logo

Genes within 1Mb (chr6:137087495:G:A):

View on , UCSC , GTEx , gnomAD

Immune cell-type specific single cell cis-eQTLs in OASIS
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000027697 IFNGR1 -131954 sc-eQTL 1.45e-01 -0.126 0.0862 0.214 B L1
ENSG00000029363 BCLAF1 797644 sc-eQTL 8.96e-01 -0.00504 0.0386 0.214 B L1
ENSG00000112357 PEX7 264931 sc-eQTL 9.48e-02 0.171 0.102 0.214 B L1
ENSG00000118503 TNFAIP3 -779719 sc-eQTL 6.02e-01 -0.0285 0.0547 0.214 B L1
ENSG00000197442 MAP3K5 295018 sc-eQTL 1.69e-01 -0.105 0.0759 0.214 B L1
ENSG00000237499 WAKMAR2 -780738 sc-eQTL 4.70e-01 -0.0621 0.0859 0.214 B L1
ENSG00000027697 IFNGR1 -131954 sc-eQTL 2.71e-02 -0.127 0.0572 0.214 CD4T L1
ENSG00000029363 BCLAF1 797644 sc-eQTL 9.63e-01 0.00206 0.0438 0.214 CD4T L1
ENSG00000112357 PEX7 264931 sc-eQTL 9.34e-01 -0.00777 0.0933 0.214 CD4T L1
ENSG00000118503 TNFAIP3 -779719 sc-eQTL 7.02e-01 0.0225 0.0587 0.214 CD4T L1
ENSG00000197442 MAP3K5 295018 sc-eQTL 1.18e-01 -0.0698 0.0444 0.214 CD4T L1
ENSG00000237499 WAKMAR2 -780738 sc-eQTL 1.18e-01 -0.115 0.0734 0.214 CD4T L1
ENSG00000027697 IFNGR1 -131954 sc-eQTL 3.37e-01 -0.0634 0.0659 0.214 CD8T L1
ENSG00000029363 BCLAF1 797644 sc-eQTL 3.85e-01 0.0388 0.0446 0.214 CD8T L1
ENSG00000112357 PEX7 264931 sc-eQTL 4.26e-01 -0.0876 0.11 0.214 CD8T L1
ENSG00000118503 TNFAIP3 -779719 sc-eQTL 5.14e-01 0.0363 0.0555 0.214 CD8T L1
ENSG00000197442 MAP3K5 295018 sc-eQTL 8.65e-01 -0.00999 0.0587 0.214 CD8T L1
ENSG00000237499 WAKMAR2 -780738 sc-eQTL 5.86e-01 0.0445 0.0816 0.214 CD8T L1
ENSG00000027697 IFNGR1 -131954 sc-eQTL 7.06e-01 -0.0293 0.0776 0.216 DC L1
ENSG00000029363 BCLAF1 797644 sc-eQTL 8.72e-01 0.0113 0.0699 0.216 DC L1
ENSG00000112357 PEX7 264931 sc-eQTL 8.98e-01 0.014 0.109 0.216 DC L1
ENSG00000118503 TNFAIP3 -779719 sc-eQTL 8.65e-01 -0.0142 0.083 0.216 DC L1
ENSG00000135525 MAP7 536676 sc-eQTL 7.59e-01 -0.0276 0.0899 0.216 DC L1
ENSG00000197442 MAP3K5 295018 sc-eQTL 9.01e-01 0.0107 0.0861 0.216 DC L1
ENSG00000237499 WAKMAR2 -780738 sc-eQTL 6.36e-01 0.0401 0.0845 0.216 DC L1
ENSG00000286646 AL121933.2 303450 sc-eQTL 5.67e-01 0.0644 0.112 0.216 DC L1
ENSG00000027697 IFNGR1 -131954 sc-eQTL 6.14e-02 -0.122 0.0649 0.214 Mono L1
ENSG00000029363 BCLAF1 797644 sc-eQTL 3.26e-01 0.055 0.0558 0.214 Mono L1
ENSG00000112357 PEX7 264931 sc-eQTL 3.30e-01 -0.107 0.11 0.214 Mono L1
ENSG00000118503 TNFAIP3 -779719 sc-eQTL 5.20e-01 0.0357 0.0554 0.214 Mono L1
ENSG00000135525 MAP7 536676 sc-eQTL 1.02e-01 -0.159 0.0965 0.214 Mono L1
ENSG00000197442 MAP3K5 295018 sc-eQTL 6.23e-01 -0.0319 0.0647 0.214 Mono L1
ENSG00000237499 WAKMAR2 -780738 sc-eQTL 9.16e-01 0.00726 0.0688 0.214 Mono L1
ENSG00000286646 AL121933.2 303450 sc-eQTL 1.60e-01 0.11 0.0781 0.214 Mono L1
ENSG00000027697 IFNGR1 -131954 sc-eQTL 5.28e-02 -0.144 0.0741 0.215 NK L1
ENSG00000029363 BCLAF1 797644 sc-eQTL 7.93e-01 0.0105 0.0397 0.215 NK L1
ENSG00000112357 PEX7 264931 sc-eQTL 3.85e-01 0.1 0.115 0.215 NK L1
ENSG00000118503 TNFAIP3 -779719 sc-eQTL 6.75e-01 0.0261 0.0622 0.215 NK L1
ENSG00000197442 MAP3K5 295018 sc-eQTL 7.91e-01 0.0237 0.0892 0.215 NK L1
ENSG00000237499 WAKMAR2 -780738 sc-eQTL 3.43e-01 -0.0836 0.0881 0.215 NK L1
ENSG00000027697 IFNGR1 -131954 sc-eQTL 3.64e-01 -0.0621 0.0683 0.214 Other_T L1
ENSG00000029363 BCLAF1 797644 sc-eQTL 6.78e-01 -0.0239 0.0573 0.214 Other_T L1
ENSG00000112357 PEX7 264931 sc-eQTL 7.16e-01 -0.0406 0.112 0.214 Other_T L1
ENSG00000118503 TNFAIP3 -779719 sc-eQTL 7.84e-01 0.0117 0.0426 0.214 Other_T L1
ENSG00000146410 MTFR2 837160 sc-eQTL 9.01e-01 0.00804 0.0645 0.214 Other_T L1
ENSG00000197442 MAP3K5 295018 sc-eQTL 9.08e-01 0.00952 0.0822 0.214 Other_T L1
ENSG00000237499 WAKMAR2 -780738 sc-eQTL 7.81e-01 -0.0235 0.0845 0.214 Other_T L1
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000027697 IFNGR1 -131954 sc-eQTL 1.76e-01 -0.156 0.115 0.219 B_Activated L2
ENSG00000029363 BCLAF1 797644 sc-eQTL 5.65e-01 0.0539 0.0936 0.219 B_Activated L2
ENSG00000112357 PEX7 264931 sc-eQTL 4.94e-02 0.222 0.112 0.219 B_Activated L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 -779719 sc-eQTL 1.55e-01 0.162 0.113 0.219 B_Activated L2
ENSG00000197442 MAP3K5 295018 sc-eQTL 2.48e-01 -0.147 0.127 0.219 B_Activated L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 -780738 sc-eQTL 7.45e-01 -0.0324 0.0994 0.219 B_Activated L2
ENSG00000027697 IFNGR1 -131954 sc-eQTL 5.16e-01 -0.0663 0.102 0.215 B_Intermediate L2
ENSG00000029363 BCLAF1 797644 sc-eQTL 5.94e-01 0.0309 0.058 0.215 B_Intermediate L2
ENSG00000112357 PEX7 264931 sc-eQTL 1.50e-01 0.153 0.106 0.215 B_Intermediate L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 -779719 sc-eQTL 9.67e-01 0.00319 0.0764 0.215 B_Intermediate L2
ENSG00000197442 MAP3K5 295018 sc-eQTL 7.27e-01 -0.0323 0.0923 0.215 B_Intermediate L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 -780738 sc-eQTL 7.28e-01 -0.0378 0.108 0.215 B_Intermediate L2
ENSG00000027697 IFNGR1 -131954 sc-eQTL 5.07e-01 -0.0746 0.112 0.216 B_Memory L2
ENSG00000029363 BCLAF1 797644 sc-eQTL 6.53e-01 0.03 0.0666 0.216 B_Memory L2
ENSG00000112357 PEX7 264931 sc-eQTL 5.78e-01 0.0631 0.113 0.216 B_Memory L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 -779719 sc-eQTL 4.99e-01 -0.0497 0.0733 0.216 B_Memory L2
ENSG00000197442 MAP3K5 295018 sc-eQTL 7.19e-01 0.0361 0.1 0.216 B_Memory L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 -780738 sc-eQTL 7.80e-01 -0.0305 0.109 0.216 B_Memory L2
ENSG00000027697 IFNGR1 -131954 sc-eQTL 8.69e-02 -0.149 0.0868 0.214 B_Naive1 L2
ENSG00000029363 BCLAF1 797644 sc-eQTL 9.91e-01 -0.000568 0.05 0.214 B_Naive1 L2
ENSG00000112357 PEX7 264931 sc-eQTL 3.53e-01 0.107 0.115 0.214 B_Naive1 L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 -779719 sc-eQTL 8.45e-01 -0.0115 0.0585 0.214 B_Naive1 L2
ENSG00000197442 MAP3K5 295018 sc-eQTL 6.37e-01 0.0388 0.0822 0.214 B_Naive1 L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 -780738 sc-eQTL 9.15e-01 0.00981 0.0917 0.214 B_Naive1 L2
ENSG00000027697 IFNGR1 -131954 sc-eQTL 9.07e-01 -0.0124 0.106 0.215 B_Naive2 L2
ENSG00000029363 BCLAF1 797644 sc-eQTL 2.91e-01 -0.0646 0.0611 0.215 B_Naive2 L2
ENSG00000112357 PEX7 264931 sc-eQTL 1.53e-01 0.165 0.115 0.215 B_Naive2 L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 -779719 sc-eQTL 9.92e-01 -0.000807 0.0841 0.215 B_Naive2 L2
ENSG00000197442 MAP3K5 295018 sc-eQTL 3.26e-02 -0.191 0.0886 0.215 B_Naive2 L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 -780738 sc-eQTL 7.49e-02 -0.193 0.108 0.215 B_Naive2 L2
ENSG00000027697 IFNGR1 -131954 sc-eQTL 6.86e-01 0.0398 0.0982 0.216 CD4_CTL L2
ENSG00000029363 BCLAF1 797644 sc-eQTL 3.41e-01 0.083 0.087 0.216 CD4_CTL L2
ENSG00000112357 PEX7 264931 sc-eQTL 5.51e-01 -0.065 0.109 0.216 CD4_CTL L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 -779719 sc-eQTL 3.42e-01 -0.0612 0.0643 0.216 CD4_CTL L2
ENSG00000197442 MAP3K5 295018 sc-eQTL 3.18e-01 -0.103 0.103 0.216 CD4_CTL L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 -780738 sc-eQTL 9.01e-01 -0.0125 0.1 0.216 CD4_CTL L2
ENSG00000027697 IFNGR1 -131954 sc-eQTL 1.90e-01 -0.0717 0.0545 0.214 CD4_Naive L2
ENSG00000029363 BCLAF1 797644 sc-eQTL 9.91e-01 0.00049 0.0439 0.214 CD4_Naive L2
ENSG00000112357 PEX7 264931 sc-eQTL 7.94e-01 0.0271 0.103 0.214 CD4_Naive L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 -779719 sc-eQTL 9.56e-01 0.0033 0.0598 0.214 CD4_Naive L2
ENSG00000197442 MAP3K5 295018 sc-eQTL 3.96e-01 -0.0373 0.0439 0.214 CD4_Naive L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 -780738 sc-eQTL 3.28e-02 -0.165 0.0767 0.214 CD4_Naive L2
ENSG00000027697 IFNGR1 -131954 sc-eQTL 4.61e-02 -0.15 0.075 0.214 CD4_TCM L2
ENSG00000029363 BCLAF1 797644 sc-eQTL 4.39e-01 0.037 0.0477 0.214 CD4_TCM L2
ENSG00000112357 PEX7 264931 sc-eQTL 3.22e-01 0.11 0.111 0.214 CD4_TCM L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 -779719 sc-eQTL 7.97e-01 0.014 0.0545 0.214 CD4_TCM L2
ENSG00000197442 MAP3K5 295018 sc-eQTL 9.22e-02 -0.104 0.0617 0.214 CD4_TCM L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 -780738 sc-eQTL 5.81e-01 -0.0422 0.0764 0.214 CD4_TCM L2
ENSG00000027697 IFNGR1 -131954 sc-eQTL 1.10e-01 -0.138 0.0862 0.214 CD4_TEM L2
ENSG00000029363 BCLAF1 797644 sc-eQTL 9.81e-01 0.00146 0.0615 0.214 CD4_TEM L2
ENSG00000112357 PEX7 264931 sc-eQTL 1.74e-01 -0.152 0.111 0.214 CD4_TEM L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 -779719 sc-eQTL 2.41e-01 0.0675 0.0574 0.214 CD4_TEM L2
ENSG00000197442 MAP3K5 295018 sc-eQTL 2.71e-01 -0.098 0.0887 0.214 CD4_TEM L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 -780738 sc-eQTL 1.51e-01 -0.132 0.0919 0.214 CD4_TEM L2
ENSG00000027697 IFNGR1 -131954 sc-eQTL 9.25e-01 -0.00747 0.0789 0.214 CD8_CTL L2
ENSG00000029363 BCLAF1 797644 sc-eQTL 2.72e-01 0.0577 0.0525 0.214 CD8_CTL L2
ENSG00000112357 PEX7 264931 sc-eQTL 3.80e-01 0.0953 0.108 0.214 CD8_CTL L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 -779719 sc-eQTL 8.84e-01 -0.00966 0.0664 0.214 CD8_CTL L2
ENSG00000197442 MAP3K5 295018 sc-eQTL 5.13e-01 0.0613 0.0936 0.214 CD8_CTL L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 -780738 sc-eQTL 7.60e-01 -0.0286 0.0933 0.214 CD8_CTL L2
ENSG00000027697 IFNGR1 -131954 sc-eQTL 2.69e-02 -0.172 0.0773 0.214 CD8_Naive L2
ENSG00000029363 BCLAF1 797644 sc-eQTL 8.51e-01 0.0103 0.0546 0.214 CD8_Naive L2
ENSG00000112357 PEX7 264931 sc-eQTL 7.10e-01 -0.0422 0.113 0.214 CD8_Naive L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 -779719 sc-eQTL 5.90e-01 0.033 0.0611 0.214 CD8_Naive L2
ENSG00000197442 MAP3K5 295018 sc-eQTL 7.96e-01 -0.0187 0.0724 0.214 CD8_Naive L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 -780738 sc-eQTL 6.75e-01 -0.038 0.0904 0.214 CD8_Naive L2
ENSG00000027697 IFNGR1 -131954 sc-eQTL 6.64e-01 0.0452 0.104 0.22 CD8_TCM L2
ENSG00000029363 BCLAF1 797644 sc-eQTL 4.85e-01 -0.0544 0.0779 0.22 CD8_TCM L2
ENSG00000112357 PEX7 264931 sc-eQTL 2.69e-01 -0.132 0.119 0.22 CD8_TCM L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 -779719 sc-eQTL 7.79e-01 -0.0159 0.0563 0.22 CD8_TCM L2
ENSG00000197442 MAP3K5 295018 sc-eQTL 6.54e-01 -0.0451 0.1 0.22 CD8_TCM L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 -780738 sc-eQTL 2.69e-01 0.114 0.103 0.22 CD8_TCM L2
ENSG00000027697 IFNGR1 -131954 sc-eQTL 4.42e-01 -0.0782 0.101 0.205 CD8_TEM L2
ENSG00000029363 BCLAF1 797644 sc-eQTL 7.27e-01 -0.0336 0.0959 0.205 CD8_TEM L2
ENSG00000112357 PEX7 264931 sc-eQTL 7.99e-01 0.0299 0.117 0.205 CD8_TEM L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 -779719 sc-eQTL 8.27e-01 0.0164 0.075 0.205 CD8_TEM L2
ENSG00000197442 MAP3K5 295018 sc-eQTL 9.53e-01 0.0069 0.116 0.205 CD8_TEM L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 -780738 sc-eQTL 6.62e-01 -0.0487 0.111 0.205 CD8_TEM L2
ENSG00000027697 IFNGR1 -131954 sc-eQTL 2.79e-01 -0.0851 0.0784 0.216 MAIT L2
ENSG00000029363 BCLAF1 797644 sc-eQTL 7.16e-01 0.0238 0.0653 0.216 MAIT L2
ENSG00000112357 PEX7 264931 sc-eQTL 4.59e-01 -0.079 0.107 0.216 MAIT L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 -779719 sc-eQTL 8.53e-01 0.0098 0.0529 0.216 MAIT L2
ENSG00000146410 MTFR2 837160 sc-eQTL 6.36e-01 0.0418 0.0881 0.216 MAIT L2
ENSG00000197442 MAP3K5 295018 sc-eQTL 2.36e-01 0.109 0.0919 0.216 MAIT L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 -780738 sc-eQTL 5.93e-01 0.0524 0.0978 0.216 MAIT L2
ENSG00000027697 IFNGR1 -131954 sc-eQTL 3.93e-01 -0.0744 0.0869 0.216 NK_CD56bright L2
ENSG00000029363 BCLAF1 797644 sc-eQTL 7.76e-01 -0.0183 0.0643 0.216 NK_CD56bright L2
ENSG00000112357 PEX7 264931 sc-eQTL 4.22e-01 0.0912 0.113 0.216 NK_CD56bright L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 -779719 sc-eQTL 5.26e-01 0.0411 0.0648 0.216 NK_CD56bright L2
ENSG00000197442 MAP3K5 295018 sc-eQTL 4.66e-01 -0.0719 0.0985 0.216 NK_CD56bright L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 -780738 sc-eQTL 5.15e-01 0.0673 0.103 0.216 NK_CD56bright L2
ENSG00000027697 IFNGR1 -131954 sc-eQTL 3.34e-01 -0.0667 0.0689 0.216 NK_CD56dim L2
ENSG00000029363 BCLAF1 797644 sc-eQTL 9.50e-01 -0.00282 0.0451 0.216 NK_CD56dim L2
ENSG00000112357 PEX7 264931 sc-eQTL 8.41e-01 0.0239 0.119 0.216 NK_CD56dim L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 -779719 sc-eQTL 5.95e-01 0.0346 0.065 0.216 NK_CD56dim L2
ENSG00000197442 MAP3K5 295018 sc-eQTL 9.68e-01 0.00371 0.0936 0.216 NK_CD56dim L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 -780738 sc-eQTL 3.48e-01 -0.0915 0.0972 0.216 NK_CD56dim L2
ENSG00000027697 IFNGR1 -131954 sc-eQTL 2.64e-02 -0.198 0.0887 0.21 NK_HLA L2
ENSG00000029363 BCLAF1 797644 sc-eQTL 8.21e-01 0.0172 0.076 0.21 NK_HLA L2
ENSG00000112357 PEX7 264931 sc-eQTL 7.24e-02 0.204 0.113 0.21 NK_HLA L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 -779719 sc-eQTL 5.21e-01 -0.0457 0.0711 0.21 NK_HLA L2
ENSG00000197442 MAP3K5 295018 sc-eQTL 1.62e-01 0.158 0.113 0.21 NK_HLA L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 -780738 sc-eQTL 5.05e-02 -0.223 0.114 0.21 NK_HLA L2
ENSG00000027697 IFNGR1 -131954 sc-eQTL 4.28e-02 -0.148 0.0725 0.216 NK_cytokine L2
ENSG00000029363 BCLAF1 797644 sc-eQTL 6.53e-01 0.0246 0.0546 0.216 NK_cytokine L2
ENSG00000112357 PEX7 264931 sc-eQTL 9.42e-01 0.00833 0.115 0.216 NK_cytokine L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 -779719 sc-eQTL 5.00e-01 0.0441 0.0653 0.216 NK_cytokine L2
ENSG00000197442 MAP3K5 295018 sc-eQTL 9.35e-01 -0.00738 0.0898 0.216 NK_cytokine L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 -780738 sc-eQTL 8.00e-01 -0.0249 0.0985 0.216 NK_cytokine L2
ENSG00000027697 IFNGR1 -131954 sc-eQTL 1.42e-02 -0.366 0.147 0.2 PB L2
ENSG00000029363 BCLAF1 797644 sc-eQTL 2.34e-02 -0.293 0.127 0.2 PB L2
ENSG00000112357 PEX7 264931 sc-eQTL 9.54e-01 0.00892 0.155 0.2 PB L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 -779719 sc-eQTL 6.84e-01 0.0479 0.117 0.2 PB L2
ENSG00000197442 MAP3K5 295018 sc-eQTL 1.85e-01 -0.177 0.133 0.2 PB L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 -780738 sc-eQTL 1.86e-01 0.186 0.14 0.2 PB L2
ENSG00000027697 IFNGR1 -131954 sc-eQTL 6.89e-01 0.0355 0.0884 0.217 Pro_T L2
ENSG00000029363 BCLAF1 797644 sc-eQTL 9.00e-01 -0.0116 0.0917 0.217 Pro_T L2
ENSG00000112357 PEX7 264931 sc-eQTL 4.78e-01 0.0763 0.107 0.217 Pro_T L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 -779719 sc-eQTL 1.85e-01 0.0714 0.0537 0.217 Pro_T L2
ENSG00000146410 MTFR2 837160 sc-eQTL 6.07e-01 0.0384 0.0746 0.217 Pro_T L2
ENSG00000197442 MAP3K5 295018 sc-eQTL 1.22e-01 -0.161 0.104 0.217 Pro_T L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 -780738 sc-eQTL 9.78e-01 -0.00292 0.105 0.217 Pro_T L2
ENSG00000027697 IFNGR1 -131954 sc-eQTL 2.13e-01 -0.129 0.103 0.214 Treg L2
ENSG00000029363 BCLAF1 797644 sc-eQTL 1.84e-01 -0.0885 0.0665 0.214 Treg L2
ENSG00000112357 PEX7 264931 sc-eQTL 8.69e-01 0.018 0.109 0.214 Treg L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 -779719 sc-eQTL 9.82e-01 -0.00148 0.0657 0.214 Treg L2
ENSG00000197442 MAP3K5 295018 sc-eQTL 5.79e-01 0.0396 0.0711 0.214 Treg L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 -780738 sc-eQTL 7.59e-01 -0.0307 0.1 0.214 Treg L2
ENSG00000027697 IFNGR1 -131954 sc-eQTL 6.73e-01 0.0368 0.0869 0.217 cDC L2
ENSG00000029363 BCLAF1 797644 sc-eQTL 1.71e-01 0.12 0.0872 0.217 cDC L2
ENSG00000112357 PEX7 264931 sc-eQTL 4.32e-01 0.0885 0.112 0.217 cDC L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 -779719 sc-eQTL 9.46e-01 0.00583 0.0858 0.217 cDC L2
ENSG00000135525 MAP7 536676 sc-eQTL 4.03e-01 0.0839 0.1 0.217 cDC L2
ENSG00000197442 MAP3K5 295018 sc-eQTL 9.13e-01 -0.00966 0.0882 0.217 cDC L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 -780738 sc-eQTL 2.21e-01 0.137 0.111 0.217 cDC L2
ENSG00000286646 AL121933.2 303450 sc-eQTL 8.95e-01 -0.0151 0.115 0.217 cDC L2
ENSG00000027697 IFNGR1 -131954 sc-eQTL 4.54e-01 -0.0458 0.061 0.214 cMono_IL1B L2
ENSG00000029363 BCLAF1 797644 sc-eQTL 6.70e-01 0.0279 0.0655 0.214 cMono_IL1B L2
ENSG00000112357 PEX7 264931 sc-eQTL 2.86e-01 -0.117 0.11 0.214 cMono_IL1B L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 -779719 sc-eQTL 5.94e-01 0.0351 0.0657 0.214 cMono_IL1B L2
ENSG00000135525 MAP7 536676 sc-eQTL 3.27e-02 -0.201 0.0936 0.214 cMono_IL1B L2
ENSG00000197442 MAP3K5 295018 sc-eQTL 8.28e-01 -0.0149 0.0684 0.214 cMono_IL1B L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 -780738 sc-eQTL 6.03e-01 0.0365 0.0702 0.214 cMono_IL1B L2
ENSG00000286646 AL121933.2 303450 sc-eQTL 3.28e-02 0.187 0.087 0.214 cMono_IL1B L2
ENSG00000027697 IFNGR1 -131954 sc-eQTL 7.66e-02 -0.125 0.0701 0.214 cMono_S100A L2
ENSG00000029363 BCLAF1 797644 sc-eQTL 3.83e-01 0.0633 0.0725 0.214 cMono_S100A L2
ENSG00000112357 PEX7 264931 sc-eQTL 4.10e-01 -0.0935 0.113 0.214 cMono_S100A L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 -779719 sc-eQTL 4.17e-01 -0.051 0.0627 0.214 cMono_S100A L2
ENSG00000135525 MAP7 536676 sc-eQTL 9.20e-01 0.0106 0.106 0.214 cMono_S100A L2
ENSG00000197442 MAP3K5 295018 sc-eQTL 4.42e-01 -0.0656 0.0853 0.214 cMono_S100A L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 -780738 sc-eQTL 1.45e-01 -0.131 0.0897 0.214 cMono_S100A L2
ENSG00000286646 AL121933.2 303450 sc-eQTL 6.64e-01 0.0382 0.088 0.214 cMono_S100A L2
ENSG00000027697 IFNGR1 -131954 sc-eQTL 4.93e-01 0.0705 0.103 0.209 gdT L2
ENSG00000029363 BCLAF1 797644 sc-eQTL 6.08e-01 -0.0464 0.0904 0.209 gdT L2
ENSG00000112357 PEX7 264931 sc-eQTL 4.10e-01 -0.107 0.13 0.209 gdT L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 -779719 sc-eQTL 7.36e-01 0.0214 0.0632 0.209 gdT L2
ENSG00000146410 MTFR2 837160 sc-eQTL 6.54e-01 0.0449 0.0997 0.209 gdT L2
ENSG00000197442 MAP3K5 295018 sc-eQTL 6.97e-01 0.0521 0.134 0.209 gdT L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 -780738 sc-eQTL 2.53e-01 -0.131 0.114 0.209 gdT L2
ENSG00000027697 IFNGR1 -131954 sc-eQTL 5.86e-01 -0.0414 0.0759 0.218 intMono L2
ENSG00000029363 BCLAF1 797644 sc-eQTL 2.39e-01 0.118 0.1 0.218 intMono L2
ENSG00000112357 PEX7 264931 sc-eQTL 9.42e-01 -0.0075 0.102 0.218 intMono L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 -779719 sc-eQTL 9.78e-01 0.00184 0.0656 0.218 intMono L2
ENSG00000135525 MAP7 536676 sc-eQTL 5.37e-01 0.0623 0.101 0.218 intMono L2
ENSG00000197442 MAP3K5 295018 sc-eQTL 4.44e-01 0.0818 0.107 0.218 intMono L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 -780738 sc-eQTL 8.74e-01 0.0156 0.0978 0.218 intMono L2
ENSG00000286646 AL121933.2 303450 sc-eQTL 4.54e-01 0.0845 0.113 0.218 intMono L2
ENSG00000027697 IFNGR1 -131954 sc-eQTL 1.03e-02 -0.228 0.088 0.215 ncMono L2
ENSG00000029363 BCLAF1 797644 sc-eQTL 1.75e-01 -0.0943 0.0692 0.215 ncMono L2
ENSG00000112357 PEX7 264931 sc-eQTL 8.08e-01 0.0269 0.111 0.215 ncMono L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 -779719 sc-eQTL 4.74e-01 0.0567 0.0791 0.215 ncMono L2
ENSG00000135525 MAP7 536676 sc-eQTL 6.07e-01 -0.0503 0.0978 0.215 ncMono L2
ENSG00000197442 MAP3K5 295018 sc-eQTL 7.05e-01 0.039 0.103 0.215 ncMono L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 -780738 sc-eQTL 9.40e-01 0.0075 0.099 0.215 ncMono L2
ENSG00000286646 AL121933.2 303450 sc-eQTL 8.73e-01 -0.0167 0.104 0.215 ncMono L2
ENSG00000027697 IFNGR1 -131954 sc-eQTL 6.61e-01 -0.0446 0.102 0.215 pDC L2
ENSG00000029363 BCLAF1 797644 sc-eQTL 6.49e-01 0.0347 0.0762 0.215 pDC L2
ENSG00000112357 PEX7 264931 sc-eQTL 5.80e-01 -0.062 0.112 0.215 pDC L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 -779719 sc-eQTL 9.78e-01 -0.00264 0.0942 0.215 pDC L2
ENSG00000135525 MAP7 536676 sc-eQTL 1.77e-01 -0.105 0.0777 0.215 pDC L2
ENSG00000197442 MAP3K5 295018 sc-eQTL 2.34e-01 0.149 0.124 0.215 pDC L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 -780738 sc-eQTL 2.86e-01 -0.102 0.0953 0.215 pDC L2
ENSG00000286646 AL121933.2 303450 sc-eQTL 2.25e-01 0.14 0.115 0.215 pDC L2
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000027697 IFNGR1 -131954 sc-eQTL 5.81e-01 -0.0504 0.0912 0.214 B_Memory LOneK1K
ENSG00000029363 BCLAF1 797644 sc-eQTL 6.80e-01 0.0211 0.0512 0.214 B_Memory LOneK1K
ENSG00000112357 PEX7 264931 sc-eQTL 7.44e-02 0.187 0.104 0.214 B_Memory LOneK1K
ENSG00000118503 TNFAIP3 -779719 sc-eQTL 2.49e-01 -0.0742 0.0642 0.214 B_Memory LOneK1K
ENSG00000197442 MAP3K5 295018 sc-eQTL 7.71e-01 -0.0248 0.0852 0.214 B_Memory LOneK1K
ENSG00000237499 WAKMAR2 -780738 sc-eQTL 5.72e-01 -0.0615 0.109 0.214 B_Memory LOneK1K
ENSG00000027697 IFNGR1 -131954 sc-eQTL 1.44e-01 -0.134 0.0915 0.214 B_Naive LOneK1K
ENSG00000029363 BCLAF1 797644 sc-eQTL 3.18e-01 -0.0422 0.0421 0.214 B_Naive LOneK1K
ENSG00000112357 PEX7 264931 sc-eQTL 2.30e-01 0.134 0.111 0.214 B_Naive LOneK1K
ENSG00000118503 TNFAIP3 -779719 sc-eQTL 8.64e-01 -0.009 0.0526 0.214 B_Naive LOneK1K
ENSG00000197442 MAP3K5 295018 sc-eQTL 5.04e-01 -0.0515 0.0771 0.214 B_Naive LOneK1K
ENSG00000237499 WAKMAR2 -780738 sc-eQTL 5.66e-01 -0.0539 0.0937 0.214 B_Naive LOneK1K
ENSG00000027697 IFNGR1 -131954 sc-eQTL 1.42e-01 -0.09 0.061 0.214 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000029363 BCLAF1 797644 sc-eQTL 3.49e-01 0.0535 0.057 0.214 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000112357 PEX7 264931 sc-eQTL 2.46e-01 -0.128 0.11 0.214 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000118503 TNFAIP3 -779719 sc-eQTL 7.52e-01 0.018 0.0567 0.214 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000135525 MAP7 536676 sc-eQTL 4.16e-02 -0.2 0.0975 0.214 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000197442 MAP3K5 295018 sc-eQTL 3.14e-01 -0.0669 0.0663 0.214 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000237499 WAKMAR2 -780738 sc-eQTL 9.76e-01 0.00206 0.068 0.214 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000286646 AL121933.2 303450 sc-eQTL 1.56e-01 0.112 0.0787 0.214 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000027697 IFNGR1 -131954 sc-eQTL 6.94e-02 -0.135 0.0739 0.216 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000029363 BCLAF1 797644 sc-eQTL 9.69e-01 0.0026 0.0673 0.216 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000112357 PEX7 264931 sc-eQTL 9.34e-01 0.00927 0.112 0.216 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000118503 TNFAIP3 -779719 sc-eQTL 9.00e-01 0.00872 0.0696 0.216 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000135525 MAP7 536676 sc-eQTL 8.62e-01 0.019 0.109 0.216 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000197442 MAP3K5 295018 sc-eQTL 2.40e-01 0.105 0.089 0.216 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000237499 WAKMAR2 -780738 sc-eQTL 8.89e-01 0.013 0.0933 0.216 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000286646 AL121933.2 303450 sc-eQTL 4.28e-01 0.0839 0.106 0.216 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000027697 IFNGR1 -131954 sc-eQTL 6.76e-02 -0.129 0.0703 0.216 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000029363 BCLAF1 797644 sc-eQTL 5.81e-01 0.0227 0.0411 0.216 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000112357 PEX7 264931 sc-eQTL 7.35e-01 0.0404 0.119 0.216 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000118503 TNFAIP3 -779719 sc-eQTL 8.14e-01 0.0152 0.0645 0.216 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000197442 MAP3K5 295018 sc-eQTL 8.51e-01 0.0163 0.0872 0.216 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000237499 WAKMAR2 -780738 sc-eQTL 2.81e-01 -0.0974 0.09 0.216 NK_CD56dim LOneK1K

Statistical fine-mapping results from Japan COVID-19 Task Force
(Shown only for PIP>0.001)
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
PIP (SuSiE)
PIP (FINEMAP)
MAF
ENSG00000027697 IFNGR1 -131954 pQTL 0.000108 -0.0769 0.0198 0.0 0.0 0.183
ENSG00000027697 IFNGR1 -131954 eQTL 2.46e-05 -0.0734 0.0173 0.0 0.0 0.178
ENSG00000182747 SLC35D3 165194 eQTL 0.000622 0.137 0.04 0.0 0.0 0.178

Expression Modifier Score(EMS) for GTEx 49tissues
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Whole Blood
Muscle Skeletal
Liver
Brain Cerebellum
Prostate
Spleen
Skin Sun Exposed Lower leg
Artery Coronary
Esophagus Muscularis
Esophagus Gastroesophageal Junction
Artery Tibial
Heart Atrial Appendage
Nerve Tibial
Heart Left Ventricle
Adrenal Gland
Adipose Visceral Omentum
Pancreas
Lung
Pituitary
Brain Nucleus accumbens basal ganglia
Colon Transverse
Adipose Subcutaneous
Esophagus Mucosa
Brain Cortex
Thyroid
Stomach
Breast Mammary Tissue
Colon Sigmoid
Skin Not Sun Exposed Suprapubic
Testis
Artery Aorta
Brain Amygdala
Brain Anterior cingulate cortex BA24
Brain Caudate basal ganglia
Brain Cerebellar Hemisphere
Brain Frontal Cortex BA9
Brain Hippocampus
Brain Hypothalamus
Brain Putamen basal ganglia
Brain Spinal cord cervical c-1
Brain Substantia nigra
Cells Cultured fibroblasts
Cells EBV-transformed lymphocytes
Kidney Cortex
Minor Salivary Gland
Ovary
Small Intestine Terminal Ileum
Uterus
Vagina
ENSG00000027697 IFNGR1 -131954 4.39e-06 3.93e-06 8.92e-07 1.89e-06 1.53e-06 1.05e-06 2.95e-06 9.79e-07 4.09e-06 1.99e-06 4.22e-06 3.21e-06 6.51e-06 1.4e-06 1.4e-06 2.98e-06 2.06e-06 2.79e-06 1.48e-06 1.04e-06 2.67e-06 4.14e-06 3.42e-06 1.48e-06 4.62e-06 1.74e-06 2.41e-06 1.43e-06 4.3e-06 3.75e-06 1.89e-06 5.58e-07 5.51e-07 1.59e-06 1.96e-06 1.02e-06 9.63e-07 5.45e-07 9.45e-07 4.07e-07 7.46e-07 4.74e-06 3.96e-07 1.63e-07 6.22e-07 5.51e-07 9.78e-07 4.43e-07 4.54e-07
ENSG00000220412 \N -619706 3.92e-07 1.83e-07 7.6e-08 2.26e-07 1.03e-07 1.08e-07 2.95e-07 8.11e-08 2.35e-07 1.37e-07 2.38e-07 1.91e-07 3.18e-07 8.66e-08 7.35e-08 1.14e-07 7.3e-08 2.66e-07 8.68e-08 8.52e-08 1.33e-07 2.15e-07 2e-07 4.25e-08 2.74e-07 2e-07 1.39e-07 1.44e-07 1.47e-07 1.69e-07 1.39e-07 4.51e-08 4.74e-08 1.03e-07 6.78e-08 5.04e-08 5.76e-08 6.32e-08 5.27e-08 6.92e-08 4.83e-08 1.63e-07 3.18e-08 1.11e-08 3.71e-08 9.65e-09 9.23e-08 0.0 4.61e-08