logo

Genes within 1Mb (chr6:137092804:C:T):

View on , UCSC , GTEx , gnomAD

Immune cell-type specific single cell cis-eQTLs in OASIS
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000027697 IFNGR1 -126645 sc-eQTL 1.48e-01 -0.125 0.086 0.218 B L1
ENSG00000029363 BCLAF1 802953 sc-eQTL 9.77e-01 0.00111 0.0385 0.218 B L1
ENSG00000112357 PEX7 270240 sc-eQTL 8.63e-02 0.175 0.102 0.218 B L1
ENSG00000118503 TNFAIP3 -774410 sc-eQTL 6.74e-01 -0.023 0.0545 0.218 B L1
ENSG00000197442 MAP3K5 300327 sc-eQTL 3.26e-01 -0.0747 0.0758 0.218 B L1
ENSG00000237499 WAKMAR2 -775429 sc-eQTL 6.74e-01 -0.0361 0.0858 0.218 B L1
ENSG00000027697 IFNGR1 -126645 sc-eQTL 2.08e-02 -0.132 0.0568 0.218 CD4T L1
ENSG00000029363 BCLAF1 802953 sc-eQTL 9.77e-01 -0.00124 0.0436 0.218 CD4T L1
ENSG00000112357 PEX7 270240 sc-eQTL 9.29e-01 -0.00822 0.0927 0.218 CD4T L1
ENSG00000118503 TNFAIP3 -774410 sc-eQTL 6.98e-01 0.0227 0.0583 0.218 CD4T L1
ENSG00000197442 MAP3K5 300327 sc-eQTL 1.52e-01 -0.0636 0.0442 0.218 CD4T L1
ENSG00000237499 WAKMAR2 -775429 sc-eQTL 1.03e-01 -0.119 0.073 0.218 CD4T L1
ENSG00000027697 IFNGR1 -126645 sc-eQTL 4.32e-01 -0.0517 0.0656 0.218 CD8T L1
ENSG00000029363 BCLAF1 802953 sc-eQTL 5.41e-01 0.0272 0.0444 0.218 CD8T L1
ENSG00000112357 PEX7 270240 sc-eQTL 6.23e-01 -0.0539 0.109 0.218 CD8T L1
ENSG00000118503 TNFAIP3 -774410 sc-eQTL 6.33e-01 0.0264 0.0552 0.218 CD8T L1
ENSG00000197442 MAP3K5 300327 sc-eQTL 9.85e-01 -0.00107 0.0584 0.218 CD8T L1
ENSG00000237499 WAKMAR2 -775429 sc-eQTL 7.26e-01 0.0285 0.0811 0.218 CD8T L1
ENSG00000027697 IFNGR1 -126645 sc-eQTL 6.31e-01 -0.0372 0.0774 0.221 DC L1
ENSG00000029363 BCLAF1 802953 sc-eQTL 8.17e-01 0.0161 0.0697 0.221 DC L1
ENSG00000112357 PEX7 270240 sc-eQTL 8.83e-01 -0.016 0.109 0.221 DC L1
ENSG00000118503 TNFAIP3 -774410 sc-eQTL 8.57e-01 -0.015 0.0828 0.221 DC L1
ENSG00000135525 MAP7 541985 sc-eQTL 7.93e-01 -0.0235 0.0896 0.221 DC L1
ENSG00000197442 MAP3K5 300327 sc-eQTL 7.92e-01 0.0227 0.0859 0.221 DC L1
ENSG00000237499 WAKMAR2 -775429 sc-eQTL 7.50e-01 0.0269 0.0844 0.221 DC L1
ENSG00000286646 AL121933.2 308759 sc-eQTL 4.63e-01 0.0824 0.112 0.221 DC L1
ENSG00000027697 IFNGR1 -126645 sc-eQTL 3.33e-02 -0.138 0.0646 0.218 Mono L1
ENSG00000029363 BCLAF1 802953 sc-eQTL 2.41e-01 0.0655 0.0556 0.218 Mono L1
ENSG00000112357 PEX7 270240 sc-eQTL 3.50e-01 -0.103 0.11 0.218 Mono L1
ENSG00000118503 TNFAIP3 -774410 sc-eQTL 4.01e-01 0.0465 0.0553 0.218 Mono L1
ENSG00000135525 MAP7 541985 sc-eQTL 7.70e-02 -0.171 0.0962 0.218 Mono L1
ENSG00000197442 MAP3K5 300327 sc-eQTL 6.93e-01 -0.0255 0.0646 0.218 Mono L1
ENSG00000237499 WAKMAR2 -775429 sc-eQTL 9.80e-01 0.00176 0.0686 0.218 Mono L1
ENSG00000286646 AL121933.2 308759 sc-eQTL 1.24e-01 0.12 0.0778 0.218 Mono L1
ENSG00000027697 IFNGR1 -126645 sc-eQTL 5.72e-02 -0.141 0.0739 0.219 NK L1
ENSG00000029363 BCLAF1 802953 sc-eQTL 9.34e-01 0.00329 0.0396 0.219 NK L1
ENSG00000112357 PEX7 270240 sc-eQTL 3.70e-01 0.103 0.115 0.219 NK L1
ENSG00000118503 TNFAIP3 -774410 sc-eQTL 7.62e-01 0.0188 0.062 0.219 NK L1
ENSG00000197442 MAP3K5 300327 sc-eQTL 5.63e-01 0.0515 0.0888 0.219 NK L1
ENSG00000237499 WAKMAR2 -775429 sc-eQTL 3.94e-01 -0.0749 0.0878 0.219 NK L1
ENSG00000027697 IFNGR1 -126645 sc-eQTL 2.74e-01 -0.0744 0.0678 0.218 Other_T L1
ENSG00000029363 BCLAF1 802953 sc-eQTL 5.96e-01 -0.0303 0.057 0.218 Other_T L1
ENSG00000112357 PEX7 270240 sc-eQTL 7.23e-01 -0.0393 0.111 0.218 Other_T L1
ENSG00000118503 TNFAIP3 -774410 sc-eQTL 8.48e-01 0.0081 0.0423 0.218 Other_T L1
ENSG00000146410 MTFR2 842469 sc-eQTL 8.52e-01 0.012 0.0641 0.218 Other_T L1
ENSG00000197442 MAP3K5 300327 sc-eQTL 7.69e-01 0.024 0.0817 0.218 Other_T L1
ENSG00000237499 WAKMAR2 -775429 sc-eQTL 7.23e-01 -0.0297 0.084 0.218 Other_T L1
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000027697 IFNGR1 -126645 sc-eQTL 1.96e-01 -0.148 0.114 0.222 B_Activated L2
ENSG00000029363 BCLAF1 802953 sc-eQTL 6.10e-01 0.0477 0.0932 0.222 B_Activated L2
ENSG00000112357 PEX7 270240 sc-eQTL 6.33e-02 0.209 0.112 0.222 B_Activated L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 -774410 sc-eQTL 2.14e-01 0.141 0.113 0.222 B_Activated L2
ENSG00000197442 MAP3K5 300327 sc-eQTL 3.32e-01 -0.123 0.127 0.222 B_Activated L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 -775429 sc-eQTL 7.39e-01 -0.0331 0.0991 0.222 B_Activated L2
ENSG00000027697 IFNGR1 -126645 sc-eQTL 6.69e-01 -0.0435 0.102 0.219 B_Intermediate L2
ENSG00000029363 BCLAF1 802953 sc-eQTL 4.18e-01 0.047 0.0578 0.219 B_Intermediate L2
ENSG00000112357 PEX7 270240 sc-eQTL 1.35e-01 0.159 0.106 0.219 B_Intermediate L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 -774410 sc-eQTL 8.36e-01 0.0157 0.0762 0.219 B_Intermediate L2
ENSG00000197442 MAP3K5 300327 sc-eQTL 7.50e-01 -0.0294 0.0921 0.219 B_Intermediate L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 -775429 sc-eQTL 9.86e-01 0.00186 0.108 0.219 B_Intermediate L2
ENSG00000027697 IFNGR1 -126645 sc-eQTL 6.58e-01 -0.0494 0.112 0.22 B_Memory L2
ENSG00000029363 BCLAF1 802953 sc-eQTL 4.56e-01 0.0495 0.0662 0.22 B_Memory L2
ENSG00000112357 PEX7 270240 sc-eQTL 6.11e-01 0.0574 0.113 0.22 B_Memory L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 -774410 sc-eQTL 6.50e-01 -0.0332 0.073 0.22 B_Memory L2
ENSG00000197442 MAP3K5 300327 sc-eQTL 5.74e-01 0.0562 0.0997 0.22 B_Memory L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 -775429 sc-eQTL 7.45e-01 -0.0353 0.109 0.22 B_Memory L2
ENSG00000027697 IFNGR1 -126645 sc-eQTL 4.35e-02 -0.175 0.0862 0.218 B_Naive1 L2
ENSG00000029363 BCLAF1 802953 sc-eQTL 9.08e-01 0.00573 0.0497 0.218 B_Naive1 L2
ENSG00000112357 PEX7 270240 sc-eQTL 3.57e-01 0.106 0.115 0.218 B_Naive1 L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 -774410 sc-eQTL 9.15e-01 -0.00625 0.0583 0.218 B_Naive1 L2
ENSG00000197442 MAP3K5 300327 sc-eQTL 4.28e-01 0.0649 0.0818 0.218 B_Naive1 L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 -775429 sc-eQTL 8.12e-01 0.0218 0.0913 0.218 B_Naive1 L2
ENSG00000027697 IFNGR1 -126645 sc-eQTL 9.51e-01 -0.00644 0.105 0.219 B_Naive2 L2
ENSG00000029363 BCLAF1 802953 sc-eQTL 3.06e-01 -0.0624 0.0608 0.219 B_Naive2 L2
ENSG00000112357 PEX7 270240 sc-eQTL 1.41e-01 0.169 0.115 0.219 B_Naive2 L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 -774410 sc-eQTL 8.46e-01 0.0163 0.0838 0.219 B_Naive2 L2
ENSG00000197442 MAP3K5 300327 sc-eQTL 6.56e-02 -0.164 0.0885 0.219 B_Naive2 L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 -775429 sc-eQTL 1.44e-01 -0.158 0.108 0.219 B_Naive2 L2
ENSG00000027697 IFNGR1 -126645 sc-eQTL 6.54e-01 0.0439 0.0977 0.22 CD4_CTL L2
ENSG00000029363 BCLAF1 802953 sc-eQTL 3.77e-01 0.0767 0.0866 0.22 CD4_CTL L2
ENSG00000112357 PEX7 270240 sc-eQTL 4.41e-01 -0.0836 0.108 0.22 CD4_CTL L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 -774410 sc-eQTL 3.09e-01 -0.0652 0.0639 0.22 CD4_CTL L2
ENSG00000197442 MAP3K5 300327 sc-eQTL 4.82e-01 -0.072 0.102 0.22 CD4_CTL L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 -775429 sc-eQTL 7.56e-01 -0.031 0.0997 0.22 CD4_CTL L2
ENSG00000027697 IFNGR1 -126645 sc-eQTL 2.10e-01 -0.0683 0.0543 0.218 CD4_Naive L2
ENSG00000029363 BCLAF1 802953 sc-eQTL 8.95e-01 -0.0058 0.0437 0.218 CD4_Naive L2
ENSG00000112357 PEX7 270240 sc-eQTL 7.63e-01 0.0311 0.103 0.218 CD4_Naive L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 -774410 sc-eQTL 9.72e-01 -0.00207 0.0596 0.218 CD4_Naive L2
ENSG00000197442 MAP3K5 300327 sc-eQTL 4.79e-01 -0.031 0.0437 0.218 CD4_Naive L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 -775429 sc-eQTL 2.61e-02 -0.171 0.0762 0.218 CD4_Naive L2
ENSG00000027697 IFNGR1 -126645 sc-eQTL 4.10e-02 -0.153 0.0746 0.218 CD4_TCM L2
ENSG00000029363 BCLAF1 802953 sc-eQTL 4.24e-01 0.038 0.0475 0.218 CD4_TCM L2
ENSG00000112357 PEX7 270240 sc-eQTL 3.29e-01 0.108 0.11 0.218 CD4_TCM L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 -774410 sc-eQTL 8.23e-01 0.0122 0.0543 0.218 CD4_TCM L2
ENSG00000197442 MAP3K5 300327 sc-eQTL 1.03e-01 -0.101 0.0614 0.218 CD4_TCM L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 -775429 sc-eQTL 5.70e-01 -0.0433 0.076 0.218 CD4_TCM L2
ENSG00000027697 IFNGR1 -126645 sc-eQTL 6.75e-02 -0.157 0.0856 0.218 CD4_TEM L2
ENSG00000029363 BCLAF1 802953 sc-eQTL 9.71e-01 0.00223 0.0612 0.218 CD4_TEM L2
ENSG00000112357 PEX7 270240 sc-eQTL 2.02e-01 -0.142 0.111 0.218 CD4_TEM L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 -774410 sc-eQTL 1.54e-01 0.0816 0.0571 0.218 CD4_TEM L2
ENSG00000197442 MAP3K5 300327 sc-eQTL 2.95e-01 -0.0928 0.0883 0.218 CD4_TEM L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 -775429 sc-eQTL 1.52e-01 -0.132 0.0915 0.218 CD4_TEM L2
ENSG00000027697 IFNGR1 -126645 sc-eQTL 9.68e-01 0.00318 0.0785 0.218 CD8_CTL L2
ENSG00000029363 BCLAF1 802953 sc-eQTL 3.42e-01 0.0498 0.0522 0.218 CD8_CTL L2
ENSG00000112357 PEX7 270240 sc-eQTL 2.72e-01 0.118 0.108 0.218 CD8_CTL L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 -774410 sc-eQTL 7.47e-01 -0.0213 0.066 0.218 CD8_CTL L2
ENSG00000197442 MAP3K5 300327 sc-eQTL 4.04e-01 0.0778 0.0931 0.218 CD8_CTL L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 -775429 sc-eQTL 7.50e-01 -0.0296 0.0928 0.218 CD8_CTL L2
ENSG00000027697 IFNGR1 -126645 sc-eQTL 2.79e-02 -0.17 0.0769 0.218 CD8_Naive L2
ENSG00000029363 BCLAF1 802953 sc-eQTL 9.40e-01 -0.00412 0.0543 0.218 CD8_Naive L2
ENSG00000112357 PEX7 270240 sc-eQTL 8.52e-01 -0.0211 0.113 0.218 CD8_Naive L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 -774410 sc-eQTL 6.09e-01 0.0312 0.0608 0.218 CD8_Naive L2
ENSG00000197442 MAP3K5 300327 sc-eQTL 7.32e-01 -0.0247 0.0721 0.218 CD8_Naive L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 -775429 sc-eQTL 5.57e-01 -0.053 0.0899 0.218 CD8_Naive L2
ENSG00000027697 IFNGR1 -126645 sc-eQTL 6.99e-01 0.0401 0.103 0.225 CD8_TCM L2
ENSG00000029363 BCLAF1 802953 sc-eQTL 5.88e-01 -0.0421 0.0776 0.225 CD8_TCM L2
ENSG00000112357 PEX7 270240 sc-eQTL 3.30e-01 -0.116 0.119 0.225 CD8_TCM L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 -774410 sc-eQTL 6.28e-01 -0.0272 0.0561 0.225 CD8_TCM L2
ENSG00000197442 MAP3K5 300327 sc-eQTL 7.27e-01 -0.035 0.1 0.225 CD8_TCM L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 -775429 sc-eQTL 2.64e-01 0.115 0.102 0.225 CD8_TCM L2
ENSG00000027697 IFNGR1 -126645 sc-eQTL 5.15e-01 -0.0659 0.101 0.21 CD8_TEM L2
ENSG00000029363 BCLAF1 802953 sc-eQTL 7.10e-01 -0.0355 0.0954 0.21 CD8_TEM L2
ENSG00000112357 PEX7 270240 sc-eQTL 6.03e-01 0.0606 0.116 0.21 CD8_TEM L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 -774410 sc-eQTL 8.61e-01 0.0131 0.0746 0.21 CD8_TEM L2
ENSG00000197442 MAP3K5 300327 sc-eQTL 7.71e-01 0.0336 0.115 0.21 CD8_TEM L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 -775429 sc-eQTL 5.17e-01 -0.0717 0.111 0.21 CD8_TEM L2
ENSG00000027697 IFNGR1 -126645 sc-eQTL 2.12e-01 -0.0976 0.078 0.221 MAIT L2
ENSG00000029363 BCLAF1 802953 sc-eQTL 7.82e-01 0.018 0.065 0.221 MAIT L2
ENSG00000112357 PEX7 270240 sc-eQTL 4.31e-01 -0.0837 0.106 0.221 MAIT L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 -774410 sc-eQTL 8.97e-01 0.00683 0.0527 0.221 MAIT L2
ENSG00000146410 MTFR2 842469 sc-eQTL 5.61e-01 0.0511 0.0877 0.221 MAIT L2
ENSG00000197442 MAP3K5 300327 sc-eQTL 1.58e-01 0.13 0.0913 0.221 MAIT L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 -775429 sc-eQTL 6.07e-01 0.0501 0.0973 0.221 MAIT L2
ENSG00000027697 IFNGR1 -126645 sc-eQTL 5.21e-01 -0.0558 0.0867 0.22 NK_CD56bright L2
ENSG00000029363 BCLAF1 802953 sc-eQTL 6.86e-01 -0.0259 0.064 0.22 NK_CD56bright L2
ENSG00000112357 PEX7 270240 sc-eQTL 3.61e-01 0.103 0.113 0.22 NK_CD56bright L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 -774410 sc-eQTL 6.09e-01 0.033 0.0646 0.22 NK_CD56bright L2
ENSG00000197442 MAP3K5 300327 sc-eQTL 6.95e-01 -0.0386 0.0982 0.22 NK_CD56bright L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 -775429 sc-eQTL 4.17e-01 0.0836 0.103 0.22 NK_CD56bright L2
ENSG00000027697 IFNGR1 -126645 sc-eQTL 3.20e-01 -0.0684 0.0685 0.22 NK_CD56dim L2
ENSG00000029363 BCLAF1 802953 sc-eQTL 8.28e-01 -0.00976 0.0449 0.22 NK_CD56dim L2
ENSG00000112357 PEX7 270240 sc-eQTL 8.15e-01 0.0278 0.118 0.22 NK_CD56dim L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 -774410 sc-eQTL 6.95e-01 0.0254 0.0647 0.22 NK_CD56dim L2
ENSG00000197442 MAP3K5 300327 sc-eQTL 7.46e-01 0.0302 0.0931 0.22 NK_CD56dim L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 -775429 sc-eQTL 3.62e-01 -0.0884 0.0967 0.22 NK_CD56dim L2
ENSG00000027697 IFNGR1 -126645 sc-eQTL 4.04e-02 -0.182 0.0881 0.215 NK_HLA L2
ENSG00000029363 BCLAF1 802953 sc-eQTL 9.49e-01 0.0048 0.0754 0.215 NK_HLA L2
ENSG00000112357 PEX7 270240 sc-eQTL 6.78e-02 0.206 0.112 0.215 NK_HLA L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 -774410 sc-eQTL 4.82e-01 -0.0497 0.0705 0.215 NK_HLA L2
ENSG00000197442 MAP3K5 300327 sc-eQTL 1.08e-01 0.18 0.111 0.215 NK_HLA L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 -775429 sc-eQTL 7.41e-02 -0.203 0.113 0.215 NK_HLA L2
ENSG00000027697 IFNGR1 -126645 sc-eQTL 4.26e-02 -0.147 0.0723 0.22 NK_cytokine L2
ENSG00000029363 BCLAF1 802953 sc-eQTL 7.58e-01 0.0168 0.0545 0.22 NK_cytokine L2
ENSG00000112357 PEX7 270240 sc-eQTL 9.55e-01 0.00641 0.115 0.22 NK_cytokine L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 -774410 sc-eQTL 5.46e-01 0.0394 0.0651 0.22 NK_cytokine L2
ENSG00000197442 MAP3K5 300327 sc-eQTL 8.72e-01 0.0145 0.0895 0.22 NK_cytokine L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 -775429 sc-eQTL 8.72e-01 -0.0159 0.0982 0.22 NK_cytokine L2
ENSG00000027697 IFNGR1 -126645 sc-eQTL 1.50e-02 -0.36 0.146 0.204 PB L2
ENSG00000029363 BCLAF1 802953 sc-eQTL 4.85e-02 -0.253 0.127 0.204 PB L2
ENSG00000112357 PEX7 270240 sc-eQTL 9.24e-01 0.0147 0.154 0.204 PB L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 -774410 sc-eQTL 7.27e-01 0.0407 0.116 0.204 PB L2
ENSG00000197442 MAP3K5 300327 sc-eQTL 1.49e-01 -0.191 0.131 0.204 PB L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 -775429 sc-eQTL 3.22e-01 0.139 0.139 0.204 PB L2
ENSG00000027697 IFNGR1 -126645 sc-eQTL 8.17e-01 0.0205 0.0883 0.222 Pro_T L2
ENSG00000029363 BCLAF1 802953 sc-eQTL 9.65e-01 -0.00397 0.0915 0.222 Pro_T L2
ENSG00000112357 PEX7 270240 sc-eQTL 3.80e-01 0.0941 0.107 0.222 Pro_T L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 -774410 sc-eQTL 2.34e-01 0.064 0.0536 0.222 Pro_T L2
ENSG00000146410 MTFR2 842469 sc-eQTL 5.12e-01 0.0489 0.0745 0.222 Pro_T L2
ENSG00000197442 MAP3K5 300327 sc-eQTL 1.03e-01 -0.169 0.103 0.222 Pro_T L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 -775429 sc-eQTL 9.31e-01 -0.00901 0.104 0.222 Pro_T L2
ENSG00000027697 IFNGR1 -126645 sc-eQTL 1.68e-01 -0.141 0.102 0.218 Treg L2
ENSG00000029363 BCLAF1 802953 sc-eQTL 1.77e-01 -0.0896 0.0661 0.218 Treg L2
ENSG00000112357 PEX7 270240 sc-eQTL 9.55e-01 0.00608 0.109 0.218 Treg L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 -774410 sc-eQTL 9.76e-01 0.00197 0.0654 0.218 Treg L2
ENSG00000197442 MAP3K5 300327 sc-eQTL 6.48e-01 0.0324 0.0708 0.218 Treg L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 -775429 sc-eQTL 8.88e-01 -0.0141 0.0997 0.218 Treg L2
ENSG00000027697 IFNGR1 -126645 sc-eQTL 7.73e-01 0.025 0.0866 0.222 cDC L2
ENSG00000029363 BCLAF1 802953 sc-eQTL 1.43e-01 0.128 0.0868 0.222 cDC L2
ENSG00000112357 PEX7 270240 sc-eQTL 6.22e-01 0.0553 0.112 0.222 cDC L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 -774410 sc-eQTL 9.22e-01 0.00841 0.0854 0.222 cDC L2
ENSG00000135525 MAP7 541985 sc-eQTL 4.04e-01 0.0833 0.0997 0.222 cDC L2
ENSG00000197442 MAP3K5 300327 sc-eQTL 9.71e-01 -0.00315 0.0879 0.222 cDC L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 -775429 sc-eQTL 3.27e-01 0.109 0.111 0.222 cDC L2
ENSG00000286646 AL121933.2 308759 sc-eQTL 9.57e-01 0.00619 0.114 0.222 cDC L2
ENSG00000027697 IFNGR1 -126645 sc-eQTL 3.04e-01 -0.0626 0.0608 0.218 cMono_IL1B L2
ENSG00000029363 BCLAF1 802953 sc-eQTL 5.59e-01 0.0382 0.0653 0.218 cMono_IL1B L2
ENSG00000112357 PEX7 270240 sc-eQTL 3.24e-01 -0.108 0.109 0.218 cMono_IL1B L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 -774410 sc-eQTL 4.26e-01 0.0522 0.0655 0.218 cMono_IL1B L2
ENSG00000135525 MAP7 541985 sc-eQTL 2.76e-02 -0.207 0.0933 0.218 cMono_IL1B L2
ENSG00000197442 MAP3K5 300327 sc-eQTL 9.13e-01 -0.00743 0.0682 0.218 cMono_IL1B L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 -775429 sc-eQTL 7.38e-01 0.0235 0.07 0.218 cMono_IL1B L2
ENSG00000286646 AL121933.2 308759 sc-eQTL 3.41e-02 0.185 0.0868 0.218 cMono_IL1B L2
ENSG00000027697 IFNGR1 -126645 sc-eQTL 6.61e-02 -0.129 0.07 0.218 cMono_S100A L2
ENSG00000029363 BCLAF1 802953 sc-eQTL 2.88e-01 0.077 0.0723 0.218 cMono_S100A L2
ENSG00000112357 PEX7 270240 sc-eQTL 3.81e-01 -0.0993 0.113 0.218 cMono_S100A L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 -774410 sc-eQTL 5.54e-01 -0.0371 0.0626 0.218 cMono_S100A L2
ENSG00000135525 MAP7 541985 sc-eQTL 9.88e-01 0.00162 0.106 0.218 cMono_S100A L2
ENSG00000197442 MAP3K5 300327 sc-eQTL 4.51e-01 -0.0642 0.0851 0.218 cMono_S100A L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 -775429 sc-eQTL 2.05e-01 -0.114 0.0897 0.218 cMono_S100A L2
ENSG00000286646 AL121933.2 308759 sc-eQTL 5.57e-01 0.0517 0.0878 0.218 cMono_S100A L2
ENSG00000027697 IFNGR1 -126645 sc-eQTL 5.80e-01 0.0567 0.102 0.215 gdT L2
ENSG00000029363 BCLAF1 802953 sc-eQTL 6.10e-01 -0.0461 0.0901 0.215 gdT L2
ENSG00000112357 PEX7 270240 sc-eQTL 4.16e-01 -0.106 0.129 0.215 gdT L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 -774410 sc-eQTL 9.49e-01 0.00404 0.063 0.215 gdT L2
ENSG00000146410 MTFR2 842469 sc-eQTL 7.67e-01 0.0295 0.0994 0.215 gdT L2
ENSG00000197442 MAP3K5 300327 sc-eQTL 6.58e-01 0.0591 0.133 0.215 gdT L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 -775429 sc-eQTL 2.19e-01 -0.14 0.114 0.215 gdT L2
ENSG00000027697 IFNGR1 -126645 sc-eQTL 3.82e-01 -0.0663 0.0757 0.222 intMono L2
ENSG00000029363 BCLAF1 802953 sc-eQTL 1.09e-01 0.16 0.0995 0.222 intMono L2
ENSG00000112357 PEX7 270240 sc-eQTL 7.90e-01 -0.0272 0.102 0.222 intMono L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 -774410 sc-eQTL 8.05e-01 0.0162 0.0654 0.222 intMono L2
ENSG00000135525 MAP7 541985 sc-eQTL 4.98e-01 0.0682 0.1 0.222 intMono L2
ENSG00000197442 MAP3K5 300327 sc-eQTL 3.77e-01 0.0942 0.106 0.222 intMono L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 -775429 sc-eQTL 6.78e-01 0.0406 0.0975 0.222 intMono L2
ENSG00000286646 AL121933.2 308759 sc-eQTL 3.61e-01 0.103 0.112 0.222 intMono L2
ENSG00000027697 IFNGR1 -126645 sc-eQTL 4.91e-03 -0.249 0.0874 0.219 ncMono L2
ENSG00000029363 BCLAF1 802953 sc-eQTL 1.41e-01 -0.102 0.0689 0.219 ncMono L2
ENSG00000112357 PEX7 270240 sc-eQTL 7.51e-01 0.0351 0.11 0.219 ncMono L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 -774410 sc-eQTL 4.22e-01 0.0634 0.0788 0.219 ncMono L2
ENSG00000135525 MAP7 541985 sc-eQTL 6.09e-01 -0.05 0.0975 0.219 ncMono L2
ENSG00000197442 MAP3K5 300327 sc-eQTL 6.14e-01 0.0517 0.102 0.219 ncMono L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 -775429 sc-eQTL 9.86e-01 -0.0017 0.0987 0.219 ncMono L2
ENSG00000286646 AL121933.2 308759 sc-eQTL 8.62e-01 -0.0182 0.104 0.219 ncMono L2
ENSG00000027697 IFNGR1 -126645 sc-eQTL 6.58e-01 -0.0448 0.101 0.22 pDC L2
ENSG00000029363 BCLAF1 802953 sc-eQTL 5.12e-01 0.0497 0.0757 0.22 pDC L2
ENSG00000112357 PEX7 270240 sc-eQTL 4.78e-01 -0.079 0.111 0.22 pDC L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 -774410 sc-eQTL 9.31e-01 -0.00814 0.0937 0.22 pDC L2
ENSG00000135525 MAP7 541985 sc-eQTL 2.53e-01 -0.0887 0.0773 0.22 pDC L2
ENSG00000197442 MAP3K5 300327 sc-eQTL 2.29e-01 0.15 0.124 0.22 pDC L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 -775429 sc-eQTL 2.57e-01 -0.108 0.0947 0.22 pDC L2
ENSG00000286646 AL121933.2 308759 sc-eQTL 2.43e-01 0.134 0.114 0.22 pDC L2
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000027697 IFNGR1 -126645 sc-eQTL 7.88e-01 -0.0246 0.0911 0.218 B_Memory LOneK1K
ENSG00000029363 BCLAF1 802953 sc-eQTL 4.84e-01 0.0358 0.0511 0.218 B_Memory LOneK1K
ENSG00000112357 PEX7 270240 sc-eQTL 8.63e-02 0.179 0.104 0.218 B_Memory LOneK1K
ENSG00000118503 TNFAIP3 -774410 sc-eQTL 3.41e-01 -0.0612 0.0641 0.218 B_Memory LOneK1K
ENSG00000197442 MAP3K5 300327 sc-eQTL 8.82e-01 -0.0126 0.0851 0.218 B_Memory LOneK1K
ENSG00000237499 WAKMAR2 -775429 sc-eQTL 7.51e-01 -0.0345 0.109 0.218 B_Memory LOneK1K
ENSG00000027697 IFNGR1 -126645 sc-eQTL 9.31e-02 -0.153 0.0909 0.218 B_Naive LOneK1K
ENSG00000029363 BCLAF1 802953 sc-eQTL 3.60e-01 -0.0385 0.042 0.218 B_Naive LOneK1K
ENSG00000112357 PEX7 270240 sc-eQTL 2.26e-01 0.135 0.111 0.218 B_Naive LOneK1K
ENSG00000118503 TNFAIP3 -774410 sc-eQTL 9.62e-01 -0.00251 0.0524 0.218 B_Naive LOneK1K
ENSG00000197442 MAP3K5 300327 sc-eQTL 7.95e-01 -0.02 0.0768 0.218 B_Naive LOneK1K
ENSG00000237499 WAKMAR2 -775429 sc-eQTL 7.08e-01 -0.035 0.0933 0.218 B_Naive LOneK1K
ENSG00000027697 IFNGR1 -126645 sc-eQTL 9.10e-02 -0.103 0.0608 0.218 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000029363 BCLAF1 802953 sc-eQTL 2.50e-01 0.0655 0.0568 0.218 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000112357 PEX7 270240 sc-eQTL 2.64e-01 -0.123 0.11 0.218 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000118503 TNFAIP3 -774410 sc-eQTL 5.67e-01 0.0325 0.0566 0.218 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000135525 MAP7 541985 sc-eQTL 3.12e-02 -0.211 0.0972 0.218 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000197442 MAP3K5 300327 sc-eQTL 3.36e-01 -0.0639 0.0662 0.218 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000237499 WAKMAR2 -775429 sc-eQTL 9.53e-01 -0.00401 0.0678 0.218 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000286646 AL121933.2 308759 sc-eQTL 1.41e-01 0.116 0.0785 0.218 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000027697 IFNGR1 -126645 sc-eQTL 3.05e-02 -0.16 0.0734 0.22 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000029363 BCLAF1 802953 sc-eQTL 9.38e-01 0.00526 0.0671 0.22 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000112357 PEX7 270240 sc-eQTL 9.66e-01 0.00474 0.112 0.22 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000118503 TNFAIP3 -774410 sc-eQTL 8.00e-01 0.0176 0.0693 0.22 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000135525 MAP7 541985 sc-eQTL 8.28e-01 0.0235 0.108 0.22 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000197442 MAP3K5 300327 sc-eQTL 1.90e-01 0.116 0.0886 0.22 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000237499 WAKMAR2 -775429 sc-eQTL 8.13e-01 0.022 0.0929 0.22 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000286646 AL121933.2 308759 sc-eQTL 4.06e-01 0.0877 0.105 0.22 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000027697 IFNGR1 -126645 sc-eQTL 6.26e-02 -0.131 0.07 0.22 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000029363 BCLAF1 802953 sc-eQTL 6.91e-01 0.0163 0.0409 0.22 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000112357 PEX7 270240 sc-eQTL 7.38e-01 0.0399 0.119 0.22 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000118503 TNFAIP3 -774410 sc-eQTL 9.06e-01 0.00758 0.0643 0.22 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000197442 MAP3K5 300327 sc-eQTL 6.45e-01 0.04 0.0868 0.22 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000237499 WAKMAR2 -775429 sc-eQTL 3.13e-01 -0.0907 0.0898 0.22 NK_CD56dim LOneK1K

Statistical fine-mapping results from Japan COVID-19 Task Force
(Shown only for PIP>0.001)
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
PIP (SuSiE)
PIP (FINEMAP)
MAF
ENSG00000027697 IFNGR1 -126645 pQTL 5.38e-05 -0.0788 0.0194 0.0 0.0 0.185
ENSG00000027697 IFNGR1 -126645 eQTL 1.18e-05 -0.0754 0.0171 0.0 0.0 0.18
ENSG00000182747 SLC35D3 170503 eQTL 0.000337 0.143 0.0396 0.0 0.0 0.18

Expression Modifier Score(EMS) for GTEx 49tissues
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Whole Blood
Muscle Skeletal
Liver
Brain Cerebellum
Prostate
Spleen
Skin Sun Exposed Lower leg
Artery Coronary
Esophagus Muscularis
Esophagus Gastroesophageal Junction
Artery Tibial
Heart Atrial Appendage
Nerve Tibial
Heart Left Ventricle
Adrenal Gland
Adipose Visceral Omentum
Pancreas
Lung
Pituitary
Brain Nucleus accumbens basal ganglia
Colon Transverse
Adipose Subcutaneous
Esophagus Mucosa
Brain Cortex
Thyroid
Stomach
Breast Mammary Tissue
Colon Sigmoid
Skin Not Sun Exposed Suprapubic
Testis
Artery Aorta
Brain Amygdala
Brain Anterior cingulate cortex BA24
Brain Caudate basal ganglia
Brain Cerebellar Hemisphere
Brain Frontal Cortex BA9
Brain Hippocampus
Brain Hypothalamus
Brain Putamen basal ganglia
Brain Spinal cord cervical c-1
Brain Substantia nigra
Cells Cultured fibroblasts
Cells EBV-transformed lymphocytes
Kidney Cortex
Minor Salivary Gland
Ovary
Small Intestine Terminal Ileum
Uterus
Vagina
ENSG00000027697 IFNGR1 -126645 4.32e-06 4.33e-06 5.96e-07 1.82e-06 8.58e-07 1.03e-06 2.92e-06 1.01e-06 3.14e-06 1.67e-06 4.2e-06 2.55e-06 6.49e-06 1.37e-06 9.2e-07 2e-06 1.82e-06 2.38e-06 1.47e-06 1.05e-06 1.62e-06 3.7e-06 3.32e-06 1.66e-06 4.89e-06 1.17e-06 1.77e-06 1.46e-06 3.88e-06 3.38e-06 1.98e-06 4.69e-07 5.48e-07 1.82e-06 1.88e-06 9.33e-07 9.24e-07 5.04e-07 1.33e-06 3.46e-07 2.08e-07 4.65e-06 4.77e-07 1.8e-07 3.46e-07 3.52e-07 8.74e-07 2.62e-07 1.56e-07
ENSG00000220412 \N -614397 3.14e-07 1.59e-07 5.72e-08 2.27e-07 1.01e-07 8.89e-08 2.16e-07 5.82e-08 1.66e-07 9.35e-08 1.76e-07 1.31e-07 2.29e-07 8e-08 5.69e-08 7.98e-08 4.35e-08 1.77e-07 7.18e-08 5.75e-08 1.22e-07 1.47e-07 1.64e-07 3.42e-08 2.28e-07 1.31e-07 1.19e-07 1.17e-07 1.32e-07 1.1e-07 1.26e-07 4.61e-08 3.38e-08 9.08e-08 4.78e-08 2.79e-08 4.07e-08 7.61e-08 6.5e-08 5.56e-08 4.42e-08 1.59e-07 4.87e-08 7.18e-09 3.87e-08 6.53e-09 8.74e-08 2.1e-09 4.83e-08