logo

Genes within 1Mb (chr6:137086878:A:G):

View on , UCSC , GTEx , gnomAD

Immune cell-type specific single cell cis-eQTLs in OASIS
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000027697 IFNGR1 -132571 sc-eQTL 1.00e-01 0.215 0.13 0.073 B L1
ENSG00000029363 BCLAF1 797027 sc-eQTL 8.05e-01 0.0144 0.0584 0.073 B L1
ENSG00000112357 PEX7 264314 sc-eQTL 4.47e-01 0.118 0.155 0.073 B L1
ENSG00000118503 TNFAIP3 -780336 sc-eQTL 2.12e-01 -0.103 0.0824 0.073 B L1
ENSG00000197442 MAP3K5 294401 sc-eQTL 2.34e-01 0.137 0.115 0.073 B L1
ENSG00000237499 WAKMAR2 -781355 sc-eQTL 2.92e-01 0.137 0.13 0.073 B L1
ENSG00000027697 IFNGR1 -132571 sc-eQTL 2.78e-01 0.0971 0.0892 0.073 CD4T L1
ENSG00000029363 BCLAF1 797027 sc-eQTL 4.37e-01 0.0526 0.0676 0.073 CD4T L1
ENSG00000112357 PEX7 264314 sc-eQTL 8.97e-01 0.0186 0.144 0.073 CD4T L1
ENSG00000118503 TNFAIP3 -780336 sc-eQTL 5.90e-01 -0.0489 0.0906 0.073 CD4T L1
ENSG00000197442 MAP3K5 294401 sc-eQTL 9.98e-01 -0.000177 0.0691 0.073 CD4T L1
ENSG00000237499 WAKMAR2 -781355 sc-eQTL 5.30e-01 -0.0716 0.114 0.073 CD4T L1
ENSG00000027697 IFNGR1 -132571 sc-eQTL 4.61e-01 0.0743 0.101 0.073 CD8T L1
ENSG00000029363 BCLAF1 797027 sc-eQTL 4.81e-01 -0.0481 0.0681 0.073 CD8T L1
ENSG00000112357 PEX7 264314 sc-eQTL 2.52e-01 0.192 0.167 0.073 CD8T L1
ENSG00000118503 TNFAIP3 -780336 sc-eQTL 7.71e-01 -0.0247 0.0847 0.073 CD8T L1
ENSG00000197442 MAP3K5 294401 sc-eQTL 4.27e-01 -0.0712 0.0894 0.073 CD8T L1
ENSG00000237499 WAKMAR2 -781355 sc-eQTL 3.07e-01 -0.127 0.124 0.073 CD8T L1
ENSG00000027697 IFNGR1 -132571 sc-eQTL 9.30e-01 0.0107 0.121 0.074 DC L1
ENSG00000029363 BCLAF1 797027 sc-eQTL 8.79e-01 -0.0166 0.109 0.074 DC L1
ENSG00000112357 PEX7 264314 sc-eQTL 4.72e-01 -0.123 0.171 0.074 DC L1
ENSG00000118503 TNFAIP3 -780336 sc-eQTL 7.72e-02 -0.229 0.129 0.074 DC L1
ENSG00000135525 MAP7 536059 sc-eQTL 4.39e-01 -0.109 0.14 0.074 DC L1
ENSG00000197442 MAP3K5 294401 sc-eQTL 5.05e-01 -0.0899 0.135 0.074 DC L1
ENSG00000237499 WAKMAR2 -781355 sc-eQTL 9.63e-01 -0.00621 0.132 0.074 DC L1
ENSG00000286646 AL121933.2 302833 sc-eQTL 3.94e-01 0.15 0.175 0.074 DC L1
ENSG00000027697 IFNGR1 -132571 sc-eQTL 7.55e-03 0.267 0.099 0.073 Mono L1
ENSG00000029363 BCLAF1 797027 sc-eQTL 3.70e-01 -0.0772 0.0859 0.073 Mono L1
ENSG00000112357 PEX7 264314 sc-eQTL 3.43e-02 0.357 0.168 0.073 Mono L1
ENSG00000118503 TNFAIP3 -780336 sc-eQTL 6.29e-01 -0.0413 0.0854 0.073 Mono L1
ENSG00000135525 MAP7 536059 sc-eQTL 8.94e-01 0.0199 0.149 0.073 Mono L1
ENSG00000197442 MAP3K5 294401 sc-eQTL 4.70e-01 -0.0721 0.0996 0.073 Mono L1
ENSG00000237499 WAKMAR2 -781355 sc-eQTL 2.43e-01 -0.123 0.106 0.073 Mono L1
ENSG00000286646 AL121933.2 302833 sc-eQTL 7.27e-01 0.0421 0.121 0.073 Mono L1
ENSG00000027697 IFNGR1 -132571 sc-eQTL 8.38e-02 0.198 0.114 0.073 NK L1
ENSG00000029363 BCLAF1 797027 sc-eQTL 9.52e-01 -0.00369 0.0609 0.073 NK L1
ENSG00000112357 PEX7 264314 sc-eQTL 1.72e-01 0.241 0.176 0.073 NK L1
ENSG00000118503 TNFAIP3 -780336 sc-eQTL 5.32e-01 -0.0597 0.0954 0.073 NK L1
ENSG00000197442 MAP3K5 294401 sc-eQTL 4.07e-01 -0.114 0.137 0.073 NK L1
ENSG00000237499 WAKMAR2 -781355 sc-eQTL 8.28e-02 -0.234 0.134 0.073 NK L1
ENSG00000027697 IFNGR1 -132571 sc-eQTL 4.86e-01 0.0733 0.105 0.073 Other_T L1
ENSG00000029363 BCLAF1 797027 sc-eQTL 1.32e-01 0.133 0.0878 0.073 Other_T L1
ENSG00000112357 PEX7 264314 sc-eQTL 8.91e-01 0.0235 0.172 0.073 Other_T L1
ENSG00000118503 TNFAIP3 -780336 sc-eQTL 9.28e-01 0.0059 0.0655 0.073 Other_T L1
ENSG00000146410 MTFR2 836543 sc-eQTL 5.75e-01 0.0557 0.0991 0.073 Other_T L1
ENSG00000197442 MAP3K5 294401 sc-eQTL 4.81e-01 -0.0892 0.126 0.073 Other_T L1
ENSG00000237499 WAKMAR2 -781355 sc-eQTL 6.14e-01 -0.0656 0.13 0.073 Other_T L1
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000027697 IFNGR1 -132571 sc-eQTL 4.89e-01 0.119 0.172 0.074 B_Activated L2
ENSG00000029363 BCLAF1 797027 sc-eQTL 2.34e-01 0.166 0.139 0.074 B_Activated L2
ENSG00000112357 PEX7 264314 sc-eQTL 7.36e-01 -0.0573 0.169 0.074 B_Activated L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 -780336 sc-eQTL 2.19e-02 -0.388 0.168 0.074 B_Activated L2
ENSG00000197442 MAP3K5 294401 sc-eQTL 4.39e-01 0.147 0.19 0.074 B_Activated L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 -781355 sc-eQTL 5.63e-01 -0.0861 0.148 0.074 B_Activated L2
ENSG00000027697 IFNGR1 -132571 sc-eQTL 4.64e-01 0.114 0.156 0.073 B_Intermediate L2
ENSG00000029363 BCLAF1 797027 sc-eQTL 4.27e-01 -0.0704 0.0885 0.073 B_Intermediate L2
ENSG00000112357 PEX7 264314 sc-eQTL 9.49e-01 0.0104 0.163 0.073 B_Intermediate L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 -780336 sc-eQTL 4.89e-01 -0.0807 0.116 0.073 B_Intermediate L2
ENSG00000197442 MAP3K5 294401 sc-eQTL 5.89e-01 -0.0762 0.141 0.073 B_Intermediate L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 -781355 sc-eQTL 5.05e-01 -0.11 0.165 0.073 B_Intermediate L2
ENSG00000027697 IFNGR1 -132571 sc-eQTL 3.32e-01 0.163 0.168 0.073 B_Memory L2
ENSG00000029363 BCLAF1 797027 sc-eQTL 5.19e-01 -0.0644 0.0997 0.073 B_Memory L2
ENSG00000112357 PEX7 264314 sc-eQTL 6.52e-01 0.0766 0.17 0.073 B_Memory L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 -780336 sc-eQTL 9.97e-01 -0.00037 0.11 0.073 B_Memory L2
ENSG00000197442 MAP3K5 294401 sc-eQTL 7.93e-01 0.0394 0.15 0.073 B_Memory L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 -781355 sc-eQTL 6.21e-01 0.081 0.163 0.073 B_Memory L2
ENSG00000027697 IFNGR1 -132571 sc-eQTL 8.77e-02 0.227 0.132 0.073 B_Naive1 L2
ENSG00000029363 BCLAF1 797027 sc-eQTL 1.72e-01 0.104 0.0757 0.073 B_Naive1 L2
ENSG00000112357 PEX7 264314 sc-eQTL 3.08e-01 -0.179 0.175 0.073 B_Naive1 L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 -780336 sc-eQTL 4.33e-01 -0.0699 0.0889 0.073 B_Naive1 L2
ENSG00000197442 MAP3K5 294401 sc-eQTL 6.48e-01 0.0571 0.125 0.073 B_Naive1 L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 -781355 sc-eQTL 3.65e-01 0.126 0.139 0.073 B_Naive1 L2
ENSG00000027697 IFNGR1 -132571 sc-eQTL 4.11e-01 -0.134 0.163 0.073 B_Naive2 L2
ENSG00000029363 BCLAF1 797027 sc-eQTL 9.82e-01 0.0022 0.0949 0.073 B_Naive2 L2
ENSG00000112357 PEX7 264314 sc-eQTL 3.14e-01 0.18 0.179 0.073 B_Naive2 L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 -780336 sc-eQTL 5.36e-01 -0.0806 0.13 0.073 B_Naive2 L2
ENSG00000197442 MAP3K5 294401 sc-eQTL 3.09e-01 0.141 0.138 0.073 B_Naive2 L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 -781355 sc-eQTL 9.74e-02 0.279 0.167 0.073 B_Naive2 L2
ENSG00000027697 IFNGR1 -132571 sc-eQTL 4.23e-01 0.121 0.151 0.073 CD4_CTL L2
ENSG00000029363 BCLAF1 797027 sc-eQTL 1.44e-01 -0.195 0.133 0.073 CD4_CTL L2
ENSG00000112357 PEX7 264314 sc-eQTL 7.91e-02 0.293 0.166 0.073 CD4_CTL L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 -780336 sc-eQTL 1.99e-01 -0.127 0.0985 0.073 CD4_CTL L2
ENSG00000197442 MAP3K5 294401 sc-eQTL 6.88e-01 0.0633 0.158 0.073 CD4_CTL L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 -781355 sc-eQTL 8.45e-02 -0.265 0.153 0.073 CD4_CTL L2
ENSG00000027697 IFNGR1 -132571 sc-eQTL 6.77e-01 0.0357 0.0856 0.073 CD4_Naive L2
ENSG00000029363 BCLAF1 797027 sc-eQTL 2.60e-01 0.0775 0.0685 0.073 CD4_Naive L2
ENSG00000112357 PEX7 264314 sc-eQTL 4.84e-01 0.113 0.161 0.073 CD4_Naive L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 -780336 sc-eQTL 7.27e-01 -0.0327 0.0936 0.073 CD4_Naive L2
ENSG00000197442 MAP3K5 294401 sc-eQTL 9.12e-01 -0.00757 0.0687 0.073 CD4_Naive L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 -781355 sc-eQTL 8.89e-01 -0.017 0.121 0.073 CD4_Naive L2
ENSG00000027697 IFNGR1 -132571 sc-eQTL 2.90e-01 0.124 0.117 0.073 CD4_TCM L2
ENSG00000029363 BCLAF1 797027 sc-eQTL 5.55e-01 0.0436 0.0738 0.073 CD4_TCM L2
ENSG00000112357 PEX7 264314 sc-eQTL 1.77e-01 -0.232 0.171 0.073 CD4_TCM L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 -780336 sc-eQTL 9.91e-01 0.001 0.0843 0.073 CD4_TCM L2
ENSG00000197442 MAP3K5 294401 sc-eQTL 7.55e-01 0.0301 0.096 0.073 CD4_TCM L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 -781355 sc-eQTL 7.72e-01 0.0342 0.118 0.073 CD4_TCM L2
ENSG00000027697 IFNGR1 -132571 sc-eQTL 8.17e-01 0.031 0.134 0.073 CD4_TEM L2
ENSG00000029363 BCLAF1 797027 sc-eQTL 4.20e-01 0.0766 0.0948 0.073 CD4_TEM L2
ENSG00000112357 PEX7 264314 sc-eQTL 2.38e-01 -0.204 0.172 0.073 CD4_TEM L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 -780336 sc-eQTL 9.73e-01 -0.00301 0.0889 0.073 CD4_TEM L2
ENSG00000197442 MAP3K5 294401 sc-eQTL 6.00e-01 -0.072 0.137 0.073 CD4_TEM L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 -781355 sc-eQTL 1.13e-01 0.226 0.142 0.073 CD4_TEM L2
ENSG00000027697 IFNGR1 -132571 sc-eQTL 9.25e-01 0.0112 0.119 0.073 CD8_CTL L2
ENSG00000029363 BCLAF1 797027 sc-eQTL 9.09e-03 -0.205 0.078 0.073 CD8_CTL L2
ENSG00000112357 PEX7 264314 sc-eQTL 4.61e-01 -0.121 0.163 0.073 CD8_CTL L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 -780336 sc-eQTL 4.10e-01 -0.0825 0.0999 0.073 CD8_CTL L2
ENSG00000197442 MAP3K5 294401 sc-eQTL 5.85e-01 -0.0773 0.141 0.073 CD8_CTL L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 -781355 sc-eQTL 2.66e-01 -0.156 0.14 0.073 CD8_CTL L2
ENSG00000027697 IFNGR1 -132571 sc-eQTL 6.79e-02 0.222 0.121 0.073 CD8_Naive L2
ENSG00000029363 BCLAF1 797027 sc-eQTL 6.22e-01 0.0421 0.0853 0.073 CD8_Naive L2
ENSG00000112357 PEX7 264314 sc-eQTL 2.71e-01 0.195 0.177 0.073 CD8_Naive L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 -780336 sc-eQTL 2.87e-01 -0.102 0.0953 0.073 CD8_Naive L2
ENSG00000197442 MAP3K5 294401 sc-eQTL 2.59e-01 0.128 0.113 0.073 CD8_Naive L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 -781355 sc-eQTL 9.46e-01 -0.0096 0.141 0.073 CD8_Naive L2
ENSG00000027697 IFNGR1 -132571 sc-eQTL 7.21e-01 -0.0603 0.169 0.074 CD8_TCM L2
ENSG00000029363 BCLAF1 797027 sc-eQTL 2.83e-01 -0.136 0.126 0.074 CD8_TCM L2
ENSG00000112357 PEX7 264314 sc-eQTL 4.51e-02 0.386 0.192 0.074 CD8_TCM L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 -780336 sc-eQTL 5.68e-02 -0.173 0.0905 0.074 CD8_TCM L2
ENSG00000197442 MAP3K5 294401 sc-eQTL 8.15e-01 0.0381 0.163 0.074 CD8_TCM L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 -781355 sc-eQTL 1.54e-01 0.238 0.166 0.074 CD8_TCM L2
ENSG00000027697 IFNGR1 -132571 sc-eQTL 4.06e-01 0.121 0.146 0.078 CD8_TEM L2
ENSG00000029363 BCLAF1 797027 sc-eQTL 8.16e-02 -0.239 0.137 0.078 CD8_TEM L2
ENSG00000112357 PEX7 264314 sc-eQTL 3.44e-01 0.159 0.167 0.078 CD8_TEM L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 -780336 sc-eQTL 5.69e-01 0.0613 0.107 0.078 CD8_TEM L2
ENSG00000197442 MAP3K5 294401 sc-eQTL 9.72e-01 0.00593 0.166 0.078 CD8_TEM L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 -781355 sc-eQTL 3.12e-01 -0.161 0.159 0.078 CD8_TEM L2
ENSG00000027697 IFNGR1 -132571 sc-eQTL 9.13e-01 0.0131 0.12 0.074 MAIT L2
ENSG00000029363 BCLAF1 797027 sc-eQTL 2.18e-01 0.123 0.0991 0.074 MAIT L2
ENSG00000112357 PEX7 264314 sc-eQTL 5.02e-01 0.109 0.162 0.074 MAIT L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 -780336 sc-eQTL 5.58e-01 -0.0473 0.0805 0.074 MAIT L2
ENSG00000146410 MTFR2 836543 sc-eQTL 2.94e-01 0.141 0.134 0.074 MAIT L2
ENSG00000197442 MAP3K5 294401 sc-eQTL 7.77e-01 0.0398 0.14 0.074 MAIT L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 -781355 sc-eQTL 4.18e-01 -0.121 0.149 0.074 MAIT L2
ENSG00000027697 IFNGR1 -132571 sc-eQTL 4.62e-01 0.0988 0.134 0.069 NK_CD56bright L2
ENSG00000029363 BCLAF1 797027 sc-eQTL 3.29e-01 -0.0966 0.0988 0.069 NK_CD56bright L2
ENSG00000112357 PEX7 264314 sc-eQTL 9.94e-01 -0.00133 0.175 0.069 NK_CD56bright L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 -780336 sc-eQTL 6.76e-01 -0.0419 0.0999 0.069 NK_CD56bright L2
ENSG00000197442 MAP3K5 294401 sc-eQTL 2.76e-01 -0.166 0.152 0.069 NK_CD56bright L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 -781355 sc-eQTL 8.19e-01 0.0366 0.159 0.069 NK_CD56bright L2
ENSG00000027697 IFNGR1 -132571 sc-eQTL 1.14e-01 0.168 0.106 0.071 NK_CD56dim L2
ENSG00000029363 BCLAF1 797027 sc-eQTL 1.59e-01 0.0978 0.0692 0.071 NK_CD56dim L2
ENSG00000112357 PEX7 264314 sc-eQTL 1.28e-01 0.279 0.182 0.071 NK_CD56dim L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 -780336 sc-eQTL 5.34e-01 -0.0623 0.1 0.071 NK_CD56dim L2
ENSG00000197442 MAP3K5 294401 sc-eQTL 7.65e-01 -0.0431 0.144 0.071 NK_CD56dim L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 -781355 sc-eQTL 1.51e-01 -0.215 0.149 0.071 NK_CD56dim L2
ENSG00000027697 IFNGR1 -132571 sc-eQTL 1.03e-01 0.22 0.135 0.071 NK_HLA L2
ENSG00000029363 BCLAF1 797027 sc-eQTL 5.19e-01 -0.0741 0.115 0.071 NK_HLA L2
ENSG00000112357 PEX7 264314 sc-eQTL 6.83e-01 -0.0705 0.172 0.071 NK_HLA L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 -780336 sc-eQTL 4.50e-01 0.0813 0.107 0.071 NK_HLA L2
ENSG00000197442 MAP3K5 294401 sc-eQTL 4.51e-01 -0.129 0.171 0.071 NK_HLA L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 -781355 sc-eQTL 1.82e-01 -0.231 0.172 0.071 NK_HLA L2
ENSG00000027697 IFNGR1 -132571 sc-eQTL 8.49e-03 0.292 0.11 0.071 NK_cytokine L2
ENSG00000029363 BCLAF1 797027 sc-eQTL 5.54e-01 -0.0495 0.0834 0.071 NK_cytokine L2
ENSG00000112357 PEX7 264314 sc-eQTL 5.91e-01 -0.0944 0.175 0.071 NK_cytokine L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 -780336 sc-eQTL 1.68e-01 -0.138 0.0994 0.071 NK_cytokine L2
ENSG00000197442 MAP3K5 294401 sc-eQTL 8.08e-01 0.0333 0.137 0.071 NK_cytokine L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 -781355 sc-eQTL 2.31e-02 -0.34 0.149 0.071 NK_cytokine L2
ENSG00000027697 IFNGR1 -132571 sc-eQTL 4.06e-01 0.176 0.211 0.078 PB L2
ENSG00000029363 BCLAF1 797027 sc-eQTL 9.03e-01 0.0224 0.183 0.078 PB L2
ENSG00000112357 PEX7 264314 sc-eQTL 2.73e-01 0.238 0.217 0.078 PB L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 -780336 sc-eQTL 8.61e-01 -0.029 0.165 0.078 PB L2
ENSG00000197442 MAP3K5 294401 sc-eQTL 3.81e-01 0.164 0.187 0.078 PB L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 -781355 sc-eQTL 8.64e-01 -0.034 0.198 0.078 PB L2
ENSG00000027697 IFNGR1 -132571 sc-eQTL 5.63e-01 0.0796 0.137 0.072 Pro_T L2
ENSG00000029363 BCLAF1 797027 sc-eQTL 4.86e-01 -0.0992 0.142 0.072 Pro_T L2
ENSG00000112357 PEX7 264314 sc-eQTL 6.01e-01 0.0873 0.167 0.072 Pro_T L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 -780336 sc-eQTL 4.19e-01 -0.0677 0.0835 0.072 Pro_T L2
ENSG00000146410 MTFR2 836543 sc-eQTL 8.54e-01 0.0214 0.116 0.072 Pro_T L2
ENSG00000197442 MAP3K5 294401 sc-eQTL 8.36e-01 -0.0336 0.162 0.072 Pro_T L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 -781355 sc-eQTL 1.29e-01 -0.246 0.162 0.072 Pro_T L2
ENSG00000027697 IFNGR1 -132571 sc-eQTL 8.94e-01 -0.0209 0.157 0.073 Treg L2
ENSG00000029363 BCLAF1 797027 sc-eQTL 8.94e-01 0.0136 0.101 0.073 Treg L2
ENSG00000112357 PEX7 264314 sc-eQTL 5.85e-01 -0.0907 0.166 0.073 Treg L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 -780336 sc-eQTL 4.12e-01 -0.0818 0.0996 0.073 Treg L2
ENSG00000197442 MAP3K5 294401 sc-eQTL 4.44e-01 0.0829 0.108 0.073 Treg L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 -781355 sc-eQTL 7.21e-02 -0.273 0.151 0.073 Treg L2
ENSG00000027697 IFNGR1 -132571 sc-eQTL 6.69e-01 0.0571 0.133 0.073 cDC L2
ENSG00000029363 BCLAF1 797027 sc-eQTL 6.84e-01 -0.0548 0.134 0.073 cDC L2
ENSG00000112357 PEX7 264314 sc-eQTL 1.17e-01 -0.269 0.171 0.073 cDC L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 -780336 sc-eQTL 2.72e-01 -0.144 0.131 0.073 cDC L2
ENSG00000135525 MAP7 536059 sc-eQTL 4.28e-01 -0.122 0.153 0.073 cDC L2
ENSG00000197442 MAP3K5 294401 sc-eQTL 7.54e-01 -0.0423 0.135 0.073 cDC L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 -781355 sc-eQTL 6.61e-01 -0.0751 0.171 0.073 cDC L2
ENSG00000286646 AL121933.2 302833 sc-eQTL 8.60e-01 -0.0311 0.176 0.073 cDC L2
ENSG00000027697 IFNGR1 -132571 sc-eQTL 3.18e-02 0.2 0.0927 0.073 cMono_IL1B L2
ENSG00000029363 BCLAF1 797027 sc-eQTL 8.11e-01 -0.0241 0.1 0.073 cMono_IL1B L2
ENSG00000112357 PEX7 264314 sc-eQTL 7.06e-02 0.304 0.167 0.073 cMono_IL1B L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 -780336 sc-eQTL 5.35e-01 -0.0627 0.101 0.073 cMono_IL1B L2
ENSG00000135525 MAP7 536059 sc-eQTL 3.98e-01 0.123 0.145 0.073 cMono_IL1B L2
ENSG00000197442 MAP3K5 294401 sc-eQTL 6.65e-01 0.0455 0.105 0.073 cMono_IL1B L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 -781355 sc-eQTL 2.48e-01 -0.124 0.107 0.073 cMono_IL1B L2
ENSG00000286646 AL121933.2 302833 sc-eQTL 7.36e-01 -0.0455 0.135 0.073 cMono_IL1B L2
ENSG00000027697 IFNGR1 -132571 sc-eQTL 2.18e-01 0.134 0.109 0.073 cMono_S100A L2
ENSG00000029363 BCLAF1 797027 sc-eQTL 3.64e-01 -0.102 0.112 0.073 cMono_S100A L2
ENSG00000112357 PEX7 264314 sc-eQTL 7.92e-02 0.307 0.174 0.073 cMono_S100A L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 -780336 sc-eQTL 6.49e-01 -0.0443 0.097 0.073 cMono_S100A L2
ENSG00000135525 MAP7 536059 sc-eQTL 3.94e-01 0.139 0.163 0.073 cMono_S100A L2
ENSG00000197442 MAP3K5 294401 sc-eQTL 2.11e-01 -0.165 0.131 0.073 cMono_S100A L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 -781355 sc-eQTL 7.07e-01 -0.0523 0.139 0.073 cMono_S100A L2
ENSG00000286646 AL121933.2 302833 sc-eQTL 9.14e-01 0.0148 0.136 0.073 cMono_S100A L2
ENSG00000027697 IFNGR1 -132571 sc-eQTL 6.79e-01 -0.0649 0.157 0.076 gdT L2
ENSG00000029363 BCLAF1 797027 sc-eQTL 6.24e-01 -0.0677 0.138 0.076 gdT L2
ENSG00000112357 PEX7 264314 sc-eQTL 9.44e-01 0.014 0.199 0.076 gdT L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 -780336 sc-eQTL 4.58e-01 0.0717 0.0963 0.076 gdT L2
ENSG00000146410 MTFR2 836543 sc-eQTL 1.87e-01 -0.201 0.151 0.076 gdT L2
ENSG00000197442 MAP3K5 294401 sc-eQTL 4.59e-03 -0.571 0.198 0.076 gdT L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 -781355 sc-eQTL 2.49e-01 0.201 0.174 0.076 gdT L2
ENSG00000027697 IFNGR1 -132571 sc-eQTL 5.65e-03 0.317 0.113 0.076 intMono L2
ENSG00000029363 BCLAF1 797027 sc-eQTL 8.53e-01 -0.0282 0.152 0.076 intMono L2
ENSG00000112357 PEX7 264314 sc-eQTL 9.04e-01 0.0188 0.156 0.076 intMono L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 -780336 sc-eQTL 8.98e-01 0.0128 0.0997 0.076 intMono L2
ENSG00000135525 MAP7 536059 sc-eQTL 1.98e-01 -0.197 0.153 0.076 intMono L2
ENSG00000197442 MAP3K5 294401 sc-eQTL 2.24e-01 -0.197 0.162 0.076 intMono L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 -781355 sc-eQTL 5.48e-01 -0.0893 0.148 0.076 intMono L2
ENSG00000286646 AL121933.2 302833 sc-eQTL 4.18e-01 0.139 0.171 0.076 intMono L2
ENSG00000027697 IFNGR1 -132571 sc-eQTL 4.18e-01 0.111 0.136 0.077 ncMono L2
ENSG00000029363 BCLAF1 797027 sc-eQTL 3.74e-02 0.22 0.105 0.077 ncMono L2
ENSG00000112357 PEX7 264314 sc-eQTL 3.25e-01 0.166 0.169 0.077 ncMono L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 -780336 sc-eQTL 4.11e-01 -0.0993 0.121 0.077 ncMono L2
ENSG00000135525 MAP7 536059 sc-eQTL 5.04e-01 0.0998 0.149 0.077 ncMono L2
ENSG00000197442 MAP3K5 294401 sc-eQTL 5.74e-01 -0.0882 0.157 0.077 ncMono L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 -781355 sc-eQTL 5.60e-01 -0.0882 0.151 0.077 ncMono L2
ENSG00000286646 AL121933.2 302833 sc-eQTL 9.61e-01 -0.00782 0.159 0.077 ncMono L2
ENSG00000027697 IFNGR1 -132571 sc-eQTL 1.71e-01 -0.209 0.152 0.076 pDC L2
ENSG00000029363 BCLAF1 797027 sc-eQTL 2.51e-01 -0.131 0.114 0.076 pDC L2
ENSG00000112357 PEX7 264314 sc-eQTL 7.06e-01 -0.0636 0.168 0.076 pDC L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 -780336 sc-eQTL 2.80e-02 -0.309 0.139 0.076 pDC L2
ENSG00000135525 MAP7 536059 sc-eQTL 4.43e-01 0.0901 0.117 0.076 pDC L2
ENSG00000197442 MAP3K5 294401 sc-eQTL 5.68e-01 0.107 0.188 0.076 pDC L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 -781355 sc-eQTL 9.06e-01 0.0171 0.144 0.076 pDC L2
ENSG00000286646 AL121933.2 302833 sc-eQTL 3.80e-01 0.152 0.173 0.076 pDC L2
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000027697 IFNGR1 -132571 sc-eQTL 1.83e-01 0.183 0.137 0.073 B_Memory LOneK1K
ENSG00000029363 BCLAF1 797027 sc-eQTL 5.60e-01 -0.0452 0.0774 0.073 B_Memory LOneK1K
ENSG00000112357 PEX7 264314 sc-eQTL 8.38e-01 0.0325 0.159 0.073 B_Memory LOneK1K
ENSG00000118503 TNFAIP3 -780336 sc-eQTL 7.60e-01 -0.0297 0.0973 0.073 B_Memory LOneK1K
ENSG00000197442 MAP3K5 294401 sc-eQTL 9.24e-01 -0.0124 0.129 0.073 B_Memory LOneK1K
ENSG00000237499 WAKMAR2 -781355 sc-eQTL 5.24e-01 -0.105 0.164 0.073 B_Memory LOneK1K
ENSG00000027697 IFNGR1 -132571 sc-eQTL 3.05e-01 0.143 0.139 0.073 B_Naive LOneK1K
ENSG00000029363 BCLAF1 797027 sc-eQTL 4.84e-01 0.0449 0.064 0.073 B_Naive LOneK1K
ENSG00000112357 PEX7 264314 sc-eQTL 9.09e-01 -0.0195 0.17 0.073 B_Naive LOneK1K
ENSG00000118503 TNFAIP3 -780336 sc-eQTL 4.75e-01 -0.0571 0.0798 0.073 B_Naive LOneK1K
ENSG00000197442 MAP3K5 294401 sc-eQTL 3.21e-01 0.116 0.117 0.073 B_Naive LOneK1K
ENSG00000237499 WAKMAR2 -781355 sc-eQTL 1.09e-01 0.228 0.141 0.073 B_Naive LOneK1K
ENSG00000027697 IFNGR1 -132571 sc-eQTL 3.15e-02 0.203 0.0936 0.073 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000029363 BCLAF1 797027 sc-eQTL 4.29e-01 -0.0697 0.0879 0.073 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000112357 PEX7 264314 sc-eQTL 3.30e-02 0.36 0.168 0.073 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000118503 TNFAIP3 -780336 sc-eQTL 7.08e-01 -0.0328 0.0874 0.073 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000135525 MAP7 536059 sc-eQTL 3.73e-01 0.135 0.152 0.073 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000197442 MAP3K5 294401 sc-eQTL 6.38e-01 -0.0483 0.102 0.073 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000237499 WAKMAR2 -781355 sc-eQTL 3.12e-01 -0.106 0.105 0.073 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000286646 AL121933.2 302833 sc-eQTL 9.08e-01 0.0141 0.122 0.073 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000027697 IFNGR1 -132571 sc-eQTL 2.38e-02 0.251 0.11 0.073 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000029363 BCLAF1 797027 sc-eQTL 2.43e-01 0.118 0.1 0.073 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000112357 PEX7 264314 sc-eQTL 4.34e-01 0.132 0.168 0.073 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000118503 TNFAIP3 -780336 sc-eQTL 5.53e-01 -0.0618 0.104 0.073 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000135525 MAP7 536059 sc-eQTL 6.77e-01 -0.0678 0.163 0.073 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000197442 MAP3K5 294401 sc-eQTL 1.31e-01 -0.201 0.133 0.073 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000237499 WAKMAR2 -781355 sc-eQTL 5.85e-01 -0.0763 0.14 0.073 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000286646 AL121933.2 302833 sc-eQTL 3.90e-01 0.136 0.158 0.073 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000027697 IFNGR1 -132571 sc-eQTL 4.45e-02 0.217 0.107 0.071 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000029363 BCLAF1 797027 sc-eQTL 8.72e-01 0.0101 0.0629 0.071 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000112357 PEX7 264314 sc-eQTL 2.15e-01 0.227 0.182 0.071 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000118503 TNFAIP3 -780336 sc-eQTL 6.74e-01 -0.0416 0.0987 0.071 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000197442 MAP3K5 294401 sc-eQTL 7.01e-01 -0.0513 0.133 0.071 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000237499 WAKMAR2 -781355 sc-eQTL 4.46e-02 -0.276 0.137 0.071 NK_CD56dim LOneK1K

Statistical fine-mapping results from Japan COVID-19 Task Force
(Shown only for PIP>0.001)
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
PIP (SuSiE)
PIP (FINEMAP)
MAF
ENSG00000027697 IFNGR1 -132571 eQTL 3.94e-10 0.141 0.0223 0.0 0.0 0.106
ENSG00000118503 TNFAIP3 -780336 eQTL 0.033 0.0468 0.0219 0.00112 0.0 0.106
ENSG00000146410 MTFR2 836554 eQTL 0.0226 0.0847 0.0371 0.0 0.0 0.106
ENSG00000182747 SLC35D3 164577 eQTL 1.02e-08 -0.298 0.0516 0.0 0.0 0.106
ENSG00000237499 AL357060.1 -781355 eQTL 0.0543 0.0404 0.021 0.00107 0.0 0.106

Expression Modifier Score(EMS) for GTEx 49tissues
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Whole Blood
Muscle Skeletal
Liver
Brain Cerebellum
Prostate
Spleen
Skin Sun Exposed Lower leg
Artery Coronary
Esophagus Muscularis
Esophagus Gastroesophageal Junction
Artery Tibial
Heart Atrial Appendage
Nerve Tibial
Heart Left Ventricle
Adrenal Gland
Adipose Visceral Omentum
Pancreas
Lung
Pituitary
Brain Nucleus accumbens basal ganglia
Colon Transverse
Adipose Subcutaneous
Esophagus Mucosa
Brain Cortex
Thyroid
Stomach
Breast Mammary Tissue
Colon Sigmoid
Skin Not Sun Exposed Suprapubic
Testis
Artery Aorta
Brain Amygdala
Brain Anterior cingulate cortex BA24
Brain Caudate basal ganglia
Brain Cerebellar Hemisphere
Brain Frontal Cortex BA9
Brain Hippocampus
Brain Hypothalamus
Brain Putamen basal ganglia
Brain Spinal cord cervical c-1
Brain Substantia nigra
Cells Cultured fibroblasts
Cells EBV-transformed lymphocytes
Kidney Cortex
Minor Salivary Gland
Ovary
Small Intestine Terminal Ileum
Uterus
Vagina
ENSG00000027697 IFNGR1 -132571 4.33e-06 4.12e-06 4.23e-07 1.88e-06 6.09e-07 1.53e-06 2.41e-06 6.96e-07 2.25e-06 1.2e-06 3.36e-06 2.13e-06 4.58e-06 1.49e-06 9.63e-07 1.79e-06 1.56e-06 2.11e-06 1.49e-06 1.41e-06 1.21e-06 3.15e-06 3.06e-06 9.71e-07 4.78e-06 1.21e-06 1.61e-06 1.77e-06 3.09e-06 3.32e-06 2.06e-06 3.27e-07 5.66e-07 1.36e-06 1.73e-06 8.7e-07 8.57e-07 4.12e-07 1.2e-06 3.46e-07 2.74e-07 4.16e-06 3.64e-07 1.8e-07 3.5e-07 3.13e-07 8.61e-07 2.41e-07 3.12e-07
ENSG00000146410 MTFR2 836554 2.61e-07 1.01e-07 3.31e-08 1.78e-07 9.65e-08 9.57e-08 1.42e-07 5.35e-08 1.37e-07 4.24e-08 1.63e-07 8.03e-08 1.27e-07 6.21e-08 5.14e-08 8.01e-08 4.94e-08 1.1e-07 5.19e-08 3.89e-08 1.06e-07 1.33e-07 1.29e-07 4.82e-08 1.31e-07 1.15e-07 1.1e-07 8.7e-08 9.97e-08 1.1e-07 9.58e-08 4.03e-08 2.92e-08 8.21e-08 9.15e-08 3.93e-08 5.06e-08 9.35e-08 8.19e-08 3.18e-08 4.19e-08 1.37e-07 3.82e-08 1.7e-08 8.79e-08 1.74e-08 1.24e-07 4.33e-09 4.77e-08
ENSG00000182747 SLC35D3 164577 3e-06 2.34e-06 2.93e-07 1.72e-06 4.89e-07 7.64e-07 1.59e-06 4.05e-07 1.75e-06 7.54e-07 2.05e-06 1.35e-06 3.24e-06 1.44e-06 6.04e-07 1.05e-06 9.63e-07 1.7e-06 7.34e-07 6.87e-07 6.18e-07 1.95e-06 1.79e-06 8.29e-07 3.75e-06 1.19e-06 1.22e-06 1.29e-06 1.69e-06 1.9e-06 9.97e-07 3.03e-07 3.71e-07 1.02e-06 9.93e-07 5.32e-07 7.71e-07 3.6e-07 5.99e-07 3.33e-07 2.58e-07 2.77e-06 6.37e-07 1.95e-07 3.12e-07 2.47e-07 4.27e-07 1.71e-07 1.82e-07