logo

Genes within 1Mb (chr6:137199061:G:A):

View on , UCSC , GTEx , gnomAD

Immune cell-type specific single cell cis-eQTLs in OASIS
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000027697 IFNGR1 -20388 sc-eQTL 3.77e-01 0.137 0.155 0.056 B L1
ENSG00000029363 BCLAF1 909210 sc-eQTL 5.00e-03 -0.193 0.0679 0.056 B L1
ENSG00000112357 PEX7 376497 sc-eQTL 4.39e-01 -0.142 0.184 0.056 B L1
ENSG00000112378 PERP -908358 sc-eQTL 6.65e-01 -0.0527 0.122 0.056 B L1
ENSG00000118503 TNFAIP3 -668153 sc-eQTL 9.72e-01 -0.00345 0.0981 0.056 B L1
ENSG00000197442 MAP3K5 406584 sc-eQTL 4.83e-01 -0.096 0.137 0.056 B L1
ENSG00000237499 WAKMAR2 -669172 sc-eQTL 4.82e-01 0.109 0.154 0.056 B L1
ENSG00000027697 IFNGR1 -20388 sc-eQTL 1.81e-01 0.137 0.102 0.056 CD4T L1
ENSG00000029363 BCLAF1 909210 sc-eQTL 2.13e-02 -0.178 0.0768 0.056 CD4T L1
ENSG00000112357 PEX7 376497 sc-eQTL 6.93e-01 -0.0654 0.166 0.056 CD4T L1
ENSG00000112378 PERP -908358 sc-eQTL 4.41e-02 0.223 0.11 0.056 CD4T L1
ENSG00000118503 TNFAIP3 -668153 sc-eQTL 5.27e-01 0.066 0.104 0.056 CD4T L1
ENSG00000197442 MAP3K5 406584 sc-eQTL 9.52e-01 -0.00478 0.0794 0.056 CD4T L1
ENSG00000237499 WAKMAR2 -669172 sc-eQTL 7.62e-01 0.0397 0.131 0.056 CD4T L1
ENSG00000027697 IFNGR1 -20388 sc-eQTL 7.38e-02 0.212 0.118 0.056 CD8T L1
ENSG00000029363 BCLAF1 909210 sc-eQTL 9.28e-01 0.00728 0.0803 0.056 CD8T L1
ENSG00000112357 PEX7 376497 sc-eQTL 3.64e-01 0.18 0.197 0.056 CD8T L1
ENSG00000112378 PERP -908358 sc-eQTL 6.89e-01 -0.0518 0.129 0.056 CD8T L1
ENSG00000118503 TNFAIP3 -668153 sc-eQTL 8.00e-01 0.0253 0.0999 0.056 CD8T L1
ENSG00000197442 MAP3K5 406584 sc-eQTL 8.90e-01 0.0146 0.106 0.056 CD8T L1
ENSG00000237499 WAKMAR2 -669172 sc-eQTL 2.63e-01 0.164 0.146 0.056 CD8T L1
ENSG00000027697 IFNGR1 -20388 sc-eQTL 4.97e-01 0.0948 0.139 0.059 DC L1
ENSG00000029363 BCLAF1 909210 sc-eQTL 8.38e-02 -0.216 0.124 0.059 DC L1
ENSG00000112357 PEX7 376497 sc-eQTL 2.48e-01 0.226 0.196 0.059 DC L1
ENSG00000118503 TNFAIP3 -668153 sc-eQTL 3.20e-01 -0.148 0.149 0.059 DC L1
ENSG00000135525 MAP7 648242 sc-eQTL 1.50e-01 0.232 0.16 0.059 DC L1
ENSG00000197442 MAP3K5 406584 sc-eQTL 5.73e-02 -0.293 0.153 0.059 DC L1
ENSG00000237499 WAKMAR2 -669172 sc-eQTL 3.32e-01 -0.147 0.151 0.059 DC L1
ENSG00000286646 AL121933.2 415016 sc-eQTL 3.70e-01 0.181 0.201 0.059 DC L1
ENSG00000027697 IFNGR1 -20388 sc-eQTL 5.33e-02 0.231 0.119 0.056 Mono L1
ENSG00000029363 BCLAF1 909210 sc-eQTL 9.62e-01 -0.00485 0.102 0.056 Mono L1
ENSG00000112357 PEX7 376497 sc-eQTL 1.15e-01 0.317 0.2 0.056 Mono L1
ENSG00000118503 TNFAIP3 -668153 sc-eQTL 7.54e-01 0.0319 0.102 0.056 Mono L1
ENSG00000135525 MAP7 648242 sc-eQTL 1.04e-02 -0.453 0.175 0.056 Mono L1
ENSG00000197442 MAP3K5 406584 sc-eQTL 8.87e-01 -0.0168 0.119 0.056 Mono L1
ENSG00000237499 WAKMAR2 -669172 sc-eQTL 7.85e-01 0.0344 0.126 0.056 Mono L1
ENSG00000286646 AL121933.2 415016 sc-eQTL 6.78e-01 -0.0598 0.144 0.056 Mono L1
ENSG00000027697 IFNGR1 -20388 sc-eQTL 2.41e-02 0.293 0.129 0.056 NK L1
ENSG00000029363 BCLAF1 909210 sc-eQTL 1.92e-01 -0.0904 0.069 0.056 NK L1
ENSG00000112357 PEX7 376497 sc-eQTL 3.59e-01 0.185 0.201 0.056 NK L1
ENSG00000112378 PERP -908358 sc-eQTL 3.25e-01 0.125 0.127 0.056 NK L1
ENSG00000118503 TNFAIP3 -668153 sc-eQTL 5.64e-01 -0.0627 0.109 0.056 NK L1
ENSG00000197442 MAP3K5 406584 sc-eQTL 1.84e-01 -0.207 0.155 0.056 NK L1
ENSG00000237499 WAKMAR2 -669172 sc-eQTL 7.72e-01 0.0446 0.154 0.056 NK L1
ENSG00000027697 IFNGR1 -20388 sc-eQTL 8.08e-01 -0.0298 0.122 0.056 Other_T L1
ENSG00000029363 BCLAF1 909210 sc-eQTL 4.97e-02 -0.201 0.102 0.056 Other_T L1
ENSG00000112357 PEX7 376497 sc-eQTL 2.66e-01 0.222 0.199 0.056 Other_T L1
ENSG00000112378 PERP -908358 sc-eQTL 8.37e-01 -0.033 0.16 0.056 Other_T L1
ENSG00000118503 TNFAIP3 -668153 sc-eQTL 2.94e-01 -0.0799 0.076 0.056 Other_T L1
ENSG00000146410 MTFR2 948726 sc-eQTL 8.94e-01 -0.0154 0.115 0.056 Other_T L1
ENSG00000197442 MAP3K5 406584 sc-eQTL 1.24e-01 -0.226 0.146 0.056 Other_T L1
ENSG00000237499 WAKMAR2 -669172 sc-eQTL 1.63e-02 0.361 0.149 0.056 Other_T L1
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000027697 IFNGR1 -20388 sc-eQTL 4.40e-03 0.546 0.189 0.059 B_Activated L2
ENSG00000029363 BCLAF1 909210 sc-eQTL 6.32e-01 -0.0754 0.157 0.059 B_Activated L2
ENSG00000112357 PEX7 376497 sc-eQTL 8.81e-01 -0.0285 0.19 0.059 B_Activated L2
ENSG00000112378 PERP -908358 sc-eQTL 1.60e-03 0.307 0.0957 0.059 B_Activated L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 -668153 sc-eQTL 1.73e-01 -0.26 0.19 0.059 B_Activated L2
ENSG00000197442 MAP3K5 406584 sc-eQTL 1.14e-01 -0.338 0.212 0.059 B_Activated L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 -669172 sc-eQTL 1.67e-01 0.23 0.166 0.059 B_Activated L2
ENSG00000027697 IFNGR1 -20388 sc-eQTL 7.58e-02 0.317 0.178 0.056 B_Intermediate L2
ENSG00000029363 BCLAF1 909210 sc-eQTL 3.41e-01 -0.097 0.102 0.056 B_Intermediate L2
ENSG00000112357 PEX7 376497 sc-eQTL 1.00e+00 9.46e-05 0.187 0.056 B_Intermediate L2
ENSG00000112378 PERP -908358 sc-eQTL 7.31e-01 0.0588 0.171 0.056 B_Intermediate L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 -668153 sc-eQTL 4.79e-01 -0.0949 0.134 0.056 B_Intermediate L2
ENSG00000197442 MAP3K5 406584 sc-eQTL 6.30e-01 0.0781 0.162 0.056 B_Intermediate L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 -669172 sc-eQTL 6.91e-01 -0.0758 0.19 0.056 B_Intermediate L2
ENSG00000027697 IFNGR1 -20388 sc-eQTL 1.88e-01 0.255 0.193 0.056 B_Memory L2
ENSG00000029363 BCLAF1 909210 sc-eQTL 3.85e-02 -0.238 0.114 0.056 B_Memory L2
ENSG00000112357 PEX7 376497 sc-eQTL 2.12e-01 -0.244 0.195 0.056 B_Memory L2
ENSG00000112378 PERP -908358 sc-eQTL 6.10e-01 -0.0941 0.184 0.056 B_Memory L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 -668153 sc-eQTL 4.65e-01 -0.0928 0.127 0.056 B_Memory L2
ENSG00000197442 MAP3K5 406584 sc-eQTL 9.59e-02 -0.288 0.172 0.056 B_Memory L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 -669172 sc-eQTL 1.49e-01 0.273 0.188 0.056 B_Memory L2
ENSG00000027697 IFNGR1 -20388 sc-eQTL 7.04e-01 0.0588 0.155 0.056 B_Naive1 L2
ENSG00000029363 BCLAF1 909210 sc-eQTL 1.42e-01 -0.13 0.0879 0.056 B_Naive1 L2
ENSG00000112357 PEX7 376497 sc-eQTL 5.26e-01 0.13 0.204 0.056 B_Naive1 L2
ENSG00000112378 PERP -908358 sc-eQTL 6.67e-01 -0.077 0.178 0.056 B_Naive1 L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 -668153 sc-eQTL 5.20e-01 -0.0667 0.103 0.056 B_Naive1 L2
ENSG00000197442 MAP3K5 406584 sc-eQTL 8.29e-01 -0.0315 0.145 0.056 B_Naive1 L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 -669172 sc-eQTL 9.96e-01 -0.00078 0.162 0.056 B_Naive1 L2
ENSG00000027697 IFNGR1 -20388 sc-eQTL 2.74e-01 0.206 0.188 0.056 B_Naive2 L2
ENSG00000029363 BCLAF1 909210 sc-eQTL 7.34e-02 -0.195 0.108 0.056 B_Naive2 L2
ENSG00000112357 PEX7 376497 sc-eQTL 1.71e-01 -0.282 0.205 0.056 B_Naive2 L2
ENSG00000112378 PERP -908358 sc-eQTL 7.25e-01 0.053 0.15 0.056 B_Naive2 L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 -668153 sc-eQTL 7.37e-02 -0.268 0.149 0.056 B_Naive2 L2
ENSG00000197442 MAP3K5 406584 sc-eQTL 2.95e-01 0.167 0.159 0.056 B_Naive2 L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 -669172 sc-eQTL 7.51e-01 -0.0618 0.194 0.056 B_Naive2 L2
ENSG00000027697 IFNGR1 -20388 sc-eQTL 6.75e-02 0.324 0.176 0.057 CD4_CTL L2
ENSG00000029363 BCLAF1 909210 sc-eQTL 8.75e-01 -0.0248 0.158 0.057 CD4_CTL L2
ENSG00000112357 PEX7 376497 sc-eQTL 7.15e-01 -0.0721 0.197 0.057 CD4_CTL L2
ENSG00000112378 PERP -908358 sc-eQTL 1.12e-01 0.317 0.199 0.057 CD4_CTL L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 -668153 sc-eQTL 4.46e-01 0.089 0.116 0.057 CD4_CTL L2
ENSG00000197442 MAP3K5 406584 sc-eQTL 4.06e-04 -0.648 0.18 0.057 CD4_CTL L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 -669172 sc-eQTL 9.34e-01 0.0151 0.181 0.057 CD4_CTL L2
ENSG00000027697 IFNGR1 -20388 sc-eQTL 9.24e-02 0.164 0.0967 0.056 CD4_Naive L2
ENSG00000029363 BCLAF1 909210 sc-eQTL 2.83e-02 -0.171 0.0773 0.056 CD4_Naive L2
ENSG00000112357 PEX7 376497 sc-eQTL 3.12e-01 -0.186 0.183 0.056 CD4_Naive L2
ENSG00000112378 PERP -908358 sc-eQTL 3.26e-01 0.149 0.151 0.056 CD4_Naive L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 -668153 sc-eQTL 5.02e-01 0.0715 0.106 0.056 CD4_Naive L2
ENSG00000197442 MAP3K5 406584 sc-eQTL 8.60e-01 0.0138 0.0782 0.056 CD4_Naive L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 -669172 sc-eQTL 9.98e-01 0.000376 0.138 0.056 CD4_Naive L2
ENSG00000027697 IFNGR1 -20388 sc-eQTL 3.12e-01 0.136 0.134 0.056 CD4_TCM L2
ENSG00000029363 BCLAF1 909210 sc-eQTL 2.97e-01 -0.0885 0.0848 0.056 CD4_TCM L2
ENSG00000112357 PEX7 376497 sc-eQTL 9.95e-01 -0.00135 0.198 0.056 CD4_TCM L2
ENSG00000112378 PERP -908358 sc-eQTL 1.28e-01 0.254 0.166 0.056 CD4_TCM L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 -668153 sc-eQTL 9.18e-01 -0.01 0.097 0.056 CD4_TCM L2
ENSG00000197442 MAP3K5 406584 sc-eQTL 5.14e-01 0.0721 0.11 0.056 CD4_TCM L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 -669172 sc-eQTL 6.65e-01 0.059 0.136 0.056 CD4_TCM L2
ENSG00000027697 IFNGR1 -20388 sc-eQTL 9.09e-02 0.258 0.152 0.056 CD4_TEM L2
ENSG00000029363 BCLAF1 909210 sc-eQTL 8.79e-01 -0.0165 0.108 0.056 CD4_TEM L2
ENSG00000112357 PEX7 376497 sc-eQTL 8.88e-01 0.0279 0.198 0.056 CD4_TEM L2
ENSG00000112378 PERP -908358 sc-eQTL 3.51e-01 0.149 0.16 0.056 CD4_TEM L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 -668153 sc-eQTL 4.97e-01 -0.0691 0.102 0.056 CD4_TEM L2
ENSG00000197442 MAP3K5 406584 sc-eQTL 1.45e-01 -0.228 0.156 0.056 CD4_TEM L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 -669172 sc-eQTL 5.36e-01 -0.101 0.163 0.056 CD4_TEM L2
ENSG00000027697 IFNGR1 -20388 sc-eQTL 4.74e-01 0.102 0.142 0.056 CD8_CTL L2
ENSG00000029363 BCLAF1 909210 sc-eQTL 8.47e-01 0.0182 0.0946 0.056 CD8_CTL L2
ENSG00000112357 PEX7 376497 sc-eQTL 5.67e-01 0.112 0.195 0.056 CD8_CTL L2
ENSG00000112378 PERP -908358 sc-eQTL 6.22e-01 -0.0925 0.188 0.056 CD8_CTL L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 -668153 sc-eQTL 6.62e-01 -0.0522 0.119 0.056 CD8_CTL L2
ENSG00000197442 MAP3K5 406584 sc-eQTL 4.50e-01 -0.127 0.168 0.056 CD8_CTL L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 -669172 sc-eQTL 9.07e-01 -0.0195 0.168 0.056 CD8_CTL L2
ENSG00000027697 IFNGR1 -20388 sc-eQTL 1.64e-01 0.193 0.138 0.056 CD8_Naive L2
ENSG00000029363 BCLAF1 909210 sc-eQTL 4.45e-01 -0.0739 0.0966 0.056 CD8_Naive L2
ENSG00000112357 PEX7 376497 sc-eQTL 2.05e-01 0.255 0.2 0.056 CD8_Naive L2
ENSG00000112378 PERP -908358 sc-eQTL 2.63e-01 0.171 0.152 0.056 CD8_Naive L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 -668153 sc-eQTL 3.38e-01 0.104 0.108 0.056 CD8_Naive L2
ENSG00000197442 MAP3K5 406584 sc-eQTL 5.30e-01 0.0808 0.128 0.056 CD8_Naive L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 -669172 sc-eQTL 7.77e-02 0.282 0.159 0.056 CD8_Naive L2
ENSG00000027697 IFNGR1 -20388 sc-eQTL 3.13e-01 0.189 0.187 0.056 CD8_TCM L2
ENSG00000029363 BCLAF1 909210 sc-eQTL 6.74e-01 0.0591 0.14 0.056 CD8_TCM L2
ENSG00000112357 PEX7 376497 sc-eQTL 6.50e-01 0.0975 0.215 0.056 CD8_TCM L2
ENSG00000112378 PERP -908358 sc-eQTL 1.19e-02 -0.526 0.207 0.056 CD8_TCM L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 -668153 sc-eQTL 4.29e-01 0.0803 0.101 0.056 CD8_TCM L2
ENSG00000197442 MAP3K5 406584 sc-eQTL 4.90e-01 0.125 0.181 0.056 CD8_TCM L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 -669172 sc-eQTL 7.68e-01 -0.0547 0.186 0.056 CD8_TCM L2
ENSG00000027697 IFNGR1 -20388 sc-eQTL 1.06e-02 0.446 0.173 0.059 CD8_TEM L2
ENSG00000029363 BCLAF1 909210 sc-eQTL 9.91e-01 0.00187 0.166 0.059 CD8_TEM L2
ENSG00000112357 PEX7 376497 sc-eQTL 5.30e-01 -0.127 0.202 0.059 CD8_TEM L2
ENSG00000112378 PERP -908358 sc-eQTL 7.71e-01 0.0612 0.21 0.059 CD8_TEM L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 -668153 sc-eQTL 7.63e-01 -0.0391 0.129 0.059 CD8_TEM L2
ENSG00000197442 MAP3K5 406584 sc-eQTL 4.22e-01 -0.161 0.2 0.059 CD8_TEM L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 -669172 sc-eQTL 7.57e-02 0.34 0.191 0.059 CD8_TEM L2
ENSG00000027697 IFNGR1 -20388 sc-eQTL 7.42e-01 0.0456 0.138 0.056 MAIT L2
ENSG00000029363 BCLAF1 909210 sc-eQTL 8.00e-02 -0.201 0.114 0.056 MAIT L2
ENSG00000112357 PEX7 376497 sc-eQTL 8.52e-01 0.0351 0.188 0.056 MAIT L2
ENSG00000112378 PERP -908358 sc-eQTL 3.75e-01 -0.174 0.195 0.056 MAIT L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 -668153 sc-eQTL 7.78e-01 -0.0262 0.0931 0.056 MAIT L2
ENSG00000146410 MTFR2 948726 sc-eQTL 9.92e-01 0.00153 0.155 0.056 MAIT L2
ENSG00000197442 MAP3K5 406584 sc-eQTL 2.63e-01 -0.182 0.162 0.056 MAIT L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 -669172 sc-eQTL 1.09e-01 0.275 0.171 0.056 MAIT L2
ENSG00000027697 IFNGR1 -20388 sc-eQTL 1.14e-02 0.4 0.157 0.053 NK_CD56bright L2
ENSG00000029363 BCLAF1 909210 sc-eQTL 8.49e-01 0.0223 0.117 0.053 NK_CD56bright L2
ENSG00000112357 PEX7 376497 sc-eQTL 1.39e-01 0.307 0.206 0.053 NK_CD56bright L2
ENSG00000112378 PERP -908358 sc-eQTL 3.69e-01 0.167 0.185 0.053 NK_CD56bright L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 -668153 sc-eQTL 9.38e-01 0.00928 0.118 0.053 NK_CD56bright L2
ENSG00000197442 MAP3K5 406584 sc-eQTL 9.29e-01 -0.0161 0.18 0.053 NK_CD56bright L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 -669172 sc-eQTL 3.26e-01 0.186 0.188 0.053 NK_CD56bright L2
ENSG00000027697 IFNGR1 -20388 sc-eQTL 8.42e-03 0.315 0.118 0.056 NK_CD56dim L2
ENSG00000029363 BCLAF1 909210 sc-eQTL 2.82e-01 -0.0845 0.0783 0.056 NK_CD56dim L2
ENSG00000112357 PEX7 376497 sc-eQTL 7.99e-01 0.0528 0.207 0.056 NK_CD56dim L2
ENSG00000112378 PERP -908358 sc-eQTL 6.41e-01 0.068 0.146 0.056 NK_CD56dim L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 -668153 sc-eQTL 3.48e-01 -0.106 0.113 0.056 NK_CD56dim L2
ENSG00000197442 MAP3K5 406584 sc-eQTL 4.19e-01 -0.132 0.163 0.056 NK_CD56dim L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 -669172 sc-eQTL 9.34e-01 0.014 0.17 0.056 NK_CD56dim L2
ENSG00000027697 IFNGR1 -20388 sc-eQTL 1.58e-01 0.226 0.16 0.05 NK_HLA L2
ENSG00000029363 BCLAF1 909210 sc-eQTL 6.49e-01 -0.0618 0.136 0.05 NK_HLA L2
ENSG00000112357 PEX7 376497 sc-eQTL 5.68e-01 0.116 0.204 0.05 NK_HLA L2
ENSG00000112378 PERP -908358 sc-eQTL 7.80e-01 0.0463 0.165 0.05 NK_HLA L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 -668153 sc-eQTL 4.50e-01 -0.0961 0.127 0.05 NK_HLA L2
ENSG00000197442 MAP3K5 406584 sc-eQTL 6.91e-01 0.0805 0.202 0.05 NK_HLA L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 -669172 sc-eQTL 7.31e-01 -0.0704 0.205 0.05 NK_HLA L2
ENSG00000027697 IFNGR1 -20388 sc-eQTL 7.13e-02 0.232 0.128 0.056 NK_cytokine L2
ENSG00000029363 BCLAF1 909210 sc-eQTL 9.50e-01 -0.00602 0.0963 0.056 NK_cytokine L2
ENSG00000112357 PEX7 376497 sc-eQTL 5.61e-01 0.118 0.202 0.056 NK_cytokine L2
ENSG00000112378 PERP -908358 sc-eQTL 8.03e-02 0.268 0.153 0.056 NK_cytokine L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 -668153 sc-eQTL 6.70e-01 -0.0491 0.115 0.056 NK_cytokine L2
ENSG00000197442 MAP3K5 406584 sc-eQTL 6.98e-02 -0.286 0.157 0.056 NK_cytokine L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 -669172 sc-eQTL 8.14e-01 0.0409 0.174 0.056 NK_cytokine L2
ENSG00000027697 IFNGR1 -20388 sc-eQTL 9.83e-01 -0.00334 0.159 0.054 Pro_T L2
ENSG00000029363 BCLAF1 909210 sc-eQTL 5.40e-01 0.101 0.165 0.054 Pro_T L2
ENSG00000112357 PEX7 376497 sc-eQTL 3.00e-01 0.2 0.192 0.054 Pro_T L2
ENSG00000112378 PERP -908358 sc-eQTL 8.49e-01 0.0292 0.153 0.054 Pro_T L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 -668153 sc-eQTL 6.72e-01 0.0411 0.0967 0.054 Pro_T L2
ENSG00000146410 MTFR2 948726 sc-eQTL 3.24e-01 -0.132 0.134 0.054 Pro_T L2
ENSG00000197442 MAP3K5 406584 sc-eQTL 4.03e-02 -0.383 0.185 0.054 Pro_T L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 -669172 sc-eQTL 1.09e-02 0.475 0.185 0.054 Pro_T L2
ENSG00000027697 IFNGR1 -20388 sc-eQTL 1.26e-01 0.281 0.183 0.056 Treg L2
ENSG00000029363 BCLAF1 909210 sc-eQTL 6.32e-02 -0.22 0.118 0.056 Treg L2
ENSG00000112357 PEX7 376497 sc-eQTL 6.96e-03 0.52 0.191 0.056 Treg L2
ENSG00000112378 PERP -908358 sc-eQTL 7.85e-01 0.0573 0.21 0.056 Treg L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 -668153 sc-eQTL 5.30e-01 -0.0735 0.117 0.056 Treg L2
ENSG00000197442 MAP3K5 406584 sc-eQTL 9.06e-01 0.015 0.127 0.056 Treg L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 -669172 sc-eQTL 9.83e-01 -0.00389 0.178 0.056 Treg L2
ENSG00000027697 IFNGR1 -20388 sc-eQTL 2.85e-01 0.166 0.155 0.059 cDC L2
ENSG00000029363 BCLAF1 909210 sc-eQTL 2.87e-01 -0.167 0.156 0.059 cDC L2
ENSG00000112357 PEX7 376497 sc-eQTL 2.35e-01 0.239 0.2 0.059 cDC L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 -668153 sc-eQTL 5.20e-01 -0.0987 0.153 0.059 cDC L2
ENSG00000135525 MAP7 648242 sc-eQTL 9.26e-02 0.301 0.178 0.059 cDC L2
ENSG00000197442 MAP3K5 406584 sc-eQTL 3.84e-01 -0.137 0.157 0.059 cDC L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 -669172 sc-eQTL 2.45e-01 0.232 0.199 0.059 cDC L2
ENSG00000286646 AL121933.2 415016 sc-eQTL 3.46e-01 -0.193 0.205 0.059 cDC L2
ENSG00000027697 IFNGR1 -20388 sc-eQTL 4.21e-02 0.226 0.111 0.056 cMono_IL1B L2
ENSG00000029363 BCLAF1 909210 sc-eQTL 7.14e-01 0.0439 0.12 0.056 cMono_IL1B L2
ENSG00000112357 PEX7 376497 sc-eQTL 1.45e-02 0.488 0.198 0.056 cMono_IL1B L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 -668153 sc-eQTL 5.68e-01 0.0687 0.12 0.056 cMono_IL1B L2
ENSG00000135525 MAP7 648242 sc-eQTL 4.19e-01 -0.14 0.173 0.056 cMono_IL1B L2
ENSG00000197442 MAP3K5 406584 sc-eQTL 3.79e-01 0.11 0.125 0.056 cMono_IL1B L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 -669172 sc-eQTL 4.91e-01 0.0886 0.128 0.056 cMono_IL1B L2
ENSG00000286646 AL121933.2 415016 sc-eQTL 4.09e-01 -0.133 0.16 0.056 cMono_IL1B L2
ENSG00000027697 IFNGR1 -20388 sc-eQTL 4.06e-01 0.105 0.127 0.056 cMono_S100A L2
ENSG00000029363 BCLAF1 909210 sc-eQTL 9.20e-01 -0.0131 0.13 0.056 cMono_S100A L2
ENSG00000112357 PEX7 376497 sc-eQTL 7.26e-01 -0.0715 0.203 0.056 cMono_S100A L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 -668153 sc-eQTL 7.77e-01 -0.0319 0.113 0.056 cMono_S100A L2
ENSG00000135525 MAP7 648242 sc-eQTL 2.17e-01 -0.234 0.189 0.056 cMono_S100A L2
ENSG00000197442 MAP3K5 406584 sc-eQTL 4.52e-02 -0.306 0.152 0.056 cMono_S100A L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 -669172 sc-eQTL 4.79e-01 0.115 0.162 0.056 cMono_S100A L2
ENSG00000286646 AL121933.2 415016 sc-eQTL 7.20e-01 -0.0567 0.158 0.056 cMono_S100A L2
ENSG00000027697 IFNGR1 -20388 sc-eQTL 7.98e-02 0.318 0.18 0.061 gdT L2
ENSG00000029363 BCLAF1 909210 sc-eQTL 1.35e-02 -0.393 0.157 0.061 gdT L2
ENSG00000112357 PEX7 376497 sc-eQTL 5.31e-01 0.145 0.231 0.061 gdT L2
ENSG00000112378 PERP -908358 sc-eQTL 5.53e-01 0.12 0.201 0.061 gdT L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 -668153 sc-eQTL 1.62e-01 -0.157 0.111 0.061 gdT L2
ENSG00000146410 MTFR2 948726 sc-eQTL 4.36e-01 0.138 0.177 0.061 gdT L2
ENSG00000197442 MAP3K5 406584 sc-eQTL 8.01e-01 -0.06 0.237 0.061 gdT L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 -669172 sc-eQTL 9.83e-01 -0.00438 0.203 0.061 gdT L2
ENSG00000027697 IFNGR1 -20388 sc-eQTL 9.24e-01 -0.0128 0.135 0.058 intMono L2
ENSG00000029363 BCLAF1 909210 sc-eQTL 7.62e-01 0.054 0.178 0.058 intMono L2
ENSG00000112357 PEX7 376497 sc-eQTL 3.34e-01 -0.175 0.181 0.058 intMono L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 -668153 sc-eQTL 9.88e-01 -0.00172 0.116 0.058 intMono L2
ENSG00000135525 MAP7 648242 sc-eQTL 8.00e-02 -0.312 0.177 0.058 intMono L2
ENSG00000197442 MAP3K5 406584 sc-eQTL 1.00e-01 0.311 0.188 0.058 intMono L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 -669172 sc-eQTL 7.86e-02 -0.304 0.172 0.058 intMono L2
ENSG00000286646 AL121933.2 415016 sc-eQTL 2.92e-01 -0.211 0.199 0.058 intMono L2
ENSG00000027697 IFNGR1 -20388 sc-eQTL 2.39e-02 0.363 0.16 0.054 ncMono L2
ENSG00000029363 BCLAF1 909210 sc-eQTL 8.06e-02 0.219 0.125 0.054 ncMono L2
ENSG00000112357 PEX7 376497 sc-eQTL 5.67e-01 0.115 0.2 0.054 ncMono L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 -668153 sc-eQTL 6.87e-01 0.0577 0.143 0.054 ncMono L2
ENSG00000135525 MAP7 648242 sc-eQTL 5.99e-03 -0.482 0.173 0.054 ncMono L2
ENSG00000197442 MAP3K5 406584 sc-eQTL 7.15e-01 0.0678 0.186 0.054 ncMono L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 -669172 sc-eQTL 8.37e-01 -0.0369 0.179 0.054 ncMono L2
ENSG00000286646 AL121933.2 415016 sc-eQTL 1.38e-01 -0.28 0.188 0.054 ncMono L2
ENSG00000027697 IFNGR1 -20388 sc-eQTL 3.65e-01 0.167 0.183 0.059 pDC L2
ENSG00000029363 BCLAF1 909210 sc-eQTL 1.44e-01 -0.201 0.137 0.059 pDC L2
ENSG00000112357 PEX7 376497 sc-eQTL 7.36e-01 0.0684 0.202 0.059 pDC L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 -668153 sc-eQTL 4.00e-01 -0.144 0.17 0.059 pDC L2
ENSG00000135525 MAP7 648242 sc-eQTL 1.41e-01 -0.208 0.14 0.059 pDC L2
ENSG00000197442 MAP3K5 406584 sc-eQTL 8.47e-01 0.0438 0.226 0.059 pDC L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 -669172 sc-eQTL 4.55e-01 -0.129 0.173 0.059 pDC L2
ENSG00000286646 AL121933.2 415016 sc-eQTL 1.39e-02 0.509 0.205 0.059 pDC L2
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000027697 IFNGR1 -20388 sc-eQTL 4.90e-02 0.314 0.159 0.056 B_Memory LOneK1K
ENSG00000029363 BCLAF1 909210 sc-eQTL 2.71e-01 -0.0989 0.0897 0.056 B_Memory LOneK1K
ENSG00000112357 PEX7 376497 sc-eQTL 2.28e-01 -0.222 0.184 0.056 B_Memory LOneK1K
ENSG00000112378 PERP -908358 sc-eQTL 7.81e-01 0.0476 0.171 0.056 B_Memory LOneK1K
ENSG00000118503 TNFAIP3 -668153 sc-eQTL 9.06e-01 -0.0134 0.113 0.056 B_Memory LOneK1K
ENSG00000197442 MAP3K5 406584 sc-eQTL 3.36e-01 -0.144 0.149 0.056 B_Memory LOneK1K
ENSG00000237499 WAKMAR2 -669172 sc-eQTL 4.51e-01 0.144 0.191 0.056 B_Memory LOneK1K
ENSG00000027697 IFNGR1 -20388 sc-eQTL 5.68e-01 0.0935 0.163 0.056 B_Naive LOneK1K
ENSG00000029363 BCLAF1 909210 sc-eQTL 2.27e-02 -0.17 0.0742 0.056 B_Naive LOneK1K
ENSG00000112357 PEX7 376497 sc-eQTL 7.50e-01 0.0635 0.199 0.056 B_Naive LOneK1K
ENSG00000112378 PERP -908358 sc-eQTL 7.18e-01 -0.0644 0.178 0.056 B_Naive LOneK1K
ENSG00000118503 TNFAIP3 -668153 sc-eQTL 3.05e-01 -0.0961 0.0934 0.056 B_Naive LOneK1K
ENSG00000197442 MAP3K5 406584 sc-eQTL 9.78e-01 -0.00375 0.137 0.056 B_Naive LOneK1K
ENSG00000237499 WAKMAR2 -669172 sc-eQTL 6.78e-01 -0.0692 0.167 0.056 B_Naive LOneK1K
ENSG00000027697 IFNGR1 -20388 sc-eQTL 9.17e-02 0.188 0.111 0.056 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000029363 BCLAF1 909210 sc-eQTL 6.66e-01 0.0449 0.104 0.056 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000112357 PEX7 376497 sc-eQTL 1.01e-01 0.329 0.199 0.056 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000118503 TNFAIP3 -668153 sc-eQTL 5.53e-01 0.0613 0.103 0.056 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000135525 MAP7 648242 sc-eQTL 7.22e-02 -0.322 0.178 0.056 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000197442 MAP3K5 406584 sc-eQTL 6.97e-01 -0.0472 0.121 0.056 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000237499 WAKMAR2 -669172 sc-eQTL 3.90e-01 0.106 0.124 0.056 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000286646 AL121933.2 415016 sc-eQTL 5.63e-01 -0.0834 0.144 0.056 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000027697 IFNGR1 -20388 sc-eQTL 1.24e-01 0.207 0.134 0.056 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000029363 BCLAF1 909210 sc-eQTL 2.90e-01 0.129 0.122 0.056 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000112357 PEX7 376497 sc-eQTL 7.71e-01 0.0592 0.204 0.056 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000118503 TNFAIP3 -668153 sc-eQTL 6.62e-01 -0.0551 0.126 0.056 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000135525 MAP7 648242 sc-eQTL 4.51e-03 -0.554 0.193 0.056 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000197442 MAP3K5 406584 sc-eQTL 5.00e-02 0.316 0.16 0.056 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000237499 WAKMAR2 -669172 sc-eQTL 2.45e-01 -0.196 0.168 0.056 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000286646 AL121933.2 415016 sc-eQTL 4.04e-01 -0.16 0.191 0.056 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000027697 IFNGR1 -20388 sc-eQTL 9.36e-03 0.318 0.121 0.056 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000029363 BCLAF1 909210 sc-eQTL 2.12e-01 -0.0892 0.0713 0.056 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000112357 PEX7 376497 sc-eQTL 4.84e-01 0.146 0.208 0.056 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000112378 PERP -908358 sc-eQTL 7.20e-01 0.0464 0.129 0.056 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000118503 TNFAIP3 -668153 sc-eQTL 5.10e-01 -0.074 0.112 0.056 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000197442 MAP3K5 406584 sc-eQTL 1.51e-01 -0.218 0.151 0.056 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000237499 WAKMAR2 -669172 sc-eQTL 9.20e-01 -0.0159 0.157 0.056 NK_CD56dim LOneK1K

Statistical fine-mapping results from Japan COVID-19 Task Force
(Shown only for PIP>0.001)
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
PIP (SuSiE)
PIP (FINEMAP)
MAF
ENSG00000027697 IFNGR1 -20388 pQTL 0.000674 0.144 0.0424 0.0 0.0 0.0397
ENSG00000027697 IFNGR1 -20388 eQTL 0.000489 0.131 0.0375 0.0 0.0 0.0358

Expression Modifier Score(EMS) for GTEx 49tissues
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Whole Blood
Muscle Skeletal
Liver
Brain Cerebellum
Prostate
Spleen
Skin Sun Exposed Lower leg
Artery Coronary
Esophagus Muscularis
Esophagus Gastroesophageal Junction
Artery Tibial
Heart Atrial Appendage
Nerve Tibial
Heart Left Ventricle
Adrenal Gland
Adipose Visceral Omentum
Pancreas
Lung
Pituitary
Brain Nucleus accumbens basal ganglia
Colon Transverse
Adipose Subcutaneous
Esophagus Mucosa
Brain Cortex
Thyroid
Stomach
Breast Mammary Tissue
Colon Sigmoid
Skin Not Sun Exposed Suprapubic
Testis
Artery Aorta
Brain Amygdala
Brain Anterior cingulate cortex BA24
Brain Caudate basal ganglia
Brain Cerebellar Hemisphere
Brain Frontal Cortex BA9
Brain Hippocampus
Brain Hypothalamus
Brain Putamen basal ganglia
Brain Spinal cord cervical c-1
Brain Substantia nigra
Cells Cultured fibroblasts
Cells EBV-transformed lymphocytes
Kidney Cortex
Minor Salivary Gland
Ovary
Small Intestine Terminal Ileum
Uterus
Vagina
ENSG00000027697 IFNGR1 -20388 0.000151 5.79e-05 7.16e-06 1.7e-05 6.17e-06 2.71e-05 6.74e-05 3.95e-06 4.13e-05 1.56e-05 5.76e-05 2.2e-05 7.51e-05 2.16e-05 8.1e-06 2.6e-05 2.53e-05 3.36e-05 1.04e-05 7.38e-06 1.95e-05 5.26e-05 4.68e-05 1.06e-05 5.65e-05 8.28e-06 1.83e-05 1.43e-05 5.14e-05 3.01e-05 3.05e-05 1.61e-06 2.59e-06 7.75e-06 1.27e-05 5.16e-06 2.84e-06 2.99e-06 5.45e-06 3.17e-06 1.71e-06 6.58e-05 5.36e-06 1.44e-07 2.89e-06 4.06e-06 4.77e-06 1.44e-06 1.52e-06
ENSG00000112357 \N 376497 4.83e-06 9.37e-07 9.89e-08 4.34e-07 9.82e-08 4.82e-07 7.53e-07 5.53e-08 2.78e-07 1.46e-07 9e-07 3.27e-07 8.34e-07 2.12e-07 1.26e-07 2.99e-07 1.73e-07 4.31e-07 3.26e-07 1.28e-07 2.3e-07 5.66e-07 5.87e-07 1.15e-07 8.33e-07 2.01e-07 1.74e-07 1.88e-07 6.76e-07 5.28e-07 3.38e-07 2.9e-08 4.98e-08 2.97e-07 3.36e-07 5.32e-08 1.23e-07 9.17e-08 4.37e-08 3e-08 4.36e-08 1.12e-06 1.1e-07 1.43e-08 3.42e-08 1.84e-08 9.34e-08 3.8e-09 4.73e-08