logo

Genes within 1Mb (chr6:137117929:C:T):

View on , UCSC , GTEx , gnomAD

Immune cell-type specific single cell cis-eQTLs in OASIS
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000027697 IFNGR1 -101520 sc-eQTL 1.68e-01 -0.11 0.0799 0.248 B L1
ENSG00000029363 BCLAF1 828078 sc-eQTL 4.37e-01 -0.0278 0.0357 0.248 B L1
ENSG00000112357 PEX7 295365 sc-eQTL 9.31e-02 0.159 0.0943 0.248 B L1
ENSG00000112378 PERP -989490 sc-eQTL 4.55e-01 -0.047 0.0628 0.248 B L1
ENSG00000118503 TNFAIP3 -749285 sc-eQTL 7.29e-01 -0.0175 0.0506 0.248 B L1
ENSG00000197442 MAP3K5 325452 sc-eQTL 6.64e-02 -0.129 0.07 0.248 B L1
ENSG00000237499 WAKMAR2 -750304 sc-eQTL 7.80e-01 -0.0223 0.0797 0.248 B L1
ENSG00000027697 IFNGR1 -101520 sc-eQTL 1.82e-01 -0.0708 0.0529 0.248 CD4T L1
ENSG00000029363 BCLAF1 828078 sc-eQTL 3.25e-01 -0.0395 0.0401 0.248 CD4T L1
ENSG00000112357 PEX7 295365 sc-eQTL 8.71e-01 -0.0139 0.0855 0.248 CD4T L1
ENSG00000112378 PERP -989490 sc-eQTL 9.23e-01 0.00556 0.0574 0.248 CD4T L1
ENSG00000118503 TNFAIP3 -749285 sc-eQTL 9.64e-01 -0.00245 0.0538 0.248 CD4T L1
ENSG00000197442 MAP3K5 325452 sc-eQTL 1.63e-01 -0.0571 0.0408 0.248 CD4T L1
ENSG00000237499 WAKMAR2 -750304 sc-eQTL 5.58e-02 -0.129 0.0671 0.248 CD4T L1
ENSG00000027697 IFNGR1 -101520 sc-eQTL 6.40e-01 0.0284 0.0606 0.248 CD8T L1
ENSG00000029363 BCLAF1 828078 sc-eQTL 7.68e-01 -0.0121 0.041 0.248 CD8T L1
ENSG00000112357 PEX7 295365 sc-eQTL 4.77e-01 -0.072 0.101 0.248 CD8T L1
ENSG00000112378 PERP -989490 sc-eQTL 4.62e-02 -0.131 0.0655 0.248 CD8T L1
ENSG00000118503 TNFAIP3 -749285 sc-eQTL 7.33e-01 0.0174 0.051 0.248 CD8T L1
ENSG00000197442 MAP3K5 325452 sc-eQTL 8.16e-01 -0.0126 0.0539 0.248 CD8T L1
ENSG00000237499 WAKMAR2 -750304 sc-eQTL 7.77e-01 0.0212 0.075 0.248 CD8T L1
ENSG00000027697 IFNGR1 -101520 sc-eQTL 7.28e-01 0.0255 0.0731 0.25 DC L1
ENSG00000029363 BCLAF1 828078 sc-eQTL 8.53e-01 -0.0122 0.0658 0.25 DC L1
ENSG00000112357 PEX7 295365 sc-eQTL 9.31e-01 0.00896 0.103 0.25 DC L1
ENSG00000118503 TNFAIP3 -749285 sc-eQTL 9.32e-01 0.00665 0.0781 0.25 DC L1
ENSG00000135525 MAP7 567110 sc-eQTL 7.72e-01 0.0246 0.0846 0.25 DC L1
ENSG00000197442 MAP3K5 325452 sc-eQTL 4.42e-01 0.0624 0.081 0.25 DC L1
ENSG00000237499 WAKMAR2 -750304 sc-eQTL 4.51e-01 0.06 0.0795 0.25 DC L1
ENSG00000286646 AL121933.2 333884 sc-eQTL 9.53e-01 -0.00618 0.106 0.25 DC L1
ENSG00000027697 IFNGR1 -101520 sc-eQTL 7.97e-02 -0.106 0.0603 0.248 Mono L1
ENSG00000029363 BCLAF1 828078 sc-eQTL 2.47e-01 0.0601 0.0518 0.248 Mono L1
ENSG00000112357 PEX7 295365 sc-eQTL 2.48e-01 -0.118 0.102 0.248 Mono L1
ENSG00000118503 TNFAIP3 -749285 sc-eQTL 6.75e-01 0.0217 0.0515 0.248 Mono L1
ENSG00000135525 MAP7 567110 sc-eQTL 1.97e-01 -0.116 0.0899 0.248 Mono L1
ENSG00000197442 MAP3K5 325452 sc-eQTL 4.18e-01 -0.0488 0.0601 0.248 Mono L1
ENSG00000237499 WAKMAR2 -750304 sc-eQTL 8.24e-01 0.0142 0.0639 0.248 Mono L1
ENSG00000286646 AL121933.2 333884 sc-eQTL 2.54e-01 0.0831 0.0726 0.248 Mono L1
ENSG00000027697 IFNGR1 -101520 sc-eQTL 4.27e-01 -0.055 0.0691 0.249 NK L1
ENSG00000029363 BCLAF1 828078 sc-eQTL 8.43e-01 0.00731 0.0368 0.249 NK L1
ENSG00000112357 PEX7 295365 sc-eQTL 4.55e-01 0.0799 0.107 0.249 NK L1
ENSG00000112378 PERP -989490 sc-eQTL 2.12e-01 0.084 0.0671 0.249 NK L1
ENSG00000118503 TNFAIP3 -749285 sc-eQTL 7.64e-01 0.0174 0.0576 0.249 NK L1
ENSG00000197442 MAP3K5 325452 sc-eQTL 8.15e-01 0.0193 0.0826 0.249 NK L1
ENSG00000237499 WAKMAR2 -750304 sc-eQTL 8.96e-01 0.0107 0.0817 0.249 NK L1
ENSG00000027697 IFNGR1 -101520 sc-eQTL 9.75e-01 0.00201 0.0631 0.248 Other_T L1
ENSG00000029363 BCLAF1 828078 sc-eQTL 2.21e-01 -0.0648 0.0528 0.248 Other_T L1
ENSG00000112357 PEX7 295365 sc-eQTL 7.25e-01 -0.0362 0.103 0.248 Other_T L1
ENSG00000112378 PERP -989490 sc-eQTL 1.84e-01 0.11 0.0823 0.248 Other_T L1
ENSG00000118503 TNFAIP3 -749285 sc-eQTL 6.24e-01 0.0193 0.0393 0.248 Other_T L1
ENSG00000146410 MTFR2 867594 sc-eQTL 9.90e-01 0.000721 0.0595 0.248 Other_T L1
ENSG00000197442 MAP3K5 325452 sc-eQTL 9.33e-01 -0.00637 0.0759 0.248 Other_T L1
ENSG00000237499 WAKMAR2 -750304 sc-eQTL 5.62e-01 -0.0453 0.0779 0.248 Other_T L1
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000027697 IFNGR1 -101520 sc-eQTL 4.08e-01 -0.087 0.105 0.258 B_Activated L2
ENSG00000029363 BCLAF1 828078 sc-eQTL 3.75e-01 0.0756 0.085 0.258 B_Activated L2
ENSG00000112357 PEX7 295365 sc-eQTL 3.37e-03 0.299 0.101 0.258 B_Activated L2
ENSG00000112378 PERP -989490 sc-eQTL 9.96e-01 -0.00027 0.0534 0.258 B_Activated L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 -749285 sc-eQTL 5.84e-02 0.195 0.103 0.258 B_Activated L2
ENSG00000197442 MAP3K5 325452 sc-eQTL 3.32e-01 -0.113 0.116 0.258 B_Activated L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 -750304 sc-eQTL 4.12e-01 0.0743 0.0904 0.258 B_Activated L2
ENSG00000027697 IFNGR1 -101520 sc-eQTL 6.98e-01 -0.0366 0.0941 0.249 B_Intermediate L2
ENSG00000029363 BCLAF1 828078 sc-eQTL 9.28e-01 -0.00484 0.0536 0.249 B_Intermediate L2
ENSG00000112357 PEX7 295365 sc-eQTL 4.67e-02 0.195 0.0976 0.249 B_Intermediate L2
ENSG00000112378 PERP -989490 sc-eQTL 5.74e-02 -0.17 0.089 0.249 B_Intermediate L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 -749285 sc-eQTL 7.20e-01 0.0253 0.0705 0.249 B_Intermediate L2
ENSG00000197442 MAP3K5 325452 sc-eQTL 1.93e-01 -0.111 0.0848 0.249 B_Intermediate L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 -750304 sc-eQTL 8.97e-01 0.0129 0.1 0.249 B_Intermediate L2
ENSG00000027697 IFNGR1 -101520 sc-eQTL 7.86e-01 -0.028 0.103 0.25 B_Memory L2
ENSG00000029363 BCLAF1 828078 sc-eQTL 2.92e-01 0.0644 0.061 0.25 B_Memory L2
ENSG00000112357 PEX7 295365 sc-eQTL 8.04e-01 0.0258 0.104 0.25 B_Memory L2
ENSG00000112378 PERP -989490 sc-eQTL 5.42e-01 0.0597 0.0978 0.25 B_Memory L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 -749285 sc-eQTL 4.49e-01 -0.051 0.0673 0.25 B_Memory L2
ENSG00000197442 MAP3K5 325452 sc-eQTL 8.50e-02 0.158 0.0913 0.25 B_Memory L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 -750304 sc-eQTL 3.72e-01 -0.0895 0.1 0.25 B_Memory L2
ENSG00000027697 IFNGR1 -101520 sc-eQTL 1.20e-01 -0.126 0.0807 0.248 B_Naive1 L2
ENSG00000029363 BCLAF1 828078 sc-eQTL 3.68e-01 -0.0418 0.0463 0.248 B_Naive1 L2
ENSG00000112357 PEX7 295365 sc-eQTL 5.24e-01 0.0683 0.107 0.248 B_Naive1 L2
ENSG00000112378 PERP -989490 sc-eQTL 7.00e-01 0.0361 0.0936 0.248 B_Naive1 L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 -749285 sc-eQTL 7.30e-01 0.0188 0.0543 0.248 B_Naive1 L2
ENSG00000197442 MAP3K5 325452 sc-eQTL 9.12e-01 0.00848 0.0763 0.248 B_Naive1 L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 -750304 sc-eQTL 8.64e-01 -0.0146 0.0851 0.248 B_Naive1 L2
ENSG00000027697 IFNGR1 -101520 sc-eQTL 5.25e-01 -0.0622 0.0976 0.249 B_Naive2 L2
ENSG00000029363 BCLAF1 828078 sc-eQTL 2.05e-01 -0.0717 0.0564 0.249 B_Naive2 L2
ENSG00000112357 PEX7 295365 sc-eQTL 1.38e-01 0.158 0.106 0.249 B_Naive2 L2
ENSG00000112378 PERP -989490 sc-eQTL 3.46e-01 -0.0733 0.0777 0.249 B_Naive2 L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 -749285 sc-eQTL 8.98e-01 0.01 0.0778 0.249 B_Naive2 L2
ENSG00000197442 MAP3K5 325452 sc-eQTL 3.44e-02 -0.174 0.0819 0.249 B_Naive2 L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 -750304 sc-eQTL 9.29e-02 -0.169 0.0999 0.249 B_Naive2 L2
ENSG00000027697 IFNGR1 -101520 sc-eQTL 7.91e-01 -0.0244 0.0922 0.248 CD4_CTL L2
ENSG00000029363 BCLAF1 828078 sc-eQTL 6.26e-01 0.0399 0.0817 0.248 CD4_CTL L2
ENSG00000112357 PEX7 295365 sc-eQTL 7.34e-01 -0.0348 0.102 0.248 CD4_CTL L2
ENSG00000112378 PERP -989490 sc-eQTL 1.20e-01 0.161 0.103 0.248 CD4_CTL L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 -749285 sc-eQTL 8.00e-01 0.0153 0.0604 0.248 CD4_CTL L2
ENSG00000197442 MAP3K5 325452 sc-eQTL 5.72e-01 -0.0546 0.0963 0.248 CD4_CTL L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 -750304 sc-eQTL 5.82e-01 -0.0518 0.094 0.248 CD4_CTL L2
ENSG00000027697 IFNGR1 -101520 sc-eQTL 6.08e-01 -0.0259 0.0506 0.248 CD4_Naive L2
ENSG00000029363 BCLAF1 828078 sc-eQTL 3.43e-01 -0.0386 0.0405 0.248 CD4_Naive L2
ENSG00000112357 PEX7 295365 sc-eQTL 6.84e-01 0.0389 0.0955 0.248 CD4_Naive L2
ENSG00000112378 PERP -989490 sc-eQTL 5.86e-01 0.0429 0.0788 0.248 CD4_Naive L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 -749285 sc-eQTL 7.13e-01 -0.0204 0.0553 0.248 CD4_Naive L2
ENSG00000197442 MAP3K5 325452 sc-eQTL 2.84e-01 -0.0435 0.0405 0.248 CD4_Naive L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 -750304 sc-eQTL 1.79e-02 -0.169 0.0707 0.248 CD4_Naive L2
ENSG00000027697 IFNGR1 -101520 sc-eQTL 1.75e-01 -0.0944 0.0693 0.248 CD4_TCM L2
ENSG00000029363 BCLAF1 828078 sc-eQTL 9.08e-01 -0.00506 0.0439 0.248 CD4_TCM L2
ENSG00000112357 PEX7 295365 sc-eQTL 1.82e-01 0.136 0.102 0.248 CD4_TCM L2
ENSG00000112378 PERP -989490 sc-eQTL 3.60e-01 -0.079 0.0862 0.248 CD4_TCM L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 -749285 sc-eQTL 9.88e-01 -0.000757 0.0502 0.248 CD4_TCM L2
ENSG00000197442 MAP3K5 325452 sc-eQTL 3.54e-01 -0.053 0.057 0.248 CD4_TCM L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 -750304 sc-eQTL 5.58e-01 -0.0412 0.0702 0.248 CD4_TCM L2
ENSG00000027697 IFNGR1 -101520 sc-eQTL 1.02e-01 -0.13 0.0791 0.248 CD4_TEM L2
ENSG00000029363 BCLAF1 828078 sc-eQTL 7.16e-01 -0.0206 0.0564 0.248 CD4_TEM L2
ENSG00000112357 PEX7 295365 sc-eQTL 1.04e-01 -0.167 0.102 0.248 CD4_TEM L2
ENSG00000112378 PERP -989490 sc-eQTL 3.96e-01 -0.0708 0.0832 0.248 CD4_TEM L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 -749285 sc-eQTL 2.36e-01 0.0626 0.0527 0.248 CD4_TEM L2
ENSG00000197442 MAP3K5 325452 sc-eQTL 9.61e-01 0.00396 0.0817 0.248 CD4_TEM L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 -750304 sc-eQTL 7.19e-02 -0.152 0.0842 0.248 CD4_TEM L2
ENSG00000027697 IFNGR1 -101520 sc-eQTL 2.43e-01 0.0846 0.0723 0.248 CD8_CTL L2
ENSG00000029363 BCLAF1 828078 sc-eQTL 9.83e-01 0.00106 0.0483 0.248 CD8_CTL L2
ENSG00000112357 PEX7 295365 sc-eQTL 8.76e-01 0.0156 0.0997 0.248 CD8_CTL L2
ENSG00000112378 PERP -989490 sc-eQTL 1.34e-01 -0.144 0.0954 0.248 CD8_CTL L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 -749285 sc-eQTL 8.65e-01 -0.0104 0.061 0.248 CD8_CTL L2
ENSG00000197442 MAP3K5 325452 sc-eQTL 3.98e-01 0.0729 0.086 0.248 CD8_CTL L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 -750304 sc-eQTL 9.48e-01 0.0056 0.0858 0.248 CD8_CTL L2
ENSG00000027697 IFNGR1 -101520 sc-eQTL 3.41e-01 -0.0696 0.0729 0.248 CD8_Naive L2
ENSG00000029363 BCLAF1 828078 sc-eQTL 7.49e-01 -0.0163 0.051 0.248 CD8_Naive L2
ENSG00000112357 PEX7 295365 sc-eQTL 9.99e-01 -0.000164 0.106 0.248 CD8_Naive L2
ENSG00000112378 PERP -989490 sc-eQTL 3.45e-01 -0.076 0.0803 0.248 CD8_Naive L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 -749285 sc-eQTL 7.61e-01 0.0174 0.0571 0.248 CD8_Naive L2
ENSG00000197442 MAP3K5 325452 sc-eQTL 6.59e-01 -0.0299 0.0677 0.248 CD8_Naive L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 -750304 sc-eQTL 3.77e-01 -0.0747 0.0843 0.248 CD8_Naive L2
ENSG00000027697 IFNGR1 -101520 sc-eQTL 7.02e-01 0.037 0.0967 0.252 CD8_TCM L2
ENSG00000029363 BCLAF1 828078 sc-eQTL 4.37e-01 -0.0564 0.0725 0.252 CD8_TCM L2
ENSG00000112357 PEX7 295365 sc-eQTL 2.67e-01 -0.123 0.111 0.252 CD8_TCM L2
ENSG00000112378 PERP -989490 sc-eQTL 3.74e-01 -0.0966 0.109 0.252 CD8_TCM L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 -749285 sc-eQTL 9.69e-01 -0.00206 0.0524 0.252 CD8_TCM L2
ENSG00000197442 MAP3K5 325452 sc-eQTL 7.47e-01 -0.0302 0.0936 0.252 CD8_TCM L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 -750304 sc-eQTL 4.73e-01 0.0689 0.0958 0.252 CD8_TCM L2
ENSG00000027697 IFNGR1 -101520 sc-eQTL 9.75e-01 -0.00286 0.092 0.242 CD8_TEM L2
ENSG00000029363 BCLAF1 828078 sc-eQTL 6.22e-01 -0.0428 0.0867 0.242 CD8_TEM L2
ENSG00000112357 PEX7 295365 sc-eQTL 4.29e-01 0.0837 0.106 0.242 CD8_TEM L2
ENSG00000112378 PERP -989490 sc-eQTL 8.27e-01 -0.024 0.11 0.242 CD8_TEM L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 -749285 sc-eQTL 6.33e-01 0.0325 0.0678 0.242 CD8_TEM L2
ENSG00000197442 MAP3K5 325452 sc-eQTL 5.61e-01 -0.061 0.105 0.242 CD8_TEM L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 -750304 sc-eQTL 5.47e-01 -0.0606 0.101 0.242 CD8_TEM L2
ENSG00000027697 IFNGR1 -101520 sc-eQTL 5.98e-01 -0.0386 0.0731 0.251 MAIT L2
ENSG00000029363 BCLAF1 828078 sc-eQTL 4.71e-01 -0.0438 0.0607 0.251 MAIT L2
ENSG00000112357 PEX7 295365 sc-eQTL 5.04e-01 -0.0663 0.0991 0.251 MAIT L2
ENSG00000112378 PERP -989490 sc-eQTL 5.02e-01 0.0695 0.103 0.251 MAIT L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 -749285 sc-eQTL 9.11e-01 0.00553 0.0492 0.251 MAIT L2
ENSG00000146410 MTFR2 867594 sc-eQTL 4.43e-01 0.0629 0.0819 0.251 MAIT L2
ENSG00000197442 MAP3K5 325452 sc-eQTL 3.34e-01 0.0829 0.0855 0.251 MAIT L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 -750304 sc-eQTL 9.25e-01 -0.00862 0.091 0.251 MAIT L2
ENSG00000027697 IFNGR1 -101520 sc-eQTL 5.62e-01 -0.0473 0.0814 0.249 NK_CD56bright L2
ENSG00000029363 BCLAF1 828078 sc-eQTL 6.58e-01 -0.0267 0.0601 0.249 NK_CD56bright L2
ENSG00000112357 PEX7 295365 sc-eQTL 8.94e-01 0.0142 0.106 0.249 NK_CD56bright L2
ENSG00000112378 PERP -989490 sc-eQTL 8.23e-01 0.0213 0.0951 0.249 NK_CD56bright L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 -749285 sc-eQTL 3.13e-01 0.0612 0.0605 0.249 NK_CD56bright L2
ENSG00000197442 MAP3K5 325452 sc-eQTL 6.61e-01 -0.0405 0.0922 0.249 NK_CD56bright L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 -750304 sc-eQTL 4.11e-01 0.0795 0.0965 0.249 NK_CD56bright L2
ENSG00000027697 IFNGR1 -101520 sc-eQTL 5.69e-01 0.036 0.0632 0.25 NK_CD56dim L2
ENSG00000029363 BCLAF1 828078 sc-eQTL 8.33e-01 0.00872 0.0413 0.25 NK_CD56dim L2
ENSG00000112357 PEX7 295365 sc-eQTL 4.88e-01 -0.0756 0.109 0.25 NK_CD56dim L2
ENSG00000112378 PERP -989490 sc-eQTL 1.21e-02 0.191 0.0754 0.25 NK_CD56dim L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 -749285 sc-eQTL 4.82e-01 0.0419 0.0595 0.25 NK_CD56dim L2
ENSG00000197442 MAP3K5 325452 sc-eQTL 9.19e-01 0.00875 0.0857 0.25 NK_CD56dim L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 -750304 sc-eQTL 5.48e-01 0.0536 0.0891 0.25 NK_CD56dim L2
ENSG00000027697 IFNGR1 -101520 sc-eQTL 4.39e-02 -0.172 0.0849 0.242 NK_HLA L2
ENSG00000029363 BCLAF1 828078 sc-eQTL 7.64e-01 0.0219 0.0727 0.242 NK_HLA L2
ENSG00000112357 PEX7 295365 sc-eQTL 3.81e-02 0.225 0.108 0.242 NK_HLA L2
ENSG00000112378 PERP -989490 sc-eQTL 7.05e-01 0.0335 0.0884 0.242 NK_HLA L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 -749285 sc-eQTL 4.57e-01 -0.0507 0.0679 0.242 NK_HLA L2
ENSG00000197442 MAP3K5 325452 sc-eQTL 2.99e-01 0.112 0.108 0.242 NK_HLA L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 -750304 sc-eQTL 7.35e-02 -0.196 0.109 0.242 NK_HLA L2
ENSG00000027697 IFNGR1 -101520 sc-eQTL 2.20e-01 -0.0844 0.0686 0.25 NK_cytokine L2
ENSG00000029363 BCLAF1 828078 sc-eQTL 9.50e-01 0.0032 0.0514 0.25 NK_cytokine L2
ENSG00000112357 PEX7 295365 sc-eQTL 8.07e-02 0.188 0.107 0.25 NK_cytokine L2
ENSG00000112378 PERP -989490 sc-eQTL 6.68e-01 -0.0352 0.082 0.25 NK_cytokine L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 -749285 sc-eQTL 4.09e-01 0.0508 0.0614 0.25 NK_cytokine L2
ENSG00000197442 MAP3K5 325452 sc-eQTL 7.84e-01 -0.0232 0.0844 0.25 NK_cytokine L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 -750304 sc-eQTL 9.59e-01 0.00475 0.0926 0.25 NK_cytokine L2
ENSG00000027697 IFNGR1 -101520 sc-eQTL 1.02e-01 -0.219 0.133 0.237 PB L2
ENSG00000029363 BCLAF1 828078 sc-eQTL 1.39e-02 -0.282 0.113 0.237 PB L2
ENSG00000112357 PEX7 295365 sc-eQTL 3.51e-01 0.129 0.138 0.237 PB L2
ENSG00000112378 PERP -989490 sc-eQTL 3.24e-02 -0.183 0.0845 0.237 PB L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 -749285 sc-eQTL 3.88e-01 0.0905 0.104 0.237 PB L2
ENSG00000197442 MAP3K5 325452 sc-eQTL 1.98e-02 -0.275 0.116 0.237 PB L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 -750304 sc-eQTL 1.43e-01 0.184 0.124 0.237 PB L2
ENSG00000027697 IFNGR1 -101520 sc-eQTL 5.62e-01 0.0474 0.0816 0.25 Pro_T L2
ENSG00000029363 BCLAF1 828078 sc-eQTL 5.93e-01 -0.0453 0.0846 0.25 Pro_T L2
ENSG00000112357 PEX7 295365 sc-eQTL 4.92e-01 0.0681 0.0991 0.25 Pro_T L2
ENSG00000112378 PERP -989490 sc-eQTL 3.27e-01 0.0773 0.0787 0.25 Pro_T L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 -749285 sc-eQTL 1.72e-01 0.0678 0.0495 0.25 Pro_T L2
ENSG00000146410 MTFR2 867594 sc-eQTL 7.09e-01 0.0258 0.0689 0.25 Pro_T L2
ENSG00000197442 MAP3K5 325452 sc-eQTL 3.61e-02 -0.201 0.0953 0.25 Pro_T L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 -750304 sc-eQTL 8.57e-01 -0.0174 0.0966 0.25 Pro_T L2
ENSG00000027697 IFNGR1 -101520 sc-eQTL 5.48e-01 -0.0569 0.0947 0.248 Treg L2
ENSG00000029363 BCLAF1 828078 sc-eQTL 7.35e-01 -0.0207 0.0612 0.248 Treg L2
ENSG00000112357 PEX7 295365 sc-eQTL 9.00e-01 -0.0126 0.1 0.248 Treg L2
ENSG00000112378 PERP -989490 sc-eQTL 4.19e-01 0.0875 0.108 0.248 Treg L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 -749285 sc-eQTL 9.59e-01 0.00312 0.0602 0.248 Treg L2
ENSG00000197442 MAP3K5 325452 sc-eQTL 1.94e-01 0.0847 0.065 0.248 Treg L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 -750304 sc-eQTL 9.78e-01 0.00254 0.0919 0.248 Treg L2
ENSG00000027697 IFNGR1 -101520 sc-eQTL 2.03e-01 0.103 0.0809 0.254 cDC L2
ENSG00000029363 BCLAF1 828078 sc-eQTL 6.78e-01 0.0341 0.0819 0.254 cDC L2
ENSG00000112357 PEX7 295365 sc-eQTL 2.68e-01 0.116 0.105 0.254 cDC L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 -749285 sc-eQTL 8.60e-01 0.0141 0.0801 0.254 cDC L2
ENSG00000135525 MAP7 567110 sc-eQTL 1.53e-01 0.134 0.0932 0.254 cDC L2
ENSG00000197442 MAP3K5 325452 sc-eQTL 9.33e-01 -0.00691 0.0825 0.254 cDC L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 -750304 sc-eQTL 3.49e-01 0.0978 0.104 0.254 cDC L2
ENSG00000286646 AL121933.2 333884 sc-eQTL 7.73e-01 -0.0311 0.107 0.254 cDC L2
ENSG00000027697 IFNGR1 -101520 sc-eQTL 4.80e-01 -0.0402 0.0567 0.248 cMono_IL1B L2
ENSG00000029363 BCLAF1 828078 sc-eQTL 7.07e-01 0.0229 0.0609 0.248 cMono_IL1B L2
ENSG00000112357 PEX7 295365 sc-eQTL 4.25e-01 -0.0815 0.102 0.248 cMono_IL1B L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 -749285 sc-eQTL 8.09e-01 0.0148 0.0611 0.248 cMono_IL1B L2
ENSG00000135525 MAP7 567110 sc-eQTL 1.66e-02 -0.21 0.0868 0.248 cMono_IL1B L2
ENSG00000197442 MAP3K5 325452 sc-eQTL 6.52e-01 -0.0287 0.0635 0.248 cMono_IL1B L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 -750304 sc-eQTL 4.81e-01 0.046 0.0652 0.248 cMono_IL1B L2
ENSG00000286646 AL121933.2 333884 sc-eQTL 1.04e-01 0.133 0.0812 0.248 cMono_IL1B L2
ENSG00000027697 IFNGR1 -101520 sc-eQTL 6.76e-02 -0.119 0.0648 0.248 cMono_S100A L2
ENSG00000029363 BCLAF1 828078 sc-eQTL 1.47e-01 0.0972 0.0668 0.248 cMono_S100A L2
ENSG00000112357 PEX7 295365 sc-eQTL 4.75e-01 -0.075 0.105 0.248 cMono_S100A L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 -749285 sc-eQTL 3.40e-01 -0.0554 0.0579 0.248 cMono_S100A L2
ENSG00000135525 MAP7 567110 sc-eQTL 7.79e-01 0.0274 0.0977 0.248 cMono_S100A L2
ENSG00000197442 MAP3K5 325452 sc-eQTL 6.36e-01 -0.0374 0.0789 0.248 cMono_S100A L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 -750304 sc-eQTL 9.62e-02 -0.138 0.0828 0.248 cMono_S100A L2
ENSG00000286646 AL121933.2 333884 sc-eQTL 7.93e-01 0.0214 0.0814 0.248 cMono_S100A L2
ENSG00000027697 IFNGR1 -101520 sc-eQTL 4.63e-01 0.0718 0.0976 0.245 gdT L2
ENSG00000029363 BCLAF1 828078 sc-eQTL 8.34e-01 -0.0181 0.086 0.245 gdT L2
ENSG00000112357 PEX7 295365 sc-eQTL 7.66e-01 -0.0369 0.124 0.245 gdT L2
ENSG00000112378 PERP -989490 sc-eQTL 4.96e-02 0.211 0.107 0.245 gdT L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 -749285 sc-eQTL 8.85e-01 0.00874 0.0601 0.245 gdT L2
ENSG00000146410 MTFR2 867594 sc-eQTL 2.53e-01 0.108 0.0944 0.245 gdT L2
ENSG00000197442 MAP3K5 325452 sc-eQTL 6.81e-01 0.0524 0.127 0.245 gdT L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 -750304 sc-eQTL 3.20e-01 -0.108 0.109 0.245 gdT L2
ENSG00000027697 IFNGR1 -101520 sc-eQTL 4.17e-01 -0.0567 0.0697 0.251 intMono L2
ENSG00000029363 BCLAF1 828078 sc-eQTL 2.19e-01 0.113 0.0919 0.251 intMono L2
ENSG00000112357 PEX7 295365 sc-eQTL 5.47e-01 -0.0567 0.094 0.251 intMono L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 -749285 sc-eQTL 6.50e-01 0.0274 0.0603 0.251 intMono L2
ENSG00000135525 MAP7 567110 sc-eQTL 1.83e-01 0.123 0.0922 0.251 intMono L2
ENSG00000197442 MAP3K5 325452 sc-eQTL 6.85e-01 -0.0399 0.0981 0.251 intMono L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 -750304 sc-eQTL 4.92e-01 0.0618 0.0897 0.251 intMono L2
ENSG00000286646 AL121933.2 333884 sc-eQTL 3.84e-01 0.0902 0.103 0.251 intMono L2
ENSG00000027697 IFNGR1 -101520 sc-eQTL 3.93e-02 -0.17 0.0821 0.247 ncMono L2
ENSG00000029363 BCLAF1 828078 sc-eQTL 2.38e-01 -0.0759 0.0642 0.247 ncMono L2
ENSG00000112357 PEX7 295365 sc-eQTL 6.65e-01 -0.0445 0.103 0.247 ncMono L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 -749285 sc-eQTL 5.51e-01 0.0438 0.0733 0.247 ncMono L2
ENSG00000135525 MAP7 567110 sc-eQTL 9.16e-01 0.00956 0.0907 0.247 ncMono L2
ENSG00000197442 MAP3K5 325452 sc-eQTL 6.76e-01 -0.0398 0.0953 0.247 ncMono L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 -750304 sc-eQTL 7.21e-01 0.0329 0.0918 0.247 ncMono L2
ENSG00000286646 AL121933.2 333884 sc-eQTL 8.18e-01 -0.0223 0.0968 0.247 ncMono L2
ENSG00000027697 IFNGR1 -101520 sc-eQTL 6.89e-01 -0.0378 0.0942 0.26 pDC L2
ENSG00000029363 BCLAF1 828078 sc-eQTL 5.45e-01 0.0428 0.0707 0.26 pDC L2
ENSG00000112357 PEX7 295365 sc-eQTL 5.59e-01 -0.0607 0.104 0.26 pDC L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 -749285 sc-eQTL 9.02e-01 0.0108 0.0874 0.26 pDC L2
ENSG00000135525 MAP7 567110 sc-eQTL 2.37e-01 -0.0857 0.0722 0.26 pDC L2
ENSG00000197442 MAP3K5 325452 sc-eQTL 1.83e-01 0.154 0.115 0.26 pDC L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 -750304 sc-eQTL 5.27e-01 -0.0561 0.0886 0.26 pDC L2
ENSG00000286646 AL121933.2 333884 sc-eQTL 5.53e-01 0.0635 0.107 0.26 pDC L2
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000027697 IFNGR1 -101520 sc-eQTL 8.93e-01 0.0113 0.0841 0.248 B_Memory LOneK1K
ENSG00000029363 BCLAF1 828078 sc-eQTL 9.31e-01 0.00412 0.0472 0.248 B_Memory LOneK1K
ENSG00000112357 PEX7 295365 sc-eQTL 1.39e-02 0.236 0.0953 0.248 B_Memory LOneK1K
ENSG00000112378 PERP -989490 sc-eQTL 6.80e-01 -0.0371 0.0898 0.248 B_Memory LOneK1K
ENSG00000118503 TNFAIP3 -749285 sc-eQTL 4.23e-01 -0.0476 0.0592 0.248 B_Memory LOneK1K
ENSG00000197442 MAP3K5 325452 sc-eQTL 6.71e-01 -0.0334 0.0785 0.248 B_Memory LOneK1K
ENSG00000237499 WAKMAR2 -750304 sc-eQTL 9.86e-01 -0.00171 0.1 0.248 B_Memory LOneK1K
ENSG00000027697 IFNGR1 -101520 sc-eQTL 1.01e-01 -0.14 0.085 0.248 B_Naive LOneK1K
ENSG00000029363 BCLAF1 828078 sc-eQTL 8.50e-02 -0.0675 0.039 0.248 B_Naive LOneK1K
ENSG00000112357 PEX7 295365 sc-eQTL 3.42e-01 0.099 0.104 0.248 B_Naive LOneK1K
ENSG00000112378 PERP -989490 sc-eQTL 7.17e-01 0.0338 0.0932 0.248 B_Naive LOneK1K
ENSG00000118503 TNFAIP3 -749285 sc-eQTL 8.78e-01 0.00753 0.049 0.248 B_Naive LOneK1K
ENSG00000197442 MAP3K5 325452 sc-eQTL 4.52e-01 -0.054 0.0717 0.248 B_Naive LOneK1K
ENSG00000237499 WAKMAR2 -750304 sc-eQTL 4.81e-01 -0.0615 0.0871 0.248 B_Naive LOneK1K
ENSG00000027697 IFNGR1 -101520 sc-eQTL 1.59e-01 -0.0802 0.0568 0.248 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000029363 BCLAF1 828078 sc-eQTL 2.61e-01 0.0598 0.053 0.248 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000112357 PEX7 295365 sc-eQTL 2.87e-01 -0.109 0.102 0.248 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000118503 TNFAIP3 -749285 sc-eQTL 8.88e-01 0.00741 0.0528 0.248 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000135525 MAP7 567110 sc-eQTL 4.86e-02 -0.18 0.0908 0.248 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000197442 MAP3K5 325452 sc-eQTL 3.28e-01 -0.0605 0.0617 0.248 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000237499 WAKMAR2 -750304 sc-eQTL 9.35e-01 0.00514 0.0633 0.248 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000286646 AL121933.2 333884 sc-eQTL 3.30e-01 0.0718 0.0735 0.248 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000027697 IFNGR1 -101520 sc-eQTL 6.50e-02 -0.126 0.0682 0.25 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000029363 BCLAF1 828078 sc-eQTL 7.11e-01 0.023 0.0621 0.25 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000112357 PEX7 295365 sc-eQTL 6.26e-01 -0.0506 0.104 0.25 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000118503 TNFAIP3 -749285 sc-eQTL 9.45e-01 0.00444 0.0642 0.25 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000135525 MAP7 567110 sc-eQTL 4.19e-01 0.0811 0.1 0.25 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000197442 MAP3K5 325452 sc-eQTL 9.72e-01 0.00294 0.0824 0.25 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000237499 WAKMAR2 -750304 sc-eQTL 5.93e-01 0.046 0.086 0.25 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000286646 AL121933.2 333884 sc-eQTL 3.14e-01 0.0984 0.0975 0.25 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000027697 IFNGR1 -101520 sc-eQTL 6.19e-01 -0.0325 0.0654 0.25 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000029363 BCLAF1 828078 sc-eQTL 5.39e-01 0.0233 0.0379 0.25 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000112357 PEX7 295365 sc-eQTL 5.84e-01 0.0604 0.11 0.25 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000112378 PERP -989490 sc-eQTL 1.34e-01 0.102 0.0681 0.25 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000118503 TNFAIP3 -749285 sc-eQTL 9.23e-01 0.0058 0.0596 0.25 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000197442 MAP3K5 325452 sc-eQTL 8.67e-01 0.0135 0.0805 0.25 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000237499 WAKMAR2 -750304 sc-eQTL 8.84e-01 -0.0121 0.0834 0.25 NK_CD56dim LOneK1K

Statistical fine-mapping results from Japan COVID-19 Task Force
(Shown only for PIP>0.001)
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
PIP (SuSiE)
PIP (FINEMAP)
MAF
ENSG00000027697 IFNGR1 -101520 pQTL 0.00105 -0.0619 0.0188 0.0 0.0 0.206
ENSG00000027697 IFNGR1 -101520 eQTL 0.00039 -0.0592 0.0166 0.0 0.0 0.2
ENSG00000182747 SLC35D3 195628 eQTL 0.00205 0.119 0.0384 0.0 0.0 0.2

Expression Modifier Score(EMS) for GTEx 49tissues
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Whole Blood
Muscle Skeletal
Liver
Brain Cerebellum
Prostate
Spleen
Skin Sun Exposed Lower leg
Artery Coronary
Esophagus Muscularis
Esophagus Gastroesophageal Junction
Artery Tibial
Heart Atrial Appendage
Nerve Tibial
Heart Left Ventricle
Adrenal Gland
Adipose Visceral Omentum
Pancreas
Lung
Pituitary
Brain Nucleus accumbens basal ganglia
Colon Transverse
Adipose Subcutaneous
Esophagus Mucosa
Brain Cortex
Thyroid
Stomach
Breast Mammary Tissue
Colon Sigmoid
Skin Not Sun Exposed Suprapubic
Testis
Artery Aorta
Brain Amygdala
Brain Anterior cingulate cortex BA24
Brain Caudate basal ganglia
Brain Cerebellar Hemisphere
Brain Frontal Cortex BA9
Brain Hippocampus
Brain Hypothalamus
Brain Putamen basal ganglia
Brain Spinal cord cervical c-1
Brain Substantia nigra
Cells Cultured fibroblasts
Cells EBV-transformed lymphocytes
Kidney Cortex
Minor Salivary Gland
Ovary
Small Intestine Terminal Ileum
Uterus
Vagina
ENSG00000027697 IFNGR1 -101520 9.86e-06 1.24e-05 1.56e-06 7.6e-06 2.36e-06 4.65e-06 2.32e-05 2.19e-06 1.05e-05 5.31e-06 1.24e-05 5.73e-06 1.6e-05 3.95e-06 3.46e-06 6.33e-06 5.67e-06 8.13e-06 2.62e-06 2.77e-06 5.94e-06 9.52e-06 1.87e-05 3.25e-06 2.16e-05 3.81e-06 5.19e-06 4.09e-06 1.83e-05 8.32e-06 5.94e-06 9.81e-07 6.91e-07 2.92e-06 5.01e-06 2.81e-06 1.42e-06 1.32e-06 1.6e-06 8.86e-07 8.23e-07 1.39e-05 1.49e-06 1.66e-07 7.66e-07 1.57e-06 1.7e-06 6.35e-07 5.08e-07
ENSG00000220412 \N -589272 1.11e-06 9.07e-07 2.81e-07 6.49e-07 9.29e-08 3.08e-07 8.39e-07 1.03e-07 5.06e-07 2.14e-07 8.15e-07 3.48e-07 9.37e-07 2.06e-07 3.94e-07 2.83e-07 5.64e-07 4.4e-07 2.88e-07 4.06e-07 2.42e-07 4.99e-07 4.77e-07 2.71e-07 1.49e-06 2.46e-07 4.83e-07 3.62e-07 5.42e-07 6.73e-07 3.13e-07 7.69e-08 4.92e-08 2.06e-07 3.42e-07 1.94e-07 2.83e-07 8.04e-08 4.17e-08 7.28e-08 8.48e-08 6.11e-07 5.54e-08 1.76e-08 8.68e-08 5.38e-08 1.19e-07 0.0 4.61e-08