logo

Genes within 1Mb (chr6:137131771:A:G):

View on , UCSC , GTEx , gnomAD

Immune cell-type specific single cell cis-eQTLs in OASIS
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000027697 IFNGR1 -87678 sc-eQTL 8.12e-01 0.0245 0.103 0.122 B L1
ENSG00000029363 BCLAF1 841920 sc-eQTL 2.67e-01 0.051 0.0458 0.122 B L1
ENSG00000112357 PEX7 309207 sc-eQTL 8.66e-01 0.0207 0.122 0.122 B L1
ENSG00000112378 PERP -975648 sc-eQTL 5.79e-01 -0.0449 0.0808 0.122 B L1
ENSG00000118503 TNFAIP3 -735443 sc-eQTL 7.01e-01 0.025 0.0651 0.122 B L1
ENSG00000197442 MAP3K5 339294 sc-eQTL 1.87e-01 0.12 0.0904 0.122 B L1
ENSG00000237499 WAKMAR2 -736462 sc-eQTL 2.86e-01 0.109 0.102 0.122 B L1
ENSG00000027697 IFNGR1 -87678 sc-eQTL 5.56e-01 -0.0405 0.0685 0.122 CD4T L1
ENSG00000029363 BCLAF1 841920 sc-eQTL 7.07e-01 0.0195 0.0519 0.122 CD4T L1
ENSG00000112357 PEX7 309207 sc-eQTL 9.56e-01 -0.00606 0.11 0.122 CD4T L1
ENSG00000112378 PERP -975648 sc-eQTL 4.59e-02 -0.147 0.0735 0.122 CD4T L1
ENSG00000118503 TNFAIP3 -735443 sc-eQTL 2.04e-01 -0.0881 0.0692 0.122 CD4T L1
ENSG00000197442 MAP3K5 339294 sc-eQTL 6.67e-01 0.0228 0.0529 0.122 CD4T L1
ENSG00000237499 WAKMAR2 -736462 sc-eQTL 1.52e-01 0.125 0.0871 0.122 CD4T L1
ENSG00000027697 IFNGR1 -87678 sc-eQTL 7.95e-01 -0.0206 0.0793 0.122 CD8T L1
ENSG00000029363 BCLAF1 841920 sc-eQTL 4.98e-01 0.0364 0.0536 0.122 CD8T L1
ENSG00000112357 PEX7 309207 sc-eQTL 5.37e-01 0.0816 0.132 0.122 CD8T L1
ENSG00000112378 PERP -975648 sc-eQTL 5.29e-01 -0.0545 0.0864 0.122 CD8T L1
ENSG00000118503 TNFAIP3 -735443 sc-eQTL 2.78e-01 -0.0723 0.0665 0.122 CD8T L1
ENSG00000197442 MAP3K5 339294 sc-eQTL 3.58e-01 0.0648 0.0704 0.122 CD8T L1
ENSG00000237499 WAKMAR2 -736462 sc-eQTL 5.41e-01 -0.06 0.0979 0.122 CD8T L1
ENSG00000027697 IFNGR1 -87678 sc-eQTL 3.28e-01 0.094 0.0959 0.124 DC L1
ENSG00000029363 BCLAF1 841920 sc-eQTL 5.69e-01 -0.0493 0.0864 0.124 DC L1
ENSG00000112357 PEX7 309207 sc-eQTL 5.72e-01 -0.0765 0.135 0.124 DC L1
ENSG00000118503 TNFAIP3 -735443 sc-eQTL 7.52e-01 -0.0325 0.103 0.124 DC L1
ENSG00000135525 MAP7 580952 sc-eQTL 1.87e-01 -0.147 0.111 0.124 DC L1
ENSG00000197442 MAP3K5 339294 sc-eQTL 9.30e-01 -0.00932 0.107 0.124 DC L1
ENSG00000237499 WAKMAR2 -736462 sc-eQTL 1.21e-01 -0.162 0.104 0.124 DC L1
ENSG00000286646 AL121933.2 347726 sc-eQTL 1.38e-01 -0.206 0.138 0.124 DC L1
ENSG00000027697 IFNGR1 -87678 sc-eQTL 8.96e-01 -0.0104 0.0795 0.122 Mono L1
ENSG00000029363 BCLAF1 841920 sc-eQTL 2.43e-02 -0.152 0.0672 0.122 Mono L1
ENSG00000112357 PEX7 309207 sc-eQTL 8.21e-01 0.0303 0.134 0.122 Mono L1
ENSG00000118503 TNFAIP3 -735443 sc-eQTL 7.62e-01 0.0204 0.0674 0.122 Mono L1
ENSG00000135525 MAP7 580952 sc-eQTL 4.29e-01 -0.0934 0.118 0.122 Mono L1
ENSG00000197442 MAP3K5 339294 sc-eQTL 2.03e-01 -0.1 0.0784 0.122 Mono L1
ENSG00000237499 WAKMAR2 -736462 sc-eQTL 8.17e-01 0.0193 0.0836 0.122 Mono L1
ENSG00000286646 AL121933.2 347726 sc-eQTL 2.38e-01 -0.112 0.095 0.122 Mono L1
ENSG00000027697 IFNGR1 -87678 sc-eQTL 4.75e-01 -0.0632 0.0883 0.122 NK L1
ENSG00000029363 BCLAF1 841920 sc-eQTL 2.31e-01 -0.0563 0.0468 0.122 NK L1
ENSG00000112357 PEX7 309207 sc-eQTL 9.31e-01 0.0119 0.136 0.122 NK L1
ENSG00000112378 PERP -975648 sc-eQTL 3.53e-01 -0.0799 0.0858 0.122 NK L1
ENSG00000118503 TNFAIP3 -735443 sc-eQTL 5.47e-01 -0.0443 0.0735 0.122 NK L1
ENSG00000197442 MAP3K5 339294 sc-eQTL 1.79e-02 0.248 0.104 0.122 NK L1
ENSG00000237499 WAKMAR2 -736462 sc-eQTL 4.58e-01 0.0775 0.104 0.122 NK L1
ENSG00000027697 IFNGR1 -87678 sc-eQTL 1.43e-01 -0.121 0.0825 0.122 Other_T L1
ENSG00000029363 BCLAF1 841920 sc-eQTL 7.73e-01 -0.0201 0.0695 0.122 Other_T L1
ENSG00000112357 PEX7 309207 sc-eQTL 4.06e-01 0.112 0.135 0.122 Other_T L1
ENSG00000112378 PERP -975648 sc-eQTL 4.97e-01 -0.0738 0.108 0.122 Other_T L1
ENSG00000118503 TNFAIP3 -735443 sc-eQTL 8.55e-01 -0.00945 0.0516 0.122 Other_T L1
ENSG00000146410 MTFR2 881436 sc-eQTL 5.22e-01 -0.0501 0.0781 0.122 Other_T L1
ENSG00000197442 MAP3K5 339294 sc-eQTL 8.00e-03 0.262 0.098 0.122 Other_T L1
ENSG00000237499 WAKMAR2 -736462 sc-eQTL 5.74e-01 -0.0577 0.102 0.122 Other_T L1
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000027697 IFNGR1 -87678 sc-eQTL 6.48e-01 -0.066 0.144 0.12 B_Activated L2
ENSG00000029363 BCLAF1 841920 sc-eQTL 3.67e-01 -0.106 0.117 0.12 B_Activated L2
ENSG00000112357 PEX7 309207 sc-eQTL 7.75e-01 -0.0407 0.142 0.12 B_Activated L2
ENSG00000112378 PERP -975648 sc-eQTL 5.92e-01 -0.0394 0.0735 0.12 B_Activated L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 -735443 sc-eQTL 5.47e-01 0.0861 0.142 0.12 B_Activated L2
ENSG00000197442 MAP3K5 339294 sc-eQTL 8.43e-01 0.0316 0.16 0.12 B_Activated L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 -736462 sc-eQTL 9.63e-01 0.00582 0.125 0.12 B_Activated L2
ENSG00000027697 IFNGR1 -87678 sc-eQTL 5.20e-02 0.24 0.123 0.122 B_Intermediate L2
ENSG00000029363 BCLAF1 841920 sc-eQTL 3.39e-01 0.0674 0.0703 0.122 B_Intermediate L2
ENSG00000112357 PEX7 309207 sc-eQTL 4.52e-01 0.0975 0.129 0.122 B_Intermediate L2
ENSG00000112378 PERP -975648 sc-eQTL 3.93e-02 -0.243 0.117 0.122 B_Intermediate L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 -735443 sc-eQTL 9.50e-01 0.00586 0.0927 0.122 B_Intermediate L2
ENSG00000197442 MAP3K5 339294 sc-eQTL 7.81e-02 0.197 0.111 0.122 B_Intermediate L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 -736462 sc-eQTL 1.39e-01 -0.194 0.131 0.122 B_Intermediate L2
ENSG00000027697 IFNGR1 -87678 sc-eQTL 8.22e-01 0.0301 0.134 0.123 B_Memory L2
ENSG00000029363 BCLAF1 841920 sc-eQTL 8.09e-02 0.138 0.0788 0.123 B_Memory L2
ENSG00000112357 PEX7 309207 sc-eQTL 6.95e-01 0.053 0.135 0.123 B_Memory L2
ENSG00000112378 PERP -975648 sc-eQTL 5.24e-01 0.0809 0.127 0.123 B_Memory L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 -735443 sc-eQTL 7.19e-01 0.0315 0.0874 0.123 B_Memory L2
ENSG00000197442 MAP3K5 339294 sc-eQTL 1.32e-01 -0.18 0.119 0.123 B_Memory L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 -736462 sc-eQTL 9.73e-02 0.215 0.129 0.123 B_Memory L2
ENSG00000027697 IFNGR1 -87678 sc-eQTL 9.32e-01 0.00905 0.106 0.122 B_Naive1 L2
ENSG00000029363 BCLAF1 841920 sc-eQTL 8.68e-01 0.01 0.0606 0.122 B_Naive1 L2
ENSG00000112357 PEX7 309207 sc-eQTL 9.08e-01 0.0163 0.14 0.122 B_Naive1 L2
ENSG00000112378 PERP -975648 sc-eQTL 6.65e-01 -0.0531 0.122 0.122 B_Naive1 L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 -735443 sc-eQTL 2.79e-01 0.0767 0.0707 0.122 B_Naive1 L2
ENSG00000197442 MAP3K5 339294 sc-eQTL 2.48e-01 0.115 0.0994 0.122 B_Naive1 L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 -736462 sc-eQTL 3.87e-01 0.0961 0.111 0.122 B_Naive1 L2
ENSG00000027697 IFNGR1 -87678 sc-eQTL 6.80e-02 0.228 0.125 0.122 B_Naive2 L2
ENSG00000029363 BCLAF1 841920 sc-eQTL 3.79e-01 0.0641 0.0726 0.122 B_Naive2 L2
ENSG00000112357 PEX7 309207 sc-eQTL 5.88e-01 -0.0745 0.137 0.122 B_Naive2 L2
ENSG00000112378 PERP -975648 sc-eQTL 8.21e-01 -0.0227 0.1 0.122 B_Naive2 L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 -735443 sc-eQTL 8.13e-01 0.0237 0.1 0.122 B_Naive2 L2
ENSG00000197442 MAP3K5 339294 sc-eQTL 6.92e-01 0.0421 0.106 0.122 B_Naive2 L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 -736462 sc-eQTL 2.89e-01 0.137 0.129 0.122 B_Naive2 L2
ENSG00000027697 IFNGR1 -87678 sc-eQTL 9.29e-02 0.196 0.116 0.125 CD4_CTL L2
ENSG00000029363 BCLAF1 841920 sc-eQTL 3.03e-01 0.107 0.103 0.125 CD4_CTL L2
ENSG00000112357 PEX7 309207 sc-eQTL 2.29e-01 -0.156 0.129 0.125 CD4_CTL L2
ENSG00000112378 PERP -975648 sc-eQTL 9.54e-02 -0.218 0.13 0.125 CD4_CTL L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 -735443 sc-eQTL 4.41e-01 0.059 0.0764 0.125 CD4_CTL L2
ENSG00000197442 MAP3K5 339294 sc-eQTL 4.60e-01 0.0903 0.122 0.125 CD4_CTL L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 -736462 sc-eQTL 9.44e-01 0.00833 0.119 0.125 CD4_CTL L2
ENSG00000027697 IFNGR1 -87678 sc-eQTL 4.60e-01 -0.0485 0.0655 0.122 CD4_Naive L2
ENSG00000029363 BCLAF1 841920 sc-eQTL 9.98e-01 0.000129 0.0527 0.122 CD4_Naive L2
ENSG00000112357 PEX7 309207 sc-eQTL 6.83e-01 -0.0507 0.124 0.122 CD4_Naive L2
ENSG00000112378 PERP -975648 sc-eQTL 8.62e-01 0.0177 0.102 0.122 CD4_Naive L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 -735443 sc-eQTL 4.10e-01 -0.0591 0.0716 0.122 CD4_Naive L2
ENSG00000197442 MAP3K5 339294 sc-eQTL 9.44e-01 -0.00373 0.0527 0.122 CD4_Naive L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 -736462 sc-eQTL 1.89e-01 0.122 0.0925 0.122 CD4_Naive L2
ENSG00000027697 IFNGR1 -87678 sc-eQTL 9.06e-01 0.0108 0.0914 0.122 CD4_TCM L2
ENSG00000029363 BCLAF1 841920 sc-eQTL 5.90e-01 -0.0312 0.0577 0.122 CD4_TCM L2
ENSG00000112357 PEX7 309207 sc-eQTL 5.89e-01 0.0726 0.134 0.122 CD4_TCM L2
ENSG00000112378 PERP -975648 sc-eQTL 9.69e-01 0.00441 0.113 0.122 CD4_TCM L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 -735443 sc-eQTL 5.70e-01 -0.0374 0.0658 0.122 CD4_TCM L2
ENSG00000197442 MAP3K5 339294 sc-eQTL 6.39e-01 0.0353 0.075 0.122 CD4_TCM L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 -736462 sc-eQTL 1.74e-01 0.125 0.0919 0.122 CD4_TCM L2
ENSG00000027697 IFNGR1 -87678 sc-eQTL 4.38e-01 -0.0817 0.105 0.122 CD4_TEM L2
ENSG00000029363 BCLAF1 841920 sc-eQTL 7.12e-01 0.0276 0.0746 0.122 CD4_TEM L2
ENSG00000112357 PEX7 309207 sc-eQTL 9.85e-01 0.00248 0.136 0.122 CD4_TEM L2
ENSG00000112378 PERP -975648 sc-eQTL 4.69e-02 -0.218 0.109 0.122 CD4_TEM L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 -735443 sc-eQTL 5.27e-01 -0.0443 0.0699 0.122 CD4_TEM L2
ENSG00000197442 MAP3K5 339294 sc-eQTL 5.63e-01 0.0625 0.108 0.122 CD4_TEM L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 -736462 sc-eQTL 1.96e-01 0.145 0.112 0.122 CD4_TEM L2
ENSG00000027697 IFNGR1 -87678 sc-eQTL 9.57e-01 0.00517 0.0957 0.122 CD8_CTL L2
ENSG00000029363 BCLAF1 841920 sc-eQTL 2.95e-01 0.0668 0.0636 0.122 CD8_CTL L2
ENSG00000112357 PEX7 309207 sc-eQTL 8.39e-01 -0.0268 0.132 0.122 CD8_CTL L2
ENSG00000112378 PERP -975648 sc-eQTL 4.58e-01 -0.0941 0.126 0.122 CD8_CTL L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 -735443 sc-eQTL 6.38e-01 -0.0379 0.0804 0.122 CD8_CTL L2
ENSG00000197442 MAP3K5 339294 sc-eQTL 8.59e-01 -0.0202 0.114 0.122 CD8_CTL L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 -736462 sc-eQTL 4.85e-01 -0.0791 0.113 0.122 CD8_CTL L2
ENSG00000027697 IFNGR1 -87678 sc-eQTL 9.68e-01 0.00372 0.0924 0.122 CD8_Naive L2
ENSG00000029363 BCLAF1 841920 sc-eQTL 8.91e-01 0.00884 0.0645 0.122 CD8_Naive L2
ENSG00000112357 PEX7 309207 sc-eQTL 2.50e-01 0.154 0.133 0.122 CD8_Naive L2
ENSG00000112378 PERP -975648 sc-eQTL 1.35e-01 0.152 0.101 0.122 CD8_Naive L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 -735443 sc-eQTL 5.63e-01 -0.0418 0.0722 0.122 CD8_Naive L2
ENSG00000197442 MAP3K5 339294 sc-eQTL 2.61e-01 0.0961 0.0854 0.122 CD8_Naive L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 -736462 sc-eQTL 8.51e-01 0.0201 0.107 0.122 CD8_Naive L2
ENSG00000027697 IFNGR1 -87678 sc-eQTL 4.69e-01 -0.0924 0.127 0.12 CD8_TCM L2
ENSG00000029363 BCLAF1 841920 sc-eQTL 6.57e-02 0.175 0.0948 0.12 CD8_TCM L2
ENSG00000112357 PEX7 309207 sc-eQTL 4.85e-01 -0.102 0.146 0.12 CD8_TCM L2
ENSG00000112378 PERP -975648 sc-eQTL 7.96e-02 -0.25 0.142 0.12 CD8_TCM L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 -735443 sc-eQTL 9.39e-01 -0.00533 0.0691 0.12 CD8_TCM L2
ENSG00000197442 MAP3K5 339294 sc-eQTL 4.41e-01 0.095 0.123 0.12 CD8_TCM L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 -736462 sc-eQTL 8.86e-01 0.0181 0.126 0.12 CD8_TCM L2
ENSG00000027697 IFNGR1 -87678 sc-eQTL 2.88e-01 -0.125 0.117 0.128 CD8_TEM L2
ENSG00000029363 BCLAF1 841920 sc-eQTL 5.74e-02 0.21 0.11 0.128 CD8_TEM L2
ENSG00000112357 PEX7 309207 sc-eQTL 4.72e-01 0.0973 0.135 0.128 CD8_TEM L2
ENSG00000112378 PERP -975648 sc-eQTL 3.89e-01 -0.121 0.14 0.128 CD8_TEM L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 -735443 sc-eQTL 8.69e-01 -0.0144 0.0866 0.128 CD8_TEM L2
ENSG00000197442 MAP3K5 339294 sc-eQTL 1.05e-01 0.217 0.133 0.128 CD8_TEM L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 -736462 sc-eQTL 9.53e-01 -0.00756 0.129 0.128 CD8_TEM L2
ENSG00000027697 IFNGR1 -87678 sc-eQTL 3.00e-01 -0.0997 0.096 0.123 MAIT L2
ENSG00000029363 BCLAF1 841920 sc-eQTL 5.46e-01 -0.0483 0.0799 0.123 MAIT L2
ENSG00000112357 PEX7 309207 sc-eQTL 7.86e-01 -0.0354 0.13 0.123 MAIT L2
ENSG00000112378 PERP -975648 sc-eQTL 4.51e-01 -0.103 0.136 0.123 MAIT L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 -735443 sc-eQTL 6.76e-01 -0.0271 0.0647 0.123 MAIT L2
ENSG00000146410 MTFR2 881436 sc-eQTL 3.94e-01 -0.0919 0.108 0.123 MAIT L2
ENSG00000197442 MAP3K5 339294 sc-eQTL 5.13e-01 0.0739 0.113 0.123 MAIT L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 -736462 sc-eQTL 6.16e-01 0.0601 0.12 0.123 MAIT L2
ENSG00000027697 IFNGR1 -87678 sc-eQTL 3.62e-01 -0.0989 0.108 0.12 NK_CD56bright L2
ENSG00000029363 BCLAF1 841920 sc-eQTL 1.22e-01 0.124 0.0795 0.12 NK_CD56bright L2
ENSG00000112357 PEX7 309207 sc-eQTL 8.63e-01 0.0244 0.141 0.12 NK_CD56bright L2
ENSG00000112378 PERP -975648 sc-eQTL 1.16e-01 -0.199 0.126 0.12 NK_CD56bright L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 -735443 sc-eQTL 5.03e-01 0.0541 0.0807 0.12 NK_CD56bright L2
ENSG00000197442 MAP3K5 339294 sc-eQTL 6.24e-02 0.228 0.122 0.12 NK_CD56bright L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 -736462 sc-eQTL 7.70e-01 0.0377 0.129 0.12 NK_CD56bright L2
ENSG00000027697 IFNGR1 -87678 sc-eQTL 4.83e-01 -0.0571 0.0813 0.123 NK_CD56dim L2
ENSG00000029363 BCLAF1 841920 sc-eQTL 6.97e-01 -0.0207 0.0532 0.123 NK_CD56dim L2
ENSG00000112357 PEX7 309207 sc-eQTL 7.35e-01 0.0474 0.14 0.123 NK_CD56dim L2
ENSG00000112378 PERP -975648 sc-eQTL 2.48e-01 -0.114 0.0983 0.123 NK_CD56dim L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 -735443 sc-eQTL 3.96e-01 -0.0651 0.0765 0.123 NK_CD56dim L2
ENSG00000197442 MAP3K5 339294 sc-eQTL 5.22e-02 0.214 0.109 0.123 NK_CD56dim L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 -736462 sc-eQTL 9.11e-01 0.0128 0.115 0.123 NK_CD56dim L2
ENSG00000027697 IFNGR1 -87678 sc-eQTL 2.82e-01 -0.111 0.103 0.123 NK_HLA L2
ENSG00000029363 BCLAF1 841920 sc-eQTL 6.44e-01 -0.0403 0.0871 0.123 NK_HLA L2
ENSG00000112357 PEX7 309207 sc-eQTL 5.86e-01 -0.0714 0.131 0.123 NK_HLA L2
ENSG00000112378 PERP -975648 sc-eQTL 8.70e-01 -0.0174 0.106 0.123 NK_HLA L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 -735443 sc-eQTL 5.62e-01 0.0474 0.0815 0.123 NK_HLA L2
ENSG00000197442 MAP3K5 339294 sc-eQTL 2.34e-01 0.154 0.129 0.123 NK_HLA L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 -736462 sc-eQTL 1.11e-02 0.332 0.129 0.123 NK_HLA L2
ENSG00000027697 IFNGR1 -87678 sc-eQTL 7.05e-01 -0.0325 0.086 0.123 NK_cytokine L2
ENSG00000029363 BCLAF1 841920 sc-eQTL 6.45e-02 -0.118 0.0637 0.123 NK_cytokine L2
ENSG00000112357 PEX7 309207 sc-eQTL 3.49e-01 -0.127 0.135 0.123 NK_cytokine L2
ENSG00000112378 PERP -975648 sc-eQTL 6.36e-01 0.0485 0.102 0.123 NK_cytokine L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 -735443 sc-eQTL 9.93e-01 -0.000708 0.0768 0.123 NK_cytokine L2
ENSG00000197442 MAP3K5 339294 sc-eQTL 2.90e-02 0.229 0.104 0.123 NK_cytokine L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 -736462 sc-eQTL 8.83e-01 0.017 0.116 0.123 NK_cytokine L2
ENSG00000027697 IFNGR1 -87678 sc-eQTL 9.29e-01 -0.0144 0.162 0.126 PB L2
ENSG00000029363 BCLAF1 841920 sc-eQTL 9.17e-02 0.234 0.138 0.126 PB L2
ENSG00000112357 PEX7 309207 sc-eQTL 9.29e-01 0.0148 0.166 0.126 PB L2
ENSG00000112378 PERP -975648 sc-eQTL 9.67e-01 0.00435 0.104 0.126 PB L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 -735443 sc-eQTL 6.15e-01 -0.0633 0.126 0.126 PB L2
ENSG00000197442 MAP3K5 339294 sc-eQTL 2.24e-01 0.174 0.142 0.126 PB L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 -736462 sc-eQTL 5.17e-01 -0.0978 0.151 0.126 PB L2
ENSG00000027697 IFNGR1 -87678 sc-eQTL 4.58e-02 -0.219 0.109 0.12 Pro_T L2
ENSG00000029363 BCLAF1 841920 sc-eQTL 9.98e-02 0.188 0.114 0.12 Pro_T L2
ENSG00000112357 PEX7 309207 sc-eQTL 4.90e-01 0.0926 0.134 0.12 Pro_T L2
ENSG00000112378 PERP -975648 sc-eQTL 8.47e-01 -0.0206 0.107 0.12 Pro_T L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 -735443 sc-eQTL 4.23e-01 -0.0539 0.0671 0.12 Pro_T L2
ENSG00000146410 MTFR2 881436 sc-eQTL 6.38e-01 0.0439 0.0931 0.12 Pro_T L2
ENSG00000197442 MAP3K5 339294 sc-eQTL 1.60e-01 0.182 0.129 0.12 Pro_T L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 -736462 sc-eQTL 2.28e-02 -0.295 0.129 0.12 Pro_T L2
ENSG00000027697 IFNGR1 -87678 sc-eQTL 9.65e-01 0.00541 0.123 0.122 Treg L2
ENSG00000029363 BCLAF1 841920 sc-eQTL 8.78e-01 0.0123 0.0798 0.122 Treg L2
ENSG00000112357 PEX7 309207 sc-eQTL 4.87e-01 0.0908 0.13 0.122 Treg L2
ENSG00000112378 PERP -975648 sc-eQTL 1.06e-01 -0.227 0.14 0.122 Treg L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 -735443 sc-eQTL 5.06e-01 -0.0522 0.0784 0.122 Treg L2
ENSG00000197442 MAP3K5 339294 sc-eQTL 7.19e-01 -0.0306 0.085 0.122 Treg L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 -736462 sc-eQTL 1.77e-01 0.161 0.119 0.122 Treg L2
ENSG00000027697 IFNGR1 -87678 sc-eQTL 2.05e-01 0.139 0.11 0.12 cDC L2
ENSG00000029363 BCLAF1 841920 sc-eQTL 8.45e-01 -0.0217 0.111 0.12 cDC L2
ENSG00000112357 PEX7 309207 sc-eQTL 4.92e-01 -0.098 0.142 0.12 cDC L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 -735443 sc-eQTL 8.40e-01 -0.0219 0.108 0.12 cDC L2
ENSG00000135525 MAP7 580952 sc-eQTL 3.33e-01 -0.123 0.126 0.12 cDC L2
ENSG00000197442 MAP3K5 339294 sc-eQTL 8.55e-01 0.0204 0.112 0.12 cDC L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 -736462 sc-eQTL 3.42e-01 -0.134 0.141 0.12 cDC L2
ENSG00000286646 AL121933.2 347726 sc-eQTL 3.54e-01 -0.135 0.145 0.12 cDC L2
ENSG00000027697 IFNGR1 -87678 sc-eQTL 4.38e-01 -0.0572 0.0736 0.122 cMono_IL1B L2
ENSG00000029363 BCLAF1 841920 sc-eQTL 5.73e-02 -0.15 0.0784 0.122 cMono_IL1B L2
ENSG00000112357 PEX7 309207 sc-eQTL 5.70e-01 -0.0754 0.133 0.122 cMono_IL1B L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 -735443 sc-eQTL 9.86e-01 -0.00144 0.0794 0.122 cMono_IL1B L2
ENSG00000135525 MAP7 580952 sc-eQTL 6.57e-01 -0.0507 0.114 0.122 cMono_IL1B L2
ENSG00000197442 MAP3K5 339294 sc-eQTL 4.83e-01 -0.0579 0.0825 0.122 cMono_IL1B L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 -736462 sc-eQTL 6.01e-01 0.0444 0.0847 0.122 cMono_IL1B L2
ENSG00000286646 AL121933.2 347726 sc-eQTL 3.30e-01 -0.103 0.106 0.122 cMono_IL1B L2
ENSG00000027697 IFNGR1 -87678 sc-eQTL 9.37e-01 -0.00682 0.0862 0.122 cMono_S100A L2
ENSG00000029363 BCLAF1 841920 sc-eQTL 7.72e-02 -0.156 0.0879 0.122 cMono_S100A L2
ENSG00000112357 PEX7 309207 sc-eQTL 4.72e-01 0.0996 0.138 0.122 cMono_S100A L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 -735443 sc-eQTL 3.82e-01 -0.0671 0.0765 0.122 cMono_S100A L2
ENSG00000135525 MAP7 580952 sc-eQTL 1.57e-02 -0.31 0.127 0.122 cMono_S100A L2
ENSG00000197442 MAP3K5 339294 sc-eQTL 1.04e-01 -0.169 0.103 0.122 cMono_S100A L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 -736462 sc-eQTL 7.65e-01 0.033 0.11 0.122 cMono_S100A L2
ENSG00000286646 AL121933.2 347726 sc-eQTL 8.78e-01 -0.0165 0.107 0.122 cMono_S100A L2
ENSG00000027697 IFNGR1 -87678 sc-eQTL 3.43e-01 -0.118 0.124 0.127 gdT L2
ENSG00000029363 BCLAF1 841920 sc-eQTL 7.74e-01 -0.0315 0.11 0.127 gdT L2
ENSG00000112357 PEX7 309207 sc-eQTL 7.04e-01 0.06 0.158 0.127 gdT L2
ENSG00000112378 PERP -975648 sc-eQTL 2.07e-01 -0.174 0.137 0.127 gdT L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 -735443 sc-eQTL 3.38e-01 -0.0734 0.0763 0.127 gdT L2
ENSG00000146410 MTFR2 881436 sc-eQTL 8.93e-01 -0.0163 0.121 0.127 gdT L2
ENSG00000197442 MAP3K5 339294 sc-eQTL 8.74e-02 0.276 0.16 0.127 gdT L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 -736462 sc-eQTL 9.42e-01 -0.0101 0.139 0.127 gdT L2
ENSG00000027697 IFNGR1 -87678 sc-eQTL 9.12e-01 0.0103 0.0934 0.122 intMono L2
ENSG00000029363 BCLAF1 841920 sc-eQTL 4.24e-01 -0.0987 0.123 0.122 intMono L2
ENSG00000112357 PEX7 309207 sc-eQTL 3.85e-01 0.109 0.126 0.122 intMono L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 -735443 sc-eQTL 2.76e-01 -0.0879 0.0804 0.122 intMono L2
ENSG00000135525 MAP7 580952 sc-eQTL 7.20e-01 -0.0444 0.124 0.122 intMono L2
ENSG00000197442 MAP3K5 339294 sc-eQTL 3.81e-01 -0.115 0.131 0.122 intMono L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 -736462 sc-eQTL 9.15e-02 -0.202 0.119 0.122 intMono L2
ENSG00000286646 AL121933.2 347726 sc-eQTL 3.10e-01 -0.141 0.138 0.122 intMono L2
ENSG00000027697 IFNGR1 -87678 sc-eQTL 7.06e-01 0.042 0.111 0.115 ncMono L2
ENSG00000029363 BCLAF1 841920 sc-eQTL 3.39e-01 -0.0827 0.0862 0.115 ncMono L2
ENSG00000112357 PEX7 309207 sc-eQTL 7.46e-01 0.0447 0.138 0.115 ncMono L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 -735443 sc-eQTL 5.35e-02 -0.189 0.0975 0.115 ncMono L2
ENSG00000135525 MAP7 580952 sc-eQTL 7.26e-03 0.324 0.119 0.115 ncMono L2
ENSG00000197442 MAP3K5 339294 sc-eQTL 4.66e-01 -0.0932 0.128 0.115 ncMono L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 -736462 sc-eQTL 6.82e-01 -0.0504 0.123 0.115 ncMono L2
ENSG00000286646 AL121933.2 347726 sc-eQTL 8.86e-01 0.0187 0.13 0.115 ncMono L2
ENSG00000027697 IFNGR1 -87678 sc-eQTL 3.93e-01 0.113 0.132 0.11 pDC L2
ENSG00000029363 BCLAF1 841920 sc-eQTL 5.79e-01 -0.0551 0.0991 0.11 pDC L2
ENSG00000112357 PEX7 309207 sc-eQTL 9.09e-01 0.0167 0.146 0.11 pDC L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 -735443 sc-eQTL 9.04e-01 0.0148 0.123 0.11 pDC L2
ENSG00000135525 MAP7 580952 sc-eQTL 9.33e-01 -0.00854 0.102 0.11 pDC L2
ENSG00000197442 MAP3K5 339294 sc-eQTL 1.39e-01 -0.24 0.162 0.11 pDC L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 -736462 sc-eQTL 8.36e-01 0.0257 0.124 0.11 pDC L2
ENSG00000286646 AL121933.2 347726 sc-eQTL 7.63e-02 -0.265 0.149 0.11 pDC L2
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000027697 IFNGR1 -87678 sc-eQTL 7.38e-01 0.0372 0.111 0.122 B_Memory LOneK1K
ENSG00000029363 BCLAF1 841920 sc-eQTL 5.03e-01 0.0418 0.0623 0.122 B_Memory LOneK1K
ENSG00000112357 PEX7 309207 sc-eQTL 9.17e-01 -0.0134 0.128 0.122 B_Memory LOneK1K
ENSG00000112378 PERP -975648 sc-eQTL 9.68e-01 -0.00481 0.119 0.122 B_Memory LOneK1K
ENSG00000118503 TNFAIP3 -735443 sc-eQTL 5.43e-01 -0.0477 0.0783 0.122 B_Memory LOneK1K
ENSG00000197442 MAP3K5 339294 sc-eQTL 4.73e-01 0.0746 0.104 0.122 B_Memory LOneK1K
ENSG00000237499 WAKMAR2 -736462 sc-eQTL 7.20e-01 -0.0475 0.132 0.122 B_Memory LOneK1K
ENSG00000027697 IFNGR1 -87678 sc-eQTL 2.96e-01 0.114 0.109 0.122 B_Naive LOneK1K
ENSG00000029363 BCLAF1 841920 sc-eQTL 7.66e-01 0.0149 0.05 0.122 B_Naive LOneK1K
ENSG00000112357 PEX7 309207 sc-eQTL 8.28e-01 -0.0288 0.132 0.122 B_Naive LOneK1K
ENSG00000112378 PERP -975648 sc-eQTL 5.76e-01 -0.0664 0.119 0.122 B_Naive LOneK1K
ENSG00000118503 TNFAIP3 -735443 sc-eQTL 3.01e-01 0.0644 0.0622 0.122 B_Naive LOneK1K
ENSG00000197442 MAP3K5 339294 sc-eQTL 1.62e-01 0.128 0.0909 0.122 B_Naive LOneK1K
ENSG00000237499 WAKMAR2 -736462 sc-eQTL 1.31e-01 0.167 0.11 0.122 B_Naive LOneK1K
ENSG00000027697 IFNGR1 -87678 sc-eQTL 6.98e-01 -0.0289 0.0744 0.122 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000029363 BCLAF1 841920 sc-eQTL 1.99e-02 -0.16 0.0684 0.122 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000112357 PEX7 309207 sc-eQTL 8.60e-01 -0.0236 0.134 0.122 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000118503 TNFAIP3 -735443 sc-eQTL 9.36e-01 -0.00551 0.0688 0.122 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000135525 MAP7 580952 sc-eQTL 1.43e-01 -0.175 0.119 0.122 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000197442 MAP3K5 339294 sc-eQTL 3.05e-01 -0.0827 0.0805 0.122 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000237499 WAKMAR2 -736462 sc-eQTL 6.38e-01 0.0388 0.0824 0.122 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000286646 AL121933.2 347726 sc-eQTL 4.53e-01 -0.0721 0.0959 0.122 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000027697 IFNGR1 -87678 sc-eQTL 8.86e-01 -0.0128 0.0895 0.123 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000029363 BCLAF1 841920 sc-eQTL 7.81e-02 -0.142 0.0803 0.123 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000112357 PEX7 309207 sc-eQTL 7.40e-01 0.0448 0.135 0.123 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000118503 TNFAIP3 -735443 sc-eQTL 3.86e-01 -0.0725 0.0835 0.123 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000135525 MAP7 580952 sc-eQTL 1.47e-01 0.189 0.13 0.123 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000197442 MAP3K5 339294 sc-eQTL 2.71e-01 -0.118 0.107 0.123 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000237499 WAKMAR2 -736462 sc-eQTL 3.32e-01 -0.109 0.112 0.123 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000286646 AL121933.2 347726 sc-eQTL 4.66e-01 -0.0928 0.127 0.123 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000027697 IFNGR1 -87678 sc-eQTL 6.02e-01 -0.0435 0.0833 0.123 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000029363 BCLAF1 841920 sc-eQTL 1.55e-01 -0.0687 0.0482 0.123 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000112357 PEX7 309207 sc-eQTL 9.92e-01 0.00137 0.141 0.123 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000112378 PERP -975648 sc-eQTL 7.55e-01 -0.0272 0.0872 0.123 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000118503 TNFAIP3 -735443 sc-eQTL 4.65e-01 -0.0555 0.0759 0.123 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000197442 MAP3K5 339294 sc-eQTL 2.82e-02 0.224 0.101 0.123 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000237499 WAKMAR2 -736462 sc-eQTL 3.83e-01 0.0928 0.106 0.123 NK_CD56dim LOneK1K

Statistical fine-mapping results from Japan COVID-19 Task Force
(Shown only for PIP>0.001)
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
PIP (SuSiE)
PIP (FINEMAP)
MAF
ENSG00000027697 IFNGR1 -87678 eQTL 0.00516 -0.0514 0.0183 0.0 0.0 0.146
ENSG00000112357 PEX7 309207 eQTL 0.0116 0.0904 0.0357 0.0 0.0 0.146
ENSG00000182747 SLC35D3 209470 eQTL 0.000622 -0.145 0.0422 0.0 0.0 0.146
ENSG00000197442 MAP3K5 339294 eQTL 0.00905 0.0436 0.0167 0.0 0.0 0.146

Expression Modifier Score(EMS) for GTEx 49tissues
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Whole Blood
Muscle Skeletal
Liver
Brain Cerebellum
Prostate
Spleen
Skin Sun Exposed Lower leg
Artery Coronary
Esophagus Muscularis
Esophagus Gastroesophageal Junction
Artery Tibial
Heart Atrial Appendage
Nerve Tibial
Heart Left Ventricle
Adrenal Gland
Adipose Visceral Omentum
Pancreas
Lung
Pituitary
Brain Nucleus accumbens basal ganglia
Colon Transverse
Adipose Subcutaneous
Esophagus Mucosa
Brain Cortex
Thyroid
Stomach
Breast Mammary Tissue
Colon Sigmoid
Skin Not Sun Exposed Suprapubic
Testis
Artery Aorta
Brain Amygdala
Brain Anterior cingulate cortex BA24
Brain Caudate basal ganglia
Brain Cerebellar Hemisphere
Brain Frontal Cortex BA9
Brain Hippocampus
Brain Hypothalamus
Brain Putamen basal ganglia
Brain Spinal cord cervical c-1
Brain Substantia nigra
Cells Cultured fibroblasts
Cells EBV-transformed lymphocytes
Kidney Cortex
Minor Salivary Gland
Ovary
Small Intestine Terminal Ileum
Uterus
Vagina
ENSG00000027697 IFNGR1 -87678 7.62e-06 9.35e-06 9.68e-07 4.16e-06 1.76e-06 2.67e-06 9.45e-06 1.32e-06 6.09e-06 4.06e-06 9.41e-06 4.49e-06 1.13e-05 3.8e-06 1.66e-06 5.1e-06 3.71e-06 3.85e-06 2.23e-06 2.15e-06 3.16e-06 7.62e-06 5.89e-06 1.92e-06 1.11e-05 2.38e-06 3.56e-06 2.27e-06 6.94e-06 7.84e-06 4.24e-06 4.96e-07 7.23e-07 2.3e-06 2.74e-06 2.11e-06 1.12e-06 9.82e-07 1.4e-06 7.35e-07 5.82e-07 9.56e-06 1.03e-06 1.62e-07 7.45e-07 9.76e-07 9.99e-07 6.82e-07 5.73e-07
ENSG00000112378 \N -975648 2.77e-07 1.27e-07 5.14e-08 1.9e-07 9.79e-08 1e-07 1.49e-07 5.37e-08 1.45e-07 4.94e-08 1.55e-07 9.19e-08 1.52e-07 7.37e-08 6.12e-08 7.36e-08 4.17e-08 1.26e-07 6.07e-08 4.92e-08 1.19e-07 1.27e-07 1.44e-07 2.95e-08 1.46e-07 1.14e-07 1.07e-07 9.92e-08 1.09e-07 1.07e-07 9.92e-08 3.84e-08 4.02e-08 8e-08 6.67e-08 2.68e-08 5.8e-08 8.93e-08 6.55e-08 4.19e-08 5.44e-08 1.33e-07 5.08e-08 1.52e-08 3.2e-08 1.77e-08 1.19e-07 2.05e-09 4.8e-08