logo

Genes within 1Mb (chr6:137149049:C:T):

View on , UCSC , GTEx , gnomAD

Immune cell-type specific single cell cis-eQTLs in OASIS
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000027697 IFNGR1 -70400 sc-eQTL 2.47e-02 -0.248 0.109 0.115 B L1
ENSG00000029363 BCLAF1 859198 sc-eQTL 3.75e-01 0.0438 0.0492 0.115 B L1
ENSG00000112357 PEX7 326485 sc-eQTL 8.88e-01 -0.0185 0.131 0.115 B L1
ENSG00000112378 PERP -958370 sc-eQTL 4.55e-01 -0.0649 0.0867 0.115 B L1
ENSG00000118503 TNFAIP3 -718165 sc-eQTL 8.29e-01 -0.0151 0.0699 0.115 B L1
ENSG00000197442 MAP3K5 356572 sc-eQTL 7.54e-01 0.0305 0.0974 0.115 B L1
ENSG00000237499 WAKMAR2 -719184 sc-eQTL 5.21e-01 0.0707 0.11 0.115 B L1
ENSG00000027697 IFNGR1 -70400 sc-eQTL 5.47e-01 -0.0444 0.0735 0.115 CD4T L1
ENSG00000029363 BCLAF1 859198 sc-eQTL 8.80e-01 -0.00839 0.0557 0.115 CD4T L1
ENSG00000112357 PEX7 326485 sc-eQTL 9.12e-01 -0.0131 0.119 0.115 CD4T L1
ENSG00000112378 PERP -958370 sc-eQTL 9.53e-01 -0.00473 0.0796 0.115 CD4T L1
ENSG00000118503 TNFAIP3 -718165 sc-eQTL 6.83e-01 -0.0304 0.0745 0.115 CD4T L1
ENSG00000197442 MAP3K5 356572 sc-eQTL 2.21e-02 -0.129 0.0561 0.115 CD4T L1
ENSG00000237499 WAKMAR2 -719184 sc-eQTL 7.93e-03 -0.247 0.0923 0.115 CD4T L1
ENSG00000027697 IFNGR1 -70400 sc-eQTL 8.52e-01 0.0155 0.0829 0.115 CD8T L1
ENSG00000029363 BCLAF1 859198 sc-eQTL 6.06e-01 0.029 0.0561 0.115 CD8T L1
ENSG00000112357 PEX7 326485 sc-eQTL 2.65e-01 0.154 0.138 0.115 CD8T L1
ENSG00000112378 PERP -958370 sc-eQTL 9.18e-01 -0.00936 0.0904 0.115 CD8T L1
ENSG00000118503 TNFAIP3 -718165 sc-eQTL 6.61e-01 0.0306 0.0697 0.115 CD8T L1
ENSG00000197442 MAP3K5 356572 sc-eQTL 4.88e-01 -0.0511 0.0736 0.115 CD8T L1
ENSG00000237499 WAKMAR2 -719184 sc-eQTL 8.98e-01 -0.0132 0.102 0.115 CD8T L1
ENSG00000027697 IFNGR1 -70400 sc-eQTL 1.89e-01 0.132 0.1 0.117 DC L1
ENSG00000029363 BCLAF1 859198 sc-eQTL 6.77e-01 0.0378 0.0907 0.117 DC L1
ENSG00000112357 PEX7 326485 sc-eQTL 3.42e-02 -0.3 0.14 0.117 DC L1
ENSG00000118503 TNFAIP3 -718165 sc-eQTL 7.55e-01 -0.0337 0.108 0.117 DC L1
ENSG00000135525 MAP7 598230 sc-eQTL 7.72e-01 -0.0339 0.117 0.117 DC L1
ENSG00000197442 MAP3K5 356572 sc-eQTL 2.47e-01 0.13 0.112 0.117 DC L1
ENSG00000237499 WAKMAR2 -719184 sc-eQTL 9.65e-01 -0.00476 0.11 0.117 DC L1
ENSG00000286646 AL121933.2 365004 sc-eQTL 1.57e-01 -0.206 0.145 0.117 DC L1
ENSG00000027697 IFNGR1 -70400 sc-eQTL 4.25e-02 -0.169 0.0827 0.115 Mono L1
ENSG00000029363 BCLAF1 859198 sc-eQTL 2.98e-01 0.0743 0.0712 0.115 Mono L1
ENSG00000112357 PEX7 326485 sc-eQTL 2.84e-01 -0.151 0.14 0.115 Mono L1
ENSG00000118503 TNFAIP3 -718165 sc-eQTL 5.28e-01 -0.0447 0.0708 0.115 Mono L1
ENSG00000135525 MAP7 598230 sc-eQTL 7.78e-01 -0.035 0.124 0.115 Mono L1
ENSG00000197442 MAP3K5 356572 sc-eQTL 1.99e-01 -0.106 0.0824 0.115 Mono L1
ENSG00000237499 WAKMAR2 -719184 sc-eQTL 7.61e-01 0.0267 0.0878 0.115 Mono L1
ENSG00000286646 AL121933.2 365004 sc-eQTL 2.48e-01 0.116 0.0999 0.115 Mono L1
ENSG00000027697 IFNGR1 -70400 sc-eQTL 6.64e-01 -0.0411 0.0943 0.116 NK L1
ENSG00000029363 BCLAF1 859198 sc-eQTL 6.68e-01 -0.0215 0.0501 0.116 NK L1
ENSG00000112357 PEX7 326485 sc-eQTL 6.13e-01 0.0737 0.146 0.116 NK L1
ENSG00000112378 PERP -958370 sc-eQTL 6.69e-01 -0.0393 0.0917 0.116 NK L1
ENSG00000118503 TNFAIP3 -718165 sc-eQTL 1.77e-01 -0.106 0.0782 0.116 NK L1
ENSG00000197442 MAP3K5 356572 sc-eQTL 7.84e-01 -0.0308 0.113 0.116 NK L1
ENSG00000237499 WAKMAR2 -719184 sc-eQTL 3.57e-01 -0.103 0.111 0.116 NK L1
ENSG00000027697 IFNGR1 -70400 sc-eQTL 8.99e-01 -0.011 0.0866 0.115 Other_T L1
ENSG00000029363 BCLAF1 859198 sc-eQTL 3.29e-01 -0.071 0.0725 0.115 Other_T L1
ENSG00000112357 PEX7 326485 sc-eQTL 9.71e-01 0.00512 0.141 0.115 Other_T L1
ENSG00000112378 PERP -958370 sc-eQTL 5.82e-01 0.0624 0.113 0.115 Other_T L1
ENSG00000118503 TNFAIP3 -718165 sc-eQTL 7.66e-01 0.016 0.0539 0.115 Other_T L1
ENSG00000146410 MTFR2 898714 sc-eQTL 6.68e-01 0.0351 0.0816 0.115 Other_T L1
ENSG00000197442 MAP3K5 356572 sc-eQTL 4.05e-01 -0.0868 0.104 0.115 Other_T L1
ENSG00000237499 WAKMAR2 -719184 sc-eQTL 6.85e-01 0.0434 0.107 0.115 Other_T L1
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000027697 IFNGR1 -70400 sc-eQTL 8.42e-01 -0.0295 0.148 0.12 B_Activated L2
ENSG00000029363 BCLAF1 859198 sc-eQTL 9.25e-02 0.201 0.119 0.12 B_Activated L2
ENSG00000112357 PEX7 326485 sc-eQTL 3.26e-01 0.143 0.145 0.12 B_Activated L2
ENSG00000112378 PERP -958370 sc-eQTL 7.62e-01 -0.0228 0.0752 0.12 B_Activated L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 -718165 sc-eQTL 9.42e-02 0.243 0.145 0.12 B_Activated L2
ENSG00000197442 MAP3K5 356572 sc-eQTL 3.20e-01 -0.162 0.163 0.12 B_Activated L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 -719184 sc-eQTL 2.32e-01 0.152 0.127 0.12 B_Activated L2
ENSG00000027697 IFNGR1 -70400 sc-eQTL 7.34e-01 0.0441 0.13 0.116 B_Intermediate L2
ENSG00000029363 BCLAF1 859198 sc-eQTL 6.00e-01 -0.0387 0.0737 0.116 B_Intermediate L2
ENSG00000112357 PEX7 326485 sc-eQTL 3.25e-01 0.134 0.135 0.116 B_Intermediate L2
ENSG00000112378 PERP -958370 sc-eQTL 3.23e-01 -0.122 0.123 0.116 B_Intermediate L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 -718165 sc-eQTL 7.16e-01 -0.0353 0.097 0.116 B_Intermediate L2
ENSG00000197442 MAP3K5 356572 sc-eQTL 9.33e-02 -0.196 0.117 0.116 B_Intermediate L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 -719184 sc-eQTL 3.67e-01 -0.124 0.137 0.116 B_Intermediate L2
ENSG00000027697 IFNGR1 -70400 sc-eQTL 4.07e-01 -0.119 0.143 0.116 B_Memory L2
ENSG00000029363 BCLAF1 859198 sc-eQTL 1.83e-01 0.113 0.0849 0.116 B_Memory L2
ENSG00000112357 PEX7 326485 sc-eQTL 4.12e-01 0.119 0.145 0.116 B_Memory L2
ENSG00000112378 PERP -958370 sc-eQTL 1.58e-01 0.192 0.136 0.116 B_Memory L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 -718165 sc-eQTL 7.83e-01 -0.0259 0.0938 0.116 B_Memory L2
ENSG00000197442 MAP3K5 356572 sc-eQTL 2.67e-01 0.142 0.128 0.116 B_Memory L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 -719184 sc-eQTL 7.72e-01 -0.0405 0.14 0.116 B_Memory L2
ENSG00000027697 IFNGR1 -70400 sc-eQTL 2.86e-02 -0.243 0.11 0.115 B_Naive1 L2
ENSG00000029363 BCLAF1 859198 sc-eQTL 8.56e-01 0.0116 0.0636 0.115 B_Naive1 L2
ENSG00000112357 PEX7 326485 sc-eQTL 4.98e-01 -0.0996 0.147 0.115 B_Naive1 L2
ENSG00000112378 PERP -958370 sc-eQTL 3.13e-01 -0.13 0.128 0.115 B_Naive1 L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 -718165 sc-eQTL 6.06e-01 0.0385 0.0745 0.115 B_Naive1 L2
ENSG00000197442 MAP3K5 356572 sc-eQTL 2.68e-01 0.116 0.104 0.115 B_Naive1 L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 -719184 sc-eQTL 9.86e-01 0.00206 0.117 0.115 B_Naive1 L2
ENSG00000027697 IFNGR1 -70400 sc-eQTL 5.28e-02 -0.257 0.132 0.116 B_Naive2 L2
ENSG00000029363 BCLAF1 859198 sc-eQTL 7.59e-01 -0.0237 0.0772 0.116 B_Naive2 L2
ENSG00000112357 PEX7 326485 sc-eQTL 6.97e-01 0.0568 0.146 0.116 B_Naive2 L2
ENSG00000112378 PERP -958370 sc-eQTL 6.63e-01 -0.0464 0.106 0.116 B_Naive2 L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 -718165 sc-eQTL 5.38e-01 -0.0655 0.106 0.116 B_Naive2 L2
ENSG00000197442 MAP3K5 356572 sc-eQTL 1.91e-01 -0.148 0.112 0.116 B_Naive2 L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 -719184 sc-eQTL 7.55e-01 -0.0429 0.137 0.116 B_Naive2 L2
ENSG00000027697 IFNGR1 -70400 sc-eQTL 8.04e-01 -0.0314 0.127 0.114 CD4_CTL L2
ENSG00000029363 BCLAF1 859198 sc-eQTL 9.03e-01 -0.0136 0.112 0.114 CD4_CTL L2
ENSG00000112357 PEX7 326485 sc-eQTL 8.71e-01 0.0229 0.14 0.114 CD4_CTL L2
ENSG00000112378 PERP -958370 sc-eQTL 2.33e-01 0.17 0.142 0.114 CD4_CTL L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 -718165 sc-eQTL 5.07e-01 0.0551 0.0829 0.114 CD4_CTL L2
ENSG00000197442 MAP3K5 356572 sc-eQTL 6.86e-01 -0.0536 0.132 0.114 CD4_CTL L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 -719184 sc-eQTL 7.74e-01 -0.0371 0.129 0.114 CD4_CTL L2
ENSG00000027697 IFNGR1 -70400 sc-eQTL 3.46e-01 -0.0657 0.0696 0.115 CD4_Naive L2
ENSG00000029363 BCLAF1 859198 sc-eQTL 7.46e-01 -0.0181 0.056 0.115 CD4_Naive L2
ENSG00000112357 PEX7 326485 sc-eQTL 3.86e-01 0.114 0.131 0.115 CD4_Naive L2
ENSG00000112378 PERP -958370 sc-eQTL 4.15e-01 0.0885 0.108 0.115 CD4_Naive L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 -718165 sc-eQTL 8.13e-01 -0.0181 0.0762 0.115 CD4_Naive L2
ENSG00000197442 MAP3K5 356572 sc-eQTL 5.68e-03 -0.154 0.055 0.115 CD4_Naive L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 -719184 sc-eQTL 3.46e-03 -0.286 0.0968 0.115 CD4_Naive L2
ENSG00000027697 IFNGR1 -70400 sc-eQTL 9.62e-01 -0.00466 0.0966 0.115 CD4_TCM L2
ENSG00000029363 BCLAF1 859198 sc-eQTL 4.46e-01 0.0465 0.0609 0.115 CD4_TCM L2
ENSG00000112357 PEX7 326485 sc-eQTL 9.35e-01 0.0117 0.142 0.115 CD4_TCM L2
ENSG00000112378 PERP -958370 sc-eQTL 7.70e-01 0.035 0.12 0.115 CD4_TCM L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 -718165 sc-eQTL 6.94e-01 -0.0274 0.0696 0.115 CD4_TCM L2
ENSG00000197442 MAP3K5 356572 sc-eQTL 1.42e-01 -0.116 0.0789 0.115 CD4_TCM L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 -719184 sc-eQTL 9.68e-01 -0.00394 0.0976 0.115 CD4_TCM L2
ENSG00000027697 IFNGR1 -70400 sc-eQTL 1.41e-01 -0.161 0.109 0.115 CD4_TEM L2
ENSG00000029363 BCLAF1 859198 sc-eQTL 1.57e-01 -0.11 0.0774 0.115 CD4_TEM L2
ENSG00000112357 PEX7 326485 sc-eQTL 6.17e-01 -0.0708 0.142 0.115 CD4_TEM L2
ENSG00000112378 PERP -958370 sc-eQTL 3.69e-02 -0.238 0.114 0.115 CD4_TEM L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 -718165 sc-eQTL 5.98e-01 -0.0384 0.0728 0.115 CD4_TEM L2
ENSG00000197442 MAP3K5 356572 sc-eQTL 6.72e-01 -0.0478 0.112 0.115 CD4_TEM L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 -719184 sc-eQTL 2.30e-01 -0.14 0.116 0.115 CD4_TEM L2
ENSG00000027697 IFNGR1 -70400 sc-eQTL 3.42e-01 0.0942 0.099 0.115 CD8_CTL L2
ENSG00000029363 BCLAF1 859198 sc-eQTL 9.96e-01 0.000329 0.0662 0.115 CD8_CTL L2
ENSG00000112357 PEX7 326485 sc-eQTL 2.25e-01 0.166 0.136 0.115 CD8_CTL L2
ENSG00000112378 PERP -958370 sc-eQTL 7.67e-01 0.0389 0.131 0.115 CD8_CTL L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 -718165 sc-eQTL 7.89e-01 0.0224 0.0835 0.115 CD8_CTL L2
ENSG00000197442 MAP3K5 356572 sc-eQTL 1.78e-01 -0.159 0.117 0.115 CD8_CTL L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 -719184 sc-eQTL 6.93e-01 0.0465 0.117 0.115 CD8_CTL L2
ENSG00000027697 IFNGR1 -70400 sc-eQTL 2.28e-01 -0.12 0.0989 0.115 CD8_Naive L2
ENSG00000029363 BCLAF1 859198 sc-eQTL 9.62e-01 0.00327 0.0693 0.115 CD8_Naive L2
ENSG00000112357 PEX7 326485 sc-eQTL 3.18e-01 0.144 0.143 0.115 CD8_Naive L2
ENSG00000112378 PERP -958370 sc-eQTL 5.64e-01 -0.0631 0.109 0.115 CD8_Naive L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 -718165 sc-eQTL 8.66e-01 -0.0131 0.0776 0.115 CD8_Naive L2
ENSG00000197442 MAP3K5 356572 sc-eQTL 6.54e-01 -0.0413 0.0919 0.115 CD8_Naive L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 -719184 sc-eQTL 3.40e-01 -0.11 0.115 0.115 CD8_Naive L2
ENSG00000027697 IFNGR1 -70400 sc-eQTL 7.71e-01 0.0377 0.129 0.118 CD8_TCM L2
ENSG00000029363 BCLAF1 859198 sc-eQTL 8.87e-01 0.0138 0.0969 0.118 CD8_TCM L2
ENSG00000112357 PEX7 326485 sc-eQTL 7.34e-01 0.0505 0.148 0.118 CD8_TCM L2
ENSG00000112378 PERP -958370 sc-eQTL 9.33e-01 0.0122 0.145 0.118 CD8_TCM L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 -718165 sc-eQTL 5.67e-01 -0.0401 0.0699 0.118 CD8_TCM L2
ENSG00000197442 MAP3K5 356572 sc-eQTL 6.99e-01 0.0484 0.125 0.118 CD8_TCM L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 -719184 sc-eQTL 9.49e-01 -0.00827 0.128 0.118 CD8_TCM L2
ENSG00000027697 IFNGR1 -70400 sc-eQTL 6.70e-01 -0.0539 0.126 0.114 CD8_TEM L2
ENSG00000029363 BCLAF1 859198 sc-eQTL 2.14e-01 0.148 0.119 0.114 CD8_TEM L2
ENSG00000112357 PEX7 326485 sc-eQTL 2.75e-01 0.159 0.145 0.114 CD8_TEM L2
ENSG00000112378 PERP -958370 sc-eQTL 3.10e-01 0.154 0.151 0.114 CD8_TEM L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 -718165 sc-eQTL 8.88e-01 0.0131 0.0932 0.114 CD8_TEM L2
ENSG00000197442 MAP3K5 356572 sc-eQTL 1.68e-01 -0.199 0.143 0.114 CD8_TEM L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 -719184 sc-eQTL 1.51e-01 -0.198 0.138 0.114 CD8_TEM L2
ENSG00000027697 IFNGR1 -70400 sc-eQTL 3.22e-01 -0.0989 0.0997 0.117 MAIT L2
ENSG00000029363 BCLAF1 859198 sc-eQTL 3.02e-01 -0.0857 0.0828 0.117 MAIT L2
ENSG00000112357 PEX7 326485 sc-eQTL 1.68e-01 -0.187 0.135 0.117 MAIT L2
ENSG00000112378 PERP -958370 sc-eQTL 8.16e-01 0.0329 0.141 0.117 MAIT L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 -718165 sc-eQTL 8.30e-01 -0.0144 0.0672 0.117 MAIT L2
ENSG00000146410 MTFR2 898714 sc-eQTL 9.40e-01 0.00839 0.112 0.117 MAIT L2
ENSG00000197442 MAP3K5 356572 sc-eQTL 8.51e-01 -0.0221 0.117 0.117 MAIT L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 -719184 sc-eQTL 7.71e-01 -0.0363 0.124 0.117 MAIT L2
ENSG00000027697 IFNGR1 -70400 sc-eQTL 5.57e-01 -0.065 0.111 0.113 NK_CD56bright L2
ENSG00000029363 BCLAF1 859198 sc-eQTL 2.64e-01 -0.0913 0.0815 0.113 NK_CD56bright L2
ENSG00000112357 PEX7 326485 sc-eQTL 6.88e-01 0.0581 0.144 0.113 NK_CD56bright L2
ENSG00000112378 PERP -958370 sc-eQTL 9.46e-01 -0.00878 0.129 0.113 NK_CD56bright L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 -718165 sc-eQTL 3.44e-01 -0.078 0.0823 0.113 NK_CD56bright L2
ENSG00000197442 MAP3K5 356572 sc-eQTL 3.40e-01 -0.12 0.125 0.113 NK_CD56bright L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 -719184 sc-eQTL 8.09e-01 0.0318 0.131 0.113 NK_CD56bright L2
ENSG00000027697 IFNGR1 -70400 sc-eQTL 7.41e-01 0.0284 0.0857 0.116 NK_CD56dim L2
ENSG00000029363 BCLAF1 859198 sc-eQTL 4.60e-01 -0.0414 0.0559 0.116 NK_CD56dim L2
ENSG00000112357 PEX7 326485 sc-eQTL 3.06e-01 -0.151 0.147 0.116 NK_CD56dim L2
ENSG00000112378 PERP -958370 sc-eQTL 9.98e-02 0.171 0.103 0.116 NK_CD56dim L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 -718165 sc-eQTL 4.61e-01 -0.0596 0.0806 0.116 NK_CD56dim L2
ENSG00000197442 MAP3K5 356572 sc-eQTL 7.89e-01 -0.0311 0.116 0.116 NK_CD56dim L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 -719184 sc-eQTL 8.90e-01 0.0167 0.121 0.116 NK_CD56dim L2
ENSG00000027697 IFNGR1 -70400 sc-eQTL 9.92e-02 -0.19 0.115 0.112 NK_HLA L2
ENSG00000029363 BCLAF1 859198 sc-eQTL 4.83e-01 0.0687 0.0977 0.112 NK_HLA L2
ENSG00000112357 PEX7 326485 sc-eQTL 8.28e-01 0.0319 0.147 0.112 NK_HLA L2
ENSG00000112378 PERP -958370 sc-eQTL 5.54e-01 -0.0705 0.119 0.112 NK_HLA L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 -718165 sc-eQTL 4.37e-01 -0.0712 0.0914 0.112 NK_HLA L2
ENSG00000197442 MAP3K5 356572 sc-eQTL 9.12e-01 0.016 0.146 0.112 NK_HLA L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 -719184 sc-eQTL 1.88e-01 -0.194 0.147 0.112 NK_HLA L2
ENSG00000027697 IFNGR1 -70400 sc-eQTL 8.67e-01 -0.0155 0.0919 0.116 NK_cytokine L2
ENSG00000029363 BCLAF1 859198 sc-eQTL 7.76e-01 -0.0195 0.0686 0.116 NK_cytokine L2
ENSG00000112357 PEX7 326485 sc-eQTL 1.10e-01 0.23 0.143 0.116 NK_cytokine L2
ENSG00000112378 PERP -958370 sc-eQTL 7.78e-01 -0.0309 0.109 0.116 NK_cytokine L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 -718165 sc-eQTL 5.25e-01 -0.0522 0.082 0.116 NK_cytokine L2
ENSG00000197442 MAP3K5 356572 sc-eQTL 4.74e-01 -0.0808 0.113 0.116 NK_cytokine L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 -719184 sc-eQTL 1.60e-01 -0.173 0.123 0.116 NK_cytokine L2
ENSG00000027697 IFNGR1 -70400 sc-eQTL 4.91e-01 -0.124 0.179 0.107 PB L2
ENSG00000029363 BCLAF1 859198 sc-eQTL 2.24e-01 -0.188 0.154 0.107 PB L2
ENSG00000112357 PEX7 326485 sc-eQTL 9.09e-01 -0.0212 0.184 0.107 PB L2
ENSG00000112378 PERP -958370 sc-eQTL 1.93e-01 -0.15 0.114 0.107 PB L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 -718165 sc-eQTL 4.62e-01 0.103 0.139 0.107 PB L2
ENSG00000197442 MAP3K5 356572 sc-eQTL 8.63e-01 -0.0276 0.159 0.107 PB L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 -719184 sc-eQTL 1.16e-02 0.418 0.163 0.107 PB L2
ENSG00000027697 IFNGR1 -70400 sc-eQTL 9.20e-01 -0.0114 0.113 0.115 Pro_T L2
ENSG00000029363 BCLAF1 859198 sc-eQTL 3.83e-01 0.103 0.117 0.115 Pro_T L2
ENSG00000112357 PEX7 326485 sc-eQTL 1.89e-01 0.181 0.137 0.115 Pro_T L2
ENSG00000112378 PERP -958370 sc-eQTL 7.16e-02 0.197 0.109 0.115 Pro_T L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 -718165 sc-eQTL 5.20e-01 0.0444 0.069 0.115 Pro_T L2
ENSG00000146410 MTFR2 898714 sc-eQTL 2.71e-01 0.105 0.0954 0.115 Pro_T L2
ENSG00000197442 MAP3K5 356572 sc-eQTL 7.75e-02 -0.235 0.133 0.115 Pro_T L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 -719184 sc-eQTL 4.80e-01 -0.0946 0.134 0.115 Pro_T L2
ENSG00000027697 IFNGR1 -70400 sc-eQTL 2.12e-01 -0.165 0.131 0.115 Treg L2
ENSG00000029363 BCLAF1 859198 sc-eQTL 3.83e-01 0.0743 0.085 0.115 Treg L2
ENSG00000112357 PEX7 326485 sc-eQTL 7.87e-01 -0.0378 0.139 0.115 Treg L2
ENSG00000112378 PERP -958370 sc-eQTL 8.72e-01 0.0243 0.151 0.115 Treg L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 -718165 sc-eQTL 9.27e-01 0.00771 0.0838 0.115 Treg L2
ENSG00000197442 MAP3K5 356572 sc-eQTL 3.46e-01 0.0855 0.0906 0.115 Treg L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 -719184 sc-eQTL 9.70e-01 -0.00479 0.128 0.115 Treg L2
ENSG00000027697 IFNGR1 -70400 sc-eQTL 6.49e-01 -0.0519 0.114 0.115 cDC L2
ENSG00000029363 BCLAF1 859198 sc-eQTL 1.70e-01 0.157 0.114 0.115 cDC L2
ENSG00000112357 PEX7 326485 sc-eQTL 1.49e-01 -0.212 0.146 0.115 cDC L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 -718165 sc-eQTL 8.27e-01 -0.0245 0.112 0.115 cDC L2
ENSG00000135525 MAP7 598230 sc-eQTL 7.97e-01 0.0339 0.131 0.115 cDC L2
ENSG00000197442 MAP3K5 356572 sc-eQTL 5.58e-01 0.0677 0.115 0.115 cDC L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 -719184 sc-eQTL 7.64e-01 0.0439 0.146 0.115 cDC L2
ENSG00000286646 AL121933.2 365004 sc-eQTL 8.65e-01 -0.0255 0.15 0.115 cDC L2
ENSG00000027697 IFNGR1 -70400 sc-eQTL 1.97e-01 -0.102 0.0786 0.115 cMono_IL1B L2
ENSG00000029363 BCLAF1 859198 sc-eQTL 7.97e-01 0.0218 0.0846 0.115 cMono_IL1B L2
ENSG00000112357 PEX7 326485 sc-eQTL 4.72e-01 -0.102 0.142 0.115 cMono_IL1B L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 -718165 sc-eQTL 5.42e-01 -0.0519 0.0849 0.115 cMono_IL1B L2
ENSG00000135525 MAP7 598230 sc-eQTL 1.98e-01 -0.157 0.122 0.115 cMono_IL1B L2
ENSG00000197442 MAP3K5 356572 sc-eQTL 4.66e-01 -0.0645 0.0883 0.115 cMono_IL1B L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 -719184 sc-eQTL 6.44e-01 0.042 0.0907 0.115 cMono_IL1B L2
ENSG00000286646 AL121933.2 365004 sc-eQTL 1.17e-01 0.178 0.113 0.115 cMono_IL1B L2
ENSG00000027697 IFNGR1 -70400 sc-eQTL 1.10e-01 -0.145 0.0901 0.115 cMono_S100A L2
ENSG00000029363 BCLAF1 859198 sc-eQTL 5.01e-01 0.0627 0.093 0.115 cMono_S100A L2
ENSG00000112357 PEX7 326485 sc-eQTL 4.49e-01 -0.11 0.145 0.115 cMono_S100A L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 -718165 sc-eQTL 5.53e-01 -0.0479 0.0805 0.115 cMono_S100A L2
ENSG00000135525 MAP7 598230 sc-eQTL 9.91e-01 0.00146 0.136 0.115 cMono_S100A L2
ENSG00000197442 MAP3K5 356572 sc-eQTL 6.16e-01 -0.0549 0.109 0.115 cMono_S100A L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 -719184 sc-eQTL 3.91e-01 -0.0992 0.115 0.115 cMono_S100A L2
ENSG00000286646 AL121933.2 365004 sc-eQTL 5.03e-01 0.0757 0.113 0.115 cMono_S100A L2
ENSG00000027697 IFNGR1 -70400 sc-eQTL 3.14e-01 0.134 0.133 0.115 gdT L2
ENSG00000029363 BCLAF1 859198 sc-eQTL 2.27e-01 -0.142 0.117 0.115 gdT L2
ENSG00000112357 PEX7 326485 sc-eQTL 9.89e-01 -0.00241 0.169 0.115 gdT L2
ENSG00000112378 PERP -958370 sc-eQTL 9.78e-01 0.00413 0.147 0.115 gdT L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 -718165 sc-eQTL 9.37e-01 0.00644 0.0819 0.115 gdT L2
ENSG00000146410 MTFR2 898714 sc-eQTL 6.92e-01 0.0512 0.129 0.115 gdT L2
ENSG00000197442 MAP3K5 356572 sc-eQTL 2.49e-01 0.199 0.172 0.115 gdT L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 -719184 sc-eQTL 9.91e-01 -0.00175 0.148 0.115 gdT L2
ENSG00000027697 IFNGR1 -70400 sc-eQTL 4.29e-01 -0.0801 0.101 0.116 intMono L2
ENSG00000029363 BCLAF1 859198 sc-eQTL 1.14e-01 0.211 0.133 0.116 intMono L2
ENSG00000112357 PEX7 326485 sc-eQTL 8.44e-01 -0.0269 0.136 0.116 intMono L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 -718165 sc-eQTL 2.82e-01 0.0939 0.0871 0.116 intMono L2
ENSG00000135525 MAP7 598230 sc-eQTL 6.48e-01 0.0613 0.134 0.116 intMono L2
ENSG00000197442 MAP3K5 356572 sc-eQTL 7.42e-01 -0.0469 0.142 0.116 intMono L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 -719184 sc-eQTL 1.76e-01 0.176 0.13 0.116 intMono L2
ENSG00000286646 AL121933.2 365004 sc-eQTL 1.76e-01 0.203 0.149 0.116 intMono L2
ENSG00000027697 IFNGR1 -70400 sc-eQTL 1.94e-01 -0.148 0.114 0.118 ncMono L2
ENSG00000029363 BCLAF1 859198 sc-eQTL 8.82e-01 -0.0132 0.0888 0.118 ncMono L2
ENSG00000112357 PEX7 326485 sc-eQTL 4.73e-01 -0.102 0.141 0.118 ncMono L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 -718165 sc-eQTL 9.19e-01 0.0103 0.101 0.118 ncMono L2
ENSG00000135525 MAP7 598230 sc-eQTL 4.68e-01 0.0909 0.125 0.118 ncMono L2
ENSG00000197442 MAP3K5 356572 sc-eQTL 6.63e-02 -0.241 0.13 0.118 ncMono L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 -719184 sc-eQTL 8.80e-01 -0.0192 0.127 0.118 ncMono L2
ENSG00000286646 AL121933.2 365004 sc-eQTL 4.34e-01 -0.104 0.133 0.118 ncMono L2
ENSG00000027697 IFNGR1 -70400 sc-eQTL 5.35e-01 0.0793 0.127 0.124 pDC L2
ENSG00000029363 BCLAF1 859198 sc-eQTL 3.97e-01 0.0811 0.0954 0.124 pDC L2
ENSG00000112357 PEX7 326485 sc-eQTL 4.54e-01 -0.105 0.14 0.124 pDC L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 -718165 sc-eQTL 7.95e-01 0.0307 0.118 0.124 pDC L2
ENSG00000135525 MAP7 598230 sc-eQTL 6.70e-02 -0.179 0.097 0.124 pDC L2
ENSG00000197442 MAP3K5 356572 sc-eQTL 8.07e-01 0.0385 0.157 0.124 pDC L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 -719184 sc-eQTL 9.06e-01 0.0142 0.12 0.124 pDC L2
ENSG00000286646 AL121933.2 365004 sc-eQTL 1.67e-01 -0.2 0.144 0.124 pDC L2
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000027697 IFNGR1 -70400 sc-eQTL 9.39e-01 -0.00889 0.116 0.115 B_Memory LOneK1K
ENSG00000029363 BCLAF1 859198 sc-eQTL 5.28e-01 0.0411 0.0649 0.115 B_Memory LOneK1K
ENSG00000112357 PEX7 326485 sc-eQTL 3.53e-01 0.124 0.133 0.115 B_Memory LOneK1K
ENSG00000112378 PERP -958370 sc-eQTL 5.89e-01 0.0669 0.124 0.115 B_Memory LOneK1K
ENSG00000118503 TNFAIP3 -718165 sc-eQTL 7.31e-01 -0.0281 0.0817 0.115 B_Memory LOneK1K
ENSG00000197442 MAP3K5 356572 sc-eQTL 5.28e-01 -0.0684 0.108 0.115 B_Memory LOneK1K
ENSG00000237499 WAKMAR2 -719184 sc-eQTL 7.40e-01 -0.0459 0.138 0.115 B_Memory LOneK1K
ENSG00000027697 IFNGR1 -70400 sc-eQTL 4.34e-03 -0.332 0.115 0.115 B_Naive LOneK1K
ENSG00000029363 BCLAF1 859198 sc-eQTL 8.47e-01 0.0104 0.0539 0.115 B_Naive LOneK1K
ENSG00000112357 PEX7 326485 sc-eQTL 5.03e-01 -0.0959 0.143 0.115 B_Naive LOneK1K
ENSG00000112378 PERP -958370 sc-eQTL 3.03e-01 -0.132 0.128 0.115 B_Naive LOneK1K
ENSG00000118503 TNFAIP3 -718165 sc-eQTL 1.00e+00 -2.17e-05 0.0672 0.115 B_Naive LOneK1K
ENSG00000197442 MAP3K5 356572 sc-eQTL 2.22e-01 0.12 0.0982 0.115 B_Naive LOneK1K
ENSG00000237499 WAKMAR2 -719184 sc-eQTL 9.51e-01 0.00733 0.12 0.115 B_Naive LOneK1K
ENSG00000027697 IFNGR1 -70400 sc-eQTL 7.90e-02 -0.138 0.0783 0.115 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000029363 BCLAF1 859198 sc-eQTL 4.28e-01 0.0581 0.0733 0.115 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000112357 PEX7 326485 sc-eQTL 1.93e-01 -0.184 0.141 0.115 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000118503 TNFAIP3 -718165 sc-eQTL 5.65e-01 -0.042 0.0729 0.115 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000135525 MAP7 598230 sc-eQTL 3.99e-01 -0.107 0.126 0.115 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000197442 MAP3K5 356572 sc-eQTL 3.22e-01 -0.0846 0.0853 0.115 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000237499 WAKMAR2 -719184 sc-eQTL 8.64e-01 0.015 0.0874 0.115 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000286646 AL121933.2 365004 sc-eQTL 1.95e-01 0.132 0.101 0.115 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000027697 IFNGR1 -70400 sc-eQTL 8.11e-02 -0.167 0.0952 0.116 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000029363 BCLAF1 859198 sc-eQTL 3.19e-01 0.0864 0.0865 0.116 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000112357 PEX7 326485 sc-eQTL 8.91e-01 -0.0199 0.145 0.116 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000118503 TNFAIP3 -718165 sc-eQTL 7.28e-01 0.0312 0.0896 0.116 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000135525 MAP7 598230 sc-eQTL 5.77e-01 0.0781 0.14 0.116 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000197442 MAP3K5 356572 sc-eQTL 1.76e-01 -0.155 0.114 0.116 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000237499 WAKMAR2 -719184 sc-eQTL 4.99e-01 0.0812 0.12 0.116 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000286646 AL121933.2 365004 sc-eQTL 9.43e-01 0.00974 0.136 0.116 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000027697 IFNGR1 -70400 sc-eQTL 6.40e-01 -0.0415 0.0887 0.116 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000029363 BCLAF1 859198 sc-eQTL 8.88e-01 -0.00729 0.0515 0.116 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000112357 PEX7 326485 sc-eQTL 9.85e-01 0.00289 0.15 0.116 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000112378 PERP -958370 sc-eQTL 9.01e-01 -0.0116 0.0929 0.116 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000118503 TNFAIP3 -718165 sc-eQTL 2.03e-01 -0.103 0.0806 0.116 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000197442 MAP3K5 356572 sc-eQTL 8.18e-01 -0.0252 0.109 0.116 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000237499 WAKMAR2 -719184 sc-eQTL 2.29e-01 -0.136 0.113 0.116 NK_CD56dim LOneK1K

Statistical fine-mapping results from Japan COVID-19 Task Force
(Shown only for PIP>0.001)
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
PIP (SuSiE)
PIP (FINEMAP)
MAF
ENSG00000220412 AL356234.1 -558152 eQTL 0.00573 -0.107 0.0388 0.00409 0.00108 0.0976

Expression Modifier Score(EMS) for GTEx 49tissues
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Whole Blood
Muscle Skeletal
Liver
Brain Cerebellum
Prostate
Spleen
Skin Sun Exposed Lower leg
Artery Coronary
Esophagus Muscularis
Esophagus Gastroesophageal Junction
Artery Tibial
Heart Atrial Appendage
Nerve Tibial
Heart Left Ventricle
Adrenal Gland
Adipose Visceral Omentum
Pancreas
Lung
Pituitary
Brain Nucleus accumbens basal ganglia
Colon Transverse
Adipose Subcutaneous
Esophagus Mucosa
Brain Cortex
Thyroid
Stomach
Breast Mammary Tissue
Colon Sigmoid
Skin Not Sun Exposed Suprapubic
Testis
Artery Aorta
Brain Amygdala
Brain Anterior cingulate cortex BA24
Brain Caudate basal ganglia
Brain Cerebellar Hemisphere
Brain Frontal Cortex BA9
Brain Hippocampus
Brain Hypothalamus
Brain Putamen basal ganglia
Brain Spinal cord cervical c-1
Brain Substantia nigra
Cells Cultured fibroblasts
Cells EBV-transformed lymphocytes
Kidney Cortex
Minor Salivary Gland
Ovary
Small Intestine Terminal Ileum
Uterus
Vagina
ENSG00000220412 AL356234.1 -558152 2.78e-06 5.7e-07 1.55e-07 4.31e-07 1.1e-07 3.2e-07 6.33e-07 9.91e-08 7.15e-07 2.98e-07 9.47e-07 3.68e-07 1.1e-06 1.6e-07 1.57e-07 4.12e-07 4.54e-07 5.67e-07 1.97e-07 1.39e-07 2.49e-07 5.2e-07 4.77e-07 1.32e-07 1.52e-06 2.74e-07 2.52e-07 2.59e-07 5.9e-07 9.08e-07 4.54e-07 7.71e-08 5.73e-08 1.38e-07 3.7e-07 5.4e-07 6.95e-08 6.66e-08 4.23e-08 7.78e-08 6.07e-08 7.45e-07 6.14e-07 1.76e-08 1.96e-07 1.37e-08 1.24e-07 0.0 4.98e-08