Genes within 1Mb (chr6:137085411:C:T):

View on , UCSC , GTEx , gnomAD


Immune cell-type specific single cell cis-eQTLs in OASIS
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000027697 IFNGR1 -134038 sc-eQTL 8.45e-01 -0.0226 0.116 0.111 B L1
ENSG00000029363 BCLAF1 795560 sc-eQTL 6.04e-01 0.0268 0.0515 0.111 B L1
ENSG00000112357 PEX7 262847 sc-eQTL 8.53e-01 0.0255 0.137 0.111 B L1
ENSG00000118503 TNFAIP3 -781803 sc-eQTL 8.47e-01 0.0141 0.073 0.111 B L1
ENSG00000197442 MAP3K5 292934 sc-eQTL 7.14e-01 0.0373 0.102 0.111 B L1
ENSG00000237499 WAKMAR2 -782822 sc-eQTL 6.77e-01 0.0479 0.115 0.111 B L1
ENSG00000027697 IFNGR1 -134038 sc-eQTL 9.45e-01 -0.00527 0.0769 0.111 CD4T L1
ENSG00000029363 BCLAF1 795560 sc-eQTL 1.01e-01 -0.0952 0.0578 0.111 CD4T L1
ENSG00000112357 PEX7 262847 sc-eQTL 9.75e-01 -0.00382 0.124 0.111 CD4T L1
ENSG00000118503 TNFAIP3 -781803 sc-eQTL 2.86e-01 -0.0832 0.0777 0.111 CD4T L1
ENSG00000197442 MAP3K5 292934 sc-eQTL 6.23e-01 0.0292 0.0593 0.111 CD4T L1
ENSG00000237499 WAKMAR2 -782822 sc-eQTL 6.08e-01 0.0504 0.098 0.111 CD4T L1
ENSG00000027697 IFNGR1 -134038 sc-eQTL 6.85e-02 0.159 0.0869 0.111 CD8T L1
ENSG00000029363 BCLAF1 795560 sc-eQTL 1.05e-01 -0.0961 0.0589 0.111 CD8T L1
ENSG00000112357 PEX7 262847 sc-eQTL 2.55e-01 0.166 0.146 0.111 CD8T L1
ENSG00000118503 TNFAIP3 -781803 sc-eQTL 3.52e-01 -0.0687 0.0736 0.111 CD8T L1
ENSG00000197442 MAP3K5 292934 sc-eQTL 5.27e-01 0.0493 0.0779 0.111 CD8T L1
ENSG00000237499 WAKMAR2 -782822 sc-eQTL 9.27e-01 -0.00994 0.108 0.111 CD8T L1
ENSG00000027697 IFNGR1 -134038 sc-eQTL 3.44e-01 0.102 0.108 0.113 DC L1
ENSG00000029363 BCLAF1 795560 sc-eQTL 4.88e-01 -0.0674 0.0969 0.113 DC L1
ENSG00000112357 PEX7 262847 sc-eQTL 8.33e-01 -0.032 0.152 0.113 DC L1
ENSG00000118503 TNFAIP3 -781803 sc-eQTL 9.89e-01 -0.00154 0.115 0.113 DC L1
ENSG00000135525 MAP7 534592 sc-eQTL 6.70e-01 0.0533 0.125 0.113 DC L1
ENSG00000197442 MAP3K5 292934 sc-eQTL 7.21e-01 0.0427 0.12 0.113 DC L1
ENSG00000237499 WAKMAR2 -782822 sc-eQTL 2.17e-01 -0.145 0.117 0.113 DC L1
ENSG00000286646 AL121933.2 301366 sc-eQTL 1.09e-01 -0.25 0.155 0.113 DC L1
ENSG00000027697 IFNGR1 -134038 sc-eQTL 8.21e-01 -0.02 0.088 0.111 Mono L1
ENSG00000029363 BCLAF1 795560 sc-eQTL 2.54e-01 -0.0859 0.075 0.111 Mono L1
ENSG00000112357 PEX7 262847 sc-eQTL 6.20e-01 -0.0736 0.148 0.111 Mono L1
ENSG00000118503 TNFAIP3 -781803 sc-eQTL 7.29e-01 -0.0259 0.0747 0.111 Mono L1
ENSG00000135525 MAP7 534592 sc-eQTL 4.76e-01 -0.0931 0.131 0.111 Mono L1
ENSG00000197442 MAP3K5 292934 sc-eQTL 2.09e-01 -0.109 0.0868 0.111 Mono L1
ENSG00000237499 WAKMAR2 -782822 sc-eQTL 6.29e-01 -0.0448 0.0925 0.111 Mono L1
ENSG00000286646 AL121933.2 301366 sc-eQTL 2.56e-01 -0.12 0.105 0.111 Mono L1
ENSG00000027697 IFNGR1 -134038 sc-eQTL 6.29e-01 0.0468 0.0968 0.112 NK L1
ENSG00000029363 BCLAF1 795560 sc-eQTL 2.54e-01 -0.0586 0.0513 0.112 NK L1
ENSG00000112357 PEX7 262847 sc-eQTL 3.76e-01 0.132 0.149 0.112 NK L1
ENSG00000118503 TNFAIP3 -781803 sc-eQTL 3.88e-01 -0.0696 0.0805 0.112 NK L1
ENSG00000197442 MAP3K5 292934 sc-eQTL 3.26e-03 0.337 0.113 0.112 NK L1
ENSG00000237499 WAKMAR2 -782822 sc-eQTL 4.67e-02 0.226 0.113 0.112 NK L1
ENSG00000027697 IFNGR1 -134038 sc-eQTL 7.81e-01 -0.0251 0.0903 0.111 Other_T L1
ENSG00000029363 BCLAF1 795560 sc-eQTL 4.85e-01 -0.053 0.0757 0.111 Other_T L1
ENSG00000112357 PEX7 262847 sc-eQTL 6.99e-01 0.0571 0.147 0.111 Other_T L1
ENSG00000118503 TNFAIP3 -781803 sc-eQTL 8.31e-01 -0.012 0.0562 0.111 Other_T L1
ENSG00000146410 MTFR2 835076 sc-eQTL 8.44e-01 -0.0167 0.0852 0.111 Other_T L1
ENSG00000197442 MAP3K5 292934 sc-eQTL 1.38e-01 0.161 0.108 0.111 Other_T L1
ENSG00000237499 WAKMAR2 -782822 sc-eQTL 8.44e-01 0.0219 0.112 0.111 Other_T L1
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000027697 IFNGR1 -134038 sc-eQTL 2.14e-01 0.187 0.15 0.117 B_Activated L2
ENSG00000029363 BCLAF1 795560 sc-eQTL 8.50e-01 0.0231 0.122 0.117 B_Activated L2
ENSG00000112357 PEX7 262847 sc-eQTL 1.88e-01 0.195 0.147 0.117 B_Activated L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 -781803 sc-eQTL 4.09e-02 0.303 0.147 0.117 B_Activated L2
ENSG00000197442 MAP3K5 292934 sc-eQTL 5.52e-01 -0.0991 0.166 0.117 B_Activated L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 -782822 sc-eQTL 4.40e-01 0.1 0.13 0.117 B_Activated L2
ENSG00000027697 IFNGR1 -134038 sc-eQTL 1.66e-01 0.184 0.132 0.112 B_Intermediate L2
ENSG00000029363 BCLAF1 795560 sc-eQTL 6.03e-01 0.0394 0.0757 0.112 B_Intermediate L2
ENSG00000112357 PEX7 262847 sc-eQTL 7.08e-01 0.0522 0.139 0.112 B_Intermediate L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 -781803 sc-eQTL 7.97e-01 0.0256 0.0996 0.112 B_Intermediate L2
ENSG00000197442 MAP3K5 292934 sc-eQTL 9.34e-01 0.01 0.12 0.112 B_Intermediate L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 -782822 sc-eQTL 4.52e-01 -0.106 0.141 0.112 B_Intermediate L2
ENSG00000027697 IFNGR1 -134038 sc-eQTL 3.84e-01 0.125 0.143 0.112 B_Memory L2
ENSG00000029363 BCLAF1 795560 sc-eQTL 6.28e-02 0.158 0.0846 0.112 B_Memory L2
ENSG00000112357 PEX7 262847 sc-eQTL 8.79e-01 -0.0221 0.145 0.112 B_Memory L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 -781803 sc-eQTL 8.54e-01 0.0173 0.0939 0.112 B_Memory L2
ENSG00000197442 MAP3K5 292934 sc-eQTL 2.64e-01 0.143 0.128 0.112 B_Memory L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 -782822 sc-eQTL 8.00e-01 -0.0354 0.14 0.112 B_Memory L2
ENSG00000027697 IFNGR1 -134038 sc-eQTL 5.48e-01 -0.071 0.118 0.111 B_Naive1 L2
ENSG00000029363 BCLAF1 795560 sc-eQTL 6.24e-01 -0.0331 0.0675 0.111 B_Naive1 L2
ENSG00000112357 PEX7 262847 sc-eQTL 7.63e-01 0.0471 0.156 0.111 B_Naive1 L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 -781803 sc-eQTL 5.36e-01 0.0491 0.079 0.111 B_Naive1 L2
ENSG00000197442 MAP3K5 292934 sc-eQTL 1.82e-01 0.148 0.111 0.111 B_Naive1 L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 -782822 sc-eQTL 7.62e-01 -0.0376 0.124 0.111 B_Naive1 L2
ENSG00000027697 IFNGR1 -134038 sc-eQTL 4.53e-01 0.103 0.138 0.112 B_Naive2 L2
ENSG00000029363 BCLAF1 795560 sc-eQTL 5.26e-01 0.0507 0.0798 0.112 B_Naive2 L2
ENSG00000112357 PEX7 262847 sc-eQTL 8.08e-01 0.0367 0.151 0.112 B_Naive2 L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 -781803 sc-eQTL 8.43e-01 -0.0218 0.11 0.112 B_Naive2 L2
ENSG00000197442 MAP3K5 292934 sc-eQTL 5.75e-01 0.0654 0.117 0.112 B_Naive2 L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 -782822 sc-eQTL 9.02e-01 0.0174 0.142 0.112 B_Naive2 L2
ENSG00000027697 IFNGR1 -134038 sc-eQTL 8.43e-01 -0.0255 0.129 0.114 CD4_CTL L2
ENSG00000029363 BCLAF1 795560 sc-eQTL 3.44e-01 0.108 0.114 0.114 CD4_CTL L2
ENSG00000112357 PEX7 262847 sc-eQTL 1.85e-01 -0.189 0.142 0.114 CD4_CTL L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 -781803 sc-eQTL 1.29e-01 0.128 0.084 0.114 CD4_CTL L2
ENSG00000197442 MAP3K5 292934 sc-eQTL 8.23e-01 0.0301 0.135 0.114 CD4_CTL L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 -782822 sc-eQTL 9.97e-01 -0.00053 0.131 0.114 CD4_CTL L2
ENSG00000027697 IFNGR1 -134038 sc-eQTL 8.08e-01 -0.0178 0.073 0.111 CD4_Naive L2
ENSG00000029363 BCLAF1 795560 sc-eQTL 8.68e-02 -0.1 0.0582 0.111 CD4_Naive L2
ENSG00000112357 PEX7 262847 sc-eQTL 6.09e-01 0.0706 0.138 0.111 CD4_Naive L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 -781803 sc-eQTL 4.78e-01 -0.0566 0.0797 0.111 CD4_Naive L2
ENSG00000197442 MAP3K5 292934 sc-eQTL 5.65e-01 -0.0337 0.0585 0.111 CD4_Naive L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 -782822 sc-eQTL 5.36e-01 0.0639 0.103 0.111 CD4_Naive L2
ENSG00000027697 IFNGR1 -134038 sc-eQTL 5.45e-01 0.0613 0.101 0.111 CD4_TCM L2
ENSG00000029363 BCLAF1 795560 sc-eQTL 1.46e-01 -0.0925 0.0634 0.111 CD4_TCM L2
ENSG00000112357 PEX7 262847 sc-eQTL 9.03e-01 -0.0182 0.148 0.111 CD4_TCM L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 -781803 sc-eQTL 4.05e-01 -0.0606 0.0727 0.111 CD4_TCM L2
ENSG00000197442 MAP3K5 292934 sc-eQTL 5.92e-02 0.156 0.0822 0.111 CD4_TCM L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 -782822 sc-eQTL 5.13e-01 0.0667 0.102 0.111 CD4_TCM L2
ENSG00000027697 IFNGR1 -134038 sc-eQTL 1.88e-01 -0.15 0.114 0.111 CD4_TEM L2
ENSG00000029363 BCLAF1 795560 sc-eQTL 6.74e-01 -0.0341 0.081 0.111 CD4_TEM L2
ENSG00000112357 PEX7 262847 sc-eQTL 8.50e-01 -0.028 0.148 0.111 CD4_TEM L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 -781803 sc-eQTL 8.68e-01 -0.0127 0.0759 0.111 CD4_TEM L2
ENSG00000197442 MAP3K5 292934 sc-eQTL 6.92e-02 0.213 0.116 0.111 CD4_TEM L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 -782822 sc-eQTL 9.42e-01 0.00879 0.122 0.111 CD4_TEM L2
ENSG00000027697 IFNGR1 -134038 sc-eQTL 2.46e-02 0.234 0.103 0.111 CD8_CTL L2
ENSG00000029363 BCLAF1 795560 sc-eQTL 5.41e-01 -0.0426 0.0696 0.111 CD8_CTL L2
ENSG00000112357 PEX7 262847 sc-eQTL 7.56e-01 0.0447 0.144 0.111 CD8_CTL L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 -781803 sc-eQTL 7.66e-01 -0.0261 0.0878 0.111 CD8_CTL L2
ENSG00000197442 MAP3K5 292934 sc-eQTL 7.18e-01 0.0449 0.124 0.111 CD8_CTL L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 -782822 sc-eQTL 9.34e-01 0.0102 0.124 0.111 CD8_CTL L2
ENSG00000027697 IFNGR1 -134038 sc-eQTL 7.73e-01 -0.0296 0.103 0.111 CD8_Naive L2
ENSG00000029363 BCLAF1 795560 sc-eQTL 3.84e-01 -0.0625 0.0716 0.111 CD8_Naive L2
ENSG00000112357 PEX7 262847 sc-eQTL 3.50e-01 0.139 0.149 0.111 CD8_Naive L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 -781803 sc-eQTL 9.30e-01 -0.0071 0.0804 0.111 CD8_Naive L2
ENSG00000197442 MAP3K5 292934 sc-eQTL 7.18e-01 0.0345 0.0952 0.111 CD8_Naive L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 -782822 sc-eQTL 7.91e-01 -0.0315 0.119 0.111 CD8_Naive L2
ENSG00000027697 IFNGR1 -134038 sc-eQTL 9.55e-01 -0.00787 0.138 0.111 CD8_TCM L2
ENSG00000029363 BCLAF1 795560 sc-eQTL 1.50e-01 0.149 0.103 0.111 CD8_TCM L2
ENSG00000112357 PEX7 262847 sc-eQTL 3.63e-01 0.144 0.158 0.111 CD8_TCM L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 -781803 sc-eQTL 4.22e-01 0.0603 0.0749 0.111 CD8_TCM L2
ENSG00000197442 MAP3K5 292934 sc-eQTL 5.80e-02 0.253 0.133 0.111 CD8_TCM L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 -782822 sc-eQTL 9.38e-01 0.0107 0.137 0.111 CD8_TCM L2
ENSG00000027697 IFNGR1 -134038 sc-eQTL 5.62e-01 0.0745 0.128 0.116 CD8_TEM L2
ENSG00000029363 BCLAF1 795560 sc-eQTL 6.38e-02 0.224 0.12 0.116 CD8_TEM L2
ENSG00000112357 PEX7 262847 sc-eQTL 2.24e-01 0.179 0.147 0.116 CD8_TEM L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 -781803 sc-eQTL 2.96e-01 0.0988 0.0943 0.116 CD8_TEM L2
ENSG00000197442 MAP3K5 292934 sc-eQTL 3.37e-01 0.14 0.146 0.116 CD8_TEM L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 -782822 sc-eQTL 8.51e-01 0.0263 0.14 0.116 CD8_TEM L2
ENSG00000027697 IFNGR1 -134038 sc-eQTL 7.47e-01 0.0331 0.103 0.113 MAIT L2
ENSG00000029363 BCLAF1 795560 sc-eQTL 5.27e-02 -0.165 0.0846 0.113 MAIT L2
ENSG00000112357 PEX7 262847 sc-eQTL 5.49e-01 -0.0835 0.139 0.113 MAIT L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 -781803 sc-eQTL 9.08e-01 0.008 0.0691 0.113 MAIT L2
ENSG00000146410 MTFR2 835076 sc-eQTL 7.45e-01 -0.0374 0.115 0.113 MAIT L2
ENSG00000197442 MAP3K5 292934 sc-eQTL 9.64e-01 0.00546 0.12 0.113 MAIT L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 -782822 sc-eQTL 7.73e-01 0.037 0.128 0.113 MAIT L2
ENSG00000027697 IFNGR1 -134038 sc-eQTL 7.62e-01 0.0353 0.117 0.109 NK_CD56bright L2
ENSG00000029363 BCLAF1 795560 sc-eQTL 7.33e-01 0.0293 0.086 0.109 NK_CD56bright L2
ENSG00000112357 PEX7 262847 sc-eQTL 6.79e-01 -0.0628 0.152 0.109 NK_CD56bright L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 -781803 sc-eQTL 1.15e-01 0.136 0.0863 0.109 NK_CD56bright L2
ENSG00000197442 MAP3K5 292934 sc-eQTL 3.26e-01 0.13 0.132 0.109 NK_CD56bright L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 -782822 sc-eQTL 4.22e-02 0.28 0.137 0.109 NK_CD56bright L2
ENSG00000027697 IFNGR1 -134038 sc-eQTL 3.62e-01 0.0817 0.0895 0.112 NK_CD56dim L2
ENSG00000029363 BCLAF1 795560 sc-eQTL 7.86e-01 -0.0159 0.0586 0.112 NK_CD56dim L2
ENSG00000112357 PEX7 262847 sc-eQTL 7.09e-01 -0.0576 0.154 0.112 NK_CD56dim L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 -781803 sc-eQTL 2.83e-01 -0.0907 0.0842 0.112 NK_CD56dim L2
ENSG00000197442 MAP3K5 292934 sc-eQTL 1.43e-02 0.296 0.12 0.112 NK_CD56dim L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 -782822 sc-eQTL 1.03e-01 0.206 0.126 0.112 NK_CD56dim L2
ENSG00000027697 IFNGR1 -134038 sc-eQTL 7.97e-01 0.0312 0.121 0.107 NK_HLA L2
ENSG00000029363 BCLAF1 795560 sc-eQTL 4.75e-01 -0.0734 0.103 0.107 NK_HLA L2
ENSG00000112357 PEX7 262847 sc-eQTL 5.70e-01 0.0876 0.154 0.107 NK_HLA L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 -781803 sc-eQTL 5.43e-01 0.0585 0.096 0.107 NK_HLA L2
ENSG00000197442 MAP3K5 292934 sc-eQTL 4.75e-02 0.302 0.151 0.107 NK_HLA L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 -782822 sc-eQTL 6.04e-03 0.422 0.152 0.107 NK_HLA L2
ENSG00000027697 IFNGR1 -134038 sc-eQTL 4.83e-01 0.066 0.094 0.112 NK_cytokine L2
ENSG00000029363 BCLAF1 795560 sc-eQTL 1.46e-01 -0.102 0.0699 0.112 NK_cytokine L2
ENSG00000112357 PEX7 262847 sc-eQTL 2.35e-01 0.175 0.147 0.112 NK_cytokine L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 -781803 sc-eQTL 8.72e-01 0.0136 0.084 0.112 NK_cytokine L2
ENSG00000197442 MAP3K5 292934 sc-eQTL 4.26e-02 0.233 0.114 0.112 NK_cytokine L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 -782822 sc-eQTL 2.77e-01 0.138 0.126 0.112 NK_cytokine L2
ENSG00000027697 IFNGR1 -134038 sc-eQTL 4.89e-01 0.128 0.185 0.111 PB L2
ENSG00000029363 BCLAF1 795560 sc-eQTL 6.54e-01 0.0717 0.159 0.111 PB L2
ENSG00000112357 PEX7 262847 sc-eQTL 1.71e-01 0.259 0.188 0.111 PB L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 -781803 sc-eQTL 9.88e-01 -0.00221 0.144 0.111 PB L2
ENSG00000197442 MAP3K5 292934 sc-eQTL 7.21e-01 -0.0585 0.164 0.111 PB L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 -782822 sc-eQTL 6.73e-01 0.0729 0.173 0.111 PB L2
ENSG00000027697 IFNGR1 -134038 sc-eQTL 1.03e-01 -0.201 0.123 0.107 Pro_T L2
ENSG00000029363 BCLAF1 795560 sc-eQTL 4.70e-01 0.0925 0.128 0.107 Pro_T L2
ENSG00000112357 PEX7 262847 sc-eQTL 1.93e-01 0.195 0.149 0.107 Pro_T L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 -781803 sc-eQTL 1.67e-01 -0.104 0.0749 0.107 Pro_T L2
ENSG00000146410 MTFR2 835076 sc-eQTL 3.56e-01 0.0963 0.104 0.107 Pro_T L2
ENSG00000197442 MAP3K5 292934 sc-eQTL 5.02e-01 0.0979 0.146 0.107 Pro_T L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 -782822 sc-eQTL 1.04e-01 -0.237 0.145 0.107 Pro_T L2
ENSG00000027697 IFNGR1 -134038 sc-eQTL 6.05e-01 0.0695 0.134 0.111 Treg L2
ENSG00000029363 BCLAF1 795560 sc-eQTL 7.42e-01 -0.0286 0.0867 0.111 Treg L2
ENSG00000112357 PEX7 262847 sc-eQTL 7.07e-01 0.0533 0.142 0.111 Treg L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 -781803 sc-eQTL 3.94e-01 -0.0728 0.0852 0.111 Treg L2
ENSG00000197442 MAP3K5 292934 sc-eQTL 3.33e-01 0.0895 0.0923 0.111 Treg L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 -782822 sc-eQTL 4.52e-02 0.26 0.129 0.111 Treg L2
ENSG00000027697 IFNGR1 -134038 sc-eQTL 1.22e-01 0.178 0.115 0.115 cDC L2
ENSG00000029363 BCLAF1 795560 sc-eQTL 5.97e-01 -0.0616 0.116 0.115 cDC L2
ENSG00000112357 PEX7 262847 sc-eQTL 8.45e-01 -0.0293 0.149 0.115 cDC L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 -781803 sc-eQTL 8.27e-01 -0.0249 0.114 0.115 cDC L2
ENSG00000135525 MAP7 534592 sc-eQTL 3.59e-01 0.122 0.133 0.115 cDC L2
ENSG00000197442 MAP3K5 292934 sc-eQTL 8.18e-01 -0.027 0.117 0.115 cDC L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 -782822 sc-eQTL 4.05e-01 -0.123 0.148 0.115 cDC L2
ENSG00000286646 AL121933.2 301366 sc-eQTL 2.00e-01 -0.195 0.152 0.115 cDC L2
ENSG00000027697 IFNGR1 -134038 sc-eQTL 4.67e-01 -0.0604 0.0828 0.111 cMono_IL1B L2
ENSG00000029363 BCLAF1 795560 sc-eQTL 1.36e-01 -0.132 0.0885 0.111 cMono_IL1B L2
ENSG00000112357 PEX7 262847 sc-eQTL 3.71e-01 -0.134 0.149 0.111 cMono_IL1B L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 -781803 sc-eQTL 3.91e-01 -0.0766 0.0891 0.111 cMono_IL1B L2
ENSG00000135525 MAP7 534592 sc-eQTL 1.33e-02 -0.316 0.127 0.111 cMono_IL1B L2
ENSG00000197442 MAP3K5 292934 sc-eQTL 7.84e-01 -0.0254 0.0928 0.111 cMono_IL1B L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 -782822 sc-eQTL 7.10e-01 -0.0355 0.0953 0.111 cMono_IL1B L2
ENSG00000286646 AL121933.2 301366 sc-eQTL 3.59e-01 -0.109 0.119 0.111 cMono_IL1B L2
ENSG00000027697 IFNGR1 -134038 sc-eQTL 6.83e-01 -0.0386 0.0946 0.111 cMono_S100A L2
ENSG00000029363 BCLAF1 795560 sc-eQTL 7.96e-01 -0.0251 0.0972 0.111 cMono_S100A L2
ENSG00000112357 PEX7 262847 sc-eQTL 6.62e-01 0.0665 0.152 0.111 cMono_S100A L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 -781803 sc-eQTL 7.43e-02 -0.15 0.0835 0.111 cMono_S100A L2
ENSG00000135525 MAP7 534592 sc-eQTL 4.29e-01 -0.112 0.141 0.111 cMono_S100A L2
ENSG00000197442 MAP3K5 292934 sc-eQTL 3.93e-02 -0.235 0.113 0.111 cMono_S100A L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 -782822 sc-eQTL 3.95e-01 -0.103 0.121 0.111 cMono_S100A L2
ENSG00000286646 AL121933.2 301366 sc-eQTL 3.53e-01 -0.109 0.118 0.111 cMono_S100A L2
ENSG00000027697 IFNGR1 -134038 sc-eQTL 8.49e-01 -0.0254 0.133 0.121 gdT L2
ENSG00000029363 BCLAF1 795560 sc-eQTL 6.08e-01 0.0603 0.117 0.121 gdT L2
ENSG00000112357 PEX7 262847 sc-eQTL 5.54e-01 0.1 0.169 0.121 gdT L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 -781803 sc-eQTL 2.01e-01 -0.105 0.0814 0.121 gdT L2
ENSG00000146410 MTFR2 835076 sc-eQTL 5.23e-01 0.0826 0.129 0.121 gdT L2
ENSG00000197442 MAP3K5 292934 sc-eQTL 1.07e-01 0.278 0.172 0.121 gdT L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 -782822 sc-eQTL 6.03e-01 0.0773 0.148 0.121 gdT L2
ENSG00000027697 IFNGR1 -134038 sc-eQTL 7.62e-02 -0.184 0.103 0.109 intMono L2
ENSG00000029363 BCLAF1 795560 sc-eQTL 8.04e-01 -0.0342 0.138 0.109 intMono L2
ENSG00000112357 PEX7 262847 sc-eQTL 8.42e-01 -0.0281 0.14 0.109 intMono L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 -781803 sc-eQTL 2.74e-01 -0.0984 0.0897 0.109 intMono L2
ENSG00000135525 MAP7 534592 sc-eQTL 4.93e-01 0.0948 0.138 0.109 intMono L2
ENSG00000197442 MAP3K5 292934 sc-eQTL 5.70e-01 -0.0833 0.146 0.109 intMono L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 -782822 sc-eQTL 7.97e-01 -0.0346 0.134 0.109 intMono L2
ENSG00000286646 AL121933.2 301366 sc-eQTL 9.17e-01 0.0162 0.155 0.109 intMono L2
ENSG00000027697 IFNGR1 -134038 sc-eQTL 8.28e-01 -0.0261 0.12 0.104 ncMono L2
ENSG00000029363 BCLAF1 795560 sc-eQTL 9.66e-01 -0.00397 0.0934 0.104 ncMono L2
ENSG00000112357 PEX7 262847 sc-eQTL 6.47e-01 0.0682 0.149 0.104 ncMono L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 -781803 sc-eQTL 4.40e-02 -0.213 0.105 0.104 ncMono L2
ENSG00000135525 MAP7 534592 sc-eQTL 8.36e-02 0.227 0.13 0.104 ncMono L2
ENSG00000197442 MAP3K5 292934 sc-eQTL 1.33e-01 -0.207 0.137 0.104 ncMono L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 -782822 sc-eQTL 8.68e-01 0.0221 0.133 0.104 ncMono L2
ENSG00000286646 AL121933.2 301366 sc-eQTL 8.58e-01 0.0251 0.14 0.104 ncMono L2
ENSG00000027697 IFNGR1 -134038 sc-eQTL 1.40e-01 0.218 0.147 0.107 pDC L2
ENSG00000029363 BCLAF1 795560 sc-eQTL 3.42e-01 -0.106 0.111 0.107 pDC L2
ENSG00000112357 PEX7 262847 sc-eQTL 9.69e-01 -0.00627 0.163 0.107 pDC L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 -781803 sc-eQTL 6.71e-01 0.0585 0.137 0.107 pDC L2
ENSG00000135525 MAP7 534592 sc-eQTL 6.90e-01 -0.0456 0.114 0.107 pDC L2
ENSG00000197442 MAP3K5 292934 sc-eQTL 3.51e-01 -0.17 0.182 0.107 pDC L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 -782822 sc-eQTL 9.73e-01 0.00479 0.14 0.107 pDC L2
ENSG00000286646 AL121933.2 301366 sc-eQTL 2.61e-01 -0.189 0.168 0.107 pDC L2
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000027697 IFNGR1 -134038 sc-eQTL 2.22e-01 0.146 0.119 0.111 B_Memory LOneK1K
ENSG00000029363 BCLAF1 795560 sc-eQTL 5.43e-01 0.0408 0.0669 0.111 B_Memory LOneK1K
ENSG00000112357 PEX7 262847 sc-eQTL 8.41e-01 -0.0275 0.137 0.111 B_Memory LOneK1K
ENSG00000118503 TNFAIP3 -781803 sc-eQTL 9.89e-01 -0.00114 0.0841 0.111 B_Memory LOneK1K
ENSG00000197442 MAP3K5 292934 sc-eQTL 6.10e-01 0.0568 0.111 0.111 B_Memory LOneK1K
ENSG00000237499 WAKMAR2 -782822 sc-eQTL 7.95e-01 -0.037 0.142 0.111 B_Memory LOneK1K
ENSG00000027697 IFNGR1 -134038 sc-eQTL 9.87e-01 -0.00196 0.122 0.111 B_Naive LOneK1K
ENSG00000029363 BCLAF1 795560 sc-eQTL 9.23e-01 0.0054 0.0559 0.111 B_Naive LOneK1K
ENSG00000112357 PEX7 262847 sc-eQTL 9.53e-01 0.00879 0.148 0.111 B_Naive LOneK1K
ENSG00000118503 TNFAIP3 -781803 sc-eQTL 6.61e-01 0.0306 0.0696 0.111 B_Naive LOneK1K
ENSG00000197442 MAP3K5 292934 sc-eQTL 3.75e-02 0.211 0.101 0.111 B_Naive LOneK1K
ENSG00000237499 WAKMAR2 -782822 sc-eQTL 9.48e-01 0.00809 0.124 0.111 B_Naive LOneK1K
ENSG00000027697 IFNGR1 -134038 sc-eQTL 6.20e-01 -0.0413 0.0832 0.111 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000029363 BCLAF1 795560 sc-eQTL 2.13e-01 -0.0965 0.0772 0.111 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000112357 PEX7 262847 sc-eQTL 4.50e-01 -0.113 0.149 0.111 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000118503 TNFAIP3 -781803 sc-eQTL 5.19e-01 -0.0496 0.0769 0.111 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000135525 MAP7 534592 sc-eQTL 7.00e-02 -0.241 0.133 0.111 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000197442 MAP3K5 292934 sc-eQTL 2.75e-01 -0.0985 0.0899 0.111 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000237499 WAKMAR2 -782822 sc-eQTL 5.56e-01 -0.0543 0.0922 0.111 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000286646 AL121933.2 301366 sc-eQTL 1.35e-01 -0.16 0.107 0.111 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000027697 IFNGR1 -134038 sc-eQTL 1.95e-01 -0.128 0.0986 0.112 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000029363 BCLAF1 795560 sc-eQTL 5.18e-01 -0.0579 0.0894 0.112 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000112357 PEX7 262847 sc-eQTL 9.18e-01 -0.0154 0.149 0.112 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000118503 TNFAIP3 -781803 sc-eQTL 2.02e-01 -0.118 0.0922 0.112 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000135525 MAP7 534592 sc-eQTL 5.90e-02 0.272 0.143 0.112 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000197442 MAP3K5 292934 sc-eQTL 2.60e-01 -0.134 0.118 0.112 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000237499 WAKMAR2 -782822 sc-eQTL 6.13e-01 0.0628 0.124 0.112 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000286646 AL121933.2 301366 sc-eQTL 6.19e-01 0.07 0.141 0.112 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000027697 IFNGR1 -134038 sc-eQTL 4.35e-01 0.0714 0.0913 0.112 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000029363 BCLAF1 795560 sc-eQTL 2.37e-01 -0.0627 0.0529 0.112 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000112357 PEX7 262847 sc-eQTL 4.55e-01 0.115 0.154 0.112 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000118503 TNFAIP3 -781803 sc-eQTL 3.24e-01 -0.0822 0.0831 0.112 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000197442 MAP3K5 292934 sc-eQTL 4.70e-03 0.315 0.11 0.112 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000237499 WAKMAR2 -782822 sc-eQTL 8.79e-02 0.198 0.116 0.112 NK_CD56dim LOneK1K


Statistical fine-mapping results from Japan COVID-19 Task Force
(Shown only for PIP>0.001)
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
PIP (SuSiE)
PIP (FINEMAP)
MAF
ENSG00000027697 IFNGR1 -134038 eQTL 0.00114 -0.0631 0.0193 0.0 0.0 0.132
ENSG00000112357 PEX7 262847 eQTL 0.0216 0.0869 0.0378 0.0 0.0 0.132


Expression Modifier Score(EMS) for GTEx 49tissues
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Whole Blood
Muscle Skeletal
Liver
Brain Cerebellum
Prostate
Spleen
Skin Sun Exposed Lower leg
Artery Coronary
Esophagus Muscularis
Esophagus Gastroesophageal Junction
Artery Tibial
Heart Atrial Appendage
Nerve Tibial
Heart Left Ventricle
Adrenal Gland
Adipose Visceral Omentum
Pancreas
Lung
Pituitary
Brain Nucleus accumbens basal ganglia
Colon Transverse
Adipose Subcutaneous
Esophagus Mucosa
Brain Cortex
Thyroid
Stomach
Breast Mammary Tissue
Colon Sigmoid
Skin Not Sun Exposed Suprapubic
Testis
Artery Aorta
Brain Amygdala
Brain Anterior cingulate cortex BA24
Brain Caudate basal ganglia
Brain Cerebellar Hemisphere
Brain Frontal Cortex BA9
Brain Hippocampus
Brain Hypothalamus
Brain Putamen basal ganglia
Brain Spinal cord cervical c-1
Brain Substantia nigra
Cells Cultured fibroblasts
Cells EBV-transformed lymphocytes
Kidney Cortex
Minor Salivary Gland
Ovary
Small Intestine Terminal Ileum
Uterus
Vagina
ENSG00000027697 IFNGR1 -134038 1.03e-05 5.58e-06 1.3e-06 2.24e-06 1.66e-06 1.56e-06 3.31e-06 4.04e-07 4.8e-06 1.63e-06 4.22e-06 1.98e-06 6.61e-06 1.77e-06 1.33e-06 3.22e-06 1.8e-06 3.83e-06 1.33e-06 8.79e-07 1.43e-06 3.89e-06 3.78e-06 1.78e-06 5.16e-06 1.81e-06 1.55e-06 1.48e-06 4.17e-06 4.17e-06 2.7e-06 3.28e-07 6.12e-07 1.9e-06 1.65e-06 1.84e-06 1.04e-06 4.21e-07 9.45e-07 3.08e-07 1.95e-07 4.67e-06 4.94e-06 1.89e-07 3.06e-07 4.01e-07 7.99e-07 2.31e-07 9.51e-08