logo

Genes within 1Mb (chr6:137116920:G:A):

View on , UCSC , GTEx , gnomAD

Immune cell-type specific single cell cis-eQTLs in OASIS
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000027697 IFNGR1 -102529 sc-eQTL 5.09e-01 0.0847 0.128 0.081 B L1
ENSG00000029363 BCLAF1 827069 sc-eQTL 6.55e-01 0.0256 0.057 0.081 B L1
ENSG00000112357 PEX7 294356 sc-eQTL 8.38e-01 -0.031 0.152 0.081 B L1
ENSG00000112378 PERP -990499 sc-eQTL 9.30e-01 0.00884 0.1 0.081 B L1
ENSG00000118503 TNFAIP3 -750294 sc-eQTL 9.13e-01 0.00883 0.0809 0.081 B L1
ENSG00000197442 MAP3K5 324443 sc-eQTL 2.12e-01 0.141 0.112 0.081 B L1
ENSG00000237499 WAKMAR2 -751313 sc-eQTL 7.08e-01 0.0477 0.127 0.081 B L1
ENSG00000027697 IFNGR1 -102529 sc-eQTL 9.12e-01 -0.00941 0.085 0.081 CD4T L1
ENSG00000029363 BCLAF1 827069 sc-eQTL 4.02e-01 -0.0539 0.0642 0.081 CD4T L1
ENSG00000112357 PEX7 294356 sc-eQTL 9.88e-01 -0.002 0.137 0.081 CD4T L1
ENSG00000112378 PERP -990499 sc-eQTL 1.87e-01 -0.121 0.0915 0.081 CD4T L1
ENSG00000118503 TNFAIP3 -750294 sc-eQTL 2.37e-01 -0.102 0.0858 0.081 CD4T L1
ENSG00000197442 MAP3K5 324443 sc-eQTL 4.46e-01 0.05 0.0655 0.081 CD4T L1
ENSG00000237499 WAKMAR2 -751313 sc-eQTL 4.42e-01 0.0834 0.108 0.081 CD4T L1
ENSG00000027697 IFNGR1 -102529 sc-eQTL 4.84e-01 0.0682 0.0974 0.081 CD8T L1
ENSG00000029363 BCLAF1 827069 sc-eQTL 2.99e-01 -0.0685 0.0658 0.081 CD8T L1
ENSG00000112357 PEX7 294356 sc-eQTL 2.62e-01 0.182 0.162 0.081 CD8T L1
ENSG00000112378 PERP -990499 sc-eQTL 6.29e-01 0.0514 0.106 0.081 CD8T L1
ENSG00000118503 TNFAIP3 -750294 sc-eQTL 2.77e-01 -0.0892 0.0818 0.081 CD8T L1
ENSG00000197442 MAP3K5 324443 sc-eQTL 5.34e-01 0.0539 0.0866 0.081 CD8T L1
ENSG00000237499 WAKMAR2 -751313 sc-eQTL 9.10e-01 0.0136 0.12 0.081 CD8T L1
ENSG00000027697 IFNGR1 -102529 sc-eQTL 5.59e-01 0.0707 0.121 0.083 DC L1
ENSG00000029363 BCLAF1 827069 sc-eQTL 9.04e-01 -0.0131 0.109 0.083 DC L1
ENSG00000112357 PEX7 294356 sc-eQTL 9.09e-01 -0.0195 0.17 0.083 DC L1
ENSG00000118503 TNFAIP3 -750294 sc-eQTL 6.29e-01 -0.0625 0.129 0.083 DC L1
ENSG00000135525 MAP7 566101 sc-eQTL 7.98e-01 -0.0358 0.14 0.083 DC L1
ENSG00000197442 MAP3K5 324443 sc-eQTL 8.98e-01 -0.0172 0.134 0.083 DC L1
ENSG00000237499 WAKMAR2 -751313 sc-eQTL 1.67e-01 -0.181 0.131 0.083 DC L1
ENSG00000286646 AL121933.2 332875 sc-eQTL 1.83e-01 -0.233 0.174 0.083 DC L1
ENSG00000027697 IFNGR1 -102529 sc-eQTL 9.07e-01 0.0116 0.0985 0.081 Mono L1
ENSG00000029363 BCLAF1 827069 sc-eQTL 3.73e-02 -0.175 0.0834 0.081 Mono L1
ENSG00000112357 PEX7 294356 sc-eQTL 5.71e-01 -0.094 0.166 0.081 Mono L1
ENSG00000118503 TNFAIP3 -750294 sc-eQTL 8.23e-01 0.0187 0.0836 0.081 Mono L1
ENSG00000135525 MAP7 566101 sc-eQTL 2.04e-01 -0.186 0.146 0.081 Mono L1
ENSG00000197442 MAP3K5 324443 sc-eQTL 2.46e-01 -0.113 0.0972 0.081 Mono L1
ENSG00000237499 WAKMAR2 -751313 sc-eQTL 8.65e-01 -0.0176 0.104 0.081 Mono L1
ENSG00000286646 AL121933.2 332875 sc-eQTL 1.86e-01 -0.156 0.118 0.081 Mono L1
ENSG00000027697 IFNGR1 -102529 sc-eQTL 8.35e-01 -0.0224 0.108 0.082 NK L1
ENSG00000029363 BCLAF1 827069 sc-eQTL 1.44e-01 -0.0832 0.0568 0.082 NK L1
ENSG00000112357 PEX7 294356 sc-eQTL 2.79e-01 0.179 0.165 0.082 NK L1
ENSG00000112378 PERP -990499 sc-eQTL 4.32e-01 -0.0823 0.104 0.082 NK L1
ENSG00000118503 TNFAIP3 -750294 sc-eQTL 4.61e-01 -0.066 0.0894 0.082 NK L1
ENSG00000197442 MAP3K5 324443 sc-eQTL 2.61e-03 0.382 0.125 0.082 NK L1
ENSG00000237499 WAKMAR2 -751313 sc-eQTL 3.49e-01 0.119 0.127 0.082 NK L1
ENSG00000027697 IFNGR1 -102529 sc-eQTL 7.71e-01 -0.0294 0.101 0.081 Other_T L1
ENSG00000029363 BCLAF1 827069 sc-eQTL 7.36e-01 0.0287 0.0849 0.081 Other_T L1
ENSG00000112357 PEX7 294356 sc-eQTL 6.32e-01 0.079 0.165 0.081 Other_T L1
ENSG00000112378 PERP -990499 sc-eQTL 2.49e-01 -0.153 0.132 0.081 Other_T L1
ENSG00000118503 TNFAIP3 -750294 sc-eQTL 5.34e-01 -0.0392 0.063 0.081 Other_T L1
ENSG00000146410 MTFR2 866585 sc-eQTL 6.98e-01 -0.037 0.0954 0.081 Other_T L1
ENSG00000197442 MAP3K5 324443 sc-eQTL 6.11e-02 0.227 0.121 0.081 Other_T L1
ENSG00000237499 WAKMAR2 -751313 sc-eQTL 5.28e-01 0.079 0.125 0.081 Other_T L1
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000027697 IFNGR1 -102529 sc-eQTL 6.33e-01 0.0813 0.17 0.084 B_Activated L2
ENSG00000029363 BCLAF1 827069 sc-eQTL 5.32e-01 -0.0865 0.138 0.084 B_Activated L2
ENSG00000112357 PEX7 294356 sc-eQTL 9.68e-01 0.00663 0.167 0.084 B_Activated L2
ENSG00000112378 PERP -990499 sc-eQTL 8.85e-01 -0.0126 0.0866 0.084 B_Activated L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 -750294 sc-eQTL 1.55e-01 0.239 0.167 0.084 B_Activated L2
ENSG00000197442 MAP3K5 324443 sc-eQTL 6.40e-01 -0.0881 0.188 0.084 B_Activated L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 -751313 sc-eQTL 8.25e-01 -0.0325 0.147 0.084 B_Activated L2
ENSG00000027697 IFNGR1 -102529 sc-eQTL 6.65e-02 0.273 0.148 0.082 B_Intermediate L2
ENSG00000029363 BCLAF1 827069 sc-eQTL 4.06e-01 0.0704 0.0846 0.082 B_Intermediate L2
ENSG00000112357 PEX7 294356 sc-eQTL 9.69e-01 0.00615 0.156 0.082 B_Intermediate L2
ENSG00000112378 PERP -990499 sc-eQTL 1.16e-01 -0.223 0.141 0.082 B_Intermediate L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 -750294 sc-eQTL 9.95e-01 0.000647 0.112 0.082 B_Intermediate L2
ENSG00000197442 MAP3K5 324443 sc-eQTL 2.20e-01 0.165 0.134 0.082 B_Intermediate L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 -751313 sc-eQTL 1.27e-01 -0.241 0.157 0.082 B_Intermediate L2
ENSG00000027697 IFNGR1 -102529 sc-eQTL 5.40e-01 0.099 0.161 0.082 B_Memory L2
ENSG00000029363 BCLAF1 827069 sc-eQTL 2.17e-01 0.118 0.0954 0.082 B_Memory L2
ENSG00000112357 PEX7 294356 sc-eQTL 7.69e-01 -0.0479 0.163 0.082 B_Memory L2
ENSG00000112378 PERP -990499 sc-eQTL 8.90e-01 -0.0211 0.153 0.082 B_Memory L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 -750294 sc-eQTL 6.93e-01 0.0417 0.105 0.082 B_Memory L2
ENSG00000197442 MAP3K5 324443 sc-eQTL 9.45e-01 0.00994 0.144 0.082 B_Memory L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 -751313 sc-eQTL 8.48e-01 0.0301 0.157 0.082 B_Memory L2
ENSG00000027697 IFNGR1 -102529 sc-eQTL 9.03e-01 0.0162 0.133 0.081 B_Naive1 L2
ENSG00000029363 BCLAF1 827069 sc-eQTL 9.89e-01 -0.00106 0.0758 0.081 B_Naive1 L2
ENSG00000112357 PEX7 294356 sc-eQTL 8.07e-01 0.0428 0.175 0.081 B_Naive1 L2
ENSG00000112378 PERP -990499 sc-eQTL 6.45e-01 0.0705 0.153 0.081 B_Naive1 L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 -750294 sc-eQTL 8.77e-01 -0.0138 0.0887 0.081 B_Naive1 L2
ENSG00000197442 MAP3K5 324443 sc-eQTL 3.55e-02 0.261 0.123 0.081 B_Naive1 L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 -751313 sc-eQTL 9.52e-01 -0.00831 0.139 0.081 B_Naive1 L2
ENSG00000027697 IFNGR1 -102529 sc-eQTL 6.99e-02 0.279 0.153 0.082 B_Naive2 L2
ENSG00000029363 BCLAF1 827069 sc-eQTL 5.72e-01 0.0505 0.0893 0.082 B_Naive2 L2
ENSG00000112357 PEX7 294356 sc-eQTL 9.07e-01 -0.0198 0.169 0.082 B_Naive2 L2
ENSG00000112378 PERP -990499 sc-eQTL 8.95e-01 -0.0163 0.123 0.082 B_Naive2 L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 -750294 sc-eQTL 5.54e-01 -0.0728 0.123 0.082 B_Naive2 L2
ENSG00000197442 MAP3K5 324443 sc-eQTL 5.26e-01 0.0829 0.131 0.082 B_Naive2 L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 -751313 sc-eQTL 4.37e-01 0.124 0.159 0.082 B_Naive2 L2
ENSG00000027697 IFNGR1 -102529 sc-eQTL 2.11e-01 0.179 0.143 0.086 CD4_CTL L2
ENSG00000029363 BCLAF1 827069 sc-eQTL 2.18e-01 0.156 0.127 0.086 CD4_CTL L2
ENSG00000112357 PEX7 294356 sc-eQTL 1.82e-01 -0.212 0.158 0.086 CD4_CTL L2
ENSG00000112378 PERP -990499 sc-eQTL 5.88e-02 -0.303 0.16 0.086 CD4_CTL L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 -750294 sc-eQTL 8.65e-01 0.016 0.0939 0.086 CD4_CTL L2
ENSG00000197442 MAP3K5 324443 sc-eQTL 8.51e-01 0.0282 0.15 0.086 CD4_CTL L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 -751313 sc-eQTL 9.24e-01 -0.014 0.146 0.086 CD4_CTL L2
ENSG00000027697 IFNGR1 -102529 sc-eQTL 5.97e-01 -0.0427 0.0806 0.081 CD4_Naive L2
ENSG00000029363 BCLAF1 827069 sc-eQTL 3.53e-01 -0.0602 0.0646 0.081 CD4_Naive L2
ENSG00000112357 PEX7 294356 sc-eQTL 9.98e-01 -0.000465 0.152 0.081 CD4_Naive L2
ENSG00000112378 PERP -990499 sc-eQTL 9.30e-01 0.0111 0.126 0.081 CD4_Naive L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 -750294 sc-eQTL 4.19e-01 -0.0713 0.0881 0.081 CD4_Naive L2
ENSG00000197442 MAP3K5 324443 sc-eQTL 8.02e-01 0.0163 0.0648 0.081 CD4_Naive L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 -751313 sc-eQTL 5.28e-01 0.0721 0.114 0.081 CD4_Naive L2
ENSG00000027697 IFNGR1 -102529 sc-eQTL 6.61e-01 0.0492 0.112 0.081 CD4_TCM L2
ENSG00000029363 BCLAF1 827069 sc-eQTL 3.22e-01 -0.07 0.0705 0.081 CD4_TCM L2
ENSG00000112357 PEX7 294356 sc-eQTL 7.52e-01 -0.052 0.164 0.081 CD4_TCM L2
ENSG00000112378 PERP -990499 sc-eQTL 4.98e-01 0.0943 0.139 0.081 CD4_TCM L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 -750294 sc-eQTL 3.42e-01 -0.0766 0.0805 0.081 CD4_TCM L2
ENSG00000197442 MAP3K5 324443 sc-eQTL 2.76e-01 0.1 0.0916 0.081 CD4_TCM L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 -751313 sc-eQTL 6.08e-01 0.058 0.113 0.081 CD4_TCM L2
ENSG00000027697 IFNGR1 -102529 sc-eQTL 4.07e-01 -0.106 0.128 0.081 CD4_TEM L2
ENSG00000029363 BCLAF1 827069 sc-eQTL 8.45e-01 -0.0179 0.0911 0.081 CD4_TEM L2
ENSG00000112357 PEX7 294356 sc-eQTL 7.65e-01 0.0497 0.166 0.081 CD4_TEM L2
ENSG00000112378 PERP -990499 sc-eQTL 2.19e-01 -0.165 0.134 0.081 CD4_TEM L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 -750294 sc-eQTL 6.92e-01 -0.0338 0.0853 0.081 CD4_TEM L2
ENSG00000197442 MAP3K5 324443 sc-eQTL 2.91e-01 0.139 0.131 0.081 CD4_TEM L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 -751313 sc-eQTL 4.72e-01 0.0985 0.137 0.081 CD4_TEM L2
ENSG00000027697 IFNGR1 -102529 sc-eQTL 2.44e-01 0.135 0.116 0.081 CD8_CTL L2
ENSG00000029363 BCLAF1 827069 sc-eQTL 9.81e-01 -0.00179 0.0773 0.081 CD8_CTL L2
ENSG00000112357 PEX7 294356 sc-eQTL 6.51e-01 0.0722 0.159 0.081 CD8_CTL L2
ENSG00000112378 PERP -990499 sc-eQTL 9.53e-01 0.00907 0.153 0.081 CD8_CTL L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 -750294 sc-eQTL 6.94e-01 -0.0384 0.0975 0.081 CD8_CTL L2
ENSG00000197442 MAP3K5 324443 sc-eQTL 9.32e-01 0.0117 0.138 0.081 CD8_CTL L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 -751313 sc-eQTL 8.95e-01 -0.018 0.137 0.081 CD8_CTL L2
ENSG00000027697 IFNGR1 -102529 sc-eQTL 3.81e-01 -0.0998 0.114 0.081 CD8_Naive L2
ENSG00000029363 BCLAF1 827069 sc-eQTL 3.74e-01 -0.0708 0.0794 0.081 CD8_Naive L2
ENSG00000112357 PEX7 294356 sc-eQTL 4.62e-01 0.122 0.165 0.081 CD8_Naive L2
ENSG00000112378 PERP -990499 sc-eQTL 3.55e-01 0.116 0.125 0.081 CD8_Naive L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 -750294 sc-eQTL 6.72e-01 -0.0378 0.0891 0.081 CD8_Naive L2
ENSG00000197442 MAP3K5 324443 sc-eQTL 8.96e-01 0.0138 0.106 0.081 CD8_Naive L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 -751313 sc-eQTL 8.04e-01 -0.0327 0.132 0.081 CD8_Naive L2
ENSG00000027697 IFNGR1 -102529 sc-eQTL 6.83e-01 -0.0636 0.156 0.081 CD8_TCM L2
ENSG00000029363 BCLAF1 827069 sc-eQTL 1.77e-01 0.158 0.116 0.081 CD8_TCM L2
ENSG00000112357 PEX7 294356 sc-eQTL 6.07e-01 0.092 0.179 0.081 CD8_TCM L2
ENSG00000112378 PERP -990499 sc-eQTL 4.32e-02 -0.353 0.173 0.081 CD8_TCM L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 -750294 sc-eQTL 6.65e-01 0.0366 0.0844 0.081 CD8_TCM L2
ENSG00000197442 MAP3K5 324443 sc-eQTL 1.32e-01 0.227 0.15 0.081 CD8_TCM L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 -751313 sc-eQTL 8.03e-01 0.0385 0.154 0.081 CD8_TCM L2
ENSG00000027697 IFNGR1 -102529 sc-eQTL 8.57e-01 0.026 0.144 0.084 CD8_TEM L2
ENSG00000029363 BCLAF1 827069 sc-eQTL 3.34e-02 0.288 0.135 0.084 CD8_TEM L2
ENSG00000112357 PEX7 294356 sc-eQTL 3.42e-01 0.158 0.166 0.084 CD8_TEM L2
ENSG00000112378 PERP -990499 sc-eQTL 4.15e-01 0.141 0.172 0.084 CD8_TEM L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 -750294 sc-eQTL 6.69e-01 0.0456 0.106 0.084 CD8_TEM L2
ENSG00000197442 MAP3K5 324443 sc-eQTL 9.38e-02 0.275 0.163 0.084 CD8_TEM L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 -751313 sc-eQTL 4.51e-01 0.119 0.158 0.084 CD8_TEM L2
ENSG00000027697 IFNGR1 -102529 sc-eQTL 5.04e-01 0.0769 0.115 0.082 MAIT L2
ENSG00000029363 BCLAF1 827069 sc-eQTL 5.25e-01 -0.0608 0.0954 0.082 MAIT L2
ENSG00000112357 PEX7 294356 sc-eQTL 8.51e-01 -0.0293 0.156 0.082 MAIT L2
ENSG00000112378 PERP -990499 sc-eQTL 1.73e-01 -0.221 0.162 0.082 MAIT L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 -750294 sc-eQTL 8.40e-01 -0.0156 0.0773 0.082 MAIT L2
ENSG00000146410 MTFR2 866585 sc-eQTL 4.43e-01 -0.099 0.129 0.082 MAIT L2
ENSG00000197442 MAP3K5 324443 sc-eQTL 7.16e-01 0.049 0.135 0.082 MAIT L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 -751313 sc-eQTL 4.46e-01 0.109 0.143 0.082 MAIT L2
ENSG00000027697 IFNGR1 -102529 sc-eQTL 8.57e-01 0.0237 0.131 0.08 NK_CD56bright L2
ENSG00000029363 BCLAF1 827069 sc-eQTL 6.61e-01 0.0425 0.0968 0.08 NK_CD56bright L2
ENSG00000112357 PEX7 294356 sc-eQTL 8.23e-01 0.0382 0.171 0.08 NK_CD56bright L2
ENSG00000112378 PERP -990499 sc-eQTL 3.69e-01 -0.138 0.153 0.08 NK_CD56bright L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 -750294 sc-eQTL 2.26e-01 0.118 0.0974 0.08 NK_CD56bright L2
ENSG00000197442 MAP3K5 324443 sc-eQTL 3.28e-01 0.145 0.148 0.08 NK_CD56bright L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 -751313 sc-eQTL 1.40e-01 0.23 0.155 0.08 NK_CD56bright L2
ENSG00000027697 IFNGR1 -102529 sc-eQTL 8.75e-01 -0.0157 0.0996 0.082 NK_CD56dim L2
ENSG00000029363 BCLAF1 827069 sc-eQTL 5.43e-01 -0.0396 0.065 0.082 NK_CD56dim L2
ENSG00000112357 PEX7 294356 sc-eQTL 4.12e-01 0.141 0.171 0.082 NK_CD56dim L2
ENSG00000112378 PERP -990499 sc-eQTL 2.67e-01 -0.134 0.12 0.082 NK_CD56dim L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 -750294 sc-eQTL 2.36e-01 -0.111 0.0934 0.082 NK_CD56dim L2
ENSG00000197442 MAP3K5 324443 sc-eQTL 2.27e-02 0.306 0.133 0.082 NK_CD56dim L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 -751313 sc-eQTL 8.44e-01 0.0277 0.14 0.082 NK_CD56dim L2
ENSG00000027697 IFNGR1 -102529 sc-eQTL 8.64e-01 -0.0223 0.13 0.08 NK_HLA L2
ENSG00000029363 BCLAF1 827069 sc-eQTL 4.88e-01 -0.0765 0.11 0.08 NK_HLA L2
ENSG00000112357 PEX7 294356 sc-eQTL 7.27e-01 0.0578 0.165 0.08 NK_HLA L2
ENSG00000112378 PERP -990499 sc-eQTL 2.70e-01 -0.148 0.134 0.08 NK_HLA L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 -750294 sc-eQTL 6.23e-01 0.0508 0.103 0.08 NK_HLA L2
ENSG00000197442 MAP3K5 324443 sc-eQTL 3.30e-02 0.348 0.162 0.08 NK_HLA L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 -751313 sc-eQTL 5.40e-03 0.459 0.163 0.08 NK_HLA L2
ENSG00000027697 IFNGR1 -102529 sc-eQTL 7.22e-01 0.0372 0.104 0.082 NK_cytokine L2
ENSG00000029363 BCLAF1 827069 sc-eQTL 1.27e-01 -0.119 0.0775 0.082 NK_cytokine L2
ENSG00000112357 PEX7 294356 sc-eQTL 4.30e-01 -0.129 0.164 0.082 NK_cytokine L2
ENSG00000112378 PERP -990499 sc-eQTL 8.77e-01 -0.0193 0.124 0.082 NK_cytokine L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 -750294 sc-eQTL 9.96e-01 0.000501 0.0932 0.082 NK_cytokine L2
ENSG00000197442 MAP3K5 324443 sc-eQTL 1.76e-02 0.302 0.126 0.082 NK_cytokine L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 -751313 sc-eQTL 5.71e-01 0.0797 0.14 0.082 NK_cytokine L2
ENSG00000027697 IFNGR1 -102529 sc-eQTL 8.52e-01 0.0391 0.209 0.078 PB L2
ENSG00000029363 BCLAF1 827069 sc-eQTL 2.41e-01 0.211 0.18 0.078 PB L2
ENSG00000112357 PEX7 294356 sc-eQTL 5.93e-01 0.115 0.215 0.078 PB L2
ENSG00000112378 PERP -990499 sc-eQTL 8.94e-01 0.018 0.134 0.078 PB L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 -750294 sc-eQTL 4.96e-01 -0.111 0.162 0.078 PB L2
ENSG00000197442 MAP3K5 324443 sc-eQTL 4.19e-01 0.15 0.185 0.078 PB L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 -751313 sc-eQTL 9.07e-01 0.0228 0.196 0.078 PB L2
ENSG00000027697 IFNGR1 -102529 sc-eQTL 5.52e-02 -0.266 0.138 0.078 Pro_T L2
ENSG00000029363 BCLAF1 827069 sc-eQTL 1.31e-01 0.218 0.144 0.078 Pro_T L2
ENSG00000112357 PEX7 294356 sc-eQTL 3.22e-01 0.168 0.169 0.078 Pro_T L2
ENSG00000112378 PERP -990499 sc-eQTL 7.35e-01 -0.0456 0.134 0.078 Pro_T L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 -750294 sc-eQTL 1.34e-01 -0.127 0.0844 0.078 Pro_T L2
ENSG00000146410 MTFR2 866585 sc-eQTL 3.17e-01 0.118 0.117 0.078 Pro_T L2
ENSG00000197442 MAP3K5 324443 sc-eQTL 5.10e-02 0.319 0.163 0.078 Pro_T L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 -751313 sc-eQTL 6.40e-02 -0.304 0.163 0.078 Pro_T L2
ENSG00000027697 IFNGR1 -102529 sc-eQTL 5.61e-01 0.0876 0.151 0.081 Treg L2
ENSG00000029363 BCLAF1 827069 sc-eQTL 3.12e-01 -0.0985 0.0971 0.081 Treg L2
ENSG00000112357 PEX7 294356 sc-eQTL 3.24e-01 0.157 0.159 0.081 Treg L2
ENSG00000112378 PERP -990499 sc-eQTL 7.12e-02 -0.31 0.171 0.081 Treg L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 -750294 sc-eQTL 3.65e-01 -0.0868 0.0956 0.081 Treg L2
ENSG00000197442 MAP3K5 324443 sc-eQTL 8.92e-01 0.0141 0.104 0.081 Treg L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 -751313 sc-eQTL 3.26e-02 0.311 0.145 0.081 Treg L2
ENSG00000027697 IFNGR1 -102529 sc-eQTL 2.77e-01 0.143 0.131 0.083 cDC L2
ENSG00000029363 BCLAF1 827069 sc-eQTL 8.95e-01 0.0176 0.132 0.083 cDC L2
ENSG00000112357 PEX7 294356 sc-eQTL 5.37e-01 -0.105 0.17 0.083 cDC L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 -750294 sc-eQTL 5.68e-01 -0.074 0.129 0.083 cDC L2
ENSG00000135525 MAP7 566101 sc-eQTL 8.05e-01 0.0374 0.151 0.083 cDC L2
ENSG00000197442 MAP3K5 324443 sc-eQTL 6.61e-01 -0.0585 0.133 0.083 cDC L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 -751313 sc-eQTL 4.05e-01 -0.14 0.168 0.083 cDC L2
ENSG00000286646 AL121933.2 332875 sc-eQTL 1.25e-01 -0.266 0.172 0.083 cDC L2
ENSG00000027697 IFNGR1 -102529 sc-eQTL 7.12e-01 -0.0342 0.0924 0.081 cMono_IL1B L2
ENSG00000029363 BCLAF1 827069 sc-eQTL 4.22e-02 -0.201 0.0981 0.081 cMono_IL1B L2
ENSG00000112357 PEX7 294356 sc-eQTL 2.13e-01 -0.207 0.166 0.081 cMono_IL1B L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 -750294 sc-eQTL 8.68e-01 -0.0166 0.0995 0.081 cMono_IL1B L2
ENSG00000135525 MAP7 566101 sc-eQTL 4.91e-02 -0.281 0.142 0.081 cMono_IL1B L2
ENSG00000197442 MAP3K5 324443 sc-eQTL 9.18e-01 -0.0107 0.103 0.081 cMono_IL1B L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 -751313 sc-eQTL 7.65e-01 -0.0318 0.106 0.081 cMono_IL1B L2
ENSG00000286646 AL121933.2 332875 sc-eQTL 3.31e-01 -0.129 0.133 0.081 cMono_IL1B L2
ENSG00000027697 IFNGR1 -102529 sc-eQTL 9.13e-01 -0.0117 0.107 0.081 cMono_S100A L2
ENSG00000029363 BCLAF1 827069 sc-eQTL 1.84e-01 -0.146 0.11 0.081 cMono_S100A L2
ENSG00000112357 PEX7 294356 sc-eQTL 7.42e-01 0.0567 0.172 0.081 cMono_S100A L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 -750294 sc-eQTL 1.95e-01 -0.123 0.0948 0.081 cMono_S100A L2
ENSG00000135525 MAP7 566101 sc-eQTL 1.71e-01 -0.219 0.16 0.081 cMono_S100A L2
ENSG00000197442 MAP3K5 324443 sc-eQTL 1.42e-02 -0.315 0.128 0.081 cMono_S100A L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 -751313 sc-eQTL 9.26e-01 -0.0127 0.137 0.081 cMono_S100A L2
ENSG00000286646 AL121933.2 332875 sc-eQTL 2.73e-01 -0.146 0.133 0.081 cMono_S100A L2
ENSG00000027697 IFNGR1 -102529 sc-eQTL 7.98e-01 0.0373 0.145 0.091 gdT L2
ENSG00000029363 BCLAF1 827069 sc-eQTL 7.79e-01 0.036 0.128 0.091 gdT L2
ENSG00000112357 PEX7 294356 sc-eQTL 9.36e-01 0.0149 0.184 0.091 gdT L2
ENSG00000112378 PERP -990499 sc-eQTL 3.44e-01 -0.152 0.16 0.091 gdT L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 -750294 sc-eQTL 3.33e-01 -0.0865 0.089 0.091 gdT L2
ENSG00000146410 MTFR2 866585 sc-eQTL 8.34e-01 -0.0296 0.141 0.091 gdT L2
ENSG00000197442 MAP3K5 324443 sc-eQTL 9.44e-02 0.315 0.187 0.091 gdT L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 -751313 sc-eQTL 6.83e-01 0.0661 0.162 0.091 gdT L2
ENSG00000027697 IFNGR1 -102529 sc-eQTL 3.22e-01 -0.117 0.118 0.08 intMono L2
ENSG00000029363 BCLAF1 827069 sc-eQTL 7.16e-01 -0.0568 0.156 0.08 intMono L2
ENSG00000112357 PEX7 294356 sc-eQTL 7.03e-01 0.0608 0.159 0.08 intMono L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 -750294 sc-eQTL 1.17e-01 -0.16 0.102 0.08 intMono L2
ENSG00000135525 MAP7 566101 sc-eQTL 7.06e-01 -0.0593 0.157 0.08 intMono L2
ENSG00000197442 MAP3K5 324443 sc-eQTL 6.22e-01 0.082 0.166 0.08 intMono L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 -751313 sc-eQTL 3.01e-01 -0.157 0.152 0.08 intMono L2
ENSG00000286646 AL121933.2 332875 sc-eQTL 9.97e-01 0.000566 0.176 0.08 intMono L2
ENSG00000027697 IFNGR1 -102529 sc-eQTL 9.13e-01 0.0146 0.134 0.077 ncMono L2
ENSG00000029363 BCLAF1 827069 sc-eQTL 7.42e-01 -0.0344 0.104 0.077 ncMono L2
ENSG00000112357 PEX7 294356 sc-eQTL 6.04e-01 0.0864 0.166 0.077 ncMono L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 -750294 sc-eQTL 4.71e-02 -0.235 0.118 0.077 ncMono L2
ENSG00000135525 MAP7 566101 sc-eQTL 2.10e-01 0.184 0.146 0.077 ncMono L2
ENSG00000197442 MAP3K5 324443 sc-eQTL 2.32e-01 -0.185 0.154 0.077 ncMono L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 -751313 sc-eQTL 8.97e-01 0.0192 0.149 0.077 ncMono L2
ENSG00000286646 AL121933.2 332875 sc-eQTL 5.56e-01 0.0923 0.157 0.077 ncMono L2
ENSG00000027697 IFNGR1 -102529 sc-eQTL 1.69e-01 0.237 0.172 0.071 pDC L2
ENSG00000029363 BCLAF1 827069 sc-eQTL 3.82e-01 -0.113 0.129 0.071 pDC L2
ENSG00000112357 PEX7 294356 sc-eQTL 9.99e-01 -0.00016 0.19 0.071 pDC L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 -750294 sc-eQTL 6.52e-01 -0.0723 0.16 0.071 pDC L2
ENSG00000135525 MAP7 566101 sc-eQTL 8.25e-01 0.0294 0.133 0.071 pDC L2
ENSG00000197442 MAP3K5 324443 sc-eQTL 3.33e-01 -0.206 0.212 0.071 pDC L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 -751313 sc-eQTL 6.47e-01 0.0744 0.162 0.071 pDC L2
ENSG00000286646 AL121933.2 332875 sc-eQTL 5.86e-01 -0.107 0.196 0.071 pDC L2
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000027697 IFNGR1 -102529 sc-eQTL 3.72e-01 0.119 0.134 0.081 B_Memory LOneK1K
ENSG00000029363 BCLAF1 827069 sc-eQTL 5.17e-01 0.0487 0.075 0.081 B_Memory LOneK1K
ENSG00000112357 PEX7 294356 sc-eQTL 2.29e-01 -0.185 0.153 0.081 B_Memory LOneK1K
ENSG00000112378 PERP -990499 sc-eQTL 9.07e-01 -0.0167 0.143 0.081 B_Memory LOneK1K
ENSG00000118503 TNFAIP3 -750294 sc-eQTL 9.58e-01 -0.00498 0.0944 0.081 B_Memory LOneK1K
ENSG00000197442 MAP3K5 324443 sc-eQTL 3.49e-01 0.117 0.125 0.081 B_Memory LOneK1K
ENSG00000237499 WAKMAR2 -751313 sc-eQTL 3.67e-01 -0.144 0.159 0.081 B_Memory LOneK1K
ENSG00000027697 IFNGR1 -102529 sc-eQTL 2.45e-01 0.157 0.134 0.081 B_Naive LOneK1K
ENSG00000029363 BCLAF1 827069 sc-eQTL 7.39e-01 0.0207 0.062 0.081 B_Naive LOneK1K
ENSG00000112357 PEX7 294356 sc-eQTL 9.03e-01 -0.0201 0.164 0.081 B_Naive LOneK1K
ENSG00000112378 PERP -990499 sc-eQTL 7.65e-01 0.0439 0.147 0.081 B_Naive LOneK1K
ENSG00000118503 TNFAIP3 -750294 sc-eQTL 9.63e-01 -0.00359 0.0772 0.081 B_Naive LOneK1K
ENSG00000197442 MAP3K5 324443 sc-eQTL 1.21e-02 0.282 0.112 0.081 B_Naive LOneK1K
ENSG00000237499 WAKMAR2 -751313 sc-eQTL 5.27e-01 0.0872 0.137 0.081 B_Naive LOneK1K
ENSG00000027697 IFNGR1 -102529 sc-eQTL 8.48e-01 -0.0177 0.0926 0.081 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000029363 BCLAF1 827069 sc-eQTL 3.52e-02 -0.181 0.0853 0.081 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000112357 PEX7 294356 sc-eQTL 3.31e-01 -0.162 0.166 0.081 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000118503 TNFAIP3 -750294 sc-eQTL 8.66e-01 -0.0145 0.0857 0.081 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000135525 MAP7 566101 sc-eQTL 4.89e-02 -0.292 0.147 0.081 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000197442 MAP3K5 324443 sc-eQTL 2.55e-01 -0.114 0.1 0.081 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000237499 WAKMAR2 -751313 sc-eQTL 8.22e-01 -0.0232 0.103 0.081 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000286646 AL121933.2 332875 sc-eQTL 1.22e-01 -0.184 0.119 0.081 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000027697 IFNGR1 -102529 sc-eQTL 5.28e-01 -0.0704 0.111 0.082 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000029363 BCLAF1 827069 sc-eQTL 2.65e-01 -0.112 0.1 0.082 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000112357 PEX7 294356 sc-eQTL 9.33e-01 0.0141 0.168 0.082 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000118503 TNFAIP3 -750294 sc-eQTL 2.08e-01 -0.131 0.104 0.082 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000135525 MAP7 566101 sc-eQTL 2.78e-01 0.176 0.162 0.082 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000197442 MAP3K5 324443 sc-eQTL 6.01e-01 -0.0698 0.133 0.082 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000237499 WAKMAR2 -751313 sc-eQTL 9.11e-01 0.0157 0.14 0.082 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000286646 AL121933.2 332875 sc-eQTL 6.65e-01 0.0687 0.158 0.082 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000027697 IFNGR1 -102529 sc-eQTL 9.82e-01 -0.0023 0.102 0.082 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000029363 BCLAF1 827069 sc-eQTL 1.43e-01 -0.0865 0.0588 0.082 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000112357 PEX7 294356 sc-eQTL 5.30e-01 0.108 0.172 0.082 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000112378 PERP -990499 sc-eQTL 5.32e-01 -0.0666 0.106 0.082 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000118503 TNFAIP3 -750294 sc-eQTL 4.08e-01 -0.0768 0.0927 0.082 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000197442 MAP3K5 324443 sc-eQTL 3.98e-03 0.358 0.123 0.082 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000237499 WAKMAR2 -751313 sc-eQTL 4.12e-01 0.107 0.13 0.082 NK_CD56dim LOneK1K

Statistical fine-mapping results from Japan COVID-19 Task Force
(Shown only for PIP>0.001)
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
PIP (SuSiE)
PIP (FINEMAP)
MAF
ENSG00000027697 IFNGR1 -102529 eQTL 0.000152 -0.0789 0.0208 0.0 0.0 0.105
ENSG00000182747 SLC35D3 194619 eQTL 0.0342 -0.102 0.0481 0.0 0.0 0.105
ENSG00000197442 MAP3K5 324443 eQTL 0.0338 0.0403 0.019 0.0 0.0 0.105

Expression Modifier Score(EMS) for GTEx 49tissues
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Whole Blood
Muscle Skeletal
Liver
Brain Cerebellum
Prostate
Spleen
Skin Sun Exposed Lower leg
Artery Coronary
Esophagus Muscularis
Esophagus Gastroesophageal Junction
Artery Tibial
Heart Atrial Appendage
Nerve Tibial
Heart Left Ventricle
Adrenal Gland
Adipose Visceral Omentum
Pancreas
Lung
Pituitary
Brain Nucleus accumbens basal ganglia
Colon Transverse
Adipose Subcutaneous
Esophagus Mucosa
Brain Cortex
Thyroid
Stomach
Breast Mammary Tissue
Colon Sigmoid
Skin Not Sun Exposed Suprapubic
Testis
Artery Aorta
Brain Amygdala
Brain Anterior cingulate cortex BA24
Brain Caudate basal ganglia
Brain Cerebellar Hemisphere
Brain Frontal Cortex BA9
Brain Hippocampus
Brain Hypothalamus
Brain Putamen basal ganglia
Brain Spinal cord cervical c-1
Brain Substantia nigra
Cells Cultured fibroblasts
Cells EBV-transformed lymphocytes
Kidney Cortex
Minor Salivary Gland
Ovary
Small Intestine Terminal Ileum
Uterus
Vagina
ENSG00000027697 IFNGR1 -102529 4.41e-06 6.3e-06 5.55e-07 3.52e-06 7.58e-07 8e-07 3.33e-06 7.56e-07 5.06e-06 1.47e-06 4.22e-06 3.45e-06 7.05e-06 1.91e-06 1.31e-06 1.52e-06 2.06e-06 2.75e-06 1.45e-06 1.16e-06 1.16e-06 3.49e-06 3.3e-06 1.64e-06 5.39e-06 1.09e-06 1.59e-06 1.69e-06 3.6e-06 3.08e-06 2.75e-06 2.87e-07 2.77e-07 1.31e-06 1.94e-06 9.66e-07 8.88e-07 4.5e-07 9.49e-07 3.74e-07 2.71e-07 5.47e-06 3.82e-07 1.44e-07 3.04e-07 4.02e-07 3.69e-07 1.71e-07 1.68e-07
ENSG00000112378 \N -990499 2.56e-07 1.08e-07 3.34e-08 1.7e-07 1.02e-07 9.05e-08 1.36e-07 5.24e-08 1.32e-07 3.99e-08 1.59e-07 7.6e-08 1.21e-07 6.07e-08 4.89e-08 7.76e-08 5.15e-08 1.06e-07 5.12e-08 2.85e-08 1.03e-07 1.31e-07 1.31e-07 5.19e-08 1.33e-07 1.09e-07 1.11e-07 8.49e-08 1.05e-07 1.09e-07 9.5e-08 3.41e-08 2.75e-08 8.26e-08 9.56e-08 4.26e-08 5.1e-08 9.2e-08 8.3e-08 3.69e-08 3.46e-08 1.4e-07 4.23e-08 1.23e-08 1.01e-07 1.74e-08 1.45e-07 4.82e-09 4.61e-08