logo

Genes within 1Mb (chr6:137125106:C:T):

View on , UCSC , GTEx , gnomAD

Immune cell-type specific single cell cis-eQTLs in OASIS
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000027697 IFNGR1 -94343 sc-eQTL 1.69e-02 -0.286 0.119 0.088 B L1
ENSG00000029363 BCLAF1 835255 sc-eQTL 4.06e-01 0.0445 0.0534 0.088 B L1
ENSG00000112357 PEX7 302542 sc-eQTL 9.15e-01 -0.0152 0.142 0.088 B L1
ENSG00000112378 PERP -982313 sc-eQTL 8.08e-01 -0.0229 0.0941 0.088 B L1
ENSG00000118503 TNFAIP3 -742108 sc-eQTL 7.67e-01 -0.0225 0.0758 0.088 B L1
ENSG00000197442 MAP3K5 332629 sc-eQTL 6.87e-01 0.0426 0.106 0.088 B L1
ENSG00000237499 WAKMAR2 -743127 sc-eQTL 7.77e-01 -0.0338 0.119 0.088 B L1
ENSG00000027697 IFNGR1 -94343 sc-eQTL 5.87e-02 -0.15 0.079 0.088 CD4T L1
ENSG00000029363 BCLAF1 835255 sc-eQTL 3.72e-01 0.0539 0.0602 0.088 CD4T L1
ENSG00000112357 PEX7 302542 sc-eQTL 1.28e-01 -0.195 0.128 0.088 CD4T L1
ENSG00000112378 PERP -982313 sc-eQTL 7.14e-01 -0.0316 0.0861 0.088 CD4T L1
ENSG00000118503 TNFAIP3 -742108 sc-eQTL 9.74e-01 0.00267 0.0807 0.088 CD4T L1
ENSG00000197442 MAP3K5 332629 sc-eQTL 6.98e-02 -0.111 0.061 0.088 CD4T L1
ENSG00000237499 WAKMAR2 -743127 sc-eQTL 3.65e-02 -0.212 0.101 0.088 CD4T L1
ENSG00000027697 IFNGR1 -94343 sc-eQTL 7.23e-01 -0.0324 0.0915 0.088 CD8T L1
ENSG00000029363 BCLAF1 835255 sc-eQTL 1.91e-01 0.0809 0.0617 0.088 CD8T L1
ENSG00000112357 PEX7 302542 sc-eQTL 2.59e-01 0.172 0.152 0.088 CD8T L1
ENSG00000112378 PERP -982313 sc-eQTL 9.77e-02 -0.165 0.0991 0.088 CD8T L1
ENSG00000118503 TNFAIP3 -742108 sc-eQTL 9.08e-01 -0.00886 0.077 0.088 CD8T L1
ENSG00000197442 MAP3K5 332629 sc-eQTL 6.93e-01 -0.0321 0.0813 0.088 CD8T L1
ENSG00000237499 WAKMAR2 -743127 sc-eQTL 3.77e-01 -0.0999 0.113 0.088 CD8T L1
ENSG00000027697 IFNGR1 -94343 sc-eQTL 8.46e-01 -0.0212 0.109 0.09 DC L1
ENSG00000029363 BCLAF1 835255 sc-eQTL 7.36e-01 0.033 0.0979 0.09 DC L1
ENSG00000112357 PEX7 302542 sc-eQTL 4.43e-01 -0.118 0.153 0.09 DC L1
ENSG00000118503 TNFAIP3 -742108 sc-eQTL 9.20e-01 0.0117 0.116 0.09 DC L1
ENSG00000135525 MAP7 574287 sc-eQTL 8.66e-01 0.0212 0.126 0.09 DC L1
ENSG00000197442 MAP3K5 332629 sc-eQTL 6.92e-01 0.0478 0.121 0.09 DC L1
ENSG00000237499 WAKMAR2 -743127 sc-eQTL 7.04e-01 0.0451 0.118 0.09 DC L1
ENSG00000286646 AL121933.2 341061 sc-eQTL 3.52e-01 -0.147 0.157 0.09 DC L1
ENSG00000027697 IFNGR1 -94343 sc-eQTL 4.26e-03 -0.258 0.0893 0.088 Mono L1
ENSG00000029363 BCLAF1 835255 sc-eQTL 9.77e-01 -0.00227 0.0779 0.088 Mono L1
ENSG00000112357 PEX7 302542 sc-eQTL 2.02e-01 -0.195 0.153 0.088 Mono L1
ENSG00000118503 TNFAIP3 -742108 sc-eQTL 2.91e-01 0.0816 0.0771 0.088 Mono L1
ENSG00000135525 MAP7 574287 sc-eQTL 3.24e-01 -0.133 0.135 0.088 Mono L1
ENSG00000197442 MAP3K5 332629 sc-eQTL 1.96e-01 -0.116 0.0898 0.088 Mono L1
ENSG00000237499 WAKMAR2 -743127 sc-eQTL 6.11e-01 0.0487 0.0957 0.088 Mono L1
ENSG00000286646 AL121933.2 341061 sc-eQTL 9.93e-02 0.18 0.109 0.088 Mono L1
ENSG00000027697 IFNGR1 -94343 sc-eQTL 8.15e-02 -0.177 0.101 0.088 NK L1
ENSG00000029363 BCLAF1 835255 sc-eQTL 7.71e-01 -0.0157 0.054 0.088 NK L1
ENSG00000112357 PEX7 302542 sc-eQTL 6.97e-01 0.0612 0.157 0.088 NK L1
ENSG00000112378 PERP -982313 sc-eQTL 4.19e-01 0.0799 0.0988 0.088 NK L1
ENSG00000118503 TNFAIP3 -742108 sc-eQTL 5.58e-01 -0.0496 0.0846 0.088 NK L1
ENSG00000197442 MAP3K5 332629 sc-eQTL 5.51e-01 -0.0723 0.121 0.088 NK L1
ENSG00000237499 WAKMAR2 -743127 sc-eQTL 2.66e-02 -0.265 0.119 0.088 NK L1
ENSG00000027697 IFNGR1 -94343 sc-eQTL 9.04e-01 0.0114 0.0943 0.088 Other_T L1
ENSG00000029363 BCLAF1 835255 sc-eQTL 8.58e-01 0.0142 0.0791 0.088 Other_T L1
ENSG00000112357 PEX7 302542 sc-eQTL 9.36e-01 -0.0124 0.154 0.088 Other_T L1
ENSG00000112378 PERP -982313 sc-eQTL 9.90e-01 0.00149 0.123 0.088 Other_T L1
ENSG00000118503 TNFAIP3 -742108 sc-eQTL 5.60e-01 0.0342 0.0587 0.088 Other_T L1
ENSG00000146410 MTFR2 874771 sc-eQTL 9.39e-01 -0.0068 0.0889 0.088 Other_T L1
ENSG00000197442 MAP3K5 332629 sc-eQTL 4.39e-01 -0.0878 0.113 0.088 Other_T L1
ENSG00000237499 WAKMAR2 -743127 sc-eQTL 3.38e-01 0.112 0.116 0.088 Other_T L1
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000027697 IFNGR1 -94343 sc-eQTL 2.37e-01 -0.191 0.161 0.089 B_Activated L2
ENSG00000029363 BCLAF1 835255 sc-eQTL 2.00e-01 0.167 0.13 0.089 B_Activated L2
ENSG00000112357 PEX7 302542 sc-eQTL 9.90e-01 -0.00205 0.159 0.089 B_Activated L2
ENSG00000112378 PERP -982313 sc-eQTL 6.22e-01 0.0405 0.082 0.089 B_Activated L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 -742108 sc-eQTL 3.90e-01 0.137 0.159 0.089 B_Activated L2
ENSG00000197442 MAP3K5 332629 sc-eQTL 7.04e-01 -0.0679 0.178 0.089 B_Activated L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 -743127 sc-eQTL 4.42e-01 -0.107 0.139 0.089 B_Activated L2
ENSG00000027697 IFNGR1 -94343 sc-eQTL 3.59e-01 -0.128 0.139 0.088 B_Intermediate L2
ENSG00000029363 BCLAF1 835255 sc-eQTL 8.88e-01 -0.0112 0.0794 0.088 B_Intermediate L2
ENSG00000112357 PEX7 302542 sc-eQTL 3.35e-01 0.141 0.146 0.088 B_Intermediate L2
ENSG00000112378 PERP -982313 sc-eQTL 9.20e-01 -0.0134 0.133 0.088 B_Intermediate L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 -742108 sc-eQTL 3.96e-01 0.0886 0.104 0.088 B_Intermediate L2
ENSG00000197442 MAP3K5 332629 sc-eQTL 7.70e-01 -0.037 0.126 0.088 B_Intermediate L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 -743127 sc-eQTL 2.22e-01 -0.181 0.148 0.088 B_Intermediate L2
ENSG00000027697 IFNGR1 -94343 sc-eQTL 3.54e-01 -0.143 0.154 0.088 B_Memory L2
ENSG00000029363 BCLAF1 835255 sc-eQTL 9.53e-01 -0.00546 0.0918 0.088 B_Memory L2
ENSG00000112357 PEX7 302542 sc-eQTL 7.59e-01 -0.048 0.156 0.088 B_Memory L2
ENSG00000112378 PERP -982313 sc-eQTL 5.61e-01 0.0856 0.147 0.088 B_Memory L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 -742108 sc-eQTL 6.55e-01 -0.0453 0.101 0.088 B_Memory L2
ENSG00000197442 MAP3K5 332629 sc-eQTL 3.45e-01 0.131 0.138 0.088 B_Memory L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 -743127 sc-eQTL 9.32e-01 -0.0128 0.151 0.088 B_Memory L2
ENSG00000027697 IFNGR1 -94343 sc-eQTL 5.13e-03 -0.331 0.117 0.088 B_Naive1 L2
ENSG00000029363 BCLAF1 835255 sc-eQTL 4.34e-01 0.0533 0.068 0.088 B_Naive1 L2
ENSG00000112357 PEX7 302542 sc-eQTL 5.37e-01 -0.0971 0.157 0.088 B_Naive1 L2
ENSG00000112378 PERP -982313 sc-eQTL 2.23e-01 -0.168 0.137 0.088 B_Naive1 L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 -742108 sc-eQTL 7.19e-01 -0.0287 0.0797 0.088 B_Naive1 L2
ENSG00000197442 MAP3K5 332629 sc-eQTL 2.76e-01 0.122 0.112 0.088 B_Naive1 L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 -743127 sc-eQTL 6.83e-01 0.0511 0.125 0.088 B_Naive1 L2
ENSG00000027697 IFNGR1 -94343 sc-eQTL 2.21e-01 -0.177 0.144 0.088 B_Naive2 L2
ENSG00000029363 BCLAF1 835255 sc-eQTL 8.14e-01 0.0197 0.084 0.088 B_Naive2 L2
ENSG00000112357 PEX7 302542 sc-eQTL 3.71e-01 0.142 0.158 0.088 B_Naive2 L2
ENSG00000112378 PERP -982313 sc-eQTL 9.74e-01 -0.00373 0.115 0.088 B_Naive2 L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 -742108 sc-eQTL 3.14e-01 -0.116 0.115 0.088 B_Naive2 L2
ENSG00000197442 MAP3K5 332629 sc-eQTL 6.42e-02 -0.227 0.122 0.088 B_Naive2 L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 -743127 sc-eQTL 3.45e-01 -0.141 0.149 0.088 B_Naive2 L2
ENSG00000027697 IFNGR1 -94343 sc-eQTL 7.20e-01 0.0501 0.139 0.089 CD4_CTL L2
ENSG00000029363 BCLAF1 835255 sc-eQTL 4.87e-01 -0.086 0.124 0.089 CD4_CTL L2
ENSG00000112357 PEX7 302542 sc-eQTL 9.16e-01 -0.0163 0.155 0.089 CD4_CTL L2
ENSG00000112378 PERP -982313 sc-eQTL 7.46e-01 0.0509 0.157 0.089 CD4_CTL L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 -742108 sc-eQTL 7.60e-01 -0.0279 0.0914 0.089 CD4_CTL L2
ENSG00000197442 MAP3K5 332629 sc-eQTL 9.66e-01 -0.00617 0.146 0.089 CD4_CTL L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 -743127 sc-eQTL 7.08e-01 -0.0534 0.142 0.089 CD4_CTL L2
ENSG00000027697 IFNGR1 -94343 sc-eQTL 6.44e-02 -0.139 0.0749 0.088 CD4_Naive L2
ENSG00000029363 BCLAF1 835255 sc-eQTL 3.88e-01 0.0523 0.0605 0.088 CD4_Naive L2
ENSG00000112357 PEX7 302542 sc-eQTL 4.35e-01 -0.111 0.142 0.088 CD4_Naive L2
ENSG00000112378 PERP -982313 sc-eQTL 8.94e-01 0.0157 0.118 0.088 CD4_Naive L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 -742108 sc-eQTL 9.31e-01 -0.00717 0.0826 0.088 CD4_Naive L2
ENSG00000197442 MAP3K5 332629 sc-eQTL 3.08e-01 -0.0618 0.0605 0.088 CD4_Naive L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 -743127 sc-eQTL 5.12e-03 -0.297 0.105 0.088 CD4_Naive L2
ENSG00000027697 IFNGR1 -94343 sc-eQTL 1.04e-01 -0.169 0.104 0.088 CD4_TCM L2
ENSG00000029363 BCLAF1 835255 sc-eQTL 1.67e-01 0.0911 0.0656 0.088 CD4_TCM L2
ENSG00000112357 PEX7 302542 sc-eQTL 2.76e-01 -0.167 0.153 0.088 CD4_TCM L2
ENSG00000112378 PERP -982313 sc-eQTL 6.02e-01 -0.0677 0.13 0.088 CD4_TCM L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 -742108 sc-eQTL 8.14e-01 -0.0177 0.0753 0.088 CD4_TCM L2
ENSG00000197442 MAP3K5 332629 sc-eQTL 3.22e-03 -0.25 0.084 0.088 CD4_TCM L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 -743127 sc-eQTL 6.98e-01 -0.041 0.105 0.088 CD4_TCM L2
ENSG00000027697 IFNGR1 -94343 sc-eQTL 3.81e-01 -0.106 0.12 0.088 CD4_TEM L2
ENSG00000029363 BCLAF1 835255 sc-eQTL 5.14e-01 -0.0557 0.0853 0.088 CD4_TEM L2
ENSG00000112357 PEX7 302542 sc-eQTL 6.82e-01 -0.0637 0.155 0.088 CD4_TEM L2
ENSG00000112378 PERP -982313 sc-eQTL 3.79e-01 -0.111 0.126 0.088 CD4_TEM L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 -742108 sc-eQTL 3.26e-01 0.0787 0.0798 0.088 CD4_TEM L2
ENSG00000197442 MAP3K5 332629 sc-eQTL 4.96e-01 -0.0841 0.123 0.088 CD4_TEM L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 -743127 sc-eQTL 5.58e-01 -0.0751 0.128 0.088 CD4_TEM L2
ENSG00000027697 IFNGR1 -94343 sc-eQTL 8.25e-01 -0.0239 0.108 0.088 CD8_CTL L2
ENSG00000029363 BCLAF1 835255 sc-eQTL 9.00e-01 -0.00903 0.072 0.088 CD8_CTL L2
ENSG00000112357 PEX7 302542 sc-eQTL 4.48e-03 0.419 0.146 0.088 CD8_CTL L2
ENSG00000112378 PERP -982313 sc-eQTL 1.18e-01 -0.223 0.142 0.088 CD8_CTL L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 -742108 sc-eQTL 6.49e-01 -0.0414 0.0909 0.088 CD8_CTL L2
ENSG00000197442 MAP3K5 332629 sc-eQTL 4.07e-01 -0.106 0.128 0.088 CD8_CTL L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 -743127 sc-eQTL 6.30e-01 -0.0615 0.128 0.088 CD8_CTL L2
ENSG00000027697 IFNGR1 -94343 sc-eQTL 3.13e-01 -0.108 0.107 0.088 CD8_Naive L2
ENSG00000029363 BCLAF1 835255 sc-eQTL 9.86e-01 -0.00127 0.075 0.088 CD8_Naive L2
ENSG00000112357 PEX7 302542 sc-eQTL 7.55e-01 0.0486 0.156 0.088 CD8_Naive L2
ENSG00000112378 PERP -982313 sc-eQTL 6.52e-02 -0.218 0.117 0.088 CD8_Naive L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 -742108 sc-eQTL 8.76e-01 -0.0131 0.084 0.088 CD8_Naive L2
ENSG00000197442 MAP3K5 332629 sc-eQTL 6.71e-01 -0.0424 0.0995 0.088 CD8_Naive L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 -743127 sc-eQTL 3.72e-01 -0.111 0.124 0.088 CD8_Naive L2
ENSG00000027697 IFNGR1 -94343 sc-eQTL 6.54e-01 -0.0631 0.14 0.093 CD8_TCM L2
ENSG00000029363 BCLAF1 835255 sc-eQTL 5.85e-01 -0.0576 0.105 0.093 CD8_TCM L2
ENSG00000112357 PEX7 302542 sc-eQTL 5.61e-01 -0.0938 0.161 0.093 CD8_TCM L2
ENSG00000112378 PERP -982313 sc-eQTL 3.04e-01 0.162 0.157 0.093 CD8_TCM L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 -742108 sc-eQTL 4.05e-01 -0.0633 0.076 0.093 CD8_TCM L2
ENSG00000197442 MAP3K5 332629 sc-eQTL 8.58e-01 0.0244 0.136 0.093 CD8_TCM L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 -743127 sc-eQTL 9.91e-01 -0.00159 0.139 0.093 CD8_TCM L2
ENSG00000027697 IFNGR1 -94343 sc-eQTL 4.25e-01 -0.113 0.142 0.087 CD8_TEM L2
ENSG00000029363 BCLAF1 835255 sc-eQTL 7.70e-01 0.0393 0.134 0.087 CD8_TEM L2
ENSG00000112357 PEX7 302542 sc-eQTL 3.30e-01 0.159 0.163 0.087 CD8_TEM L2
ENSG00000112378 PERP -982313 sc-eQTL 8.44e-01 -0.0335 0.17 0.087 CD8_TEM L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 -742108 sc-eQTL 2.82e-01 -0.113 0.104 0.087 CD8_TEM L2
ENSG00000197442 MAP3K5 332629 sc-eQTL 1.96e-01 -0.209 0.161 0.087 CD8_TEM L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 -743127 sc-eQTL 2.00e-01 -0.199 0.155 0.087 CD8_TEM L2
ENSG00000027697 IFNGR1 -94343 sc-eQTL 5.76e-01 -0.0618 0.11 0.089 MAIT L2
ENSG00000029363 BCLAF1 835255 sc-eQTL 2.93e-01 0.0964 0.0915 0.089 MAIT L2
ENSG00000112357 PEX7 302542 sc-eQTL 6.77e-01 -0.0625 0.15 0.089 MAIT L2
ENSG00000112378 PERP -982313 sc-eQTL 8.95e-01 0.0207 0.156 0.089 MAIT L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 -742108 sc-eQTL 2.50e-01 0.0855 0.0741 0.089 MAIT L2
ENSG00000146410 MTFR2 874771 sc-eQTL 8.92e-01 -0.0169 0.124 0.089 MAIT L2
ENSG00000197442 MAP3K5 332629 sc-eQTL 7.99e-01 -0.033 0.129 0.089 MAIT L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 -743127 sc-eQTL 4.34e-01 0.108 0.137 0.089 MAIT L2
ENSG00000027697 IFNGR1 -94343 sc-eQTL 2.96e-01 -0.126 0.12 0.089 NK_CD56bright L2
ENSG00000029363 BCLAF1 835255 sc-eQTL 8.97e-01 -0.0115 0.0887 0.089 NK_CD56bright L2
ENSG00000112357 PEX7 302542 sc-eQTL 2.00e-01 0.201 0.156 0.089 NK_CD56bright L2
ENSG00000112378 PERP -982313 sc-eQTL 6.69e-01 0.0601 0.14 0.089 NK_CD56bright L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 -742108 sc-eQTL 6.55e-01 -0.0401 0.0895 0.089 NK_CD56bright L2
ENSG00000197442 MAP3K5 332629 sc-eQTL 3.42e-01 -0.129 0.136 0.089 NK_CD56bright L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 -743127 sc-eQTL 6.42e-01 0.0663 0.143 0.089 NK_CD56bright L2
ENSG00000027697 IFNGR1 -94343 sc-eQTL 1.94e-01 -0.121 0.0927 0.088 NK_CD56dim L2
ENSG00000029363 BCLAF1 835255 sc-eQTL 3.38e-01 -0.0582 0.0607 0.088 NK_CD56dim L2
ENSG00000112357 PEX7 302542 sc-eQTL 8.73e-01 -0.0257 0.16 0.088 NK_CD56dim L2
ENSG00000112378 PERP -982313 sc-eQTL 6.19e-02 0.21 0.112 0.088 NK_CD56dim L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 -742108 sc-eQTL 8.21e-01 -0.0199 0.0877 0.088 NK_CD56dim L2
ENSG00000197442 MAP3K5 332629 sc-eQTL 6.77e-01 -0.0527 0.126 0.088 NK_CD56dim L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 -743127 sc-eQTL 5.94e-02 -0.247 0.13 0.088 NK_CD56dim L2
ENSG00000027697 IFNGR1 -94343 sc-eQTL 1.04e-02 -0.324 0.125 0.087 NK_HLA L2
ENSG00000029363 BCLAF1 835255 sc-eQTL 3.68e-01 0.0972 0.108 0.087 NK_HLA L2
ENSG00000112357 PEX7 302542 sc-eQTL 6.26e-01 0.0789 0.162 0.087 NK_HLA L2
ENSG00000112378 PERP -982313 sc-eQTL 1.21e-01 -0.203 0.13 0.087 NK_HLA L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 -742108 sc-eQTL 5.29e-01 -0.0636 0.101 0.087 NK_HLA L2
ENSG00000197442 MAP3K5 332629 sc-eQTL 7.61e-01 0.0489 0.16 0.087 NK_HLA L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 -743127 sc-eQTL 2.62e-02 -0.36 0.161 0.087 NK_HLA L2
ENSG00000027697 IFNGR1 -94343 sc-eQTL 1.25e-01 -0.153 0.0993 0.088 NK_cytokine L2
ENSG00000029363 BCLAF1 835255 sc-eQTL 6.93e-01 0.0295 0.0745 0.088 NK_cytokine L2
ENSG00000112357 PEX7 302542 sc-eQTL 4.92e-01 -0.108 0.157 0.088 NK_cytokine L2
ENSG00000112378 PERP -982313 sc-eQTL 3.06e-01 0.122 0.119 0.088 NK_cytokine L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 -742108 sc-eQTL 9.86e-01 0.00158 0.0892 0.088 NK_cytokine L2
ENSG00000197442 MAP3K5 332629 sc-eQTL 2.94e-01 -0.129 0.122 0.088 NK_cytokine L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 -743127 sc-eQTL 1.24e-01 -0.207 0.134 0.088 NK_cytokine L2
ENSG00000027697 IFNGR1 -94343 sc-eQTL 1.63e-01 -0.272 0.194 0.074 PB L2
ENSG00000029363 BCLAF1 835255 sc-eQTL 5.77e-01 -0.0943 0.169 0.074 PB L2
ENSG00000112357 PEX7 302542 sc-eQTL 4.74e-01 -0.144 0.201 0.074 PB L2
ENSG00000112378 PERP -982313 sc-eQTL 8.11e-01 -0.03 0.126 0.074 PB L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 -742108 sc-eQTL 5.92e-01 0.0817 0.152 0.074 PB L2
ENSG00000197442 MAP3K5 332629 sc-eQTL 7.84e-01 0.0475 0.173 0.074 PB L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 -743127 sc-eQTL 2.24e-02 0.414 0.179 0.074 PB L2
ENSG00000027697 IFNGR1 -94343 sc-eQTL 8.59e-01 0.022 0.124 0.089 Pro_T L2
ENSG00000029363 BCLAF1 835255 sc-eQTL 1.79e-01 0.172 0.128 0.089 Pro_T L2
ENSG00000112357 PEX7 302542 sc-eQTL 9.40e-01 0.0113 0.15 0.089 Pro_T L2
ENSG00000112378 PERP -982313 sc-eQTL 2.10e-01 0.15 0.119 0.089 Pro_T L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 -742108 sc-eQTL 5.01e-01 0.0508 0.0753 0.089 Pro_T L2
ENSG00000146410 MTFR2 874771 sc-eQTL 7.39e-01 0.0348 0.105 0.089 Pro_T L2
ENSG00000197442 MAP3K5 332629 sc-eQTL 8.25e-01 -0.0324 0.146 0.089 Pro_T L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 -743127 sc-eQTL 6.44e-01 -0.0676 0.146 0.089 Pro_T L2
ENSG00000027697 IFNGR1 -94343 sc-eQTL 1.84e-01 -0.19 0.143 0.088 Treg L2
ENSG00000029363 BCLAF1 835255 sc-eQTL 4.28e-01 -0.0732 0.0923 0.088 Treg L2
ENSG00000112357 PEX7 302542 sc-eQTL 8.14e-01 -0.0357 0.151 0.088 Treg L2
ENSG00000112378 PERP -982313 sc-eQTL 7.16e-01 0.0597 0.163 0.088 Treg L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 -742108 sc-eQTL 8.40e-01 0.0184 0.091 0.088 Treg L2
ENSG00000197442 MAP3K5 332629 sc-eQTL 4.74e-01 0.0707 0.0985 0.088 Treg L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 -743127 sc-eQTL 4.92e-01 -0.0955 0.139 0.088 Treg L2
ENSG00000027697 IFNGR1 -94343 sc-eQTL 3.03e-01 -0.126 0.122 0.085 cDC L2
ENSG00000029363 BCLAF1 835255 sc-eQTL 6.14e-02 0.229 0.122 0.085 cDC L2
ENSG00000112357 PEX7 302542 sc-eQTL 8.11e-01 0.0379 0.158 0.085 cDC L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 -742108 sc-eQTL 7.42e-01 0.0397 0.12 0.085 cDC L2
ENSG00000135525 MAP7 574287 sc-eQTL 2.67e-01 0.156 0.14 0.085 cDC L2
ENSG00000197442 MAP3K5 332629 sc-eQTL 9.21e-01 -0.0123 0.124 0.085 cDC L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 -743127 sc-eQTL 8.53e-01 0.0291 0.157 0.085 cDC L2
ENSG00000286646 AL121933.2 341061 sc-eQTL 6.01e-01 0.0843 0.161 0.085 cDC L2
ENSG00000027697 IFNGR1 -94343 sc-eQTL 2.78e-02 -0.188 0.0847 0.088 cMono_IL1B L2
ENSG00000029363 BCLAF1 835255 sc-eQTL 8.36e-01 -0.019 0.0919 0.088 cMono_IL1B L2
ENSG00000112357 PEX7 302542 sc-eQTL 2.37e-01 -0.182 0.154 0.088 cMono_IL1B L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 -742108 sc-eQTL 4.64e-01 0.0676 0.0921 0.088 cMono_IL1B L2
ENSG00000135525 MAP7 574287 sc-eQTL 3.96e-01 -0.113 0.133 0.088 cMono_IL1B L2
ENSG00000197442 MAP3K5 332629 sc-eQTL 2.63e-01 -0.107 0.0956 0.088 cMono_IL1B L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 -743127 sc-eQTL 8.02e-01 0.0248 0.0985 0.088 cMono_IL1B L2
ENSG00000286646 AL121933.2 341061 sc-eQTL 9.76e-03 0.316 0.121 0.088 cMono_IL1B L2
ENSG00000027697 IFNGR1 -94343 sc-eQTL 5.87e-02 -0.185 0.0976 0.088 cMono_S100A L2
ENSG00000029363 BCLAF1 835255 sc-eQTL 7.53e-01 0.0319 0.101 0.088 cMono_S100A L2
ENSG00000112357 PEX7 302542 sc-eQTL 7.44e-01 -0.0517 0.158 0.088 cMono_S100A L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 -742108 sc-eQTL 4.29e-01 0.0692 0.0873 0.088 cMono_S100A L2
ENSG00000135525 MAP7 574287 sc-eQTL 9.82e-01 -0.00336 0.147 0.088 cMono_S100A L2
ENSG00000197442 MAP3K5 332629 sc-eQTL 3.95e-01 -0.101 0.119 0.088 cMono_S100A L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 -743127 sc-eQTL 8.38e-01 -0.0257 0.126 0.088 cMono_S100A L2
ENSG00000286646 AL121933.2 341061 sc-eQTL 6.31e-01 0.0589 0.122 0.088 cMono_S100A L2
ENSG00000027697 IFNGR1 -94343 sc-eQTL 1.57e-01 0.202 0.142 0.091 gdT L2
ENSG00000029363 BCLAF1 835255 sc-eQTL 6.89e-02 -0.228 0.125 0.091 gdT L2
ENSG00000112357 PEX7 302542 sc-eQTL 7.82e-02 -0.318 0.18 0.091 gdT L2
ENSG00000112378 PERP -982313 sc-eQTL 8.77e-01 0.0246 0.158 0.091 gdT L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 -742108 sc-eQTL 3.66e-01 0.0797 0.0878 0.091 gdT L2
ENSG00000146410 MTFR2 874771 sc-eQTL 8.24e-01 -0.031 0.139 0.091 gdT L2
ENSG00000197442 MAP3K5 332629 sc-eQTL 4.44e-01 0.143 0.186 0.091 gdT L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 -743127 sc-eQTL 7.79e-01 -0.045 0.16 0.091 gdT L2
ENSG00000027697 IFNGR1 -94343 sc-eQTL 2.33e-01 -0.131 0.11 0.089 intMono L2
ENSG00000029363 BCLAF1 835255 sc-eQTL 4.00e-01 0.122 0.145 0.089 intMono L2
ENSG00000112357 PEX7 302542 sc-eQTL 8.81e-01 0.0221 0.148 0.089 intMono L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 -742108 sc-eQTL 5.95e-01 0.0505 0.0948 0.089 intMono L2
ENSG00000135525 MAP7 574287 sc-eQTL 9.56e-01 -0.00801 0.146 0.089 intMono L2
ENSG00000197442 MAP3K5 332629 sc-eQTL 2.14e-01 0.192 0.154 0.089 intMono L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 -743127 sc-eQTL 4.29e-01 -0.112 0.141 0.089 intMono L2
ENSG00000286646 AL121933.2 341061 sc-eQTL 8.30e-02 0.282 0.162 0.089 intMono L2
ENSG00000027697 IFNGR1 -94343 sc-eQTL 5.93e-02 -0.235 0.124 0.09 ncMono L2
ENSG00000029363 BCLAF1 835255 sc-eQTL 3.43e-01 -0.0923 0.0971 0.09 ncMono L2
ENSG00000112357 PEX7 302542 sc-eQTL 9.52e-01 -0.00935 0.155 0.09 ncMono L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 -742108 sc-eQTL 5.49e-01 0.0664 0.111 0.09 ncMono L2
ENSG00000135525 MAP7 574287 sc-eQTL 3.53e-01 -0.127 0.137 0.09 ncMono L2
ENSG00000197442 MAP3K5 332629 sc-eQTL 2.77e-01 -0.157 0.144 0.09 ncMono L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 -743127 sc-eQTL 5.78e-01 0.0772 0.138 0.09 ncMono L2
ENSG00000286646 AL121933.2 341061 sc-eQTL 6.60e-01 -0.0644 0.146 0.09 ncMono L2
ENSG00000027697 IFNGR1 -94343 sc-eQTL 8.14e-01 0.0324 0.137 0.093 pDC L2
ENSG00000029363 BCLAF1 835255 sc-eQTL 3.28e-01 0.101 0.103 0.093 pDC L2
ENSG00000112357 PEX7 302542 sc-eQTL 3.19e-01 -0.151 0.151 0.093 pDC L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 -742108 sc-eQTL 5.11e-01 0.0837 0.127 0.093 pDC L2
ENSG00000135525 MAP7 574287 sc-eQTL 2.44e-02 -0.236 0.104 0.093 pDC L2
ENSG00000197442 MAP3K5 332629 sc-eQTL 9.55e-01 -0.00952 0.169 0.093 pDC L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 -743127 sc-eQTL 2.35e-01 0.153 0.129 0.093 pDC L2
ENSG00000286646 AL121933.2 341061 sc-eQTL 3.55e-01 -0.144 0.155 0.093 pDC L2
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000027697 IFNGR1 -94343 sc-eQTL 1.51e-01 -0.179 0.124 0.088 B_Memory LOneK1K
ENSG00000029363 BCLAF1 835255 sc-eQTL 9.01e-01 0.00868 0.07 0.088 B_Memory LOneK1K
ENSG00000112357 PEX7 302542 sc-eQTL 9.22e-01 0.0141 0.143 0.088 B_Memory LOneK1K
ENSG00000112378 PERP -982313 sc-eQTL 8.64e-01 0.0228 0.133 0.088 B_Memory LOneK1K
ENSG00000118503 TNFAIP3 -742108 sc-eQTL 8.26e-01 0.0194 0.0879 0.088 B_Memory LOneK1K
ENSG00000197442 MAP3K5 332629 sc-eQTL 6.29e-01 0.0563 0.116 0.088 B_Memory LOneK1K
ENSG00000237499 WAKMAR2 -743127 sc-eQTL 2.52e-01 -0.17 0.148 0.088 B_Memory LOneK1K
ENSG00000027697 IFNGR1 -94343 sc-eQTL 7.73e-03 -0.333 0.124 0.088 B_Naive LOneK1K
ENSG00000029363 BCLAF1 835255 sc-eQTL 5.33e-01 0.036 0.0577 0.088 B_Naive LOneK1K
ENSG00000112357 PEX7 302542 sc-eQTL 7.07e-01 -0.0576 0.153 0.088 B_Naive LOneK1K
ENSG00000112378 PERP -982313 sc-eQTL 3.39e-01 -0.131 0.137 0.088 B_Naive LOneK1K
ENSG00000118503 TNFAIP3 -742108 sc-eQTL 6.57e-01 -0.032 0.072 0.088 B_Naive LOneK1K
ENSG00000197442 MAP3K5 332629 sc-eQTL 7.28e-01 0.0368 0.106 0.088 B_Naive LOneK1K
ENSG00000237499 WAKMAR2 -743127 sc-eQTL 9.50e-01 0.00799 0.128 0.088 B_Naive LOneK1K
ENSG00000027697 IFNGR1 -94343 sc-eQTL 1.19e-02 -0.214 0.0842 0.088 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000029363 BCLAF1 835255 sc-eQTL 9.18e-01 0.00815 0.0796 0.088 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000112357 PEX7 302542 sc-eQTL 2.12e-01 -0.191 0.153 0.088 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000118503 TNFAIP3 -742108 sc-eQTL 4.12e-01 0.0648 0.0789 0.088 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000135525 MAP7 574287 sc-eQTL 2.71e-01 -0.151 0.137 0.088 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000197442 MAP3K5 332629 sc-eQTL 1.46e-01 -0.135 0.0922 0.088 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000237499 WAKMAR2 -743127 sc-eQTL 7.95e-01 0.0246 0.0947 0.088 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000286646 AL121933.2 341061 sc-eQTL 6.44e-02 0.203 0.109 0.088 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000027697 IFNGR1 -94343 sc-eQTL 2.33e-02 -0.238 0.104 0.088 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000029363 BCLAF1 835255 sc-eQTL 8.28e-01 0.0207 0.0954 0.088 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000112357 PEX7 302542 sc-eQTL 9.34e-01 -0.0132 0.159 0.088 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000118503 TNFAIP3 -742108 sc-eQTL 3.51e-01 0.092 0.0984 0.088 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000135525 MAP7 574287 sc-eQTL 9.78e-01 -0.00433 0.154 0.088 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000197442 MAP3K5 332629 sc-eQTL 9.02e-01 -0.0156 0.126 0.088 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000237499 WAKMAR2 -743127 sc-eQTL 8.18e-01 0.0304 0.132 0.088 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000286646 AL121933.2 341061 sc-eQTL 8.94e-01 0.02 0.15 0.088 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000027697 IFNGR1 -94343 sc-eQTL 4.43e-02 -0.192 0.0949 0.088 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000029363 BCLAF1 835255 sc-eQTL 8.58e-01 -0.00997 0.0556 0.088 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000112357 PEX7 302542 sc-eQTL 6.13e-01 -0.0818 0.161 0.088 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000112378 PERP -982313 sc-eQTL 3.47e-01 0.0943 0.1 0.088 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000118503 TNFAIP3 -742108 sc-eQTL 5.98e-01 -0.0461 0.0872 0.088 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000197442 MAP3K5 332629 sc-eQTL 5.25e-01 -0.0749 0.118 0.088 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000237499 WAKMAR2 -743127 sc-eQTL 1.45e-02 -0.297 0.12 0.088 NK_CD56dim LOneK1K

Statistical fine-mapping results from Japan COVID-19 Task Force
(Shown only for PIP>0.001)
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
PIP (SuSiE)
PIP (FINEMAP)
MAF
ENSG00000027697 IFNGR1 -94343 eQTL 0.00388 -0.0758 0.0262 0.0 0.0 0.0687
ENSG00000029363 BCLAF1 835255 eQTL 0.0439 0.0345 0.0171 0.0 0.0 0.0687
ENSG00000182747 SLC35D3 202805 eQTL 0.0169 0.145 0.0604 0.0 0.0 0.0687
ENSG00000220412 AL356234.1 -582095 eQTL 0.0502 -0.0915 0.0467 0.00103 0.0 0.0687

Expression Modifier Score(EMS) for GTEx 49tissues
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Whole Blood
Muscle Skeletal
Liver
Brain Cerebellum
Prostate
Spleen
Skin Sun Exposed Lower leg
Artery Coronary
Esophagus Muscularis
Esophagus Gastroesophageal Junction
Artery Tibial
Heart Atrial Appendage
Nerve Tibial
Heart Left Ventricle
Adrenal Gland
Adipose Visceral Omentum
Pancreas
Lung
Pituitary
Brain Nucleus accumbens basal ganglia
Colon Transverse
Adipose Subcutaneous
Esophagus Mucosa
Brain Cortex
Thyroid
Stomach
Breast Mammary Tissue
Colon Sigmoid
Skin Not Sun Exposed Suprapubic
Testis
Artery Aorta
Brain Amygdala
Brain Anterior cingulate cortex BA24
Brain Caudate basal ganglia
Brain Cerebellar Hemisphere
Brain Frontal Cortex BA9
Brain Hippocampus
Brain Hypothalamus
Brain Putamen basal ganglia
Brain Spinal cord cervical c-1
Brain Substantia nigra
Cells Cultured fibroblasts
Cells EBV-transformed lymphocytes
Kidney Cortex
Minor Salivary Gland
Ovary
Small Intestine Terminal Ileum
Uterus
Vagina