logo

Genes within 1Mb (chr6:137165845:C:T):

View on , UCSC , GTEx , gnomAD

Immune cell-type specific single cell cis-eQTLs in OASIS
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000027697 IFNGR1 -53604 sc-eQTL 5.11e-01 -0.0678 0.103 0.12 B L1
ENSG00000029363 BCLAF1 875994 sc-eQTL 5.81e-01 0.0254 0.0459 0.12 B L1
ENSG00000112357 PEX7 343281 sc-eQTL 6.56e-01 0.0545 0.122 0.12 B L1
ENSG00000112378 PERP -941574 sc-eQTL 9.37e-01 0.00642 0.0808 0.12 B L1
ENSG00000118503 TNFAIP3 -701369 sc-eQTL 2.56e-01 0.0739 0.0649 0.12 B L1
ENSG00000197442 MAP3K5 373368 sc-eQTL 3.49e-01 0.0851 0.0906 0.12 B L1
ENSG00000237499 WAKMAR2 -702388 sc-eQTL 3.72e-02 0.213 0.101 0.12 B L1
ENSG00000027697 IFNGR1 -53604 sc-eQTL 1.70e-01 -0.0931 0.0676 0.12 CD4T L1
ENSG00000029363 BCLAF1 875994 sc-eQTL 2.90e-01 0.0544 0.0513 0.12 CD4T L1
ENSG00000112357 PEX7 343281 sc-eQTL 1.87e-02 -0.256 0.108 0.12 CD4T L1
ENSG00000112378 PERP -941574 sc-eQTL 7.99e-01 -0.0187 0.0735 0.12 CD4T L1
ENSG00000118503 TNFAIP3 -701369 sc-eQTL 9.22e-01 0.00675 0.0688 0.12 CD4T L1
ENSG00000197442 MAP3K5 373368 sc-eQTL 3.77e-01 0.0463 0.0524 0.12 CD4T L1
ENSG00000237499 WAKMAR2 -702388 sc-eQTL 1.50e-03 0.272 0.0846 0.12 CD4T L1
ENSG00000027697 IFNGR1 -53604 sc-eQTL 1.44e-02 -0.19 0.077 0.12 CD8T L1
ENSG00000029363 BCLAF1 875994 sc-eQTL 1.34e-01 0.079 0.0526 0.12 CD8T L1
ENSG00000112357 PEX7 343281 sc-eQTL 4.75e-02 0.257 0.129 0.12 CD8T L1
ENSG00000112378 PERP -941574 sc-eQTL 8.56e-01 -0.0155 0.0851 0.12 CD8T L1
ENSG00000118503 TNFAIP3 -701369 sc-eQTL 8.40e-01 0.0133 0.0657 0.12 CD8T L1
ENSG00000197442 MAP3K5 373368 sc-eQTL 1.03e-01 0.113 0.069 0.12 CD8T L1
ENSG00000237499 WAKMAR2 -702388 sc-eQTL 9.22e-01 0.00945 0.0965 0.12 CD8T L1
ENSG00000027697 IFNGR1 -53604 sc-eQTL 5.71e-01 0.0538 0.0947 0.122 DC L1
ENSG00000029363 BCLAF1 875994 sc-eQTL 4.08e-01 0.0705 0.0851 0.122 DC L1
ENSG00000112357 PEX7 343281 sc-eQTL 3.71e-01 0.119 0.133 0.122 DC L1
ENSG00000118503 TNFAIP3 -701369 sc-eQTL 6.95e-01 0.0398 0.101 0.122 DC L1
ENSG00000135525 MAP7 615026 sc-eQTL 5.00e-01 -0.074 0.11 0.122 DC L1
ENSG00000197442 MAP3K5 373368 sc-eQTL 3.28e-01 -0.103 0.105 0.122 DC L1
ENSG00000237499 WAKMAR2 -702388 sc-eQTL 3.02e-01 -0.106 0.103 0.122 DC L1
ENSG00000286646 AL121933.2 381800 sc-eQTL 8.96e-01 0.0179 0.137 0.122 DC L1
ENSG00000027697 IFNGR1 -53604 sc-eQTL 3.45e-06 -0.36 0.0754 0.12 Mono L1
ENSG00000029363 BCLAF1 875994 sc-eQTL 8.91e-01 -0.00932 0.0679 0.12 Mono L1
ENSG00000112357 PEX7 343281 sc-eQTL 6.60e-02 -0.245 0.133 0.12 Mono L1
ENSG00000118503 TNFAIP3 -701369 sc-eQTL 4.54e-01 0.0505 0.0673 0.12 Mono L1
ENSG00000135525 MAP7 615026 sc-eQTL 3.23e-01 -0.117 0.118 0.12 Mono L1
ENSG00000197442 MAP3K5 373368 sc-eQTL 7.54e-01 0.0247 0.0786 0.12 Mono L1
ENSG00000237499 WAKMAR2 -702388 sc-eQTL 2.95e-01 0.0875 0.0832 0.12 Mono L1
ENSG00000286646 AL121933.2 381800 sc-eQTL 7.03e-01 -0.0364 0.0952 0.12 Mono L1
ENSG00000027697 IFNGR1 -53604 sc-eQTL 1.46e-01 -0.125 0.0859 0.12 NK L1
ENSG00000029363 BCLAF1 875994 sc-eQTL 9.65e-01 -0.002 0.0459 0.12 NK L1
ENSG00000112357 PEX7 343281 sc-eQTL 7.14e-01 0.0489 0.133 0.12 NK L1
ENSG00000112378 PERP -941574 sc-eQTL 3.12e-01 0.0849 0.0838 0.12 NK L1
ENSG00000118503 TNFAIP3 -701369 sc-eQTL 3.41e-01 0.0685 0.0717 0.12 NK L1
ENSG00000197442 MAP3K5 373368 sc-eQTL 2.79e-01 0.112 0.103 0.12 NK L1
ENSG00000237499 WAKMAR2 -702388 sc-eQTL 1.89e-01 0.134 0.101 0.12 NK L1
ENSG00000027697 IFNGR1 -53604 sc-eQTL 5.38e-01 -0.049 0.0794 0.12 Other_T L1
ENSG00000029363 BCLAF1 875994 sc-eQTL 3.74e-01 -0.0593 0.0665 0.12 Other_T L1
ENSG00000112357 PEX7 343281 sc-eQTL 6.13e-02 0.242 0.128 0.12 Other_T L1
ENSG00000112378 PERP -941574 sc-eQTL 5.09e-01 -0.0687 0.104 0.12 Other_T L1
ENSG00000118503 TNFAIP3 -701369 sc-eQTL 4.13e-01 0.0405 0.0494 0.12 Other_T L1
ENSG00000146410 MTFR2 915510 sc-eQTL 9.80e-01 0.00185 0.0749 0.12 Other_T L1
ENSG00000197442 MAP3K5 373368 sc-eQTL 2.29e-01 0.115 0.0951 0.12 Other_T L1
ENSG00000237499 WAKMAR2 -702388 sc-eQTL 6.63e-01 0.0427 0.0981 0.12 Other_T L1
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000027697 IFNGR1 -53604 sc-eQTL 5.48e-01 -0.0831 0.138 0.107 B_Activated L2
ENSG00000029363 BCLAF1 875994 sc-eQTL 7.99e-01 -0.0287 0.112 0.107 B_Activated L2
ENSG00000112357 PEX7 343281 sc-eQTL 7.08e-01 -0.051 0.136 0.107 B_Activated L2
ENSG00000112378 PERP -941574 sc-eQTL 8.41e-01 -0.0141 0.0704 0.107 B_Activated L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 -701369 sc-eQTL 1.23e-01 0.21 0.136 0.107 B_Activated L2
ENSG00000197442 MAP3K5 373368 sc-eQTL 7.10e-01 0.0569 0.153 0.107 B_Activated L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 -702388 sc-eQTL 1.70e-02 0.282 0.117 0.107 B_Activated L2
ENSG00000027697 IFNGR1 -53604 sc-eQTL 9.71e-01 -0.00437 0.121 0.118 B_Intermediate L2
ENSG00000029363 BCLAF1 875994 sc-eQTL 6.38e-01 0.0323 0.0686 0.118 B_Intermediate L2
ENSG00000112357 PEX7 343281 sc-eQTL 5.07e-01 0.0839 0.126 0.118 B_Intermediate L2
ENSG00000112378 PERP -941574 sc-eQTL 6.04e-01 0.0597 0.115 0.118 B_Intermediate L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 -701369 sc-eQTL 4.47e-01 0.0687 0.0901 0.118 B_Intermediate L2
ENSG00000197442 MAP3K5 373368 sc-eQTL 2.58e-01 0.123 0.109 0.118 B_Intermediate L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 -702388 sc-eQTL 3.50e-01 0.12 0.128 0.118 B_Intermediate L2
ENSG00000027697 IFNGR1 -53604 sc-eQTL 5.59e-01 -0.0773 0.132 0.119 B_Memory L2
ENSG00000029363 BCLAF1 875994 sc-eQTL 5.83e-01 -0.0431 0.0784 0.119 B_Memory L2
ENSG00000112357 PEX7 343281 sc-eQTL 4.69e-03 0.374 0.131 0.119 B_Memory L2
ENSG00000112378 PERP -941574 sc-eQTL 1.16e-01 0.197 0.125 0.119 B_Memory L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 -701369 sc-eQTL 9.92e-03 0.221 0.085 0.119 B_Memory L2
ENSG00000197442 MAP3K5 373368 sc-eQTL 5.15e-01 0.0769 0.118 0.119 B_Memory L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 -702388 sc-eQTL 9.12e-02 0.217 0.128 0.119 B_Memory L2
ENSG00000027697 IFNGR1 -53604 sc-eQTL 4.56e-01 -0.0759 0.102 0.12 B_Naive1 L2
ENSG00000029363 BCLAF1 875994 sc-eQTL 3.64e-01 0.0528 0.0581 0.12 B_Naive1 L2
ENSG00000112357 PEX7 343281 sc-eQTL 3.46e-01 -0.127 0.134 0.12 B_Naive1 L2
ENSG00000112378 PERP -941574 sc-eQTL 5.59e-01 -0.0687 0.117 0.12 B_Naive1 L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 -701369 sc-eQTL 1.02e-02 0.174 0.0671 0.12 B_Naive1 L2
ENSG00000197442 MAP3K5 373368 sc-eQTL 7.14e-01 0.0351 0.0958 0.12 B_Naive1 L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 -702388 sc-eQTL 1.66e-02 0.254 0.105 0.12 B_Naive1 L2
ENSG00000027697 IFNGR1 -53604 sc-eQTL 4.41e-01 0.0975 0.126 0.118 B_Naive2 L2
ENSG00000029363 BCLAF1 875994 sc-eQTL 2.98e-01 0.0763 0.0732 0.118 B_Naive2 L2
ENSG00000112357 PEX7 343281 sc-eQTL 8.41e-01 -0.0279 0.138 0.118 B_Naive2 L2
ENSG00000112378 PERP -941574 sc-eQTL 7.95e-01 -0.0262 0.101 0.118 B_Naive2 L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 -701369 sc-eQTL 3.81e-01 0.0884 0.101 0.118 B_Naive2 L2
ENSG00000197442 MAP3K5 373368 sc-eQTL 3.59e-01 0.0985 0.107 0.118 B_Naive2 L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 -702388 sc-eQTL 2.65e-01 0.145 0.13 0.118 B_Naive2 L2
ENSG00000027697 IFNGR1 -53604 sc-eQTL 9.19e-01 -0.0124 0.121 0.116 CD4_CTL L2
ENSG00000029363 BCLAF1 875994 sc-eQTL 9.79e-01 0.00289 0.108 0.116 CD4_CTL L2
ENSG00000112357 PEX7 343281 sc-eQTL 3.94e-01 0.115 0.134 0.116 CD4_CTL L2
ENSG00000112378 PERP -941574 sc-eQTL 3.24e-01 -0.135 0.136 0.116 CD4_CTL L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 -701369 sc-eQTL 1.06e-01 0.129 0.0791 0.116 CD4_CTL L2
ENSG00000197442 MAP3K5 373368 sc-eQTL 3.79e-01 -0.112 0.127 0.116 CD4_CTL L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 -702388 sc-eQTL 1.31e-01 0.187 0.123 0.116 CD4_CTL L2
ENSG00000027697 IFNGR1 -53604 sc-eQTL 7.63e-01 -0.0195 0.0643 0.12 CD4_Naive L2
ENSG00000029363 BCLAF1 875994 sc-eQTL 5.86e-01 0.0281 0.0516 0.12 CD4_Naive L2
ENSG00000112357 PEX7 343281 sc-eQTL 9.67e-03 -0.312 0.12 0.12 CD4_Naive L2
ENSG00000112378 PERP -941574 sc-eQTL 9.57e-01 0.00545 0.1 0.12 CD4_Naive L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 -701369 sc-eQTL 8.45e-01 -0.0138 0.0703 0.12 CD4_Naive L2
ENSG00000197442 MAP3K5 373368 sc-eQTL 6.89e-01 0.0207 0.0516 0.12 CD4_Naive L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 -702388 sc-eQTL 2.63e-03 0.271 0.0892 0.12 CD4_Naive L2
ENSG00000027697 IFNGR1 -53604 sc-eQTL 1.18e-01 -0.144 0.0918 0.12 CD4_TCM L2
ENSG00000029363 BCLAF1 875994 sc-eQTL 3.96e-01 0.0495 0.0582 0.12 CD4_TCM L2
ENSG00000112357 PEX7 343281 sc-eQTL 9.34e-01 -0.0112 0.136 0.12 CD4_TCM L2
ENSG00000112378 PERP -941574 sc-eQTL 5.62e-01 -0.0664 0.115 0.12 CD4_TCM L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 -701369 sc-eQTL 5.17e-01 0.0431 0.0665 0.12 CD4_TCM L2
ENSG00000197442 MAP3K5 373368 sc-eQTL 8.30e-01 0.0162 0.0758 0.12 CD4_TCM L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 -702388 sc-eQTL 7.37e-02 0.166 0.0926 0.12 CD4_TCM L2
ENSG00000027697 IFNGR1 -53604 sc-eQTL 2.75e-01 -0.111 0.102 0.12 CD4_TEM L2
ENSG00000029363 BCLAF1 875994 sc-eQTL 9.92e-02 0.119 0.0718 0.12 CD4_TEM L2
ENSG00000112357 PEX7 343281 sc-eQTL 5.17e-01 -0.0852 0.131 0.12 CD4_TEM L2
ENSG00000112378 PERP -941574 sc-eQTL 9.37e-01 -0.00849 0.107 0.12 CD4_TEM L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 -701369 sc-eQTL 6.09e-01 0.0347 0.0677 0.12 CD4_TEM L2
ENSG00000197442 MAP3K5 373368 sc-eQTL 6.57e-01 0.0465 0.104 0.12 CD4_TEM L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 -702388 sc-eQTL 2.19e-01 0.133 0.108 0.12 CD4_TEM L2
ENSG00000027697 IFNGR1 -53604 sc-eQTL 7.76e-02 -0.164 0.0927 0.12 CD8_CTL L2
ENSG00000029363 BCLAF1 875994 sc-eQTL 1.88e-01 0.082 0.062 0.12 CD8_CTL L2
ENSG00000112357 PEX7 343281 sc-eQTL 3.94e-01 0.11 0.128 0.12 CD8_CTL L2
ENSG00000112378 PERP -941574 sc-eQTL 9.57e-01 0.00664 0.123 0.12 CD8_CTL L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 -701369 sc-eQTL 1.71e-01 0.107 0.0782 0.12 CD8_CTL L2
ENSG00000197442 MAP3K5 373368 sc-eQTL 2.32e-01 0.132 0.11 0.12 CD8_CTL L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 -702388 sc-eQTL 7.60e-01 0.0338 0.11 0.12 CD8_CTL L2
ENSG00000027697 IFNGR1 -53604 sc-eQTL 4.12e-01 -0.0757 0.0922 0.12 CD8_Naive L2
ENSG00000029363 BCLAF1 875994 sc-eQTL 5.73e-01 0.0364 0.0644 0.12 CD8_Naive L2
ENSG00000112357 PEX7 343281 sc-eQTL 6.50e-01 0.0607 0.134 0.12 CD8_Naive L2
ENSG00000112378 PERP -941574 sc-eQTL 7.63e-01 -0.0306 0.102 0.12 CD8_Naive L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 -701369 sc-eQTL 5.73e-01 -0.0408 0.0722 0.12 CD8_Naive L2
ENSG00000197442 MAP3K5 373368 sc-eQTL 2.68e-03 0.255 0.0838 0.12 CD8_Naive L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 -702388 sc-eQTL 7.75e-01 0.0305 0.107 0.12 CD8_Naive L2
ENSG00000027697 IFNGR1 -53604 sc-eQTL 2.34e-01 -0.148 0.124 0.111 CD8_TCM L2
ENSG00000029363 BCLAF1 875994 sc-eQTL 2.52e-02 0.207 0.0919 0.111 CD8_TCM L2
ENSG00000112357 PEX7 343281 sc-eQTL 5.36e-01 0.0882 0.142 0.111 CD8_TCM L2
ENSG00000112378 PERP -941574 sc-eQTL 9.57e-01 -0.00748 0.14 0.111 CD8_TCM L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 -701369 sc-eQTL 9.40e-02 0.112 0.0668 0.111 CD8_TCM L2
ENSG00000197442 MAP3K5 373368 sc-eQTL 7.01e-01 0.0461 0.12 0.111 CD8_TCM L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 -702388 sc-eQTL 8.70e-01 -0.0202 0.123 0.111 CD8_TCM L2
ENSG00000027697 IFNGR1 -53604 sc-eQTL 5.35e-01 -0.0704 0.113 0.119 CD8_TEM L2
ENSG00000029363 BCLAF1 875994 sc-eQTL 2.56e-01 0.121 0.106 0.119 CD8_TEM L2
ENSG00000112357 PEX7 343281 sc-eQTL 5.57e-01 -0.0767 0.13 0.119 CD8_TEM L2
ENSG00000112378 PERP -941574 sc-eQTL 4.19e-01 -0.11 0.135 0.119 CD8_TEM L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 -701369 sc-eQTL 9.77e-01 -0.00238 0.0835 0.119 CD8_TEM L2
ENSG00000197442 MAP3K5 373368 sc-eQTL 2.28e-01 0.155 0.129 0.119 CD8_TEM L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 -702388 sc-eQTL 9.76e-01 0.00367 0.124 0.119 CD8_TEM L2
ENSG00000027697 IFNGR1 -53604 sc-eQTL 5.36e-01 -0.0599 0.0965 0.121 MAIT L2
ENSG00000029363 BCLAF1 875994 sc-eQTL 5.66e-01 0.0462 0.0802 0.121 MAIT L2
ENSG00000112357 PEX7 343281 sc-eQTL 4.15e-01 0.107 0.131 0.121 MAIT L2
ENSG00000112378 PERP -941574 sc-eQTL 9.35e-02 -0.229 0.136 0.121 MAIT L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 -701369 sc-eQTL 9.13e-01 0.00715 0.065 0.121 MAIT L2
ENSG00000146410 MTFR2 915510 sc-eQTL 5.62e-02 0.206 0.107 0.121 MAIT L2
ENSG00000197442 MAP3K5 373368 sc-eQTL 3.09e-01 0.115 0.113 0.121 MAIT L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 -702388 sc-eQTL 4.41e-01 0.0927 0.12 0.121 MAIT L2
ENSG00000027697 IFNGR1 -53604 sc-eQTL 2.16e-01 -0.125 0.101 0.124 NK_CD56bright L2
ENSG00000029363 BCLAF1 875994 sc-eQTL 4.02e-01 0.0625 0.0745 0.124 NK_CD56bright L2
ENSG00000112357 PEX7 343281 sc-eQTL 8.90e-01 0.0182 0.132 0.124 NK_CD56bright L2
ENSG00000112378 PERP -941574 sc-eQTL 6.71e-01 0.0501 0.118 0.124 NK_CD56bright L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 -701369 sc-eQTL 9.68e-01 0.00298 0.0753 0.124 NK_CD56bright L2
ENSG00000197442 MAP3K5 373368 sc-eQTL 5.63e-02 0.218 0.113 0.124 NK_CD56bright L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 -702388 sc-eQTL 7.65e-02 0.212 0.119 0.124 NK_CD56bright L2
ENSG00000027697 IFNGR1 -53604 sc-eQTL 1.80e-02 -0.187 0.0783 0.121 NK_CD56dim L2
ENSG00000029363 BCLAF1 875994 sc-eQTL 4.18e-01 -0.042 0.0517 0.121 NK_CD56dim L2
ENSG00000112357 PEX7 343281 sc-eQTL 5.21e-01 0.0878 0.137 0.121 NK_CD56dim L2
ENSG00000112378 PERP -941574 sc-eQTL 9.27e-01 0.00882 0.0961 0.121 NK_CD56dim L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 -701369 sc-eQTL 3.56e-01 0.069 0.0746 0.121 NK_CD56dim L2
ENSG00000197442 MAP3K5 373368 sc-eQTL 3.09e-01 0.109 0.107 0.121 NK_CD56dim L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 -702388 sc-eQTL 8.25e-01 0.0247 0.112 0.121 NK_CD56dim L2
ENSG00000027697 IFNGR1 -53604 sc-eQTL 3.87e-02 -0.209 0.1 0.126 NK_HLA L2
ENSG00000029363 BCLAF1 875994 sc-eQTL 9.70e-01 0.00321 0.0858 0.126 NK_HLA L2
ENSG00000112357 PEX7 343281 sc-eQTL 7.49e-02 -0.229 0.128 0.126 NK_HLA L2
ENSG00000112378 PERP -941574 sc-eQTL 2.20e-01 0.128 0.104 0.126 NK_HLA L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 -701369 sc-eQTL 9.09e-01 -0.00914 0.0803 0.126 NK_HLA L2
ENSG00000197442 MAP3K5 373368 sc-eQTL 7.11e-01 0.0473 0.128 0.126 NK_HLA L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 -702388 sc-eQTL 5.39e-01 0.0795 0.129 0.126 NK_HLA L2
ENSG00000027697 IFNGR1 -53604 sc-eQTL 1.75e-01 -0.114 0.0835 0.121 NK_cytokine L2
ENSG00000029363 BCLAF1 875994 sc-eQTL 5.84e-01 -0.0343 0.0625 0.121 NK_cytokine L2
ENSG00000112357 PEX7 343281 sc-eQTL 4.37e-01 0.102 0.131 0.121 NK_cytokine L2
ENSG00000112378 PERP -941574 sc-eQTL 5.56e-01 0.0589 0.0998 0.121 NK_cytokine L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 -701369 sc-eQTL 3.30e-01 0.073 0.0747 0.121 NK_cytokine L2
ENSG00000197442 MAP3K5 373368 sc-eQTL 3.45e-01 0.0971 0.103 0.121 NK_cytokine L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 -702388 sc-eQTL 3.29e-02 0.24 0.112 0.121 NK_cytokine L2
ENSG00000027697 IFNGR1 -53604 sc-eQTL 8.02e-01 -0.0392 0.156 0.122 PB L2
ENSG00000029363 BCLAF1 875994 sc-eQTL 2.13e-01 -0.167 0.134 0.122 PB L2
ENSG00000112357 PEX7 343281 sc-eQTL 9.05e-01 -0.0191 0.16 0.122 PB L2
ENSG00000112378 PERP -941574 sc-eQTL 2.76e-01 -0.109 0.0995 0.122 PB L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 -701369 sc-eQTL 2.96e-01 0.127 0.121 0.122 PB L2
ENSG00000197442 MAP3K5 373368 sc-eQTL 4.09e-01 -0.114 0.138 0.122 PB L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 -702388 sc-eQTL 1.72e-01 -0.199 0.145 0.122 PB L2
ENSG00000027697 IFNGR1 -53604 sc-eQTL 7.86e-01 0.028 0.103 0.122 Pro_T L2
ENSG00000029363 BCLAF1 875994 sc-eQTL 9.99e-01 0.000107 0.107 0.122 Pro_T L2
ENSG00000112357 PEX7 343281 sc-eQTL 9.17e-01 -0.013 0.125 0.122 Pro_T L2
ENSG00000112378 PERP -941574 sc-eQTL 6.43e-01 0.0461 0.0994 0.122 Pro_T L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 -701369 sc-eQTL 6.84e-02 0.114 0.0622 0.122 Pro_T L2
ENSG00000146410 MTFR2 915510 sc-eQTL 2.32e-01 -0.104 0.0866 0.122 Pro_T L2
ENSG00000197442 MAP3K5 373368 sc-eQTL 8.20e-01 0.0277 0.121 0.122 Pro_T L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 -702388 sc-eQTL 6.62e-01 -0.0532 0.122 0.122 Pro_T L2
ENSG00000027697 IFNGR1 -53604 sc-eQTL 5.95e-01 -0.0635 0.119 0.12 Treg L2
ENSG00000029363 BCLAF1 875994 sc-eQTL 1.44e-02 0.188 0.0761 0.12 Treg L2
ENSG00000112357 PEX7 343281 sc-eQTL 3.58e-02 -0.264 0.125 0.12 Treg L2
ENSG00000112378 PERP -941574 sc-eQTL 5.58e-01 -0.0801 0.136 0.12 Treg L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 -701369 sc-eQTL 3.33e-01 0.0735 0.0758 0.12 Treg L2
ENSG00000197442 MAP3K5 373368 sc-eQTL 8.14e-01 0.0194 0.0823 0.12 Treg L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 -702388 sc-eQTL 3.09e-01 0.118 0.116 0.12 Treg L2
ENSG00000027697 IFNGR1 -53604 sc-eQTL 2.37e-01 0.125 0.106 0.12 cDC L2
ENSG00000029363 BCLAF1 875994 sc-eQTL 6.62e-01 -0.0467 0.107 0.12 cDC L2
ENSG00000112357 PEX7 343281 sc-eQTL 5.69e-01 0.0781 0.137 0.12 cDC L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 -701369 sc-eQTL 2.20e-01 0.128 0.104 0.12 cDC L2
ENSG00000135525 MAP7 615026 sc-eQTL 4.13e-01 -0.1 0.122 0.12 cDC L2
ENSG00000197442 MAP3K5 373368 sc-eQTL 3.95e-02 -0.22 0.106 0.12 cDC L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 -702388 sc-eQTL 6.68e-02 -0.249 0.135 0.12 cDC L2
ENSG00000286646 AL121933.2 381800 sc-eQTL 8.85e-01 0.0203 0.14 0.12 cDC L2
ENSG00000027697 IFNGR1 -53604 sc-eQTL 4.93e-06 -0.331 0.0706 0.12 cMono_IL1B L2
ENSG00000029363 BCLAF1 875994 sc-eQTL 5.98e-01 0.0419 0.0795 0.12 cMono_IL1B L2
ENSG00000112357 PEX7 343281 sc-eQTL 2.66e-01 -0.148 0.133 0.12 cMono_IL1B L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 -701369 sc-eQTL 3.49e-01 0.0747 0.0796 0.12 cMono_IL1B L2
ENSG00000135525 MAP7 615026 sc-eQTL 2.47e-01 -0.133 0.115 0.12 cMono_IL1B L2
ENSG00000197442 MAP3K5 373368 sc-eQTL 4.95e-01 -0.0567 0.0829 0.12 cMono_IL1B L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 -702388 sc-eQTL 5.00e-01 0.0575 0.0851 0.12 cMono_IL1B L2
ENSG00000286646 AL121933.2 381800 sc-eQTL 1.91e-02 -0.249 0.105 0.12 cMono_IL1B L2
ENSG00000027697 IFNGR1 -53604 sc-eQTL 1.70e-02 -0.201 0.0836 0.12 cMono_S100A L2
ENSG00000029363 BCLAF1 875994 sc-eQTL 2.93e-01 -0.0915 0.0868 0.12 cMono_S100A L2
ENSG00000112357 PEX7 343281 sc-eQTL 2.22e-02 -0.309 0.134 0.12 cMono_S100A L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 -701369 sc-eQTL 6.75e-01 0.0316 0.0752 0.12 cMono_S100A L2
ENSG00000135525 MAP7 615026 sc-eQTL 9.30e-01 -0.0111 0.127 0.12 cMono_S100A L2
ENSG00000197442 MAP3K5 373368 sc-eQTL 2.24e-01 0.124 0.102 0.12 cMono_S100A L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 -702388 sc-eQTL 2.72e-02 0.238 0.107 0.12 cMono_S100A L2
ENSG00000286646 AL121933.2 381800 sc-eQTL 1.13e-01 0.167 0.105 0.12 cMono_S100A L2
ENSG00000027697 IFNGR1 -53604 sc-eQTL 1.73e-01 -0.178 0.13 0.115 gdT L2
ENSG00000029363 BCLAF1 875994 sc-eQTL 9.32e-02 -0.193 0.114 0.115 gdT L2
ENSG00000112357 PEX7 343281 sc-eQTL 9.17e-01 -0.0174 0.166 0.115 gdT L2
ENSG00000112378 PERP -941574 sc-eQTL 2.35e-01 -0.172 0.144 0.115 gdT L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 -701369 sc-eQTL 1.28e-01 0.122 0.0799 0.115 gdT L2
ENSG00000146410 MTFR2 915510 sc-eQTL 6.45e-01 0.0587 0.127 0.115 gdT L2
ENSG00000197442 MAP3K5 373368 sc-eQTL 7.06e-02 0.307 0.168 0.115 gdT L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 -702388 sc-eQTL 9.62e-01 0.0069 0.146 0.115 gdT L2
ENSG00000027697 IFNGR1 -53604 sc-eQTL 7.25e-03 -0.239 0.0882 0.124 intMono L2
ENSG00000029363 BCLAF1 875994 sc-eQTL 7.62e-01 -0.0359 0.119 0.124 intMono L2
ENSG00000112357 PEX7 343281 sc-eQTL 1.83e-01 -0.161 0.121 0.124 intMono L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 -701369 sc-eQTL 1.38e-01 0.115 0.0771 0.124 intMono L2
ENSG00000135525 MAP7 615026 sc-eQTL 4.92e-01 0.082 0.119 0.124 intMono L2
ENSG00000197442 MAP3K5 373368 sc-eQTL 5.01e-01 0.0849 0.126 0.124 intMono L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 -702388 sc-eQTL 6.48e-01 -0.0529 0.115 0.124 intMono L2
ENSG00000286646 AL121933.2 381800 sc-eQTL 9.04e-01 0.0161 0.133 0.124 intMono L2
ENSG00000027697 IFNGR1 -53604 sc-eQTL 2.23e-03 -0.324 0.105 0.12 ncMono L2
ENSG00000029363 BCLAF1 875994 sc-eQTL 7.78e-01 0.0235 0.0832 0.12 ncMono L2
ENSG00000112357 PEX7 343281 sc-eQTL 7.85e-01 -0.0363 0.133 0.12 ncMono L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 -701369 sc-eQTL 9.26e-01 -0.00881 0.0949 0.12 ncMono L2
ENSG00000135525 MAP7 615026 sc-eQTL 8.31e-01 0.0251 0.117 0.12 ncMono L2
ENSG00000197442 MAP3K5 373368 sc-eQTL 7.19e-01 0.0443 0.123 0.12 ncMono L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 -702388 sc-eQTL 2.81e-01 -0.128 0.118 0.12 ncMono L2
ENSG00000286646 AL121933.2 381800 sc-eQTL 8.54e-01 0.023 0.125 0.12 ncMono L2
ENSG00000027697 IFNGR1 -53604 sc-eQTL 7.15e-01 -0.0451 0.123 0.116 pDC L2
ENSG00000029363 BCLAF1 875994 sc-eQTL 1.99e-01 0.119 0.092 0.116 pDC L2
ENSG00000112357 PEX7 343281 sc-eQTL 9.17e-01 0.0142 0.136 0.116 pDC L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 -701369 sc-eQTL 4.88e-01 0.0795 0.114 0.116 pDC L2
ENSG00000135525 MAP7 615026 sc-eQTL 9.74e-01 0.00311 0.0948 0.116 pDC L2
ENSG00000197442 MAP3K5 373368 sc-eQTL 8.10e-01 0.0366 0.152 0.116 pDC L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 -702388 sc-eQTL 3.11e-01 -0.118 0.116 0.116 pDC L2
ENSG00000286646 AL121933.2 381800 sc-eQTL 2.29e-01 0.168 0.139 0.116 pDC L2
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000027697 IFNGR1 -53604 sc-eQTL 5.63e-01 -0.0625 0.108 0.12 B_Memory LOneK1K
ENSG00000029363 BCLAF1 875994 sc-eQTL 9.34e-01 -0.00499 0.0606 0.12 B_Memory LOneK1K
ENSG00000112357 PEX7 343281 sc-eQTL 4.16e-03 0.352 0.122 0.12 B_Memory LOneK1K
ENSG00000112378 PERP -941574 sc-eQTL 7.01e-02 0.208 0.114 0.12 B_Memory LOneK1K
ENSG00000118503 TNFAIP3 -701369 sc-eQTL 5.65e-01 0.0438 0.076 0.12 B_Memory LOneK1K
ENSG00000197442 MAP3K5 373368 sc-eQTL 2.62e-01 0.113 0.1 0.12 B_Memory LOneK1K
ENSG00000237499 WAKMAR2 -702388 sc-eQTL 2.23e-02 0.292 0.127 0.12 B_Memory LOneK1K
ENSG00000027697 IFNGR1 -53604 sc-eQTL 5.89e-01 -0.0601 0.111 0.12 B_Naive LOneK1K
ENSG00000029363 BCLAF1 875994 sc-eQTL 6.54e-01 0.0229 0.051 0.12 B_Naive LOneK1K
ENSG00000112357 PEX7 343281 sc-eQTL 6.62e-01 -0.059 0.135 0.12 B_Naive LOneK1K
ENSG00000112378 PERP -941574 sc-eQTL 3.34e-01 -0.117 0.121 0.12 B_Naive LOneK1K
ENSG00000118503 TNFAIP3 -701369 sc-eQTL 1.53e-01 0.0908 0.0632 0.12 B_Naive LOneK1K
ENSG00000197442 MAP3K5 373368 sc-eQTL 8.93e-01 0.0125 0.0931 0.12 B_Naive LOneK1K
ENSG00000237499 WAKMAR2 -702388 sc-eQTL 2.77e-02 0.248 0.112 0.12 B_Naive LOneK1K
ENSG00000027697 IFNGR1 -53604 sc-eQTL 1.81e-05 -0.314 0.0716 0.12 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000029363 BCLAF1 875994 sc-eQTL 9.31e-01 -0.00603 0.0696 0.12 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000112357 PEX7 343281 sc-eQTL 8.94e-02 -0.227 0.133 0.12 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000118503 TNFAIP3 -701369 sc-eQTL 6.27e-01 0.0337 0.0691 0.12 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000135525 MAP7 615026 sc-eQTL 3.27e-01 -0.118 0.12 0.12 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000197442 MAP3K5 373368 sc-eQTL 7.76e-01 -0.0231 0.081 0.12 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000237499 WAKMAR2 -702388 sc-eQTL 2.55e-01 0.0943 0.0826 0.12 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000286646 AL121933.2 381800 sc-eQTL 7.05e-01 -0.0365 0.0964 0.12 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000027697 IFNGR1 -53604 sc-eQTL 4.45e-05 -0.35 0.084 0.121 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000029363 BCLAF1 875994 sc-eQTL 9.78e-01 0.00214 0.079 0.121 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000112357 PEX7 343281 sc-eQTL 5.09e-01 -0.0872 0.132 0.121 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000118503 TNFAIP3 -701369 sc-eQTL 4.61e-01 0.0602 0.0816 0.121 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000135525 MAP7 615026 sc-eQTL 9.07e-01 0.0149 0.128 0.121 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000197442 MAP3K5 373368 sc-eQTL 8.14e-01 0.0247 0.105 0.121 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000237499 WAKMAR2 -702388 sc-eQTL 3.25e-01 -0.108 0.109 0.121 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000286646 AL121933.2 381800 sc-eQTL 8.59e-01 -0.0222 0.124 0.121 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000027697 IFNGR1 -53604 sc-eQTL 1.01e-01 -0.133 0.081 0.121 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000029363 BCLAF1 875994 sc-eQTL 7.42e-01 -0.0156 0.0473 0.121 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000112357 PEX7 343281 sc-eQTL 7.02e-01 0.0526 0.138 0.121 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000112378 PERP -941574 sc-eQTL 2.26e-01 0.103 0.085 0.121 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000118503 TNFAIP3 -701369 sc-eQTL 3.51e-01 0.0692 0.0742 0.121 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000197442 MAP3K5 373368 sc-eQTL 3.10e-01 0.102 0.1 0.121 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000237499 WAKMAR2 -702388 sc-eQTL 2.33e-01 0.124 0.104 0.121 NK_CD56dim LOneK1K

Statistical fine-mapping results from Japan COVID-19 Task Force
(Shown only for PIP>0.001)
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
PIP (SuSiE)
PIP (FINEMAP)
MAF
ENSG00000027697 IFNGR1 -53604 pQTL 1.91e-05 -0.0972 0.0227 0.0 0.0 0.131
ENSG00000027697 IFNGR1 -53604 eQTL 4.09e-11 -0.127 0.019 0.0 0.0 0.132

Expression Modifier Score(EMS) for GTEx 49tissues
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Whole Blood
Muscle Skeletal
Liver
Brain Cerebellum
Prostate
Spleen
Skin Sun Exposed Lower leg
Artery Coronary
Esophagus Muscularis
Esophagus Gastroesophageal Junction
Artery Tibial
Heart Atrial Appendage
Nerve Tibial
Heart Left Ventricle
Adrenal Gland
Adipose Visceral Omentum
Pancreas
Lung
Pituitary
Brain Nucleus accumbens basal ganglia
Colon Transverse
Adipose Subcutaneous
Esophagus Mucosa
Brain Cortex
Thyroid
Stomach
Breast Mammary Tissue
Colon Sigmoid
Skin Not Sun Exposed Suprapubic
Testis
Artery Aorta
Brain Amygdala
Brain Anterior cingulate cortex BA24
Brain Caudate basal ganglia
Brain Cerebellar Hemisphere
Brain Frontal Cortex BA9
Brain Hippocampus
Brain Hypothalamus
Brain Putamen basal ganglia
Brain Spinal cord cervical c-1
Brain Substantia nigra
Cells Cultured fibroblasts
Cells EBV-transformed lymphocytes
Kidney Cortex
Minor Salivary Gland
Ovary
Small Intestine Terminal Ileum
Uterus
Vagina
ENSG00000027697 IFNGR1 -53604 1e-05 1.18e-05 1.31e-06 5.63e-06 2.35e-06 4.26e-06 1.09e-05 2.17e-06 1e-05 5.05e-06 1.25e-05 5.74e-06 1.66e-05 3.54e-06 2.45e-06 6.52e-06 4.97e-06 7.77e-06 2.66e-06 2.77e-06 4.99e-06 1e-05 7.91e-06 3.15e-06 1.45e-05 3.75e-06 4.75e-06 4.18e-06 1.02e-05 8.58e-06 5.79e-06 9.71e-07 1.27e-06 2.91e-06 4.56e-06 2.56e-06 1.65e-06 1.85e-06 1.72e-06 1.02e-06 8.6e-07 1.3e-05 1.47e-06 1.44e-07 7.72e-07 1.67e-06 1.06e-06 7.44e-07 4.78e-07