Genes within 1Mb (chr6:137099603:A:G):

View on , UCSC , GTEx , gnomAD


Immune cell-type specific single cell cis-eQTLs in OASIS
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000027697 IFNGR1 -119846 sc-eQTL 6.44e-01 0.0509 0.11 0.12 B L1
ENSG00000029363 BCLAF1 809752 sc-eQTL 9.61e-01 -0.00242 0.0489 0.12 B L1
ENSG00000112357 PEX7 277039 sc-eQTL 8.51e-01 0.0245 0.13 0.12 B L1
ENSG00000118503 TNFAIP3 -767611 sc-eQTL 8.24e-01 0.0155 0.0693 0.12 B L1
ENSG00000197442 MAP3K5 307126 sc-eQTL 9.54e-01 -0.00563 0.0966 0.12 B L1
ENSG00000237499 WAKMAR2 -768630 sc-eQTL 6.89e-01 0.0437 0.109 0.12 B L1
ENSG00000027697 IFNGR1 -119846 sc-eQTL 5.74e-01 0.0412 0.0732 0.12 CD4T L1
ENSG00000029363 BCLAF1 809752 sc-eQTL 7.58e-02 -0.0981 0.055 0.12 CD4T L1
ENSG00000112357 PEX7 277039 sc-eQTL 8.94e-01 0.0157 0.118 0.12 CD4T L1
ENSG00000118503 TNFAIP3 -767611 sc-eQTL 2.64e-01 -0.0828 0.074 0.12 CD4T L1
ENSG00000197442 MAP3K5 307126 sc-eQTL 4.09e-01 0.0467 0.0564 0.12 CD4T L1
ENSG00000237499 WAKMAR2 -768630 sc-eQTL 7.65e-01 0.028 0.0934 0.12 CD4T L1
ENSG00000027697 IFNGR1 -119846 sc-eQTL 1.47e-02 0.202 0.0821 0.12 CD8T L1
ENSG00000029363 BCLAF1 809752 sc-eQTL 2.64e-02 -0.125 0.0557 0.12 CD8T L1
ENSG00000112357 PEX7 277039 sc-eQTL 2.80e-01 0.15 0.139 0.12 CD8T L1
ENSG00000118503 TNFAIP3 -767611 sc-eQTL 2.77e-01 -0.0762 0.0699 0.12 CD8T L1
ENSG00000197442 MAP3K5 307126 sc-eQTL 7.49e-01 0.0238 0.0741 0.12 CD8T L1
ENSG00000237499 WAKMAR2 -768630 sc-eQTL 9.29e-01 -0.00919 0.103 0.12 CD8T L1
ENSG00000027697 IFNGR1 -119846 sc-eQTL 2.52e-01 0.118 0.103 0.122 DC L1
ENSG00000029363 BCLAF1 809752 sc-eQTL 6.40e-01 -0.0435 0.093 0.122 DC L1
ENSG00000112357 PEX7 277039 sc-eQTL 6.79e-01 -0.0603 0.146 0.122 DC L1
ENSG00000118503 TNFAIP3 -767611 sc-eQTL 9.23e-01 -0.0108 0.11 0.122 DC L1
ENSG00000135525 MAP7 548784 sc-eQTL 5.82e-01 0.0658 0.12 0.122 DC L1
ENSG00000197442 MAP3K5 307126 sc-eQTL 3.44e-01 0.109 0.114 0.122 DC L1
ENSG00000237499 WAKMAR2 -768630 sc-eQTL 5.01e-01 -0.0759 0.112 0.122 DC L1
ENSG00000286646 AL121933.2 315558 sc-eQTL 4.90e-02 -0.294 0.148 0.122 DC L1
ENSG00000027697 IFNGR1 -119846 sc-eQTL 9.61e-01 -0.00411 0.0839 0.12 Mono L1
ENSG00000029363 BCLAF1 809752 sc-eQTL 2.76e-01 -0.0781 0.0715 0.12 Mono L1
ENSG00000112357 PEX7 277039 sc-eQTL 4.72e-01 -0.102 0.141 0.12 Mono L1
ENSG00000118503 TNFAIP3 -767611 sc-eQTL 8.48e-01 -0.0136 0.0712 0.12 Mono L1
ENSG00000135525 MAP7 548784 sc-eQTL 5.05e-01 -0.083 0.124 0.12 Mono L1
ENSG00000197442 MAP3K5 307126 sc-eQTL 1.62e-01 -0.116 0.0827 0.12 Mono L1
ENSG00000237499 WAKMAR2 -768630 sc-eQTL 9.50e-01 -0.0055 0.0882 0.12 Mono L1
ENSG00000286646 AL121933.2 315558 sc-eQTL 2.14e-01 -0.125 0.1 0.12 Mono L1
ENSG00000027697 IFNGR1 -119846 sc-eQTL 1.58e-01 0.131 0.0927 0.12 NK L1
ENSG00000029363 BCLAF1 809752 sc-eQTL 3.21e-01 -0.049 0.0493 0.12 NK L1
ENSG00000112357 PEX7 277039 sc-eQTL 5.74e-01 0.0808 0.144 0.12 NK L1
ENSG00000118503 TNFAIP3 -767611 sc-eQTL 3.80e-01 -0.068 0.0774 0.12 NK L1
ENSG00000197442 MAP3K5 307126 sc-eQTL 1.18e-02 0.278 0.109 0.12 NK L1
ENSG00000237499 WAKMAR2 -768630 sc-eQTL 5.74e-02 0.208 0.109 0.12 NK L1
ENSG00000027697 IFNGR1 -119846 sc-eQTL 3.97e-01 0.0733 0.0865 0.12 Other_T L1
ENSG00000029363 BCLAF1 809752 sc-eQTL 4.24e-01 -0.0582 0.0725 0.12 Other_T L1
ENSG00000112357 PEX7 277039 sc-eQTL 7.35e-01 0.0479 0.141 0.12 Other_T L1
ENSG00000118503 TNFAIP3 -767611 sc-eQTL 8.48e-01 -0.0104 0.0539 0.12 Other_T L1
ENSG00000146410 MTFR2 849268 sc-eQTL 5.78e-01 -0.0454 0.0816 0.12 Other_T L1
ENSG00000197442 MAP3K5 307126 sc-eQTL 2.38e-01 0.123 0.104 0.12 Other_T L1
ENSG00000237499 WAKMAR2 -768630 sc-eQTL 7.48e-01 0.0344 0.107 0.12 Other_T L1
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000027697 IFNGR1 -119846 sc-eQTL 1.88e-01 0.187 0.142 0.128 B_Activated L2
ENSG00000029363 BCLAF1 809752 sc-eQTL 9.85e-01 0.00211 0.116 0.128 B_Activated L2
ENSG00000112357 PEX7 277039 sc-eQTL 2.12e-01 0.174 0.139 0.128 B_Activated L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 -767611 sc-eQTL 3.75e-02 0.291 0.139 0.128 B_Activated L2
ENSG00000197442 MAP3K5 307126 sc-eQTL 4.99e-01 -0.107 0.157 0.128 B_Activated L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 -768630 sc-eQTL 2.23e-01 0.149 0.122 0.128 B_Activated L2
ENSG00000027697 IFNGR1 -119846 sc-eQTL 6.24e-02 0.237 0.127 0.12 B_Intermediate L2
ENSG00000029363 BCLAF1 809752 sc-eQTL 8.45e-01 -0.0142 0.0726 0.12 B_Intermediate L2
ENSG00000112357 PEX7 277039 sc-eQTL 4.51e-01 0.101 0.133 0.12 B_Intermediate L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 -767611 sc-eQTL 7.16e-01 0.0347 0.0954 0.12 B_Intermediate L2
ENSG00000197442 MAP3K5 307126 sc-eQTL 8.10e-01 -0.0278 0.115 0.12 B_Intermediate L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 -768630 sc-eQTL 3.60e-01 -0.124 0.135 0.12 B_Intermediate L2
ENSG00000027697 IFNGR1 -119846 sc-eQTL 3.51e-01 0.128 0.137 0.121 B_Memory L2
ENSG00000029363 BCLAF1 809752 sc-eQTL 5.40e-02 0.157 0.081 0.121 B_Memory L2
ENSG00000112357 PEX7 277039 sc-eQTL 7.54e-01 -0.0436 0.139 0.121 B_Memory L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 -767611 sc-eQTL 9.23e-01 0.00874 0.09 0.121 B_Memory L2
ENSG00000197442 MAP3K5 307126 sc-eQTL 9.29e-02 0.206 0.122 0.121 B_Memory L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 -768630 sc-eQTL 3.34e-01 -0.129 0.134 0.121 B_Memory L2
ENSG00000027697 IFNGR1 -119846 sc-eQTL 9.04e-01 0.0135 0.112 0.12 B_Naive1 L2
ENSG00000029363 BCLAF1 809752 sc-eQTL 3.62e-01 -0.0585 0.064 0.12 B_Naive1 L2
ENSG00000112357 PEX7 277039 sc-eQTL 9.33e-01 0.0124 0.148 0.12 B_Naive1 L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 -767611 sc-eQTL 5.06e-01 0.05 0.075 0.12 B_Naive1 L2
ENSG00000197442 MAP3K5 307126 sc-eQTL 1.80e-01 0.141 0.105 0.12 B_Naive1 L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 -768630 sc-eQTL 4.94e-01 -0.0806 0.118 0.12 B_Naive1 L2
ENSG00000027697 IFNGR1 -119846 sc-eQTL 5.10e-01 0.0869 0.132 0.12 B_Naive2 L2
ENSG00000029363 BCLAF1 809752 sc-eQTL 6.04e-01 0.0397 0.0764 0.12 B_Naive2 L2
ENSG00000112357 PEX7 277039 sc-eQTL 9.96e-01 -0.00081 0.144 0.12 B_Naive2 L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 -767611 sc-eQTL 8.64e-01 -0.018 0.105 0.12 B_Naive2 L2
ENSG00000197442 MAP3K5 307126 sc-eQTL 9.53e-01 0.00656 0.112 0.12 B_Naive2 L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 -768630 sc-eQTL 6.72e-01 0.0575 0.136 0.12 B_Naive2 L2
ENSG00000027697 IFNGR1 -119846 sc-eQTL 6.87e-01 0.0496 0.123 0.123 CD4_CTL L2
ENSG00000029363 BCLAF1 809752 sc-eQTL 6.50e-01 0.0496 0.109 0.123 CD4_CTL L2
ENSG00000112357 PEX7 277039 sc-eQTL 3.12e-01 -0.138 0.136 0.123 CD4_CTL L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 -767611 sc-eQTL 6.88e-02 0.146 0.08 0.123 CD4_CTL L2
ENSG00000197442 MAP3K5 307126 sc-eQTL 3.86e-01 0.112 0.129 0.123 CD4_CTL L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 -768630 sc-eQTL 9.59e-01 -0.0064 0.126 0.123 CD4_CTL L2
ENSG00000027697 IFNGR1 -119846 sc-eQTL 7.44e-01 0.0226 0.0694 0.12 CD4_Naive L2
ENSG00000029363 BCLAF1 809752 sc-eQTL 9.53e-02 -0.0928 0.0554 0.12 CD4_Naive L2
ENSG00000112357 PEX7 277039 sc-eQTL 5.49e-01 0.0785 0.131 0.12 CD4_Naive L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 -767611 sc-eQTL 3.63e-01 -0.0691 0.0757 0.12 CD4_Naive L2
ENSG00000197442 MAP3K5 307126 sc-eQTL 8.65e-01 -0.00947 0.0557 0.12 CD4_Naive L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 -768630 sc-eQTL 7.36e-01 0.0331 0.0982 0.12 CD4_Naive L2
ENSG00000027697 IFNGR1 -119846 sc-eQTL 4.07e-01 0.0803 0.0966 0.12 CD4_TCM L2
ENSG00000029363 BCLAF1 809752 sc-eQTL 8.86e-02 -0.104 0.0606 0.12 CD4_TCM L2
ENSG00000112357 PEX7 277039 sc-eQTL 9.64e-01 0.00642 0.142 0.12 CD4_TCM L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 -767611 sc-eQTL 3.91e-01 -0.0599 0.0696 0.12 CD4_TCM L2
ENSG00000197442 MAP3K5 307126 sc-eQTL 3.66e-02 0.165 0.0786 0.12 CD4_TCM L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 -768630 sc-eQTL 6.81e-01 0.0402 0.0977 0.12 CD4_TCM L2
ENSG00000027697 IFNGR1 -119846 sc-eQTL 3.33e-01 -0.106 0.109 0.12 CD4_TEM L2
ENSG00000029363 BCLAF1 809752 sc-eQTL 4.58e-01 -0.0575 0.0773 0.12 CD4_TEM L2
ENSG00000112357 PEX7 277039 sc-eQTL 8.24e-01 -0.0313 0.141 0.12 CD4_TEM L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 -767611 sc-eQTL 8.88e-01 -0.0102 0.0725 0.12 CD4_TEM L2
ENSG00000197442 MAP3K5 307126 sc-eQTL 2.41e-02 0.251 0.111 0.12 CD4_TEM L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 -768630 sc-eQTL 9.20e-01 0.0118 0.116 0.12 CD4_TEM L2
ENSG00000027697 IFNGR1 -119846 sc-eQTL 5.75e-03 0.273 0.0978 0.12 CD8_CTL L2
ENSG00000029363 BCLAF1 809752 sc-eQTL 2.75e-01 -0.0725 0.0662 0.12 CD8_CTL L2
ENSG00000112357 PEX7 277039 sc-eQTL 6.98e-01 -0.0532 0.137 0.12 CD8_CTL L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 -767611 sc-eQTL 7.90e-01 -0.0223 0.0838 0.12 CD8_CTL L2
ENSG00000197442 MAP3K5 307126 sc-eQTL 8.43e-01 0.0234 0.118 0.12 CD8_CTL L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 -768630 sc-eQTL 6.78e-01 0.049 0.118 0.12 CD8_CTL L2
ENSG00000027697 IFNGR1 -119846 sc-eQTL 7.60e-01 0.0304 0.0991 0.12 CD8_Naive L2
ENSG00000029363 BCLAF1 809752 sc-eQTL 2.66e-01 -0.077 0.069 0.12 CD8_Naive L2
ENSG00000112357 PEX7 277039 sc-eQTL 2.27e-01 0.173 0.143 0.12 CD8_Naive L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 -767611 sc-eQTL 7.98e-01 -0.0199 0.0775 0.12 CD8_Naive L2
ENSG00000197442 MAP3K5 307126 sc-eQTL 9.08e-01 -0.0107 0.0919 0.12 CD8_Naive L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 -768630 sc-eQTL 4.34e-01 -0.0898 0.114 0.12 CD8_Naive L2
ENSG00000027697 IFNGR1 -119846 sc-eQTL 8.45e-01 -0.0265 0.136 0.118 CD8_TCM L2
ENSG00000029363 BCLAF1 809752 sc-eQTL 1.75e-01 0.138 0.101 0.118 CD8_TCM L2
ENSG00000112357 PEX7 277039 sc-eQTL 5.79e-01 0.0864 0.155 0.118 CD8_TCM L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 -767611 sc-eQTL 4.13e-01 0.0602 0.0733 0.118 CD8_TCM L2
ENSG00000197442 MAP3K5 307126 sc-eQTL 1.41e-01 0.193 0.13 0.118 CD8_TCM L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 -768630 sc-eQTL 9.39e-01 0.0103 0.134 0.118 CD8_TCM L2
ENSG00000027697 IFNGR1 -119846 sc-eQTL 2.47e-01 0.142 0.122 0.126 CD8_TEM L2
ENSG00000029363 BCLAF1 809752 sc-eQTL 8.24e-02 0.2 0.115 0.126 CD8_TEM L2
ENSG00000112357 PEX7 277039 sc-eQTL 1.36e-01 0.21 0.14 0.126 CD8_TEM L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 -767611 sc-eQTL 2.92e-01 0.0952 0.0901 0.126 CD8_TEM L2
ENSG00000197442 MAP3K5 307126 sc-eQTL 3.58e-01 0.129 0.139 0.126 CD8_TEM L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 -768630 sc-eQTL 6.47e-01 0.0615 0.134 0.126 CD8_TEM L2
ENSG00000027697 IFNGR1 -119846 sc-eQTL 2.77e-01 0.107 0.0982 0.121 MAIT L2
ENSG00000029363 BCLAF1 809752 sc-eQTL 6.44e-02 -0.151 0.0811 0.121 MAIT L2
ENSG00000112357 PEX7 277039 sc-eQTL 8.10e-01 -0.0321 0.134 0.121 MAIT L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 -767611 sc-eQTL 9.84e-01 -0.00137 0.0663 0.121 MAIT L2
ENSG00000146410 MTFR2 849268 sc-eQTL 7.18e-01 -0.0399 0.11 0.121 MAIT L2
ENSG00000197442 MAP3K5 307126 sc-eQTL 9.58e-01 -0.00608 0.115 0.121 MAIT L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 -768630 sc-eQTL 8.89e-01 0.0172 0.123 0.121 MAIT L2
ENSG00000027697 IFNGR1 -119846 sc-eQTL 4.70e-01 0.0809 0.112 0.118 NK_CD56bright L2
ENSG00000029363 BCLAF1 809752 sc-eQTL 9.29e-01 -0.0074 0.0826 0.118 NK_CD56bright L2
ENSG00000112357 PEX7 277039 sc-eQTL 5.40e-01 -0.0895 0.146 0.118 NK_CD56bright L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 -767611 sc-eQTL 1.04e-01 0.135 0.0829 0.118 NK_CD56bright L2
ENSG00000197442 MAP3K5 307126 sc-eQTL 3.17e-01 0.127 0.127 0.118 NK_CD56bright L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 -768630 sc-eQTL 1.35e-01 0.199 0.132 0.118 NK_CD56bright L2
ENSG00000027697 IFNGR1 -119846 sc-eQTL 5.40e-02 0.165 0.0851 0.121 NK_CD56dim L2
ENSG00000029363 BCLAF1 809752 sc-eQTL 8.36e-01 0.0116 0.0561 0.121 NK_CD56dim L2
ENSG00000112357 PEX7 277039 sc-eQTL 4.87e-01 -0.103 0.148 0.121 NK_CD56dim L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 -767611 sc-eQTL 3.81e-01 -0.0708 0.0807 0.121 NK_CD56dim L2
ENSG00000197442 MAP3K5 307126 sc-eQTL 5.52e-02 0.222 0.115 0.121 NK_CD56dim L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 -768630 sc-eQTL 5.10e-02 0.235 0.12 0.121 NK_CD56dim L2
ENSG00000027697 IFNGR1 -119846 sc-eQTL 6.57e-01 0.0527 0.119 0.116 NK_HLA L2
ENSG00000029363 BCLAF1 809752 sc-eQTL 6.62e-01 -0.0439 0.1 0.116 NK_HLA L2
ENSG00000112357 PEX7 277039 sc-eQTL 7.10e-01 0.0561 0.151 0.116 NK_HLA L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 -767611 sc-eQTL 6.12e-01 0.0478 0.094 0.116 NK_HLA L2
ENSG00000197442 MAP3K5 307126 sc-eQTL 1.58e-01 0.211 0.149 0.116 NK_HLA L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 -768630 sc-eQTL 1.81e-02 0.356 0.15 0.116 NK_HLA L2
ENSG00000027697 IFNGR1 -119846 sc-eQTL 1.73e-01 0.126 0.0918 0.121 NK_cytokine L2
ENSG00000029363 BCLAF1 809752 sc-eQTL 1.31e-01 -0.104 0.0685 0.121 NK_cytokine L2
ENSG00000112357 PEX7 277039 sc-eQTL 1.44e-01 0.211 0.144 0.121 NK_cytokine L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 -767611 sc-eQTL 9.45e-01 0.00565 0.0824 0.121 NK_cytokine L2
ENSG00000197442 MAP3K5 307126 sc-eQTL 5.67e-02 0.215 0.112 0.121 NK_cytokine L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 -768630 sc-eQTL 4.52e-01 0.0935 0.124 0.121 NK_cytokine L2
ENSG00000027697 IFNGR1 -119846 sc-eQTL 4.33e-01 0.135 0.171 0.119 PB L2
ENSG00000029363 BCLAF1 809752 sc-eQTL 5.63e-01 0.0857 0.148 0.119 PB L2
ENSG00000112357 PEX7 277039 sc-eQTL 1.17e-01 0.275 0.174 0.119 PB L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 -767611 sc-eQTL 9.39e-01 0.0103 0.133 0.119 PB L2
ENSG00000197442 MAP3K5 307126 sc-eQTL 4.26e-01 -0.121 0.151 0.119 PB L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 -768630 sc-eQTL 6.17e-01 0.0802 0.16 0.119 PB L2
ENSG00000027697 IFNGR1 -119846 sc-eQTL 1.47e-01 -0.17 0.117 0.115 Pro_T L2
ENSG00000029363 BCLAF1 809752 sc-eQTL 5.39e-01 0.0749 0.122 0.115 Pro_T L2
ENSG00000112357 PEX7 277039 sc-eQTL 4.06e-01 0.118 0.142 0.115 Pro_T L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 -767611 sc-eQTL 2.40e-01 -0.0839 0.0713 0.115 Pro_T L2
ENSG00000146410 MTFR2 849268 sc-eQTL 5.19e-01 0.064 0.0991 0.115 Pro_T L2
ENSG00000197442 MAP3K5 307126 sc-eQTL 4.87e-01 0.0963 0.138 0.115 Pro_T L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 -768630 sc-eQTL 8.78e-02 -0.237 0.138 0.115 Pro_T L2
ENSG00000027697 IFNGR1 -119846 sc-eQTL 3.79e-01 0.113 0.129 0.12 Treg L2
ENSG00000029363 BCLAF1 809752 sc-eQTL 8.82e-01 0.0123 0.0832 0.12 Treg L2
ENSG00000112357 PEX7 277039 sc-eQTL 7.28e-01 0.0474 0.136 0.12 Treg L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 -767611 sc-eQTL 4.31e-01 -0.0646 0.0818 0.12 Treg L2
ENSG00000197442 MAP3K5 307126 sc-eQTL 2.55e-01 0.101 0.0885 0.12 Treg L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 -768630 sc-eQTL 2.48e-02 0.279 0.123 0.12 Treg L2
ENSG00000027697 IFNGR1 -119846 sc-eQTL 7.71e-02 0.194 0.109 0.124 cDC L2
ENSG00000029363 BCLAF1 809752 sc-eQTL 4.11e-01 -0.0912 0.111 0.124 cDC L2
ENSG00000112357 PEX7 277039 sc-eQTL 8.43e-01 -0.0282 0.142 0.124 cDC L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 -767611 sc-eQTL 8.38e-01 -0.0221 0.108 0.124 cDC L2
ENSG00000135525 MAP7 548784 sc-eQTL 3.16e-01 0.127 0.126 0.124 cDC L2
ENSG00000197442 MAP3K5 307126 sc-eQTL 9.08e-01 0.0129 0.112 0.124 cDC L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 -768630 sc-eQTL 3.83e-01 -0.123 0.141 0.124 cDC L2
ENSG00000286646 AL121933.2 315558 sc-eQTL 1.69e-01 -0.2 0.144 0.124 cDC L2
ENSG00000027697 IFNGR1 -119846 sc-eQTL 6.21e-01 -0.039 0.0788 0.12 cMono_IL1B L2
ENSG00000029363 BCLAF1 809752 sc-eQTL 1.11e-01 -0.134 0.0841 0.12 cMono_IL1B L2
ENSG00000112357 PEX7 277039 sc-eQTL 3.90e-01 -0.122 0.142 0.12 cMono_IL1B L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 -767611 sc-eQTL 5.02e-01 -0.0571 0.0848 0.12 cMono_IL1B L2
ENSG00000135525 MAP7 548784 sc-eQTL 2.44e-02 -0.274 0.121 0.12 cMono_IL1B L2
ENSG00000197442 MAP3K5 307126 sc-eQTL 6.43e-01 -0.0409 0.0882 0.12 cMono_IL1B L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 -768630 sc-eQTL 9.97e-01 0.000321 0.0906 0.12 cMono_IL1B L2
ENSG00000286646 AL121933.2 315558 sc-eQTL 2.03e-01 -0.144 0.113 0.12 cMono_IL1B L2
ENSG00000027697 IFNGR1 -119846 sc-eQTL 7.11e-01 -0.0336 0.0905 0.12 cMono_S100A L2
ENSG00000029363 BCLAF1 809752 sc-eQTL 9.13e-01 -0.0102 0.093 0.12 cMono_S100A L2
ENSG00000112357 PEX7 277039 sc-eQTL 7.40e-01 0.0483 0.145 0.12 cMono_S100A L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 -767611 sc-eQTL 1.21e-01 -0.125 0.08 0.12 cMono_S100A L2
ENSG00000135525 MAP7 548784 sc-eQTL 4.87e-01 -0.0941 0.135 0.12 cMono_S100A L2
ENSG00000197442 MAP3K5 307126 sc-eQTL 1.04e-01 -0.177 0.109 0.12 cMono_S100A L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 -768630 sc-eQTL 5.63e-01 -0.0668 0.115 0.12 cMono_S100A L2
ENSG00000286646 AL121933.2 315558 sc-eQTL 3.28e-01 -0.11 0.112 0.12 cMono_S100A L2
ENSG00000027697 IFNGR1 -119846 sc-eQTL 7.54e-01 0.041 0.131 0.13 gdT L2
ENSG00000029363 BCLAF1 809752 sc-eQTL 5.21e-01 0.074 0.115 0.13 gdT L2
ENSG00000112357 PEX7 277039 sc-eQTL 5.35e-01 0.103 0.165 0.13 gdT L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 -767611 sc-eQTL 2.13e-01 -0.0999 0.0799 0.13 gdT L2
ENSG00000146410 MTFR2 849268 sc-eQTL 5.22e-01 0.0813 0.127 0.13 gdT L2
ENSG00000197442 MAP3K5 307126 sc-eQTL 1.68e-01 0.234 0.169 0.13 gdT L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 -768630 sc-eQTL 5.77e-01 0.0813 0.145 0.13 gdT L2
ENSG00000027697 IFNGR1 -119846 sc-eQTL 2.44e-01 -0.115 0.0983 0.118 intMono L2
ENSG00000029363 BCLAF1 809752 sc-eQTL 9.89e-01 -0.0018 0.13 0.118 intMono L2
ENSG00000112357 PEX7 277039 sc-eQTL 4.86e-01 -0.0928 0.133 0.118 intMono L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 -767611 sc-eQTL 3.68e-01 -0.0766 0.085 0.118 intMono L2
ENSG00000135525 MAP7 548784 sc-eQTL 4.50e-01 0.0988 0.131 0.118 intMono L2
ENSG00000197442 MAP3K5 307126 sc-eQTL 2.88e-01 -0.147 0.138 0.118 intMono L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 -768630 sc-eQTL 8.33e-01 -0.0267 0.127 0.118 intMono L2
ENSG00000286646 AL121933.2 315558 sc-eQTL 6.19e-01 0.0727 0.146 0.118 intMono L2
ENSG00000027697 IFNGR1 -119846 sc-eQTL 8.71e-01 0.0188 0.115 0.113 ncMono L2
ENSG00000029363 BCLAF1 809752 sc-eQTL 9.39e-01 0.00683 0.0897 0.113 ncMono L2
ENSG00000112357 PEX7 277039 sc-eQTL 9.82e-01 -0.00317 0.143 0.113 ncMono L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 -767611 sc-eQTL 6.44e-02 -0.188 0.101 0.113 ncMono L2
ENSG00000135525 MAP7 548784 sc-eQTL 6.68e-02 0.231 0.125 0.113 ncMono L2
ENSG00000197442 MAP3K5 307126 sc-eQTL 5.08e-02 -0.258 0.131 0.113 ncMono L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 -768630 sc-eQTL 6.88e-01 0.0513 0.128 0.113 ncMono L2
ENSG00000286646 AL121933.2 315558 sc-eQTL 7.81e-01 0.0375 0.135 0.113 ncMono L2
ENSG00000027697 IFNGR1 -119846 sc-eQTL 1.92e-01 0.183 0.14 0.119 pDC L2
ENSG00000029363 BCLAF1 809752 sc-eQTL 7.23e-01 -0.0375 0.106 0.119 pDC L2
ENSG00000112357 PEX7 277039 sc-eQTL 8.56e-01 -0.0281 0.155 0.119 pDC L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 -767611 sc-eQTL 8.40e-01 -0.0264 0.131 0.119 pDC L2
ENSG00000135525 MAP7 548784 sc-eQTL 8.34e-01 0.0227 0.108 0.119 pDC L2
ENSG00000197442 MAP3K5 307126 sc-eQTL 5.19e-01 -0.112 0.173 0.119 pDC L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 -768630 sc-eQTL 3.05e-01 0.136 0.132 0.119 pDC L2
ENSG00000286646 AL121933.2 315558 sc-eQTL 1.30e-01 -0.242 0.159 0.119 pDC L2
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000027697 IFNGR1 -119846 sc-eQTL 9.94e-02 0.188 0.113 0.12 B_Memory LOneK1K
ENSG00000029363 BCLAF1 809752 sc-eQTL 9.00e-01 0.00808 0.0641 0.12 B_Memory LOneK1K
ENSG00000112357 PEX7 277039 sc-eQTL 8.70e-01 0.0215 0.131 0.12 B_Memory LOneK1K
ENSG00000118503 TNFAIP3 -767611 sc-eQTL 8.76e-01 0.0126 0.0805 0.12 B_Memory LOneK1K
ENSG00000197442 MAP3K5 307126 sc-eQTL 6.58e-01 0.0473 0.107 0.12 B_Memory LOneK1K
ENSG00000237499 WAKMAR2 -768630 sc-eQTL 6.60e-01 -0.0599 0.136 0.12 B_Memory LOneK1K
ENSG00000027697 IFNGR1 -119846 sc-eQTL 6.41e-01 0.054 0.116 0.12 B_Naive LOneK1K
ENSG00000029363 BCLAF1 809752 sc-eQTL 7.39e-01 -0.0177 0.0532 0.12 B_Naive LOneK1K
ENSG00000112357 PEX7 277039 sc-eQTL 8.39e-01 -0.0287 0.141 0.12 B_Naive LOneK1K
ENSG00000118503 TNFAIP3 -767611 sc-eQTL 7.11e-01 0.0246 0.0663 0.12 B_Naive LOneK1K
ENSG00000197442 MAP3K5 307126 sc-eQTL 8.48e-02 0.167 0.0965 0.12 B_Naive LOneK1K
ENSG00000237499 WAKMAR2 -768630 sc-eQTL 9.87e-01 -0.00186 0.118 0.12 B_Naive LOneK1K
ENSG00000027697 IFNGR1 -119846 sc-eQTL 7.24e-01 -0.028 0.0793 0.12 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000029363 BCLAF1 809752 sc-eQTL 2.26e-01 -0.0894 0.0735 0.12 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000112357 PEX7 277039 sc-eQTL 4.38e-01 -0.111 0.142 0.12 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000118503 TNFAIP3 -767611 sc-eQTL 6.22e-01 -0.0362 0.0733 0.12 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000135525 MAP7 548784 sc-eQTL 8.72e-02 -0.217 0.126 0.12 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000197442 MAP3K5 307126 sc-eQTL 3.13e-01 -0.0868 0.0857 0.12 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000237499 WAKMAR2 -768630 sc-eQTL 8.64e-01 -0.0151 0.0879 0.12 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000286646 AL121933.2 315558 sc-eQTL 9.86e-02 -0.169 0.102 0.12 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000027697 IFNGR1 -119846 sc-eQTL 4.39e-01 -0.0732 0.0945 0.121 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000029363 BCLAF1 809752 sc-eQTL 7.23e-01 -0.0304 0.0855 0.121 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000112357 PEX7 277039 sc-eQTL 4.99e-01 -0.0966 0.143 0.121 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000118503 TNFAIP3 -767611 sc-eQTL 2.19e-01 -0.109 0.0881 0.121 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000135525 MAP7 548784 sc-eQTL 7.77e-02 0.243 0.137 0.121 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000197442 MAP3K5 307126 sc-eQTL 9.55e-02 -0.189 0.113 0.121 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000237499 WAKMAR2 -768630 sc-eQTL 6.44e-01 0.0548 0.118 0.121 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000286646 AL121933.2 315558 sc-eQTL 3.94e-01 0.115 0.134 0.121 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000027697 IFNGR1 -119846 sc-eQTL 8.09e-02 0.153 0.0871 0.121 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000029363 BCLAF1 809752 sc-eQTL 4.29e-01 -0.0403 0.0509 0.121 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000112357 PEX7 277039 sc-eQTL 5.85e-01 0.0809 0.148 0.121 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000118503 TNFAIP3 -767611 sc-eQTL 3.26e-01 -0.0785 0.0798 0.121 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000197442 MAP3K5 307126 sc-eQTL 1.69e-02 0.257 0.107 0.121 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000237499 WAKMAR2 -768630 sc-eQTL 1.08e-01 0.18 0.111 0.121 NK_CD56dim LOneK1K


Statistical fine-mapping results from Japan COVID-19 Task Force
(Shown only for PIP>0.001)
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
PIP (SuSiE)
PIP (FINEMAP)
MAF
ENSG00000027697 IFNGR1 -119846 eQTL 0.00115 -0.0621 0.019 0.0 0.0 0.136
ENSG00000112357 PEX7 277039 eQTL 0.0268 0.0825 0.0372 0.0 0.0 0.136


Expression Modifier Score(EMS) for GTEx 49tissues
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Whole Blood
Muscle Skeletal
Liver
Brain Cerebellum
Prostate
Spleen
Skin Sun Exposed Lower leg
Artery Coronary
Esophagus Muscularis
Esophagus Gastroesophageal Junction
Artery Tibial
Heart Atrial Appendage
Nerve Tibial
Heart Left Ventricle
Adrenal Gland
Adipose Visceral Omentum
Pancreas
Lung
Pituitary
Brain Nucleus accumbens basal ganglia
Colon Transverse
Adipose Subcutaneous
Esophagus Mucosa
Brain Cortex
Thyroid
Stomach
Breast Mammary Tissue
Colon Sigmoid
Skin Not Sun Exposed Suprapubic
Testis
Artery Aorta
Brain Amygdala
Brain Anterior cingulate cortex BA24
Brain Caudate basal ganglia
Brain Cerebellar Hemisphere
Brain Frontal Cortex BA9
Brain Hippocampus
Brain Hypothalamus
Brain Putamen basal ganglia
Brain Spinal cord cervical c-1
Brain Substantia nigra
Cells Cultured fibroblasts
Cells EBV-transformed lymphocytes
Kidney Cortex
Minor Salivary Gland
Ovary
Small Intestine Terminal Ileum
Uterus
Vagina
ENSG00000027697 IFNGR1 -119846 4.19e-06 3.74e-06 4.62e-07 2.04e-06 6.04e-07 7.56e-07 2.53e-06 6.85e-07 2.25e-06 1.2e-06 3.14e-06 1.72e-06 5.21e-06 1.4e-06 9.35e-07 2.02e-06 1.59e-06 2.15e-06 1.5e-06 1.5e-06 1.36e-06 3.35e-06 3.17e-06 1.15e-06 4.51e-06 1.09e-06 1.59e-06 1.79e-06 2.82e-06 3.32e-06 1.98e-06 3.22e-07 5.19e-07 1.28e-06 1.63e-06 9.72e-07 7.8e-07 4.58e-07 9.59e-07 3.73e-07 3.02e-07 4.12e-06 5.42e-07 1.99e-07 3.22e-07 3.27e-07 8.36e-07 2.22e-07 2.27e-07