logo

Genes within 1Mb (chr6:137239158:G:A):

View on , UCSC , GTEx , gnomAD

Immune cell-type specific single cell cis-eQTLs in OASIS
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000027697 IFNGR1 19709 sc-eQTL 3.51e-02 -0.177 0.0833 0.203 B L1
ENSG00000029363 BCLAF1 949307 sc-eQTL 6.57e-01 0.0167 0.0375 0.203 B L1
ENSG00000112357 PEX7 416594 sc-eQTL 3.99e-01 0.0841 0.0995 0.203 B L1
ENSG00000112378 PERP -868261 sc-eQTL 9.14e-01 -0.00715 0.066 0.203 B L1
ENSG00000118503 TNFAIP3 -628056 sc-eQTL 7.85e-01 -0.0145 0.0531 0.203 B L1
ENSG00000197442 MAP3K5 446681 sc-eQTL 3.28e-01 -0.0725 0.0739 0.203 B L1
ENSG00000237499 WAKMAR2 -629075 sc-eQTL 8.32e-01 -0.0177 0.0836 0.203 B L1
ENSG00000027697 IFNGR1 19709 sc-eQTL 5.34e-01 -0.0352 0.0566 0.203 CD4T L1
ENSG00000029363 BCLAF1 949307 sc-eQTL 3.67e-01 -0.0386 0.0428 0.203 CD4T L1
ENSG00000112357 PEX7 416594 sc-eQTL 1.66e-01 -0.126 0.0908 0.203 CD4T L1
ENSG00000112378 PERP -868261 sc-eQTL 2.90e-01 -0.0648 0.061 0.203 CD4T L1
ENSG00000118503 TNFAIP3 -628056 sc-eQTL 5.75e-01 -0.0322 0.0573 0.203 CD4T L1
ENSG00000197442 MAP3K5 446681 sc-eQTL 4.92e-01 -0.03 0.0436 0.203 CD4T L1
ENSG00000237499 WAKMAR2 -629075 sc-eQTL 5.33e-02 -0.139 0.0716 0.203 CD4T L1
ENSG00000027697 IFNGR1 19709 sc-eQTL 3.59e-01 -0.0585 0.0637 0.203 CD8T L1
ENSG00000029363 BCLAF1 949307 sc-eQTL 5.87e-01 0.0235 0.0432 0.203 CD8T L1
ENSG00000112357 PEX7 416594 sc-eQTL 4.37e-01 -0.0828 0.106 0.203 CD8T L1
ENSG00000112378 PERP -868261 sc-eQTL 8.46e-01 0.0135 0.0696 0.203 CD8T L1
ENSG00000118503 TNFAIP3 -628056 sc-eQTL 4.38e-01 0.0416 0.0536 0.203 CD8T L1
ENSG00000197442 MAP3K5 446681 sc-eQTL 6.78e-01 -0.0236 0.0567 0.203 CD8T L1
ENSG00000237499 WAKMAR2 -629075 sc-eQTL 1.82e-01 -0.105 0.0786 0.203 CD8T L1
ENSG00000027697 IFNGR1 19709 sc-eQTL 1.74e-01 -0.102 0.0746 0.207 DC L1
ENSG00000029363 BCLAF1 949307 sc-eQTL 5.04e-01 -0.0451 0.0674 0.207 DC L1
ENSG00000112357 PEX7 416594 sc-eQTL 4.89e-01 0.073 0.105 0.207 DC L1
ENSG00000118503 TNFAIP3 -628056 sc-eQTL 6.50e-01 0.0363 0.0801 0.207 DC L1
ENSG00000135525 MAP7 688339 sc-eQTL 4.58e-01 -0.0644 0.0866 0.207 DC L1
ENSG00000197442 MAP3K5 446681 sc-eQTL 3.99e-01 -0.0701 0.083 0.207 DC L1
ENSG00000237499 WAKMAR2 -629075 sc-eQTL 7.92e-01 0.0215 0.0816 0.207 DC L1
ENSG00000286646 AL121933.2 455113 sc-eQTL 7.48e-01 0.0349 0.108 0.207 DC L1
ENSG00000027697 IFNGR1 19709 sc-eQTL 8.20e-01 -0.0148 0.0651 0.203 Mono L1
ENSG00000029363 BCLAF1 949307 sc-eQTL 7.63e-01 0.0168 0.0556 0.203 Mono L1
ENSG00000112357 PEX7 416594 sc-eQTL 5.35e-02 -0.211 0.109 0.203 Mono L1
ENSG00000118503 TNFAIP3 -628056 sc-eQTL 2.76e-01 0.0601 0.0551 0.203 Mono L1
ENSG00000135525 MAP7 688339 sc-eQTL 4.74e-01 -0.0692 0.0965 0.203 Mono L1
ENSG00000197442 MAP3K5 446681 sc-eQTL 6.13e-01 0.0327 0.0644 0.203 Mono L1
ENSG00000237499 WAKMAR2 -629075 sc-eQTL 3.14e-01 0.0689 0.0682 0.203 Mono L1
ENSG00000286646 AL121933.2 455113 sc-eQTL 8.81e-01 0.0117 0.078 0.203 Mono L1
ENSG00000027697 IFNGR1 19709 sc-eQTL 9.41e-02 -0.12 0.0713 0.204 NK L1
ENSG00000029363 BCLAF1 949307 sc-eQTL 8.33e-01 0.00806 0.0381 0.204 NK L1
ENSG00000112357 PEX7 416594 sc-eQTL 9.91e-01 0.0012 0.111 0.204 NK L1
ENSG00000112378 PERP -868261 sc-eQTL 1.22e-01 -0.108 0.0694 0.204 NK L1
ENSG00000118503 TNFAIP3 -628056 sc-eQTL 6.40e-01 -0.028 0.0597 0.204 NK L1
ENSG00000197442 MAP3K5 446681 sc-eQTL 7.04e-01 -0.0326 0.0856 0.204 NK L1
ENSG00000237499 WAKMAR2 -629075 sc-eQTL 8.06e-01 -0.0208 0.0847 0.204 NK L1
ENSG00000027697 IFNGR1 19709 sc-eQTL 6.30e-04 -0.223 0.0644 0.203 Other_T L1
ENSG00000029363 BCLAF1 949307 sc-eQTL 1.50e-01 -0.0797 0.0552 0.203 Other_T L1
ENSG00000112357 PEX7 416594 sc-eQTL 5.30e-01 -0.0677 0.108 0.203 Other_T L1
ENSG00000112378 PERP -868261 sc-eQTL 8.01e-01 0.0218 0.0866 0.203 Other_T L1
ENSG00000118503 TNFAIP3 -628056 sc-eQTL 2.39e-01 0.0485 0.0411 0.203 Other_T L1
ENSG00000146410 MTFR2 988823 sc-eQTL 5.09e-01 -0.0412 0.0623 0.203 Other_T L1
ENSG00000197442 MAP3K5 446681 sc-eQTL 9.69e-01 -0.00308 0.0795 0.203 Other_T L1
ENSG00000237499 WAKMAR2 -629075 sc-eQTL 1.72e-01 -0.111 0.0814 0.203 Other_T L1
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000027697 IFNGR1 19709 sc-eQTL 1.20e-01 -0.17 0.109 0.194 B_Activated L2
ENSG00000029363 BCLAF1 949307 sc-eQTL 6.14e-01 0.0449 0.0887 0.194 B_Activated L2
ENSG00000112357 PEX7 416594 sc-eQTL 5.72e-01 -0.0609 0.107 0.194 B_Activated L2
ENSG00000112378 PERP -868261 sc-eQTL 7.58e-01 0.0172 0.0557 0.194 B_Activated L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 -628056 sc-eQTL 6.30e-01 0.0521 0.108 0.194 B_Activated L2
ENSG00000197442 MAP3K5 446681 sc-eQTL 9.04e-01 -0.0145 0.121 0.194 B_Activated L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 -629075 sc-eQTL 8.87e-01 -0.0135 0.0943 0.194 B_Activated L2
ENSG00000027697 IFNGR1 19709 sc-eQTL 8.70e-02 -0.168 0.0977 0.204 B_Intermediate L2
ENSG00000029363 BCLAF1 949307 sc-eQTL 3.34e-01 -0.0541 0.0559 0.204 B_Intermediate L2
ENSG00000112357 PEX7 416594 sc-eQTL 2.01e-01 0.132 0.103 0.204 B_Intermediate L2
ENSG00000112378 PERP -868261 sc-eQTL 7.18e-01 -0.0339 0.0938 0.204 B_Intermediate L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 -628056 sc-eQTL 6.50e-01 -0.0335 0.0736 0.204 B_Intermediate L2
ENSG00000197442 MAP3K5 446681 sc-eQTL 6.25e-01 0.0435 0.089 0.204 B_Intermediate L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 -629075 sc-eQTL 6.62e-01 -0.0457 0.104 0.204 B_Intermediate L2
ENSG00000027697 IFNGR1 19709 sc-eQTL 1.36e-01 -0.16 0.107 0.203 B_Memory L2
ENSG00000029363 BCLAF1 949307 sc-eQTL 4.95e-01 -0.0434 0.0635 0.203 B_Memory L2
ENSG00000112357 PEX7 416594 sc-eQTL 9.25e-01 -0.0102 0.108 0.203 B_Memory L2
ENSG00000112378 PERP -868261 sc-eQTL 1.36e-01 0.151 0.101 0.203 B_Memory L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 -628056 sc-eQTL 5.31e-01 0.0439 0.07 0.203 B_Memory L2
ENSG00000197442 MAP3K5 446681 sc-eQTL 3.55e-01 -0.0885 0.0955 0.203 B_Memory L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 -629075 sc-eQTL 6.68e-01 0.0448 0.104 0.203 B_Memory L2
ENSG00000027697 IFNGR1 19709 sc-eQTL 3.85e-01 -0.0727 0.0834 0.203 B_Naive1 L2
ENSG00000029363 BCLAF1 949307 sc-eQTL 7.29e-01 0.0165 0.0477 0.203 B_Naive1 L2
ENSG00000112357 PEX7 416594 sc-eQTL 6.66e-01 -0.0476 0.11 0.203 B_Naive1 L2
ENSG00000112378 PERP -868261 sc-eQTL 1.43e-01 -0.141 0.0959 0.203 B_Naive1 L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 -628056 sc-eQTL 9.14e-01 0.00606 0.0559 0.203 B_Naive1 L2
ENSG00000197442 MAP3K5 446681 sc-eQTL 9.93e-01 -0.000646 0.0786 0.203 B_Naive1 L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 -629075 sc-eQTL 7.80e-01 0.0245 0.0876 0.203 B_Naive1 L2
ENSG00000027697 IFNGR1 19709 sc-eQTL 2.69e-01 -0.113 0.102 0.204 B_Naive2 L2
ENSG00000029363 BCLAF1 949307 sc-eQTL 3.01e-02 0.128 0.0586 0.204 B_Naive2 L2
ENSG00000112357 PEX7 416594 sc-eQTL 1.39e-01 0.165 0.111 0.204 B_Naive2 L2
ENSG00000112378 PERP -868261 sc-eQTL 5.48e-01 -0.0489 0.0813 0.204 B_Naive2 L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 -628056 sc-eQTL 3.09e-01 -0.0828 0.0812 0.204 B_Naive2 L2
ENSG00000197442 MAP3K5 446681 sc-eQTL 2.99e-01 -0.0899 0.0864 0.204 B_Naive2 L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 -629075 sc-eQTL 4.68e-01 -0.0764 0.105 0.204 B_Naive2 L2
ENSG00000027697 IFNGR1 19709 sc-eQTL 1.24e-01 -0.148 0.0955 0.202 CD4_CTL L2
ENSG00000029363 BCLAF1 949307 sc-eQTL 5.18e-01 -0.0551 0.0852 0.202 CD4_CTL L2
ENSG00000112357 PEX7 416594 sc-eQTL 4.58e-01 -0.0792 0.106 0.202 CD4_CTL L2
ENSG00000112378 PERP -868261 sc-eQTL 8.07e-01 -0.0265 0.108 0.202 CD4_CTL L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 -628056 sc-eQTL 8.41e-01 -0.0126 0.063 0.202 CD4_CTL L2
ENSG00000197442 MAP3K5 446681 sc-eQTL 9.78e-01 0.00278 0.101 0.202 CD4_CTL L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 -629075 sc-eQTL 1.68e-01 -0.135 0.0976 0.202 CD4_CTL L2
ENSG00000027697 IFNGR1 19709 sc-eQTL 7.16e-01 0.0195 0.0535 0.203 CD4_Naive L2
ENSG00000029363 BCLAF1 949307 sc-eQTL 3.99e-01 -0.0363 0.0429 0.203 CD4_Naive L2
ENSG00000112357 PEX7 416594 sc-eQTL 5.92e-01 -0.0542 0.101 0.203 CD4_Naive L2
ENSG00000112378 PERP -868261 sc-eQTL 9.76e-02 -0.138 0.0829 0.203 CD4_Naive L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 -628056 sc-eQTL 5.57e-01 -0.0344 0.0585 0.203 CD4_Naive L2
ENSG00000197442 MAP3K5 446681 sc-eQTL 6.09e-01 -0.022 0.043 0.203 CD4_Naive L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 -629075 sc-eQTL 2.43e-02 -0.17 0.0749 0.203 CD4_Naive L2
ENSG00000027697 IFNGR1 19709 sc-eQTL 7.33e-01 -0.025 0.073 0.203 CD4_TCM L2
ENSG00000029363 BCLAF1 949307 sc-eQTL 6.05e-02 -0.0863 0.0457 0.203 CD4_TCM L2
ENSG00000112357 PEX7 416594 sc-eQTL 2.00e-01 -0.137 0.107 0.203 CD4_TCM L2
ENSG00000112378 PERP -868261 sc-eQTL 6.97e-01 -0.0353 0.0906 0.203 CD4_TCM L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 -628056 sc-eQTL 4.47e-01 -0.04 0.0525 0.203 CD4_TCM L2
ENSG00000197442 MAP3K5 446681 sc-eQTL 8.52e-01 -0.0112 0.0599 0.203 CD4_TCM L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 -629075 sc-eQTL 1.36e-01 -0.11 0.0733 0.203 CD4_TCM L2
ENSG00000027697 IFNGR1 19709 sc-eQTL 8.23e-01 -0.0189 0.0842 0.203 CD4_TEM L2
ENSG00000029363 BCLAF1 949307 sc-eQTL 9.61e-01 -0.00291 0.0597 0.203 CD4_TEM L2
ENSG00000112357 PEX7 416594 sc-eQTL 1.28e-01 0.165 0.108 0.203 CD4_TEM L2
ENSG00000112378 PERP -868261 sc-eQTL 9.60e-01 0.00441 0.0881 0.203 CD4_TEM L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 -628056 sc-eQTL 9.95e-01 0.000377 0.0559 0.203 CD4_TEM L2
ENSG00000197442 MAP3K5 446681 sc-eQTL 1.81e-01 -0.115 0.086 0.203 CD4_TEM L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 -629075 sc-eQTL 5.71e-01 -0.0508 0.0896 0.203 CD4_TEM L2
ENSG00000027697 IFNGR1 19709 sc-eQTL 4.62e-01 0.0566 0.0768 0.203 CD8_CTL L2
ENSG00000029363 BCLAF1 949307 sc-eQTL 7.83e-01 -0.0142 0.0513 0.203 CD8_CTL L2
ENSG00000112357 PEX7 416594 sc-eQTL 9.20e-01 0.0107 0.106 0.203 CD8_CTL L2
ENSG00000112378 PERP -868261 sc-eQTL 7.45e-01 0.0331 0.102 0.203 CD8_CTL L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 -628056 sc-eQTL 5.85e-01 0.0354 0.0647 0.203 CD8_CTL L2
ENSG00000197442 MAP3K5 446681 sc-eQTL 6.37e-01 -0.0431 0.0913 0.203 CD8_CTL L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 -629075 sc-eQTL 4.98e-01 0.0617 0.0909 0.203 CD8_CTL L2
ENSG00000027697 IFNGR1 19709 sc-eQTL 4.48e-01 -0.0572 0.0752 0.203 CD8_Naive L2
ENSG00000029363 BCLAF1 949307 sc-eQTL 4.86e-01 0.0366 0.0525 0.203 CD8_Naive L2
ENSG00000112357 PEX7 416594 sc-eQTL 4.60e-01 -0.0806 0.109 0.203 CD8_Naive L2
ENSG00000112378 PERP -868261 sc-eQTL 3.51e-01 -0.0774 0.0828 0.203 CD8_Naive L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 -628056 sc-eQTL 7.53e-01 -0.0185 0.0589 0.203 CD8_Naive L2
ENSG00000197442 MAP3K5 446681 sc-eQTL 7.34e-01 -0.0237 0.0698 0.203 CD8_Naive L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 -629075 sc-eQTL 1.04e-01 -0.141 0.0865 0.203 CD8_Naive L2
ENSG00000027697 IFNGR1 19709 sc-eQTL 5.31e-01 -0.0644 0.102 0.199 CD8_TCM L2
ENSG00000029363 BCLAF1 949307 sc-eQTL 9.08e-01 -0.00888 0.077 0.199 CD8_TCM L2
ENSG00000112357 PEX7 416594 sc-eQTL 9.50e-01 0.00737 0.118 0.199 CD8_TCM L2
ENSG00000112378 PERP -868261 sc-eQTL 8.47e-01 0.0223 0.115 0.199 CD8_TCM L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 -628056 sc-eQTL 1.93e-01 0.0723 0.0553 0.199 CD8_TCM L2
ENSG00000197442 MAP3K5 446681 sc-eQTL 9.10e-01 -0.0112 0.0992 0.199 CD8_TCM L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 -629075 sc-eQTL 4.46e-01 -0.0775 0.102 0.199 CD8_TCM L2
ENSG00000027697 IFNGR1 19709 sc-eQTL 5.65e-02 -0.184 0.096 0.199 CD8_TEM L2
ENSG00000029363 BCLAF1 949307 sc-eQTL 7.21e-01 -0.0327 0.0914 0.199 CD8_TEM L2
ENSG00000112357 PEX7 416594 sc-eQTL 9.71e-01 -0.0041 0.112 0.199 CD8_TEM L2
ENSG00000112378 PERP -868261 sc-eQTL 1.65e-01 -0.161 0.115 0.199 CD8_TEM L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 -628056 sc-eQTL 1.27e-01 0.109 0.0711 0.199 CD8_TEM L2
ENSG00000197442 MAP3K5 446681 sc-eQTL 7.73e-01 -0.0319 0.111 0.199 CD8_TEM L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 -629075 sc-eQTL 6.57e-01 0.0471 0.106 0.199 CD8_TEM L2
ENSG00000027697 IFNGR1 19709 sc-eQTL 1.31e-06 -0.367 0.0737 0.203 MAIT L2
ENSG00000029363 BCLAF1 949307 sc-eQTL 2.81e-01 -0.0699 0.0646 0.203 MAIT L2
ENSG00000112357 PEX7 416594 sc-eQTL 6.31e-01 0.0508 0.106 0.203 MAIT L2
ENSG00000112378 PERP -868261 sc-eQTL 9.02e-01 0.0136 0.11 0.203 MAIT L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 -628056 sc-eQTL 5.38e-01 0.0323 0.0524 0.203 MAIT L2
ENSG00000146410 MTFR2 988823 sc-eQTL 3.71e-01 0.0782 0.0872 0.203 MAIT L2
ENSG00000197442 MAP3K5 446681 sc-eQTL 6.62e-01 0.04 0.0913 0.203 MAIT L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 -629075 sc-eQTL 2.34e-01 -0.115 0.0966 0.203 MAIT L2
ENSG00000027697 IFNGR1 19709 sc-eQTL 9.26e-02 -0.143 0.0846 0.2 NK_CD56bright L2
ENSG00000029363 BCLAF1 949307 sc-eQTL 8.64e-01 0.0108 0.0629 0.2 NK_CD56bright L2
ENSG00000112357 PEX7 416594 sc-eQTL 3.05e-01 -0.114 0.111 0.2 NK_CD56bright L2
ENSG00000112378 PERP -868261 sc-eQTL 5.00e-01 -0.0672 0.0994 0.2 NK_CD56bright L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 -628056 sc-eQTL 9.48e-01 0.00416 0.0634 0.2 NK_CD56bright L2
ENSG00000197442 MAP3K5 446681 sc-eQTL 1.34e-01 -0.144 0.096 0.2 NK_CD56bright L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 -629075 sc-eQTL 9.05e-02 -0.171 0.1 0.2 NK_CD56bright L2
ENSG00000027697 IFNGR1 19709 sc-eQTL 3.75e-01 -0.0592 0.0666 0.205 NK_CD56dim L2
ENSG00000029363 BCLAF1 949307 sc-eQTL 3.89e-01 0.0376 0.0435 0.205 NK_CD56dim L2
ENSG00000112357 PEX7 416594 sc-eQTL 4.33e-01 -0.0901 0.115 0.205 NK_CD56dim L2
ENSG00000112378 PERP -868261 sc-eQTL 5.19e-01 -0.0522 0.0808 0.205 NK_CD56dim L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 -628056 sc-eQTL 7.04e-01 -0.0239 0.0629 0.205 NK_CD56dim L2
ENSG00000197442 MAP3K5 446681 sc-eQTL 9.49e-01 0.00578 0.0905 0.205 NK_CD56dim L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 -629075 sc-eQTL 5.92e-01 -0.0505 0.0941 0.205 NK_CD56dim L2
ENSG00000027697 IFNGR1 19709 sc-eQTL 8.00e-02 -0.147 0.0835 0.212 NK_HLA L2
ENSG00000029363 BCLAF1 949307 sc-eQTL 6.69e-01 -0.0305 0.0712 0.212 NK_HLA L2
ENSG00000112357 PEX7 416594 sc-eQTL 1.30e-01 0.161 0.106 0.212 NK_HLA L2
ENSG00000112378 PERP -868261 sc-eQTL 9.45e-01 0.00595 0.0867 0.212 NK_HLA L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 -628056 sc-eQTL 3.13e-01 -0.0673 0.0665 0.212 NK_HLA L2
ENSG00000197442 MAP3K5 446681 sc-eQTL 6.84e-01 -0.0431 0.106 0.212 NK_HLA L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 -629075 sc-eQTL 7.67e-01 0.0319 0.107 0.212 NK_HLA L2
ENSG00000027697 IFNGR1 19709 sc-eQTL 2.04e-01 -0.0893 0.0701 0.205 NK_cytokine L2
ENSG00000029363 BCLAF1 949307 sc-eQTL 1.64e-01 -0.0729 0.0523 0.205 NK_cytokine L2
ENSG00000112357 PEX7 416594 sc-eQTL 9.18e-02 0.186 0.11 0.205 NK_cytokine L2
ENSG00000112378 PERP -868261 sc-eQTL 9.42e-01 0.00614 0.0838 0.205 NK_cytokine L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 -628056 sc-eQTL 9.34e-01 -0.00521 0.0628 0.205 NK_cytokine L2
ENSG00000197442 MAP3K5 446681 sc-eQTL 5.90e-01 -0.0465 0.0863 0.205 NK_cytokine L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 -629075 sc-eQTL 9.47e-01 -0.00634 0.0947 0.205 NK_cytokine L2
ENSG00000027697 IFNGR1 19709 sc-eQTL 2.00e-01 0.165 0.128 0.178 PB L2
ENSG00000029363 BCLAF1 949307 sc-eQTL 8.75e-01 -0.0174 0.111 0.178 PB L2
ENSG00000112357 PEX7 416594 sc-eQTL 8.97e-01 0.0171 0.132 0.178 PB L2
ENSG00000112378 PERP -868261 sc-eQTL 1.32e-01 -0.124 0.0817 0.178 PB L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 -628056 sc-eQTL 8.37e-01 -0.0206 0.1 0.178 PB L2
ENSG00000197442 MAP3K5 446681 sc-eQTL 2.24e-01 -0.138 0.113 0.178 PB L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 -629075 sc-eQTL 5.10e-01 -0.0793 0.12 0.178 PB L2
ENSG00000027697 IFNGR1 19709 sc-eQTL 7.17e-01 -0.0309 0.0853 0.202 Pro_T L2
ENSG00000029363 BCLAF1 949307 sc-eQTL 7.12e-01 -0.0327 0.0884 0.202 Pro_T L2
ENSG00000112357 PEX7 416594 sc-eQTL 4.45e-01 -0.0791 0.103 0.202 Pro_T L2
ENSG00000112378 PERP -868261 sc-eQTL 3.56e-01 -0.0761 0.0822 0.202 Pro_T L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 -628056 sc-eQTL 3.83e-01 0.0453 0.0519 0.202 Pro_T L2
ENSG00000146410 MTFR2 988823 sc-eQTL 5.12e-01 -0.0473 0.072 0.202 Pro_T L2
ENSG00000197442 MAP3K5 446681 sc-eQTL 2.20e-01 0.123 0.1 0.202 Pro_T L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 -629075 sc-eQTL 2.92e-01 -0.106 0.101 0.202 Pro_T L2
ENSG00000027697 IFNGR1 19709 sc-eQTL 6.33e-01 -0.0473 0.0988 0.203 Treg L2
ENSG00000029363 BCLAF1 949307 sc-eQTL 3.53e-01 -0.0593 0.0637 0.203 Treg L2
ENSG00000112357 PEX7 416594 sc-eQTL 2.04e-01 -0.133 0.104 0.203 Treg L2
ENSG00000112378 PERP -868261 sc-eQTL 6.46e-01 -0.0519 0.113 0.203 Treg L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 -628056 sc-eQTL 2.07e-01 0.0793 0.0626 0.203 Treg L2
ENSG00000197442 MAP3K5 446681 sc-eQTL 6.33e-01 0.0325 0.068 0.203 Treg L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 -629075 sc-eQTL 1.88e-01 0.126 0.0954 0.203 Treg L2
ENSG00000027697 IFNGR1 19709 sc-eQTL 2.91e-01 -0.0869 0.0821 0.21 cDC L2
ENSG00000029363 BCLAF1 949307 sc-eQTL 2.03e-01 -0.106 0.0826 0.21 cDC L2
ENSG00000112357 PEX7 416594 sc-eQTL 4.04e-01 0.089 0.106 0.21 cDC L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 -628056 sc-eQTL 5.46e-01 -0.049 0.0811 0.21 cDC L2
ENSG00000135525 MAP7 688339 sc-eQTL 4.68e-01 -0.0689 0.0948 0.21 cDC L2
ENSG00000197442 MAP3K5 446681 sc-eQTL 4.61e-01 -0.0617 0.0834 0.21 cDC L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 -629075 sc-eQTL 7.35e-01 -0.0359 0.106 0.21 cDC L2
ENSG00000286646 AL121933.2 455113 sc-eQTL 4.03e-01 0.0911 0.109 0.21 cDC L2
ENSG00000027697 IFNGR1 19709 sc-eQTL 5.63e-01 0.0349 0.0602 0.203 cMono_IL1B L2
ENSG00000029363 BCLAF1 949307 sc-eQTL 4.68e-01 0.0469 0.0645 0.203 cMono_IL1B L2
ENSG00000112357 PEX7 416594 sc-eQTL 5.43e-02 -0.208 0.107 0.203 cMono_IL1B L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 -628056 sc-eQTL 4.84e-02 0.128 0.0642 0.203 cMono_IL1B L2
ENSG00000135525 MAP7 688339 sc-eQTL 3.64e-01 -0.0847 0.0931 0.203 cMono_IL1B L2
ENSG00000197442 MAP3K5 446681 sc-eQTL 4.88e-01 -0.0468 0.0673 0.203 cMono_IL1B L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 -629075 sc-eQTL 2.28e-01 0.0834 0.069 0.203 cMono_IL1B L2
ENSG00000286646 AL121933.2 455113 sc-eQTL 8.02e-01 -0.0218 0.0866 0.203 cMono_IL1B L2
ENSG00000027697 IFNGR1 19709 sc-eQTL 4.37e-01 -0.0545 0.07 0.203 cMono_S100A L2
ENSG00000029363 BCLAF1 949307 sc-eQTL 7.61e-01 -0.0219 0.0719 0.203 cMono_S100A L2
ENSG00000112357 PEX7 416594 sc-eQTL 2.20e-01 -0.138 0.112 0.203 cMono_S100A L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 -628056 sc-eQTL 3.40e-01 0.0594 0.0621 0.203 cMono_S100A L2
ENSG00000135525 MAP7 688339 sc-eQTL 2.47e-02 -0.234 0.104 0.203 cMono_S100A L2
ENSG00000197442 MAP3K5 446681 sc-eQTL 1.06e-01 0.137 0.0841 0.203 cMono_S100A L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 -629075 sc-eQTL 6.29e-01 -0.0432 0.0893 0.203 cMono_S100A L2
ENSG00000286646 AL121933.2 455113 sc-eQTL 5.69e-01 0.0497 0.0872 0.203 cMono_S100A L2
ENSG00000027697 IFNGR1 19709 sc-eQTL 5.47e-01 -0.0613 0.102 0.218 gdT L2
ENSG00000029363 BCLAF1 949307 sc-eQTL 2.99e-01 -0.0931 0.0893 0.218 gdT L2
ENSG00000112357 PEX7 416594 sc-eQTL 4.88e-01 -0.0897 0.129 0.218 gdT L2
ENSG00000112378 PERP -868261 sc-eQTL 6.27e-02 0.209 0.111 0.218 gdT L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 -628056 sc-eQTL 1.56e-01 0.0888 0.0622 0.218 gdT L2
ENSG00000146410 MTFR2 988823 sc-eQTL 4.36e-01 -0.077 0.0987 0.218 gdT L2
ENSG00000197442 MAP3K5 446681 sc-eQTL 7.21e-02 0.237 0.131 0.218 gdT L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 -629075 sc-eQTL 4.58e-01 -0.0843 0.113 0.218 gdT L2
ENSG00000027697 IFNGR1 19709 sc-eQTL 5.76e-01 0.0419 0.0749 0.202 intMono L2
ENSG00000029363 BCLAF1 949307 sc-eQTL 1.87e-01 -0.131 0.0986 0.202 intMono L2
ENSG00000112357 PEX7 416594 sc-eQTL 1.53e-01 -0.144 0.101 0.202 intMono L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 -628056 sc-eQTL 2.39e-01 0.0763 0.0645 0.202 intMono L2
ENSG00000135525 MAP7 688339 sc-eQTL 7.08e-01 0.0373 0.0994 0.202 intMono L2
ENSG00000197442 MAP3K5 446681 sc-eQTL 1.74e-01 -0.143 0.105 0.202 intMono L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 -629075 sc-eQTL 8.67e-01 -0.0162 0.0965 0.202 intMono L2
ENSG00000286646 AL121933.2 455113 sc-eQTL 3.33e-01 -0.108 0.111 0.202 intMono L2
ENSG00000027697 IFNGR1 19709 sc-eQTL 6.58e-01 -0.0386 0.0871 0.199 ncMono L2
ENSG00000029363 BCLAF1 949307 sc-eQTL 9.91e-01 0.000751 0.0677 0.199 ncMono L2
ENSG00000112357 PEX7 416594 sc-eQTL 5.05e-01 -0.072 0.108 0.199 ncMono L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 -628056 sc-eQTL 1.09e-01 0.123 0.0766 0.199 ncMono L2
ENSG00000135525 MAP7 688339 sc-eQTL 9.69e-01 0.0037 0.0953 0.199 ncMono L2
ENSG00000197442 MAP3K5 446681 sc-eQTL 1.19e-01 0.156 0.0995 0.199 ncMono L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 -629075 sc-eQTL 6.10e-01 0.0493 0.0963 0.199 ncMono L2
ENSG00000286646 AL121933.2 455113 sc-eQTL 5.49e-01 -0.0609 0.102 0.199 ncMono L2
ENSG00000027697 IFNGR1 19709 sc-eQTL 4.60e-01 -0.0706 0.0954 0.218 pDC L2
ENSG00000029363 BCLAF1 949307 sc-eQTL 6.15e-01 0.0361 0.0716 0.218 pDC L2
ENSG00000112357 PEX7 416594 sc-eQTL 9.34e-01 -0.00872 0.105 0.218 pDC L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 -628056 sc-eQTL 4.47e-02 0.177 0.0874 0.218 pDC L2
ENSG00000135525 MAP7 688339 sc-eQTL 9.78e-01 -0.00206 0.0734 0.218 pDC L2
ENSG00000197442 MAP3K5 446681 sc-eQTL 8.32e-01 0.025 0.118 0.218 pDC L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 -629075 sc-eQTL 5.89e-01 -0.0486 0.0898 0.218 pDC L2
ENSG00000286646 AL121933.2 455113 sc-eQTL 5.79e-01 0.0601 0.108 0.218 pDC L2
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000027697 IFNGR1 19709 sc-eQTL 5.99e-03 -0.238 0.0859 0.203 B_Memory LOneK1K
ENSG00000029363 BCLAF1 949307 sc-eQTL 2.37e-01 -0.058 0.0489 0.203 B_Memory LOneK1K
ENSG00000112357 PEX7 416594 sc-eQTL 7.28e-01 0.035 0.101 0.203 B_Memory LOneK1K
ENSG00000112378 PERP -868261 sc-eQTL 2.31e-01 0.112 0.0931 0.203 B_Memory LOneK1K
ENSG00000118503 TNFAIP3 -628056 sc-eQTL 5.86e-01 -0.0336 0.0616 0.203 B_Memory LOneK1K
ENSG00000197442 MAP3K5 446681 sc-eQTL 7.98e-01 0.0209 0.0816 0.203 B_Memory LOneK1K
ENSG00000237499 WAKMAR2 -629075 sc-eQTL 9.62e-01 -0.00496 0.104 0.203 B_Memory LOneK1K
ENSG00000027697 IFNGR1 19709 sc-eQTL 1.68e-01 -0.121 0.0878 0.203 B_Naive LOneK1K
ENSG00000029363 BCLAF1 949307 sc-eQTL 1.76e-01 0.0548 0.0404 0.203 B_Naive LOneK1K
ENSG00000112357 PEX7 416594 sc-eQTL 5.56e-01 0.0633 0.107 0.203 B_Naive LOneK1K
ENSG00000112378 PERP -868261 sc-eQTL 1.47e-01 -0.139 0.0956 0.203 B_Naive LOneK1K
ENSG00000118503 TNFAIP3 -628056 sc-eQTL 7.13e-01 -0.0186 0.0505 0.203 B_Naive LOneK1K
ENSG00000197442 MAP3K5 446681 sc-eQTL 1.97e-01 -0.0956 0.0737 0.203 B_Naive LOneK1K
ENSG00000237499 WAKMAR2 -629075 sc-eQTL 7.94e-01 -0.0236 0.0899 0.203 B_Naive LOneK1K
ENSG00000027697 IFNGR1 19709 sc-eQTL 8.69e-01 -0.0102 0.0617 0.203 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000029363 BCLAF1 949307 sc-eQTL 5.19e-01 0.0371 0.0574 0.203 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000112357 PEX7 416594 sc-eQTL 6.44e-02 -0.204 0.11 0.203 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000118503 TNFAIP3 -628056 sc-eQTL 1.70e-01 0.0782 0.0568 0.203 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000135525 MAP7 688339 sc-eQTL 9.74e-02 -0.164 0.0984 0.203 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000197442 MAP3K5 446681 sc-eQTL 7.30e-01 0.0231 0.0668 0.203 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000237499 WAKMAR2 -629075 sc-eQTL 3.72e-01 0.061 0.0682 0.203 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000286646 AL121933.2 455113 sc-eQTL 8.79e-01 -0.0122 0.0796 0.203 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000027697 IFNGR1 19709 sc-eQTL 6.79e-01 -0.0297 0.0716 0.205 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000029363 BCLAF1 949307 sc-eQTL 5.98e-01 -0.0342 0.0647 0.205 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000112357 PEX7 416594 sc-eQTL 3.45e-01 -0.102 0.108 0.205 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000118503 TNFAIP3 -628056 sc-eQTL 1.89e-02 0.156 0.0661 0.205 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000135525 MAP7 688339 sc-eQTL 8.00e-01 0.0265 0.105 0.205 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000197442 MAP3K5 446681 sc-eQTL 6.21e-01 0.0425 0.0858 0.205 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000237499 WAKMAR2 -629075 sc-eQTL 9.85e-01 0.00167 0.0897 0.205 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000286646 AL121933.2 455113 sc-eQTL 1.71e-01 -0.139 0.101 0.205 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000027697 IFNGR1 19709 sc-eQTL 1.39e-01 -0.1 0.0674 0.205 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000029363 BCLAF1 949307 sc-eQTL 9.39e-01 0.003 0.0393 0.205 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000112357 PEX7 416594 sc-eQTL 5.32e-01 0.0715 0.114 0.205 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000112378 PERP -868261 sc-eQTL 2.61e-01 -0.0798 0.0707 0.205 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000118503 TNFAIP3 -628056 sc-eQTL 5.46e-01 -0.0373 0.0617 0.205 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000197442 MAP3K5 446681 sc-eQTL 6.75e-01 -0.0351 0.0834 0.205 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000237499 WAKMAR2 -629075 sc-eQTL 9.64e-01 -0.00395 0.0864 0.205 NK_CD56dim LOneK1K

Statistical fine-mapping results from Japan COVID-19 Task Force
(Shown only for PIP>0.001)
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
PIP (SuSiE)
PIP (FINEMAP)
MAF
ENSG00000027697 IFNGR1 19709 pQTL 0.0161 -0.0445 0.0185 0.0 0.0 0.21
ENSG00000027697 IFNGR1 19709 eQTL 4.35e-06 -0.0734 0.0159 0.0 0.0 0.203

Expression Modifier Score(EMS) for GTEx 49tissues
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Whole Blood
Muscle Skeletal
Liver
Brain Cerebellum
Prostate
Spleen
Skin Sun Exposed Lower leg
Artery Coronary
Esophagus Muscularis
Esophagus Gastroesophageal Junction
Artery Tibial
Heart Atrial Appendage
Nerve Tibial
Heart Left Ventricle
Adrenal Gland
Adipose Visceral Omentum
Pancreas
Lung
Pituitary
Brain Nucleus accumbens basal ganglia
Colon Transverse
Adipose Subcutaneous
Esophagus Mucosa
Brain Cortex
Thyroid
Stomach
Breast Mammary Tissue
Colon Sigmoid
Skin Not Sun Exposed Suprapubic
Testis
Artery Aorta
Brain Amygdala
Brain Anterior cingulate cortex BA24
Brain Caudate basal ganglia
Brain Cerebellar Hemisphere
Brain Frontal Cortex BA9
Brain Hippocampus
Brain Hypothalamus
Brain Putamen basal ganglia
Brain Spinal cord cervical c-1
Brain Substantia nigra
Cells Cultured fibroblasts
Cells EBV-transformed lymphocytes
Kidney Cortex
Minor Salivary Gland
Ovary
Small Intestine Terminal Ileum
Uterus
Vagina
ENSG00000027697 IFNGR1 19709 1.67e-05 1.52e-05 2.47e-06 9.17e-06 2.42e-06 7.28e-06 1.91e-05 2.44e-06 1.41e-05 6.86e-06 1.85e-05 7.34e-06 2.46e-05 5.67e-06 4.38e-06 9.08e-06 8.06e-06 1.26e-05 3.6e-06 3.53e-06 6.92e-06 1.36e-05 1.39e-05 4.02e-06 2.48e-05 4.94e-06 7.67e-06 5.28e-06 1.5e-05 1.42e-05 9.55e-06 9.88e-07 1.21e-06 3.85e-06 6.46e-06 2.85e-06 1.78e-06 2.25e-06 2.24e-06 1.42e-06 1.07e-06 1.92e-05 2.48e-06 1.32e-07 9.34e-07 2.12e-06 2.4e-06 7e-07 4.84e-07
ENSG00000237499 \N -629075 2.69e-07 1.16e-07 4.47e-08 1.81e-07 9.01e-08 9.8e-08 1.44e-07 5.2e-08 1.4e-07 4.57e-08 1.56e-07 7.78e-08 1.33e-07 6.56e-08 6e-08 7.37e-08 3.9e-08 1.21e-07 5.82e-08 4e-08 1.08e-07 1.23e-07 1.34e-07 3.42e-08 1.37e-07 1.16e-07 1.06e-07 9.32e-08 1.05e-07 1.07e-07 9.91e-08 3.89e-08 3.56e-08 8.44e-08 7.51e-08 3.76e-08 4.95e-08 8.72e-08 6.86e-08 3.8e-08 4.69e-08 1.33e-07 5.27e-08 1.18e-08 5.19e-08 1.84e-08 1.21e-07 3.83e-09 5.09e-08