logo

Genes within 1Mb (chr6:137141980:CT:C):

View on , UCSC , GTEx , gnomAD

Immune cell-type specific single cell cis-eQTLs in OASIS
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000027697 IFNGR1 -77469 sc-eQTL 3.52e-01 0.0897 0.0962 0.139 B L1
ENSG00000029363 BCLAF1 852129 sc-eQTL 5.08e-01 0.0284 0.0429 0.139 B L1
ENSG00000112357 PEX7 319416 sc-eQTL 7.91e-01 -0.0302 0.114 0.139 B L1
ENSG00000112378 PERP -965439 sc-eQTL 7.46e-01 0.0245 0.0755 0.139 B L1
ENSG00000118503 TNFAIP3 -725234 sc-eQTL 8.12e-01 0.0145 0.0608 0.139 B L1
ENSG00000197442 MAP3K5 349503 sc-eQTL 5.50e-01 0.0507 0.0847 0.139 B L1
ENSG00000237499 WAKMAR2 -726253 sc-eQTL 3.12e-02 0.205 0.0947 0.139 B L1
ENSG00000027697 IFNGR1 -77469 sc-eQTL 8.59e-01 0.0115 0.0646 0.139 CD4T L1
ENSG00000029363 BCLAF1 852129 sc-eQTL 8.92e-01 0.00668 0.0489 0.139 CD4T L1
ENSG00000112357 PEX7 319416 sc-eQTL 2.36e-01 -0.123 0.104 0.139 CD4T L1
ENSG00000112378 PERP -965439 sc-eQTL 2.67e-01 -0.0776 0.0696 0.139 CD4T L1
ENSG00000118503 TNFAIP3 -725234 sc-eQTL 9.09e-02 -0.11 0.065 0.139 CD4T L1
ENSG00000197442 MAP3K5 349503 sc-eQTL 2.56e-01 0.0567 0.0497 0.139 CD4T L1
ENSG00000237499 WAKMAR2 -726253 sc-eQTL 1.99e-01 0.106 0.0821 0.139 CD4T L1
ENSG00000027697 IFNGR1 -77469 sc-eQTL 6.35e-01 0.0347 0.073 0.139 CD8T L1
ENSG00000029363 BCLAF1 852129 sc-eQTL 5.98e-01 0.0261 0.0494 0.139 CD8T L1
ENSG00000112357 PEX7 319416 sc-eQTL 1.65e-01 0.169 0.121 0.139 CD8T L1
ENSG00000112378 PERP -965439 sc-eQTL 9.56e-01 -0.00441 0.0797 0.139 CD8T L1
ENSG00000118503 TNFAIP3 -725234 sc-eQTL 2.92e-02 -0.133 0.0608 0.139 CD8T L1
ENSG00000197442 MAP3K5 349503 sc-eQTL 1.71e-01 0.0889 0.0647 0.139 CD8T L1
ENSG00000237499 WAKMAR2 -726253 sc-eQTL 2.65e-01 -0.101 0.09 0.139 CD8T L1
ENSG00000027697 IFNGR1 -77469 sc-eQTL 1.60e-01 0.125 0.0886 0.14 DC L1
ENSG00000029363 BCLAF1 852129 sc-eQTL 7.22e-01 -0.0286 0.0801 0.14 DC L1
ENSG00000112357 PEX7 319416 sc-eQTL 7.09e-01 0.0468 0.125 0.14 DC L1
ENSG00000118503 TNFAIP3 -725234 sc-eQTL 5.87e-01 0.0517 0.095 0.14 DC L1
ENSG00000135525 MAP7 591161 sc-eQTL 9.41e-02 -0.172 0.102 0.14 DC L1
ENSG00000197442 MAP3K5 349503 sc-eQTL 4.42e-01 0.0759 0.0986 0.14 DC L1
ENSG00000237499 WAKMAR2 -726253 sc-eQTL 1.40e-01 -0.143 0.0964 0.14 DC L1
ENSG00000286646 AL121933.2 357935 sc-eQTL 1.87e-01 -0.17 0.128 0.14 DC L1
ENSG00000027697 IFNGR1 -77469 sc-eQTL 9.19e-02 -0.125 0.0736 0.139 Mono L1
ENSG00000029363 BCLAF1 852129 sc-eQTL 1.53e-01 -0.0904 0.063 0.139 Mono L1
ENSG00000112357 PEX7 319416 sc-eQTL 8.77e-01 -0.0193 0.125 0.139 Mono L1
ENSG00000118503 TNFAIP3 -725234 sc-eQTL 9.91e-01 0.000714 0.0628 0.139 Mono L1
ENSG00000135525 MAP7 591161 sc-eQTL 6.87e-01 -0.0443 0.11 0.139 Mono L1
ENSG00000197442 MAP3K5 349503 sc-eQTL 9.85e-01 -0.00135 0.0733 0.139 Mono L1
ENSG00000237499 WAKMAR2 -726253 sc-eQTL 7.77e-01 0.0221 0.0778 0.139 Mono L1
ENSG00000286646 AL121933.2 357935 sc-eQTL 4.17e-02 -0.18 0.0879 0.139 Mono L1
ENSG00000027697 IFNGR1 -77469 sc-eQTL 8.49e-01 -0.0154 0.0807 0.139 NK L1
ENSG00000029363 BCLAF1 852129 sc-eQTL 4.04e-01 -0.0358 0.0428 0.139 NK L1
ENSG00000112357 PEX7 319416 sc-eQTL 6.18e-01 0.0621 0.124 0.139 NK L1
ENSG00000112378 PERP -965439 sc-eQTL 9.82e-01 -0.00178 0.0785 0.139 NK L1
ENSG00000118503 TNFAIP3 -725234 sc-eQTL 5.06e-01 -0.0447 0.0671 0.139 NK L1
ENSG00000197442 MAP3K5 349503 sc-eQTL 1.93e-02 0.224 0.095 0.139 NK L1
ENSG00000237499 WAKMAR2 -726253 sc-eQTL 9.97e-01 0.000309 0.0952 0.139 NK L1
ENSG00000027697 IFNGR1 -77469 sc-eQTL 6.87e-01 0.0306 0.0758 0.139 Other_T L1
ENSG00000029363 BCLAF1 852129 sc-eQTL 7.92e-01 -0.0168 0.0636 0.139 Other_T L1
ENSG00000112357 PEX7 319416 sc-eQTL 1.60e-01 0.174 0.123 0.139 Other_T L1
ENSG00000112378 PERP -965439 sc-eQTL 5.43e-01 -0.0604 0.0992 0.139 Other_T L1
ENSG00000118503 TNFAIP3 -725234 sc-eQTL 3.60e-01 -0.0432 0.0471 0.139 Other_T L1
ENSG00000146410 MTFR2 891645 sc-eQTL 7.76e-01 -0.0204 0.0715 0.139 Other_T L1
ENSG00000197442 MAP3K5 349503 sc-eQTL 7.64e-02 0.161 0.0905 0.139 Other_T L1
ENSG00000237499 WAKMAR2 -726253 sc-eQTL 6.70e-01 -0.04 0.0937 0.139 Other_T L1
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000027697 IFNGR1 -77469 sc-eQTL 2.94e-01 -0.141 0.134 0.133 B_Activated L2
ENSG00000029363 BCLAF1 852129 sc-eQTL 6.41e-01 -0.051 0.109 0.133 B_Activated L2
ENSG00000112357 PEX7 319416 sc-eQTL 4.50e-01 -0.1 0.132 0.133 B_Activated L2
ENSG00000112378 PERP -965439 sc-eQTL 3.57e-01 -0.0632 0.0684 0.133 B_Activated L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 -725234 sc-eQTL 5.11e-01 0.0875 0.133 0.133 B_Activated L2
ENSG00000197442 MAP3K5 349503 sc-eQTL 4.95e-01 0.102 0.149 0.133 B_Activated L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 -726253 sc-eQTL 9.52e-01 0.00695 0.116 0.133 B_Activated L2
ENSG00000027697 IFNGR1 -77469 sc-eQTL 5.06e-03 0.323 0.114 0.139 B_Intermediate L2
ENSG00000029363 BCLAF1 852129 sc-eQTL 1.85e-01 0.0875 0.0658 0.139 B_Intermediate L2
ENSG00000112357 PEX7 319416 sc-eQTL 7.13e-01 0.0448 0.121 0.139 B_Intermediate L2
ENSG00000112378 PERP -965439 sc-eQTL 5.59e-01 -0.0647 0.111 0.139 B_Intermediate L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 -725234 sc-eQTL 8.28e-01 -0.0188 0.0869 0.139 B_Intermediate L2
ENSG00000197442 MAP3K5 349503 sc-eQTL 2.01e-01 0.134 0.105 0.139 B_Intermediate L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 -726253 sc-eQTL 5.53e-01 -0.0731 0.123 0.139 B_Intermediate L2
ENSG00000027697 IFNGR1 -77469 sc-eQTL 4.57e-01 0.0931 0.125 0.138 B_Memory L2
ENSG00000029363 BCLAF1 852129 sc-eQTL 5.18e-01 0.0481 0.0743 0.138 B_Memory L2
ENSG00000112357 PEX7 319416 sc-eQTL 1.80e-01 0.169 0.126 0.138 B_Memory L2
ENSG00000112378 PERP -965439 sc-eQTL 1.03e-01 0.193 0.118 0.138 B_Memory L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 -725234 sc-eQTL 1.70e-01 0.112 0.0815 0.138 B_Memory L2
ENSG00000197442 MAP3K5 349503 sc-eQTL 4.77e-01 -0.0795 0.112 0.138 B_Memory L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 -726253 sc-eQTL 3.66e-01 0.11 0.122 0.138 B_Memory L2
ENSG00000027697 IFNGR1 -77469 sc-eQTL 7.48e-01 0.0315 0.0979 0.139 B_Naive1 L2
ENSG00000029363 BCLAF1 852129 sc-eQTL 9.37e-01 0.00442 0.0559 0.139 B_Naive1 L2
ENSG00000112357 PEX7 319416 sc-eQTL 8.85e-01 -0.0187 0.129 0.139 B_Naive1 L2
ENSG00000112378 PERP -965439 sc-eQTL 7.63e-01 -0.0342 0.113 0.139 B_Naive1 L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 -725234 sc-eQTL 2.44e-01 0.0763 0.0653 0.139 B_Naive1 L2
ENSG00000197442 MAP3K5 349503 sc-eQTL 8.59e-01 -0.0164 0.0921 0.139 B_Naive1 L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 -726253 sc-eQTL 1.44e-01 0.15 0.102 0.139 B_Naive1 L2
ENSG00000027697 IFNGR1 -77469 sc-eQTL 6.36e-02 0.218 0.117 0.137 B_Naive2 L2
ENSG00000029363 BCLAF1 852129 sc-eQTL 4.09e-01 0.0566 0.0683 0.137 B_Naive2 L2
ENSG00000112357 PEX7 319416 sc-eQTL 2.11e-01 -0.162 0.129 0.137 B_Naive2 L2
ENSG00000112378 PERP -965439 sc-eQTL 6.12e-01 -0.0477 0.094 0.137 B_Naive2 L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 -725234 sc-eQTL 7.10e-01 0.035 0.094 0.137 B_Naive2 L2
ENSG00000197442 MAP3K5 349503 sc-eQTL 8.08e-01 0.0243 0.1 0.137 B_Naive2 L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 -726253 sc-eQTL 1.23e-01 0.187 0.121 0.137 B_Naive2 L2
ENSG00000027697 IFNGR1 -77469 sc-eQTL 5.14e-02 0.209 0.107 0.143 CD4_CTL L2
ENSG00000029363 BCLAF1 852129 sc-eQTL 5.84e-01 0.0525 0.0956 0.143 CD4_CTL L2
ENSG00000112357 PEX7 319416 sc-eQTL 3.74e-01 -0.106 0.119 0.143 CD4_CTL L2
ENSG00000112378 PERP -965439 sc-eQTL 2.66e-01 -0.135 0.121 0.143 CD4_CTL L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 -725234 sc-eQTL 7.23e-01 0.0251 0.0707 0.143 CD4_CTL L2
ENSG00000197442 MAP3K5 349503 sc-eQTL 8.17e-01 -0.0261 0.113 0.143 CD4_CTL L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 -726253 sc-eQTL 9.19e-01 -0.0112 0.11 0.143 CD4_CTL L2
ENSG00000027697 IFNGR1 -77469 sc-eQTL 7.20e-01 0.0222 0.062 0.139 CD4_Naive L2
ENSG00000029363 BCLAF1 852129 sc-eQTL 6.33e-01 -0.0238 0.0497 0.139 CD4_Naive L2
ENSG00000112357 PEX7 319416 sc-eQTL 1.74e-01 -0.159 0.117 0.139 CD4_Naive L2
ENSG00000112378 PERP -965439 sc-eQTL 8.64e-01 0.0166 0.0966 0.139 CD4_Naive L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 -725234 sc-eQTL 1.38e-01 -0.1 0.0674 0.139 CD4_Naive L2
ENSG00000197442 MAP3K5 349503 sc-eQTL 6.54e-01 0.0223 0.0498 0.139 CD4_Naive L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 -726253 sc-eQTL 2.92e-01 0.0925 0.0876 0.139 CD4_Naive L2
ENSG00000027697 IFNGR1 -77469 sc-eQTL 7.81e-01 0.024 0.0862 0.139 CD4_TCM L2
ENSG00000029363 BCLAF1 852129 sc-eQTL 8.44e-01 0.0107 0.0544 0.139 CD4_TCM L2
ENSG00000112357 PEX7 319416 sc-eQTL 8.34e-01 -0.0265 0.127 0.139 CD4_TCM L2
ENSG00000112378 PERP -965439 sc-eQTL 7.83e-01 -0.0294 0.107 0.139 CD4_TCM L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 -725234 sc-eQTL 3.22e-01 -0.0615 0.062 0.139 CD4_TCM L2
ENSG00000197442 MAP3K5 349503 sc-eQTL 3.68e-01 0.0637 0.0706 0.139 CD4_TCM L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 -726253 sc-eQTL 2.53e-01 0.0994 0.0868 0.139 CD4_TCM L2
ENSG00000027697 IFNGR1 -77469 sc-eQTL 2.49e-01 -0.112 0.0965 0.139 CD4_TEM L2
ENSG00000029363 BCLAF1 852129 sc-eQTL 4.04e-01 0.0572 0.0685 0.139 CD4_TEM L2
ENSG00000112357 PEX7 319416 sc-eQTL 2.72e-01 -0.137 0.125 0.139 CD4_TEM L2
ENSG00000112378 PERP -965439 sc-eQTL 2.78e-01 -0.11 0.101 0.139 CD4_TEM L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 -725234 sc-eQTL 7.75e-01 -0.0184 0.0643 0.139 CD4_TEM L2
ENSG00000197442 MAP3K5 349503 sc-eQTL 2.57e-01 0.113 0.099 0.139 CD4_TEM L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 -726253 sc-eQTL 3.14e-01 0.104 0.103 0.139 CD4_TEM L2
ENSG00000027697 IFNGR1 -77469 sc-eQTL 4.13e-01 0.0714 0.0871 0.139 CD8_CTL L2
ENSG00000029363 BCLAF1 852129 sc-eQTL 3.94e-01 0.0496 0.0581 0.139 CD8_CTL L2
ENSG00000112357 PEX7 319416 sc-eQTL 4.02e-01 0.101 0.12 0.139 CD8_CTL L2
ENSG00000112378 PERP -965439 sc-eQTL 9.91e-01 -0.00133 0.115 0.139 CD8_CTL L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 -725234 sc-eQTL 4.58e-01 -0.0545 0.0733 0.139 CD8_CTL L2
ENSG00000197442 MAP3K5 349503 sc-eQTL 9.11e-01 -0.0116 0.104 0.139 CD8_CTL L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 -726253 sc-eQTL 6.45e-01 -0.0475 0.103 0.139 CD8_CTL L2
ENSG00000027697 IFNGR1 -77469 sc-eQTL 8.90e-01 0.0121 0.0872 0.139 CD8_Naive L2
ENSG00000029363 BCLAF1 852129 sc-eQTL 6.86e-01 0.0246 0.0609 0.139 CD8_Naive L2
ENSG00000112357 PEX7 319416 sc-eQTL 9.07e-01 0.0148 0.126 0.139 CD8_Naive L2
ENSG00000112378 PERP -965439 sc-eQTL 3.08e-01 0.098 0.0959 0.139 CD8_Naive L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 -725234 sc-eQTL 6.50e-02 -0.126 0.0677 0.139 CD8_Naive L2
ENSG00000197442 MAP3K5 349503 sc-eQTL 7.62e-03 0.214 0.0795 0.139 CD8_Naive L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 -726253 sc-eQTL 6.51e-01 -0.0457 0.101 0.139 CD8_Naive L2
ENSG00000027697 IFNGR1 -77469 sc-eQTL 2.24e-01 -0.147 0.121 0.132 CD8_TCM L2
ENSG00000029363 BCLAF1 852129 sc-eQTL 1.70e-02 0.216 0.0896 0.132 CD8_TCM L2
ENSG00000112357 PEX7 319416 sc-eQTL 4.13e-01 0.114 0.139 0.132 CD8_TCM L2
ENSG00000112378 PERP -965439 sc-eQTL 5.60e-01 -0.0794 0.136 0.132 CD8_TCM L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 -725234 sc-eQTL 8.28e-01 0.0143 0.0657 0.132 CD8_TCM L2
ENSG00000197442 MAP3K5 349503 sc-eQTL 3.28e-01 0.115 0.117 0.132 CD8_TCM L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 -726253 sc-eQTL 7.30e-01 -0.0415 0.12 0.132 CD8_TCM L2
ENSG00000027697 IFNGR1 -77469 sc-eQTL 8.29e-01 0.0236 0.109 0.144 CD8_TEM L2
ENSG00000029363 BCLAF1 852129 sc-eQTL 3.08e-02 0.222 0.102 0.144 CD8_TEM L2
ENSG00000112357 PEX7 319416 sc-eQTL 3.46e-01 0.119 0.125 0.144 CD8_TEM L2
ENSG00000112378 PERP -965439 sc-eQTL 4.18e-01 -0.106 0.131 0.144 CD8_TEM L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 -725234 sc-eQTL 3.46e-01 -0.076 0.0804 0.144 CD8_TEM L2
ENSG00000197442 MAP3K5 349503 sc-eQTL 7.08e-02 0.224 0.124 0.144 CD8_TEM L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 -726253 sc-eQTL 9.60e-01 -0.006 0.12 0.144 CD8_TEM L2
ENSG00000027697 IFNGR1 -77469 sc-eQTL 7.22e-01 0.0315 0.0885 0.141 MAIT L2
ENSG00000029363 BCLAF1 852129 sc-eQTL 6.37e-01 -0.0348 0.0735 0.141 MAIT L2
ENSG00000112357 PEX7 319416 sc-eQTL 7.45e-01 0.0391 0.12 0.141 MAIT L2
ENSG00000112378 PERP -965439 sc-eQTL 5.25e-01 -0.0795 0.125 0.141 MAIT L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 -725234 sc-eQTL 5.32e-01 -0.0373 0.0595 0.141 MAIT L2
ENSG00000146410 MTFR2 891645 sc-eQTL 7.71e-01 0.0289 0.0992 0.141 MAIT L2
ENSG00000197442 MAP3K5 349503 sc-eQTL 7.07e-01 0.039 0.104 0.141 MAIT L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 -726253 sc-eQTL 9.93e-01 -0.00104 0.11 0.141 MAIT L2
ENSG00000027697 IFNGR1 -77469 sc-eQTL 9.39e-01 -0.00746 0.0967 0.142 NK_CD56bright L2
ENSG00000029363 BCLAF1 852129 sc-eQTL 3.64e-01 0.0648 0.0712 0.142 NK_CD56bright L2
ENSG00000112357 PEX7 319416 sc-eQTL 5.77e-01 0.0704 0.126 0.142 NK_CD56bright L2
ENSG00000112378 PERP -965439 sc-eQTL 6.56e-01 -0.0503 0.113 0.142 NK_CD56bright L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 -725234 sc-eQTL 8.78e-01 0.0111 0.072 0.142 NK_CD56bright L2
ENSG00000197442 MAP3K5 349503 sc-eQTL 2.91e-02 0.238 0.108 0.142 NK_CD56bright L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 -726253 sc-eQTL 5.15e-01 0.0747 0.115 0.142 NK_CD56bright L2
ENSG00000027697 IFNGR1 -77469 sc-eQTL 6.94e-01 -0.0292 0.0741 0.14 NK_CD56dim L2
ENSG00000029363 BCLAF1 852129 sc-eQTL 9.36e-01 -0.0039 0.0485 0.14 NK_CD56dim L2
ENSG00000112357 PEX7 319416 sc-eQTL 5.09e-01 0.0844 0.128 0.14 NK_CD56dim L2
ENSG00000112378 PERP -965439 sc-eQTL 8.47e-01 -0.0173 0.0898 0.14 NK_CD56dim L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 -725234 sc-eQTL 7.47e-01 -0.0226 0.0698 0.14 NK_CD56dim L2
ENSG00000197442 MAP3K5 349503 sc-eQTL 1.36e-01 0.15 0.1 0.14 NK_CD56dim L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 -726253 sc-eQTL 7.23e-01 -0.0371 0.105 0.14 NK_CD56dim L2
ENSG00000027697 IFNGR1 -77469 sc-eQTL 5.67e-01 -0.054 0.0941 0.144 NK_HLA L2
ENSG00000029363 BCLAF1 852129 sc-eQTL 8.67e-01 0.0134 0.0797 0.144 NK_HLA L2
ENSG00000112357 PEX7 319416 sc-eQTL 8.86e-01 -0.0172 0.12 0.144 NK_HLA L2
ENSG00000112378 PERP -965439 sc-eQTL 3.95e-01 0.0824 0.0968 0.144 NK_HLA L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 -725234 sc-eQTL 9.80e-01 0.00188 0.0746 0.144 NK_HLA L2
ENSG00000197442 MAP3K5 349503 sc-eQTL 4.48e-01 0.09 0.118 0.144 NK_HLA L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 -726253 sc-eQTL 3.93e-02 0.247 0.119 0.144 NK_HLA L2
ENSG00000027697 IFNGR1 -77469 sc-eQTL 8.99e-01 -0.00998 0.0783 0.14 NK_cytokine L2
ENSG00000029363 BCLAF1 852129 sc-eQTL 6.15e-02 -0.109 0.058 0.14 NK_cytokine L2
ENSG00000112357 PEX7 319416 sc-eQTL 1.74e-01 -0.167 0.122 0.14 NK_cytokine L2
ENSG00000112378 PERP -965439 sc-eQTL 8.17e-01 0.0216 0.0933 0.14 NK_cytokine L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 -725234 sc-eQTL 9.09e-01 -0.00803 0.0699 0.14 NK_cytokine L2
ENSG00000197442 MAP3K5 349503 sc-eQTL 7.40e-02 0.171 0.0954 0.14 NK_cytokine L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 -726253 sc-eQTL 7.12e-01 0.0389 0.105 0.14 NK_cytokine L2
ENSG00000027697 IFNGR1 -77469 sc-eQTL 5.93e-01 0.0884 0.165 0.119 PB L2
ENSG00000029363 BCLAF1 852129 sc-eQTL 3.31e-01 -0.138 0.142 0.119 PB L2
ENSG00000112357 PEX7 319416 sc-eQTL 7.67e-01 -0.0503 0.169 0.119 PB L2
ENSG00000112378 PERP -965439 sc-eQTL 1.19e-01 -0.164 0.105 0.119 PB L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 -725234 sc-eQTL 9.67e-01 0.00532 0.128 0.119 PB L2
ENSG00000197442 MAP3K5 349503 sc-eQTL 1.68e-01 -0.201 0.145 0.119 PB L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 -726253 sc-eQTL 5.71e-01 -0.0875 0.154 0.119 PB L2
ENSG00000027697 IFNGR1 -77469 sc-eQTL 6.41e-01 -0.0468 0.1 0.137 Pro_T L2
ENSG00000029363 BCLAF1 852129 sc-eQTL 2.95e-01 0.109 0.104 0.137 Pro_T L2
ENSG00000112357 PEX7 319416 sc-eQTL 5.43e-01 0.0739 0.121 0.137 Pro_T L2
ENSG00000112378 PERP -965439 sc-eQTL 3.29e-01 -0.0944 0.0965 0.137 Pro_T L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 -725234 sc-eQTL 8.13e-01 -0.0145 0.061 0.137 Pro_T L2
ENSG00000146410 MTFR2 891645 sc-eQTL 8.69e-01 0.0139 0.0845 0.137 Pro_T L2
ENSG00000197442 MAP3K5 349503 sc-eQTL 3.64e-01 0.107 0.118 0.137 Pro_T L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 -726253 sc-eQTL 7.43e-02 -0.211 0.117 0.137 Pro_T L2
ENSG00000027697 IFNGR1 -77469 sc-eQTL 6.94e-01 -0.045 0.114 0.139 Treg L2
ENSG00000029363 BCLAF1 852129 sc-eQTL 2.00e-01 0.0943 0.0734 0.139 Treg L2
ENSG00000112357 PEX7 319416 sc-eQTL 9.66e-01 -0.00515 0.121 0.139 Treg L2
ENSG00000112378 PERP -965439 sc-eQTL 1.64e-01 -0.181 0.13 0.139 Treg L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 -725234 sc-eQTL 4.33e-01 -0.0569 0.0724 0.139 Treg L2
ENSG00000197442 MAP3K5 349503 sc-eQTL 5.43e-01 0.0478 0.0785 0.139 Treg L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 -726253 sc-eQTL 1.15e-01 0.174 0.11 0.139 Treg L2
ENSG00000027697 IFNGR1 -77469 sc-eQTL 1.65e-01 0.139 0.0997 0.144 cDC L2
ENSG00000029363 BCLAF1 852129 sc-eQTL 1.00e+00 4.2e-05 0.101 0.144 cDC L2
ENSG00000112357 PEX7 319416 sc-eQTL 6.72e-01 0.055 0.13 0.144 cDC L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 -725234 sc-eQTL 6.72e-01 0.0419 0.0988 0.144 cDC L2
ENSG00000135525 MAP7 591161 sc-eQTL 2.61e-01 -0.13 0.115 0.144 cDC L2
ENSG00000197442 MAP3K5 349503 sc-eQTL 4.06e-01 -0.0846 0.101 0.144 cDC L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 -726253 sc-eQTL 2.55e-01 -0.147 0.128 0.144 cDC L2
ENSG00000286646 AL121933.2 357935 sc-eQTL 4.04e-01 -0.111 0.132 0.144 cDC L2
ENSG00000027697 IFNGR1 -77469 sc-eQTL 4.83e-02 -0.136 0.0685 0.139 cMono_IL1B L2
ENSG00000029363 BCLAF1 852129 sc-eQTL 5.02e-01 -0.0498 0.074 0.139 cMono_IL1B L2
ENSG00000112357 PEX7 319416 sc-eQTL 2.31e-01 -0.149 0.124 0.139 cMono_IL1B L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 -725234 sc-eQTL 9.17e-01 0.0078 0.0744 0.139 cMono_IL1B L2
ENSG00000135525 MAP7 591161 sc-eQTL 3.89e-01 -0.0922 0.107 0.139 cMono_IL1B L2
ENSG00000197442 MAP3K5 349503 sc-eQTL 6.96e-01 -0.0302 0.0773 0.139 cMono_IL1B L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 -726253 sc-eQTL 9.56e-01 0.00435 0.0794 0.139 cMono_IL1B L2
ENSG00000286646 AL121933.2 357935 sc-eQTL 3.44e-02 -0.21 0.0984 0.139 cMono_IL1B L2
ENSG00000027697 IFNGR1 -77469 sc-eQTL 3.37e-01 -0.0774 0.0804 0.139 cMono_S100A L2
ENSG00000029363 BCLAF1 852129 sc-eQTL 6.83e-02 -0.15 0.0821 0.139 cMono_S100A L2
ENSG00000112357 PEX7 319416 sc-eQTL 4.61e-01 -0.0953 0.129 0.139 cMono_S100A L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 -725234 sc-eQTL 4.80e-01 -0.0506 0.0715 0.139 cMono_S100A L2
ENSG00000135525 MAP7 591161 sc-eQTL 3.51e-01 -0.112 0.12 0.139 cMono_S100A L2
ENSG00000197442 MAP3K5 349503 sc-eQTL 9.95e-01 0.000621 0.0973 0.139 cMono_S100A L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 -726253 sc-eQTL 4.34e-01 0.0804 0.103 0.139 cMono_S100A L2
ENSG00000286646 AL121933.2 357935 sc-eQTL 8.11e-01 0.024 0.1 0.139 cMono_S100A L2
ENSG00000027697 IFNGR1 -77469 sc-eQTL 8.76e-01 -0.0177 0.113 0.148 gdT L2
ENSG00000029363 BCLAF1 852129 sc-eQTL 4.25e-01 -0.0797 0.0997 0.148 gdT L2
ENSG00000112357 PEX7 319416 sc-eQTL 2.80e-01 0.155 0.143 0.148 gdT L2
ENSG00000112378 PERP -965439 sc-eQTL 2.40e-01 -0.147 0.125 0.148 gdT L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 -725234 sc-eQTL 8.91e-01 0.00955 0.0698 0.148 gdT L2
ENSG00000146410 MTFR2 891645 sc-eQTL 5.53e-01 -0.0654 0.11 0.148 gdT L2
ENSG00000197442 MAP3K5 349503 sc-eQTL 1.03e-01 0.24 0.146 0.148 gdT L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 -726253 sc-eQTL 8.30e-01 -0.0272 0.126 0.148 gdT L2
ENSG00000027697 IFNGR1 -77469 sc-eQTL 2.65e-01 -0.0954 0.0854 0.14 intMono L2
ENSG00000029363 BCLAF1 852129 sc-eQTL 2.00e-01 -0.145 0.113 0.14 intMono L2
ENSG00000112357 PEX7 319416 sc-eQTL 3.43e-01 0.109 0.115 0.14 intMono L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 -725234 sc-eQTL 7.68e-01 -0.0219 0.074 0.14 intMono L2
ENSG00000135525 MAP7 591161 sc-eQTL 5.09e-01 0.075 0.114 0.14 intMono L2
ENSG00000197442 MAP3K5 349503 sc-eQTL 8.82e-01 -0.018 0.12 0.14 intMono L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 -726253 sc-eQTL 5.51e-01 -0.0658 0.11 0.14 intMono L2
ENSG00000286646 AL121933.2 357935 sc-eQTL 3.10e-02 -0.273 0.126 0.14 intMono L2
ENSG00000027697 IFNGR1 -77469 sc-eQTL 3.47e-01 -0.0957 0.101 0.14 ncMono L2
ENSG00000029363 BCLAF1 852129 sc-eQTL 8.83e-01 0.0117 0.079 0.14 ncMono L2
ENSG00000112357 PEX7 319416 sc-eQTL 1.62e-01 0.176 0.125 0.14 ncMono L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 -725234 sc-eQTL 1.13e-01 -0.142 0.0894 0.14 ncMono L2
ENSG00000135525 MAP7 591161 sc-eQTL 8.78e-02 0.189 0.11 0.14 ncMono L2
ENSG00000197442 MAP3K5 349503 sc-eQTL 4.64e-01 -0.0856 0.117 0.14 ncMono L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 -726253 sc-eQTL 3.34e-01 -0.109 0.112 0.14 ncMono L2
ENSG00000286646 AL121933.2 357935 sc-eQTL 2.45e-01 -0.138 0.118 0.14 ncMono L2
ENSG00000027697 IFNGR1 -77469 sc-eQTL 5.81e-01 0.0694 0.125 0.13 pDC L2
ENSG00000029363 BCLAF1 852129 sc-eQTL 6.26e-01 -0.0459 0.0941 0.13 pDC L2
ENSG00000112357 PEX7 319416 sc-eQTL 9.06e-01 -0.0163 0.138 0.13 pDC L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 -725234 sc-eQTL 7.86e-01 0.0317 0.116 0.13 pDC L2
ENSG00000135525 MAP7 591161 sc-eQTL 6.64e-01 -0.042 0.0964 0.13 pDC L2
ENSG00000197442 MAP3K5 349503 sc-eQTL 7.94e-01 0.0404 0.154 0.13 pDC L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 -726253 sc-eQTL 4.93e-01 -0.0811 0.118 0.13 pDC L2
ENSG00000286646 AL121933.2 357935 sc-eQTL 9.11e-01 -0.016 0.142 0.13 pDC L2
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000027697 IFNGR1 -77469 sc-eQTL 2.03e-01 0.13 0.102 0.139 B_Memory LOneK1K
ENSG00000029363 BCLAF1 852129 sc-eQTL 3.64e-01 0.0523 0.0575 0.139 B_Memory LOneK1K
ENSG00000112357 PEX7 319416 sc-eQTL 5.02e-01 0.0792 0.118 0.139 B_Memory LOneK1K
ENSG00000112378 PERP -965439 sc-eQTL 7.59e-02 0.194 0.109 0.139 B_Memory LOneK1K
ENSG00000118503 TNFAIP3 -725234 sc-eQTL 8.31e-01 -0.0154 0.0723 0.139 B_Memory LOneK1K
ENSG00000197442 MAP3K5 349503 sc-eQTL 5.11e-01 0.063 0.0957 0.139 B_Memory LOneK1K
ENSG00000237499 WAKMAR2 -726253 sc-eQTL 4.93e-01 0.084 0.122 0.139 B_Memory LOneK1K
ENSG00000027697 IFNGR1 -77469 sc-eQTL 2.80e-01 0.11 0.101 0.139 B_Naive LOneK1K
ENSG00000029363 BCLAF1 852129 sc-eQTL 9.77e-01 0.00136 0.0467 0.139 B_Naive LOneK1K
ENSG00000112357 PEX7 319416 sc-eQTL 3.37e-01 -0.119 0.124 0.139 B_Naive LOneK1K
ENSG00000112378 PERP -965439 sc-eQTL 6.27e-01 -0.0539 0.111 0.139 B_Naive LOneK1K
ENSG00000118503 TNFAIP3 -725234 sc-eQTL 5.29e-01 0.0367 0.0582 0.139 B_Naive LOneK1K
ENSG00000197442 MAP3K5 349503 sc-eQTL 9.06e-01 0.0101 0.0854 0.139 B_Naive LOneK1K
ENSG00000237499 WAKMAR2 -726253 sc-eQTL 1.80e-02 0.244 0.102 0.139 B_Naive LOneK1K
ENSG00000027697 IFNGR1 -77469 sc-eQTL 9.08e-02 -0.118 0.0694 0.139 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000029363 BCLAF1 852129 sc-eQTL 2.05e-01 -0.0824 0.0648 0.139 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000112357 PEX7 319416 sc-eQTL 3.71e-01 -0.112 0.125 0.139 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000118503 TNFAIP3 -725234 sc-eQTL 6.87e-01 -0.0261 0.0646 0.139 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000135525 MAP7 591161 sc-eQTL 2.85e-01 -0.12 0.112 0.139 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000197442 MAP3K5 349503 sc-eQTL 7.92e-01 -0.02 0.0758 0.139 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000237499 WAKMAR2 -726253 sc-eQTL 9.17e-01 0.00806 0.0775 0.139 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000286646 AL121933.2 357935 sc-eQTL 2.16e-01 -0.111 0.0898 0.139 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000027697 IFNGR1 -77469 sc-eQTL 7.27e-02 -0.147 0.0815 0.14 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000029363 BCLAF1 852129 sc-eQTL 2.97e-01 -0.0775 0.074 0.14 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000112357 PEX7 319416 sc-eQTL 2.38e-01 0.146 0.124 0.14 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000118503 TNFAIP3 -725234 sc-eQTL 7.37e-01 -0.0258 0.0768 0.14 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000135525 MAP7 591161 sc-eQTL 1.21e-01 0.186 0.119 0.14 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000197442 MAP3K5 349503 sc-eQTL 4.58e-01 -0.073 0.0983 0.14 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000237499 WAKMAR2 -726253 sc-eQTL 7.36e-01 -0.0347 0.103 0.14 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000286646 AL121933.2 357935 sc-eQTL 1.22e-02 -0.291 0.115 0.14 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000027697 IFNGR1 -77469 sc-eQTL 8.60e-01 -0.0135 0.0761 0.14 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000029363 BCLAF1 852129 sc-eQTL 3.29e-01 -0.0431 0.0441 0.14 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000112357 PEX7 319416 sc-eQTL 9.68e-01 0.00516 0.128 0.14 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000112378 PERP -965439 sc-eQTL 6.22e-01 0.0393 0.0796 0.14 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000118503 TNFAIP3 -725234 sc-eQTL 5.55e-01 -0.0409 0.0693 0.14 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000197442 MAP3K5 349503 sc-eQTL 3.12e-02 0.201 0.0927 0.14 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000237499 WAKMAR2 -726253 sc-eQTL 9.90e-01 0.00119 0.097 0.14 NK_CD56dim LOneK1K

Statistical fine-mapping results from Japan COVID-19 Task Force
(Shown only for PIP>0.001)
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
PIP (SuSiE)
PIP (FINEMAP)
MAF
ENSG00000027697 IFNGR1 -77469 pQTL 0.000145 -0.0798 0.021 0.0 0.0 0.16
ENSG00000027697 IFNGR1 -77469 eQTL 2.93e-09 -0.103 0.0172 0.0 0.0 0.171

Expression Modifier Score(EMS) for GTEx 49tissues
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Whole Blood
Muscle Skeletal
Liver
Brain Cerebellum
Prostate
Spleen
Skin Sun Exposed Lower leg
Artery Coronary
Esophagus Muscularis
Esophagus Gastroesophageal Junction
Artery Tibial
Heart Atrial Appendage
Nerve Tibial
Heart Left Ventricle
Adrenal Gland
Adipose Visceral Omentum
Pancreas
Lung
Pituitary
Brain Nucleus accumbens basal ganglia
Colon Transverse
Adipose Subcutaneous
Esophagus Mucosa
Brain Cortex
Thyroid
Stomach
Breast Mammary Tissue
Colon Sigmoid
Skin Not Sun Exposed Suprapubic
Testis
Artery Aorta
Brain Amygdala
Brain Anterior cingulate cortex BA24
Brain Caudate basal ganglia
Brain Cerebellar Hemisphere
Brain Frontal Cortex BA9
Brain Hippocampus
Brain Hypothalamus
Brain Putamen basal ganglia
Brain Spinal cord cervical c-1
Brain Substantia nigra
Cells Cultured fibroblasts
Cells EBV-transformed lymphocytes
Kidney Cortex
Minor Salivary Gland
Ovary
Small Intestine Terminal Ileum
Uterus
Vagina
ENSG00000027697 IFNGR1 -77469 6.33e-05 7.73e-06 1.29e-06 5.06e-06 8.47e-07 4.75e-06 9.3e-06 4.04e-07 5e-06 3.43e-06 6.86e-06 3.05e-06 1.04e-05 3.5e-06 1.03e-06 5.46e-06 3.67e-06 3.19e-06 1.39e-06 1.05e-06 3.08e-06 7.64e-06 4.74e-06 1.42e-06 1.1e-05 2.06e-06 2.53e-06 1.77e-06 6.43e-06 7.15e-06 2.86e-06 1.82e-07 3.27e-07 1.77e-06 2.03e-06 1.3e-06 9.08e-07 3.44e-07 6.22e-07 1.87e-07 1.46e-07 8.48e-06 1.46e-06 1.96e-07 3.13e-07 3.11e-07 1.11e-06 7.69e-08 4.52e-08