logo

Genes within 1Mb (chr6:137145477:A:G):

View on , UCSC , GTEx , gnomAD

Immune cell-type specific single cell cis-eQTLs in OASIS
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000027697 IFNGR1 -73972 sc-eQTL 3.72e-01 0.0853 0.0953 0.143 B L1
ENSG00000029363 BCLAF1 855626 sc-eQTL 4.05e-01 0.0354 0.0425 0.143 B L1
ENSG00000112357 PEX7 322913 sc-eQTL 7.50e-01 -0.0361 0.113 0.143 B L1
ENSG00000112378 PERP -961942 sc-eQTL 9.86e-01 0.00133 0.0748 0.143 B L1
ENSG00000118503 TNFAIP3 -721737 sc-eQTL 9.31e-01 0.00523 0.0603 0.143 B L1
ENSG00000197442 MAP3K5 353000 sc-eQTL 4.92e-01 0.0577 0.0839 0.143 B L1
ENSG00000237499 WAKMAR2 -722756 sc-eQTL 1.00e-01 0.156 0.0942 0.143 B L1
ENSG00000027697 IFNGR1 -73972 sc-eQTL 9.93e-01 0.000594 0.0643 0.143 CD4T L1
ENSG00000029363 BCLAF1 855626 sc-eQTL 8.32e-01 0.0103 0.0487 0.143 CD4T L1
ENSG00000112357 PEX7 322913 sc-eQTL 1.37e-01 -0.154 0.103 0.143 CD4T L1
ENSG00000112378 PERP -961942 sc-eQTL 1.78e-01 -0.0936 0.0692 0.143 CD4T L1
ENSG00000118503 TNFAIP3 -721737 sc-eQTL 1.69e-01 -0.0895 0.0649 0.143 CD4T L1
ENSG00000197442 MAP3K5 353000 sc-eQTL 2.51e-01 0.0569 0.0495 0.143 CD4T L1
ENSG00000237499 WAKMAR2 -722756 sc-eQTL 1.44e-01 0.12 0.0816 0.143 CD4T L1
ENSG00000027697 IFNGR1 -73972 sc-eQTL 6.68e-01 0.0312 0.0727 0.143 CD8T L1
ENSG00000029363 BCLAF1 855626 sc-eQTL 6.32e-01 0.0236 0.0492 0.143 CD8T L1
ENSG00000112357 PEX7 322913 sc-eQTL 2.60e-01 0.136 0.121 0.143 CD8T L1
ENSG00000112378 PERP -961942 sc-eQTL 7.16e-01 -0.0289 0.0792 0.143 CD8T L1
ENSG00000118503 TNFAIP3 -721737 sc-eQTL 3.83e-02 -0.126 0.0606 0.143 CD8T L1
ENSG00000197442 MAP3K5 353000 sc-eQTL 1.43e-01 0.0946 0.0643 0.143 CD8T L1
ENSG00000237499 WAKMAR2 -722756 sc-eQTL 2.42e-01 -0.105 0.0896 0.143 CD8T L1
ENSG00000027697 IFNGR1 -73972 sc-eQTL 2.15e-01 0.11 0.0881 0.144 DC L1
ENSG00000029363 BCLAF1 855626 sc-eQTL 8.13e-01 -0.0188 0.0796 0.144 DC L1
ENSG00000112357 PEX7 322913 sc-eQTL 3.78e-01 0.11 0.124 0.144 DC L1
ENSG00000118503 TNFAIP3 -721737 sc-eQTL 5.52e-01 0.0563 0.0945 0.144 DC L1
ENSG00000135525 MAP7 594658 sc-eQTL 1.15e-01 -0.161 0.102 0.144 DC L1
ENSG00000197442 MAP3K5 353000 sc-eQTL 5.54e-01 0.0581 0.098 0.144 DC L1
ENSG00000237499 WAKMAR2 -722756 sc-eQTL 2.92e-01 -0.101 0.0961 0.144 DC L1
ENSG00000286646 AL121933.2 361432 sc-eQTL 1.41e-01 -0.188 0.127 0.144 DC L1
ENSG00000027697 IFNGR1 -73972 sc-eQTL 3.98e-02 -0.151 0.0729 0.143 Mono L1
ENSG00000029363 BCLAF1 855626 sc-eQTL 1.91e-01 -0.0822 0.0627 0.143 Mono L1
ENSG00000112357 PEX7 322913 sc-eQTL 8.77e-01 -0.0191 0.124 0.143 Mono L1
ENSG00000118503 TNFAIP3 -721737 sc-eQTL 7.40e-01 0.0208 0.0624 0.143 Mono L1
ENSG00000135525 MAP7 594658 sc-eQTL 5.87e-01 -0.0594 0.109 0.143 Mono L1
ENSG00000197442 MAP3K5 353000 sc-eQTL 9.32e-01 -0.00623 0.0728 0.143 Mono L1
ENSG00000237499 WAKMAR2 -722756 sc-eQTL 6.80e-01 0.0319 0.0773 0.143 Mono L1
ENSG00000286646 AL121933.2 361432 sc-eQTL 5.89e-02 -0.166 0.0875 0.143 Mono L1
ENSG00000027697 IFNGR1 -73972 sc-eQTL 8.32e-01 -0.0171 0.0802 0.144 NK L1
ENSG00000029363 BCLAF1 855626 sc-eQTL 3.84e-01 -0.0371 0.0425 0.144 NK L1
ENSG00000112357 PEX7 322913 sc-eQTL 5.14e-01 0.081 0.124 0.144 NK L1
ENSG00000112378 PERP -961942 sc-eQTL 9.29e-01 -0.00697 0.078 0.144 NK L1
ENSG00000118503 TNFAIP3 -721737 sc-eQTL 5.29e-01 -0.0421 0.0667 0.144 NK L1
ENSG00000197442 MAP3K5 353000 sc-eQTL 1.75e-02 0.226 0.0944 0.144 NK L1
ENSG00000237499 WAKMAR2 -722756 sc-eQTL 9.04e-01 0.0115 0.0947 0.144 NK L1
ENSG00000027697 IFNGR1 -73972 sc-eQTL 7.26e-01 0.0264 0.0754 0.143 Other_T L1
ENSG00000029363 BCLAF1 855626 sc-eQTL 7.98e-01 -0.0162 0.0632 0.143 Other_T L1
ENSG00000112357 PEX7 322913 sc-eQTL 1.56e-01 0.174 0.122 0.143 Other_T L1
ENSG00000112378 PERP -961942 sc-eQTL 4.03e-01 -0.0826 0.0985 0.143 Other_T L1
ENSG00000118503 TNFAIP3 -721737 sc-eQTL 4.19e-01 -0.0379 0.0469 0.143 Other_T L1
ENSG00000146410 MTFR2 895142 sc-eQTL 7.65e-01 -0.0213 0.071 0.143 Other_T L1
ENSG00000197442 MAP3K5 353000 sc-eQTL 9.37e-02 0.152 0.09 0.143 Other_T L1
ENSG00000237499 WAKMAR2 -722756 sc-eQTL 7.99e-01 -0.0237 0.0931 0.143 Other_T L1
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000027697 IFNGR1 -73972 sc-eQTL 3.01e-01 -0.137 0.133 0.138 B_Activated L2
ENSG00000029363 BCLAF1 855626 sc-eQTL 4.00e-01 -0.091 0.108 0.138 B_Activated L2
ENSG00000112357 PEX7 322913 sc-eQTL 7.12e-01 -0.0483 0.131 0.138 B_Activated L2
ENSG00000112378 PERP -961942 sc-eQTL 3.75e-01 -0.0601 0.0676 0.138 B_Activated L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 -721737 sc-eQTL 5.96e-01 0.0697 0.131 0.138 B_Activated L2
ENSG00000197442 MAP3K5 353000 sc-eQTL 3.52e-01 0.137 0.147 0.138 B_Activated L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 -722756 sc-eQTL 8.50e-01 0.0218 0.115 0.138 B_Activated L2
ENSG00000027697 IFNGR1 -73972 sc-eQTL 5.12e-03 0.32 0.113 0.144 B_Intermediate L2
ENSG00000029363 BCLAF1 855626 sc-eQTL 1.17e-01 0.103 0.0652 0.144 B_Intermediate L2
ENSG00000112357 PEX7 322913 sc-eQTL 8.84e-01 0.0175 0.121 0.144 B_Intermediate L2
ENSG00000112378 PERP -961942 sc-eQTL 4.79e-01 -0.0778 0.11 0.144 B_Intermediate L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 -721737 sc-eQTL 7.95e-01 -0.0224 0.0862 0.144 B_Intermediate L2
ENSG00000197442 MAP3K5 353000 sc-eQTL 1.91e-01 0.136 0.104 0.144 B_Intermediate L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 -722756 sc-eQTL 6.17e-01 -0.0613 0.122 0.144 B_Intermediate L2
ENSG00000027697 IFNGR1 -73972 sc-eQTL 5.59e-01 0.0726 0.124 0.142 B_Memory L2
ENSG00000029363 BCLAF1 855626 sc-eQTL 5.69e-01 0.0421 0.0737 0.142 B_Memory L2
ENSG00000112357 PEX7 322913 sc-eQTL 1.41e-01 0.185 0.125 0.142 B_Memory L2
ENSG00000112378 PERP -961942 sc-eQTL 1.43e-01 0.173 0.117 0.142 B_Memory L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 -721737 sc-eQTL 1.56e-01 0.115 0.0808 0.142 B_Memory L2
ENSG00000197442 MAP3K5 353000 sc-eQTL 6.44e-01 -0.0513 0.111 0.142 B_Memory L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 -722756 sc-eQTL 4.80e-01 0.0854 0.121 0.142 B_Memory L2
ENSG00000027697 IFNGR1 -73972 sc-eQTL 6.18e-01 0.0485 0.0971 0.143 B_Naive1 L2
ENSG00000029363 BCLAF1 855626 sc-eQTL 7.92e-01 0.0147 0.0555 0.143 B_Naive1 L2
ENSG00000112357 PEX7 322913 sc-eQTL 8.32e-01 -0.0272 0.128 0.143 B_Naive1 L2
ENSG00000112378 PERP -961942 sc-eQTL 5.64e-01 -0.0647 0.112 0.143 B_Naive1 L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 -721737 sc-eQTL 3.64e-01 0.0591 0.0649 0.143 B_Naive1 L2
ENSG00000197442 MAP3K5 353000 sc-eQTL 9.35e-01 -0.00749 0.0914 0.143 B_Naive1 L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 -722756 sc-eQTL 3.88e-01 0.0879 0.102 0.143 B_Naive1 L2
ENSG00000027697 IFNGR1 -73972 sc-eQTL 7.94e-02 0.205 0.116 0.142 B_Naive2 L2
ENSG00000029363 BCLAF1 855626 sc-eQTL 2.99e-01 0.0706 0.0678 0.142 B_Naive2 L2
ENSG00000112357 PEX7 322913 sc-eQTL 2.13e-01 -0.16 0.128 0.142 B_Naive2 L2
ENSG00000112378 PERP -961942 sc-eQTL 6.09e-01 -0.0479 0.0934 0.142 B_Naive2 L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 -721737 sc-eQTL 6.99e-01 0.0362 0.0933 0.142 B_Naive2 L2
ENSG00000197442 MAP3K5 353000 sc-eQTL 7.57e-01 0.0308 0.0993 0.142 B_Naive2 L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 -722756 sc-eQTL 1.72e-01 0.165 0.12 0.142 B_Naive2 L2
ENSG00000027697 IFNGR1 -73972 sc-eQTL 9.07e-02 0.181 0.106 0.148 CD4_CTL L2
ENSG00000029363 BCLAF1 855626 sc-eQTL 5.54e-01 0.0562 0.0949 0.148 CD4_CTL L2
ENSG00000112357 PEX7 322913 sc-eQTL 2.82e-01 -0.128 0.118 0.148 CD4_CTL L2
ENSG00000112378 PERP -961942 sc-eQTL 1.65e-01 -0.167 0.12 0.148 CD4_CTL L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 -721737 sc-eQTL 6.28e-01 0.034 0.0702 0.148 CD4_CTL L2
ENSG00000197442 MAP3K5 353000 sc-eQTL 6.10e-01 -0.0572 0.112 0.148 CD4_CTL L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 -722756 sc-eQTL 9.63e-01 -0.00506 0.109 0.148 CD4_CTL L2
ENSG00000027697 IFNGR1 -73972 sc-eQTL 7.18e-01 0.0222 0.0614 0.143 CD4_Naive L2
ENSG00000029363 BCLAF1 855626 sc-eQTL 6.23e-01 -0.0243 0.0493 0.143 CD4_Naive L2
ENSG00000112357 PEX7 322913 sc-eQTL 9.82e-02 -0.191 0.115 0.143 CD4_Naive L2
ENSG00000112378 PERP -961942 sc-eQTL 8.78e-01 0.0147 0.0957 0.143 CD4_Naive L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 -721737 sc-eQTL 2.29e-01 -0.0807 0.0669 0.143 CD4_Naive L2
ENSG00000197442 MAP3K5 353000 sc-eQTL 5.72e-01 0.0279 0.0493 0.143 CD4_Naive L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 -722756 sc-eQTL 1.82e-01 0.116 0.0866 0.143 CD4_Naive L2
ENSG00000027697 IFNGR1 -73972 sc-eQTL 7.66e-01 0.0256 0.0859 0.143 CD4_TCM L2
ENSG00000029363 BCLAF1 855626 sc-eQTL 7.15e-01 0.0198 0.0542 0.143 CD4_TCM L2
ENSG00000112357 PEX7 322913 sc-eQTL 6.88e-01 -0.0507 0.126 0.143 CD4_TCM L2
ENSG00000112378 PERP -961942 sc-eQTL 5.73e-01 -0.0602 0.106 0.143 CD4_TCM L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 -721737 sc-eQTL 5.14e-01 -0.0404 0.0618 0.143 CD4_TCM L2
ENSG00000197442 MAP3K5 353000 sc-eQTL 3.33e-01 0.0682 0.0703 0.143 CD4_TCM L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 -722756 sc-eQTL 1.89e-01 0.114 0.0864 0.143 CD4_TCM L2
ENSG00000027697 IFNGR1 -73972 sc-eQTL 2.11e-01 -0.12 0.0958 0.143 CD4_TEM L2
ENSG00000029363 BCLAF1 855626 sc-eQTL 4.92e-01 0.0469 0.0681 0.143 CD4_TEM L2
ENSG00000112357 PEX7 322913 sc-eQTL 2.96e-01 -0.13 0.124 0.143 CD4_TEM L2
ENSG00000112378 PERP -961942 sc-eQTL 3.10e-01 -0.102 0.1 0.143 CD4_TEM L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 -721737 sc-eQTL 8.80e-01 -0.00967 0.0639 0.143 CD4_TEM L2
ENSG00000197442 MAP3K5 353000 sc-eQTL 1.90e-01 0.129 0.0983 0.143 CD4_TEM L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 -722756 sc-eQTL 3.63e-01 0.0932 0.102 0.143 CD4_TEM L2
ENSG00000027697 IFNGR1 -73972 sc-eQTL 4.59e-01 0.0641 0.0865 0.143 CD8_CTL L2
ENSG00000029363 BCLAF1 855626 sc-eQTL 4.12e-01 0.0474 0.0577 0.143 CD8_CTL L2
ENSG00000112357 PEX7 322913 sc-eQTL 4.87e-01 0.0829 0.119 0.143 CD8_CTL L2
ENSG00000112378 PERP -961942 sc-eQTL 8.65e-01 -0.0195 0.115 0.143 CD8_CTL L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 -721737 sc-eQTL 4.90e-01 -0.0503 0.0728 0.143 CD8_CTL L2
ENSG00000197442 MAP3K5 353000 sc-eQTL 9.59e-01 -0.00525 0.103 0.143 CD8_CTL L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 -722756 sc-eQTL 6.38e-01 -0.0482 0.102 0.143 CD8_CTL L2
ENSG00000027697 IFNGR1 -73972 sc-eQTL 9.88e-01 -0.00132 0.0868 0.143 CD8_Naive L2
ENSG00000029363 BCLAF1 855626 sc-eQTL 5.65e-01 0.0349 0.0605 0.143 CD8_Naive L2
ENSG00000112357 PEX7 322913 sc-eQTL 9.81e-01 -0.00293 0.126 0.143 CD8_Naive L2
ENSG00000112378 PERP -961942 sc-eQTL 3.39e-01 0.0915 0.0954 0.143 CD8_Naive L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 -721737 sc-eQTL 9.18e-02 -0.114 0.0674 0.143 CD8_Naive L2
ENSG00000197442 MAP3K5 353000 sc-eQTL 6.26e-03 0.218 0.079 0.143 CD8_Naive L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 -722756 sc-eQTL 6.54e-01 -0.045 0.1 0.143 CD8_Naive L2
ENSG00000027697 IFNGR1 -73972 sc-eQTL 2.19e-01 -0.148 0.12 0.137 CD8_TCM L2
ENSG00000029363 BCLAF1 855626 sc-eQTL 4.10e-02 0.184 0.0894 0.137 CD8_TCM L2
ENSG00000112357 PEX7 322913 sc-eQTL 5.44e-01 0.084 0.138 0.137 CD8_TCM L2
ENSG00000112378 PERP -961942 sc-eQTL 4.35e-01 -0.106 0.135 0.137 CD8_TCM L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 -721737 sc-eQTL 6.81e-01 0.0269 0.0652 0.137 CD8_TCM L2
ENSG00000197442 MAP3K5 353000 sc-eQTL 3.81e-01 0.102 0.116 0.137 CD8_TCM L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 -722756 sc-eQTL 7.26e-01 -0.0419 0.119 0.137 CD8_TCM L2
ENSG00000027697 IFNGR1 -73972 sc-eQTL 7.67e-01 0.0322 0.109 0.148 CD8_TEM L2
ENSG00000029363 BCLAF1 855626 sc-eQTL 2.12e-02 0.235 0.101 0.148 CD8_TEM L2
ENSG00000112357 PEX7 322913 sc-eQTL 3.49e-01 0.117 0.125 0.148 CD8_TEM L2
ENSG00000112378 PERP -961942 sc-eQTL 3.97e-01 -0.11 0.13 0.148 CD8_TEM L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 -721737 sc-eQTL 3.90e-01 -0.0689 0.08 0.148 CD8_TEM L2
ENSG00000197442 MAP3K5 353000 sc-eQTL 4.38e-02 0.249 0.123 0.148 CD8_TEM L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 -722756 sc-eQTL 8.70e-01 0.0195 0.119 0.148 CD8_TEM L2
ENSG00000027697 IFNGR1 -73972 sc-eQTL 8.33e-01 0.0185 0.0879 0.145 MAIT L2
ENSG00000029363 BCLAF1 855626 sc-eQTL 7.42e-01 -0.0241 0.073 0.145 MAIT L2
ENSG00000112357 PEX7 322913 sc-eQTL 6.92e-01 0.0473 0.119 0.145 MAIT L2
ENSG00000112378 PERP -961942 sc-eQTL 3.73e-01 -0.111 0.124 0.145 MAIT L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 -721737 sc-eQTL 5.88e-01 -0.0321 0.0591 0.145 MAIT L2
ENSG00000146410 MTFR2 895142 sc-eQTL 7.30e-01 0.0341 0.0985 0.145 MAIT L2
ENSG00000197442 MAP3K5 353000 sc-eQTL 8.32e-01 0.0219 0.103 0.145 MAIT L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 -722756 sc-eQTL 7.54e-01 0.0343 0.109 0.145 MAIT L2
ENSG00000027697 IFNGR1 -73972 sc-eQTL 9.78e-01 -0.00265 0.0959 0.147 NK_CD56bright L2
ENSG00000029363 BCLAF1 855626 sc-eQTL 3.33e-01 0.0685 0.0706 0.147 NK_CD56bright L2
ENSG00000112357 PEX7 322913 sc-eQTL 5.37e-01 0.0771 0.125 0.147 NK_CD56bright L2
ENSG00000112378 PERP -961942 sc-eQTL 5.84e-01 -0.0614 0.112 0.147 NK_CD56bright L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 -721737 sc-eQTL 8.62e-01 0.0124 0.0714 0.147 NK_CD56bright L2
ENSG00000197442 MAP3K5 353000 sc-eQTL 3.57e-02 0.227 0.107 0.147 NK_CD56bright L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 -722756 sc-eQTL 5.06e-01 0.0758 0.114 0.147 NK_CD56bright L2
ENSG00000027697 IFNGR1 -73972 sc-eQTL 6.25e-01 -0.0361 0.0737 0.144 NK_CD56dim L2
ENSG00000029363 BCLAF1 855626 sc-eQTL 9.86e-01 -0.000864 0.0482 0.144 NK_CD56dim L2
ENSG00000112357 PEX7 322913 sc-eQTL 4.93e-01 0.0872 0.127 0.144 NK_CD56dim L2
ENSG00000112378 PERP -961942 sc-eQTL 7.50e-01 -0.0285 0.0893 0.144 NK_CD56dim L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 -721737 sc-eQTL 7.00e-01 -0.0267 0.0694 0.144 NK_CD56dim L2
ENSG00000197442 MAP3K5 353000 sc-eQTL 1.49e-01 0.144 0.0995 0.144 NK_CD56dim L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 -722756 sc-eQTL 7.10e-01 -0.0388 0.104 0.144 NK_CD56dim L2
ENSG00000027697 IFNGR1 -73972 sc-eQTL 5.03e-01 -0.0627 0.0935 0.148 NK_HLA L2
ENSG00000029363 BCLAF1 855626 sc-eQTL 8.28e-01 0.0172 0.0792 0.148 NK_HLA L2
ENSG00000112357 PEX7 322913 sc-eQTL 7.69e-01 -0.0349 0.119 0.148 NK_HLA L2
ENSG00000112378 PERP -961942 sc-eQTL 3.43e-01 0.0914 0.0962 0.148 NK_HLA L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 -721737 sc-eQTL 8.81e-01 0.0112 0.0742 0.148 NK_HLA L2
ENSG00000197442 MAP3K5 353000 sc-eQTL 2.98e-01 0.123 0.118 0.148 NK_HLA L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 -722756 sc-eQTL 3.00e-02 0.258 0.118 0.148 NK_HLA L2
ENSG00000027697 IFNGR1 -73972 sc-eQTL 8.30e-01 -0.0167 0.0779 0.144 NK_cytokine L2
ENSG00000029363 BCLAF1 855626 sc-eQTL 6.14e-02 -0.108 0.0576 0.144 NK_cytokine L2
ENSG00000112357 PEX7 322913 sc-eQTL 2.11e-01 -0.153 0.122 0.144 NK_cytokine L2
ENSG00000112378 PERP -961942 sc-eQTL 8.83e-01 0.0137 0.0927 0.144 NK_cytokine L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 -721737 sc-eQTL 9.65e-01 -0.00308 0.0695 0.144 NK_cytokine L2
ENSG00000197442 MAP3K5 353000 sc-eQTL 4.42e-02 0.191 0.0946 0.144 NK_cytokine L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 -722756 sc-eQTL 6.00e-01 0.055 0.105 0.144 NK_cytokine L2
ENSG00000027697 IFNGR1 -73972 sc-eQTL 9.30e-01 0.0142 0.162 0.126 PB L2
ENSG00000029363 BCLAF1 855626 sc-eQTL 2.41e-01 -0.163 0.138 0.126 PB L2
ENSG00000112357 PEX7 322913 sc-eQTL 7.72e-01 -0.0482 0.166 0.126 PB L2
ENSG00000112378 PERP -961942 sc-eQTL 1.55e-01 -0.147 0.103 0.126 PB L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 -721737 sc-eQTL 9.07e-01 0.0148 0.126 0.126 PB L2
ENSG00000197442 MAP3K5 353000 sc-eQTL 1.35e-01 -0.213 0.142 0.126 PB L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 -722756 sc-eQTL 4.26e-01 -0.12 0.15 0.126 PB L2
ENSG00000027697 IFNGR1 -73972 sc-eQTL 5.94e-01 -0.053 0.0993 0.141 Pro_T L2
ENSG00000029363 BCLAF1 855626 sc-eQTL 4.03e-01 0.0861 0.103 0.141 Pro_T L2
ENSG00000112357 PEX7 322913 sc-eQTL 6.36e-01 0.0571 0.121 0.141 Pro_T L2
ENSG00000112378 PERP -961942 sc-eQTL 3.72e-01 -0.0857 0.0958 0.141 Pro_T L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 -721737 sc-eQTL 9.75e-01 0.0019 0.0605 0.141 Pro_T L2
ENSG00000146410 MTFR2 895142 sc-eQTL 8.17e-01 0.0195 0.0839 0.141 Pro_T L2
ENSG00000197442 MAP3K5 353000 sc-eQTL 2.79e-01 0.127 0.117 0.141 Pro_T L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 -722756 sc-eQTL 5.53e-02 -0.224 0.116 0.141 Pro_T L2
ENSG00000027697 IFNGR1 -73972 sc-eQTL 7.84e-01 -0.0312 0.114 0.143 Treg L2
ENSG00000029363 BCLAF1 855626 sc-eQTL 9.70e-02 0.122 0.0729 0.143 Treg L2
ENSG00000112357 PEX7 322913 sc-eQTL 8.32e-01 -0.0255 0.12 0.143 Treg L2
ENSG00000112378 PERP -961942 sc-eQTL 2.54e-01 -0.148 0.129 0.143 Treg L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 -721737 sc-eQTL 5.05e-01 -0.0481 0.0721 0.143 Treg L2
ENSG00000197442 MAP3K5 353000 sc-eQTL 4.89e-01 0.0541 0.0781 0.143 Treg L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 -722756 sc-eQTL 1.22e-01 0.17 0.109 0.143 Treg L2
ENSG00000027697 IFNGR1 -73972 sc-eQTL 1.42e-01 0.146 0.0989 0.149 cDC L2
ENSG00000029363 BCLAF1 855626 sc-eQTL 7.91e-01 -0.0266 0.1 0.149 cDC L2
ENSG00000112357 PEX7 322913 sc-eQTL 7.64e-01 0.0387 0.129 0.149 cDC L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 -721737 sc-eQTL 7.55e-01 0.0306 0.098 0.149 cDC L2
ENSG00000135525 MAP7 594658 sc-eQTL 2.30e-01 -0.138 0.114 0.149 cDC L2
ENSG00000197442 MAP3K5 353000 sc-eQTL 4.27e-01 -0.0802 0.101 0.149 cDC L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 -722756 sc-eQTL 3.78e-01 -0.113 0.127 0.149 cDC L2
ENSG00000286646 AL121933.2 361432 sc-eQTL 3.01e-01 -0.136 0.131 0.149 cDC L2
ENSG00000027697 IFNGR1 -73972 sc-eQTL 2.76e-02 -0.151 0.068 0.143 cMono_IL1B L2
ENSG00000029363 BCLAF1 855626 sc-eQTL 6.10e-01 -0.0376 0.0737 0.143 cMono_IL1B L2
ENSG00000112357 PEX7 322913 sc-eQTL 4.54e-01 -0.0927 0.123 0.143 cMono_IL1B L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 -721737 sc-eQTL 6.75e-01 0.031 0.074 0.143 cMono_IL1B L2
ENSG00000135525 MAP7 594658 sc-eQTL 3.51e-01 -0.0993 0.106 0.143 cMono_IL1B L2
ENSG00000197442 MAP3K5 353000 sc-eQTL 6.58e-01 -0.0341 0.0769 0.143 cMono_IL1B L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 -722756 sc-eQTL 8.38e-01 0.0162 0.079 0.143 cMono_IL1B L2
ENSG00000286646 AL121933.2 361432 sc-eQTL 5.54e-02 -0.189 0.0981 0.143 cMono_IL1B L2
ENSG00000027697 IFNGR1 -73972 sc-eQTL 2.29e-01 -0.0963 0.0798 0.143 cMono_S100A L2
ENSG00000029363 BCLAF1 855626 sc-eQTL 1.07e-01 -0.132 0.0818 0.143 cMono_S100A L2
ENSG00000112357 PEX7 322913 sc-eQTL 2.15e-01 -0.159 0.128 0.143 cMono_S100A L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 -721737 sc-eQTL 7.02e-01 -0.0272 0.0711 0.143 cMono_S100A L2
ENSG00000135525 MAP7 594658 sc-eQTL 2.60e-01 -0.135 0.119 0.143 cMono_S100A L2
ENSG00000197442 MAP3K5 353000 sc-eQTL 7.87e-01 0.0262 0.0967 0.143 cMono_S100A L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 -722756 sc-eQTL 3.78e-01 0.0901 0.102 0.143 cMono_S100A L2
ENSG00000286646 AL121933.2 361432 sc-eQTL 9.33e-01 0.00835 0.0997 0.143 cMono_S100A L2
ENSG00000027697 IFNGR1 -73972 sc-eQTL 9.10e-01 -0.0128 0.113 0.155 gdT L2
ENSG00000029363 BCLAF1 855626 sc-eQTL 4.40e-01 -0.0766 0.099 0.155 gdT L2
ENSG00000112357 PEX7 322913 sc-eQTL 2.80e-01 0.154 0.142 0.155 gdT L2
ENSG00000112378 PERP -961942 sc-eQTL 1.98e-01 -0.16 0.124 0.155 gdT L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 -721737 sc-eQTL 9.29e-01 0.0062 0.0693 0.155 gdT L2
ENSG00000146410 MTFR2 895142 sc-eQTL 4.33e-01 -0.0858 0.109 0.155 gdT L2
ENSG00000197442 MAP3K5 353000 sc-eQTL 1.43e-01 0.214 0.146 0.155 gdT L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 -722756 sc-eQTL 8.16e-01 -0.0293 0.126 0.155 gdT L2
ENSG00000027697 IFNGR1 -73972 sc-eQTL 1.74e-01 -0.116 0.0847 0.144 intMono L2
ENSG00000029363 BCLAF1 855626 sc-eQTL 2.81e-01 -0.121 0.112 0.144 intMono L2
ENSG00000112357 PEX7 322913 sc-eQTL 3.31e-01 0.112 0.114 0.144 intMono L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 -721737 sc-eQTL 9.07e-01 -0.00859 0.0735 0.144 intMono L2
ENSG00000135525 MAP7 594658 sc-eQTL 6.08e-01 0.0581 0.113 0.144 intMono L2
ENSG00000197442 MAP3K5 353000 sc-eQTL 7.78e-01 -0.0337 0.12 0.144 intMono L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 -722756 sc-eQTL 6.96e-01 -0.0428 0.11 0.144 intMono L2
ENSG00000286646 AL121933.2 361432 sc-eQTL 3.66e-02 -0.263 0.125 0.144 intMono L2
ENSG00000027697 IFNGR1 -73972 sc-eQTL 2.69e-01 -0.111 0.101 0.145 ncMono L2
ENSG00000029363 BCLAF1 855626 sc-eQTL 9.75e-01 -0.00251 0.0783 0.145 ncMono L2
ENSG00000112357 PEX7 322913 sc-eQTL 2.97e-01 0.13 0.125 0.145 ncMono L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 -721737 sc-eQTL 1.93e-01 -0.116 0.0889 0.145 ncMono L2
ENSG00000135525 MAP7 594658 sc-eQTL 4.76e-02 0.218 0.109 0.145 ncMono L2
ENSG00000197442 MAP3K5 353000 sc-eQTL 2.85e-01 -0.124 0.116 0.145 ncMono L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 -722756 sc-eQTL 2.64e-01 -0.124 0.111 0.145 ncMono L2
ENSG00000286646 AL121933.2 361432 sc-eQTL 2.54e-01 -0.134 0.117 0.145 ncMono L2
ENSG00000027697 IFNGR1 -73972 sc-eQTL 7.55e-01 0.0386 0.124 0.136 pDC L2
ENSG00000029363 BCLAF1 855626 sc-eQTL 8.66e-01 -0.0157 0.0927 0.136 pDC L2
ENSG00000112357 PEX7 322913 sc-eQTL 5.79e-01 0.0755 0.136 0.136 pDC L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 -721737 sc-eQTL 5.42e-01 0.0699 0.114 0.136 pDC L2
ENSG00000135525 MAP7 594658 sc-eQTL 8.98e-01 -0.0122 0.095 0.136 pDC L2
ENSG00000197442 MAP3K5 353000 sc-eQTL 9.37e-01 0.012 0.152 0.136 pDC L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 -722756 sc-eQTL 7.71e-01 -0.0339 0.116 0.136 pDC L2
ENSG00000286646 AL121933.2 361432 sc-eQTL 8.05e-01 -0.0347 0.14 0.136 pDC L2
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000027697 IFNGR1 -73972 sc-eQTL 2.77e-01 0.111 0.102 0.143 B_Memory LOneK1K
ENSG00000029363 BCLAF1 855626 sc-eQTL 3.29e-01 0.0558 0.0571 0.143 B_Memory LOneK1K
ENSG00000112357 PEX7 322913 sc-eQTL 5.06e-01 0.0779 0.117 0.143 B_Memory LOneK1K
ENSG00000112378 PERP -961942 sc-eQTL 1.21e-01 0.169 0.108 0.143 B_Memory LOneK1K
ENSG00000118503 TNFAIP3 -721737 sc-eQTL 8.04e-01 -0.0178 0.0719 0.143 B_Memory LOneK1K
ENSG00000197442 MAP3K5 353000 sc-eQTL 3.93e-01 0.0814 0.095 0.143 B_Memory LOneK1K
ENSG00000237499 WAKMAR2 -722756 sc-eQTL 5.11e-01 0.08 0.121 0.143 B_Memory LOneK1K
ENSG00000027697 IFNGR1 -73972 sc-eQTL 2.45e-01 0.117 0.101 0.143 B_Naive LOneK1K
ENSG00000029363 BCLAF1 855626 sc-eQTL 7.81e-01 0.0129 0.0464 0.143 B_Naive LOneK1K
ENSG00000112357 PEX7 322913 sc-eQTL 3.17e-01 -0.123 0.123 0.143 B_Naive LOneK1K
ENSG00000112378 PERP -961942 sc-eQTL 4.97e-01 -0.0748 0.11 0.143 B_Naive LOneK1K
ENSG00000118503 TNFAIP3 -721737 sc-eQTL 6.84e-01 0.0235 0.0578 0.143 B_Naive LOneK1K
ENSG00000197442 MAP3K5 353000 sc-eQTL 7.90e-01 0.0226 0.0848 0.143 B_Naive LOneK1K
ENSG00000237499 WAKMAR2 -722756 sc-eQTL 6.09e-02 0.192 0.102 0.143 B_Naive LOneK1K
ENSG00000027697 IFNGR1 -73972 sc-eQTL 4.04e-02 -0.142 0.0689 0.143 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000029363 BCLAF1 855626 sc-eQTL 2.78e-01 -0.0703 0.0646 0.143 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000112357 PEX7 322913 sc-eQTL 4.78e-01 -0.0887 0.125 0.143 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000118503 TNFAIP3 -721737 sc-eQTL 9.18e-01 -0.00667 0.0644 0.143 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000135525 MAP7 594658 sc-eQTL 2.09e-01 -0.14 0.111 0.143 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000197442 MAP3K5 353000 sc-eQTL 8.22e-01 -0.017 0.0754 0.143 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000237499 WAKMAR2 -722756 sc-eQTL 8.21e-01 0.0175 0.0771 0.143 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000286646 AL121933.2 361432 sc-eQTL 2.41e-01 -0.105 0.0895 0.143 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000027697 IFNGR1 -73972 sc-eQTL 3.72e-02 -0.169 0.0807 0.144 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000029363 BCLAF1 855626 sc-eQTL 2.73e-01 -0.0808 0.0734 0.144 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000112357 PEX7 322913 sc-eQTL 3.53e-01 0.114 0.123 0.144 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000118503 TNFAIP3 -721737 sc-eQTL 9.92e-01 -0.000761 0.0761 0.144 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000135525 MAP7 594658 sc-eQTL 9.72e-02 0.197 0.118 0.144 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000197442 MAP3K5 353000 sc-eQTL 2.92e-01 -0.103 0.0974 0.144 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000237499 WAKMAR2 -722756 sc-eQTL 8.48e-01 -0.0196 0.102 0.144 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000286646 AL121933.2 361432 sc-eQTL 1.61e-02 -0.277 0.114 0.144 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000027697 IFNGR1 -73972 sc-eQTL 8.07e-01 -0.0185 0.0757 0.144 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000029363 BCLAF1 855626 sc-eQTL 2.99e-01 -0.0456 0.0438 0.144 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000112357 PEX7 322913 sc-eQTL 8.69e-01 0.021 0.128 0.144 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000112378 PERP -961942 sc-eQTL 6.38e-01 0.0373 0.0791 0.144 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000118503 TNFAIP3 -721737 sc-eQTL 5.58e-01 -0.0404 0.0689 0.144 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000197442 MAP3K5 353000 sc-eQTL 2.55e-02 0.207 0.0921 0.144 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000237499 WAKMAR2 -722756 sc-eQTL 9.21e-01 0.00952 0.0965 0.144 NK_CD56dim LOneK1K

Statistical fine-mapping results from Japan COVID-19 Task Force
(Shown only for PIP>0.001)
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
PIP (SuSiE)
PIP (FINEMAP)
MAF
ENSG00000027697 IFNGR1 -73972 pQTL 0.000289 -0.076 0.0209 0.0 0.0 0.161
ENSG00000027697 IFNGR1 -73972 eQTL 4.96e-09 -0.101 0.0172 0.0 0.0 0.172

Expression Modifier Score(EMS) for GTEx 49tissues
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Whole Blood
Muscle Skeletal
Liver
Brain Cerebellum
Prostate
Spleen
Skin Sun Exposed Lower leg
Artery Coronary
Esophagus Muscularis
Esophagus Gastroesophageal Junction
Artery Tibial
Heart Atrial Appendage
Nerve Tibial
Heart Left Ventricle
Adrenal Gland
Adipose Visceral Omentum
Pancreas
Lung
Pituitary
Brain Nucleus accumbens basal ganglia
Colon Transverse
Adipose Subcutaneous
Esophagus Mucosa
Brain Cortex
Thyroid
Stomach
Breast Mammary Tissue
Colon Sigmoid
Skin Not Sun Exposed Suprapubic
Testis
Artery Aorta
Brain Amygdala
Brain Anterior cingulate cortex BA24
Brain Caudate basal ganglia
Brain Cerebellar Hemisphere
Brain Frontal Cortex BA9
Brain Hippocampus
Brain Hypothalamus
Brain Putamen basal ganglia
Brain Spinal cord cervical c-1
Brain Substantia nigra
Cells Cultured fibroblasts
Cells EBV-transformed lymphocytes
Kidney Cortex
Minor Salivary Gland
Ovary
Small Intestine Terminal Ileum
Uterus
Vagina
ENSG00000027697 IFNGR1 -73972 2.69e-05 2.37e-05 4.42e-06 1.27e-05 3.82e-06 1.04e-05 2.99e-05 3.65e-06 2.08e-05 1.09e-05 2.71e-05 1.07e-05 3.65e-05 9.51e-06 5.36e-06 1.35e-05 1.08e-05 1.89e-05 5.97e-06 5.35e-06 1.01e-05 2.26e-05 2.22e-05 6.56e-06 3.21e-05 5.95e-06 9.55e-06 8.99e-06 2.23e-05 1.85e-05 1.35e-05 1.65e-06 2e-06 5.28e-06 8.98e-06 4.55e-06 2.4e-06 2.81e-06 3.6e-06 2.79e-06 1.58e-06 2.95e-05 2.88e-06 2.69e-07 2.04e-06 2.75e-06 3.42e-06 1.5e-06 1.36e-06