logo

Genes within 1Mb (chr6:137182318:A:G):

View on , UCSC , GTEx , gnomAD

Immune cell-type specific single cell cis-eQTLs in OASIS
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000027697 IFNGR1 -37131 sc-eQTL 2.47e-02 -0.248 0.109 0.115 B L1
ENSG00000029363 BCLAF1 892467 sc-eQTL 3.75e-01 0.0438 0.0492 0.115 B L1
ENSG00000112357 PEX7 359754 sc-eQTL 8.88e-01 -0.0185 0.131 0.115 B L1
ENSG00000112378 PERP -925101 sc-eQTL 4.55e-01 -0.0649 0.0867 0.115 B L1
ENSG00000118503 TNFAIP3 -684896 sc-eQTL 8.29e-01 -0.0151 0.0699 0.115 B L1
ENSG00000197442 MAP3K5 389841 sc-eQTL 7.54e-01 0.0305 0.0974 0.115 B L1
ENSG00000237499 WAKMAR2 -685915 sc-eQTL 5.21e-01 0.0707 0.11 0.115 B L1
ENSG00000027697 IFNGR1 -37131 sc-eQTL 5.47e-01 -0.0444 0.0735 0.115 CD4T L1
ENSG00000029363 BCLAF1 892467 sc-eQTL 8.80e-01 -0.00839 0.0557 0.115 CD4T L1
ENSG00000112357 PEX7 359754 sc-eQTL 9.12e-01 -0.0131 0.119 0.115 CD4T L1
ENSG00000112378 PERP -925101 sc-eQTL 9.53e-01 -0.00473 0.0796 0.115 CD4T L1
ENSG00000118503 TNFAIP3 -684896 sc-eQTL 6.83e-01 -0.0304 0.0745 0.115 CD4T L1
ENSG00000197442 MAP3K5 389841 sc-eQTL 2.21e-02 -0.129 0.0561 0.115 CD4T L1
ENSG00000237499 WAKMAR2 -685915 sc-eQTL 7.93e-03 -0.247 0.0923 0.115 CD4T L1
ENSG00000027697 IFNGR1 -37131 sc-eQTL 8.52e-01 0.0155 0.0829 0.115 CD8T L1
ENSG00000029363 BCLAF1 892467 sc-eQTL 6.06e-01 0.029 0.0561 0.115 CD8T L1
ENSG00000112357 PEX7 359754 sc-eQTL 2.65e-01 0.154 0.138 0.115 CD8T L1
ENSG00000112378 PERP -925101 sc-eQTL 9.18e-01 -0.00936 0.0904 0.115 CD8T L1
ENSG00000118503 TNFAIP3 -684896 sc-eQTL 6.61e-01 0.0306 0.0697 0.115 CD8T L1
ENSG00000197442 MAP3K5 389841 sc-eQTL 4.88e-01 -0.0511 0.0736 0.115 CD8T L1
ENSG00000237499 WAKMAR2 -685915 sc-eQTL 8.98e-01 -0.0132 0.102 0.115 CD8T L1
ENSG00000027697 IFNGR1 -37131 sc-eQTL 1.89e-01 0.132 0.1 0.117 DC L1
ENSG00000029363 BCLAF1 892467 sc-eQTL 6.77e-01 0.0378 0.0907 0.117 DC L1
ENSG00000112357 PEX7 359754 sc-eQTL 3.42e-02 -0.3 0.14 0.117 DC L1
ENSG00000118503 TNFAIP3 -684896 sc-eQTL 7.55e-01 -0.0337 0.108 0.117 DC L1
ENSG00000135525 MAP7 631499 sc-eQTL 7.72e-01 -0.0339 0.117 0.117 DC L1
ENSG00000197442 MAP3K5 389841 sc-eQTL 2.47e-01 0.13 0.112 0.117 DC L1
ENSG00000237499 WAKMAR2 -685915 sc-eQTL 9.65e-01 -0.00476 0.11 0.117 DC L1
ENSG00000286646 AL121933.2 398273 sc-eQTL 1.57e-01 -0.206 0.145 0.117 DC L1
ENSG00000027697 IFNGR1 -37131 sc-eQTL 4.25e-02 -0.169 0.0827 0.115 Mono L1
ENSG00000029363 BCLAF1 892467 sc-eQTL 2.98e-01 0.0743 0.0712 0.115 Mono L1
ENSG00000112357 PEX7 359754 sc-eQTL 2.84e-01 -0.151 0.14 0.115 Mono L1
ENSG00000118503 TNFAIP3 -684896 sc-eQTL 5.28e-01 -0.0447 0.0708 0.115 Mono L1
ENSG00000135525 MAP7 631499 sc-eQTL 7.78e-01 -0.035 0.124 0.115 Mono L1
ENSG00000197442 MAP3K5 389841 sc-eQTL 1.99e-01 -0.106 0.0824 0.115 Mono L1
ENSG00000237499 WAKMAR2 -685915 sc-eQTL 7.61e-01 0.0267 0.0878 0.115 Mono L1
ENSG00000286646 AL121933.2 398273 sc-eQTL 2.48e-01 0.116 0.0999 0.115 Mono L1
ENSG00000027697 IFNGR1 -37131 sc-eQTL 6.64e-01 -0.0411 0.0943 0.116 NK L1
ENSG00000029363 BCLAF1 892467 sc-eQTL 6.68e-01 -0.0215 0.0501 0.116 NK L1
ENSG00000112357 PEX7 359754 sc-eQTL 6.13e-01 0.0737 0.146 0.116 NK L1
ENSG00000112378 PERP -925101 sc-eQTL 6.69e-01 -0.0393 0.0917 0.116 NK L1
ENSG00000118503 TNFAIP3 -684896 sc-eQTL 1.77e-01 -0.106 0.0782 0.116 NK L1
ENSG00000197442 MAP3K5 389841 sc-eQTL 7.84e-01 -0.0308 0.113 0.116 NK L1
ENSG00000237499 WAKMAR2 -685915 sc-eQTL 3.57e-01 -0.103 0.111 0.116 NK L1
ENSG00000027697 IFNGR1 -37131 sc-eQTL 8.99e-01 -0.011 0.0866 0.115 Other_T L1
ENSG00000029363 BCLAF1 892467 sc-eQTL 3.29e-01 -0.071 0.0725 0.115 Other_T L1
ENSG00000112357 PEX7 359754 sc-eQTL 9.71e-01 0.00512 0.141 0.115 Other_T L1
ENSG00000112378 PERP -925101 sc-eQTL 5.82e-01 0.0624 0.113 0.115 Other_T L1
ENSG00000118503 TNFAIP3 -684896 sc-eQTL 7.66e-01 0.016 0.0539 0.115 Other_T L1
ENSG00000146410 MTFR2 931983 sc-eQTL 6.68e-01 0.0351 0.0816 0.115 Other_T L1
ENSG00000197442 MAP3K5 389841 sc-eQTL 4.05e-01 -0.0868 0.104 0.115 Other_T L1
ENSG00000237499 WAKMAR2 -685915 sc-eQTL 6.85e-01 0.0434 0.107 0.115 Other_T L1
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000027697 IFNGR1 -37131 sc-eQTL 8.42e-01 -0.0295 0.148 0.12 B_Activated L2
ENSG00000029363 BCLAF1 892467 sc-eQTL 9.25e-02 0.201 0.119 0.12 B_Activated L2
ENSG00000112357 PEX7 359754 sc-eQTL 3.26e-01 0.143 0.145 0.12 B_Activated L2
ENSG00000112378 PERP -925101 sc-eQTL 7.62e-01 -0.0228 0.0752 0.12 B_Activated L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 -684896 sc-eQTL 9.42e-02 0.243 0.145 0.12 B_Activated L2
ENSG00000197442 MAP3K5 389841 sc-eQTL 3.20e-01 -0.162 0.163 0.12 B_Activated L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 -685915 sc-eQTL 2.32e-01 0.152 0.127 0.12 B_Activated L2
ENSG00000027697 IFNGR1 -37131 sc-eQTL 7.34e-01 0.0441 0.13 0.116 B_Intermediate L2
ENSG00000029363 BCLAF1 892467 sc-eQTL 6.00e-01 -0.0387 0.0737 0.116 B_Intermediate L2
ENSG00000112357 PEX7 359754 sc-eQTL 3.25e-01 0.134 0.135 0.116 B_Intermediate L2
ENSG00000112378 PERP -925101 sc-eQTL 3.23e-01 -0.122 0.123 0.116 B_Intermediate L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 -684896 sc-eQTL 7.16e-01 -0.0353 0.097 0.116 B_Intermediate L2
ENSG00000197442 MAP3K5 389841 sc-eQTL 9.33e-02 -0.196 0.117 0.116 B_Intermediate L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 -685915 sc-eQTL 3.67e-01 -0.124 0.137 0.116 B_Intermediate L2
ENSG00000027697 IFNGR1 -37131 sc-eQTL 4.07e-01 -0.119 0.143 0.116 B_Memory L2
ENSG00000029363 BCLAF1 892467 sc-eQTL 1.83e-01 0.113 0.0849 0.116 B_Memory L2
ENSG00000112357 PEX7 359754 sc-eQTL 4.12e-01 0.119 0.145 0.116 B_Memory L2
ENSG00000112378 PERP -925101 sc-eQTL 1.58e-01 0.192 0.136 0.116 B_Memory L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 -684896 sc-eQTL 7.83e-01 -0.0259 0.0938 0.116 B_Memory L2
ENSG00000197442 MAP3K5 389841 sc-eQTL 2.67e-01 0.142 0.128 0.116 B_Memory L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 -685915 sc-eQTL 7.72e-01 -0.0405 0.14 0.116 B_Memory L2
ENSG00000027697 IFNGR1 -37131 sc-eQTL 2.86e-02 -0.243 0.11 0.115 B_Naive1 L2
ENSG00000029363 BCLAF1 892467 sc-eQTL 8.56e-01 0.0116 0.0636 0.115 B_Naive1 L2
ENSG00000112357 PEX7 359754 sc-eQTL 4.98e-01 -0.0996 0.147 0.115 B_Naive1 L2
ENSG00000112378 PERP -925101 sc-eQTL 3.13e-01 -0.13 0.128 0.115 B_Naive1 L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 -684896 sc-eQTL 6.06e-01 0.0385 0.0745 0.115 B_Naive1 L2
ENSG00000197442 MAP3K5 389841 sc-eQTL 2.68e-01 0.116 0.104 0.115 B_Naive1 L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 -685915 sc-eQTL 9.86e-01 0.00206 0.117 0.115 B_Naive1 L2
ENSG00000027697 IFNGR1 -37131 sc-eQTL 5.28e-02 -0.257 0.132 0.116 B_Naive2 L2
ENSG00000029363 BCLAF1 892467 sc-eQTL 7.59e-01 -0.0237 0.0772 0.116 B_Naive2 L2
ENSG00000112357 PEX7 359754 sc-eQTL 6.97e-01 0.0568 0.146 0.116 B_Naive2 L2
ENSG00000112378 PERP -925101 sc-eQTL 6.63e-01 -0.0464 0.106 0.116 B_Naive2 L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 -684896 sc-eQTL 5.38e-01 -0.0655 0.106 0.116 B_Naive2 L2
ENSG00000197442 MAP3K5 389841 sc-eQTL 1.91e-01 -0.148 0.112 0.116 B_Naive2 L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 -685915 sc-eQTL 7.55e-01 -0.0429 0.137 0.116 B_Naive2 L2
ENSG00000027697 IFNGR1 -37131 sc-eQTL 8.04e-01 -0.0314 0.127 0.114 CD4_CTL L2
ENSG00000029363 BCLAF1 892467 sc-eQTL 9.03e-01 -0.0136 0.112 0.114 CD4_CTL L2
ENSG00000112357 PEX7 359754 sc-eQTL 8.71e-01 0.0229 0.14 0.114 CD4_CTL L2
ENSG00000112378 PERP -925101 sc-eQTL 2.33e-01 0.17 0.142 0.114 CD4_CTL L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 -684896 sc-eQTL 5.07e-01 0.0551 0.0829 0.114 CD4_CTL L2
ENSG00000197442 MAP3K5 389841 sc-eQTL 6.86e-01 -0.0536 0.132 0.114 CD4_CTL L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 -685915 sc-eQTL 7.74e-01 -0.0371 0.129 0.114 CD4_CTL L2
ENSG00000027697 IFNGR1 -37131 sc-eQTL 3.46e-01 -0.0657 0.0696 0.115 CD4_Naive L2
ENSG00000029363 BCLAF1 892467 sc-eQTL 7.46e-01 -0.0181 0.056 0.115 CD4_Naive L2
ENSG00000112357 PEX7 359754 sc-eQTL 3.86e-01 0.114 0.131 0.115 CD4_Naive L2
ENSG00000112378 PERP -925101 sc-eQTL 4.15e-01 0.0885 0.108 0.115 CD4_Naive L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 -684896 sc-eQTL 8.13e-01 -0.0181 0.0762 0.115 CD4_Naive L2
ENSG00000197442 MAP3K5 389841 sc-eQTL 5.68e-03 -0.154 0.055 0.115 CD4_Naive L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 -685915 sc-eQTL 3.46e-03 -0.286 0.0968 0.115 CD4_Naive L2
ENSG00000027697 IFNGR1 -37131 sc-eQTL 9.62e-01 -0.00466 0.0966 0.115 CD4_TCM L2
ENSG00000029363 BCLAF1 892467 sc-eQTL 4.46e-01 0.0465 0.0609 0.115 CD4_TCM L2
ENSG00000112357 PEX7 359754 sc-eQTL 9.35e-01 0.0117 0.142 0.115 CD4_TCM L2
ENSG00000112378 PERP -925101 sc-eQTL 7.70e-01 0.035 0.12 0.115 CD4_TCM L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 -684896 sc-eQTL 6.94e-01 -0.0274 0.0696 0.115 CD4_TCM L2
ENSG00000197442 MAP3K5 389841 sc-eQTL 1.42e-01 -0.116 0.0789 0.115 CD4_TCM L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 -685915 sc-eQTL 9.68e-01 -0.00394 0.0976 0.115 CD4_TCM L2
ENSG00000027697 IFNGR1 -37131 sc-eQTL 1.41e-01 -0.161 0.109 0.115 CD4_TEM L2
ENSG00000029363 BCLAF1 892467 sc-eQTL 1.57e-01 -0.11 0.0774 0.115 CD4_TEM L2
ENSG00000112357 PEX7 359754 sc-eQTL 6.17e-01 -0.0708 0.142 0.115 CD4_TEM L2
ENSG00000112378 PERP -925101 sc-eQTL 3.69e-02 -0.238 0.114 0.115 CD4_TEM L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 -684896 sc-eQTL 5.98e-01 -0.0384 0.0728 0.115 CD4_TEM L2
ENSG00000197442 MAP3K5 389841 sc-eQTL 6.72e-01 -0.0478 0.112 0.115 CD4_TEM L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 -685915 sc-eQTL 2.30e-01 -0.14 0.116 0.115 CD4_TEM L2
ENSG00000027697 IFNGR1 -37131 sc-eQTL 3.42e-01 0.0942 0.099 0.115 CD8_CTL L2
ENSG00000029363 BCLAF1 892467 sc-eQTL 9.96e-01 0.000329 0.0662 0.115 CD8_CTL L2
ENSG00000112357 PEX7 359754 sc-eQTL 2.25e-01 0.166 0.136 0.115 CD8_CTL L2
ENSG00000112378 PERP -925101 sc-eQTL 7.67e-01 0.0389 0.131 0.115 CD8_CTL L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 -684896 sc-eQTL 7.89e-01 0.0224 0.0835 0.115 CD8_CTL L2
ENSG00000197442 MAP3K5 389841 sc-eQTL 1.78e-01 -0.159 0.117 0.115 CD8_CTL L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 -685915 sc-eQTL 6.93e-01 0.0465 0.117 0.115 CD8_CTL L2
ENSG00000027697 IFNGR1 -37131 sc-eQTL 2.28e-01 -0.12 0.0989 0.115 CD8_Naive L2
ENSG00000029363 BCLAF1 892467 sc-eQTL 9.62e-01 0.00327 0.0693 0.115 CD8_Naive L2
ENSG00000112357 PEX7 359754 sc-eQTL 3.18e-01 0.144 0.143 0.115 CD8_Naive L2
ENSG00000112378 PERP -925101 sc-eQTL 5.64e-01 -0.0631 0.109 0.115 CD8_Naive L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 -684896 sc-eQTL 8.66e-01 -0.0131 0.0776 0.115 CD8_Naive L2
ENSG00000197442 MAP3K5 389841 sc-eQTL 6.54e-01 -0.0413 0.0919 0.115 CD8_Naive L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 -685915 sc-eQTL 3.40e-01 -0.11 0.115 0.115 CD8_Naive L2
ENSG00000027697 IFNGR1 -37131 sc-eQTL 7.71e-01 0.0377 0.129 0.118 CD8_TCM L2
ENSG00000029363 BCLAF1 892467 sc-eQTL 8.87e-01 0.0138 0.0969 0.118 CD8_TCM L2
ENSG00000112357 PEX7 359754 sc-eQTL 7.34e-01 0.0505 0.148 0.118 CD8_TCM L2
ENSG00000112378 PERP -925101 sc-eQTL 9.33e-01 0.0122 0.145 0.118 CD8_TCM L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 -684896 sc-eQTL 5.67e-01 -0.0401 0.0699 0.118 CD8_TCM L2
ENSG00000197442 MAP3K5 389841 sc-eQTL 6.99e-01 0.0484 0.125 0.118 CD8_TCM L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 -685915 sc-eQTL 9.49e-01 -0.00827 0.128 0.118 CD8_TCM L2
ENSG00000027697 IFNGR1 -37131 sc-eQTL 6.70e-01 -0.0539 0.126 0.114 CD8_TEM L2
ENSG00000029363 BCLAF1 892467 sc-eQTL 2.14e-01 0.148 0.119 0.114 CD8_TEM L2
ENSG00000112357 PEX7 359754 sc-eQTL 2.75e-01 0.159 0.145 0.114 CD8_TEM L2
ENSG00000112378 PERP -925101 sc-eQTL 3.10e-01 0.154 0.151 0.114 CD8_TEM L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 -684896 sc-eQTL 8.88e-01 0.0131 0.0932 0.114 CD8_TEM L2
ENSG00000197442 MAP3K5 389841 sc-eQTL 1.68e-01 -0.199 0.143 0.114 CD8_TEM L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 -685915 sc-eQTL 1.51e-01 -0.198 0.138 0.114 CD8_TEM L2
ENSG00000027697 IFNGR1 -37131 sc-eQTL 3.22e-01 -0.0989 0.0997 0.117 MAIT L2
ENSG00000029363 BCLAF1 892467 sc-eQTL 3.02e-01 -0.0857 0.0828 0.117 MAIT L2
ENSG00000112357 PEX7 359754 sc-eQTL 1.68e-01 -0.187 0.135 0.117 MAIT L2
ENSG00000112378 PERP -925101 sc-eQTL 8.16e-01 0.0329 0.141 0.117 MAIT L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 -684896 sc-eQTL 8.30e-01 -0.0144 0.0672 0.117 MAIT L2
ENSG00000146410 MTFR2 931983 sc-eQTL 9.40e-01 0.00839 0.112 0.117 MAIT L2
ENSG00000197442 MAP3K5 389841 sc-eQTL 8.51e-01 -0.0221 0.117 0.117 MAIT L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 -685915 sc-eQTL 7.71e-01 -0.0363 0.124 0.117 MAIT L2
ENSG00000027697 IFNGR1 -37131 sc-eQTL 5.57e-01 -0.065 0.111 0.113 NK_CD56bright L2
ENSG00000029363 BCLAF1 892467 sc-eQTL 2.64e-01 -0.0913 0.0815 0.113 NK_CD56bright L2
ENSG00000112357 PEX7 359754 sc-eQTL 6.88e-01 0.0581 0.144 0.113 NK_CD56bright L2
ENSG00000112378 PERP -925101 sc-eQTL 9.46e-01 -0.00878 0.129 0.113 NK_CD56bright L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 -684896 sc-eQTL 3.44e-01 -0.078 0.0823 0.113 NK_CD56bright L2
ENSG00000197442 MAP3K5 389841 sc-eQTL 3.40e-01 -0.12 0.125 0.113 NK_CD56bright L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 -685915 sc-eQTL 8.09e-01 0.0318 0.131 0.113 NK_CD56bright L2
ENSG00000027697 IFNGR1 -37131 sc-eQTL 7.41e-01 0.0284 0.0857 0.116 NK_CD56dim L2
ENSG00000029363 BCLAF1 892467 sc-eQTL 4.60e-01 -0.0414 0.0559 0.116 NK_CD56dim L2
ENSG00000112357 PEX7 359754 sc-eQTL 3.06e-01 -0.151 0.147 0.116 NK_CD56dim L2
ENSG00000112378 PERP -925101 sc-eQTL 9.98e-02 0.171 0.103 0.116 NK_CD56dim L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 -684896 sc-eQTL 4.61e-01 -0.0596 0.0806 0.116 NK_CD56dim L2
ENSG00000197442 MAP3K5 389841 sc-eQTL 7.89e-01 -0.0311 0.116 0.116 NK_CD56dim L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 -685915 sc-eQTL 8.90e-01 0.0167 0.121 0.116 NK_CD56dim L2
ENSG00000027697 IFNGR1 -37131 sc-eQTL 9.92e-02 -0.19 0.115 0.112 NK_HLA L2
ENSG00000029363 BCLAF1 892467 sc-eQTL 4.83e-01 0.0687 0.0977 0.112 NK_HLA L2
ENSG00000112357 PEX7 359754 sc-eQTL 8.28e-01 0.0319 0.147 0.112 NK_HLA L2
ENSG00000112378 PERP -925101 sc-eQTL 5.54e-01 -0.0705 0.119 0.112 NK_HLA L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 -684896 sc-eQTL 4.37e-01 -0.0712 0.0914 0.112 NK_HLA L2
ENSG00000197442 MAP3K5 389841 sc-eQTL 9.12e-01 0.016 0.146 0.112 NK_HLA L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 -685915 sc-eQTL 1.88e-01 -0.194 0.147 0.112 NK_HLA L2
ENSG00000027697 IFNGR1 -37131 sc-eQTL 8.67e-01 -0.0155 0.0919 0.116 NK_cytokine L2
ENSG00000029363 BCLAF1 892467 sc-eQTL 7.76e-01 -0.0195 0.0686 0.116 NK_cytokine L2
ENSG00000112357 PEX7 359754 sc-eQTL 1.10e-01 0.23 0.143 0.116 NK_cytokine L2
ENSG00000112378 PERP -925101 sc-eQTL 7.78e-01 -0.0309 0.109 0.116 NK_cytokine L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 -684896 sc-eQTL 5.25e-01 -0.0522 0.082 0.116 NK_cytokine L2
ENSG00000197442 MAP3K5 389841 sc-eQTL 4.74e-01 -0.0808 0.113 0.116 NK_cytokine L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 -685915 sc-eQTL 1.60e-01 -0.173 0.123 0.116 NK_cytokine L2
ENSG00000027697 IFNGR1 -37131 sc-eQTL 4.91e-01 -0.124 0.179 0.107 PB L2
ENSG00000029363 BCLAF1 892467 sc-eQTL 2.24e-01 -0.188 0.154 0.107 PB L2
ENSG00000112357 PEX7 359754 sc-eQTL 9.09e-01 -0.0212 0.184 0.107 PB L2
ENSG00000112378 PERP -925101 sc-eQTL 1.93e-01 -0.15 0.114 0.107 PB L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 -684896 sc-eQTL 4.62e-01 0.103 0.139 0.107 PB L2
ENSG00000197442 MAP3K5 389841 sc-eQTL 8.63e-01 -0.0276 0.159 0.107 PB L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 -685915 sc-eQTL 1.16e-02 0.418 0.163 0.107 PB L2
ENSG00000027697 IFNGR1 -37131 sc-eQTL 9.20e-01 -0.0114 0.113 0.115 Pro_T L2
ENSG00000029363 BCLAF1 892467 sc-eQTL 3.83e-01 0.103 0.117 0.115 Pro_T L2
ENSG00000112357 PEX7 359754 sc-eQTL 1.89e-01 0.181 0.137 0.115 Pro_T L2
ENSG00000112378 PERP -925101 sc-eQTL 7.16e-02 0.197 0.109 0.115 Pro_T L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 -684896 sc-eQTL 5.20e-01 0.0444 0.069 0.115 Pro_T L2
ENSG00000146410 MTFR2 931983 sc-eQTL 2.71e-01 0.105 0.0954 0.115 Pro_T L2
ENSG00000197442 MAP3K5 389841 sc-eQTL 7.75e-02 -0.235 0.133 0.115 Pro_T L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 -685915 sc-eQTL 4.80e-01 -0.0946 0.134 0.115 Pro_T L2
ENSG00000027697 IFNGR1 -37131 sc-eQTL 2.12e-01 -0.165 0.131 0.115 Treg L2
ENSG00000029363 BCLAF1 892467 sc-eQTL 3.83e-01 0.0743 0.085 0.115 Treg L2
ENSG00000112357 PEX7 359754 sc-eQTL 7.87e-01 -0.0378 0.139 0.115 Treg L2
ENSG00000112378 PERP -925101 sc-eQTL 8.72e-01 0.0243 0.151 0.115 Treg L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 -684896 sc-eQTL 9.27e-01 0.00771 0.0838 0.115 Treg L2
ENSG00000197442 MAP3K5 389841 sc-eQTL 3.46e-01 0.0855 0.0906 0.115 Treg L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 -685915 sc-eQTL 9.70e-01 -0.00479 0.128 0.115 Treg L2
ENSG00000027697 IFNGR1 -37131 sc-eQTL 6.49e-01 -0.0519 0.114 0.115 cDC L2
ENSG00000029363 BCLAF1 892467 sc-eQTL 1.70e-01 0.157 0.114 0.115 cDC L2
ENSG00000112357 PEX7 359754 sc-eQTL 1.49e-01 -0.212 0.146 0.115 cDC L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 -684896 sc-eQTL 8.27e-01 -0.0245 0.112 0.115 cDC L2
ENSG00000135525 MAP7 631499 sc-eQTL 7.97e-01 0.0339 0.131 0.115 cDC L2
ENSG00000197442 MAP3K5 389841 sc-eQTL 5.58e-01 0.0677 0.115 0.115 cDC L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 -685915 sc-eQTL 7.64e-01 0.0439 0.146 0.115 cDC L2
ENSG00000286646 AL121933.2 398273 sc-eQTL 8.65e-01 -0.0255 0.15 0.115 cDC L2
ENSG00000027697 IFNGR1 -37131 sc-eQTL 1.97e-01 -0.102 0.0786 0.115 cMono_IL1B L2
ENSG00000029363 BCLAF1 892467 sc-eQTL 7.97e-01 0.0218 0.0846 0.115 cMono_IL1B L2
ENSG00000112357 PEX7 359754 sc-eQTL 4.72e-01 -0.102 0.142 0.115 cMono_IL1B L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 -684896 sc-eQTL 5.42e-01 -0.0519 0.0849 0.115 cMono_IL1B L2
ENSG00000135525 MAP7 631499 sc-eQTL 1.98e-01 -0.157 0.122 0.115 cMono_IL1B L2
ENSG00000197442 MAP3K5 389841 sc-eQTL 4.66e-01 -0.0645 0.0883 0.115 cMono_IL1B L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 -685915 sc-eQTL 6.44e-01 0.042 0.0907 0.115 cMono_IL1B L2
ENSG00000286646 AL121933.2 398273 sc-eQTL 1.17e-01 0.178 0.113 0.115 cMono_IL1B L2
ENSG00000027697 IFNGR1 -37131 sc-eQTL 1.10e-01 -0.145 0.0901 0.115 cMono_S100A L2
ENSG00000029363 BCLAF1 892467 sc-eQTL 5.01e-01 0.0627 0.093 0.115 cMono_S100A L2
ENSG00000112357 PEX7 359754 sc-eQTL 4.49e-01 -0.11 0.145 0.115 cMono_S100A L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 -684896 sc-eQTL 5.53e-01 -0.0479 0.0805 0.115 cMono_S100A L2
ENSG00000135525 MAP7 631499 sc-eQTL 9.91e-01 0.00146 0.136 0.115 cMono_S100A L2
ENSG00000197442 MAP3K5 389841 sc-eQTL 6.16e-01 -0.0549 0.109 0.115 cMono_S100A L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 -685915 sc-eQTL 3.91e-01 -0.0992 0.115 0.115 cMono_S100A L2
ENSG00000286646 AL121933.2 398273 sc-eQTL 5.03e-01 0.0757 0.113 0.115 cMono_S100A L2
ENSG00000027697 IFNGR1 -37131 sc-eQTL 3.14e-01 0.134 0.133 0.115 gdT L2
ENSG00000029363 BCLAF1 892467 sc-eQTL 2.27e-01 -0.142 0.117 0.115 gdT L2
ENSG00000112357 PEX7 359754 sc-eQTL 9.89e-01 -0.00241 0.169 0.115 gdT L2
ENSG00000112378 PERP -925101 sc-eQTL 9.78e-01 0.00413 0.147 0.115 gdT L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 -684896 sc-eQTL 9.37e-01 0.00644 0.0819 0.115 gdT L2
ENSG00000146410 MTFR2 931983 sc-eQTL 6.92e-01 0.0512 0.129 0.115 gdT L2
ENSG00000197442 MAP3K5 389841 sc-eQTL 2.49e-01 0.199 0.172 0.115 gdT L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 -685915 sc-eQTL 9.91e-01 -0.00175 0.148 0.115 gdT L2
ENSG00000027697 IFNGR1 -37131 sc-eQTL 4.29e-01 -0.0801 0.101 0.116 intMono L2
ENSG00000029363 BCLAF1 892467 sc-eQTL 1.14e-01 0.211 0.133 0.116 intMono L2
ENSG00000112357 PEX7 359754 sc-eQTL 8.44e-01 -0.0269 0.136 0.116 intMono L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 -684896 sc-eQTL 2.82e-01 0.0939 0.0871 0.116 intMono L2
ENSG00000135525 MAP7 631499 sc-eQTL 6.48e-01 0.0613 0.134 0.116 intMono L2
ENSG00000197442 MAP3K5 389841 sc-eQTL 7.42e-01 -0.0469 0.142 0.116 intMono L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 -685915 sc-eQTL 1.76e-01 0.176 0.13 0.116 intMono L2
ENSG00000286646 AL121933.2 398273 sc-eQTL 1.76e-01 0.203 0.149 0.116 intMono L2
ENSG00000027697 IFNGR1 -37131 sc-eQTL 1.94e-01 -0.148 0.114 0.118 ncMono L2
ENSG00000029363 BCLAF1 892467 sc-eQTL 8.82e-01 -0.0132 0.0888 0.118 ncMono L2
ENSG00000112357 PEX7 359754 sc-eQTL 4.73e-01 -0.102 0.141 0.118 ncMono L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 -684896 sc-eQTL 9.19e-01 0.0103 0.101 0.118 ncMono L2
ENSG00000135525 MAP7 631499 sc-eQTL 4.68e-01 0.0909 0.125 0.118 ncMono L2
ENSG00000197442 MAP3K5 389841 sc-eQTL 6.63e-02 -0.241 0.13 0.118 ncMono L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 -685915 sc-eQTL 8.80e-01 -0.0192 0.127 0.118 ncMono L2
ENSG00000286646 AL121933.2 398273 sc-eQTL 4.34e-01 -0.104 0.133 0.118 ncMono L2
ENSG00000027697 IFNGR1 -37131 sc-eQTL 5.35e-01 0.0793 0.127 0.124 pDC L2
ENSG00000029363 BCLAF1 892467 sc-eQTL 3.97e-01 0.0811 0.0954 0.124 pDC L2
ENSG00000112357 PEX7 359754 sc-eQTL 4.54e-01 -0.105 0.14 0.124 pDC L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 -684896 sc-eQTL 7.95e-01 0.0307 0.118 0.124 pDC L2
ENSG00000135525 MAP7 631499 sc-eQTL 6.70e-02 -0.179 0.097 0.124 pDC L2
ENSG00000197442 MAP3K5 389841 sc-eQTL 8.07e-01 0.0385 0.157 0.124 pDC L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 -685915 sc-eQTL 9.06e-01 0.0142 0.12 0.124 pDC L2
ENSG00000286646 AL121933.2 398273 sc-eQTL 1.67e-01 -0.2 0.144 0.124 pDC L2
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000027697 IFNGR1 -37131 sc-eQTL 9.39e-01 -0.00889 0.116 0.115 B_Memory LOneK1K
ENSG00000029363 BCLAF1 892467 sc-eQTL 5.28e-01 0.0411 0.0649 0.115 B_Memory LOneK1K
ENSG00000112357 PEX7 359754 sc-eQTL 3.53e-01 0.124 0.133 0.115 B_Memory LOneK1K
ENSG00000112378 PERP -925101 sc-eQTL 5.89e-01 0.0669 0.124 0.115 B_Memory LOneK1K
ENSG00000118503 TNFAIP3 -684896 sc-eQTL 7.31e-01 -0.0281 0.0817 0.115 B_Memory LOneK1K
ENSG00000197442 MAP3K5 389841 sc-eQTL 5.28e-01 -0.0684 0.108 0.115 B_Memory LOneK1K
ENSG00000237499 WAKMAR2 -685915 sc-eQTL 7.40e-01 -0.0459 0.138 0.115 B_Memory LOneK1K
ENSG00000027697 IFNGR1 -37131 sc-eQTL 4.34e-03 -0.332 0.115 0.115 B_Naive LOneK1K
ENSG00000029363 BCLAF1 892467 sc-eQTL 8.47e-01 0.0104 0.0539 0.115 B_Naive LOneK1K
ENSG00000112357 PEX7 359754 sc-eQTL 5.03e-01 -0.0959 0.143 0.115 B_Naive LOneK1K
ENSG00000112378 PERP -925101 sc-eQTL 3.03e-01 -0.132 0.128 0.115 B_Naive LOneK1K
ENSG00000118503 TNFAIP3 -684896 sc-eQTL 1.00e+00 -2.17e-05 0.0672 0.115 B_Naive LOneK1K
ENSG00000197442 MAP3K5 389841 sc-eQTL 2.22e-01 0.12 0.0982 0.115 B_Naive LOneK1K
ENSG00000237499 WAKMAR2 -685915 sc-eQTL 9.51e-01 0.00733 0.12 0.115 B_Naive LOneK1K
ENSG00000027697 IFNGR1 -37131 sc-eQTL 7.90e-02 -0.138 0.0783 0.115 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000029363 BCLAF1 892467 sc-eQTL 4.28e-01 0.0581 0.0733 0.115 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000112357 PEX7 359754 sc-eQTL 1.93e-01 -0.184 0.141 0.115 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000118503 TNFAIP3 -684896 sc-eQTL 5.65e-01 -0.042 0.0729 0.115 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000135525 MAP7 631499 sc-eQTL 3.99e-01 -0.107 0.126 0.115 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000197442 MAP3K5 389841 sc-eQTL 3.22e-01 -0.0846 0.0853 0.115 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000237499 WAKMAR2 -685915 sc-eQTL 8.64e-01 0.015 0.0874 0.115 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000286646 AL121933.2 398273 sc-eQTL 1.95e-01 0.132 0.101 0.115 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000027697 IFNGR1 -37131 sc-eQTL 8.11e-02 -0.167 0.0952 0.116 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000029363 BCLAF1 892467 sc-eQTL 3.19e-01 0.0864 0.0865 0.116 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000112357 PEX7 359754 sc-eQTL 8.91e-01 -0.0199 0.145 0.116 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000118503 TNFAIP3 -684896 sc-eQTL 7.28e-01 0.0312 0.0896 0.116 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000135525 MAP7 631499 sc-eQTL 5.77e-01 0.0781 0.14 0.116 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000197442 MAP3K5 389841 sc-eQTL 1.76e-01 -0.155 0.114 0.116 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000237499 WAKMAR2 -685915 sc-eQTL 4.99e-01 0.0812 0.12 0.116 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000286646 AL121933.2 398273 sc-eQTL 9.43e-01 0.00974 0.136 0.116 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000027697 IFNGR1 -37131 sc-eQTL 6.40e-01 -0.0415 0.0887 0.116 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000029363 BCLAF1 892467 sc-eQTL 8.88e-01 -0.00729 0.0515 0.116 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000112357 PEX7 359754 sc-eQTL 9.85e-01 0.00289 0.15 0.116 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000112378 PERP -925101 sc-eQTL 9.01e-01 -0.0116 0.0929 0.116 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000118503 TNFAIP3 -684896 sc-eQTL 2.03e-01 -0.103 0.0806 0.116 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000197442 MAP3K5 389841 sc-eQTL 8.18e-01 -0.0252 0.109 0.116 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000237499 WAKMAR2 -685915 sc-eQTL 2.29e-01 -0.136 0.113 0.116 NK_CD56dim LOneK1K

Statistical fine-mapping results from Japan COVID-19 Task Force
(Shown only for PIP>0.001)
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
PIP (SuSiE)
PIP (FINEMAP)
MAF
ENSG00000027697 IFNGR1 -37131 eQTL 0.0126 -0.0561 0.0224 0.0 0.0 0.0952
ENSG00000220412 AL356234.1 -524883 eQTL 0.0161 -0.0963 0.0399 0.00206 0.0 0.0952

Expression Modifier Score(EMS) for GTEx 49tissues
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Whole Blood
Muscle Skeletal
Liver
Brain Cerebellum
Prostate
Spleen
Skin Sun Exposed Lower leg
Artery Coronary
Esophagus Muscularis
Esophagus Gastroesophageal Junction
Artery Tibial
Heart Atrial Appendage
Nerve Tibial
Heart Left Ventricle
Adrenal Gland
Adipose Visceral Omentum
Pancreas
Lung
Pituitary
Brain Nucleus accumbens basal ganglia
Colon Transverse
Adipose Subcutaneous
Esophagus Mucosa
Brain Cortex
Thyroid
Stomach
Breast Mammary Tissue
Colon Sigmoid
Skin Not Sun Exposed Suprapubic
Testis
Artery Aorta
Brain Amygdala
Brain Anterior cingulate cortex BA24
Brain Caudate basal ganglia
Brain Cerebellar Hemisphere
Brain Frontal Cortex BA9
Brain Hippocampus
Brain Hypothalamus
Brain Putamen basal ganglia
Brain Spinal cord cervical c-1
Brain Substantia nigra
Cells Cultured fibroblasts
Cells EBV-transformed lymphocytes
Kidney Cortex
Minor Salivary Gland
Ovary
Small Intestine Terminal Ileum
Uterus
Vagina