logo

Genes within 1Mb (chr6:137228542:C:T):

View on , UCSC , GTEx , gnomAD

Immune cell-type specific single cell cis-eQTLs in OASIS
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000027697 IFNGR1 9093 sc-eQTL 1.91e-03 0.234 0.0744 0.295 B L1
ENSG00000029363 BCLAF1 938691 sc-eQTL 5.34e-01 -0.0211 0.0339 0.295 B L1
ENSG00000112357 PEX7 405978 sc-eQTL 4.30e-01 -0.0711 0.09 0.295 B L1
ENSG00000112378 PERP -878877 sc-eQTL 2.04e-01 -0.0758 0.0594 0.295 B L1
ENSG00000118503 TNFAIP3 -638672 sc-eQTL 1.16e-02 0.12 0.0473 0.295 B L1
ENSG00000197442 MAP3K5 436065 sc-eQTL 3.67e-01 -0.0604 0.0668 0.295 B L1
ENSG00000237499 WAKMAR2 -639691 sc-eQTL 4.99e-01 0.0511 0.0755 0.295 B L1
ENSG00000027697 IFNGR1 9093 sc-eQTL 1.40e-02 0.121 0.0488 0.295 CD4T L1
ENSG00000029363 BCLAF1 938691 sc-eQTL 8.81e-01 -0.0056 0.0374 0.295 CD4T L1
ENSG00000112357 PEX7 405978 sc-eQTL 2.72e-02 0.175 0.0788 0.295 CD4T L1
ENSG00000112378 PERP -878877 sc-eQTL 1.44e-01 0.078 0.0532 0.295 CD4T L1
ENSG00000118503 TNFAIP3 -638672 sc-eQTL 2.22e-01 0.0612 0.0499 0.295 CD4T L1
ENSG00000197442 MAP3K5 436065 sc-eQTL 1.66e-01 -0.0528 0.038 0.295 CD4T L1
ENSG00000237499 WAKMAR2 -639691 sc-eQTL 9.82e-01 -0.00145 0.0631 0.295 CD4T L1
ENSG00000027697 IFNGR1 9093 sc-eQTL 1.74e-04 0.212 0.0555 0.295 CD8T L1
ENSG00000029363 BCLAF1 938691 sc-eQTL 6.86e-01 0.0157 0.0388 0.295 CD8T L1
ENSG00000112357 PEX7 405978 sc-eQTL 4.36e-01 0.0747 0.0956 0.295 CD8T L1
ENSG00000112378 PERP -878877 sc-eQTL 2.53e-01 0.0715 0.0624 0.295 CD8T L1
ENSG00000118503 TNFAIP3 -638672 sc-eQTL 3.31e-01 0.047 0.0482 0.295 CD8T L1
ENSG00000197442 MAP3K5 436065 sc-eQTL 1.96e-01 -0.0659 0.0509 0.295 CD8T L1
ENSG00000237499 WAKMAR2 -639691 sc-eQTL 1.81e-01 0.0949 0.0707 0.295 CD8T L1
ENSG00000027697 IFNGR1 9093 sc-eQTL 1.36e-01 0.102 0.0684 0.3 DC L1
ENSG00000029363 BCLAF1 938691 sc-eQTL 2.36e-02 -0.139 0.0611 0.3 DC L1
ENSG00000112357 PEX7 405978 sc-eQTL 6.53e-01 0.0436 0.0968 0.3 DC L1
ENSG00000118503 TNFAIP3 -638672 sc-eQTL 2.66e-01 0.0817 0.0733 0.3 DC L1
ENSG00000135525 MAP7 677723 sc-eQTL 4.90e-01 -0.055 0.0795 0.3 DC L1
ENSG00000197442 MAP3K5 436065 sc-eQTL 4.28e-01 -0.0605 0.0762 0.3 DC L1
ENSG00000237499 WAKMAR2 -639691 sc-eQTL 4.04e-01 -0.0625 0.0748 0.3 DC L1
ENSG00000286646 AL121933.2 444497 sc-eQTL 6.53e-01 -0.0448 0.0995 0.3 DC L1
ENSG00000027697 IFNGR1 9093 sc-eQTL 1.24e-01 0.0905 0.0587 0.295 Mono L1
ENSG00000029363 BCLAF1 938691 sc-eQTL 2.10e-01 -0.0631 0.0502 0.295 Mono L1
ENSG00000112357 PEX7 405978 sc-eQTL 1.27e-01 0.151 0.0987 0.295 Mono L1
ENSG00000118503 TNFAIP3 -638672 sc-eQTL 9.76e-02 0.0827 0.0497 0.295 Mono L1
ENSG00000135525 MAP7 677723 sc-eQTL 6.87e-02 -0.159 0.0869 0.295 Mono L1
ENSG00000197442 MAP3K5 436065 sc-eQTL 1.25e-01 -0.0894 0.0581 0.295 Mono L1
ENSG00000237499 WAKMAR2 -639691 sc-eQTL 9.66e-01 -0.00261 0.062 0.295 Mono L1
ENSG00000286646 AL121933.2 444497 sc-eQTL 2.65e-01 0.0787 0.0705 0.295 Mono L1
ENSG00000027697 IFNGR1 9093 sc-eQTL 1.02e-03 0.208 0.0625 0.296 NK L1
ENSG00000029363 BCLAF1 938691 sc-eQTL 7.42e-01 0.0112 0.034 0.296 NK L1
ENSG00000112357 PEX7 405978 sc-eQTL 8.52e-01 -0.0185 0.0989 0.296 NK L1
ENSG00000112378 PERP -878877 sc-eQTL 6.73e-02 0.114 0.0618 0.296 NK L1
ENSG00000118503 TNFAIP3 -638672 sc-eQTL 3.16e-01 0.0535 0.0532 0.296 NK L1
ENSG00000197442 MAP3K5 436065 sc-eQTL 1.91e-01 -0.0997 0.0761 0.296 NK L1
ENSG00000237499 WAKMAR2 -639691 sc-eQTL 8.89e-01 -0.0106 0.0756 0.296 NK L1
ENSG00000027697 IFNGR1 9093 sc-eQTL 3.23e-10 0.366 0.0555 0.295 Other_T L1
ENSG00000029363 BCLAF1 938691 sc-eQTL 5.72e-01 -0.0289 0.0511 0.295 Other_T L1
ENSG00000112357 PEX7 405978 sc-eQTL 7.28e-01 0.0346 0.0994 0.295 Other_T L1
ENSG00000112378 PERP -878877 sc-eQTL 7.67e-01 0.0236 0.0797 0.295 Other_T L1
ENSG00000118503 TNFAIP3 -638672 sc-eQTL 5.28e-02 0.0732 0.0376 0.295 Other_T L1
ENSG00000146410 MTFR2 978207 sc-eQTL 3.30e-01 0.056 0.0573 0.295 Other_T L1
ENSG00000197442 MAP3K5 436065 sc-eQTL 2.42e-02 -0.164 0.0724 0.295 Other_T L1
ENSG00000237499 WAKMAR2 -639691 sc-eQTL 7.60e-02 0.133 0.0747 0.295 Other_T L1
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000027697 IFNGR1 9093 sc-eQTL 5.59e-03 0.272 0.097 0.298 B_Activated L2
ENSG00000029363 BCLAF1 938691 sc-eQTL 9.51e-01 -0.00499 0.0805 0.298 B_Activated L2
ENSG00000112357 PEX7 405978 sc-eQTL 5.07e-02 0.19 0.0965 0.298 B_Activated L2
ENSG00000112378 PERP -878877 sc-eQTL 6.29e-01 -0.0244 0.0504 0.298 B_Activated L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 -638672 sc-eQTL 5.53e-01 0.0581 0.0978 0.298 B_Activated L2
ENSG00000197442 MAP3K5 436065 sc-eQTL 5.56e-01 -0.0647 0.11 0.298 B_Activated L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 -639691 sc-eQTL 6.61e-01 0.0376 0.0855 0.298 B_Activated L2
ENSG00000027697 IFNGR1 9093 sc-eQTL 1.87e-02 0.209 0.088 0.296 B_Intermediate L2
ENSG00000029363 BCLAF1 938691 sc-eQTL 6.30e-01 -0.0245 0.0507 0.296 B_Intermediate L2
ENSG00000112357 PEX7 405978 sc-eQTL 4.21e-01 0.0752 0.0932 0.296 B_Intermediate L2
ENSG00000112378 PERP -878877 sc-eQTL 7.38e-01 -0.0285 0.0851 0.296 B_Intermediate L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 -638672 sc-eQTL 2.15e-02 0.153 0.0659 0.296 B_Intermediate L2
ENSG00000197442 MAP3K5 436065 sc-eQTL 8.08e-01 -0.0197 0.0807 0.296 B_Intermediate L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 -639691 sc-eQTL 9.18e-01 -0.00976 0.0947 0.296 B_Intermediate L2
ENSG00000027697 IFNGR1 9093 sc-eQTL 6.47e-03 0.258 0.0939 0.293 B_Memory L2
ENSG00000029363 BCLAF1 938691 sc-eQTL 2.99e-01 0.059 0.0566 0.293 B_Memory L2
ENSG00000112357 PEX7 405978 sc-eQTL 4.40e-01 -0.0746 0.0964 0.293 B_Memory L2
ENSG00000112378 PERP -878877 sc-eQTL 4.36e-01 -0.0708 0.0907 0.293 B_Memory L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 -638672 sc-eQTL 1.09e-01 0.1 0.0621 0.293 B_Memory L2
ENSG00000197442 MAP3K5 436065 sc-eQTL 6.56e-01 0.038 0.0853 0.293 B_Memory L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 -639691 sc-eQTL 9.99e-01 -0.000159 0.0931 0.293 B_Memory L2
ENSG00000027697 IFNGR1 9093 sc-eQTL 2.74e-02 0.168 0.0757 0.295 B_Naive1 L2
ENSG00000029363 BCLAF1 938691 sc-eQTL 7.86e-01 -0.0119 0.0438 0.295 B_Naive1 L2
ENSG00000112357 PEX7 405978 sc-eQTL 2.00e-02 -0.234 0.0998 0.295 B_Naive1 L2
ENSG00000112378 PERP -878877 sc-eQTL 7.93e-01 0.0232 0.0884 0.295 B_Naive1 L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 -638672 sc-eQTL 1.86e-01 0.0677 0.0511 0.295 B_Naive1 L2
ENSG00000197442 MAP3K5 436065 sc-eQTL 9.54e-01 0.00416 0.0721 0.295 B_Naive1 L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 -639691 sc-eQTL 5.26e-01 -0.051 0.0803 0.295 B_Naive1 L2
ENSG00000027697 IFNGR1 9093 sc-eQTL 9.66e-02 0.155 0.0926 0.294 B_Naive2 L2
ENSG00000029363 BCLAF1 938691 sc-eQTL 7.01e-01 0.0207 0.054 0.294 B_Naive2 L2
ENSG00000112357 PEX7 405978 sc-eQTL 7.36e-01 -0.0344 0.102 0.294 B_Naive2 L2
ENSG00000112378 PERP -878877 sc-eQTL 4.02e-01 0.0622 0.0742 0.294 B_Naive2 L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 -638672 sc-eQTL 2.16e-01 0.0919 0.074 0.294 B_Naive2 L2
ENSG00000197442 MAP3K5 436065 sc-eQTL 9.48e-01 -0.00517 0.079 0.294 B_Naive2 L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 -639691 sc-eQTL 4.92e-01 0.066 0.0959 0.294 B_Naive2 L2
ENSG00000027697 IFNGR1 9093 sc-eQTL 2.73e-01 0.0979 0.089 0.293 CD4_CTL L2
ENSG00000029363 BCLAF1 938691 sc-eQTL 2.28e-01 -0.0954 0.0789 0.293 CD4_CTL L2
ENSG00000112357 PEX7 405978 sc-eQTL 4.58e-02 0.197 0.098 0.293 CD4_CTL L2
ENSG00000112378 PERP -878877 sc-eQTL 6.65e-01 0.0435 0.1 0.293 CD4_CTL L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 -638672 sc-eQTL 5.96e-01 0.0311 0.0585 0.293 CD4_CTL L2
ENSG00000197442 MAP3K5 436065 sc-eQTL 1.15e-01 -0.147 0.0928 0.293 CD4_CTL L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 -639691 sc-eQTL 8.64e-01 -0.0157 0.0911 0.293 CD4_CTL L2
ENSG00000027697 IFNGR1 9093 sc-eQTL 2.35e-01 0.0556 0.0467 0.295 CD4_Naive L2
ENSG00000029363 BCLAF1 938691 sc-eQTL 4.78e-01 -0.0267 0.0376 0.295 CD4_Naive L2
ENSG00000112357 PEX7 405978 sc-eQTL 8.01e-02 0.154 0.0878 0.295 CD4_Naive L2
ENSG00000112378 PERP -878877 sc-eQTL 8.21e-01 -0.0166 0.073 0.295 CD4_Naive L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 -638672 sc-eQTL 3.83e-01 0.0447 0.0511 0.295 CD4_Naive L2
ENSG00000197442 MAP3K5 436065 sc-eQTL 9.86e-01 0.000679 0.0376 0.295 CD4_Naive L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 -639691 sc-eQTL 9.60e-01 -0.00334 0.0663 0.295 CD4_Naive L2
ENSG00000027697 IFNGR1 9093 sc-eQTL 3.33e-02 0.139 0.0648 0.295 CD4_TCM L2
ENSG00000029363 BCLAF1 938691 sc-eQTL 1.74e-01 0.0561 0.0411 0.295 CD4_TCM L2
ENSG00000112357 PEX7 405978 sc-eQTL 4.11e-01 0.079 0.096 0.295 CD4_TCM L2
ENSG00000112378 PERP -878877 sc-eQTL 4.94e-02 0.159 0.0805 0.295 CD4_TCM L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 -638672 sc-eQTL 1.65e-01 0.0654 0.047 0.295 CD4_TCM L2
ENSG00000197442 MAP3K5 436065 sc-eQTL 5.92e-01 -0.0288 0.0537 0.295 CD4_TCM L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 -639691 sc-eQTL 5.11e-01 0.0434 0.066 0.295 CD4_TCM L2
ENSG00000027697 IFNGR1 9093 sc-eQTL 3.86e-03 0.215 0.0734 0.295 CD4_TEM L2
ENSG00000029363 BCLAF1 938691 sc-eQTL 7.36e-01 -0.0179 0.0531 0.295 CD4_TEM L2
ENSG00000112357 PEX7 405978 sc-eQTL 9.19e-01 0.00979 0.0967 0.295 CD4_TEM L2
ENSG00000112378 PERP -878877 sc-eQTL 5.28e-01 0.0495 0.0783 0.295 CD4_TEM L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 -638672 sc-eQTL 8.29e-01 0.0108 0.0497 0.295 CD4_TEM L2
ENSG00000197442 MAP3K5 436065 sc-eQTL 1.37e-01 -0.114 0.0764 0.295 CD4_TEM L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 -639691 sc-eQTL 4.47e-01 -0.0606 0.0797 0.295 CD4_TEM L2
ENSG00000027697 IFNGR1 9093 sc-eQTL 4.40e-06 0.308 0.0653 0.295 CD8_CTL L2
ENSG00000029363 BCLAF1 938691 sc-eQTL 5.48e-01 -0.0275 0.0457 0.295 CD8_CTL L2
ENSG00000112357 PEX7 405978 sc-eQTL 9.96e-01 -0.000529 0.0945 0.295 CD8_CTL L2
ENSG00000112378 PERP -878877 sc-eQTL 1.03e-01 0.148 0.0903 0.295 CD8_CTL L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 -638672 sc-eQTL 2.32e-01 0.069 0.0576 0.295 CD8_CTL L2
ENSG00000197442 MAP3K5 436065 sc-eQTL 2.90e-01 -0.0863 0.0813 0.295 CD8_CTL L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 -639691 sc-eQTL 5.07e-01 0.0539 0.0811 0.295 CD8_CTL L2
ENSG00000027697 IFNGR1 9093 sc-eQTL 2.36e-01 0.0812 0.0683 0.295 CD8_Naive L2
ENSG00000029363 BCLAF1 938691 sc-eQTL 9.71e-01 0.00177 0.0478 0.295 CD8_Naive L2
ENSG00000112357 PEX7 405978 sc-eQTL 1.86e-02 0.232 0.098 0.295 CD8_Naive L2
ENSG00000112378 PERP -878877 sc-eQTL 1.21e-01 0.117 0.075 0.295 CD8_Naive L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 -638672 sc-eQTL 3.70e-01 0.048 0.0535 0.295 CD8_Naive L2
ENSG00000197442 MAP3K5 436065 sc-eQTL 5.65e-01 -0.0366 0.0634 0.295 CD8_Naive L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 -639691 sc-eQTL 8.70e-01 -0.013 0.0792 0.295 CD8_Naive L2
ENSG00000027697 IFNGR1 9093 sc-eQTL 7.82e-01 0.0252 0.0909 0.289 CD8_TCM L2
ENSG00000029363 BCLAF1 938691 sc-eQTL 6.38e-01 -0.0322 0.0682 0.289 CD8_TCM L2
ENSG00000112357 PEX7 405978 sc-eQTL 2.42e-01 0.122 0.104 0.289 CD8_TCM L2
ENSG00000112378 PERP -878877 sc-eQTL 9.37e-01 0.00809 0.102 0.289 CD8_TCM L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 -638672 sc-eQTL 4.32e-01 -0.0388 0.0492 0.289 CD8_TCM L2
ENSG00000197442 MAP3K5 436065 sc-eQTL 9.50e-01 0.00552 0.088 0.289 CD8_TCM L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 -639691 sc-eQTL 1.06e-01 -0.146 0.0896 0.289 CD8_TCM L2
ENSG00000027697 IFNGR1 9093 sc-eQTL 1.59e-04 0.333 0.0865 0.306 CD8_TEM L2
ENSG00000029363 BCLAF1 938691 sc-eQTL 5.08e-01 -0.0561 0.0846 0.306 CD8_TEM L2
ENSG00000112357 PEX7 405978 sc-eQTL 1.55e-01 0.147 0.103 0.306 CD8_TEM L2
ENSG00000112378 PERP -878877 sc-eQTL 3.64e-01 0.0974 0.107 0.306 CD8_TEM L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 -638672 sc-eQTL 2.01e-01 0.0845 0.0659 0.306 CD8_TEM L2
ENSG00000197442 MAP3K5 436065 sc-eQTL 3.91e-02 -0.21 0.101 0.306 CD8_TEM L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 -639691 sc-eQTL 5.60e-01 0.0573 0.0981 0.306 CD8_TEM L2
ENSG00000027697 IFNGR1 9093 sc-eQTL 1.23e-08 0.379 0.0639 0.299 MAIT L2
ENSG00000029363 BCLAF1 938691 sc-eQTL 4.38e-01 0.0445 0.0573 0.299 MAIT L2
ENSG00000112357 PEX7 405978 sc-eQTL 1.33e-01 -0.141 0.0932 0.299 MAIT L2
ENSG00000112378 PERP -878877 sc-eQTL 3.73e-01 0.087 0.0975 0.299 MAIT L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 -638672 sc-eQTL 2.83e-02 0.102 0.046 0.299 MAIT L2
ENSG00000146410 MTFR2 978207 sc-eQTL 9.87e-01 -0.00126 0.0775 0.299 MAIT L2
ENSG00000197442 MAP3K5 436065 sc-eQTL 1.07e-02 -0.205 0.0797 0.299 MAIT L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 -639691 sc-eQTL 5.15e-01 0.0561 0.0859 0.299 MAIT L2
ENSG00000027697 IFNGR1 9093 sc-eQTL 3.29e-02 0.163 0.0761 0.298 NK_CD56bright L2
ENSG00000029363 BCLAF1 938691 sc-eQTL 6.37e-01 -0.0268 0.0567 0.298 NK_CD56bright L2
ENSG00000112357 PEX7 405978 sc-eQTL 1.28e-01 0.152 0.0997 0.298 NK_CD56bright L2
ENSG00000112378 PERP -878877 sc-eQTL 7.56e-01 -0.0279 0.0898 0.298 NK_CD56bright L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 -638672 sc-eQTL 6.32e-02 0.106 0.0568 0.298 NK_CD56bright L2
ENSG00000197442 MAP3K5 436065 sc-eQTL 6.77e-01 -0.0363 0.0871 0.298 NK_CD56bright L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 -639691 sc-eQTL 1.50e-01 0.131 0.0909 0.298 NK_CD56bright L2
ENSG00000027697 IFNGR1 9093 sc-eQTL 9.91e-05 0.226 0.0568 0.293 NK_CD56dim L2
ENSG00000029363 BCLAF1 938691 sc-eQTL 1.18e-01 0.0601 0.0383 0.293 NK_CD56dim L2
ENSG00000112357 PEX7 405978 sc-eQTL 3.92e-01 -0.0868 0.101 0.293 NK_CD56dim L2
ENSG00000112378 PERP -878877 sc-eQTL 1.27e-01 0.109 0.0709 0.293 NK_CD56dim L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 -638672 sc-eQTL 1.43e-01 0.0811 0.0552 0.293 NK_CD56dim L2
ENSG00000197442 MAP3K5 436065 sc-eQTL 3.47e-01 -0.0752 0.0797 0.293 NK_CD56dim L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 -639691 sc-eQTL 7.90e-01 0.0222 0.0831 0.293 NK_CD56dim L2
ENSG00000027697 IFNGR1 9093 sc-eQTL 5.59e-03 0.218 0.0777 0.285 NK_HLA L2
ENSG00000029363 BCLAF1 938691 sc-eQTL 1.40e-01 -0.0988 0.0667 0.285 NK_HLA L2
ENSG00000112357 PEX7 405978 sc-eQTL 1.92e-01 0.131 0.1 0.285 NK_HLA L2
ENSG00000112378 PERP -878877 sc-eQTL 8.26e-01 0.0179 0.0816 0.285 NK_HLA L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 -638672 sc-eQTL 3.65e-01 0.0569 0.0626 0.285 NK_HLA L2
ENSG00000197442 MAP3K5 436065 sc-eQTL 6.41e-01 -0.0466 0.0997 0.285 NK_HLA L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 -639691 sc-eQTL 3.03e-01 -0.104 0.101 0.285 NK_HLA L2
ENSG00000027697 IFNGR1 9093 sc-eQTL 6.83e-03 0.169 0.0618 0.293 NK_cytokine L2
ENSG00000029363 BCLAF1 938691 sc-eQTL 3.35e-01 0.0453 0.0469 0.293 NK_cytokine L2
ENSG00000112357 PEX7 405978 sc-eQTL 4.54e-01 -0.0741 0.0987 0.293 NK_cytokine L2
ENSG00000112378 PERP -878877 sc-eQTL 8.94e-01 0.01 0.075 0.293 NK_cytokine L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 -638672 sc-eQTL 5.72e-01 0.0318 0.0561 0.293 NK_cytokine L2
ENSG00000197442 MAP3K5 436065 sc-eQTL 4.42e-01 -0.0594 0.0771 0.293 NK_cytokine L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 -639691 sc-eQTL 4.22e-01 -0.068 0.0846 0.293 NK_cytokine L2
ENSG00000027697 IFNGR1 9093 sc-eQTL 4.10e-01 -0.0897 0.109 0.315 PB L2
ENSG00000029363 BCLAF1 938691 sc-eQTL 2.47e-01 -0.109 0.0934 0.315 PB L2
ENSG00000112357 PEX7 405978 sc-eQTL 3.28e-01 0.109 0.111 0.315 PB L2
ENSG00000112378 PERP -878877 sc-eQTL 2.23e-01 0.085 0.0693 0.315 PB L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 -638672 sc-eQTL 3.03e-01 0.0872 0.0843 0.315 PB L2
ENSG00000197442 MAP3K5 436065 sc-eQTL 6.32e-01 -0.0462 0.0962 0.315 PB L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 -639691 sc-eQTL 4.13e-03 0.287 0.098 0.315 PB L2
ENSG00000027697 IFNGR1 9093 sc-eQTL 9.77e-04 0.258 0.0771 0.291 Pro_T L2
ENSG00000029363 BCLAF1 938691 sc-eQTL 7.11e-02 -0.148 0.0814 0.291 Pro_T L2
ENSG00000112357 PEX7 405978 sc-eQTL 3.19e-01 0.0959 0.0959 0.291 Pro_T L2
ENSG00000112378 PERP -878877 sc-eQTL 6.65e-01 0.0332 0.0764 0.291 Pro_T L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 -638672 sc-eQTL 7.52e-01 -0.0153 0.0482 0.291 Pro_T L2
ENSG00000146410 MTFR2 978207 sc-eQTL 1.42e-01 0.098 0.0665 0.291 Pro_T L2
ENSG00000197442 MAP3K5 436065 sc-eQTL 8.34e-01 -0.0195 0.0934 0.291 Pro_T L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 -639691 sc-eQTL 1.55e-01 0.133 0.0931 0.291 Pro_T L2
ENSG00000027697 IFNGR1 9093 sc-eQTL 2.26e-01 0.109 0.0898 0.295 Treg L2
ENSG00000029363 BCLAF1 938691 sc-eQTL 9.57e-01 -0.00312 0.0582 0.295 Treg L2
ENSG00000112357 PEX7 405978 sc-eQTL 5.62e-01 0.0552 0.0951 0.295 Treg L2
ENSG00000112378 PERP -878877 sc-eQTL 2.28e-02 0.233 0.102 0.295 Treg L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 -638672 sc-eQTL 8.89e-01 0.00799 0.0573 0.295 Treg L2
ENSG00000197442 MAP3K5 436065 sc-eQTL 4.03e-01 -0.052 0.062 0.295 Treg L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 -639691 sc-eQTL 6.92e-01 -0.0346 0.0873 0.295 Treg L2
ENSG00000027697 IFNGR1 9093 sc-eQTL 2.20e-01 0.0955 0.0775 0.295 cDC L2
ENSG00000029363 BCLAF1 938691 sc-eQTL 1.05e-01 -0.127 0.0779 0.295 cDC L2
ENSG00000112357 PEX7 405978 sc-eQTL 2.98e-01 0.105 0.1 0.295 cDC L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 -638672 sc-eQTL 6.80e-01 0.0317 0.0767 0.295 cDC L2
ENSG00000135525 MAP7 677723 sc-eQTL 9.83e-01 -0.00186 0.0897 0.295 cDC L2
ENSG00000197442 MAP3K5 436065 sc-eQTL 4.49e-01 -0.0598 0.0788 0.295 cDC L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 -639691 sc-eQTL 2.39e-02 -0.224 0.0985 0.295 cDC L2
ENSG00000286646 AL121933.2 444497 sc-eQTL 4.39e-01 -0.0796 0.103 0.295 cDC L2
ENSG00000027697 IFNGR1 9093 sc-eQTL 4.62e-01 0.0404 0.0548 0.295 cMono_IL1B L2
ENSG00000029363 BCLAF1 938691 sc-eQTL 1.51e-01 -0.0845 0.0586 0.295 cMono_IL1B L2
ENSG00000112357 PEX7 405978 sc-eQTL 8.19e-01 0.0227 0.0987 0.295 cMono_IL1B L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 -638672 sc-eQTL 9.97e-01 0.000211 0.0591 0.295 cMono_IL1B L2
ENSG00000135525 MAP7 677723 sc-eQTL 2.36e-01 -0.101 0.0848 0.295 cMono_IL1B L2
ENSG00000197442 MAP3K5 436065 sc-eQTL 1.96e-01 -0.0794 0.0612 0.295 cMono_IL1B L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 -639691 sc-eQTL 8.13e-01 0.0149 0.0631 0.295 cMono_IL1B L2
ENSG00000286646 AL121933.2 444497 sc-eQTL 5.60e-01 0.0461 0.0789 0.295 cMono_IL1B L2
ENSG00000027697 IFNGR1 9093 sc-eQTL 3.42e-01 0.0611 0.0641 0.295 cMono_S100A L2
ENSG00000029363 BCLAF1 938691 sc-eQTL 1.03e-01 -0.107 0.0656 0.295 cMono_S100A L2
ENSG00000112357 PEX7 405978 sc-eQTL 2.19e-01 0.127 0.103 0.295 cMono_S100A L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 -638672 sc-eQTL 8.05e-01 0.0141 0.0571 0.295 cMono_S100A L2
ENSG00000135525 MAP7 677723 sc-eQTL 9.27e-01 -0.00877 0.0961 0.295 cMono_S100A L2
ENSG00000197442 MAP3K5 436065 sc-eQTL 1.43e-01 -0.114 0.0772 0.295 cMono_S100A L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 -639691 sc-eQTL 3.39e-01 -0.0783 0.0818 0.295 cMono_S100A L2
ENSG00000286646 AL121933.2 444497 sc-eQTL 2.79e-01 0.0866 0.0798 0.295 cMono_S100A L2
ENSG00000027697 IFNGR1 9093 sc-eQTL 4.05e-04 0.341 0.0942 0.291 gdT L2
ENSG00000029363 BCLAF1 938691 sc-eQTL 8.30e-02 -0.15 0.0858 0.291 gdT L2
ENSG00000112357 PEX7 405978 sc-eQTL 9.47e-01 0.00826 0.125 0.291 gdT L2
ENSG00000112378 PERP -878877 sc-eQTL 6.72e-01 0.0461 0.109 0.291 gdT L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 -638672 sc-eQTL 6.40e-02 0.112 0.0598 0.291 gdT L2
ENSG00000146410 MTFR2 978207 sc-eQTL 9.98e-01 0.000271 0.0956 0.291 gdT L2
ENSG00000197442 MAP3K5 436065 sc-eQTL 3.66e-01 -0.116 0.128 0.291 gdT L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 -639691 sc-eQTL 1.59e-01 0.154 0.109 0.291 gdT L2
ENSG00000027697 IFNGR1 9093 sc-eQTL 3.62e-01 0.061 0.0668 0.3 intMono L2
ENSG00000029363 BCLAF1 938691 sc-eQTL 4.87e-01 0.0615 0.0883 0.3 intMono L2
ENSG00000112357 PEX7 405978 sc-eQTL 2.37e-01 0.107 0.0899 0.3 intMono L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 -638672 sc-eQTL 9.07e-01 -0.00678 0.0578 0.3 intMono L2
ENSG00000135525 MAP7 677723 sc-eQTL 7.22e-01 -0.0316 0.0888 0.3 intMono L2
ENSG00000197442 MAP3K5 436065 sc-eQTL 7.76e-01 0.0268 0.094 0.3 intMono L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 -639691 sc-eQTL 1.40e-01 -0.127 0.0857 0.3 intMono L2
ENSG00000286646 AL121933.2 444497 sc-eQTL 1.28e-02 0.246 0.0978 0.3 intMono L2
ENSG00000027697 IFNGR1 9093 sc-eQTL 3.25e-01 0.0788 0.0798 0.301 ncMono L2
ENSG00000029363 BCLAF1 938691 sc-eQTL 1.31e-01 0.0936 0.0618 0.301 ncMono L2
ENSG00000112357 PEX7 405978 sc-eQTL 3.21e-01 0.0982 0.0988 0.301 ncMono L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 -638672 sc-eQTL 7.50e-01 0.0226 0.0708 0.301 ncMono L2
ENSG00000135525 MAP7 677723 sc-eQTL 6.94e-02 -0.158 0.0867 0.301 ncMono L2
ENSG00000197442 MAP3K5 436065 sc-eQTL 8.67e-01 0.0155 0.092 0.301 ncMono L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 -639691 sc-eQTL 6.58e-01 0.0392 0.0885 0.301 ncMono L2
ENSG00000286646 AL121933.2 444497 sc-eQTL 2.41e-01 0.109 0.093 0.301 ncMono L2
ENSG00000027697 IFNGR1 9093 sc-eQTL 8.61e-01 0.0161 0.0914 0.297 pDC L2
ENSG00000029363 BCLAF1 938691 sc-eQTL 7.63e-02 -0.121 0.0679 0.297 pDC L2
ENSG00000112357 PEX7 405978 sc-eQTL 2.61e-01 -0.113 0.1 0.297 pDC L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 -638672 sc-eQTL 5.78e-02 0.16 0.0837 0.297 pDC L2
ENSG00000135525 MAP7 677723 sc-eQTL 8.26e-01 0.0155 0.0702 0.297 pDC L2
ENSG00000197442 MAP3K5 436065 sc-eQTL 8.33e-01 0.0237 0.112 0.297 pDC L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 -639691 sc-eQTL 2.90e-01 0.091 0.0857 0.297 pDC L2
ENSG00000286646 AL121933.2 444497 sc-eQTL 7.47e-01 0.0335 0.104 0.297 pDC L2
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000027697 IFNGR1 9093 sc-eQTL 3.53e-04 0.276 0.0759 0.295 B_Memory LOneK1K
ENSG00000029363 BCLAF1 938691 sc-eQTL 8.24e-01 0.00979 0.0439 0.295 B_Memory LOneK1K
ENSG00000112357 PEX7 405978 sc-eQTL 4.04e-01 0.0752 0.0898 0.295 B_Memory LOneK1K
ENSG00000112378 PERP -878877 sc-eQTL 2.14e-01 -0.104 0.0833 0.295 B_Memory LOneK1K
ENSG00000118503 TNFAIP3 -638672 sc-eQTL 1.18e-03 0.177 0.0538 0.295 B_Memory LOneK1K
ENSG00000197442 MAP3K5 436065 sc-eQTL 8.54e-01 -0.0135 0.0731 0.295 B_Memory LOneK1K
ENSG00000237499 WAKMAR2 -639691 sc-eQTL 7.14e-01 0.0343 0.0933 0.295 B_Memory LOneK1K
ENSG00000027697 IFNGR1 9093 sc-eQTL 1.24e-02 0.201 0.0797 0.295 B_Naive LOneK1K
ENSG00000029363 BCLAF1 938691 sc-eQTL 9.07e-01 -0.00435 0.0372 0.295 B_Naive LOneK1K
ENSG00000112357 PEX7 405978 sc-eQTL 1.05e-01 -0.159 0.0978 0.295 B_Naive LOneK1K
ENSG00000112378 PERP -878877 sc-eQTL 7.12e-01 0.0326 0.0881 0.295 B_Naive LOneK1K
ENSG00000118503 TNFAIP3 -638672 sc-eQTL 1.18e-01 0.0723 0.046 0.295 B_Naive LOneK1K
ENSG00000197442 MAP3K5 436065 sc-eQTL 5.69e-01 0.0387 0.0678 0.295 B_Naive LOneK1K
ENSG00000237499 WAKMAR2 -639691 sc-eQTL 9.41e-01 -0.00606 0.0825 0.295 B_Naive LOneK1K
ENSG00000027697 IFNGR1 9093 sc-eQTL 3.65e-01 0.0502 0.0553 0.295 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000029363 BCLAF1 938691 sc-eQTL 1.12e-01 -0.0819 0.0513 0.295 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000112357 PEX7 405978 sc-eQTL 5.82e-01 0.0548 0.0995 0.295 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000118503 TNFAIP3 -638672 sc-eQTL 5.46e-01 0.031 0.0512 0.295 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000135525 MAP7 677723 sc-eQTL 3.03e-01 -0.0917 0.0888 0.295 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000197442 MAP3K5 436065 sc-eQTL 6.10e-02 -0.112 0.0596 0.295 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000237499 WAKMAR2 -639691 sc-eQTL 6.61e-01 -0.0269 0.0614 0.295 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000286646 AL121933.2 444497 sc-eQTL 3.19e-01 0.0713 0.0713 0.295 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000027697 IFNGR1 9093 sc-eQTL 4.85e-02 0.127 0.064 0.297 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000029363 BCLAF1 938691 sc-eQTL 3.40e-02 0.123 0.0578 0.297 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000112357 PEX7 405978 sc-eQTL 2.17e-01 0.12 0.0972 0.297 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000118503 TNFAIP3 -638672 sc-eQTL 8.72e-01 0.00972 0.0604 0.297 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000135525 MAP7 677723 sc-eQTL 8.61e-02 -0.161 0.0936 0.297 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000197442 MAP3K5 436065 sc-eQTL 8.49e-01 -0.0147 0.0774 0.297 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000237499 WAKMAR2 -639691 sc-eQTL 5.31e-01 -0.0507 0.0808 0.297 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000286646 AL121933.2 444497 sc-eQTL 3.48e-03 0.266 0.09 0.297 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000027697 IFNGR1 9093 sc-eQTL 1.41e-04 0.226 0.0583 0.293 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000029363 BCLAF1 938691 sc-eQTL 4.90e-01 0.0242 0.035 0.293 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000112357 PEX7 405978 sc-eQTL 5.72e-01 -0.0576 0.102 0.293 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000112378 PERP -878877 sc-eQTL 1.13e-01 0.0999 0.0628 0.293 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000118503 TNFAIP3 -638672 sc-eQTL 3.22e-01 0.0545 0.0549 0.293 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000197442 MAP3K5 436065 sc-eQTL 2.12e-01 -0.0928 0.0741 0.293 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000237499 WAKMAR2 -639691 sc-eQTL 7.20e-01 -0.0276 0.077 0.293 NK_CD56dim LOneK1K

Statistical fine-mapping results from Japan COVID-19 Task Force
(Shown only for PIP>0.001)
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
PIP (SuSiE)
PIP (FINEMAP)
MAF
ENSG00000027697 IFNGR1 9093 pQTL 0.00173 0.054 0.0172 0.0 0.0 0.279
ENSG00000027697 IFNGR1 9093 eQTL 3.35e-06 0.0686 0.0147 0.0 0.0 0.281
ENSG00000135525 MAP7 677723 eQTL 0.0258 -0.0579 0.0259 0.00143 0.0 0.281

Expression Modifier Score(EMS) for GTEx 49tissues
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Whole Blood
Muscle Skeletal
Liver
Brain Cerebellum
Prostate
Spleen
Skin Sun Exposed Lower leg
Artery Coronary
Esophagus Muscularis
Esophagus Gastroesophageal Junction
Artery Tibial
Heart Atrial Appendage
Nerve Tibial
Heart Left Ventricle
Adrenal Gland
Adipose Visceral Omentum
Pancreas
Lung
Pituitary
Brain Nucleus accumbens basal ganglia
Colon Transverse
Adipose Subcutaneous
Esophagus Mucosa
Brain Cortex
Thyroid
Stomach
Breast Mammary Tissue
Colon Sigmoid
Skin Not Sun Exposed Suprapubic
Testis
Artery Aorta
Brain Amygdala
Brain Anterior cingulate cortex BA24
Brain Caudate basal ganglia
Brain Cerebellar Hemisphere
Brain Frontal Cortex BA9
Brain Hippocampus
Brain Hypothalamus
Brain Putamen basal ganglia
Brain Spinal cord cervical c-1
Brain Substantia nigra
Cells Cultured fibroblasts
Cells EBV-transformed lymphocytes
Kidney Cortex
Minor Salivary Gland
Ovary
Small Intestine Terminal Ileum
Uterus
Vagina
ENSG00000027697 IFNGR1 9093 6.26e-05 3.37e-05 3.79e-06 1.32e-05 2.97e-06 1.51e-05 3.46e-05 2.58e-06 2.12e-05 9.01e-06 3.19e-05 1.09e-05 3.92e-05 1.05e-05 5.19e-06 1.13e-05 1.31e-05 1.77e-05 4.95e-06 4.12e-06 9.59e-06 2.42e-05 2.61e-05 4.94e-06 3.84e-05 5.52e-06 8.52e-06 7.68e-06 2.73e-05 1.88e-05 1.51e-05 9.49e-07 1.17e-06 4.03e-06 9.41e-06 3.28e-06 1.78e-06 2.15e-06 2.46e-06 1.6e-06 9.45e-07 4e-05 3.58e-06 1.97e-07 1.36e-06 2.61e-06 3.43e-06 7.39e-07 6.37e-07
ENSG00000182747 \N 306241 1.26e-06 6.26e-07 6.86e-08 3.62e-07 9.93e-08 2.64e-07 4.05e-07 9.91e-08 2.75e-07 1.5e-07 3.92e-07 2.22e-07 4.88e-07 1.17e-07 1.45e-07 1.61e-07 2.98e-07 2.93e-07 1.27e-07 9.01e-08 1.57e-07 3.76e-07 2.81e-07 6.52e-08 7.72e-07 1.9e-07 2.58e-07 2.24e-07 1.76e-07 2.26e-07 1.76e-07 7.59e-08 4.93e-08 1.15e-07 3.38e-07 5.32e-08 1.15e-07 6.98e-08 5.84e-08 8.3e-08 6.14e-08 6.27e-07 2.75e-08 5.83e-09 3.07e-08 1.59e-08 9.73e-08 2.75e-09 4.83e-08