logo

Genes within 1Mb (chr6:137192717:TG:T):

View on , UCSC , GTEx , gnomAD

Immune cell-type specific single cell cis-eQTLs in OASIS
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000027697 IFNGR1 -26732 sc-eQTL 4.27e-02 -0.213 0.104 0.118 B L1
ENSG00000029363 BCLAF1 902866 sc-eQTL 4.90e-01 0.0324 0.0469 0.118 B L1
ENSG00000112357 PEX7 370153 sc-eQTL 3.14e-01 0.126 0.125 0.118 B L1
ENSG00000112378 PERP -914702 sc-eQTL 8.82e-01 0.0123 0.0826 0.118 B L1
ENSG00000118503 TNFAIP3 -674497 sc-eQTL 9.83e-01 0.00143 0.0666 0.118 B L1
ENSG00000197442 MAP3K5 400240 sc-eQTL 8.09e-01 -0.0225 0.0927 0.118 B L1
ENSG00000237499 WAKMAR2 -675516 sc-eQTL 1.41e-01 -0.154 0.104 0.118 B L1
ENSG00000027697 IFNGR1 -26732 sc-eQTL 1.48e-01 -0.102 0.0701 0.118 CD4T L1
ENSG00000029363 BCLAF1 902866 sc-eQTL 6.70e-01 0.0227 0.0533 0.118 CD4T L1
ENSG00000112357 PEX7 370153 sc-eQTL 6.63e-02 -0.208 0.113 0.118 CD4T L1
ENSG00000112378 PERP -914702 sc-eQTL 8.51e-01 0.0144 0.0762 0.118 CD4T L1
ENSG00000118503 TNFAIP3 -674497 sc-eQTL 9.62e-01 0.0034 0.0714 0.118 CD4T L1
ENSG00000197442 MAP3K5 400240 sc-eQTL 3.70e-01 0.0487 0.0543 0.118 CD4T L1
ENSG00000237499 WAKMAR2 -675516 sc-eQTL 8.71e-01 0.0147 0.0899 0.118 CD4T L1
ENSG00000027697 IFNGR1 -26732 sc-eQTL 2.67e-02 -0.176 0.0791 0.118 CD8T L1
ENSG00000029363 BCLAF1 902866 sc-eQTL 2.48e-01 -0.0625 0.054 0.118 CD8T L1
ENSG00000112357 PEX7 370153 sc-eQTL 5.83e-02 -0.252 0.132 0.118 CD8T L1
ENSG00000112378 PERP -914702 sc-eQTL 4.29e-01 0.0691 0.0871 0.118 CD8T L1
ENSG00000118503 TNFAIP3 -674497 sc-eQTL 8.93e-01 0.00908 0.0673 0.118 CD8T L1
ENSG00000197442 MAP3K5 400240 sc-eQTL 4.09e-01 0.0588 0.071 0.118 CD8T L1
ENSG00000237499 WAKMAR2 -675516 sc-eQTL 1.29e-01 0.15 0.0983 0.118 CD8T L1
ENSG00000027697 IFNGR1 -26732 sc-eQTL 9.81e-02 -0.161 0.0968 0.117 DC L1
ENSG00000029363 BCLAF1 902866 sc-eQTL 8.11e-01 0.0211 0.0877 0.117 DC L1
ENSG00000112357 PEX7 370153 sc-eQTL 5.38e-01 0.0847 0.137 0.117 DC L1
ENSG00000118503 TNFAIP3 -674497 sc-eQTL 6.02e-01 -0.0544 0.104 0.117 DC L1
ENSG00000135525 MAP7 641898 sc-eQTL 4.43e-01 0.0866 0.113 0.117 DC L1
ENSG00000197442 MAP3K5 400240 sc-eQTL 4.44e-01 -0.0829 0.108 0.117 DC L1
ENSG00000237499 WAKMAR2 -675516 sc-eQTL 2.71e-01 0.117 0.106 0.117 DC L1
ENSG00000286646 AL121933.2 408672 sc-eQTL 6.34e-01 -0.0672 0.141 0.117 DC L1
ENSG00000027697 IFNGR1 -26732 sc-eQTL 2.47e-04 -0.293 0.0786 0.118 Mono L1
ENSG00000029363 BCLAF1 902866 sc-eQTL 7.54e-01 0.0217 0.0694 0.118 Mono L1
ENSG00000112357 PEX7 370153 sc-eQTL 1.93e-01 -0.178 0.136 0.118 Mono L1
ENSG00000118503 TNFAIP3 -674497 sc-eQTL 4.83e-01 -0.0483 0.0688 0.118 Mono L1
ENSG00000135525 MAP7 641898 sc-eQTL 7.27e-01 -0.0421 0.12 0.118 Mono L1
ENSG00000197442 MAP3K5 400240 sc-eQTL 6.55e-01 0.0359 0.0803 0.118 Mono L1
ENSG00000237499 WAKMAR2 -675516 sc-eQTL 8.62e-01 -0.0149 0.0853 0.118 Mono L1
ENSG00000286646 AL121933.2 408672 sc-eQTL 5.56e-01 0.0574 0.0972 0.118 Mono L1
ENSG00000027697 IFNGR1 -26732 sc-eQTL 3.73e-02 -0.188 0.0895 0.116 NK L1
ENSG00000029363 BCLAF1 902866 sc-eQTL 4.70e-01 -0.0347 0.048 0.116 NK L1
ENSG00000112357 PEX7 370153 sc-eQTL 8.05e-01 0.0346 0.14 0.116 NK L1
ENSG00000112378 PERP -914702 sc-eQTL 8.62e-01 -0.0153 0.088 0.116 NK L1
ENSG00000118503 TNFAIP3 -674497 sc-eQTL 9.03e-01 0.00919 0.0753 0.116 NK L1
ENSG00000197442 MAP3K5 400240 sc-eQTL 9.30e-01 -0.0095 0.108 0.116 NK L1
ENSG00000237499 WAKMAR2 -675516 sc-eQTL 4.57e-02 0.212 0.106 0.116 NK L1
ENSG00000027697 IFNGR1 -26732 sc-eQTL 5.31e-01 -0.0536 0.0854 0.118 Other_T L1
ENSG00000029363 BCLAF1 902866 sc-eQTL 4.43e-01 0.055 0.0715 0.118 Other_T L1
ENSG00000112357 PEX7 370153 sc-eQTL 3.34e-01 -0.135 0.139 0.118 Other_T L1
ENSG00000112378 PERP -914702 sc-eQTL 2.59e-02 -0.248 0.11 0.118 Other_T L1
ENSG00000118503 TNFAIP3 -674497 sc-eQTL 1.27e-01 -0.0811 0.0529 0.118 Other_T L1
ENSG00000146410 MTFR2 942382 sc-eQTL 6.54e-01 -0.0361 0.0805 0.118 Other_T L1
ENSG00000197442 MAP3K5 400240 sc-eQTL 8.05e-01 -0.0254 0.103 0.118 Other_T L1
ENSG00000237499 WAKMAR2 -675516 sc-eQTL 7.59e-01 0.0324 0.106 0.118 Other_T L1
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000027697 IFNGR1 -26732 sc-eQTL 6.35e-01 0.0653 0.137 0.117 B_Activated L2
ENSG00000029363 BCLAF1 902866 sc-eQTL 8.11e-01 -0.0267 0.112 0.117 B_Activated L2
ENSG00000112357 PEX7 370153 sc-eQTL 2.79e-01 -0.146 0.135 0.117 B_Activated L2
ENSG00000112378 PERP -914702 sc-eQTL 4.64e-02 0.139 0.0692 0.117 B_Activated L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 -674497 sc-eQTL 8.18e-01 -0.0314 0.136 0.117 B_Activated L2
ENSG00000197442 MAP3K5 400240 sc-eQTL 8.04e-02 0.265 0.151 0.117 B_Activated L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 -675516 sc-eQTL 8.55e-01 -0.0217 0.119 0.117 B_Activated L2
ENSG00000027697 IFNGR1 -26732 sc-eQTL 4.90e-05 -0.495 0.119 0.118 B_Intermediate L2
ENSG00000029363 BCLAF1 902866 sc-eQTL 4.72e-01 -0.0509 0.0705 0.118 B_Intermediate L2
ENSG00000112357 PEX7 370153 sc-eQTL 2.77e-01 0.141 0.13 0.118 B_Intermediate L2
ENSG00000112378 PERP -914702 sc-eQTL 1.20e-01 -0.184 0.118 0.118 B_Intermediate L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 -674497 sc-eQTL 9.18e-01 0.0096 0.0929 0.118 B_Intermediate L2
ENSG00000197442 MAP3K5 400240 sc-eQTL 3.00e-01 -0.116 0.112 0.118 B_Intermediate L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 -675516 sc-eQTL 9.01e-01 0.0164 0.132 0.118 B_Intermediate L2
ENSG00000027697 IFNGR1 -26732 sc-eQTL 3.23e-01 -0.135 0.136 0.119 B_Memory L2
ENSG00000029363 BCLAF1 902866 sc-eQTL 6.13e-01 -0.0411 0.081 0.119 B_Memory L2
ENSG00000112357 PEX7 370153 sc-eQTL 9.27e-02 -0.231 0.137 0.119 B_Memory L2
ENSG00000112378 PERP -914702 sc-eQTL 6.92e-01 -0.0514 0.13 0.119 B_Memory L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 -674497 sc-eQTL 2.58e-01 -0.101 0.089 0.119 B_Memory L2
ENSG00000197442 MAP3K5 400240 sc-eQTL 6.95e-01 -0.0479 0.122 0.119 B_Memory L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 -675516 sc-eQTL 8.67e-01 -0.0222 0.133 0.119 B_Memory L2
ENSG00000027697 IFNGR1 -26732 sc-eQTL 6.75e-02 -0.193 0.105 0.118 B_Naive1 L2
ENSG00000029363 BCLAF1 902866 sc-eQTL 8.48e-01 -0.0116 0.0606 0.118 B_Naive1 L2
ENSG00000112357 PEX7 370153 sc-eQTL 3.64e-01 0.127 0.14 0.118 B_Naive1 L2
ENSG00000112378 PERP -914702 sc-eQTL 6.52e-01 -0.0553 0.122 0.118 B_Naive1 L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 -674497 sc-eQTL 5.21e-01 -0.0455 0.0709 0.118 B_Naive1 L2
ENSG00000197442 MAP3K5 400240 sc-eQTL 9.56e-01 0.00554 0.0997 0.118 B_Naive1 L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 -675516 sc-eQTL 5.16e-02 -0.216 0.11 0.118 B_Naive1 L2
ENSG00000027697 IFNGR1 -26732 sc-eQTL 9.10e-01 -0.0148 0.13 0.118 B_Naive2 L2
ENSG00000029363 BCLAF1 902866 sc-eQTL 2.82e-01 0.0811 0.0752 0.118 B_Naive2 L2
ENSG00000112357 PEX7 370153 sc-eQTL 7.57e-02 0.252 0.141 0.118 B_Naive2 L2
ENSG00000112378 PERP -914702 sc-eQTL 7.30e-01 -0.0358 0.104 0.118 B_Naive2 L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 -674497 sc-eQTL 4.08e-01 -0.0858 0.103 0.118 B_Naive2 L2
ENSG00000197442 MAP3K5 400240 sc-eQTL 9.77e-01 0.00321 0.11 0.118 B_Naive2 L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 -675516 sc-eQTL 3.70e-01 -0.12 0.134 0.118 B_Naive2 L2
ENSG00000027697 IFNGR1 -26732 sc-eQTL 2.81e-02 -0.279 0.126 0.116 CD4_CTL L2
ENSG00000029363 BCLAF1 902866 sc-eQTL 9.27e-01 -0.0104 0.113 0.116 CD4_CTL L2
ENSG00000112357 PEX7 370153 sc-eQTL 5.65e-02 -0.269 0.14 0.116 CD4_CTL L2
ENSG00000112378 PERP -914702 sc-eQTL 3.00e-01 -0.149 0.143 0.116 CD4_CTL L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 -674497 sc-eQTL 5.53e-01 0.0498 0.0837 0.116 CD4_CTL L2
ENSG00000197442 MAP3K5 400240 sc-eQTL 3.51e-02 0.281 0.132 0.116 CD4_CTL L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 -675516 sc-eQTL 8.85e-01 -0.0188 0.13 0.116 CD4_CTL L2
ENSG00000027697 IFNGR1 -26732 sc-eQTL 7.65e-01 -0.02 0.0668 0.118 CD4_Naive L2
ENSG00000029363 BCLAF1 902866 sc-eQTL 5.04e-01 0.0359 0.0536 0.118 CD4_Naive L2
ENSG00000112357 PEX7 370153 sc-eQTL 1.80e-01 -0.169 0.126 0.118 CD4_Naive L2
ENSG00000112378 PERP -914702 sc-eQTL 8.06e-01 -0.0255 0.104 0.118 CD4_Naive L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 -674497 sc-eQTL 8.30e-01 0.0157 0.073 0.118 CD4_Naive L2
ENSG00000197442 MAP3K5 400240 sc-eQTL 8.95e-02 0.0909 0.0533 0.118 CD4_Naive L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 -675516 sc-eQTL 7.17e-01 0.0343 0.0946 0.118 CD4_Naive L2
ENSG00000027697 IFNGR1 -26732 sc-eQTL 6.50e-01 -0.0425 0.0936 0.118 CD4_TCM L2
ENSG00000029363 BCLAF1 902866 sc-eQTL 5.83e-01 0.0325 0.059 0.118 CD4_TCM L2
ENSG00000112357 PEX7 370153 sc-eQTL 1.26e-01 -0.21 0.137 0.118 CD4_TCM L2
ENSG00000112378 PERP -914702 sc-eQTL 8.87e-01 -0.0165 0.116 0.118 CD4_TCM L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 -674497 sc-eQTL 9.04e-01 -0.00812 0.0675 0.118 CD4_TCM L2
ENSG00000197442 MAP3K5 400240 sc-eQTL 4.47e-01 -0.0585 0.0767 0.118 CD4_TCM L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 -675516 sc-eQTL 7.91e-01 -0.025 0.0945 0.118 CD4_TCM L2
ENSG00000027697 IFNGR1 -26732 sc-eQTL 2.12e-01 -0.135 0.108 0.118 CD4_TEM L2
ENSG00000029363 BCLAF1 902866 sc-eQTL 9.54e-01 0.00447 0.0768 0.118 CD4_TEM L2
ENSG00000112357 PEX7 370153 sc-eQTL 7.96e-01 -0.0362 0.14 0.118 CD4_TEM L2
ENSG00000112378 PERP -914702 sc-eQTL 3.58e-01 -0.104 0.113 0.118 CD4_TEM L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 -674497 sc-eQTL 7.44e-01 -0.0235 0.0719 0.118 CD4_TEM L2
ENSG00000197442 MAP3K5 400240 sc-eQTL 1.08e-01 0.178 0.11 0.118 CD4_TEM L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 -675516 sc-eQTL 6.49e-01 -0.0526 0.115 0.118 CD4_TEM L2
ENSG00000027697 IFNGR1 -26732 sc-eQTL 6.63e-03 -0.256 0.0935 0.118 CD8_CTL L2
ENSG00000029363 BCLAF1 902866 sc-eQTL 5.79e-01 0.0352 0.0634 0.118 CD8_CTL L2
ENSG00000112357 PEX7 370153 sc-eQTL 9.37e-01 -0.0103 0.131 0.118 CD8_CTL L2
ENSG00000112378 PERP -914702 sc-eQTL 8.26e-01 0.0277 0.126 0.118 CD8_CTL L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 -674497 sc-eQTL 6.47e-01 0.0367 0.08 0.118 CD8_CTL L2
ENSG00000197442 MAP3K5 400240 sc-eQTL 7.27e-01 0.0395 0.113 0.118 CD8_CTL L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 -675516 sc-eQTL 2.75e-01 0.123 0.112 0.118 CD8_CTL L2
ENSG00000027697 IFNGR1 -26732 sc-eQTL 7.57e-02 -0.171 0.0959 0.118 CD8_Naive L2
ENSG00000029363 BCLAF1 902866 sc-eQTL 3.78e-01 -0.0595 0.0673 0.118 CD8_Naive L2
ENSG00000112357 PEX7 370153 sc-eQTL 8.67e-02 -0.239 0.139 0.118 CD8_Naive L2
ENSG00000112378 PERP -914702 sc-eQTL 9.01e-02 -0.18 0.106 0.118 CD8_Naive L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 -674497 sc-eQTL 4.37e-01 0.0588 0.0755 0.118 CD8_Naive L2
ENSG00000197442 MAP3K5 400240 sc-eQTL 7.25e-01 -0.0315 0.0895 0.118 CD8_Naive L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 -675516 sc-eQTL 4.20e-01 0.0901 0.112 0.118 CD8_Naive L2
ENSG00000027697 IFNGR1 -26732 sc-eQTL 7.85e-01 0.0339 0.124 0.123 CD8_TCM L2
ENSG00000029363 BCLAF1 902866 sc-eQTL 2.66e-01 -0.104 0.0928 0.123 CD8_TCM L2
ENSG00000112357 PEX7 370153 sc-eQTL 2.81e-01 -0.153 0.142 0.123 CD8_TCM L2
ENSG00000112378 PERP -914702 sc-eQTL 4.15e-01 0.114 0.139 0.123 CD8_TCM L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 -674497 sc-eQTL 2.85e-01 -0.0718 0.067 0.123 CD8_TCM L2
ENSG00000197442 MAP3K5 400240 sc-eQTL 7.74e-02 0.211 0.119 0.123 CD8_TCM L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 -675516 sc-eQTL 7.33e-01 -0.0421 0.123 0.123 CD8_TCM L2
ENSG00000027697 IFNGR1 -26732 sc-eQTL 2.71e-01 -0.134 0.121 0.119 CD8_TEM L2
ENSG00000029363 BCLAF1 902866 sc-eQTL 8.55e-01 0.021 0.115 0.119 CD8_TEM L2
ENSG00000112357 PEX7 370153 sc-eQTL 1.51e-02 -0.338 0.138 0.119 CD8_TEM L2
ENSG00000112378 PERP -914702 sc-eQTL 6.98e-01 -0.0566 0.145 0.119 CD8_TEM L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 -674497 sc-eQTL 9.32e-01 0.0077 0.0896 0.119 CD8_TEM L2
ENSG00000197442 MAP3K5 400240 sc-eQTL 4.68e-01 0.101 0.138 0.119 CD8_TEM L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 -675516 sc-eQTL 1.70e-01 0.182 0.132 0.119 CD8_TEM L2
ENSG00000027697 IFNGR1 -26732 sc-eQTL 5.33e-01 -0.0604 0.0967 0.117 MAIT L2
ENSG00000029363 BCLAF1 902866 sc-eQTL 8.44e-01 -0.0159 0.0804 0.117 MAIT L2
ENSG00000112357 PEX7 370153 sc-eQTL 9.44e-01 -0.0093 0.131 0.117 MAIT L2
ENSG00000112378 PERP -914702 sc-eQTL 3.16e-01 -0.137 0.137 0.117 MAIT L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 -674497 sc-eQTL 9.73e-01 0.00218 0.0651 0.117 MAIT L2
ENSG00000146410 MTFR2 942382 sc-eQTL 7.15e-01 -0.0397 0.108 0.117 MAIT L2
ENSG00000197442 MAP3K5 400240 sc-eQTL 2.13e-01 0.141 0.113 0.117 MAIT L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 -675516 sc-eQTL 5.41e-01 0.0736 0.12 0.117 MAIT L2
ENSG00000027697 IFNGR1 -26732 sc-eQTL 8.51e-01 -0.0201 0.106 0.118 NK_CD56bright L2
ENSG00000029363 BCLAF1 902866 sc-eQTL 7.21e-01 0.0281 0.0785 0.118 NK_CD56bright L2
ENSG00000112357 PEX7 370153 sc-eQTL 4.62e-01 0.102 0.139 0.118 NK_CD56bright L2
ENSG00000112378 PERP -914702 sc-eQTL 7.45e-01 -0.0405 0.124 0.118 NK_CD56bright L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 -674497 sc-eQTL 8.29e-01 0.0171 0.0793 0.118 NK_CD56bright L2
ENSG00000197442 MAP3K5 400240 sc-eQTL 7.81e-01 0.0335 0.121 0.118 NK_CD56bright L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 -675516 sc-eQTL 1.86e-01 0.167 0.126 0.118 NK_CD56bright L2
ENSG00000027697 IFNGR1 -26732 sc-eQTL 8.76e-02 -0.142 0.0828 0.116 NK_CD56dim L2
ENSG00000029363 BCLAF1 902866 sc-eQTL 1.36e-01 -0.0812 0.0542 0.116 NK_CD56dim L2
ENSG00000112357 PEX7 370153 sc-eQTL 9.59e-01 -0.0074 0.144 0.116 NK_CD56dim L2
ENSG00000112378 PERP -914702 sc-eQTL 2.86e-01 0.108 0.101 0.116 NK_CD56dim L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 -674497 sc-eQTL 9.03e-01 0.00962 0.0785 0.116 NK_CD56dim L2
ENSG00000197442 MAP3K5 400240 sc-eQTL 6.12e-01 -0.0574 0.113 0.116 NK_CD56dim L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 -675516 sc-eQTL 1.53e-01 0.168 0.117 0.116 NK_CD56dim L2
ENSG00000027697 IFNGR1 -26732 sc-eQTL 5.66e-02 -0.199 0.104 0.121 NK_HLA L2
ENSG00000029363 BCLAF1 902866 sc-eQTL 6.63e-01 -0.0386 0.0885 0.121 NK_HLA L2
ENSG00000112357 PEX7 370153 sc-eQTL 9.36e-01 -0.0106 0.133 0.121 NK_HLA L2
ENSG00000112378 PERP -914702 sc-eQTL 1.43e-01 -0.158 0.107 0.121 NK_HLA L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 -674497 sc-eQTL 6.58e-01 -0.0367 0.0828 0.121 NK_HLA L2
ENSG00000197442 MAP3K5 400240 sc-eQTL 3.86e-01 0.114 0.131 0.121 NK_HLA L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 -675516 sc-eQTL 1.73e-01 0.182 0.133 0.121 NK_HLA L2
ENSG00000027697 IFNGR1 -26732 sc-eQTL 4.03e-03 -0.251 0.0863 0.116 NK_cytokine L2
ENSG00000029363 BCLAF1 902866 sc-eQTL 4.27e-01 0.0522 0.0656 0.116 NK_cytokine L2
ENSG00000112357 PEX7 370153 sc-eQTL 7.89e-01 0.037 0.138 0.116 NK_cytokine L2
ENSG00000112378 PERP -914702 sc-eQTL 7.77e-01 -0.0297 0.105 0.116 NK_cytokine L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 -674497 sc-eQTL 8.91e-01 -0.0107 0.0786 0.116 NK_cytokine L2
ENSG00000197442 MAP3K5 400240 sc-eQTL 3.77e-01 0.0955 0.108 0.116 NK_cytokine L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 -675516 sc-eQTL 1.84e-02 0.278 0.117 0.116 NK_cytokine L2
ENSG00000027697 IFNGR1 -26732 sc-eQTL 6.25e-01 0.0837 0.171 0.107 PB L2
ENSG00000029363 BCLAF1 902866 sc-eQTL 6.44e-02 0.271 0.145 0.107 PB L2
ENSG00000112357 PEX7 370153 sc-eQTL 1.98e-01 -0.225 0.174 0.107 PB L2
ENSG00000112378 PERP -914702 sc-eQTL 8.44e-01 0.0215 0.109 0.107 PB L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 -674497 sc-eQTL 9.06e-01 0.0157 0.133 0.107 PB L2
ENSG00000197442 MAP3K5 400240 sc-eQTL 2.18e-01 -0.186 0.15 0.107 PB L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 -675516 sc-eQTL 8.70e-01 -0.0261 0.159 0.107 PB L2
ENSG00000027697 IFNGR1 -26732 sc-eQTL 8.57e-01 -0.0195 0.108 0.12 Pro_T L2
ENSG00000029363 BCLAF1 902866 sc-eQTL 8.22e-02 0.194 0.111 0.12 Pro_T L2
ENSG00000112357 PEX7 370153 sc-eQTL 4.78e-01 -0.093 0.131 0.12 Pro_T L2
ENSG00000112378 PERP -914702 sc-eQTL 9.83e-02 -0.172 0.104 0.12 Pro_T L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 -674497 sc-eQTL 7.65e-01 0.0197 0.0658 0.12 Pro_T L2
ENSG00000146410 MTFR2 942382 sc-eQTL 8.45e-01 0.0178 0.0912 0.12 Pro_T L2
ENSG00000197442 MAP3K5 400240 sc-eQTL 1.54e-01 0.181 0.127 0.12 Pro_T L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 -675516 sc-eQTL 2.13e-01 -0.159 0.127 0.12 Pro_T L2
ENSG00000027697 IFNGR1 -26732 sc-eQTL 2.71e-01 -0.139 0.126 0.118 Treg L2
ENSG00000029363 BCLAF1 902866 sc-eQTL 6.91e-01 0.0324 0.0813 0.118 Treg L2
ENSG00000112357 PEX7 370153 sc-eQTL 9.38e-01 -0.0104 0.133 0.118 Treg L2
ENSG00000112378 PERP -914702 sc-eQTL 7.59e-01 -0.0441 0.144 0.118 Treg L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 -674497 sc-eQTL 3.63e-01 -0.0729 0.0799 0.118 Treg L2
ENSG00000197442 MAP3K5 400240 sc-eQTL 7.34e-01 0.0295 0.0868 0.118 Treg L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 -675516 sc-eQTL 3.88e-01 0.105 0.122 0.118 Treg L2
ENSG00000027697 IFNGR1 -26732 sc-eQTL 2.35e-02 -0.242 0.106 0.117 cDC L2
ENSG00000029363 BCLAF1 902866 sc-eQTL 7.41e-01 0.0359 0.108 0.117 cDC L2
ENSG00000112357 PEX7 370153 sc-eQTL 8.51e-02 0.239 0.138 0.117 cDC L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 -674497 sc-eQTL 8.60e-01 -0.0188 0.106 0.117 cDC L2
ENSG00000135525 MAP7 641898 sc-eQTL 4.15e-01 0.101 0.124 0.117 cDC L2
ENSG00000197442 MAP3K5 400240 sc-eQTL 5.33e-01 0.0682 0.109 0.117 cDC L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 -675516 sc-eQTL 4.22e-01 0.111 0.138 0.117 cDC L2
ENSG00000286646 AL121933.2 408672 sc-eQTL 6.26e-01 0.0695 0.142 0.117 cDC L2
ENSG00000027697 IFNGR1 -26732 sc-eQTL 1.83e-03 -0.236 0.0748 0.118 cMono_IL1B L2
ENSG00000029363 BCLAF1 902866 sc-eQTL 6.91e-01 -0.0327 0.0821 0.118 cMono_IL1B L2
ENSG00000112357 PEX7 370153 sc-eQTL 6.48e-02 -0.254 0.137 0.118 cMono_IL1B L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 -674497 sc-eQTL 4.52e-01 -0.0621 0.0823 0.118 cMono_IL1B L2
ENSG00000135525 MAP7 641898 sc-eQTL 4.99e-02 0.232 0.118 0.118 cMono_IL1B L2
ENSG00000197442 MAP3K5 400240 sc-eQTL 8.35e-01 -0.0179 0.0857 0.118 cMono_IL1B L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 -675516 sc-eQTL 8.41e-01 0.0177 0.088 0.118 cMono_IL1B L2
ENSG00000286646 AL121933.2 408672 sc-eQTL 2.07e-01 0.139 0.11 0.118 cMono_IL1B L2
ENSG00000027697 IFNGR1 -26732 sc-eQTL 4.90e-04 -0.306 0.0864 0.118 cMono_S100A L2
ENSG00000029363 BCLAF1 902866 sc-eQTL 7.09e-01 -0.0342 0.0913 0.118 cMono_S100A L2
ENSG00000112357 PEX7 370153 sc-eQTL 6.58e-01 0.0632 0.143 0.118 cMono_S100A L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 -674497 sc-eQTL 7.02e-01 -0.0303 0.079 0.118 cMono_S100A L2
ENSG00000135525 MAP7 641898 sc-eQTL 4.50e-02 -0.266 0.132 0.118 cMono_S100A L2
ENSG00000197442 MAP3K5 400240 sc-eQTL 7.00e-01 0.0414 0.107 0.118 cMono_S100A L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 -675516 sc-eQTL 5.50e-01 -0.0678 0.113 0.118 cMono_S100A L2
ENSG00000286646 AL121933.2 408672 sc-eQTL 4.87e-01 0.0771 0.111 0.118 cMono_S100A L2
ENSG00000027697 IFNGR1 -26732 sc-eQTL 1.73e-01 -0.168 0.123 0.13 gdT L2
ENSG00000029363 BCLAF1 902866 sc-eQTL 4.54e-01 0.0816 0.109 0.13 gdT L2
ENSG00000112357 PEX7 370153 sc-eQTL 4.09e-01 -0.13 0.156 0.13 gdT L2
ENSG00000112378 PERP -914702 sc-eQTL 8.90e-02 -0.232 0.136 0.13 gdT L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 -674497 sc-eQTL 8.49e-02 -0.131 0.0753 0.13 gdT L2
ENSG00000146410 MTFR2 942382 sc-eQTL 2.75e-02 -0.263 0.118 0.13 gdT L2
ENSG00000197442 MAP3K5 400240 sc-eQTL 5.14e-01 -0.105 0.161 0.13 gdT L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 -675516 sc-eQTL 6.68e-01 0.0591 0.138 0.13 gdT L2
ENSG00000027697 IFNGR1 -26732 sc-eQTL 5.49e-02 -0.178 0.0921 0.116 intMono L2
ENSG00000029363 BCLAF1 902866 sc-eQTL 6.36e-01 0.0582 0.123 0.116 intMono L2
ENSG00000112357 PEX7 370153 sc-eQTL 9.72e-01 0.00444 0.125 0.116 intMono L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 -674497 sc-eQTL 5.52e-02 -0.153 0.0796 0.116 intMono L2
ENSG00000135525 MAP7 641898 sc-eQTL 3.49e-01 0.116 0.123 0.116 intMono L2
ENSG00000197442 MAP3K5 400240 sc-eQTL 2.16e-02 0.299 0.129 0.116 intMono L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 -675516 sc-eQTL 7.98e-01 0.0306 0.12 0.116 intMono L2
ENSG00000286646 AL121933.2 408672 sc-eQTL 8.83e-01 -0.0203 0.138 0.116 intMono L2
ENSG00000027697 IFNGR1 -26732 sc-eQTL 4.28e-03 -0.313 0.108 0.118 ncMono L2
ENSG00000029363 BCLAF1 902866 sc-eQTL 1.25e-01 -0.131 0.0853 0.118 ncMono L2
ENSG00000112357 PEX7 370153 sc-eQTL 9.66e-01 -0.00591 0.137 0.118 ncMono L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 -674497 sc-eQTL 8.17e-01 -0.0226 0.0977 0.118 ncMono L2
ENSG00000135525 MAP7 641898 sc-eQTL 5.87e-01 -0.0656 0.121 0.118 ncMono L2
ENSG00000197442 MAP3K5 400240 sc-eQTL 3.08e-01 0.13 0.127 0.118 ncMono L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 -675516 sc-eQTL 6.62e-01 0.0535 0.122 0.118 ncMono L2
ENSG00000286646 AL121933.2 408672 sc-eQTL 5.63e-01 -0.0746 0.129 0.118 ncMono L2
ENSG00000027697 IFNGR1 -26732 sc-eQTL 5.56e-01 0.074 0.125 0.121 pDC L2
ENSG00000029363 BCLAF1 902866 sc-eQTL 1.16e-01 0.148 0.0934 0.121 pDC L2
ENSG00000112357 PEX7 370153 sc-eQTL 6.72e-01 -0.0586 0.138 0.121 pDC L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 -674497 sc-eQTL 9.34e-01 -0.0096 0.116 0.121 pDC L2
ENSG00000135525 MAP7 641898 sc-eQTL 4.48e-01 -0.0733 0.0963 0.121 pDC L2
ENSG00000197442 MAP3K5 400240 sc-eQTL 3.39e-01 -0.148 0.154 0.121 pDC L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 -675516 sc-eQTL 4.49e-02 0.236 0.117 0.121 pDC L2
ENSG00000286646 AL121933.2 408672 sc-eQTL 1.39e-01 -0.21 0.141 0.121 pDC L2
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000027697 IFNGR1 -26732 sc-eQTL 1.05e-04 -0.421 0.107 0.118 B_Memory LOneK1K
ENSG00000029363 BCLAF1 902866 sc-eQTL 5.01e-01 -0.0418 0.0619 0.118 B_Memory LOneK1K
ENSG00000112357 PEX7 370153 sc-eQTL 6.83e-01 -0.0519 0.127 0.118 B_Memory LOneK1K
ENSG00000112378 PERP -914702 sc-eQTL 3.68e-01 -0.106 0.118 0.118 B_Memory LOneK1K
ENSG00000118503 TNFAIP3 -674497 sc-eQTL 8.92e-01 -0.0106 0.0779 0.118 B_Memory LOneK1K
ENSG00000197442 MAP3K5 400240 sc-eQTL 6.33e-01 -0.0492 0.103 0.118 B_Memory LOneK1K
ENSG00000237499 WAKMAR2 -675516 sc-eQTL 9.83e-01 -0.00278 0.132 0.118 B_Memory LOneK1K
ENSG00000027697 IFNGR1 -26732 sc-eQTL 2.15e-01 -0.138 0.111 0.118 B_Naive LOneK1K
ENSG00000029363 BCLAF1 902866 sc-eQTL 5.76e-01 0.0287 0.0513 0.118 B_Naive LOneK1K
ENSG00000112357 PEX7 370153 sc-eQTL 9.02e-02 0.23 0.135 0.118 B_Naive LOneK1K
ENSG00000112378 PERP -914702 sc-eQTL 3.99e-01 -0.103 0.121 0.118 B_Naive LOneK1K
ENSG00000118503 TNFAIP3 -674497 sc-eQTL 5.00e-01 -0.0432 0.0639 0.118 B_Naive LOneK1K
ENSG00000197442 MAP3K5 400240 sc-eQTL 7.23e-01 -0.0333 0.0937 0.118 B_Naive LOneK1K
ENSG00000237499 WAKMAR2 -675516 sc-eQTL 5.30e-02 -0.22 0.113 0.118 B_Naive LOneK1K
ENSG00000027697 IFNGR1 -26732 sc-eQTL 3.91e-04 -0.269 0.0746 0.118 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000029363 BCLAF1 902866 sc-eQTL 8.13e-01 -0.017 0.0716 0.118 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000112357 PEX7 370153 sc-eQTL 1.27e-01 -0.21 0.137 0.118 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000118503 TNFAIP3 -674497 sc-eQTL 9.11e-01 -0.00793 0.0711 0.118 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000135525 MAP7 641898 sc-eQTL 8.03e-01 -0.0308 0.123 0.118 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000197442 MAP3K5 400240 sc-eQTL 9.51e-01 0.00514 0.0833 0.118 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000237499 WAKMAR2 -675516 sc-eQTL 7.94e-01 0.0223 0.0852 0.118 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000286646 AL121933.2 408672 sc-eQTL 2.21e-01 0.121 0.0988 0.118 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000027697 IFNGR1 -26732 sc-eQTL 3.59e-03 -0.261 0.0885 0.116 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000029363 BCLAF1 902866 sc-eQTL 5.19e-01 -0.0527 0.0815 0.116 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000112357 PEX7 370153 sc-eQTL 9.47e-01 0.00912 0.136 0.116 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000118503 TNFAIP3 -674497 sc-eQTL 3.83e-01 -0.0737 0.0842 0.116 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000135525 MAP7 641898 sc-eQTL 7.13e-01 0.0485 0.132 0.116 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000197442 MAP3K5 400240 sc-eQTL 2.67e-02 0.239 0.107 0.116 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000237499 WAKMAR2 -675516 sc-eQTL 9.53e-01 0.00661 0.113 0.116 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000286646 AL121933.2 408672 sc-eQTL 4.11e-01 -0.106 0.128 0.116 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000027697 IFNGR1 -26732 sc-eQTL 2.52e-02 -0.19 0.0843 0.116 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000029363 BCLAF1 902866 sc-eQTL 4.57e-01 -0.0369 0.0494 0.116 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000112357 PEX7 370153 sc-eQTL 8.76e-01 -0.0224 0.144 0.116 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000112378 PERP -914702 sc-eQTL 8.45e-01 0.0174 0.0892 0.116 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000118503 TNFAIP3 -674497 sc-eQTL 9.89e-01 -0.0011 0.0777 0.116 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000197442 MAP3K5 400240 sc-eQTL 9.92e-01 -0.00105 0.105 0.116 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000237499 WAKMAR2 -675516 sc-eQTL 2.94e-02 0.236 0.108 0.116 NK_CD56dim LOneK1K

Statistical fine-mapping results from Japan COVID-19 Task Force
(Shown only for PIP>0.001)
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
PIP (SuSiE)
PIP (FINEMAP)
MAF
ENSG00000027697 IFNGR1 -26732 pQTL 0.0165 -0.0591 0.0246 0.0 0.0 0.122
ENSG00000027697 IFNGR1 -26732 eQTL 9.88e-14 -0.157 0.0208 0.0 0.0 0.116

Expression Modifier Score(EMS) for GTEx 49tissues
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Whole Blood
Muscle Skeletal
Liver
Brain Cerebellum
Prostate
Spleen
Skin Sun Exposed Lower leg
Artery Coronary
Esophagus Muscularis
Esophagus Gastroesophageal Junction
Artery Tibial
Heart Atrial Appendage
Nerve Tibial
Heart Left Ventricle
Adrenal Gland
Adipose Visceral Omentum
Pancreas
Lung
Pituitary
Brain Nucleus accumbens basal ganglia
Colon Transverse
Adipose Subcutaneous
Esophagus Mucosa
Brain Cortex
Thyroid
Stomach
Breast Mammary Tissue
Colon Sigmoid
Skin Not Sun Exposed Suprapubic
Testis
Artery Aorta
Brain Amygdala
Brain Anterior cingulate cortex BA24
Brain Caudate basal ganglia
Brain Cerebellar Hemisphere
Brain Frontal Cortex BA9
Brain Hippocampus
Brain Hypothalamus
Brain Putamen basal ganglia
Brain Spinal cord cervical c-1
Brain Substantia nigra
Cells Cultured fibroblasts
Cells EBV-transformed lymphocytes
Kidney Cortex
Minor Salivary Gland
Ovary
Small Intestine Terminal Ileum
Uterus
Vagina
ENSG00000027697 IFNGR1 -26732 3.98e-05 3.1e-05 6.64e-06 1.24e-05 2.36e-06 7.63e-06 2.09e-05 1.85e-06 1.78e-05 7.58e-06 1.97e-05 1.58e-05 2.82e-05 1.2e-05 8.88e-06 1.01e-05 1.11e-05 1.26e-05 3.32e-06 2.91e-06 7.77e-06 2.08e-05 1.37e-05 4.28e-06 2.67e-05 5.29e-06 7.76e-06 5.53e-06 1.54e-05 1.57e-05 1.07e-05 9.78e-07 1.21e-06 3.59e-06 5.76e-06 2.77e-06 1.79e-06 2e-06 2.21e-06 1.02e-06 4.72e-07 2.78e-05 3.68e-06 5.58e-07 9.99e-07 2.77e-06 2.5e-06 6.86e-07 5.08e-07
ENSG00000112357 \N 370153 9.47e-07 4.78e-07 1.12e-07 3.22e-07 1.08e-07 3.24e-07 4.09e-07 5.75e-08 2.75e-07 2.01e-07 5.73e-07 1.86e-07 8.16e-07 1.56e-07 2.86e-07 1.49e-07 3.13e-07 2.87e-07 1.69e-07 5.04e-08 1.27e-07 2.76e-07 2.26e-07 4.27e-08 5.15e-07 2.01e-07 1.57e-07 1.28e-07 1.34e-07 6.35e-07 1.71e-07 3.89e-08 3.89e-08 2.98e-07 3.52e-07 3.18e-08 6.48e-08 9.23e-08 5.25e-08 5.25e-08 4e-08 3.85e-07 1.96e-08 4.31e-07 3.48e-08 1.88e-08 7.13e-08 4.14e-09 4.74e-08