logo

Genes within 1Mb (chr6:137240673:GC:G):

View on , UCSC , GTEx , gnomAD

Immune cell-type specific single cell cis-eQTLs in OASIS
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000027697 IFNGR1 21224 sc-eQTL 5.41e-02 -0.164 0.0846 0.199 B L1
ENSG00000029363 BCLAF1 950822 sc-eQTL 5.56e-01 0.0224 0.038 0.199 B L1
ENSG00000112357 PEX7 418109 sc-eQTL 3.60e-01 0.0925 0.101 0.199 B L1
ENSG00000112378 PERP -866746 sc-eQTL 9.56e-01 -0.00369 0.0669 0.199 B L1
ENSG00000118503 TNFAIP3 -626541 sc-eQTL 8.77e-01 -0.00834 0.0539 0.199 B L1
ENSG00000197442 MAP3K5 448196 sc-eQTL 3.91e-01 -0.0644 0.075 0.199 B L1
ENSG00000237499 WAKMAR2 -627560 sc-eQTL 8.58e-01 0.0152 0.0848 0.199 B L1
ENSG00000027697 IFNGR1 21224 sc-eQTL 4.19e-01 -0.0464 0.0572 0.199 CD4T L1
ENSG00000029363 BCLAF1 950822 sc-eQTL 4.94e-01 -0.0297 0.0433 0.199 CD4T L1
ENSG00000112357 PEX7 418109 sc-eQTL 2.18e-01 -0.114 0.0919 0.199 CD4T L1
ENSG00000112378 PERP -866746 sc-eQTL 3.41e-01 -0.0589 0.0618 0.199 CD4T L1
ENSG00000118503 TNFAIP3 -626541 sc-eQTL 8.45e-01 -0.0113 0.058 0.199 CD4T L1
ENSG00000197442 MAP3K5 448196 sc-eQTL 3.45e-01 -0.0417 0.0441 0.199 CD4T L1
ENSG00000237499 WAKMAR2 -627560 sc-eQTL 6.02e-02 -0.137 0.0725 0.199 CD4T L1
ENSG00000027697 IFNGR1 21224 sc-eQTL 5.02e-01 -0.0433 0.0644 0.199 CD8T L1
ENSG00000029363 BCLAF1 950822 sc-eQTL 4.67e-01 0.0317 0.0436 0.199 CD8T L1
ENSG00000112357 PEX7 418109 sc-eQTL 5.25e-01 -0.0683 0.107 0.199 CD8T L1
ENSG00000112378 PERP -866746 sc-eQTL 7.76e-01 0.02 0.0702 0.199 CD8T L1
ENSG00000118503 TNFAIP3 -626541 sc-eQTL 2.71e-01 0.0597 0.0541 0.199 CD8T L1
ENSG00000197442 MAP3K5 448196 sc-eQTL 6.86e-01 -0.0232 0.0573 0.199 CD8T L1
ENSG00000237499 WAKMAR2 -627560 sc-eQTL 1.93e-01 -0.104 0.0793 0.199 CD8T L1
ENSG00000027697 IFNGR1 21224 sc-eQTL 1.85e-01 -0.101 0.076 0.203 DC L1
ENSG00000029363 BCLAF1 950822 sc-eQTL 4.91e-01 -0.0474 0.0686 0.203 DC L1
ENSG00000112357 PEX7 418109 sc-eQTL 3.44e-01 0.102 0.107 0.203 DC L1
ENSG00000118503 TNFAIP3 -626541 sc-eQTL 5.05e-01 0.0544 0.0815 0.203 DC L1
ENSG00000135525 MAP7 689854 sc-eQTL 4.26e-01 -0.0704 0.0882 0.203 DC L1
ENSG00000197442 MAP3K5 448196 sc-eQTL 3.29e-01 -0.0827 0.0845 0.203 DC L1
ENSG00000237499 WAKMAR2 -627560 sc-eQTL 8.41e-01 0.0167 0.0831 0.203 DC L1
ENSG00000286646 AL121933.2 456628 sc-eQTL 7.12e-01 0.0409 0.11 0.203 DC L1
ENSG00000027697 IFNGR1 21224 sc-eQTL 9.79e-01 -0.00176 0.0654 0.199 Mono L1
ENSG00000029363 BCLAF1 950822 sc-eQTL 7.38e-01 0.0187 0.0559 0.199 Mono L1
ENSG00000112357 PEX7 418109 sc-eQTL 3.91e-02 -0.226 0.109 0.199 Mono L1
ENSG00000118503 TNFAIP3 -626541 sc-eQTL 2.88e-01 0.0589 0.0553 0.199 Mono L1
ENSG00000135525 MAP7 689854 sc-eQTL 5.15e-01 -0.0633 0.097 0.199 Mono L1
ENSG00000197442 MAP3K5 448196 sc-eQTL 5.05e-01 0.0432 0.0647 0.199 Mono L1
ENSG00000237499 WAKMAR2 -627560 sc-eQTL 4.14e-01 0.0562 0.0686 0.199 Mono L1
ENSG00000286646 AL121933.2 456628 sc-eQTL 8.31e-01 0.0167 0.0784 0.199 Mono L1
ENSG00000027697 IFNGR1 21224 sc-eQTL 1.49e-01 -0.105 0.0723 0.2 NK L1
ENSG00000029363 BCLAF1 950822 sc-eQTL 5.84e-01 0.0211 0.0386 0.2 NK L1
ENSG00000112357 PEX7 418109 sc-eQTL 1.00e+00 4.29e-05 0.112 0.2 NK L1
ENSG00000112378 PERP -866746 sc-eQTL 1.57e-01 -0.0999 0.0703 0.2 NK L1
ENSG00000118503 TNFAIP3 -626541 sc-eQTL 7.93e-01 -0.0159 0.0605 0.2 NK L1
ENSG00000197442 MAP3K5 448196 sc-eQTL 7.01e-01 -0.0333 0.0866 0.2 NK L1
ENSG00000237499 WAKMAR2 -627560 sc-eQTL 8.83e-01 -0.0126 0.0857 0.2 NK L1
ENSG00000027697 IFNGR1 21224 sc-eQTL 7.53e-04 -0.224 0.0654 0.199 Other_T L1
ENSG00000029363 BCLAF1 950822 sc-eQTL 1.31e-01 -0.0849 0.056 0.199 Other_T L1
ENSG00000112357 PEX7 418109 sc-eQTL 6.85e-01 -0.0445 0.109 0.199 Other_T L1
ENSG00000112378 PERP -866746 sc-eQTL 6.50e-01 0.04 0.0878 0.199 Other_T L1
ENSG00000118503 TNFAIP3 -626541 sc-eQTL 1.63e-01 0.0583 0.0416 0.199 Other_T L1
ENSG00000146410 MTFR2 990338 sc-eQTL 4.61e-01 -0.0467 0.0632 0.199 Other_T L1
ENSG00000197442 MAP3K5 448196 sc-eQTL 6.93e-01 -0.0319 0.0807 0.199 Other_T L1
ENSG00000237499 WAKMAR2 -627560 sc-eQTL 1.63e-01 -0.115 0.0826 0.199 Other_T L1
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000027697 IFNGR1 21224 sc-eQTL 1.10e-01 -0.178 0.111 0.191 B_Activated L2
ENSG00000029363 BCLAF1 950822 sc-eQTL 5.92e-01 0.0487 0.0905 0.191 B_Activated L2
ENSG00000112357 PEX7 418109 sc-eQTL 6.61e-01 -0.0482 0.11 0.191 B_Activated L2
ENSG00000112378 PERP -866746 sc-eQTL 7.08e-01 0.0213 0.0568 0.191 B_Activated L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 -626541 sc-eQTL 6.49e-01 0.0502 0.11 0.191 B_Activated L2
ENSG00000197442 MAP3K5 448196 sc-eQTL 9.43e-01 -0.00883 0.123 0.191 B_Activated L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 -627560 sc-eQTL 9.27e-01 -0.0088 0.0962 0.191 B_Activated L2
ENSG00000027697 IFNGR1 21224 sc-eQTL 8.70e-02 -0.171 0.0992 0.2 B_Intermediate L2
ENSG00000029363 BCLAF1 950822 sc-eQTL 2.39e-01 -0.0668 0.0566 0.2 B_Intermediate L2
ENSG00000112357 PEX7 418109 sc-eQTL 2.30e-01 0.126 0.104 0.2 B_Intermediate L2
ENSG00000112378 PERP -866746 sc-eQTL 7.85e-01 -0.026 0.0953 0.2 B_Intermediate L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 -626541 sc-eQTL 8.26e-01 -0.0165 0.0748 0.2 B_Intermediate L2
ENSG00000197442 MAP3K5 448196 sc-eQTL 8.30e-01 0.0194 0.0903 0.2 B_Intermediate L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 -627560 sc-eQTL 7.94e-01 -0.0277 0.106 0.2 B_Intermediate L2
ENSG00000027697 IFNGR1 21224 sc-eQTL 2.05e-01 -0.138 0.108 0.198 B_Memory L2
ENSG00000029363 BCLAF1 950822 sc-eQTL 3.97e-01 -0.0548 0.0645 0.198 B_Memory L2
ENSG00000112357 PEX7 418109 sc-eQTL 9.49e-01 0.00701 0.11 0.198 B_Memory L2
ENSG00000112378 PERP -866746 sc-eQTL 1.86e-01 0.137 0.103 0.198 B_Memory L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 -626541 sc-eQTL 5.12e-01 0.0467 0.0711 0.198 B_Memory L2
ENSG00000197442 MAP3K5 448196 sc-eQTL 5.60e-01 -0.0567 0.0971 0.198 B_Memory L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 -627560 sc-eQTL 7.00e-01 0.0408 0.106 0.198 B_Memory L2
ENSG00000027697 IFNGR1 21224 sc-eQTL 3.55e-01 -0.0784 0.0845 0.199 B_Naive1 L2
ENSG00000029363 BCLAF1 950822 sc-eQTL 5.77e-01 0.027 0.0484 0.199 B_Naive1 L2
ENSG00000112357 PEX7 418109 sc-eQTL 5.81e-01 -0.0618 0.112 0.199 B_Naive1 L2
ENSG00000112378 PERP -866746 sc-eQTL 1.10e-01 -0.156 0.0972 0.199 B_Naive1 L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 -626541 sc-eQTL 7.94e-01 0.0148 0.0567 0.199 B_Naive1 L2
ENSG00000197442 MAP3K5 448196 sc-eQTL 9.34e-01 -0.00656 0.0797 0.199 B_Naive1 L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 -627560 sc-eQTL 6.08e-01 0.0456 0.0888 0.199 B_Naive1 L2
ENSG00000027697 IFNGR1 21224 sc-eQTL 3.32e-01 -0.1 0.103 0.2 B_Naive2 L2
ENSG00000029363 BCLAF1 950822 sc-eQTL 1.87e-02 0.14 0.0593 0.2 B_Naive2 L2
ENSG00000112357 PEX7 418109 sc-eQTL 1.45e-01 0.165 0.113 0.2 B_Naive2 L2
ENSG00000112378 PERP -866746 sc-eQTL 6.37e-01 -0.039 0.0825 0.2 B_Naive2 L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 -626541 sc-eQTL 2.61e-01 -0.0926 0.0823 0.2 B_Naive2 L2
ENSG00000197442 MAP3K5 448196 sc-eQTL 3.63e-01 -0.08 0.0877 0.2 B_Naive2 L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 -627560 sc-eQTL 5.85e-01 -0.0583 0.107 0.2 B_Naive2 L2
ENSG00000027697 IFNGR1 21224 sc-eQTL 1.68e-01 -0.134 0.0973 0.198 CD4_CTL L2
ENSG00000029363 BCLAF1 950822 sc-eQTL 4.71e-01 -0.0625 0.0866 0.198 CD4_CTL L2
ENSG00000112357 PEX7 418109 sc-eQTL 5.63e-01 -0.0627 0.108 0.198 CD4_CTL L2
ENSG00000112378 PERP -866746 sc-eQTL 8.32e-01 -0.0233 0.11 0.198 CD4_CTL L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 -626541 sc-eQTL 9.64e-01 0.00286 0.0641 0.198 CD4_CTL L2
ENSG00000197442 MAP3K5 448196 sc-eQTL 9.86e-01 0.00181 0.102 0.198 CD4_CTL L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 -627560 sc-eQTL 1.56e-01 -0.141 0.0992 0.198 CD4_CTL L2
ENSG00000027697 IFNGR1 21224 sc-eQTL 9.18e-01 0.00562 0.0543 0.199 CD4_Naive L2
ENSG00000029363 BCLAF1 950822 sc-eQTL 5.71e-01 -0.0247 0.0436 0.199 CD4_Naive L2
ENSG00000112357 PEX7 418109 sc-eQTL 5.68e-01 -0.0586 0.102 0.199 CD4_Naive L2
ENSG00000112378 PERP -866746 sc-eQTL 8.37e-02 -0.146 0.084 0.199 CD4_Naive L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 -626541 sc-eQTL 7.76e-01 -0.0169 0.0593 0.199 CD4_Naive L2
ENSG00000197442 MAP3K5 448196 sc-eQTL 4.88e-01 -0.0302 0.0435 0.199 CD4_Naive L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 -627560 sc-eQTL 3.27e-02 -0.164 0.0761 0.199 CD4_Naive L2
ENSG00000027697 IFNGR1 21224 sc-eQTL 5.34e-01 -0.0461 0.074 0.199 CD4_TCM L2
ENSG00000029363 BCLAF1 950822 sc-eQTL 7.17e-02 -0.084 0.0464 0.199 CD4_TCM L2
ENSG00000112357 PEX7 418109 sc-eQTL 3.14e-01 -0.11 0.109 0.199 CD4_TCM L2
ENSG00000112378 PERP -866746 sc-eQTL 7.30e-01 -0.0318 0.0919 0.199 CD4_TCM L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 -626541 sc-eQTL 6.70e-01 -0.0228 0.0534 0.199 CD4_TCM L2
ENSG00000197442 MAP3K5 448196 sc-eQTL 6.53e-01 -0.0274 0.0608 0.199 CD4_TCM L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 -627560 sc-eQTL 1.59e-01 -0.105 0.0745 0.199 CD4_TCM L2
ENSG00000027697 IFNGR1 21224 sc-eQTL 8.44e-01 -0.0169 0.0854 0.199 CD4_TEM L2
ENSG00000029363 BCLAF1 950822 sc-eQTL 7.83e-01 0.0167 0.0606 0.199 CD4_TEM L2
ENSG00000112357 PEX7 418109 sc-eQTL 1.03e-01 0.179 0.11 0.199 CD4_TEM L2
ENSG00000112378 PERP -866746 sc-eQTL 8.39e-01 0.0182 0.0894 0.199 CD4_TEM L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 -626541 sc-eQTL 9.62e-01 0.00273 0.0567 0.199 CD4_TEM L2
ENSG00000197442 MAP3K5 448196 sc-eQTL 2.31e-01 -0.105 0.0873 0.199 CD4_TEM L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 -627560 sc-eQTL 4.45e-01 -0.0695 0.0909 0.199 CD4_TEM L2
ENSG00000027697 IFNGR1 21224 sc-eQTL 4.21e-01 0.0624 0.0775 0.199 CD8_CTL L2
ENSG00000029363 BCLAF1 950822 sc-eQTL 7.76e-01 -0.0148 0.0517 0.199 CD8_CTL L2
ENSG00000112357 PEX7 418109 sc-eQTL 8.04e-01 0.0265 0.107 0.199 CD8_CTL L2
ENSG00000112378 PERP -866746 sc-eQTL 7.45e-01 0.0335 0.103 0.199 CD8_CTL L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 -626541 sc-eQTL 4.32e-01 0.0513 0.0652 0.199 CD8_CTL L2
ENSG00000197442 MAP3K5 448196 sc-eQTL 7.06e-01 -0.0348 0.0921 0.199 CD8_CTL L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 -627560 sc-eQTL 6.58e-01 0.0407 0.0918 0.199 CD8_CTL L2
ENSG00000027697 IFNGR1 21224 sc-eQTL 4.76e-01 -0.0544 0.0761 0.199 CD8_Naive L2
ENSG00000029363 BCLAF1 950822 sc-eQTL 4.44e-01 0.0408 0.0531 0.199 CD8_Naive L2
ENSG00000112357 PEX7 418109 sc-eQTL 3.71e-01 -0.0988 0.11 0.199 CD8_Naive L2
ENSG00000112378 PERP -866746 sc-eQTL 3.79e-01 -0.0739 0.0838 0.199 CD8_Naive L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 -626541 sc-eQTL 9.80e-01 -0.00148 0.0596 0.199 CD8_Naive L2
ENSG00000197442 MAP3K5 448196 sc-eQTL 7.21e-01 -0.0252 0.0706 0.199 CD8_Naive L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 -627560 sc-eQTL 1.84e-01 -0.117 0.0878 0.199 CD8_Naive L2
ENSG00000027697 IFNGR1 21224 sc-eQTL 6.44e-01 -0.0474 0.102 0.197 CD8_TCM L2
ENSG00000029363 BCLAF1 950822 sc-eQTL 8.82e-01 -0.0114 0.0769 0.197 CD8_TCM L2
ENSG00000112357 PEX7 418109 sc-eQTL 8.21e-01 0.0267 0.118 0.197 CD8_TCM L2
ENSG00000112378 PERP -866746 sc-eQTL 7.70e-01 0.0337 0.115 0.197 CD8_TCM L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 -626541 sc-eQTL 1.72e-01 0.0758 0.0553 0.197 CD8_TCM L2
ENSG00000197442 MAP3K5 448196 sc-eQTL 8.45e-01 -0.0194 0.0991 0.197 CD8_TCM L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 -627560 sc-eQTL 4.33e-01 -0.0798 0.101 0.197 CD8_TCM L2
ENSG00000027697 IFNGR1 21224 sc-eQTL 9.57e-02 -0.164 0.0979 0.194 CD8_TEM L2
ENSG00000029363 BCLAF1 950822 sc-eQTL 6.53e-01 -0.0419 0.093 0.194 CD8_TEM L2
ENSG00000112357 PEX7 418109 sc-eQTL 9.64e-01 -0.00519 0.113 0.194 CD8_TEM L2
ENSG00000112378 PERP -866746 sc-eQTL 1.82e-01 -0.158 0.117 0.194 CD8_TEM L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 -626541 sc-eQTL 1.11e-01 0.116 0.0722 0.194 CD8_TEM L2
ENSG00000197442 MAP3K5 448196 sc-eQTL 6.49e-01 -0.0513 0.112 0.194 CD8_TEM L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 -627560 sc-eQTL 8.06e-01 0.0265 0.108 0.194 CD8_TEM L2
ENSG00000027697 IFNGR1 21224 sc-eQTL 1.97e-06 -0.366 0.0747 0.199 MAIT L2
ENSG00000029363 BCLAF1 950822 sc-eQTL 2.71e-01 -0.0721 0.0654 0.199 MAIT L2
ENSG00000112357 PEX7 418109 sc-eQTL 4.94e-01 0.0733 0.107 0.199 MAIT L2
ENSG00000112378 PERP -866746 sc-eQTL 6.75e-01 0.0469 0.112 0.199 MAIT L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 -626541 sc-eQTL 4.02e-01 0.0445 0.053 0.199 MAIT L2
ENSG00000146410 MTFR2 990338 sc-eQTL 3.15e-01 0.0889 0.0883 0.199 MAIT L2
ENSG00000197442 MAP3K5 448196 sc-eQTL 9.10e-01 0.0105 0.0925 0.199 MAIT L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 -627560 sc-eQTL 1.71e-01 -0.134 0.0978 0.199 MAIT L2
ENSG00000027697 IFNGR1 21224 sc-eQTL 1.55e-01 -0.123 0.0865 0.196 NK_CD56bright L2
ENSG00000029363 BCLAF1 950822 sc-eQTL 6.96e-01 0.0251 0.0641 0.196 NK_CD56bright L2
ENSG00000112357 PEX7 418109 sc-eQTL 2.58e-01 -0.128 0.113 0.196 NK_CD56bright L2
ENSG00000112378 PERP -866746 sc-eQTL 5.35e-01 -0.063 0.101 0.196 NK_CD56bright L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 -626541 sc-eQTL 7.64e-01 0.0194 0.0647 0.196 NK_CD56bright L2
ENSG00000197442 MAP3K5 448196 sc-eQTL 1.45e-01 -0.143 0.0979 0.196 NK_CD56bright L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 -627560 sc-eQTL 1.39e-01 -0.152 0.103 0.196 NK_CD56bright L2
ENSG00000027697 IFNGR1 21224 sc-eQTL 3.04e-01 -0.0689 0.0669 0.2 NK_CD56dim L2
ENSG00000029363 BCLAF1 950822 sc-eQTL 3.82e-01 0.0383 0.0437 0.2 NK_CD56dim L2
ENSG00000112357 PEX7 418109 sc-eQTL 3.90e-01 -0.0993 0.115 0.2 NK_CD56dim L2
ENSG00000112378 PERP -866746 sc-eQTL 6.95e-01 -0.0318 0.0812 0.2 NK_CD56dim L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 -626541 sc-eQTL 7.99e-01 -0.0161 0.0631 0.2 NK_CD56dim L2
ENSG00000197442 MAP3K5 448196 sc-eQTL 8.83e-01 0.0134 0.0909 0.2 NK_CD56dim L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 -627560 sc-eQTL 6.67e-01 -0.0408 0.0945 0.2 NK_CD56dim L2
ENSG00000027697 IFNGR1 21224 sc-eQTL 1.08e-01 -0.137 0.0847 0.208 NK_HLA L2
ENSG00000029363 BCLAF1 950822 sc-eQTL 7.64e-01 -0.0217 0.0722 0.208 NK_HLA L2
ENSG00000112357 PEX7 418109 sc-eQTL 1.61e-01 0.152 0.108 0.208 NK_HLA L2
ENSG00000112378 PERP -866746 sc-eQTL 7.83e-01 0.0242 0.0879 0.208 NK_HLA L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 -626541 sc-eQTL 3.60e-01 -0.0619 0.0675 0.208 NK_HLA L2
ENSG00000197442 MAP3K5 448196 sc-eQTL 5.18e-01 -0.0694 0.107 0.208 NK_HLA L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 -627560 sc-eQTL 9.84e-01 0.00215 0.109 0.208 NK_HLA L2
ENSG00000027697 IFNGR1 21224 sc-eQTL 2.21e-01 -0.0868 0.0707 0.2 NK_cytokine L2
ENSG00000029363 BCLAF1 950822 sc-eQTL 4.07e-01 -0.044 0.0529 0.2 NK_cytokine L2
ENSG00000112357 PEX7 418109 sc-eQTL 4.60e-02 0.222 0.11 0.2 NK_cytokine L2
ENSG00000112378 PERP -866746 sc-eQTL 9.46e-01 -0.0057 0.0845 0.2 NK_cytokine L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 -626541 sc-eQTL 9.86e-01 -0.00115 0.0634 0.2 NK_cytokine L2
ENSG00000197442 MAP3K5 448196 sc-eQTL 5.27e-01 -0.0551 0.087 0.2 NK_cytokine L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 -627560 sc-eQTL 9.06e-01 -0.0113 0.0955 0.2 NK_cytokine L2
ENSG00000027697 IFNGR1 21224 sc-eQTL 1.79e-01 0.178 0.132 0.174 PB L2
ENSG00000029363 BCLAF1 950822 sc-eQTL 9.52e-01 -0.00686 0.114 0.174 PB L2
ENSG00000112357 PEX7 418109 sc-eQTL 8.52e-01 0.0255 0.136 0.174 PB L2
ENSG00000112378 PERP -866746 sc-eQTL 1.36e-01 -0.126 0.0841 0.174 PB L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 -626541 sc-eQTL 9.49e-01 -0.00655 0.103 0.174 PB L2
ENSG00000197442 MAP3K5 448196 sc-eQTL 2.51e-01 -0.135 0.117 0.174 PB L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 -627560 sc-eQTL 6.48e-01 -0.0566 0.124 0.174 PB L2
ENSG00000027697 IFNGR1 21224 sc-eQTL 8.30e-01 -0.0186 0.0864 0.198 Pro_T L2
ENSG00000029363 BCLAF1 950822 sc-eQTL 5.27e-01 -0.0567 0.0895 0.198 Pro_T L2
ENSG00000112357 PEX7 418109 sc-eQTL 4.45e-01 -0.0803 0.105 0.198 Pro_T L2
ENSG00000112378 PERP -866746 sc-eQTL 4.67e-01 -0.0608 0.0834 0.198 Pro_T L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 -626541 sc-eQTL 3.16e-01 0.0528 0.0525 0.198 Pro_T L2
ENSG00000146410 MTFR2 990338 sc-eQTL 4.73e-01 -0.0524 0.0729 0.198 Pro_T L2
ENSG00000197442 MAP3K5 448196 sc-eQTL 2.32e-01 0.122 0.102 0.198 Pro_T L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 -627560 sc-eQTL 3.59e-01 -0.0937 0.102 0.198 Pro_T L2
ENSG00000027697 IFNGR1 21224 sc-eQTL 7.12e-01 -0.0371 0.1 0.199 Treg L2
ENSG00000029363 BCLAF1 950822 sc-eQTL 3.40e-01 -0.0619 0.0647 0.199 Treg L2
ENSG00000112357 PEX7 418109 sc-eQTL 2.20e-01 -0.13 0.106 0.199 Treg L2
ENSG00000112378 PERP -866746 sc-eQTL 5.56e-01 -0.0676 0.115 0.199 Treg L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 -626541 sc-eQTL 1.36e-01 0.0949 0.0635 0.199 Treg L2
ENSG00000197442 MAP3K5 448196 sc-eQTL 6.17e-01 0.0346 0.0691 0.199 Treg L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 -627560 sc-eQTL 2.52e-01 0.111 0.0971 0.199 Treg L2
ENSG00000027697 IFNGR1 21224 sc-eQTL 2.41e-01 -0.0977 0.083 0.205 cDC L2
ENSG00000029363 BCLAF1 950822 sc-eQTL 1.72e-01 -0.115 0.0835 0.205 cDC L2
ENSG00000112357 PEX7 418109 sc-eQTL 3.96e-01 0.0916 0.108 0.205 cDC L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 -626541 sc-eQTL 6.72e-01 -0.0348 0.0821 0.205 cDC L2
ENSG00000135525 MAP7 689854 sc-eQTL 4.49e-01 -0.0728 0.0959 0.205 cDC L2
ENSG00000197442 MAP3K5 448196 sc-eQTL 3.90e-01 -0.0727 0.0843 0.205 cDC L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 -627560 sc-eQTL 4.55e-01 -0.08 0.107 0.205 cDC L2
ENSG00000286646 AL121933.2 456628 sc-eQTL 2.77e-01 0.12 0.11 0.205 cDC L2
ENSG00000027697 IFNGR1 21224 sc-eQTL 6.27e-01 0.0296 0.0609 0.199 cMono_IL1B L2
ENSG00000029363 BCLAF1 950822 sc-eQTL 4.04e-01 0.0545 0.0652 0.199 cMono_IL1B L2
ENSG00000112357 PEX7 418109 sc-eQTL 5.76e-02 -0.207 0.109 0.199 cMono_IL1B L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 -626541 sc-eQTL 7.63e-02 0.116 0.0651 0.199 cMono_IL1B L2
ENSG00000135525 MAP7 689854 sc-eQTL 3.64e-01 -0.0856 0.0942 0.199 cMono_IL1B L2
ENSG00000197442 MAP3K5 448196 sc-eQTL 6.52e-01 -0.0308 0.0681 0.199 cMono_IL1B L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 -627560 sc-eQTL 3.71e-01 0.0627 0.0699 0.199 cMono_IL1B L2
ENSG00000286646 AL121933.2 456628 sc-eQTL 7.74e-01 -0.0252 0.0876 0.199 cMono_IL1B L2
ENSG00000027697 IFNGR1 21224 sc-eQTL 5.51e-01 -0.0418 0.0701 0.199 cMono_S100A L2
ENSG00000029363 BCLAF1 950822 sc-eQTL 6.47e-01 -0.0331 0.072 0.199 cMono_S100A L2
ENSG00000112357 PEX7 418109 sc-eQTL 2.04e-01 -0.143 0.112 0.199 cMono_S100A L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 -626541 sc-eQTL 3.07e-01 0.0636 0.0622 0.199 cMono_S100A L2
ENSG00000135525 MAP7 689854 sc-eQTL 3.08e-02 -0.226 0.104 0.199 cMono_S100A L2
ENSG00000197442 MAP3K5 448196 sc-eQTL 9.91e-02 0.14 0.0842 0.199 cMono_S100A L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 -627560 sc-eQTL 6.51e-01 -0.0406 0.0895 0.199 cMono_S100A L2
ENSG00000286646 AL121933.2 456628 sc-eQTL 6.61e-01 0.0383 0.0873 0.199 cMono_S100A L2
ENSG00000027697 IFNGR1 21224 sc-eQTL 5.94e-01 -0.0542 0.101 0.215 gdT L2
ENSG00000029363 BCLAF1 950822 sc-eQTL 3.77e-01 -0.0791 0.0892 0.215 gdT L2
ENSG00000112357 PEX7 418109 sc-eQTL 4.71e-01 -0.0929 0.128 0.215 gdT L2
ENSG00000112378 PERP -866746 sc-eQTL 7.67e-02 0.198 0.111 0.215 gdT L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 -626541 sc-eQTL 1.73e-01 0.085 0.0621 0.215 gdT L2
ENSG00000146410 MTFR2 990338 sc-eQTL 4.82e-01 -0.0694 0.0984 0.215 gdT L2
ENSG00000197442 MAP3K5 448196 sc-eQTL 9.80e-02 0.218 0.131 0.215 gdT L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 -627560 sc-eQTL 6.12e-01 -0.0574 0.113 0.215 gdT L2
ENSG00000027697 IFNGR1 21224 sc-eQTL 4.82e-01 0.0527 0.0748 0.2 intMono L2
ENSG00000029363 BCLAF1 950822 sc-eQTL 2.10e-01 -0.124 0.0985 0.2 intMono L2
ENSG00000112357 PEX7 418109 sc-eQTL 1.09e-01 -0.161 0.1 0.2 intMono L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 -626541 sc-eQTL 2.12e-01 0.0806 0.0644 0.2 intMono L2
ENSG00000135525 MAP7 689854 sc-eQTL 6.01e-01 0.052 0.0993 0.2 intMono L2
ENSG00000197442 MAP3K5 448196 sc-eQTL 1.20e-01 -0.163 0.105 0.2 intMono L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 -627560 sc-eQTL 8.81e-01 -0.0145 0.0963 0.2 intMono L2
ENSG00000286646 AL121933.2 456628 sc-eQTL 2.91e-01 -0.117 0.111 0.2 intMono L2
ENSG00000027697 IFNGR1 21224 sc-eQTL 7.84e-01 -0.0239 0.087 0.197 ncMono L2
ENSG00000029363 BCLAF1 950822 sc-eQTL 8.77e-01 0.0104 0.0676 0.197 ncMono L2
ENSG00000112357 PEX7 418109 sc-eQTL 5.04e-01 -0.0721 0.108 0.197 ncMono L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 -626541 sc-eQTL 1.05e-01 0.125 0.0765 0.197 ncMono L2
ENSG00000135525 MAP7 689854 sc-eQTL 9.89e-01 0.00137 0.0952 0.197 ncMono L2
ENSG00000197442 MAP3K5 448196 sc-eQTL 1.40e-01 0.148 0.0995 0.197 ncMono L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 -627560 sc-eQTL 5.60e-01 0.0563 0.0963 0.197 ncMono L2
ENSG00000286646 AL121933.2 456628 sc-eQTL 6.69e-01 -0.0434 0.102 0.197 ncMono L2
ENSG00000027697 IFNGR1 21224 sc-eQTL 5.51e-01 -0.0584 0.0977 0.212 pDC L2
ENSG00000029363 BCLAF1 950822 sc-eQTL 4.77e-01 0.0522 0.0733 0.212 pDC L2
ENSG00000112357 PEX7 418109 sc-eQTL 9.41e-01 0.00797 0.108 0.212 pDC L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 -626541 sc-eQTL 3.31e-02 0.192 0.0894 0.212 pDC L2
ENSG00000135525 MAP7 689854 sc-eQTL 9.56e-01 -0.0042 0.0752 0.212 pDC L2
ENSG00000197442 MAP3K5 448196 sc-eQTL 8.13e-01 0.0285 0.12 0.212 pDC L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 -627560 sc-eQTL 6.86e-01 -0.0373 0.092 0.212 pDC L2
ENSG00000286646 AL121933.2 456628 sc-eQTL 6.98e-01 0.0431 0.111 0.212 pDC L2
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000027697 IFNGR1 21224 sc-eQTL 9.81e-03 -0.228 0.0874 0.199 B_Memory LOneK1K
ENSG00000029363 BCLAF1 950822 sc-eQTL 1.63e-01 -0.0694 0.0496 0.199 B_Memory LOneK1K
ENSG00000112357 PEX7 418109 sc-eQTL 6.11e-01 0.0519 0.102 0.199 B_Memory LOneK1K
ENSG00000112378 PERP -866746 sc-eQTL 2.78e-01 0.103 0.0946 0.199 B_Memory LOneK1K
ENSG00000118503 TNFAIP3 -626541 sc-eQTL 7.73e-01 -0.0181 0.0626 0.199 B_Memory LOneK1K
ENSG00000197442 MAP3K5 448196 sc-eQTL 7.88e-01 0.0223 0.0829 0.199 B_Memory LOneK1K
ENSG00000237499 WAKMAR2 -627560 sc-eQTL 9.01e-01 0.0132 0.106 0.199 B_Memory LOneK1K
ENSG00000027697 IFNGR1 21224 sc-eQTL 1.76e-01 -0.121 0.0891 0.199 B_Naive LOneK1K
ENSG00000029363 BCLAF1 950822 sc-eQTL 9.85e-02 0.0678 0.0408 0.199 B_Naive LOneK1K
ENSG00000112357 PEX7 418109 sc-eQTL 6.09e-01 0.0557 0.109 0.199 B_Naive LOneK1K
ENSG00000112378 PERP -866746 sc-eQTL 1.29e-01 -0.148 0.097 0.199 B_Naive LOneK1K
ENSG00000118503 TNFAIP3 -626541 sc-eQTL 7.35e-01 -0.0173 0.0512 0.199 B_Naive LOneK1K
ENSG00000197442 MAP3K5 448196 sc-eQTL 2.31e-01 -0.0898 0.0748 0.199 B_Naive LOneK1K
ENSG00000237499 WAKMAR2 -627560 sc-eQTL 9.41e-01 0.0068 0.0912 0.199 B_Naive LOneK1K
ENSG00000027697 IFNGR1 21224 sc-eQTL 9.32e-01 -0.00531 0.0619 0.199 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000029363 BCLAF1 950822 sc-eQTL 4.93e-01 0.0396 0.0576 0.199 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000112357 PEX7 418109 sc-eQTL 5.10e-02 -0.216 0.11 0.199 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000118503 TNFAIP3 -626541 sc-eQTL 1.87e-01 0.0755 0.057 0.199 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000135525 MAP7 689854 sc-eQTL 1.13e-01 -0.157 0.0988 0.199 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000197442 MAP3K5 448196 sc-eQTL 5.49e-01 0.0403 0.0671 0.199 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000237499 WAKMAR2 -627560 sc-eQTL 5.41e-01 0.0419 0.0686 0.199 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000286646 AL121933.2 456628 sc-eQTL 8.23e-01 -0.0179 0.0799 0.199 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000027697 IFNGR1 21224 sc-eQTL 8.89e-01 -0.00999 0.0716 0.2 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000029363 BCLAF1 950822 sc-eQTL 7.28e-01 -0.0225 0.0647 0.2 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000112357 PEX7 418109 sc-eQTL 3.46e-01 -0.102 0.108 0.2 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000118503 TNFAIP3 -626541 sc-eQTL 1.70e-02 0.159 0.066 0.2 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000135525 MAP7 689854 sc-eQTL 7.77e-01 0.0297 0.104 0.2 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000197442 MAP3K5 448196 sc-eQTL 7.62e-01 0.026 0.0858 0.2 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000237499 WAKMAR2 -627560 sc-eQTL 9.19e-01 0.00909 0.0897 0.2 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000286646 AL121933.2 456628 sc-eQTL 2.34e-01 -0.121 0.101 0.2 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000027697 IFNGR1 21224 sc-eQTL 1.72e-01 -0.0935 0.0682 0.2 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000029363 BCLAF1 950822 sc-eQTL 6.69e-01 0.017 0.0397 0.2 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000112357 PEX7 418109 sc-eQTL 5.21e-01 0.0742 0.115 0.2 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000112378 PERP -866746 sc-eQTL 2.95e-01 -0.075 0.0715 0.2 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000118503 TNFAIP3 -626541 sc-eQTL 6.91e-01 -0.0248 0.0624 0.2 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000197442 MAP3K5 448196 sc-eQTL 6.45e-01 -0.0389 0.0843 0.2 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000237499 WAKMAR2 -627560 sc-eQTL 9.94e-01 -0.000631 0.0873 0.2 NK_CD56dim LOneK1K

Statistical fine-mapping results from Japan COVID-19 Task Force
(Shown only for PIP>0.001)
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
PIP (SuSiE)
PIP (FINEMAP)
MAF
ENSG00000027697 IFNGR1 21224 pQTL 0.0175 -0.0443 0.0186 0.0 0.0 0.21
ENSG00000027697 IFNGR1 21224 eQTL 4.65e-06 -0.0736 0.016 0.0 0.0 0.202

Expression Modifier Score(EMS) for GTEx 49tissues
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Whole Blood
Muscle Skeletal
Liver
Brain Cerebellum
Prostate
Spleen
Skin Sun Exposed Lower leg
Artery Coronary
Esophagus Muscularis
Esophagus Gastroesophageal Junction
Artery Tibial
Heart Atrial Appendage
Nerve Tibial
Heart Left Ventricle
Adrenal Gland
Adipose Visceral Omentum
Pancreas
Lung
Pituitary
Brain Nucleus accumbens basal ganglia
Colon Transverse
Adipose Subcutaneous
Esophagus Mucosa
Brain Cortex
Thyroid
Stomach
Breast Mammary Tissue
Colon Sigmoid
Skin Not Sun Exposed Suprapubic
Testis
Artery Aorta
Brain Amygdala
Brain Anterior cingulate cortex BA24
Brain Caudate basal ganglia
Brain Cerebellar Hemisphere
Brain Frontal Cortex BA9
Brain Hippocampus
Brain Hypothalamus
Brain Putamen basal ganglia
Brain Spinal cord cervical c-1
Brain Substantia nigra
Cells Cultured fibroblasts
Cells EBV-transformed lymphocytes
Kidney Cortex
Minor Salivary Gland
Ovary
Small Intestine Terminal Ileum
Uterus
Vagina
ENSG00000027697 IFNGR1 21224 0.000142 7.62e-05 6.95e-06 1.21e-05 8.4e-06 2.19e-05 9.17e-05 3.67e-06 4.17e-05 1.03e-05 8.56e-05 1.65e-05 0.000109 1.54e-05 1.99e-05 4.35e-05 1.43e-05 4.02e-05 6.61e-06 5.93e-06 1.52e-05 0.000135 6.39e-05 7.57e-06 5.65e-05 5.34e-06 2.82e-05 1.18e-05 6.58e-05 1.67e-05 2.34e-05 9.89e-07 2.23e-06 6.04e-06 9.49e-06 4.46e-06 1.68e-06 3.19e-06 3.92e-06 2.93e-06 1.67e-06 0.000243 1.06e-05 2.1e-07 1.97e-06 7.07e-06 3.4e-06 7.73e-07 6.16e-07
ENSG00000237499 \N -627560 2.66e-07 1.08e-07 3.41e-08 1.67e-07 1.03e-07 9.14e-08 1.39e-07 5.29e-08 1.32e-07 3.99e-08 1.63e-07 7.49e-08 1.23e-07 6.1e-08 4.77e-08 7.76e-08 5.15e-08 1.06e-07 4.91e-08 2.93e-08 1.04e-07 1.31e-07 1.31e-07 5.23e-08 1.33e-07 1.03e-07 1.12e-07 8.27e-08 1.05e-07 1.09e-07 9.5e-08 3.29e-08 2.6e-08 8.09e-08 9.88e-08 4.23e-08 3.84e-08 8.48e-08 8.44e-08 3.87e-08 2.6e-08 1.33e-07 4.34e-08 0.0 1.15e-07 1.83e-08 1.5e-07 4.96e-09 4.72e-08