Genes within 1Mb (chr6:137092090:G:A):

View on , UCSC , GTEx , gnomAD


Immune cell-type specific single cell cis-eQTLs in OASIS
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000027697 IFNGR1 -127359 sc-eQTL 1.73e-01 -0.118 0.0865 0.212 B L1
ENSG00000029363 BCLAF1 802239 sc-eQTL 6.91e-01 -0.0154 0.0387 0.212 B L1
ENSG00000112357 PEX7 269526 sc-eQTL 8.59e-02 0.176 0.102 0.212 B L1
ENSG00000118503 TNFAIP3 -775124 sc-eQTL 6.02e-01 -0.0286 0.0548 0.212 B L1
ENSG00000197442 MAP3K5 299613 sc-eQTL 1.82e-01 -0.102 0.076 0.212 B L1
ENSG00000237499 WAKMAR2 -776143 sc-eQTL 5.15e-01 -0.0561 0.0861 0.212 B L1
ENSG00000027697 IFNGR1 -127359 sc-eQTL 3.98e-02 -0.119 0.0574 0.212 CD4T L1
ENSG00000029363 BCLAF1 802239 sc-eQTL 9.35e-01 -0.00359 0.0439 0.212 CD4T L1
ENSG00000112357 PEX7 269526 sc-eQTL 8.42e-01 -0.0186 0.0934 0.212 CD4T L1
ENSG00000118503 TNFAIP3 -775124 sc-eQTL 9.34e-01 0.00485 0.0587 0.212 CD4T L1
ENSG00000197442 MAP3K5 299613 sc-eQTL 1.23e-01 -0.0689 0.0445 0.212 CD4T L1
ENSG00000237499 WAKMAR2 -776143 sc-eQTL 1.08e-01 -0.119 0.0735 0.212 CD4T L1
ENSG00000027697 IFNGR1 -127359 sc-eQTL 3.87e-01 -0.0572 0.066 0.212 CD8T L1
ENSG00000029363 BCLAF1 802239 sc-eQTL 4.71e-01 0.0323 0.0447 0.212 CD8T L1
ENSG00000112357 PEX7 269526 sc-eQTL 4.83e-01 -0.0774 0.11 0.212 CD8T L1
ENSG00000118503 TNFAIP3 -775124 sc-eQTL 6.36e-01 0.0264 0.0556 0.212 CD8T L1
ENSG00000197442 MAP3K5 299613 sc-eQTL 8.88e-01 -0.0083 0.0588 0.212 CD8T L1
ENSG00000237499 WAKMAR2 -776143 sc-eQTL 4.79e-01 0.0579 0.0816 0.212 CD8T L1
ENSG00000027697 IFNGR1 -127359 sc-eQTL 9.41e-01 -0.00573 0.0778 0.214 DC L1
ENSG00000029363 BCLAF1 802239 sc-eQTL 8.05e-01 0.0173 0.07 0.214 DC L1
ENSG00000112357 PEX7 269526 sc-eQTL 8.08e-01 0.0266 0.11 0.214 DC L1
ENSG00000118503 TNFAIP3 -775124 sc-eQTL 9.11e-01 -0.00931 0.0831 0.214 DC L1
ENSG00000135525 MAP7 541271 sc-eQTL 7.82e-01 -0.025 0.09 0.214 DC L1
ENSG00000197442 MAP3K5 299613 sc-eQTL 9.40e-01 0.00653 0.0863 0.214 DC L1
ENSG00000237499 WAKMAR2 -776143 sc-eQTL 6.64e-01 0.0369 0.0847 0.214 DC L1
ENSG00000286646 AL121933.2 308045 sc-eQTL 6.65e-01 0.0488 0.113 0.214 DC L1
ENSG00000027697 IFNGR1 -127359 sc-eQTL 8.44e-02 -0.113 0.0651 0.212 Mono L1
ENSG00000029363 BCLAF1 802239 sc-eQTL 3.93e-01 0.0478 0.0559 0.212 Mono L1
ENSG00000112357 PEX7 269526 sc-eQTL 2.65e-01 -0.123 0.11 0.212 Mono L1
ENSG00000118503 TNFAIP3 -775124 sc-eQTL 4.83e-01 0.039 0.0555 0.212 Mono L1
ENSG00000135525 MAP7 541271 sc-eQTL 9.59e-02 -0.162 0.0966 0.212 Mono L1
ENSG00000197442 MAP3K5 299613 sc-eQTL 6.09e-01 -0.0332 0.0648 0.212 Mono L1
ENSG00000237499 WAKMAR2 -776143 sc-eQTL 8.62e-01 0.012 0.0689 0.212 Mono L1
ENSG00000286646 AL121933.2 308045 sc-eQTL 1.68e-01 0.108 0.0782 0.212 Mono L1
ENSG00000027697 IFNGR1 -127359 sc-eQTL 4.12e-02 -0.152 0.0741 0.212 NK L1
ENSG00000029363 BCLAF1 802239 sc-eQTL 9.56e-01 0.00222 0.0397 0.212 NK L1
ENSG00000112357 PEX7 269526 sc-eQTL 2.95e-01 0.121 0.115 0.212 NK L1
ENSG00000118503 TNFAIP3 -775124 sc-eQTL 6.93e-01 0.0247 0.0623 0.212 NK L1
ENSG00000197442 MAP3K5 299613 sc-eQTL 8.32e-01 0.0189 0.0892 0.212 NK L1
ENSG00000237499 WAKMAR2 -776143 sc-eQTL 4.18e-01 -0.0715 0.0881 0.212 NK L1
ENSG00000027697 IFNGR1 -127359 sc-eQTL 3.77e-01 -0.0605 0.0683 0.212 Other_T L1
ENSG00000029363 BCLAF1 802239 sc-eQTL 5.98e-01 -0.0303 0.0574 0.212 Other_T L1
ENSG00000112357 PEX7 269526 sc-eQTL 5.90e-01 -0.0603 0.112 0.212 Other_T L1
ENSG00000118503 TNFAIP3 -775124 sc-eQTL 8.34e-01 0.00892 0.0426 0.212 Other_T L1
ENSG00000146410 MTFR2 841755 sc-eQTL 8.85e-01 0.00931 0.0645 0.212 Other_T L1
ENSG00000197442 MAP3K5 299613 sc-eQTL 8.45e-01 0.0161 0.0822 0.212 Other_T L1
ENSG00000237499 WAKMAR2 -776143 sc-eQTL 7.50e-01 -0.027 0.0845 0.212 Other_T L1
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000027697 IFNGR1 -127359 sc-eQTL 1.17e-01 -0.18 0.115 0.217 B_Activated L2
ENSG00000029363 BCLAF1 802239 sc-eQTL 5.73e-01 0.0528 0.0936 0.217 B_Activated L2
ENSG00000112357 PEX7 269526 sc-eQTL 3.16e-02 0.243 0.112 0.217 B_Activated L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 -775124 sc-eQTL 1.46e-01 0.166 0.113 0.217 B_Activated L2
ENSG00000197442 MAP3K5 299613 sc-eQTL 2.66e-01 -0.142 0.127 0.217 B_Activated L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 -776143 sc-eQTL 8.01e-01 -0.0251 0.0995 0.217 B_Activated L2
ENSG00000027697 IFNGR1 -127359 sc-eQTL 5.58e-01 -0.0599 0.102 0.212 B_Intermediate L2
ENSG00000029363 BCLAF1 802239 sc-eQTL 6.36e-01 0.0276 0.0581 0.212 B_Intermediate L2
ENSG00000112357 PEX7 269526 sc-eQTL 1.41e-01 0.157 0.106 0.212 B_Intermediate L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 -775124 sc-eQTL 9.79e-01 -0.00199 0.0765 0.212 B_Intermediate L2
ENSG00000197442 MAP3K5 299613 sc-eQTL 6.91e-01 -0.0368 0.0924 0.212 B_Intermediate L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 -776143 sc-eQTL 6.82e-01 -0.0445 0.108 0.212 B_Intermediate L2
ENSG00000027697 IFNGR1 -127359 sc-eQTL 4.96e-01 -0.0766 0.112 0.213 B_Memory L2
ENSG00000029363 BCLAF1 802239 sc-eQTL 7.94e-01 0.0174 0.0667 0.213 B_Memory L2
ENSG00000112357 PEX7 269526 sc-eQTL 5.85e-01 0.0621 0.113 0.213 B_Memory L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 -775124 sc-eQTL 4.45e-01 -0.0562 0.0734 0.213 B_Memory L2
ENSG00000197442 MAP3K5 299613 sc-eQTL 6.08e-01 0.0516 0.1 0.213 B_Memory L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 -776143 sc-eQTL 7.93e-01 -0.0287 0.109 0.213 B_Memory L2
ENSG00000027697 IFNGR1 -127359 sc-eQTL 8.77e-02 -0.149 0.087 0.212 B_Naive1 L2
ENSG00000029363 BCLAF1 802239 sc-eQTL 8.67e-01 -0.0084 0.0501 0.212 B_Naive1 L2
ENSG00000112357 PEX7 269526 sc-eQTL 3.48e-01 0.109 0.115 0.212 B_Naive1 L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 -775124 sc-eQTL 7.88e-01 -0.0158 0.0586 0.212 B_Naive1 L2
ENSG00000197442 MAP3K5 299613 sc-eQTL 7.44e-01 0.027 0.0824 0.212 B_Naive1 L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 -776143 sc-eQTL 8.42e-01 0.0184 0.0919 0.212 B_Naive1 L2
ENSG00000027697 IFNGR1 -127359 sc-eQTL 9.14e-01 0.0114 0.106 0.212 B_Naive2 L2
ENSG00000029363 BCLAF1 802239 sc-eQTL 2.03e-01 -0.0779 0.061 0.212 B_Naive2 L2
ENSG00000112357 PEX7 269526 sc-eQTL 1.34e-01 0.173 0.115 0.212 B_Naive2 L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 -775124 sc-eQTL 9.76e-01 -0.00255 0.0841 0.212 B_Naive2 L2
ENSG00000197442 MAP3K5 299613 sc-eQTL 4.26e-02 -0.181 0.0887 0.212 B_Naive2 L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 -776143 sc-eQTL 7.80e-02 -0.191 0.108 0.212 B_Naive2 L2
ENSG00000027697 IFNGR1 -127359 sc-eQTL 6.85e-01 0.0399 0.0984 0.214 CD4_CTL L2
ENSG00000029363 BCLAF1 802239 sc-eQTL 4.01e-01 0.0734 0.0872 0.214 CD4_CTL L2
ENSG00000112357 PEX7 269526 sc-eQTL 5.82e-01 -0.0602 0.109 0.214 CD4_CTL L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 -775124 sc-eQTL 2.57e-01 -0.0732 0.0643 0.214 CD4_CTL L2
ENSG00000197442 MAP3K5 299613 sc-eQTL 2.55e-01 -0.117 0.103 0.214 CD4_CTL L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 -776143 sc-eQTL 7.85e-01 -0.0275 0.1 0.214 CD4_CTL L2
ENSG00000027697 IFNGR1 -127359 sc-eQTL 2.45e-01 -0.0637 0.0547 0.212 CD4_Naive L2
ENSG00000029363 BCLAF1 802239 sc-eQTL 9.03e-01 -0.00535 0.044 0.212 CD4_Naive L2
ENSG00000112357 PEX7 269526 sc-eQTL 9.44e-01 0.00734 0.104 0.212 CD4_Naive L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 -775124 sc-eQTL 8.65e-01 -0.0102 0.0599 0.212 CD4_Naive L2
ENSG00000197442 MAP3K5 299613 sc-eQTL 4.50e-01 -0.0332 0.044 0.212 CD4_Naive L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 -776143 sc-eQTL 2.87e-02 -0.169 0.0768 0.212 CD4_Naive L2
ENSG00000027697 IFNGR1 -127359 sc-eQTL 5.95e-02 -0.142 0.075 0.212 CD4_TCM L2
ENSG00000029363 BCLAF1 802239 sc-eQTL 5.38e-01 0.0295 0.0477 0.212 CD4_TCM L2
ENSG00000112357 PEX7 269526 sc-eQTL 2.59e-01 0.125 0.111 0.212 CD4_TCM L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 -775124 sc-eQTL 8.79e-01 0.0083 0.0545 0.212 CD4_TCM L2
ENSG00000197442 MAP3K5 299613 sc-eQTL 7.80e-02 -0.109 0.0616 0.212 CD4_TCM L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 -776143 sc-eQTL 6.00e-01 -0.0401 0.0764 0.212 CD4_TCM L2
ENSG00000027697 IFNGR1 -127359 sc-eQTL 1.04e-01 -0.14 0.0861 0.212 CD4_TEM L2
ENSG00000029363 BCLAF1 802239 sc-eQTL 9.51e-01 0.00376 0.0615 0.212 CD4_TEM L2
ENSG00000112357 PEX7 269526 sc-eQTL 2.14e-01 -0.139 0.111 0.212 CD4_TEM L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 -775124 sc-eQTL 2.67e-01 0.0639 0.0574 0.212 CD4_TEM L2
ENSG00000197442 MAP3K5 299613 sc-eQTL 2.65e-01 -0.099 0.0887 0.212 CD4_TEM L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 -776143 sc-eQTL 1.44e-01 -0.135 0.0919 0.212 CD4_TEM L2
ENSG00000027697 IFNGR1 -127359 sc-eQTL 9.48e-01 -0.00519 0.079 0.212 CD8_CTL L2
ENSG00000029363 BCLAF1 802239 sc-eQTL 3.68e-01 0.0474 0.0526 0.212 CD8_CTL L2
ENSG00000112357 PEX7 269526 sc-eQTL 4.06e-01 0.0904 0.108 0.212 CD8_CTL L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 -775124 sc-eQTL 7.67e-01 -0.0197 0.0664 0.212 CD8_CTL L2
ENSG00000197442 MAP3K5 299613 sc-eQTL 4.67e-01 0.0682 0.0937 0.212 CD8_CTL L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 -776143 sc-eQTL 8.46e-01 -0.0182 0.0934 0.212 CD8_CTL L2
ENSG00000027697 IFNGR1 -127359 sc-eQTL 5.27e-02 -0.151 0.0776 0.212 CD8_Naive L2
ENSG00000029363 BCLAF1 802239 sc-eQTL 9.93e-01 -0.000456 0.0547 0.212 CD8_Naive L2
ENSG00000112357 PEX7 269526 sc-eQTL 8.50e-01 -0.0214 0.113 0.212 CD8_Naive L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 -775124 sc-eQTL 8.30e-01 0.0131 0.0612 0.212 CD8_Naive L2
ENSG00000197442 MAP3K5 299613 sc-eQTL 6.94e-01 -0.0286 0.0725 0.212 CD8_Naive L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 -776143 sc-eQTL 7.43e-01 -0.0297 0.0905 0.212 CD8_Naive L2
ENSG00000027697 IFNGR1 -127359 sc-eQTL 6.05e-01 0.0538 0.104 0.218 CD8_TCM L2
ENSG00000029363 BCLAF1 802239 sc-eQTL 4.23e-01 -0.0624 0.0778 0.218 CD8_TCM L2
ENSG00000112357 PEX7 269526 sc-eQTL 2.26e-01 -0.144 0.119 0.218 CD8_TCM L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 -775124 sc-eQTL 8.19e-01 -0.0129 0.0563 0.218 CD8_TCM L2
ENSG00000197442 MAP3K5 299613 sc-eQTL 6.54e-01 -0.045 0.1 0.218 CD8_TCM L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 -776143 sc-eQTL 2.48e-01 0.119 0.103 0.218 CD8_TCM L2
ENSG00000027697 IFNGR1 -127359 sc-eQTL 3.91e-01 -0.0871 0.101 0.203 CD8_TEM L2
ENSG00000029363 BCLAF1 802239 sc-eQTL 6.61e-01 -0.0421 0.0959 0.203 CD8_TEM L2
ENSG00000112357 PEX7 269526 sc-eQTL 6.47e-01 0.0536 0.117 0.203 CD8_TEM L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 -775124 sc-eQTL 9.77e-01 0.00221 0.0749 0.203 CD8_TEM L2
ENSG00000197442 MAP3K5 299613 sc-eQTL 8.90e-01 -0.016 0.116 0.203 CD8_TEM L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 -776143 sc-eQTL 7.30e-01 -0.0384 0.111 0.203 CD8_TEM L2
ENSG00000027697 IFNGR1 -127359 sc-eQTL 3.06e-01 -0.0806 0.0787 0.214 MAIT L2
ENSG00000029363 BCLAF1 802239 sc-eQTL 8.79e-01 0.00996 0.0655 0.214 MAIT L2
ENSG00000112357 PEX7 269526 sc-eQTL 4.16e-01 -0.087 0.107 0.214 MAIT L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 -775124 sc-eQTL 9.45e-01 -0.00368 0.0531 0.214 MAIT L2
ENSG00000146410 MTFR2 841755 sc-eQTL 6.06e-01 0.0457 0.0883 0.214 MAIT L2
ENSG00000197442 MAP3K5 299613 sc-eQTL 1.70e-01 0.127 0.092 0.214 MAIT L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 -776143 sc-eQTL 6.32e-01 0.047 0.0981 0.214 MAIT L2
ENSG00000027697 IFNGR1 -127359 sc-eQTL 3.42e-01 -0.0828 0.0869 0.213 NK_CD56bright L2
ENSG00000029363 BCLAF1 802239 sc-eQTL 9.72e-01 -0.00227 0.0643 0.213 NK_CD56bright L2
ENSG00000112357 PEX7 269526 sc-eQTL 3.45e-01 0.107 0.113 0.213 NK_CD56bright L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 -775124 sc-eQTL 6.45e-01 0.03 0.0648 0.213 NK_CD56bright L2
ENSG00000197442 MAP3K5 299613 sc-eQTL 4.50e-01 -0.0745 0.0985 0.213 NK_CD56bright L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 -776143 sc-eQTL 4.90e-01 0.0715 0.103 0.213 NK_CD56bright L2
ENSG00000027697 IFNGR1 -127359 sc-eQTL 3.41e-01 -0.0658 0.0689 0.213 NK_CD56dim L2
ENSG00000029363 BCLAF1 802239 sc-eQTL 7.37e-01 -0.0152 0.0451 0.213 NK_CD56dim L2
ENSG00000112357 PEX7 269526 sc-eQTL 7.78e-01 0.0336 0.119 0.213 NK_CD56dim L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 -775124 sc-eQTL 6.23e-01 0.032 0.065 0.213 NK_CD56dim L2
ENSG00000197442 MAP3K5 299613 sc-eQTL 9.43e-01 0.00668 0.0936 0.213 NK_CD56dim L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 -776143 sc-eQTL 4.12e-01 -0.0799 0.0973 0.213 NK_CD56dim L2
ENSG00000027697 IFNGR1 -127359 sc-eQTL 1.92e-02 -0.209 0.0886 0.208 NK_HLA L2
ENSG00000029363 BCLAF1 802239 sc-eQTL 8.58e-01 0.0137 0.0761 0.208 NK_HLA L2
ENSG00000112357 PEX7 269526 sc-eQTL 4.72e-02 0.226 0.113 0.208 NK_HLA L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 -775124 sc-eQTL 3.66e-01 -0.0644 0.0711 0.208 NK_HLA L2
ENSG00000197442 MAP3K5 299613 sc-eQTL 1.96e-01 0.146 0.113 0.208 NK_HLA L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 -776143 sc-eQTL 5.51e-02 -0.219 0.114 0.208 NK_HLA L2
ENSG00000027697 IFNGR1 -127359 sc-eQTL 4.08e-02 -0.149 0.0726 0.213 NK_cytokine L2
ENSG00000029363 BCLAF1 802239 sc-eQTL 7.95e-01 0.0142 0.0547 0.213 NK_cytokine L2
ENSG00000112357 PEX7 269526 sc-eQTL 9.41e-01 0.00859 0.115 0.213 NK_cytokine L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 -775124 sc-eQTL 4.98e-01 0.0444 0.0654 0.213 NK_cytokine L2
ENSG00000197442 MAP3K5 299613 sc-eQTL 8.51e-01 -0.0169 0.0899 0.213 NK_cytokine L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 -776143 sc-eQTL 7.93e-01 -0.0258 0.0986 0.213 NK_cytokine L2
ENSG00000027697 IFNGR1 -127359 sc-eQTL 1.56e-02 -0.362 0.148 0.196 PB L2
ENSG00000029363 BCLAF1 802239 sc-eQTL 1.51e-02 -0.314 0.127 0.196 PB L2
ENSG00000112357 PEX7 269526 sc-eQTL 9.54e-01 0.00896 0.156 0.196 PB L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 -775124 sc-eQTL 6.80e-01 0.0486 0.118 0.196 PB L2
ENSG00000197442 MAP3K5 299613 sc-eQTL 1.90e-01 -0.175 0.133 0.196 PB L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 -776143 sc-eQTL 1.97e-01 0.182 0.14 0.196 PB L2
ENSG00000027697 IFNGR1 -127359 sc-eQTL 6.56e-01 0.0395 0.0886 0.215 Pro_T L2
ENSG00000029363 BCLAF1 802239 sc-eQTL 8.49e-01 -0.0176 0.0919 0.215 Pro_T L2
ENSG00000112357 PEX7 269526 sc-eQTL 5.33e-01 0.0671 0.108 0.215 Pro_T L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 -775124 sc-eQTL 1.98e-01 0.0695 0.0538 0.215 Pro_T L2
ENSG00000146410 MTFR2 841755 sc-eQTL 5.71e-01 0.0424 0.0748 0.215 Pro_T L2
ENSG00000197442 MAP3K5 299613 sc-eQTL 1.14e-01 -0.165 0.104 0.215 Pro_T L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 -776143 sc-eQTL 9.44e-01 -0.00732 0.105 0.215 Pro_T L2
ENSG00000027697 IFNGR1 -127359 sc-eQTL 2.94e-01 -0.108 0.103 0.212 Treg L2
ENSG00000029363 BCLAF1 802239 sc-eQTL 2.60e-01 -0.0752 0.0666 0.212 Treg L2
ENSG00000112357 PEX7 269526 sc-eQTL 7.30e-01 0.0377 0.109 0.212 Treg L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 -775124 sc-eQTL 9.80e-01 -0.00161 0.0657 0.212 Treg L2
ENSG00000197442 MAP3K5 299613 sc-eQTL 5.65e-01 0.0411 0.0712 0.212 Treg L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 -776143 sc-eQTL 6.84e-01 -0.0409 0.1 0.212 Treg L2
ENSG00000027697 IFNGR1 -127359 sc-eQTL 5.26e-01 0.0551 0.0868 0.215 cDC L2
ENSG00000029363 BCLAF1 802239 sc-eQTL 1.72e-01 0.119 0.0871 0.215 cDC L2
ENSG00000112357 PEX7 269526 sc-eQTL 3.85e-01 0.0977 0.112 0.215 cDC L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 -775124 sc-eQTL 9.52e-01 0.00516 0.0856 0.215 cDC L2
ENSG00000135525 MAP7 541271 sc-eQTL 3.73e-01 0.0893 0.0999 0.215 cDC L2
ENSG00000197442 MAP3K5 299613 sc-eQTL 8.01e-01 -0.0222 0.0881 0.215 cDC L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 -776143 sc-eQTL 2.80e-01 0.121 0.111 0.215 cDC L2
ENSG00000286646 AL121933.2 308045 sc-eQTL 7.71e-01 -0.0334 0.115 0.215 cDC L2
ENSG00000027697 IFNGR1 -127359 sc-eQTL 5.30e-01 -0.0384 0.0611 0.212 cMono_IL1B L2
ENSG00000029363 BCLAF1 802239 sc-eQTL 7.08e-01 0.0246 0.0656 0.212 cMono_IL1B L2
ENSG00000112357 PEX7 269526 sc-eQTL 3.16e-01 -0.11 0.11 0.212 cMono_IL1B L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 -775124 sc-eQTL 5.16e-01 0.0428 0.0658 0.212 cMono_IL1B L2
ENSG00000135525 MAP7 541271 sc-eQTL 2.74e-02 -0.208 0.0937 0.212 cMono_IL1B L2
ENSG00000197442 MAP3K5 299613 sc-eQTL 8.25e-01 -0.0151 0.0684 0.212 cMono_IL1B L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 -776143 sc-eQTL 5.47e-01 0.0423 0.0702 0.212 cMono_IL1B L2
ENSG00000286646 AL121933.2 308045 sc-eQTL 3.07e-02 0.189 0.087 0.212 cMono_IL1B L2
ENSG00000027697 IFNGR1 -127359 sc-eQTL 9.56e-02 -0.118 0.0703 0.212 cMono_S100A L2
ENSG00000029363 BCLAF1 802239 sc-eQTL 3.76e-01 0.0644 0.0726 0.212 cMono_S100A L2
ENSG00000112357 PEX7 269526 sc-eQTL 3.24e-01 -0.112 0.113 0.212 cMono_S100A L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 -775124 sc-eQTL 4.60e-01 -0.0465 0.0628 0.212 cMono_S100A L2
ENSG00000135525 MAP7 541271 sc-eQTL 9.30e-01 0.00929 0.106 0.212 cMono_S100A L2
ENSG00000197442 MAP3K5 299613 sc-eQTL 3.98e-01 -0.0722 0.0854 0.212 cMono_S100A L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 -776143 sc-eQTL 1.25e-01 -0.138 0.0898 0.212 cMono_S100A L2
ENSG00000286646 AL121933.2 308045 sc-eQTL 7.07e-01 0.0331 0.0881 0.212 cMono_S100A L2
ENSG00000027697 IFNGR1 -127359 sc-eQTL 4.93e-01 0.0705 0.103 0.209 gdT L2
ENSG00000029363 BCLAF1 802239 sc-eQTL 6.08e-01 -0.0464 0.0904 0.209 gdT L2
ENSG00000112357 PEX7 269526 sc-eQTL 4.10e-01 -0.107 0.13 0.209 gdT L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 -775124 sc-eQTL 7.36e-01 0.0214 0.0632 0.209 gdT L2
ENSG00000146410 MTFR2 841755 sc-eQTL 6.54e-01 0.0449 0.0997 0.209 gdT L2
ENSG00000197442 MAP3K5 299613 sc-eQTL 6.97e-01 0.0521 0.134 0.209 gdT L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 -776143 sc-eQTL 2.53e-01 -0.131 0.114 0.209 gdT L2
ENSG00000027697 IFNGR1 -127359 sc-eQTL 5.92e-01 -0.0408 0.076 0.216 intMono L2
ENSG00000029363 BCLAF1 802239 sc-eQTL 2.35e-01 0.119 0.1 0.216 intMono L2
ENSG00000112357 PEX7 269526 sc-eQTL 9.01e-01 0.0128 0.103 0.216 intMono L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 -775124 sc-eQTL 9.42e-01 0.00476 0.0657 0.216 intMono L2
ENSG00000135525 MAP7 541271 sc-eQTL 5.37e-01 0.0623 0.101 0.216 intMono L2
ENSG00000197442 MAP3K5 299613 sc-eQTL 4.64e-01 0.0784 0.107 0.216 intMono L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 -776143 sc-eQTL 8.24e-01 0.0218 0.0979 0.216 intMono L2
ENSG00000286646 AL121933.2 308045 sc-eQTL 5.54e-01 0.0668 0.113 0.216 intMono L2
ENSG00000027697 IFNGR1 -127359 sc-eQTL 2.50e-02 -0.2 0.0885 0.213 ncMono L2
ENSG00000029363 BCLAF1 802239 sc-eQTL 1.53e-01 -0.0993 0.0692 0.213 ncMono L2
ENSG00000112357 PEX7 269526 sc-eQTL 8.97e-01 -0.0144 0.111 0.213 ncMono L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 -775124 sc-eQTL 4.76e-01 0.0566 0.0792 0.213 ncMono L2
ENSG00000135525 MAP7 541271 sc-eQTL 7.04e-01 -0.0373 0.0979 0.213 ncMono L2
ENSG00000197442 MAP3K5 299613 sc-eQTL 7.18e-01 0.0373 0.103 0.213 ncMono L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 -776143 sc-eQTL 8.37e-01 0.0204 0.0991 0.213 ncMono L2
ENSG00000286646 AL121933.2 308045 sc-eQTL 8.75e-01 -0.0165 0.105 0.213 ncMono L2
ENSG00000027697 IFNGR1 -127359 sc-eQTL 6.61e-01 -0.0446 0.102 0.215 pDC L2
ENSG00000029363 BCLAF1 802239 sc-eQTL 6.49e-01 0.0347 0.0762 0.215 pDC L2
ENSG00000112357 PEX7 269526 sc-eQTL 5.80e-01 -0.062 0.112 0.215 pDC L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 -775124 sc-eQTL 9.78e-01 -0.00264 0.0942 0.215 pDC L2
ENSG00000135525 MAP7 541271 sc-eQTL 1.77e-01 -0.105 0.0777 0.215 pDC L2
ENSG00000197442 MAP3K5 299613 sc-eQTL 2.34e-01 0.149 0.124 0.215 pDC L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 -776143 sc-eQTL 2.86e-01 -0.102 0.0953 0.215 pDC L2
ENSG00000286646 AL121933.2 308045 sc-eQTL 2.25e-01 0.14 0.115 0.215 pDC L2
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000027697 IFNGR1 -127359 sc-eQTL 6.00e-01 -0.0479 0.0912 0.212 B_Memory LOneK1K
ENSG00000029363 BCLAF1 802239 sc-eQTL 7.65e-01 0.0153 0.0512 0.212 B_Memory LOneK1K
ENSG00000112357 PEX7 269526 sc-eQTL 6.58e-02 0.193 0.104 0.212 B_Memory LOneK1K
ENSG00000118503 TNFAIP3 -775124 sc-eQTL 2.34e-01 -0.0766 0.0642 0.212 B_Memory LOneK1K
ENSG00000197442 MAP3K5 299613 sc-eQTL 8.07e-01 -0.0209 0.0852 0.212 B_Memory LOneK1K
ENSG00000237499 WAKMAR2 -776143 sc-eQTL 5.71e-01 -0.0618 0.109 0.212 B_Memory LOneK1K
ENSG00000027697 IFNGR1 -127359 sc-eQTL 1.80e-01 -0.123 0.0918 0.212 B_Naive LOneK1K
ENSG00000029363 BCLAF1 802239 sc-eQTL 2.21e-01 -0.0518 0.0422 0.212 B_Naive LOneK1K
ENSG00000112357 PEX7 269526 sc-eQTL 2.15e-01 0.139 0.112 0.212 B_Naive LOneK1K
ENSG00000118503 TNFAIP3 -775124 sc-eQTL 8.60e-01 -0.00933 0.0528 0.212 B_Naive LOneK1K
ENSG00000197442 MAP3K5 299613 sc-eQTL 5.13e-01 -0.0507 0.0773 0.212 B_Naive LOneK1K
ENSG00000237499 WAKMAR2 -776143 sc-eQTL 6.35e-01 -0.0447 0.0939 0.212 B_Naive LOneK1K
ENSG00000027697 IFNGR1 -127359 sc-eQTL 1.76e-01 -0.083 0.0612 0.212 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000029363 BCLAF1 802239 sc-eQTL 3.72e-01 0.051 0.0571 0.212 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000112357 PEX7 269526 sc-eQTL 2.14e-01 -0.137 0.11 0.212 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000118503 TNFAIP3 -775124 sc-eQTL 6.87e-01 0.0229 0.0568 0.212 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000135525 MAP7 541271 sc-eQTL 3.77e-02 -0.204 0.0976 0.212 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000197442 MAP3K5 299613 sc-eQTL 3.01e-01 -0.0689 0.0664 0.212 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000237499 WAKMAR2 -776143 sc-eQTL 9.39e-01 0.00518 0.0681 0.212 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000286646 AL121933.2 308045 sc-eQTL 1.68e-01 0.109 0.0789 0.212 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000027697 IFNGR1 -127359 sc-eQTL 8.08e-02 -0.13 0.074 0.213 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000029363 BCLAF1 802239 sc-eQTL 9.48e-01 0.00443 0.0674 0.213 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000112357 PEX7 269526 sc-eQTL 9.69e-01 0.00444 0.113 0.213 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000118503 TNFAIP3 -775124 sc-eQTL 8.80e-01 0.0106 0.0697 0.213 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000135525 MAP7 541271 sc-eQTL 7.93e-01 0.0285 0.109 0.213 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000197442 MAP3K5 299613 sc-eQTL 2.62e-01 0.1 0.0891 0.213 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000237499 WAKMAR2 -776143 sc-eQTL 7.50e-01 0.0298 0.0934 0.213 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000286646 AL121933.2 308045 sc-eQTL 5.06e-01 0.0706 0.106 0.213 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000027697 IFNGR1 -127359 sc-eQTL 5.96e-02 -0.133 0.0702 0.213 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000029363 BCLAF1 802239 sc-eQTL 7.18e-01 0.0149 0.0411 0.213 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000112357 PEX7 269526 sc-eQTL 6.39e-01 0.0562 0.119 0.213 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000118503 TNFAIP3 -775124 sc-eQTL 8.34e-01 0.0136 0.0645 0.213 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000197442 MAP3K5 299613 sc-eQTL 8.90e-01 0.0121 0.0872 0.213 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000237499 WAKMAR2 -776143 sc-eQTL 3.35e-01 -0.087 0.0901 0.213 NK_CD56dim LOneK1K


Statistical fine-mapping results from Japan COVID-19 Task Force
(Shown only for PIP>0.001)
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
PIP (SuSiE)
PIP (FINEMAP)
MAF
ENSG00000027697 IFNGR1 -127359 pQTL 0.000294 -0.0723 0.0199 0.0 0.0 0.178
ENSG00000027697 IFNGR1 -127359 eQTL 0.000218 -0.0647 0.0174 0.0 0.0 0.173
ENSG00000182747 SLC35D3 169789 eQTL 0.00126 0.13 0.0402 0.0 0.0 0.173


Expression Modifier Score(EMS) for GTEx 49tissues
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Whole Blood
Muscle Skeletal
Liver
Brain Cerebellum
Prostate
Spleen
Skin Sun Exposed Lower leg
Artery Coronary
Esophagus Muscularis
Esophagus Gastroesophageal Junction
Artery Tibial
Heart Atrial Appendage
Nerve Tibial
Heart Left Ventricle
Adrenal Gland
Adipose Visceral Omentum
Pancreas
Lung
Pituitary
Brain Nucleus accumbens basal ganglia
Colon Transverse
Adipose Subcutaneous
Esophagus Mucosa
Brain Cortex
Thyroid
Stomach
Breast Mammary Tissue
Colon Sigmoid
Skin Not Sun Exposed Suprapubic
Testis
Artery Aorta
Brain Amygdala
Brain Anterior cingulate cortex BA24
Brain Caudate basal ganglia
Brain Cerebellar Hemisphere
Brain Frontal Cortex BA9
Brain Hippocampus
Brain Hypothalamus
Brain Putamen basal ganglia
Brain Spinal cord cervical c-1
Brain Substantia nigra
Cells Cultured fibroblasts
Cells EBV-transformed lymphocytes
Kidney Cortex
Minor Salivary Gland
Ovary
Small Intestine Terminal Ileum
Uterus
Vagina
ENSG00000027697 IFNGR1 -127359 7.86e-06 9.98e-06 1.35e-06 5.03e-06 2.35e-06 3.41e-06 1.05e-05 1.45e-06 7.7e-06 4.47e-06 1.06e-05 5.73e-06 1.12e-05 3.77e-06 2.92e-06 6.06e-06 5.38e-06 6.85e-06 2.29e-06 2.68e-06 3.97e-06 7.77e-06 8.67e-06 1.91e-06 1.24e-05 3.86e-06 4.45e-06 3.05e-06 9.94e-06 7.9e-06 5.4e-06 1.07e-06 1.09e-06 2.76e-06 3.56e-06 2.1e-06 1.3e-06 1.94e-06 1.76e-06 9.8e-07 1.01e-06 9.56e-06 1.6e-06 1.56e-07 7.05e-07 1.17e-06 1.3e-06 7.5e-07 5.77e-07
ENSG00000220412 \N -615111 3.1e-07 2.56e-07 6.57e-08 2.44e-07 1.05e-07 1.03e-07 4.42e-07 5.84e-08 1.96e-07 1.11e-07 3.66e-07 1.91e-07 3.6e-07 9.15e-08 9.33e-08 1.06e-07 2.25e-07 2.87e-07 9.71e-08 6.03e-08 1.65e-07 1.98e-07 2.56e-07 3.07e-08 3.41e-07 2.2e-07 1.37e-07 1.36e-07 1.6e-07 2.89e-07 1.76e-07 3.54e-08 3.56e-08 1.17e-07 1.07e-07 3.11e-08 5.62e-08 6.78e-08 5.28e-08 8.03e-08 5.04e-08 1.64e-07 2.62e-08 1.75e-07 8.43e-08 1.05e-08 7.83e-08 0.0 4.69e-08