Genes within 1Mb (chr1:55205223:G:C):

View on , UCSC , GTEx , gnomAD


Immune cell-type specific single cell cis-eQTLs in OASIS
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000006555 TTC22 403900 sc-eQTL 8.95e-01 0.024 0.181 0.053 B L1
ENSG00000116133 DHCR24 318028 sc-eQTL 7.99e-01 -0.0437 0.172 0.053 B L1
ENSG00000157216 SSBP3 791744 sc-eQTL 8.76e-01 0.0194 0.124 0.053 B L1
ENSG00000162402 USP24 -10141 sc-eQTL 8.00e-01 -0.0265 0.105 0.053 B L1
ENSG00000243725 TTC4 489362 sc-eQTL 2.75e-01 -0.191 0.175 0.053 B L1
ENSG00000006555 TTC22 403900 sc-eQTL 1.58e-01 0.198 0.14 0.053 CD4T L1
ENSG00000157216 SSBP3 791744 sc-eQTL 7.61e-01 -0.0375 0.123 0.053 CD4T L1
ENSG00000162402 USP24 -10141 sc-eQTL 2.33e-01 0.119 0.0998 0.053 CD4T L1
ENSG00000243725 TTC4 489362 sc-eQTL 8.61e-01 -0.0264 0.151 0.053 CD4T L1
ENSG00000006555 TTC22 403900 sc-eQTL 6.77e-01 0.0509 0.122 0.053 CD8T L1
ENSG00000157216 SSBP3 791744 sc-eQTL 4.89e-01 -0.0724 0.104 0.053 CD8T L1
ENSG00000162402 USP24 -10141 sc-eQTL 1.29e-01 -0.153 0.1 0.053 CD8T L1
ENSG00000243725 TTC4 489362 sc-eQTL 3.47e-01 0.165 0.175 0.053 CD8T L1
ENSG00000116133 DHCR24 318028 sc-eQTL 5.28e-01 0.1 0.159 0.056 DC L1
ENSG00000157216 SSBP3 791744 sc-eQTL 7.72e-01 -0.0485 0.168 0.056 DC L1
ENSG00000162390 ACOT11 662966 sc-eQTL 7.16e-01 -0.0588 0.161 0.056 DC L1
ENSG00000162402 USP24 -10141 sc-eQTL 6.78e-01 0.0405 0.0972 0.056 DC L1
ENSG00000243725 TTC4 489362 sc-eQTL 7.25e-01 0.0666 0.189 0.056 DC L1
ENSG00000116133 DHCR24 318028 sc-eQTL 5.44e-01 -0.0715 0.117 0.053 Mono L1
ENSG00000157216 SSBP3 791744 sc-eQTL 5.33e-01 0.113 0.18 0.053 Mono L1
ENSG00000162402 USP24 -10141 sc-eQTL 8.87e-01 -0.0153 0.108 0.053 Mono L1
ENSG00000243725 TTC4 489362 sc-eQTL 8.43e-01 0.0376 0.189 0.053 Mono L1
ENSG00000006555 TTC22 403900 sc-eQTL 4.63e-01 0.12 0.164 0.054 NK L1
ENSG00000116133 DHCR24 318028 sc-eQTL 2.55e-01 0.188 0.165 0.054 NK L1
ENSG00000157216 SSBP3 791744 sc-eQTL 6.02e-01 -0.0719 0.138 0.054 NK L1
ENSG00000162398 LEXM 399160 sc-eQTL 3.54e-01 0.143 0.154 0.054 NK L1
ENSG00000162402 USP24 -10141 sc-eQTL 2.11e-02 0.215 0.0925 0.054 NK L1
ENSG00000243725 TTC4 489362 sc-eQTL 7.09e-02 0.319 0.176 0.054 NK L1
ENSG00000006555 TTC22 403900 sc-eQTL 5.42e-01 -0.0885 0.145 0.053 Other_T L1
ENSG00000116133 DHCR24 318028 sc-eQTL 5.15e-01 0.0733 0.112 0.053 Other_T L1
ENSG00000157216 SSBP3 791744 sc-eQTL 2.88e-01 -0.133 0.125 0.053 Other_T L1
ENSG00000162402 USP24 -10141 sc-eQTL 7.51e-01 -0.0423 0.133 0.053 Other_T L1
ENSG00000243725 TTC4 489362 sc-eQTL 6.46e-01 -0.0835 0.182 0.053 Other_T L1
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000006555 TTC22 403900 sc-eQTL 9.36e-01 0.0124 0.155 0.056 B_Activated L2
ENSG00000116133 DHCR24 318028 sc-eQTL 4.56e-01 -0.135 0.181 0.056 B_Activated L2
ENSG00000157216 SSBP3 791744 sc-eQTL 4.66e-01 -0.148 0.202 0.056 B_Activated L2
ENSG00000162402 USP24 -10141 sc-eQTL 7.73e-01 0.057 0.198 0.056 B_Activated L2
ENSG00000243725 TTC4 489362 sc-eQTL 4.55e-01 0.141 0.189 0.056 B_Activated L2
ENSG00000006555 TTC22 403900 sc-eQTL 4.01e-01 0.162 0.192 0.054 B_Intermediate L2
ENSG00000116133 DHCR24 318028 sc-eQTL 8.44e-01 -0.0351 0.179 0.054 B_Intermediate L2
ENSG00000157216 SSBP3 791744 sc-eQTL 9.39e-01 -0.0127 0.167 0.054 B_Intermediate L2
ENSG00000162402 USP24 -10141 sc-eQTL 5.26e-01 -0.0894 0.141 0.054 B_Intermediate L2
ENSG00000243725 TTC4 489362 sc-eQTL 2.64e-01 -0.203 0.181 0.054 B_Intermediate L2
ENSG00000006555 TTC22 403900 sc-eQTL 3.11e-01 -0.184 0.181 0.054 B_Memory L2
ENSG00000116133 DHCR24 318028 sc-eQTL 9.73e-01 -0.00606 0.181 0.054 B_Memory L2
ENSG00000157216 SSBP3 791744 sc-eQTL 5.90e-01 0.0821 0.152 0.054 B_Memory L2
ENSG00000162402 USP24 -10141 sc-eQTL 6.01e-01 0.0779 0.149 0.054 B_Memory L2
ENSG00000243725 TTC4 489362 sc-eQTL 7.20e-01 0.0684 0.191 0.054 B_Memory L2
ENSG00000006555 TTC22 403900 sc-eQTL 4.48e-01 -0.147 0.193 0.053 B_Naive1 L2
ENSG00000116133 DHCR24 318028 sc-eQTL 8.74e-01 0.0288 0.181 0.053 B_Naive1 L2
ENSG00000157216 SSBP3 791744 sc-eQTL 2.71e-01 0.182 0.165 0.053 B_Naive1 L2
ENSG00000162402 USP24 -10141 sc-eQTL 4.46e-01 -0.099 0.13 0.053 B_Naive1 L2
ENSG00000243725 TTC4 489362 sc-eQTL 9.47e-01 -0.0118 0.177 0.053 B_Naive1 L2
ENSG00000006555 TTC22 403900 sc-eQTL 2.60e-01 0.221 0.195 0.054 B_Naive2 L2
ENSG00000116133 DHCR24 318028 sc-eQTL 1.50e-01 -0.245 0.17 0.054 B_Naive2 L2
ENSG00000157216 SSBP3 791744 sc-eQTL 5.40e-02 -0.347 0.179 0.054 B_Naive2 L2
ENSG00000162402 USP24 -10141 sc-eQTL 3.17e-01 0.143 0.143 0.054 B_Naive2 L2
ENSG00000243725 TTC4 489362 sc-eQTL 5.01e-01 -0.141 0.209 0.054 B_Naive2 L2
ENSG00000006555 TTC22 403900 sc-eQTL 3.27e-04 0.632 0.173 0.057 CD4_CTL L2
ENSG00000157216 SSBP3 791744 sc-eQTL 7.09e-01 0.0472 0.126 0.057 CD4_CTL L2
ENSG00000162402 USP24 -10141 sc-eQTL 2.22e-01 0.212 0.173 0.057 CD4_CTL L2
ENSG00000243725 TTC4 489362 sc-eQTL 6.09e-01 -0.0995 0.194 0.057 CD4_CTL L2
ENSG00000006555 TTC22 403900 sc-eQTL 3.14e-01 0.166 0.164 0.053 CD4_Naive L2
ENSG00000157216 SSBP3 791744 sc-eQTL 1.99e-01 -0.161 0.125 0.053 CD4_Naive L2
ENSG00000162402 USP24 -10141 sc-eQTL 2.88e-01 0.115 0.108 0.053 CD4_Naive L2
ENSG00000243725 TTC4 489362 sc-eQTL 7.34e-01 0.056 0.165 0.053 CD4_Naive L2
ENSG00000006555 TTC22 403900 sc-eQTL 5.65e-01 0.0999 0.173 0.053 CD4_TCM L2
ENSG00000157216 SSBP3 791744 sc-eQTL 1.02e-01 -0.256 0.156 0.053 CD4_TCM L2
ENSG00000162402 USP24 -10141 sc-eQTL 8.67e-02 0.222 0.129 0.053 CD4_TCM L2
ENSG00000243725 TTC4 489362 sc-eQTL 8.70e-01 0.0307 0.187 0.053 CD4_TCM L2
ENSG00000006555 TTC22 403900 sc-eQTL 9.71e-01 0.00732 0.201 0.053 CD4_TEM L2
ENSG00000157216 SSBP3 791744 sc-eQTL 3.98e-01 0.137 0.162 0.053 CD4_TEM L2
ENSG00000162402 USP24 -10141 sc-eQTL 2.98e-01 -0.154 0.148 0.053 CD4_TEM L2
ENSG00000243725 TTC4 489362 sc-eQTL 6.63e-01 -0.0854 0.196 0.053 CD4_TEM L2
ENSG00000006555 TTC22 403900 sc-eQTL 9.00e-01 -0.0203 0.161 0.053 CD8_CTL L2
ENSG00000157216 SSBP3 791744 sc-eQTL 7.53e-01 -0.0394 0.125 0.053 CD8_CTL L2
ENSG00000162402 USP24 -10141 sc-eQTL 2.88e-01 -0.132 0.124 0.053 CD8_CTL L2
ENSG00000243725 TTC4 489362 sc-eQTL 4.50e-01 0.141 0.186 0.053 CD8_CTL L2
ENSG00000006555 TTC22 403900 sc-eQTL 6.36e-01 0.0847 0.179 0.053 CD8_Naive L2
ENSG00000157216 SSBP3 791744 sc-eQTL 1.81e-01 -0.192 0.143 0.053 CD8_Naive L2
ENSG00000162402 USP24 -10141 sc-eQTL 1.65e-01 -0.181 0.13 0.053 CD8_Naive L2
ENSG00000243725 TTC4 489362 sc-eQTL 6.28e-01 0.0927 0.191 0.053 CD8_Naive L2
ENSG00000006555 TTC22 403900 sc-eQTL 5.01e-01 -0.129 0.191 0.056 CD8_TCM L2
ENSG00000157216 SSBP3 791744 sc-eQTL 6.70e-01 -0.071 0.167 0.056 CD8_TCM L2
ENSG00000162402 USP24 -10141 sc-eQTL 8.75e-01 -0.0255 0.162 0.056 CD8_TCM L2
ENSG00000243725 TTC4 489362 sc-eQTL 7.59e-01 0.0602 0.196 0.056 CD8_TCM L2
ENSG00000006555 TTC22 403900 sc-eQTL 9.37e-02 0.316 0.188 0.055 CD8_TEM L2
ENSG00000157216 SSBP3 791744 sc-eQTL 2.91e-01 -0.193 0.182 0.055 CD8_TEM L2
ENSG00000162402 USP24 -10141 sc-eQTL 4.65e-02 -0.382 0.191 0.055 CD8_TEM L2
ENSG00000243725 TTC4 489362 sc-eQTL 5.17e-01 -0.127 0.196 0.055 CD8_TEM L2
ENSG00000006555 TTC22 403900 sc-eQTL 7.44e-01 -0.0565 0.173 0.054 MAIT L2
ENSG00000116133 DHCR24 318028 sc-eQTL 9.15e-01 0.0136 0.128 0.054 MAIT L2
ENSG00000157216 SSBP3 791744 sc-eQTL 6.37e-01 -0.0828 0.175 0.054 MAIT L2
ENSG00000162402 USP24 -10141 sc-eQTL 1.72e-01 -0.212 0.155 0.054 MAIT L2
ENSG00000243725 TTC4 489362 sc-eQTL 9.47e-01 0.012 0.18 0.054 MAIT L2
ENSG00000006555 TTC22 403900 sc-eQTL 4.64e-01 0.142 0.193 0.056 NK_CD56bright L2
ENSG00000116133 DHCR24 318028 sc-eQTL 6.71e-01 0.0726 0.171 0.056 NK_CD56bright L2
ENSG00000157216 SSBP3 791744 sc-eQTL 7.42e-01 -0.0488 0.148 0.056 NK_CD56bright L2
ENSG00000162398 LEXM 399160 sc-eQTL 2.51e-01 0.201 0.174 0.056 NK_CD56bright L2
ENSG00000162402 USP24 -10141 sc-eQTL 8.86e-01 0.0217 0.151 0.056 NK_CD56bright L2
ENSG00000243725 TTC4 489362 sc-eQTL 2.13e-02 0.435 0.187 0.056 NK_CD56bright L2
ENSG00000006555 TTC22 403900 sc-eQTL 6.30e-01 0.0792 0.164 0.054 NK_CD56dim L2
ENSG00000116133 DHCR24 318028 sc-eQTL 3.50e-01 0.16 0.171 0.054 NK_CD56dim L2
ENSG00000157216 SSBP3 791744 sc-eQTL 5.10e-01 -0.0965 0.146 0.054 NK_CD56dim L2
ENSG00000162398 LEXM 399160 sc-eQTL 8.14e-01 -0.0396 0.168 0.054 NK_CD56dim L2
ENSG00000162402 USP24 -10141 sc-eQTL 3.69e-01 0.0961 0.107 0.054 NK_CD56dim L2
ENSG00000243725 TTC4 489362 sc-eQTL 1.08e-01 0.293 0.182 0.054 NK_CD56dim L2
ENSG00000006555 TTC22 403900 sc-eQTL 4.27e-01 0.151 0.19 0.057 NK_HLA L2
ENSG00000116133 DHCR24 318028 sc-eQTL 9.73e-01 -0.00635 0.186 0.057 NK_HLA L2
ENSG00000157216 SSBP3 791744 sc-eQTL 1.23e-01 0.246 0.159 0.057 NK_HLA L2
ENSG00000162398 LEXM 399160 sc-eQTL 5.78e-01 0.101 0.18 0.057 NK_HLA L2
ENSG00000162402 USP24 -10141 sc-eQTL 7.31e-02 0.237 0.131 0.057 NK_HLA L2
ENSG00000243725 TTC4 489362 sc-eQTL 4.32e-01 -0.156 0.198 0.057 NK_HLA L2
ENSG00000006555 TTC22 403900 sc-eQTL 1.97e-01 0.226 0.174 0.054 NK_cytokine L2
ENSG00000116133 DHCR24 318028 sc-eQTL 1.75e-01 0.24 0.176 0.054 NK_cytokine L2
ENSG00000157216 SSBP3 791744 sc-eQTL 3.99e-01 -0.125 0.148 0.054 NK_cytokine L2
ENSG00000162398 LEXM 399160 sc-eQTL 3.68e-01 0.166 0.184 0.054 NK_cytokine L2
ENSG00000162402 USP24 -10141 sc-eQTL 4.26e-03 0.357 0.123 0.054 NK_cytokine L2
ENSG00000243725 TTC4 489362 sc-eQTL 8.57e-01 -0.0336 0.187 0.054 NK_cytokine L2
ENSG00000006555 TTC22 403900 sc-eQTL 7.19e-01 0.0639 0.177 0.054 Pro_T L2
ENSG00000116133 DHCR24 318028 sc-eQTL 5.27e-01 0.0956 0.151 0.054 Pro_T L2
ENSG00000157216 SSBP3 791744 sc-eQTL 4.87e-01 -0.0977 0.14 0.054 Pro_T L2
ENSG00000162402 USP24 -10141 sc-eQTL 5.62e-01 0.0993 0.171 0.054 Pro_T L2
ENSG00000243725 TTC4 489362 sc-eQTL 3.97e-01 0.159 0.188 0.054 Pro_T L2
ENSG00000006555 TTC22 403900 sc-eQTL 3.14e-01 0.177 0.175 0.053 Treg L2
ENSG00000157216 SSBP3 791744 sc-eQTL 9.12e-01 0.0181 0.164 0.053 Treg L2
ENSG00000162402 USP24 -10141 sc-eQTL 4.97e-02 -0.305 0.155 0.053 Treg L2
ENSG00000243725 TTC4 489362 sc-eQTL 7.02e-01 -0.0753 0.197 0.053 Treg L2
ENSG00000116133 DHCR24 318028 sc-eQTL 8.56e-01 0.0284 0.156 0.056 cDC L2
ENSG00000157216 SSBP3 791744 sc-eQTL 9.79e-01 0.00481 0.185 0.056 cDC L2
ENSG00000162390 ACOT11 662966 sc-eQTL 9.41e-01 0.0127 0.172 0.056 cDC L2
ENSG00000162402 USP24 -10141 sc-eQTL 8.41e-01 0.0388 0.193 0.056 cDC L2
ENSG00000243725 TTC4 489362 sc-eQTL 7.49e-02 0.351 0.196 0.056 cDC L2
ENSG00000116133 DHCR24 318028 sc-eQTL 5.58e-01 -0.0668 0.114 0.053 cMono_IL1B L2
ENSG00000157216 SSBP3 791744 sc-eQTL 3.84e-01 0.152 0.174 0.053 cMono_IL1B L2
ENSG00000162402 USP24 -10141 sc-eQTL 7.80e-01 0.036 0.129 0.053 cMono_IL1B L2
ENSG00000243725 TTC4 489362 sc-eQTL 4.78e-01 0.14 0.197 0.053 cMono_IL1B L2
ENSG00000116133 DHCR24 318028 sc-eQTL 7.86e-01 -0.0293 0.108 0.053 cMono_S100A L2
ENSG00000157216 SSBP3 791744 sc-eQTL 3.89e-01 0.17 0.197 0.053 cMono_S100A L2
ENSG00000162402 USP24 -10141 sc-eQTL 8.14e-01 -0.0377 0.16 0.053 cMono_S100A L2
ENSG00000243725 TTC4 489362 sc-eQTL 3.78e-01 -0.177 0.2 0.053 cMono_S100A L2
ENSG00000006555 TTC22 403900 sc-eQTL 4.20e-01 -0.133 0.164 0.067 gdT L2
ENSG00000116133 DHCR24 318028 sc-eQTL 1.38e-01 0.272 0.182 0.067 gdT L2
ENSG00000157216 SSBP3 791744 sc-eQTL 6.15e-01 0.0662 0.131 0.067 gdT L2
ENSG00000162402 USP24 -10141 sc-eQTL 8.87e-01 0.0252 0.177 0.067 gdT L2
ENSG00000243725 TTC4 489362 sc-eQTL 2.75e-01 -0.225 0.206 0.067 gdT L2
ENSG00000116133 DHCR24 318028 sc-eQTL 8.50e-01 0.027 0.142 0.056 intMono L2
ENSG00000157216 SSBP3 791744 sc-eQTL 8.27e-01 0.0445 0.203 0.056 intMono L2
ENSG00000162402 USP24 -10141 sc-eQTL 7.05e-01 -0.0688 0.181 0.056 intMono L2
ENSG00000243725 TTC4 489362 sc-eQTL 8.93e-01 -0.026 0.193 0.056 intMono L2
ENSG00000116133 DHCR24 318028 sc-eQTL 7.03e-01 0.0523 0.137 0.057 ncMono L2
ENSG00000157216 SSBP3 791744 sc-eQTL 7.59e-01 -0.0594 0.193 0.057 ncMono L2
ENSG00000162402 USP24 -10141 sc-eQTL 6.98e-01 -0.0601 0.154 0.057 ncMono L2
ENSG00000243725 TTC4 489362 sc-eQTL 7.91e-01 -0.0486 0.183 0.057 ncMono L2
ENSG00000116133 DHCR24 318028 sc-eQTL 7.73e-01 -0.0441 0.153 0.071 pDC L2
ENSG00000157216 SSBP3 791744 sc-eQTL 7.44e-01 0.0566 0.173 0.071 pDC L2
ENSG00000162390 ACOT11 662966 sc-eQTL 1.74e-01 -0.0988 0.0722 0.071 pDC L2
ENSG00000162402 USP24 -10141 sc-eQTL 3.82e-01 0.107 0.122 0.071 pDC L2
ENSG00000243725 TTC4 489362 sc-eQTL 1.76e-01 -0.262 0.193 0.071 pDC L2
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000006555 TTC22 403900 sc-eQTL 8.63e-01 0.0315 0.183 0.053 B_Memory LOneK1K
ENSG00000116133 DHCR24 318028 sc-eQTL 7.43e-01 -0.0601 0.183 0.053 B_Memory LOneK1K
ENSG00000157216 SSBP3 791744 sc-eQTL 7.72e-01 0.0418 0.144 0.053 B_Memory LOneK1K
ENSG00000162402 USP24 -10141 sc-eQTL 6.04e-01 -0.068 0.131 0.053 B_Memory LOneK1K
ENSG00000243725 TTC4 489362 sc-eQTL 4.90e-01 -0.125 0.181 0.053 B_Memory LOneK1K
ENSG00000006555 TTC22 403900 sc-eQTL 4.83e-01 0.137 0.195 0.053 B_Naive LOneK1K
ENSG00000116133 DHCR24 318028 sc-eQTL 2.81e-01 -0.189 0.175 0.053 B_Naive LOneK1K
ENSG00000157216 SSBP3 791744 sc-eQTL 9.65e-01 0.00631 0.145 0.053 B_Naive LOneK1K
ENSG00000162402 USP24 -10141 sc-eQTL 6.78e-01 0.0516 0.124 0.053 B_Naive LOneK1K
ENSG00000243725 TTC4 489362 sc-eQTL 5.71e-01 -0.105 0.185 0.053 B_Naive LOneK1K
ENSG00000116133 DHCR24 318028 sc-eQTL 7.08e-01 -0.0414 0.11 0.053 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000157216 SSBP3 791744 sc-eQTL 4.35e-01 0.138 0.176 0.053 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000162402 USP24 -10141 sc-eQTL 9.23e-01 0.0117 0.121 0.053 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000243725 TTC4 489362 sc-eQTL 8.96e-01 0.0262 0.2 0.053 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000116133 DHCR24 318028 sc-eQTL 8.08e-01 -0.0329 0.135 0.054 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000157216 SSBP3 791744 sc-eQTL 5.42e-01 -0.118 0.192 0.054 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000162402 USP24 -10141 sc-eQTL 4.64e-01 -0.111 0.152 0.054 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000243725 TTC4 489362 sc-eQTL 8.56e-01 -0.0346 0.19 0.054 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000006555 TTC22 403900 sc-eQTL 2.71e-01 0.177 0.16 0.054 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000116133 DHCR24 318028 sc-eQTL 2.34e-01 0.199 0.167 0.054 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000157216 SSBP3 791744 sc-eQTL 7.09e-01 -0.0522 0.14 0.054 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000162398 LEXM 399160 sc-eQTL 7.93e-01 0.0414 0.157 0.054 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000162402 USP24 -10141 sc-eQTL 2.51e-02 0.222 0.0986 0.054 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000243725 TTC4 489362 sc-eQTL 4.17e-01 0.144 0.177 0.054 NK_CD56dim LOneK1K


Statistical fine-mapping results from Japan COVID-19 Task Force
(Shown only for PIP>0.001)
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
PIP (SuSiE)
PIP (FINEMAP)
MAF
ENSG00000162402 USP24 -10141 eQTL 0.0173 -0.0581 0.0244 0.0 0.0 0.0554
ENSG00000169174 PCSK9 165675 eQTL 0.00166 -0.112 0.0355 0.00513 0.00154 0.0554


Expression Modifier Score(EMS) for GTEx 49tissues
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Whole Blood
Muscle Skeletal
Liver
Brain Cerebellum
Prostate
Spleen
Skin Sun Exposed Lower leg
Artery Coronary
Esophagus Muscularis
Esophagus Gastroesophageal Junction
Artery Tibial
Heart Atrial Appendage
Nerve Tibial
Heart Left Ventricle
Adrenal Gland
Adipose Visceral Omentum
Pancreas
Lung
Pituitary
Brain Nucleus accumbens basal ganglia
Colon Transverse
Adipose Subcutaneous
Esophagus Mucosa
Brain Cortex
Thyroid
Stomach
Breast Mammary Tissue
Colon Sigmoid
Skin Not Sun Exposed Suprapubic
Testis
Artery Aorta
Brain Amygdala
Brain Anterior cingulate cortex BA24
Brain Caudate basal ganglia
Brain Cerebellar Hemisphere
Brain Frontal Cortex BA9
Brain Hippocampus
Brain Hypothalamus
Brain Putamen basal ganglia
Brain Spinal cord cervical c-1
Brain Substantia nigra
Cells Cultured fibroblasts
Cells EBV-transformed lymphocytes
Kidney Cortex
Minor Salivary Gland
Ovary
Small Intestine Terminal Ileum
Uterus
Vagina