logo

Genes within 1Mb (chr6:137146995:C:CA):

View on , UCSC , GTEx , gnomAD

Immune cell-type specific single cell cis-eQTLs in OASIS
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000027697 IFNGR1 -72454 sc-eQTL 7.49e-03 -0.274 0.101 0.135 B L1
ENSG00000029363 BCLAF1 857144 sc-eQTL 4.93e-01 0.0315 0.0459 0.135 B L1
ENSG00000112357 PEX7 324431 sc-eQTL 4.70e-01 -0.0883 0.122 0.135 B L1
ENSG00000112378 PERP -960424 sc-eQTL 7.56e-01 -0.0252 0.0808 0.135 B L1
ENSG00000118503 TNFAIP3 -720219 sc-eQTL 7.78e-01 -0.0184 0.0651 0.135 B L1
ENSG00000197442 MAP3K5 354518 sc-eQTL 2.94e-01 0.0953 0.0905 0.135 B L1
ENSG00000237499 WAKMAR2 -721238 sc-eQTL 7.31e-01 0.0353 0.102 0.135 B L1
ENSG00000027697 IFNGR1 -72454 sc-eQTL 3.19e-01 -0.068 0.0681 0.135 CD4T L1
ENSG00000029363 BCLAF1 857144 sc-eQTL 8.37e-01 0.0106 0.0516 0.135 CD4T L1
ENSG00000112357 PEX7 324431 sc-eQTL 9.78e-01 -0.00304 0.11 0.135 CD4T L1
ENSG00000112378 PERP -960424 sc-eQTL 5.07e-01 -0.049 0.0737 0.135 CD4T L1
ENSG00000118503 TNFAIP3 -720219 sc-eQTL 8.02e-01 -0.0174 0.0691 0.135 CD4T L1
ENSG00000197442 MAP3K5 354518 sc-eQTL 3.46e-02 -0.111 0.0521 0.135 CD4T L1
ENSG00000237499 WAKMAR2 -721238 sc-eQTL 8.26e-04 -0.288 0.0848 0.135 CD4T L1
ENSG00000027697 IFNGR1 -72454 sc-eQTL 7.19e-01 0.0278 0.0772 0.135 CD8T L1
ENSG00000029363 BCLAF1 857144 sc-eQTL 3.96e-01 0.0443 0.0522 0.135 CD8T L1
ENSG00000112357 PEX7 324431 sc-eQTL 2.07e-01 0.162 0.128 0.135 CD8T L1
ENSG00000112378 PERP -960424 sc-eQTL 9.59e-01 -0.00438 0.0842 0.135 CD8T L1
ENSG00000118503 TNFAIP3 -720219 sc-eQTL 6.62e-01 0.0284 0.065 0.135 CD8T L1
ENSG00000197442 MAP3K5 354518 sc-eQTL 4.13e-01 -0.0563 0.0686 0.135 CD8T L1
ENSG00000237499 WAKMAR2 -721238 sc-eQTL 1.58e-01 -0.135 0.095 0.135 CD8T L1
ENSG00000027697 IFNGR1 -72454 sc-eQTL 1.83e-01 0.125 0.0938 0.137 DC L1
ENSG00000029363 BCLAF1 857144 sc-eQTL 8.25e-01 0.0187 0.0847 0.137 DC L1
ENSG00000112357 PEX7 324431 sc-eQTL 3.76e-02 -0.275 0.131 0.137 DC L1
ENSG00000118503 TNFAIP3 -720219 sc-eQTL 8.84e-01 -0.0148 0.101 0.137 DC L1
ENSG00000135525 MAP7 596176 sc-eQTL 7.25e-01 -0.0384 0.109 0.137 DC L1
ENSG00000197442 MAP3K5 354518 sc-eQTL 2.62e-01 0.117 0.104 0.137 DC L1
ENSG00000237499 WAKMAR2 -721238 sc-eQTL 7.51e-01 -0.0326 0.103 0.137 DC L1
ENSG00000286646 AL121933.2 362950 sc-eQTL 9.05e-02 -0.23 0.135 0.137 DC L1
ENSG00000027697 IFNGR1 -72454 sc-eQTL 2.59e-02 -0.174 0.0778 0.135 Mono L1
ENSG00000029363 BCLAF1 857144 sc-eQTL 2.49e-01 0.0776 0.0671 0.135 Mono L1
ENSG00000112357 PEX7 324431 sc-eQTL 6.05e-01 -0.0685 0.132 0.135 Mono L1
ENSG00000118503 TNFAIP3 -720219 sc-eQTL 6.39e-01 -0.0314 0.0667 0.135 Mono L1
ENSG00000135525 MAP7 596176 sc-eQTL 5.93e-01 -0.0625 0.117 0.135 Mono L1
ENSG00000197442 MAP3K5 354518 sc-eQTL 9.03e-02 -0.132 0.0774 0.135 Mono L1
ENSG00000237499 WAKMAR2 -721238 sc-eQTL 9.15e-01 0.00888 0.0827 0.135 Mono L1
ENSG00000286646 AL121933.2 362950 sc-eQTL 2.48e-01 0.109 0.0941 0.135 Mono L1
ENSG00000027697 IFNGR1 -72454 sc-eQTL 8.70e-01 -0.0145 0.0886 0.135 NK L1
ENSG00000029363 BCLAF1 857144 sc-eQTL 5.32e-01 -0.0294 0.047 0.135 NK L1
ENSG00000112357 PEX7 324431 sc-eQTL 6.99e-01 0.0528 0.137 0.135 NK L1
ENSG00000112378 PERP -960424 sc-eQTL 7.63e-01 -0.026 0.0861 0.135 NK L1
ENSG00000118503 TNFAIP3 -720219 sc-eQTL 4.04e-01 -0.0615 0.0736 0.135 NK L1
ENSG00000197442 MAP3K5 354518 sc-eQTL 8.61e-01 0.0185 0.106 0.135 NK L1
ENSG00000237499 WAKMAR2 -721238 sc-eQTL 2.81e-01 -0.113 0.104 0.135 NK L1
ENSG00000027697 IFNGR1 -72454 sc-eQTL 9.62e-01 0.00392 0.0814 0.135 Other_T L1
ENSG00000029363 BCLAF1 857144 sc-eQTL 6.20e-01 -0.0339 0.0682 0.135 Other_T L1
ENSG00000112357 PEX7 324431 sc-eQTL 8.58e-01 -0.0238 0.133 0.135 Other_T L1
ENSG00000112378 PERP -960424 sc-eQTL 6.88e-01 0.0428 0.106 0.135 Other_T L1
ENSG00000118503 TNFAIP3 -720219 sc-eQTL 7.85e-01 0.0139 0.0507 0.135 Other_T L1
ENSG00000146410 MTFR2 896660 sc-eQTL 7.00e-01 0.0296 0.0767 0.135 Other_T L1
ENSG00000197442 MAP3K5 354518 sc-eQTL 5.01e-01 -0.0659 0.0977 0.135 Other_T L1
ENSG00000237499 WAKMAR2 -721238 sc-eQTL 5.89e-01 0.0544 0.1 0.135 Other_T L1
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000027697 IFNGR1 -72454 sc-eQTL 6.66e-01 -0.0586 0.136 0.143 B_Activated L2
ENSG00000029363 BCLAF1 857144 sc-eQTL 8.32e-02 0.191 0.109 0.143 B_Activated L2
ENSG00000112357 PEX7 324431 sc-eQTL 4.39e-01 0.104 0.133 0.143 B_Activated L2
ENSG00000112378 PERP -960424 sc-eQTL 7.33e-01 -0.0236 0.0691 0.143 B_Activated L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 -720219 sc-eQTL 7.07e-02 0.242 0.133 0.143 B_Activated L2
ENSG00000197442 MAP3K5 354518 sc-eQTL 7.29e-01 -0.052 0.15 0.143 B_Activated L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 -721238 sc-eQTL 2.89e-01 0.124 0.117 0.143 B_Activated L2
ENSG00000027697 IFNGR1 -72454 sc-eQTL 8.07e-01 0.0294 0.12 0.135 B_Intermediate L2
ENSG00000029363 BCLAF1 857144 sc-eQTL 8.63e-01 -0.0119 0.0685 0.135 B_Intermediate L2
ENSG00000112357 PEX7 324431 sc-eQTL 2.14e-01 0.156 0.126 0.135 B_Intermediate L2
ENSG00000112378 PERP -960424 sc-eQTL 1.20e-01 -0.178 0.114 0.135 B_Intermediate L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 -720219 sc-eQTL 5.38e-01 -0.0555 0.09 0.135 B_Intermediate L2
ENSG00000197442 MAP3K5 354518 sc-eQTL 3.61e-01 -0.0995 0.109 0.135 B_Intermediate L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 -721238 sc-eQTL 1.42e-01 -0.188 0.127 0.135 B_Intermediate L2
ENSG00000027697 IFNGR1 -72454 sc-eQTL 2.60e-01 -0.151 0.134 0.136 B_Memory L2
ENSG00000029363 BCLAF1 857144 sc-eQTL 3.08e-01 0.0811 0.0794 0.136 B_Memory L2
ENSG00000112357 PEX7 324431 sc-eQTL 3.92e-01 0.116 0.135 0.136 B_Memory L2
ENSG00000112378 PERP -960424 sc-eQTL 4.23e-01 0.102 0.127 0.136 B_Memory L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 -720219 sc-eQTL 4.45e-01 -0.067 0.0875 0.136 B_Memory L2
ENSG00000197442 MAP3K5 354518 sc-eQTL 3.04e-01 0.123 0.119 0.136 B_Memory L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 -721238 sc-eQTL 7.08e-01 -0.0489 0.13 0.136 B_Memory L2
ENSG00000027697 IFNGR1 -72454 sc-eQTL 1.82e-02 -0.245 0.103 0.135 B_Naive1 L2
ENSG00000029363 BCLAF1 857144 sc-eQTL 8.75e-01 -0.00937 0.0595 0.135 B_Naive1 L2
ENSG00000112357 PEX7 324431 sc-eQTL 1.40e-01 -0.203 0.137 0.135 B_Naive1 L2
ENSG00000112378 PERP -960424 sc-eQTL 6.22e-01 -0.0593 0.12 0.135 B_Naive1 L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 -720219 sc-eQTL 5.10e-01 0.0459 0.0696 0.135 B_Naive1 L2
ENSG00000197442 MAP3K5 354518 sc-eQTL 1.06e-01 0.158 0.0974 0.135 B_Naive1 L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 -721238 sc-eQTL 9.11e-01 -0.0123 0.109 0.135 B_Naive1 L2
ENSG00000027697 IFNGR1 -72454 sc-eQTL 6.09e-02 -0.232 0.123 0.135 B_Naive2 L2
ENSG00000029363 BCLAF1 857144 sc-eQTL 3.24e-01 -0.0712 0.0719 0.135 B_Naive2 L2
ENSG00000112357 PEX7 324431 sc-eQTL 9.76e-01 -0.00405 0.136 0.135 B_Naive2 L2
ENSG00000112378 PERP -960424 sc-eQTL 6.23e-01 -0.0488 0.0991 0.135 B_Naive2 L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 -720219 sc-eQTL 4.59e-01 -0.0734 0.0989 0.135 B_Naive2 L2
ENSG00000197442 MAP3K5 354518 sc-eQTL 4.53e-01 -0.0791 0.105 0.135 B_Naive2 L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 -721238 sc-eQTL 9.84e-01 0.00261 0.128 0.135 B_Naive2 L2
ENSG00000027697 IFNGR1 -72454 sc-eQTL 8.47e-01 -0.023 0.119 0.134 CD4_CTL L2
ENSG00000029363 BCLAF1 857144 sc-eQTL 9.72e-01 -0.00366 0.105 0.134 CD4_CTL L2
ENSG00000112357 PEX7 324431 sc-eQTL 6.67e-01 -0.0567 0.132 0.134 CD4_CTL L2
ENSG00000112378 PERP -960424 sc-eQTL 3.24e-01 0.132 0.133 0.134 CD4_CTL L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 -720219 sc-eQTL 1.98e-01 0.1 0.0776 0.134 CD4_CTL L2
ENSG00000197442 MAP3K5 354518 sc-eQTL 4.98e-01 0.0843 0.124 0.134 CD4_CTL L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 -721238 sc-eQTL 8.49e-01 -0.0231 0.121 0.134 CD4_CTL L2
ENSG00000027697 IFNGR1 -72454 sc-eQTL 1.67e-01 -0.089 0.0641 0.135 CD4_Naive L2
ENSG00000029363 BCLAF1 857144 sc-eQTL 9.38e-01 -0.004 0.0517 0.135 CD4_Naive L2
ENSG00000112357 PEX7 324431 sc-eQTL 2.14e-01 0.151 0.121 0.135 CD4_Naive L2
ENSG00000112378 PERP -960424 sc-eQTL 8.91e-01 0.0137 0.1 0.135 CD4_Naive L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 -720219 sc-eQTL 8.35e-01 -0.0147 0.0704 0.135 CD4_Naive L2
ENSG00000197442 MAP3K5 354518 sc-eQTL 1.32e-02 -0.127 0.0509 0.135 CD4_Naive L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 -721238 sc-eQTL 3.94e-04 -0.319 0.0885 0.135 CD4_Naive L2
ENSG00000027697 IFNGR1 -72454 sc-eQTL 7.20e-01 -0.0322 0.0897 0.135 CD4_TCM L2
ENSG00000029363 BCLAF1 857144 sc-eQTL 2.72e-01 0.0622 0.0565 0.135 CD4_TCM L2
ENSG00000112357 PEX7 324431 sc-eQTL 6.93e-01 -0.0521 0.132 0.135 CD4_TCM L2
ENSG00000112378 PERP -960424 sc-eQTL 9.28e-01 0.0101 0.111 0.135 CD4_TCM L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 -720219 sc-eQTL 9.43e-01 -0.00464 0.0647 0.135 CD4_TCM L2
ENSG00000197442 MAP3K5 354518 sc-eQTL 2.28e-01 -0.0888 0.0734 0.135 CD4_TCM L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 -721238 sc-eQTL 6.19e-01 -0.0451 0.0905 0.135 CD4_TCM L2
ENSG00000027697 IFNGR1 -72454 sc-eQTL 1.86e-01 -0.135 0.102 0.135 CD4_TEM L2
ENSG00000029363 BCLAF1 857144 sc-eQTL 5.92e-01 -0.0389 0.0725 0.135 CD4_TEM L2
ENSG00000112357 PEX7 324431 sc-eQTL 7.09e-01 -0.0494 0.132 0.135 CD4_TEM L2
ENSG00000112378 PERP -960424 sc-eQTL 1.03e-02 -0.273 0.105 0.135 CD4_TEM L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 -720219 sc-eQTL 6.27e-01 -0.0331 0.0679 0.135 CD4_TEM L2
ENSG00000197442 MAP3K5 354518 sc-eQTL 9.60e-01 -0.00527 0.105 0.135 CD4_TEM L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 -721238 sc-eQTL 1.05e-01 -0.176 0.108 0.135 CD4_TEM L2
ENSG00000027697 IFNGR1 -72454 sc-eQTL 2.46e-01 0.108 0.0929 0.135 CD8_CTL L2
ENSG00000029363 BCLAF1 857144 sc-eQTL 7.78e-01 0.0176 0.0621 0.135 CD8_CTL L2
ENSG00000112357 PEX7 324431 sc-eQTL 1.35e-01 0.191 0.128 0.135 CD8_CTL L2
ENSG00000112378 PERP -960424 sc-eQTL 4.33e-01 0.0967 0.123 0.135 CD8_CTL L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 -720219 sc-eQTL 3.96e-01 0.0666 0.0783 0.135 CD8_CTL L2
ENSG00000197442 MAP3K5 354518 sc-eQTL 1.45e-01 -0.161 0.11 0.135 CD8_CTL L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 -721238 sc-eQTL 8.55e-01 -0.0202 0.11 0.135 CD8_CTL L2
ENSG00000027697 IFNGR1 -72454 sc-eQTL 9.53e-02 -0.154 0.0916 0.135 CD8_Naive L2
ENSG00000029363 BCLAF1 857144 sc-eQTL 9.43e-01 0.00462 0.0644 0.135 CD8_Naive L2
ENSG00000112357 PEX7 324431 sc-eQTL 4.44e-01 0.102 0.133 0.135 CD8_Naive L2
ENSG00000112378 PERP -960424 sc-eQTL 5.20e-01 -0.0653 0.101 0.135 CD8_Naive L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 -720219 sc-eQTL 8.69e-01 -0.0119 0.0721 0.135 CD8_Naive L2
ENSG00000197442 MAP3K5 354518 sc-eQTL 8.28e-01 -0.0186 0.0855 0.135 CD8_Naive L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 -721238 sc-eQTL 4.65e-02 -0.211 0.106 0.135 CD8_Naive L2
ENSG00000027697 IFNGR1 -72454 sc-eQTL 7.78e-01 -0.034 0.121 0.139 CD8_TCM L2
ENSG00000029363 BCLAF1 857144 sc-eQTL 6.86e-01 0.0366 0.0905 0.139 CD8_TCM L2
ENSG00000112357 PEX7 324431 sc-eQTL 4.01e-01 0.116 0.138 0.139 CD8_TCM L2
ENSG00000112378 PERP -960424 sc-eQTL 8.68e-01 0.0226 0.136 0.139 CD8_TCM L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 -720219 sc-eQTL 9.70e-01 0.00248 0.0654 0.139 CD8_TCM L2
ENSG00000197442 MAP3K5 354518 sc-eQTL 5.90e-01 0.0629 0.117 0.139 CD8_TCM L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 -721238 sc-eQTL 4.45e-01 -0.0916 0.12 0.139 CD8_TCM L2
ENSG00000027697 IFNGR1 -72454 sc-eQTL 9.56e-01 -0.0065 0.118 0.135 CD8_TEM L2
ENSG00000029363 BCLAF1 857144 sc-eQTL 6.66e-02 0.203 0.11 0.135 CD8_TEM L2
ENSG00000112357 PEX7 324431 sc-eQTL 2.60e-01 0.153 0.135 0.135 CD8_TEM L2
ENSG00000112378 PERP -960424 sc-eQTL 4.22e-01 0.113 0.141 0.135 CD8_TEM L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 -720219 sc-eQTL 5.04e-01 0.0581 0.0868 0.135 CD8_TEM L2
ENSG00000197442 MAP3K5 354518 sc-eQTL 2.52e-01 -0.154 0.134 0.135 CD8_TEM L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 -721238 sc-eQTL 1.27e-01 -0.196 0.128 0.135 CD8_TEM L2
ENSG00000027697 IFNGR1 -72454 sc-eQTL 2.87e-01 -0.0998 0.0935 0.136 MAIT L2
ENSG00000029363 BCLAF1 857144 sc-eQTL 6.93e-01 -0.0308 0.0778 0.136 MAIT L2
ENSG00000112357 PEX7 324431 sc-eQTL 1.01e-01 -0.208 0.126 0.136 MAIT L2
ENSG00000112378 PERP -960424 sc-eQTL 8.71e-01 -0.0215 0.133 0.136 MAIT L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 -720219 sc-eQTL 9.29e-01 -0.00559 0.0631 0.136 MAIT L2
ENSG00000146410 MTFR2 896660 sc-eQTL 9.51e-01 0.00645 0.105 0.136 MAIT L2
ENSG00000197442 MAP3K5 354518 sc-eQTL 6.57e-01 -0.0489 0.11 0.136 MAIT L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 -721238 sc-eQTL 7.43e-01 -0.0383 0.117 0.136 MAIT L2
ENSG00000027697 IFNGR1 -72454 sc-eQTL 8.84e-01 -0.0151 0.104 0.133 NK_CD56bright L2
ENSG00000029363 BCLAF1 857144 sc-eQTL 1.80e-01 -0.103 0.0762 0.133 NK_CD56bright L2
ENSG00000112357 PEX7 324431 sc-eQTL 7.40e-01 0.0449 0.135 0.133 NK_CD56bright L2
ENSG00000112378 PERP -960424 sc-eQTL 4.48e-01 -0.092 0.121 0.133 NK_CD56bright L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 -720219 sc-eQTL 8.51e-01 -0.0145 0.0772 0.133 NK_CD56bright L2
ENSG00000197442 MAP3K5 354518 sc-eQTL 4.87e-01 -0.0816 0.117 0.133 NK_CD56bright L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 -721238 sc-eQTL 7.58e-01 -0.038 0.123 0.133 NK_CD56bright L2
ENSG00000027697 IFNGR1 -72454 sc-eQTL 8.07e-01 0.0197 0.0807 0.136 NK_CD56dim L2
ENSG00000029363 BCLAF1 857144 sc-eQTL 5.61e-01 -0.0306 0.0527 0.136 NK_CD56dim L2
ENSG00000112357 PEX7 324431 sc-eQTL 1.48e-01 -0.201 0.138 0.136 NK_CD56dim L2
ENSG00000112378 PERP -960424 sc-eQTL 6.42e-02 0.18 0.0969 0.136 NK_CD56dim L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 -720219 sc-eQTL 6.55e-01 -0.0339 0.076 0.136 NK_CD56dim L2
ENSG00000197442 MAP3K5 354518 sc-eQTL 8.49e-01 -0.0209 0.109 0.136 NK_CD56dim L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 -721238 sc-eQTL 8.11e-01 -0.0272 0.114 0.136 NK_CD56dim L2
ENSG00000027697 IFNGR1 -72454 sc-eQTL 2.65e-01 -0.12 0.107 0.13 NK_HLA L2
ENSG00000029363 BCLAF1 857144 sc-eQTL 3.71e-01 0.0813 0.0907 0.13 NK_HLA L2
ENSG00000112357 PEX7 324431 sc-eQTL 6.85e-01 0.0554 0.136 0.13 NK_HLA L2
ENSG00000112378 PERP -960424 sc-eQTL 6.27e-01 -0.0538 0.111 0.13 NK_HLA L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 -720219 sc-eQTL 9.93e-01 -0.000722 0.0851 0.13 NK_HLA L2
ENSG00000197442 MAP3K5 354518 sc-eQTL 7.63e-01 0.0408 0.135 0.13 NK_HLA L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 -721238 sc-eQTL 2.27e-01 -0.165 0.137 0.13 NK_HLA L2
ENSG00000027697 IFNGR1 -72454 sc-eQTL 8.58e-01 0.0154 0.086 0.136 NK_cytokine L2
ENSG00000029363 BCLAF1 857144 sc-eQTL 4.84e-01 -0.045 0.0641 0.136 NK_cytokine L2
ENSG00000112357 PEX7 324431 sc-eQTL 1.02e-01 0.22 0.134 0.136 NK_cytokine L2
ENSG00000112378 PERP -960424 sc-eQTL 9.49e-01 0.00656 0.102 0.136 NK_cytokine L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 -720219 sc-eQTL 8.81e-01 -0.0115 0.0767 0.136 NK_cytokine L2
ENSG00000197442 MAP3K5 354518 sc-eQTL 5.63e-01 -0.061 0.105 0.136 NK_cytokine L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 -721238 sc-eQTL 3.05e-01 -0.119 0.115 0.136 NK_cytokine L2
ENSG00000027697 IFNGR1 -72454 sc-eQTL 4.73e-01 -0.118 0.164 0.13 PB L2
ENSG00000029363 BCLAF1 857144 sc-eQTL 3.03e-01 -0.146 0.141 0.13 PB L2
ENSG00000112357 PEX7 324431 sc-eQTL 6.33e-01 -0.0805 0.168 0.13 PB L2
ENSG00000112378 PERP -960424 sc-eQTL 5.37e-01 -0.0651 0.105 0.13 PB L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 -720219 sc-eQTL 7.94e-01 0.0333 0.128 0.13 PB L2
ENSG00000197442 MAP3K5 354518 sc-eQTL 6.95e-01 0.057 0.145 0.13 PB L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 -721238 sc-eQTL 1.00e-02 0.39 0.149 0.13 PB L2
ENSG00000027697 IFNGR1 -72454 sc-eQTL 7.40e-01 -0.0356 0.107 0.135 Pro_T L2
ENSG00000029363 BCLAF1 857144 sc-eQTL 5.19e-01 0.0717 0.111 0.135 Pro_T L2
ENSG00000112357 PEX7 324431 sc-eQTL 1.84e-01 0.173 0.13 0.135 Pro_T L2
ENSG00000112378 PERP -960424 sc-eQTL 1.36e-01 0.154 0.103 0.135 Pro_T L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 -720219 sc-eQTL 6.84e-01 0.0266 0.0653 0.135 Pro_T L2
ENSG00000146410 MTFR2 896660 sc-eQTL 4.00e-01 0.0763 0.0904 0.135 Pro_T L2
ENSG00000197442 MAP3K5 354518 sc-eQTL 1.01e-01 -0.207 0.126 0.135 Pro_T L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 -721238 sc-eQTL 1.79e-01 -0.17 0.126 0.135 Pro_T L2
ENSG00000027697 IFNGR1 -72454 sc-eQTL 7.25e-02 -0.219 0.121 0.135 Treg L2
ENSG00000029363 BCLAF1 857144 sc-eQTL 4.10e-01 0.065 0.0788 0.135 Treg L2
ENSG00000112357 PEX7 324431 sc-eQTL 8.57e-01 -0.0233 0.129 0.135 Treg L2
ENSG00000112378 PERP -960424 sc-eQTL 9.63e-01 -0.0065 0.14 0.135 Treg L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 -720219 sc-eQTL 8.52e-01 0.0145 0.0777 0.135 Treg L2
ENSG00000197442 MAP3K5 354518 sc-eQTL 6.44e-01 0.0389 0.0841 0.135 Treg L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 -721238 sc-eQTL 7.55e-01 -0.037 0.118 0.135 Treg L2
ENSG00000027697 IFNGR1 -72454 sc-eQTL 6.52e-01 -0.0475 0.105 0.137 cDC L2
ENSG00000029363 BCLAF1 857144 sc-eQTL 1.01e-01 0.174 0.105 0.137 cDC L2
ENSG00000112357 PEX7 324431 sc-eQTL 1.25e-01 -0.209 0.135 0.137 cDC L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 -720219 sc-eQTL 7.70e-01 0.0304 0.104 0.137 cDC L2
ENSG00000135525 MAP7 596176 sc-eQTL 7.91e-01 0.0323 0.121 0.137 cDC L2
ENSG00000197442 MAP3K5 354518 sc-eQTL 5.72e-01 0.0605 0.107 0.137 cDC L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 -721238 sc-eQTL 9.12e-01 -0.015 0.135 0.137 cDC L2
ENSG00000286646 AL121933.2 362950 sc-eQTL 5.04e-01 -0.093 0.139 0.137 cDC L2
ENSG00000027697 IFNGR1 -72454 sc-eQTL 6.52e-02 -0.137 0.0737 0.135 cMono_IL1B L2
ENSG00000029363 BCLAF1 857144 sc-eQTL 7.21e-01 0.0285 0.0796 0.135 cMono_IL1B L2
ENSG00000112357 PEX7 324431 sc-eQTL 6.55e-01 -0.0598 0.134 0.135 cMono_IL1B L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 -720219 sc-eQTL 5.32e-01 -0.05 0.0799 0.135 cMono_IL1B L2
ENSG00000135525 MAP7 596176 sc-eQTL 1.42e-01 -0.169 0.115 0.135 cMono_IL1B L2
ENSG00000197442 MAP3K5 354518 sc-eQTL 2.06e-01 -0.105 0.0828 0.135 cMono_IL1B L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 -721238 sc-eQTL 7.69e-01 0.0252 0.0854 0.135 cMono_IL1B L2
ENSG00000286646 AL121933.2 362950 sc-eQTL 7.59e-02 0.189 0.106 0.135 cMono_IL1B L2
ENSG00000027697 IFNGR1 -72454 sc-eQTL 8.14e-02 -0.148 0.0846 0.135 cMono_S100A L2
ENSG00000029363 BCLAF1 857144 sc-eQTL 5.32e-01 0.0548 0.0875 0.135 cMono_S100A L2
ENSG00000112357 PEX7 324431 sc-eQTL 9.50e-01 -0.00867 0.137 0.135 cMono_S100A L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 -720219 sc-eQTL 5.06e-01 -0.0504 0.0757 0.135 cMono_S100A L2
ENSG00000135525 MAP7 596176 sc-eQTL 6.40e-01 -0.0596 0.127 0.135 cMono_S100A L2
ENSG00000197442 MAP3K5 354518 sc-eQTL 4.14e-01 -0.0841 0.103 0.135 cMono_S100A L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 -721238 sc-eQTL 3.43e-01 -0.103 0.109 0.135 cMono_S100A L2
ENSG00000286646 AL121933.2 362950 sc-eQTL 5.61e-01 0.0617 0.106 0.135 cMono_S100A L2
ENSG00000027697 IFNGR1 -72454 sc-eQTL 1.20e-01 0.195 0.125 0.136 gdT L2
ENSG00000029363 BCLAF1 857144 sc-eQTL 7.54e-01 -0.0349 0.111 0.136 gdT L2
ENSG00000112357 PEX7 324431 sc-eQTL 8.61e-01 0.0281 0.16 0.136 gdT L2
ENSG00000112378 PERP -960424 sc-eQTL 7.63e-01 -0.0422 0.139 0.136 gdT L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 -720219 sc-eQTL 7.39e-01 0.0258 0.0774 0.136 gdT L2
ENSG00000146410 MTFR2 896660 sc-eQTL 5.37e-01 -0.0755 0.122 0.136 gdT L2
ENSG00000197442 MAP3K5 354518 sc-eQTL 2.10e-01 0.205 0.163 0.136 gdT L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 -721238 sc-eQTL 5.15e-01 0.0914 0.14 0.136 gdT L2
ENSG00000027697 IFNGR1 -72454 sc-eQTL 5.02e-01 -0.0635 0.0945 0.136 intMono L2
ENSG00000029363 BCLAF1 857144 sc-eQTL 1.39e-01 0.185 0.124 0.136 intMono L2
ENSG00000112357 PEX7 324431 sc-eQTL 6.89e-01 -0.051 0.127 0.136 intMono L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 -720219 sc-eQTL 1.86e-01 0.108 0.0813 0.136 intMono L2
ENSG00000135525 MAP7 596176 sc-eQTL 9.19e-01 0.0128 0.125 0.136 intMono L2
ENSG00000197442 MAP3K5 354518 sc-eQTL 7.92e-01 -0.035 0.133 0.136 intMono L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 -721238 sc-eQTL 1.77e-01 0.164 0.121 0.136 intMono L2
ENSG00000286646 AL121933.2 362950 sc-eQTL 3.39e-01 0.134 0.14 0.136 intMono L2
ENSG00000027697 IFNGR1 -72454 sc-eQTL 1.22e-01 -0.167 0.108 0.138 ncMono L2
ENSG00000029363 BCLAF1 857144 sc-eQTL 5.36e-01 -0.0521 0.0841 0.138 ncMono L2
ENSG00000112357 PEX7 324431 sc-eQTL 4.44e-01 -0.103 0.134 0.138 ncMono L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 -720219 sc-eQTL 7.48e-01 -0.0308 0.0959 0.138 ncMono L2
ENSG00000135525 MAP7 596176 sc-eQTL 1.40e-01 0.175 0.118 0.138 ncMono L2
ENSG00000197442 MAP3K5 354518 sc-eQTL 6.59e-02 -0.228 0.124 0.138 ncMono L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 -721238 sc-eQTL 5.04e-01 -0.0802 0.12 0.138 ncMono L2
ENSG00000286646 AL121933.2 362950 sc-eQTL 4.31e-01 -0.0996 0.126 0.138 ncMono L2
ENSG00000027697 IFNGR1 -72454 sc-eQTL 2.94e-01 0.127 0.12 0.141 pDC L2
ENSG00000029363 BCLAF1 857144 sc-eQTL 6.42e-01 0.0422 0.0905 0.141 pDC L2
ENSG00000112357 PEX7 324431 sc-eQTL 4.21e-01 -0.107 0.133 0.141 pDC L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 -720219 sc-eQTL 6.86e-01 0.0453 0.112 0.141 pDC L2
ENSG00000135525 MAP7 596176 sc-eQTL 1.29e-01 -0.141 0.0921 0.141 pDC L2
ENSG00000197442 MAP3K5 354518 sc-eQTL 6.68e-01 0.0637 0.148 0.141 pDC L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 -721238 sc-eQTL 9.84e-01 -0.00221 0.114 0.141 pDC L2
ENSG00000286646 AL121933.2 362950 sc-eQTL 8.87e-02 -0.232 0.136 0.141 pDC L2
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000027697 IFNGR1 -72454 sc-eQTL 4.72e-01 -0.0773 0.107 0.135 B_Memory LOneK1K
ENSG00000029363 BCLAF1 857144 sc-eQTL 6.99e-01 0.0233 0.0604 0.135 B_Memory LOneK1K
ENSG00000112357 PEX7 324431 sc-eQTL 4.46e-01 0.0943 0.123 0.135 B_Memory LOneK1K
ENSG00000112378 PERP -960424 sc-eQTL 8.98e-01 0.0148 0.115 0.135 B_Memory LOneK1K
ENSG00000118503 TNFAIP3 -720219 sc-eQTL 5.88e-01 -0.0411 0.0758 0.135 B_Memory LOneK1K
ENSG00000197442 MAP3K5 354518 sc-eQTL 9.66e-01 0.00424 0.1 0.135 B_Memory LOneK1K
ENSG00000237499 WAKMAR2 -721238 sc-eQTL 3.28e-01 -0.125 0.128 0.135 B_Memory LOneK1K
ENSG00000027697 IFNGR1 -72454 sc-eQTL 3.97e-03 -0.312 0.107 0.135 B_Naive LOneK1K
ENSG00000029363 BCLAF1 857144 sc-eQTL 8.15e-01 -0.0118 0.0503 0.135 B_Naive LOneK1K
ENSG00000112357 PEX7 324431 sc-eQTL 7.71e-02 -0.235 0.132 0.135 B_Naive LOneK1K
ENSG00000112378 PERP -960424 sc-eQTL 5.34e-01 -0.0741 0.119 0.135 B_Naive LOneK1K
ENSG00000118503 TNFAIP3 -720219 sc-eQTL 8.82e-01 0.00931 0.0627 0.135 B_Naive LOneK1K
ENSG00000197442 MAP3K5 354518 sc-eQTL 3.25e-02 0.196 0.0908 0.135 B_Naive LOneK1K
ENSG00000237499 WAKMAR2 -721238 sc-eQTL 6.55e-01 0.05 0.112 0.135 B_Naive LOneK1K
ENSG00000027697 IFNGR1 -72454 sc-eQTL 3.24e-02 -0.158 0.0734 0.135 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000029363 BCLAF1 857144 sc-eQTL 3.61e-01 0.0631 0.0689 0.135 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000112357 PEX7 324431 sc-eQTL 5.19e-01 -0.0859 0.133 0.135 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000118503 TNFAIP3 -720219 sc-eQTL 6.83e-01 -0.028 0.0686 0.135 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000135525 MAP7 596176 sc-eQTL 1.93e-01 -0.155 0.119 0.135 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000197442 MAP3K5 354518 sc-eQTL 1.46e-01 -0.117 0.08 0.135 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000237499 WAKMAR2 -721238 sc-eQTL 8.93e-01 0.0111 0.0822 0.135 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000286646 AL121933.2 362950 sc-eQTL 1.74e-01 0.13 0.0953 0.135 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000027697 IFNGR1 -72454 sc-eQTL 1.07e-01 -0.145 0.0897 0.136 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000029363 BCLAF1 857144 sc-eQTL 6.76e-01 0.0341 0.0815 0.136 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000112357 PEX7 324431 sc-eQTL 8.03e-01 -0.034 0.136 0.136 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000118503 TNFAIP3 -720219 sc-eQTL 8.53e-01 0.0156 0.0843 0.136 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000135525 MAP7 596176 sc-eQTL 2.94e-01 0.138 0.131 0.136 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000197442 MAP3K5 354518 sc-eQTL 2.16e-01 -0.134 0.108 0.136 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000237499 WAKMAR2 -721238 sc-eQTL 6.27e-01 0.055 0.113 0.136 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000286646 AL121933.2 362950 sc-eQTL 9.97e-01 0.000545 0.128 0.136 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000027697 IFNGR1 -72454 sc-eQTL 7.69e-01 -0.0245 0.0834 0.136 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000029363 BCLAF1 857144 sc-eQTL 7.80e-01 -0.0135 0.0484 0.136 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000112357 PEX7 324431 sc-eQTL 8.17e-01 -0.0326 0.141 0.136 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000112378 PERP -960424 sc-eQTL 8.70e-01 0.0143 0.0873 0.136 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000118503 TNFAIP3 -720219 sc-eQTL 4.74e-01 -0.0544 0.0759 0.136 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000197442 MAP3K5 354518 sc-eQTL 9.06e-01 0.0122 0.103 0.136 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000237499 WAKMAR2 -721238 sc-eQTL 2.15e-01 -0.132 0.106 0.136 NK_CD56dim LOneK1K

Statistical fine-mapping results from Japan COVID-19 Task Force
(Shown only for PIP>0.001)
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
PIP (SuSiE)
PIP (FINEMAP)
MAF

Expression Modifier Score(EMS) for GTEx 49tissues
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Whole Blood
Muscle Skeletal
Liver
Brain Cerebellum
Prostate
Spleen
Skin Sun Exposed Lower leg
Artery Coronary
Esophagus Muscularis
Esophagus Gastroesophageal Junction
Artery Tibial
Heart Atrial Appendage
Nerve Tibial
Heart Left Ventricle
Adrenal Gland
Adipose Visceral Omentum
Pancreas
Lung
Pituitary
Brain Nucleus accumbens basal ganglia
Colon Transverse
Adipose Subcutaneous
Esophagus Mucosa
Brain Cortex
Thyroid
Stomach
Breast Mammary Tissue
Colon Sigmoid
Skin Not Sun Exposed Suprapubic
Testis
Artery Aorta
Brain Amygdala
Brain Anterior cingulate cortex BA24
Brain Caudate basal ganglia
Brain Cerebellar Hemisphere
Brain Frontal Cortex BA9
Brain Hippocampus
Brain Hypothalamus
Brain Putamen basal ganglia
Brain Spinal cord cervical c-1
Brain Substantia nigra
Cells Cultured fibroblasts
Cells EBV-transformed lymphocytes
Kidney Cortex
Minor Salivary Gland
Ovary
Small Intestine Terminal Ileum
Uterus
Vagina
ENSG00000197442 \N 354518 3.14e-07 1.76e-07 3.69e-08 3.57e-07 1.03e-07 1.5e-07 1.99e-07 5.33e-08 1.45e-07 4.57e-08 3.97e-07 1.22e-07 2.29e-07 8.42e-08 5.72e-08 7.26e-08 4.18e-08 2.43e-07 5.82e-08 4.03e-08 1.13e-07 1.42e-07 1.62e-07 3.79e-08 1.63e-07 1.25e-07 1.07e-07 8.71e-08 1.22e-07 1.24e-07 1.14e-07 3.59e-08 3.09e-08 9.9e-08 3.07e-08 2.68e-08 4.43e-08 9.22e-08 6.55e-08 3.54e-08 3.77e-08 2.41e-07 4.7e-08 2.07e-07 8.03e-08 1.19e-08 1.3e-07 4.7e-09 4.72e-08