logo

Genes within 1Mb (chr6:137189588:G:T):

View on , UCSC , GTEx , gnomAD

Immune cell-type specific single cell cis-eQTLs in OASIS
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000027697 IFNGR1 -29861 sc-eQTL 3.81e-02 -0.232 0.111 0.107 B L1
ENSG00000029363 BCLAF1 899737 sc-eQTL 1.56e-01 0.0709 0.0498 0.107 B L1
ENSG00000112357 PEX7 367024 sc-eQTL 9.53e-01 -0.00777 0.133 0.107 B L1
ENSG00000112378 PERP -917831 sc-eQTL 3.09e-01 -0.0896 0.0878 0.107 B L1
ENSG00000118503 TNFAIP3 -677626 sc-eQTL 7.16e-01 -0.0258 0.0709 0.107 B L1
ENSG00000197442 MAP3K5 397111 sc-eQTL 9.43e-01 0.00702 0.0988 0.107 B L1
ENSG00000237499 WAKMAR2 -678645 sc-eQTL 4.30e-01 0.088 0.111 0.107 B L1
ENSG00000027697 IFNGR1 -29861 sc-eQTL 2.93e-01 -0.079 0.075 0.107 CD4T L1
ENSG00000029363 BCLAF1 899737 sc-eQTL 7.52e-01 0.018 0.0569 0.107 CD4T L1
ENSG00000112357 PEX7 367024 sc-eQTL 7.31e-01 -0.0417 0.121 0.107 CD4T L1
ENSG00000112378 PERP -917831 sc-eQTL 6.67e-01 -0.0351 0.0813 0.107 CD4T L1
ENSG00000118503 TNFAIP3 -677626 sc-eQTL 5.43e-01 -0.0464 0.0761 0.107 CD4T L1
ENSG00000197442 MAP3K5 397111 sc-eQTL 2.94e-02 -0.126 0.0574 0.107 CD4T L1
ENSG00000237499 WAKMAR2 -678645 sc-eQTL 1.83e-02 -0.225 0.0947 0.107 CD4T L1
ENSG00000027697 IFNGR1 -29861 sc-eQTL 8.26e-01 -0.0186 0.0844 0.107 CD8T L1
ENSG00000029363 BCLAF1 899737 sc-eQTL 3.46e-01 0.0539 0.057 0.107 CD8T L1
ENSG00000112357 PEX7 367024 sc-eQTL 2.54e-01 0.16 0.14 0.107 CD8T L1
ENSG00000112378 PERP -917831 sc-eQTL 5.09e-01 -0.0607 0.0919 0.107 CD8T L1
ENSG00000118503 TNFAIP3 -677626 sc-eQTL 7.48e-01 0.0228 0.071 0.107 CD8T L1
ENSG00000197442 MAP3K5 397111 sc-eQTL 4.25e-01 -0.0599 0.075 0.107 CD8T L1
ENSG00000237499 WAKMAR2 -678645 sc-eQTL 8.81e-01 -0.0157 0.104 0.107 CD8T L1
ENSG00000027697 IFNGR1 -29861 sc-eQTL 5.02e-01 0.0695 0.103 0.108 DC L1
ENSG00000029363 BCLAF1 899737 sc-eQTL 4.23e-01 0.0746 0.093 0.108 DC L1
ENSG00000112357 PEX7 367024 sc-eQTL 4.88e-02 -0.286 0.144 0.108 DC L1
ENSG00000118503 TNFAIP3 -677626 sc-eQTL 7.94e-01 -0.0289 0.111 0.108 DC L1
ENSG00000135525 MAP7 638769 sc-eQTL 8.21e-01 -0.0272 0.12 0.108 DC L1
ENSG00000197442 MAP3K5 397111 sc-eQTL 1.53e-01 0.164 0.114 0.108 DC L1
ENSG00000237499 WAKMAR2 -678645 sc-eQTL 9.94e-01 0.000832 0.113 0.108 DC L1
ENSG00000286646 AL121933.2 405543 sc-eQTL 8.75e-02 -0.255 0.149 0.108 DC L1
ENSG00000027697 IFNGR1 -29861 sc-eQTL 4.75e-02 -0.169 0.0847 0.107 Mono L1
ENSG00000029363 BCLAF1 899737 sc-eQTL 1.87e-01 0.0965 0.0728 0.107 Mono L1
ENSG00000112357 PEX7 367024 sc-eQTL 2.24e-01 -0.175 0.143 0.107 Mono L1
ENSG00000118503 TNFAIP3 -677626 sc-eQTL 9.05e-01 -0.00868 0.0725 0.107 Mono L1
ENSG00000135525 MAP7 638769 sc-eQTL 8.36e-01 -0.0264 0.127 0.107 Mono L1
ENSG00000197442 MAP3K5 397111 sc-eQTL 3.17e-01 -0.0847 0.0845 0.107 Mono L1
ENSG00000237499 WAKMAR2 -678645 sc-eQTL 8.62e-01 0.0156 0.0899 0.107 Mono L1
ENSG00000286646 AL121933.2 405543 sc-eQTL 1.06e-01 0.165 0.102 0.107 Mono L1
ENSG00000027697 IFNGR1 -29861 sc-eQTL 3.23e-01 -0.0947 0.0955 0.107 NK L1
ENSG00000029363 BCLAF1 899737 sc-eQTL 8.71e-01 0.00827 0.0508 0.107 NK L1
ENSG00000112357 PEX7 367024 sc-eQTL 7.32e-01 0.0507 0.148 0.107 NK L1
ENSG00000112378 PERP -917831 sc-eQTL 6.34e-01 -0.0443 0.093 0.107 NK L1
ENSG00000118503 TNFAIP3 -677626 sc-eQTL 1.85e-01 -0.105 0.0793 0.107 NK L1
ENSG00000197442 MAP3K5 397111 sc-eQTL 8.51e-01 -0.0215 0.114 0.107 NK L1
ENSG00000237499 WAKMAR2 -678645 sc-eQTL 1.85e-01 -0.149 0.112 0.107 NK L1
ENSG00000027697 IFNGR1 -29861 sc-eQTL 7.63e-01 -0.0267 0.0884 0.107 Other_T L1
ENSG00000029363 BCLAF1 899737 sc-eQTL 5.89e-01 -0.0401 0.0741 0.107 Other_T L1
ENSG00000112357 PEX7 367024 sc-eQTL 8.76e-01 -0.0226 0.144 0.107 Other_T L1
ENSG00000112378 PERP -917831 sc-eQTL 8.34e-01 0.0243 0.116 0.107 Other_T L1
ENSG00000118503 TNFAIP3 -677626 sc-eQTL 8.22e-01 0.0124 0.055 0.107 Other_T L1
ENSG00000146410 MTFR2 939253 sc-eQTL 4.92e-01 0.0573 0.0832 0.107 Other_T L1
ENSG00000197442 MAP3K5 397111 sc-eQTL 6.74e-01 -0.0448 0.106 0.107 Other_T L1
ENSG00000237499 WAKMAR2 -678645 sc-eQTL 8.18e-01 0.0252 0.109 0.107 Other_T L1
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000027697 IFNGR1 -29861 sc-eQTL 8.27e-01 -0.0328 0.15 0.11 B_Activated L2
ENSG00000029363 BCLAF1 899737 sc-eQTL 6.79e-02 0.222 0.121 0.11 B_Activated L2
ENSG00000112357 PEX7 367024 sc-eQTL 2.39e-01 0.174 0.147 0.11 B_Activated L2
ENSG00000112378 PERP -917831 sc-eQTL 8.08e-01 -0.0186 0.0764 0.11 B_Activated L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 -677626 sc-eQTL 9.48e-02 0.247 0.147 0.11 B_Activated L2
ENSG00000197442 MAP3K5 397111 sc-eQTL 2.82e-01 -0.178 0.165 0.11 B_Activated L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 -678645 sc-eQTL 6.86e-01 0.0524 0.129 0.11 B_Activated L2
ENSG00000027697 IFNGR1 -29861 sc-eQTL 9.28e-01 0.0118 0.131 0.107 B_Intermediate L2
ENSG00000029363 BCLAF1 899737 sc-eQTL 9.93e-01 0.0007 0.0748 0.107 B_Intermediate L2
ENSG00000112357 PEX7 367024 sc-eQTL 3.31e-01 0.134 0.137 0.107 B_Intermediate L2
ENSG00000112378 PERP -917831 sc-eQTL 3.55e-01 -0.116 0.125 0.107 B_Intermediate L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 -677626 sc-eQTL 4.35e-01 -0.0768 0.0982 0.107 B_Intermediate L2
ENSG00000197442 MAP3K5 397111 sc-eQTL 1.41e-01 -0.175 0.118 0.107 B_Intermediate L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 -678645 sc-eQTL 3.82e-01 -0.122 0.139 0.107 B_Intermediate L2
ENSG00000027697 IFNGR1 -29861 sc-eQTL 2.85e-01 -0.156 0.145 0.108 B_Memory L2
ENSG00000029363 BCLAF1 899737 sc-eQTL 1.08e-01 0.139 0.086 0.108 B_Memory L2
ENSG00000112357 PEX7 367024 sc-eQTL 6.09e-01 0.0753 0.147 0.108 B_Memory L2
ENSG00000112378 PERP -917831 sc-eQTL 3.95e-01 0.118 0.138 0.108 B_Memory L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 -677626 sc-eQTL 6.26e-01 -0.0465 0.0952 0.108 B_Memory L2
ENSG00000197442 MAP3K5 397111 sc-eQTL 3.19e-01 0.13 0.13 0.108 B_Memory L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 -678645 sc-eQTL 8.21e-01 0.0321 0.142 0.108 B_Memory L2
ENSG00000027697 IFNGR1 -29861 sc-eQTL 8.04e-02 -0.196 0.112 0.107 B_Naive1 L2
ENSG00000029363 BCLAF1 899737 sc-eQTL 6.07e-01 0.0331 0.0643 0.107 B_Naive1 L2
ENSG00000112357 PEX7 367024 sc-eQTL 5.41e-01 -0.0909 0.148 0.107 B_Naive1 L2
ENSG00000112378 PERP -917831 sc-eQTL 4.63e-01 -0.0954 0.13 0.107 B_Naive1 L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 -677626 sc-eQTL 9.05e-01 0.00898 0.0754 0.107 B_Naive1 L2
ENSG00000197442 MAP3K5 397111 sc-eQTL 2.95e-01 0.111 0.106 0.107 B_Naive1 L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 -678645 sc-eQTL 7.98e-01 -0.0303 0.118 0.107 B_Naive1 L2
ENSG00000027697 IFNGR1 -29861 sc-eQTL 1.14e-01 -0.214 0.135 0.107 B_Naive2 L2
ENSG00000029363 BCLAF1 899737 sc-eQTL 7.34e-01 -0.0268 0.0787 0.107 B_Naive2 L2
ENSG00000112357 PEX7 367024 sc-eQTL 4.17e-01 0.121 0.148 0.107 B_Naive2 L2
ENSG00000112378 PERP -917831 sc-eQTL 4.02e-01 -0.0907 0.108 0.107 B_Naive2 L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 -677626 sc-eQTL 3.56e-01 -0.0999 0.108 0.107 B_Naive2 L2
ENSG00000197442 MAP3K5 397111 sc-eQTL 1.32e-01 -0.173 0.114 0.107 B_Naive2 L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 -678645 sc-eQTL 8.79e-01 -0.0213 0.14 0.107 B_Naive2 L2
ENSG00000027697 IFNGR1 -29861 sc-eQTL 8.68e-01 0.0214 0.129 0.107 CD4_CTL L2
ENSG00000029363 BCLAF1 899737 sc-eQTL 7.81e-01 -0.0319 0.114 0.107 CD4_CTL L2
ENSG00000112357 PEX7 367024 sc-eQTL 7.60e-01 0.0437 0.143 0.107 CD4_CTL L2
ENSG00000112378 PERP -917831 sc-eQTL 3.22e-01 0.144 0.145 0.107 CD4_CTL L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 -677626 sc-eQTL 8.84e-01 0.0123 0.0846 0.107 CD4_CTL L2
ENSG00000197442 MAP3K5 397111 sc-eQTL 5.97e-01 -0.0713 0.135 0.107 CD4_CTL L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 -678645 sc-eQTL 8.50e-01 -0.0249 0.132 0.107 CD4_CTL L2
ENSG00000027697 IFNGR1 -29861 sc-eQTL 2.16e-01 -0.0881 0.0709 0.107 CD4_Naive L2
ENSG00000029363 BCLAF1 899737 sc-eQTL 9.47e-01 0.00379 0.0572 0.107 CD4_Naive L2
ENSG00000112357 PEX7 367024 sc-eQTL 6.52e-01 0.0606 0.134 0.107 CD4_Naive L2
ENSG00000112378 PERP -917831 sc-eQTL 3.92e-01 0.0951 0.111 0.107 CD4_Naive L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 -677626 sc-eQTL 7.42e-01 -0.0257 0.0778 0.107 CD4_Naive L2
ENSG00000197442 MAP3K5 397111 sc-eQTL 1.15e-02 -0.144 0.0563 0.107 CD4_Naive L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 -678645 sc-eQTL 8.88e-03 -0.262 0.0992 0.107 CD4_Naive L2
ENSG00000027697 IFNGR1 -29861 sc-eQTL 6.78e-01 -0.0407 0.0981 0.107 CD4_TCM L2
ENSG00000029363 BCLAF1 899737 sc-eQTL 4.49e-01 0.0469 0.0619 0.107 CD4_TCM L2
ENSG00000112357 PEX7 367024 sc-eQTL 9.01e-01 -0.0179 0.144 0.107 CD4_TCM L2
ENSG00000112378 PERP -917831 sc-eQTL 9.67e-01 -0.00507 0.122 0.107 CD4_TCM L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 -677626 sc-eQTL 7.39e-01 -0.0236 0.0707 0.107 CD4_TCM L2
ENSG00000197442 MAP3K5 397111 sc-eQTL 9.89e-02 -0.133 0.08 0.107 CD4_TCM L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 -678645 sc-eQTL 9.84e-01 0.00193 0.0991 0.107 CD4_TCM L2
ENSG00000027697 IFNGR1 -29861 sc-eQTL 1.32e-01 -0.168 0.111 0.107 CD4_TEM L2
ENSG00000029363 BCLAF1 899737 sc-eQTL 2.72e-01 -0.087 0.0789 0.107 CD4_TEM L2
ENSG00000112357 PEX7 367024 sc-eQTL 9.09e-01 0.0166 0.144 0.107 CD4_TEM L2
ENSG00000112378 PERP -917831 sc-eQTL 9.30e-02 -0.196 0.116 0.107 CD4_TEM L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 -677626 sc-eQTL 5.01e-01 -0.0499 0.0741 0.107 CD4_TEM L2
ENSG00000197442 MAP3K5 397111 sc-eQTL 5.19e-01 -0.0739 0.114 0.107 CD4_TEM L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 -678645 sc-eQTL 2.03e-01 -0.151 0.118 0.107 CD4_TEM L2
ENSG00000027697 IFNGR1 -29861 sc-eQTL 4.92e-01 0.0695 0.101 0.107 CD8_CTL L2
ENSG00000029363 BCLAF1 899737 sc-eQTL 6.21e-01 0.0334 0.0674 0.107 CD8_CTL L2
ENSG00000112357 PEX7 367024 sc-eQTL 3.12e-01 0.141 0.139 0.107 CD8_CTL L2
ENSG00000112378 PERP -917831 sc-eQTL 8.50e-01 -0.0254 0.134 0.107 CD8_CTL L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 -677626 sc-eQTL 8.41e-01 0.0171 0.0851 0.107 CD8_CTL L2
ENSG00000197442 MAP3K5 397111 sc-eQTL 2.06e-01 -0.152 0.12 0.107 CD8_CTL L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 -678645 sc-eQTL 7.11e-01 0.0443 0.12 0.107 CD8_CTL L2
ENSG00000027697 IFNGR1 -29861 sc-eQTL 9.24e-02 -0.169 0.1 0.107 CD8_Naive L2
ENSG00000029363 BCLAF1 899737 sc-eQTL 7.23e-01 0.025 0.0703 0.107 CD8_Naive L2
ENSG00000112357 PEX7 367024 sc-eQTL 3.19e-01 0.146 0.146 0.107 CD8_Naive L2
ENSG00000112378 PERP -917831 sc-eQTL 3.33e-01 -0.107 0.111 0.107 CD8_Naive L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 -677626 sc-eQTL 6.64e-01 -0.0343 0.0788 0.107 CD8_Naive L2
ENSG00000197442 MAP3K5 397111 sc-eQTL 5.49e-01 -0.0561 0.0933 0.107 CD8_Naive L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 -678645 sc-eQTL 3.40e-01 -0.111 0.116 0.107 CD8_Naive L2
ENSG00000027697 IFNGR1 -29861 sc-eQTL 9.05e-01 0.0158 0.132 0.111 CD8_TCM L2
ENSG00000029363 BCLAF1 899737 sc-eQTL 8.03e-01 0.0248 0.0991 0.111 CD8_TCM L2
ENSG00000112357 PEX7 367024 sc-eQTL 9.18e-01 0.0156 0.152 0.111 CD8_TCM L2
ENSG00000112378 PERP -917831 sc-eQTL 9.82e-01 0.00328 0.148 0.111 CD8_TCM L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 -677626 sc-eQTL 4.56e-01 -0.0534 0.0714 0.111 CD8_TCM L2
ENSG00000197442 MAP3K5 397111 sc-eQTL 7.03e-01 0.0487 0.128 0.111 CD8_TCM L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 -678645 sc-eQTL 9.27e-01 0.0121 0.131 0.111 CD8_TCM L2
ENSG00000027697 IFNGR1 -29861 sc-eQTL 6.23e-01 -0.0636 0.129 0.105 CD8_TEM L2
ENSG00000029363 BCLAF1 899737 sc-eQTL 1.73e-01 0.166 0.121 0.105 CD8_TEM L2
ENSG00000112357 PEX7 367024 sc-eQTL 2.64e-01 0.166 0.148 0.105 CD8_TEM L2
ENSG00000112378 PERP -917831 sc-eQTL 5.74e-01 0.087 0.155 0.105 CD8_TEM L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 -677626 sc-eQTL 8.59e-01 0.0169 0.0953 0.105 CD8_TEM L2
ENSG00000197442 MAP3K5 397111 sc-eQTL 1.53e-01 -0.211 0.147 0.105 CD8_TEM L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 -678645 sc-eQTL 2.47e-01 -0.164 0.141 0.105 CD8_TEM L2
ENSG00000027697 IFNGR1 -29861 sc-eQTL 3.07e-01 -0.104 0.102 0.108 MAIT L2
ENSG00000029363 BCLAF1 899737 sc-eQTL 5.39e-01 -0.0521 0.0847 0.108 MAIT L2
ENSG00000112357 PEX7 367024 sc-eQTL 2.98e-01 -0.144 0.138 0.108 MAIT L2
ENSG00000112378 PERP -917831 sc-eQTL 7.78e-01 -0.0408 0.144 0.108 MAIT L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 -677626 sc-eQTL 9.30e-01 -0.006 0.0687 0.108 MAIT L2
ENSG00000146410 MTFR2 939253 sc-eQTL 6.64e-01 0.0497 0.114 0.108 MAIT L2
ENSG00000197442 MAP3K5 397111 sc-eQTL 7.67e-01 -0.0355 0.12 0.108 MAIT L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 -678645 sc-eQTL 6.76e-01 -0.0531 0.127 0.108 MAIT L2
ENSG00000027697 IFNGR1 -29861 sc-eQTL 2.83e-01 -0.121 0.113 0.104 NK_CD56bright L2
ENSG00000029363 BCLAF1 899737 sc-eQTL 3.84e-01 -0.0726 0.0832 0.104 NK_CD56bright L2
ENSG00000112357 PEX7 367024 sc-eQTL 4.94e-01 0.101 0.147 0.104 NK_CD56bright L2
ENSG00000112378 PERP -917831 sc-eQTL 6.14e-01 -0.0667 0.132 0.104 NK_CD56bright L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 -677626 sc-eQTL 6.73e-01 -0.0356 0.0841 0.104 NK_CD56bright L2
ENSG00000197442 MAP3K5 397111 sc-eQTL 5.91e-01 -0.0688 0.128 0.104 NK_CD56bright L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 -678645 sc-eQTL 6.57e-01 0.0596 0.134 0.104 NK_CD56bright L2
ENSG00000027697 IFNGR1 -29861 sc-eQTL 7.85e-01 -0.0239 0.0873 0.108 NK_CD56dim L2
ENSG00000029363 BCLAF1 899737 sc-eQTL 9.41e-01 0.00419 0.0571 0.108 NK_CD56dim L2
ENSG00000112357 PEX7 367024 sc-eQTL 3.12e-01 -0.152 0.15 0.108 NK_CD56dim L2
ENSG00000112378 PERP -917831 sc-eQTL 1.58e-01 0.149 0.105 0.108 NK_CD56dim L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 -677626 sc-eQTL 4.42e-01 -0.0633 0.0822 0.108 NK_CD56dim L2
ENSG00000197442 MAP3K5 397111 sc-eQTL 9.45e-01 -0.0082 0.118 0.108 NK_CD56dim L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 -678645 sc-eQTL 8.55e-01 -0.0226 0.123 0.108 NK_CD56dim L2
ENSG00000027697 IFNGR1 -29861 sc-eQTL 1.18e-01 -0.186 0.118 0.103 NK_HLA L2
ENSG00000029363 BCLAF1 899737 sc-eQTL 5.01e-01 0.0679 0.101 0.103 NK_HLA L2
ENSG00000112357 PEX7 367024 sc-eQTL 6.03e-01 0.0788 0.151 0.103 NK_HLA L2
ENSG00000112378 PERP -917831 sc-eQTL 1.87e-01 -0.162 0.122 0.103 NK_HLA L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 -677626 sc-eQTL 3.20e-01 -0.094 0.0942 0.103 NK_HLA L2
ENSG00000197442 MAP3K5 397111 sc-eQTL 5.96e-01 0.0796 0.15 0.103 NK_HLA L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 -678645 sc-eQTL 2.44e-01 -0.177 0.152 0.103 NK_HLA L2
ENSG00000027697 IFNGR1 -29861 sc-eQTL 5.69e-01 -0.0534 0.0935 0.108 NK_cytokine L2
ENSG00000029363 BCLAF1 899737 sc-eQTL 9.99e-01 -7.22e-05 0.0698 0.108 NK_cytokine L2
ENSG00000112357 PEX7 367024 sc-eQTL 5.13e-01 0.0962 0.147 0.108 NK_cytokine L2
ENSG00000112378 PERP -917831 sc-eQTL 8.76e-01 0.0174 0.111 0.108 NK_cytokine L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 -677626 sc-eQTL 3.68e-01 -0.0753 0.0834 0.108 NK_cytokine L2
ENSG00000197442 MAP3K5 397111 sc-eQTL 5.58e-01 -0.0673 0.115 0.108 NK_cytokine L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 -678645 sc-eQTL 6.04e-02 -0.236 0.125 0.108 NK_cytokine L2
ENSG00000027697 IFNGR1 -29861 sc-eQTL 5.05e-01 -0.124 0.185 0.096 PB L2
ENSG00000029363 BCLAF1 899737 sc-eQTL 4.41e-01 -0.123 0.16 0.096 PB L2
ENSG00000112357 PEX7 367024 sc-eQTL 4.04e-01 -0.159 0.19 0.096 PB L2
ENSG00000112378 PERP -917831 sc-eQTL 3.02e-01 -0.123 0.118 0.096 PB L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 -677626 sc-eQTL 3.16e-01 0.145 0.144 0.096 PB L2
ENSG00000197442 MAP3K5 397111 sc-eQTL 7.81e-01 0.0457 0.164 0.096 PB L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 -678645 sc-eQTL 1.73e-02 0.408 0.169 0.096 PB L2
ENSG00000027697 IFNGR1 -29861 sc-eQTL 6.86e-01 -0.0469 0.116 0.107 Pro_T L2
ENSG00000029363 BCLAF1 899737 sc-eQTL 1.52e-01 0.172 0.12 0.107 Pro_T L2
ENSG00000112357 PEX7 367024 sc-eQTL 3.46e-01 0.133 0.141 0.107 Pro_T L2
ENSG00000112378 PERP -917831 sc-eQTL 6.54e-02 0.206 0.111 0.107 Pro_T L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 -677626 sc-eQTL 6.27e-01 0.0344 0.0707 0.107 Pro_T L2
ENSG00000146410 MTFR2 939253 sc-eQTL 2.76e-01 0.107 0.0977 0.107 Pro_T L2
ENSG00000197442 MAP3K5 397111 sc-eQTL 3.27e-01 -0.134 0.137 0.107 Pro_T L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 -678645 sc-eQTL 3.50e-01 -0.128 0.137 0.107 Pro_T L2
ENSG00000027697 IFNGR1 -29861 sc-eQTL 2.03e-01 -0.172 0.134 0.107 Treg L2
ENSG00000029363 BCLAF1 899737 sc-eQTL 2.84e-01 0.0933 0.0869 0.107 Treg L2
ENSG00000112357 PEX7 367024 sc-eQTL 8.41e-01 -0.0286 0.143 0.107 Treg L2
ENSG00000112378 PERP -917831 sc-eQTL 8.26e-01 -0.0339 0.154 0.107 Treg L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 -677626 sc-eQTL 8.54e-01 0.0158 0.0858 0.107 Treg L2
ENSG00000197442 MAP3K5 397111 sc-eQTL 4.63e-01 0.0682 0.0928 0.107 Treg L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 -678645 sc-eQTL 9.69e-01 0.00515 0.131 0.107 Treg L2
ENSG00000027697 IFNGR1 -29861 sc-eQTL 7.61e-01 -0.0355 0.117 0.105 cDC L2
ENSG00000029363 BCLAF1 899737 sc-eQTL 7.42e-02 0.209 0.117 0.105 cDC L2
ENSG00000112357 PEX7 367024 sc-eQTL 1.80e-01 -0.202 0.15 0.105 cDC L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 -677626 sc-eQTL 7.49e-01 -0.0369 0.115 0.105 cDC L2
ENSG00000135525 MAP7 638769 sc-eQTL 7.79e-01 0.0377 0.134 0.105 cDC L2
ENSG00000197442 MAP3K5 397111 sc-eQTL 4.53e-01 0.0889 0.118 0.105 cDC L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 -678645 sc-eQTL 8.94e-01 0.02 0.15 0.105 cDC L2
ENSG00000286646 AL121933.2 405543 sc-eQTL 6.89e-01 -0.0617 0.154 0.105 cDC L2
ENSG00000027697 IFNGR1 -29861 sc-eQTL 2.02e-01 -0.103 0.0804 0.107 cMono_IL1B L2
ENSG00000029363 BCLAF1 899737 sc-eQTL 4.41e-01 0.0667 0.0865 0.107 cMono_IL1B L2
ENSG00000112357 PEX7 367024 sc-eQTL 4.19e-01 -0.117 0.145 0.107 cMono_IL1B L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 -677626 sc-eQTL 9.81e-01 -0.00211 0.0869 0.107 cMono_IL1B L2
ENSG00000135525 MAP7 638769 sc-eQTL 2.13e-01 -0.156 0.125 0.107 cMono_IL1B L2
ENSG00000197442 MAP3K5 397111 sc-eQTL 6.20e-01 -0.0448 0.0903 0.107 cMono_IL1B L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 -678645 sc-eQTL 5.50e-01 0.0555 0.0927 0.107 cMono_IL1B L2
ENSG00000286646 AL121933.2 405543 sc-eQTL 6.75e-02 0.212 0.115 0.107 cMono_IL1B L2
ENSG00000027697 IFNGR1 -29861 sc-eQTL 1.20e-01 -0.144 0.0924 0.107 cMono_S100A L2
ENSG00000029363 BCLAF1 899737 sc-eQTL 3.53e-01 0.0886 0.0953 0.107 cMono_S100A L2
ENSG00000112357 PEX7 367024 sc-eQTL 2.54e-01 -0.17 0.149 0.107 cMono_S100A L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 -677626 sc-eQTL 9.67e-01 -0.00337 0.0826 0.107 cMono_S100A L2
ENSG00000135525 MAP7 638769 sc-eQTL 8.75e-01 -0.0219 0.139 0.107 cMono_S100A L2
ENSG00000197442 MAP3K5 397111 sc-eQTL 7.73e-01 -0.0325 0.112 0.107 cMono_S100A L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 -678645 sc-eQTL 2.58e-01 -0.134 0.118 0.107 cMono_S100A L2
ENSG00000286646 AL121933.2 405543 sc-eQTL 5.24e-01 0.0737 0.116 0.107 cMono_S100A L2
ENSG00000027697 IFNGR1 -29861 sc-eQTL 3.27e-01 0.134 0.137 0.106 gdT L2
ENSG00000029363 BCLAF1 899737 sc-eQTL 2.34e-01 -0.144 0.12 0.106 gdT L2
ENSG00000112357 PEX7 367024 sc-eQTL 6.40e-01 -0.0814 0.174 0.106 gdT L2
ENSG00000112378 PERP -917831 sc-eQTL 8.22e-01 0.0342 0.152 0.106 gdT L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 -677626 sc-eQTL 6.71e-01 0.0359 0.0843 0.106 gdT L2
ENSG00000146410 MTFR2 939253 sc-eQTL 4.91e-01 0.0917 0.133 0.106 gdT L2
ENSG00000197442 MAP3K5 397111 sc-eQTL 2.87e-01 0.19 0.178 0.106 gdT L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 -678645 sc-eQTL 8.55e-01 -0.028 0.153 0.106 gdT L2
ENSG00000027697 IFNGR1 -29861 sc-eQTL 4.36e-01 -0.081 0.104 0.107 intMono L2
ENSG00000029363 BCLAF1 899737 sc-eQTL 5.96e-02 0.258 0.136 0.107 intMono L2
ENSG00000112357 PEX7 367024 sc-eQTL 8.54e-01 -0.0258 0.14 0.107 intMono L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 -677626 sc-eQTL 1.52e-01 0.128 0.0892 0.107 intMono L2
ENSG00000135525 MAP7 638769 sc-eQTL 5.50e-01 0.0824 0.138 0.107 intMono L2
ENSG00000197442 MAP3K5 397111 sc-eQTL 9.15e-01 -0.0157 0.146 0.107 intMono L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 -678645 sc-eQTL 2.76e-01 0.145 0.133 0.107 intMono L2
ENSG00000286646 AL121933.2 405543 sc-eQTL 1.32e-01 0.231 0.153 0.107 intMono L2
ENSG00000027697 IFNGR1 -29861 sc-eQTL 2.13e-01 -0.147 0.117 0.109 ncMono L2
ENSG00000029363 BCLAF1 899737 sc-eQTL 7.04e-01 -0.0348 0.0916 0.109 ncMono L2
ENSG00000112357 PEX7 367024 sc-eQTL 7.62e-01 -0.0443 0.146 0.109 ncMono L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 -677626 sc-eQTL 5.31e-01 0.0655 0.104 0.109 ncMono L2
ENSG00000135525 MAP7 638769 sc-eQTL 2.58e-01 0.146 0.129 0.109 ncMono L2
ENSG00000197442 MAP3K5 397111 sc-eQTL 1.29e-01 -0.206 0.135 0.109 ncMono L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 -678645 sc-eQTL 9.97e-01 0.00051 0.131 0.109 ncMono L2
ENSG00000286646 AL121933.2 405543 sc-eQTL 6.97e-01 -0.0536 0.138 0.109 ncMono L2
ENSG00000027697 IFNGR1 -29861 sc-eQTL 8.29e-01 0.0281 0.13 0.116 pDC L2
ENSG00000029363 BCLAF1 899737 sc-eQTL 4.21e-01 0.0785 0.0973 0.116 pDC L2
ENSG00000112357 PEX7 367024 sc-eQTL 4.67e-01 -0.104 0.143 0.116 pDC L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 -677626 sc-eQTL 7.30e-01 0.0417 0.12 0.116 pDC L2
ENSG00000135525 MAP7 638769 sc-eQTL 9.96e-02 -0.164 0.0991 0.116 pDC L2
ENSG00000197442 MAP3K5 397111 sc-eQTL 5.56e-01 0.0943 0.16 0.116 pDC L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 -678645 sc-eQTL 8.95e-01 0.0161 0.122 0.116 pDC L2
ENSG00000286646 AL121933.2 405543 sc-eQTL 1.54e-01 -0.21 0.147 0.116 pDC L2
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000027697 IFNGR1 -29861 sc-eQTL 5.12e-01 -0.0769 0.117 0.107 B_Memory LOneK1K
ENSG00000029363 BCLAF1 899737 sc-eQTL 2.45e-01 0.0765 0.0656 0.107 B_Memory LOneK1K
ENSG00000112357 PEX7 367024 sc-eQTL 4.54e-01 0.101 0.135 0.107 B_Memory LOneK1K
ENSG00000112378 PERP -917831 sc-eQTL 8.00e-01 0.0318 0.125 0.107 B_Memory LOneK1K
ENSG00000118503 TNFAIP3 -677626 sc-eQTL 4.68e-01 -0.0601 0.0826 0.107 B_Memory LOneK1K
ENSG00000197442 MAP3K5 397111 sc-eQTL 5.98e-01 -0.0578 0.109 0.107 B_Memory LOneK1K
ENSG00000237499 WAKMAR2 -678645 sc-eQTL 8.05e-01 -0.0345 0.14 0.107 B_Memory LOneK1K
ENSG00000027697 IFNGR1 -29861 sc-eQTL 1.84e-02 -0.279 0.117 0.107 B_Naive LOneK1K
ENSG00000029363 BCLAF1 899737 sc-eQTL 6.95e-01 0.0215 0.0546 0.107 B_Naive LOneK1K
ENSG00000112357 PEX7 367024 sc-eQTL 7.71e-01 -0.0422 0.145 0.107 B_Naive LOneK1K
ENSG00000112378 PERP -917831 sc-eQTL 4.17e-01 -0.105 0.129 0.107 B_Naive LOneK1K
ENSG00000118503 TNFAIP3 -677626 sc-eQTL 9.13e-01 -0.00741 0.0681 0.107 B_Naive LOneK1K
ENSG00000197442 MAP3K5 397111 sc-eQTL 3.05e-01 0.102 0.0995 0.107 B_Naive LOneK1K
ENSG00000237499 WAKMAR2 -678645 sc-eQTL 9.72e-01 0.00424 0.121 0.107 B_Naive LOneK1K
ENSG00000027697 IFNGR1 -29861 sc-eQTL 9.29e-02 -0.135 0.0801 0.107 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000029363 BCLAF1 899737 sc-eQTL 2.11e-01 0.0939 0.0748 0.107 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000112357 PEX7 367024 sc-eQTL 1.37e-01 -0.215 0.144 0.107 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000118503 TNFAIP3 -677626 sc-eQTL 9.85e-01 -0.00139 0.0746 0.107 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000135525 MAP7 638769 sc-eQTL 3.70e-01 -0.116 0.129 0.107 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000197442 MAP3K5 397111 sc-eQTL 4.82e-01 -0.0614 0.0873 0.107 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000237499 WAKMAR2 -678645 sc-eQTL 9.17e-01 0.00932 0.0894 0.107 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000286646 AL121933.2 405543 sc-eQTL 1.06e-01 0.168 0.103 0.107 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000027697 IFNGR1 -29861 sc-eQTL 8.86e-02 -0.167 0.0979 0.108 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000029363 BCLAF1 899737 sc-eQTL 2.84e-01 0.0954 0.0888 0.108 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000112357 PEX7 367024 sc-eQTL 9.06e-01 0.0176 0.149 0.108 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000118503 TNFAIP3 -677626 sc-eQTL 3.23e-01 0.0911 0.0919 0.108 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000135525 MAP7 638769 sc-eQTL 3.58e-01 0.132 0.144 0.108 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000197442 MAP3K5 397111 sc-eQTL 2.87e-01 -0.126 0.118 0.108 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000237499 WAKMAR2 -678645 sc-eQTL 5.50e-01 0.0739 0.123 0.108 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000286646 AL121933.2 405543 sc-eQTL 6.68e-01 0.0602 0.14 0.108 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000027697 IFNGR1 -29861 sc-eQTL 3.03e-01 -0.0926 0.0897 0.108 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000029363 BCLAF1 899737 sc-eQTL 6.01e-01 0.0273 0.0521 0.108 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000112357 PEX7 367024 sc-eQTL 8.23e-01 -0.0339 0.152 0.108 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000112378 PERP -917831 sc-eQTL 9.81e-01 -0.00223 0.094 0.108 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000118503 TNFAIP3 -677626 sc-eQTL 1.88e-01 -0.108 0.0816 0.108 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000197442 MAP3K5 397111 sc-eQTL 8.95e-01 -0.0146 0.111 0.108 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000237499 WAKMAR2 -678645 sc-eQTL 9.85e-02 -0.189 0.114 0.108 NK_CD56dim LOneK1K

Statistical fine-mapping results from Japan COVID-19 Task Force
(Shown only for PIP>0.001)
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
PIP (SuSiE)
PIP (FINEMAP)
MAF
ENSG00000027697 IFNGR1 -29861 eQTL 0.0298 -0.0507 0.0233 0.0 0.0 0.0888
ENSG00000220412 AL356234.1 -517613 eQTL 0.0138 -0.102 0.0414 0.00226 0.0 0.0888

Expression Modifier Score(EMS) for GTEx 49tissues
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Whole Blood
Muscle Skeletal
Liver
Brain Cerebellum
Prostate
Spleen
Skin Sun Exposed Lower leg
Artery Coronary
Esophagus Muscularis
Esophagus Gastroesophageal Junction
Artery Tibial
Heart Atrial Appendage
Nerve Tibial
Heart Left Ventricle
Adrenal Gland
Adipose Visceral Omentum
Pancreas
Lung
Pituitary
Brain Nucleus accumbens basal ganglia
Colon Transverse
Adipose Subcutaneous
Esophagus Mucosa
Brain Cortex
Thyroid
Stomach
Breast Mammary Tissue
Colon Sigmoid
Skin Not Sun Exposed Suprapubic
Testis
Artery Aorta
Brain Amygdala
Brain Anterior cingulate cortex BA24
Brain Caudate basal ganglia
Brain Cerebellar Hemisphere
Brain Frontal Cortex BA9
Brain Hippocampus
Brain Hypothalamus
Brain Putamen basal ganglia
Brain Spinal cord cervical c-1
Brain Substantia nigra
Cells Cultured fibroblasts
Cells EBV-transformed lymphocytes
Kidney Cortex
Minor Salivary Gland
Ovary
Small Intestine Terminal Ileum
Uterus
Vagina