logo

Genes within 1Mb (chr6:137159612:T:C):

View on , UCSC , GTEx , gnomAD

Immune cell-type specific single cell cis-eQTLs in OASIS
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000027697 IFNGR1 -59837 sc-eQTL 6.14e-01 -0.0685 0.135 0.073 B L1
ENSG00000029363 BCLAF1 869761 sc-eQTL 6.19e-01 0.03 0.0603 0.073 B L1
ENSG00000112357 PEX7 337048 sc-eQTL 4.64e-01 -0.118 0.16 0.073 B L1
ENSG00000112378 PERP -947807 sc-eQTL 5.33e-01 0.0661 0.106 0.073 B L1
ENSG00000118503 TNFAIP3 -707602 sc-eQTL 5.97e-01 -0.0452 0.0854 0.073 B L1
ENSG00000197442 MAP3K5 367135 sc-eQTL 8.93e-01 -0.016 0.119 0.073 B L1
ENSG00000237499 WAKMAR2 -708621 sc-eQTL 4.19e-01 0.109 0.134 0.073 B L1
ENSG00000027697 IFNGR1 -59837 sc-eQTL 7.20e-02 -0.16 0.0884 0.073 CD4T L1
ENSG00000029363 BCLAF1 869761 sc-eQTL 9.21e-01 0.00672 0.0674 0.073 CD4T L1
ENSG00000112357 PEX7 337048 sc-eQTL 4.72e-01 -0.103 0.143 0.073 CD4T L1
ENSG00000112378 PERP -947807 sc-eQTL 8.72e-03 -0.251 0.0947 0.073 CD4T L1
ENSG00000118503 TNFAIP3 -707602 sc-eQTL 6.81e-01 -0.0372 0.0902 0.073 CD4T L1
ENSG00000197442 MAP3K5 367135 sc-eQTL 7.75e-01 -0.0197 0.0687 0.073 CD4T L1
ENSG00000237499 WAKMAR2 -708621 sc-eQTL 4.75e-01 -0.0812 0.113 0.073 CD4T L1
ENSG00000027697 IFNGR1 -59837 sc-eQTL 4.48e-01 -0.076 0.0999 0.073 CD8T L1
ENSG00000029363 BCLAF1 869761 sc-eQTL 6.06e-01 -0.035 0.0676 0.073 CD8T L1
ENSG00000112357 PEX7 337048 sc-eQTL 2.80e-01 0.18 0.166 0.073 CD8T L1
ENSG00000112378 PERP -947807 sc-eQTL 7.15e-01 0.0399 0.109 0.073 CD8T L1
ENSG00000118503 TNFAIP3 -707602 sc-eQTL 8.16e-02 -0.146 0.0836 0.073 CD8T L1
ENSG00000197442 MAP3K5 367135 sc-eQTL 3.97e-01 -0.0753 0.0888 0.073 CD8T L1
ENSG00000237499 WAKMAR2 -708621 sc-eQTL 3.20e-02 -0.264 0.122 0.073 CD8T L1
ENSG00000027697 IFNGR1 -59837 sc-eQTL 5.51e-01 -0.0728 0.122 0.077 DC L1
ENSG00000029363 BCLAF1 869761 sc-eQTL 8.58e-01 0.0197 0.11 0.077 DC L1
ENSG00000112357 PEX7 337048 sc-eQTL 2.41e-01 0.201 0.171 0.077 DC L1
ENSG00000118503 TNFAIP3 -707602 sc-eQTL 1.80e-01 -0.174 0.13 0.077 DC L1
ENSG00000135525 MAP7 608793 sc-eQTL 6.19e-01 -0.0701 0.141 0.077 DC L1
ENSG00000197442 MAP3K5 367135 sc-eQTL 5.70e-01 0.0768 0.135 0.077 DC L1
ENSG00000237499 WAKMAR2 -708621 sc-eQTL 5.92e-01 -0.0712 0.133 0.077 DC L1
ENSG00000286646 AL121933.2 375567 sc-eQTL 8.27e-01 0.0387 0.176 0.077 DC L1
ENSG00000027697 IFNGR1 -59837 sc-eQTL 8.45e-01 0.0203 0.104 0.073 Mono L1
ENSG00000029363 BCLAF1 869761 sc-eQTL 7.23e-01 -0.0316 0.0889 0.073 Mono L1
ENSG00000112357 PEX7 337048 sc-eQTL 8.30e-01 -0.0376 0.175 0.073 Mono L1
ENSG00000118503 TNFAIP3 -707602 sc-eQTL 4.86e-01 -0.0615 0.0881 0.073 Mono L1
ENSG00000135525 MAP7 608793 sc-eQTL 6.60e-01 0.0679 0.154 0.073 Mono L1
ENSG00000197442 MAP3K5 367135 sc-eQTL 4.03e-01 -0.0861 0.103 0.073 Mono L1
ENSG00000237499 WAKMAR2 -708621 sc-eQTL 7.53e-01 -0.0345 0.109 0.073 Mono L1
ENSG00000286646 AL121933.2 375567 sc-eQTL 7.93e-01 0.0327 0.125 0.073 Mono L1
ENSG00000027697 IFNGR1 -59837 sc-eQTL 3.02e-01 -0.115 0.111 0.073 NK L1
ENSG00000029363 BCLAF1 869761 sc-eQTL 2.53e-01 -0.0676 0.059 0.073 NK L1
ENSG00000112357 PEX7 337048 sc-eQTL 1.62e-01 0.24 0.171 0.073 NK L1
ENSG00000112378 PERP -947807 sc-eQTL 4.83e-01 -0.076 0.108 0.073 NK L1
ENSG00000118503 TNFAIP3 -707602 sc-eQTL 5.26e-01 -0.0588 0.0926 0.073 NK L1
ENSG00000197442 MAP3K5 367135 sc-eQTL 9.11e-02 0.224 0.132 0.073 NK L1
ENSG00000237499 WAKMAR2 -708621 sc-eQTL 3.77e-01 -0.116 0.131 0.073 NK L1
ENSG00000027697 IFNGR1 -59837 sc-eQTL 8.88e-01 -0.0147 0.104 0.073 Other_T L1
ENSG00000029363 BCLAF1 869761 sc-eQTL 3.18e-01 0.087 0.0869 0.073 Other_T L1
ENSG00000112357 PEX7 337048 sc-eQTL 8.14e-01 0.0399 0.169 0.073 Other_T L1
ENSG00000112378 PERP -947807 sc-eQTL 6.12e-01 -0.0691 0.136 0.073 Other_T L1
ENSG00000118503 TNFAIP3 -707602 sc-eQTL 4.92e-01 -0.0445 0.0646 0.073 Other_T L1
ENSG00000146410 MTFR2 909277 sc-eQTL 8.75e-01 0.0155 0.0979 0.073 Other_T L1
ENSG00000197442 MAP3K5 367135 sc-eQTL 3.52e-01 0.116 0.125 0.073 Other_T L1
ENSG00000237499 WAKMAR2 -708621 sc-eQTL 9.27e-01 0.0118 0.128 0.073 Other_T L1
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000027697 IFNGR1 -59837 sc-eQTL 4.07e-01 -0.145 0.175 0.079 B_Activated L2
ENSG00000029363 BCLAF1 869761 sc-eQTL 9.84e-01 0.00281 0.142 0.079 B_Activated L2
ENSG00000112357 PEX7 337048 sc-eQTL 3.17e-01 -0.172 0.172 0.079 B_Activated L2
ENSG00000112378 PERP -947807 sc-eQTL 8.30e-01 -0.0191 0.0891 0.079 B_Activated L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 -707602 sc-eQTL 6.22e-01 0.0852 0.173 0.079 B_Activated L2
ENSG00000197442 MAP3K5 367135 sc-eQTL 1.45e-01 0.282 0.192 0.079 B_Activated L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 -708621 sc-eQTL 9.61e-01 -0.00737 0.151 0.079 B_Activated L2
ENSG00000027697 IFNGR1 -59837 sc-eQTL 2.06e-01 0.198 0.156 0.071 B_Intermediate L2
ENSG00000029363 BCLAF1 869761 sc-eQTL 1.70e-01 0.122 0.0888 0.071 B_Intermediate L2
ENSG00000112357 PEX7 337048 sc-eQTL 9.52e-01 -0.00987 0.164 0.071 B_Intermediate L2
ENSG00000112378 PERP -947807 sc-eQTL 6.94e-02 -0.271 0.148 0.071 B_Intermediate L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 -707602 sc-eQTL 3.35e-01 -0.113 0.117 0.071 B_Intermediate L2
ENSG00000197442 MAP3K5 367135 sc-eQTL 9.95e-01 0.000913 0.142 0.071 B_Intermediate L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 -708621 sc-eQTL 6.17e-01 -0.0832 0.166 0.071 B_Intermediate L2
ENSG00000027697 IFNGR1 -59837 sc-eQTL 7.39e-01 -0.057 0.171 0.073 B_Memory L2
ENSG00000029363 BCLAF1 869761 sc-eQTL 7.95e-01 0.0265 0.102 0.073 B_Memory L2
ENSG00000112357 PEX7 337048 sc-eQTL 8.55e-01 -0.0316 0.173 0.073 B_Memory L2
ENSG00000112378 PERP -947807 sc-eQTL 3.65e-01 -0.147 0.162 0.073 B_Memory L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 -707602 sc-eQTL 3.96e-01 -0.0951 0.112 0.073 B_Memory L2
ENSG00000197442 MAP3K5 367135 sc-eQTL 9.95e-01 0.000948 0.153 0.073 B_Memory L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 -708621 sc-eQTL 2.66e-01 -0.185 0.166 0.073 B_Memory L2
ENSG00000027697 IFNGR1 -59837 sc-eQTL 7.78e-01 0.0393 0.139 0.073 B_Naive1 L2
ENSG00000029363 BCLAF1 869761 sc-eQTL 7.65e-01 -0.0238 0.0795 0.073 B_Naive1 L2
ENSG00000112357 PEX7 337048 sc-eQTL 8.80e-01 0.0277 0.184 0.073 B_Naive1 L2
ENSG00000112378 PERP -947807 sc-eQTL 6.75e-01 -0.0673 0.161 0.073 B_Naive1 L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 -707602 sc-eQTL 4.30e-01 -0.0736 0.093 0.073 B_Naive1 L2
ENSG00000197442 MAP3K5 367135 sc-eQTL 6.45e-01 0.0603 0.131 0.073 B_Naive1 L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 -708621 sc-eQTL 5.98e-01 0.077 0.146 0.073 B_Naive1 L2
ENSG00000027697 IFNGR1 -59837 sc-eQTL 9.35e-01 -0.0136 0.165 0.073 B_Naive2 L2
ENSG00000029363 BCLAF1 869761 sc-eQTL 6.71e-01 -0.0406 0.0956 0.073 B_Naive2 L2
ENSG00000112357 PEX7 337048 sc-eQTL 7.60e-01 -0.0552 0.18 0.073 B_Naive2 L2
ENSG00000112378 PERP -947807 sc-eQTL 2.68e-01 0.145 0.131 0.073 B_Naive2 L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 -707602 sc-eQTL 8.06e-01 -0.0323 0.131 0.073 B_Naive2 L2
ENSG00000197442 MAP3K5 367135 sc-eQTL 6.70e-01 -0.0596 0.14 0.073 B_Naive2 L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 -708621 sc-eQTL 4.04e-01 0.142 0.17 0.073 B_Naive2 L2
ENSG00000027697 IFNGR1 -59837 sc-eQTL 7.29e-01 0.0519 0.15 0.075 CD4_CTL L2
ENSG00000029363 BCLAF1 869761 sc-eQTL 9.00e-01 0.0166 0.133 0.075 CD4_CTL L2
ENSG00000112357 PEX7 337048 sc-eQTL 4.24e-01 -0.133 0.166 0.075 CD4_CTL L2
ENSG00000112378 PERP -947807 sc-eQTL 2.44e-01 -0.196 0.168 0.075 CD4_CTL L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 -707602 sc-eQTL 9.35e-01 0.00803 0.0982 0.075 CD4_CTL L2
ENSG00000197442 MAP3K5 367135 sc-eQTL 5.86e-01 0.0854 0.157 0.075 CD4_CTL L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 -708621 sc-eQTL 2.65e-01 -0.17 0.152 0.075 CD4_CTL L2
ENSG00000027697 IFNGR1 -59837 sc-eQTL 3.57e-02 -0.175 0.0827 0.073 CD4_Naive L2
ENSG00000029363 BCLAF1 869761 sc-eQTL 8.91e-01 -0.00917 0.0671 0.073 CD4_Naive L2
ENSG00000112357 PEX7 337048 sc-eQTL 7.57e-01 -0.0489 0.158 0.073 CD4_Naive L2
ENSG00000112378 PERP -947807 sc-eQTL 5.05e-02 -0.254 0.129 0.073 CD4_Naive L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 -707602 sc-eQTL 6.38e-01 -0.043 0.0913 0.073 CD4_Naive L2
ENSG00000197442 MAP3K5 367135 sc-eQTL 9.14e-01 -0.00727 0.0671 0.073 CD4_Naive L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 -708621 sc-eQTL 4.22e-01 -0.095 0.118 0.073 CD4_Naive L2
ENSG00000027697 IFNGR1 -59837 sc-eQTL 9.89e-01 -0.00164 0.118 0.073 CD4_TCM L2
ENSG00000029363 BCLAF1 869761 sc-eQTL 5.39e-01 -0.0458 0.0745 0.073 CD4_TCM L2
ENSG00000112357 PEX7 337048 sc-eQTL 2.14e-01 -0.215 0.173 0.073 CD4_TCM L2
ENSG00000112378 PERP -947807 sc-eQTL 3.37e-01 -0.141 0.146 0.073 CD4_TCM L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 -707602 sc-eQTL 8.48e-01 0.0164 0.0851 0.073 CD4_TCM L2
ENSG00000197442 MAP3K5 367135 sc-eQTL 7.00e-01 -0.0374 0.0969 0.073 CD4_TCM L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 -708621 sc-eQTL 7.02e-01 -0.0458 0.119 0.073 CD4_TCM L2
ENSG00000027697 IFNGR1 -59837 sc-eQTL 2.41e-02 -0.297 0.131 0.073 CD4_TEM L2
ENSG00000029363 BCLAF1 869761 sc-eQTL 4.37e-01 0.073 0.0937 0.073 CD4_TEM L2
ENSG00000112357 PEX7 337048 sc-eQTL 7.54e-01 0.0535 0.171 0.073 CD4_TEM L2
ENSG00000112378 PERP -947807 sc-eQTL 4.95e-01 -0.0945 0.138 0.073 CD4_TEM L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 -707602 sc-eQTL 6.87e-01 -0.0355 0.0879 0.073 CD4_TEM L2
ENSG00000197442 MAP3K5 367135 sc-eQTL 7.38e-01 -0.0454 0.136 0.073 CD4_TEM L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 -708621 sc-eQTL 9.51e-01 -0.00865 0.141 0.073 CD4_TEM L2
ENSG00000027697 IFNGR1 -59837 sc-eQTL 8.80e-01 -0.0181 0.119 0.073 CD8_CTL L2
ENSG00000029363 BCLAF1 869761 sc-eQTL 5.83e-01 0.0436 0.0794 0.073 CD8_CTL L2
ENSG00000112357 PEX7 337048 sc-eQTL 8.66e-01 0.0276 0.164 0.073 CD8_CTL L2
ENSG00000112378 PERP -947807 sc-eQTL 1.90e-01 0.206 0.157 0.073 CD8_CTL L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 -707602 sc-eQTL 2.80e-01 -0.108 0.1 0.073 CD8_CTL L2
ENSG00000197442 MAP3K5 367135 sc-eQTL 8.48e-01 -0.0272 0.142 0.073 CD8_CTL L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 -708621 sc-eQTL 8.56e-02 -0.242 0.14 0.073 CD8_CTL L2
ENSG00000027697 IFNGR1 -59837 sc-eQTL 2.95e-01 -0.125 0.119 0.073 CD8_Naive L2
ENSG00000029363 BCLAF1 869761 sc-eQTL 1.31e-01 -0.125 0.0827 0.073 CD8_Naive L2
ENSG00000112357 PEX7 337048 sc-eQTL 5.77e-01 0.0962 0.172 0.073 CD8_Naive L2
ENSG00000112378 PERP -947807 sc-eQTL 8.87e-01 0.0186 0.131 0.073 CD8_Naive L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 -707602 sc-eQTL 1.04e-01 -0.151 0.0925 0.073 CD8_Naive L2
ENSG00000197442 MAP3K5 367135 sc-eQTL 9.76e-01 -0.00327 0.11 0.073 CD8_Naive L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 -708621 sc-eQTL 9.64e-02 -0.228 0.137 0.073 CD8_Naive L2
ENSG00000027697 IFNGR1 -59837 sc-eQTL 3.03e-01 -0.16 0.155 0.072 CD8_TCM L2
ENSG00000029363 BCLAF1 869761 sc-eQTL 9.90e-01 0.00144 0.117 0.072 CD8_TCM L2
ENSG00000112357 PEX7 337048 sc-eQTL 3.22e-01 0.177 0.178 0.072 CD8_TCM L2
ENSG00000112378 PERP -947807 sc-eQTL 9.20e-01 -0.0175 0.175 0.072 CD8_TCM L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 -707602 sc-eQTL 4.31e-01 0.0665 0.0843 0.072 CD8_TCM L2
ENSG00000197442 MAP3K5 367135 sc-eQTL 9.19e-01 -0.0153 0.151 0.072 CD8_TCM L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 -708621 sc-eQTL 5.09e-02 -0.301 0.153 0.072 CD8_TCM L2
ENSG00000027697 IFNGR1 -59837 sc-eQTL 7.19e-01 -0.0555 0.154 0.071 CD8_TEM L2
ENSG00000029363 BCLAF1 869761 sc-eQTL 4.22e-01 0.117 0.145 0.071 CD8_TEM L2
ENSG00000112357 PEX7 337048 sc-eQTL 9.97e-03 0.454 0.174 0.071 CD8_TEM L2
ENSG00000112378 PERP -947807 sc-eQTL 3.14e-01 -0.186 0.184 0.071 CD8_TEM L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 -707602 sc-eQTL 7.78e-01 -0.0321 0.114 0.071 CD8_TEM L2
ENSG00000197442 MAP3K5 367135 sc-eQTL 5.82e-01 0.0968 0.176 0.071 CD8_TEM L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 -708621 sc-eQTL 4.31e-01 0.133 0.168 0.071 CD8_TEM L2
ENSG00000027697 IFNGR1 -59837 sc-eQTL 4.81e-01 -0.0852 0.121 0.074 MAIT L2
ENSG00000029363 BCLAF1 869761 sc-eQTL 5.09e-01 0.0664 0.1 0.074 MAIT L2
ENSG00000112357 PEX7 337048 sc-eQTL 8.21e-01 -0.0372 0.164 0.074 MAIT L2
ENSG00000112378 PERP -947807 sc-eQTL 2.76e-01 -0.186 0.171 0.074 MAIT L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 -707602 sc-eQTL 5.47e-01 -0.0491 0.0813 0.074 MAIT L2
ENSG00000146410 MTFR2 909277 sc-eQTL 9.33e-01 -0.0114 0.136 0.074 MAIT L2
ENSG00000197442 MAP3K5 367135 sc-eQTL 8.49e-01 -0.027 0.142 0.074 MAIT L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 -708621 sc-eQTL 9.51e-01 -0.00921 0.151 0.074 MAIT L2
ENSG00000027697 IFNGR1 -59837 sc-eQTL 4.18e-01 -0.108 0.133 0.073 NK_CD56bright L2
ENSG00000029363 BCLAF1 869761 sc-eQTL 9.75e-01 0.00309 0.098 0.073 NK_CD56bright L2
ENSG00000112357 PEX7 337048 sc-eQTL 4.99e-01 0.117 0.173 0.073 NK_CD56bright L2
ENSG00000112378 PERP -947807 sc-eQTL 2.00e-02 -0.359 0.153 0.073 NK_CD56bright L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 -707602 sc-eQTL 5.46e-01 0.0597 0.0988 0.073 NK_CD56bright L2
ENSG00000197442 MAP3K5 367135 sc-eQTL 7.21e-01 0.0538 0.15 0.073 NK_CD56bright L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 -708621 sc-eQTL 5.85e-01 0.0861 0.158 0.073 NK_CD56bright L2
ENSG00000027697 IFNGR1 -59837 sc-eQTL 5.58e-01 -0.0601 0.103 0.073 NK_CD56dim L2
ENSG00000029363 BCLAF1 869761 sc-eQTL 8.62e-01 -0.0117 0.067 0.073 NK_CD56dim L2
ENSG00000112357 PEX7 337048 sc-eQTL 8.53e-01 0.0329 0.177 0.073 NK_CD56dim L2
ENSG00000112378 PERP -947807 sc-eQTL 4.14e-01 -0.102 0.124 0.073 NK_CD56dim L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 -707602 sc-eQTL 5.52e-01 -0.0575 0.0965 0.073 NK_CD56dim L2
ENSG00000197442 MAP3K5 367135 sc-eQTL 1.55e-01 0.197 0.138 0.073 NK_CD56dim L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 -708621 sc-eQTL 1.55e-01 -0.206 0.144 0.073 NK_CD56dim L2
ENSG00000027697 IFNGR1 -59837 sc-eQTL 9.02e-01 0.0162 0.132 0.075 NK_HLA L2
ENSG00000029363 BCLAF1 869761 sc-eQTL 9.69e-01 0.00441 0.112 0.075 NK_HLA L2
ENSG00000112357 PEX7 337048 sc-eQTL 1.30e-01 0.254 0.167 0.075 NK_HLA L2
ENSG00000112378 PERP -947807 sc-eQTL 5.02e-01 -0.0914 0.136 0.075 NK_HLA L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 -707602 sc-eQTL 5.13e-01 0.0686 0.105 0.075 NK_HLA L2
ENSG00000197442 MAP3K5 367135 sc-eQTL 3.65e-01 0.151 0.166 0.075 NK_HLA L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 -708621 sc-eQTL 9.91e-02 0.278 0.168 0.075 NK_HLA L2
ENSG00000027697 IFNGR1 -59837 sc-eQTL 2.40e-01 -0.127 0.108 0.073 NK_cytokine L2
ENSG00000029363 BCLAF1 869761 sc-eQTL 1.13e-01 -0.127 0.08 0.073 NK_cytokine L2
ENSG00000112357 PEX7 337048 sc-eQTL 9.70e-01 0.00644 0.169 0.073 NK_cytokine L2
ENSG00000112378 PERP -947807 sc-eQTL 2.93e-01 0.135 0.128 0.073 NK_cytokine L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 -707602 sc-eQTL 6.24e-01 -0.0472 0.0963 0.073 NK_cytokine L2
ENSG00000197442 MAP3K5 367135 sc-eQTL 3.87e-01 0.114 0.132 0.073 NK_cytokine L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 -708621 sc-eQTL 4.11e-01 -0.119 0.145 0.073 NK_cytokine L2
ENSG00000027697 IFNGR1 -59837 sc-eQTL 4.33e-01 -0.172 0.218 0.074 PB L2
ENSG00000029363 BCLAF1 869761 sc-eQTL 4.86e-01 0.132 0.188 0.074 PB L2
ENSG00000112357 PEX7 337048 sc-eQTL 6.20e-01 0.111 0.224 0.074 PB L2
ENSG00000112378 PERP -947807 sc-eQTL 1.34e-01 0.209 0.139 0.074 PB L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 -707602 sc-eQTL 3.12e-01 -0.172 0.169 0.074 PB L2
ENSG00000197442 MAP3K5 367135 sc-eQTL 4.69e-01 -0.14 0.193 0.074 PB L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 -708621 sc-eQTL 9.76e-01 -0.00611 0.204 0.074 PB L2
ENSG00000027697 IFNGR1 -59837 sc-eQTL 5.41e-01 -0.0895 0.146 0.07 Pro_T L2
ENSG00000029363 BCLAF1 869761 sc-eQTL 7.72e-01 0.044 0.152 0.07 Pro_T L2
ENSG00000112357 PEX7 337048 sc-eQTL 7.25e-01 0.0625 0.178 0.07 Pro_T L2
ENSG00000112378 PERP -947807 sc-eQTL 6.95e-01 -0.0554 0.141 0.07 Pro_T L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 -707602 sc-eQTL 3.48e-01 -0.0836 0.0889 0.07 Pro_T L2
ENSG00000146410 MTFR2 909277 sc-eQTL 3.32e-01 0.12 0.123 0.07 Pro_T L2
ENSG00000197442 MAP3K5 367135 sc-eQTL 7.75e-02 0.304 0.171 0.07 Pro_T L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 -708621 sc-eQTL 6.57e-02 -0.317 0.171 0.07 Pro_T L2
ENSG00000027697 IFNGR1 -59837 sc-eQTL 4.44e-01 -0.12 0.157 0.073 Treg L2
ENSG00000029363 BCLAF1 869761 sc-eQTL 7.08e-01 0.0381 0.102 0.073 Treg L2
ENSG00000112357 PEX7 337048 sc-eQTL 9.10e-01 -0.0189 0.166 0.073 Treg L2
ENSG00000112378 PERP -947807 sc-eQTL 1.17e-01 -0.281 0.179 0.073 Treg L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 -707602 sc-eQTL 7.23e-01 -0.0355 0.1 0.073 Treg L2
ENSG00000197442 MAP3K5 367135 sc-eQTL 3.27e-01 -0.106 0.108 0.073 Treg L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 -708621 sc-eQTL 6.61e-01 0.0671 0.153 0.073 Treg L2
ENSG00000027697 IFNGR1 -59837 sc-eQTL 7.67e-01 -0.0402 0.136 0.078 cDC L2
ENSG00000029363 BCLAF1 869761 sc-eQTL 9.82e-01 0.00302 0.137 0.078 cDC L2
ENSG00000112357 PEX7 337048 sc-eQTL 5.75e-01 0.0986 0.175 0.078 cDC L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 -707602 sc-eQTL 1.02e-01 -0.218 0.133 0.078 cDC L2
ENSG00000135525 MAP7 608793 sc-eQTL 6.14e-01 -0.0788 0.156 0.078 cDC L2
ENSG00000197442 MAP3K5 367135 sc-eQTL 9.61e-01 0.00677 0.138 0.078 cDC L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 -708621 sc-eQTL 6.22e-01 -0.0859 0.174 0.078 cDC L2
ENSG00000286646 AL121933.2 375567 sc-eQTL 8.75e-01 -0.0283 0.179 0.078 cDC L2
ENSG00000027697 IFNGR1 -59837 sc-eQTL 8.10e-01 0.0231 0.0961 0.073 cMono_IL1B L2
ENSG00000029363 BCLAF1 869761 sc-eQTL 5.37e-01 -0.0637 0.103 0.073 cMono_IL1B L2
ENSG00000112357 PEX7 337048 sc-eQTL 1.79e-01 -0.232 0.172 0.073 cMono_IL1B L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 -707602 sc-eQTL 5.99e-01 -0.0545 0.103 0.073 cMono_IL1B L2
ENSG00000135525 MAP7 608793 sc-eQTL 8.75e-01 0.0235 0.149 0.073 cMono_IL1B L2
ENSG00000197442 MAP3K5 367135 sc-eQTL 2.57e-01 -0.122 0.107 0.073 cMono_IL1B L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 -708621 sc-eQTL 7.79e-01 0.031 0.111 0.073 cMono_IL1B L2
ENSG00000286646 AL121933.2 375567 sc-eQTL 4.39e-01 0.107 0.138 0.073 cMono_IL1B L2
ENSG00000027697 IFNGR1 -59837 sc-eQTL 9.02e-01 0.0139 0.113 0.073 cMono_S100A L2
ENSG00000029363 BCLAF1 869761 sc-eQTL 6.43e-01 -0.0538 0.116 0.073 cMono_S100A L2
ENSG00000112357 PEX7 337048 sc-eQTL 7.86e-01 0.0493 0.181 0.073 cMono_S100A L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 -707602 sc-eQTL 1.79e-01 -0.135 0.1 0.073 cMono_S100A L2
ENSG00000135525 MAP7 608793 sc-eQTL 4.09e-01 -0.14 0.169 0.073 cMono_S100A L2
ENSG00000197442 MAP3K5 367135 sc-eQTL 5.10e-01 -0.0901 0.136 0.073 cMono_S100A L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 -708621 sc-eQTL 3.56e-01 -0.133 0.144 0.073 cMono_S100A L2
ENSG00000286646 AL121933.2 375567 sc-eQTL 8.20e-01 -0.032 0.141 0.073 cMono_S100A L2
ENSG00000027697 IFNGR1 -59837 sc-eQTL 9.63e-01 -0.00714 0.155 0.079 gdT L2
ENSG00000029363 BCLAF1 869761 sc-eQTL 1.60e-01 0.192 0.135 0.079 gdT L2
ENSG00000112357 PEX7 337048 sc-eQTL 2.50e-01 0.226 0.195 0.079 gdT L2
ENSG00000112378 PERP -947807 sc-eQTL 1.23e-01 -0.264 0.17 0.079 gdT L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 -707602 sc-eQTL 3.88e-01 -0.0823 0.095 0.079 gdT L2
ENSG00000146410 MTFR2 909277 sc-eQTL 1.72e-01 -0.205 0.149 0.079 gdT L2
ENSG00000197442 MAP3K5 367135 sc-eQTL 8.99e-01 -0.0257 0.202 0.079 gdT L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 -708621 sc-eQTL 7.59e-01 0.053 0.173 0.079 gdT L2
ENSG00000027697 IFNGR1 -59837 sc-eQTL 8.62e-01 0.0215 0.124 0.069 intMono L2
ENSG00000029363 BCLAF1 869761 sc-eQTL 3.03e-01 -0.168 0.163 0.069 intMono L2
ENSG00000112357 PEX7 337048 sc-eQTL 4.69e-01 0.121 0.167 0.069 intMono L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 -707602 sc-eQTL 2.51e-01 -0.123 0.107 0.069 intMono L2
ENSG00000135525 MAP7 608793 sc-eQTL 3.73e-01 -0.146 0.164 0.069 intMono L2
ENSG00000197442 MAP3K5 367135 sc-eQTL 4.55e-01 -0.13 0.174 0.069 intMono L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 -708621 sc-eQTL 8.71e-01 -0.0259 0.159 0.069 intMono L2
ENSG00000286646 AL121933.2 375567 sc-eQTL 1.94e-01 -0.238 0.183 0.069 intMono L2
ENSG00000027697 IFNGR1 -59837 sc-eQTL 6.16e-01 0.0688 0.137 0.075 ncMono L2
ENSG00000029363 BCLAF1 869761 sc-eQTL 5.72e-01 -0.0602 0.107 0.075 ncMono L2
ENSG00000112357 PEX7 337048 sc-eQTL 3.25e-01 0.167 0.17 0.075 ncMono L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 -707602 sc-eQTL 6.18e-02 -0.226 0.12 0.075 ncMono L2
ENSG00000135525 MAP7 608793 sc-eQTL 4.12e-02 0.305 0.149 0.075 ncMono L2
ENSG00000197442 MAP3K5 367135 sc-eQTL 6.21e-01 -0.0782 0.158 0.075 ncMono L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 -708621 sc-eQTL 6.93e-01 -0.06 0.152 0.075 ncMono L2
ENSG00000286646 AL121933.2 375567 sc-eQTL 2.38e-02 0.36 0.158 0.075 ncMono L2
ENSG00000027697 IFNGR1 -59837 sc-eQTL 9.43e-01 -0.0118 0.164 0.073 pDC L2
ENSG00000029363 BCLAF1 869761 sc-eQTL 7.23e-01 -0.0437 0.123 0.073 pDC L2
ENSG00000112357 PEX7 337048 sc-eQTL 5.22e-01 0.116 0.181 0.073 pDC L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 -707602 sc-eQTL 7.88e-01 -0.0411 0.152 0.073 pDC L2
ENSG00000135525 MAP7 608793 sc-eQTL 6.33e-02 0.234 0.125 0.073 pDC L2
ENSG00000197442 MAP3K5 367135 sc-eQTL 2.57e-01 -0.229 0.201 0.073 pDC L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 -708621 sc-eQTL 6.63e-01 0.0674 0.155 0.073 pDC L2
ENSG00000286646 AL121933.2 375567 sc-eQTL 4.18e-01 -0.151 0.186 0.073 pDC L2
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000027697 IFNGR1 -59837 sc-eQTL 8.34e-01 -0.0295 0.14 0.073 B_Memory LOneK1K
ENSG00000029363 BCLAF1 869761 sc-eQTL 4.49e-01 0.0597 0.0787 0.073 B_Memory LOneK1K
ENSG00000112357 PEX7 337048 sc-eQTL 2.33e-01 -0.193 0.161 0.073 B_Memory LOneK1K
ENSG00000112378 PERP -947807 sc-eQTL 3.57e-01 -0.138 0.15 0.073 B_Memory LOneK1K
ENSG00000118503 TNFAIP3 -707602 sc-eQTL 3.69e-01 -0.089 0.0989 0.073 B_Memory LOneK1K
ENSG00000197442 MAP3K5 367135 sc-eQTL 3.72e-01 0.117 0.131 0.073 B_Memory LOneK1K
ENSG00000237499 WAKMAR2 -708621 sc-eQTL 3.34e-01 -0.162 0.167 0.073 B_Memory LOneK1K
ENSG00000027697 IFNGR1 -59837 sc-eQTL 7.12e-01 0.0525 0.142 0.073 B_Naive LOneK1K
ENSG00000029363 BCLAF1 869761 sc-eQTL 9.43e-01 -0.00467 0.0652 0.073 B_Naive LOneK1K
ENSG00000112357 PEX7 337048 sc-eQTL 4.65e-01 -0.126 0.172 0.073 B_Naive LOneK1K
ENSG00000112378 PERP -947807 sc-eQTL 7.50e-01 0.0494 0.155 0.073 B_Naive LOneK1K
ENSG00000118503 TNFAIP3 -707602 sc-eQTL 4.65e-01 -0.0595 0.0811 0.073 B_Naive LOneK1K
ENSG00000197442 MAP3K5 367135 sc-eQTL 3.99e-01 0.1 0.119 0.073 B_Naive LOneK1K
ENSG00000237499 WAKMAR2 -708621 sc-eQTL 1.40e-01 0.213 0.144 0.073 B_Naive LOneK1K
ENSG00000027697 IFNGR1 -59837 sc-eQTL 8.47e-01 0.0188 0.0971 0.073 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000029363 BCLAF1 869761 sc-eQTL 5.67e-01 -0.0518 0.0903 0.073 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000112357 PEX7 337048 sc-eQTL 5.20e-01 -0.112 0.174 0.073 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000118503 TNFAIP3 -707602 sc-eQTL 2.94e-01 -0.0943 0.0896 0.073 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000135525 MAP7 608793 sc-eQTL 7.74e-01 -0.0447 0.156 0.073 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000197442 MAP3K5 367135 sc-eQTL 4.54e-01 -0.0789 0.105 0.073 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000237499 WAKMAR2 -708621 sc-eQTL 6.78e-01 -0.0448 0.108 0.073 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000286646 AL121933.2 375567 sc-eQTL 6.94e-01 0.0493 0.125 0.073 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000027697 IFNGR1 -59837 sc-eQTL 7.50e-01 0.0373 0.117 0.073 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000029363 BCLAF1 869761 sc-eQTL 1.88e-01 -0.139 0.105 0.073 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000112357 PEX7 337048 sc-eQTL 4.48e-01 0.134 0.176 0.073 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000118503 TNFAIP3 -707602 sc-eQTL 2.49e-01 -0.126 0.109 0.073 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000135525 MAP7 608793 sc-eQTL 1.02e-01 0.278 0.169 0.073 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000197442 MAP3K5 367135 sc-eQTL 7.31e-01 -0.0481 0.14 0.073 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000237499 WAKMAR2 -708621 sc-eQTL 6.91e-01 0.0581 0.146 0.073 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000286646 AL121933.2 375567 sc-eQTL 2.39e-01 0.195 0.165 0.073 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000027697 IFNGR1 -59837 sc-eQTL 4.38e-01 -0.0816 0.105 0.073 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000029363 BCLAF1 869761 sc-eQTL 2.81e-01 -0.0658 0.0609 0.073 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000112357 PEX7 337048 sc-eQTL 3.17e-01 0.177 0.177 0.073 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000112378 PERP -947807 sc-eQTL 8.27e-01 -0.0241 0.11 0.073 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000118503 TNFAIP3 -707602 sc-eQTL 5.56e-01 -0.0564 0.0957 0.073 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000197442 MAP3K5 367135 sc-eQTL 7.66e-02 0.229 0.128 0.073 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000237499 WAKMAR2 -708621 sc-eQTL 2.44e-01 -0.156 0.134 0.073 NK_CD56dim LOneK1K

Statistical fine-mapping results from Japan COVID-19 Task Force
(Shown only for PIP>0.001)
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
PIP (SuSiE)
PIP (FINEMAP)
MAF
ENSG00000027697 IFNGR1 -59837 pQTL 0.0345 -0.0535 0.0253 0.0 0.0 0.108
ENSG00000027697 IFNGR1 -59837 eQTL 2.27e-07 -0.109 0.0208 0.0 0.0 0.115
ENSG00000112357 PEX7 337048 eQTL 0.00076 0.138 0.0409 0.0 0.0 0.115
ENSG00000197442 MAP3K5 367135 eQTL 0.00852 0.0504 0.0191 0.0 0.0 0.115

Expression Modifier Score(EMS) for GTEx 49tissues
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Whole Blood
Muscle Skeletal
Liver
Brain Cerebellum
Prostate
Spleen
Skin Sun Exposed Lower leg
Artery Coronary
Esophagus Muscularis
Esophagus Gastroesophageal Junction
Artery Tibial
Heart Atrial Appendage
Nerve Tibial
Heart Left Ventricle
Adrenal Gland
Adipose Visceral Omentum
Pancreas
Lung
Pituitary
Brain Nucleus accumbens basal ganglia
Colon Transverse
Adipose Subcutaneous
Esophagus Mucosa
Brain Cortex
Thyroid
Stomach
Breast Mammary Tissue
Colon Sigmoid
Skin Not Sun Exposed Suprapubic
Testis
Artery Aorta
Brain Amygdala
Brain Anterior cingulate cortex BA24
Brain Caudate basal ganglia
Brain Cerebellar Hemisphere
Brain Frontal Cortex BA9
Brain Hippocampus
Brain Hypothalamus
Brain Putamen basal ganglia
Brain Spinal cord cervical c-1
Brain Substantia nigra
Cells Cultured fibroblasts
Cells EBV-transformed lymphocytes
Kidney Cortex
Minor Salivary Gland
Ovary
Small Intestine Terminal Ileum
Uterus
Vagina
ENSG00000027697 IFNGR1 -59837 1.65e-05 1.18e-05 1.32e-06 5.99e-06 2.08e-06 5.43e-06 1.07e-05 1.44e-06 6.97e-06 4.62e-06 1.19e-05 4.92e-06 1.31e-05 3.77e-06 2.01e-06 6.38e-06 4.17e-06 7.08e-06 2.56e-06 2.64e-06 4.54e-06 8.85e-06 7.67e-06 2.64e-06 1.58e-05 3.31e-06 4.68e-06 2.82e-06 8.8e-06 7.79e-06 4.48e-06 7.86e-07 7.37e-07 2.85e-06 3.88e-06 1.13e-06 1.1e-06 5.58e-07 1.2e-06 8.61e-07 7.14e-07 1.34e-05 1.57e-06 1.52e-07 6.81e-07 1.02e-06 8.82e-07 7.36e-07 3.52e-07