logo

Genes within 1Mb (chr6:137243937:C:G):

View on , UCSC , GTEx , gnomAD

Immune cell-type specific single cell cis-eQTLs in OASIS
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000027697 IFNGR1 24488 sc-eQTL 3.51e-02 -0.177 0.0833 0.203 B L1
ENSG00000029363 BCLAF1 954086 sc-eQTL 6.57e-01 0.0167 0.0375 0.203 B L1
ENSG00000112357 PEX7 421373 sc-eQTL 3.99e-01 0.0841 0.0995 0.203 B L1
ENSG00000112378 PERP -863482 sc-eQTL 9.14e-01 -0.00715 0.066 0.203 B L1
ENSG00000118503 TNFAIP3 -623277 sc-eQTL 7.85e-01 -0.0145 0.0531 0.203 B L1
ENSG00000197442 MAP3K5 451460 sc-eQTL 3.28e-01 -0.0725 0.0739 0.203 B L1
ENSG00000237499 WAKMAR2 -624296 sc-eQTL 8.32e-01 -0.0177 0.0836 0.203 B L1
ENSG00000027697 IFNGR1 24488 sc-eQTL 5.34e-01 -0.0352 0.0566 0.203 CD4T L1
ENSG00000029363 BCLAF1 954086 sc-eQTL 3.67e-01 -0.0386 0.0428 0.203 CD4T L1
ENSG00000112357 PEX7 421373 sc-eQTL 1.66e-01 -0.126 0.0908 0.203 CD4T L1
ENSG00000112378 PERP -863482 sc-eQTL 2.90e-01 -0.0648 0.061 0.203 CD4T L1
ENSG00000118503 TNFAIP3 -623277 sc-eQTL 5.75e-01 -0.0322 0.0573 0.203 CD4T L1
ENSG00000197442 MAP3K5 451460 sc-eQTL 4.92e-01 -0.03 0.0436 0.203 CD4T L1
ENSG00000237499 WAKMAR2 -624296 sc-eQTL 5.33e-02 -0.139 0.0716 0.203 CD4T L1
ENSG00000027697 IFNGR1 24488 sc-eQTL 3.59e-01 -0.0585 0.0637 0.203 CD8T L1
ENSG00000029363 BCLAF1 954086 sc-eQTL 5.87e-01 0.0235 0.0432 0.203 CD8T L1
ENSG00000112357 PEX7 421373 sc-eQTL 4.37e-01 -0.0828 0.106 0.203 CD8T L1
ENSG00000112378 PERP -863482 sc-eQTL 8.46e-01 0.0135 0.0696 0.203 CD8T L1
ENSG00000118503 TNFAIP3 -623277 sc-eQTL 4.38e-01 0.0416 0.0536 0.203 CD8T L1
ENSG00000197442 MAP3K5 451460 sc-eQTL 6.78e-01 -0.0236 0.0567 0.203 CD8T L1
ENSG00000237499 WAKMAR2 -624296 sc-eQTL 1.82e-01 -0.105 0.0786 0.203 CD8T L1
ENSG00000027697 IFNGR1 24488 sc-eQTL 1.74e-01 -0.102 0.0746 0.207 DC L1
ENSG00000029363 BCLAF1 954086 sc-eQTL 5.04e-01 -0.0451 0.0674 0.207 DC L1
ENSG00000112357 PEX7 421373 sc-eQTL 4.89e-01 0.073 0.105 0.207 DC L1
ENSG00000118503 TNFAIP3 -623277 sc-eQTL 6.50e-01 0.0363 0.0801 0.207 DC L1
ENSG00000135525 MAP7 693118 sc-eQTL 4.58e-01 -0.0644 0.0866 0.207 DC L1
ENSG00000197442 MAP3K5 451460 sc-eQTL 3.99e-01 -0.0701 0.083 0.207 DC L1
ENSG00000237499 WAKMAR2 -624296 sc-eQTL 7.92e-01 0.0215 0.0816 0.207 DC L1
ENSG00000286646 AL121933.2 459892 sc-eQTL 7.48e-01 0.0349 0.108 0.207 DC L1
ENSG00000027697 IFNGR1 24488 sc-eQTL 8.20e-01 -0.0148 0.0651 0.203 Mono L1
ENSG00000029363 BCLAF1 954086 sc-eQTL 7.63e-01 0.0168 0.0556 0.203 Mono L1
ENSG00000112357 PEX7 421373 sc-eQTL 5.35e-02 -0.211 0.109 0.203 Mono L1
ENSG00000118503 TNFAIP3 -623277 sc-eQTL 2.76e-01 0.0601 0.0551 0.203 Mono L1
ENSG00000135525 MAP7 693118 sc-eQTL 4.74e-01 -0.0692 0.0965 0.203 Mono L1
ENSG00000197442 MAP3K5 451460 sc-eQTL 6.13e-01 0.0327 0.0644 0.203 Mono L1
ENSG00000237499 WAKMAR2 -624296 sc-eQTL 3.14e-01 0.0689 0.0682 0.203 Mono L1
ENSG00000286646 AL121933.2 459892 sc-eQTL 8.81e-01 0.0117 0.078 0.203 Mono L1
ENSG00000027697 IFNGR1 24488 sc-eQTL 9.41e-02 -0.12 0.0713 0.204 NK L1
ENSG00000029363 BCLAF1 954086 sc-eQTL 8.33e-01 0.00806 0.0381 0.204 NK L1
ENSG00000112357 PEX7 421373 sc-eQTL 9.91e-01 0.0012 0.111 0.204 NK L1
ENSG00000112378 PERP -863482 sc-eQTL 1.22e-01 -0.108 0.0694 0.204 NK L1
ENSG00000118503 TNFAIP3 -623277 sc-eQTL 6.40e-01 -0.028 0.0597 0.204 NK L1
ENSG00000197442 MAP3K5 451460 sc-eQTL 7.04e-01 -0.0326 0.0856 0.204 NK L1
ENSG00000237499 WAKMAR2 -624296 sc-eQTL 8.06e-01 -0.0208 0.0847 0.204 NK L1
ENSG00000027697 IFNGR1 24488 sc-eQTL 6.30e-04 -0.223 0.0644 0.203 Other_T L1
ENSG00000029363 BCLAF1 954086 sc-eQTL 1.50e-01 -0.0797 0.0552 0.203 Other_T L1
ENSG00000112357 PEX7 421373 sc-eQTL 5.30e-01 -0.0677 0.108 0.203 Other_T L1
ENSG00000112378 PERP -863482 sc-eQTL 8.01e-01 0.0218 0.0866 0.203 Other_T L1
ENSG00000118503 TNFAIP3 -623277 sc-eQTL 2.39e-01 0.0485 0.0411 0.203 Other_T L1
ENSG00000146410 MTFR2 993602 sc-eQTL 5.09e-01 -0.0412 0.0623 0.203 Other_T L1
ENSG00000197442 MAP3K5 451460 sc-eQTL 9.69e-01 -0.00308 0.0795 0.203 Other_T L1
ENSG00000237499 WAKMAR2 -624296 sc-eQTL 1.72e-01 -0.111 0.0814 0.203 Other_T L1
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000027697 IFNGR1 24488 sc-eQTL 1.20e-01 -0.17 0.109 0.194 B_Activated L2
ENSG00000029363 BCLAF1 954086 sc-eQTL 6.14e-01 0.0449 0.0887 0.194 B_Activated L2
ENSG00000112357 PEX7 421373 sc-eQTL 5.72e-01 -0.0609 0.107 0.194 B_Activated L2
ENSG00000112378 PERP -863482 sc-eQTL 7.58e-01 0.0172 0.0557 0.194 B_Activated L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 -623277 sc-eQTL 6.30e-01 0.0521 0.108 0.194 B_Activated L2
ENSG00000197442 MAP3K5 451460 sc-eQTL 9.04e-01 -0.0145 0.121 0.194 B_Activated L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 -624296 sc-eQTL 8.87e-01 -0.0135 0.0943 0.194 B_Activated L2
ENSG00000027697 IFNGR1 24488 sc-eQTL 8.70e-02 -0.168 0.0977 0.204 B_Intermediate L2
ENSG00000029363 BCLAF1 954086 sc-eQTL 3.34e-01 -0.0541 0.0559 0.204 B_Intermediate L2
ENSG00000112357 PEX7 421373 sc-eQTL 2.01e-01 0.132 0.103 0.204 B_Intermediate L2
ENSG00000112378 PERP -863482 sc-eQTL 7.18e-01 -0.0339 0.0938 0.204 B_Intermediate L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 -623277 sc-eQTL 6.50e-01 -0.0335 0.0736 0.204 B_Intermediate L2
ENSG00000197442 MAP3K5 451460 sc-eQTL 6.25e-01 0.0435 0.089 0.204 B_Intermediate L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 -624296 sc-eQTL 6.62e-01 -0.0457 0.104 0.204 B_Intermediate L2
ENSG00000027697 IFNGR1 24488 sc-eQTL 1.36e-01 -0.16 0.107 0.203 B_Memory L2
ENSG00000029363 BCLAF1 954086 sc-eQTL 4.95e-01 -0.0434 0.0635 0.203 B_Memory L2
ENSG00000112357 PEX7 421373 sc-eQTL 9.25e-01 -0.0102 0.108 0.203 B_Memory L2
ENSG00000112378 PERP -863482 sc-eQTL 1.36e-01 0.151 0.101 0.203 B_Memory L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 -623277 sc-eQTL 5.31e-01 0.0439 0.07 0.203 B_Memory L2
ENSG00000197442 MAP3K5 451460 sc-eQTL 3.55e-01 -0.0885 0.0955 0.203 B_Memory L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 -624296 sc-eQTL 6.68e-01 0.0448 0.104 0.203 B_Memory L2
ENSG00000027697 IFNGR1 24488 sc-eQTL 3.85e-01 -0.0727 0.0834 0.203 B_Naive1 L2
ENSG00000029363 BCLAF1 954086 sc-eQTL 7.29e-01 0.0165 0.0477 0.203 B_Naive1 L2
ENSG00000112357 PEX7 421373 sc-eQTL 6.66e-01 -0.0476 0.11 0.203 B_Naive1 L2
ENSG00000112378 PERP -863482 sc-eQTL 1.43e-01 -0.141 0.0959 0.203 B_Naive1 L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 -623277 sc-eQTL 9.14e-01 0.00606 0.0559 0.203 B_Naive1 L2
ENSG00000197442 MAP3K5 451460 sc-eQTL 9.93e-01 -0.000646 0.0786 0.203 B_Naive1 L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 -624296 sc-eQTL 7.80e-01 0.0245 0.0876 0.203 B_Naive1 L2
ENSG00000027697 IFNGR1 24488 sc-eQTL 2.69e-01 -0.113 0.102 0.204 B_Naive2 L2
ENSG00000029363 BCLAF1 954086 sc-eQTL 3.01e-02 0.128 0.0586 0.204 B_Naive2 L2
ENSG00000112357 PEX7 421373 sc-eQTL 1.39e-01 0.165 0.111 0.204 B_Naive2 L2
ENSG00000112378 PERP -863482 sc-eQTL 5.48e-01 -0.0489 0.0813 0.204 B_Naive2 L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 -623277 sc-eQTL 3.09e-01 -0.0828 0.0812 0.204 B_Naive2 L2
ENSG00000197442 MAP3K5 451460 sc-eQTL 2.99e-01 -0.0899 0.0864 0.204 B_Naive2 L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 -624296 sc-eQTL 4.68e-01 -0.0764 0.105 0.204 B_Naive2 L2
ENSG00000027697 IFNGR1 24488 sc-eQTL 1.24e-01 -0.148 0.0955 0.202 CD4_CTL L2
ENSG00000029363 BCLAF1 954086 sc-eQTL 5.18e-01 -0.0551 0.0852 0.202 CD4_CTL L2
ENSG00000112357 PEX7 421373 sc-eQTL 4.58e-01 -0.0792 0.106 0.202 CD4_CTL L2
ENSG00000112378 PERP -863482 sc-eQTL 8.07e-01 -0.0265 0.108 0.202 CD4_CTL L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 -623277 sc-eQTL 8.41e-01 -0.0126 0.063 0.202 CD4_CTL L2
ENSG00000197442 MAP3K5 451460 sc-eQTL 9.78e-01 0.00278 0.101 0.202 CD4_CTL L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 -624296 sc-eQTL 1.68e-01 -0.135 0.0976 0.202 CD4_CTL L2
ENSG00000027697 IFNGR1 24488 sc-eQTL 7.16e-01 0.0195 0.0535 0.203 CD4_Naive L2
ENSG00000029363 BCLAF1 954086 sc-eQTL 3.99e-01 -0.0363 0.0429 0.203 CD4_Naive L2
ENSG00000112357 PEX7 421373 sc-eQTL 5.92e-01 -0.0542 0.101 0.203 CD4_Naive L2
ENSG00000112378 PERP -863482 sc-eQTL 9.76e-02 -0.138 0.0829 0.203 CD4_Naive L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 -623277 sc-eQTL 5.57e-01 -0.0344 0.0585 0.203 CD4_Naive L2
ENSG00000197442 MAP3K5 451460 sc-eQTL 6.09e-01 -0.022 0.043 0.203 CD4_Naive L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 -624296 sc-eQTL 2.43e-02 -0.17 0.0749 0.203 CD4_Naive L2
ENSG00000027697 IFNGR1 24488 sc-eQTL 7.33e-01 -0.025 0.073 0.203 CD4_TCM L2
ENSG00000029363 BCLAF1 954086 sc-eQTL 6.05e-02 -0.0863 0.0457 0.203 CD4_TCM L2
ENSG00000112357 PEX7 421373 sc-eQTL 2.00e-01 -0.137 0.107 0.203 CD4_TCM L2
ENSG00000112378 PERP -863482 sc-eQTL 6.97e-01 -0.0353 0.0906 0.203 CD4_TCM L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 -623277 sc-eQTL 4.47e-01 -0.04 0.0525 0.203 CD4_TCM L2
ENSG00000197442 MAP3K5 451460 sc-eQTL 8.52e-01 -0.0112 0.0599 0.203 CD4_TCM L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 -624296 sc-eQTL 1.36e-01 -0.11 0.0733 0.203 CD4_TCM L2
ENSG00000027697 IFNGR1 24488 sc-eQTL 8.23e-01 -0.0189 0.0842 0.203 CD4_TEM L2
ENSG00000029363 BCLAF1 954086 sc-eQTL 9.61e-01 -0.00291 0.0597 0.203 CD4_TEM L2
ENSG00000112357 PEX7 421373 sc-eQTL 1.28e-01 0.165 0.108 0.203 CD4_TEM L2
ENSG00000112378 PERP -863482 sc-eQTL 9.60e-01 0.00441 0.0881 0.203 CD4_TEM L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 -623277 sc-eQTL 9.95e-01 0.000377 0.0559 0.203 CD4_TEM L2
ENSG00000197442 MAP3K5 451460 sc-eQTL 1.81e-01 -0.115 0.086 0.203 CD4_TEM L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 -624296 sc-eQTL 5.71e-01 -0.0508 0.0896 0.203 CD4_TEM L2
ENSG00000027697 IFNGR1 24488 sc-eQTL 4.62e-01 0.0566 0.0768 0.203 CD8_CTL L2
ENSG00000029363 BCLAF1 954086 sc-eQTL 7.83e-01 -0.0142 0.0513 0.203 CD8_CTL L2
ENSG00000112357 PEX7 421373 sc-eQTL 9.20e-01 0.0107 0.106 0.203 CD8_CTL L2
ENSG00000112378 PERP -863482 sc-eQTL 7.45e-01 0.0331 0.102 0.203 CD8_CTL L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 -623277 sc-eQTL 5.85e-01 0.0354 0.0647 0.203 CD8_CTL L2
ENSG00000197442 MAP3K5 451460 sc-eQTL 6.37e-01 -0.0431 0.0913 0.203 CD8_CTL L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 -624296 sc-eQTL 4.98e-01 0.0617 0.0909 0.203 CD8_CTL L2
ENSG00000027697 IFNGR1 24488 sc-eQTL 4.48e-01 -0.0572 0.0752 0.203 CD8_Naive L2
ENSG00000029363 BCLAF1 954086 sc-eQTL 4.86e-01 0.0366 0.0525 0.203 CD8_Naive L2
ENSG00000112357 PEX7 421373 sc-eQTL 4.60e-01 -0.0806 0.109 0.203 CD8_Naive L2
ENSG00000112378 PERP -863482 sc-eQTL 3.51e-01 -0.0774 0.0828 0.203 CD8_Naive L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 -623277 sc-eQTL 7.53e-01 -0.0185 0.0589 0.203 CD8_Naive L2
ENSG00000197442 MAP3K5 451460 sc-eQTL 7.34e-01 -0.0237 0.0698 0.203 CD8_Naive L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 -624296 sc-eQTL 1.04e-01 -0.141 0.0865 0.203 CD8_Naive L2
ENSG00000027697 IFNGR1 24488 sc-eQTL 5.31e-01 -0.0644 0.102 0.199 CD8_TCM L2
ENSG00000029363 BCLAF1 954086 sc-eQTL 9.08e-01 -0.00888 0.077 0.199 CD8_TCM L2
ENSG00000112357 PEX7 421373 sc-eQTL 9.50e-01 0.00737 0.118 0.199 CD8_TCM L2
ENSG00000112378 PERP -863482 sc-eQTL 8.47e-01 0.0223 0.115 0.199 CD8_TCM L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 -623277 sc-eQTL 1.93e-01 0.0723 0.0553 0.199 CD8_TCM L2
ENSG00000197442 MAP3K5 451460 sc-eQTL 9.10e-01 -0.0112 0.0992 0.199 CD8_TCM L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 -624296 sc-eQTL 4.46e-01 -0.0775 0.102 0.199 CD8_TCM L2
ENSG00000027697 IFNGR1 24488 sc-eQTL 5.65e-02 -0.184 0.096 0.199 CD8_TEM L2
ENSG00000029363 BCLAF1 954086 sc-eQTL 7.21e-01 -0.0327 0.0914 0.199 CD8_TEM L2
ENSG00000112357 PEX7 421373 sc-eQTL 9.71e-01 -0.0041 0.112 0.199 CD8_TEM L2
ENSG00000112378 PERP -863482 sc-eQTL 1.65e-01 -0.161 0.115 0.199 CD8_TEM L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 -623277 sc-eQTL 1.27e-01 0.109 0.0711 0.199 CD8_TEM L2
ENSG00000197442 MAP3K5 451460 sc-eQTL 7.73e-01 -0.0319 0.111 0.199 CD8_TEM L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 -624296 sc-eQTL 6.57e-01 0.0471 0.106 0.199 CD8_TEM L2
ENSG00000027697 IFNGR1 24488 sc-eQTL 1.31e-06 -0.367 0.0737 0.203 MAIT L2
ENSG00000029363 BCLAF1 954086 sc-eQTL 2.81e-01 -0.0699 0.0646 0.203 MAIT L2
ENSG00000112357 PEX7 421373 sc-eQTL 6.31e-01 0.0508 0.106 0.203 MAIT L2
ENSG00000112378 PERP -863482 sc-eQTL 9.02e-01 0.0136 0.11 0.203 MAIT L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 -623277 sc-eQTL 5.38e-01 0.0323 0.0524 0.203 MAIT L2
ENSG00000146410 MTFR2 993602 sc-eQTL 3.71e-01 0.0782 0.0872 0.203 MAIT L2
ENSG00000197442 MAP3K5 451460 sc-eQTL 6.62e-01 0.04 0.0913 0.203 MAIT L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 -624296 sc-eQTL 2.34e-01 -0.115 0.0966 0.203 MAIT L2
ENSG00000027697 IFNGR1 24488 sc-eQTL 9.26e-02 -0.143 0.0846 0.2 NK_CD56bright L2
ENSG00000029363 BCLAF1 954086 sc-eQTL 8.64e-01 0.0108 0.0629 0.2 NK_CD56bright L2
ENSG00000112357 PEX7 421373 sc-eQTL 3.05e-01 -0.114 0.111 0.2 NK_CD56bright L2
ENSG00000112378 PERP -863482 sc-eQTL 5.00e-01 -0.0672 0.0994 0.2 NK_CD56bright L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 -623277 sc-eQTL 9.48e-01 0.00416 0.0634 0.2 NK_CD56bright L2
ENSG00000197442 MAP3K5 451460 sc-eQTL 1.34e-01 -0.144 0.096 0.2 NK_CD56bright L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 -624296 sc-eQTL 9.05e-02 -0.171 0.1 0.2 NK_CD56bright L2
ENSG00000027697 IFNGR1 24488 sc-eQTL 3.75e-01 -0.0592 0.0666 0.205 NK_CD56dim L2
ENSG00000029363 BCLAF1 954086 sc-eQTL 3.89e-01 0.0376 0.0435 0.205 NK_CD56dim L2
ENSG00000112357 PEX7 421373 sc-eQTL 4.33e-01 -0.0901 0.115 0.205 NK_CD56dim L2
ENSG00000112378 PERP -863482 sc-eQTL 5.19e-01 -0.0522 0.0808 0.205 NK_CD56dim L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 -623277 sc-eQTL 7.04e-01 -0.0239 0.0629 0.205 NK_CD56dim L2
ENSG00000197442 MAP3K5 451460 sc-eQTL 9.49e-01 0.00578 0.0905 0.205 NK_CD56dim L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 -624296 sc-eQTL 5.92e-01 -0.0505 0.0941 0.205 NK_CD56dim L2
ENSG00000027697 IFNGR1 24488 sc-eQTL 8.00e-02 -0.147 0.0835 0.212 NK_HLA L2
ENSG00000029363 BCLAF1 954086 sc-eQTL 6.69e-01 -0.0305 0.0712 0.212 NK_HLA L2
ENSG00000112357 PEX7 421373 sc-eQTL 1.30e-01 0.161 0.106 0.212 NK_HLA L2
ENSG00000112378 PERP -863482 sc-eQTL 9.45e-01 0.00595 0.0867 0.212 NK_HLA L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 -623277 sc-eQTL 3.13e-01 -0.0673 0.0665 0.212 NK_HLA L2
ENSG00000197442 MAP3K5 451460 sc-eQTL 6.84e-01 -0.0431 0.106 0.212 NK_HLA L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 -624296 sc-eQTL 7.67e-01 0.0319 0.107 0.212 NK_HLA L2
ENSG00000027697 IFNGR1 24488 sc-eQTL 2.04e-01 -0.0893 0.0701 0.205 NK_cytokine L2
ENSG00000029363 BCLAF1 954086 sc-eQTL 1.64e-01 -0.0729 0.0523 0.205 NK_cytokine L2
ENSG00000112357 PEX7 421373 sc-eQTL 9.18e-02 0.186 0.11 0.205 NK_cytokine L2
ENSG00000112378 PERP -863482 sc-eQTL 9.42e-01 0.00614 0.0838 0.205 NK_cytokine L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 -623277 sc-eQTL 9.34e-01 -0.00521 0.0628 0.205 NK_cytokine L2
ENSG00000197442 MAP3K5 451460 sc-eQTL 5.90e-01 -0.0465 0.0863 0.205 NK_cytokine L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 -624296 sc-eQTL 9.47e-01 -0.00634 0.0947 0.205 NK_cytokine L2
ENSG00000027697 IFNGR1 24488 sc-eQTL 2.00e-01 0.165 0.128 0.178 PB L2
ENSG00000029363 BCLAF1 954086 sc-eQTL 8.75e-01 -0.0174 0.111 0.178 PB L2
ENSG00000112357 PEX7 421373 sc-eQTL 8.97e-01 0.0171 0.132 0.178 PB L2
ENSG00000112378 PERP -863482 sc-eQTL 1.32e-01 -0.124 0.0817 0.178 PB L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 -623277 sc-eQTL 8.37e-01 -0.0206 0.1 0.178 PB L2
ENSG00000197442 MAP3K5 451460 sc-eQTL 2.24e-01 -0.138 0.113 0.178 PB L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 -624296 sc-eQTL 5.10e-01 -0.0793 0.12 0.178 PB L2
ENSG00000027697 IFNGR1 24488 sc-eQTL 7.17e-01 -0.0309 0.0853 0.202 Pro_T L2
ENSG00000029363 BCLAF1 954086 sc-eQTL 7.12e-01 -0.0327 0.0884 0.202 Pro_T L2
ENSG00000112357 PEX7 421373 sc-eQTL 4.45e-01 -0.0791 0.103 0.202 Pro_T L2
ENSG00000112378 PERP -863482 sc-eQTL 3.56e-01 -0.0761 0.0822 0.202 Pro_T L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 -623277 sc-eQTL 3.83e-01 0.0453 0.0519 0.202 Pro_T L2
ENSG00000146410 MTFR2 993602 sc-eQTL 5.12e-01 -0.0473 0.072 0.202 Pro_T L2
ENSG00000197442 MAP3K5 451460 sc-eQTL 2.20e-01 0.123 0.1 0.202 Pro_T L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 -624296 sc-eQTL 2.92e-01 -0.106 0.101 0.202 Pro_T L2
ENSG00000027697 IFNGR1 24488 sc-eQTL 6.33e-01 -0.0473 0.0988 0.203 Treg L2
ENSG00000029363 BCLAF1 954086 sc-eQTL 3.53e-01 -0.0593 0.0637 0.203 Treg L2
ENSG00000112357 PEX7 421373 sc-eQTL 2.04e-01 -0.133 0.104 0.203 Treg L2
ENSG00000112378 PERP -863482 sc-eQTL 6.46e-01 -0.0519 0.113 0.203 Treg L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 -623277 sc-eQTL 2.07e-01 0.0793 0.0626 0.203 Treg L2
ENSG00000197442 MAP3K5 451460 sc-eQTL 6.33e-01 0.0325 0.068 0.203 Treg L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 -624296 sc-eQTL 1.88e-01 0.126 0.0954 0.203 Treg L2
ENSG00000027697 IFNGR1 24488 sc-eQTL 2.91e-01 -0.0869 0.0821 0.21 cDC L2
ENSG00000029363 BCLAF1 954086 sc-eQTL 2.03e-01 -0.106 0.0826 0.21 cDC L2
ENSG00000112357 PEX7 421373 sc-eQTL 4.04e-01 0.089 0.106 0.21 cDC L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 -623277 sc-eQTL 5.46e-01 -0.049 0.0811 0.21 cDC L2
ENSG00000135525 MAP7 693118 sc-eQTL 4.68e-01 -0.0689 0.0948 0.21 cDC L2
ENSG00000197442 MAP3K5 451460 sc-eQTL 4.61e-01 -0.0617 0.0834 0.21 cDC L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 -624296 sc-eQTL 7.35e-01 -0.0359 0.106 0.21 cDC L2
ENSG00000286646 AL121933.2 459892 sc-eQTL 4.03e-01 0.0911 0.109 0.21 cDC L2
ENSG00000027697 IFNGR1 24488 sc-eQTL 5.63e-01 0.0349 0.0602 0.203 cMono_IL1B L2
ENSG00000029363 BCLAF1 954086 sc-eQTL 4.68e-01 0.0469 0.0645 0.203 cMono_IL1B L2
ENSG00000112357 PEX7 421373 sc-eQTL 5.43e-02 -0.208 0.107 0.203 cMono_IL1B L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 -623277 sc-eQTL 4.84e-02 0.128 0.0642 0.203 cMono_IL1B L2
ENSG00000135525 MAP7 693118 sc-eQTL 3.64e-01 -0.0847 0.0931 0.203 cMono_IL1B L2
ENSG00000197442 MAP3K5 451460 sc-eQTL 4.88e-01 -0.0468 0.0673 0.203 cMono_IL1B L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 -624296 sc-eQTL 2.28e-01 0.0834 0.069 0.203 cMono_IL1B L2
ENSG00000286646 AL121933.2 459892 sc-eQTL 8.02e-01 -0.0218 0.0866 0.203 cMono_IL1B L2
ENSG00000027697 IFNGR1 24488 sc-eQTL 4.37e-01 -0.0545 0.07 0.203 cMono_S100A L2
ENSG00000029363 BCLAF1 954086 sc-eQTL 7.61e-01 -0.0219 0.0719 0.203 cMono_S100A L2
ENSG00000112357 PEX7 421373 sc-eQTL 2.20e-01 -0.138 0.112 0.203 cMono_S100A L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 -623277 sc-eQTL 3.40e-01 0.0594 0.0621 0.203 cMono_S100A L2
ENSG00000135525 MAP7 693118 sc-eQTL 2.47e-02 -0.234 0.104 0.203 cMono_S100A L2
ENSG00000197442 MAP3K5 451460 sc-eQTL 1.06e-01 0.137 0.0841 0.203 cMono_S100A L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 -624296 sc-eQTL 6.29e-01 -0.0432 0.0893 0.203 cMono_S100A L2
ENSG00000286646 AL121933.2 459892 sc-eQTL 5.69e-01 0.0497 0.0872 0.203 cMono_S100A L2
ENSG00000027697 IFNGR1 24488 sc-eQTL 5.47e-01 -0.0613 0.102 0.218 gdT L2
ENSG00000029363 BCLAF1 954086 sc-eQTL 2.99e-01 -0.0931 0.0893 0.218 gdT L2
ENSG00000112357 PEX7 421373 sc-eQTL 4.88e-01 -0.0897 0.129 0.218 gdT L2
ENSG00000112378 PERP -863482 sc-eQTL 6.27e-02 0.209 0.111 0.218 gdT L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 -623277 sc-eQTL 1.56e-01 0.0888 0.0622 0.218 gdT L2
ENSG00000146410 MTFR2 993602 sc-eQTL 4.36e-01 -0.077 0.0987 0.218 gdT L2
ENSG00000197442 MAP3K5 451460 sc-eQTL 7.21e-02 0.237 0.131 0.218 gdT L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 -624296 sc-eQTL 4.58e-01 -0.0843 0.113 0.218 gdT L2
ENSG00000027697 IFNGR1 24488 sc-eQTL 5.76e-01 0.0419 0.0749 0.202 intMono L2
ENSG00000029363 BCLAF1 954086 sc-eQTL 1.87e-01 -0.131 0.0986 0.202 intMono L2
ENSG00000112357 PEX7 421373 sc-eQTL 1.53e-01 -0.144 0.101 0.202 intMono L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 -623277 sc-eQTL 2.39e-01 0.0763 0.0645 0.202 intMono L2
ENSG00000135525 MAP7 693118 sc-eQTL 7.08e-01 0.0373 0.0994 0.202 intMono L2
ENSG00000197442 MAP3K5 451460 sc-eQTL 1.74e-01 -0.143 0.105 0.202 intMono L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 -624296 sc-eQTL 8.67e-01 -0.0162 0.0965 0.202 intMono L2
ENSG00000286646 AL121933.2 459892 sc-eQTL 3.33e-01 -0.108 0.111 0.202 intMono L2
ENSG00000027697 IFNGR1 24488 sc-eQTL 6.58e-01 -0.0386 0.0871 0.199 ncMono L2
ENSG00000029363 BCLAF1 954086 sc-eQTL 9.91e-01 0.000751 0.0677 0.199 ncMono L2
ENSG00000112357 PEX7 421373 sc-eQTL 5.05e-01 -0.072 0.108 0.199 ncMono L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 -623277 sc-eQTL 1.09e-01 0.123 0.0766 0.199 ncMono L2
ENSG00000135525 MAP7 693118 sc-eQTL 9.69e-01 0.0037 0.0953 0.199 ncMono L2
ENSG00000197442 MAP3K5 451460 sc-eQTL 1.19e-01 0.156 0.0995 0.199 ncMono L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 -624296 sc-eQTL 6.10e-01 0.0493 0.0963 0.199 ncMono L2
ENSG00000286646 AL121933.2 459892 sc-eQTL 5.49e-01 -0.0609 0.102 0.199 ncMono L2
ENSG00000027697 IFNGR1 24488 sc-eQTL 4.60e-01 -0.0706 0.0954 0.218 pDC L2
ENSG00000029363 BCLAF1 954086 sc-eQTL 6.15e-01 0.0361 0.0716 0.218 pDC L2
ENSG00000112357 PEX7 421373 sc-eQTL 9.34e-01 -0.00872 0.105 0.218 pDC L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 -623277 sc-eQTL 4.47e-02 0.177 0.0874 0.218 pDC L2
ENSG00000135525 MAP7 693118 sc-eQTL 9.78e-01 -0.00206 0.0734 0.218 pDC L2
ENSG00000197442 MAP3K5 451460 sc-eQTL 8.32e-01 0.025 0.118 0.218 pDC L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 -624296 sc-eQTL 5.89e-01 -0.0486 0.0898 0.218 pDC L2
ENSG00000286646 AL121933.2 459892 sc-eQTL 5.79e-01 0.0601 0.108 0.218 pDC L2
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000027697 IFNGR1 24488 sc-eQTL 5.99e-03 -0.238 0.0859 0.203 B_Memory LOneK1K
ENSG00000029363 BCLAF1 954086 sc-eQTL 2.37e-01 -0.058 0.0489 0.203 B_Memory LOneK1K
ENSG00000112357 PEX7 421373 sc-eQTL 7.28e-01 0.035 0.101 0.203 B_Memory LOneK1K
ENSG00000112378 PERP -863482 sc-eQTL 2.31e-01 0.112 0.0931 0.203 B_Memory LOneK1K
ENSG00000118503 TNFAIP3 -623277 sc-eQTL 5.86e-01 -0.0336 0.0616 0.203 B_Memory LOneK1K
ENSG00000197442 MAP3K5 451460 sc-eQTL 7.98e-01 0.0209 0.0816 0.203 B_Memory LOneK1K
ENSG00000237499 WAKMAR2 -624296 sc-eQTL 9.62e-01 -0.00496 0.104 0.203 B_Memory LOneK1K
ENSG00000027697 IFNGR1 24488 sc-eQTL 1.68e-01 -0.121 0.0878 0.203 B_Naive LOneK1K
ENSG00000029363 BCLAF1 954086 sc-eQTL 1.76e-01 0.0548 0.0404 0.203 B_Naive LOneK1K
ENSG00000112357 PEX7 421373 sc-eQTL 5.56e-01 0.0633 0.107 0.203 B_Naive LOneK1K
ENSG00000112378 PERP -863482 sc-eQTL 1.47e-01 -0.139 0.0956 0.203 B_Naive LOneK1K
ENSG00000118503 TNFAIP3 -623277 sc-eQTL 7.13e-01 -0.0186 0.0505 0.203 B_Naive LOneK1K
ENSG00000197442 MAP3K5 451460 sc-eQTL 1.97e-01 -0.0956 0.0737 0.203 B_Naive LOneK1K
ENSG00000237499 WAKMAR2 -624296 sc-eQTL 7.94e-01 -0.0236 0.0899 0.203 B_Naive LOneK1K
ENSG00000027697 IFNGR1 24488 sc-eQTL 8.69e-01 -0.0102 0.0617 0.203 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000029363 BCLAF1 954086 sc-eQTL 5.19e-01 0.0371 0.0574 0.203 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000112357 PEX7 421373 sc-eQTL 6.44e-02 -0.204 0.11 0.203 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000118503 TNFAIP3 -623277 sc-eQTL 1.70e-01 0.0782 0.0568 0.203 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000135525 MAP7 693118 sc-eQTL 9.74e-02 -0.164 0.0984 0.203 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000197442 MAP3K5 451460 sc-eQTL 7.30e-01 0.0231 0.0668 0.203 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000237499 WAKMAR2 -624296 sc-eQTL 3.72e-01 0.061 0.0682 0.203 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000286646 AL121933.2 459892 sc-eQTL 8.79e-01 -0.0122 0.0796 0.203 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000027697 IFNGR1 24488 sc-eQTL 6.79e-01 -0.0297 0.0716 0.205 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000029363 BCLAF1 954086 sc-eQTL 5.98e-01 -0.0342 0.0647 0.205 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000112357 PEX7 421373 sc-eQTL 3.45e-01 -0.102 0.108 0.205 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000118503 TNFAIP3 -623277 sc-eQTL 1.89e-02 0.156 0.0661 0.205 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000135525 MAP7 693118 sc-eQTL 8.00e-01 0.0265 0.105 0.205 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000197442 MAP3K5 451460 sc-eQTL 6.21e-01 0.0425 0.0858 0.205 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000237499 WAKMAR2 -624296 sc-eQTL 9.85e-01 0.00167 0.0897 0.205 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000286646 AL121933.2 459892 sc-eQTL 1.71e-01 -0.139 0.101 0.205 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000027697 IFNGR1 24488 sc-eQTL 1.39e-01 -0.1 0.0674 0.205 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000029363 BCLAF1 954086 sc-eQTL 9.39e-01 0.003 0.0393 0.205 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000112357 PEX7 421373 sc-eQTL 5.32e-01 0.0715 0.114 0.205 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000112378 PERP -863482 sc-eQTL 2.61e-01 -0.0798 0.0707 0.205 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000118503 TNFAIP3 -623277 sc-eQTL 5.46e-01 -0.0373 0.0617 0.205 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000197442 MAP3K5 451460 sc-eQTL 6.75e-01 -0.0351 0.0834 0.205 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000237499 WAKMAR2 -624296 sc-eQTL 9.64e-01 -0.00395 0.0864 0.205 NK_CD56dim LOneK1K

Statistical fine-mapping results from Japan COVID-19 Task Force
(Shown only for PIP>0.001)
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
PIP (SuSiE)
PIP (FINEMAP)
MAF
ENSG00000027697 IFNGR1 24488 pQTL 0.0172 -0.0447 0.0187 0.0 0.0 0.21
ENSG00000027697 IFNGR1 24488 eQTL 3.48e-06 -0.0751 0.0161 0.0 0.0 0.203

Expression Modifier Score(EMS) for GTEx 49tissues
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Whole Blood
Muscle Skeletal
Liver
Brain Cerebellum
Prostate
Spleen
Skin Sun Exposed Lower leg
Artery Coronary
Esophagus Muscularis
Esophagus Gastroesophageal Junction
Artery Tibial
Heart Atrial Appendage
Nerve Tibial
Heart Left Ventricle
Adrenal Gland
Adipose Visceral Omentum
Pancreas
Lung
Pituitary
Brain Nucleus accumbens basal ganglia
Colon Transverse
Adipose Subcutaneous
Esophagus Mucosa
Brain Cortex
Thyroid
Stomach
Breast Mammary Tissue
Colon Sigmoid
Skin Not Sun Exposed Suprapubic
Testis
Artery Aorta
Brain Amygdala
Brain Anterior cingulate cortex BA24
Brain Caudate basal ganglia
Brain Cerebellar Hemisphere
Brain Frontal Cortex BA9
Brain Hippocampus
Brain Hypothalamus
Brain Putamen basal ganglia
Brain Spinal cord cervical c-1
Brain Substantia nigra
Cells Cultured fibroblasts
Cells EBV-transformed lymphocytes
Kidney Cortex
Minor Salivary Gland
Ovary
Small Intestine Terminal Ileum
Uterus
Vagina
ENSG00000027697 IFNGR1 24488 5.67e-05 1.67e-05 2.98e-06 1.13e-05 3.17e-06 1.42e-05 2.29e-05 2.93e-06 1.63e-05 7.65e-06 2.06e-05 8.28e-06 2.88e-05 5.79e-06 4.91e-06 1.13e-05 8.79e-06 1.87e-05 3.58e-06 4.17e-06 8.07e-06 2e-05 1.73e-05 4.69e-06 2.69e-05 5.34e-06 8.26e-06 6.17e-06 1.75e-05 1.55e-05 1.07e-05 1.19e-06 1.46e-06 4.39e-06 7.74e-06 3.58e-06 1.81e-06 2.64e-06 2.7e-06 2.38e-06 1.63e-06 2.34e-05 2.98e-06 1.88e-07 1.84e-06 2.34e-06 3.27e-06 7.99e-07 5.4e-07
ENSG00000237499 \N -624296 3.71e-07 1.59e-07 5.14e-08 2.31e-07 9.8e-08 8.75e-08 2.16e-07 5.68e-08 1.44e-07 6.75e-08 1.66e-07 1.23e-07 2.38e-07 8e-08 5.98e-08 7.98e-08 4.31e-08 1.77e-07 6.92e-08 5.07e-08 1.18e-07 1.56e-07 1.58e-07 3.4e-08 1.98e-07 1.22e-07 1.19e-07 1.06e-07 1.34e-07 1.06e-07 1.14e-07 3.72e-08 3.38e-08 9.78e-08 4.78e-08 2.68e-08 5.51e-08 9.17e-08 6.3e-08 5.13e-08 5.05e-08 1.59e-07 3.02e-08 1.1e-08 2.82e-08 1.68e-08 1e-07 1.96e-09 4.82e-08