logo

Genes within 1Mb (chr6:137131593:G:A):

View on , UCSC , GTEx , gnomAD

Immune cell-type specific single cell cis-eQTLs in OASIS
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000027697 IFNGR1 -87856 sc-eQTL 1.66e-01 -0.111 0.0797 0.246 B L1
ENSG00000029363 BCLAF1 841742 sc-eQTL 3.97e-01 -0.0302 0.0356 0.246 B L1
ENSG00000112357 PEX7 309029 sc-eQTL 8.65e-02 0.162 0.0941 0.246 B L1
ENSG00000112378 PERP -975826 sc-eQTL 4.79e-01 -0.0444 0.0627 0.246 B L1
ENSG00000118503 TNFAIP3 -735621 sc-eQTL 7.61e-01 -0.0154 0.0505 0.246 B L1
ENSG00000197442 MAP3K5 339116 sc-eQTL 7.51e-02 -0.125 0.0699 0.246 B L1
ENSG00000237499 WAKMAR2 -736640 sc-eQTL 7.79e-01 -0.0224 0.0795 0.246 B L1
ENSG00000027697 IFNGR1 -87856 sc-eQTL 1.58e-01 -0.0746 0.0527 0.246 CD4T L1
ENSG00000029363 BCLAF1 841742 sc-eQTL 3.52e-01 -0.0373 0.04 0.246 CD4T L1
ENSG00000112357 PEX7 309029 sc-eQTL 9.89e-01 -0.00114 0.0852 0.246 CD4T L1
ENSG00000112378 PERP -975826 sc-eQTL 9.32e-01 0.00486 0.0572 0.246 CD4T L1
ENSG00000118503 TNFAIP3 -735621 sc-eQTL 9.41e-01 -0.00399 0.0536 0.246 CD4T L1
ENSG00000197442 MAP3K5 339116 sc-eQTL 1.48e-01 -0.059 0.0406 0.246 CD4T L1
ENSG00000237499 WAKMAR2 -736640 sc-eQTL 5.31e-02 -0.13 0.0669 0.246 CD4T L1
ENSG00000027697 IFNGR1 -87856 sc-eQTL 7.63e-01 0.0183 0.0605 0.246 CD8T L1
ENSG00000029363 BCLAF1 841742 sc-eQTL 8.17e-01 -0.00949 0.0409 0.246 CD8T L1
ENSG00000112357 PEX7 309029 sc-eQTL 4.35e-01 -0.0787 0.101 0.246 CD8T L1
ENSG00000112378 PERP -975826 sc-eQTL 3.47e-02 -0.139 0.0653 0.246 CD8T L1
ENSG00000118503 TNFAIP3 -735621 sc-eQTL 7.96e-01 0.0132 0.0509 0.246 CD8T L1
ENSG00000197442 MAP3K5 339116 sc-eQTL 7.29e-01 -0.0187 0.0538 0.246 CD8T L1
ENSG00000237499 WAKMAR2 -736640 sc-eQTL 8.59e-01 0.0133 0.0748 0.246 CD8T L1
ENSG00000027697 IFNGR1 -87856 sc-eQTL 6.63e-01 0.0319 0.073 0.248 DC L1
ENSG00000029363 BCLAF1 841742 sc-eQTL 9.77e-01 0.00191 0.0657 0.248 DC L1
ENSG00000112357 PEX7 309029 sc-eQTL 9.52e-01 0.00625 0.103 0.248 DC L1
ENSG00000118503 TNFAIP3 -735621 sc-eQTL 8.58e-01 0.014 0.078 0.248 DC L1
ENSG00000135525 MAP7 580774 sc-eQTL 7.85e-01 0.0231 0.0845 0.248 DC L1
ENSG00000197442 MAP3K5 339116 sc-eQTL 2.87e-01 0.0863 0.0808 0.248 DC L1
ENSG00000237499 WAKMAR2 -736640 sc-eQTL 3.70e-01 0.0713 0.0794 0.248 DC L1
ENSG00000286646 AL121933.2 347548 sc-eQTL 8.12e-01 -0.0251 0.106 0.248 DC L1
ENSG00000027697 IFNGR1 -87856 sc-eQTL 6.08e-02 -0.114 0.0605 0.246 Mono L1
ENSG00000029363 BCLAF1 841742 sc-eQTL 1.99e-01 0.0669 0.0519 0.246 Mono L1
ENSG00000112357 PEX7 309029 sc-eQTL 3.60e-01 -0.0938 0.102 0.246 Mono L1
ENSG00000118503 TNFAIP3 -735621 sc-eQTL 7.81e-01 0.0144 0.0517 0.246 Mono L1
ENSG00000135525 MAP7 580774 sc-eQTL 2.84e-01 -0.0969 0.0902 0.246 Mono L1
ENSG00000197442 MAP3K5 339116 sc-eQTL 5.25e-01 -0.0384 0.0603 0.246 Mono L1
ENSG00000237499 WAKMAR2 -736640 sc-eQTL 8.14e-01 0.0151 0.0641 0.246 Mono L1
ENSG00000286646 AL121933.2 347548 sc-eQTL 2.54e-01 0.0834 0.0729 0.246 Mono L1
ENSG00000027697 IFNGR1 -87856 sc-eQTL 3.68e-01 -0.0621 0.0689 0.247 NK L1
ENSG00000029363 BCLAF1 841742 sc-eQTL 9.54e-01 -0.00209 0.0366 0.247 NK L1
ENSG00000112357 PEX7 309029 sc-eQTL 3.51e-01 0.0994 0.106 0.247 NK L1
ENSG00000112378 PERP -975826 sc-eQTL 2.49e-01 0.0773 0.0669 0.247 NK L1
ENSG00000118503 TNFAIP3 -735621 sc-eQTL 8.04e-01 0.0143 0.0574 0.247 NK L1
ENSG00000197442 MAP3K5 339116 sc-eQTL 8.35e-01 0.0171 0.0823 0.247 NK L1
ENSG00000237499 WAKMAR2 -736640 sc-eQTL 9.66e-01 -0.00345 0.0814 0.247 NK L1
ENSG00000027697 IFNGR1 -87856 sc-eQTL 9.86e-01 -0.00114 0.0631 0.246 Other_T L1
ENSG00000029363 BCLAF1 841742 sc-eQTL 2.07e-01 -0.0667 0.0527 0.246 Other_T L1
ENSG00000112357 PEX7 309029 sc-eQTL 7.54e-01 -0.0323 0.103 0.246 Other_T L1
ENSG00000112378 PERP -975826 sc-eQTL 2.18e-01 0.102 0.0822 0.246 Other_T L1
ENSG00000118503 TNFAIP3 -735621 sc-eQTL 6.75e-01 0.0165 0.0392 0.246 Other_T L1
ENSG00000146410 MTFR2 881258 sc-eQTL 9.37e-01 0.00473 0.0594 0.246 Other_T L1
ENSG00000197442 MAP3K5 339116 sc-eQTL 8.98e-01 -0.00976 0.0758 0.246 Other_T L1
ENSG00000237499 WAKMAR2 -736640 sc-eQTL 5.58e-01 -0.0457 0.0778 0.246 Other_T L1
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000027697 IFNGR1 -87856 sc-eQTL 3.71e-01 -0.0937 0.104 0.255 B_Activated L2
ENSG00000029363 BCLAF1 841742 sc-eQTL 3.85e-01 0.0739 0.0848 0.255 B_Activated L2
ENSG00000112357 PEX7 309029 sc-eQTL 3.24e-03 0.3 0.1 0.255 B_Activated L2
ENSG00000112378 PERP -975826 sc-eQTL 6.35e-01 -0.0253 0.0533 0.255 B_Activated L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 -735621 sc-eQTL 6.29e-02 0.192 0.102 0.255 B_Activated L2
ENSG00000197442 MAP3K5 339116 sc-eQTL 3.62e-01 -0.106 0.115 0.255 B_Activated L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 -736640 sc-eQTL 4.70e-01 0.0652 0.0901 0.255 B_Activated L2
ENSG00000027697 IFNGR1 -87856 sc-eQTL 7.02e-01 -0.036 0.094 0.247 B_Intermediate L2
ENSG00000029363 BCLAF1 841742 sc-eQTL 9.02e-01 -0.00657 0.0535 0.247 B_Intermediate L2
ENSG00000112357 PEX7 309029 sc-eQTL 4.05e-02 0.201 0.0974 0.247 B_Intermediate L2
ENSG00000112378 PERP -975826 sc-eQTL 5.04e-02 -0.175 0.0889 0.247 B_Intermediate L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 -735621 sc-eQTL 7.13e-01 0.0259 0.0704 0.247 B_Intermediate L2
ENSG00000197442 MAP3K5 339116 sc-eQTL 2.06e-01 -0.108 0.0847 0.247 B_Intermediate L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 -736640 sc-eQTL 9.29e-01 0.00884 0.0998 0.247 B_Intermediate L2
ENSG00000027697 IFNGR1 -87856 sc-eQTL 7.71e-01 -0.03 0.103 0.248 B_Memory L2
ENSG00000029363 BCLAF1 841742 sc-eQTL 3.14e-01 0.0615 0.0609 0.248 B_Memory L2
ENSG00000112357 PEX7 309029 sc-eQTL 7.37e-01 0.035 0.104 0.248 B_Memory L2
ENSG00000112378 PERP -975826 sc-eQTL 5.06e-01 0.065 0.0976 0.248 B_Memory L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 -735621 sc-eQTL 5.40e-01 -0.0413 0.0672 0.248 B_Memory L2
ENSG00000197442 MAP3K5 339116 sc-eQTL 8.77e-02 0.157 0.0912 0.248 B_Memory L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 -736640 sc-eQTL 4.08e-01 -0.0828 0.0999 0.248 B_Memory L2
ENSG00000027697 IFNGR1 -87856 sc-eQTL 1.25e-01 -0.124 0.0805 0.246 B_Naive1 L2
ENSG00000029363 BCLAF1 841742 sc-eQTL 3.28e-01 -0.0452 0.0462 0.246 B_Naive1 L2
ENSG00000112357 PEX7 309029 sc-eQTL 4.89e-01 0.074 0.107 0.246 B_Naive1 L2
ENSG00000112378 PERP -975826 sc-eQTL 7.46e-01 0.0303 0.0934 0.246 B_Naive1 L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 -735621 sc-eQTL 6.87e-01 0.0219 0.0542 0.246 B_Naive1 L2
ENSG00000197442 MAP3K5 339116 sc-eQTL 8.96e-01 0.00994 0.0761 0.246 B_Naive1 L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 -736640 sc-eQTL 8.34e-01 -0.0178 0.0849 0.246 B_Naive1 L2
ENSG00000027697 IFNGR1 -87856 sc-eQTL 4.78e-01 -0.0691 0.0974 0.247 B_Naive2 L2
ENSG00000029363 BCLAF1 841742 sc-eQTL 1.78e-01 -0.0761 0.0563 0.247 B_Naive2 L2
ENSG00000112357 PEX7 309029 sc-eQTL 1.70e-01 0.146 0.106 0.247 B_Naive2 L2
ENSG00000112378 PERP -975826 sc-eQTL 3.08e-01 -0.0793 0.0775 0.247 B_Naive2 L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 -735621 sc-eQTL 7.98e-01 0.0199 0.0776 0.247 B_Naive2 L2
ENSG00000197442 MAP3K5 339116 sc-eQTL 3.61e-02 -0.173 0.0818 0.247 B_Naive2 L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 -736640 sc-eQTL 1.09e-01 -0.161 0.0998 0.247 B_Naive2 L2
ENSG00000027697 IFNGR1 -87856 sc-eQTL 7.89e-01 -0.0246 0.0921 0.245 CD4_CTL L2
ENSG00000029363 BCLAF1 841742 sc-eQTL 6.60e-01 0.036 0.0817 0.245 CD4_CTL L2
ENSG00000112357 PEX7 309029 sc-eQTL 8.19e-01 -0.0234 0.102 0.245 CD4_CTL L2
ENSG00000112378 PERP -975826 sc-eQTL 8.63e-02 0.177 0.103 0.245 CD4_CTL L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 -735621 sc-eQTL 9.59e-01 0.00314 0.0604 0.245 CD4_CTL L2
ENSG00000197442 MAP3K5 339116 sc-eQTL 6.20e-01 -0.0479 0.0963 0.245 CD4_CTL L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 -736640 sc-eQTL 5.61e-01 -0.0548 0.0939 0.245 CD4_CTL L2
ENSG00000027697 IFNGR1 -87856 sc-eQTL 5.10e-01 -0.0332 0.0503 0.246 CD4_Naive L2
ENSG00000029363 BCLAF1 841742 sc-eQTL 3.41e-01 -0.0385 0.0404 0.246 CD4_Naive L2
ENSG00000112357 PEX7 309029 sc-eQTL 6.10e-01 0.0486 0.0951 0.246 CD4_Naive L2
ENSG00000112378 PERP -975826 sc-eQTL 6.92e-01 0.0312 0.0785 0.246 CD4_Naive L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 -735621 sc-eQTL 6.50e-01 -0.025 0.0551 0.246 CD4_Naive L2
ENSG00000197442 MAP3K5 339116 sc-eQTL 2.65e-01 -0.0451 0.0403 0.246 CD4_Naive L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 -736640 sc-eQTL 1.86e-02 -0.167 0.0704 0.246 CD4_Naive L2
ENSG00000027697 IFNGR1 -87856 sc-eQTL 1.98e-01 -0.0892 0.0691 0.246 CD4_TCM L2
ENSG00000029363 BCLAF1 841742 sc-eQTL 9.21e-01 -0.00432 0.0438 0.246 CD4_TCM L2
ENSG00000112357 PEX7 309029 sc-eQTL 1.33e-01 0.153 0.101 0.246 CD4_TCM L2
ENSG00000112378 PERP -975826 sc-eQTL 3.59e-01 -0.079 0.0859 0.246 CD4_TCM L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 -735621 sc-eQTL 9.71e-01 0.00181 0.05 0.246 CD4_TCM L2
ENSG00000197442 MAP3K5 339116 sc-eQTL 3.37e-01 -0.0547 0.0568 0.246 CD4_TCM L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 -736640 sc-eQTL 5.26e-01 -0.0444 0.07 0.246 CD4_TCM L2
ENSG00000027697 IFNGR1 -87856 sc-eQTL 5.59e-02 -0.152 0.0789 0.246 CD4_TEM L2
ENSG00000029363 BCLAF1 841742 sc-eQTL 7.17e-01 -0.0205 0.0564 0.246 CD4_TEM L2
ENSG00000112357 PEX7 309029 sc-eQTL 1.33e-01 -0.154 0.102 0.246 CD4_TEM L2
ENSG00000112378 PERP -975826 sc-eQTL 3.47e-01 -0.0783 0.0831 0.246 CD4_TEM L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 -735621 sc-eQTL 2.45e-01 0.0615 0.0527 0.246 CD4_TEM L2
ENSG00000197442 MAP3K5 339116 sc-eQTL 9.27e-01 -0.00749 0.0817 0.246 CD4_TEM L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 -736640 sc-eQTL 5.83e-02 -0.16 0.0841 0.246 CD4_TEM L2
ENSG00000027697 IFNGR1 -87856 sc-eQTL 2.95e-01 0.0758 0.0722 0.246 CD8_CTL L2
ENSG00000029363 BCLAF1 841742 sc-eQTL 9.41e-01 0.00357 0.0483 0.246 CD8_CTL L2
ENSG00000112357 PEX7 309029 sc-eQTL 9.76e-01 0.00302 0.0996 0.246 CD8_CTL L2
ENSG00000112378 PERP -975826 sc-eQTL 1.24e-01 -0.147 0.0952 0.246 CD8_CTL L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 -735621 sc-eQTL 8.68e-01 -0.0101 0.0609 0.246 CD8_CTL L2
ENSG00000197442 MAP3K5 339116 sc-eQTL 4.52e-01 0.0646 0.0858 0.246 CD8_CTL L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 -736640 sc-eQTL 9.41e-01 0.00632 0.0856 0.246 CD8_CTL L2
ENSG00000027697 IFNGR1 -87856 sc-eQTL 2.72e-01 -0.08 0.0726 0.246 CD8_Naive L2
ENSG00000029363 BCLAF1 841742 sc-eQTL 8.85e-01 -0.00735 0.0508 0.246 CD8_Naive L2
ENSG00000112357 PEX7 309029 sc-eQTL 8.52e-01 -0.0197 0.105 0.246 CD8_Naive L2
ENSG00000112378 PERP -975826 sc-eQTL 2.89e-01 -0.0851 0.08 0.246 CD8_Naive L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 -735621 sc-eQTL 8.94e-01 0.00758 0.0569 0.246 CD8_Naive L2
ENSG00000197442 MAP3K5 339116 sc-eQTL 6.41e-01 -0.0315 0.0674 0.246 CD8_Naive L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 -736640 sc-eQTL 2.91e-01 -0.0888 0.084 0.246 CD8_Naive L2
ENSG00000027697 IFNGR1 -87856 sc-eQTL 6.70e-01 0.0412 0.0966 0.25 CD8_TCM L2
ENSG00000029363 BCLAF1 841742 sc-eQTL 4.40e-01 -0.0561 0.0724 0.25 CD8_TCM L2
ENSG00000112357 PEX7 309029 sc-eQTL 3.14e-01 -0.112 0.111 0.25 CD8_TCM L2
ENSG00000112378 PERP -975826 sc-eQTL 3.66e-01 -0.0982 0.108 0.25 CD8_TCM L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 -735621 sc-eQTL 9.47e-01 -0.00347 0.0524 0.25 CD8_TCM L2
ENSG00000197442 MAP3K5 339116 sc-eQTL 5.64e-01 -0.054 0.0934 0.25 CD8_TCM L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 -736640 sc-eQTL 5.44e-01 0.0582 0.0957 0.25 CD8_TCM L2
ENSG00000027697 IFNGR1 -87856 sc-eQTL 9.73e-01 0.00306 0.0917 0.24 CD8_TEM L2
ENSG00000029363 BCLAF1 841742 sc-eQTL 6.72e-01 -0.0367 0.0865 0.24 CD8_TEM L2
ENSG00000112357 PEX7 309029 sc-eQTL 3.43e-01 0.1 0.105 0.24 CD8_TEM L2
ENSG00000112378 PERP -975826 sc-eQTL 7.46e-01 -0.0356 0.11 0.24 CD8_TEM L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 -735621 sc-eQTL 6.54e-01 0.0304 0.0676 0.24 CD8_TEM L2
ENSG00000197442 MAP3K5 339116 sc-eQTL 4.19e-01 -0.0846 0.104 0.24 CD8_TEM L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 -736640 sc-eQTL 4.60e-01 -0.0742 0.1 0.24 CD8_TEM L2
ENSG00000027697 IFNGR1 -87856 sc-eQTL 5.99e-01 -0.0384 0.0729 0.249 MAIT L2
ENSG00000029363 BCLAF1 841742 sc-eQTL 3.98e-01 -0.0513 0.0606 0.249 MAIT L2
ENSG00000112357 PEX7 309029 sc-eQTL 4.25e-01 -0.0789 0.0988 0.249 MAIT L2
ENSG00000112378 PERP -975826 sc-eQTL 5.26e-01 0.0655 0.103 0.249 MAIT L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 -735621 sc-eQTL 9.99e-01 3.1e-05 0.0491 0.249 MAIT L2
ENSG00000146410 MTFR2 881258 sc-eQTL 4.25e-01 0.0653 0.0817 0.249 MAIT L2
ENSG00000197442 MAP3K5 339116 sc-eQTL 3.46e-01 0.0807 0.0854 0.249 MAIT L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 -736640 sc-eQTL 8.66e-01 -0.0153 0.0908 0.249 MAIT L2
ENSG00000027697 IFNGR1 -87856 sc-eQTL 5.35e-01 -0.0507 0.0816 0.247 NK_CD56bright L2
ENSG00000029363 BCLAF1 841742 sc-eQTL 4.80e-01 -0.0426 0.0602 0.247 NK_CD56bright L2
ENSG00000112357 PEX7 309029 sc-eQTL 9.93e-01 0.000964 0.106 0.247 NK_CD56bright L2
ENSG00000112378 PERP -975826 sc-eQTL 9.69e-01 0.00374 0.0953 0.247 NK_CD56bright L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 -735621 sc-eQTL 4.04e-01 0.0507 0.0607 0.247 NK_CD56bright L2
ENSG00000197442 MAP3K5 339116 sc-eQTL 8.35e-01 -0.0193 0.0925 0.247 NK_CD56bright L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 -736640 sc-eQTL 4.33e-01 0.0761 0.0968 0.247 NK_CD56bright L2
ENSG00000027697 IFNGR1 -87856 sc-eQTL 6.04e-01 0.0327 0.063 0.248 NK_CD56dim L2
ENSG00000029363 BCLAF1 841742 sc-eQTL 8.20e-01 0.00937 0.0412 0.248 NK_CD56dim L2
ENSG00000112357 PEX7 309029 sc-eQTL 6.56e-01 -0.0485 0.109 0.248 NK_CD56dim L2
ENSG00000112378 PERP -975826 sc-eQTL 1.22e-02 0.19 0.0752 0.248 NK_CD56dim L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 -735621 sc-eQTL 4.69e-01 0.043 0.0593 0.248 NK_CD56dim L2
ENSG00000197442 MAP3K5 339116 sc-eQTL 9.66e-01 0.00365 0.0855 0.248 NK_CD56dim L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 -736640 sc-eQTL 5.36e-01 0.055 0.0889 0.248 NK_CD56dim L2
ENSG00000027697 IFNGR1 -87856 sc-eQTL 3.19e-02 -0.183 0.0848 0.24 NK_HLA L2
ENSG00000029363 BCLAF1 841742 sc-eQTL 9.23e-01 0.00701 0.0726 0.24 NK_HLA L2
ENSG00000112357 PEX7 309029 sc-eQTL 3.69e-02 0.226 0.108 0.24 NK_HLA L2
ENSG00000112378 PERP -975826 sc-eQTL 6.04e-01 0.0459 0.0883 0.24 NK_HLA L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 -735621 sc-eQTL 3.45e-01 -0.0643 0.0678 0.24 NK_HLA L2
ENSG00000197442 MAP3K5 339116 sc-eQTL 3.39e-01 0.103 0.108 0.24 NK_HLA L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 -736640 sc-eQTL 6.68e-02 -0.2 0.109 0.24 NK_HLA L2
ENSG00000027697 IFNGR1 -87856 sc-eQTL 1.80e-01 -0.0916 0.0681 0.248 NK_cytokine L2
ENSG00000029363 BCLAF1 841742 sc-eQTL 8.20e-01 -0.0116 0.0511 0.248 NK_cytokine L2
ENSG00000112357 PEX7 309029 sc-eQTL 7.14e-02 0.193 0.107 0.248 NK_cytokine L2
ENSG00000112378 PERP -975826 sc-eQTL 6.00e-01 -0.0427 0.0814 0.248 NK_cytokine L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 -735621 sc-eQTL 4.29e-01 0.0483 0.061 0.248 NK_cytokine L2
ENSG00000197442 MAP3K5 339116 sc-eQTL 7.50e-01 -0.0268 0.0839 0.248 NK_cytokine L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 -736640 sc-eQTL 8.75e-01 -0.0145 0.0921 0.248 NK_cytokine L2
ENSG00000027697 IFNGR1 -87856 sc-eQTL 1.02e-01 -0.218 0.132 0.233 PB L2
ENSG00000029363 BCLAF1 841742 sc-eQTL 1.33e-02 -0.283 0.112 0.233 PB L2
ENSG00000112357 PEX7 309029 sc-eQTL 3.75e-01 0.122 0.137 0.233 PB L2
ENSG00000112378 PERP -975826 sc-eQTL 4.77e-02 -0.169 0.0844 0.233 PB L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 -735621 sc-eQTL 4.27e-01 0.0829 0.104 0.233 PB L2
ENSG00000197442 MAP3K5 339116 sc-eQTL 1.76e-02 -0.279 0.116 0.233 PB L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 -736640 sc-eQTL 1.62e-01 0.175 0.124 0.233 PB L2
ENSG00000027697 IFNGR1 -87856 sc-eQTL 6.14e-01 0.0411 0.0815 0.248 Pro_T L2
ENSG00000029363 BCLAF1 841742 sc-eQTL 5.44e-01 -0.0514 0.0845 0.248 Pro_T L2
ENSG00000112357 PEX7 309029 sc-eQTL 4.91e-01 0.0682 0.0989 0.248 Pro_T L2
ENSG00000112378 PERP -975826 sc-eQTL 3.58e-01 0.0725 0.0786 0.248 Pro_T L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 -735621 sc-eQTL 1.90e-01 0.0651 0.0495 0.248 Pro_T L2
ENSG00000146410 MTFR2 881258 sc-eQTL 7.20e-01 0.0247 0.0688 0.248 Pro_T L2
ENSG00000197442 MAP3K5 339116 sc-eQTL 3.44e-02 -0.203 0.0952 0.248 Pro_T L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 -736640 sc-eQTL 8.56e-01 -0.0175 0.0964 0.248 Pro_T L2
ENSG00000027697 IFNGR1 -87856 sc-eQTL 5.31e-01 -0.0593 0.0946 0.246 Treg L2
ENSG00000029363 BCLAF1 841742 sc-eQTL 9.10e-01 -0.00695 0.0611 0.246 Treg L2
ENSG00000112357 PEX7 309029 sc-eQTL 6.71e-01 -0.0426 0.1 0.246 Treg L2
ENSG00000112378 PERP -975826 sc-eQTL 4.05e-01 0.09 0.108 0.246 Treg L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 -735621 sc-eQTL 8.60e-01 0.0107 0.0602 0.246 Treg L2
ENSG00000197442 MAP3K5 339116 sc-eQTL 1.93e-01 0.0848 0.0649 0.246 Treg L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 -736640 sc-eQTL 9.99e-01 -0.000164 0.0918 0.246 Treg L2
ENSG00000027697 IFNGR1 -87856 sc-eQTL 2.03e-01 0.103 0.0809 0.254 cDC L2
ENSG00000029363 BCLAF1 841742 sc-eQTL 6.78e-01 0.0341 0.0819 0.254 cDC L2
ENSG00000112357 PEX7 309029 sc-eQTL 2.68e-01 0.116 0.105 0.254 cDC L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 -735621 sc-eQTL 8.60e-01 0.0141 0.0801 0.254 cDC L2
ENSG00000135525 MAP7 580774 sc-eQTL 1.53e-01 0.134 0.0932 0.254 cDC L2
ENSG00000197442 MAP3K5 339116 sc-eQTL 9.33e-01 -0.00691 0.0825 0.254 cDC L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 -736640 sc-eQTL 3.49e-01 0.0978 0.104 0.254 cDC L2
ENSG00000286646 AL121933.2 347548 sc-eQTL 7.73e-01 -0.0311 0.107 0.254 cDC L2
ENSG00000027697 IFNGR1 -87856 sc-eQTL 4.13e-01 -0.0466 0.0568 0.246 cMono_IL1B L2
ENSG00000029363 BCLAF1 841742 sc-eQTL 6.49e-01 0.0278 0.061 0.246 cMono_IL1B L2
ENSG00000112357 PEX7 309029 sc-eQTL 4.97e-01 -0.0695 0.102 0.246 cMono_IL1B L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 -735621 sc-eQTL 9.56e-01 0.00339 0.0612 0.246 cMono_IL1B L2
ENSG00000135525 MAP7 580774 sc-eQTL 2.16e-02 -0.201 0.087 0.246 cMono_IL1B L2
ENSG00000197442 MAP3K5 339116 sc-eQTL 6.35e-01 -0.0303 0.0636 0.246 cMono_IL1B L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 -736640 sc-eQTL 4.46e-01 0.0498 0.0653 0.246 cMono_IL1B L2
ENSG00000286646 AL121933.2 347548 sc-eQTL 1.14e-01 0.129 0.0814 0.246 cMono_IL1B L2
ENSG00000027697 IFNGR1 -87856 sc-eQTL 5.37e-02 -0.126 0.0648 0.246 cMono_S100A L2
ENSG00000029363 BCLAF1 841742 sc-eQTL 1.62e-01 0.0936 0.0668 0.246 cMono_S100A L2
ENSG00000112357 PEX7 309029 sc-eQTL 5.47e-01 -0.0632 0.105 0.246 cMono_S100A L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 -735621 sc-eQTL 2.61e-01 -0.0652 0.0579 0.246 cMono_S100A L2
ENSG00000135525 MAP7 580774 sc-eQTL 6.35e-01 0.0464 0.0977 0.246 cMono_S100A L2
ENSG00000197442 MAP3K5 339116 sc-eQTL 9.26e-01 -0.00738 0.0789 0.246 cMono_S100A L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 -736640 sc-eQTL 6.72e-02 -0.152 0.0827 0.246 cMono_S100A L2
ENSG00000286646 AL121933.2 347548 sc-eQTL 7.19e-01 0.0293 0.0813 0.246 cMono_S100A L2
ENSG00000027697 IFNGR1 -87856 sc-eQTL 5.72e-01 0.0551 0.0972 0.242 gdT L2
ENSG00000029363 BCLAF1 841742 sc-eQTL 9.09e-01 0.00982 0.0857 0.242 gdT L2
ENSG00000112357 PEX7 309029 sc-eQTL 8.64e-01 -0.0212 0.123 0.242 gdT L2
ENSG00000112378 PERP -975826 sc-eQTL 7.30e-02 0.192 0.107 0.242 gdT L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 -735621 sc-eQTL 8.34e-01 0.0126 0.0599 0.242 gdT L2
ENSG00000146410 MTFR2 881258 sc-eQTL 2.38e-01 0.112 0.094 0.242 gdT L2
ENSG00000197442 MAP3K5 339116 sc-eQTL 8.06e-01 0.0311 0.127 0.242 gdT L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 -736640 sc-eQTL 3.06e-01 -0.111 0.108 0.242 gdT L2
ENSG00000027697 IFNGR1 -87856 sc-eQTL 5.18e-01 -0.0452 0.0699 0.249 intMono L2
ENSG00000029363 BCLAF1 841742 sc-eQTL 1.99e-01 0.118 0.092 0.249 intMono L2
ENSG00000112357 PEX7 309029 sc-eQTL 6.13e-01 -0.0477 0.0942 0.249 intMono L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 -735621 sc-eQTL 5.77e-01 0.0337 0.0603 0.249 intMono L2
ENSG00000135525 MAP7 580774 sc-eQTL 2.04e-01 0.118 0.0924 0.249 intMono L2
ENSG00000197442 MAP3K5 339116 sc-eQTL 6.69e-01 -0.042 0.0982 0.249 intMono L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 -736640 sc-eQTL 4.63e-01 0.066 0.0899 0.249 intMono L2
ENSG00000286646 AL121933.2 347548 sc-eQTL 3.76e-01 0.0919 0.104 0.249 intMono L2
ENSG00000027697 IFNGR1 -87856 sc-eQTL 3.93e-02 -0.17 0.0821 0.247 ncMono L2
ENSG00000029363 BCLAF1 841742 sc-eQTL 2.38e-01 -0.0759 0.0642 0.247 ncMono L2
ENSG00000112357 PEX7 309029 sc-eQTL 6.65e-01 -0.0445 0.103 0.247 ncMono L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 -735621 sc-eQTL 5.51e-01 0.0438 0.0733 0.247 ncMono L2
ENSG00000135525 MAP7 580774 sc-eQTL 9.16e-01 0.00956 0.0907 0.247 ncMono L2
ENSG00000197442 MAP3K5 339116 sc-eQTL 6.76e-01 -0.0398 0.0953 0.247 ncMono L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 -736640 sc-eQTL 7.21e-01 0.0329 0.0918 0.247 ncMono L2
ENSG00000286646 AL121933.2 347548 sc-eQTL 8.18e-01 -0.0223 0.0968 0.247 ncMono L2
ENSG00000027697 IFNGR1 -87856 sc-eQTL 6.89e-01 -0.0378 0.0942 0.26 pDC L2
ENSG00000029363 BCLAF1 841742 sc-eQTL 5.45e-01 0.0428 0.0707 0.26 pDC L2
ENSG00000112357 PEX7 309029 sc-eQTL 5.59e-01 -0.0607 0.104 0.26 pDC L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 -735621 sc-eQTL 9.02e-01 0.0108 0.0874 0.26 pDC L2
ENSG00000135525 MAP7 580774 sc-eQTL 2.37e-01 -0.0857 0.0722 0.26 pDC L2
ENSG00000197442 MAP3K5 339116 sc-eQTL 1.83e-01 0.154 0.115 0.26 pDC L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 -736640 sc-eQTL 5.27e-01 -0.0561 0.0886 0.26 pDC L2
ENSG00000286646 AL121933.2 347548 sc-eQTL 5.53e-01 0.0635 0.107 0.26 pDC L2
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000027697 IFNGR1 -87856 sc-eQTL 8.57e-01 0.0151 0.084 0.246 B_Memory LOneK1K
ENSG00000029363 BCLAF1 841742 sc-eQTL 9.64e-01 0.00212 0.0472 0.246 B_Memory LOneK1K
ENSG00000112357 PEX7 309029 sc-eQTL 9.83e-03 0.248 0.0951 0.246 B_Memory LOneK1K
ENSG00000112378 PERP -975826 sc-eQTL 6.98e-01 -0.0348 0.0897 0.246 B_Memory LOneK1K
ENSG00000118503 TNFAIP3 -735621 sc-eQTL 4.74e-01 -0.0425 0.0592 0.246 B_Memory LOneK1K
ENSG00000197442 MAP3K5 339116 sc-eQTL 6.73e-01 -0.0331 0.0784 0.246 B_Memory LOneK1K
ENSG00000237499 WAKMAR2 -736640 sc-eQTL 9.76e-01 -0.00297 0.1 0.246 B_Memory LOneK1K
ENSG00000027697 IFNGR1 -87856 sc-eQTL 1.01e-01 -0.14 0.0848 0.246 B_Naive LOneK1K
ENSG00000029363 BCLAF1 841742 sc-eQTL 6.88e-02 -0.0712 0.0389 0.246 B_Naive LOneK1K
ENSG00000112357 PEX7 309029 sc-eQTL 3.47e-01 0.0978 0.104 0.246 B_Naive LOneK1K
ENSG00000112378 PERP -975826 sc-eQTL 7.81e-01 0.0259 0.093 0.246 B_Naive LOneK1K
ENSG00000118503 TNFAIP3 -735621 sc-eQTL 8.52e-01 0.00913 0.0489 0.246 B_Naive LOneK1K
ENSG00000197442 MAP3K5 339116 sc-eQTL 4.65e-01 -0.0524 0.0716 0.246 B_Naive LOneK1K
ENSG00000237499 WAKMAR2 -736640 sc-eQTL 4.83e-01 -0.0611 0.087 0.246 B_Naive LOneK1K
ENSG00000027697 IFNGR1 -87856 sc-eQTL 1.24e-01 -0.0877 0.0569 0.246 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000029363 BCLAF1 841742 sc-eQTL 2.49e-01 0.0613 0.0531 0.246 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000112357 PEX7 309029 sc-eQTL 3.54e-01 -0.0952 0.102 0.246 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000118503 TNFAIP3 -735621 sc-eQTL 9.64e-01 -0.00236 0.0529 0.246 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000135525 MAP7 580774 sc-eQTL 8.23e-02 -0.159 0.0911 0.246 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000197442 MAP3K5 339116 sc-eQTL 4.13e-01 -0.0508 0.0619 0.246 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000237499 WAKMAR2 -736640 sc-eQTL 9.35e-01 0.00514 0.0634 0.246 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000286646 AL121933.2 347548 sc-eQTL 3.08e-01 0.0751 0.0736 0.246 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000027697 IFNGR1 -87856 sc-eQTL 8.15e-02 -0.12 0.0684 0.248 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000029363 BCLAF1 841742 sc-eQTL 6.95e-01 0.0245 0.0623 0.248 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000112357 PEX7 309029 sc-eQTL 7.14e-01 -0.0382 0.104 0.248 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000118503 TNFAIP3 -735621 sc-eQTL 8.75e-01 0.0101 0.0644 0.248 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000135525 MAP7 580774 sc-eQTL 4.31e-01 0.0793 0.1 0.248 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000197442 MAP3K5 339116 sc-eQTL 9.71e-01 0.003 0.0826 0.248 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000237499 WAKMAR2 -736640 sc-eQTL 5.93e-01 0.0462 0.0863 0.248 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000286646 AL121933.2 347548 sc-eQTL 3.36e-01 0.0943 0.0978 0.248 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000027697 IFNGR1 -87856 sc-eQTL 5.59e-01 -0.0381 0.0651 0.248 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000029363 BCLAF1 841742 sc-eQTL 7.06e-01 0.0143 0.0378 0.248 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000112357 PEX7 309029 sc-eQTL 4.49e-01 0.0833 0.11 0.248 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000112378 PERP -975826 sc-eQTL 1.49e-01 0.0983 0.0679 0.248 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000118503 TNFAIP3 -735621 sc-eQTL 9.53e-01 0.00352 0.0594 0.248 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000197442 MAP3K5 339116 sc-eQTL 9.01e-01 0.01 0.0802 0.248 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000237499 WAKMAR2 -736640 sc-eQTL 7.51e-01 -0.0264 0.0831 0.248 NK_CD56dim LOneK1K

Statistical fine-mapping results from Japan COVID-19 Task Force
(Shown only for PIP>0.001)
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
PIP (SuSiE)
PIP (FINEMAP)
MAF
ENSG00000027697 IFNGR1 -87856 pQTL 0.000764 -0.0635 0.0188 0.0 0.0 0.205
ENSG00000027697 IFNGR1 -87856 eQTL 0.000273 -0.0606 0.0166 0.0 0.0 0.2
ENSG00000182747 SLC35D3 209292 eQTL 0.00185 0.12 0.0383 0.0 0.0 0.2

Expression Modifier Score(EMS) for GTEx 49tissues
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Whole Blood
Muscle Skeletal
Liver
Brain Cerebellum
Prostate
Spleen
Skin Sun Exposed Lower leg
Artery Coronary
Esophagus Muscularis
Esophagus Gastroesophageal Junction
Artery Tibial
Heart Atrial Appendage
Nerve Tibial
Heart Left Ventricle
Adrenal Gland
Adipose Visceral Omentum
Pancreas
Lung
Pituitary
Brain Nucleus accumbens basal ganglia
Colon Transverse
Adipose Subcutaneous
Esophagus Mucosa
Brain Cortex
Thyroid
Stomach
Breast Mammary Tissue
Colon Sigmoid
Skin Not Sun Exposed Suprapubic
Testis
Artery Aorta
Brain Amygdala
Brain Anterior cingulate cortex BA24
Brain Caudate basal ganglia
Brain Cerebellar Hemisphere
Brain Frontal Cortex BA9
Brain Hippocampus
Brain Hypothalamus
Brain Putamen basal ganglia
Brain Spinal cord cervical c-1
Brain Substantia nigra
Cells Cultured fibroblasts
Cells EBV-transformed lymphocytes
Kidney Cortex
Minor Salivary Gland
Ovary
Small Intestine Terminal Ileum
Uterus
Vagina
ENSG00000027697 IFNGR1 -87856 5.75e-06 6.84e-06 6.06e-07 3.5e-06 1.61e-06 1.54e-06 7.57e-06 1.07e-06 5e-06 2.99e-06 7.34e-06 3.2e-06 9.37e-06 2.13e-06 1.16e-06 3.73e-06 2.73e-06 3.95e-06 1.44e-06 1.39e-06 2.67e-06 5.42e-06 4.84e-06 1.55e-06 9.05e-06 2.15e-06 2.28e-06 1.53e-06 5.03e-06 6.66e-06 2.62e-06 5.58e-07 5.55e-07 1.69e-06 2.07e-06 1.18e-06 1.06e-06 4.51e-07 9e-07 4.88e-07 4.96e-07 8.12e-06 6.31e-07 1.63e-07 4.86e-07 1.03e-06 1.05e-06 4.59e-07 3.9e-07
ENSG00000220412 \N -575608 3.62e-07 1.78e-07 6.28e-08 2.35e-07 1.01e-07 8.85e-08 2.74e-07 5.82e-08 1.71e-07 1.03e-07 1.86e-07 1.37e-07 2.45e-07 8.44e-08 5.97e-08 8.71e-08 5.42e-08 1.8e-07 7.29e-08 6.16e-08 1.24e-07 1.7e-07 1.75e-07 4.07e-08 2.36e-07 1.31e-07 1.29e-07 1.26e-07 1.37e-07 1.39e-07 1.26e-07 4.61e-08 4.37e-08 9.58e-08 6.35e-08 3.11e-08 4.07e-08 7.92e-08 6.49e-08 5.56e-08 4.92e-08 1.68e-07 3.08e-08 1.13e-08 3.48e-08 6.53e-09 7.97e-08 2.16e-09 4.91e-08