058 CD8_TCM L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 -617013 sc-eQTL 8.08e-01 -0.0439 0.18 0.058 CD8_TCM L2
ENSG00000027697 IFNGR1 31771 sc-eQTL 5.79e-01 0.0908 0.163 0.062 CD8_TEM L2
ENSG00000029363 BCLAF1 961369 sc-eQTL 6.20e-01 -0.0765 0.154 0.062 CD8_TEM L2
ENSG00000112357 PEX7 428656 sc-eQTL 5.33e-01 0.117 0.188 0.062 CD8_TEM L2
ENSG00000112378 PERP -856199 sc-eQTL 2.40e-01 0.23 0.195 0.062 CD8_TEM L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 -615994 sc-eQTL 5.65e-01 0.0693 0.12 0.062 CD8_TEM L2
ENSG00000197442 MAP3K5 458743 sc-eQTL 5.53e-01 -0.111 0.186 0.062 CD8_TEM L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 -617013 sc-eQTL 5.75e-02 -0.338 0.177 0.062 CD8_TEM L2
ENSG00000027697 IFNGR1 31771 sc-eQTL 2.79e-01 0.142 0.131 0.061 MAIT L2
ENSG00000029363 BCLAF1 961369 sc-eQTL 1.25e-02 0.27 0.107 0.061 MAIT L2
ENSG00000112357 PEX7 428656 sc-eQTL 2.12e-01 -0.221 0.177 0.061 MAIT L2
ENSG00000112378 PERP -856199 sc-eQTL 8.36e-02 0.32 0.184 0.061 MAIT L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 -615994 sc-eQTL 5.69e-01 -0.0502 0.088 0.061 MAIT L2
ENSG00000197442 MAP3K5 458743 sc-eQTL 8.66e-01 0.026 0.153 0.061 MAIT L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 -617013 sc-eQTL 9.54e-01 -0.00932 0.163 0.061 MAIT L2
ENSG00000027697 IFNGR1 31771 sc-eQTL 6.68e-01 0.0634 0.148 0.058 NK_CD56bright L2
ENSG00000029363 BCLAF1 961369 sc-eQTL 4.53e-01 -0.0818 0.109 0.058 NK_CD56bright L2
ENSG00000112357 PEX7 428656 sc-eQTL 7.31e-01 -0.0663 0.193 0.058 NK_CD56bright L2
ENSG00000112378 PERP -856199 sc-eQTL 3.21e-01 0.171 0.172 0.058 NK_CD56bright L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 -615994 sc-eQTL 5.82e-01 0.0607 0.11 0.058 NK_CD56bright L2
ENSG00000197442 MAP3K5 458743 sc-eQTL 4.88e-01 -0.116 0.167 0.058 NK_CD56bright L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 -617013 sc-eQTL 9.51e-01 -0.0107 0.176 0.058 NK_CD56bright L2
ENSG00000027697 IFNGR1 31771 sc-eQTL 1.48e-01 0.166 0.114 0.058 NK_CD56dim L2
ENSG00000029363 BCLAF1 961369 sc-eQTL 4.59e-01 0.0555 0.0748 0.058 NK_CD56dim L2
ENSG00000112357 PEX7 428656 sc-eQTL 8.79e-01 0.0302 0.197 0.058 NK_CD56dim L2
ENSG00000112378 PERP -856199 sc-eQTL 1.11e-02 0.35 0.137 0.058 NK_CD56dim L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 -615994 sc-eQTL 9.20e-01 -0.0109 0.108 0.058 NK_CD56dim L2
ENSG00000197442 MAP3K5 458743 sc-eQTL 6.46e-01 0.0714 0.155 0.058 NK_CD56dim L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 -617013 sc-eQTL 1.10e-01 -0.258 0.161 0.058 NK_CD56dim L2
ENSG00000027697 IFNGR1 31771 sc-eQTL 7.38e-01 0.05 0.149 0.057 NK_HLA L2
ENSG00000029363 BCLAF1 961369 sc-eQTL 1.84e-01 -0.168 0.126 0.057 NK_HLA L2
ENSG00000112357 PEX7 428656 sc-eQTL 5.19e-01 -0.122 0.189 0.057 NK_HLA L2
ENSG00000112378 PERP -856199 sc-eQTL 8.62e-01 -0.0267 0.154 0.057 NK_HLA L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 -615994 sc-eQTL 8.33e-01 -0.025 0.118 0.057 NK_HLA L2
ENSG00000197442 MAP3K5 458743 sc-eQTL 7.24e-01 0.0665 0.188 0.057 NK_HLA L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 -617013 sc-eQTL 1.35e-01 -0.284 0.19 0.057 NK_HLA L2
ENSG00000027697 IFNGR1 31771 sc-eQTL 2.21e-01 0.147 0.12 0.058 NK_cytokine L2
ENSG00000029363 BCLAF1 961369 sc-eQTL 7.38e-01 0.0301 0.0899 0.058 NK_cytokine L2
ENSG00000112357 PEX7 428656 sc-eQTL 1.78e-02 -0.446 0.187 0.058 NK_cytokine L2
ENSG00000112378 PERP -856199 sc-eQTL 6.48e-01 0.0656 0.143 0.058 NK_cytokine L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 -615994 sc-eQTL 7.29e-01 -0.0374 0.108 0.058 NK_cytokine L2
ENSG00000197442 MAP3K5 458743 sc-eQTL 4.48e-01 0.112 0.148 0.058 NK_cytokine L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 -617013 sc-eQTL 9.47e-01 0.0108 0.162 0.058 NK_cytokine L2
ENSG00000027697 IFNGR1 31771 sc-eQTL 7.76e-01 0.0658 0.231 0.059 PB L2
ENSG00000029363 BCLAF1 961369 sc-eQTL 9.72e-01 -0.00689 0.199 0.059 PB L2
ENSG00000112357 PEX7 428656 sc-eQTL 5.90e-01 -0.128 0.237 0.059 PB L2
ENSG00000112378 PERP -856199 sc-eQTL 7.67e-02 0.261 0.146 0.059 PB L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 -615994 sc-eQTL 2.70e-01 0.198 0.178 0.059 PB L2
ENSG00000197442 MAP3K5 458743 sc-eQTL 7.57e-01 0.0632 0.204 0.059 PB L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 -617013 sc-eQTL 3.97e-01 0.183 0.215 0.059 PB L2
ENSG00000027697 IFNGR1 31771 sc-eQTL 5.43e-01 0.0911 0.15 0.059 Pro_T L2
ENSG00000029363 BCLAF1 961369 sc-eQTL 2.42e-01 -0.181 0.155 0.059 Pro_T L2
ENSG00000112357 PEX7 428656 sc-eQTL 1.00e-01 0.298 0.181 0.059 Pro_T L2
ENSG00000112378 PERP -856199 sc-eQTL 3.34e-01 0.14 0.144 0.059 Pro_T L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 -615994 sc-eQTL 6.20e-01 -0.0452 0.0911 0.059 Pro_T L2
ENSG00000197442 MAP3K5 458743 sc-eQTL 5.15e-01 0.115 0.176 0.059 Pro_T L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 -617013 sc-eQTL 5.65e-01 0.102 0.177 0.059 Pro_T L2
ENSG00000027697 IFNGR1 31771 sc-eQTL 1.17e-01 0.279 0.177 0.06 Treg L2
ENSG00000029363 BCLAF1 961369 sc-eQTL 4.29e-01 0.0911 0.115 0.06 Treg L2
ENSG00000112357 PEX7 428656 sc-eQTL 4.11e-01 -0.155 0.188 0.06 Treg L2
ENSG00000112378 PERP -856199 sc-eQTL 2.67e-02 0.449 0.201 0.06 Treg L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 -615994 sc-eQTL 6.89e-02 -0.205 0.112 0.06 Treg L2
ENSG00000197442 MAP3K5 458743 sc-eQTL 8.35e-02 -0.212 0.122 0.06 Treg L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 -617013 sc-eQTL 6.38e-02 -0.319 0.171 0.06 Treg L2
ENSG00000027697 IFNGR1 31771 sc-eQTL 2.75e-01 0.167 0.152 0.056 cDC L2
ENSG00000029363 BCLAF1 961369 sc-eQTL 7.53e-01 0.0484 0.154 0.056 cDC L2
ENSG00000112357 PEX7 428656 sc-eQTL 2.43e-01 -0.231 0.197 0.056 cDC L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 -615994 sc-eQTL 4.15e-01 -0.123 0.15 0.056 cDC L2
ENSG00000135525 MAP7 700401 sc-eQTL 4.70e-01 -0.127 0.176 0.056 cDC L2
ENSG00000197442 MAP3K5 458743 sc-eQTL 7.70e-01 0.0453 0.155 0.056 cDC L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 -617013 sc-eQTL 6.14e-01 -0.0992 0.196 0.056 cDC L2
ENSG00000286646 AL121933.2 467175 sc-eQTL 6.72e-01 0.0855 0.202 0.056 cDC L2
ENSG00000027697 IFNGR1 31771 sc-eQTL 1.30e-01 0.153 0.101 0.06 cMono_IL1B L2
ENSG00000029363 BCLAF1 961369 sc-eQTL 2.18e-01 -0.134 0.108 0.06 cMono_IL1B L2
ENSG00000112357 PEX7 428656 sc-eQTL 6.32e-01 0.0873 0.182 0.06 cMono_IL1B L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 -615994 sc-eQTL 5.95e-01 0.058 0.109 0.06 cMono_IL1B L2
ENSG00000135525 MAP7 700401 sc-eQTL 8.23e-01 0.0351 0.157 0.06 cMono_IL1B L2
ENSG00000197442 MAP3K5 458743 sc-eQTL 5.87e-01 0.0616 0.113 0.06 cMono_IL1B L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 -617013 sc-eQTL 8.06e-01 -0.0287 0.116 0.06 cMono_IL1B L2
ENSG00000286646 AL121933.2 467175 sc-eQTL 4.63e-01 0.107 0.146 0.06 cMono_IL1B L2
ENSG00000027697 IFNGR1 31771 sc-eQTL 5.24e-01 0.0749 0.117 0.06 cMono_S100A L2
ENSG00000029363 BCLAF1 961369 sc-eQTL 5.89e-01 -0.0652 0.121 0.06 cMono_S100A L2
ENSG00000112357 PEX7 428656 sc-eQTL 4.15e-03 0.535 0.185 0.06 cMono_S100A L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 -615994 sc-eQTL 6.77e-01 0.0435 0.104 0.06 cMono_S100A L2
ENSG00000135525 MAP7 700401 sc-eQTL 5.29e-01 -0.111 0.175 0.06 cMono_S100A L2
ENSG00000197442 MAP3K5 458743 sc-eQTL 7.37e-01 0.0478 0.142 0.06 cMono_S100A L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 -617013 sc-eQTL 2.00e-01 -0.192 0.149 0.06 cMono_S100A L2
ENSG00000286646 AL121933.2 467175 sc-eQTL 3.34e-01 0.141 0.146 0.06 cMono_S100A L2
ENSG00000027697 IFNGR1 31771 sc-eQTL 4.35e-01 0.0992 0.127 0.06 intMono L2
ENSG00000029363 BCLAF1 961369 sc-eQTL 2.74e-01 -0.183 0.167 0.06 intMono L2
ENSG00000112357 PEX7 428656 sc-eQTL 7.58e-01 -0.0528 0.171 0.06 intMono L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 -615994 sc-eQTL 7.13e-01 0.0403 0.109 0.06 intMono L2
ENSG00000135525 MAP7 700401 sc-eQTL 6.40e-01 -0.0788 0.168 0.06 intMono L2
ENSG00000197442 MAP3K5 458743 sc-eQTL 9.33e-01 0.0151 0.178 0.06 intMono L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 -617013 sc-eQTL 4.38e-01 -0.127 0.163 0.06 intMono L2
ENSG00000286646 AL121933.2 467175 sc-eQTL 8.88e-01 0.0266 0.188 0.06 intMono L2
ENSG00000027697 IFNGR1 31771 sc-eQTL 8.21e-01 -0.0334 0.147 0.063 ncMono L2
ENSG00000029363 BCLAF1 961369 sc-eQTL 3.31e-01 0.111 0.114 0.063 ncMono L2
ENSG00000112357 PEX7 428656 sc-eQTL 1.10e-01 0.291 0.181 0.063 ncMono L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 -615994 sc-eQTL 6.25e-01 -0.0638 0.13 0.063 ncMono L2
ENSG00000135525 MAP7 700401 sc-eQTL 7.96e-01 -0.0417 0.161 0.063 ncMono L2
ENSG00000197442 MAP3K5 458743 sc-eQTL 7.38e-01 0.0568 0.169 0.063 ncMono L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 -617013 sc-eQTL 2.62e-01 0.183 0.163 0.063 ncMono L2
ENSG00000286646 AL121933.2 467175 sc-eQTL 8.91e-01 -0.0235 0.172 0.063 ncMono L2
ENSG00000027697 IFNGR1 31771 sc-eQTL 7.23e-01 -0.0642 0.181 0.056 pDC L2
ENSG00000029363 BCLAF1 961369 sc-eQTL 2.16e-01 -0.167 0.135 0.056 pDC L2
ENSG00000112357 PEX7 428656 sc-eQTL 5.57e-01 0.117 0.199 0.056 pDC L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 -615994 sc-eQTL 3.74e-01 0.149 0.167 0.056 pDC L2
ENSG00000135525 MAP7 700401 sc-eQTL 9.66e-01 0.00597 0.139 0.056 pDC L2
ENSG00000197442 MAP3K5 458743 sc-eQTL 2.50e-01 0.256 0.221 0.056 pDC L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 -617013 sc-eQTL 3.78e-01 -0.15 0.17 0.056 pDC L2
ENSG00000286646 AL121933.2 467175 sc-eQTL 6.19e-01 -0.102 0.205 0.056 pDC L2
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000027697 IFNGR1 31771 sc-eQTL 2.02e-02 0.352 0.151 0.06 B_Memory LOneK1K
ENSG00000029363 BCLAF1 961369 sc-eQTL 3.24e-01 0.0844 0.0854 0.06 B_Memory LOneK1K
ENSG00000112357 PEX7 428656 sc-eQTL 7.64e-01 0.0526 0.175 0.06 B_Memory LOneK1K
ENSG00000112378 PERP -856199 sc-eQTL 9.05e-02 0.275 0.162 0.06 B_Memory LOneK1K
ENSG00000118503 TNFAIP3 -615994 sc-eQTL 2.68e-01 0.119 0.107 0.06 B_Memory LOneK1K
ENSG00000197442 MAP3K5 458743 sc-eQTL 7.45e-02 0.253 0.141 0.06 B_Memory LOneK1K
ENSG00000237499 WAKMAR2 -617013 sc-eQTL 5.14e-01 -0.119 0.182 0.06 B_Memory LOneK1K
ENSG00000027697 IFNGR1 31771 sc-eQTL 6.77e-01 0.0648 0.155 0.06 B_Naive LOneK1K
ENSG00000029363 BCLAF1 961369 sc-eQTL 3.70e-01 0.064 0.0713 0.06 B_Naive LOneK1K
ENSG00000112357 PEX7 428656 sc-eQTL 1.13e-01 -0.3 0.188 0.06 B_Naive LOneK1K
ENSG00000112378 PERP -856199 sc-eQTL 9.52e-01 -0.0102 0.169 0.06 B_Naive LOneK1K
ENSG00000118503 TNFAIP3 -615994 sc-eQTL 7.96e-01 0.0231 0.0891 0.06 B_Naive LOneK1K
ENSG00000197442 MAP3K5 458743 sc-eQTL 5.43e-01 0.0795 0.13 0.06 B_Naive LOneK1K
ENSG00000237499 WAKMAR2 -617013 sc-eQTL 2.44e-01 0.185 0.158 0.06 B_Naive LOneK1K
ENSG00000027697 IFNGR1 31771 sc-eQTL 2.11e-01 0.128 0.102 0.06 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000029363 BCLAF1 961369 sc-eQTL 1.66e-01 -0.132 0.0947 0.06 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000112357 PEX7 428656 sc-eQTL 5.45e-02 0.352 0.182 0.06 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000118503 TNFAIP3 -615994 sc-eQTL 6.22e-01 0.0466 0.0945 0.06 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000135525 MAP7 700401 sc-eQTL 9.66e-01 -0.00697 0.164 0.06 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000197442 MAP3K5 458743 sc-eQTL 4.46e-01 0.0846 0.111 0.06 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000237499 WAKMAR2 -617013 sc-eQTL 3.93e-01 -0.0968 0.113 0.06 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000286646 AL121933.2 467175 sc-eQTL 1.73e-01 0.18 0.131 0.06 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000027697 IFNGR1 31771 sc-eQTL 5.83e-01 0.0673 0.122 0.06 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000029363 BCLAF1 961369 sc-eQTL 9.02e-01 -0.0136 0.111 0.06 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000112357 PEX7 428656 sc-eQTL 5.39e-01 0.114 0.185 0.06 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000118503 TNFAIP3 -615994 sc-eQTL 8.87e-01 0.0163 0.114 0.06 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000135525 MAP7 700401 sc-eQTL 4.70e-01 -0.129 0.178 0.06 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000197442 MAP3K5 458743 sc-eQTL 5.25e-01 -0.0932 0.147 0.06 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000237499 WAKMAR2 -617013 sc-eQTL 6.36e-01 0.0726 0.153 0.06 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000286646 AL121933.2 467175 sc-eQTL 7.23e-01 0.0617 0.174 0.06 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000027697 IFNGR1 31771 sc-eQTL 1.85e-01 0.156 0.117 0.058 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000029363 BCLAF1 961369 sc-eQTL 8.71e-01 -0.0111 0.0681 0.058 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000112357 PEX7 428656 sc-eQTL 2.55e-01 -0.225 0.197 0.058 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000112378 PERP -856199 sc-eQTL 3.05e-02 0.265 0.121 0.058 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000118503 TNFAIP3 -615994 sc-eQTL 5.75e-01 -0.0599 0.107 0.058 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000197442 MAP3K5 458743 sc-eQTL 4.81e-01 0.102 0.144 0.058 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000237499 WAKMAR2 -617013 sc-eQTL 1.06e-01 -0.242 0.149 0.058 NK_CD56dim LOneK1K

Statistical fine-mapping results from Japan COVID-19 Task Force
(Shown only for PIP>0.001)
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
PIP (SuSiE)
PIP (FINEMAP)
MAF
ENSG00000027697 IFNGR1 31771 eQTL 0.000245 0.101 0.0274 0.0 0.0 0.0662
ENSG00000182747 SLC35D3 328919 eQTL 0.0146 -0.155 0.0635 0.0 0.0 0.0662

Expression Modifier Score(EMS) for GTEx 49tissues
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Whole Blood
Muscle Skeletal
Liver
Brain Cerebellum
Prostate
Spleen
Skin Sun Exposed Lower leg
Artery Coronary
Esophagus Muscularis
Esophagus Gastroesophageal Junction
Artery Tibial
Heart Atrial Appendage
Nerve Tibial
Heart Left Ventricle
Adrenal Gland
Adipose Visceral Omentum
Pancreas
Lung
Pituitary
Brain Nucleus accumbens basal ganglia
Colon Transverse
Adipose Subcutaneous
Esophagus Mucosa
Brain Cortex
Thyroid
Stomach
Breast Mammary Tissue
Colon Sigmoid
Skin Not Sun Exposed Suprapubic
Testis
Artery Aorta
Brain Amygdala
Brain Anterior cingulate cortex BA24
Brain Caudate basal ganglia
Brain Cerebellar Hemisphere
Brain Frontal Cortex BA9
Brain Hippocampus
Brain Hypothalamus
Brain Putamen basal ganglia
Brain Spinal cord cervical c-1
Brain Substantia nigra
Cells Cultured fibroblasts
Cells EBV-transformed lymphocytes
Kidney Cortex
Minor Salivary Gland
Ovary
Small Intestine Terminal Ileum
Uterus
Vagina
ENSG00000027697 IFNGR1 31771 1.11e-05 1.23e-05 2.23e-06 6.13e-06 2.38e-06 5.2e-06 1.23e-05 2.03e-06 1.03e-05 5.58e-06 1.42e-05 6.14e-06 1.83e-05 3.97e-06 3.46e-06 6.79e-06 6.1e-06 9.38e-06 2.98e-06 2.8e-06 6.39e-06 1.09e-05 1.03e-05 3.4e-06 1.77e-05 4.43e-06 5.98e-06 4.84e-06 1.23e-05 1.18e-05 7.01e-06 1e-06 1.22e-06 3.37e-06 4.77e-06 2.87e-06 1.79e-06 2e-06 2.05e-06 9.85e-07 9.49e-07 1.43e-05 1.62e-06 1.95e-07 8.86e-07 1.75e-06 1.8e-06 7e-07 4.51e-07
ENSG00000182747 SLC35D3 328919 1.27e-06 8.34e-07 1.45e-07 4.39e-07 1.12e-07 3.39e-07 7.02e-07 2e-07 7.15e-07 3.12e-07 1.08e-06 5.22e-07 1.15e-06 1.76e-07 3.35e-07 3.68e-07 6.29e-07 4.4e-07 2.79e-07 1.87e-07 2.43e-07 5.76e-07 5.77e-07 2.65e-07 1.49e-06 2.53e-07 4.25e-07 3.62e-07 6.62e-07 8.56e-07 4.39e-07 6.84e-08 4.98e-08 1.71e-07 3.69e-07 1.94e-07 1.23e-07 1.07e-07 7.81e-08 2.68e-08 1.14e-07 9.49e-07 4.71e-08 5.93e-09 1.67e-07 1.37e-08 1.3e-07 2.38e-08 6.17e-08