logo

Genes within 1Mb (chr6:137147518:G:A):

View on , UCSC , GTEx , gnomAD

Immune cell-type specific single cell cis-eQTLs in OASIS
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000027697 IFNGR1 -71931 sc-eQTL 5.91e-01 -0.0547 0.102 0.124 B L1
ENSG00000029363 BCLAF1 857667 sc-eQTL 5.92e-01 0.0243 0.0453 0.124 B L1
ENSG00000112357 PEX7 324954 sc-eQTL 4.46e-01 0.0917 0.12 0.124 B L1
ENSG00000112378 PERP -959901 sc-eQTL 8.52e-01 0.0149 0.0797 0.124 B L1
ENSG00000118503 TNFAIP3 -719696 sc-eQTL 2.33e-01 0.0765 0.064 0.124 B L1
ENSG00000197442 MAP3K5 355041 sc-eQTL 3.75e-01 0.0794 0.0893 0.124 B L1
ENSG00000237499 WAKMAR2 -720715 sc-eQTL 4.90e-02 0.198 0.1 0.124 B L1
ENSG00000027697 IFNGR1 -71931 sc-eQTL 2.09e-01 -0.0846 0.0672 0.124 CD4T L1
ENSG00000029363 BCLAF1 857667 sc-eQTL 2.48e-01 0.0589 0.0509 0.124 CD4T L1
ENSG00000112357 PEX7 324954 sc-eQTL 5.80e-02 -0.205 0.108 0.124 CD4T L1
ENSG00000112378 PERP -959901 sc-eQTL 6.26e-01 -0.0356 0.0728 0.124 CD4T L1
ENSG00000118503 TNFAIP3 -719696 sc-eQTL 8.56e-01 -0.0124 0.0683 0.124 CD4T L1
ENSG00000197442 MAP3K5 355041 sc-eQTL 4.96e-01 0.0354 0.052 0.124 CD4T L1
ENSG00000237499 WAKMAR2 -720715 sc-eQTL 5.39e-03 0.237 0.0844 0.124 CD4T L1
ENSG00000027697 IFNGR1 -71931 sc-eQTL 1.93e-02 -0.18 0.0765 0.124 CD8T L1
ENSG00000029363 BCLAF1 857667 sc-eQTL 9.91e-02 0.0863 0.0521 0.124 CD8T L1
ENSG00000112357 PEX7 324954 sc-eQTL 4.05e-02 0.264 0.128 0.124 CD8T L1
ENSG00000112378 PERP -959901 sc-eQTL 9.40e-01 -0.00635 0.0845 0.124 CD8T L1
ENSG00000118503 TNFAIP3 -719696 sc-eQTL 8.70e-01 0.0107 0.0652 0.124 CD8T L1
ENSG00000197442 MAP3K5 355041 sc-eQTL 1.23e-01 0.106 0.0686 0.124 CD8T L1
ENSG00000237499 WAKMAR2 -720715 sc-eQTL 7.74e-01 -0.0276 0.0958 0.124 CD8T L1
ENSG00000027697 IFNGR1 -71931 sc-eQTL 2.86e-01 0.1 0.0936 0.126 DC L1
ENSG00000029363 BCLAF1 857667 sc-eQTL 4.31e-01 0.0665 0.0844 0.126 DC L1
ENSG00000112357 PEX7 324954 sc-eQTL 4.30e-01 0.104 0.132 0.126 DC L1
ENSG00000118503 TNFAIP3 -719696 sc-eQTL 6.84e-01 0.0408 0.1 0.126 DC L1
ENSG00000135525 MAP7 596699 sc-eQTL 4.95e-01 -0.0742 0.109 0.126 DC L1
ENSG00000197442 MAP3K5 355041 sc-eQTL 2.65e-01 -0.116 0.104 0.126 DC L1
ENSG00000237499 WAKMAR2 -720715 sc-eQTL 2.76e-01 -0.111 0.102 0.126 DC L1
ENSG00000286646 AL121933.2 363473 sc-eQTL 8.71e-01 -0.022 0.136 0.126 DC L1
ENSG00000027697 IFNGR1 -71931 sc-eQTL 9.05e-06 -0.341 0.0749 0.124 Mono L1
ENSG00000029363 BCLAF1 857667 sc-eQTL 7.39e-01 -0.0224 0.0671 0.124 Mono L1
ENSG00000112357 PEX7 324954 sc-eQTL 9.93e-02 -0.217 0.131 0.124 Mono L1
ENSG00000118503 TNFAIP3 -719696 sc-eQTL 4.60e-01 0.0493 0.0665 0.124 Mono L1
ENSG00000135525 MAP7 596699 sc-eQTL 2.39e-01 -0.137 0.116 0.124 Mono L1
ENSG00000197442 MAP3K5 355041 sc-eQTL 6.46e-01 0.0358 0.0777 0.124 Mono L1
ENSG00000237499 WAKMAR2 -720715 sc-eQTL 2.23e-01 0.101 0.0822 0.124 Mono L1
ENSG00000286646 AL121933.2 363473 sc-eQTL 5.63e-01 -0.0545 0.0941 0.124 Mono L1
ENSG00000027697 IFNGR1 -71931 sc-eQTL 1.69e-01 -0.118 0.0852 0.124 NK L1
ENSG00000029363 BCLAF1 857667 sc-eQTL 8.55e-01 0.00831 0.0454 0.124 NK L1
ENSG00000112357 PEX7 324954 sc-eQTL 8.57e-01 0.0238 0.132 0.124 NK L1
ENSG00000112378 PERP -959901 sc-eQTL 2.47e-01 0.0964 0.0829 0.124 NK L1
ENSG00000118503 TNFAIP3 -719696 sc-eQTL 2.96e-01 0.0744 0.071 0.124 NK L1
ENSG00000197442 MAP3K5 355041 sc-eQTL 3.27e-01 0.0999 0.102 0.124 NK L1
ENSG00000237499 WAKMAR2 -720715 sc-eQTL 2.94e-01 0.106 0.101 0.124 NK L1
ENSG00000027697 IFNGR1 -71931 sc-eQTL 7.03e-01 -0.03 0.0787 0.124 Other_T L1
ENSG00000029363 BCLAF1 857667 sc-eQTL 3.91e-01 -0.0566 0.0659 0.124 Other_T L1
ENSG00000112357 PEX7 324954 sc-eQTL 8.02e-02 0.224 0.127 0.124 Other_T L1
ENSG00000112378 PERP -959901 sc-eQTL 5.63e-01 -0.0597 0.103 0.124 Other_T L1
ENSG00000118503 TNFAIP3 -719696 sc-eQTL 3.45e-01 0.0462 0.0489 0.124 Other_T L1
ENSG00000146410 MTFR2 897183 sc-eQTL 9.96e-01 -0.000332 0.0742 0.124 Other_T L1
ENSG00000197442 MAP3K5 355041 sc-eQTL 2.51e-01 0.109 0.0943 0.124 Other_T L1
ENSG00000237499 WAKMAR2 -720715 sc-eQTL 7.34e-01 0.0331 0.0972 0.124 Other_T L1
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000027697 IFNGR1 -71931 sc-eQTL 6.14e-01 -0.0688 0.136 0.112 B_Activated L2
ENSG00000029363 BCLAF1 857667 sc-eQTL 7.69e-01 -0.0326 0.111 0.112 B_Activated L2
ENSG00000112357 PEX7 324954 sc-eQTL 7.61e-01 -0.0408 0.134 0.112 B_Activated L2
ENSG00000112378 PERP -959901 sc-eQTL 8.08e-01 -0.0168 0.0693 0.112 B_Activated L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 -719696 sc-eQTL 1.04e-01 0.218 0.133 0.112 B_Activated L2
ENSG00000197442 MAP3K5 355041 sc-eQTL 5.34e-01 0.0937 0.15 0.112 B_Activated L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 -720715 sc-eQTL 2.77e-02 0.257 0.116 0.112 B_Activated L2
ENSG00000027697 IFNGR1 -71931 sc-eQTL 8.94e-01 0.0159 0.119 0.122 B_Intermediate L2
ENSG00000029363 BCLAF1 857667 sc-eQTL 6.25e-01 0.0331 0.0676 0.122 B_Intermediate L2
ENSG00000112357 PEX7 324954 sc-eQTL 3.19e-01 0.124 0.124 0.122 B_Intermediate L2
ENSG00000112378 PERP -959901 sc-eQTL 4.56e-01 0.0847 0.113 0.122 B_Intermediate L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 -719696 sc-eQTL 4.75e-01 0.0637 0.0889 0.122 B_Intermediate L2
ENSG00000197442 MAP3K5 355041 sc-eQTL 3.30e-01 0.105 0.107 0.122 B_Intermediate L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 -720715 sc-eQTL 5.23e-01 0.0807 0.126 0.122 B_Intermediate L2
ENSG00000027697 IFNGR1 -71931 sc-eQTL 6.74e-01 -0.0549 0.13 0.123 B_Memory L2
ENSG00000029363 BCLAF1 857667 sc-eQTL 4.17e-01 -0.0629 0.0773 0.123 B_Memory L2
ENSG00000112357 PEX7 324954 sc-eQTL 3.76e-03 0.378 0.129 0.123 B_Memory L2
ENSG00000112378 PERP -959901 sc-eQTL 1.14e-01 0.195 0.123 0.123 B_Memory L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 -719696 sc-eQTL 1.95e-02 0.198 0.0842 0.123 B_Memory L2
ENSG00000197442 MAP3K5 355041 sc-eQTL 6.16e-01 0.0585 0.116 0.123 B_Memory L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 -720715 sc-eQTL 7.89e-02 0.222 0.126 0.123 B_Memory L2
ENSG00000027697 IFNGR1 -71931 sc-eQTL 3.92e-01 -0.0864 0.101 0.124 B_Naive1 L2
ENSG00000029363 BCLAF1 857667 sc-eQTL 2.68e-01 0.0638 0.0575 0.124 B_Naive1 L2
ENSG00000112357 PEX7 324954 sc-eQTL 3.45e-01 -0.126 0.133 0.124 B_Naive1 L2
ENSG00000112378 PERP -959901 sc-eQTL 6.60e-01 -0.0512 0.116 0.124 B_Naive1 L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 -719696 sc-eQTL 1.39e-02 0.165 0.0666 0.124 B_Naive1 L2
ENSG00000197442 MAP3K5 355041 sc-eQTL 7.11e-01 0.0352 0.0949 0.124 B_Naive1 L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 -720715 sc-eQTL 2.81e-02 0.231 0.105 0.124 B_Naive1 L2
ENSG00000027697 IFNGR1 -71931 sc-eQTL 2.82e-01 0.134 0.125 0.122 B_Naive2 L2
ENSG00000029363 BCLAF1 857667 sc-eQTL 3.80e-01 0.0636 0.0724 0.122 B_Naive2 L2
ENSG00000112357 PEX7 324954 sc-eQTL 8.58e-01 -0.0244 0.137 0.122 B_Naive2 L2
ENSG00000112378 PERP -959901 sc-eQTL 7.55e-01 -0.0311 0.0996 0.122 B_Naive2 L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 -719696 sc-eQTL 2.83e-01 0.107 0.0993 0.122 B_Naive2 L2
ENSG00000197442 MAP3K5 355041 sc-eQTL 3.13e-01 0.107 0.106 0.122 B_Naive2 L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 -720715 sc-eQTL 1.66e-01 0.178 0.128 0.122 B_Naive2 L2
ENSG00000027697 IFNGR1 -71931 sc-eQTL 8.96e-01 -0.0157 0.12 0.12 CD4_CTL L2
ENSG00000029363 BCLAF1 857667 sc-eQTL 9.92e-01 -0.00106 0.106 0.12 CD4_CTL L2
ENSG00000112357 PEX7 324954 sc-eQTL 3.41e-01 0.127 0.133 0.12 CD4_CTL L2
ENSG00000112378 PERP -959901 sc-eQTL 3.13e-01 -0.136 0.135 0.12 CD4_CTL L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 -719696 sc-eQTL 9.71e-02 0.13 0.0781 0.12 CD4_CTL L2
ENSG00000197442 MAP3K5 355041 sc-eQTL 3.35e-01 -0.121 0.125 0.12 CD4_CTL L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 -720715 sc-eQTL 1.89e-01 0.161 0.122 0.12 CD4_CTL L2
ENSG00000027697 IFNGR1 -71931 sc-eQTL 8.73e-01 -0.0102 0.0638 0.124 CD4_Naive L2
ENSG00000029363 BCLAF1 857667 sc-eQTL 5.16e-01 0.0333 0.0512 0.124 CD4_Naive L2
ENSG00000112357 PEX7 324954 sc-eQTL 3.22e-02 -0.257 0.119 0.124 CD4_Naive L2
ENSG00000112378 PERP -959901 sc-eQTL 9.65e-01 -0.00431 0.0994 0.124 CD4_Naive L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 -719696 sc-eQTL 6.54e-01 -0.0313 0.0697 0.124 CD4_Naive L2
ENSG00000197442 MAP3K5 355041 sc-eQTL 6.93e-01 0.0202 0.0512 0.124 CD4_Naive L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 -720715 sc-eQTL 8.13e-03 0.237 0.0889 0.124 CD4_Naive L2
ENSG00000027697 IFNGR1 -71931 sc-eQTL 1.34e-01 -0.137 0.0912 0.124 CD4_TCM L2
ENSG00000029363 BCLAF1 857667 sc-eQTL 3.85e-01 0.0503 0.0578 0.124 CD4_TCM L2
ENSG00000112357 PEX7 324954 sc-eQTL 8.98e-01 0.0173 0.135 0.124 CD4_TCM L2
ENSG00000112378 PERP -959901 sc-eQTL 6.41e-01 -0.0532 0.114 0.124 CD4_TCM L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 -719696 sc-eQTL 6.52e-01 0.0299 0.066 0.124 CD4_TCM L2
ENSG00000197442 MAP3K5 355041 sc-eQTL 9.34e-01 0.00625 0.0753 0.124 CD4_TCM L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 -720715 sc-eQTL 7.61e-02 0.164 0.0919 0.124 CD4_TCM L2
ENSG00000027697 IFNGR1 -71931 sc-eQTL 3.99e-01 -0.085 0.101 0.124 CD4_TEM L2
ENSG00000029363 BCLAF1 857667 sc-eQTL 6.86e-02 0.13 0.0709 0.124 CD4_TEM L2
ENSG00000112357 PEX7 324954 sc-eQTL 3.31e-01 -0.126 0.13 0.124 CD4_TEM L2
ENSG00000112378 PERP -959901 sc-eQTL 7.05e-01 -0.04 0.105 0.124 CD4_TEM L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 -719696 sc-eQTL 6.76e-01 0.028 0.0669 0.124 CD4_TEM L2
ENSG00000197442 MAP3K5 355041 sc-eQTL 7.03e-01 0.0395 0.103 0.124 CD4_TEM L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 -720715 sc-eQTL 3.17e-01 0.107 0.107 0.124 CD4_TEM L2
ENSG00000027697 IFNGR1 -71931 sc-eQTL 1.26e-01 -0.141 0.0918 0.124 CD8_CTL L2
ENSG00000029363 BCLAF1 857667 sc-eQTL 2.07e-01 0.0777 0.0613 0.124 CD8_CTL L2
ENSG00000112357 PEX7 324954 sc-eQTL 4.64e-01 0.093 0.127 0.124 CD8_CTL L2
ENSG00000112378 PERP -959901 sc-eQTL 8.15e-01 0.0286 0.122 0.124 CD8_CTL L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 -719696 sc-eQTL 1.10e-01 0.124 0.0772 0.124 CD8_CTL L2
ENSG00000197442 MAP3K5 355041 sc-eQTL 2.80e-01 0.118 0.109 0.124 CD8_CTL L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 -720715 sc-eQTL 8.30e-01 0.0235 0.109 0.124 CD8_CTL L2
ENSG00000027697 IFNGR1 -71931 sc-eQTL 5.38e-01 -0.0564 0.0915 0.124 CD8_Naive L2
ENSG00000029363 BCLAF1 857667 sc-eQTL 4.41e-01 0.0492 0.0638 0.124 CD8_Naive L2
ENSG00000112357 PEX7 324954 sc-eQTL 5.53e-01 0.0788 0.133 0.124 CD8_Naive L2
ENSG00000112378 PERP -959901 sc-eQTL 7.86e-01 -0.0273 0.101 0.124 CD8_Naive L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 -719696 sc-eQTL 4.32e-01 -0.0563 0.0715 0.124 CD8_Naive L2
ENSG00000197442 MAP3K5 355041 sc-eQTL 1.59e-03 0.265 0.0828 0.124 CD8_Naive L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 -720715 sc-eQTL 9.71e-01 -0.00385 0.106 0.124 CD8_Naive L2
ENSG00000027697 IFNGR1 -71931 sc-eQTL 3.65e-01 -0.111 0.122 0.116 CD8_TCM L2
ENSG00000029363 BCLAF1 857667 sc-eQTL 1.54e-02 0.221 0.0906 0.116 CD8_TCM L2
ENSG00000112357 PEX7 324954 sc-eQTL 5.74e-01 0.0791 0.14 0.116 CD8_TCM L2
ENSG00000112378 PERP -959901 sc-eQTL 8.44e-01 -0.0271 0.138 0.116 CD8_TCM L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 -719696 sc-eQTL 1.25e-01 0.102 0.066 0.116 CD8_TCM L2
ENSG00000197442 MAP3K5 355041 sc-eQTL 7.54e-01 0.0372 0.119 0.116 CD8_TCM L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 -720715 sc-eQTL 7.48e-01 -0.0392 0.121 0.116 CD8_TCM L2
ENSG00000027697 IFNGR1 -71931 sc-eQTL 5.90e-01 -0.0607 0.112 0.123 CD8_TEM L2
ENSG00000029363 BCLAF1 857667 sc-eQTL 1.70e-01 0.145 0.106 0.123 CD8_TEM L2
ENSG00000112357 PEX7 324954 sc-eQTL 6.50e-01 -0.0588 0.129 0.123 CD8_TEM L2
ENSG00000112378 PERP -959901 sc-eQTL 2.98e-01 -0.14 0.134 0.123 CD8_TEM L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 -719696 sc-eQTL 9.13e-01 0.00912 0.0829 0.123 CD8_TEM L2
ENSG00000197442 MAP3K5 355041 sc-eQTL 2.40e-01 0.151 0.128 0.123 CD8_TEM L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 -720715 sc-eQTL 8.01e-01 -0.031 0.123 0.123 CD8_TEM L2
ENSG00000027697 IFNGR1 -71931 sc-eQTL 6.40e-01 -0.045 0.096 0.126 MAIT L2
ENSG00000029363 BCLAF1 857667 sc-eQTL 2.49e-01 0.0919 0.0796 0.126 MAIT L2
ENSG00000112357 PEX7 324954 sc-eQTL 5.49e-01 0.0781 0.13 0.126 MAIT L2
ENSG00000112378 PERP -959901 sc-eQTL 8.52e-02 -0.233 0.135 0.126 MAIT L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 -719696 sc-eQTL 9.79e-01 0.00171 0.0646 0.126 MAIT L2
ENSG00000146410 MTFR2 897183 sc-eQTL 8.47e-02 0.185 0.107 0.126 MAIT L2
ENSG00000197442 MAP3K5 355041 sc-eQTL 2.83e-01 0.121 0.112 0.126 MAIT L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 -720715 sc-eQTL 6.43e-01 0.0554 0.119 0.126 MAIT L2
ENSG00000027697 IFNGR1 -71931 sc-eQTL 2.84e-01 -0.107 0.0998 0.129 NK_CD56bright L2
ENSG00000029363 BCLAF1 857667 sc-eQTL 1.97e-01 0.0953 0.0736 0.129 NK_CD56bright L2
ENSG00000112357 PEX7 324954 sc-eQTL 9.95e-01 0.000868 0.13 0.129 NK_CD56bright L2
ENSG00000112378 PERP -959901 sc-eQTL 7.97e-01 0.0301 0.117 0.129 NK_CD56bright L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 -719696 sc-eQTL 8.38e-01 0.0153 0.0745 0.129 NK_CD56bright L2
ENSG00000197442 MAP3K5 355041 sc-eQTL 6.81e-02 0.206 0.112 0.129 NK_CD56bright L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 -720715 sc-eQTL 9.71e-02 0.197 0.118 0.129 NK_CD56bright L2
ENSG00000027697 IFNGR1 -71931 sc-eQTL 2.94e-02 -0.17 0.0777 0.125 NK_CD56dim L2
ENSG00000029363 BCLAF1 857667 sc-eQTL 5.59e-01 -0.03 0.0513 0.125 NK_CD56dim L2
ENSG00000112357 PEX7 324954 sc-eQTL 4.76e-01 0.0965 0.135 0.125 NK_CD56dim L2
ENSG00000112378 PERP -959901 sc-eQTL 8.51e-01 0.0179 0.0951 0.125 NK_CD56dim L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 -719696 sc-eQTL 3.18e-01 0.0739 0.0738 0.125 NK_CD56dim L2
ENSG00000197442 MAP3K5 355041 sc-eQTL 4.55e-01 0.0795 0.106 0.125 NK_CD56dim L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 -720715 sc-eQTL 9.62e-01 0.0053 0.111 0.125 NK_CD56dim L2
ENSG00000027697 IFNGR1 -71931 sc-eQTL 4.29e-02 -0.202 0.0991 0.13 NK_HLA L2
ENSG00000029363 BCLAF1 857667 sc-eQTL 8.68e-01 0.0141 0.0848 0.13 NK_HLA L2
ENSG00000112357 PEX7 324954 sc-eQTL 5.95e-02 -0.239 0.126 0.13 NK_HLA L2
ENSG00000112378 PERP -959901 sc-eQTL 2.47e-01 0.119 0.103 0.13 NK_HLA L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 -719696 sc-eQTL 8.81e-01 -0.0119 0.0794 0.13 NK_HLA L2
ENSG00000197442 MAP3K5 355041 sc-eQTL 6.12e-01 0.0642 0.126 0.13 NK_HLA L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 -720715 sc-eQTL 7.00e-01 0.0493 0.128 0.13 NK_HLA L2
ENSG00000027697 IFNGR1 -71931 sc-eQTL 1.87e-01 -0.109 0.0826 0.125 NK_cytokine L2
ENSG00000029363 BCLAF1 857667 sc-eQTL 5.51e-01 -0.0369 0.0619 0.125 NK_cytokine L2
ENSG00000112357 PEX7 324954 sc-eQTL 5.94e-01 0.0695 0.13 0.125 NK_cytokine L2
ENSG00000112378 PERP -959901 sc-eQTL 3.69e-01 0.0888 0.0986 0.125 NK_cytokine L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 -719696 sc-eQTL 2.73e-01 0.0811 0.0738 0.125 NK_cytokine L2
ENSG00000197442 MAP3K5 355041 sc-eQTL 3.58e-01 0.0936 0.102 0.125 NK_cytokine L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 -720715 sc-eQTL 5.07e-02 0.217 0.111 0.125 NK_cytokine L2
ENSG00000027697 IFNGR1 -71931 sc-eQTL 8.02e-01 -0.0392 0.156 0.122 PB L2
ENSG00000029363 BCLAF1 857667 sc-eQTL 2.13e-01 -0.167 0.134 0.122 PB L2
ENSG00000112357 PEX7 324954 sc-eQTL 9.05e-01 -0.0191 0.16 0.122 PB L2
ENSG00000112378 PERP -959901 sc-eQTL 2.76e-01 -0.109 0.0995 0.122 PB L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 -719696 sc-eQTL 2.96e-01 0.127 0.121 0.122 PB L2
ENSG00000197442 MAP3K5 355041 sc-eQTL 4.09e-01 -0.114 0.138 0.122 PB L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 -720715 sc-eQTL 1.72e-01 -0.199 0.145 0.122 PB L2
ENSG00000027697 IFNGR1 -71931 sc-eQTL 8.23e-01 0.0228 0.102 0.126 Pro_T L2
ENSG00000029363 BCLAF1 857667 sc-eQTL 9.40e-01 -0.00793 0.105 0.126 Pro_T L2
ENSG00000112357 PEX7 324954 sc-eQTL 9.67e-01 -0.00515 0.123 0.126 Pro_T L2
ENSG00000112378 PERP -959901 sc-eQTL 7.00e-01 0.0379 0.0982 0.126 Pro_T L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 -719696 sc-eQTL 7.33e-02 0.111 0.0614 0.126 Pro_T L2
ENSG00000146410 MTFR2 897183 sc-eQTL 2.47e-01 -0.0994 0.0855 0.126 Pro_T L2
ENSG00000197442 MAP3K5 355041 sc-eQTL 8.01e-01 0.0303 0.12 0.126 Pro_T L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 -720715 sc-eQTL 4.23e-01 -0.0964 0.12 0.126 Pro_T L2
ENSG00000027697 IFNGR1 -71931 sc-eQTL 8.07e-01 -0.0288 0.118 0.124 Treg L2
ENSG00000029363 BCLAF1 857667 sc-eQTL 9.94e-03 0.195 0.0751 0.124 Treg L2
ENSG00000112357 PEX7 324954 sc-eQTL 4.46e-02 -0.25 0.124 0.124 Treg L2
ENSG00000112378 PERP -959901 sc-eQTL 4.65e-01 -0.0987 0.135 0.124 Treg L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 -719696 sc-eQTL 4.21e-01 0.0605 0.075 0.124 Treg L2
ENSG00000197442 MAP3K5 355041 sc-eQTL 9.38e-01 -0.00629 0.0814 0.124 Treg L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 -720715 sc-eQTL 3.36e-01 0.11 0.114 0.124 Treg L2
ENSG00000027697 IFNGR1 -71931 sc-eQTL 9.95e-02 0.172 0.104 0.124 cDC L2
ENSG00000029363 BCLAF1 857667 sc-eQTL 7.11e-01 -0.0392 0.106 0.124 cDC L2
ENSG00000112357 PEX7 324954 sc-eQTL 8.80e-01 0.0206 0.136 0.124 cDC L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 -719696 sc-eQTL 2.06e-01 0.131 0.103 0.124 cDC L2
ENSG00000135525 MAP7 596699 sc-eQTL 4.43e-01 -0.0929 0.121 0.124 cDC L2
ENSG00000197442 MAP3K5 355041 sc-eQTL 6.06e-02 -0.199 0.105 0.124 cDC L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 -720715 sc-eQTL 3.80e-02 -0.278 0.133 0.124 cDC L2
ENSG00000286646 AL121933.2 363473 sc-eQTL 9.37e-01 -0.011 0.139 0.124 cDC L2
ENSG00000027697 IFNGR1 -71931 sc-eQTL 6.89e-06 -0.323 0.0699 0.124 cMono_IL1B L2
ENSG00000029363 BCLAF1 857667 sc-eQTL 6.15e-01 0.0396 0.0786 0.124 cMono_IL1B L2
ENSG00000112357 PEX7 324954 sc-eQTL 3.75e-01 -0.117 0.132 0.124 cMono_IL1B L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 -719696 sc-eQTL 4.00e-01 0.0665 0.0788 0.124 cMono_IL1B L2
ENSG00000135525 MAP7 596699 sc-eQTL 2.07e-01 -0.143 0.113 0.124 cMono_IL1B L2
ENSG00000197442 MAP3K5 355041 sc-eQTL 5.29e-01 -0.0517 0.082 0.124 cMono_IL1B L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 -720715 sc-eQTL 3.16e-01 0.0845 0.0841 0.124 cMono_IL1B L2
ENSG00000286646 AL121933.2 363473 sc-eQTL 1.76e-02 -0.249 0.104 0.124 cMono_IL1B L2
ENSG00000027697 IFNGR1 -71931 sc-eQTL 2.17e-02 -0.192 0.0829 0.124 cMono_S100A L2
ENSG00000029363 BCLAF1 857667 sc-eQTL 1.96e-01 -0.111 0.0859 0.124 cMono_S100A L2
ENSG00000112357 PEX7 324954 sc-eQTL 3.98e-02 -0.276 0.133 0.124 cMono_S100A L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 -719696 sc-eQTL 6.99e-01 0.0289 0.0745 0.124 cMono_S100A L2
ENSG00000135525 MAP7 596699 sc-eQTL 6.47e-01 -0.0575 0.125 0.124 cMono_S100A L2
ENSG00000197442 MAP3K5 355041 sc-eQTL 1.17e-01 0.159 0.101 0.124 cMono_S100A L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 -720715 sc-eQTL 5.62e-02 0.204 0.106 0.124 cMono_S100A L2
ENSG00000286646 AL121933.2 363473 sc-eQTL 1.30e-01 0.158 0.104 0.124 cMono_S100A L2
ENSG00000027697 IFNGR1 -71931 sc-eQTL 3.43e-01 -0.122 0.129 0.121 gdT L2
ENSG00000029363 BCLAF1 857667 sc-eQTL 9.89e-02 -0.187 0.113 0.121 gdT L2
ENSG00000112357 PEX7 324954 sc-eQTL 6.67e-01 -0.0707 0.164 0.121 gdT L2
ENSG00000112378 PERP -959901 sc-eQTL 3.04e-01 -0.147 0.143 0.121 gdT L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 -719696 sc-eQTL 6.36e-02 0.147 0.0786 0.121 gdT L2
ENSG00000146410 MTFR2 897183 sc-eQTL 8.81e-01 0.0188 0.125 0.121 gdT L2
ENSG00000197442 MAP3K5 355041 sc-eQTL 1.17e-01 0.263 0.167 0.121 gdT L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 -720715 sc-eQTL 7.72e-01 0.0419 0.144 0.121 gdT L2
ENSG00000027697 IFNGR1 -71931 sc-eQTL 1.31e-02 -0.219 0.0875 0.129 intMono L2
ENSG00000029363 BCLAF1 857667 sc-eQTL 7.06e-01 -0.0443 0.117 0.129 intMono L2
ENSG00000112357 PEX7 324954 sc-eQTL 1.16e-01 -0.188 0.119 0.129 intMono L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 -719696 sc-eQTL 9.54e-02 0.128 0.0762 0.129 intMono L2
ENSG00000135525 MAP7 596699 sc-eQTL 5.59e-01 0.069 0.118 0.129 intMono L2
ENSG00000197442 MAP3K5 355041 sc-eQTL 4.34e-01 0.0977 0.125 0.129 intMono L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 -720715 sc-eQTL 7.62e-01 -0.0346 0.114 0.129 intMono L2
ENSG00000286646 AL121933.2 363473 sc-eQTL 8.28e-01 -0.0288 0.132 0.129 intMono L2
ENSG00000027697 IFNGR1 -71931 sc-eQTL 4.30e-03 -0.301 0.104 0.124 ncMono L2
ENSG00000029363 BCLAF1 857667 sc-eQTL 8.01e-01 0.0208 0.0825 0.124 ncMono L2
ENSG00000112357 PEX7 324954 sc-eQTL 8.75e-01 -0.0207 0.132 0.124 ncMono L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 -719696 sc-eQTL 8.69e-01 -0.0155 0.094 0.124 ncMono L2
ENSG00000135525 MAP7 596699 sc-eQTL 5.71e-01 0.0659 0.116 0.124 ncMono L2
ENSG00000197442 MAP3K5 355041 sc-eQTL 7.83e-01 0.0337 0.122 0.124 ncMono L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 -720715 sc-eQTL 3.45e-01 -0.111 0.117 0.124 ncMono L2
ENSG00000286646 AL121933.2 363473 sc-eQTL 9.63e-01 0.00568 0.124 0.124 ncMono L2
ENSG00000027697 IFNGR1 -71931 sc-eQTL 8.04e-01 -0.0304 0.122 0.119 pDC L2
ENSG00000029363 BCLAF1 857667 sc-eQTL 2.20e-01 0.112 0.0912 0.119 pDC L2
ENSG00000112357 PEX7 324954 sc-eQTL 7.30e-01 0.0464 0.134 0.119 pDC L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 -719696 sc-eQTL 4.36e-01 0.0884 0.113 0.119 pDC L2
ENSG00000135525 MAP7 596699 sc-eQTL 9.86e-01 -0.00161 0.0939 0.119 pDC L2
ENSG00000197442 MAP3K5 355041 sc-eQTL 8.99e-01 0.0192 0.15 0.119 pDC L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 -720715 sc-eQTL 4.56e-01 -0.0858 0.115 0.119 pDC L2
ENSG00000286646 AL121933.2 363473 sc-eQTL 3.50e-01 0.13 0.138 0.119 pDC L2
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000027697 IFNGR1 -71931 sc-eQTL 7.29e-01 -0.0368 0.106 0.124 B_Memory LOneK1K
ENSG00000029363 BCLAF1 857667 sc-eQTL 8.28e-01 -0.013 0.0596 0.124 B_Memory LOneK1K
ENSG00000112357 PEX7 324954 sc-eQTL 1.73e-03 0.378 0.119 0.124 B_Memory LOneK1K
ENSG00000112378 PERP -959901 sc-eQTL 6.29e-02 0.21 0.113 0.124 B_Memory LOneK1K
ENSG00000118503 TNFAIP3 -719696 sc-eQTL 6.19e-01 0.0373 0.0748 0.124 B_Memory LOneK1K
ENSG00000197442 MAP3K5 355041 sc-eQTL 3.14e-01 0.0998 0.0989 0.124 B_Memory LOneK1K
ENSG00000237499 WAKMAR2 -720715 sc-eQTL 4.64e-02 0.251 0.125 0.124 B_Memory LOneK1K
ENSG00000027697 IFNGR1 -71931 sc-eQTL 6.60e-01 -0.0481 0.109 0.124 B_Naive LOneK1K
ENSG00000029363 BCLAF1 857667 sc-eQTL 6.45e-01 0.0232 0.0502 0.124 B_Naive LOneK1K
ENSG00000112357 PEX7 324954 sc-eQTL 6.47e-01 -0.0611 0.133 0.124 B_Naive LOneK1K
ENSG00000112378 PERP -959901 sc-eQTL 4.01e-01 -0.1 0.119 0.124 B_Naive LOneK1K
ENSG00000118503 TNFAIP3 -719696 sc-eQTL 1.24e-01 0.0962 0.0623 0.124 B_Naive LOneK1K
ENSG00000197442 MAP3K5 355041 sc-eQTL 8.19e-01 0.0211 0.0918 0.124 B_Naive LOneK1K
ENSG00000237499 WAKMAR2 -720715 sc-eQTL 2.47e-02 0.249 0.11 0.124 B_Naive LOneK1K
ENSG00000027697 IFNGR1 -71931 sc-eQTL 2.63e-05 -0.305 0.0709 0.124 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000029363 BCLAF1 857667 sc-eQTL 8.33e-01 -0.0145 0.0688 0.124 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000112357 PEX7 324954 sc-eQTL 1.45e-01 -0.193 0.132 0.124 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000118503 TNFAIP3 -719696 sc-eQTL 6.40e-01 0.032 0.0684 0.124 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000135525 MAP7 596699 sc-eQTL 1.93e-01 -0.154 0.118 0.124 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000197442 MAP3K5 355041 sc-eQTL 9.75e-01 -0.00254 0.0801 0.124 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000237499 WAKMAR2 -720715 sc-eQTL 1.99e-01 0.105 0.0816 0.124 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000286646 AL121933.2 363473 sc-eQTL 6.65e-01 -0.0413 0.0953 0.124 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000027697 IFNGR1 -71931 sc-eQTL 1.22e-04 -0.328 0.0836 0.125 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000029363 BCLAF1 857667 sc-eQTL 9.58e-01 -0.00409 0.0783 0.125 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000112357 PEX7 324954 sc-eQTL 5.23e-01 -0.0837 0.131 0.125 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000118503 TNFAIP3 -719696 sc-eQTL 4.71e-01 0.0584 0.0809 0.125 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000135525 MAP7 596699 sc-eQTL 7.18e-01 0.0457 0.126 0.125 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000197442 MAP3K5 355041 sc-eQTL 9.18e-01 0.0107 0.104 0.125 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000237499 WAKMAR2 -720715 sc-eQTL 4.03e-01 -0.0908 0.108 0.125 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000286646 AL121933.2 363473 sc-eQTL 6.74e-01 -0.0519 0.123 0.125 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000027697 IFNGR1 -71931 sc-eQTL 1.35e-01 -0.121 0.0803 0.125 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000029363 BCLAF1 857667 sc-eQTL 8.41e-01 -0.0094 0.0469 0.125 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000112357 PEX7 324954 sc-eQTL 7.90e-01 0.0362 0.136 0.125 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000112378 PERP -959901 sc-eQTL 1.63e-01 0.118 0.0841 0.125 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000118503 TNFAIP3 -719696 sc-eQTL 3.21e-01 0.0731 0.0734 0.125 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000197442 MAP3K5 355041 sc-eQTL 3.54e-01 0.0922 0.0992 0.125 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000237499 WAKMAR2 -720715 sc-eQTL 3.59e-01 0.0944 0.103 0.125 NK_CD56dim LOneK1K

Statistical fine-mapping results from Japan COVID-19 Task Force
(Shown only for PIP>0.001)
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
PIP (SuSiE)
PIP (FINEMAP)
MAF
ENSG00000027697 IFNGR1 -71931 pQTL 1.39e-05 -0.0996 0.0228 0.0 0.0 0.133
ENSG00000027697 IFNGR1 -71931 eQTL 2.02e-09 -0.117 0.0193 0.0 0.0 0.134

Expression Modifier Score(EMS) for GTEx 49tissues
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Whole Blood
Muscle Skeletal
Liver
Brain Cerebellum
Prostate
Spleen
Skin Sun Exposed Lower leg
Artery Coronary
Esophagus Muscularis
Esophagus Gastroesophageal Junction
Artery Tibial
Heart Atrial Appendage
Nerve Tibial
Heart Left Ventricle
Adrenal Gland
Adipose Visceral Omentum
Pancreas
Lung
Pituitary
Brain Nucleus accumbens basal ganglia
Colon Transverse
Adipose Subcutaneous
Esophagus Mucosa
Brain Cortex
Thyroid
Stomach
Breast Mammary Tissue
Colon Sigmoid
Skin Not Sun Exposed Suprapubic
Testis
Artery Aorta
Brain Amygdala
Brain Anterior cingulate cortex BA24
Brain Caudate basal ganglia
Brain Cerebellar Hemisphere
Brain Frontal Cortex BA9
Brain Hippocampus
Brain Hypothalamus
Brain Putamen basal ganglia
Brain Spinal cord cervical c-1
Brain Substantia nigra
Cells Cultured fibroblasts
Cells EBV-transformed lymphocytes
Kidney Cortex
Minor Salivary Gland
Ovary
Small Intestine Terminal Ileum
Uterus
Vagina
ENSG00000027697 IFNGR1 -71931 8.08e-06 9.78e-06 1.3e-06 5.25e-06 2.44e-06 4.22e-06 1.03e-05 1.76e-06 8.84e-06 5.12e-06 1.19e-05 5.26e-06 1.34e-05 3.77e-06 2.6e-06 6.61e-06 4.55e-06 6.85e-06 2.58e-06 2.86e-06 5.05e-06 9.17e-06 7.37e-06 3.2e-06 1.43e-05 3.75e-06 4.87e-06 3.96e-06 9.57e-06 8.64e-06 5.38e-06 9.99e-07 1.12e-06 2.99e-06 4.27e-06 2.66e-06 1.86e-06 2.02e-06 2.16e-06 1.03e-06 9.92e-07 1.18e-05 1.46e-06 1.95e-07 6.84e-07 1.63e-06 1.3e-06 6.68e-07 4.15e-07