logo

Genes within 1Mb (chr6:137095200:C:T):

View on , UCSC , GTEx , gnomAD

Immune cell-type specific single cell cis-eQTLs in OASIS
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000027697 IFNGR1 -124249 sc-eQTL 1.58e-01 -0.123 0.0866 0.209 B L1
ENSG00000029363 BCLAF1 805349 sc-eQTL 6.17e-01 -0.0194 0.0387 0.209 B L1
ENSG00000112357 PEX7 272636 sc-eQTL 1.26e-01 0.157 0.102 0.209 B L1
ENSG00000118503 TNFAIP3 -772014 sc-eQTL 6.33e-01 -0.0262 0.0549 0.209 B L1
ENSG00000197442 MAP3K5 302723 sc-eQTL 2.75e-01 -0.0835 0.0763 0.209 B L1
ENSG00000237499 WAKMAR2 -773033 sc-eQTL 7.15e-01 -0.0316 0.0863 0.209 B L1
ENSG00000027697 IFNGR1 -124249 sc-eQTL 4.67e-02 -0.115 0.0576 0.209 CD4T L1
ENSG00000029363 BCLAF1 805349 sc-eQTL 8.07e-01 -0.0108 0.044 0.209 CD4T L1
ENSG00000112357 PEX7 272636 sc-eQTL 7.70e-01 -0.0274 0.0936 0.209 CD4T L1
ENSG00000118503 TNFAIP3 -772014 sc-eQTL 9.78e-01 0.00159 0.0589 0.209 CD4T L1
ENSG00000197442 MAP3K5 302723 sc-eQTL 9.64e-02 -0.0744 0.0446 0.209 CD4T L1
ENSG00000237499 WAKMAR2 -773033 sc-eQTL 7.13e-02 -0.133 0.0735 0.209 CD4T L1
ENSG00000027697 IFNGR1 -124249 sc-eQTL 3.46e-01 -0.0624 0.0661 0.209 CD8T L1
ENSG00000029363 BCLAF1 805349 sc-eQTL 4.66e-01 0.0327 0.0448 0.209 CD8T L1
ENSG00000112357 PEX7 272636 sc-eQTL 3.81e-01 -0.0967 0.11 0.209 CD8T L1
ENSG00000118503 TNFAIP3 -772014 sc-eQTL 6.19e-01 0.0278 0.0557 0.209 CD8T L1
ENSG00000197442 MAP3K5 302723 sc-eQTL 9.31e-01 -0.00514 0.0589 0.209 CD8T L1
ENSG00000237499 WAKMAR2 -773033 sc-eQTL 6.48e-01 0.0374 0.0819 0.209 CD8T L1
ENSG00000027697 IFNGR1 -124249 sc-eQTL 9.10e-01 -0.00887 0.078 0.212 DC L1
ENSG00000029363 BCLAF1 805349 sc-eQTL 9.39e-01 0.00538 0.0702 0.212 DC L1
ENSG00000112357 PEX7 272636 sc-eQTL 7.41e-01 0.0364 0.11 0.212 DC L1
ENSG00000118503 TNFAIP3 -772014 sc-eQTL 8.82e-01 -0.0123 0.0833 0.212 DC L1
ENSG00000135525 MAP7 544381 sc-eQTL 7.87e-01 -0.0244 0.0902 0.212 DC L1
ENSG00000197442 MAP3K5 302723 sc-eQTL 9.80e-01 0.00212 0.0865 0.212 DC L1
ENSG00000237499 WAKMAR2 -773033 sc-eQTL 6.73e-01 0.0358 0.0849 0.212 DC L1
ENSG00000286646 AL121933.2 311155 sc-eQTL 5.77e-01 0.063 0.113 0.212 DC L1
ENSG00000027697 IFNGR1 -124249 sc-eQTL 7.53e-02 -0.117 0.0652 0.209 Mono L1
ENSG00000029363 BCLAF1 805349 sc-eQTL 4.72e-01 0.0405 0.0561 0.209 Mono L1
ENSG00000112357 PEX7 272636 sc-eQTL 2.88e-01 -0.118 0.11 0.209 Mono L1
ENSG00000118503 TNFAIP3 -772014 sc-eQTL 4.51e-01 0.0421 0.0557 0.209 Mono L1
ENSG00000135525 MAP7 544381 sc-eQTL 8.48e-02 -0.168 0.0969 0.209 Mono L1
ENSG00000197442 MAP3K5 302723 sc-eQTL 5.77e-01 -0.0363 0.065 0.209 Mono L1
ENSG00000237499 WAKMAR2 -773033 sc-eQTL 8.61e-01 0.0121 0.0691 0.209 Mono L1
ENSG00000286646 AL121933.2 311155 sc-eQTL 1.85e-01 0.104 0.0785 0.209 Mono L1
ENSG00000027697 IFNGR1 -124249 sc-eQTL 3.17e-02 -0.16 0.0741 0.21 NK L1
ENSG00000029363 BCLAF1 805349 sc-eQTL 9.98e-01 -0.0001 0.0398 0.21 NK L1
ENSG00000112357 PEX7 272636 sc-eQTL 2.67e-01 0.128 0.115 0.21 NK L1
ENSG00000118503 TNFAIP3 -772014 sc-eQTL 6.05e-01 0.0323 0.0623 0.21 NK L1
ENSG00000197442 MAP3K5 302723 sc-eQTL 7.52e-01 0.0282 0.0894 0.21 NK L1
ENSG00000237499 WAKMAR2 -773033 sc-eQTL 4.65e-01 -0.0646 0.0883 0.21 NK L1
ENSG00000027697 IFNGR1 -124249 sc-eQTL 4.06e-01 -0.057 0.0684 0.209 Other_T L1
ENSG00000029363 BCLAF1 805349 sc-eQTL 6.41e-01 -0.0268 0.0574 0.209 Other_T L1
ENSG00000112357 PEX7 272636 sc-eQTL 7.45e-01 -0.0364 0.112 0.209 Other_T L1
ENSG00000118503 TNFAIP3 -772014 sc-eQTL 7.92e-01 0.0112 0.0426 0.209 Other_T L1
ENSG00000146410 MTFR2 844865 sc-eQTL 8.49e-01 0.0123 0.0646 0.209 Other_T L1
ENSG00000197442 MAP3K5 302723 sc-eQTL 8.10e-01 0.0198 0.0823 0.209 Other_T L1
ENSG00000237499 WAKMAR2 -773033 sc-eQTL 6.48e-01 -0.0386 0.0846 0.209 Other_T L1
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000027697 IFNGR1 -124249 sc-eQTL 9.57e-02 -0.193 0.115 0.214 B_Activated L2
ENSG00000029363 BCLAF1 805349 sc-eQTL 5.91e-01 0.0507 0.0941 0.214 B_Activated L2
ENSG00000112357 PEX7 272636 sc-eQTL 2.58e-02 0.253 0.112 0.214 B_Activated L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 -772014 sc-eQTL 1.72e-01 0.156 0.114 0.214 B_Activated L2
ENSG00000197442 MAP3K5 302723 sc-eQTL 4.02e-01 -0.108 0.128 0.214 B_Activated L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 -773033 sc-eQTL 8.14e-01 -0.0236 0.1 0.214 B_Activated L2
ENSG00000027697 IFNGR1 -124249 sc-eQTL 5.12e-01 -0.0673 0.102 0.21 B_Intermediate L2
ENSG00000029363 BCLAF1 805349 sc-eQTL 5.29e-01 0.0367 0.0582 0.21 B_Intermediate L2
ENSG00000112357 PEX7 272636 sc-eQTL 1.14e-01 0.169 0.107 0.21 B_Intermediate L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 -772014 sc-eQTL 9.19e-01 0.0078 0.0767 0.21 B_Intermediate L2
ENSG00000197442 MAP3K5 302723 sc-eQTL 7.06e-01 -0.035 0.0926 0.21 B_Intermediate L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 -773033 sc-eQTL 8.65e-01 -0.0186 0.109 0.21 B_Intermediate L2
ENSG00000027697 IFNGR1 -124249 sc-eQTL 5.29e-01 -0.0709 0.112 0.211 B_Memory L2
ENSG00000029363 BCLAF1 805349 sc-eQTL 6.60e-01 0.0294 0.0667 0.211 B_Memory L2
ENSG00000112357 PEX7 272636 sc-eQTL 7.48e-01 0.0366 0.113 0.211 B_Memory L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 -772014 sc-eQTL 5.29e-01 -0.0463 0.0734 0.211 B_Memory L2
ENSG00000197442 MAP3K5 302723 sc-eQTL 5.80e-01 0.0556 0.1 0.211 B_Memory L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 -773033 sc-eQTL 9.58e-01 -0.00573 0.109 0.211 B_Memory L2
ENSG00000027697 IFNGR1 -124249 sc-eQTL 8.94e-02 -0.149 0.0872 0.209 B_Naive1 L2
ENSG00000029363 BCLAF1 805349 sc-eQTL 7.87e-01 -0.0136 0.0502 0.209 B_Naive1 L2
ENSG00000112357 PEX7 272636 sc-eQTL 4.32e-01 0.0911 0.116 0.209 B_Naive1 L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 -772014 sc-eQTL 8.03e-01 -0.0147 0.0588 0.209 B_Naive1 L2
ENSG00000197442 MAP3K5 302723 sc-eQTL 6.46e-01 0.038 0.0826 0.209 B_Naive1 L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 -773033 sc-eQTL 7.57e-01 0.0286 0.0921 0.209 B_Naive1 L2
ENSG00000027697 IFNGR1 -124249 sc-eQTL 9.82e-01 0.00243 0.106 0.21 B_Naive2 L2
ENSG00000029363 BCLAF1 805349 sc-eQTL 1.60e-01 -0.0862 0.0612 0.21 B_Naive2 L2
ENSG00000112357 PEX7 272636 sc-eQTL 1.25e-01 0.177 0.115 0.21 B_Naive2 L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 -772014 sc-eQTL 8.97e-01 -0.011 0.0844 0.21 B_Naive2 L2
ENSG00000197442 MAP3K5 302723 sc-eQTL 5.70e-02 -0.17 0.0891 0.21 B_Naive2 L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 -773033 sc-eQTL 1.04e-01 -0.177 0.108 0.21 B_Naive2 L2
ENSG00000027697 IFNGR1 -124249 sc-eQTL 8.00e-01 0.0249 0.0985 0.211 CD4_CTL L2
ENSG00000029363 BCLAF1 805349 sc-eQTL 3.15e-01 0.0878 0.0872 0.211 CD4_CTL L2
ENSG00000112357 PEX7 272636 sc-eQTL 6.38e-01 -0.0514 0.109 0.211 CD4_CTL L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 -772014 sc-eQTL 2.87e-01 -0.0687 0.0644 0.211 CD4_CTL L2
ENSG00000197442 MAP3K5 302723 sc-eQTL 2.42e-01 -0.121 0.103 0.211 CD4_CTL L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 -773033 sc-eQTL 5.39e-01 -0.0618 0.1 0.211 CD4_CTL L2
ENSG00000027697 IFNGR1 -124249 sc-eQTL 2.39e-01 -0.0646 0.0548 0.209 CD4_Naive L2
ENSG00000029363 BCLAF1 805349 sc-eQTL 7.29e-01 -0.0153 0.0441 0.209 CD4_Naive L2
ENSG00000112357 PEX7 272636 sc-eQTL 9.73e-01 -0.00356 0.104 0.209 CD4_Naive L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 -772014 sc-eQTL 8.18e-01 -0.0138 0.0601 0.209 CD4_Naive L2
ENSG00000197442 MAP3K5 302723 sc-eQTL 3.91e-01 -0.0379 0.044 0.209 CD4_Naive L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 -773033 sc-eQTL 1.60e-02 -0.186 0.0767 0.209 CD4_Naive L2
ENSG00000027697 IFNGR1 -124249 sc-eQTL 6.64e-02 -0.139 0.0752 0.209 CD4_TCM L2
ENSG00000029363 BCLAF1 805349 sc-eQTL 5.93e-01 0.0256 0.0478 0.209 CD4_TCM L2
ENSG00000112357 PEX7 272636 sc-eQTL 2.29e-01 0.134 0.111 0.209 CD4_TCM L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 -772014 sc-eQTL 9.89e-01 0.00073 0.0547 0.209 CD4_TCM L2
ENSG00000197442 MAP3K5 302723 sc-eQTL 5.60e-02 -0.119 0.0617 0.209 CD4_TCM L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 -773033 sc-eQTL 5.40e-01 -0.047 0.0765 0.209 CD4_TCM L2
ENSG00000027697 IFNGR1 -124249 sc-eQTL 1.16e-01 -0.136 0.0863 0.209 CD4_TEM L2
ENSG00000029363 BCLAF1 805349 sc-eQTL 9.52e-01 0.00373 0.0615 0.209 CD4_TEM L2
ENSG00000112357 PEX7 272636 sc-eQTL 1.65e-01 -0.156 0.112 0.209 CD4_TEM L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 -772014 sc-eQTL 2.56e-01 0.0655 0.0575 0.209 CD4_TEM L2
ENSG00000197442 MAP3K5 302723 sc-eQTL 3.08e-01 -0.0907 0.0888 0.209 CD4_TEM L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 -773033 sc-eQTL 1.20e-01 -0.143 0.0919 0.209 CD4_TEM L2
ENSG00000027697 IFNGR1 -124249 sc-eQTL 9.14e-01 -0.00856 0.0791 0.209 CD8_CTL L2
ENSG00000029363 BCLAF1 805349 sc-eQTL 3.82e-01 0.0461 0.0526 0.209 CD8_CTL L2
ENSG00000112357 PEX7 272636 sc-eQTL 4.31e-01 0.0857 0.109 0.209 CD8_CTL L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 -772014 sc-eQTL 8.08e-01 -0.0162 0.0665 0.209 CD8_CTL L2
ENSG00000197442 MAP3K5 302723 sc-eQTL 4.10e-01 0.0774 0.0937 0.209 CD8_CTL L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 -773033 sc-eQTL 7.27e-01 -0.0326 0.0935 0.209 CD8_CTL L2
ENSG00000027697 IFNGR1 -124249 sc-eQTL 6.09e-02 -0.147 0.0778 0.209 CD8_Naive L2
ENSG00000029363 BCLAF1 805349 sc-eQTL 9.40e-01 -0.00414 0.0548 0.209 CD8_Naive L2
ENSG00000112357 PEX7 272636 sc-eQTL 6.53e-01 -0.0512 0.114 0.209 CD8_Naive L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 -772014 sc-eQTL 8.12e-01 0.0146 0.0614 0.209 CD8_Naive L2
ENSG00000197442 MAP3K5 302723 sc-eQTL 7.70e-01 -0.0213 0.0727 0.209 CD8_Naive L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 -773033 sc-eQTL 6.17e-01 -0.0455 0.0907 0.209 CD8_Naive L2
ENSG00000027697 IFNGR1 -124249 sc-eQTL 7.74e-01 0.0299 0.104 0.215 CD8_TCM L2
ENSG00000029363 BCLAF1 805349 sc-eQTL 3.30e-01 -0.076 0.0778 0.215 CD8_TCM L2
ENSG00000112357 PEX7 272636 sc-eQTL 2.02e-01 -0.152 0.119 0.215 CD8_TCM L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 -772014 sc-eQTL 7.03e-01 -0.0215 0.0563 0.215 CD8_TCM L2
ENSG00000197442 MAP3K5 302723 sc-eQTL 6.38e-01 -0.0473 0.1 0.215 CD8_TCM L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 -773033 sc-eQTL 3.79e-01 0.0906 0.103 0.215 CD8_TCM L2
ENSG00000027697 IFNGR1 -124249 sc-eQTL 3.84e-01 -0.0888 0.102 0.201 CD8_TEM L2
ENSG00000029363 BCLAF1 805349 sc-eQTL 6.24e-01 -0.0473 0.0963 0.201 CD8_TEM L2
ENSG00000112357 PEX7 272636 sc-eQTL 7.58e-01 0.0362 0.117 0.201 CD8_TEM L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 -772014 sc-eQTL 9.66e-01 -0.00323 0.0753 0.201 CD8_TEM L2
ENSG00000197442 MAP3K5 302723 sc-eQTL 8.20e-01 -0.0266 0.116 0.201 CD8_TEM L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 -773033 sc-eQTL 6.06e-01 -0.0577 0.112 0.201 CD8_TEM L2
ENSG00000027697 IFNGR1 -124249 sc-eQTL 3.26e-01 -0.0776 0.0788 0.212 MAIT L2
ENSG00000029363 BCLAF1 805349 sc-eQTL 7.92e-01 0.0173 0.0656 0.212 MAIT L2
ENSG00000112357 PEX7 272636 sc-eQTL 5.11e-01 -0.0704 0.107 0.212 MAIT L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 -772014 sc-eQTL 1.00e+00 -3.33e-05 0.0531 0.212 MAIT L2
ENSG00000146410 MTFR2 844865 sc-eQTL 5.55e-01 0.0522 0.0884 0.212 MAIT L2
ENSG00000197442 MAP3K5 302723 sc-eQTL 1.81e-01 0.124 0.0922 0.212 MAIT L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 -773033 sc-eQTL 7.58e-01 0.0303 0.0982 0.212 MAIT L2
ENSG00000027697 IFNGR1 -124249 sc-eQTL 2.87e-01 -0.0929 0.087 0.211 NK_CD56bright L2
ENSG00000029363 BCLAF1 805349 sc-eQTL 9.09e-01 -0.00733 0.0644 0.211 NK_CD56bright L2
ENSG00000112357 PEX7 272636 sc-eQTL 4.42e-01 0.0876 0.114 0.211 NK_CD56bright L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 -772014 sc-eQTL 5.34e-01 0.0404 0.0649 0.211 NK_CD56bright L2
ENSG00000197442 MAP3K5 302723 sc-eQTL 5.50e-01 -0.0592 0.0988 0.211 NK_CD56bright L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 -773033 sc-eQTL 4.85e-01 0.0724 0.103 0.211 NK_CD56bright L2
ENSG00000027697 IFNGR1 -124249 sc-eQTL 3.01e-01 -0.0715 0.069 0.211 NK_CD56dim L2
ENSG00000029363 BCLAF1 805349 sc-eQTL 7.20e-01 -0.0162 0.0452 0.211 NK_CD56dim L2
ENSG00000112357 PEX7 272636 sc-eQTL 7.11e-01 0.0441 0.119 0.211 NK_CD56dim L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 -772014 sc-eQTL 5.14e-01 0.0425 0.0651 0.211 NK_CD56dim L2
ENSG00000197442 MAP3K5 302723 sc-eQTL 8.84e-01 0.0137 0.0938 0.211 NK_CD56dim L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 -773033 sc-eQTL 4.40e-01 -0.0753 0.0974 0.211 NK_CD56dim L2
ENSG00000027697 IFNGR1 -124249 sc-eQTL 1.00e-02 -0.23 0.0884 0.205 NK_HLA L2
ENSG00000029363 BCLAF1 805349 sc-eQTL 8.68e-01 0.0127 0.0761 0.205 NK_HLA L2
ENSG00000112357 PEX7 272636 sc-eQTL 3.30e-02 0.242 0.113 0.205 NK_HLA L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 -772014 sc-eQTL 4.10e-01 -0.0587 0.0711 0.205 NK_HLA L2
ENSG00000197442 MAP3K5 302723 sc-eQTL 1.36e-01 0.168 0.113 0.205 NK_HLA L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 -773033 sc-eQTL 8.06e-02 -0.2 0.114 0.205 NK_HLA L2
ENSG00000027697 IFNGR1 -124249 sc-eQTL 3.17e-02 -0.157 0.0726 0.211 NK_cytokine L2
ENSG00000029363 BCLAF1 805349 sc-eQTL 8.47e-01 0.0106 0.0548 0.211 NK_cytokine L2
ENSG00000112357 PEX7 272636 sc-eQTL 8.88e-01 0.0163 0.115 0.211 NK_cytokine L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 -772014 sc-eQTL 4.07e-01 0.0544 0.0654 0.211 NK_cytokine L2
ENSG00000197442 MAP3K5 302723 sc-eQTL 8.86e-01 -0.0129 0.09 0.211 NK_cytokine L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 -773033 sc-eQTL 8.84e-01 -0.0144 0.0987 0.211 NK_cytokine L2
ENSG00000027697 IFNGR1 -124249 sc-eQTL 1.56e-02 -0.362 0.148 0.196 PB L2
ENSG00000029363 BCLAF1 805349 sc-eQTL 1.51e-02 -0.314 0.127 0.196 PB L2
ENSG00000112357 PEX7 272636 sc-eQTL 9.54e-01 0.00896 0.156 0.196 PB L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 -772014 sc-eQTL 6.80e-01 0.0486 0.118 0.196 PB L2
ENSG00000197442 MAP3K5 302723 sc-eQTL 1.90e-01 -0.175 0.133 0.196 PB L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 -773033 sc-eQTL 1.97e-01 0.182 0.14 0.196 PB L2
ENSG00000027697 IFNGR1 -124249 sc-eQTL 6.14e-01 0.0448 0.0886 0.213 Pro_T L2
ENSG00000029363 BCLAF1 805349 sc-eQTL 9.33e-01 -0.00775 0.092 0.213 Pro_T L2
ENSG00000112357 PEX7 272636 sc-eQTL 4.54e-01 0.0808 0.108 0.213 Pro_T L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 -772014 sc-eQTL 1.57e-01 0.0763 0.0538 0.213 Pro_T L2
ENSG00000146410 MTFR2 844865 sc-eQTL 5.79e-01 0.0416 0.0748 0.213 Pro_T L2
ENSG00000197442 MAP3K5 302723 sc-eQTL 1.20e-01 -0.162 0.104 0.213 Pro_T L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 -773033 sc-eQTL 9.32e-01 -0.00899 0.105 0.213 Pro_T L2
ENSG00000027697 IFNGR1 -124249 sc-eQTL 3.34e-01 -0.1 0.103 0.209 Treg L2
ENSG00000029363 BCLAF1 805349 sc-eQTL 2.36e-01 -0.0793 0.0667 0.209 Treg L2
ENSG00000112357 PEX7 272636 sc-eQTL 7.94e-01 0.0286 0.109 0.209 Treg L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 -772014 sc-eQTL 9.46e-01 0.00448 0.0659 0.209 Treg L2
ENSG00000197442 MAP3K5 302723 sc-eQTL 5.50e-01 0.0427 0.0714 0.209 Treg L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 -773033 sc-eQTL 7.61e-01 -0.0306 0.1 0.209 Treg L2
ENSG00000027697 IFNGR1 -124249 sc-eQTL 4.92e-01 0.0599 0.087 0.212 cDC L2
ENSG00000029363 BCLAF1 805349 sc-eQTL 2.35e-01 0.104 0.0875 0.212 cDC L2
ENSG00000112357 PEX7 272636 sc-eQTL 3.51e-01 0.105 0.112 0.212 cDC L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 -772014 sc-eQTL 9.77e-01 -0.00245 0.0859 0.212 cDC L2
ENSG00000135525 MAP7 544381 sc-eQTL 3.70e-01 0.0902 0.1 0.212 cDC L2
ENSG00000197442 MAP3K5 302723 sc-eQTL 6.37e-01 -0.0418 0.0884 0.212 cDC L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 -773033 sc-eQTL 2.52e-01 0.128 0.112 0.212 cDC L2
ENSG00000286646 AL121933.2 311155 sc-eQTL 8.12e-01 -0.0274 0.115 0.212 cDC L2
ENSG00000027697 IFNGR1 -124249 sc-eQTL 5.32e-01 -0.0384 0.0613 0.209 cMono_IL1B L2
ENSG00000029363 BCLAF1 805349 sc-eQTL 7.65e-01 0.0197 0.0658 0.209 cMono_IL1B L2
ENSG00000112357 PEX7 272636 sc-eQTL 3.07e-01 -0.113 0.11 0.209 cMono_IL1B L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 -772014 sc-eQTL 5.01e-01 0.0445 0.066 0.209 cMono_IL1B L2
ENSG00000135525 MAP7 544381 sc-eQTL 3.20e-02 -0.203 0.094 0.209 cMono_IL1B L2
ENSG00000197442 MAP3K5 302723 sc-eQTL 8.45e-01 -0.0134 0.0687 0.209 cMono_IL1B L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 -773033 sc-eQTL 5.76e-01 0.0395 0.0705 0.209 cMono_IL1B L2
ENSG00000286646 AL121933.2 311155 sc-eQTL 3.49e-02 0.186 0.0874 0.209 cMono_IL1B L2
ENSG00000027697 IFNGR1 -124249 sc-eQTL 7.75e-02 -0.125 0.0705 0.209 cMono_S100A L2
ENSG00000029363 BCLAF1 805349 sc-eQTL 4.36e-01 0.0568 0.0728 0.209 cMono_S100A L2
ENSG00000112357 PEX7 272636 sc-eQTL 4.13e-01 -0.0933 0.114 0.209 cMono_S100A L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 -772014 sc-eQTL 4.97e-01 -0.0429 0.063 0.209 cMono_S100A L2
ENSG00000135525 MAP7 544381 sc-eQTL 9.55e-01 -0.00594 0.106 0.209 cMono_S100A L2
ENSG00000197442 MAP3K5 302723 sc-eQTL 3.91e-01 -0.0736 0.0856 0.209 cMono_S100A L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 -773033 sc-eQTL 1.58e-01 -0.128 0.0901 0.209 cMono_S100A L2
ENSG00000286646 AL121933.2 311155 sc-eQTL 7.44e-01 0.0289 0.0884 0.209 cMono_S100A L2
ENSG00000027697 IFNGR1 -124249 sc-eQTL 4.78e-01 0.0731 0.103 0.206 gdT L2
ENSG00000029363 BCLAF1 805349 sc-eQTL 5.97e-01 -0.048 0.0907 0.206 gdT L2
ENSG00000112357 PEX7 272636 sc-eQTL 4.55e-01 -0.0976 0.13 0.206 gdT L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 -772014 sc-eQTL 6.56e-01 0.0283 0.0634 0.206 gdT L2
ENSG00000146410 MTFR2 844865 sc-eQTL 5.83e-01 0.055 0.0999 0.206 gdT L2
ENSG00000197442 MAP3K5 302723 sc-eQTL 5.96e-01 0.0712 0.134 0.206 gdT L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 -773033 sc-eQTL 2.30e-01 -0.138 0.114 0.206 gdT L2
ENSG00000027697 IFNGR1 -124249 sc-eQTL 5.34e-01 -0.0474 0.076 0.213 intMono L2
ENSG00000029363 BCLAF1 805349 sc-eQTL 2.65e-01 0.112 0.1 0.213 intMono L2
ENSG00000112357 PEX7 272636 sc-eQTL 8.99e-01 0.0131 0.103 0.213 intMono L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 -772014 sc-eQTL 8.54e-01 0.0121 0.0657 0.213 intMono L2
ENSG00000135525 MAP7 544381 sc-eQTL 5.32e-01 0.0631 0.101 0.213 intMono L2
ENSG00000197442 MAP3K5 302723 sc-eQTL 4.88e-01 0.0743 0.107 0.213 intMono L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 -773033 sc-eQTL 8.05e-01 0.0243 0.0979 0.213 intMono L2
ENSG00000286646 AL121933.2 311155 sc-eQTL 5.71e-01 0.0641 0.113 0.213 intMono L2
ENSG00000027697 IFNGR1 -124249 sc-eQTL 2.22e-02 -0.204 0.0886 0.21 ncMono L2
ENSG00000029363 BCLAF1 805349 sc-eQTL 1.19e-01 -0.108 0.0693 0.21 ncMono L2
ENSG00000112357 PEX7 272636 sc-eQTL 9.17e-01 -0.0116 0.111 0.21 ncMono L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 -772014 sc-eQTL 4.49e-01 0.0601 0.0793 0.21 ncMono L2
ENSG00000135525 MAP7 544381 sc-eQTL 6.38e-01 -0.0462 0.0981 0.21 ncMono L2
ENSG00000197442 MAP3K5 302723 sc-eQTL 7.94e-01 0.027 0.103 0.21 ncMono L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 -773033 sc-eQTL 8.72e-01 0.016 0.0993 0.21 ncMono L2
ENSG00000286646 AL121933.2 311155 sc-eQTL 9.43e-01 -0.00752 0.105 0.21 ncMono L2
ENSG00000027697 IFNGR1 -124249 sc-eQTL 5.73e-01 -0.0576 0.102 0.212 pDC L2
ENSG00000029363 BCLAF1 805349 sc-eQTL 6.94e-01 0.0301 0.0764 0.212 pDC L2
ENSG00000112357 PEX7 272636 sc-eQTL 6.16e-01 -0.0562 0.112 0.212 pDC L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 -772014 sc-eQTL 9.90e-01 0.0012 0.0945 0.212 pDC L2
ENSG00000135525 MAP7 544381 sc-eQTL 1.94e-01 -0.102 0.0779 0.212 pDC L2
ENSG00000197442 MAP3K5 302723 sc-eQTL 1.82e-01 0.167 0.125 0.212 pDC L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 -773033 sc-eQTL 2.48e-01 -0.111 0.0955 0.212 pDC L2
ENSG00000286646 AL121933.2 311155 sc-eQTL 1.57e-01 0.163 0.115 0.212 pDC L2
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000027697 IFNGR1 -124249 sc-eQTL 5.76e-01 -0.0512 0.0913 0.209 B_Memory LOneK1K
ENSG00000029363 BCLAF1 805349 sc-eQTL 6.63e-01 0.0224 0.0513 0.209 B_Memory LOneK1K
ENSG00000112357 PEX7 272636 sc-eQTL 8.74e-02 0.179 0.104 0.209 B_Memory LOneK1K
ENSG00000118503 TNFAIP3 -772014 sc-eQTL 3.01e-01 -0.0666 0.0643 0.209 B_Memory LOneK1K
ENSG00000197442 MAP3K5 302723 sc-eQTL 8.59e-01 -0.0152 0.0853 0.209 B_Memory LOneK1K
ENSG00000237499 WAKMAR2 -773033 sc-eQTL 7.78e-01 -0.0308 0.109 0.209 B_Memory LOneK1K
ENSG00000027697 IFNGR1 -124249 sc-eQTL 1.80e-01 -0.124 0.092 0.209 B_Naive LOneK1K
ENSG00000029363 BCLAF1 805349 sc-eQTL 1.73e-01 -0.0578 0.0422 0.209 B_Naive LOneK1K
ENSG00000112357 PEX7 272636 sc-eQTL 2.69e-01 0.124 0.112 0.209 B_Naive LOneK1K
ENSG00000118503 TNFAIP3 -772014 sc-eQTL 8.72e-01 -0.00856 0.0529 0.209 B_Naive LOneK1K
ENSG00000197442 MAP3K5 302723 sc-eQTL 6.34e-01 -0.0369 0.0775 0.209 B_Naive LOneK1K
ENSG00000237499 WAKMAR2 -773033 sc-eQTL 7.53e-01 -0.0296 0.0941 0.209 B_Naive LOneK1K
ENSG00000027697 IFNGR1 -124249 sc-eQTL 1.70e-01 -0.0845 0.0614 0.209 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000029363 BCLAF1 805349 sc-eQTL 4.47e-01 0.0436 0.0573 0.209 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000112357 PEX7 272636 sc-eQTL 2.32e-01 -0.132 0.11 0.209 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000118503 TNFAIP3 -772014 sc-eQTL 6.73e-01 0.0241 0.057 0.209 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000135525 MAP7 544381 sc-eQTL 3.48e-02 -0.208 0.0979 0.209 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000197442 MAP3K5 302723 sc-eQTL 3.04e-01 -0.0686 0.0666 0.209 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000237499 WAKMAR2 -773033 sc-eQTL 9.44e-01 0.00483 0.0683 0.209 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000286646 AL121933.2 311155 sc-eQTL 1.91e-01 0.104 0.0792 0.209 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000027697 IFNGR1 -124249 sc-eQTL 6.91e-02 -0.135 0.0742 0.211 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000029363 BCLAF1 805349 sc-eQTL 9.50e-01 -0.00425 0.0675 0.211 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000112357 PEX7 272636 sc-eQTL 9.52e-01 0.00676 0.113 0.211 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000118503 TNFAIP3 -772014 sc-eQTL 8.40e-01 0.0141 0.0698 0.211 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000135525 MAP7 544381 sc-eQTL 8.28e-01 0.0237 0.109 0.211 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000197442 MAP3K5 302723 sc-eQTL 3.16e-01 0.0898 0.0893 0.211 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000237499 WAKMAR2 -773033 sc-eQTL 7.71e-01 0.0273 0.0936 0.211 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000286646 AL121933.2 311155 sc-eQTL 4.76e-01 0.0757 0.106 0.211 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000027697 IFNGR1 -124249 sc-eQTL 4.89e-02 -0.139 0.0703 0.211 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000029363 BCLAF1 805349 sc-eQTL 7.74e-01 0.0119 0.0412 0.211 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000112357 PEX7 272636 sc-eQTL 5.55e-01 0.0707 0.12 0.211 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000118503 TNFAIP3 -772014 sc-eQTL 7.47e-01 0.0209 0.0646 0.211 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000197442 MAP3K5 302723 sc-eQTL 8.03e-01 0.0218 0.0873 0.211 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000237499 WAKMAR2 -773033 sc-eQTL 3.77e-01 -0.08 0.0903 0.211 NK_CD56dim LOneK1K

Statistical fine-mapping results from Japan COVID-19 Task Force
(Shown only for PIP>0.001)
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
PIP (SuSiE)
PIP (FINEMAP)
MAF
ENSG00000027697 IFNGR1 -124249 pQTL 0.000265 -0.0728 0.0199 0.0 0.0 0.178
ENSG00000027697 IFNGR1 -124249 eQTL 0.000196 -0.0651 0.0174 0.0 0.0 0.173
ENSG00000182747 SLC35D3 172899 eQTL 0.00119 0.131 0.0402 0.0 0.0 0.173

Expression Modifier Score(EMS) for GTEx 49tissues
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Whole Blood
Muscle Skeletal
Liver
Brain Cerebellum
Prostate
Spleen
Skin Sun Exposed Lower leg
Artery Coronary
Esophagus Muscularis
Esophagus Gastroesophageal Junction
Artery Tibial
Heart Atrial Appendage
Nerve Tibial
Heart Left Ventricle
Adrenal Gland
Adipose Visceral Omentum
Pancreas
Lung
Pituitary
Brain Nucleus accumbens basal ganglia
Colon Transverse
Adipose Subcutaneous
Esophagus Mucosa
Brain Cortex
Thyroid
Stomach
Breast Mammary Tissue
Colon Sigmoid
Skin Not Sun Exposed Suprapubic
Testis
Artery Aorta
Brain Amygdala
Brain Anterior cingulate cortex BA24
Brain Caudate basal ganglia
Brain Cerebellar Hemisphere
Brain Frontal Cortex BA9
Brain Hippocampus
Brain Hypothalamus
Brain Putamen basal ganglia
Brain Spinal cord cervical c-1
Brain Substantia nigra
Cells Cultured fibroblasts
Cells EBV-transformed lymphocytes
Kidney Cortex
Minor Salivary Gland
Ovary
Small Intestine Terminal Ileum
Uterus
Vagina
ENSG00000027697 IFNGR1 -124249 4.33e-06 4.99e-06 3.08e-07 2.32e-06 6.17e-07 8.89e-07 3.15e-06 7.94e-07 2.78e-06 1.2e-06 3.8e-06 1.84e-06 6.37e-06 1.4e-06 9.36e-07 1.79e-06 1.87e-06 2.12e-06 1.47e-06 1.47e-06 1.14e-06 3.5e-06 3.34e-06 1.22e-06 5.54e-06 1.26e-06 1.6e-06 1.8e-06 3.88e-06 3.39e-06 2e-06 2.69e-07 4.8e-07 1.23e-06 1.98e-06 6.6e-07 7.68e-07 3.82e-07 1.14e-06 3.54e-07 2.82e-07 4.71e-06 4.96e-07 1.65e-07 3.75e-07 3.31e-07 4.3e-07 1.71e-07 2.74e-07
ENSG00000220412 \N -612001 2.69e-07 1.3e-07 3.59e-08 1.82e-07 9.21e-08 9.65e-08 1.49e-07 5.33e-08 1.44e-07 4.74e-08 1.62e-07 8.14e-08 1.45e-07 6.76e-08 5.99e-08 7.26e-08 3.94e-08 1.18e-07 5.39e-08 4.21e-08 1.04e-07 1.23e-07 1.39e-07 4.05e-08 1.5e-07 1.19e-07 1.08e-07 9.32e-08 1.05e-07 1.1e-07 9.7e-08 3.98e-08 2.91e-08 8.68e-08 8.76e-08 3.9e-08 4.84e-08 9.44e-08 7.58e-08 3.18e-08 3.91e-08 1.35e-07 4.04e-08 7.32e-09 5.59e-08 1.69e-08 1.26e-07 4.26e-09 5.04e-08