logo

Genes within 1Mb (chr6:137087768:A:G):

View on , UCSC , GTEx , gnomAD

Immune cell-type specific single cell cis-eQTLs in OASIS
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000027697 IFNGR1 -131681 sc-eQTL 1.73e-01 -0.118 0.0865 0.212 B L1
ENSG00000029363 BCLAF1 797917 sc-eQTL 6.91e-01 -0.0154 0.0387 0.212 B L1
ENSG00000112357 PEX7 265204 sc-eQTL 8.59e-02 0.176 0.102 0.212 B L1
ENSG00000118503 TNFAIP3 -779446 sc-eQTL 6.02e-01 -0.0286 0.0548 0.212 B L1
ENSG00000197442 MAP3K5 295291 sc-eQTL 1.82e-01 -0.102 0.076 0.212 B L1
ENSG00000237499 WAKMAR2 -780465 sc-eQTL 5.15e-01 -0.0561 0.0861 0.212 B L1
ENSG00000027697 IFNGR1 -131681 sc-eQTL 3.98e-02 -0.119 0.0574 0.212 CD4T L1
ENSG00000029363 BCLAF1 797917 sc-eQTL 9.35e-01 -0.00359 0.0439 0.212 CD4T L1
ENSG00000112357 PEX7 265204 sc-eQTL 8.42e-01 -0.0186 0.0934 0.212 CD4T L1
ENSG00000118503 TNFAIP3 -779446 sc-eQTL 9.34e-01 0.00485 0.0587 0.212 CD4T L1
ENSG00000197442 MAP3K5 295291 sc-eQTL 1.23e-01 -0.0689 0.0445 0.212 CD4T L1
ENSG00000237499 WAKMAR2 -780465 sc-eQTL 1.08e-01 -0.119 0.0735 0.212 CD4T L1
ENSG00000027697 IFNGR1 -131681 sc-eQTL 3.87e-01 -0.0572 0.066 0.212 CD8T L1
ENSG00000029363 BCLAF1 797917 sc-eQTL 4.71e-01 0.0323 0.0447 0.212 CD8T L1
ENSG00000112357 PEX7 265204 sc-eQTL 4.83e-01 -0.0774 0.11 0.212 CD8T L1
ENSG00000118503 TNFAIP3 -779446 sc-eQTL 6.36e-01 0.0264 0.0556 0.212 CD8T L1
ENSG00000197442 MAP3K5 295291 sc-eQTL 8.88e-01 -0.0083 0.0588 0.212 CD8T L1
ENSG00000237499 WAKMAR2 -780465 sc-eQTL 4.79e-01 0.0579 0.0816 0.212 CD8T L1
ENSG00000027697 IFNGR1 -131681 sc-eQTL 9.41e-01 -0.00573 0.0778 0.214 DC L1
ENSG00000029363 BCLAF1 797917 sc-eQTL 8.05e-01 0.0173 0.07 0.214 DC L1
ENSG00000112357 PEX7 265204 sc-eQTL 8.08e-01 0.0266 0.11 0.214 DC L1
ENSG00000118503 TNFAIP3 -779446 sc-eQTL 9.11e-01 -0.00931 0.0831 0.214 DC L1
ENSG00000135525 MAP7 536949 sc-eQTL 7.82e-01 -0.025 0.09 0.214 DC L1
ENSG00000197442 MAP3K5 295291 sc-eQTL 9.40e-01 0.00653 0.0863 0.214 DC L1
ENSG00000237499 WAKMAR2 -780465 sc-eQTL 6.64e-01 0.0369 0.0847 0.214 DC L1
ENSG00000286646 AL121933.2 303723 sc-eQTL 6.65e-01 0.0488 0.113 0.214 DC L1
ENSG00000027697 IFNGR1 -131681 sc-eQTL 8.44e-02 -0.113 0.0651 0.212 Mono L1
ENSG00000029363 BCLAF1 797917 sc-eQTL 3.93e-01 0.0478 0.0559 0.212 Mono L1
ENSG00000112357 PEX7 265204 sc-eQTL 2.65e-01 -0.123 0.11 0.212 Mono L1
ENSG00000118503 TNFAIP3 -779446 sc-eQTL 4.83e-01 0.039 0.0555 0.212 Mono L1
ENSG00000135525 MAP7 536949 sc-eQTL 9.59e-02 -0.162 0.0966 0.212 Mono L1
ENSG00000197442 MAP3K5 295291 sc-eQTL 6.09e-01 -0.0332 0.0648 0.212 Mono L1
ENSG00000237499 WAKMAR2 -780465 sc-eQTL 8.62e-01 0.012 0.0689 0.212 Mono L1
ENSG00000286646 AL121933.2 303723 sc-eQTL 1.68e-01 0.108 0.0782 0.212 Mono L1
ENSG00000027697 IFNGR1 -131681 sc-eQTL 4.12e-02 -0.152 0.0741 0.212 NK L1
ENSG00000029363 BCLAF1 797917 sc-eQTL 9.56e-01 0.00222 0.0397 0.212 NK L1
ENSG00000112357 PEX7 265204 sc-eQTL 2.95e-01 0.121 0.115 0.212 NK L1
ENSG00000118503 TNFAIP3 -779446 sc-eQTL 6.93e-01 0.0247 0.0623 0.212 NK L1
ENSG00000197442 MAP3K5 295291 sc-eQTL 8.32e-01 0.0189 0.0892 0.212 NK L1
ENSG00000237499 WAKMAR2 -780465 sc-eQTL 4.18e-01 -0.0715 0.0881 0.212 NK L1
ENSG00000027697 IFNGR1 -131681 sc-eQTL 3.77e-01 -0.0605 0.0683 0.212 Other_T L1
ENSG00000029363 BCLAF1 797917 sc-eQTL 5.98e-01 -0.0303 0.0574 0.212 Other_T L1
ENSG00000112357 PEX7 265204 sc-eQTL 5.90e-01 -0.0603 0.112 0.212 Other_T L1
ENSG00000118503 TNFAIP3 -779446 sc-eQTL 8.34e-01 0.00892 0.0426 0.212 Other_T L1
ENSG00000146410 MTFR2 837433 sc-eQTL 8.85e-01 0.00931 0.0645 0.212 Other_T L1
ENSG00000197442 MAP3K5 295291 sc-eQTL 8.45e-01 0.0161 0.0822 0.212 Other_T L1
ENSG00000237499 WAKMAR2 -780465 sc-eQTL 7.50e-01 -0.027 0.0845 0.212 Other_T L1
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000027697 IFNGR1 -131681 sc-eQTL 1.17e-01 -0.18 0.115 0.217 B_Activated L2
ENSG00000029363 BCLAF1 797917 sc-eQTL 5.73e-01 0.0528 0.0936 0.217 B_Activated L2
ENSG00000112357 PEX7 265204 sc-eQTL 3.16e-02 0.243 0.112 0.217 B_Activated L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 -779446 sc-eQTL 1.46e-01 0.166 0.113 0.217 B_Activated L2
ENSG00000197442 MAP3K5 295291 sc-eQTL 2.66e-01 -0.142 0.127 0.217 B_Activated L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 -780465 sc-eQTL 8.01e-01 -0.0251 0.0995 0.217 B_Activated L2
ENSG00000027697 IFNGR1 -131681 sc-eQTL 5.58e-01 -0.0599 0.102 0.212 B_Intermediate L2
ENSG00000029363 BCLAF1 797917 sc-eQTL 6.36e-01 0.0276 0.0581 0.212 B_Intermediate L2
ENSG00000112357 PEX7 265204 sc-eQTL 1.41e-01 0.157 0.106 0.212 B_Intermediate L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 -779446 sc-eQTL 9.79e-01 -0.00199 0.0765 0.212 B_Intermediate L2
ENSG00000197442 MAP3K5 295291 sc-eQTL 6.91e-01 -0.0368 0.0924 0.212 B_Intermediate L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 -780465 sc-eQTL 6.82e-01 -0.0445 0.108 0.212 B_Intermediate L2
ENSG00000027697 IFNGR1 -131681 sc-eQTL 4.96e-01 -0.0766 0.112 0.213 B_Memory L2
ENSG00000029363 BCLAF1 797917 sc-eQTL 7.94e-01 0.0174 0.0667 0.213 B_Memory L2
ENSG00000112357 PEX7 265204 sc-eQTL 5.85e-01 0.0621 0.113 0.213 B_Memory L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 -779446 sc-eQTL 4.45e-01 -0.0562 0.0734 0.213 B_Memory L2
ENSG00000197442 MAP3K5 295291 sc-eQTL 6.08e-01 0.0516 0.1 0.213 B_Memory L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 -780465 sc-eQTL 7.93e-01 -0.0287 0.109 0.213 B_Memory L2
ENSG00000027697 IFNGR1 -131681 sc-eQTL 8.77e-02 -0.149 0.087 0.212 B_Naive1 L2
ENSG00000029363 BCLAF1 797917 sc-eQTL 8.67e-01 -0.0084 0.0501 0.212 B_Naive1 L2
ENSG00000112357 PEX7 265204 sc-eQTL 3.48e-01 0.109 0.115 0.212 B_Naive1 L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 -779446 sc-eQTL 7.88e-01 -0.0158 0.0586 0.212 B_Naive1 L2
ENSG00000197442 MAP3K5 295291 sc-eQTL 7.44e-01 0.027 0.0824 0.212 B_Naive1 L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 -780465 sc-eQTL 8.42e-01 0.0184 0.0919 0.212 B_Naive1 L2
ENSG00000027697 IFNGR1 -131681 sc-eQTL 9.14e-01 0.0114 0.106 0.212 B_Naive2 L2
ENSG00000029363 BCLAF1 797917 sc-eQTL 2.03e-01 -0.0779 0.061 0.212 B_Naive2 L2
ENSG00000112357 PEX7 265204 sc-eQTL 1.34e-01 0.173 0.115 0.212 B_Naive2 L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 -779446 sc-eQTL 9.76e-01 -0.00255 0.0841 0.212 B_Naive2 L2
ENSG00000197442 MAP3K5 295291 sc-eQTL 4.26e-02 -0.181 0.0887 0.212 B_Naive2 L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 -780465 sc-eQTL 7.80e-02 -0.191 0.108 0.212 B_Naive2 L2
ENSG00000027697 IFNGR1 -131681 sc-eQTL 6.85e-01 0.0399 0.0984 0.214 CD4_CTL L2
ENSG00000029363 BCLAF1 797917 sc-eQTL 4.01e-01 0.0734 0.0872 0.214 CD4_CTL L2
ENSG00000112357 PEX7 265204 sc-eQTL 5.82e-01 -0.0602 0.109 0.214 CD4_CTL L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 -779446 sc-eQTL 2.57e-01 -0.0732 0.0643 0.214 CD4_CTL L2
ENSG00000197442 MAP3K5 295291 sc-eQTL 2.55e-01 -0.117 0.103 0.214 CD4_CTL L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 -780465 sc-eQTL 7.85e-01 -0.0275 0.1 0.214 CD4_CTL L2
ENSG00000027697 IFNGR1 -131681 sc-eQTL 2.45e-01 -0.0637 0.0547 0.212 CD4_Naive L2
ENSG00000029363 BCLAF1 797917 sc-eQTL 9.03e-01 -0.00535 0.044 0.212 CD4_Naive L2
ENSG00000112357 PEX7 265204 sc-eQTL 9.44e-01 0.00734 0.104 0.212 CD4_Naive L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 -779446 sc-eQTL 8.65e-01 -0.0102 0.0599 0.212 CD4_Naive L2
ENSG00000197442 MAP3K5 295291 sc-eQTL 4.50e-01 -0.0332 0.044 0.212 CD4_Naive L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 -780465 sc-eQTL 2.87e-02 -0.169 0.0768 0.212 CD4_Naive L2
ENSG00000027697 IFNGR1 -131681 sc-eQTL 5.95e-02 -0.142 0.075 0.212 CD4_TCM L2
ENSG00000029363 BCLAF1 797917 sc-eQTL 5.38e-01 0.0295 0.0477 0.212 CD4_TCM L2
ENSG00000112357 PEX7 265204 sc-eQTL 2.59e-01 0.125 0.111 0.212 CD4_TCM L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 -779446 sc-eQTL 8.79e-01 0.0083 0.0545 0.212 CD4_TCM L2
ENSG00000197442 MAP3K5 295291 sc-eQTL 7.80e-02 -0.109 0.0616 0.212 CD4_TCM L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 -780465 sc-eQTL 6.00e-01 -0.0401 0.0764 0.212 CD4_TCM L2
ENSG00000027697 IFNGR1 -131681 sc-eQTL 1.04e-01 -0.14 0.0861 0.212 CD4_TEM L2
ENSG00000029363 BCLAF1 797917 sc-eQTL 9.51e-01 0.00376 0.0615 0.212 CD4_TEM L2
ENSG00000112357 PEX7 265204 sc-eQTL 2.14e-01 -0.139 0.111 0.212 CD4_TEM L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 -779446 sc-eQTL 2.67e-01 0.0639 0.0574 0.212 CD4_TEM L2
ENSG00000197442 MAP3K5 295291 sc-eQTL 2.65e-01 -0.099 0.0887 0.212 CD4_TEM L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 -780465 sc-eQTL 1.44e-01 -0.135 0.0919 0.212 CD4_TEM L2
ENSG00000027697 IFNGR1 -131681 sc-eQTL 9.48e-01 -0.00519 0.079 0.212 CD8_CTL L2
ENSG00000029363 BCLAF1 797917 sc-eQTL 3.68e-01 0.0474 0.0526 0.212 CD8_CTL L2
ENSG00000112357 PEX7 265204 sc-eQTL 4.06e-01 0.0904 0.108 0.212 CD8_CTL L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 -779446 sc-eQTL 7.67e-01 -0.0197 0.0664 0.212 CD8_CTL L2
ENSG00000197442 MAP3K5 295291 sc-eQTL 4.67e-01 0.0682 0.0937 0.212 CD8_CTL L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 -780465 sc-eQTL 8.46e-01 -0.0182 0.0934 0.212 CD8_CTL L2
ENSG00000027697 IFNGR1 -131681 sc-eQTL 5.27e-02 -0.151 0.0776 0.212 CD8_Naive L2
ENSG00000029363 BCLAF1 797917 sc-eQTL 9.93e-01 -0.000456 0.0547 0.212 CD8_Naive L2
ENSG00000112357 PEX7 265204 sc-eQTL 8.50e-01 -0.0214 0.113 0.212 CD8_Naive L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 -779446 sc-eQTL 8.30e-01 0.0131 0.0612 0.212 CD8_Naive L2
ENSG00000197442 MAP3K5 295291 sc-eQTL 6.94e-01 -0.0286 0.0725 0.212 CD8_Naive L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 -780465 sc-eQTL 7.43e-01 -0.0297 0.0905 0.212 CD8_Naive L2
ENSG00000027697 IFNGR1 -131681 sc-eQTL 6.05e-01 0.0538 0.104 0.218 CD8_TCM L2
ENSG00000029363 BCLAF1 797917 sc-eQTL 4.23e-01 -0.0624 0.0778 0.218 CD8_TCM L2
ENSG00000112357 PEX7 265204 sc-eQTL 2.26e-01 -0.144 0.119 0.218 CD8_TCM L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 -779446 sc-eQTL 8.19e-01 -0.0129 0.0563 0.218 CD8_TCM L2
ENSG00000197442 MAP3K5 295291 sc-eQTL 6.54e-01 -0.045 0.1 0.218 CD8_TCM L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 -780465 sc-eQTL 2.48e-01 0.119 0.103 0.218 CD8_TCM L2
ENSG00000027697 IFNGR1 -131681 sc-eQTL 3.91e-01 -0.0871 0.101 0.203 CD8_TEM L2
ENSG00000029363 BCLAF1 797917 sc-eQTL 6.61e-01 -0.0421 0.0959 0.203 CD8_TEM L2
ENSG00000112357 PEX7 265204 sc-eQTL 6.47e-01 0.0536 0.117 0.203 CD8_TEM L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 -779446 sc-eQTL 9.77e-01 0.00221 0.0749 0.203 CD8_TEM L2
ENSG00000197442 MAP3K5 295291 sc-eQTL 8.90e-01 -0.016 0.116 0.203 CD8_TEM L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 -780465 sc-eQTL 7.30e-01 -0.0384 0.111 0.203 CD8_TEM L2
ENSG00000027697 IFNGR1 -131681 sc-eQTL 3.06e-01 -0.0806 0.0787 0.214 MAIT L2
ENSG00000029363 BCLAF1 797917 sc-eQTL 8.79e-01 0.00996 0.0655 0.214 MAIT L2
ENSG00000112357 PEX7 265204 sc-eQTL 4.16e-01 -0.087 0.107 0.214 MAIT L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 -779446 sc-eQTL 9.45e-01 -0.00368 0.0531 0.214 MAIT L2
ENSG00000146410 MTFR2 837433 sc-eQTL 6.06e-01 0.0457 0.0883 0.214 MAIT L2
ENSG00000197442 MAP3K5 295291 sc-eQTL 1.70e-01 0.127 0.092 0.214 MAIT L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 -780465 sc-eQTL 6.32e-01 0.047 0.0981 0.214 MAIT L2
ENSG00000027697 IFNGR1 -131681 sc-eQTL 3.42e-01 -0.0828 0.0869 0.213 NK_CD56bright L2
ENSG00000029363 BCLAF1 797917 sc-eQTL 9.72e-01 -0.00227 0.0643 0.213 NK_CD56bright L2
ENSG00000112357 PEX7 265204 sc-eQTL 3.45e-01 0.107 0.113 0.213 NK_CD56bright L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 -779446 sc-eQTL 6.45e-01 0.03 0.0648 0.213 NK_CD56bright L2
ENSG00000197442 MAP3K5 295291 sc-eQTL 4.50e-01 -0.0745 0.0985 0.213 NK_CD56bright L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 -780465 sc-eQTL 4.90e-01 0.0715 0.103 0.213 NK_CD56bright L2
ENSG00000027697 IFNGR1 -131681 sc-eQTL 3.41e-01 -0.0658 0.0689 0.213 NK_CD56dim L2
ENSG00000029363 BCLAF1 797917 sc-eQTL 7.37e-01 -0.0152 0.0451 0.213 NK_CD56dim L2
ENSG00000112357 PEX7 265204 sc-eQTL 7.78e-01 0.0336 0.119 0.213 NK_CD56dim L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 -779446 sc-eQTL 6.23e-01 0.032 0.065 0.213 NK_CD56dim L2
ENSG00000197442 MAP3K5 295291 sc-eQTL 9.43e-01 0.00668 0.0936 0.213 NK_CD56dim L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 -780465 sc-eQTL 4.12e-01 -0.0799 0.0973 0.213 NK_CD56dim L2
ENSG00000027697 IFNGR1 -131681 sc-eQTL 1.92e-02 -0.209 0.0886 0.208 NK_HLA L2
ENSG00000029363 BCLAF1 797917 sc-eQTL 8.58e-01 0.0137 0.0761 0.208 NK_HLA L2
ENSG00000112357 PEX7 265204 sc-eQTL 4.72e-02 0.226 0.113 0.208 NK_HLA L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 -779446 sc-eQTL 3.66e-01 -0.0644 0.0711 0.208 NK_HLA L2
ENSG00000197442 MAP3K5 295291 sc-eQTL 1.96e-01 0.146 0.113 0.208 NK_HLA L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 -780465 sc-eQTL 5.51e-02 -0.219 0.114 0.208 NK_HLA L2
ENSG00000027697 IFNGR1 -131681 sc-eQTL 4.08e-02 -0.149 0.0726 0.213 NK_cytokine L2
ENSG00000029363 BCLAF1 797917 sc-eQTL 7.95e-01 0.0142 0.0547 0.213 NK_cytokine L2
ENSG00000112357 PEX7 265204 sc-eQTL 9.41e-01 0.00859 0.115 0.213 NK_cytokine L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 -779446 sc-eQTL 4.98e-01 0.0444 0.0654 0.213 NK_cytokine L2
ENSG00000197442 MAP3K5 295291 sc-eQTL 8.51e-01 -0.0169 0.0899 0.213 NK_cytokine L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 -780465 sc-eQTL 7.93e-01 -0.0258 0.0986 0.213 NK_cytokine L2
ENSG00000027697 IFNGR1 -131681 sc-eQTL 1.56e-02 -0.362 0.148 0.196 PB L2
ENSG00000029363 BCLAF1 797917 sc-eQTL 1.51e-02 -0.314 0.127 0.196 PB L2
ENSG00000112357 PEX7 265204 sc-eQTL 9.54e-01 0.00896 0.156 0.196 PB L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 -779446 sc-eQTL 6.80e-01 0.0486 0.118 0.196 PB L2
ENSG00000197442 MAP3K5 295291 sc-eQTL 1.90e-01 -0.175 0.133 0.196 PB L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 -780465 sc-eQTL 1.97e-01 0.182 0.14 0.196 PB L2
ENSG00000027697 IFNGR1 -131681 sc-eQTL 6.56e-01 0.0395 0.0886 0.215 Pro_T L2
ENSG00000029363 BCLAF1 797917 sc-eQTL 8.49e-01 -0.0176 0.0919 0.215 Pro_T L2
ENSG00000112357 PEX7 265204 sc-eQTL 5.33e-01 0.0671 0.108 0.215 Pro_T L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 -779446 sc-eQTL 1.98e-01 0.0695 0.0538 0.215 Pro_T L2
ENSG00000146410 MTFR2 837433 sc-eQTL 5.71e-01 0.0424 0.0748 0.215 Pro_T L2
ENSG00000197442 MAP3K5 295291 sc-eQTL 1.14e-01 -0.165 0.104 0.215 Pro_T L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 -780465 sc-eQTL 9.44e-01 -0.00732 0.105 0.215 Pro_T L2
ENSG00000027697 IFNGR1 -131681 sc-eQTL 2.94e-01 -0.108 0.103 0.212 Treg L2
ENSG00000029363 BCLAF1 797917 sc-eQTL 2.60e-01 -0.0752 0.0666 0.212 Treg L2
ENSG00000112357 PEX7 265204 sc-eQTL 7.30e-01 0.0377 0.109 0.212 Treg L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 -779446 sc-eQTL 9.80e-01 -0.00161 0.0657 0.212 Treg L2
ENSG00000197442 MAP3K5 295291 sc-eQTL 5.65e-01 0.0411 0.0712 0.212 Treg L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 -780465 sc-eQTL 6.84e-01 -0.0409 0.1 0.212 Treg L2
ENSG00000027697 IFNGR1 -131681 sc-eQTL 5.26e-01 0.0551 0.0868 0.215 cDC L2
ENSG00000029363 BCLAF1 797917 sc-eQTL 1.72e-01 0.119 0.0871 0.215 cDC L2
ENSG00000112357 PEX7 265204 sc-eQTL 3.85e-01 0.0977 0.112 0.215 cDC L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 -779446 sc-eQTL 9.52e-01 0.00516 0.0856 0.215 cDC L2
ENSG00000135525 MAP7 536949 sc-eQTL 3.73e-01 0.0893 0.0999 0.215 cDC L2
ENSG00000197442 MAP3K5 295291 sc-eQTL 8.01e-01 -0.0222 0.0881 0.215 cDC L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 -780465 sc-eQTL 2.80e-01 0.121 0.111 0.215 cDC L2
ENSG00000286646 AL121933.2 303723 sc-eQTL 7.71e-01 -0.0334 0.115 0.215 cDC L2
ENSG00000027697 IFNGR1 -131681 sc-eQTL 5.30e-01 -0.0384 0.0611 0.212 cMono_IL1B L2
ENSG00000029363 BCLAF1 797917 sc-eQTL 7.08e-01 0.0246 0.0656 0.212 cMono_IL1B L2
ENSG00000112357 PEX7 265204 sc-eQTL 3.16e-01 -0.11 0.11 0.212 cMono_IL1B L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 -779446 sc-eQTL 5.16e-01 0.0428 0.0658 0.212 cMono_IL1B L2
ENSG00000135525 MAP7 536949 sc-eQTL 2.74e-02 -0.208 0.0937 0.212 cMono_IL1B L2
ENSG00000197442 MAP3K5 295291 sc-eQTL 8.25e-01 -0.0151 0.0684 0.212 cMono_IL1B L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 -780465 sc-eQTL 5.47e-01 0.0423 0.0702 0.212 cMono_IL1B L2
ENSG00000286646 AL121933.2 303723 sc-eQTL 3.07e-02 0.189 0.087 0.212 cMono_IL1B L2
ENSG00000027697 IFNGR1 -131681 sc-eQTL 9.56e-02 -0.118 0.0703 0.212 cMono_S100A L2
ENSG00000029363 BCLAF1 797917 sc-eQTL 3.76e-01 0.0644 0.0726 0.212 cMono_S100A L2
ENSG00000112357 PEX7 265204 sc-eQTL 3.24e-01 -0.112 0.113 0.212 cMono_S100A L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 -779446 sc-eQTL 4.60e-01 -0.0465 0.0628 0.212 cMono_S100A L2
ENSG00000135525 MAP7 536949 sc-eQTL 9.30e-01 0.00929 0.106 0.212 cMono_S100A L2
ENSG00000197442 MAP3K5 295291 sc-eQTL 3.98e-01 -0.0722 0.0854 0.212 cMono_S100A L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 -780465 sc-eQTL 1.25e-01 -0.138 0.0898 0.212 cMono_S100A L2
ENSG00000286646 AL121933.2 303723 sc-eQTL 7.07e-01 0.0331 0.0881 0.212 cMono_S100A L2
ENSG00000027697 IFNGR1 -131681 sc-eQTL 4.93e-01 0.0705 0.103 0.209 gdT L2
ENSG00000029363 BCLAF1 797917 sc-eQTL 6.08e-01 -0.0464 0.0904 0.209 gdT L2
ENSG00000112357 PEX7 265204 sc-eQTL 4.10e-01 -0.107 0.13 0.209 gdT L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 -779446 sc-eQTL 7.36e-01 0.0214 0.0632 0.209 gdT L2
ENSG00000146410 MTFR2 837433 sc-eQTL 6.54e-01 0.0449 0.0997 0.209 gdT L2
ENSG00000197442 MAP3K5 295291 sc-eQTL 6.97e-01 0.0521 0.134 0.209 gdT L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 -780465 sc-eQTL 2.53e-01 -0.131 0.114 0.209 gdT L2
ENSG00000027697 IFNGR1 -131681 sc-eQTL 5.92e-01 -0.0408 0.076 0.216 intMono L2
ENSG00000029363 BCLAF1 797917 sc-eQTL 2.35e-01 0.119 0.1 0.216 intMono L2
ENSG00000112357 PEX7 265204 sc-eQTL 9.01e-01 0.0128 0.103 0.216 intMono L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 -779446 sc-eQTL 9.42e-01 0.00476 0.0657 0.216 intMono L2
ENSG00000135525 MAP7 536949 sc-eQTL 5.37e-01 0.0623 0.101 0.216 intMono L2
ENSG00000197442 MAP3K5 295291 sc-eQTL 4.64e-01 0.0784 0.107 0.216 intMono L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 -780465 sc-eQTL 8.24e-01 0.0218 0.0979 0.216 intMono L2
ENSG00000286646 AL121933.2 303723 sc-eQTL 5.54e-01 0.0668 0.113 0.216 intMono L2
ENSG00000027697 IFNGR1 -131681 sc-eQTL 2.50e-02 -0.2 0.0885 0.213 ncMono L2
ENSG00000029363 BCLAF1 797917 sc-eQTL 1.53e-01 -0.0993 0.0692 0.213 ncMono L2
ENSG00000112357 PEX7 265204 sc-eQTL 8.97e-01 -0.0144 0.111 0.213 ncMono L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 -779446 sc-eQTL 4.76e-01 0.0566 0.0792 0.213 ncMono L2
ENSG00000135525 MAP7 536949 sc-eQTL 7.04e-01 -0.0373 0.0979 0.213 ncMono L2
ENSG00000197442 MAP3K5 295291 sc-eQTL 7.18e-01 0.0373 0.103 0.213 ncMono L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 -780465 sc-eQTL 8.37e-01 0.0204 0.0991 0.213 ncMono L2
ENSG00000286646 AL121933.2 303723 sc-eQTL 8.75e-01 -0.0165 0.105 0.213 ncMono L2
ENSG00000027697 IFNGR1 -131681 sc-eQTL 6.61e-01 -0.0446 0.102 0.215 pDC L2
ENSG00000029363 BCLAF1 797917 sc-eQTL 6.49e-01 0.0347 0.0762 0.215 pDC L2
ENSG00000112357 PEX7 265204 sc-eQTL 5.80e-01 -0.062 0.112 0.215 pDC L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 -779446 sc-eQTL 9.78e-01 -0.00264 0.0942 0.215 pDC L2
ENSG00000135525 MAP7 536949 sc-eQTL 1.77e-01 -0.105 0.0777 0.215 pDC L2
ENSG00000197442 MAP3K5 295291 sc-eQTL 2.34e-01 0.149 0.124 0.215 pDC L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 -780465 sc-eQTL 2.86e-01 -0.102 0.0953 0.215 pDC L2
ENSG00000286646 AL121933.2 303723 sc-eQTL 2.25e-01 0.14 0.115 0.215 pDC L2
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000027697 IFNGR1 -131681 sc-eQTL 6.00e-01 -0.0479 0.0912 0.212 B_Memory LOneK1K
ENSG00000029363 BCLAF1 797917 sc-eQTL 7.65e-01 0.0153 0.0512 0.212 B_Memory LOneK1K
ENSG00000112357 PEX7 265204 sc-eQTL 6.58e-02 0.193 0.104 0.212 B_Memory LOneK1K
ENSG00000118503 TNFAIP3 -779446 sc-eQTL 2.34e-01 -0.0766 0.0642 0.212 B_Memory LOneK1K
ENSG00000197442 MAP3K5 295291 sc-eQTL 8.07e-01 -0.0209 0.0852 0.212 B_Memory LOneK1K
ENSG00000237499 WAKMAR2 -780465 sc-eQTL 5.71e-01 -0.0618 0.109 0.212 B_Memory LOneK1K
ENSG00000027697 IFNGR1 -131681 sc-eQTL 1.80e-01 -0.123 0.0918 0.212 B_Naive LOneK1K
ENSG00000029363 BCLAF1 797917 sc-eQTL 2.21e-01 -0.0518 0.0422 0.212 B_Naive LOneK1K
ENSG00000112357 PEX7 265204 sc-eQTL 2.15e-01 0.139 0.112 0.212 B_Naive LOneK1K
ENSG00000118503 TNFAIP3 -779446 sc-eQTL 8.60e-01 -0.00933 0.0528 0.212 B_Naive LOneK1K
ENSG00000197442 MAP3K5 295291 sc-eQTL 5.13e-01 -0.0507 0.0773 0.212 B_Naive LOneK1K
ENSG00000237499 WAKMAR2 -780465 sc-eQTL 6.35e-01 -0.0447 0.0939 0.212 B_Naive LOneK1K
ENSG00000027697 IFNGR1 -131681 sc-eQTL 1.76e-01 -0.083 0.0612 0.212 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000029363 BCLAF1 797917 sc-eQTL 3.72e-01 0.051 0.0571 0.212 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000112357 PEX7 265204 sc-eQTL 2.14e-01 -0.137 0.11 0.212 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000118503 TNFAIP3 -779446 sc-eQTL 6.87e-01 0.0229 0.0568 0.212 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000135525 MAP7 536949 sc-eQTL 3.77e-02 -0.204 0.0976 0.212 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000197442 MAP3K5 295291 sc-eQTL 3.01e-01 -0.0689 0.0664 0.212 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000237499 WAKMAR2 -780465 sc-eQTL 9.39e-01 0.00518 0.0681 0.212 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000286646 AL121933.2 303723 sc-eQTL 1.68e-01 0.109 0.0789 0.212 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000027697 IFNGR1 -131681 sc-eQTL 8.08e-02 -0.13 0.074 0.213 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000029363 BCLAF1 797917 sc-eQTL 9.48e-01 0.00443 0.0674 0.213 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000112357 PEX7 265204 sc-eQTL 9.69e-01 0.00444 0.113 0.213 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000118503 TNFAIP3 -779446 sc-eQTL 8.80e-01 0.0106 0.0697 0.213 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000135525 MAP7 536949 sc-eQTL 7.93e-01 0.0285 0.109 0.213 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000197442 MAP3K5 295291 sc-eQTL 2.62e-01 0.1 0.0891 0.213 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000237499 WAKMAR2 -780465 sc-eQTL 7.50e-01 0.0298 0.0934 0.213 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000286646 AL121933.2 303723 sc-eQTL 5.06e-01 0.0706 0.106 0.213 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000027697 IFNGR1 -131681 sc-eQTL 5.96e-02 -0.133 0.0702 0.213 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000029363 BCLAF1 797917 sc-eQTL 7.18e-01 0.0149 0.0411 0.213 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000112357 PEX7 265204 sc-eQTL 6.39e-01 0.0562 0.119 0.213 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000118503 TNFAIP3 -779446 sc-eQTL 8.34e-01 0.0136 0.0645 0.213 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000197442 MAP3K5 295291 sc-eQTL 8.90e-01 0.0121 0.0872 0.213 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000237499 WAKMAR2 -780465 sc-eQTL 3.35e-01 -0.087 0.0901 0.213 NK_CD56dim LOneK1K

Statistical fine-mapping results from Japan COVID-19 Task Force
(Shown only for PIP>0.001)
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
PIP (SuSiE)
PIP (FINEMAP)
MAF
ENSG00000027697 IFNGR1 -131681 pQTL 0.000293 -0.0723 0.0199 0.0 0.0 0.178
ENSG00000027697 IFNGR1 -131681 eQTL 0.000225 -0.0645 0.0174 0.0 0.0 0.173
ENSG00000182747 SLC35D3 165467 eQTL 0.0013 0.13 0.0403 0.0 0.0 0.173

Expression Modifier Score(EMS) for GTEx 49tissues
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Whole Blood
Muscle Skeletal
Liver
Brain Cerebellum
Prostate
Spleen
Skin Sun Exposed Lower leg
Artery Coronary
Esophagus Muscularis
Esophagus Gastroesophageal Junction
Artery Tibial
Heart Atrial Appendage
Nerve Tibial
Heart Left Ventricle
Adrenal Gland
Adipose Visceral Omentum
Pancreas
Lung
Pituitary
Brain Nucleus accumbens basal ganglia
Colon Transverse
Adipose Subcutaneous
Esophagus Mucosa
Brain Cortex
Thyroid
Stomach
Breast Mammary Tissue
Colon Sigmoid
Skin Not Sun Exposed Suprapubic
Testis
Artery Aorta
Brain Amygdala
Brain Anterior cingulate cortex BA24
Brain Caudate basal ganglia
Brain Cerebellar Hemisphere
Brain Frontal Cortex BA9
Brain Hippocampus
Brain Hypothalamus
Brain Putamen basal ganglia
Brain Spinal cord cervical c-1
Brain Substantia nigra
Cells Cultured fibroblasts
Cells EBV-transformed lymphocytes
Kidney Cortex
Minor Salivary Gland
Ovary
Small Intestine Terminal Ileum
Uterus
Vagina
ENSG00000027697 IFNGR1 -131681 4.25e-06 4.67e-06 8.72e-07 2.46e-06 1.6e-06 1.19e-06 3.48e-06 9.97e-07 4.57e-06 2.17e-06 4.65e-06 3.41e-06 7.58e-06 2.04e-06 1.43e-06 2.9e-06 2.06e-06 2.94e-06 1.45e-06 1e-06 2.95e-06 4.6e-06 3.54e-06 1.52e-06 5.2e-06 1.67e-06 2.55e-06 1.75e-06 4.24e-06 4.23e-06 2.17e-06 4.91e-07 5.47e-07 1.73e-06 2.1e-06 9.01e-07 9.63e-07 4.59e-07 9.31e-07 4.11e-07 6.18e-07 5.32e-06 4.34e-07 1.53e-07 5.79e-07 6.92e-07 8.71e-07 4.43e-07 3.9e-07
ENSG00000220412 \N -619433 3.92e-07 2.4e-07 7.92e-08 2.53e-07 1.05e-07 1.19e-07 3.25e-07 7.52e-08 2.12e-07 1.37e-07 2.62e-07 1.86e-07 3.48e-07 8.42e-08 9.2e-08 1.14e-07 8.53e-08 2.75e-07 9.69e-08 7.26e-08 1.48e-07 2.15e-07 2.04e-07 5.01e-08 3.14e-07 1.9e-07 1.57e-07 1.69e-07 1.6e-07 2.02e-07 1.52e-07 8.37e-08 5.17e-08 9.61e-08 9.25e-08 5.05e-08 6.57e-08 6.31e-08 4.82e-08 8.03e-08 3.46e-08 2.41e-07 3.31e-08 1.72e-08 9.15e-08 9.12e-09 9.38e-08 2.85e-09 5.16e-08