logo

Genes within 1Mb (chr6:137246882:G:T):

View on , UCSC , GTEx , gnomAD

Immune cell-type specific single cell cis-eQTLs in OASIS
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000027697 IFNGR1 27433 sc-eQTL 3.61e-02 -0.178 0.0846 0.201 B L1
ENSG00000029363 BCLAF1 957031 sc-eQTL 6.45e-01 0.0176 0.038 0.201 B L1
ENSG00000112357 PEX7 424318 sc-eQTL 3.29e-01 0.0987 0.101 0.201 B L1
ENSG00000112378 PERP -860537 sc-eQTL 9.07e-01 -0.00783 0.0669 0.201 B L1
ENSG00000118503 TNFAIP3 -620332 sc-eQTL 7.03e-01 -0.0206 0.0539 0.201 B L1
ENSG00000197442 MAP3K5 454405 sc-eQTL 2.90e-01 -0.0795 0.075 0.201 B L1
ENSG00000237499 WAKMAR2 -621351 sc-eQTL 8.57e-01 -0.0153 0.0848 0.201 B L1
ENSG00000027697 IFNGR1 27433 sc-eQTL 6.94e-01 -0.0227 0.0575 0.201 CD4T L1
ENSG00000029363 BCLAF1 957031 sc-eQTL 3.73e-01 -0.0388 0.0435 0.201 CD4T L1
ENSG00000112357 PEX7 424318 sc-eQTL 1.41e-01 -0.136 0.0922 0.201 CD4T L1
ENSG00000112378 PERP -860537 sc-eQTL 2.64e-01 -0.0694 0.062 0.201 CD4T L1
ENSG00000118503 TNFAIP3 -620332 sc-eQTL 4.42e-01 -0.0449 0.0582 0.201 CD4T L1
ENSG00000197442 MAP3K5 454405 sc-eQTL 4.92e-01 -0.0306 0.0444 0.201 CD4T L1
ENSG00000237499 WAKMAR2 -621351 sc-eQTL 6.29e-02 -0.136 0.0728 0.201 CD4T L1
ENSG00000027697 IFNGR1 27433 sc-eQTL 3.65e-01 -0.0587 0.0647 0.201 CD8T L1
ENSG00000029363 BCLAF1 957031 sc-eQTL 5.43e-01 0.0267 0.0438 0.201 CD8T L1
ENSG00000112357 PEX7 424318 sc-eQTL 4.31e-01 -0.0852 0.108 0.201 CD8T L1
ENSG00000112378 PERP -860537 sc-eQTL 9.85e-01 0.0013 0.0706 0.201 CD8T L1
ENSG00000118503 TNFAIP3 -620332 sc-eQTL 5.96e-01 0.0289 0.0545 0.201 CD8T L1
ENSG00000197442 MAP3K5 454405 sc-eQTL 7.24e-01 -0.0204 0.0576 0.201 CD8T L1
ENSG00000237499 WAKMAR2 -621351 sc-eQTL 2.38e-01 -0.0945 0.0798 0.201 CD8T L1
ENSG00000027697 IFNGR1 27433 sc-eQTL 2.16e-01 -0.0941 0.0758 0.205 DC L1
ENSG00000029363 BCLAF1 957031 sc-eQTL 4.91e-01 -0.0472 0.0684 0.205 DC L1
ENSG00000112357 PEX7 424318 sc-eQTL 4.57e-01 0.0797 0.107 0.205 DC L1
ENSG00000118503 TNFAIP3 -620332 sc-eQTL 4.97e-01 0.0553 0.0813 0.205 DC L1
ENSG00000135525 MAP7 696063 sc-eQTL 3.76e-01 -0.078 0.0879 0.205 DC L1
ENSG00000197442 MAP3K5 454405 sc-eQTL 3.67e-01 -0.0761 0.0843 0.205 DC L1
ENSG00000237499 WAKMAR2 -621351 sc-eQTL 6.87e-01 0.0334 0.0829 0.205 DC L1
ENSG00000286646 AL121933.2 462837 sc-eQTL 8.63e-01 0.019 0.11 0.205 DC L1
ENSG00000027697 IFNGR1 27433 sc-eQTL 7.56e-01 -0.0206 0.0662 0.201 Mono L1
ENSG00000029363 BCLAF1 957031 sc-eQTL 8.25e-01 0.0125 0.0566 0.201 Mono L1
ENSG00000112357 PEX7 424318 sc-eQTL 6.67e-02 -0.204 0.111 0.201 Mono L1
ENSG00000118503 TNFAIP3 -620332 sc-eQTL 2.71e-01 0.0618 0.056 0.201 Mono L1
ENSG00000135525 MAP7 696063 sc-eQTL 5.26e-01 -0.0624 0.0982 0.201 Mono L1
ENSG00000197442 MAP3K5 454405 sc-eQTL 6.35e-01 0.0312 0.0655 0.201 Mono L1
ENSG00000237499 WAKMAR2 -621351 sc-eQTL 2.46e-01 0.0807 0.0694 0.201 Mono L1
ENSG00000286646 AL121933.2 462837 sc-eQTL 7.00e-01 0.0306 0.0794 0.201 Mono L1
ENSG00000027697 IFNGR1 27433 sc-eQTL 8.87e-02 -0.124 0.0722 0.202 NK L1
ENSG00000029363 BCLAF1 957031 sc-eQTL 8.95e-01 0.00511 0.0386 0.202 NK L1
ENSG00000112357 PEX7 424318 sc-eQTL 8.41e-01 -0.0225 0.112 0.202 NK L1
ENSG00000112378 PERP -860537 sc-eQTL 1.29e-01 -0.107 0.0703 0.202 NK L1
ENSG00000118503 TNFAIP3 -620332 sc-eQTL 5.79e-01 -0.0336 0.0605 0.202 NK L1
ENSG00000197442 MAP3K5 454405 sc-eQTL 6.32e-01 -0.0416 0.0867 0.202 NK L1
ENSG00000237499 WAKMAR2 -621351 sc-eQTL 7.92e-01 -0.0226 0.0858 0.202 NK L1
ENSG00000027697 IFNGR1 27433 sc-eQTL 6.24e-04 -0.227 0.0652 0.201 Other_T L1
ENSG00000029363 BCLAF1 957031 sc-eQTL 1.16e-01 -0.0882 0.0559 0.201 Other_T L1
ENSG00000112357 PEX7 424318 sc-eQTL 6.07e-01 -0.0563 0.109 0.201 Other_T L1
ENSG00000112378 PERP -860537 sc-eQTL 7.90e-01 0.0234 0.0878 0.201 Other_T L1
ENSG00000118503 TNFAIP3 -620332 sc-eQTL 3.32e-01 0.0405 0.0417 0.201 Other_T L1
ENSG00000146410 MTFR2 996547 sc-eQTL 5.39e-01 -0.0389 0.0632 0.201 Other_T L1
ENSG00000197442 MAP3K5 454405 sc-eQTL 8.64e-01 -0.0138 0.0806 0.201 Other_T L1
ENSG00000237499 WAKMAR2 -621351 sc-eQTL 1.66e-01 -0.115 0.0825 0.201 Other_T L1
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000027697 IFNGR1 27433 sc-eQTL 1.73e-01 -0.151 0.111 0.191 B_Activated L2
ENSG00000029363 BCLAF1 957031 sc-eQTL 6.76e-01 0.0378 0.0903 0.191 B_Activated L2
ENSG00000112357 PEX7 424318 sc-eQTL 6.66e-01 -0.0473 0.109 0.191 B_Activated L2
ENSG00000112378 PERP -860537 sc-eQTL 7.25e-01 0.02 0.0567 0.191 B_Activated L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 -620332 sc-eQTL 6.80e-01 0.0454 0.11 0.191 B_Activated L2
ENSG00000197442 MAP3K5 454405 sc-eQTL 9.11e-01 -0.0137 0.123 0.191 B_Activated L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 -621351 sc-eQTL 7.72e-01 -0.0279 0.096 0.191 B_Activated L2
ENSG00000027697 IFNGR1 27433 sc-eQTL 1.25e-01 -0.153 0.0991 0.202 B_Intermediate L2
ENSG00000029363 BCLAF1 957031 sc-eQTL 3.26e-01 -0.0557 0.0566 0.202 B_Intermediate L2
ENSG00000112357 PEX7 424318 sc-eQTL 2.24e-01 0.127 0.104 0.202 B_Intermediate L2
ENSG00000112378 PERP -860537 sc-eQTL 7.77e-01 -0.0269 0.0951 0.202 B_Intermediate L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 -620332 sc-eQTL 7.27e-01 -0.0261 0.0746 0.202 B_Intermediate L2
ENSG00000197442 MAP3K5 454405 sc-eQTL 7.50e-01 0.0287 0.0902 0.202 B_Intermediate L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 -621351 sc-eQTL 6.08e-01 -0.0543 0.106 0.202 B_Intermediate L2
ENSG00000027697 IFNGR1 27433 sc-eQTL 1.30e-01 -0.164 0.108 0.2 B_Memory L2
ENSG00000029363 BCLAF1 957031 sc-eQTL 5.29e-01 -0.0405 0.0643 0.2 B_Memory L2
ENSG00000112357 PEX7 424318 sc-eQTL 9.06e-01 -0.0129 0.109 0.2 B_Memory L2
ENSG00000112378 PERP -860537 sc-eQTL 1.47e-01 0.149 0.102 0.2 B_Memory L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 -620332 sc-eQTL 5.27e-01 0.0448 0.0708 0.2 B_Memory L2
ENSG00000197442 MAP3K5 454405 sc-eQTL 2.52e-01 -0.111 0.0964 0.2 B_Memory L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 -621351 sc-eQTL 6.08e-01 0.0542 0.105 0.2 B_Memory L2
ENSG00000027697 IFNGR1 27433 sc-eQTL 3.33e-01 -0.082 0.0845 0.201 B_Naive1 L2
ENSG00000029363 BCLAF1 957031 sc-eQTL 7.36e-01 0.0163 0.0484 0.201 B_Naive1 L2
ENSG00000112357 PEX7 424318 sc-eQTL 6.93e-01 -0.0441 0.112 0.201 B_Naive1 L2
ENSG00000112378 PERP -860537 sc-eQTL 1.22e-01 -0.151 0.0972 0.201 B_Naive1 L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 -620332 sc-eQTL 9.92e-01 -0.00058 0.0567 0.201 B_Naive1 L2
ENSG00000197442 MAP3K5 454405 sc-eQTL 9.60e-01 0.00399 0.0797 0.201 B_Naive1 L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 -621351 sc-eQTL 7.41e-01 0.0294 0.0888 0.201 B_Naive1 L2
ENSG00000027697 IFNGR1 27433 sc-eQTL 3.10e-01 -0.105 0.103 0.202 B_Naive2 L2
ENSG00000029363 BCLAF1 957031 sc-eQTL 2.23e-02 0.136 0.0593 0.202 B_Naive2 L2
ENSG00000112357 PEX7 424318 sc-eQTL 8.04e-02 0.198 0.112 0.202 B_Naive2 L2
ENSG00000112378 PERP -860537 sc-eQTL 6.11e-01 -0.042 0.0825 0.202 B_Naive2 L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 -620332 sc-eQTL 3.41e-01 -0.0786 0.0823 0.202 B_Naive2 L2
ENSG00000197442 MAP3K5 454405 sc-eQTL 2.88e-01 -0.0932 0.0876 0.202 B_Naive2 L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 -621351 sc-eQTL 4.63e-01 -0.0783 0.107 0.202 B_Naive2 L2
ENSG00000027697 IFNGR1 27433 sc-eQTL 9.84e-02 -0.161 0.0969 0.2 CD4_CTL L2
ENSG00000029363 BCLAF1 957031 sc-eQTL 3.78e-01 -0.0762 0.0864 0.2 CD4_CTL L2
ENSG00000112357 PEX7 424318 sc-eQTL 5.10e-01 -0.0713 0.108 0.2 CD4_CTL L2
ENSG00000112378 PERP -860537 sc-eQTL 6.48e-01 -0.0502 0.11 0.2 CD4_CTL L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 -620332 sc-eQTL 6.48e-01 -0.0292 0.0639 0.2 CD4_CTL L2
ENSG00000197442 MAP3K5 454405 sc-eQTL 8.50e-01 -0.0194 0.102 0.2 CD4_CTL L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 -621351 sc-eQTL 1.30e-01 -0.15 0.0989 0.2 CD4_CTL L2
ENSG00000027697 IFNGR1 27433 sc-eQTL 5.94e-01 0.029 0.0543 0.201 CD4_Naive L2
ENSG00000029363 BCLAF1 957031 sc-eQTL 4.25e-01 -0.0348 0.0436 0.201 CD4_Naive L2
ENSG00000112357 PEX7 424318 sc-eQTL 5.47e-01 -0.0618 0.103 0.201 CD4_Naive L2
ENSG00000112378 PERP -860537 sc-eQTL 1.06e-01 -0.137 0.0842 0.201 CD4_Naive L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 -620332 sc-eQTL 5.23e-01 -0.038 0.0594 0.201 CD4_Naive L2
ENSG00000197442 MAP3K5 454405 sc-eQTL 6.19e-01 -0.0217 0.0436 0.201 CD4_Naive L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 -621351 sc-eQTL 2.96e-02 -0.167 0.0761 0.201 CD4_Naive L2
ENSG00000027697 IFNGR1 27433 sc-eQTL 7.78e-01 -0.0209 0.074 0.201 CD4_TCM L2
ENSG00000029363 BCLAF1 957031 sc-eQTL 6.20e-02 -0.0869 0.0463 0.201 CD4_TCM L2
ENSG00000112357 PEX7 424318 sc-eQTL 1.77e-01 -0.147 0.108 0.201 CD4_TCM L2
ENSG00000112378 PERP -860537 sc-eQTL 6.63e-01 -0.0401 0.0918 0.201 CD4_TCM L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 -620332 sc-eQTL 3.81e-01 -0.0468 0.0532 0.201 CD4_TCM L2
ENSG00000197442 MAP3K5 454405 sc-eQTL 7.83e-01 -0.0167 0.0607 0.201 CD4_TCM L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 -621351 sc-eQTL 1.64e-01 -0.104 0.0744 0.201 CD4_TCM L2
ENSG00000027697 IFNGR1 27433 sc-eQTL 9.02e-01 -0.0105 0.0852 0.201 CD4_TEM L2
ENSG00000029363 BCLAF1 957031 sc-eQTL 8.44e-01 -0.0119 0.0604 0.201 CD4_TEM L2
ENSG00000112357 PEX7 424318 sc-eQTL 1.28e-01 0.167 0.109 0.201 CD4_TEM L2
ENSG00000112378 PERP -860537 sc-eQTL 8.84e-01 -0.013 0.0891 0.201 CD4_TEM L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 -620332 sc-eQTL 7.72e-01 -0.0164 0.0566 0.201 CD4_TEM L2
ENSG00000197442 MAP3K5 454405 sc-eQTL 1.49e-01 -0.126 0.087 0.201 CD4_TEM L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 -621351 sc-eQTL 6.12e-01 -0.0461 0.0907 0.201 CD4_TEM L2
ENSG00000027697 IFNGR1 27433 sc-eQTL 6.20e-01 0.0387 0.078 0.201 CD8_CTL L2
ENSG00000029363 BCLAF1 957031 sc-eQTL 9.31e-01 -0.0045 0.052 0.201 CD8_CTL L2
ENSG00000112357 PEX7 424318 sc-eQTL 9.23e-01 0.0104 0.107 0.201 CD8_CTL L2
ENSG00000112378 PERP -860537 sc-eQTL 8.98e-01 0.0133 0.103 0.201 CD8_CTL L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 -620332 sc-eQTL 6.34e-01 0.0313 0.0656 0.201 CD8_CTL L2
ENSG00000197442 MAP3K5 454405 sc-eQTL 6.63e-01 -0.0405 0.0926 0.201 CD8_CTL L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 -621351 sc-eQTL 5.17e-01 0.0598 0.0922 0.201 CD8_CTL L2
ENSG00000027697 IFNGR1 27433 sc-eQTL 6.08e-01 -0.0392 0.0763 0.201 CD8_Naive L2
ENSG00000029363 BCLAF1 957031 sc-eQTL 5.37e-01 0.0329 0.0533 0.201 CD8_Naive L2
ENSG00000112357 PEX7 424318 sc-eQTL 5.28e-01 -0.07 0.111 0.201 CD8_Naive L2
ENSG00000112378 PERP -860537 sc-eQTL 3.35e-01 -0.0812 0.084 0.201 CD8_Naive L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 -620332 sc-eQTL 5.56e-01 -0.0352 0.0597 0.201 CD8_Naive L2
ENSG00000197442 MAP3K5 454405 sc-eQTL 7.12e-01 -0.0262 0.0708 0.201 CD8_Naive L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 -621351 sc-eQTL 1.22e-01 -0.136 0.0878 0.201 CD8_Naive L2
ENSG00000027697 IFNGR1 27433 sc-eQTL 6.47e-01 -0.0477 0.104 0.197 CD8_TCM L2
ENSG00000029363 BCLAF1 957031 sc-eQTL 9.38e-01 0.00612 0.0782 0.197 CD8_TCM L2
ENSG00000112357 PEX7 424318 sc-eQTL 8.94e-01 -0.0159 0.12 0.197 CD8_TCM L2
ENSG00000112378 PERP -860537 sc-eQTL 9.86e-01 0.0021 0.117 0.197 CD8_TCM L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 -620332 sc-eQTL 2.98e-01 0.0588 0.0563 0.197 CD8_TCM L2
ENSG00000197442 MAP3K5 454405 sc-eQTL 9.53e-01 0.00598 0.101 0.197 CD8_TCM L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 -621351 sc-eQTL 4.93e-01 -0.071 0.103 0.197 CD8_TCM L2
ENSG00000027697 IFNGR1 27433 sc-eQTL 5.93e-02 -0.185 0.0975 0.196 CD8_TEM L2
ENSG00000029363 BCLAF1 957031 sc-eQTL 7.15e-01 -0.0339 0.0929 0.196 CD8_TEM L2
ENSG00000112357 PEX7 424318 sc-eQTL 8.98e-01 -0.0145 0.113 0.196 CD8_TEM L2
ENSG00000112378 PERP -860537 sc-eQTL 1.45e-01 -0.172 0.117 0.196 CD8_TEM L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 -620332 sc-eQTL 1.63e-01 0.101 0.0722 0.196 CD8_TEM L2
ENSG00000197442 MAP3K5 454405 sc-eQTL 5.87e-01 -0.0611 0.112 0.196 CD8_TEM L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 -621351 sc-eQTL 4.28e-01 0.0854 0.108 0.196 CD8_TEM L2
ENSG00000027697 IFNGR1 27433 sc-eQTL 1.54e-06 -0.37 0.0748 0.201 MAIT L2
ENSG00000029363 BCLAF1 957031 sc-eQTL 2.47e-01 -0.0761 0.0655 0.201 MAIT L2
ENSG00000112357 PEX7 424318 sc-eQTL 5.90e-01 0.0579 0.107 0.201 MAIT L2
ENSG00000112378 PERP -860537 sc-eQTL 9.71e-01 0.00414 0.112 0.201 MAIT L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 -620332 sc-eQTL 6.54e-01 0.0239 0.0532 0.201 MAIT L2
ENSG00000146410 MTFR2 996547 sc-eQTL 3.36e-01 0.0853 0.0884 0.201 MAIT L2
ENSG00000197442 MAP3K5 454405 sc-eQTL 7.52e-01 0.0294 0.0926 0.201 MAIT L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 -621351 sc-eQTL 2.16e-01 -0.122 0.098 0.201 MAIT L2
ENSG00000027697 IFNGR1 27433 sc-eQTL 1.28e-01 -0.131 0.0858 0.198 NK_CD56bright L2
ENSG00000029363 BCLAF1 957031 sc-eQTL 7.39e-01 0.0212 0.0637 0.198 NK_CD56bright L2
ENSG00000112357 PEX7 424318 sc-eQTL 1.86e-01 -0.149 0.112 0.198 NK_CD56bright L2
ENSG00000112378 PERP -860537 sc-eQTL 3.48e-01 -0.0946 0.101 0.198 NK_CD56bright L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 -620332 sc-eQTL 8.70e-01 0.0105 0.0643 0.198 NK_CD56bright L2
ENSG00000197442 MAP3K5 454405 sc-eQTL 1.67e-01 -0.135 0.0973 0.198 NK_CD56bright L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 -621351 sc-eQTL 9.96e-02 -0.168 0.102 0.198 NK_CD56bright L2
ENSG00000027697 IFNGR1 27433 sc-eQTL 3.35e-01 -0.0653 0.0676 0.203 NK_CD56dim L2
ENSG00000029363 BCLAF1 957031 sc-eQTL 4.36e-01 0.0345 0.0442 0.203 NK_CD56dim L2
ENSG00000112357 PEX7 424318 sc-eQTL 3.11e-01 -0.118 0.116 0.203 NK_CD56dim L2
ENSG00000112378 PERP -860537 sc-eQTL 5.44e-01 -0.0498 0.0819 0.203 NK_CD56dim L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 -620332 sc-eQTL 7.15e-01 -0.0233 0.0637 0.203 NK_CD56dim L2
ENSG00000197442 MAP3K5 454405 sc-eQTL 9.99e-01 0.000126 0.0918 0.203 NK_CD56dim L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 -621351 sc-eQTL 5.90e-01 -0.0516 0.0955 0.203 NK_CD56dim L2
ENSG00000027697 IFNGR1 27433 sc-eQTL 5.74e-02 -0.162 0.0846 0.21 NK_HLA L2
ENSG00000029363 BCLAF1 957031 sc-eQTL 7.53e-01 -0.0228 0.0723 0.21 NK_HLA L2
ENSG00000112357 PEX7 424318 sc-eQTL 1.49e-01 0.156 0.108 0.21 NK_HLA L2
ENSG00000112378 PERP -860537 sc-eQTL 9.88e-01 0.00133 0.088 0.21 NK_HLA L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 -620332 sc-eQTL 3.11e-01 -0.0685 0.0675 0.21 NK_HLA L2
ENSG00000197442 MAP3K5 454405 sc-eQTL 6.30e-01 -0.0519 0.107 0.21 NK_HLA L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 -621351 sc-eQTL 7.66e-01 0.0325 0.109 0.21 NK_HLA L2
ENSG00000027697 IFNGR1 27433 sc-eQTL 1.92e-01 -0.0929 0.071 0.203 NK_cytokine L2
ENSG00000029363 BCLAF1 957031 sc-eQTL 1.36e-01 -0.0792 0.0529 0.203 NK_cytokine L2
ENSG00000112357 PEX7 424318 sc-eQTL 8.02e-02 0.195 0.111 0.203 NK_cytokine L2
ENSG00000112378 PERP -860537 sc-eQTL 8.70e-01 0.0139 0.0849 0.203 NK_cytokine L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 -620332 sc-eQTL 8.89e-01 -0.00892 0.0636 0.203 NK_cytokine L2
ENSG00000197442 MAP3K5 454405 sc-eQTL 5.28e-01 -0.0553 0.0874 0.203 NK_cytokine L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 -621351 sc-eQTL 9.85e-01 0.00184 0.0959 0.203 NK_cytokine L2
ENSG00000027697 IFNGR1 27433 sc-eQTL 2.15e-01 0.164 0.132 0.174 PB L2
ENSG00000029363 BCLAF1 957031 sc-eQTL 9.08e-01 -0.0133 0.114 0.174 PB L2
ENSG00000112357 PEX7 424318 sc-eQTL 8.08e-01 0.0331 0.136 0.174 PB L2
ENSG00000112378 PERP -860537 sc-eQTL 1.52e-01 -0.121 0.0842 0.174 PB L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 -620332 sc-eQTL 9.47e-01 -0.00693 0.103 0.174 PB L2
ENSG00000197442 MAP3K5 454405 sc-eQTL 1.59e-01 -0.165 0.116 0.174 PB L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 -621351 sc-eQTL 5.44e-01 -0.0752 0.124 0.174 PB L2
ENSG00000027697 IFNGR1 27433 sc-eQTL 7.05e-01 -0.0329 0.0867 0.2 Pro_T L2
ENSG00000029363 BCLAF1 957031 sc-eQTL 6.67e-01 -0.0388 0.0899 0.2 Pro_T L2
ENSG00000112357 PEX7 424318 sc-eQTL 5.48e-01 -0.0634 0.105 0.2 Pro_T L2
ENSG00000112378 PERP -860537 sc-eQTL 3.86e-01 -0.0727 0.0836 0.2 Pro_T L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 -620332 sc-eQTL 4.04e-01 0.0442 0.0528 0.2 Pro_T L2
ENSG00000146410 MTFR2 996547 sc-eQTL 5.81e-01 -0.0405 0.0732 0.2 Pro_T L2
ENSG00000197442 MAP3K5 454405 sc-eQTL 3.18e-01 0.102 0.102 0.2 Pro_T L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 -621351 sc-eQTL 3.16e-01 -0.103 0.102 0.2 Pro_T L2
ENSG00000027697 IFNGR1 27433 sc-eQTL 8.34e-01 -0.021 0.1 0.201 Treg L2
ENSG00000029363 BCLAF1 957031 sc-eQTL 3.59e-01 -0.0593 0.0645 0.201 Treg L2
ENSG00000112357 PEX7 424318 sc-eQTL 1.80e-01 -0.142 0.105 0.201 Treg L2
ENSG00000112378 PERP -860537 sc-eQTL 7.48e-01 -0.0368 0.114 0.201 Treg L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 -620332 sc-eQTL 2.88e-01 0.0676 0.0635 0.201 Treg L2
ENSG00000197442 MAP3K5 454405 sc-eQTL 6.58e-01 0.0306 0.069 0.201 Treg L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 -621351 sc-eQTL 1.68e-01 0.134 0.0967 0.201 Treg L2
ENSG00000027697 IFNGR1 27433 sc-eQTL 3.94e-01 -0.0714 0.0836 0.207 cDC L2
ENSG00000029363 BCLAF1 957031 sc-eQTL 1.85e-01 -0.112 0.084 0.207 cDC L2
ENSG00000112357 PEX7 424318 sc-eQTL 3.43e-01 0.103 0.108 0.207 cDC L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 -620332 sc-eQTL 6.94e-01 -0.0325 0.0825 0.207 cDC L2
ENSG00000135525 MAP7 696063 sc-eQTL 4.21e-01 -0.0777 0.0964 0.207 cDC L2
ENSG00000197442 MAP3K5 454405 sc-eQTL 4.32e-01 -0.0668 0.0848 0.207 cDC L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 -621351 sc-eQTL 8.29e-01 -0.0232 0.108 0.207 cDC L2
ENSG00000286646 AL121933.2 462837 sc-eQTL 4.96e-01 0.0753 0.11 0.207 cDC L2
ENSG00000027697 IFNGR1 27433 sc-eQTL 6.08e-01 0.0315 0.0612 0.201 cMono_IL1B L2
ENSG00000029363 BCLAF1 957031 sc-eQTL 5.12e-01 0.0431 0.0656 0.201 cMono_IL1B L2
ENSG00000112357 PEX7 424318 sc-eQTL 6.34e-02 -0.204 0.109 0.201 cMono_IL1B L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 -620332 sc-eQTL 4.74e-02 0.13 0.0653 0.201 cMono_IL1B L2
ENSG00000135525 MAP7 696063 sc-eQTL 3.81e-01 -0.0832 0.0946 0.201 cMono_IL1B L2
ENSG00000197442 MAP3K5 454405 sc-eQTL 4.58e-01 -0.0509 0.0684 0.201 cMono_IL1B L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 -621351 sc-eQTL 1.79e-01 0.0944 0.07 0.201 cMono_IL1B L2
ENSG00000286646 AL121933.2 462837 sc-eQTL 9.00e-01 -0.0111 0.0881 0.201 cMono_IL1B L2
ENSG00000027697 IFNGR1 27433 sc-eQTL 4.46e-01 -0.0544 0.0712 0.201 cMono_S100A L2
ENSG00000029363 BCLAF1 957031 sc-eQTL 7.90e-01 -0.0195 0.0732 0.201 cMono_S100A L2
ENSG00000112357 PEX7 424318 sc-eQTL 2.58e-01 -0.129 0.114 0.201 cMono_S100A L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 -620332 sc-eQTL 2.99e-01 0.0659 0.0632 0.201 cMono_S100A L2
ENSG00000135525 MAP7 696063 sc-eQTL 2.46e-02 -0.239 0.105 0.201 cMono_S100A L2
ENSG00000197442 MAP3K5 454405 sc-eQTL 1.02e-01 0.141 0.0856 0.201 cMono_S100A L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 -621351 sc-eQTL 6.66e-01 -0.0393 0.0909 0.201 cMono_S100A L2
ENSG00000286646 AL121933.2 462837 sc-eQTL 5.02e-01 0.0596 0.0887 0.201 cMono_S100A L2
ENSG00000027697 IFNGR1 27433 sc-eQTL 5.28e-01 -0.0655 0.103 0.215 gdT L2
ENSG00000029363 BCLAF1 957031 sc-eQTL 2.28e-01 -0.11 0.0908 0.215 gdT L2
ENSG00000112357 PEX7 424318 sc-eQTL 4.85e-01 -0.0917 0.131 0.215 gdT L2
ENSG00000112378 PERP -860537 sc-eQTL 6.37e-02 0.212 0.113 0.215 gdT L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 -620332 sc-eQTL 1.94e-01 0.0826 0.0634 0.215 gdT L2
ENSG00000146410 MTFR2 996547 sc-eQTL 4.79e-01 -0.0712 0.1 0.215 gdT L2
ENSG00000197442 MAP3K5 454405 sc-eQTL 7.00e-02 0.243 0.133 0.215 gdT L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 -621351 sc-eQTL 3.94e-01 -0.0984 0.115 0.215 gdT L2
ENSG00000027697 IFNGR1 27433 sc-eQTL 5.60e-01 0.0444 0.076 0.2 intMono L2
ENSG00000029363 BCLAF1 957031 sc-eQTL 1.45e-01 -0.146 0.1 0.2 intMono L2
ENSG00000112357 PEX7 424318 sc-eQTL 1.44e-01 -0.15 0.102 0.2 intMono L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 -620332 sc-eQTL 2.16e-01 0.0813 0.0655 0.2 intMono L2
ENSG00000135525 MAP7 696063 sc-eQTL 6.93e-01 0.0399 0.101 0.2 intMono L2
ENSG00000197442 MAP3K5 454405 sc-eQTL 1.90e-01 -0.14 0.106 0.2 intMono L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 -621351 sc-eQTL 8.61e-01 -0.0172 0.0979 0.2 intMono L2
ENSG00000286646 AL121933.2 462837 sc-eQTL 4.35e-01 -0.0882 0.113 0.2 intMono L2
ENSG00000027697 IFNGR1 27433 sc-eQTL 6.60e-01 -0.039 0.0886 0.197 ncMono L2
ENSG00000029363 BCLAF1 957031 sc-eQTL 9.65e-01 -0.00303 0.0689 0.197 ncMono L2
ENSG00000112357 PEX7 424318 sc-eQTL 4.76e-01 -0.0783 0.11 0.197 ncMono L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 -620332 sc-eQTL 6.50e-02 0.144 0.0778 0.197 ncMono L2
ENSG00000135525 MAP7 696063 sc-eQTL 8.21e-01 0.0219 0.097 0.197 ncMono L2
ENSG00000197442 MAP3K5 454405 sc-eQTL 1.16e-01 0.16 0.101 0.197 ncMono L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 -621351 sc-eQTL 4.43e-01 0.0753 0.098 0.197 ncMono L2
ENSG00000286646 AL121933.2 462837 sc-eQTL 6.55e-01 -0.0463 0.103 0.197 ncMono L2
ENSG00000027697 IFNGR1 27433 sc-eQTL 4.60e-01 -0.0706 0.0954 0.218 pDC L2
ENSG00000029363 BCLAF1 957031 sc-eQTL 6.15e-01 0.0361 0.0716 0.218 pDC L2
ENSG00000112357 PEX7 424318 sc-eQTL 9.34e-01 -0.00872 0.105 0.218 pDC L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 -620332 sc-eQTL 4.47e-02 0.177 0.0874 0.218 pDC L2
ENSG00000135525 MAP7 696063 sc-eQTL 9.78e-01 -0.00206 0.0734 0.218 pDC L2
ENSG00000197442 MAP3K5 454405 sc-eQTL 8.32e-01 0.025 0.118 0.218 pDC L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 -621351 sc-eQTL 5.89e-01 -0.0486 0.0898 0.218 pDC L2
ENSG00000286646 AL121933.2 462837 sc-eQTL 5.79e-01 0.0601 0.108 0.218 pDC L2
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000027697 IFNGR1 27433 sc-eQTL 9.39e-03 -0.228 0.087 0.201 B_Memory LOneK1K
ENSG00000029363 BCLAF1 957031 sc-eQTL 2.47e-01 -0.0575 0.0495 0.201 B_Memory LOneK1K
ENSG00000112357 PEX7 424318 sc-eQTL 7.52e-01 0.0322 0.102 0.201 B_Memory LOneK1K
ENSG00000112378 PERP -860537 sc-eQTL 2.27e-01 0.114 0.0942 0.201 B_Memory LOneK1K
ENSG00000118503 TNFAIP3 -620332 sc-eQTL 5.91e-01 -0.0336 0.0624 0.201 B_Memory LOneK1K
ENSG00000197442 MAP3K5 454405 sc-eQTL 9.69e-01 0.00319 0.0826 0.201 B_Memory LOneK1K
ENSG00000237499 WAKMAR2 -621351 sc-eQTL 9.31e-01 -0.00913 0.106 0.201 B_Memory LOneK1K
ENSG00000027697 IFNGR1 27433 sc-eQTL 1.51e-01 -0.128 0.089 0.201 B_Naive LOneK1K
ENSG00000029363 BCLAF1 957031 sc-eQTL 1.77e-01 0.0554 0.0409 0.201 B_Naive LOneK1K
ENSG00000112357 PEX7 424318 sc-eQTL 4.53e-01 0.0817 0.109 0.201 B_Naive LOneK1K
ENSG00000112378 PERP -860537 sc-eQTL 1.25e-01 -0.149 0.0969 0.201 B_Naive LOneK1K
ENSG00000118503 TNFAIP3 -620332 sc-eQTL 6.32e-01 -0.0245 0.0512 0.201 B_Naive LOneK1K
ENSG00000197442 MAP3K5 454405 sc-eQTL 2.15e-01 -0.093 0.0748 0.201 B_Naive LOneK1K
ENSG00000237499 WAKMAR2 -621351 sc-eQTL 8.19e-01 -0.0209 0.0912 0.201 B_Naive LOneK1K
ENSG00000027697 IFNGR1 27433 sc-eQTL 8.10e-01 -0.0151 0.0628 0.201 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000029363 BCLAF1 957031 sc-eQTL 5.42e-01 0.0356 0.0584 0.201 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000112357 PEX7 424318 sc-eQTL 8.27e-02 -0.195 0.112 0.201 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000118503 TNFAIP3 -620332 sc-eQTL 1.77e-01 0.0784 0.0578 0.201 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000135525 MAP7 696063 sc-eQTL 1.05e-01 -0.163 0.1 0.201 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000197442 MAP3K5 454405 sc-eQTL 7.58e-01 0.021 0.068 0.201 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000237499 WAKMAR2 -621351 sc-eQTL 3.12e-01 0.0704 0.0694 0.201 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000286646 AL121933.2 462837 sc-eQTL 9.97e-01 -0.000259 0.081 0.201 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000027697 IFNGR1 27433 sc-eQTL 6.63e-01 -0.0318 0.0728 0.203 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000029363 BCLAF1 957031 sc-eQTL 5.09e-01 -0.0435 0.0658 0.203 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000112357 PEX7 424318 sc-eQTL 3.33e-01 -0.106 0.11 0.203 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000118503 TNFAIP3 -620332 sc-eQTL 1.30e-02 0.168 0.0671 0.203 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000135525 MAP7 696063 sc-eQTL 7.69e-01 0.0313 0.106 0.203 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000197442 MAP3K5 454405 sc-eQTL 5.88e-01 0.0473 0.0872 0.203 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000237499 WAKMAR2 -621351 sc-eQTL 9.31e-01 0.00789 0.0912 0.203 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000286646 AL121933.2 462837 sc-eQTL 2.42e-01 -0.121 0.103 0.203 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000027697 IFNGR1 27433 sc-eQTL 1.28e-01 -0.104 0.0683 0.203 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000029363 BCLAF1 957031 sc-eQTL 9.93e-01 -0.00036 0.0398 0.203 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000112357 PEX7 424318 sc-eQTL 6.37e-01 0.0547 0.116 0.203 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000112378 PERP -860537 sc-eQTL 3.09e-01 -0.0731 0.0717 0.203 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000118503 TNFAIP3 -620332 sc-eQTL 4.71e-01 -0.0452 0.0625 0.203 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000197442 MAP3K5 454405 sc-eQTL 6.16e-01 -0.0424 0.0845 0.203 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000237499 WAKMAR2 -621351 sc-eQTL 9.30e-01 -0.00773 0.0875 0.203 NK_CD56dim LOneK1K

Statistical fine-mapping results from Japan COVID-19 Task Force
(Shown only for PIP>0.001)
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
PIP (SuSiE)
PIP (FINEMAP)
MAF
ENSG00000027697 IFNGR1 27433 pQTL 0.0073 -0.0507 0.0189 0.0 0.0 0.21
ENSG00000027697 IFNGR1 27433 eQTL 2.15e-06 -0.0771 0.0162 0.0 0.0 0.203

Expression Modifier Score(EMS) for GTEx 49tissues
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Whole Blood
Muscle Skeletal
Liver
Brain Cerebellum
Prostate
Spleen
Skin Sun Exposed Lower leg
Artery Coronary
Esophagus Muscularis
Esophagus Gastroesophageal Junction
Artery Tibial
Heart Atrial Appendage
Nerve Tibial
Heart Left Ventricle
Adrenal Gland
Adipose Visceral Omentum
Pancreas
Lung
Pituitary
Brain Nucleus accumbens basal ganglia
Colon Transverse
Adipose Subcutaneous
Esophagus Mucosa
Brain Cortex
Thyroid
Stomach
Breast Mammary Tissue
Colon Sigmoid
Skin Not Sun Exposed Suprapubic
Testis
Artery Aorta
Brain Amygdala
Brain Anterior cingulate cortex BA24
Brain Caudate basal ganglia
Brain Cerebellar Hemisphere
Brain Frontal Cortex BA9
Brain Hippocampus
Brain Hypothalamus
Brain Putamen basal ganglia
Brain Spinal cord cervical c-1
Brain Substantia nigra
Cells Cultured fibroblasts
Cells EBV-transformed lymphocytes
Kidney Cortex
Minor Salivary Gland
Ovary
Small Intestine Terminal Ileum
Uterus
Vagina
ENSG00000027697 IFNGR1 27433 6.45e-05 3.73e-05 5.89e-06 1.49e-05 5.33e-06 1.74e-05 4.97e-05 3.78e-06 3.16e-05 1.25e-05 3.76e-05 1.55e-05 5.15e-05 1.36e-05 6.2e-06 1.75e-05 1.8e-05 2.61e-05 7.51e-06 5.62e-06 1.39e-05 3.46e-05 3.55e-05 8.4e-06 4.24e-05 7.55e-06 1.17e-05 1.08e-05 3.57e-05 2.67e-05 1.96e-05 1.65e-06 2.24e-06 5.67e-06 1.04e-05 4.54e-06 2.48e-06 2.82e-06 3.6e-06 2.79e-06 1.62e-06 4.56e-05 4.42e-06 2.5e-07 2.49e-06 2.97e-06 3.62e-06 1.34e-06 1.3e-06
ENSG00000237499 \N -621351 1.28e-06 9.07e-07 7.76e-08 6.94e-07 1.05e-07 4.12e-07 8.96e-07 1.31e-07 6.53e-07 2.43e-07 1.19e-06 4.94e-07 9.37e-07 2.1e-07 4.39e-07 2.83e-07 2.98e-07 4.95e-07 2.79e-07 2.37e-07 1.87e-07 6.27e-07 5.41e-07 1.94e-07 1.57e-06 2.4e-07 2.72e-07 2.63e-07 5.42e-07 7.42e-07 4.61e-07 6.92e-08 5.64e-08 1.69e-07 3.18e-07 5.23e-08 1.22e-07 8.21e-08 6.33e-08 6.31e-08 4.27e-08 7.38e-07 2.88e-08 1.06e-08 5.49e-08 4.38e-08 9.73e-08 0.0 4.83e-08