Genes within 1Mb (chr6:137102642:G:A):

View on , UCSC , GTEx , gnomAD


Immune cell-type specific single cell cis-eQTLs in OASIS
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000027697 IFNGR1 -116807 sc-eQTL 6.44e-01 0.0509 0.11 0.12 B L1
ENSG00000029363 BCLAF1 812791 sc-eQTL 9.61e-01 -0.00242 0.0489 0.12 B L1
ENSG00000112357 PEX7 280078 sc-eQTL 8.51e-01 0.0245 0.13 0.12 B L1
ENSG00000118503 TNFAIP3 -764572 sc-eQTL 8.24e-01 0.0155 0.0693 0.12 B L1
ENSG00000197442 MAP3K5 310165 sc-eQTL 9.54e-01 -0.00563 0.0966 0.12 B L1
ENSG00000237499 WAKMAR2 -765591 sc-eQTL 6.89e-01 0.0437 0.109 0.12 B L1
ENSG00000027697 IFNGR1 -116807 sc-eQTL 5.74e-01 0.0412 0.0732 0.12 CD4T L1
ENSG00000029363 BCLAF1 812791 sc-eQTL 7.58e-02 -0.0981 0.055 0.12 CD4T L1
ENSG00000112357 PEX7 280078 sc-eQTL 8.94e-01 0.0157 0.118 0.12 CD4T L1
ENSG00000118503 TNFAIP3 -764572 sc-eQTL 2.64e-01 -0.0828 0.074 0.12 CD4T L1
ENSG00000197442 MAP3K5 310165 sc-eQTL 4.09e-01 0.0467 0.0564 0.12 CD4T L1
ENSG00000237499 WAKMAR2 -765591 sc-eQTL 7.65e-01 0.028 0.0934 0.12 CD4T L1
ENSG00000027697 IFNGR1 -116807 sc-eQTL 1.47e-02 0.202 0.0821 0.12 CD8T L1
ENSG00000029363 BCLAF1 812791 sc-eQTL 2.64e-02 -0.125 0.0557 0.12 CD8T L1
ENSG00000112357 PEX7 280078 sc-eQTL 2.80e-01 0.15 0.139 0.12 CD8T L1
ENSG00000118503 TNFAIP3 -764572 sc-eQTL 2.77e-01 -0.0762 0.0699 0.12 CD8T L1
ENSG00000197442 MAP3K5 310165 sc-eQTL 7.49e-01 0.0238 0.0741 0.12 CD8T L1
ENSG00000237499 WAKMAR2 -765591 sc-eQTL 9.29e-01 -0.00919 0.103 0.12 CD8T L1
ENSG00000027697 IFNGR1 -116807 sc-eQTL 2.52e-01 0.118 0.103 0.122 DC L1
ENSG00000029363 BCLAF1 812791 sc-eQTL 6.40e-01 -0.0435 0.093 0.122 DC L1
ENSG00000112357 PEX7 280078 sc-eQTL 6.79e-01 -0.0603 0.146 0.122 DC L1
ENSG00000118503 TNFAIP3 -764572 sc-eQTL 9.23e-01 -0.0108 0.11 0.122 DC L1
ENSG00000135525 MAP7 551823 sc-eQTL 5.82e-01 0.0658 0.12 0.122 DC L1
ENSG00000197442 MAP3K5 310165 sc-eQTL 3.44e-01 0.109 0.114 0.122 DC L1
ENSG00000237499 WAKMAR2 -765591 sc-eQTL 5.01e-01 -0.0759 0.112 0.122 DC L1
ENSG00000286646 AL121933.2 318597 sc-eQTL 4.90e-02 -0.294 0.148 0.122 DC L1
ENSG00000027697 IFNGR1 -116807 sc-eQTL 9.61e-01 -0.00411 0.0839 0.12 Mono L1
ENSG00000029363 BCLAF1 812791 sc-eQTL 2.76e-01 -0.0781 0.0715 0.12 Mono L1
ENSG00000112357 PEX7 280078 sc-eQTL 4.72e-01 -0.102 0.141 0.12 Mono L1
ENSG00000118503 TNFAIP3 -764572 sc-eQTL 8.48e-01 -0.0136 0.0712 0.12 Mono L1
ENSG00000135525 MAP7 551823 sc-eQTL 5.05e-01 -0.083 0.124 0.12 Mono L1
ENSG00000197442 MAP3K5 310165 sc-eQTL 1.62e-01 -0.116 0.0827 0.12 Mono L1
ENSG00000237499 WAKMAR2 -765591 sc-eQTL 9.50e-01 -0.0055 0.0882 0.12 Mono L1
ENSG00000286646 AL121933.2 318597 sc-eQTL 2.14e-01 -0.125 0.1 0.12 Mono L1
ENSG00000027697 IFNGR1 -116807 sc-eQTL 1.58e-01 0.131 0.0927 0.12 NK L1
ENSG00000029363 BCLAF1 812791 sc-eQTL 3.21e-01 -0.049 0.0493 0.12 NK L1
ENSG00000112357 PEX7 280078 sc-eQTL 5.74e-01 0.0808 0.144 0.12 NK L1
ENSG00000118503 TNFAIP3 -764572 sc-eQTL 3.80e-01 -0.068 0.0774 0.12 NK L1
ENSG00000197442 MAP3K5 310165 sc-eQTL 1.18e-02 0.278 0.109 0.12 NK L1
ENSG00000237499 WAKMAR2 -765591 sc-eQTL 5.74e-02 0.208 0.109 0.12 NK L1
ENSG00000027697 IFNGR1 -116807 sc-eQTL 3.97e-01 0.0733 0.0865 0.12 Other_T L1
ENSG00000029363 BCLAF1 812791 sc-eQTL 4.24e-01 -0.0582 0.0725 0.12 Other_T L1
ENSG00000112357 PEX7 280078 sc-eQTL 7.35e-01 0.0479 0.141 0.12 Other_T L1
ENSG00000118503 TNFAIP3 -764572 sc-eQTL 8.48e-01 -0.0104 0.0539 0.12 Other_T L1
ENSG00000146410 MTFR2 852307 sc-eQTL 5.78e-01 -0.0454 0.0816 0.12 Other_T L1
ENSG00000197442 MAP3K5 310165 sc-eQTL 2.38e-01 0.123 0.104 0.12 Other_T L1
ENSG00000237499 WAKMAR2 -765591 sc-eQTL 7.48e-01 0.0344 0.107 0.12 Other_T L1
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000027697 IFNGR1 -116807 sc-eQTL 1.88e-01 0.187 0.142 0.128 B_Activated L2
ENSG00000029363 BCLAF1 812791 sc-eQTL 9.85e-01 0.00211 0.116 0.128 B_Activated L2
ENSG00000112357 PEX7 280078 sc-eQTL 2.12e-01 0.174 0.139 0.128 B_Activated L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 -764572 sc-eQTL 3.75e-02 0.291 0.139 0.128 B_Activated L2
ENSG00000197442 MAP3K5 310165 sc-eQTL 4.99e-01 -0.107 0.157 0.128 B_Activated L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 -765591 sc-eQTL 2.23e-01 0.149 0.122 0.128 B_Activated L2
ENSG00000027697 IFNGR1 -116807 sc-eQTL 6.24e-02 0.237 0.127 0.12 B_Intermediate L2
ENSG00000029363 BCLAF1 812791 sc-eQTL 8.45e-01 -0.0142 0.0726 0.12 B_Intermediate L2
ENSG00000112357 PEX7 280078 sc-eQTL 4.51e-01 0.101 0.133 0.12 B_Intermediate L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 -764572 sc-eQTL 7.16e-01 0.0347 0.0954 0.12 B_Intermediate L2
ENSG00000197442 MAP3K5 310165 sc-eQTL 8.10e-01 -0.0278 0.115 0.12 B_Intermediate L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 -765591 sc-eQTL 3.60e-01 -0.124 0.135 0.12 B_Intermediate L2
ENSG00000027697 IFNGR1 -116807 sc-eQTL 3.51e-01 0.128 0.137 0.121 B_Memory L2
ENSG00000029363 BCLAF1 812791 sc-eQTL 5.40e-02 0.157 0.081 0.121 B_Memory L2
ENSG00000112357 PEX7 280078 sc-eQTL 7.54e-01 -0.0436 0.139 0.121 B_Memory L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 -764572 sc-eQTL 9.23e-01 0.00874 0.09 0.121 B_Memory L2
ENSG00000197442 MAP3K5 310165 sc-eQTL 9.29e-02 0.206 0.122 0.121 B_Memory L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 -765591 sc-eQTL 3.34e-01 -0.129 0.134 0.121 B_Memory L2
ENSG00000027697 IFNGR1 -116807 sc-eQTL 9.04e-01 0.0135 0.112 0.12 B_Naive1 L2
ENSG00000029363 BCLAF1 812791 sc-eQTL 3.62e-01 -0.0585 0.064 0.12 B_Naive1 L2
ENSG00000112357 PEX7 280078 sc-eQTL 9.33e-01 0.0124 0.148 0.12 B_Naive1 L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 -764572 sc-eQTL 5.06e-01 0.05 0.075 0.12 B_Naive1 L2
ENSG00000197442 MAP3K5 310165 sc-eQTL 1.80e-01 0.141 0.105 0.12 B_Naive1 L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 -765591 sc-eQTL 4.94e-01 -0.0806 0.118 0.12 B_Naive1 L2
ENSG00000027697 IFNGR1 -116807 sc-eQTL 5.10e-01 0.0869 0.132 0.12 B_Naive2 L2
ENSG00000029363 BCLAF1 812791 sc-eQTL 6.04e-01 0.0397 0.0764 0.12 B_Naive2 L2
ENSG00000112357 PEX7 280078 sc-eQTL 9.96e-01 -0.00081 0.144 0.12 B_Naive2 L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 -764572 sc-eQTL 8.64e-01 -0.018 0.105 0.12 B_Naive2 L2
ENSG00000197442 MAP3K5 310165 sc-eQTL 9.53e-01 0.00656 0.112 0.12 B_Naive2 L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 -765591 sc-eQTL 6.72e-01 0.0575 0.136 0.12 B_Naive2 L2
ENSG00000027697 IFNGR1 -116807 sc-eQTL 6.87e-01 0.0496 0.123 0.123 CD4_CTL L2
ENSG00000029363 BCLAF1 812791 sc-eQTL 6.50e-01 0.0496 0.109 0.123 CD4_CTL L2
ENSG00000112357 PEX7 280078 sc-eQTL 3.12e-01 -0.138 0.136 0.123 CD4_CTL L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 -764572 sc-eQTL 6.88e-02 0.146 0.08 0.123 CD4_CTL L2
ENSG00000197442 MAP3K5 310165 sc-eQTL 3.86e-01 0.112 0.129 0.123 CD4_CTL L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 -765591 sc-eQTL 9.59e-01 -0.0064 0.126 0.123 CD4_CTL L2
ENSG00000027697 IFNGR1 -116807 sc-eQTL 7.44e-01 0.0226 0.0694 0.12 CD4_Naive L2
ENSG00000029363 BCLAF1 812791 sc-eQTL 9.53e-02 -0.0928 0.0554 0.12 CD4_Naive L2
ENSG00000112357 PEX7 280078 sc-eQTL 5.49e-01 0.0785 0.131 0.12 CD4_Naive L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 -764572 sc-eQTL 3.63e-01 -0.0691 0.0757 0.12 CD4_Naive L2
ENSG00000197442 MAP3K5 310165 sc-eQTL 8.65e-01 -0.00947 0.0557 0.12 CD4_Naive L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 -765591 sc-eQTL 7.36e-01 0.0331 0.0982 0.12 CD4_Naive L2
ENSG00000027697 IFNGR1 -116807 sc-eQTL 4.07e-01 0.0803 0.0966 0.12 CD4_TCM L2
ENSG00000029363 BCLAF1 812791 sc-eQTL 8.86e-02 -0.104 0.0606 0.12 CD4_TCM L2
ENSG00000112357 PEX7 280078 sc-eQTL 9.64e-01 0.00642 0.142 0.12 CD4_TCM L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 -764572 sc-eQTL 3.91e-01 -0.0599 0.0696 0.12 CD4_TCM L2
ENSG00000197442 MAP3K5 310165 sc-eQTL 3.66e-02 0.165 0.0786 0.12 CD4_TCM L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 -765591 sc-eQTL 6.81e-01 0.0402 0.0977 0.12 CD4_TCM L2
ENSG00000027697 IFNGR1 -116807 sc-eQTL 3.33e-01 -0.106 0.109 0.12 CD4_TEM L2
ENSG00000029363 BCLAF1 812791 sc-eQTL 4.58e-01 -0.0575 0.0773 0.12 CD4_TEM L2
ENSG00000112357 PEX7 280078 sc-eQTL 8.24e-01 -0.0313 0.141 0.12 CD4_TEM L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 -764572 sc-eQTL 8.88e-01 -0.0102 0.0725 0.12 CD4_TEM L2
ENSG00000197442 MAP3K5 310165 sc-eQTL 2.41e-02 0.251 0.111 0.12 CD4_TEM L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 -765591 sc-eQTL 9.20e-01 0.0118 0.116 0.12 CD4_TEM L2
ENSG00000027697 IFNGR1 -116807 sc-eQTL 5.75e-03 0.273 0.0978 0.12 CD8_CTL L2
ENSG00000029363 BCLAF1 812791 sc-eQTL 2.75e-01 -0.0725 0.0662 0.12 CD8_CTL L2
ENSG00000112357 PEX7 280078 sc-eQTL 6.98e-01 -0.0532 0.137 0.12 CD8_CTL L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 -764572 sc-eQTL 7.90e-01 -0.0223 0.0838 0.12 CD8_CTL L2
ENSG00000197442 MAP3K5 310165 sc-eQTL 8.43e-01 0.0234 0.118 0.12 CD8_CTL L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 -765591 sc-eQTL 6.78e-01 0.049 0.118 0.12 CD8_CTL L2
ENSG00000027697 IFNGR1 -116807 sc-eQTL 7.60e-01 0.0304 0.0991 0.12 CD8_Naive L2
ENSG00000029363 BCLAF1 812791 sc-eQTL 2.66e-01 -0.077 0.069 0.12 CD8_Naive L2
ENSG00000112357 PEX7 280078 sc-eQTL 2.27e-01 0.173 0.143 0.12 CD8_Naive L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 -764572 sc-eQTL 7.98e-01 -0.0199 0.0775 0.12 CD8_Naive L2
ENSG00000197442 MAP3K5 310165 sc-eQTL 9.08e-01 -0.0107 0.0919 0.12 CD8_Naive L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 -765591 sc-eQTL 4.34e-01 -0.0898 0.114 0.12 CD8_Naive L2
ENSG00000027697 IFNGR1 -116807 sc-eQTL 8.45e-01 -0.0265 0.136 0.118 CD8_TCM L2
ENSG00000029363 BCLAF1 812791 sc-eQTL 1.75e-01 0.138 0.101 0.118 CD8_TCM L2
ENSG00000112357 PEX7 280078 sc-eQTL 5.79e-01 0.0864 0.155 0.118 CD8_TCM L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 -764572 sc-eQTL 4.13e-01 0.0602 0.0733 0.118 CD8_TCM L2
ENSG00000197442 MAP3K5 310165 sc-eQTL 1.41e-01 0.193 0.13 0.118 CD8_TCM L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 -765591 sc-eQTL 9.39e-01 0.0103 0.134 0.118 CD8_TCM L2
ENSG00000027697 IFNGR1 -116807 sc-eQTL 2.47e-01 0.142 0.122 0.126 CD8_TEM L2
ENSG00000029363 BCLAF1 812791 sc-eQTL 8.24e-02 0.2 0.115 0.126 CD8_TEM L2
ENSG00000112357 PEX7 280078 sc-eQTL 1.36e-01 0.21 0.14 0.126 CD8_TEM L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 -764572 sc-eQTL 2.92e-01 0.0952 0.0901 0.126 CD8_TEM L2
ENSG00000197442 MAP3K5 310165 sc-eQTL 3.58e-01 0.129 0.139 0.126 CD8_TEM L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 -765591 sc-eQTL 6.47e-01 0.0615 0.134 0.126 CD8_TEM L2
ENSG00000027697 IFNGR1 -116807 sc-eQTL 2.77e-01 0.107 0.0982 0.121 MAIT L2
ENSG00000029363 BCLAF1 812791 sc-eQTL 6.44e-02 -0.151 0.0811 0.121 MAIT L2
ENSG00000112357 PEX7 280078 sc-eQTL 8.10e-01 -0.0321 0.134 0.121 MAIT L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 -764572 sc-eQTL 9.84e-01 -0.00137 0.0663 0.121 MAIT L2
ENSG00000146410 MTFR2 852307 sc-eQTL 7.18e-01 -0.0399 0.11 0.121 MAIT L2
ENSG00000197442 MAP3K5 310165 sc-eQTL 9.58e-01 -0.00608 0.115 0.121 MAIT L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 -765591 sc-eQTL 8.89e-01 0.0172 0.123 0.121 MAIT L2
ENSG00000027697 IFNGR1 -116807 sc-eQTL 4.70e-01 0.0809 0.112 0.118 NK_CD56bright L2
ENSG00000029363 BCLAF1 812791 sc-eQTL 9.29e-01 -0.0074 0.0826 0.118 NK_CD56bright L2
ENSG00000112357 PEX7 280078 sc-eQTL 5.40e-01 -0.0895 0.146 0.118 NK_CD56bright L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 -764572 sc-eQTL 1.04e-01 0.135 0.0829 0.118 NK_CD56bright L2
ENSG00000197442 MAP3K5 310165 sc-eQTL 3.17e-01 0.127 0.127 0.118 NK_CD56bright L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 -765591 sc-eQTL 1.35e-01 0.199 0.132 0.118 NK_CD56bright L2
ENSG00000027697 IFNGR1 -116807 sc-eQTL 5.40e-02 0.165 0.0851 0.121 NK_CD56dim L2
ENSG00000029363 BCLAF1 812791 sc-eQTL 8.36e-01 0.0116 0.0561 0.121 NK_CD56dim L2
ENSG00000112357 PEX7 280078 sc-eQTL 4.87e-01 -0.103 0.148 0.121 NK_CD56dim L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 -764572 sc-eQTL 3.81e-01 -0.0708 0.0807 0.121 NK_CD56dim L2
ENSG00000197442 MAP3K5 310165 sc-eQTL 5.52e-02 0.222 0.115 0.121 NK_CD56dim L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 -765591 sc-eQTL 5.10e-02 0.235 0.12 0.121 NK_CD56dim L2
ENSG00000027697 IFNGR1 -116807 sc-eQTL 6.57e-01 0.0527 0.119 0.116 NK_HLA L2
ENSG00000029363 BCLAF1 812791 sc-eQTL 6.62e-01 -0.0439 0.1 0.116 NK_HLA L2
ENSG00000112357 PEX7 280078 sc-eQTL 7.10e-01 0.0561 0.151 0.116 NK_HLA L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 -764572 sc-eQTL 6.12e-01 0.0478 0.094 0.116 NK_HLA L2
ENSG00000197442 MAP3K5 310165 sc-eQTL 1.58e-01 0.211 0.149 0.116 NK_HLA L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 -765591 sc-eQTL 1.81e-02 0.356 0.15 0.116 NK_HLA L2
ENSG00000027697 IFNGR1 -116807 sc-eQTL 1.73e-01 0.126 0.0918 0.121 NK_cytokine L2
ENSG00000029363 BCLAF1 812791 sc-eQTL 1.31e-01 -0.104 0.0685 0.121 NK_cytokine L2
ENSG00000112357 PEX7 280078 sc-eQTL 1.44e-01 0.211 0.144 0.121 NK_cytokine L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 -764572 sc-eQTL 9.45e-01 0.00565 0.0824 0.121 NK_cytokine L2
ENSG00000197442 MAP3K5 310165 sc-eQTL 5.67e-02 0.215 0.112 0.121 NK_cytokine L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 -765591 sc-eQTL 4.52e-01 0.0935 0.124 0.121 NK_cytokine L2
ENSG00000027697 IFNGR1 -116807 sc-eQTL 4.33e-01 0.135 0.171 0.119 PB L2
ENSG00000029363 BCLAF1 812791 sc-eQTL 5.63e-01 0.0857 0.148 0.119 PB L2
ENSG00000112357 PEX7 280078 sc-eQTL 1.17e-01 0.275 0.174 0.119 PB L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 -764572 sc-eQTL 9.39e-01 0.0103 0.133 0.119 PB L2
ENSG00000197442 MAP3K5 310165 sc-eQTL 4.26e-01 -0.121 0.151 0.119 PB L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 -765591 sc-eQTL 6.17e-01 0.0802 0.16 0.119 PB L2
ENSG00000027697 IFNGR1 -116807 sc-eQTL 1.47e-01 -0.17 0.117 0.115 Pro_T L2
ENSG00000029363 BCLAF1 812791 sc-eQTL 5.39e-01 0.0749 0.122 0.115 Pro_T L2
ENSG00000112357 PEX7 280078 sc-eQTL 4.06e-01 0.118 0.142 0.115 Pro_T L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 -764572 sc-eQTL 2.40e-01 -0.0839 0.0713 0.115 Pro_T L2
ENSG00000146410 MTFR2 852307 sc-eQTL 5.19e-01 0.064 0.0991 0.115 Pro_T L2
ENSG00000197442 MAP3K5 310165 sc-eQTL 4.87e-01 0.0963 0.138 0.115 Pro_T L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 -765591 sc-eQTL 8.78e-02 -0.237 0.138 0.115 Pro_T L2
ENSG00000027697 IFNGR1 -116807 sc-eQTL 3.79e-01 0.113 0.129 0.12 Treg L2
ENSG00000029363 BCLAF1 812791 sc-eQTL 8.82e-01 0.0123 0.0832 0.12 Treg L2
ENSG00000112357 PEX7 280078 sc-eQTL 7.28e-01 0.0474 0.136 0.12 Treg L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 -764572 sc-eQTL 4.31e-01 -0.0646 0.0818 0.12 Treg L2
ENSG00000197442 MAP3K5 310165 sc-eQTL 2.55e-01 0.101 0.0885 0.12 Treg L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 -765591 sc-eQTL 2.48e-02 0.279 0.123 0.12 Treg L2
ENSG00000027697 IFNGR1 -116807 sc-eQTL 7.71e-02 0.194 0.109 0.124 cDC L2
ENSG00000029363 BCLAF1 812791 sc-eQTL 4.11e-01 -0.0912 0.111 0.124 cDC L2
ENSG00000112357 PEX7 280078 sc-eQTL 8.43e-01 -0.0282 0.142 0.124 cDC L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 -764572 sc-eQTL 8.38e-01 -0.0221 0.108 0.124 cDC L2
ENSG00000135525 MAP7 551823 sc-eQTL 3.16e-01 0.127 0.126 0.124 cDC L2
ENSG00000197442 MAP3K5 310165 sc-eQTL 9.08e-01 0.0129 0.112 0.124 cDC L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 -765591 sc-eQTL 3.83e-01 -0.123 0.141 0.124 cDC L2
ENSG00000286646 AL121933.2 318597 sc-eQTL 1.69e-01 -0.2 0.144 0.124 cDC L2
ENSG00000027697 IFNGR1 -116807 sc-eQTL 6.21e-01 -0.039 0.0788 0.12 cMono_IL1B L2
ENSG00000029363 BCLAF1 812791 sc-eQTL 1.11e-01 -0.134 0.0841 0.12 cMono_IL1B L2
ENSG00000112357 PEX7 280078 sc-eQTL 3.90e-01 -0.122 0.142 0.12 cMono_IL1B L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 -764572 sc-eQTL 5.02e-01 -0.0571 0.0848 0.12 cMono_IL1B L2
ENSG00000135525 MAP7 551823 sc-eQTL 2.44e-02 -0.274 0.121 0.12 cMono_IL1B L2
ENSG00000197442 MAP3K5 310165 sc-eQTL 6.43e-01 -0.0409 0.0882 0.12 cMono_IL1B L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 -765591 sc-eQTL 9.97e-01 0.000321 0.0906 0.12 cMono_IL1B L2
ENSG00000286646 AL121933.2 318597 sc-eQTL 2.03e-01 -0.144 0.113 0.12 cMono_IL1B L2
ENSG00000027697 IFNGR1 -116807 sc-eQTL 7.11e-01 -0.0336 0.0905 0.12 cMono_S100A L2
ENSG00000029363 BCLAF1 812791 sc-eQTL 9.13e-01 -0.0102 0.093 0.12 cMono_S100A L2
ENSG00000112357 PEX7 280078 sc-eQTL 7.40e-01 0.0483 0.145 0.12 cMono_S100A L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 -764572 sc-eQTL 1.21e-01 -0.125 0.08 0.12 cMono_S100A L2
ENSG00000135525 MAP7 551823 sc-eQTL 4.87e-01 -0.0941 0.135 0.12 cMono_S100A L2
ENSG00000197442 MAP3K5 310165 sc-eQTL 1.04e-01 -0.177 0.109 0.12 cMono_S100A L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 -765591 sc-eQTL 5.63e-01 -0.0668 0.115 0.12 cMono_S100A L2
ENSG00000286646 AL121933.2 318597 sc-eQTL 3.28e-01 -0.11 0.112 0.12 cMono_S100A L2
ENSG00000027697 IFNGR1 -116807 sc-eQTL 7.54e-01 0.041 0.131 0.13 gdT L2
ENSG00000029363 BCLAF1 812791 sc-eQTL 5.21e-01 0.074 0.115 0.13 gdT L2
ENSG00000112357 PEX7 280078 sc-eQTL 5.35e-01 0.103 0.165 0.13 gdT L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 -764572 sc-eQTL 2.13e-01 -0.0999 0.0799 0.13 gdT L2
ENSG00000146410 MTFR2 852307 sc-eQTL 5.22e-01 0.0813 0.127 0.13 gdT L2
ENSG00000197442 MAP3K5 310165 sc-eQTL 1.68e-01 0.234 0.169 0.13 gdT L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 -765591 sc-eQTL 5.77e-01 0.0813 0.145 0.13 gdT L2
ENSG00000027697 IFNGR1 -116807 sc-eQTL 2.44e-01 -0.115 0.0983 0.118 intMono L2
ENSG00000029363 BCLAF1 812791 sc-eQTL 9.89e-01 -0.0018 0.13 0.118 intMono L2
ENSG00000112357 PEX7 280078 sc-eQTL 4.86e-01 -0.0928 0.133 0.118 intMono L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 -764572 sc-eQTL 3.68e-01 -0.0766 0.085 0.118 intMono L2
ENSG00000135525 MAP7 551823 sc-eQTL 4.50e-01 0.0988 0.131 0.118 intMono L2
ENSG00000197442 MAP3K5 310165 sc-eQTL 2.88e-01 -0.147 0.138 0.118 intMono L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 -765591 sc-eQTL 8.33e-01 -0.0267 0.127 0.118 intMono L2
ENSG00000286646 AL121933.2 318597 sc-eQTL 6.19e-01 0.0727 0.146 0.118 intMono L2
ENSG00000027697 IFNGR1 -116807 sc-eQTL 8.71e-01 0.0188 0.115 0.113 ncMono L2
ENSG00000029363 BCLAF1 812791 sc-eQTL 9.39e-01 0.00683 0.0897 0.113 ncMono L2
ENSG00000112357 PEX7 280078 sc-eQTL 9.82e-01 -0.00317 0.143 0.113 ncMono L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 -764572 sc-eQTL 6.44e-02 -0.188 0.101 0.113 ncMono L2
ENSG00000135525 MAP7 551823 sc-eQTL 6.68e-02 0.231 0.125 0.113 ncMono L2
ENSG00000197442 MAP3K5 310165 sc-eQTL 5.08e-02 -0.258 0.131 0.113 ncMono L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 -765591 sc-eQTL 6.88e-01 0.0513 0.128 0.113 ncMono L2
ENSG00000286646 AL121933.2 318597 sc-eQTL 7.81e-01 0.0375 0.135 0.113 ncMono L2
ENSG00000027697 IFNGR1 -116807 sc-eQTL 1.92e-01 0.183 0.14 0.119 pDC L2
ENSG00000029363 BCLAF1 812791 sc-eQTL 7.23e-01 -0.0375 0.106 0.119 pDC L2
ENSG00000112357 PEX7 280078 sc-eQTL 8.56e-01 -0.0281 0.155 0.119 pDC L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 -764572 sc-eQTL 8.40e-01 -0.0264 0.131 0.119 pDC L2
ENSG00000135525 MAP7 551823 sc-eQTL 8.34e-01 0.0227 0.108 0.119 pDC L2
ENSG00000197442 MAP3K5 310165 sc-eQTL 5.19e-01 -0.112 0.173 0.119 pDC L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 -765591 sc-eQTL 3.05e-01 0.136 0.132 0.119 pDC L2
ENSG00000286646 AL121933.2 318597 sc-eQTL 1.30e-01 -0.242 0.159 0.119 pDC L2
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000027697 IFNGR1 -116807 sc-eQTL 9.94e-02 0.188 0.113 0.12 B_Memory LOneK1K
ENSG00000029363 BCLAF1 812791 sc-eQTL 9.00e-01 0.00808 0.0641 0.12 B_Memory LOneK1K
ENSG00000112357 PEX7 280078 sc-eQTL 8.70e-01 0.0215 0.131 0.12 B_Memory LOneK1K
ENSG00000118503 TNFAIP3 -764572 sc-eQTL 8.76e-01 0.0126 0.0805 0.12 B_Memory LOneK1K
ENSG00000197442 MAP3K5 310165 sc-eQTL 6.58e-01 0.0473 0.107 0.12 B_Memory LOneK1K
ENSG00000237499 WAKMAR2 -765591 sc-eQTL 6.60e-01 -0.0599 0.136 0.12 B_Memory LOneK1K
ENSG00000027697 IFNGR1 -116807 sc-eQTL 6.41e-01 0.054 0.116 0.12 B_Naive LOneK1K
ENSG00000029363 BCLAF1 812791 sc-eQTL 7.39e-01 -0.0177 0.0532 0.12 B_Naive LOneK1K
ENSG00000112357 PEX7 280078 sc-eQTL 8.39e-01 -0.0287 0.141 0.12 B_Naive LOneK1K
ENSG00000118503 TNFAIP3 -764572 sc-eQTL 7.11e-01 0.0246 0.0663 0.12 B_Naive LOneK1K
ENSG00000197442 MAP3K5 310165 sc-eQTL 8.48e-02 0.167 0.0965 0.12 B_Naive LOneK1K
ENSG00000237499 WAKMAR2 -765591 sc-eQTL 9.87e-01 -0.00186 0.118 0.12 B_Naive LOneK1K
ENSG00000027697 IFNGR1 -116807 sc-eQTL 7.24e-01 -0.028 0.0793 0.12 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000029363 BCLAF1 812791 sc-eQTL 2.26e-01 -0.0894 0.0735 0.12 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000112357 PEX7 280078 sc-eQTL 4.38e-01 -0.111 0.142 0.12 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000118503 TNFAIP3 -764572 sc-eQTL 6.22e-01 -0.0362 0.0733 0.12 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000135525 MAP7 551823 sc-eQTL 8.72e-02 -0.217 0.126 0.12 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000197442 MAP3K5 310165 sc-eQTL 3.13e-01 -0.0868 0.0857 0.12 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000237499 WAKMAR2 -765591 sc-eQTL 8.64e-01 -0.0151 0.0879 0.12 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000286646 AL121933.2 318597 sc-eQTL 9.86e-02 -0.169 0.102 0.12 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000027697 IFNGR1 -116807 sc-eQTL 4.39e-01 -0.0732 0.0945 0.121 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000029363 BCLAF1 812791 sc-eQTL 7.23e-01 -0.0304 0.0855 0.121 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000112357 PEX7 280078 sc-eQTL 4.99e-01 -0.0966 0.143 0.121 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000118503 TNFAIP3 -764572 sc-eQTL 2.19e-01 -0.109 0.0881 0.121 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000135525 MAP7 551823 sc-eQTL 7.77e-02 0.243 0.137 0.121 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000197442 MAP3K5 310165 sc-eQTL 9.55e-02 -0.189 0.113 0.121 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000237499 WAKMAR2 -765591 sc-eQTL 6.44e-01 0.0548 0.118 0.121 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000286646 AL121933.2 318597 sc-eQTL 3.94e-01 0.115 0.134 0.121 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000027697 IFNGR1 -116807 sc-eQTL 8.09e-02 0.153 0.0871 0.121 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000029363 BCLAF1 812791 sc-eQTL 4.29e-01 -0.0403 0.0509 0.121 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000112357 PEX7 280078 sc-eQTL 5.85e-01 0.0809 0.148 0.121 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000118503 TNFAIP3 -764572 sc-eQTL 3.26e-01 -0.0785 0.0798 0.121 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000197442 MAP3K5 310165 sc-eQTL 1.69e-02 0.257 0.107 0.121 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000237499 WAKMAR2 -765591 sc-eQTL 1.08e-01 0.18 0.111 0.121 NK_CD56dim LOneK1K


Statistical fine-mapping results from Japan COVID-19 Task Force
(Shown only for PIP>0.001)
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
PIP (SuSiE)
PIP (FINEMAP)
MAF
ENSG00000027697 IFNGR1 -116807 eQTL 0.0011 -0.0622 0.019 0.0 0.0 0.135
ENSG00000112357 PEX7 280078 eQTL 0.027 0.0823 0.0371 0.0 0.0 0.135


Expression Modifier Score(EMS) for GTEx 49tissues
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Whole Blood
Muscle Skeletal
Liver
Brain Cerebellum
Prostate
Spleen
Skin Sun Exposed Lower leg
Artery Coronary
Esophagus Muscularis
Esophagus Gastroesophageal Junction
Artery Tibial
Heart Atrial Appendage
Nerve Tibial
Heart Left Ventricle
Adrenal Gland
Adipose Visceral Omentum
Pancreas
Lung
Pituitary
Brain Nucleus accumbens basal ganglia
Colon Transverse
Adipose Subcutaneous
Esophagus Mucosa
Brain Cortex
Thyroid
Stomach
Breast Mammary Tissue
Colon Sigmoid
Skin Not Sun Exposed Suprapubic
Testis
Artery Aorta
Brain Amygdala
Brain Anterior cingulate cortex BA24
Brain Caudate basal ganglia
Brain Cerebellar Hemisphere
Brain Frontal Cortex BA9
Brain Hippocampus
Brain Hypothalamus
Brain Putamen basal ganglia
Brain Spinal cord cervical c-1
Brain Substantia nigra
Cells Cultured fibroblasts
Cells EBV-transformed lymphocytes
Kidney Cortex
Minor Salivary Gland
Ovary
Small Intestine Terminal Ileum
Uterus
Vagina
ENSG00000027697 IFNGR1 -116807 1.54e-05 1.66e-05 3.02e-06 5.59e-06 2.6e-06 5.65e-06 1.83e-05 1.54e-06 1.05e-05 5.38e-06 1.76e-05 6.79e-06 1.81e-05 5.63e-06 3.58e-06 8.56e-06 8.2e-06 9.74e-06 3.37e-06 2.74e-06 6.46e-06 1.06e-05 1.47e-05 3.43e-06 1.98e-05 4.4e-06 6.2e-06 3.68e-06 1.5e-05 1.46e-05 8.2e-06 1.07e-06 1.1e-06 3.24e-06 4.34e-06 2.74e-06 1.86e-06 2.13e-06 2.11e-06 7.73e-07 7.24e-07 1.83e-05 4.93e-06 2.27e-07 2.01e-06 1.74e-06 1.75e-06 8.91e-07 4.59e-07