logo

Genes within 1Mb (chr6:137143081:G:A):

View on , UCSC , GTEx , gnomAD

Immune cell-type specific single cell cis-eQTLs in OASIS
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000027697 IFNGR1 -76368 sc-eQTL 3.52e-01 0.0897 0.0962 0.139 B L1
ENSG00000029363 BCLAF1 853230 sc-eQTL 5.08e-01 0.0284 0.0429 0.139 B L1
ENSG00000112357 PEX7 320517 sc-eQTL 7.91e-01 -0.0302 0.114 0.139 B L1
ENSG00000112378 PERP -964338 sc-eQTL 7.46e-01 0.0245 0.0755 0.139 B L1
ENSG00000118503 TNFAIP3 -724133 sc-eQTL 8.12e-01 0.0145 0.0608 0.139 B L1
ENSG00000197442 MAP3K5 350604 sc-eQTL 5.50e-01 0.0507 0.0847 0.139 B L1
ENSG00000237499 WAKMAR2 -725152 sc-eQTL 3.12e-02 0.205 0.0947 0.139 B L1
ENSG00000027697 IFNGR1 -76368 sc-eQTL 8.59e-01 0.0115 0.0646 0.139 CD4T L1
ENSG00000029363 BCLAF1 853230 sc-eQTL 8.92e-01 0.00668 0.0489 0.139 CD4T L1
ENSG00000112357 PEX7 320517 sc-eQTL 2.36e-01 -0.123 0.104 0.139 CD4T L1
ENSG00000112378 PERP -964338 sc-eQTL 2.67e-01 -0.0776 0.0696 0.139 CD4T L1
ENSG00000118503 TNFAIP3 -724133 sc-eQTL 9.09e-02 -0.11 0.065 0.139 CD4T L1
ENSG00000197442 MAP3K5 350604 sc-eQTL 2.56e-01 0.0567 0.0497 0.139 CD4T L1
ENSG00000237499 WAKMAR2 -725152 sc-eQTL 1.99e-01 0.106 0.0821 0.139 CD4T L1
ENSG00000027697 IFNGR1 -76368 sc-eQTL 6.35e-01 0.0347 0.073 0.139 CD8T L1
ENSG00000029363 BCLAF1 853230 sc-eQTL 5.98e-01 0.0261 0.0494 0.139 CD8T L1
ENSG00000112357 PEX7 320517 sc-eQTL 1.65e-01 0.169 0.121 0.139 CD8T L1
ENSG00000112378 PERP -964338 sc-eQTL 9.56e-01 -0.00441 0.0797 0.139 CD8T L1
ENSG00000118503 TNFAIP3 -724133 sc-eQTL 2.92e-02 -0.133 0.0608 0.139 CD8T L1
ENSG00000197442 MAP3K5 350604 sc-eQTL 1.71e-01 0.0889 0.0647 0.139 CD8T L1
ENSG00000237499 WAKMAR2 -725152 sc-eQTL 2.65e-01 -0.101 0.09 0.139 CD8T L1
ENSG00000027697 IFNGR1 -76368 sc-eQTL 1.60e-01 0.125 0.0886 0.14 DC L1
ENSG00000029363 BCLAF1 853230 sc-eQTL 7.22e-01 -0.0286 0.0801 0.14 DC L1
ENSG00000112357 PEX7 320517 sc-eQTL 7.09e-01 0.0468 0.125 0.14 DC L1
ENSG00000118503 TNFAIP3 -724133 sc-eQTL 5.87e-01 0.0517 0.095 0.14 DC L1
ENSG00000135525 MAP7 592262 sc-eQTL 9.41e-02 -0.172 0.102 0.14 DC L1
ENSG00000197442 MAP3K5 350604 sc-eQTL 4.42e-01 0.0759 0.0986 0.14 DC L1
ENSG00000237499 WAKMAR2 -725152 sc-eQTL 1.40e-01 -0.143 0.0964 0.14 DC L1
ENSG00000286646 AL121933.2 359036 sc-eQTL 1.87e-01 -0.17 0.128 0.14 DC L1
ENSG00000027697 IFNGR1 -76368 sc-eQTL 9.19e-02 -0.125 0.0736 0.139 Mono L1
ENSG00000029363 BCLAF1 853230 sc-eQTL 1.53e-01 -0.0904 0.063 0.139 Mono L1
ENSG00000112357 PEX7 320517 sc-eQTL 8.77e-01 -0.0193 0.125 0.139 Mono L1
ENSG00000118503 TNFAIP3 -724133 sc-eQTL 9.91e-01 0.000714 0.0628 0.139 Mono L1
ENSG00000135525 MAP7 592262 sc-eQTL 6.87e-01 -0.0443 0.11 0.139 Mono L1
ENSG00000197442 MAP3K5 350604 sc-eQTL 9.85e-01 -0.00135 0.0733 0.139 Mono L1
ENSG00000237499 WAKMAR2 -725152 sc-eQTL 7.77e-01 0.0221 0.0778 0.139 Mono L1
ENSG00000286646 AL121933.2 359036 sc-eQTL 4.17e-02 -0.18 0.0879 0.139 Mono L1
ENSG00000027697 IFNGR1 -76368 sc-eQTL 8.49e-01 -0.0154 0.0807 0.139 NK L1
ENSG00000029363 BCLAF1 853230 sc-eQTL 4.04e-01 -0.0358 0.0428 0.139 NK L1
ENSG00000112357 PEX7 320517 sc-eQTL 6.18e-01 0.0621 0.124 0.139 NK L1
ENSG00000112378 PERP -964338 sc-eQTL 9.82e-01 -0.00178 0.0785 0.139 NK L1
ENSG00000118503 TNFAIP3 -724133 sc-eQTL 5.06e-01 -0.0447 0.0671 0.139 NK L1
ENSG00000197442 MAP3K5 350604 sc-eQTL 1.93e-02 0.224 0.095 0.139 NK L1
ENSG00000237499 WAKMAR2 -725152 sc-eQTL 9.97e-01 0.000309 0.0952 0.139 NK L1
ENSG00000027697 IFNGR1 -76368 sc-eQTL 6.87e-01 0.0306 0.0758 0.139 Other_T L1
ENSG00000029363 BCLAF1 853230 sc-eQTL 7.92e-01 -0.0168 0.0636 0.139 Other_T L1
ENSG00000112357 PEX7 320517 sc-eQTL 1.60e-01 0.174 0.123 0.139 Other_T L1
ENSG00000112378 PERP -964338 sc-eQTL 5.43e-01 -0.0604 0.0992 0.139 Other_T L1
ENSG00000118503 TNFAIP3 -724133 sc-eQTL 3.60e-01 -0.0432 0.0471 0.139 Other_T L1
ENSG00000146410 MTFR2 892746 sc-eQTL 7.76e-01 -0.0204 0.0715 0.139 Other_T L1
ENSG00000197442 MAP3K5 350604 sc-eQTL 7.64e-02 0.161 0.0905 0.139 Other_T L1
ENSG00000237499 WAKMAR2 -725152 sc-eQTL 6.70e-01 -0.04 0.0937 0.139 Other_T L1
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000027697 IFNGR1 -76368 sc-eQTL 2.94e-01 -0.141 0.134 0.133 B_Activated L2
ENSG00000029363 BCLAF1 853230 sc-eQTL 6.41e-01 -0.051 0.109 0.133 B_Activated L2
ENSG00000112357 PEX7 320517 sc-eQTL 4.50e-01 -0.1 0.132 0.133 B_Activated L2
ENSG00000112378 PERP -964338 sc-eQTL 3.57e-01 -0.0632 0.0684 0.133 B_Activated L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 -724133 sc-eQTL 5.11e-01 0.0875 0.133 0.133 B_Activated L2
ENSG00000197442 MAP3K5 350604 sc-eQTL 4.95e-01 0.102 0.149 0.133 B_Activated L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 -725152 sc-eQTL 9.52e-01 0.00695 0.116 0.133 B_Activated L2
ENSG00000027697 IFNGR1 -76368 sc-eQTL 5.06e-03 0.323 0.114 0.139 B_Intermediate L2
ENSG00000029363 BCLAF1 853230 sc-eQTL 1.85e-01 0.0875 0.0658 0.139 B_Intermediate L2
ENSG00000112357 PEX7 320517 sc-eQTL 7.13e-01 0.0448 0.121 0.139 B_Intermediate L2
ENSG00000112378 PERP -964338 sc-eQTL 5.59e-01 -0.0647 0.111 0.139 B_Intermediate L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 -724133 sc-eQTL 8.28e-01 -0.0188 0.0869 0.139 B_Intermediate L2
ENSG00000197442 MAP3K5 350604 sc-eQTL 2.01e-01 0.134 0.105 0.139 B_Intermediate L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 -725152 sc-eQTL 5.53e-01 -0.0731 0.123 0.139 B_Intermediate L2
ENSG00000027697 IFNGR1 -76368 sc-eQTL 4.57e-01 0.0931 0.125 0.138 B_Memory L2
ENSG00000029363 BCLAF1 853230 sc-eQTL 5.18e-01 0.0481 0.0743 0.138 B_Memory L2
ENSG00000112357 PEX7 320517 sc-eQTL 1.80e-01 0.169 0.126 0.138 B_Memory L2
ENSG00000112378 PERP -964338 sc-eQTL 1.03e-01 0.193 0.118 0.138 B_Memory L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 -724133 sc-eQTL 1.70e-01 0.112 0.0815 0.138 B_Memory L2
ENSG00000197442 MAP3K5 350604 sc-eQTL 4.77e-01 -0.0795 0.112 0.138 B_Memory L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 -725152 sc-eQTL 3.66e-01 0.11 0.122 0.138 B_Memory L2
ENSG00000027697 IFNGR1 -76368 sc-eQTL 7.48e-01 0.0315 0.0979 0.139 B_Naive1 L2
ENSG00000029363 BCLAF1 853230 sc-eQTL 9.37e-01 0.00442 0.0559 0.139 B_Naive1 L2
ENSG00000112357 PEX7 320517 sc-eQTL 8.85e-01 -0.0187 0.129 0.139 B_Naive1 L2
ENSG00000112378 PERP -964338 sc-eQTL 7.63e-01 -0.0342 0.113 0.139 B_Naive1 L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 -724133 sc-eQTL 2.44e-01 0.0763 0.0653 0.139 B_Naive1 L2
ENSG00000197442 MAP3K5 350604 sc-eQTL 8.59e-01 -0.0164 0.0921 0.139 B_Naive1 L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 -725152 sc-eQTL 1.44e-01 0.15 0.102 0.139 B_Naive1 L2
ENSG00000027697 IFNGR1 -76368 sc-eQTL 6.36e-02 0.218 0.117 0.137 B_Naive2 L2
ENSG00000029363 BCLAF1 853230 sc-eQTL 4.09e-01 0.0566 0.0683 0.137 B_Naive2 L2
ENSG00000112357 PEX7 320517 sc-eQTL 2.11e-01 -0.162 0.129 0.137 B_Naive2 L2
ENSG00000112378 PERP -964338 sc-eQTL 6.12e-01 -0.0477 0.094 0.137 B_Naive2 L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 -724133 sc-eQTL 7.10e-01 0.035 0.094 0.137 B_Naive2 L2
ENSG00000197442 MAP3K5 350604 sc-eQTL 8.08e-01 0.0243 0.1 0.137 B_Naive2 L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 -725152 sc-eQTL 1.23e-01 0.187 0.121 0.137 B_Naive2 L2
ENSG00000027697 IFNGR1 -76368 sc-eQTL 5.14e-02 0.209 0.107 0.143 CD4_CTL L2
ENSG00000029363 BCLAF1 853230 sc-eQTL 5.84e-01 0.0525 0.0956 0.143 CD4_CTL L2
ENSG00000112357 PEX7 320517 sc-eQTL 3.74e-01 -0.106 0.119 0.143 CD4_CTL L2
ENSG00000112378 PERP -964338 sc-eQTL 2.66e-01 -0.135 0.121 0.143 CD4_CTL L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 -724133 sc-eQTL 7.23e-01 0.0251 0.0707 0.143 CD4_CTL L2
ENSG00000197442 MAP3K5 350604 sc-eQTL 8.17e-01 -0.0261 0.113 0.143 CD4_CTL L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 -725152 sc-eQTL 9.19e-01 -0.0112 0.11 0.143 CD4_CTL L2
ENSG00000027697 IFNGR1 -76368 sc-eQTL 7.20e-01 0.0222 0.062 0.139 CD4_Naive L2
ENSG00000029363 BCLAF1 853230 sc-eQTL 6.33e-01 -0.0238 0.0497 0.139 CD4_Naive L2
ENSG00000112357 PEX7 320517 sc-eQTL 1.74e-01 -0.159 0.117 0.139 CD4_Naive L2
ENSG00000112378 PERP -964338 sc-eQTL 8.64e-01 0.0166 0.0966 0.139 CD4_Naive L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 -724133 sc-eQTL 1.38e-01 -0.1 0.0674 0.139 CD4_Naive L2
ENSG00000197442 MAP3K5 350604 sc-eQTL 6.54e-01 0.0223 0.0498 0.139 CD4_Naive L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 -725152 sc-eQTL 2.92e-01 0.0925 0.0876 0.139 CD4_Naive L2
ENSG00000027697 IFNGR1 -76368 sc-eQTL 7.81e-01 0.024 0.0862 0.139 CD4_TCM L2
ENSG00000029363 BCLAF1 853230 sc-eQTL 8.44e-01 0.0107 0.0544 0.139 CD4_TCM L2
ENSG00000112357 PEX7 320517 sc-eQTL 8.34e-01 -0.0265 0.127 0.139 CD4_TCM L2
ENSG00000112378 PERP -964338 sc-eQTL 7.83e-01 -0.0294 0.107 0.139 CD4_TCM L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 -724133 sc-eQTL 3.22e-01 -0.0615 0.062 0.139 CD4_TCM L2
ENSG00000197442 MAP3K5 350604 sc-eQTL 3.68e-01 0.0637 0.0706 0.139 CD4_TCM L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 -725152 sc-eQTL 2.53e-01 0.0994 0.0868 0.139 CD4_TCM L2
ENSG00000027697 IFNGR1 -76368 sc-eQTL 2.49e-01 -0.112 0.0965 0.139 CD4_TEM L2
ENSG00000029363 BCLAF1 853230 sc-eQTL 4.04e-01 0.0572 0.0685 0.139 CD4_TEM L2
ENSG00000112357 PEX7 320517 sc-eQTL 2.72e-01 -0.137 0.125 0.139 CD4_TEM L2
ENSG00000112378 PERP -964338 sc-eQTL 2.78e-01 -0.11 0.101 0.139 CD4_TEM L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 -724133 sc-eQTL 7.75e-01 -0.0184 0.0643 0.139 CD4_TEM L2
ENSG00000197442 MAP3K5 350604 sc-eQTL 2.57e-01 0.113 0.099 0.139 CD4_TEM L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 -725152 sc-eQTL 3.14e-01 0.104 0.103 0.139 CD4_TEM L2
ENSG00000027697 IFNGR1 -76368 sc-eQTL 4.13e-01 0.0714 0.0871 0.139 CD8_CTL L2
ENSG00000029363 BCLAF1 853230 sc-eQTL 3.94e-01 0.0496 0.0581 0.139 CD8_CTL L2
ENSG00000112357 PEX7 320517 sc-eQTL 4.02e-01 0.101 0.12 0.139 CD8_CTL L2
ENSG00000112378 PERP -964338 sc-eQTL 9.91e-01 -0.00133 0.115 0.139 CD8_CTL L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 -724133 sc-eQTL 4.58e-01 -0.0545 0.0733 0.139 CD8_CTL L2
ENSG00000197442 MAP3K5 350604 sc-eQTL 9.11e-01 -0.0116 0.104 0.139 CD8_CTL L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 -725152 sc-eQTL 6.45e-01 -0.0475 0.103 0.139 CD8_CTL L2
ENSG00000027697 IFNGR1 -76368 sc-eQTL 8.90e-01 0.0121 0.0872 0.139 CD8_Naive L2
ENSG00000029363 BCLAF1 853230 sc-eQTL 6.86e-01 0.0246 0.0609 0.139 CD8_Naive L2
ENSG00000112357 PEX7 320517 sc-eQTL 9.07e-01 0.0148 0.126 0.139 CD8_Naive L2
ENSG00000112378 PERP -964338 sc-eQTL 3.08e-01 0.098 0.0959 0.139 CD8_Naive L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 -724133 sc-eQTL 6.50e-02 -0.126 0.0677 0.139 CD8_Naive L2
ENSG00000197442 MAP3K5 350604 sc-eQTL 7.62e-03 0.214 0.0795 0.139 CD8_Naive L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 -725152 sc-eQTL 6.51e-01 -0.0457 0.101 0.139 CD8_Naive L2
ENSG00000027697 IFNGR1 -76368 sc-eQTL 2.24e-01 -0.147 0.121 0.132 CD8_TCM L2
ENSG00000029363 BCLAF1 853230 sc-eQTL 1.70e-02 0.216 0.0896 0.132 CD8_TCM L2
ENSG00000112357 PEX7 320517 sc-eQTL 4.13e-01 0.114 0.139 0.132 CD8_TCM L2
ENSG00000112378 PERP -964338 sc-eQTL 5.60e-01 -0.0794 0.136 0.132 CD8_TCM L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 -724133 sc-eQTL 8.28e-01 0.0143 0.0657 0.132 CD8_TCM L2
ENSG00000197442 MAP3K5 350604 sc-eQTL 3.28e-01 0.115 0.117 0.132 CD8_TCM L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 -725152 sc-eQTL 7.30e-01 -0.0415 0.12 0.132 CD8_TCM L2
ENSG00000027697 IFNGR1 -76368 sc-eQTL 8.29e-01 0.0236 0.109 0.144 CD8_TEM L2
ENSG00000029363 BCLAF1 853230 sc-eQTL 3.08e-02 0.222 0.102 0.144 CD8_TEM L2
ENSG00000112357 PEX7 320517 sc-eQTL 3.46e-01 0.119 0.125 0.144 CD8_TEM L2
ENSG00000112378 PERP -964338 sc-eQTL 4.18e-01 -0.106 0.131 0.144 CD8_TEM L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 -724133 sc-eQTL 3.46e-01 -0.076 0.0804 0.144 CD8_TEM L2
ENSG00000197442 MAP3K5 350604 sc-eQTL 7.08e-02 0.224 0.124 0.144 CD8_TEM L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 -725152 sc-eQTL 9.60e-01 -0.006 0.12 0.144 CD8_TEM L2
ENSG00000027697 IFNGR1 -76368 sc-eQTL 7.22e-01 0.0315 0.0885 0.141 MAIT L2
ENSG00000029363 BCLAF1 853230 sc-eQTL 6.37e-01 -0.0348 0.0735 0.141 MAIT L2
ENSG00000112357 PEX7 320517 sc-eQTL 7.45e-01 0.0391 0.12 0.141 MAIT L2
ENSG00000112378 PERP -964338 sc-eQTL 5.25e-01 -0.0795 0.125 0.141 MAIT L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 -724133 sc-eQTL 5.32e-01 -0.0373 0.0595 0.141 MAIT L2
ENSG00000146410 MTFR2 892746 sc-eQTL 7.71e-01 0.0289 0.0992 0.141 MAIT L2
ENSG00000197442 MAP3K5 350604 sc-eQTL 7.07e-01 0.039 0.104 0.141 MAIT L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 -725152 sc-eQTL 9.93e-01 -0.00104 0.11 0.141 MAIT L2
ENSG00000027697 IFNGR1 -76368 sc-eQTL 9.39e-01 -0.00746 0.0967 0.142 NK_CD56bright L2
ENSG00000029363 BCLAF1 853230 sc-eQTL 3.64e-01 0.0648 0.0712 0.142 NK_CD56bright L2
ENSG00000112357 PEX7 320517 sc-eQTL 5.77e-01 0.0704 0.126 0.142 NK_CD56bright L2
ENSG00000112378 PERP -964338 sc-eQTL 6.56e-01 -0.0503 0.113 0.142 NK_CD56bright L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 -724133 sc-eQTL 8.78e-01 0.0111 0.072 0.142 NK_CD56bright L2
ENSG00000197442 MAP3K5 350604 sc-eQTL 2.91e-02 0.238 0.108 0.142 NK_CD56bright L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 -725152 sc-eQTL 5.15e-01 0.0747 0.115 0.142 NK_CD56bright L2
ENSG00000027697 IFNGR1 -76368 sc-eQTL 6.94e-01 -0.0292 0.0741 0.14 NK_CD56dim L2
ENSG00000029363 BCLAF1 853230 sc-eQTL 9.36e-01 -0.0039 0.0485 0.14 NK_CD56dim L2
ENSG00000112357 PEX7 320517 sc-eQTL 5.09e-01 0.0844 0.128 0.14 NK_CD56dim L2
ENSG00000112378 PERP -964338 sc-eQTL 8.47e-01 -0.0173 0.0898 0.14 NK_CD56dim L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 -724133 sc-eQTL 7.47e-01 -0.0226 0.0698 0.14 NK_CD56dim L2
ENSG00000197442 MAP3K5 350604 sc-eQTL 1.36e-01 0.15 0.1 0.14 NK_CD56dim L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 -725152 sc-eQTL 7.23e-01 -0.0371 0.105 0.14 NK_CD56dim L2
ENSG00000027697 IFNGR1 -76368 sc-eQTL 5.67e-01 -0.054 0.0941 0.144 NK_HLA L2
ENSG00000029363 BCLAF1 853230 sc-eQTL 8.67e-01 0.0134 0.0797 0.144 NK_HLA L2
ENSG00000112357 PEX7 320517 sc-eQTL 8.86e-01 -0.0172 0.12 0.144 NK_HLA L2
ENSG00000112378 PERP -964338 sc-eQTL 3.95e-01 0.0824 0.0968 0.144 NK_HLA L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 -724133 sc-eQTL 9.80e-01 0.00188 0.0746 0.144 NK_HLA L2
ENSG00000197442 MAP3K5 350604 sc-eQTL 4.48e-01 0.09 0.118 0.144 NK_HLA L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 -725152 sc-eQTL 3.93e-02 0.247 0.119 0.144 NK_HLA L2
ENSG00000027697 IFNGR1 -76368 sc-eQTL 8.99e-01 -0.00998 0.0783 0.14 NK_cytokine L2
ENSG00000029363 BCLAF1 853230 sc-eQTL 6.15e-02 -0.109 0.058 0.14 NK_cytokine L2
ENSG00000112357 PEX7 320517 sc-eQTL 1.74e-01 -0.167 0.122 0.14 NK_cytokine L2
ENSG00000112378 PERP -964338 sc-eQTL 8.17e-01 0.0216 0.0933 0.14 NK_cytokine L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 -724133 sc-eQTL 9.09e-01 -0.00803 0.0699 0.14 NK_cytokine L2
ENSG00000197442 MAP3K5 350604 sc-eQTL 7.40e-02 0.171 0.0954 0.14 NK_cytokine L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 -725152 sc-eQTL 7.12e-01 0.0389 0.105 0.14 NK_cytokine L2
ENSG00000027697 IFNGR1 -76368 sc-eQTL 5.93e-01 0.0884 0.165 0.119 PB L2
ENSG00000029363 BCLAF1 853230 sc-eQTL 3.31e-01 -0.138 0.142 0.119 PB L2
ENSG00000112357 PEX7 320517 sc-eQTL 7.67e-01 -0.0503 0.169 0.119 PB L2
ENSG00000112378 PERP -964338 sc-eQTL 1.19e-01 -0.164 0.105 0.119 PB L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 -724133 sc-eQTL 9.67e-01 0.00532 0.128 0.119 PB L2
ENSG00000197442 MAP3K5 350604 sc-eQTL 1.68e-01 -0.201 0.145 0.119 PB L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 -725152 sc-eQTL 5.71e-01 -0.0875 0.154 0.119 PB L2
ENSG00000027697 IFNGR1 -76368 sc-eQTL 6.41e-01 -0.0468 0.1 0.137 Pro_T L2
ENSG00000029363 BCLAF1 853230 sc-eQTL 2.95e-01 0.109 0.104 0.137 Pro_T L2
ENSG00000112357 PEX7 320517 sc-eQTL 5.43e-01 0.0739 0.121 0.137 Pro_T L2
ENSG00000112378 PERP -964338 sc-eQTL 3.29e-01 -0.0944 0.0965 0.137 Pro_T L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 -724133 sc-eQTL 8.13e-01 -0.0145 0.061 0.137 Pro_T L2
ENSG00000146410 MTFR2 892746 sc-eQTL 8.69e-01 0.0139 0.0845 0.137 Pro_T L2
ENSG00000197442 MAP3K5 350604 sc-eQTL 3.64e-01 0.107 0.118 0.137 Pro_T L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 -725152 sc-eQTL 7.43e-02 -0.211 0.117 0.137 Pro_T L2
ENSG00000027697 IFNGR1 -76368 sc-eQTL 6.94e-01 -0.045 0.114 0.139 Treg L2
ENSG00000029363 BCLAF1 853230 sc-eQTL 2.00e-01 0.0943 0.0734 0.139 Treg L2
ENSG00000112357 PEX7 320517 sc-eQTL 9.66e-01 -0.00515 0.121 0.139 Treg L2
ENSG00000112378 PERP -964338 sc-eQTL 1.64e-01 -0.181 0.13 0.139 Treg L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 -724133 sc-eQTL 4.33e-01 -0.0569 0.0724 0.139 Treg L2
ENSG00000197442 MAP3K5 350604 sc-eQTL 5.43e-01 0.0478 0.0785 0.139 Treg L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 -725152 sc-eQTL 1.15e-01 0.174 0.11 0.139 Treg L2
ENSG00000027697 IFNGR1 -76368 sc-eQTL 1.65e-01 0.139 0.0997 0.144 cDC L2
ENSG00000029363 BCLAF1 853230 sc-eQTL 1.00e+00 4.2e-05 0.101 0.144 cDC L2
ENSG00000112357 PEX7 320517 sc-eQTL 6.72e-01 0.055 0.13 0.144 cDC L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 -724133 sc-eQTL 6.72e-01 0.0419 0.0988 0.144 cDC L2
ENSG00000135525 MAP7 592262 sc-eQTL 2.61e-01 -0.13 0.115 0.144 cDC L2
ENSG00000197442 MAP3K5 350604 sc-eQTL 4.06e-01 -0.0846 0.101 0.144 cDC L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 -725152 sc-eQTL 2.55e-01 -0.147 0.128 0.144 cDC L2
ENSG00000286646 AL121933.2 359036 sc-eQTL 4.04e-01 -0.111 0.132 0.144 cDC L2
ENSG00000027697 IFNGR1 -76368 sc-eQTL 4.83e-02 -0.136 0.0685 0.139 cMono_IL1B L2
ENSG00000029363 BCLAF1 853230 sc-eQTL 5.02e-01 -0.0498 0.074 0.139 cMono_IL1B L2
ENSG00000112357 PEX7 320517 sc-eQTL 2.31e-01 -0.149 0.124 0.139 cMono_IL1B L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 -724133 sc-eQTL 9.17e-01 0.0078 0.0744 0.139 cMono_IL1B L2
ENSG00000135525 MAP7 592262 sc-eQTL 3.89e-01 -0.0922 0.107 0.139 cMono_IL1B L2
ENSG00000197442 MAP3K5 350604 sc-eQTL 6.96e-01 -0.0302 0.0773 0.139 cMono_IL1B L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 -725152 sc-eQTL 9.56e-01 0.00435 0.0794 0.139 cMono_IL1B L2
ENSG00000286646 AL121933.2 359036 sc-eQTL 3.44e-02 -0.21 0.0984 0.139 cMono_IL1B L2
ENSG00000027697 IFNGR1 -76368 sc-eQTL 3.37e-01 -0.0774 0.0804 0.139 cMono_S100A L2
ENSG00000029363 BCLAF1 853230 sc-eQTL 6.83e-02 -0.15 0.0821 0.139 cMono_S100A L2
ENSG00000112357 PEX7 320517 sc-eQTL 4.61e-01 -0.0953 0.129 0.139 cMono_S100A L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 -724133 sc-eQTL 4.80e-01 -0.0506 0.0715 0.139 cMono_S100A L2
ENSG00000135525 MAP7 592262 sc-eQTL 3.51e-01 -0.112 0.12 0.139 cMono_S100A L2
ENSG00000197442 MAP3K5 350604 sc-eQTL 9.95e-01 0.000621 0.0973 0.139 cMono_S100A L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 -725152 sc-eQTL 4.34e-01 0.0804 0.103 0.139 cMono_S100A L2
ENSG00000286646 AL121933.2 359036 sc-eQTL 8.11e-01 0.024 0.1 0.139 cMono_S100A L2
ENSG00000027697 IFNGR1 -76368 sc-eQTL 8.76e-01 -0.0177 0.113 0.148 gdT L2
ENSG00000029363 BCLAF1 853230 sc-eQTL 4.25e-01 -0.0797 0.0997 0.148 gdT L2
ENSG00000112357 PEX7 320517 sc-eQTL 2.80e-01 0.155 0.143 0.148 gdT L2
ENSG00000112378 PERP -964338 sc-eQTL 2.40e-01 -0.147 0.125 0.148 gdT L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 -724133 sc-eQTL 8.91e-01 0.00955 0.0698 0.148 gdT L2
ENSG00000146410 MTFR2 892746 sc-eQTL 5.53e-01 -0.0654 0.11 0.148 gdT L2
ENSG00000197442 MAP3K5 350604 sc-eQTL 1.03e-01 0.24 0.146 0.148 gdT L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 -725152 sc-eQTL 8.30e-01 -0.0272 0.126 0.148 gdT L2
ENSG00000027697 IFNGR1 -76368 sc-eQTL 2.65e-01 -0.0954 0.0854 0.14 intMono L2
ENSG00000029363 BCLAF1 853230 sc-eQTL 2.00e-01 -0.145 0.113 0.14 intMono L2
ENSG00000112357 PEX7 320517 sc-eQTL 3.43e-01 0.109 0.115 0.14 intMono L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 -724133 sc-eQTL 7.68e-01 -0.0219 0.074 0.14 intMono L2
ENSG00000135525 MAP7 592262 sc-eQTL 5.09e-01 0.075 0.114 0.14 intMono L2
ENSG00000197442 MAP3K5 350604 sc-eQTL 8.82e-01 -0.018 0.12 0.14 intMono L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 -725152 sc-eQTL 5.51e-01 -0.0658 0.11 0.14 intMono L2
ENSG00000286646 AL121933.2 359036 sc-eQTL 3.10e-02 -0.273 0.126 0.14 intMono L2
ENSG00000027697 IFNGR1 -76368 sc-eQTL 3.47e-01 -0.0957 0.101 0.14 ncMono L2
ENSG00000029363 BCLAF1 853230 sc-eQTL 8.83e-01 0.0117 0.079 0.14 ncMono L2
ENSG00000112357 PEX7 320517 sc-eQTL 1.62e-01 0.176 0.125 0.14 ncMono L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 -724133 sc-eQTL 1.13e-01 -0.142 0.0894 0.14 ncMono L2
ENSG00000135525 MAP7 592262 sc-eQTL 8.78e-02 0.189 0.11 0.14 ncMono L2
ENSG00000197442 MAP3K5 350604 sc-eQTL 4.64e-01 -0.0856 0.117 0.14 ncMono L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 -725152 sc-eQTL 3.34e-01 -0.109 0.112 0.14 ncMono L2
ENSG00000286646 AL121933.2 359036 sc-eQTL 2.45e-01 -0.138 0.118 0.14 ncMono L2
ENSG00000027697 IFNGR1 -76368 sc-eQTL 5.81e-01 0.0694 0.125 0.13 pDC L2
ENSG00000029363 BCLAF1 853230 sc-eQTL 6.26e-01 -0.0459 0.0941 0.13 pDC L2
ENSG00000112357 PEX7 320517 sc-eQTL 9.06e-01 -0.0163 0.138 0.13 pDC L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 -724133 sc-eQTL 7.86e-01 0.0317 0.116 0.13 pDC L2
ENSG00000135525 MAP7 592262 sc-eQTL 6.64e-01 -0.042 0.0964 0.13 pDC L2
ENSG00000197442 MAP3K5 350604 sc-eQTL 7.94e-01 0.0404 0.154 0.13 pDC L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 -725152 sc-eQTL 4.93e-01 -0.0811 0.118 0.13 pDC L2
ENSG00000286646 AL121933.2 359036 sc-eQTL 9.11e-01 -0.016 0.142 0.13 pDC L2
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000027697 IFNGR1 -76368 sc-eQTL 2.03e-01 0.13 0.102 0.139 B_Memory LOneK1K
ENSG00000029363 BCLAF1 853230 sc-eQTL 3.64e-01 0.0523 0.0575 0.139 B_Memory LOneK1K
ENSG00000112357 PEX7 320517 sc-eQTL 5.02e-01 0.0792 0.118 0.139 B_Memory LOneK1K
ENSG00000112378 PERP -964338 sc-eQTL 7.59e-02 0.194 0.109 0.139 B_Memory LOneK1K
ENSG00000118503 TNFAIP3 -724133 sc-eQTL 8.31e-01 -0.0154 0.0723 0.139 B_Memory LOneK1K
ENSG00000197442 MAP3K5 350604 sc-eQTL 5.11e-01 0.063 0.0957 0.139 B_Memory LOneK1K
ENSG00000237499 WAKMAR2 -725152 sc-eQTL 4.93e-01 0.084 0.122 0.139 B_Memory LOneK1K
ENSG00000027697 IFNGR1 -76368 sc-eQTL 2.80e-01 0.11 0.101 0.139 B_Naive LOneK1K
ENSG00000029363 BCLAF1 853230 sc-eQTL 9.77e-01 0.00136 0.0467 0.139 B_Naive LOneK1K
ENSG00000112357 PEX7 320517 sc-eQTL 3.37e-01 -0.119 0.124 0.139 B_Naive LOneK1K
ENSG00000112378 PERP -964338 sc-eQTL 6.27e-01 -0.0539 0.111 0.139 B_Naive LOneK1K
ENSG00000118503 TNFAIP3 -724133 sc-eQTL 5.29e-01 0.0367 0.0582 0.139 B_Naive LOneK1K
ENSG00000197442 MAP3K5 350604 sc-eQTL 9.06e-01 0.0101 0.0854 0.139 B_Naive LOneK1K
ENSG00000237499 WAKMAR2 -725152 sc-eQTL 1.80e-02 0.244 0.102 0.139 B_Naive LOneK1K
ENSG00000027697 IFNGR1 -76368 sc-eQTL 9.08e-02 -0.118 0.0694 0.139 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000029363 BCLAF1 853230 sc-eQTL 2.05e-01 -0.0824 0.0648 0.139 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000112357 PEX7 320517 sc-eQTL 3.71e-01 -0.112 0.125 0.139 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000118503 TNFAIP3 -724133 sc-eQTL 6.87e-01 -0.0261 0.0646 0.139 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000135525 MAP7 592262 sc-eQTL 2.85e-01 -0.12 0.112 0.139 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000197442 MAP3K5 350604 sc-eQTL 7.92e-01 -0.02 0.0758 0.139 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000237499 WAKMAR2 -725152 sc-eQTL 9.17e-01 0.00806 0.0775 0.139 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000286646 AL121933.2 359036 sc-eQTL 2.16e-01 -0.111 0.0898 0.139 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000027697 IFNGR1 -76368 sc-eQTL 7.27e-02 -0.147 0.0815 0.14 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000029363 BCLAF1 853230 sc-eQTL 2.97e-01 -0.0775 0.074 0.14 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000112357 PEX7 320517 sc-eQTL 2.38e-01 0.146 0.124 0.14 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000118503 TNFAIP3 -724133 sc-eQTL 7.37e-01 -0.0258 0.0768 0.14 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000135525 MAP7 592262 sc-eQTL 1.21e-01 0.186 0.119 0.14 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000197442 MAP3K5 350604 sc-eQTL 4.58e-01 -0.073 0.0983 0.14 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000237499 WAKMAR2 -725152 sc-eQTL 7.36e-01 -0.0347 0.103 0.14 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000286646 AL121933.2 359036 sc-eQTL 1.22e-02 -0.291 0.115 0.14 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000027697 IFNGR1 -76368 sc-eQTL 8.60e-01 -0.0135 0.0761 0.14 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000029363 BCLAF1 853230 sc-eQTL 3.29e-01 -0.0431 0.0441 0.14 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000112357 PEX7 320517 sc-eQTL 9.68e-01 0.00516 0.128 0.14 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000112378 PERP -964338 sc-eQTL 6.22e-01 0.0393 0.0796 0.14 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000118503 TNFAIP3 -724133 sc-eQTL 5.55e-01 -0.0409 0.0693 0.14 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000197442 MAP3K5 350604 sc-eQTL 3.12e-02 0.201 0.0927 0.14 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000237499 WAKMAR2 -725152 sc-eQTL 9.90e-01 0.00119 0.097 0.14 NK_CD56dim LOneK1K

Statistical fine-mapping results from Japan COVID-19 Task Force
(Shown only for PIP>0.001)
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
PIP (SuSiE)
PIP (FINEMAP)
MAF
ENSG00000027697 IFNGR1 -76368 pQTL 0.000142 -0.08 0.021 0.0 0.0 0.16
ENSG00000027697 IFNGR1 -76368 eQTL 3e-09 -0.103 0.0172 0.0 0.0 0.171

Expression Modifier Score(EMS) for GTEx 49tissues
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Whole Blood
Muscle Skeletal
Liver
Brain Cerebellum
Prostate
Spleen
Skin Sun Exposed Lower leg
Artery Coronary
Esophagus Muscularis
Esophagus Gastroesophageal Junction
Artery Tibial
Heart Atrial Appendage
Nerve Tibial
Heart Left Ventricle
Adrenal Gland
Adipose Visceral Omentum
Pancreas
Lung
Pituitary
Brain Nucleus accumbens basal ganglia
Colon Transverse
Adipose Subcutaneous
Esophagus Mucosa
Brain Cortex
Thyroid
Stomach
Breast Mammary Tissue
Colon Sigmoid
Skin Not Sun Exposed Suprapubic
Testis
Artery Aorta
Brain Amygdala
Brain Anterior cingulate cortex BA24
Brain Caudate basal ganglia
Brain Cerebellar Hemisphere
Brain Frontal Cortex BA9
Brain Hippocampus
Brain Hypothalamus
Brain Putamen basal ganglia
Brain Spinal cord cervical c-1
Brain Substantia nigra
Cells Cultured fibroblasts
Cells EBV-transformed lymphocytes
Kidney Cortex
Minor Salivary Gland
Ovary
Small Intestine Terminal Ileum
Uterus
Vagina
ENSG00000027697 IFNGR1 -76368 7.88e-06 5.83e-06 1.22e-06 3.42e-06 1.87e-06 2.67e-06 8.29e-06 1.09e-06 4.86e-06 2.82e-06 5.94e-06 3.37e-06 9.33e-06 2.02e-06 1.54e-06 3.98e-06 3e-06 3.89e-06 2.64e-06 1.55e-06 3.16e-06 7.22e-06 4.6e-06 1.96e-06 9.22e-06 2.05e-06 2.35e-06 1.84e-06 5.66e-06 7.35e-06 3.29e-06 4.46e-07 9.66e-07 2.31e-06 1.98e-06 1.17e-06 1.09e-06 6.96e-07 1.41e-06 4.07e-07 3.75e-07 6.1e-06 1.61e-06 1.44e-07 7.28e-07 1.2e-06 1.08e-06 6.58e-07 3.74e-07